1DGKN

Mutant monomer of recombinant human hexokinase type i with glucose and adp in the active site
Total Genus 343
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
343
sequence length
898
structure length
898
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDRAIDAYSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGANFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structures of mutant monomeric hexokinase I reveal multiple ADP binding sites and conformational changes relevant to allosteric regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE TYPE I
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 343
structure length 898
sequence length 898
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1999-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
N PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dgkN01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1dgkN04
1KAYA 4HWIA 5FPEA 2I7PA 3H3NO 1Z05A 4FWKA 3GOIA 1E4GT 1HUXA 3CJAA 3RSEB 4M7XA 3CIPA 3QMLA 4XH4A 4EHTA 3VEOA 3QBWA 3J8AA 4BQZA 3UKRB 3LL3A 4BRDA 1HKBA 4BRIA 2FLOA 4ISGA 4NO7A 5AR0A 5FPMA 1TUYA 1NGFA 3VF4A 5FPDA 1MWKA 2P9LA 1K8KA 3VEVA 4JHDB 2F9TA 4AM6A 3HTVA 1T44A 5E84A 2YJFA 2P9PB 2DPNA 4FPAA 3GDQA 5AZJA 1MA9B 4Z94A 2EWSA 3VESA 3BF3A 4MLHA 3H1VX 4H5NA 3DJCA 3ZETA 1V4TA 3VF2A 3D2EA 4H0TB 1QQOA 3CERA 3GL1A 3IMXA 1NGJA 1QHAA 3HSCA 5AZIA 2GELA 3H1QA 4LC9B 3TU5A 2QW9A 4IJNA 3O5BA 3ZEUA 1LCUA 4B1XB 1X9JA 4BGBA 3D2FA 4RCHA 4EHUA 4H5VA 4CD1A 4IWVA 4DHYA 5AQIA 3KVGA 3ZX2A 4A61A 4A62A 3L4IA 5LJWA 3VEYA 4BR0A 5TKYA 2P9LB 3WEEA 4O8KA 3MDQA 1K8KB 5LJVA 4QS7A 2KHOA 3U4LA 5EXWA 3VGKA 5EVZA 4CZFA 4JD2A 2GWJA 2NLXA 3ULEB 5CE3A 4DB3A 2W40A 3I8BA 3ATVA 2E8AA 4JNEA 5AQVA 4CZMA 1ZXOA 1BOTO 1GLLO 5AQPA 3MN5A 3M6GA 3ZETB 3D2EB 5JMVA 3WT0A 4Y0WA 3H6EA 3MCPA 1NGCA 2UYTA 5AZIB 1WOQA 3QBXA 5BN8A 3GG4A 4BRAA 4CZLA 1CZAN 5BR9A 5AQOA 3O6WA 4M63C 4XEIA 1BDGA 4B1UB 3ZEUB 1XUPO 1DKGD 2V52B 3D2FB 4DQ8A 5BRDA 1NGGA 2AP1A 5AQHA 4BRKA 3AARA 2FF6A 4BC3A 1TUUA 4H0YB 3CJ7A 4MLEA 4BRMA 3WXJA 4MO4A 4K25A 3P4IA 3WEEB 3C7NB 1D4XA 4BR5A 5AQNA 4EFHA 3U8XA 2YHWA 2YI1A 3WUHA 5AQWA 2P9NA 4BREA 5F0XA 4JD2B 3O1BA 4H0XB 3BF1A 3DWLA 3CETA 2VWBA 4FOIA 1GLFO 3BP8A 3QB0A 4BRQA 4BR4A 3DXMA 4K43A 5AQQA 2Q1NA 2FSNA 4B1ZA 2QWMA 3CJCA 5AQJA 2E2NA 5AQGA 5BRFA 3LM9A 1YUWA 5KQ8A 3FFKB 3H45C 2GTDA 3GE1A 1ATNA 1S3XA 4RTFD 1ZC6A 4BR2A 3ZX0A 4QS8A 1NLVA 3VGLA 2D4WA 2HF4A 5AFUH 3WQUA 2I7NA 4B1VA 4BQLA 5I9EB 4BR7A 1JCEA 3LDPA 2A40A 3OHRA 3EL2A 3CQXA 4CZGA 2P9NB 2YHXA 4CZJA 3CQYA 2E2PA 2P9IA 3LM2A 4WQ4A 1RDWX 5JLFA 4BR9A 3ENHA 3VEXA 2E2OA 3SLCA 3IDHA 4FWPA 4QS9A 4CBWA 1DEJA 1HJOA 2V7ZA 4H5RA 3O80A 4WQ4C 3I33A 3QICA 3DXMB 5AQUA 2ASPA 1HLUA 2Q0UA 5EOYA 5F1XA 2BUPA 3SJHA 3S41A 3QDKA 3HM8A 2H3GX 3JS6A 2BTFA 4MO5A 2HOEA 3DXKB 1NBWA 4JN4A 2IVOA 4CD3A 3A5MC 3M1FA 4PKGA 2QWPA 3D7EO 4JAXA 4C23A 5BPNA 2AA4A 1E4FT 2PAVA 1OKJA 3IUCA 4H5WA 4I6MA 4PL8A 4BVOA 5BREA 3M3ZA 3FZFA 4BRGA 3A5LC 4CZHA 4BVPA 3WXIA 5ADXH 5AQXA 1QZ5A 3R6MA 1YXQA 4FWNA 1GLDG 3AAQA 3UE5A 3R9PA 3O1WA 1HKGA 2E1ZA 1BA1A 5BPMA 1QZ6A 4K41A 1MWMA 1DGKN 1IG8A 5AQFA 3WQTA 5AZJB 4CZEA 1MDUB 1BU6O 3EO3A 1HPMA 4B1WB 3IFRA 4FWSA 5JICA 5EX5A 4ISFA 4WQ5A 2NRHA 3L0QA 3FGUA 4FOEA 1NM1A 5KPZA 1C0GA 3CJ9A 4BRLA 4BRFA 5F2RA 2FF3B 3A0IX 3FE1A 3UB5A 3CJ1A 4WQ5C 1KAXA 4PL7A 3MMVA 4PKIA 3HBTA 4BG9A 4BGAA 2NZTA 4I6MB 4M7YA 2J4RA 4FO0A 3KZBA 3MK6A 2FSKA 3UKUA 1NGAA 1QQMA 1LOTB 2QM1A 2P9KA 3ZX3A 2D0PA 3R8EA 2QWNA 1ATSA 3C0BA 5LY3A 3A5NC 2Q0RA 3H3OB 5BRHA 3EN9A 2IIRA 3F9MA 1R59O 2ZWHA 4EAHD 5KPTA 4FWQA 2F9WA 3LDNA 3VENA 2E20A 2A3ZA 1RGIA 3KHYA 3SK3A 1GLEG 4H03B 4GY2B 4FWOA 4AM7A 1SZ2A 4CBUA 1GLBG 2P9UA 4RWTA 2P9SA 4FWRA 1GLCG 2FSJA 3O8MA 1HX1A 1Z6RA 2Q97A 4CZIA 2V51B 2QWRA 4KBOA 1KXPA 1YVNA 2ASOA 3W3DA 4JHDA 3UKUB 4FWLA 2ZGYA 2P9PA 5AQZA 1BO5O 1JCFA 2P9KB 3SMSA 1HKCA 4BRCA 2E88A 3FLCO 2IVPA 1U2VA 2CH6A 1BWFO 3EZWA 2QWQA 3QFPA 3AAPA 2A6AA 1TYQA 1NGIA 2YCHA 3SMPA 1BA0A 5BPLA 1NGDA 4FSVA 3W0LA 5AQRA 3FZMA 5EY4A 2Q2RA 3L6QA 1C0FA 5AQMA 3QFUA 4BRPA 4ISEA 4WYBA 3B8AX 4BRNA 1X3NA 4NB4A 2P9UB 2V7YA 2P9SB 3ID8A 2ASMA 3BEXA 1XC3A 1JCGA 3LDOA 3ATUA 3VF6A 3FR0A 5KQDA 5AQYA 4FL9A 2CH5A 3ENOA 4CZKA 1BUPA 1V4SA 2QXLA 4O5FA 2HMPA 5KPRA 3O08A 4K42A 3A5OC 1YAGA 4CJ7A 1SAZA 3WXLA 3CJBA 2D1KA 3ULEA 2E2QA 3H46O 1U2VB 4H0PA 5JLHA 3GBTA 2CGLA 2GUPA 3G25A 2ZGZA 4BRHA 2PBDA 1TYQB 4BROA 4H5TA 3VETA 2QWOA 2P9IB 4H0OA 1XQSC 2CGKA 2A5XA 4E1JA 3JXUA 4XH5A 4H0VB 3EKSA 1GLAG 2FXUA 2W41A 1EQYA 3U9ZA 5FPNA 4IXCA 4A2AA 1QQNA 5ELZA 1RFQA 3LDQA 3VOVA 3TPQA 2CGJA 4F9OA 1H1VA 1IJJA 1J6ZA 3LDLA 2VYPA 4CI6A 1BG3A 4DCHA 3C7NA 1ATRA 4IZ9A 2QWLA 2VCPA 5AQKA 3BUZB 5AFUA 3FZLA 2E1YA 3FZHA 2IVNA 4YDUA 5AQTA 2GWKA 4L3QA 3WXKA 1SQKA 3A8YA 3MN6A 2HF3A 4GNIA 2A41A 4YDUC 1Q18A 1ZBSA 2Q36A 3O4WA 3U9DA 3CHWA 4HTLA 1WUAA 4XH1A 3HI0A 3FZKA 1U6ZA 4BG8A 3AY9A 3VERA 3VEWA 5AQSA 5BN9A 3VPZA 5E26A 4BC5A 1P8ZA 5B8HA 3RSEA 4CBXA 4A2BA 1T6DA 3MN9A 3VGMA 1T6CA 1ESVA 3UKRA 2YHYA 4BC2A 4B1YB 2ZF5O 2YJEA 3DAWA 2D0OA 4BC4A 3EKUA 3MN7A 1NMDA 2A42A 3CI5A 3HZ6A 4PKHA 1Y64A 4FWMA 4FPBA 1KAZA 4J8FA 4IJAA 3VEZA 2Q31A 5ADXA 5AQLA 2ITMA 1NGBA 1GLJO 4EIAA 4IO8A 2GEMA 2OANA 1NGEA 1NGHA 1S22A 1NWKA 4B9QA 2WUSA 1X3MA 3DXKA 1G99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KAYA 2QEXN 4FLVA 3CCVN 4FW1A 3TSQA 1J5EK 3CJAA 5LMUK 2PY5A 2O8DA 1WSFA 1S1UA 4DQRA 2XY7A 4K8ZA 1WN7A 5FPMA 3THWB 3P39A 4TSXA 5FPDA 4DR7K 1K8KA 4CHYA 4AM6A 3MXJA 1T44A 3WNEA 2YJFA 4FLZA 3WNHA 4R5PA 2IOCA 4CJTA 3LPUA 4E7KA 3KKRA 5DM7L 3I0RA 4FK4A 1RT1A 1W2BM 1NOYA 3NH0A 4ID5A 3TABA 2O8DB 1ZBFA 1RBSA 3WNGA 3ZEUA 5DK5A 1RILA 3D2FA 3QINA 2RF2A 4CIEA 4DHYA 4DS5A 3ZX2A 1U49A 3V9UA 4IOAL 3U3YA 4DTOA 3L4QA 1KC8O 4JI8K 3AO3A 1ASVA 4O8KA 3MDQA 4DFKA 1K8KB 3AVAA 1NJWA 2ATQA 3V9WA 4MQ3A 1NK5A 5EVZA 2OPPA 4CZFA 4PQUA 2KFZA 4DB3A 3L2UA 3ATVA 5J2MA 2X78A 1BOTO 4HUGA 1TVRA 1JLEA 1TKDA 4CEFA 1VQ8N 3O3FA 4C8MA 2PYLA 4BRAA 4CZLA 4Q5VA 3OYCA 1TK0A 5BR9A 3O6WA 4B1UB 3ZEUB 1BQNA 3D2FB 1NJZA 4BRKA 2FF6A 1ILYA 3CJ7A 1N34K 1XHXA 1YJ9N 1RTJA 2YV0X 4PA1A 1QSYA 4OJRA 2O8EA 2YHWA 2YI1A 5AQWA 4WFNL 4FJ7A 2HHQA 3AO2A 4JRPA 4AHCA 3CFOA 3DWLA 4J2BA 4QOZB 3HL8A 1GLFO 4BRQA 5FLXO 4BR4A 3S3MA 2Q1NA 3HYFA 4B1ZA 3CJCA 4W5OA 1IG9A 4DV2K 3ZSXA 5BRFA 3KK1A 1OH5A 2AJQA 1YUWA 4F3TA 2YHAA 4JK9A 2GTDA 1FW6A 3ULDA 1S9EA 1ZC6A 2HHVA 4BR2A 2NRXA 1NLVA 5AFUH 3UIQA 1S9GA 4JS5A 1JCEA 4B8CA 4WCEL 3PLAA 2UXCK 2A40A 3OHRA 2O8EB 3CCSN 3CQXA 4CGJA 4KV8A 4CZGA 3VQ5A 4LF5K 3CCQN 3CQYA 3HJFA 3LM2A 1RDWX 3VEXA 3V9SA 1WSIA 3LANA 4CBWA 1DEJA 4H5RA 3TARA 3TAMA 3O80A 1LV5A 1CZ9A 2XO7A 3ZT0A 4CIGA 3I33A 4KHQA 3KIOA 3NVKA 2ASPA 2HVIA 5I3UA 5EOYA 3M8SA 3IAYA 2BUPA 2P5GA 3SJHA 3KD1E 2HB5A 3HM8A 2H3GX 4NLBA 1CXUA 2HOEA 1NBWA 4CD3A 3A5MC 2HBMA 1OH8A 3DLBA 4ELUA 1VSKA 4I2QA 4C23A 4CF0A 2AA4A 1E4FT 3N4QA 4CHZA 2XY8A 3VQDA 3IUCA 4H5WA 5BREA 4BDYA 4M41A 4JV5K 4CJ5A 3FZFA 3K5MA 4BRGA 4CZHA 3SI6A 4W5QA 4KHSA 3NGYA 3WXIA 4FWNA 4LFAK 5CYMA 3NFAA 1GLDG 4DTRA 4GKJK 3O1WA 4O44A 4KI4A 3OYMA 2HHTA 5BPMA 4K41A 3DLLL 2ZJPL 4CZEA 4L8RB 4BE2A 4XIUA 4CECA 3SUOA 1HPMA 3O3HA 3V9ZA 5JICA 2F96A 3K9JA 3VTIA 1LW2A 5EX5A 1RBRA 4WQ5A 3T7ZA 4DTMA 3L0QA 2IC3A 3HP9A 1T03A 3FE1A 3UB5A 4PL7A 1L3SA 2ZJQL 5C2FA 2RKIA 4KRFA 4FO0A 1QQMA 3EE9A 3P31A 1KRPA 3ID6A 3MCAB 2A1SA 5JS1A 3T1HK 1N5YA 1VHXA 3C0BA 4O55A 5LY3A 4B3RK 2Q0RA 1TK8A 4KH4A 3K58A 4DV3K 5GAHP 1BGXT 3OYGA 3ZSWA 4NYFA 4JI5K 2A3ZA 4HCBA 2F4VK 1GLBG 2P9SA 2JWLA 4B9SA 3HPHA 4KB0A 3CD6N 1HX1A 4DR1K 2QKKA 4CFDA 2QK9A 4NYNA 2QWRA 1VAZA 1KXPA 3RRHA 1D9DA 1YT3A 1J53A 2VG6A 5C2DA 3OYIA 4CGIA 4KKOA 4CF2A 3NH2A 2P9PA 1JLCA 3CCJN 4JI6K 3SMSA 1XMOK 3NMUA 1RDUA 1K73O 2QI2A 3L8BA 3EZWA 4Q0BA 4YOUA 4FXDA 3S3NA 3AAPA 4KB1A 4GV3A 4N76A 2YNIA 4DS4A 4C1NK 4X62K 3V1QA 4KHNA 5AQMA 1IH7A 3HVRA 3SAHA 1RT6A 3L3UA 3B8AX 2DFHA 4BRNA 2P9SB 3OJSA 4C8OA 3KD5E 1XC3A 1TK5A 1M90O 3FR0A 1NK0A 2HHWA 2CH5A 3HOTA 1L5UA 1BUPA 1V4SA 3OS1A 4O5FA 2QXLA 3I0SA 4C8KA 5FRNA 3A5OC 1SAZA 3CJBA 1E3MA 3K2PA 3KKSA 3VA0A 4DTXA 2BE2A 3GBTA 4A5AA 3OBWA 5HBMA 3L2RA 3VETA 1HR0K 1JLFA 1BI4A 4CHOA 1S1TA 4E1JA 3MAQA 1NK6A 4DSLA 4XH5A 4DSFA 4G1QA 3TAEA 2YHBA 4A2AA 1RFQA 5KGWA 3VOVA 3IRXA 3TSUA 4OO1J 3C6UA 2D0BA 3CM5A 1J6ZA 4HCCA 3DLEA 3C7NA 3KLFA 3OYLA 1ATRA 4FZZA 5AQKA 3FZLA 2Y1JA 3L3VA 5AQTA 4HVJA 4ILJA 3WXKA 3L2QA 2OPSA 1SQKA 4JI3K 2HF3A 4YDUC 4OKJA 4JKDA 4CF9A 4DV0K 1R0AA 3K5LA 3O4WA 4DFJA 4ILGB 3U9DA 4ZTJA 4EZ9A 1VQ7N 3KK3A 2LSNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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