3D2EB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70, selenomethionine-labeled crystals
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 109
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2eB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2eB04
2V7ZA 4BREA 3VPZA 3H1VX 1TYQB 1YAGA 3OHRA 1NGGA 5AQYA 4GNIA 3J8AA 3SLCA 4BR7A 2E8AA 5KPTA 1QZ6A 2D1KA 2GWJA 2A6AA 3UKUA 3W3DA 3C7NA 2OANA 4BRCA 4Y0WA 4BRHA 1E4GT 2FLOA 2A41A 3U9ZA 5BRDA 5BN9A 2FXUA 3DAWA 3ID8A 4JHDA 3D2FB 1NM1A 2P9UB 4FWOA 3MN7A 2P9KA 4BR4A 5CE3A 4MO4A 5ADXA 5JLHA 4H0OA 2QWOA 3A0IX 4FOEA 1WUAA 2GWKA 5AQUA 4PKIA 1RFQA 3WXLA 2QWQA 3ZETB 4FWQA 4CBXA 4BQLA 4E1JA 2Q0RA 1QZ5A 5AZIB 3H3OB 4A2AA 1S22A 1XC3A 2ZGYA 2IVNA 3VESA 4CZMA 3B8AX 3MN9A 3GE1A 5AQZA 1T6CA 2FF6A 4CZJA 2Q31A 2FSKA 3O1BA 5KPZA 1MWKA 2P9NA 3H1QA 4HWIA 1GLJO 2QWRA 2W41A 4XEIA 2PAVA 4FPAA 1IG8A 4BC5A 5FPEA 4EAHD 3C7NB 3KVGA 3M6GA 5AR0A 1BWFO 3MN5A 3VF4A 1NGFA 4BRLA 4CD3A 4IO8A 4JHDB 1XQSC 2D0OA 2D4WA 2E2OA 1QQNA 4ISGA 1HPMA 2E1ZA 5AQQA 1C0FA 1KXPA 2ASOA 4GY2B 4BGAA 3D7EO 1U2VB 3HTVA 2YCHA 3R6MA 4IXCA 3L0QA 2YHWA 3CQXA 3VEWA 5FPMA 4CZEA 4B9QA 1NLVA 3H3NO 3LM9A 3LL3A 2A5XA 3ZX2A 3A5NC 4EFHA 3CJ1A 5BR9A 2ZWHA 4H5TA 4B1VA 3JS6A 4H5NA 5F1XA 1JCFA 3FZHA 4H0XB 1GLBG 2GEMA 2P9PA 4CZGA 3VERA 2D0PA 5BPLA 2P9NB 4XH4A 3HBTA 1CZAN 4CZLA 1GLLO 3GDQA 3IMXA 5AFUH 1YVNA 2NRHA 3IDHA 4CZKA 5AQVA 4JN4A 3C0BA 2HMPA 1Q18A 3CHWA 3QBWA 1IJJA 4KBOA 4BG8A 3LDOA 3LDNA 5AQHA 5KQDA 2QWNA 1RGIA 3TPQA 1NGEA 1NGDA 3AY9A 4WQ5C 3FFKB 2QM1A 1Y64A 2P9SA 5AQJA 1E4FT 5JMVA 1ATNA 4FOIA 3DWLA 3A8YA 3FR0A 5AFUA 3BP8A 2BTFA 1XUPO 1BA0A 1R59O 3WT0A 4ISFA 1BU6O 2Q1NA 3CJBA 1QQOA 1D4XA 1G99A 4MLEA 3UE5A 2DPNA 1NBWA 2Q36A 4BRGA 3I8BA 1ATSA 3VEXA 3WEEA 4FL9A 4JNEA 3ULEA 2P9PB 5AQRA 4BRQA 3VOVA 3VEZA 4BG9A 4H5VA 3AAQA 3WQUA 2BUPA 3EZWA 3EN9A 5ELZA 4K25A 4AM7A 5KPRA 1NGAA 1X3MA 1RDWX 4RCHA 3ZEUA 1Z05A 4M63C 1JCEA 4EIAA 3MCPA 3ENOA 5JLFA 3U8XA 3FGUA 3S41A 4ISEA 2YJEA 1KAYA 4BROA 5AZJA 2P9SB 4H0YB 3ENHA 4A2BA 4FWKA 4PKGA 4BRKA 3JXUA 5FPDA 1BOTO 3G25A 1Z6RA 1V4SA 4BRNA 2VCPA 1YXQA 2CGLA 5AQNA 5BPNA 4BRAA 3QDKA 1BUPA 3ZX0A 4FWLA 3QFPA 2QXLA 3BF3A 4B1XB 4BQZA 1U6ZA 5LJWA 3UKUB 4IJNA 4BRFA 2E2QA 2P9LA 4BGBA 4CZHA 4DHYA 1P8ZA 2Q97A 3SMSA 3EL2A 2Q2RA 3ULEB 2QWPA 1ESVA 1GLAG 1ZXOA 4FO0A 3EKSA 4EHTA 4H5WA 3FZFA 5BREA 2I7NA 1V4TA 2GELA 3BEXA 4CBUA 2P9KB 3LDPA 4BVOA 1GLCG 2E1YA 4FWPA 3L4IA 2PBDA 4CD1A 5AQLA 3ATVA 3U9DA 1KAXA 3FLCO 5F0XA 4WQ5A 2YHYA 3R8EA 1LCUA 3VEYA 4O5FA 2YI1A 1J6ZA 4L3QA 3ZEUB 3R9PA 4K42A 1NWKA 3A5MC 2AP1A 2HOEA 3BF1A 2J4RA 4NO7A 1X9JA 4QS8A 3VEVA 1DEJA 3VGMA 5AQKA 2QWMA 2ZGZA 2VWBA 2V51B 2QW9A 3O8MA 4CI6A 1X3NA 3H46O 5AZJB 5EY4A 4BRDA 4B1WB 3CJ7A 1ATRA 1TUYA 3QBXA 4K41A 3QICA 3WXKA 2V7YA 1NGJA 3U4LA 1BO5O 4FPBA 3DXMA 3EO3A 1SAZA 2A40A 4IZ9A 5BN8A 2NZTA 3BUZB 3CJAA 2IVOA 3VENA 5I9EB 2P9LB 3A5OC 1QQMA 3F9MA 5B8HA 4RTFD 4PL8A 5BRHA 2NLXA 2E20A 4H5RA 4XH5A 4DB3A 5AQIA 1DKGD 3W0LA 4BR9A 1NGCA 3A5LC 4H0PA 3VF6A 3CIPA 3IUCA 3O5BA 4CZIA 2FF3B 3GL1A 2H3GX 4WQ4C 3MK6A 5AQGA 4JAXA 3HI0A 2CGJA 4J8FA 3VGLA 1HKGA 2YHXA 3KZBA 2GUPA 2IVPA 2WUSA 3CJCA 2W40A 2ITMA 3SK3A 4QS7A 2P9IA 2V52B 3KHYA 3UB5A 3CETA 3RSEA 1HUXA 3EKUA 1EQYA 1H1VA 4M7XA 3DXMB 1MA9B 3H45C 4PL7A 2A42A 3DXKA 5KQ8A 3HZ6A 2KHOA 5JICA 4Z94A 2HF4A 4MO5A 3VETA 1S3XA 3GOIA 4A61A 3GBTA 4H0TB 1NGBA 4K43A 2F9WA 4FWNA 4BR5A 3LDQA 3WXJA 5E26A 5E84A 3DJCA 3HM8A 4DCHA 2YJFA 3CERA 4F9OA 3O4WA 2CH6A 1HLUA 4MLHA 4WYBA 3WQTA 1OKJA 4BVPA 4O8KA 5TKYA 1U2VA 1NGIA 1GLEG 1TUUA 4A62A 4H03B 3MDQA 2QWLA 4RWTA 3O80A 3LDLA 2VYPA 5AQFA 3QB0A 4CZFA 1GLFO 3WEEB 3D2EA 3QFUA 5AQTA 3FZMA 3O08A 4JD2A 2P9IB 3SMPA 5F2RA 3RSEB 4BRPA 4PKHA 4XH1A 2A3ZA 2AA4A 1K8KA 3CI5A 5EOYA 3UKRA 4YDUA 4EHUA 5LJVA 3DXKB 3FE1A 2Q0UA 5EXWA 1SQKA 3M1FA 5AQXA 1HJOA 4FWRA 3ZX3A 4B1UB 4B1YB 1ZBSA 2CGKA 4I6MA 2I7PA 4AM6A 1T44A 4BC3A 3M3ZA 4CJ7A 4NB4A 5FPNA 1BDGA 3P4IA 4IWVA 1ZC6A 4FSVA 1KAZA 3CJ9A 1HKCA 4WQ4A 2GTDA 3TU5A 3VF2A 5EVZA 4BR2A 1TYQA 4FWSA 3HSCA 4BRIA 2F9TA 1WOQA 1YUWA 3FZLA 1NMDA 2IIRA 1JCGA 1SZ2A 3LM2A 4BR0A 4BC2A 3WXIA 3GG4A 5LY3A 1BG3A 1HX1A 4YDUC 3D2EB 4BC4A 1LOTB 2FSNA 2ZF5O 2FSJA 4JD2B 1BA1A 1DGKN 1T6DA 1QHAA 4HTLA 5AQPA 3D2FA 2P9UA 5AQMA 3I33A 3FZKA 3L6QA 1K8KB 2E2NA 3O6WA 2ASMA 3UKRB 3AAPA 1MWMA 3QMLA 4CBWA 2UYTA 4M7YA 3WUHA 1NGHA 4IJAA 5EX5A 3CQYA 3ZETA 4LC9B 3H6EA 2CH5A 3AARA 1GLDG 3MN6A 5AQOA 5AZIA 3SJHA 1HKBA 5BPMA 2E88A 3ATUA 4FWMA 5AQSA 2EWSA 3MMVA 5BRFA 4I6MB 5AQWA 2HF3A 4C23A 2E2PA 1C0GA 4QS9A 4BRMA 4DQ8A 2ASPA 3O1WA 4B1ZA 3IFRA 1MDUB 4H0VB 3VGKA 3VEOA 5ADXH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V7ZA 3VPZA 4GV9A 3H1VX 5C2DA 1NGGA 5AQYA 4GNIA 1KFDA 1N36K 2E8AA 4M3YA 1LW0A 5KPTA 3U3YA 2UUCK 3P5JA 2A6AA 1FK9A 2FBTA 4BRCA 4Y0WA 1WNSA 4DU4A 1E4GT 2FLOA 3AVJA 3V9ZA 2F4VK 2FXUA 4RW7A 2N66A 5HRSA 4CF1A 4FWOA 3BDPA 1W9HA 2P9KA 4O55A 3SQ2A 3PIOL 1ZBIA 2NY8X 4BR4A 4YOXA 3M8RA 1W97L 5ADXA 4R5PA 4H0OA 4FOEA 2GWKA 1VQKN 1F21A 1NK9A 1HQEA 4CHOA 3NH1A 1ZU3A 3NMUA 1NJWA 4OVLA 4RW9A 3OTOK 4BE1A 1NK4A 2ZJPL 3ZT0A 4CHYA 3MECA 1EX4A 2XHBA 4IG0A 1D5AA 1MWKA 3HOTA 1SKRA 4IOCL 4FJHA 1TAQA 1R0AA 2VWKA 3IAYA 2W41A 4JKBA 3ZT4A 3OYAA 1IG8A 3WNGA 4M42A 3K5LA 1LQIA 3ENBA 1S6QA 1JLBA 4OGEA 1S9GA 2RN2A 2YNHA 2ZD1A 4XJXA 3VF4A 1NGFA 1KVAA 1RT7A 4CD3A 4IO8A 2NRRA 2VQEK 1XQSC 2D0OA 2D4WA 1IBKK 2P5GA 1LAVA 2E2OA 1QQNA 3DLEA 4CK2A 1JLEA 3LZIA 5AQQA 4F2RA 2KZZA 4V1DC 1OMYA 4BGAA 3MX5A 4O0IA 2ZE2A 5C24A 5SZTA 2BANA 4YFUA 1JKZA 3BGRA 3ZYYX 3M8PA 1C1BA 2HNYA 3CJ1A 2XO7A 5BR9A 2YNIA 5MLCQ 4X64K 1HYSA 2QA4N 3AO4A 4H5NA 5F1XA 3RWUA 3FZHA 3T1HK 4H0XB 1IKWA 1GLBG 2GEMA 1DTQA 1SN4A 2D0PA 3OYKA 2YEOA 4W5QA 1CZAN 3OYMA 1QHTA 1EXQA 1VSIA 2IC3A 2NNWA 4CZKA 5AQVA 2B3CA 4CJSA 2QKBA 4FLUA 1Q18A 3T1AA 4GMJB 1WLJA 1RGIA 3I8DA 2PYJA 1NGDA 1Q9YA 3AY9A 1Q8IA 3RMBA 4WQ5C 3THWA 4BDYA 3SJJA 3TARA 5AQJA 1Q7YO 2O8DA 3DWLA 1P90A 3IS9A 3FR0A 3ID6A 3EY1A 1CLQA 1TAUA 3P38A 3BP8A 5HP1A 2G8WA 2UUAK 4DQPA 3B6PA 1R59O 3HK2A 1BU6O 4CF9A 3OYFA 2HHSA 3QLHA 3TSQA 5GINA 3CCQN 1NBWA 3C95A 2DFEA 1NKBA 3I8BA 1LWEA 1VSFA 2P9PB 5FLXO 4DR2K 4C8KA 4OLAA 4BRQA 4AHSA 1LWCA 4KPYA 4FK2A 3UIQA 2HHUA 3EZWA 4JI2K 3SF4D 5ELZA 4CJLA 1VSDA 4JRQA 4G1QA 4FJ8A 2KLAA 1NGAA 1BL3A 1X3MA 1RDWX 4DSIA 4M63C 4DV7K 3QEIA 3MCPA 1T3VA 1KAYA 4N5SA 3T7ZA 4H0YB 4FWKA 4BE0A 5FPDA 1M1KO 4JI8K 2O8BA 3G25A 3AVHA 1NK5A 3VN5A 3F5TA 2VCPA 1TVRA 1YXQA 5BPNA 4IBNA 3DLRA 3IRXA 3HP6A 3QFPA 1C0MA 3BF3A 4M3WA 1MR4A 1OVYA 4CZHA 3JSMA 4DTOA 1EO1A 4J2BA 3ULEB 4C8MA 1YIJN 3VQ5A 1ESVA 1GLAG 4FO0A 1NJIO 1V4TA 3BEXA 4CBUA 4FLXA 3LDPA 4Y1CA 3ZSXA 1GLCG 4JK7A 2O8FB 1P00A 3J7ZO 2W6KA 4CD1A 2O8EA 1KAXA 5GAGP 1OH5A 5F0XA 4WQ5A 1S5JA 4Q0BA 2UXCK 4L3QA 4OKKA 3R9PA 1T1TA 4K42A 4J2EA 4I2PA 1ZFUA 4NO7A 3SCXA 4QS8A 3CFPA 3RMDA 4LFBK 3PX6A 3K5NA 1RBSA 1KVCA 4BRDA 3CJ7A 1KV0A 3EEQA 3WXKA 3V6DA 3E9LA 1U49A 4DV0K 3JAMO 3JYTA 4YOYA 1VQPN 4B3TK 1IV0A 4CK3A 4QOZB 2NZTA 1WT7A 5I9EB 2O4GA 3ISNC 2SN3A 2A1RA 3KKSA 1L3UA 1ITGA 5FRMA 1HMVA 5BRHA 3CPEA 3F9KA 4XH5A 4XIUA 1NJYA 1NGCA 4NXMK 2P51A 1XWLA 4KB0A 4JK9A 1TI5A 3CIPA 2RF2A 1KTQA 4DV1K 4DUYK 2FF3B 4ILGB 3OJUA 4EZ9A 4KTQA 2CGJA 3AA4A 3VGLA 3K9KA 2QK9A 4YOVA 2KQ2A 3IKMA 4FJKA 3SK3A 5FDLA 1KLNA 1NU0A 2HHVA 1FKOA 3KKRA 3H45C 3NCIA 3RMCA 2A42A 3CCMN 4AEIA 3HZ6A 2IS3A 4BWMA 1S6PA 3S9HA 4MO5A 1ZBUA 3VETA 3QO9A 4A61A 3VQEA 4BR5A 4PUOA 1TKTA 4EP5A 1VAZA 5FROA 2A7TA 2M8BB 2YJFA 3ZCMA 3O4WA 2CH6A 4MLHA 3OBWA 3THYB 2YNGA 4BVPA 5TKYA 4HTUA 1NRAA 2Z1JA 2EHGA 3I0RA 3SBGA 4CHPA 4CJUA 4F4KA 3VQ7A 1DLOA 4F3TA 1O13A 3WEEB 4E89A 3QFUA 1GOAA 3CF5L 3FZMA 3I55N 3AVNA 5F2RA 3TAQA 1IKXA 4CHQA 5EU7A 4PKHA 3M5RA 4Z4EA 4O5BA 1NG9A 5EOYA 2JDQD 4CIEA 1JL2A 3S3NA 2Q0UA 3PSIA 5EXWA 5C25A 5AQXA 3HL8A 5DMRA 2NUBA 4GVEA 3CM5A 4CEQA 2NRTA 1ZBSA 4J2AA 2CGKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2V7Z A;  3VPZ A;  4GV9 A;  3H1V X;  5C2D A;  1NGG A;  5AQY A;  4GNI A;  1KFD A;  1N36 K;  2E8A A;  4M3Y A;  1LW0 A;  5KPT A;  3U3Y A;  2UUC K;  3P5J A;  2A6A A;  1FK9 A;  2FBT A;  4BRC A;  4Y0W A;  1WNS A;  4DU4 A;  1E4G T;  2FLO A;  3AVJ A;  3V9Z A;  2F4V K;  2FXU A;  4RW7 A;  2N66 A;  5HRS A;  4CF1 A;  4FWO A;  3BDP A;  1W9H A;  2P9K A;  4O55 A;  3SQ2 A;  3PIO L;  1ZBI A;  2NY8 X;  4BR4 A;  4YOX A;  3M8R A;  1W97 L;  5ADX A;  4R5P A;  4H0O A;  4FOE A;  2GWK A;  1VQK N;  1F21 A;  1NK9 A;  1HQE A;  4CHO A;  3NH1 A;  1ZU3 A;  3NMU A;  1NJW A;  4OVL A;  4RW9 A;  3OTO K;  4BE1 A;  1NK4 A;  2ZJP L;  3ZT0 A;  4CHY A;  3MEC A;  1EX4 A;  2XHB A;  4IG0 A;  1D5A A;  1MWK A;  3HOT A;  1SKR A;  4IOC L;  4FJH A;  1TAQ A;  1R0A A;  2VWK A;  3IAY A;  2W41 A;  4JKB A;  3ZT4 A;  3OYA A;  1IG8 A;  3WNG A;  4M42 A;  3K5L A;  1LQI A;  3ENB A;  1S6Q A;  1JLB A;  4OGE A;  1S9G A;  2RN2 A;  2YNH A;  2ZD1 A;  4XJX A;  3VF4 A;  1NGF A;  1KVA A;  1RT7 A;  4CD3 A;  4IO8 A;  2NRR A;  2VQE K;  1XQS C;  2D0O A;  2D4W A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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