4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
4CI6A 2ASPA 1Y64A 4L3QA 4RCHA 2P9KA 2IIRA 3UKRA 3O6WA 4CZGA 4BQZA 2EWSA 1H1VA 1T44A 1SAZA 2P9IB 3H3NO 4PKIA 5AQGA 3FZMA 5JLHA 4FWOA 4BGBA 4CD3A 3FZHA 4ISGA 1X9JA 4FOEA 2P9UA 2ITMA 1DKGD 1HX1A 3QFPA 3J8AA 3GDQA 2D0PA 1BA1A 1KXPA 4BR5A 3A5NC 3UKUB 2Q97A 4WQ5A 5AQLA 3CJAA 2A5XA 4CD1A 1ATNA 1RDWX 2Q0RA 4EAHD 2FSKA 3CJ7A 3WEEA 3WXIA 3MN7A 1GLCG 3O8MA 3A0IX 2CGLA 2Q31A 4XH5A 3WQUA 4BC3A 1J6ZA 5KPRA 5EXWA 1D4XA 4AM7A 3H3OB 3ZETB 4FWSA 4HTLA 2FSJA 2HMPA 2P9PA 2GWKA 2ZGYA 4IJAA 4A62A 4FO0A 5CE3A 1ATRA 4WYBA 3M3ZA 2YJEA 4FPAA 4ISFA 2GUPA 3D2EB 3BP8A 3CHWA 3AY9A 4FWQA 1GLEG 1YXQA 5AZIB 3SK3A 5JLFA 1V4TA 2QXLA 5ELZA 3QDKA 5FPNA 4PKGA 5AQJA 3W0LA 2E88A 3QBWA 4YDUA 3MCPA 5AQVA 1TYQA 3U9ZA 5BN8A 2P9SA 5E26A 3AAPA 2P9NA 5AQRA 2F9WA 1KAYA 4CZFA 4CZJA 4BR7A 2QWMA 1XC3A 4A2AA 3O08A 4XH1A 3VETA 5KPTA 3MDQA 2H3GX 3M6GA 2YJFA 3B8AX 2V7YA 4O8KA 3VGLA 5AQKA 1S3XA 4KBOA 5AQTA 3S41A 1QQOA 2E8AA 3FZKA 3FE1A 3H1VX 4BRMA 3ZX2A 1LOTB 4K41A 4YDUC 4CBUA 1X3MA 4K42A 3O4WA 2PAVA 3SMSA 1MWMA 3HM8A 1HUXA 1XQSC 4B1WB 4CZEA 3QMLA 3IMXA 2NRHA 3ZEUA 2E2QA 1NMDA 2UYTA 3I33A 1E4FT 2VWBA 2ZGZA 3VGKA 4BQLA 4JD2B 3ATUA 4CZHA 1RGIA 4EFHA 3D2FA 4O5FA 1HLUA 4H0YB 1NGBA 3L4IA 3DWLA 3WXKA 1DEJA 1NGGA 2I7NA 4I6MB 3LDPA 2CGKA 3CJ1A 2GWJA 5FPDA 3EL2A 1QQNA 4EIAA 3HI0A 3WUHA 1BDGA 4JNEA 3GE1A 2V51B 3ZX3A 2D4WA 4M7XA 4H5TA 1NLVA 1NGIA 4EHTA 3LDOA 4BG8A 2QW9A 1KAZA 3RSEA 1TUYA 2V52B 4FWLA 1DGKN 2QWNA 1ATSA 2CH6A 5BN9A 1YVNA 2HF3A 5KPZA 1CZAN 3U8XA 1KAXA 4IO8A 3TPQA 4H5RA 4CBWA 4FWPA 3FLCO 4FOIA 3CQXA 5AQFA 4BG9A 4RWTA 5B8HA 4PL8A 3C7NA 4BR0A 4K43A 1R59O 5KQ8A 5ADXA 2I7PA 2NZTA 1TUUA 5BPLA 4MLHA 2E2PA 2FSNA 2P9KB 3UKRB 2WUSA 2FXUA 3VOVA 4IWVA 4BR9A 4MLEA 1EQYA 2QM1A 4FWKA 4K25A 4B1UB 5AQNA 4DB3A 2J4RA 3OHRA 4DHYA 3AAQA 4H5NA 5AQMA 4FWRA 1WUAA 2P9UB 5BRFA 1JCFA 2Q2RA 4JN4A 4H0PA 1MA9B 2GTDA 4BVPA 3O1BA 1HKCA 2AA4A 3EZWA 3U4LA 4H0TB 4B1ZA 1SZ2A 2BUPA 2ASMA 2AP1A 4E1JA 4WQ5C 5AQUA 2A40A 1X3NA 3VEYA 1V4SA 3WEEB 2A6AA 1NGAA 2VYPA 3UB5A 1HPMA 1XUPO 2IVOA 1JCEA 4BC5A 1HKBA 1E4GT 3F9MA 2PBDA 2QWQA 4B1YB 4F9OA 5EY4A 4B1XB 4Z94A 5BREA 3ATVA 4DQ8A 3GL1A 2YHYA 3SJHA 3WT0A 1JCGA 3MMVA 2P9PB 4A2BA 5KQDA 4BRLA 4EHUA 3G25A 5AQQA 4IXCA 4CJ7A 3EN9A 1NGCA 4IJNA 3DXMA 3KHYA 4IZ9A 5I9EB 1GLDG 4PKHA 1QZ6A 3LDQA 2IVPA 3DXKA 3QICA 5BRDA 2ZF5O 1NGJA 2ASOA 4DCHA 1GLFO 1U2VA 4GY2B 5AQHA 3MN6A 2ZWHA 3A5LC 1TYQB 1T6CA 1K8KA 2P9SB 1GLJO 3IFRA 2P9NB 3HTVA 3VEWA 1LCUA 4WQ4A 3KVGA 2D1KA 4H03B 4JHDA 3VERA 1MWKA 1NWKA 3ZX0A 2W41A 2DPNA 2F9TA 3ULEA 4H0XB 3MK6A 3C0BA 3MN5A 3SMPA 4QS7A 3U9DA 2A42A 4BRHA 3H1QA 3UE5A 2D0OA 4BR2A 3BF1A 2W40A 4HWIA 1BOTO 5AZJA 4BRPA 2E1ZA 3JXUA 5FPEA 5EVZA 3LDNA 3VGMA 2HF4A 3ZEUB 3ENOA 1ZBSA 4H5WA 3EKSA 4NB4A 4FSVA 1BA0A 1NBWA 3CI5A 4RTFD 4M7YA 4BRIA 1U6ZA 2P9LA 3HZ6A 3QB0A 5E84A 1Z6RA 3D2FB 3H46O 3IDHA 3SLCA 3W3DA 2IVNA 3IUCA 4BRGA 5ADXH 3VF4A 4BVOA 5LY3A 1ESVA 3CQYA 3GG4A 2E20A 1BU6O 3VEZA 2A41A 2QWLA 2P9IA 3BF3A 4BC2A 4BRQA 3VF6A 5LJWA 2QWPA 2E2NA 2YCHA 3BEXA 1IJJA 4H5VA 2GELA 5BPMA 5F1XA 5AQSA 3WQTA 3UKUA 2VCPA 4PL7A 3QBXA 1ZXOA 3GBTA 3HSCA 5F2RA 1Z05A 3M1FA 3RSEB 1MDUB 2BTFA 1C0FA 4CBXA 3MN9A 2FLOA 4H0OA 1Q18A 3CJCA 2NLXA 3FZLA 1HJOA 3R6MA 4QS9A 1IG8A 3ZETA 1G99A 4H0VB 3C7NB 5AFUH 5AQWA 4BRFA 5AQZA 5AQXA 5BRHA 1GLLO 3JS6A 1QZ5A 4BRCA 5LJVA 4BC4A 3D2EA 4MO4A 3VPZA 1RFQA 5AFUA 3CIPA 1BO5O 5AZIA 3L0QA 2Q36A 2V7ZA 4BGAA 5FPMA 3P4IA 4BRDA 4J8FA 4QS8A 2GEMA 2HOEA 2YHWA 3LM2A 4FL9A 3VESA 1SQKA 5AQYA 5TKYA 3H45C 3AARA 3VEVA 2E1YA 4CZIA 1NGFA 5BPNA 4BRNA 3LL3A 3CETA 1NGHA 1BWFO 4LC9B 3TU5A 5AQIA 3H6EA 2KHOA 3QFUA 4GNIA 2CGJA 2OANA 4ISEA 4M63C 1NGDA 4Y0WA 2Q0UA 2E2OA 4B9QA 3FFKB 3LDLA 2QWRA 4FWMA 1QQMA 4CZKA 5AR0A 4CZMA 1NM1A 2YHXA 3O5BA 1T6DA 2CH5A 4BREA 2QWOA 3FGUA 3GOIA 1YUWA 3LM9A 3VEXA 1P8ZA 2FF6A 1GLAG 2YI1A 3D7EO 3DXMB 5JMVA 3FZFA 3O80A 3O1WA 3DXKB 4JD2A 4MO5A 4CZLA 1U2VB 4A61A 1WOQA 3WXJA 5EX5A 1K8KB 3A5OC 4AM6A 4JAXA 3EO3A 4FWNA 4BR4A 5BR9A 4I6MA 4C23A 3DJCA 4JHDB 3VEOA 2A3ZA 3CJ9A 5JICA 4WQ4C 5AQOA 1BG3A 2Q1NA 3KZBA 3CJBA 3ULEB 3BUZB 3EKUA 5F0XA 3R9PA 4BRKA 1C0GA 3HBTA 4NO7A 1ZC6A 3ENHA 3L6QA 4B1VA 1GLBG 3WXLA 1OKJA 3FR0A 1NGEA 3VENA 2FF3B 3A5MC 4XH4A 5AZJB 4FPBA 3DAWA 5EOYA 4BRAA 1HKGA 3ID8A 1YAGA 3R8EA 3CERA 3VF2A 4XEIA 3A8YA 2P9LB 1S22A 5AQPA 3I8BA 4BROA 1QHAA 1BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y64A 1FH3A 1FK9A 1W0HA 4CJFA 1RTIA 1W7AA 4EZ9A 3V4IA 1U4BA 2O4GA 4ISGA 4HCCA 4FOEA 1RT7A 2IOCA 1DKGD 1Q9XA 3GDQA 4CHNA 1BA1A 3A5NC 3QEXA 4WQ5A 3KLIA 1HNVA 4CHYA 1RDWX 4BDYA 4DSJA 3TAMA 1YITN 3CJ7A 3WEEA 3MN7A 4ZHRA 1GLCG 3DLEA 2A1RA 3O8MA 4XH5A 3WQUA 4W5NA 1J6ZA 3ENBA 1D4XA 4JKHA 3T1AA 4FWSA 1VAZA 2P9PA 2ZGYA 4IJAA 4CJQA 4DSEA 2Y1JA 4KTQA 4CK3A 4FO0A 5JVHL 4OX9K 4B3OA 3RVCA 4FPAA 4V1DC 4FWQA 1GLEG 4CEQA 1YXQA 3SQ4A 3KWGA 3VQ6A 5ELZA 1Q7YO 5FPNA 1YJ9N 2MN5A 1VQ8N 3HPHA 1U04A 2E88A 3QBWA 4DV2K 3CF5L 3NFAA 5BN8A 3TAQA 2OZSA 3MEEA 4IOCL 3O08A 3AVJA 4CIEA 4DQRA 3HXMA 5AQKA 2E5LK 4B9TA 2G8IA 4KBOA 1NJWA 3S41A 2E8AA 4DV5K 3FZKA 1RDUA 4B3TK 1GOBA 1NKBA 1UA0A 2G8UA 2VG6A 3O9QA 4FJIA 4BRMA 5FRMA 3KK7A 4K41A 1EETA 2HHQA 4HUFA 4ZTFA 2PAVA 1MWMA 3PV8A 1EX4A 2QKKA 4CZEA 4FK4A 3LWLA 1KFSA 3ZEUA 4CJEA 3PIPL 1NMDA 2UYTA 2N69A 3OBYA 5GIOA 4BECA 2O4IA 3TARA 1RDCA 3ATUA 4CGJA 2KBJA 2G8KA 2P51A 2ZJQL 3AO4A 4E7JA 1NGBA 3L4IA 3WXKA 4NXNK 4FJNA 2F4VK 3U3YA 4DV1K 4RG8A 1L4VA 4BACA 3CJ1A 2GWJA 5FPDA 3HPOA 1JXBA 4B8AB 1BDGA 4JNEA 2F8TA 3GE1A 2V51B 3ZX3A 4AHCA 4M7XA 2QKBA 4DTOA 5KGWA 2RF2A 2WBNA 1N4NA 3QETA 3TWHA 1KAZA 2OPRA 4FWLA 1DGKN 4CJSA 4Y1DA 2OPSA 2QWNA 2CH6A 2NRTA 5KPZA 3AVHA 2M8BB 1CZAN 4IO8A 3TPQA 4KREA 1N6QA 4FWPA 4DF8A 4M41A 4K8XA 3WNGA 3CQXA 4BG9A 4FJKA 3C7NA 4BR0A 5GIPA 4WFAL 4M3ZA 2KZZA 3AVMA 5KQ8A 4GKJK 4MLHA 3PLAA 3UKRB 4DS5A 2WUSA 2NY8X 4PHTX 1HJRA 1EQYA 4K25A 3QI7A 3QLHA 1KLNA 3E01A 4E1NA 3L8BA 4H5NA 5AQMA 4FWRA 5LL6Z 1HR0K 3G6EN 1BCMA 1WAJA 5IT9O 4R5PA 2KFZA 5DK5A 4IOAL 1L3SA 3VQBA 3EZWA 2KQ2A 3AVIA 2PFUA 4AHUA 4B1ZA 4OO1J 2ASMA 1GPTA 4F4KA 3LWMA 1XHXA 2N2QA 2VYPA 1XUPO 2FC0A 1JCEA 1LW0A 1KD1O 1LQQA 3BZKA 4G9ZA 3HVTA 3KP0A 4E3SA 3BK3C 4CF0A 4Z94A 3ATVA 4F2RA 3SJHA 3WT0A 3M8PA 4JEPA 2PZSA 4ID5A 1T7EA 4BRLA 4EHUA 1N33K 4B9VA 3G25A 5HBMA 1VQ6N 1DJTA 3EN9A 4B9LA 1NGCA 3SBGA 1DTQA 4Z4CA 4IJNA 4IZ9A 1S1TA 2B68A 4PKHA 3TR8A 3THYA 1QZ6A 3LDQA 3BDPA 2IVPA 5BRDA 1NGJA 2ASOA 5GAHP 2JDQD 1U2VA 4GY2B 3LP3A 2P9SB 1HNZK 2G8WA 3AGKA 3KLHA 2SN3A 3NHGA 4IDKA 4JI3K 2UU9K 4WQ4A 3CC2N 4H03B 1HMVA 4JYAK 1SKSA 2LY6A 3PO4A 4Q0BA 2DY4A 4H0XB 1U49A 3MK6A 3MWPA 3C0BA 3U9DA 1SV5A 3OY9A 1YHQN 4XJXA 1TV6A 1VSKA 1IH7A 5CHIA 1SN1A 2ITGA 1NNEA 2RE2A 3CMEN 4CJTA 4JI7K 5AZJA 3K58A 3TSUA 1SS6A 5EVZA 4DSIA 2HHTA 1ZVGA 5LMUK 3LP0A 3DRSA 1ZBSA 3TI0A 2O8CA 1BA0A 1NBWA 4BRIA 1N36K 4JKDA 3D6RA 3TANA 1Z6RA 2RPIA 3H46O 3KK2A 1VQKN 3W3DA 2IVNA 1KCFA 1NH5A 2XY8A 1QQCA 4JKEA 4IBNA 3VQEA 2HHSA 3VF4A 1U48A 4BVOA 1RILA 3CQYA 3ITHA 2NRVA 3VEZA 2A41A 1C0UA 3WXMB 2HHHK 2QWPA 4CE9A 3P1GA 2YCHA 1IJJA 3V81A 3P31A 2GELA 4DFKA 4JI4K 5AQSA 4CJLA 4UJ0A 3GBTA 1T7BA 3M1FA 3RMAA 1VQ4N 4HCBA 4KRFA 1W97L 4CCHA 3HJFA 5JS2A 4CBXA 4E7LA 4JV5K 3MX2A 2B6AA 3KWIA 3OYMA 3CJCA 3ZSXA 3PUFA 3IAYA 1NJZA 1HJOA 2KFNA 4KHNA 3AA3A 5SZTA 4DR1K 1C1AA 4OPHA 4DFMA 1QZ5A 1IKYA 3KOYA 4IO9L 4BC4A 2VGMA 4IEIA 4DUYK 1RFQA 2DFFA 4GW6A 1VSDA 5AFUA 1A5XA 4DQPA 4JS4A 2Q36A 4UY8O 4BGAA 3AO1A 4CF9A 3R3LA 4J8FA 4X65K 2YHWA 2BH1A 4DR5K 1WSHA 1SQKA 1S1XA 4LH5A 5C15A 4ICLA 3VEVA 4EP5A 4CZIA 1LQIA 3CETA 1KVAA 2YC1C 5AQIA 1P90A 4IDHA 4FYDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1Y64 A;  1FH3 A;  1FK9 A;  1W0H A;  4CJF A;  1RTI A;  1W7A A;  4EZ9 A;  3V4I A;  1U4B A;  2O4G A;  4ISG A;  4HCC A;  4FOE A;  1RT7 A;  2IOC A;  1DKG D;  1Q9X A;  3GDQ A;  4CHN A;  1BA1 A;  3A5N C;  3QEX A;  4WQ5 A;  3KLI A;  1HNV A;  4CHY A;  1RDW X;  4BDY A;  4DSJ A;  3TAM A;  1YIT N;  3CJ7 A;  3WEE A;  3MN7 A;  4ZHR A;  1GLC G;  3DLE A;  2A1R A;  3O8M A;  4XH5 A;  3WQU A;  4W5N A;  1J6Z A;  3ENB A;  1D4X A;  4JKH A;  3T1A A;  4FWS A;  1VAZ A;  2P9P A;  2ZGY A;  4IJA A;  4CJQ A;  4DSE A;  2Y1J A;  4KTQ A;  4CK3 A;  4FO0 A;  5JVH L;  4OX9 K;  4B3O A;  3RVC A;  4FPA A;  4V1D C;  4FWQ A;  1GLE G;  4CEQ A;  1YXQ A;  3SQ4 A;  3KWG A;  3VQ6 A;  5ELZ A;  1Q7Y O;  5FPN A;  1YJ9 N;  2MN5 A;  1VQ8 N;  3HPH A;  1U04 A;  2E88 A;  3QBW A;  4DV2 K;  3CF5 L;  3NFA A;  5BN8 A;  3TAQ A;  2OZS A;  3MEE A;  4IOC L;  3O08 A;  3AVJ A;  4CIE A;  4DQR A;  3HXM A;  5AQK A;  2E5L K;  4B9T A;  2G8I A;  4KBO A;  1NJW A;  3S41 A;  2E8A A;  4DV5 K;  3FZK A;  1RDU A;  4B3T K;  1GOB A;  1NKB A;  1UA0 A;  2G8U A;  2VG6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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