4CZEA

C. crescentus mreb, double filament, empty
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
321
Chain Sequence
SNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGFVNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
molecule tags Structural protein
total genus 97
structure length 321
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czeA03
5AQHA 1D4XA 4AM7A 2Q36A 4QS9A 3FZLA 4Y0WA 2P9IA 3H3NO 3ID8A 4BQLA 3RSEA 4JNEA 4B1ZA 4FWSA 2FSKA 4DHYA 4WQ5A 5EXWA 2Q0RA 4BG9A 3QB0A 4FPBA 1NMDA 1BO5O 3MMVA 2YJFA 1JCGA 1ESVA 1GLFO 2D0OA 2ITMA 2A41A 2D4WA 5TKYA 3KZBA 4CZJA 3GBTA 2A3ZA 4CZFA 4EIAA 1DKGD 4BRCA 2VYPA 3BF1A 4JD2B 2YHWA 1MWMA 3VEVA 4WQ4C 5BPMA 4XEIA 3CJBA 3UKUB 4BC4A 2GELA 4CZLA 1TYQB 1WUAA 3MDQA 2CGKA 3CIPA 5AFUH 1Q18A 3VEOA 3DXKB 2FF3B 3JS6A 3VF2A 4PKHA 4XH1A 3VEYA 2KHOA 3A8YA 3HSCA 4WQ4A 2CGLA 2HF4A 3DWLA 1BWFO 1WOQA 5BN8A 1NGJA 3UE5A 4DQ8A 1NGHA 2NZTA 1KAZA 1C0FA 1NGEA 3EL2A 5AQGA 5BREA 3O8MA 4H5NA 4M63C 4M7XA 5AQLA 3S41A 3BEXA 2ASPA 2QWLA 2Q1NA 4I6MA 4IXCA 1EQYA 4BVPA 4BGAA 1QZ6A 2UYTA 3MN6A 4BR0A 4DCHA 3CETA 2E2OA 2IVOA 3WXJA 1K8KA 5FPMA 3MCPA 5KPTA 2HOEA 1KAYA 4XH4A 4BR4A 3QBXA 1GLLO 1NGBA 2FF6A 5JMVA 5BRDA 3HBTA 3F9MA 3C7NA 4BG8A 2P9NA 3LDLA 4M7YA 3GDQA 4FSVA 5BRFA 4BR9A 3BUZB 4CZMA 4BR5A 2P9PA 3VENA 2J4RA 1QQOA 5AQQA 4MLHA 3I8BA 2V7YA 2A6AA 1S22A 1HUXA 5F0XA 4ISEA 2ZF5O 1E4FT 2P9SA 2QWNA 1JCEA 4J8FA 5AQTA 5JICA 3AAPA 4PL8A 4FL9A 3ZEUA 1RFQA 2E1YA 2ZGZA 5FPEA 5BRHA 4BRFA 4BRQA 4FWPA 4FWKA 4WYBA 2QWPA 3WXLA 5I9EB 2FLOA 4A62A 1HKCA 3TPQA 2NRHA 2QWOA 4H0YB 2A42A 3QBWA 4BR7A 4HWIA 3EKSA 3ZX0A 5KQDA 1RGIA 1U2VB 1SQKA 3LDNA 3O6WA 3U8XA 4BRGA 1NGIA 3SMSA 4WQ5C 5ADXH 3WEEA 1ATSA 4GY2B 3GL1A 1NGAA 4BRDA 3EO3A 4JD2A 4JN4A 3WXIA 3WXKA 4JHDB 3CHWA 5AR0A 4CBUA 2VWBA 4NB4A 2A40A 3IUCA 2P9KB 3M1FA 3UKUA 4FO0A 1HLUA 4E1JA 4IO8A 2FXUA 1TYQA 4IWVA 4MO4A 1MDUB 1T6CA 4ISGA 3H1QA 3VEXA 4BRNA 4H0XB 1LCUA 3FZKA 3QFPA 3R8EA 3SK3A 3VESA 3FZMA 4PKIA 4Z94A 1X3NA 5AQNA 2AP1A 5AQOA 1HKBA 1TUYA 3VF4A 3UKRB 1ATRA 5AQIA 4IJNA 2GEMA 3W0LA 2PBDA 2Q97A 3FE1A 4K41A 1H1VA 4FWQA 3EKUA 3R6MA 4H5VA 3ULEB 3LDQA 2E2QA 5KQ8A 2P9IB 3CJ1A 1QZ5A 3SMPA 5AQPA 4KBOA 4CI6A 2Q0UA 1SZ2A 3MN5A 1Y64A 4CZEA 3VEWA 4B1XB 2QWQA 3HI0A 4H0VB 3VGMA 1XC3A 5BPNA 2P9UB 4L3QA 2AA4A 3HTVA 4K25A 1GLEG 1QQNA 3A5MC 4A61A 2P9LA 1Z6RA 3LM2A 4FWMA 3M6GA 3VOVA 4H5TA 4CZIA 3O08A 3DXMB 4RCHA 5AZIB 2W40A 2E8AA 5LJVA 3FZHA 1RDWX 4F9OA 4FOEA 4B1YB 3H3OB 1J6ZA 3IDHA 4HTLA 1HX1A 3A5NC 1C0GA 3CJCA 1Z05A 3ZETA 2FSNA 1NGCA 4H5RA 4PKGA 3SLCA 4BREA 4C23A 5BR9A 2A5XA 3OHRA 2GWKA 2ZGYA 1KAXA 1T6DA 4BROA 3ZX2A 3LM9A 4RWTA 3H6EA 3D2EA 3FGUA 4BRMA 5ELZA 3ZX3A 4K42A 3TU5A 4CZHA 4BRIA 2OANA 1GLAG 3QMLA 4H0TB 4BRAA 5AQZA 4A2AA 5KPRA 3DAWA 2D0PA 2IIRA 3CQXA 2D1KA 3WQUA 4CD1A 3A0IX 1SAZA 1BA0A 3WQTA 4B1WB 4EAHD 2ZWHA 3U4LA 2HF3A 3WT0A 4H5WA 3VPZA 4BQZA 5BN9A 1GLBG 1NWKA 3D2FB 3AAQA 3ATUA 4CZKA 4MLEA 2P9NB 5B8HA 3D7EO 3H45C 2Q2RA 5LJWA 3IFRA 3O5BA 5AQFA 4CZGA 5AZJB 1YXQA 3EZWA 2I7PA 2CH5A 2V52B 4QS8A 5BPLA 3WUHA 4BR2A 4QS7A 4O5FA 3CERA 5AQXA 3KVGA 2WUSA 5AQRA 1BA1A 3CJ9A 3CI5A 3HZ6A 1BU6O 4CBWA 2GUPA 5AQYA 2GWJA 3IMXA 3M3ZA 4BRHA 2CH6A 3FFKB 2QXLA 2YHYA 4EHUA 2ASMA 1GLJO 2E88A 2QWMA 3R9PA 5CE3A 1BUPA 1XQSC 5LY3A 1GLCG 5FPNA 1E4GT 3VGLA 3DXKA 3L6QA 1NGDA 4FOIA 5AFUA 1BDGA 4CJ7A 2EWSA 5AQVA 1NLVA 2V51B 3ULEA 1ZC6A 3G25A 4BC5A 2YCHA 4IZ9A 1ZXOA 3L0QA 2NLXA 3QICA 1S3XA 3MK6A 4BVOA 1DEJA 2Q31A 3U9ZA 5F1XA 4H0OA 3LL3A 2VCPA 4CBXA 1NBWA 2QM1A 2P9UA 3WEEB 2QWRA 1YVNA 1HJOA 3CQYA 3BF3A 3VF6A 1LOTB 4BRPA 2F9WA 4BRLA 3CJ7A 4H03B 5AQKA 5AQMA 1NM1A 4JAXA 3RSEB 1R59O 4BC3A 5EOYA 5AQUA 3FLCO 2QW9A 1DGKN 3DXMA 3GOIA 5AZIA 3MN9A 5EVZA 2YI1A 1XUPO 3L4IA 3GG4A 3ENHA 5EX5A 3BP8A 4B9QA 2HMPA 1NGGA 2E20A 3EN9A 3O1BA 4ISFA 2E1ZA 2W41A 2BUPA 4FPAA 4MO5A 4B1UB 1YAGA 3GE1A 4YDUC 4LC9B 2H3GX 3HM8A 3QDKA 2BTFA 1GLDG 3ENOA 4O8KA 3DJCA 5E84A 3O80A 4FWNA 4NO7A 3AARA 1HKGA 2E2PA 4CD3A 5JLFA 5JLHA 3QFUA 4YDUA 1YUWA 4FWLA 1V4TA 2DPNA 2CGJA 1OKJA 5E26A 3LDOA 3W3DA 4EHTA 4H0PA 1NGFA 3KHYA 3B8AX 1BOTO 2YHXA 2GTDA 3MN7A 4BGBA 3O4WA 3D2FA 3LDPA 5F2RA 3VEZA 1V4SA 2PAVA 1U2VA 3UB5A 2YJEA 2FSJA 4I6MB 1KXPA 3U9DA 1X9JA 2F9TA 2ASOA 5AZJA 3VGKA 1MWKA 1MA9B 3CJAA 5ADXA 2P9LB 1P8ZA 1K8KB 3I33A 3H1VX 4A2BA 4AM6A 1U6ZA 1JCFA 1QQMA 4JHDA 3AY9A 3A5OC 3P4IA 3A5LC 3H46O 4K43A 3C0BA 3C7NB 2P9KA 3J8AA 3FR0A 5AQSA 2I7NA 1X3MA 2IVNA 2IVPA 2E2NA 3FZFA 3ATVA 1ATNA 3JXUA 2P9PB 4FWRA 3ZETB 1ZBSA 4XH5A 1TUUA 1QHAA 5AQJA 4FWOA 3VETA 2P9SB 5FPDA 5EY4A 1T44A 1BG3A 4B1VA 1IG8A 4IJAA 2V7ZA 3VERA 4BC2A 4PL7A 4EFHA 3D2EB 3UKRA 3ZEUB 4RTFD 4GNIA 3SJHA 3O1WA 4DB3A 1CZAN 4BRKA 5AQWA 5KPZA 1IJJA 1HPMA 1G99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQIA 3PLAA 1VSHA 4OX9K 1XNQK 4FYDA 4O5BA 5SWMA 3H3NO 3ID8A 4JNEA 1S1TA 4I9QA 3V9WA 2OPQA 1ZBIA 5EXWA 4KB1A 2Q0RA 1LW2A 1P90A 4BG9A 2ZD1A 1BO5O 3WNEA 4OGEA 3D0PA 1YI2N 1M1KO 4L8RB 5J2QA 2IOCA 2ITMA 2VG7A 1Q81O 4CGGA 4DS4A 1WLJA 4LF8K 3MX2A 2YHWA 5CYQA 3VEVA 4XJXA 3DMJA 2GELA 1TK5A 1WUAA 2BE2A 3MDQA 3AO3A 3DYAA 1SL0A 3DLHA 1Q18A 3ZSYA 3JS6A 3CM6A 4JK8A 4PKHA 2G8KA 2KHOA 1BIUA 4WQ4A 2HHXA 2VGMA 2VWJA 2UXCK 1C0MA 4DV6K 1NGJA 4CF1A 4DQ8A 3ZSQA 3JYTA 2G8VA 5AQGA 3EE8A 3T69A 4WCEL 4MFBA 2DFEA 2VQEK 3SAGA 4KHNA 4NXNK 4EZ6A 4IXCA 3NGZA 4BVPA 5GIOA 4BDPA 1A5XA 3M8PA 2UYTA 2YV0X 1U4BA 1VQLN 4DTUA 4OJRA 1VSKA 4G1QA 5FPMA 3AVGA 3MCPA 2D0BA 1NOZA 1J53A 3QBXA 1GOAA 3DRRA 5BRDA 1XMQK 4NYFA 2JWLA 3HL8A 1D9FA 3TI0A 3AVBA 4CJQA 2J4RA 4DLEA 5AQQA 4MLHA 4X62K 3OY9A 1K8AO 4C1NK 4A59A 2B6AA 1E4FT 5AQTA 3AAPA 3I55N 4R79A 2HBKA 3E9OA 5FPEA 3ID6A 2ZM6K 5FDLA 4YOXA 4WYBA 3RTVA 5MLCQ 1NK0A 2FLOA 1CXUA 1VSEA 4A62A 2BGGA 3TPQA 3LP3A 1NNEA 2NRHA 4JI3K 3QEIA 4H0YB 1WSJA 3LZJA 4KH6A 3ZX0A 1N32K 1I94K 3O6WA 1RTDA 2O8CA 1NGIA 4FLYA 4W5TA 3HYFA 4Z4FA 3CFRA 4UQGA 1A5WA 4YFUA 2RN2A 4FCYA 3RR8A 3CYMA 4DQQA 1RBTA 4BE1A 1NGAA 4YHHK 1B9DA 4AHUA 3IUCA 1IBLK 4CE9A 1U04A 4DSEA 1I3AA 3KK3A 1JLQA 4IWVA 1MDUB 3WNHA 3Q7CA 3T1HK 1S1XA 5C42A 4CEDA 3H1QA 4IG3A 1MU2A 3QFPA 3R8EA 4KPYA 2E6MA 4KO0A 2AP1A 2QA4N 3DM2A 2HHQA 1ATRA 1B92A 3LAMA 3W0LA 4CFCA 5JS2A 3MAQA 1NKBA 3FE1A 3RMDA 5E41A 4FJNA 2ATQA 5FRMA 2IS3A 1QZ5A 4YOVA 5KGXA 1SZ2A 1C0TA 1Y64A 3JSMA 3OYNA 4B1XB 4DR2K 2QWQA 2OPRA 2P9UB 4L3QA 3SUPA 4PWDA 2DY4A 2AA4A 1VSDA 2X78A 4DV0K 4A61A 5CZ2A 3V1QA 2YNFA 4N5SA 3LM2A 3OYEA 4FWMA 1S72N 4CZIA 4DU1A 4RCHA 2W40A 5LJVA 4DV5K 1KFSA 4KTWA 3V1RA 4CIGA 4E1NA 4AHTA 3H3OB 4DQSA 5C12A 3SNNA 4HTLA 4ELTA 2YHAA 4DR3K 1C0GA 3VMFB 4H5RA 4PKGA 4CJVA 2FBTA 4C23A 4IFVA 2EX3A 5BR9A 2YHBA 4M3ZA 2A1RA 3CCQN 3OHRA 4M3YA 2GWKA 3LM9A 3D2EA 4B8CA 4DV7K 1ASVA 4K42A 2PYJA 4IBNA 4BRIA 5AQZA 4A2AA 5KPRA 4ELVA 2IIRA 2QI2A 3WQUA 3SV4A 3U4LA 2HF3A 3ZT4A 3VQ7A 3VN5A 1VQ9N 4E1MA 3OYIA 3LPTA 1VRUA 3DOKA 1HPMA 3S3NA 3TAPA 4LF9K 1KC8O 3EZWA 4QS8A 3RRHA 2XRIA 4CEOA 3ENBA 1I39A 1ILYA 3KVGA 3NF7A 1WBBA 1WSEA 3CI5A 1BU6O 1YVUA 5AQYA 3VTHA 1ZBFA 2AJQA 4BRHA 2CH6A 3FFKB 4BE2A 2YHYA 4B9MA 2HSTA 3R9PA 2W00A 4C8OA 1YJWN 3KK2A 4FJXA 1X1PA 1XHXA 4Z4IA 1NGDA 4FOIA 1BDGA 1NLVA 2V51B 1Q7YO 1VQ5N 5GINA 4BC5A 4KHWA 1TL1A 4F4KA 4R5PA 1YHQN 1ZXOA 1NK7A 3KLIA 1WN7A 2WONA 1K9MO 1S3XA 4DUYK 4NYNA 1NBWA 3J80O 1TVRA 5M1OA 3CQYA 3VF6A 1LOTB 4F3TA 4JYAK 4OPHA 5FROA 2VG5A 4AQYK 1ZYQA 5CYMA 4DSLA 1VAZA 1LAVA 4FZZA 1JLGA 3LWLA 1EX4A 5AQUA 2QW9A 1DGKN 3MEEA 1QTMA 3L4IA 2QKBA 5EX5A 3BP8A 4ILJA 4M3TA 3L2QA 3NVMA 2E20A 3EN9A 3O1BA 3NH0A 2GX9A 3J7ZO 2BUPA 4EP4A 1Q9YA 4FPAA 4FLWA 4B1UB 4JI2K 1YAGA 2FC0A 4K8ZA 3QERA 2H3GX 3LDSA 2BTFA 3M8RA 1VSIA 3IS9A 3DJCA 1OH7A 2O8EB 3UIQA 4DV1K 4OPKA 1Z26A 4CEBA 4E19A 4YDUA 4FWLA 2YNIA 1OKJA 1SL1A 3KD5E 3OYFA 3VQ5A 1EWRA 3ZSXA 4X64K 3PO4A 1RBSA 1S1WA 3VA0A 2WTUA 3MN7A 3RR7A 5JENA 2VWKA 5F2RA 4A5AA 2VQFK 1NJYA 4FK2A 4IEIA 4LH5A 2ASOA 3C6HA 5AZJA 4KHUA 1MWKA 4DQPA 1XC9A 3NGIA 2YNGA 3I33A 3SCXA 4Y1CA 3U6FA 1L3UA 3OYKA 1Q82O 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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