4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
1MWKA 2YCHA 4JN4A 4NO7A 4RTFD 5EXWA 1GLCG 4FWRA 1BA1A 1BOTO 5BN9A 1Z6RA 2Q1NA 3FZHA 3CJ7A 5BPNA 1BG3A 3G25A 4BRCA 5FPNA 3QBWA 3HZ6A 3CETA 2QWRA 2GWJA 3MN6A 3WT0A 1YAGA 3HM8A 1YUWA 4CZLA 4EIAA 2QWNA 1HLUA 4BR2A 3AAQA 3D7EO 5BREA 3RSEB 1NBWA 2VWBA 2KHOA 4BGBA 4BROA 3VENA 1HX1A 4CBWA 1K8KB 2QM1A 3C7NA 3WUHA 3R8EA 5LJWA 1HJOA 5AQIA 3KZBA 5FPEA 2I7PA 3WEEB 3VGLA 3O4WA 2P9LA 3S41A 3ZX2A 3D2EA 2E20A 1V4TA 2F9WA 3U9DA 2P9UA 4I6MA 3AAPA 5ADXH 3MDQA 5AQLA 2ASPA 1HKGA 1ESVA 3CJBA 1T6CA 3VGMA 3VEOA 1GLDG 1G99A 4BC4A 3J8AA 3MK6A 2QWQA 2Q0RA 2AA4A 3BEXA 4A2BA 4FWSA 1KAXA 4E1JA 4FO0A 2IIRA 3W0LA 2HOEA 1ATSA 2QWOA 1E4FT 2CH5A 4JD2A 1RDWX 4H0OA 1S3XA 5F1XA 3O80A 2Q31A 4A2AA 2WUSA 1BA0A 1NGAA 1IG8A 2P9KB 3FLCO 5AZJA 3ENHA 3ID8A 1Z05A 1KAYA 3EKSA 3UB5A 3WXLA 3A5OC 4LC9B 1MDUB 1GLFO 2ZF5O 4BGAA 4IXCA 4AM6A 5KPZA 5JLFA 3O1WA 4RWTA 3U9ZA 5BRFA 3MMVA 1CZAN 4K43A 1JCGA 2NRHA 3ZX3A 4H5RA 4BQLA 4B9QA 2FF6A 1ZBSA 2FXUA 3LL3A 3VEVA 1D4XA 3GE1A 4M7YA 3TPQA 1TYQB 3ZETB 2F9TA 3JXUA 4B1ZA 4CZEA 5AQOA 4WQ4A 3VERA 2D4WA 3EO3A 4CD3A 4CJ7A 3SMPA 3M6GA 4BVPA 3VETA 4NB4A 3O1BA 3LDPA 1GLBG 2E2OA 2FLOA 1ATNA 5E84A 4CZKA 3ZEUA 4IJNA 4PKGA 2E1ZA 5AQHA 3DJCA 1MA9B 3DXKB 4BRHA 1NGEA 1XC3A 3BP8A 3CJAA 2YHYA 5ADXA 2DPNA 4BC5A 4WYBA 5LY3A 3VEWA 1DKGD 4XH5A 4B1UB 4M7XA 2PAVA 3ATUA 3QMLA 1T6DA 5AQGA 4B1XB 5EY4A 1NGJA 1QZ6A 3QB0A 3VF2A 4PKIA 4H0TB 5CE3A 3GDQA 3DWLA 1NGFA 2QWMA 1BWFO 4BVOA 1TUUA 4H0VB 3VGKA 3C0BA 3BUZB 4BRAA 5AQSA 2GUPA 5TKYA 1GLJO 4BG9A 3LDLA 3HBTA 4CBXA 4PL7A 1WOQA 2IVPA 4CZIA 3H1VX 3ULEB 5LJVA 2CGKA 1SAZA 4IJAA 3MN5A 2J4RA 3UKRA 4JHDB 4BC2A 4BQZA 3LM9A 4BREA 2QW9A 3ZX0A 3SMSA 5KPTA 1NGHA 4GY2B 4FWMA 3A5NC 2P9SB 3H3OB 4A62A 1KXPA 2E1YA 2E2NA 4FOEA 4PKHA 5AQTA 3GG4A 3OHRA 3D2FB 3QFUA 2FSNA 5JLHA 4QS8A 3M3ZA 1RGIA 3IDHA 1BO5O 2E2QA 3O5BA 4BRFA 4XH1A 2GELA 3CJCA 4CZHA 1NGCA 2ASOA 2A42A 3H3NO 3FR0A 1U2VA 4YDUA 3EZWA 3H46O 1YXQA 4EFHA 2FF3B 3A5LC 1QQNA 2CGJA 4BG8A 4DHYA 4CZFA 3RSEA 4FWLA 3I33A 1SQKA 5KQ8A 3M1FA 1BDGA 5BRDA 1JCFA 5AQJA 1GLEG 2A6AA 4J8FA 3U8XA 2P9IB 5FPDA 4JD2B 1ZXOA 1HKCA 4WQ5A 4CBUA 2VYPA 3WEEA 3H1QA 2HMPA 5E26A 3A5MC 1MWMA 4BRQA 2Q0UA 3CJ9A 3VF4A 1HPMA 3VESA 3B8AX 5AZIB 1XUPO 4BRPA 3LDOA 3O08A 3U4LA 2E8AA 4FL9A 4BRNA 4BRGA 1NLVA 4L3QA 3HSCA 1S22A 2D1KA 3AY9A 5AQMA 5AFUA 1T44A 1V4SA 2IVOA 3GL1A 2HF4A 3VF6A 1BU6O 4B1YB 1J6ZA 3HI0A 4DQ8A 3GOIA 4BRDA 1JCEA 4H0YB 2E2PA 2P9KA 4H5WA 4AM7A 3LDQA 2A5XA 2V7ZA 2UYTA 1Q18A 3DXMB 1QQOA 3O6WA 5AQRA 3WXKA 1SZ2A 2A3ZA 3UKUB 4FWOA 1NMDA 5AQYA 1TYQA 3ZETA 3KVGA 4IZ9A 2P9PA 2W41A 1TUYA 3CJ1A 4ISGA 5AQNA 4O8KA 2VCPA 2GTDA 4KBOA 1P8ZA 1NGIA 4H0PA 4FPBA 1E4GT 2V7YA 4BR4A 3FGUA 5EX5A 5KQDA 2P9NB 4M63C 4Z94A 3WQUA 2YJEA 1HUXA 3WXJA 1RFQA 4WQ4C 4B1VA 3CQYA 3VOVA 2NLXA 4CZGA 3UKRB 1C0FA 1C0GA 5AQVA 3BF1A 2E88A 3CHWA 4ISFA 4CZJA 3TU5A 4BRKA 4BRLA 2W40A 5AFUH 2IVNA 5BPLA 1LCUA 4EHUA 4B1WB 3CI5A 4IWVA 5BN8A 4CZMA 2V52B 4CI6A 4K42A 5I9EB 1DEJA 3VEZA 5AQWA 4MLHA 3H6EA 1QZ5A 3F9MA 3C7NB 2FSJA 2Q36A 2YHXA 2HF3A 5AR0A 1GLAG 3SK3A 3QICA 4MO4A 4FWKA 3KHYA 1H1VA 4MLEA 3QFPA 3VEYA 2A40A 1NWKA 3ATVA 1NM1A 3EKUA 3VPZA 1WUAA 3ULEA 5AQZA 4JNEA 5JICA 4O5FA 2P9LB 5AQFA 2EWSA 3D2EB 4A61A 2D0OA 1U2VB 2P9UB 4I6MB 4JHDA 2I7NA 1U6ZA 2ITMA 5JMVA 4BRIA 3CERA 1BUPA 3R6MA 3FZKA 4IO8A 1OKJA 5EOYA 4HTLA 4FOIA 3W3DA 2P9SA 4FPAA 4H03B 2H3GX 4RCHA 3SJHA 2V51B 3D2FA 3BF3A 4EAHD 3IMXA 1K8KA 2YJFA 4FWQA 5FPMA 2A41A 3P4IA 3JS6A 3L0QA 5BR9A 5AQKA 1X9JA 4BR5A 5AZJB 4F9OA 3ENOA 5KPRA 2Q2RA 4GNIA 2PBDA 3FE1A 4MO5A 5BRHA 3MN7A 4H5VA 1NGDA 4Y0WA 3A8YA 2GEMA 4K25A 5AQUA 4YDUC 1NGGA 2YI1A 2P9IA 4DCHA 2AP1A 5ELZA 2GWKA 1X3MA 3FZLA 4FWNA 3A0IX 4H0XB 3I8BA 4JAXA 2BUPA 3GBTA 4XH4A 1X3NA 5EVZA 3HTVA 4QS9A 1GLLO 3EL2A 2D0PA 5AZIA 1HKBA 2QWLA 3L6QA 3QBXA 2NZTA 2CGLA 3FZFA 1R59O 4WQ5C 3ZEUB 1Y64A 4PL8A 2ZGZA 3DAWA 3IFRA 2OANA 3CQXA 3MN9A 5AQPA 2Q97A 4BC3A 4FSVA 4FWPA 3UE5A 2P9PB 4QS7A 4BR7A 1NGBA 4H5TA 3LDNA 2ASMA 4DB3A 3CIPA 3WXIA 4ISEA 3VEXA 3SLCA 3FFKB 2ZWHA 3QDKA 2FSKA 4H5NA 1ATRA 3IUCA 1ZC6A 3H45C 3DXMA 1LOTB 3DXKA 4XEIA 5F2RA 1IJJA 2BTFA 3UKUA 4C23A 2QXLA 1DGKN 2CH6A 3MCPA 3WQTA 4BRMA 3AARA 4CD1A 1KAZA 5AQXA 5BPMA 2ZGYA 3L4IA 2QWPA 4EHTA 5F0XA 3FZMA 3O8MA 1EQYA 5AQQA 2YHWA 1QQMA 4HWIA 4K41A 1QHAA 3R9PA 5B8HA 4BR0A 4BR9A 3EN9A 3LM2A 2P9NA 1YVNA 1XQSC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YCHA 4JN4A 4NO7A 4RTFD 3ISNC 3EYZA 4CHYA 1BOTO 3FZHA 3CJ7A 5BPNA 3G25A 1RTJA 1EETA 5FPNA 1J5OA 1I94K 1S1XA 3SI6A 2N66A 2QWRA 3HM8A 4CZLA 4EIAA 1XHXA 1FH3A 2PFUA 5BREA 3SUPA 4ID1A 1U4BA 1W0HA 2D0BA 3DOKA 1XI1A 2FC0A 4CBWA 2QM1A 3TAMA 3R8EA 2YNFA 5KTQA 1YI2N 4U67L 5LJWA 5AQIA 3T69A 4B3RK 3O4WA 3ZSWA 1P00A 1G15A 2P9UA 3U9DA 4I6MA 3AAPA 5ADXH 1QE1A 2ASPA 3MDQA 3TAFA 3VEOA 4DUYK 5CR4A 1TK8A 1LAVA 5H1SQ 2HHQA 4RW8A 4J2DA 3VA0A 3TARA 3V9XA 4J2AA 5KRSA 4B8CA 1SNBA 2IIRA 1BCOA 2HOEA 3CQ8A 2QWOA 1E4FT 2PZSA 1OH7A 3R1XA 1S3XA 5F1XA 4DKWA 5CZ1A 2KYQA 2HSTA 2WUSA 1NGAA 1IG8A 4O55A 2P9KB 3SYZA 4L8RB 2NRZA 5GIOA 4CQKA 5KRTA 4QAGA 4BGAA 3C95A 3HO1A 5JLFA 1U49A 4M41A 4RWTA 1EWRA 4B9UA 1CZAN 1JCGA 4H5RA 2VG6A 4BQLA 3QIPA 3LL3A 1RT2A 3VEVA 4KKOA 5E41A 4M7YA 3PSFA 4O44A 3LPTA 3TPQA 4DTNA 2RKIA 3JXUA 4BECA 2OZSA 1YTAA 4WF9L 1EP4A 2D0AA 4AHTA 3AVBA 4M3WA 4CD3A 3VMFB 3SMPA 4CJ3A 4CJ7A 1KLNA 3OYGA 1RBRA 3AVAA 3O1BA 4CHOA 4DU4A 2P51A 1WAFA 4V1DC 2HHHK 4JI1K 4IJNA 4FZYA 5AQHA 4BRHA 4HVJA 1C0UA 1QSYA 1WSJA 2YHYA 1XMOK 4CW7B 2DPNA 4BC5A 3VEWA 5JS1A 4YORA 2D56A 1DKGD 1HQUA 4CJRA 5DK5A 1A5WA 4M7XA 4B1UB 4GMJB 3SAHA 4FLVA 4JI8K 4AHSA 4U7BA 4DS4A 1QZ6A 3VF2A 4RW4A 4CF9A 1U45A 4FJXA 3CCEN 2YC1C 4CEOA 3PUFA 3GDQA 1NGFA 3HYFA 3HJFA 4H0VB 3QEPA 1BGXT 2QKBA 1VQMN 4B08A 4CBXA 3LP1A 3G71N 4KH5A 5KGWA 4KO0A 3L2RA 2CGKA 4IJAA 4FXDA 1CZBA 4BC2A 4BQZA 5KK4A 3LM9A 3SJJA 1WLJA 4Y1CA 3ZX0A 3SZ2A 3SMSA 1YIJN 1ZBLA 2P9SB 4W5RA 4JRQA 4DV1K 4JKCA 4FOEA 4ZTFA 4PWDA 4FM0A 3D2FB 2FSNA 1IO2A 4KHSA 4QS8A 3M3ZA 2P5GA 1KTQA 3BGRA 4XH1A 4OPJA 4LSLA 1QTMA 5GINA 4CZHA 1NGCA 3KHWA 3HL8A 1SL2A 2XY8A 3CYMA 1YJ9N 3ZLJA 3H46O 3OY9A 4KHQA 1QQNA 2CGJA 1J9AA 4BG8A 4CZFA 3I33A 1SQKA 5KQ8A 3M1FA 3NVMA 5BRDA 2VWKA 1JCFA 5AQJA 1D5AA 3O3HA 3L56A 4E7JA 1ZXOA 4AQYK 1HKCA 1RNHA 1Q9XA 4JI7K 1RBVA 3U6FA 2Y1IA 4YOWA 5KI6A 2Q0UA 3K57A 5AZIB 3LDOA 3U4LA 3IS9A 2E8AA 4FL9A 3LP3A 4DSKA 1NLVA 4CFDA 3HSCA 5CZ2A 3SUNA 4ELVA 1J54A 1UWBA 3P1GA 4FJGA 3HP9A 2G2KA 3GL1A 3NGZA 3SUOA 3CXCM 2MZ0A 2HBJA 2I5JA 3EE9A 1W97L 1P90A 5LMNK 1XHZA 3M8RA 4JLHA 4NCBA 4JKGA 4FJ9A 4F2RA 1NRAA 3BDPA 3CCUN 4H5WA 4I2PA 4FW2A 4AM7A 3LDQA 4C8LA 4KRFA 4YNQA 2XO7A 3O6WA 3VQBA 3P39A 5C0YA 3IKMA 3OS1A 1XC9A 3UKUB 1NMDA 3PIOL 1TYQA 3VQAA 1W2BM 3QEIA 4CERA 3HPGA 3WXMB 2JGUA 2W41A 1TUYA 4KPYA 5AQNA 1HNWK 2O8CA 2VCPA 2GTDA 1QVFM 1E4GT 4Z4IA 4LFCK 3HSTB 3WNHA 4UAEF 4RG8A 2BH1A 3KK1A 2YJEA 2WOMA 3P83D 2G8KA 3VOVA 4AHVA 4DSEA 1QSLA 3UKRB 3PX4A 4NCAA 3BF1A 4ILHA 2G8IA 4RW9A 2YIPA 2ZJRL 5BPLA 1SKSA 4EHUA 3KP0A 4B1WB 2V52B 4CI6A 1HNVA 3LZIA 5HP1A 3MWTA 3DLLL 5J2NA 3VEZA 3WNGA 5AQWA 4LF4K 3H6EA 4OLBA 2FSJA 2Q36A 5J2PA 2YHXA 3E9OA 4M3UA 4MO4A 3DM2A 1T7BA 4FLXA 1NWKA 3ATVA 1NM1A 3EKUA 2RE2A 4O5FA 1ASUA 1DTTA 4CGDA 5AQFA 2EWSA 3P31A 3NAEA 4JHDA 2P9UB 4I6MB 1T0ZA 3KD1E 3MECA 1U6ZA 1NKBA 3OJUA 5M1KA 2MN5A 4GVMA 1IKXA 1TL1A 2HHUA 5FLXO 4IO8A 1OKJA 4HTLA 1NE5A 4CJ4A 1HMVA 4GVEA 2HHSA 3I0SA 1NJIO 2K35A 3THXA 4NYFA 4DV2K 3SBTA 2KZZA 5FPMA 4CJQA 3G4SN 3CFRA 5AQKA 1DT9A 4BR5A 4F9OA 1IH7A 2C1IA 4GV3A 2YIOA 3SCXA 4UAFE 5GADP 4O8UA 3EEQA 4MO5A 3VQ5A 5BRHA 1SEGA 3MN7A 1JL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YCH A;  4JN4 A;  4NO7 A;  4RTF D;  3ISN C;  3EYZ A;  4CHY A;  1BOT O;  3FZH A;  3CJ7 A;  5BPN A;  3G25 A;  1RTJ A;  1EET A;  5FPN A;  1J5O A;  1I94 K;  1S1X A;  3SI6 A;  2N66 A;  2QWR A;  3HM8 A;  4CZL A;  4EIA A;  1XHX A;  1FH3 A;  2PFU A;  5BRE A;  3SUP A;  4ID1 A;  1U4B A;  1W0H A;  2D0B A;  3DOK A;  1XI1 A;  2FC0 A;  4CBW A;  2QM1 A;  3TAM A;  3R8E A;  2YNF A;  5KTQ A;  1YI2 N;  4U67 L;  5LJW A;  5AQI A;  3T69 A;  4B3R K;  3O4W A;  3ZSW A;  1P00 A;  1G15 A;  2P9U A;  3U9D A;  4I6M A;  3AAP A;  5ADX H;  1QE1 A;  2ASP A;  3MDQ A;  3TAF A;  3VEO A;  4DUY K;  5CR4 A;  1TK8 A;  1LAV A;  5H1S Q;  2HHQ A;  4RW8 A;  4J2D A;  3VA0 A;  3TAR A;  3V9X A;  4J2A A;  5KRS A;  4B8C A;  1SNB A;  2IIR A;  1BCO A;  2HOE A;  3CQ8 A;  2QWO A;  1E4F T;  2PZS A;  1OH7 A;  3R1X A;  1S3X A;  5F1X A;  4DKW A;  5CZ1 A;  2KYQ A;  2HST A;  2WUS A;  1NGA A;  1IG8 A;  4O55 A;  2P9K B;  3SYZ A;  4L8R B;  2NRZ A;  5GIO A;  4CQK A;  5KRT A;  4QAG A;  4BGA A;  3C95 A;  3HO1 A;  5JLF A;  1U49 A;  4M41 A;  4RWT A;  1EWR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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