2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
4CHNA 4IG3A 3AO4A 1RBVA 2B4JA 3OVNA 4NCAA 2XO7A 4H4OA 4W5QA 2XY5A 4DWIA 5EU7A 1YTAA 5KTQA 3VA0A 3C95A 1D9FA 3NFAA 1RDBA 3SJJA 4KI4A 3HK2A 2HHUA 4CFBA 1T7PA 4QOZB 1I39A 4ZTFA 2VG7A 4DFKA 3ALYA 3CQ8A 4FK2A 1JL2A 3ASMA 4HTUA 4RW8A 1RT1A 1G15A 3ISNC 3NAEA 3D45A 4FVMA 4CGJA 2ZQBA 4CJ4A 4FLYA 4EP4A 4PY5A 5HBMA 1NK4A 1L3VA 3OS0A 1QHTA 3T19A 4M3YA 1RT3A 4HUGA 4Q5VA 4W5RA 3NDKA 4G1QA 4CF8A 4FJKA 3VQDA 4DTSA 1LAVA 3O3GA 4E7IA 1NKBA 1SKRA 2G8HA 3LANA 4B9TA 4CEAA 1VRUA 1R0AA 1IH7A 4DU4A 3QEWA 1U04A 1MU2A 1NJWA 2JLEA 4I2PA 3V1OA 1UA0A 1HQEA 2BE2A 3PY8A 3KLFA 3HVTA 1BCOA 1RTIA 3G0ZA 4E3SA 4C8OA 2HB5A 2KZMA 4CFDA 1KTQA 1RBUA 3RTVA 1KSPA 2Q3SA 4E7LA 1SUQA 3LAMA 4KTQA 1VSKA 4AILC 4FW1A 3QLHA 3VQPA 3L2UA 1T03A 4GVMA 3NH0A 2I5JA 2ITGA 4DU3A 4FM2A 3MXMA 3B6OA 2HVIA 1TK0A 2G8VA 2RF2A 4E19A 2Y1IA 3RR8A 1QTMA 2X74A 3V1QA 4W5NA 1S9EA 4Y1DA 2B6AA 3P5JA 4DSEA 4E1MA 2FBYA 4E7KA 1KLNA 4QCLA 3ZT0A 3KLHA 4FJJA 3OYAA 2OPSA 4NYNA 2KTQA 4CJLA 4DLEA 1VSEA 3K57A 3LP3A 1J53A 1IG9A 1TKXA 2O4GA 3SQ2A 2F96A 3OYKA 3PO5A 4FZXC 3VQ9A 4IKFA 1TL1A 4M3UA 1RDDA 1DLOA 4CF2A 3HYFA 2HHQA 4DFMA 1J5OA 1HNVA 1L3SA 1WAJA 3P1GA 4CJPA 1JL1A 1JLEA 4FJIA 3VQCA 3NF9A 4FLXA 1WSIA 5CY4A 4C8MA 4M3RA 3ZT4A 1VSHA 3LPTA 2VWJA 2VWKA 3HPGA 2D5RA 3V81A 2XY6A 3TABA 3SUNA 4K8XA 1VSLA 1X1PA 4DTJA 1XC9A 4J2AA 4JS4A 1JLCA 1GOAA 2XRIA 3AVIA 3P83D 2QKKA 4DQQA 5FRMA 1W0HA 2YHBA 5HRSA 1ZBLA 3KK2A 4OKJA 5K14A 1RNHA 3AVFA 3HPHA 3NGZA 3OYFA 1XI1A 3O4QA 2HMIA 3OYDA 2RKIA 3ITHA 4F2SA 4LSLA 4IDKA 1S9GA 4DQIA 3H08A 4BE1A 4B9UA 3PX4A 1ITGA 3UIQA 4ELVA 1F21A 4HCCA 4FZZA 2BGGA 3SV3A 4CJRA 2OPQA 3MECA 1L3TA 1VSFA 2IOCA 2WOMA 3SI6A 2KZZA 4DTPA 4FJNA 3TAPA 4LSNA 3RRHA 3OYJA 3SQ4A 1A5WA 1NK9A 4DQSA 3TAMA 1BGXT 3LDSA 3PV8A 3ZSWA 4CEBA 3AVMA 3DMJA 4H8KA 3OYGA 1X9SA 4FJ8A 1GOCA 1UAXA 4NCBA 1IKVA 2LSNA 3DRSA 3KIOA 1TGOA 4KV8A 4LH5A 3HT3A 3LP2A 3KJVA 4IFVA 3QIPA 2P5GA 3DLGA 1ZBHA 3TARA 4ZTJA 2DTUA 2YNHA 4Z0UA 1YVUA 1HYVA 3ZT2A 3KLEA 3AO1A 2KFZA 2FBVA 2DY4A 1IKYA 4O0JA 4CGGA 3QEVA 3RMBA 1BIUA 3MEDA 1NKEA 4M41A 4B9VA 4CERA 1VRTA 3V4IA 5CZ1A 5HLFA 3SV4A 2GV9A 2KFNA 4O55A 3VQQA 3PO4A 3VA3A 3U3YA 4DS4A 2YKMA 1C0MA 5JS1A 4OGEA 1WSFA 3SUQA 4CIGA 3KTQA 1HYSA 4E1NA 1YT3A 4CJ3A 4B9MA 1KVAA 3F9KA 3OJUA 4KTWA 4ELUA 1LWEA 3SZ2A 3LWLA 1ASVA 3QESA 3DLHA 1IKXA 2Z1HA 3V6DA 3RMDA 1SL2A 4OPJA 1WSJA 4CF9A 4YFUA 1X9MA 3VQ7A 1RT4A 1JXBA 4CEFA 3AV9A 4OVLA 3NE6A 1S1UA 3LAKA 3ZSRA 1S1TA 3E01A 3DLEA 4HVJA 2HHTA 4BDYA 3PUFA 4FW2A 3CFOA 4CEEA 4M45A 4DF4A 1CZ9A 2RPIA 4O0IA 2D0AA 4B9SA 4DQPA 2YNFA 2DFFA 3S3OA 4O4GA 3KLGA 3HP6A 5HRRA 1EETA 3MEGA 1NK7A 2FC0A 3QINA 2IDOA 2E6MA 3CG7A 5KI6A 1ZBUA 3AO3A 2A1SA 4H4MA 3AVHA 3AO2A 2Y1JA 2ZE2A 3LPUA 1KFDA 4C8NA 3OS2A 2YNIA 2X6NA 4CJWA 4DTUA 3WNFA 2EX3A 1RCHA 4DSJA 1CXQA 1O1WA 1ASUA 2HNYA 2OYQA 4E89A 3AVBA 1SKWA 4Z4IA 1W9HA 3K5MA 3ZSQA 1S5JA 1BL3A 3AA4A 3C6UA 4OJRA 3OYLA 4OKEA 2GUIA 3WNGA 3HM9A 4FJ5A 3QEIA 3DLRA 3VQ5A 3L3VA 4CK2A 3C94A 3BGRA 3DRPA 3LALA 4N56A 4KAZA 1RTHA 3L2VA 1HRHA 4PQUA 3FFIA 3SPZA 5HROA 4J2DA 1VSJA 2G8FA 1DTTA 4HHTA 3MXJA 5KRTA 1SV5A 4R5PA 3QNNA 1IO2A 4FM1A 5J2QA 1RBSA 4DTMA 1U47A 1QSSA 1RBTA 2E4LA 1VSIA 3LP1A 2G8UA 1BCMA 3NF7A 4CIEA 5T7BA 3JSMA 1UA1A 2YKNA 4M3WA 4M3ZA 3B6PA 4KHQA 4DFPA 4O44A 2VG5A 4Q0BA 3QETA 1C0TA 1NJZA 3OY9A 1EX4A 3L3UA 5C24A 3OYBA 3U6FA 4B9NA 1ZBFA 3M8QA 4HCBA 1N6QA 3VQAA 4Z4HA 3O3HA 2P5OA 4CFCA 3V9ZA 1BQNA 1TVRA 3OJSA 4CK3A 3ULDA 4JRQA 2EHGA 4FJMA 5DMRA 3AVGA 2QK9A 2BDPA 2IC3A 1D8YA 2OZMA 4O5BA 1RTJA 4MFBA 3JYTA 2PYLA 4E0DA 4FJ9A 4HUFA 1T8EA 3TWHA 4FLZA 2RN2A 1BISA 4CEZA 1WNSA 1TKDA 4HUEA 4L8RB 2G8IA 4DSLA 4I9QA 3LZJA 3HVRA 4DQRA 2BANA 2DFHA 2X78A 4DMNA 5DK5A 5KGXA 3QEPA 2PY5A 4FK0A 3K5LA 5HRPA 1XHZA 1NJYA 4CHOA 2HHSA 1JLQA 3PX6A 5J2PA 3K59A 4DF8A 3S3NA 4B8AB 1QSYA 1UWBA 1IKWA 4I9LA 2B5JA 4CJKA 2D0CA 3S3MA 2HNZA 3TAQA 1BI4A 1BQMA 5D3GA 1TL3A 1WAFA 1FKPA 4ZHRA 4B3OA 2AJQA 3VQEA 1VSMA 4W5OA 3LWMA 5SWMA 3RMAA 1JXEA 4CCHA 1XWLA 4AHCA 3KK1A 4FCYA 1VK0A 1BHLA 3F73A 1WSEA 3RR7A 4KHWA 2G8KA 5I3UA 5J1EA 4W5TA 1NK5A 4C8LA 1B9FA 2ATQA 1WLJA 2W42A 2ETJA 4MQ3A 4CHZA 3M8SA 4IBNA 4CESA 4BWMA 3HPOA 1D9DA 3KD1E 3AA2A 2O4IA 3WNHA 1TKTA 3L8BA 1KVCA 4AHTA 4GMJB 4BE2A 3ZCMA 4AHRA 4JS5A 1L5UA 2PYJA 3OYEA 1CLQA 4Z4GA 3QERA 3OYCA 4F4KA 1KCFA 5CYQA 4KI6A 4UQGA 1NK0A 3HXMA 3CM5A 4DTRA 3NH1A 5FRNA 4NYFA 3PX0A 3NHGA 3AA5X 3AVCA 3NGIA 3VQ8A 1LAWA 3O4NA 3L2RA 4E7HA 1TK8A 1HYZA 3M8PA 4F3TA 2HVHA 2E6LA 1C0UA 3DOLA 4N5SA 3CM6A 4DG1A 2OPPA 3OS1A 3VQ6A 2XY7A 1C1BA 1J54A 4KFBA 1SL1A 4FZYA 4JLHA 2YV0X 3V1RA 4B9LA 5SZTA 1C1AA 4NCGA 3K58A 4FJHA 3TI0A 4BACA 4M3TA 3HL8A 4CHQA 4DSKA 3LZIA 2JGUA 4N41A 4OPKA 1RDCA 4XIUA 4AHSA 2IS3A 1JLGA 4Z4CA 3S9HA 4EZ6A 1S1XA 3DM2A 1BI4B 4IFYA 4EP5A 4AH9A 3AVJA 2XY8A 1U4BA 4ID5A 4CE9A 1RTDA 4K8ZA 1RDAA 1Q8IA 3ZSXA 1LV5A 3BDPA 3HO1A 4I2QA 3OYIA 2A1RA 1ZYQA 3LP0A 3V9XA 2Z1JA 3THVA 1ZBIA 2DFEA 3DLKA 3SQ1A 3TAEA 1NJXA 3TANA 2YNGA 3G10A 1KLMA 1TK5A 3KD5E 4CJFA 3OYNA 4KHUA 4OGCA 4E7JA 3A2FA 3AA3A 5J2MA 4JRPA 4WE1A 3M8RA 1KRPA 3I0RA 4B08A 3KK3A 5J2NA 3NF6A 4QAGA 1LWCA 4C8KA 1L3UA 1UOCA 2ZD1A 1RT5A 4CJTA 4CJUA 1CZBA 4YNQA 1RBRA 4CECA 4FJGA 3K5OA 4B8CA 3EY1A 4F2RA 4DTXA 4CGHA 4BDZA 2IAJA 3HSTB 3RMCA 1S6QA 4OLAA 1X9WA 1NOZA 1FK9A 2QKBA 1QE1A 3L2QA 1FXXA 1S1VA 4FLUA 1B9DA 3IRXA 3K5NA 4RW9A 1NKCA 1Q9XA 4F8RA 3NCIA 1NK8A 3C6TA 3VQBA 3TAFA 3IAYA 2HHXA 3NF8A 4KO0A 3VQ4A 4N47A 4LY7A 1WN7A 2Z1IA 5C25A 4FK4A 1HQUA 1BIZA 3NBPA 4RW6A 1QSLA 1JLAA 1JLBA 3AVNA 1S6PA 1LWFA 5CZ2A 1LW0A 4N76A 4FJ7A 4LH4A 3ZSVA 1J9AA 3I8DA 3SUOA 3SQ0A 2R7YA 4RG8A 1TV6A 1N5YA 1FKOA 1WSHA 2KW4A 4DU1A 1CXUA 1C1CA 2X6SA 1LW2A 1HNIA 2HHVA 4KHYA 3I0SA 5HRNA 2OA8A 4KPYA 3KKSA 3SCXA 5I42A 3SUPA 4M42A 1SKSA 4KRFA 1RT7A 3AO5A 4FJXA 1RT6A 2Z1GA 3DLBA 5KRSA 4DLGA 1REVA 3ZSZA 3CYMA 4CK1A 4CF1A 5E41A 2HHWA 3AVLA 4RW4A 5FROA 1I3AA 3IS9A 4Y1CA 3T1AA 4DTOA 1QQCA 3SNNA 3HP9A 3KKRA 1EXQA 1NOYA 4GW6A 3TAGA 3DYAA 3OYHA 3EYZA 5JS2A 4KREA 4PWDA 3DRRA 3SPYA 4OLBA 3IG1A 4CJSA 4DTNA 1U48A 3ZSYA 4ELTA 3SYZA 2NUBA 3O3FA 2WONA 1T05A 4CJEA 2VG6A 3U3GA 2P51A 4DFJA 1NK6A 2OPRA 3HJFA 1TAUA 1EKEA 2G8WA 4PUOA 4BDPA 1Y97A 1K6YA 1SL0A 4Z4FA 1C6VA 4M3XA 4AHUA 3EZ5A 3CFPA 1EP4A 1WSGA 1HJRA 1VSDA 3OYMA 3QEXA 2XHBA 4J2BA 5KGWA 4CHPA 4CGDA 4FXDA 1TAQA 2FBXA 3NGYA 4CHYA 4CIFA 3ZT3A 1Z26A 5C42A 5FDLA 3D0PA 1ASWA 1DTQA 4ID1A 3V9SA 4CEOA 3T3FA 2PZSA 4AHVA 2F8SA 4KKOA 3V9WA 3L2WA 4CJVA 3QIOA 1YTUA 2FBTA 3VN5A 4CGIA 3DOKA 3NH2A 1RILA 4BWJA 4FLWA 1XHXA 2P1JA 1D5AA 1Z25A 1HMVA 3RWUA 2IGIA 4CGFA 2YHAA 3V9UA 3RRGA 3MAQA 4F3OA 4J2EA 4KHNA 4EZ9A 5CYMA 4RW7A 1KFSA 3CFRA 1B92A 3K2PA 3TR8A 1U45A 3ZSOA 3QO9A 1KVBA 4CF0A 2QXFA 5HP1A 4ICLA 1S1WA 4CJ5A 4TSXA 4FLVA 4KB1A 3DI6A 4CEDA 4DSIA 2KQ2A 4I7FA 4BE0A 4PA1A 3AVAA 3MEEA 3ZT1A 4CEQA 1U49A 1GOBA 1RT2A 4DS5A 4FLTA 4KHSA 3WNEA 3QNOA 4FYDA 2D0BA 2GBZA 4KB0A 4OKKA 1A5XA 4CJQA 1HPZA 4Z4EA 1A5VA 4DSFA 2HW3A 4FJLA 4FM0A 1JLFA 4LD0A 1Q9YA 3MXIA 4CFAA 1JKHA 1TKZA 3KLIA 4IG0A 4KTZA 2F8TA 2OZSA 2HNDA 3AVKA 1QS4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHNA 3OVNA 1WUAA 3CJ7A 1SAZA 2XY5A 2Q31A 5ADXH 1D9FA 3HK2A 3SJJA 2BUPA 1T7PA 4DFKA 4B9QA 1G15A 2QWOA 2ZGYA 3NAEA 4CGJA 5JVHL 4FLYA 3CPWM 1YXQA 1C0FA 3GG4A 3TTCA 3O6WA 5AQPA 4HUGA 4Q5VA 4FJKA 2ASPA 1LAVA 2G8HA 4FOIA 4B9TA 4CEAA 1VRUA 1R0AA 5C0YA 1U04A 2JLEA 3V1OA 1UA0A 2NZTA 2BE2A 3PY8A 3KLFA 1BCOA 3G0ZA 1WBDA 3W0LA 3I55N 4AILC 3QMLA 3QLHA 1T03A 1HNZK 3DJCA 4GVMA 2I5JA 3MXMA 4A2BA 1BO5O 4B1YB 4E19A 1VQ8N 2Y1IA 3RR8A 1QTMA 2X74A 4CVNE 2FBYA 3CCSN 2OPSA 3O9SA 4GV9A 1VQNN 4FWPA 3SQ2A 4FZXC 3VQ9A 1TL1A 4HWIA 1RDDA 1HNVA 1L3SA 4FLXA 5CY4A 4M3RA 3ZT4A 3V81A 3WXIA 3I8BA 1W0HA 1ZBLA 3KK2A 5K14A 4FWRA 3CC2N 3OYFA 4IXCA 3PIOL 1YAGA 3O4QA 2RKIA 4LSLA 4CZFA 1S9GA 3DWLA 3TPQA 1F21A 1T6CA 3T1YK 3SV3A 3O9RA 2OPQA 3A8YA 1L3TA 1VSFA 4CJ7A 2KZZA 4FJNA 3P4IA 3MN7A 4KH4A 4DQSA 3TAMA 3PV8A 4DB3A 3AGRA 1LOTB 2HBKA 3DRSA 5LY3A 1TGOA 3HT3A 5AQVA 3KJVA 3QIPA 1XMQK 1OH8A 4ZTJA 1GLJO 2DY4A 1YUWA 3AO1A 4DR7K 1IKYA 1X3NA 3QEVA 3CQYA 4H5NA 4X66K 4NB4A 4B9VA 4GVEA 5AZJB 4CERA 3V4IA 5CZ1A 4O55A 4BRKA 4DS4A 4B3SK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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