2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
4LD0A 4CIGA 3HO1A 4FJ8A 4F3TA 1EETA 3ZSQA 4CJFA 4FM2A 3A2FA 4W5TA 4FJIA 1RCHA 4N47A 4CJUA 1FK9A 4FLZA 1JLAA 3TAFA 4E1MA 3LP2A 3PV8A 3S3NA 2JLEA 3DRSA 4Z4FA 4FJKA 3AA5X 4B9SA 3ZSOA 1QHTA 3C6UA 1QQCA 3OVNA 5J2NA 4CGIA 1XI1A 3H08A 3KIOA 3KKSA 4CEBA 3V4IA 5KTQA 1RBTA 3DRRA 3NF8A 3L2UA 5HRNA 3OS0A 3F9KA 3LALA 3LZIA 3NGYA 4HUFA 1LWFA 3UIQA 2OZSA 3NH0A 1IG9A 1D9FA 1B92A 4DTOA 2KZZA 3DM2A 4KTWA 4DLEA 3ITHA 3NGZA 3F73A 4FZYA 2RKIA 4Q5VA 3JSMA 3NDKA 3VQ9A 2Y1IA 3QINA 3TARA 4CESA 4K8XA 4KHUA 1B9DA 1U4BA 5HLFA 1LW0A 3QEIA 4CHPA 1QSYA 4B3OA 3QNNA 1XHXA 4CF9A 3KLFA 4PWDA 3HPGA 3IRXA 3JYTA 2ZE2A 2D0BA 4KTQA 4N56A 5FRMA 4DTSA 1GOAA 1JLFA 4OKJA 4HVJA 3LDSA 1S1XA 3EY1A 3AVGA 4DTRA 3TWHA 4QOZB 4FK4A 3L2VA 3CG7A 3OYEA 4HUEA 4FK0A 4CJQA 1TAQA 4GMJB 4FLYA 4CHOA 4KHWA 4E7JA 1JLEA 1RILA 1S1WA 4KB1A 2D5RA 1KVAA 1LW2A 1RBSA 3ZSYA 4CK1A 4N5SA 3HSTB 3KK3A 4FCYA 3U3GA 3PY8A 1YTAA 4DSEA 2B4JA 2DFFA 2IAJA 1ASUA 1TGOA 4HCCA 4RW7A 5JS1A 2OA8A 4BE1A 3OYGA 4CGHA 3ZCMA 1HNVA 4KPYA 1TKTA 3C6TA 2OPSA 2X74A 3SJJA 3TI0A 3ISNC 1Q8IA 4J2AA 4ZHRA 2BANA 4KFBA 1WSFA 4KTZA 1HQUA 2WOMA 1HJRA 3QERA 4CHZA 3PUFA 4NYNA 1TKZA 1GOBA 2ZQBA 3AVMA 2YHAA 4OKEA 4DS4A 3KKRA 4KAZA 4M3XA 3HP9A 4OPKA 4CCHA 4I9LA 1ZBFA 2RF2A 3OS1A 2KZMA 1WSJA 4CJ4A 4OPJA 4RW8A 1Q9XA 4O5BA 3KK2A 3CFPA 2YNFA 3OYHA 4I2PA 1BIZA 1JL1A 4CIEA 1C6VA 1LWEA 4CK3A 4FLUA 2PZSA 3IS9A 3PO5A 2F8SA 4MQ3A 1RT7A 3NAEA 1X9SA 5DK5A 1JLGA 4AILC 3AO1A 3AVBA 3PX0A 2VG5A 3I8DA 4DQIA 4M3ZA 2O4IA 3QO9A 4ZTJA 4FJ9A 1T03A 3AVLA 4M3RA 2A1RA 1REVA 4BWJA 3S9HA 3MECA 3VQ6A 3K59A 3LP3A 5I42A 1KLNA 3K58A 1KVCA 4DSLA 1LWCA 2P1JA 4FZZA 4KI6A 4MFBA 2IS3A 1ZBLA 4E7IA 1CLQA 4Y1CA 3MEEA 3V9WA 3K2PA 4E19A 4DTJA 3DLGA 4FLWA 4Y1DA 4B9MA 1RT3A 2E6LA 4OGEA 1GOCA 2BDPA 3MEGA 4FK2A 4CJEA 1U47A 4W5OA 3LWMA 3NF6A 4CJKA 3PX4A 1HYVA 3PO4A 4IFYA 4E1NA 3AVHA 1VSDA 1X9MA 1HRHA 4CGGA 3KK1A 3AO5A 1N5YA 4Z4EA 4J2DA 1IO2A 2EHGA 1K6YA 4NYFA 4JRPA 1X9WA 1SKSA 1RDBA 1L3UA 3RR8A 1S6PA 1CZ9A 2VG6A 5CYQA 4CEAA 3ASMA 4FW2A 3VA3A 1SL1A 1IKXA 3L2WA 3K5NA 1NKBA 2DFHA 4O0JA 1YTUA 2RN2A 2FBXA 5J2MA 4KRFA 4CIFA 3SV3A 2HB5A 4O0IA 2YNGA 1ASWA 3RMBA 4IKFA 1ITGA 4DF4A 3ZT0A 3ULDA 1TK0A 5HP1A 1WAJA 1T05A 1D9DA 5HRPA 1J5OA 3VQ7A 4CJ5A 2RPIA 1RDAA 1UA1A 1NK8A 4FJHA 2XO7A 3MXIA 1QSSA 4H4MA 1BISA 4FLTA 2X6SA 2ATQA 3WNEA 5KRTA 1UA0A 3DOKA 4DFJA 3KLIA 4FZXC 3K5OA 4G1QA 1RBUA 3DI6A 4BACA 1TK5A 4QAGA 2X6NA 4DU4A 2KFZA 4I9QA 3AVIA 1KTQA 1RDCA 4CEDA 1RTJA 3CQ8A 1NJZA 3T19A 4JLHA 3SQ4A 1NKCA 1L3TA 1JXBA 3VQAA 4R5PA 3NHGA 3KJVA 1T7PA 1KVBA 4CF2A 4RW9A 3RMCA 4QCLA 4AHSA 3D45A 2AJQA 4M3YA 2Z1JA 4KB0A 4I2QA 3OYNA 1C0UA 1VSFA 2HHSA 4ID5A 5HRRA 4FYDA 4Z4IA 1VSLA 5KI6A 4B8AB 2I5JA 2DTUA 3SUPA 1RTDA 4RW6A 4OLAA 4GVMA 2B6AA 3P83D 3QLHA 3TAEA 2W42A 2HHXA 1IKVA 3O3FA 1CXUA 1VSHA 4LSNA 1RBRA 3I0RA 3O4QA 4YNQA 4DSKA 3PX6A 2KW4A 2KTQA 1JLQA 1T8EA 5KGXA 1TKDA 1IH7A 3SQ2A 1NJXA 3EYZA 3TAQA 1KSPA 2G8VA 3IG1A 3TAPA 4Q0BA 2A1SA 4LY7A 1JXEA 3TANA 1HMVA 2OPPA 2B5JA 3SPYA 3LP1A 3VQQA 4HUGA 3DYAA 5HROA 1D5AA 3SNNA 4CEOA 1I3AA 4I7FA 4DSIA 3G10A 3RTVA 3DLRA 1BQNA 1SL2A 3NCIA 1LAVA 4FVMA 2KQ2A 3QEXA 3SQ0A 3S3MA 4Z4HA 1L3SA 1B9FA 2FBYA 1S9EA 3C94A 3V9ZA 1BIUA 3WNGA 2X78A 4ZTFA 3E01A 4FJLA 3V1QA 5J1EA 4W5RA 2Q3SA 3CFOA 4AHVA 1L5UA 2OZMA 2YKMA 2VWJA 4FJJA 3TR8A 3RMDA 4W5QA 3DLBA 1O1WA 1CZBA 3SYZA 4BDYA 4DFPA 4CFBA 3DLHA 3VQPA 1ZBHA 4DF8A 5E41A 1S5JA 4Z4CA 1WSHA 4B9LA 1QSLA 1U04A 3L2RA 3AVCA 3SUOA 4CE9A 4E3SA 4DQSA 2GBZA 1QTMA 3BDPA 4OGCA 5D3GA 3CM6A 3HYFA 1RT5A 3OY9A 1UWBA 2VG7A 1UOCA 3ALYA 5DMRA 4KHSA 3AA3A 1HPZA 2OPQA 3HJFA 3RWUA 4NCGA 5CYMA 3RRGA 1NOZA 2F96A 4E89A 4CF0A 4DFKA 1JKHA 3ZSXA 1Q9YA 4O44A 4TSXA 1Z26A 1TKXA 4FJ7A 2QK9A 4C8MA 2R7YA 3OJSA 3LP0A 4FLXA 1U45A 4FJNA 3AO2A 3VQEA 3CYMA 4K8ZA 4B9NA 2DY4A 1VSIA 1JLBA 4FM0A 1TL1A 2XY7A 1S1VA 4CFAA 1NKEA 1W9HA 1BHLA 3LWLA 1QE1A 3DMJA 3T1AA 4CJLA 2HMIA 4J2EA 2Z1HA 1G15A 3SZ2A 3OYFA 2QXFA 3VA0A 4AHUA 3HP6A 3QEPA 4NCBA 3QNOA 3L2QA 4Z4GA 4RW4A 4ELUA 4JS5A 3AO3A 4F3OA 4KI4A 3OYIA 4CEQA 2IOCA 4KO0A 1VSMA 2HVIA 1UAXA 4M3WA 1U49A 1NK5A 1RT6A 3AV9A 2ETJA 4IG3A 4L8RB 1NK7A 4O4GA 3AA4A 1NK4A 3SUNA 4KHQA 1VSEA 1WSEA 3MEDA 4M3TA 1RT4A 3AA2A 1RTIA 4FJ5A 2HHWA 3KLEA 3OYJA 1HYSA 3LAMA 3WNHA 3ZSRA 3ZT1A 3KLHA 3LZJA 4OKKA 2G8HA 4J2BA 5I3UA 3ZSWA 1BCMA 4DLGA 1BGXT 1RT2A 2Y1JA 4M3UA 3VQ4A 3HPOA 2F8TA 3VQ8A 2XHBA 4LSLA 1R0AA 1L3VA 4B08A 3OYAA 4DQRA 1VRUA 3O4NA 4O55A 3BGRA 3K57A 3U3YA 3LAKA 3MXJA 3EZ5A 1IKWA 1JLCA 2HVHA 2LSNA 3NH1A 2HNYA 3OYKA 4AH9A 4DU3A 4CGFA 4FJXA 1ZBIA 5SWMA 3THVA 3I0SA 3NFAA 1KFSA 1ZYQA 4PY5A 2D0AA 3DRPA 1TVRA 4ICLA 3VQBA 3LANA 4BE2A 3OYMA 1SL0A 3V9SA 4FW1A 1NK6A 3U6FA 2PYLA 3P1GA 4CJRA 3B6PA 4UQGA 4KHNA 1RBVA 2YKNA 2WONA 3AVJA 1KLMA 3LPTA 1EKEA 3LPUA 3D0PA 1HNIA 1EP4A 2XY8A 4BE0A 4DTPA 1RTHA 3OYCA 3KLGA 5C24A 1KRPA 2PY5A 3HL8A 1ZBUA 4CEZA 4PA1A 4KHYA 4CJPA 3S3OA 3M8RA 4CEFA 2G8UA 1BI4B 4CJVA 2HHUA 1DTTA 4B8CA 1SV5A 1MU2A 1TL3A 3AO4A 4CFDA 4ELTA 4E7HA 3IAYA 1S6QA 1NOYA 4FXDA 1A5VA 1XHZA 3TABA 1KCFA 4F2SA 4DG1A 4EP4A 4JS4A 5HRSA 1CXQA 5C25A 3T3FA 1VRTA 2BE2A 3L3UA 3SCXA 1TK8A 2KFNA 3L8BA 4EP5A 4LH5A 3SPZA 3VQ5A 4OLBA 2GUIA 5CZ1A 4BWMA 1RNHA 1BI4A 1VSJA 3HPHA 1DTQA 5CY4A 3VN5A 5KRSA 1Z25A 1D8YA 1LAWA 2HHTA 3OYBA 5T7BA 3MAQA 4CJSA 3C95A 1YT3A 4AHRA 4HCBA 3QIOA 1RT1A 1LV5A 1EX4A 2P5OA 1SKRA 4N76A 2JGUA 2ZD1A 4PQUA 3OYDA 1DLOA 1EXQA 1J9AA 2D0CA 3NGIA 3AVNA 4DTXA 3B6OA 2IGIA 5KGWA 2OPRA 4KKOA 5J2QA 4DS5A 4DQQA 3V1OA 3OJUA 3M8QA 1SKWA 1A5XA 2IDOA 4F8RA 4E7LA 4CK2A 1J54A 1FXXA 2E4LA 4CHNA 4NCAA 4GW6A 4IG0A 1S9GA 4LH4A 3TAMA 3HVTA 2E6MA 4WE1A 4YFUA 3NH2A 3TAGA 4FJGA 4DTNA 3V1RA 5FROA 4W5NA 4DMNA 4E7KA 2P5GA 4CEEA 4OJRA 4B9TA 4IFVA 1C0TA 3ZT4A 4JRQA 3QIPA 1S1UA 3KD5E 2HW3A 5K14A 2O4GA 4CF8A 5FRNA 1BL3A 4EZ6A 3VQDA 3QEWA 1WAFA 4CGJA 3HXMA 3NF7A 5CZ2A 4CFCA 4FM1A 3QETA 3V81A 3WNFA 2G8FA 3K5MA 4HTUA 4OVLA 4IBNA 3CM5A 3CFRA 3KTQA 4C8LA 4CGDA 3HT3A 1VSKA 4B9VA 4E0DA 4CJ3A 4DSJA 3SV4A 5FDLA 4DSFA 5EU7A 3RMAA 1HYZA 1X1PA 1XWLA 2DFEA 2NUBA 2Z1GA 1J53A 3FFIA 4KV8A 4CJWA 3O3HA 2BGGA 4CERA 3M8SA 4ID1A 2YHBA 2YNHA 2YNIA 3DOLA 1S1TA 3OS2A 1I39A 3V9UA 4C8KA 1SUQA 4CHYA 4XIUA 5C42A 4M42A 3ZSVA 3K5LA 3AVAA 5HBMA 3ZT2A 3L3VA 4PUOA 2FC0A 1C0MA 2P51A 4IDKA 3OYLA 3NE6A 1C1BA 1A5WA 2Z1IA 3O3GA 2HHQA 1VK0A 4DFMA 1QS4A 1WNSA 2VWKA 4HHTA 1U48A 1C1AA 1BCOA 2FBVA 2G8WA 1NK9A 1N6QA 3KD1E 4DTUA 4F4KA 4AHCA 2XY5A 1WSIA 4BDZA 5JS2A 1BQMA 4FLVA 2QKBA 3AVKA 2EX3A 4DTMA 3G0ZA 2G8KA 3ZT3A 3HM9A 3MXMA 1F21A 5J2PA 2XY6A 4N41A 1WSGA 1NJWA 4AHTA 4ELVA 3DLKA 3HVRA 3V9XA 4B9UA 3SUQA 3AVFA 2FBTA 2PYJA 4F2RA 4C8OA 2G8IA 4CJTA 3RR7A 1C1CA 1Y97A 2HNDA 1IKYA 2HNZA 2HHVA 2XRIA 4DQPA 1WLJA 1ASVA 1WN7A 5SZTA 3NF9A 3RRHA 4FJMA 1FKPA 3P5JA 4RG8A 3QEVA 2OYQA 4DU1A 3M8PA 4DWIA 1TAUA 1FKOA 1HQEA 4M41A 2GV9A 2QKKA 4C8NA 3SQ1A 3SI6A 2YV0X 4M45A 3V6DA 3QESA 1XC9A 1JL2A 3NBPA 4H4OA 4Z0UA 1KFDA 4EZ9A 1NK0A 4CHQA 4CECA 1W0HA 1TV6A 4BDPA 4KREA 3DLEA 1RDDA 1YVUA 2IC3A 2ITGA 3HK2A 3VQCA 1NJYA 4H8KA 4CF1A 3ZSZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJFA 4N47A 1FK9A 4FLZA 3TAFA 4E1MA 4H0TB 3C7NA 4FJKA 1XC3A 4B9SA 2HBMA 4CD3A 3C6UA 4BRDA 1HPMA 3OVNA 3V4IA 2V7YA 2QW9A 1RBTA 1WUAA 3CCSN 3EE9A 5M1QA 2P9NB 1RDWX 1IG9A 5M1FA 1YUWA 3ITHA 4BREA 4Q5VA 3NDKA 4X64K 3QINA 5AQLA 3LDNA 1U4BA 1IV0A 2E2PA 3QNNA 1XHXA 5ELZA 1RFQA 3THYA 2D0BA 3AGRA 3LDSA 4DTRA 4DR1K 3TWHA 2D1KA 2OTJN 3BF3A 1YXQA 4FK0A 2VCPA 1TAQA 4CBWA 2E20A 1JLEA 1RILA 5M1KA 2D5RA 1NGFA 1RBSA 4FCYA 4CK1A 3HSTB 3LDOA 1QQOA 3U3GA 3A5NC 2NRWA 4DSEA 4Z94A 4FWOA 4HCCA 4RW7A 2OA8A 1NWKA 4BE1A 3OYGA 1HNVA 2OPSA 2X74A 4JKFA 4GV9A 4ZHRA 4KFBA 4KTZA 5AQVA 5E84A 1HQUA 3A8YA 4NLBA 5AQZA 1TKZA 1GOBA 3J80O 2FXUA 5GINA 4BVPA 3HP9A 4M3XA 4JN4A 2O8DB 4CZLA 1Q9XA 1JL1A 4FLUA 4FVUA 3NAEA 1X9SA 5BREA 1JLGA 4LF7K 4BG9A 2P9IB 5JMVA 2NLXA 2VG5A 1VQLN 5H1SQ 4DQIA 4M3RA 4BWJA 3MECA 3VQ6A 4BG8A 4FZZA 3CCJN 3O9UA 1S22A 1ZBLA 3O9TA 2E5LK 4U7BA 4BRCA 4FLWA 4Y1DA 3TTFA 4B9MA 4FK2A 1GOCA 1U47A 4W5OA 3NF6A 1WBDA 3PX4A 1NNEA 3PO4A 1W2BM 3KK1A 1N5YA 5KPRA 2EHGA 4DR3K 3WXJA 1X9WA 1SKSA 1S6PA 4CEAA 3ASMA 3G71N 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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