1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
b'EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
2YHYA 4I6MB 1NGGA 1DKGD 2P9SA 3MN6A 3CQXA 4M7YA 3CJ1A 4BRHA 1IG8A 1NGIA 5ADXH 4BC3A 3C7NA 4BR4A 4GY2B 3ENOA 4PKHA 4BRNA 4BR0A 5JICA 3O08A 5F0XA 4IJAA 3VEVA 2P9LA 3W0LA 4B1VA 2Q1NA 3ZX2A 1TYQB 1BDGA 2YCHA 3A5NC 4HTLA 4I6MA 1KXPA 2ASPA 1SQKA 3L0QA 1SZ2A 2GWJA 1U6ZA 4BR7A 1GLBG 2BUPA 2A40A 4RTFD 3FZKA 3CI5A 2Q97A 4BVOA 3HTVA 3QB0A 1BA0A 3ATVA 3DWLA 3HBTA 5BN8A 2E2NA 4FOEA 4QS8A 3EKSA 5BRFA 1MDUB 2E2QA 3L4IA 2P9SB 2EWSA 4B1XB 1E4FT 1GLAG 4CZKA 2FSJA 1QZ6A 2ASOA 2H3GX 3UKUA 2CH6A 4M7XA 1D4XA 3FZMA 1XC3A 2P9IA 3LDNA 3H3OB 5AQPA 4FPAA 3FZFA 4ISEA 4WQ5A 5CE3A 3LL3A 1RGIA 3O5BA 4H5TA 2V51B 1ESVA 4IXCA 3WXJA 1NWKA 4PL7A 5AQFA 1HKGA 4FO0A 5AQRA 3FGUA 3IUCA 4K25A 1GLDG 1HJOA 1NLVA 3WXIA 5E26A 1GLJO 4B1UB 2IIRA 2OANA 3BF1A 2HMPA 2HF3A 5BPNA 4Z94A 1T6CA 5BN9A 3VGKA 4FL9A 4A61A 1T6DA 5FPMA 2FF6A 3CJCA 3M1FA 3QBWA 3IMXA 3GL1A 4BC2A 3D2FB 2A42A 3GE1A 5AQIA 3ZETA 5ADXA 4ISGA 1NBWA 2Q2RA 5AQGA 3O4WA 1RDWX 2YJFA 3SMPA 5EY4A 4B1YB 3UE5A 1NGCA 2W40A 2NLXA 2E2OA 1X9JA 4GNIA 4MO5A 1BU6O 2HOEA 4FWRA 3QMLA 2IVNA 3SJHA 3WUHA 3L6QA 3O1WA 3H1QA 1IJJA 1MWMA 1GLEG 4JHDB 3C7NB 4AM7A 1V4TA 2UYTA 3LDPA 4IJNA 5AQYA 5F1XA 3DJCA 2F9TA 3EL2A 1GLLO 5AQKA 4BGBA 1QQOA 1X3NA 4JAXA 1YAGA 3A5OC 2QWOA 2QWQA 3CIPA 5LY3A 3CERA 3AAQA 2QWLA 3JS6A 5EOYA 1Z6RA 4H5RA 3EN9A 4HWIA 1BUPA 4J8FA 4FWNA 4FWOA 3MN7A 3AARA 5LJWA 3KVGA 1YXQA 3CHWA 1DGKN 3ATUA 3VENA 5BR9A 3DXMA 3VPZA 2V7ZA 3R8EA 4BQLA 1X3MA 2NRHA 3BEXA 1ZXOA 1TUYA 1KAZA 3WEEB 2FF3B 2YHWA 5AQOA 3TU5A 3CETA 5ELZA 3UKUB 3BF3A 3DXKA 4K41A 3WEEA 3H1VX 2QWRA 4H0YB 2D0OA 2Q31A 5F2RA 4A2BA 1TYQA 1JCEA 2WUSA 1RFQA 5FPNA 3MMVA 4FWPA 3HM8A 2VWBA 4FOIA 3JXUA 3C0BA 1E4GT 1HPMA 4WQ4C 4K43A 3FFKB 4MLHA 4BREA 3LM2A 2FSNA 3GDQA 3HI0A 1XUPO 4RCHA 2DPNA 2FXUA 4IZ9A 5AQWA 5TKYA 4CZJA 3GBTA 4H5VA 2P9IB 4MLEA 4CJ7A 2ZGYA 4IO8A 5JLFA 1S3XA 2Q36A 3IFRA 4CBXA 4CZEA 3AAPA 3HZ6A 5KQDA 4PKGA 4JHDA 5AZIA 4BRIA 1ATSA 3VF6A 2PBDA 1JCGA 1YUWA 4DQ8A 5KQ8A 1NM1A 5AQSA 1KAYA 1NGFA 1XQSC 1HUXA 3FZLA 2D1KA 1GLCG 4CZMA 3LM9A 2QW9A 4Y0WA 3CJ9A 5BPLA 1HKCA 2P9PB 4CD3A 1HLUA 3SMSA 3DAWA 3GG4A 2D0PA 4PL8A 1WUAA 3O1BA 3A8YA 4FWMA 2PAVA 2ITMA 2VYPA 2E20A 3D2FA 4KBOA 3S41A 2QWMA 2J4RA 4CI6A 2Q0RA 4FSVA 3DXMB 1CZAN 1HX1A 4BRPA 2QWNA 4FPBA 4YDUC 5LJVA 2I7NA 4EFHA 3CJAA 3QDKA 3EKUA 2FSKA 5JMVA 2P9PA 3ZEUA 3FE1A 3HSCA 3QFUA 4M63C 1C0FA 5AQUA 5AZJB 4A2AA 3D2EA 4E1JA 2V52B 2F9WA 3CQYA 3WT0A 3VETA 4BQZA 4QS7A 4H0TB 1LOTB 2E88A 5KPTA 4A62A 2P9UA 5I9EB 2P9KB 1NGJA 3I8BA 2A3ZA 4FWSA 3ULEA 3AY9A 3ZETB 4CZLA 1ZBSA 4B1ZA 1C0GA 3BUZB 5AQXA 2KHOA 2BTFA 4CZIA 2CGJA 5AZIB 3RSEA 4MO4A 2QXLA 3M3ZA 3EZWA 3BP8A 5AQMA 3J8AA 2GEMA 2E1ZA 4ISFA 4NB4A 1Q18A 2QWPA 2W41A 5BREA 2AP1A 4FWKA 4BG9A 1Z05A 5EVZA 3FZHA 2E8AA 1H1VA 2ZGZA 5E84A 1V4SA 2IVOA 3VESA 1ZC6A 4DHYA 3VGMA 3QBXA 1DEJA 1QZ5A 2V7YA 2A6AA 1P8ZA 3R9PA 2CH5A 3MN5A 4XH5A 5AQHA 5AQJA 1JCFA 2AA4A 3D2EB 3MDQA 3SK3A 2GTDA 5BRDA 3MK6A 4L3QA 3H46O 4XH1A 4CD1A 3H3NO 4H0OA 3ZX3A 1Y64A 3TPQA 1K8KB 4K42A 3ENHA 4C23A 2P9NA 3LDOA 3KZBA 1BG3A 3WXLA 4BVPA 4JD2B 3UKRA 4H03B 4F9OA 3UB5A 3VEWA 1NGDA 5B8HA 3EO3A 1J6ZA 3U9DA 1U2VA 2P9KA 5AQLA 4CZFA 5AZJA 2ASMA 3LDQA 2E1YA 2YI1A 3FR0A 2P9NB 3R6MA 1BOTO 1K8KA 1NGBA 2GELA 1BO5O 4BRMA 1QQMA 4AM6A 4BRGA 3U4LA 3WQTA 4H5NA 2D4WA 4XEIA 2CGLA 4WYBA 5AFUH 2HF4A 5EXWA 4B9QA 3VOVA 5FPEA 1U2VB 3A0IX 4BRLA 1ATNA 4JNEA 4H0XB 5EX5A 1KAXA 4EHTA 3A5MC 2P9UB 3QICA 3U8XA 1G99A 4CBUA 3OHRA 3P4IA 1LCUA 4PKIA 4CZGA 2CGKA 4WQ4A 3VGLA 1BWFO 1NGHA 5AQVA 1OKJA 1NGEA 3ZEUB 3ULEB 5BPMA 4YDUA 3H45C 1QQNA 5KPZA 4DB3A 5AQQA 3O8MA 4H0PA 2NZTA 2I7PA 3D7EO 1YVNA 4EHUA 4BR2A 4WQ5C 3M6GA 4B1WB 1WOQA 2YJEA 4BR5A 1MA9B 1R59O 1T44A 3GOIA 3WQUA 4BRQA 3F9MA 2Q0UA 1MWKA 4H0VB 4BR9A 1EQYA 4H5WA 5AQZA 3IDHA 5AQNA 3I33A 4EIAA 2VCPA 2A41A 3LDLA 1GLFO 3RSEB 3CJ7A 2A5XA 1HKBA 3MN9A 1NMDA 3U9ZA 3SLCA 1NGAA 1S22A 4FWQA 3VEXA 1QHAA 3VERA 3FLCO 3O6WA 4O5FA 3H6EA 1ATRA 3ZX0A 2GWKA 4BGAA 2GUPA 3W3DA 2YHXA 2FLOA 3VF2A 4RWTA 4BRKA 3KHYA 5JLHA 1TUUA 3O80A 4BC4A 4BC5A 3QFPA 4BROA 4JN4A 3G25A 3DXKB 4O8KA 5AFUA 4BRDA 4CZHA 5AR0A 4FWLA 2ZWHA 4NO7A 4EAHD 4QS9A 2ZF5O 1SAZA 4BRAA 2IVPA 3VEYA 4IWVA 4LC9B 3WXKA 4BG8A 5AQTA 4BRFA 4DCHA 4BRCA 3VEZA 5KPRA 2QM1A 3MCPA 4JD2A 3UKRB 2E2PA 5BRHA 3CJBA 5FPDA 3ID8A 3B8AX 4XH4A 2P9LB 3VF4A 4CBWA 3VEOA 1BA1A 3A5LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LW2A 2YHYA 4JI1K 1NGGA 4M7YA 3LZJA 4OGCA 3HP9A 3JYTA 1Q81O 5FDLA 1WAFA 3PX6A 4BR4A 4PKHA 4PQUA 5JICA 2YV0X 4B1VA 1TYQB 1BDGA 2YCHA 4FW1A 4KB1A 3RMDA 4OKJA 2ASPA 2GWJA 2FBXA 3BGRA 3M8QA 3MWTA 3VQ6A 4DR1K 4BR7A 4NCAA 3HT3A 3CD6N 3M5RA 1GOAA 3FZKA 4XIUA 4BDZA 4KH4A 4OX9K 2D0AA 1VQ9N 1JL2A 3KLGA 3SUOA 3DWLA 3QNNA 5LL6Z 1RNHA 1YTAA 4B1XB 5MLCQ 3OJUA 3ULDA 4CEZA 4H4OA 4CGGA 3SAGA 4O44A 4ILHA 4M7XA 1D4XA 1T05A 1XC3A 5M1NA 2P1JA 3MCAB 3PO4A 4CVNE 3NE6A 5J2NA 2ATQA 3CCSN 4LF6K 5DMRA 4FJKA 1HMVA 1HKGA 4KO0A 5KGXA 3NH1A 3IUCA 3SQ1A 1NLVA 1TKTA 1D9FA 2O8DA 4B1UB 2G8VA 2Z1GA 3MWPA 5M1QA 3IRXA 3BF1A 5BPNA 2HF3A 5FLXO 3ZSWA 4JI3K 4G1QA 3M1FA 2DFFA 3IMXA 3QBWA 4CGIA 3GL1A 4BC2A 3D2FB 2B6AA 1HQUA 2PFUA 4C8MA 3TTDA 3DLEA 5AQGA 1XI1A 2HNYA 2NLXA 1X9JA 1A5XA 4MO5A 2E6LA 1SL2A 2HOEA 4FWRA 3L6QA 5GADP 3H1QA 1GLEG 4JHDB 4IBNA 1V4TA 1W9HA 2O8CB 4IJNA 5F1XA 2WTUA 2F9TA 3S3MA 3EL2A 4BGBA 4CEBA 1X3NA 1YAGA 3C6UA 2P5GA 3HL8A 3AAQA 1Z6RA 4FVUA 1YTUA 3NVMA 4FWNA 4FWOA 4LFBK 3VQCA 3SUQA 1DGKN 1BCOA 1TK8A 4PA1A 5BR9A 3J7AP 1NJXA 4BQLA 1NNEA 4DQRA 3WEEB 2FF3B 4Q0BA 3TU5A 5HRRA 3EYZA 3CETA 3P83D 5ELZA 2XY7A 2O8FB 3BF3A 3E01A 4B3OA 1W0HA 2IGIA 4YORA 1RT2A 4H0YB 3HPHA 3NH0A 4PWDA 3ZLJA 2F4VK 1TYQA 4KTWA 3KTQA 1BIUA 1KC8O 1RFQA 2VWBA 5HRSA 4FOIA 3JXUA 3C0BA 5M1KA 5SWMA 1RTDA 3HPGA 3FFKB 4CJWA 5C2DA 2WFBA 1IG9A 2FSNA 3SV4A 4BE0A 4CZJA 5TKYA 1WSHA 1IKYA 2X74A 4FXDA 2ZGYA 4W5TA 4IO8A 1U04A 1YJ9N 1RDBA 3IFRA 4B9SA 4I2PA 3AAPA 3G10A 3HZ6A 5KQDA 1ATSA 4KTQA 3VF6A 1JCGA 4DQ8A 5KQ8A 3ZSQA 2VQEK 5AQSA 3CCVN 1KAYA 1NJIO 3FZLA 4WCEL 4ELUA 4CZMA 4Y0WA 3VQ5A 3F5TA 1NKCA 1KFSA 4CF0A 3CCUN 1BI4A 2D0PA 3GG4A 5KRTA 3DOKA 4FWMA 2PAVA 3ITHA 2KFZA 1VSDA 2QWMA 3F73A 2J4RA 3DLKA 4CI6A 3I0RA 3DXMB 4NXMK 2B4JA 1HX1A 4BRPA 4CJ3A 3CC2N 4FK2A 1KTQA 3CJAA 4CEDA 4DV2K 4DR5K 2FSKA 2P9PA 1KSPA 3FE1A 1O13A 2HHVA 4IKFA 4AHUA 4ELVA 2YKNA 3TARA 2LSNA 2HHHK 3AO1A 3D2EA 5C24A 4CK2A 1QSLA 3KWGA 4YOYA 3VETA 1OVYA 4E1MA 2E88A 5A2QO 5KPTA 4A62A 2P9UA 1HQEA 4H4MA 5I9EB 1NGJA 4FWSA 3AY9A 3ZETB 5C10A 4NLCA 4F4KA 2OCEA 2VWKA 4CFBA 3QETA 4NCGA 2D0BA 3E66A 4ISFA 4CK1A 3L2VA 2W41A 5BREA 2AP1A 4AHRA 4ILJA 1Z05A 2XO7A 1H1VA 3EEQA 3A2FA 4EZ9A 3KKRA 1RDCA 1C1AA 4XH5A 4FK0A 1DLOA 1NU0A 3EE8A 5BRDA 3AA3A 1TL1A 3I0SA 4M3ZA 1X9SA 3I8DA 4C23A 1ASWA 3PLAA 1ZBHA 3TAGA 4FVMA 3U3YA 1JLGA 5M1OA 4J2DA 3UB5A 2VQFK 4CJSA 2X6NA 5M1PA 1YHQN 4LY7A 2P9KA 3AO3A 4B8CA 1NG9A 2E5LK 4DV5K 2E1YA 3T3FA 1K8KA 1NGBA 5HBMA 4BRMA 5GAGP 3OYLA 3WQTA 4XEIA 3T1HK 5AFUH 1U2VB 3A0IX 4N76A 2O8EA 3NF7A 4FM2A 1KVAA 4OVLA 4EHTA 3QICA 3U8XA 1FKPA 3L4QA 4CBUA 3QNOA 3RWUA 3OYNA 3TI0A 2ETJA 3VGLA 1BWFO 4GV3A 2IC3A 4DFMA 1JKHA 3ULEB 1WSGA 1QQNA 1VQ7N 5DK5A 1T7PA 1SKRA 4EHUA 2I7PA 2NRZA 1WSJA 4WQ5C 4BR2A 4DTXA 4JKBA 3HXMA 1QTMA 4H0VB 4ZHRA 1LWEA 4B9VA 4RW4A 3QEVA 2HBJA 4GW6A 4A57A 4EIAA 3AVCA 3LDLA 3PUFA 3SBGA 3J7YP 3MN9A 3OYMA 2UXCK 3THXA 2FBYA 3H6EA 4YOWA 3THXB 4GVMA 3LP3A 3W3DA 3VF2A 3LPUA 1S1UA 4JK7A 4E7LA 5CYMA 2OPQA 1TUUA 4FLTA 4BROA 3QFPA 3DXKB 4TSXA 3CCJN 3HOTA 3SQ4A 2ZWHA 4EAHD 4CHYA 4QS9A 1N34K 4E7KA 1DT9A 3DLRA 3VEZA 3CF5L 4DSFA 1VQ5N 1W7AA 3MCPA 4DMNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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