4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
3ULEB 4MLEA 3LDLA 3HZ6A 4HTLA 1ATNA 2E1YA 2GELA 4CBXA 2FF6A 5AQZA 1RGIA 3UE5A 4YDUA 3P4IA 2P9KB 1KAXA 1ATRA 3D2EB 3BUZB 4QS7A 3SMPA 4M7YA 2FF3B 4O5FA 4BC2A 2E20A 4JHDA 2E2OA 4BROA 2UYTA 4ISEA 2FSJA 2Q36A 1S3XA 4XH1A 4BVPA 3EZWA 4XH4A 4CD3A 4BC5A 2HMPA 1BDGA 2IVPA 2P9SA 1TYQB 1GLCG 3GE1A 3H45C 3ZX0A 3GBTA 3QDKA 5ADXH 4FPBA 2A3ZA 5F0XA 3DWLA 3UKRB 1YUWA 4BC4A 2F9TA 2P9IB 3AAPA 5AQRA 1SZ2A 1NGAA 1Z6RA 5LY3A 2CGJA 4H0PA 5AQYA 3SMSA 3WXJA 3CJ9A 3VETA 4QS9A 4XH5A 2CH6A 4Y0WA 3EKSA 5AZJB 4H03B 3TPQA 2HF4A 1MWMA 4BR7A 2J4RA 3U9DA 1NGIA 4BR0A 1LCUA 5FPEA 2CH5A 3O08A 4BG8A 4RCHA 3VF4A 3KVGA 2FXUA 5F1XA 4FWLA 2CGLA 4H5WA 5B8HA 3VEXA 2ASOA 3EKUA 1HPMA 1EQYA 3ZETB 1XUPO 5BREA 3GOIA 3IMXA 3OHRA 1HKCA 4FPAA 5AZIA 4C23A 4I6MA 3UKUA 2W41A 1QQMA 4JAXA 1T6CA 2AA4A 4JHDB 3G25A 2ASPA 4FWOA 1MWKA 4BRNA 3EL2A 3FZKA 2V7ZA 3DJCA 3BP8A 3CJ1A 4H0VB 3O1BA 3M6GA 2P9SB 4M63C 4CZMA 4H5VA 1GLFO 3VENA 4JNEA 3FLCO 3D2FA 1ESVA 3IDHA 3BF1A 2NRHA 5BPNA 1ZC6A 3LDPA 5AFUA 4B1VA 4IJAA 4BGBA 3SJHA 2YJFA 1QQOA 2Q31A 5E26A 1NGBA 3MDQA 3VF2A 4Z94A 1K8KA 3FZMA 3GL1A 3CI5A 3IFRA 4MO4A 5JLFA 2E2PA 2CGKA 3WXLA 3VERA 2DPNA 1BA0A 1IG8A 3VEWA 2V52B 3ENHA 3DXKA 2QW9A 5EY4A 2YI1A 3VEZA 4AM7A 3FZLA 3MCPA 4BRQA 1NWKA 5AQWA 4KBOA 1JCGA 1WUAA 2QWRA 3R6MA 4RTFD 4CZIA 4BRPA 3L4IA 2NZTA 3U4LA 4CBWA 1Z05A 3H46O 4NO7A 3LM2A 1SQKA 4WQ4C 4CZFA 2P9NB 3CJCA 3JXUA 2KHOA 3ZX3A 4BRCA 2HF3A 3FR0A 5AZIB 1C0GA 4JD2A 4I6MB 4BR4A 2YHYA 4A61A 3A5OC 5BPMA 4FL9A 1R59O 3O6WA 4H0YB 1J6ZA 3LM9A 4CJ7A 4CZKA 5KPTA 5FPMA 1TUUA 4K41A 5AQHA 1SAZA 3H3OB 4FWKA 3TU5A 3D2FB 1YXQA 4JN4A 4EHUA 4B1ZA 1NGEA 4BR5A 4PKIA 4B1YB 2W40A 4BGAA 2GWJA 3JS6A 4H0XB 1NGDA 5ADXA 4BRLA 3A5MC 1HJOA 4RWTA 3O4WA 4WQ5A 1QZ5A 1BG3A 1JCEA 3D7EO 3HBTA 4IWVA 3CJBA 1BUPA 2GTDA 1XC3A 2ZGYA 1GLAG 2GEMA 2I7NA 4L3QA 2QWNA 3VGKA 3VESA 1HUXA 4B9QA 3W3DA 2ITMA 3ATVA 1CZAN 3ZEUB 3AY9A 2P9LB 2A41A 4CZGA 4DCHA 5AQFA 3L6QA 4EHTA 3WT0A 4F9OA 3F9MA 4BR9A 4YDUC 3I8BA 1YAGA 3U9ZA 2YJEA 1NMDA 5BRHA 4H0TB 1MA9B 3O8MA 5KPRA 2QWQA 4JD2B 4CZHA 3ZX2A 1HKBA 2A5XA 2BTFA 1NGHA 4H5NA 2FSKA 5F2RA 1GLDG 2A40A 2EWSA 4FWMA 1NGGA 2GWKA 3LL3A 3EN9A 4FSVA 4MO5A 3ENOA 2YCHA 5AQMA 2E2NA 3HI0A 1NLVA 1Q18A 2VWBA 4CZLA 3MK6A 3RSEA 4PKGA 3VPZA 1T6DA 5BRDA 4FWQA 3B8AX 2Q2RA 3CQYA 3H1VX 2D1KA 3ULEA 4ISFA 3VOVA 2A6AA 5BR9A 5BN8A 4E1JA 4K25A 5AR0A 3WXIA 4K42A 4K43A 1DGKN 3A5LC 4CBUA 1GLJO 3VEYA 3MMVA 2AP1A 3QICA 4BR2A 3M3ZA 1LOTB 4GY2B 5CE3A 3WQUA 3VGMA 1DEJA 3I33A 5AQLA 4PKHA 3MN5A 3CHWA 5KQDA 2PBDA 4FWNA 4QS8A 1GLLO 5JICA 2I7PA 2GUPA 4M7XA 2QWMA 2QXLA 1E4FT 2OANA 5KPZA 5EX5A 2IVOA 5E84A 4H5TA 5FPNA 1U2VA 1D4XA 4BRAA 4CI6A 3FZHA 4BQLA 3FFKB 4FWRA 3HM8A 3QFPA 3DXMA 3VGLA 3SLCA 5AQVA 4A2BA 5EXWA 3C7NA 1ZXOA 3J8AA 5AQKA 4EIAA 5AQXA 1P8ZA 1RDWX 2D0OA 5AQUA 2FSNA 3CETA 3H1QA 3UKUB 3QB0A 3IUCA 4BREA 4FO0A 3CJ7A 2P9PA 2QM1A 3AARA 4EAHD 2FLOA 3LDQA 4BQZA 3O80A 1S22A 3VEOA 1HX1A 3H6EA 1TUYA 4BRIA 3A0IX 1V4TA 1IJJA 2YHWA 3RSEB 3MN9A 2E1ZA 2V51B 2YHXA 3QMLA 4BG9A 3QFUA 1BOTO 1XQSC 4BVOA 5AQNA 4HWIA 1KAZA 4FOIA 1KAYA 2P9UA 3L0QA 3A8YA 3FGUA 3QBWA 5AQSA 1H1VA 3ZETA 3H3NO 4DQ8A 5JMVA 1K8KB 5AQIA 4PL7A 1RFQA 3CIPA 1QZ6A 4CZEA 3O5BA 3MN6A 3UB5A 1X3MA 3WEEA 4LC9B 3DAWA 4CD1A 3O1WA 4CZJA 3CQXA 3MN7A 5BRFA 3DXKB 1U2VB 1Y64A 4BRMA 1QHAA 3ID8A 1BWFO 1HKGA 5KQ8A 3DXMB 2V7YA 1KXPA 1JCFA 2F9WA 3BEXA 2ZWHA 3BF3A 4BRKA 3EO3A 2QWLA 3WXKA 3C7NB 2HOEA 3QBXA 5FPDA 2QWOA 3HTVA 4NB4A 3WUHA 1MDUB 4WYBA 1HLUA 4FOEA 4A2AA 2P9PB 1WOQA 2IVNA 2NLXA 5LJWA 2E8AA 2E2QA 2Q97A 5AQTA 2VCPA 1NBWA 1GLBG 1BU6O 1V4SA 2WUSA 4J8FA 3SK3A 5AQGA 2D0PA 3LDOA 4B1XB 2D4WA 4FWPA 2ZF5O 5I9EB 1GLEG 3CERA 3GDQA 4WQ5C 2P9UB 4IZ9A 3AAQA 3FE1A 4BC3A 1E4GT 1NGFA 4BRHA 3VF6A 4XEIA 5ELZA 2PAVA 5LJVA 2P9NA 3M1FA 2IIRA 1NGCA 2ZGZA 1BO5O 5JLHA 2Q0UA 4AM6A 4FWSA 1BA1A 5AQPA 3S41A 2P9KA 3CJAA 3D2EA 5BPLA 4MLHA 3WEEB 4EFHA 3A5NC 1NM1A 4WQ4A 2QWPA 4H0OA 5AQQA 3ATUA 4IO8A 4IJNA 3VEVA 1OKJA 2E88A 1G99A 4O8KA 3HSCA 4BRGA 1X9JA 3R8EA 3LDNA 5AQJA 5TKYA 4B1UB 5AFUH 1TYQA 4PL8A 2A42A 3UKRA 4H5RA 5BN9A 5AQOA 2P9IA 1ATSA 3KZBA 2Q1NA 2H3GX 1NGJA 1U6ZA 4BRFA 3KHYA 1C0FA 1YVNA 4B1WB 4DHYA 3GG4A 1QQNA 3U8XA 4A62A 5EOYA 5AZJA 2Q0RA 4BRDA 1DKGD 4IXCA 3WQTA 3ZEUA 2P9LA 1ZBSA 3R9PA 3FZFA 4ISGA 3W0LA 4DB3A 5EVZA 1T44A 4GNIA 2VYPA 1X3NA 3C0BA 2ASMA 2BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ULEB 3LDLA 1JLQA 3TSPA 4U67L 2YNHA 2B6AA 1RGIA 1YT3A 5KGXA 1XHXA 4CEEA 3CG7A 3P4IA 2P9KB 1ATRA 1WWNA 4QS7A 3CFPA 4M7YA 4M3XA 2UXBK 1KC8O 3SPZA 4O5FA 1YIJN 3DLGA 3VMFB 5LMUK 1M1KO 4JKBA 2M8BB 4FLZA 2B3CA 4ISEA 3KTQA 4NYNA 1JLEA 4O8UA 4BVPA 1T3VA 1VRTA 4CD3A 3KD1E 4IOCL 1BDGA 1HYSA 3H45C 3GBTA 3K9JA 3RWUA 3HJFA 4FPBA 2E4LA 4BC4A 4AILC 2P9IB 2HHSA 3ZCMA 2FBVA 2O8FB 3AAPA 3NGZA 3RMCA 4CE9A 4H0PA 4I7FA 4ICLA 4QS9A 4Y0WA 4GKJK 1U47A 1MWMA 4ZTJA 3VTIA 3CCUN 1NGIA 4Y1CA 3KLFA 4OKKA 1PX9A 5C2DA 1BIZA 4CESA 3TSQA 3CC4N 2CGLA 5FDLA 3HP9A 3Q7CA 1WSGA 2B5JA 2Z1HA 4WFAL 3KLEA 4KTWA 2FBYA 1XUPO 3V1RA 3OHRA 2YEOA 4FPAA 1SNBA 1WLJA 1RBSA 1KV0A 3AVAA 4DKWA 3G25A 3DLEA 4AHVA 5GAGP 5TKWA 4BRNA 3LWMA 2V7ZA 3MWTA 2YHBA 3O1BA 3M6GA 3PSMA 4M63C 4CZMA 2HHXA 1GLFO 1SKSA 4A59A 1IBKK 2HNYA 3NF8A 1BCMA 4LSLA 3D2FA 1Y97A 3IDHA 4OPJA 5BPNA 3AA3A 3IG1A 4GVEA 4IDHA 2Q31A 3AVCA 2RPIA 1FH3A 1BCGA 5E26A 2A1SA 4OPHA 1X9WA 2O8EA 5JLFA 2CGKA 4CGFA 3VQ7A 3CCMN 5CY4A 1VSHA 1RTIA 2OPRA 2WFBA 2Y1IA 3VEZA 1SL1A 4NCBA 3FZLA 3IS9A 3MCPA 1NWKA 1WUAA 4KYPA 4RTFD 3K0SA 2KZMA 3U4LA 4CBWA 1S1XA 3NGYA 4AHUA 1CZBA 3HYFA 4NO7A 3O4QA 3THXA 1T1TA 2LKBA 1SL2A 2QKKA 4E7KA 2P5OA 3DM2A 2HF3A 3FR0A 1C0GA 4JD2A 4BR4A 1NKEA 1FJGK 3VQ9A 4R5PA 4N47A 1IKXA 1T0ZA 2LN8A 3O6WA 4CHNA 2G8KA 2YV0X 1EWRA 3D45A 4C8KA 3P1GA 3LP0A 4JKDA 1JLFA 1SAZA 3H3OB 4FJ5A 1BQNA 4GV6A 3D2FB 4CHOA 4EHUA 1UAXA 4CJ5A 3OYNA 4OO1J 1EKEA 4B1YB 2G8VA 4LFCK 4YOUA 1MR4A 3A5MC 1HJOA 1CXQA 2O8EB 4YOTA 3HVRA 1T05A 1RT1A 2GTDA 1QHTA 4CHQA 3OYLA 4KREA 4PY5A 3MEDA 3K5OA 4F3TA 2GL1A 4JKAA 3QI7A 3N4QA 3NF7A 3OJUA 3AY9A 4CEFA 1FW6A 4CZGA 2F8SA 2DFFA 3L6QA 2IS3A 3WT0A 3WNHA 3U3YA 5C0YA 1ZBUA 1HJRA 4WCEL 2VG6A 1NK4A 3VQAA 4CGDA 1YJ9N 1LQIA 3THXB 2KYQA 1CN2A 4H0TB 1MA9B 2LI7A 4JD2B 2W00A 4X64K 1JXBA 5C10A 4CJSA 4OVLA 1GLDG 3PV8A 1JXCA 4RW7A 1NGGA 2E6LA 4CJQA 1VQKN 3C94A 3EN9A 2HHHK 1JJ2M 3SBGA 2R7YA 1I6GA 2GV9A 2O8CA 4MO5A 3DRRA 4M41A 2YCHA 3WXMB 2O8BA 1Q18A 3E9LA 3MK6A 2D0AA 4I2PA 5SWMA 4PKGA 1T6DA 2P51A 4DFPA 2Q2RA 1NU0A 3H1VX 5BR9A 4ISFA 4E1JA 3SV3A 4DQSA 5AR0A 3VEYA 2AP1A 3QICA 3R1XA 4FLVA 1OZZA 3RMBA 2ETJA 1GLLO 5JICA 2I7PA 4IFYA 3CCRN 4M7XA 1CXUA 1E4FT 5EX5A 4H5TA 1VHXA 4CFBA 3OBYA 4JRQA 2OPPA 4CI6A 3OYDA 3PY8A 3HM8A 2HHQA 3OVNA 2ZE2A 4CERA 5FRNA 5EXWA 3QERA 1ZUTA 2HBMA 1BCOA 3J8AA 4LH4A 4EIAA 5AQXA 2E5LK 1I2VA 2GBZA 3QB0A 3IUCA 4EP5A 5HRSA 4FO0A 4N56A 3WNGA 2O8CB 1BISA 2QM1A 3E7RL 3O80A 1S22A 1LW2A 4DR3K 4NCAA 3L4QA 2O8BB 4A57A 4BRIA 3A0IX 2LY6A 1IJJA 3ZSXA 1ASUA 1EP4A 2E1ZA 3ZT2A 2VWKA 4IDKA 3QMLA 4M45A 4HUGA 3TTDA 3TANA 1XQSC 4BVOA 2JGUA 1JL1A 5AQNA 1IBLK 1RCHA 1U4BA 4E72A 4AH9A 5AQSA 1SS6A 3E9PA 1S9EA 4AF1A 4DU4A 1J53A 4GKKK 3MX2A 2RKIA 3QEIA 1NK5A 1GOAA 1HNIA 4CZEA 2GMOA 3EZ5A 4CJ3A 4IEIA 4DQQA 4JLHA 1X3MA 3NGIA 4W5NA 4ILJA 5GINA 1L5UA 2Y1JA 3O1WA 1BMRA 4UADE 4FK4A 1HQUA 1BWFO 3TAEA 1N36K 1IV0A 4GVMA 3LANA 4DV4K 1LAVA 2V7YA 4RW6A 4H4OA 2QWLA 1DJTA 3LP2A 4DR7K 4HCCA 1E3MA 2XO7A 4ID5A 3M8SA 3WUHA 1MDUB 3V9ZA 1QQCA 4JK8A 3SUOA 1DQ7A 1TV6A 2HNZA 2N66A 3NAEA 2Q97A 4DTPA 1P90A 1W9HA 1WSJA 2HSTA 4E3SA 4B1XB 1DLOA 2UXDK 2HBKA 2G8UA 3AVIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ULE B;  3LDL A;  1JLQ A;  3TSP A;  4U67 L;  2YNH A;  2B6A A;  1RGI A;  1YT3 A;  5KGX A;  1XHX A;  4CEE A;  3CG7 A;  3P4I A;  2P9K B;  1ATR A;  1WWN A;  4QS7 A;  3CFP A;  4M7Y A;  4M3X A;  2UXB K;  1KC8 O;  3SPZ A;  4O5F A;  1YIJ N;  3DLG A;  3VMF B;  5LMU K;  1M1K O;  4JKB A;  2M8B B;  4FLZ A;  2B3C A;  4ISE A;  3KTQ A;  4NYN A;  1JLE A;  4O8U A;  4BVP A;  1T3V A;  1VRT A;  4CD3 A;  3KD1 E;  4IOC L;  1BDG A;  1HYS A;  3H45 C;  3GBT A;  3K9J A;  3RWU A;  3HJF A;  4FPB A;  2E4L A;  4BC4 A;  4AIL C;  2P9I B;  2HHS A;  3ZCM A;  2FBV A;  2O8F B;  3AAP A;  3NGZ A;  3RMC A;  4CE9 A;  4H0P A;  4I7F A;  4ICL A;  4QS9 A;  4Y0W A;  4GKJ K;  1U47 A;  1MWM A;  4ZTJ A;  3VTI A;  3CCU N;  1NGI A;  4Y1C A;  3KLF A;  4OKK A;  1PX9 A;  5C2D A;  1BIZ A;  4CES A;  3TSQ A;  3CC4 N;  2CGL A;  5FDL A;  3HP9 A;  3Q7C A;  1WSG A;  2B5J A;  2Z1H A;  4WFA L;  3KLE A;  4KTW A;  2FBY A;  1XUP O;  3V1R A;  3OHR A;  2YEO A;  4FPA A;  1SNB A;  1WLJ A;  1RBS A;  1KV0 A;  3AVA A;  4DKW A;  3G25 A;  3DLE A;  4AHV A;  5GAG P; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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