4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
1T6CA 3UKUA 3O4WA 4BRGA 3HZ6A 5AZIA 4B9QA 4QS9A 3H3OB 1Y64A 2P9UB 3H45C 4WYBA 4AM7A 3HI0A 4BQLA 3VGMA 2YCHA 3C7NB 4BREA 4FPAA 2GWKA 2BTFA 4GY2B 5AR0A 2FLOA 3ENHA 1MWKA 3M1FA 2D0OA 3LDNA 4CZGA 3A0IX 1HKBA 4BVOA 2A3ZA 4CZKA 4EHTA 5AQGA 1ATNA 2P9NB 4BRCA 5LJVA 3A5LC 4FWQA 4BRAA 5AQOA 4JD2A 5AQXA 1U2VA 1QQOA 2QWMA 3CQYA 3LL3A 2QWOA 1GLLO 5CE3A 5E26A 3FZKA 4H0YB 4QS8A 5AZJA 1U6ZA 1NGCA 1BDGA 3UB5A 3FGUA 3U9DA 1JCEA 1NM1A 3GE1A 2Q36A 3R6MA 4FWNA 1YUWA 2P9LA 2PBDA 2E2OA 2VWBA 4B1YB 1ZC6A 4A2BA 1HJOA 3CJ7A 3O08A 4BROA 4HWIA 3KZBA 3EN9A 3QICA 1KAYA 1ZBSA 3FZFA 4CBWA 2IIRA 4I6MA 2I7NA 1Z05A 2NRHA 2ASMA 3VGKA 4MLEA 2YJFA 2E2NA 3VF4A 1GLEG 2E1ZA 5AFUA 4ISFA 2IVNA 1K8KB 4BRKA 1BA0A 1BUPA 1HLUA 3WQUA 4BG8A 1TYQA 4FO0A 1ATRA 4DCHA 1XUPO 4FWLA 1QZ5A 4H5NA 2OANA 4FWMA 5KPZA 2VYPA 5KQ8A 4H0TB 4A62A 1X9JA 3H46O 3QB0A 4BC5A 1XQSC 2YHWA 4PL7A 2A40A 3VEZA 4YDUC 1BOTO 2FSJA 2FF6A 2PAVA 4C23A 2Q1NA 5I9EB 2Q0UA 3OHRA 1D4XA 2YJEA 4ISGA 3BF3A 5BRHA 5B8HA 3WEEB 4RWTA 3A5OC 5BPLA 4RTFD 3H3NO 2ASOA 3JXUA 1Z6RA 2P9SB 3UKRB 3TU5A 3VETA 3CERA 4B1XB 4FL9A 2NLXA 3GOIA 5ADXA 3RSEB 3TPQA 4YDUA 3L0QA 4WQ5C 2A42A 5E84A 2E2PA 5AQSA 1C0FA 3VF2A 5FPEA 4CZEA 1V4SA 5F2RA 4BQZA 3AAQA 3UE5A 4K41A 4PKIA 3D2FB 3AAPA 1NGDA 3GBTA 2HOEA 2QW9A 1GLDG 2W40A 1BU6O 4K42A 2CGLA 4H5WA 4A2AA 3QFUA 4HTLA 1GLFO 5F0XA 1SZ2A 4WQ5A 3BEXA 1NGJA 4CZFA 2I7PA 2IVOA 1NGFA 1HPMA 3WT0A 4AM6A 3DXKA 3J8AA 4CJ7A 3WXIA 4FWSA 3ULEB 4EFHA 2P9PB 3QBWA 3EKUA 3LDOA 4A61A 4PKHA 3ZEUB 5LY3A 5AQZA 4M7XA 3HBTA 1NGIA 4NO7A 2BUPA 4O5FA 4BGAA 4JAXA 5EY4A 4Y0WA 3A8YA 5EX5A 5FPNA 1QQMA 1X3MA 1ESVA 3BP8A 3O6WA 4EAHD 3DAWA 3SMSA 1R59O 3CIPA 4B1WB 4BRIA 3ZX0A 4CZLA 2V7ZA 3FE1A 3WXKA 4H0XB 3I8BA 4FWRA 1S3XA 2EWSA 2Q31A 2Q0RA 2KHOA 2UYTA 4BR7A 3D2EA 4IO8A 3ATVA 5AQKA 4JHDB 3A5MC 1V4TA 3C0BA 3CJ9A 1QZ6A 4BRQA 2P9KB 3ZX3A 4FWPA 4BRDA 1NMDA 3CJ1A 3MN5A 4H0PA 4J8FA 3L4IA 4DQ8A 1DKGD 4M7YA 1NGGA 4IXCA 3SJHA 1E4GT 1GLCG 3JS6A 2HF3A 4FWKA 4BC3A 1NLVA 4CZIA 2D1KA 3FZMA 4MLHA 4XH5A 2Q97A 4BR4A 1H1VA 3W3DA 3F9MA 3EZWA 4CI6A 2CGJA 5BR9A 4ISEA 3UKUB 1TUUA 5BREA 4RCHA 2QWLA 1GLAG 4XH1A 2GUPA 2P9UA 2ZF5O 4BR2A 2V52B 4IZ9A 1NWKA 3ZEUA 3C7NA 3M3ZA 3ZETB 4H03B 1KXPA 4BRNA 5ELZA 1NGBA 4B1UB 4BRFA 2P9NA 5AQNA 1U2VB 3DXMB 4PL8A 5AQWA 4CBXA 1GLJO 2WUSA 2E88A 2CGKA 1C0GA 5BPNA 3QMLA 3MDQA 4PKGA 4GNIA 1LOTB 3HSCA 1HKGA 1S22A 3MN6A 3EO3A 3S41A 5KPRA 5BN8A 1MDUB 1DGKN 1YAGA 2FSNA 3DWLA 4JHDA 3R9PA 3VEVA 3FZHA 2P9LB 1KAZA 3VEWA 1MWMA 4DHYA 5JLHA 3O1WA 5AQTA 3VEXA 3VESA 2P9KA 3BUZB 1WOQA 1BA1A 3WUHA 2AA4A 5AQMA 3CJCA 3U8XA 3VF6A 3LDPA 1YXQA 1QHAA 1JCFA 3H1QA 4B1ZA 5EVZA 3AARA 1K8KA 1TYQB 3O5BA 3QDKA 5EOYA 1MA9B 2ASPA 3MCPA 4L3QA 1KAXA 3U4LA 3KHYA 4MO5A 4BVPA 2AP1A 4CD3A 2V51B 3DJCA 1QQNA 3A5NC 2QWNA 1TUYA 3CI5A 1BG3A 5JMVA 4QS7A 1RDWX 4FWOA 2H3GX 4B1VA 4WQ4C 3AY9A 3MMVA 4BG9A 4CZJA 2P9IB 3LDLA 4H0VB 4JN4A 2D4WA 4EHUA 4LC9B 3CJAA 3IFRA 3HM8A 3SLCA 3P4IA 1RGIA 5AQHA 3WXLA 4BC4A 3FLCO 5LJWA 3ZETA 3QFPA 3SMPA 3WEEA 3D7EO 1WUAA 2W41A 3VEOA 5AQVA 2P9SA 3UKRA 1NBWA 4CZHA 5BRDA 2A6AA 3DXMA 2QWPA 4WQ4A 2FSKA 2F9WA 1ZXOA 3RSEA 2A41A 3VENA 4BGBA 3ID8A 4XH4A 3FZLA 3I33A 2QWRA 2F9TA 4M63C 1T44A 2QWQA 3VPZA 5AQJA 3H6EA 1XC3A 1IG8A 2VCPA 4XEIA 5TKYA 4CD1A 2IVPA 3D2FA 3CETA 2GWJA 4DB3A 2E20A 3R8EA 2GTDA 5AFUH 3KVGA 3HTVA 3MN9A 1Q18A 4Z94A 5KPTA 5BPMA 4BR5A 1GLBG 2ZWHA 3U9ZA 2QXLA 2FXUA 4JNEA 1BO5O 2CH6A 2QM1A 3ENOA 1BWFO 1P8ZA 2E2QA 2ITMA 5AQRA 4BR9A 1ATSA 3B8AX 2YHYA 1RFQA 2GELA 4MO4A 5AZIB 4BR0A 3DXKB 3WQTA 1YVNA 4H5VA 3ULEA 3IDHA 2P9PA 2NZTA 4FOIA 1DEJA 3O1BA 2A5XA 3FR0A 3WXJA 3ZX2A 3VGLA 4F9OA 5FPMA 3SK3A 1OKJA 4K25A 2YI1A 4JD2B 4BC2A 1NGEA 4CZMA 2J4RA 4FPBA 3VEYA 2DPNA 1NGHA 3G25A 5FPDA 3GG4A 1EQYA 2P9IA 3MK6A 3ATUA 1SAZA 3MN7A 4CBUA 3BF1A 5AZJB 2V7YA 4BRPA 4H0OA 3CQXA 3EL2A 1LCUA 5ADXH 3LDQA 3D2EB 5AQUA 5JICA 3IMXA 3W0LA 2ZGYA 3VOVA 3GDQA 5AQFA 2FF3B 4E1JA 2E8AA 3H1VX 1HX1A 3FFKB 3EKSA 1X3NA 1J6ZA 1SQKA 5AQLA 1HUXA 5AQPA 1HKCA 4I6MB 5F1XA 4FSVA 1T6DA 4H5TA 2D0PA 2YHXA 4BRMA 4IWVA 3VERA 3LM2A 4EIAA 2Q2RA 3L6QA 1JCGA 2HF4A 2HMPA 4IJNA 4NB4A 3O80A 3O8MA 3M6GA 1E4FT 4K43A 5EXWA 3IUCA 2GEMA 3LM9A 5BRFA 1CZAN 1G99A 4O8KA 5AQQA 4BRHA 2ZGZA 5AQIA 4IJAA 4KBOA 1IJJA 5JLFA 1NGAA 5KQDA 3QBXA 4H5RA 4BRLA 3CHWA 3CJBA 3GL1A 5BN9A 4FOEA 2E1YA 5AQYA 2CH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC4N 3KP1A 4BRGA 3AV9A 4CHYA 4HHFA 1C0MA 3L8BA 3VGMA 4CJPA 4EP5A 3C7NB 5FDLA 2W00A 4W5OA 5SWMA 3U3YA 2MBKA 1WSFA 4M41A 2D0OA 3A0IX 4DKWA 4CZKA 1CZBA 1RT6A 4B9LA 1ATNA 2P9NB 1K8AO 1J5OA 2G8VA 5BR8K 1QQOA 2WBNA 2N69A 2BE2A 1GLLO 5KRTA 5E26A 3FZKA 2FBVA 5AZJA 2JDQD 3E7RL 3OYKA 1SN4A 1IBLK 4G9ZA 4FWNA 1YUWA 1O13A 1JJ2M 3ZT0A 2PBDA 4B1YB 1ZC6A 4DR6K 1HJOA 1Q86O 5JS1A 1CZ9A 3CJ7A 1G15A 1JXCA 2NY9X 4DV0K 4FCYA 1RTIA 1TK0A 1I3AA 4I6MA 1Z05A 4UQGA 4JI3K 1S9GA 4X65K 2E1ZA 3KIOA 4RW9A 2IVNA 4DUZK 3SUQA 1AYJA 2HHSA 1HLUA 5I42A 1YVUA 2HSTA 3M8QA 4B9UA 4WF9L 4BDZA 1GOAA 5M1OA 1VQLN 4KV8A 3HM9A 3M5RA 2VYPA 4UJ0A 4JK8A 1TI5A 4BE2A 3QB0A 4JK9A 3ZSQA 4KHYA 3KC6A 3V1RA 1WSIA 3ZT2A 1JXEA 2A40A 1QHTA 4YOUA 1RT2A 3Q7CA 4WFAL 1LWFA 3ZT4A 3SF4D 5I9EB 2Q0UA 5C42A 2YJEA 1BQNA 4JKGA 1FH3A 2KBHA 4EZ9A 3T19A 5HL7L 2O8BA 3WEEB 5BPLA 4RTFD 1GPSA 3H3NO 1Z6RA 4CGIA 4B1XB 5IWAK 4M42A 1JLQA 4OPKA 1BISA 3G4SN 5HRRA 3THXB 5FPEA 4O5BA 5F2RA 3WNGA 3UE5A 4C1NK 4U67L 3D2FB 4FJJA 1RBTA 4NXNK 5CY0A 3CCRN 1T1TA 3V1QA 2E0HA 4K42A 1NK4A 1RILA 2CGLA 2HHXA 2E5LK 4O55A 1P0AA 1SZ2A 3BEXA 3T1HK 3I56N 1S6QA 4DV3K 3WT0A 3EZ5A 5T7BA 4DSKA 2P9PB 2YV0X 3MCAB 3DYAA 5LY3A 4M7XA 3HBTA 1NGIA 1NJZA 2KZMA 2Z1IA 1FJGK 3QETA 2LI7A 5C2FA 3HK2A 2KSKA 3C6AA 3O6WA 4EAHD 3DAWA 1OH6A 1R59O 1ASWA 1EX4A 1RDCA 2V7ZA 4M45A 5IT9O 1XMQK 2RF2A 3WXKA 3AA3A 4H0XB 3NH1A 1YF5L 3SCXA 2KQ2A 1N8RO 2LT8A 2KHOA 4AF1A 1L3VA 3AO1A 2LR3A 1V4TA 2PFUA 4CJKA 1C0UA 3LAKA 3CCJN 1NH5A 3RTVA 4BRQA 2QK9A 4FJHA 2YC1C 4C8KA 4DV7K 3SI6A 4DQ8A 1DKGD 3RRHA 2VWJA 2F8TA 4CJSA 3EE9A 2HF3A 2XRIA 2HBKA 5M1QA 2UUCK 2K35A 4CZIA 1KVCA 2LY5A 3FZMA 3QESA 1NKEA 4OLAA 2HMIA 4KH4A 4BR4A 3F9MA 2C1IA 4DTNA 3SBGA 3E9LA 1D5AA 1QE1A 2IS3A 3E01A 5FRMA 4O8UA 3UKUB 2O8FB 4CFCA 4CERA 3IS9A 3NF6A 1CHZA 3PLAA 3KP0A 3ZSYA 1N33K 3CYMA 2V52B 1WB9A 3CW4A 3ZEUA 5KGWA 3C7NA 3BGRA 3ZETB 4UY8O 4LFCK 2P9NA 4LF6K 3G71N 4FK2A 4IEIA 1S1XA 2VWKA 3J81O 1KD1O 1LOTB 3AVGA 3HSCA 3C6TA 2OPPA 1S22A 1S1WA 2IDOA 1QSLA 1T3VA 3NVMA 5LL6Z 5BN8A 2VGNA 2EHGA 3DWLA 4JHDA 1KSPA 3VEXA 3VESA 1HNVA 2AA4A 3E66A 1XMOK 4HCBA 2VG5A 4KH5A 3U8XA 5FRNA 1I6GA 1JCFA 4CK3A 3PO4A 2HHIA 5EVZA 1FK9A 1XWLA 3AARA 4MDBA 1RDBA 5CHIA 4CVNE 3MX5A 3E1YA 4F3OA 2ASPA 3MCPA 3HVTA 1LWCA 4YOXA 3AO5A 1T7AA 3CI5A 3KLGA 5JMVA 4DTSA 1IG9A 1LQQA 4B1VA 3AY9A 4BG9A 5J2MA 1VSMA 3C94A 2NRVA 1W2BM 4FK0A 3AO3A 4KHPK 2G8WA 4JN4A 4B9VA 4EHUA 3CJAA 3IFRA 3QEXA 4AEIA 4FJNA 4J2DA 3LANA 4BC4A 3CQ8A 3FLCO 5DM6L 1GOCA 3DRPA 3SMPA 5FROA 3WEEA 3D7EO 3IRXA 2W41A 4DV1K 4NCAA 4BE7B 5BRDA 2A6AA 1BRZA 4WQ4A 5KI6A 2YIPA 2F9WA 2E6LA 1ZXOA 3AVHA 4Z4HA 2ETJA 3VENA 4BGBA 1IKXA 4XH4A 1CXQA 3M8RA 1T44A 2KFZA 3VPZA 5AQJA 1A5WA 1ZUTA 5AJ3K 1W97L 5TKYA 3D2FA 1I6FA 3I55N 1IBMK 2VG7A 3WNHA 3F5TA 1LAWA 5AFUH 3OBWA 4Z94A 2YHBA 3L3UA 3DOKA 4ELUA 4AQYK 3PV8A 3K9KA 2OTJN 2E3FA 1SNBA 5GAGP 4B3MK 3T3FA 2QM1A 2X78A 4CJ5A 2C1GA 2ITMA 3OYGA 4RW8A 4BR9A 4QCLA 4B3SK 4B08A 1ZYQA 5J2QA 4NCBA 3DXKB 3K5NA 3F73A 1CXUA 3PY8A 3IDHA 2P9PA 2YKMA 3O1BA 3PX4A 2A5XA 4U7BA 1O1WA 3FR0A 3WXJA 4A59A 3ZX2A 1VSHA 3DMJA 4F9OA 1BL3A 2FBTA 4FJMA 3BY5A 4E89A 4BC2A 1NGEA 2J4RA 3NE6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CC4 N;  3KP1 A;  4BRG A;  3AV9 A;  4CHY A;  4HHF A;  1C0M A;  3L8B A;  3VGM A;  4CJP A;  4EP5 A;  3C7N B;  5FDL A;  2W00 A;  4W5O A;  5SWM A;  3U3Y A;  2MBK A;  1WSF A;  4M41 A;  2D0O A;  3A0I X;  4DKW A;  4CZK A;  1CZB A;  1RT6 A;  4B9L A;  1ATN A;  2P9N B;  1K8A O;  1J5O A;  2G8V A;  5BR8 K;  1QQO A;  2WBN A;  2N69 A;  2BE2 A;  1GLL O;  5KRT A;  5E26 A;  3FZK A;  2FBV A;  5AZJ A;  2JDQ D;  3E7R L;  3OYK A;  1SN4 A;  1IBL K;  4G9Z A;  4FWN A;  1YUW A;  1O13 A;  1JJ2 M;  3ZT0 A;  2PBD A;  4B1Y B;  1ZC6 A;  4DR6 K;  1HJO A;  1Q86 O;  5JS1 A;  1CZ9 A;  3CJ7 A;  1G15 A;  1JXC A;  2NY9 X;  4DV0 K;  4FCY A;  1RTI A;  1TK0 A;  1I3A A;  4I6M A;  1Z05 A;  4UQG A;  4JI3 K;  1S9G A;  4X65 K;  2E1Z A;  3KIO A;  4RW9 A;  2IVN A;  4DUZ K;  3SUQ A;  1AYJ A;  2HHS A;  1HLU A;  5I42 A;  1YVU A;  2HST A;  3M8Q A;  4B9U A;  4WF9 L;  4BDZ A;  1GOA A;  5M1O A;  1VQL N;  4KV8 A;  3HM9 A;  3M5R A;  2VYP A;  4UJ0 A;  4JK8 A;  1TI5 A;  4BE2 A;  3QB0 A;  4JK9 A;  3ZSQ A;  4KHY A;  3KC6 A;  3V1R A;  1WSI A;  3ZT2 A; 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