1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
4FOEA 3SLCA 4FO0A 2QW9A 3C0BA 3CERA 3VEWA 1HLUA 1ZXOA 1KAZA 2ASMA 2H3GX 3BF1A 1GLJO 1ZBSA 3CJAA 4K42A 3RSEA 4O8KA 1XQSC 3D2FB 4BG8A 4GNIA 4CZMA 4GY2B 3VEOA 2GELA 3EN9A 1BO5O 4H0OA 4CBUA 3HZ6A 3ULEA 3AAQA 1YXQA 3UKUA 1WOQA 3EO3A 4O5FA 4FWOA 1DGKN 2FF6A 3ZETA 3FFKB 3VOVA 3WQUA 4YDUC 5TKYA 5EOYA 3A5LC 3I8BA 5LY3A 3CJ7A 4PKHA 1NGFA 4B1ZA 5AQJA 1NGAA 3ZX2A 3U9DA 4A2BA 1IG8A 2P9IB 4H5RA 2V51B 3H46O 3VEZA 4YDUA 1NGDA 2E2PA 4BRGA 5E84A 2J4RA 3VGKA 4EFHA 2A42A 3GE1A 2W40A 1U6ZA 3CHWA 3HI0A 2CGLA 1NGHA 2E20A 5BRFA 5E26A 4CBWA 4FWLA 3MN6A 2ZF5O 3OHRA 2FSJA 1RGIA 4EHUA 3EZWA 1T44A 2E88A 1Y64A 2NZTA 4M63C 1Q18A 2IVOA 2Q2RA 2VWBA 3LDNA 5AR0A 5FPNA 3VF4A 4BC3A 5FPEA 2P9NB 2CH6A 1IJJA 1GLCG 2E8AA 4EAHD 3UB5A 3VF2A 2F9TA 3WXKA 3MN9A 3QB0A 5AZIB 5LJVA 1NWKA 2D4WA 3ENOA 3A5NC 3DXMB 4PKGA 4PKIA 5AQLA 2P9PA 3CJ9A 5AQPA 3H6EA 2FSNA 5ADXA 4FWKA 4BGAA 5B8HA 1T6DA 1JCFA 4JAXA 4NO7A 5KPRA 4BRNA 3MN5A 1DEJA 4BVOA 1E4FT 5AQOA 2IVPA 5EVZA 2V7YA 3MK6A 3ZEUB 4CJ7A 1E4GT 2P9UA 3HBTA 2A40A 2IVNA 2D0OA 3R9PA 2F9WA 3A5MC 4DB3A 5BRDA 4B1UB 2ZGYA 2QWMA 1TYQB 2UYTA 3DXKA 3QBWA 4H03B 4XH5A 3LM2A 4C23A 1G99A 5KQ8A 4H0XB 3UKRA 1NGBA 3A5OC 4CZHA 4A61A 4IJNA 4BRHA 3WXJA 3GBTA 4BGBA 4B1VA 3FE1A 1QQMA 2GWKA 3LDLA 3WUHA 3H1VX 3WXIA 4K25A 1D4XA 2I7PA 3VEXA 2GEMA 3GL1A 2E2QA 5AQHA 3D2EA 3LM9A 5AQZA 4CZKA 2GTDA 3A8YA 4JNEA 3O6WA 1BA0A 1GLDG 1QQOA 5ELZA 2QWPA 5BN8A 3VEVA 2A3ZA 4BROA 4Y0WA 3SK3A 2P9SB 5AQGA 3LDOA 2V7ZA 2NRHA 3FZHA 5FPDA 2HOEA 2QWQA 3WQTA 2YHXA 5JLHA 4PL7A 3HTVA 3L0QA 1K8KB 1Z05A 3H1QA 3FZLA 4BC5A 3G25A 3UE5A 4BRPA 3VETA 3MDQA 1GLBG 3R6MA 1ZC6A 4BRAA 3WEEB 1BWFO 4AM6A 3CJ1A 4BRIA 5F1XA 3ATUA 1HUXA 2HF4A 1MWKA 3EL2A 3R8EA 2NLXA 4HWIA 2P9LB 1QHAA 1HJOA 4BRCA 5AZJB 4BC2A 1BA1A 2QWNA 2Q0RA 5F0XA 5AQFA 3AY9A 3MCPA 4JHDA 4CD1A 3AAPA 4CZIA 1U2VA 2YJEA 1NLVA 1ATSA 1KXPA 4BR4A 4WQ4C 1QZ5A 2Q1NA 4B1WB 3O1BA 2BUPA 3FR0A 3VGMA 3D2FA 4MO4A 3WXLA 4ISGA 2HF3A 2E2NA 1SAZA 4K43A 1C0GA 5AQKA 4BRQA 3M6GA 4XEIA 3QDKA 4WQ4A 4IZ9A 4AM7A 1TUUA 3W0LA 1LOTB 3CQXA 1RDWX 3GG4A 4I6MB 1ATNA 5FPMA 1GLFO 1S22A 1QZ6A 1Z6RA 2P9KB 3H45C 3BEXA 2FSKA 3QICA 1GLLO 4CZJA 3C7NB 1CZAN 1WUAA 1BU6O 1RFQA 3VEYA 3VENA 3QBXA 3GOIA 2IIRA 4WYBA 4MO5A 5BPNA 4H0PA 3U4LA 4CZEA 4MLEA 5AQQA 2QXLA 2P9IA 3U9ZA 1X3MA 5AFUH 4CBXA 5BRHA 4IO8A 1T6CA 1NM1A 2E1YA 4E1JA 5BPMA 1XUPO 1H1VA 3W3DA 3U8XA 3IFRA 4H5WA 4RCHA 4BR5A 4FWNA 5AQRA 3O5BA 1SZ2A 3QFPA 4ISEA 1EQYA 3VF6A 4B9QA 2I7NA 4J8FA 5AQTA 1KAXA 3CETA 3VGLA 1BOTO 4XH1A 1HX1A 1JCGA 3RSEB 1GLAG 3DAWA 2P9NA 4IWVA 3MN7A 3JS6A 4NB4A 5F2RA 3ULEB 4IJAA 3P4IA 4H5NA 4ISFA 3H3OB 1NGGA 1V4SA 3CIPA 3JXUA 3KHYA 5AZIA 3VERA 3DXMA 4K41A 2E1ZA 3UKUB 4QS7A 4Z94A 3FZMA 4FWMA 3O4WA 1P8ZA 3O1WA 5AQUA 4WQ5C 5CE3A 4H5TA 3ZETB 1HKCA 3KZBA 4M7XA 4CD3A 2VYPA 3FLCO 1QQNA 2QWOA 2HMPA 5EY4A 1NGJA 3ZEUA 3SMPA 3S41A 4BQZA 1SQKA 2CGJA 2Q97A 4MLHA 2DPNA 2QWRA 3IUCA 4DHYA 4BC4A 4B1YB 1TYQA 4WQ5A 2FF3B 4EHTA 3BF3A 4H0VB 1YAGA 4QS9A 4RTFD 3LDPA 3ATVA 1HPMA 2E2OA 3DWLA 4FPBA 3IMXA 5AFUA 3CJBA 1BDGA 3O08A 1JCEA 1KAYA 4FWQA 3FZKA 4FPAA 1V4TA 2GWJA 2A5XA 2OANA 3HM8A 3ZX3A 1ATRA 4JD2A 3A0IX 4M7YA 5ADXH 3BUZB 3O80A 2FLOA 2D0PA 5BPLA 1TUYA 2YCHA 4CZFA 3ZX0A 3CJCA 3TU5A 4KBOA 2YJFA 1ESVA 4H0YB 2P9SA 5LJWA 2W41A 2BTFA 2Q0UA 2PAVA 3M1FA 2ZGZA 4BRMA 5BN9A 2P9PB 2QM1A 3VPZA 3VESA 4DCHA 1MDUB 3EKUA 3H3NO 1BG3A 1DKGD 3LDQA 4FWPA 4L3QA 4EIAA 1K8KA 5AQIA 4FWSA 5AQXA 2PBDA 3AARA 4BRFA 4A2AA 5JICA 5AQWA 5JLFA 2GUPA 2CH5A 5JMVA 3CI5A 3ENHA 5KQDA 4BR0A 2D1KA 4FOIA 1NMDA 3WEEA 3D7EO 4DQ8A 2P9UB 2QWLA 5AQMA 4F9OA 4FSVA 5BREA 2CGKA 2EWSA 3QMLA 3TPQA 5AQNA 2P9LA 1R59O 5EX5A 3LL3A 1J6ZA 3DXKB 2YHYA 1X3NA 3IDHA 5AZJA 3ID8A 3UKRB 5KPTA 3GDQA 4H0TB 1HKBA 2YI1A 4JN4A 1YUWA 4PL8A 3WT0A 2V52B 1MWMA 3DJCA 3SJHA 4XH4A 1XC3A 2A41A 1MA9B 2KHOA 5EXWA 2Q36A 3D2EB 2ASOA 3CQYA 4BR7A 4QS8A 4A62A 4BRKA 1S3XA 3QFUA 4FL9A 4BG9A 4BREA 4BRLA 5AQYA 1HKGA 3HSCA 3FGUA 3I33A 4HTLA 4BRDA 1C0FA 4B1XB 2A6AA 3M3ZA 4I6MA 1OKJA 5I9EB 4CI6A 1X9JA 4BR2A 3L6QA 1GLEG 5AQSA 2P9KA 2YHWA 1BUPA 4IXCA 3C7NA 3BP8A 1NGEA 3O8MA 3J8AA 3L4IA 1NGIA 2ITMA 1LCUA 4CZGA 2AA4A 4RWTA 3FZFA 5BR9A 3F9MA 3EKSA 4H5VA 1YVNA 4LC9B 1NBWA 2WUSA 3SMSA 2AP1A 5KPZA 2ZWHA 2FXUA 3MMVA 4JD2B 2ASPA 3KVGA 4BQLA 4FWRA 1NGCA 5AQVA 2Q31A 3B8AX 4CZLA 4JHDB 2VCPA 4BR9A 4BVPA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QEXN 4FO0A 2QW9A 4Z4IA 1O13A 4DSIA 1HNWK 2Z1GA 1HLUA 1RDCA 2E4LA 4OVLA 2HHUA 4WFBL 3BF1A 1CXUA 3PX6A 4K42A 1LAWA 3RSEA 2ZJPL 3RR8A 2QI2A 3D2FB 4BWJA 4CF1A 3LPTA 2GELA 3CPWM 4CBUA 1ZBHA 3M5RA 1WBDA 3OW2M 3AAQA 2BH1A 4DLEA 1KTQA 2PYJA 4M3TA 5GAGP 1DGKN 1VQNN 2FF6A 4J2DA 3ZETA 4GV6A 4ZTFA 3RVCA 3VOVA 3QETA 1BI4A 1I39A 5TKYA 2KKZA 3O9QA 3BZKA 5HROA 1J5EK 1RT7A 5LY3A 1NGFA 1JXBA 2O8BB 2G8HA 3H08A 3QNOA 4A2BA 4CJFA 1Z26A 1C0MA 1ZYQA 1CZ9A 2HNDA 1FJGK 3H46O 3VEZA 1I94K 1NGDA 4A5AA 4DF4A 1HQUA 4DR5K 4K8XA 3ZSWA 4JKHA 3CHWA 3U6FA 4LF4K 2CGLA 1UAXA 4LF5K 1QSSA 1D5AA 4FWLA 3L2UA 2ZF5O 4ID1A 4BDYA 3NH0A 4Z4CA 3OYFA 3LPUA 2VWBA 1ILYA 1JLBA 3C95A 4KFBA 1BIZA 4GV9A 4A5BA 3MN9A 4CCHA 1LW0A 3WXMB 4CJRA 1NU0A 3RWUA 4FWKA 4BGAA 3D0PA 5KPRA 1ASVA 4NO7A 5HOOA 4E3SA 2IGIA 1NKBA 3J7ZO 4I2QA 3CC2N 3DM2A 2IVPA 4U7BA 2DTUA 5EVZA 3QEPA 1E4GT 2O8FB 2F9WA 5BRDA 1RT3A 4U67L 1VHXA 1OH7A 4IKFA 1W7AA 3EZ5A 4H03B 1NNEA 1G99A 5KQ8A 2KFZA 3ENBA 1RCHA 4YOYA 1YIJN 3SAGA 4N76A 3OJUA 3LDLA 4GKJK 1UA1A 1EWRA 1N5YA 1YJ9N 2HVHA 2E2QA 1TL3A 2R7YA 3LM9A 5AQZA 4CZKA 2WFBA 1WSEA 1HNIA 1IO2A 3L2VA 4KHPK 2FC0A 4KHYA 1WSHA 4BROA 4Y0WA 5I42A 2P9SB 1NJIO 4CFCA 5HL7L 2O8DA 3D45A 4KREA 2HOEA 4B08A 1TK8A 4FJ5A 2QWQA 2YHXA 4PL7A 4H8KA 1XNQK 3FZLA 4BC5A 2WBNA 3F2KA 2W42A 3MDQA 3AGRA 3V1OA 1WLJA 1L5UA 3DI6A 4O44A 4GKKK 2P9LB 1VQLN 1QHAA 2VG6A 1A5XA 2KLAA 4CERA 4LFBK 4JHDA 4CD1A 1TV6A 1ZBFA 3T1HK 1KXPA 3KJVA 3PX0A 5M1NA 1QS4A 4Z0UA 3I55N 1BCMA 4IOCL 1W0HA 2JWLA 2HF3A 4AHRA 2QA4N 1SAZA 1C0GA 1VSHA 1RBTA 4LF9K 1FKOA 1RTDA 1XMQK 3CQXA 4FVUA 2YNFA 1KLMA 3SV4A 4DTUA 1ATNA 1K6YA 4NYFA 3JYTA 2RE2A 1S5JA 3QICA 3ULDA 2FSKA 3TTFA 4CZJA 4JI0K 4CEFA 3OYAA 2X6NA 4DV2K 4JRQA 1WUAA 3VEYA 2O4GA 1Y97A 3GOIA 2HBMA 5C25A 4MLEA 2ZD1A 4EZ6A 1JL2A 1WN7A 5AFUH 4IO8A 1T6CA 4E1JA 3W3DA 3LDSA 4CHYA 3G71N 4W5OA 4BR5A 1U04A 1UA0A 4KHNA 3K0SA 3QFPA 4NYNA 3KK7A 3VF6A 2B5JA 1S1XA 4I7FA 5KRTA 2HB5A 4IG0A 2EX3A 1ZBIA 4GVEA 4QCLA 5JS2A 2P9NA 4DTRA 2VGNA 1N8RO 3JSMA 3MN7A 5CYMA 4CEBA 1XMOK 4JI5K 2LSNA 3ALYA 4JI2K 3NGIA 3CFRA 4H5NA 1YJNN 3TI0A 4J2AA 3LALA 2JLEA 3DLRA 4K41A 2E1ZA 3UKUB 4QS7A 4DFJA 3MEGA 3O4WA 3O1WA 5CE3A 4WQ5C 3K5MA 3CMAN 4E19A 4CHQA 1LWFA 2NNWA 2QWOA 4KHUA 4GW6A 3SBTA 1VQ9N 3S41A 4MLHA 2DPNA 2QWRA 2G8KA 1RBSA 4DS4A 4BC4A 2X78A 5JVHL 4B1YB 3ZCMA 3KLFA 1GOAA 4NLCA 4DG1A 4KHSA 3QNNA 3LDPA 2F96A 2E2OA 3ZT4A 3IMXA 4JKGB 5AFUA 4FWQA 4FPAA 3FZKA 2A5XA 1SKWA 3HM8A 1ATRA 4JD2A 4CHPA 5CZ2A 5ADXH 4O55A 2OA8A 1VSIA 3O80A 2IAJA 2HHVA 5BPLA 3LANA 3PIPL 1W9HA 4DV6K 2ZJQL 3ZX0A 3CJCA 3TU5A 5M1KA 3J80O 4B3MK 3AVAA 3ASMA 5C10A 3L3UA 2O8EA 4CJTA 3VTHA 3D6RA 4BRMA 5BN9A 4DV7K 4IO9L 3K2PA 4UQGA 1BG3A 1ZBLA 3LDQA 5GADP 3RR7A 3NFAA 5JLFA 3IRXA 3VQBA 5JMVA 4DTNA 4IEIA 3WEEA 4DQ8A 3IAYA 2QWLA 1HYZA 3VTIA 3HPHA 2CGKA 1RT6A 3MEEA 4JK8A 1Z25A 3UIQA 1R59O 4DTJA 1UWBA 4CK2A 4RW8A 5AZJA 3G10A 3CCLN 5KPTA 4H0TB 2X6SA 1N32K 2YI1A 1YUWA 4PL8A 3WT0A 1QTMA 1EKEA 4N47A 1MWMA 2ZQBA 2ITGA 4XH4A 1XC3A 1MA9B 5HRRA 3P83D 3LAMA 4BR7A 2ASOA 3L2RA 3OYKA 4A62A 4BRKA 4DTMA 1S3XA 4FZXC 2EHGA 1LWCA 3QFUA 4IOXA 4BG9A 3JAMO 2BE2A 5CZ1A 3QERA 4BRLA 1EWQA 5AQYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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