3D2EB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70, selenomethionine-labeled crystals
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 109
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2eB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2eB04
3VETA 5FPEA 4FOIA 1NM1A 3BF3A 3LL3A 2VCPA 3RSEA 5F0XA 1T6DA 3ZEUA 3HSCA 2P9UA 3DAWA 3GG4A 1T44A 2YHYA 1Q18A 3WXLA 2GUPA 2QWQA 4M63C 2YHWA 1GLLO 3AAPA 1XQSC 3VF2A 4RTFD 1NGIA 1DEJA 1V4TA 2IVPA 3CJ9A 3QBXA 5BPNA 4BC2A 5F2RA 3FZLA 1RGIA 3U9ZA 2GTDA 2P9IA 2EWSA 3CHWA 2P9LB 3ULEA 4EIAA 4J8FA 1T6CA 2I7NA 2E20A 4BR2A 1HUXA 1XC3A 3W0LA 1GLFO 1P8ZA 2P9KB 2E8AA 4BR9A 4XH1A 1K8KA 4CZGA 5AQVA 2CH6A 3WQUA 3D2FB 5AR0A 3A5LC 5FPNA 1C0FA 3SLCA 4AM6A 2YHXA 4BVPA 1QHAA 2QM1A 2D0OA 3TPQA 2HF4A 5BRDA 5AQKA 1MWKA 1U2VA 4FWOA 4KBOA 5EY4A 4WYBA 4FWRA 4IJNA 4NO7A 3G25A 3U4LA 3M3ZA 4ISEA 3HTVA 4ISFA 3WT0A 4BROA 3A5OC 3AAQA 2E2OA 4XEIA 3O1BA 5AQUA 4CZJA 3P4IA 3HM8A 4QS9A 5LY3A 5ADXH 5KPZA 1SAZA 4DHYA 1V4SA 2W40A 5E26A 2NRHA 3CJ1A 1RDWX 1U6ZA 2Q31A 2E88A 3VF6A 2FF3B 4CBXA 1KAZA 2HOEA 5EXWA 3UKUB 3VEOA 4GY2B 1S22A 1NLVA 3B8AX 1ATNA 3MDQA 1ZXOA 4B1YB 4BG9A 1HKBA 2QWLA 3A0IX 3ENOA 3CETA 4BGAA 3QB0A 3L4IA 5AQJA 4EAHD 1QQOA 3O6WA 4BR5A 2GEMA 2FF6A 5AQSA 3VEXA 1MDUB 3DWLA 1HLUA 3ZETA 4MO4A 2A5XA 3I33A 4E1JA 1ATRA 5KPTA 1BO5O 3QBWA 3IUCA 3DXKA 4EHUA 2AP1A 4H0PA 1NGHA 4AM7A 1Y64A 5BRFA 5AZJA 3GE1A 2P9NA 4H0XB 3AY9A 3H6EA 5JLHA 3DJCA 2P9SA 5AZIA 4H0OA 4GNIA 3H46O 1DKGD 4BC4A 4JHDA 1E4GT 3TU5A 1TYQB 2E2PA 2CH5A 2ZWHA 2FSJA 4EFHA 5ELZA 5AQFA 2IVNA 1BWFO 2FSNA 4C23A 2IVOA 4XH5A 4A2AA 1HKCA 1NGFA 3VESA 2CGLA 3UKRB 1KAXA 2P9PB 1IJJA 2V52B 3VOVA 1J6ZA 4BRFA 3SJHA 3FE1A 3D2EB 4IO8A 3EZWA 3IMXA 2A41A 4BGBA 3R9PA 4BQLA 4WQ4C 5ADXA 1GLBG 1NGCA 4EHTA 4K43A 4FO0A 4BRQA 5BN9A 1YXQA 3ID8A 3ATUA 1H1VA 3LM9A 1CZAN 3DXMA 1NWKA 3WEEA 3QFUA 4M7YA 1NBWA 4B1XB 3CJCA 3H3NO 1JCEA 5AQLA 4JD2A 5FPMA 4H0TB 5AFUH 5LJVA 3H3OB 3LDNA 5AQHA 4YDUA 1QZ5A 2D4WA 3VERA 1ESVA 4H5NA 4DQ8A 3A5MC 4B1ZA 1BA1A 2CGJA 4BR0A 1QQMA 3O1WA 3BF1A 5BN8A 1WOQA 5KQ8A 3AARA 1HPMA 4A62A 3C7NB 1ZBSA 5AQTA 3CQYA 4I6MB 3QMLA 1X3MA 4BC3A 2YCHA 5AQMA 1X3NA 3WQTA 4BR4A 4BRHA 4H0VB 4IJAA 2Q97A 1JCFA 4JNEA 3A5NC 1KAYA 1YUWA 4H0YB 2P9LA 4BRKA 3GBTA 3ENHA 1Z6RA 3S41A 3VF4A 1BUPA 3VPZA 5EVZA 4H5TA 4O8KA 2P9KA 4CZLA 5AQRA 5LJWA 4Y0WA 1IG8A 4NB4A 4WQ4A 4DB3A 3D2FA 1BA0A 3LDLA 2QWNA 1Z05A 3CI5A 3WUHA 1HKGA 3L0QA 1WUAA 2J4RA 1NGDA 4FWKA 4CD1A 1GLJO 3JXUA 4F9OA 4CBUA 3M6GA 4PKGA 3VGKA 3CIPA 3MN7A 5JMVA 2ZGYA 2V51B 4O5FA 4B1UB 1BU6O 2A40A 1ATSA 2Q2RA 2QWPA 2BUPA 3ZX2A 4BRMA 3A8YA 3BUZB 4H5VA 5AQXA 4CBWA 5I9EB 2A42A 3OHRA 3QDKA 2FSKA 3R6MA 1NGGA 1GLCG 3CJ7A 2PBDA 4A2BA 4LC9B 4L3QA 4FWSA 1SZ2A 4H5RA 5B8HA 3EN9A 3FZMA 3BEXA 4HTLA 3FZFA 3U9DA 4BRAA 2QXLA 4FSVA 4FWQA 4K41A 4YDUC 2NZTA 1HJOA 2Q0UA 1D4XA 2ASPA 5TKYA 4CZEA 4JAXA 3EKUA 3RSEB 2ZGZA 4B9QA 3I8BA 3ZEUB 1SQKA 2P9UB 4MLHA 2D1KA 3F9MA 3UKUA 5AFUA 3HZ6A 3M1FA 2VYPA 3R8EA 3MMVA 3MN5A 1LOTB 2NLXA 4QS7A 2Q36A 3IFRA 1OKJA 2WUSA 3VEWA 1QQNA 2P9IB 1S3XA 3CQXA 2PAVA 3ULEB 3WXKA 3QFPA 2YJEA 3VEZA 1YAGA 3GL1A 1LCUA 3KZBA 3FZHA 4CJ7A 4FWNA 4WQ5C 3J8AA 3KHYA 3L6QA 5AQGA 1KXPA 1K8KB 1X9JA 3ATVA 2GWJA 5KQDA 5AQPA 1E4FT 4IZ9A 5AQZA 1NGEA 4BQZA 4CZMA 5JICA 4FPBA 3FZKA 1RFQA 2YI1A 3H45C 4B1VA 2HMPA 4RWTA 5EOYA 4BREA 1YVNA 1U2VB 2W41A 2GELA 4RCHA 4IXCA 4BRNA 5AQOA 3D7EO 3UE5A 4DCHA 2FXUA 1MWMA 4BC5A 1TYQA 2E1YA 5E84A 1QZ6A 4FPAA 3ZX0A 2BTFA 4FL9A 4K42A 2ZF5O 4FWPA 4PKHA 5JLFA 1C0GA 2F9WA 3CERA 3UKRA 2P9PA 3SK3A 3VEVA 2AA4A 4BRDA 2IIRA 4CD3A 4PL7A 5BR9A 3D2EA 5BRHA 3H1QA 4CZHA 1NMDA 4QS8A 1BDGA 2D0PA 3CJBA 2A6AA 2YJFA 1BOTO 2OANA 3WXIA 2E1ZA 1TUYA 1NGAA 3ZX3A 3CJAA 2Q1NA 1DGKN 5AQNA 3MN6A 4WQ5A 3VENA 5EX5A 4MO5A 3WXJA 3U8XA 4A61A 3EKSA 4H5WA 3FGUA 3FR0A 2VWBA 5BPMA 4BRLA 4BRCA 3GOIA 2E2NA 3LDPA 3O8MA 2CGKA 2F9TA 5KPRA 5AQWA 4H03B 3EL2A 4BRPA 5CE3A 3HBTA 3MCPA 3O08A 3ZETB 3C7NA 5AQQA 5F1XA 4I6MA 3FLCO 4XH4A 5FPDA 2ASMA 2QW9A 3DXKB 2QWRA 3KVGA 1MA9B 2KHOA 1TUUA 2V7YA 4FWLA 2UYTA 5AZJB 3SMSA 3O5BA 3UB5A 2P9NB 1R59O 1EQYA 2V7ZA 2FLOA 2P9SB 5AZIB 3LM2A 1JCGA 3H1VX 3VEYA 3LDQA 3LDOA 2GWKA 4JHDB 4CZKA 2QWOA 5AQYA 1G99A 1GLDG 3GDQA 1GLAG 1NGJA 3O4WA 4BR7A 3JS6A 4BRGA 4CZIA 4BG8A 3QICA 4ISGA 2HF3A 1ZC6A 3HI0A 2QWMA 1XUPO 5AQIA 4JN4A 1NGBA 3EO3A 4CZFA 4CI6A 4IWVA 2Q0RA 3W3DA 4BVOA 4BRIA 1BG3A 2A3ZA 3BP8A 3FFKB 2ASOA 2I7PA 4PKIA 2ITMA 3VGLA 4MLEA 4K25A 2E2QA 3IDHA 4B1WB 3DXMB 4M7XA 4Z94A 4FWMA 3WEEB 3O80A 4FOEA 3MN9A 2DPNA 2H3GX 4PL8A 4JD2B 5BREA 3MK6A 3C0BA 4HWIA 5BPLA 1HX1A 3SMPA 1GLEG 3VGMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRSA 1L4VA 1SL2A 4CHQA 3RSEA 4M3UA 4AHUA 5F0XA 3CCQN 1X1PA 3GG4A 4OKEA 3ZSXA 1T44A 2HB5A 2YHYA 2Y1JA 2QWQA 4M63C 4RW6A 1GLLO 5LMUK 3VF2A 2LJ7A 4RTFD 4YOVA 1DEJA 2IVPA 3TR8A 2HVIA 5F2RA 2JWLA 1RGIA 2O8BA 1RBUA 4CCHA 4J8FA 3CC7N 3PSIA 4LF5K 4BR2A 1HUXA 3C6UA 1GLFO 2P9KB 4WFBL 5AQVA 5KI6A 2CH6A 4EP5A 5KRSA 2RPIA 3L3UA 5FPNA 4AM6A 2YHXA 1QHAA 3IRXA 4DFPA 3TPQA 2QK9A 3E66A 3K0SA 4UQGA 4DR4K 2YKNA 1L5UA 4F3TA 3U4LA 4ISEA 1LQQA 3LALA 1C1CA 3AAQA 3AO2A 2DTUA 1X9MA 2W6KA 2ZJPL 4XEIA 1HYSA 4CZJA 5AQUA 1GOCA 1JLEA 1N34K 3CC2N 2HHVA 2KGQA 1RT2A 2XY8A 2OPRA 5KPZA 4FZXC 4C8LA 3AVHA 3HSTB 2LI7A 2G8KA 4CJFA 1ZYQA 1L3TA 1DJTA 2Q31A 2LR3A 4IFEA 3VF6A 4DS4A 4KHUA 1KAZA 2HOEA 4IEIA 1NLVA 3J7ZO 2BDPA 1VRTA 3SUPA 3DM2A 1ZYVA 4DWIA 4CJWA 3VQ9A 3ENOA 4BGAA 2F8SA 1Y97A 3L4IA 5AQJA 4F4KA 1QQOA 1SNBA 1B9FA 4FLWA 5AQSA 3AVKA 2IS3A 3DLEA 1NPIA 4DTRA 5K14A 3I33A 2A5XA 2YNIA 1ATRA 3KP1A 4FLTA 1JXCA 2GX9A 3THWA 1RDUA 4UAFE 1D9FA 4O55A 5M1NA 1SKRA 4B9LA 3V1RA 4H0OA 1ZUTA 3TU5A 1TYQB 3O4NA 3DYAA 3AO4A 3NF9A 4OVLA 2IVNA 1BWFO 4RW8A 2O8FB 4C23A 1I6GA 3DMJA 3V9SA 1GOBA 1KFSA 4HHFA 3MXIA 1KAXA 4CESA 3HL8A 3K5MA 3FE1A 1JLQA 3IMXA 4YFUA 4B9SA 3PX0A 1SKSA 5ADXA 4EHTA 4LFBK 4XJXA 4C8NA 4Z4FA 2O8CB 2RN2A 3M8SA 1NRBA 1CZAN 2JGUA 2P5OA 1RBSA 4H4MA 3KC6A 4M7YA 1NBWA 3V9WA 4C1NI 1C55A 3KK1A 4H0TB 3ZSWA 3DOLA 4FJMA 4FLXA 1JKZA 5AQHA 1NE5A 4W5TA 5HL7L 4M45A 1KC8O 4GVEA 2CGJA 1L3UA 4FLVA 1QQMA 3C95A 1UAXA 2RKIA 1VQ6N 5BN8A 3L2RA 1CZBA 2XRIA 4FJJA 4A62A 1MU2A 4PA1A 4KHQA 1YTUA 4BC3A 2DY4A 2VY6A 3WQTA 1X3NA 4BR4A 1BHLA 4H0VB 3SBTA 1VNBA 3TAFA 4N76A 4DSLA 2ZQBA 4KRFA 4JKHA 4BRKA 4O0JA 1C0UA 1WAFA 2QEXN 3TTDA 2P9KA 4J2DA 3T19A 3K5NA 5LJWA 1JJ2M 2YV0X 4E3SA 5BR8K 3NAEA 4JKGB 3KTQA 2N2QA 3C6HA 1HR0K 1ITGA 1HQEA 4KAZA 4CBUA 3M6GA 3V9UA 1JZAA 2KSKA 3QESA 1YJNN 4HUFA 1ILYA 1UA0A 2B6AA 5JMVA 1FKOA 3QEIA 1BU6O 2A40A 3NH1A 2HBLA 2QWPA 2BUPA 4BRMA 3BUZB 5KK4A 3DRRA 5LMNK 2G8HA 2OZMA 2F96A 2JLEA 5DMRA 4LC9B 2G8UA 1K6YA 2FBYA 4CEBA 4WFNL 4FWSA 1VAZA 1N4NA 5B8HA 3EN9A 3FZMA 4BRAA 5I3UA 3FZFA 3I0SA 4FWQA 4K41A 3MWPA 2NZTA 1D4XA 2F4VK 4CZEA 4DV2K 3RWUA 4B9QA 2YKMA 1M90O 2Z1IA 4ELVA 2M8BB 2B5JA 3K9JA 4FJHA 3MN5A 3SYZA 5JENA 3E7UX 4GV6A 1LOTB 3L56A 2NLXA 2VGNA 3LPUA 1OKJA 2WUSA 1RNHA 3CQXA 2PAVA 3ULEB 3WXKA 2YJEA 1YAGA 4YOWA 4CJ7A 1EX4A 4CERA 1K8KB 3T3FA 3T7ZA 4NYNA 2ATQA 3MAQA 2LJMA 1E4FT 4IZ9A 1RTJA 2KW4A 3OYJA 1TL3A 1EKEA 3AGKA 1N32K 3FZKA 1A5WA 3HM9A 1T8EA 4RW9A 1VQLN 2IAJA 4B1VA 1I6FA 4ILGB 1DQ7A 3A2FA 4DV1K 2BRZA 1U2VB 2UXDK 4ZHRA 2W41A 3QO9A 4FYDA 1Q82O 4LY7A 4IXCA 4C8MA 4BRNA 1VQ8N 1E3MA 1RT7A 4DCHA 2G2KA 3CXCM 2KYQA 1TYQA 3ZT3A 4CF0A 4LH5A 3OTOK 4AHRA 1P90A 3ZX0A 5FLXO 5M1QA 2FBTA 2O8FA 4G1QA 4PKHA 1VSFA 3ZLJA 3SK3A 3RMDA 2NY9X 1N6QA 2QXFA 3KLHA 3D45A 4DG1A 4CZHA 4QS8A 3CJBA 2I61A 1BOTO 2JDQD 2OANA 3O3HA 3WXIA 5HOOA 1RILA 2OPSA 1WAJA 4KV8A 2O8CA 1K9MO 1RDBA 4O0IA 2N2RA 3E7RL 5CZ1A 3CCVN 3KWIA 3F9KA 4WQ5A 3H08A 4A61A 3WXJA 4IBNA 4CJQA 3EKSA 4UJ0A 2YNHA 3CFPA 4N47A 4B9TA 4KHNA 5BPMA 1XNRK 4CJ5A 3CCRN 4DU4A 2CGKA 3DLBA 4AH9A 4H03B 5HBMA 4BRPA 4CJ3A 3ZSOA 4W5RA 5F1XA 1CXQA 5KGWA 2N66A 5FPDA 3MXMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5HRS A;  1L4V A;  1SL2 A;  4CHQ A;  3RSE A;  4M3U A;  4AHU A;  5F0X A;  3CCQ N;  1X1P A;  3GG4 A;  4OKE A;  3ZSX A;  1T44 A;  2HB5 A;  2YHY A;  2Y1J A;  2QWQ A;  4M63 C;  4RW6 A;  1GLL O;  5LMU K;  3VF2 A;  2LJ7 A;  4RTF D;  4YOV A;  1DEJ A;  2IVP A;  3TR8 A;  2HVI A;  5F2R A;  2JWL A;  1RGI A;  2O8B A;  1RBU A;  4CCH A;  4J8F A;  3CC7 N;  3PSI A;  4LF5 K;  4BR2 A;  1HUX A;  3C6U A;  1GLF O;  2P9K B;  4WFB L;  5AQV A;  5KI6 A;  2CH6 A;  4EP5 A;  5KRS A;  2RPI A;  3L3U A;  5FPN A;  4AM6 A;  2YHX A;  1QHA A;  3IRX A;  4DFP A;  3TPQ A;  2QK9 A;  3E66 A;  3K0S A;  4UQG A;  4DR4 K;  2YKN A;  1L5U A;  4F3T A;  3U4L A;  4ISE A;  1LQQ A;  3LAL A;  1C1C A;  3AAQ A;  3AO2 A;  2DTU A;  1X9M A;  2W6K A;  2ZJP L;  4XEI A;  1HYS A;  4CZJ A;  5AQU A;  1GOC A;  1JLE A;  1N34 K;  3CC2 N;  2HHV A;  2KGQ A;  1RT2 A;  2XY8 A;  2OPR A;  5KPZ A;  4FZX C;  4C8L A;  3AVH A;  3HST B;  2LI7 A;  2G8K A;  4CJF A;  1ZYQ A;  1L3T A;  1DJT A;  2Q31 A;  2LR3 A;  4IFE A;  3VF6 A;  4DS4 A;  4KHU A;  1KAZ A;  2HOE A;  4IEI A; 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