2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
b'HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
3OYDA 4CCHA 3ULDA 4DTNA 1NKBA 4LY7A 1SL1A 3HT3A 2G8KA 1B9FA 4ZHRA 3K5LA 3TAGA 1IO2A 3SQ1A 4N41A 3DOLA 1ZBHA 4O0IA 3OYBA 4F3OA 2QKBA 2WOMA 4QOZB 4KTWA 4MQ3A 1BQNA 4B9NA 1NJZA 2PY5A 4N47A 4F8RA 3V6DA 3K2PA 4M3ZA 1S9EA 1HQEA 2E6LA 4RW7A 1VSHA 5T7BA 3V9XA 2HB5A 3HPOA 1U49A 4CEZA 4CFCA 1A5WA 2A1SA 3NE6A 4I9LA 2YHAA 3AV9A 3E01A 3MXJA 4DFKA 1KCFA 1W0HA 4MFBA 3ZSOA 1DTQA 4AHTA 1TKZA 3QINA 3JYTA 4OKJA 3TI0A 4CHYA 3OYMA 2P5GA 3NGIA 2G8VA 5DMRA 3TAPA 3FFIA 4NYFA 3EY1A 2OZMA 1D5AA 4CGGA 4CHZA 4CEAA 3SYZA 5C42A 1R0AA 2G8HA 1RCHA 3AVFA 3VQ9A 2BE2A 3OS1A 1VSDA 1NK6A 2Q3SA 4HHTA 2YNGA 4FCYA 1U48A 4E7IA 2XRIA 4DSEA 3EZ5A 1ASVA 2D5RA 3PX0A 1RILA 3ZSXA 2G8WA 4ID5A 4J2EA 1S1TA 4B9SA 4B08A 5DK5A 4ICLA 3ZSRA 4CF1A 1NK4A 3OYEA 3VQCA 2Z1IA 3TAMA 4CJVA 3LAMA 3T3FA 3CM5A 3ZCMA 3V1RA 4RW4A 3SQ2A 3NF6A 3HP9A 1SKWA 3IAYA 3SQ4A 4NCAA 2OZSA 3VQ7A 3AVBA 4FJNA 4HCBA 3V4IA 1ZYQA 4B8AB 3SNNA 4E1NA 5J1EA 1NK5A 1GOBA 4B9UA 2VWJA 1RTDA 4C8LA 3MEDA 4CJQA 2B4JA 3KK2A 3L2VA 3WNHA 3ZSZA 4HTUA 4CEEA 2GV9A 2GBZA 3IRXA 1GOAA 1D9DA 4CJ4A 3NGZA 4CJ3A 1S1UA 5I42A 3KD1E 4Q0BA 1A5VA 1REVA 1UAXA 3NH2A 4KHUA 2HW3A 2HHVA 1NJWA 5K14A 4FJKA 2HNYA 4CGJA 1XC9A 4AHRA 4CHOA 4CJLA 3CFOA 4O55A 4Z4CA 4B9LA 4H4MA 4IFYA 4PUOA 3DLKA 4PA1A 5FRNA 1YVUA 4OGEA 1EP4A 1S9GA 2YHBA 4FK0A 4E19A 3OYJA 3AA2A 3VQDA 4KRFA 2O4IA 2FBYA 2KW4A 3L2QA 1CXQA 1UOCA 1VSFA 4O5BA 3L2WA 4E7JA 3QEIA 4PY5A 1C0UA 3B6PA 1XHZA 3DYAA 4O0JA 4CIEA 4HCCA 2YNHA 4CJPA 3QNOA 4I2PA 3SV4A 4LH4A 4DLGA 2IC3A 3OYKA 3V1QA 4W5QA 1TK8A 4DSJA 3ZSYA 4CFAA 3MAQA 4M3WA 4CFBA 4K8ZA 3O4QA 4ID1A 1W9HA 3MXIA 5JS2A 3OYHA 3NF8A 3AA4A 4FJJA 4FZXC 4WE1A 2KZMA 3MXMA 3THVA 1C1BA 3C6TA 4AHVA 4DFMA 1N6QA 1J5OA 5J2QA 4OJRA 3NF7A 1ZBLA 4FJLA 4R5PA 3ZT3A 4DTPA 4QAGA 3OYLA 4FJGA 2OA8A 2BANA 4AHCA 5CY4A 2KQ2A 4CIGA 3MEEA 4OKKA 5EU7A 1CZBA 3BDPA 3HL8A 5C24A 2R7YA 1T8EA 3LP0A 2NUBA 3VQ5A 1BCMA 3QO9A 3KK1A 3M8SA 4F2RA 4FM1A 3OYAA 4IBNA 3NF9A 1C1CA 3HP6A 4E7KA 1DLOA 4RW8A 1TK0A 1WSJA 4LSLA 3DOKA 4DFPA 4DS4A 4KREA 1YTAA 1S1WA 2IS3A 2X78A 3KJVA 3L3VA 5CYQA 1HQUA 1Z26A 4EZ6A 3AA5X 3VQ6A 1JXBA 1RBUA 3RRHA 3QESA 3AO2A 3V9ZA 1JL1A 3ZT1A 2JGUA 1F21A 3VQ8A 3QLHA 1NOYA 2KZZA 4CK1A 1QSYA 3O3FA 2I5JA 1S1VA 4JS5A 4CK3A 3VN5A 3RRGA 1BQMA 4Q5VA 3HYFA 2G8IA 3V81A 4B8CA 2JLEA 3C95A 3MECA 3AVLA 1J53A 1VSMA 3DLRA 3K57A 2Z1GA 3M8QA 5KGXA 1JLCA 3CFPA 2DFFA 2ZQBA 1WSIA 3KLHA 4TSXA 1IH7A 2Y1IA 3TAEA 1XHXA 1TKDA 3WNGA 4C8OA 3LANA 3TABA 1L3VA 4FLYA 3LWMA 3AA3A 1U04A 1S6QA 1LV5A 3HSTB 3ZT2A 1KRPA 4CEOA 3SJJA 5KRSA 4BDZA 1C6VA 1QE1A 2HNDA 1BIUA 4KHYA 3QERA 2QKKA 2AJQA 4FZYA 1BIZA 1XWLA 4CESA 4J2DA 4Y1CA 4FYDA 2RPIA 4CF8A 1RT6A 1I3AA 4KB1A 5CZ2A 4DU3A 4H4OA 4DTJA 2OPSA 3D0PA 1MU2A 3AVKA 2P5OA 3VA0A 4F4KA 1LWEA 1VSLA 3DLEA 1UWBA 4NYNA 2XO7A 4DTUA 2XY6A 3KLIA 3SUOA 3O3GA 4CIFA 3H08A 3S3NA 2OPRA 1J54A 1L3TA 4K8XA 3HJFA 4IFVA 3SQ0A 2QK9A 3RMDA 1SL0A 1RT7A 1RNHA 4OPKA 3BGRA 2P1JA 1JLBA 1I39A 4BE2A 3RR7A 3VQPA 2PZSA 1QS4A 3V9UA 1JLAA 3IS9A 1JXEA 3NFAA 1SKRA 4CHNA 4FLWA 1HNVA 3DRPA 3KK3A 4KTZA 3LPUA 2HHUA 3HPGA 4CHPA 4CHQA 1VSIA 4CJ5A 4BDYA 4KAZA 4UQGA 1ZBFA 2YKNA 1RBVA 1WN7A 2E6MA 4LSNA 3OS0A 4JLHA 4YNQA 1LWFA 4FJ5A 1J9AA 1LAWA 1RDBA 5KI6A 4FJMA 3RMAA 4OLBA 1ITGA 3L3UA 4I7FA 1IG9A 2HVHA 1N5YA 1L5UA 2XY7A 4FJHA 3DRSA 4G1QA 4DF8A 3OY9A 1RT1A 2IDOA 4B9VA 1HYZA 2HHSA 1WAFA 4CGFA 2LSNA 1KFSA 4O44A 1WSFA 3K5MA 4C8NA 4FLUA 1S5JA 4ELTA 4M42A 3QEPA 2FC0A 3CG7A 3HM9A 4KV8A 1XI1A 2D0AA 5KRTA 4FM0A 2PYJA 2F8TA 4CJWA 4CEQA 1B9DA 2FBXA 3KTQA 3V9WA 3LZIA 4C8MA 1HPZA 4ZTJA 4IG0A 4AHUA 1HJRA 4E1MA 1Q8IA 4CF9A 4LD0A 1RT4A 3ASMA 3KIOA 1FK9A 4E7HA 4NCBA 1SL2A 4DLEA 4FM2A 4OKEA 4I2QA 4CE9A 4DTMA 4B9TA 1S1XA 3SCXA 4EZ9A 1TL3A 4CJSA 2A1RA 2GUIA 2D0CA 1D9FA 1YT3A 2YV0X 4C8KA 4DMNA 3ZT4A 3ALYA 5HLFA 5J2PA 2RN2A 2ITGA 3S3OA 1KSPA 4B9MA 3KKRA 4FLXA 4AILC 2G8UA 1BI4A 4E3SA 4KPYA 3NBPA 2DFHA 3AO5A 5E41A 4KHWA 1RBSA 1S6PA 2YKMA 3JSMA 3NHGA 3QEWA 2XY5A 4Z4FA 3AVNA 4RW6A 1TAUA 1G15A 3NGYA 1UA0A 2Z1JA 4W5OA 4J2BA 3IG1A 4FLTA 3RR8A 1NKCA 2O4GA 3QEXA 3K59A 5HRPA 4DU4A 3LP2A 3PO4A 5HRSA 4Y1DA 1KVAA 3O3HA 1KFDA 4HUGA 4N5SA 1X9SA 2RKIA 4CFDA 1SUQA 4BACA 1NK7A 2EHGA 1NK9A 2BDPA 3QEVA 3LP1A 3V9SA 1ASUA 3NH1A 3LWLA 1U45A 3LALA 1BI4B 3VQQA 3OYNA 1X1PA 3F73A 3HO1A 3RMBA 2Y1JA 1EETA 2X74A 3QIOA 3MEGA 1TAQA 1K6YA 4FJ7A 4CK2A 3PV8A 1RT3A 3WNFA 3OYFA 1IKXA 4M45A 4DG1A 3WNEA 4CEFA 2XHBA 3AVMA 5SZTA 4CF0A 4GMJB 4CGIA 2ETJA 5KGWA 4DTSA 4AH9A 5HP1A 2OYQA 1LW2A 4KHSA 3NCIA 3NAEA 3TAFA 1NKEA 1X9MA 1VSJA 4CECA 1T7PA 3QETA 4KI6A 2VG5A 3A2FA 3U3GA 4YFUA 3K5NA 3AVIA 4Z4GA 2D0BA 1FXXA 3OVNA 2KFNA 1HYVA 4CGHA 4B3OA 3QIPA 4W5TA 1FKOA 1TKTA 4DSKA 1HYSA 2XY8A 1LW0A 3I8DA 3U6FA 4F2SA 4DTOA 1VSKA 3AVHA 3LPTA 3KD5E 1WSHA 4DQPA 1A5XA 3AVGA 4DWIA 3CFRA 2KTQA 4DF4A 2F96A 4KI4A 4FJ9A 4FXDA 3RTVA 1T03A 2HVIA 3SV3A 4FJIA 1QSLA 1BISA 1TGOA 2EX3A 1RDAA 3P83D 4CEDA 4ZTFA 3HXMA 2WONA 2HHWA 3KKSA 3CQ8A 4M3TA 5CYMA 4OVLA 4HVJA 1WSGA 4CJRA 3VQAA 1NOZA 1Z25A 4BWMA 4DS5A 3OS2A 2W42A 3DLBA 3HK2A 1TK5A 1JKHA 1RTHA 3KLGA 4L8RB 1EXQA 3DM2A 4J2AA 1CLQA 1GOCA 1QQCA 4QCLA 1D8YA 2IAJA 1C0MA 3AO1A 3O4NA 4O4GA 4W5RA 5SWMA 5FDLA 3LZJA 1WAJA 4F3TA 4DU1A 1CXUA 3DMJA 2P51A 1C1AA 1IKYA 4M3RA 5FRMA 5D3GA 1EX4A 3U3YA 3SZ2A 1Q9XA 3LDSA 1WLJA 3HVTA 4FLZA 4CEBA 3DI6A 5JS1A 5CZ1A 4E89A 4W5NA 3VQBA 3P1GA 1VRUA 4I9QA 1O1WA 3L2RA 3SPZA 1VK0A 1Y97A 2RF2A 3TAQA 4FK4A 3NDKA 5KTQA 1IKWA 3LAKA 4DSFA 3ZT0A 1NJXA 3AO4A 4E0DA 5HBMA 1VRTA 3OYIA 3OYGA 4HUFA 4DTRA 4PWDA 1T05A 1RTIA 1BL3A 4IDKA 4Z0UA 4CERA 3K58A 4BE1A 3AVCA 2HMIA 4FK2A 4M3XA 2IGIA 2F8SA 1RDDA 5HRRA 4JRPA 3TARA 2HNZA 4FVMA 3K5OA 4N56A 4IKFA 1BGXT 3HPHA 3AO3A 3L8BA 3VA3A 4Z4EA 2OPQA 1BHLA 2VWKA 4Z4IA 2DY4A 2ZE2A 3AVAA 1QTMA 3SUNA 1HMVA 1TKXA 3SI6A 1JLEA 3SUQA 2FBVA 4CF2A 4BDPA 3NH0A 1L3UA 1FKPA 1SV5A 1JLFA 4OLAA 1KTQA 4N76A 5HRNA 4DSIA 1U4BA 4DQQA 1TV6A 4FLVA 4LH5A 3D45A 4M3YA 4GVMA 2FBTA 4DSLA 4OPJA 1KLMA 3T19A 3HVRA 1IKVA 4FW2A 3T1AA 4DQRA 1C0TA 4FJXA 3TANA 3S9HA 2B5JA 3CYMA 4IG3A 4OGCA 5J2NA 4ELUA 1ASWA 4NCGA 1JLQA 1RT2A 2Z1HA 1U47A 1QSSA 3DLHA 1EKEA 2ATQA 2QXFA 2B6AA 4KO0A 3PY8A 4GW6A 3L2UA 5J2MA 3G10A 2YNIA 3EYZA 3UIQA 1RTJA 4XIUA 4EP5A 4JRQA 1KLNA 3PX6A 4EP4A 3QNNA 3PX4A 1RT5A 4CJTA 3PO5A 3G0ZA 4KHQA 3P5JA 1TL1A 4M41A 3VQEA 3OJUA 3ZSQA 1VSEA 2VG7A 3OJSA 4CJFA 3S3MA 1YTUA 4KB0A 4RW9A 4FJ8A 4DTXA 1RBRA 4KFBA 1SKSA 3PUFA 3VQ4A 4BE0A 4BWJA 2OPPA 3SPYA 1X9WA 1L3SA 3ISNC 3KLEA 1DTTA 3DLGA 4E7LA 2HHTA 1BCOA 1WNSA 2E4LA 4RG8A 1Q9YA 4ELVA 3CM6A 3F9KA 1QHTA 2YNFA 2ZD1A 5FROA 4CJEA 2KFZA 2G8FA 4KKOA 3C94A 4AHSA 1LAVA 4H8KA 3ZSVA 2PYLA 5HROA 1UA1A 4M3UA 1HNIA 1JLGA 2VG6A 4CJUA 1NK8A 4DQSA 3LP3A 4Z4HA 3RMCA 2X6SA 5C25A 4PQUA 3ZSWA 1RBTA 4DQIA 3B6OA 4KHNA 2BGGA 3I0RA 1NK0A 1RDCA 1CZ9A 3C6UA 1B92A 1JL2A 4FW1A 4CJKA 3RWUA 3M8PA 1KVCA 1ZBIA 1HRHA 1WSEA 4JS4A 3M8RA 3ITHA 3V1OA 1ZBUA 3OYCA 4DFJA 3SUPA 3KLFA 4KTQA 4HUEA 3DRRA 3TWHA 4FZZA 1LWCA 1NJYA 3AVJA 3I0SA 3TR8A 2DTUA 2HHQA 2X6NA 1KVBA 5I3UA 2HHXA 2IOCA 2DFEA 4CGDA 1TVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZKA 3H6EA 4CZIA 4ZHRA 4K25A 3TAGA 1IO2A 4QOZB 1ZBHA 1NM1A 5LY3A 2FXUA 4RCHA 5B8HA 2P9PB 4N47A 1NJZA 4B3RK 1MA9B 3HPOA 4CZHA 1KAZA 4I9LA 4IEEA 1SQKA 3KZBA 1DTQA 4WF9L 5M1QA 3TI0A 2A6AA 3UKRB 2P5GA 2QWPA 4NYFA 2HF4A 1BA1A 2YJFA 1D5AA 4CHZA 3A5MC 4CEAA 1HKGA 1R0AA 1RCHA 3VQ9A 5AFUH 2BE2A 3DWLA 1VQ4N 3QDKA 4BRNA 2XRIA 1TUYA 2UUCK 2DPNA 5DM6L 4ICLA 1Z05A 4CF1A 3OYEA 3VQCA 4EFHA 3HTVA 3MCPA 4H5VA 3T3FA 3O9UA 3V1RA 4RW4A 1SS6A 4HCBA 1DGKN 3UKUB 2ZGZA 3FZLA 5J1EA 1NK5A 4DR7K 2QXLA 1RTDA 3MEDA 2B4JA 4HTUA 2GV9A 4PKHA 4EHUA 3NGZA 4CJ3A 1VHXA 5I42A 4Q0BA 2UUBK 1NMDA 3VEOA 4JKBA 1NJWA 4O55A 3WEEA 4H4MA 4NXNK 4JKGB 1S9GA 4E19A 3OYJA 5AQYA 2CH5A 3AA2A 4YDUC 3L2QA 1YITN 1CXQA 3L2WA 3QEIA 1C0UA 3BUZB 4B1ZA 4HCCA 4A59A 3QNOA 3SV4A 4LH4A 4FWKA 3OYKA 3ZSYA 4CFAA 3ULEB 4GKKK 4K8ZA 2OCEA 3MXIA 1K8KA 3U9DA 4FJJA 3MXMA 3CQXA 1J5OA 2NRVA 1ZBLA 4FJLA 1M90O 3U9ZA 3OYLA 4FJGA 3BF1A 4WQ4A 4K41A 4OX9K 2KQ2A 4IWVA 3MEEA 1CZBA 2P9PA 4A61A 3QO9A 4X62K 1YI2N 3OYAA 4IBNA 3HP6A 4RW8A 4DFPA 4DS4A 4B1YB 3KJVA 3DXKB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CZK A;  3H6E A;  4CZI A;  4ZHR A;  4K25 A;  3TAG A;  1IO2 A;  4QOZ B;  1ZBH A;  1NM1 A;  5LY3 A;  2FXU A;  4RCH A;  5B8H A;  2P9P B;  4N47 A;  1NJZ A;  4B3R K;  1MA9 B;  3HPO A;  4CZH A;  1KAZ A;  4I9L A;  4IEE A;  1SQK A;  3KZB A;  1DTQ A;  4WF9 L;  5M1Q A;  3TI0 A;  2A6A A;  3UKR B;  2P5G A;  2QWP A;  4NYF A;  2HF4 A;  1BA1 A;  2YJF A;  1D5A A;  4CHZ A;  3A5M C;  4CEA A;  1HKG A;  1R0A A;  1RCH A;  3VQ9 A;  5AFU H;  2BE2 A;  3DWL A;  1VQ4 N;  3QDK A;  4BRN A;  2XRI A;  1TUY A;  2UUC K;  2DPN A;  5DM6 L;  4ICL A;  1Z05 A;  4CF1 A;  3OYE A;  3VQC A;  4EFH A;  3HTV A;  3MCP A;  4H5V A;  3T3F A;  3O9U A;  3V1R A;  4RW4 A;  1SS6 A;  4HCB A;  1DGK N;  3UKU B;  2ZGZ A;  3FZL A;  5J1E A;  1NK5 A;  4DR7 K;  2QXL A;  1RTD A;  3MED A;  2B4J A;  4HTU A;  2GV9 A;  4PKH A;  4EHU A;  3NGZ A;  4CJ3 A;  1VHX A;  5I42 A;  4Q0B A;  2UUB K;  1NMD A;  3VEO A;  4JKB A;  1NJW A;  4O55 A;  3WEE A;  4H4M A;  4NXN K;  4JKG B;  1S9G A;  4E19 A;  3OYJ A;  5AQY A;  2CH5 A;  3AA2 A;  4YDU C;  3L2Q A;  1YIT N;  1CXQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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