2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
4KO0A 4N47A 1JLFA 3RMBA 2HHQA 3OYAA 2KZMA 3T1AA 1RT6A 2FBTA 3C95A 1RDCA 1SKRA 3AA2A 4GW6A 2I5JA 3AVKA 4O55A 4CJ3A 1NK4A 4FZXC 2F96A 3DLEA 3NBPA 4J2DA 3K5MA 4LSLA 2OPRA 4KV8A 5HRNA 1HYVA 1HPZA 2IGIA 4DSFA 2VWJA 1Z26A 4DS4A 3LDSA 1ASWA 4CF1A 1RTIA 4M3ZA 4CJPA 1T8EA 1EP4A 3RMAA 2HW3A 3F9KA 3QLHA 4FZYA 4IDKA 2F8SA 4OLAA 1SKSA 5DMRA 1S1TA 3NGIA 3HSTB 2G8HA 4Q0BA 2IC3A 3WNFA 4NYFA 1QQCA 3DRPA 2DFFA 4E19A 4Z4HA 3KJVA 4DTNA 1B9FA 3QEXA 4CJQA 3G0ZA 4CHPA 4FLTA 2B4JA 3HVTA 3DYAA 4FXDA 4Z0UA 2PYJA 3SUNA 4I7FA 3KLHA 3G10A 3I0RA 3M8SA 2YKNA 4G1QA 3PX4A 2R7YA 1HQUA 4YFUA 1VSEA 2OPPA 3OY9A 3L2VA 3NHGA 3MXMA 4KHWA 1WSFA 4JRPA 3L2WA 4M3TA 4CGDA 3KLEA 3T3FA 5C24A 2NUBA 1W9HA 3FFIA 3V1QA 3ZT1A 3AVNA 5JS2A 1MU2A 2GBZA 4H8KA 4AHVA 3L2QA 4N5SA 1G15A 1A5WA 5HRRA 3PX0A 1X9SA 3V1OA 3TAMA 1TKTA 4CHZA 4CJRA 3VA3A 3SQ1A 1D8YA 1LWFA 1JLBA 1VSIA 3ZSRA 3DRSA 2RF2A 4CEDA 4OPJA 4W5QA 3OS2A 4DFJA 4CHOA 1NOYA 4KHQA 3LP1A 3U6FA 3V9WA 4HUGA 1KVBA 2Z1IA 4FW1A 3S3NA 2FC0A 1RILA 4CEQA 3P83D 5J1EA 1ZYQA 3IG1A 2HHUA 3LANA 4CEFA 4M3UA 4ZTJA 4DQQA 3L3VA 4FVMA 1NJZA 2BDPA 3TAPA 3O4NA 3OYGA 3OYBA 3OJUA 2XRIA 3DLHA 2HMIA 3LAMA 4ZHRA 2O4GA 3LP2A 2LSNA 1JKHA 3KLGA 3HM9A 3KTQA 3IS9A 1KCFA 4OLBA 4IG3A 3VA0A 1RCHA 3SUOA 4F2SA 3DM2A 3DI6A 3AVAA 2X78A 3ZT3A 5C42A 1NJXA 2FBXA 4LY7A 4CF9A 5SZTA 4FK0A 1TKZA 2HVIA 4CF2A 2HHXA 1WAJA 3ALYA 1IKVA 2QKBA 4B9TA 1S9EA 4NCGA 3L2RA 4AILC 4NCAA 1BISA 3VQ7A 3TANA 4DFKA 1T03A 3AV9A 3V6DA 1NK8A 5C25A 1SL2A 4CE9A 4M3YA 4Z4IA 1U49A 4PUOA 4LH5A 3MXIA 3CG7A 4KTZA 3U3YA 4DSKA 2HHWA 3AVMA 3HVRA 3NAEA 3OYKA 4CEAA 1HRHA 2JLEA 4B9UA 4Y1CA 1RT7A 3K5NA 1WSGA 1QSSA 1QHTA 5CYMA 2XY8A 3ZSVA 3ZT2A 3QNNA 1N6QA 3C6UA 4FLYA 4BACA 4DQPA 2E4LA 3DLBA 1B9DA 4CF8A 3EY1A 2G8IA 5KI6A 5I42A 3AVLA 1BL3A 3SUPA 1RT5A 4XIUA 1REVA 1IKXA 1RBUA 3HP6A 4Z4EA 3D45A 4F4KA 4PWDA 3ZCMA 3M8QA 4DTJA 4FJ9A 4CFAA 1N5YA 3NFAA 3K57A 3CYMA 1VSMA 1HJRA 1BQNA 2VG7A 1S5JA 4DU4A 4FJNA 2YNFA 1TGOA 1ZBIA 3LZIA 1LV5A 1BI4A 1RTJA 4KHSA 4FYDA 3U3GA 3QEVA 5J2MA 3QNOA 4FLZA 1U47A 1IKYA 1D5AA 3M8PA 3VQQA 4FLXA 1NK0A 4FJJA 4CJWA 3LP3A 3AA4A 1JLGA 1WNSA 1BCMA 3HPOA 1VRTA 4WE1A 3HJFA 1SV5A 4HVJA 3ISNC 3QETA 4E1NA 3UIQA 1ITGA 1NOZA 1TV6A 2OPSA 2ZD1A 4B9LA 1LWEA 3RMDA 3TWHA 2BANA 3NH1A 4M3WA 3EZ5A 4QOZB 2P5GA 3QINA 4FJGA 3O3FA 2G8KA 2VWKA 4KHNA 2DTUA 1LAVA 4M41A 4FJHA 3CM6A 1RDAA 2WOMA 3AVCA 1ZBHA 4M3RA 1WSJA 3KLIA 4ZTFA 1TK0A 2XY7A 1NKCA 4OJRA 2BE2A 3SNNA 1Q9YA 4GMJB 4RW4A 4DSIA 1RT3A 3THVA 4CHYA 4H4OA 4M42A 2OA8A 2HNYA 3MEEA 4CJUA 3M8RA 1BIZA 3F73A 4DU1A 5EU7A 4DG1A 4HHTA 3SZ2A 1NJWA 4DQSA 3OYLA 1CLQA 4IBNA 1DLOA 3VQCA 3JYTA 2D5RA 4AHRA 2W42A 1JLAA 1TVRA 4O0JA 4DFPA 1L3SA 3NCIA 4CJ5A 4HUFA 3AVHA 3TAQA 3B6OA 3MXJA 3T19A 4BDPA 4F8RA 2YKMA 1IKWA 3MECA 1EETA 3AO4A 1DTTA 4NCBA 3VQ6A 4DLEA 4BE0A 4E7LA 3RR8A 3BDPA 4CK3A 1KSPA 4CHNA 3ZSOA 1Q8IA 5HROA 1RTDA 3CFOA 1D9DA 4CHQA 4IFYA 3K5LA 2Z1GA 4LSNA 4OKKA 4BE1A 1U48A 3ITHA 3VQBA 3ZT4A 1WSEA 4LH4A 1SKWA 2YHBA 4DFMA 3JSMA 4IKFA 2D0BA 4TSXA 3OYFA 3MEDA 2GUIA 4RW8A 4Z4FA 4B8AB 5T7BA 2YHAA 2YNIA 3C94A 3L3UA 3VQDA 1TAQA 3V9UA 4MFBA 3HPGA 3RRGA 5E41A 2G8FA 3QEIA 1IO2A 1CZ9A 3CFPA 4DTUA 1U45A 3OYMA 1NK9A 3KKRA 4C8OA 4K8ZA 3VQAA 3LWMA 1TK8A 3ULDA 4CGGA 3PO5A 1BHLA 3HXMA 1J5OA 2KTQA 1XHXA 2OZSA 3ASMA 4F2RA 1JL1A 5SWMA 2YNHA 1WN7A 3NH0A 3KK1A 4DSEA 3QEPA 2O4IA 1TL1A 2B6AA 4W5TA 3HO1A 4Y1DA 2D0AA 3C6TA 4RG8A 1RT1A 4Z4GA 4QAGA 4DQIA 3AA5X 1A5XA 2HNZA 1C1CA 1JLCA 1WAFA 2X6SA 1EX4A 5KRSA 3OYEA 1QSLA 4E7JA 2HVHA 1JL2A 1BCOA 1HQEA 3NH2A 1C0UA 4O0IA 1TKXA 1K6YA 1LW2A 3HYFA 4GVMA 1NKBA 1J53A 4JRQA 3SQ4A 3QIPA 1JLQA 3HT3A 1VSKA 4PY5A 4DQRA 3S3MA 4O44A 4YNQA 1VSLA 4O5BA 4ELVA 1VRUA 5D3GA 2Z1HA 2PY5A 1EKEA 1S1WA 4C8LA 1QS4A 1KLMA 2KQ2A 2F8TA 1HYSA 4N41A 3SPYA 3SV3A 3TR8A 3OYNA 2DY4A 4O4GA 1KVCA 1KFSA 1RDDA 4DWIA 5HRPA 3P5JA 4FJ7A 5FRNA 3ZT0A 3LPUA 3L8BA 3KK2A 3TARA 1X9WA 1RBSA 4K8XA 1RTHA 3KD1E 2A1SA 3QO9A 4CESA 1R0AA 3NF6A 4ID5A 2IOCA 4OPKA 2RPIA 5KGWA 3OYJA 4HCCA 1LAWA 2P5OA 4AHUA 4CEZA 4ELUA 4OVLA 3PY8A 3OS1A 3TAEA 1BIUA 1HYZA 3LAKA 4OKEA 4CGFA 4KTWA 4PA1A 5KGXA 1KTQA 4EP5A 2XO7A 5J2QA 4W5NA 3AO3A 4CGHA 3OJSA 3CFRA 4FK2A 1KFDA 1BI4B 4CGJA 4CJKA 2XHBA 4DTMA 2IAJA 4FCYA 5K14A 3VQ9A 3VQ8A 2VG5A 4FLWA 4CFDA 4IFVA 4NYNA 3NF7A 3SQ2A 3SCXA 1C0TA 3AA3A 4CIEA 4J2EA 3I0SA 2P1JA 3ZSQA 3KKSA 2WONA 3QERA 2KZZA 3AVFA 3OYCA 2YNGA 4I2PA 1YVUA 3AVGA 2IDOA 4MQ3A 4CK2A 3V9SA 3CM5A 5HLFA 4C8KA 4I2QA 2A1RA 3NE6A 4E3SA 5J2PA 3SI6A 1QTMA 1VSDA 3DLGA 3OYIA 3RWUA 5FROA 4IG0A 4E89A 3I8DA 4KHUA 3K2PA 2PYLA 4B9VA 1RT2A 3K5OA 2GV9A 4JLHA 1XC9A 3AO5A 1I39A 3QEWA 4LD0A 4CJFA 1U4BA 1DTQA 1ZBUA 2OZMA 2QKKA 2X6NA 1ASVA 2HB5A 1LWCA 3TI0A 1IH7A 4CECA 1KLNA 4DTSA 2HHSA 4DTOA 1S1VA 1UA0A 1WSHA 3AO2A 1QSYA 3SPZA 1A5VA 4W5OA 5HP1A 1NJYA 4DSLA 1WSIA 4CJTA 4L8RB 1GOAA 3OVNA 2KFZA 4DTXA 3A2FA 1ZBFA 3VQEA 3HPHA 4BDZA 1I3AA 5J2NA 4F3TA 1VK0A 2DFHA 2D0CA 1VSHA 1EXQA 3SYZA 4DSJA 1S9GA 1YT3A 1L3UA 1NK6A 4DF8A 3PV8A 1FKOA 3ZSWA 1BGXT 2ETJA 3BGRA 3K58A 4M3XA 4B3OA 1CXQA 4F3OA 4CERA 4B9NA 4EZ6A 4W5RA 4FM1A 3OYDA 2QXFA 1ASUA 5FRMA 3KIOA 4H4MA 2OPQA 3DRRA 5CY4A 4BDYA 4KTQA 1IG9A 4FJ5A 4CK1A 2Z1JA 3S9HA 1RT4A 3WNEA 2P51A 3VQPA 1JLEA 4JS4A 2ATQA 1RDBA 4ELTA 1JXEA 1L3TA 3H08A 4CJLA 2YV0X 5CZ2A 2EHGA 1D9FA 1T7PA 4CIGA 1UOCA 4FLUA 3RTVA 4UQGA 2HHTA 2ZQBA 1UAXA 3DLRA 3O3HA 4CCHA 1UA1A 3ZSYA 2HHVA 1VSJA 3NGZA 3DLKA 1YTUA 3SJJA 3S3OA 1RNHA 3LZJA 1GOBA 2VG6A 3KLFA 4ID1A 4CFCA 1XWLA 4E7KA 3LALA 4E7HA 3QESA 3ZSZA 2QK9A 1C1AA 3NGYA 4KFBA 2AJQA 3TAFA 3MEGA 4FZZA 4CJVA 1C0MA 5CZ1A 3VQ5A 1X1PA 4CEBA 4N56A 3V9ZA 2XY5A 3DMJA 3RR7A 2BGGA 1YTAA 3DOKA 4CIFA 2EX3A 1S1XA 3VN5A 1KRPA 1TL3A 4FLVA 4AHSA 1S6QA 3NF9A 3V9XA 1FK9A 4QCLA 2Y1IA 4KAZA 3B6PA 4R5PA 1JXBA 4C8MA 4E7IA 1XI1A 3O3GA 2ZE2A 3AVJA 2IS3A 3HL8A 1X9MA 3QIOA 3K59A 1CZBA 4CJEA 4N76A 1U04A 4CEOA 4DTPA 3V1RA 3OS0A 2G8VA 4KB1A 1QE1A 4PQUA 1B92A 2Q3SA 3L2UA 4KI4A 1BQMA 4AHCA 4FJ8A 4BWMA 1RBTA 1WLJA 4EP4A 4CEEA 1L3VA 4CGIA 1O1WA 3PUFA 2JGUA 4HCBA 4FJMA 2E6LA 3AO1A 4KKOA 4RW7A 1RBVA 4AHTA 1RBRA 3NF8A 3ZSXA 4CFBA 5CYQA 1TKDA 1KVAA 3VQ4A 4FK4A 1Y97A 4KRFA 1SUQA 4DTRA 3WNHA 4DLGA 2FBYA 4OKJA 5FDLA 5DK5A 3PO4A 3HK2A 1NK5A 1SL1A 3WNGA 4KPYA 4RW6A 4OGEA 4B9SA 2PZSA 1NK7A 3NDKA 3LPTA 2RKIA 4CJ4A 4DS5A 1L5UA 3P1GA 1UWBA 1TK5A 2RN2A 1J9AA 4JS5A 3IRXA 5HRSA 4FW2A 4AH9A 3LWLA 2KFNA 1C6VA 4I9LA 4FM2A 4HUEA 5KTQA 3AVBA 1SL0A 4Z4CA 3IAYA 3HP9A 3PX6A 4CF0A 4E0DA 4J2BA 4KREA 1TAUA 4FJKA 2B5JA 1HNIA 3KK3A 1S1UA 2E6MA 4B8CA 1ZBLA 1HMVA 3D0PA 4B9MA 2OYQA 1C1BA 4KI6A 3EYZA 3CQ8A 1S6PA 3SV4A 1FKPA 3O4QA 4ICLA 3TAGA 2G8WA 3RRHA 1T05A 1VSFA 4DF4A 2DFEA 5HBMA 5KRTA 3SUQA 4FJLA 1GOCA 5I3UA 3KD5E 3E01A 1F21A 3LP0A 1Z25A 2KW4A 4DMNA 3TABA 3OYHA 2ITGA 4EZ9A 3AVIA 3MAQA 4KHYA 3SQ0A 3DOLA 4OGCA 4FJIA 1W0HA 2XY6A 4DU3A 3V4IA 4C8NA 1NKEA 3RMCA 4RW9A 4E1MA 4FM0A 4B08A 2HNDA 4Q5VA 1Q9XA 4I9QA 1XHZA 4CJSA 2X74A 4FJXA 1FXXA 5JS1A 1J54A 4HTUA 3V81A 4J2AA 1LW0A 4M45A 4BE2A 2Y1JA 2G8UA 2FBVA 1HNVA 4BWJA 4KB0A 1CXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B1VA 2FBTA 1MA9B 1RDCA 5FLXO 4XH4A 4O55A 2I5JA 1NK4A 3DLEA 3NBPA 4J2DA 4CZJA 4YHHK 2Q31A 4DV5K 1Z26A 1DGKN 4CF1A 4M3ZA 3CMAN 4YOTA 1EP4A 2IVOA 1BU6O 3ULEB 4OLAA 3TTCA 3MN9A 3HSTB 1QVFM 4DTNA 4Z4HA 2ASOA 2NRZA 3QEXA 3G0ZA 4CHPA 2B4JA 3HM8A 4JD2A 3M3ZA 3M8SA 2UYTA 2YKNA 5AZJB 4BRIA 4IOCL 1WSFA 4B1WB 1K8KB 2GTDA 5EXWA 4JRPA 1DKGD 4JI8K 3HOTA 4CGDA 1U2VB 1W9HA 3V1QA 4JI4K 4DQ8A 1JCEA 5BPLA 5JS2A 1MU2A 2P9SA 4H8KA 4M63C 3U8XA 5CE3A 3SQ1A 4A2AA 2Q1NA 3OS2A 4DFJA 4EAHD 2RF2A 5MLCQ 5EX5A 4CHOA 2QI2A 4HUGA 1QZ5A 2GX9A 2O8FA 3IG1A 4WFNL 4M3UA 2Q2RA 3N4QA 4NLCA 3OYBA 1S72N 2HMIA 2IVPA 3VTIA 4Z94A 4ZHRA 3QICA 2HF3A 3IS9A 2YI1A 4OLBA 3O9UA 1NGGA 3DI6A 4JHDA 4B1YB 4OX9K 4CF9A 2E2PA 3FZLA 2HVIA 3ALYA 2QKBA 1BISA 3TANA 4DFKA 3AV9A 4BREA 1NK8A 4CE9A 1U49A 2EWSA 2QWMA 4KTZA 3AVMA 3HVRA 3NAEA 4Y1CA 1WSGA 4JEPA 2XY8A 3ZSVA 3ZT2A 3J81O 2GELA 3C6UA 3GL1A 3CJ1A 4JKAA 2E4LA 4M7XA 4CF8A 1RT5A 1IKXA 4Z4EA 5M1PA 4PWDA 3U9ZA 3M8QA 4XEIA 1BQNA 4FJNA 2RE2A 3LZIA 1HPMA 1Q7YO 1U47A 3TSUA 4R79A 3L4QA 1NK0A 5AQWA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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