1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
3FGUA 5AQYA 5CE3A 1NGHA 2KHOA 4Y0WA 3CQXA 2P9LB 3DXKA 4H5TA 1NWKA 4BRLA 3A5NC 1NGAA 5AQWA 2D0OA 3GOIA 3FZKA 3FZFA 5TKYA 3L6QA 1KAYA 2ASMA 1KXPA 1NGIA 4FWQA 3BP8A 4JD2B 5BPLA 4XH1A 2E8AA 2BUPA 1ATRA 3QFPA 5E84A 2V7YA 4CBWA 3EKSA 4H5RA 3U8XA 4BRHA 5LJVA 1NGGA 3WT0A 4A61A 2QWPA 4EIAA 2QWMA 4LC9B 4FO0A 3EL2A 1IG8A 3MN6A 5AQNA 4BRMA 3O1WA 4O8KA 1D4XA 2IVPA 4MLEA 2P9PA 3CJ9A 3M3ZA 2W40A 4M7YA 4WQ5C 1HX1A 4FPAA 3VOVA 5AQOA 1E4GT 2E2QA 5AQZA 1JCEA 2QM1A 4BRAA 4H0OA 2P9LA 3VF6A 1S3XA 4QS8A 5BN8A 4RCHA 3VEYA 4PL7A 4FOEA 4GNIA 3ZX0A 3D2FB 4K41A 1SQKA 1SAZA 4JD2A 3VEVA 3IMXA 4FWRA 3ZETB 5BRFA 2A3ZA 3FLCO 5BREA 1HKBA 4F9OA 5AQXA 1JCFA 3QICA 3DXMB 3R6MA 3VETA 5ELZA 1BO5O 4H0XB 3RSEB 5AQPA 3FR0A 4BRFA 2P9NA 5AQGA 2Q2RA 4MO5A 2E88A 3KVGA 4DCHA 5FPMA 4WQ5A 5AFUA 1YVNA 1NM1A 3ULEB 5AQJA 3FZLA 4Z94A 4DQ8A 4EFHA 3BUZB 4B1YB 3I8BA 5BPNA 2QWRA 3CETA 4WQ4C 3HM8A 1QQMA 3D7EO 5FPNA 1HPMA 5AQQA 1XQSC 3TU5A 3D2FA 4BRCA 1IJJA 1U2VB 3WXJA 1HLUA 4PL8A 4EAHD 5EOYA 3WQTA 4HWIA 3ZETA 1KAZA 4BRNA 5KQ8A 1V4SA 3G25A 3HSCA 4FL9A 4H0YB 4H03B 4DB3A 2ZF5O 1RDWX 3O6WA 2E1ZA 4J8FA 4JNEA 3VEWA 5LY3A 3D2EB 3U4LA 3CJ1A 2FXUA 3RSEA 2Q0UA 3MN9A 3ZX3A 1GLEG 5FPEA 1T44A 3BF3A 3WXIA 4IXCA 4CZFA 2ASPA 3FZMA 3O8MA 1JCGA 3LL3A 3L4IA 3ULEA 3AAPA 3UKRB 2FF3B 1QZ6A 5AQUA 3AY9A 2BTFA 2GEMA 3O1BA 5EVZA 5F1XA 3IFRA 2CH6A 3P4IA 2E1YA 4FWOA 2FSNA 3ZX2A 3FE1A 4FSVA 4A62A 2FLOA 1U2VA 1YXQA 4B9QA 4B1WB 5AQHA 3UE5A 2AA4A 1BA1A 4H5VA 4L3QA 4MLHA 3CHWA 4AM6A 3LDOA 1RFQA 3H1VX 3D2EA 3WUHA 4H0VB 1WUAA 4B1VA 3QMLA 3AAQA 4H5WA 5AQRA 4FPBA 1MA9B 4BC2A 3ID8A 4K42A 5AQFA 4BC5A 5LJWA 4WYBA 3CQYA 4NB4A 3FFKB 1QQNA 5BRDA 3A8YA 3UKUB 1LOTB 3VGMA 2CGJA 3IDHA 2GTDA 3UKRA 2Q31A 3VESA 3W3DA 5KPZA 3MK6A 3A0IX 3DAWA 5KPRA 3SLCA 5BRHA 1J6ZA 5B8HA 3MDQA 3J8AA 3U9DA 2PAVA 1V4TA 2A41A 3A5OC 2ZGZA 2D0PA 2P9SB 2YHWA 2GWJA 4BRGA 2DPNA 2E2OA 1BU6O 5BN9A 5JMVA 4CJ7A 3HI0A 4KBOA 3VEZA 1K8KB 3LDPA 2YJFA 3ATVA 4K43A 3VERA 1ESVA 1ZC6A 3W0LA 4BC4A 1BOTO 1GLDG 1SZ2A 2YHYA 3QBXA 4CBXA 1DKGD 3MN7A 5AZJB 3R9PA 2WUSA 1NLVA 1R59O 3H45C 4M7XA 1BA0A 2A6AA 4IZ9A 2GELA 4BRIA 2FSJA 4BR0A 1HUXA 5F2RA 2V7ZA 3JS6A 3MMVA 4XH5A 1DEJA 3SJHA 4E1JA 2FSKA 3B8AX 3KHYA 1GLLO 2YI1A 5I9EB 1NGBA 3QBWA 3WEEB 1QQOA 4ISEA 4A2BA 2Q36A 1ATSA 2P9SA 5JLFA 1WOQA 2VCPA 5KPTA 2QXLA 3EO3A 4BR4A 1OKJA 4CZGA 1CZAN 1TYQB 3CJ7A 4BROA 1NGCA 5AZIB 1X9JA 4HTLA 2F9TA 3VGKA 4FWMA 4EHUA 1P8ZA 1NMDA 3O80A 2NZTA 3M1FA 5AR0A 3WXLA 1QZ5A 3ATUA 2VWBA 4I6MB 3VF2A 3DXMA 4CZHA 5ADXH 4C23A 2PBDA 3AARA 3FZHA 3GE1A 3C0BA 4BC3A 3HBTA 4CD3A 1GLCG 1BWFO 2CH5A 3WEEA 3VEOA 2I7PA 3SMSA 3LM9A 4FWLA 4M63C 2W41A 1DGKN 4EHTA 2F9WA 4XH4A 1GLBG 3EN9A 4CBUA 3UB5A 1TYQA 1QHAA 2P9UB 4CZEA 4MO4A 1X3NA 5AZIA 4PKGA 4H0PA 3LM2A 4IJNA 4CZJA 1ZXOA 4RTFD 3LDNA 4DHYA 2A42A 3VEXA 3A5MC 4JAXA 2QWOA 4BR2A 2H3GX 1H1VA 1U6ZA 3QB0A 4I6MA 3VENA 4BRPA 4BQZA 1C0FA 5AQMA 2YCHA 3LDQA 4BG8A 1Z6RA 2ITMA 3LDLA 3VGLA 2QWQA 5BPMA 4IWVA 3I33A 4BREA 4XEIA 5AQVA 1ATNA 3BEXA 4BR5A 3H6EA 3QDKA 2QW9A 3EZWA 2UYTA 4IO8A 4BVOA 2FF6A 2V51B 5EXWA 2VYPA 1TUYA 1ZBSA 2V52B 2EWSA 5BR9A 1C0GA 2GUPA 2QWLA 2D1KA 2HF4A 2P9UA 5AQTA 1HJOA 4RWTA 1BDGA 4FWKA 1KAXA 3U9ZA 3ENOA 4BRQA 3KZBA 5EX5A 1NGDA 2CGLA 4BRKA 1YAGA 2P9KB 4CZIA 3H1QA 2GWKA 4CZMA 4CI6A 1NGFA 1XUPO 2P9NB 3GL1A 1NGJA 2IVOA 3WXKA 2ZWHA 1Q18A 4GY2B 3C7NB 1NGEA 2A5XA 1G99A 3IUCA 4K25A 1MWKA 2HOEA 4O5FA 2OANA 4QS9A 3JXUA 5E26A 4A2AA 4BGAA 3ENHA 4FWNA 4BR9A 3HZ6A 2CGKA 1S22A 4YDUC 3UKUA 2P9IB 1GLJO 3CJBA 2Q97A 4FWSA 1Y64A 4BQLA 2ASOA 2HMPA 3MN5A 1RGIA 2AP1A 1E4FT 3GBTA 3O5BA 3CIPA 2J4RA 3TPQA 3SK3A 3O4WA 4BVPA 2QWNA 2Q0RA 4H5NA 4AM7A 3S41A 3BF1A 4NO7A 3DWLA 4B1UB 2P9KA 4JN4A 5JICA 2NRHA 4PKIA 3VF4A 3CI5A 3QFUA 1TUUA 1K8KA 1LCUA 5AQKA 2E2NA 3OHRA 3ZEUB 4ISFA 3GDQA 4CD1A 3F9MA 3H3OB 5ADXA 1GLAG 3C7NA 3DJCA 3EKUA 5AZJA 3MCPA 5AQIA 2E20A 3VPZA 5FPDA 1X3MA 1BG3A 1NBWA 1XC3A 2A40A 2P9IA 3H46O 4YDUA 5AFUH 1HKCA 2YJEA 2E2PA 2IIRA 3A5LC 4BG9A 4FWPA 4JHDB 1MWMA 3M6GA 3HTVA 2D4WA 1T6CA 3H3NO 4ISGA 5AQLA 3DXKB 4B1ZA 2I7NA 3GG4A 5AQSA 3CERA 1YUWA 4B1XB 1BUPA 4BR7A 4H0TB 4QS7A 3CJCA 3SMPA 4IJAA 5JLHA 4CZLA 4PKHA 2Q1NA 1T6DA 5EY4A 1MDUB 3ZEUA 4BGBA 4CZKA 2HF3A 5KQDA 1HKGA 3L0QA 4FOIA 2NLXA 2YHXA 4BRDA 3WQUA 2ZGYA 5F0XA 2IVNA 1Z05A 2P9PB 1EQYA 4WQ4A 3R8EA 3O08A 1GLFO 3CJAA 4JHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FGUA 5AQYA 1T03A 1UAXA 3KD5E 1CXUA 1NWKA 1SV5A 3TARA 1EWRA 3FZKA 3FZFA 5TKYA 4JV5K 4DSEA 1KAYA 2G8FA 5BPLA 4CHPA 4YOVA 2V7YA 4BRHA 1LAVA 1NGGA 3LANA 4AHTA 4B3OA 4FO0A 2Z1JA 3OBYA 3CPEA 4O8KA 3V9WA 1D4XA 4J2EA 2HBKA 3HJFA 4CEQA 3CJ9A 1HQUA 5TKWA 1VQ5N 1NK4A 2EHGA 4WQ5C 1NOZA 3OJUA 3D45A 5LMNK 1BHLA 2QM1A 2F96A 4A57A 4BRAA 3VF6A 3NVKA 4JI6K 3QEIA 3A2FA 4ID1A 4PL7A 4WFAL 4FOEA 4FJIA 4JRPA 3VQEA 4PQUA 3D2FB 1NKCA 3VQ5A 4K41A 1SAZA 4JD2A 3IMXA 1IKVA 2YNFA 4FWRA 1SKSA 3FLCO 3M8RA 1K73O 4X62K 5AQXA 3EZ5A 5I3UA 1VQPN 2KFZA 5DM6L 1QVGM 3VETA 2ZQBA 2HBJA 3O9UA 3K9KA 3ZYYX 4FJJA 3MX5A 1EO1A 4M42A 1L3UA 2HBLA 3U3YA 3B6PA 4MO5A 4F8RA 3KVGA 5FPMA 1YVNA 3L2VA 1NK7A 4B9MA 4Z94A 1VK0A 4DQ8A 3BUZB 3L2WA 2EX3A 4CJFA 4FLTA 5FPNA 4DSKA 3P1GA 2VQFK 4CFAA 5K14A 1IJJA 1UOCA 4LY7A 4PWDA 5EOYA 3WQTA 1VSMA 3SAFA 5KQ8A 3LPTA 3G4SN 4H03B 1EETA 2E1ZA 5KRSA 1BI4A 4WE1A 4MDBA 3U4LA 1IKYA 4AHVA 3L2RA 2Q0UA 2UU9K 3R1XA 3T1YK 3MN9A 2ZJQL 3ZX3A 3BGRA 1BQMA 2GUIA 4FJ9A 3SV4A 3ZSQA 4GV6A 1RILA 3ULEA 1C0MA 3WXMB 1FK9A 5AQUA 3AY9A 2BTFA 5KI6A 3O1BA 3OW2M 2CH6A 4KH6A 2E1YA 3T3FA 5M1OA 3FE1A 3JYTA 3OYAA 4CHOA 3ITHA 1KCFA 4OO1J 4DV6K 4B1WB 1TK8A 5AQHA 1LWCA 4HCBA 4ILGB 3ZSXA 4F3OA 1JKHA 2E6MA 1CXQA 3AGRA 2UUCK 1WUAA 4FJNA 5AQRA 1OVQA 1MA9B 2OTJN 3ID8A 1S72N 4WYBA 3CQYA 4LF4K 3FFKB 4JI8K 5BRDA 1ASWA 5J2NA 3A8YA 4QCLA 4OLBA 3IDHA 3LALA 1M1KO 3VESA 5KPZA 2P5OA 2UUBK 3A0IX 5CZ1A 4AF1A 2ZD1A 3SLCA 5BRHA 3ZSYA 2FBTA 1J6ZA 4CIFA 4CGHA 2YKNA 2D0PA 2P9SB 2GWJA 4IDKA 2E2OA 1BIZA 3I0SA 1O13A 2G8IA 3OYJA 1U47A 1VQMN 4DS4A 3LDPA 2YJFA 3ATVA 4YNQA 4YOYA 1QSSA 4CF8A 1ESVA 1ZC6A 2HMIA 4J2DA 3W0LA 5FRNA 4F4KA 1BCOA 1RT7A 4M7XA 4E19A 1BA0A 2GELA 4BRIA 5HRNA 1NKEA 3SJHA 4E1JA 4M3TA 2FSKA 3THWA 4YOUA 1T3VA 4FLWA 3MEGA 1GLLO 2YI1A 4H4OA 1WAJA 3QBWA 3WEEB 5SZTA 3KLIA 4JKDA 1ATSA 4B9TA 3RTVA 3M8SA 1E3MA 3KK7A 3CF5L 3QESA 4K8ZA 3TAFA 3DOKA 4HTLA 4BE1A 1L3TA 4EHUA 3O80A 4DV4K 1QZ5A 1WSGA 3DXMA 3E9PA 3FZHA 3GE1A 4NCBA 3B6OA 2LSNA 3T69A 1KLMA 2Z1HA 3OBWA 4DTMA 3HOSA 4OGEA 1WB9A 2KW4A 3RR7A 5GIPA 5J1EA 1TGOA 4M63C 1DGKN 3HL8A 2F9WA 1TAUA 3UB5A 1CLQA 1YIJN 1QHAA 1YT3A 3SQ1A 2OA8A 3SAHA 4DQRA 3V9ZA 4B3SK 3VEXA 1OH5A 1KFSA 4GV3A 1N6QA 3NGZA 2YNHA 4F2RA 3C65A 5C42A 5A2QO 1TKTA 1H1VA 1U6ZA 3DI6A 1KC8O 1YITN 4IOCL 4DQQA 4OLAA 1VQ9N 4I9LA 4LSNA 3LDQA 3F5TA 4LH5A 4BG8A 2ZE2A 5HBMA 5FLXO 2QWQA 1HMVA 3C94A 3VQPA 4IWVA 3CCVN 5JVGL 4BREA 3SCXA 4B3TK 3DRSA 3LAMA 4XEIA 1ATNA 3J81O 4K8XA 1JXEA 3EZWA 4N47A 2HNDA 2FF6A 4GW6A 4AILC 4KHNA 2VYPA 4RW9A 3OYEA 4DF8A 2B5JA 5GAEP 4B9SA 2GUPA 2KLAA 2QWLA 3EE8A 4DTXA 2P9UA 1HYVA 4CEOA 4JI0K 3TAPA 1VSIA 3RR8A 1YAGA 2QXFA 2DTUA 3K5LA 4KH4A 4HUEA 3KJVA 1NGFA 4CJ5A 5KGXA 1NGJA 2IVOA 2ZWHA 1Q18A 4MQ3A 1B9DA 3L4QA 4BY9C 2HHUA 3IUCA 3H08A 4K25A 3G0ZA 4O5FA 4QS9A 1X1PA 4BDYA 3UKUA 4C1NK 4FWSA 5IT9O 3THYA 5C2FA 1RGIA 3HPOA 4O5BA 4CW7B 4JK7A 3ZT2A 3VQ4A 4UQGA 1J5EK 1ASVA 3SK3A 3K57A 4BVPA 1XNQK 2RPIA 5BR8K 2XY6A 4H5NA 3S41A 2F4VK 4LF5K 2D0BA 2NRVA 3DWLA 2P9KA 5JICA 2NRHA 4PKIA 3QFUA 2ITGA 3E01A 4E1MA 1K8KA 4CFCA 5AQKA 4CJLA 3OHRA 3TR8A 1JLCA 3ZSZA 4EP5A 5GAHP 3AV9A 3L2QA 4JS4A 1GLAG 1HNIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FGU A;  5AQY A;  5CE3 A;  1NGH A;  2KHO A;  4Y0W A;  3CQX A;  2P9L B;  3DXK A;  4H5T A;  1NWK A;  4BRL A;  3A5N C;  1NGA A;  5AQW A;  2D0O A;  3GOI A;  3FZK A;  3FZF A;  5TKY A;  3L6Q A;  1KAY A;  2ASM A;  1KXP A;  1NGI A;  4FWQ A;  3BP8 A;  4JD2 B;  5BPL A;  4XH1 A;  2E8A A;  2BUP A;  1ATR A;  3QFP A;  5E84 A;  2V7Y A;  4CBW A;  3EKS A;  4H5R A;  3U8X A;  4BRH A;  5LJV A;  1NGG A;  3WT0 A;  4A61 A;  2QWP A;  4EIA A;  2QWM A;  4LC9 B;  4FO0 A;  3EL2 A;  1IG8 A;  3MN6 A;  5AQN A;  4BRM A;  3O1W A;  4O8K A;  1D4X A;  2IVP A;  4MLE A;  2P9P A;  3CJ9 A;  3M3Z A;  2W40 A;  4M7Y A;  4WQ5 C;  1HX1 A;  4FPA A;  3VOV A;  5AQO A;  1E4G T;  2E2Q A;  5AQZ A;  1JCE A;  2QM1 A;  4BRA A;  4H0O A;  2P9L A;  3VF6 A;  1S3X A;  4QS8 A;  5BN8 A;  4RCH A;  3VEY A;  4PL7 A;  4FOE A;  4GNI A;  3ZX0 A;  3D2F B;  4K41 A;  1SQK A;  1SAZ A;  4JD2 A;  3VEV A;  3IMX A;  4FWR A;  3ZET B;  5BRF A;  2A3Z A;  3FLC O;  5BRE A;  1HKB A;  4F9O A;  5AQX A;  1JCF A;  3QIC A;  3DXM B;  3R6M A;  3VET A;  5ELZ A;  1BO5 O;  4H0X B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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