4IZ9A

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
383
structure length
381
Chain Sequence
DGARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIGESPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 135
structure length 381
sequence length 383
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2013-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A02
4WQ5A 4DHYA 5BREA 4BVOA 2YHXA 1H1VA 3EKSA 4CZMA 2BTFA 3BF3A 3ATUA 1X3NA 4CZIA 3JXUA 1V4SA 1HKGA 3WXJA 3ZETB 2E2OA 5AFUA 5BPNA 4XH5A 3H1VX 3GBTA 1C0FA 1K8KB 1QZ5A 4L3QA 5AQRA 3O08A 3C7NB 4CZHA 1GLLO 1HPMA 3G25A 3D2EA 3DWLA 4CZFA 3SJHA 2QXLA 4AM6A 1XC3A 4CD3A 3ZEUB 2CGJA 2E2PA 3CIPA 2AP1A 1G99A 3CQXA 2KHOA 4FWKA 4B1VA 5CE3A 3VETA 4BR0A 3CJAA 3KVGA 2HF4A 1J6ZA 3WEEA 4FPBA 4BRGA 3CJCA 4CBWA 4PL7A 3DXMA 3FZHA 2CH5A 3EN9A 3D2FA 5AQVA 1MDUB 2WUSA 2PAVA 5EOYA 2FLOA 3QBWA 3MN7A 4IJAA 3VENA 5EY4A 4F9OA 4FL9A 2F9TA 5AQXA 2W40A 2YJFA 3C0BA 4RWTA 4GY2B 4I6MB 4RTFD 3CJ1A 2CH6A 1TYQA 3F9MA 5FPNA 3VEVA 1KXPA 4FWQA 1BWFO 4BRQA 2HF3A 5ELZA 2F9WA 3CJ7A 4DB3A 3ZETA 4Y0WA 2ASPA 1BDGA 3QICA 4DQ8A 1GLCG 5AQUA 1YXQA 1K8KA 4K25A 2V7YA 3C7NA 4IXCA 1SAZA 2D4WA 4FWSA 1GLFO 4B1YB 5AR0A 4FWLA 2VWBA 2P9UB 3QFUA 3IDHA 4B9QA 3ZEUA 1SZ2A 3A5LC 1WUAA 3ID8A 2YHYA 1ZBSA 4EIAA 4CJ7A 5BR9A 3U4LA 4K41A 1QQOA 1JCEA 4K43A 3FR0A 1BA1A 4FOEA 4BRDA 2V51B 1R59O 5BRDA 3WXIA 3FZLA 4IZ9A 4FWOA 4KBOA 4JNEA 4QS9A 5E26A 5BPLA 3DXKB 3M1FA 2V7ZA 3H3NO 2Q0RA 3W0LA 1HUXA 1OKJA 2P9LB 5KPTA 3O1WA 3ATVA 4I6MA 2GELA 3VEYA 1NGEA 3CI5A 2Q0UA 3M3ZA 2FSJA 3HSCA 3O6WA 3VGLA 2FSNA 5AQMA 3GL1A 3QB0A 4FWMA 2P9KB 4H5RA 1T6CA 3SLCA 4ISEA 3AARA 3WUHA 4CD1A 3W3DA 5AQNA 2P9UA 2Q2RA 5FPEA 4IWVA 2J4RA 3VERA 4BRMA 4YDUC 2V52B 3EL2A 4RCHA 4O8KA 3MCPA 1MWMA 5JICA 2CGLA 1SQKA 4JD2B 4JN4A 1Q18A 2QWNA 3FFKB 2IIRA 3CJ9A 1TYQB 3O80A 1NGDA 4BGAA 2GWJA 4H0OA 3MN9A 2QWQA 3DXKA 2P9PB 2I7PA 5AZIB 3CERA 4EHTA 3WQTA 1MWKA 2P9LA 3EO3A 1NGIA 1YAGA 4IJNA 3H46O 4BRFA 4PL8A 3CETA 3QDKA 4EFHA 3MN5A 5EX5A 5AQZA 3AY9A 2QWLA 5ADXH 2W41A 1YVNA 2FF3B 4H0XB 2P9KA 4NB4A 3FZFA 1NMDA 2VCPA 1IJJA 2Q31A 3HBTA 5AZJB 2DPNA 1BU6O 3VEOA 3SMSA 4CI6A 3SMPA 3D7EO 5FPMA 3FZMA 4WQ4A 4JD2A 2FSKA 1NM1A 1IG8A 2E2NA 1NGBA 3LDPA 3A5OC 4ISFA 1P8ZA 3BP8A 4MLHA 1RFQA 4NO7A 5AQJA 1TUUA 5BRFA 1C0GA 2P9PA 5AZIA 4FWRA 4FSVA 4M7XA 3U8XA 3TPQA 1JCGA 5EXWA 3S41A 1GLAG 3BUZB 4WQ5C 2FF6A 5AQSA 1RDWX 5AQTA 3VPZA 2ITMA 3IFRA 4H0YB 3KZBA 4FWNA 1KAYA 3GDQA 5AQFA 3RSEB 3LDQA 1U2VB 5EVZA 2D0OA 3VF4A 1Z6RA 1KAZA 1HKCA 1Y64A 3L6QA 1X9JA 2EWSA 5F2RA 3QMLA 5FPDA 4BRLA 1ATSA 3QFPA 2AA4A 1QQMA 4B1XB 5AZJA 1Z05A 4YDUA 4JHDB 3AAQA 3H3OB 1BO5O 3FGUA 1KAXA 3HM8A 3U9DA 4BVPA 4J8FA 1ZXOA 4MO5A 4BRHA 5ADXA 4BR2A 3L0QA 1MA9B 1S22A 3MK6A 5AQPA 3A5NC 5BPMA 2CGKA 2E20A 2IVPA 4MLEA 4K42A 4BRAA 5KPZA 4BQZA 2QWPA 1E4FT 1DEJA 1HJOA 3LDLA 4H0VB 1GLEG 1XQSC 4Z94A 2YJEA 3IMXA 3RSEA 2HOEA 1X3MA 3VOVA 3SK3A 1BUPA 4E1JA 1U2VA 2A42A 1ZC6A 2QW9A 2YI1A 1RGIA 3ZX0A 2ASOA 4EHUA 2NZTA 3O1BA 2P9NB 5BRHA 4BC3A 3P4IA 3MN6A 3CJBA 4HWIA 3MMVA 3EKUA 3B8AX 4JHDA 2A6AA 2GEMA 3FE1A 4BG9A 1ATRA 1S3XA 4JAXA 5LJWA 2E8AA 2BUPA 5AQIA 2ZGZA 1JCFA 5E84A 4PKHA 3UKRB 1DKGD 3LM9A 2ASMA 2I7NA 4A61A 2HMPA 2QWMA 4BR9A 1NWKA 5LY3A 1CZAN 2VYPA 1GLJO 1QHAA 5JMVA 3TU5A 4FWPA 2GTDA 3ULEB 4O5FA 1NGHA 4H03B 5JLHA 5AQKA 2Q36A 4BRNA 5BN8A 3ZX3A 4H5NA 4BRCA 2E1ZA 4H5VA 3OHRA 3UKUB 3U9ZA 5TKYA 2GUPA 4XH4A 2Q1NA 3GOIA 4BRIA 3EZWA 5BN9A 3AAPA 5AQQA 3L4IA 3I33A 3A8YA 2P9SB 4FO0A 3IUCA 5KQ8A 2P9NA 3BF1A 3WT0A 2QM1A 5F1XA 1HKBA 4QS7A 5AQLA 5JLFA 3ZX2A 1E4GT 3O5BA 4CZJA 2ZGYA 1TUYA 4FPAA 4A62A 1ATNA 1ESVA 2E2QA 1BG3A 2FXUA 3UKRA 4LC9B 3CHWA 3GG4A 4H0PA 3KHYA 3UB5A 3VEWA 4C23A 3DAWA 2A3ZA 1NLVA 1T44A 3R9PA 4A2AA 3VESA 3ULEA 4H5TA 4H5WA 2NLXA 3WQUA 5AQYA 2Q97A 3A5MC 4BC5A 1NGJA 3VEXA 3M6GA 3LDNA 1WOQA 2A41A 3UKUA 4BG8A 4ISGA 4BC2A 5I9EB 4XH1A 2ZF5O 3ENHA 3J8AA 4A2BA 4BC4A 2ZWHA 1YUWA 4GNIA 2P9SA 5AQHA 5LJVA 3VGKA 4BR5A 2GWKA 3H45C 4CZGA 1U6ZA 3DJCA 4CZEA 2P9IB 3R8EA 5KPRA 3HTVA 3VF6A 1NGCA 5AFUH 5AQWA 1GLBG 3MDQA 4DCHA 4BGBA 1BOTO 4IO8A 2D0PA 2YCHA 4HTLA 4BR4A 2OANA 3LM2A 5B8HA 3QBXA 1T6DA 2IVNA 3ENOA 4BQLA 1V4TA 5F0XA 1XUPO 1EQYA 1DGKN 4WQ4C 5AQOA 1BA0A 3BEXA 2QWRA 1NBWA 3H6EA 1D4XA 4QS8A 3WXLA 3VGMA 2IVOA 4EAHD 2D1KA 3LDOA 1HLUA 2E1YA 4M63C 4PKGA 2PBDA 4BR7A 4BRPA 2A40A 3WXKA 2QWOA 4H0TB 3FZKA 4CZLA 2NRHA 3H1QA 3GE1A 3HZ6A 3R6MA 2E88A 4MO4A 3CQYA 4M7YA 4B1ZA 3JS6A 2H3GX 2A5XA 5KQDA 3D2EB 1HX1A 4AM7A 3LL3A 3FLCO 4CBXA 4B1UB 1QQNA 3O8MA 4PKIA 5AQGA 4BREA 3A0IX 4B1WB 3WEEB 3HI0A 1LCUA 3DXMB 4BRKA 3D2FB 2P9IA 3I8BA 1QZ6A 4FOIA 1GLDG 4CZKA 3VF2A 3O4WA 2UYTA 1NGAA 2YHWA 4CBUA 3VEZA 3UE5A 4WYBA 4XEIA 1NGGA 1NGFA 1LOTB 4BROA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TANA 4J2DA 4DHYA 5BREA 1ASUA 5HRPA 1SL0A 1VQ6N 5CY4A 2QTDA 4CZIA 3JXUA 1V4SA 1HKGA 3WXJA 4CFCA 4B9TA 2E2OA 5BPNA 3RMAA 4XH5A 3DRSA 4L3QA 4RG8A 2Z1IA 5CYQA 3HXMA 4B08A 4E1MA 4IOCL 3KK2A 1HPMA 1SL2A 1YVUA 4FLTA 1FW6A 3DWLA 2OYQA 1RT1A 4CD3A 4NXMK 3CQXA 4KHNA 4KPYA 2UXDK 4BR0A 1HPZA 3CJAA 3KVGA 4FM1A 2NRXA 3WEEA 1FJGK 3DXMA 3EN9A 3D2FA 4RW9A 4HHTA 3QEWA 5AQVA 3DRPA 4AHVA 1NNEA 3L2VA 4WFNL 3KK1A 5HLFA 2P5OA 5AQXA 1RT3A 1LAVA 3BZCA 4RWTA 3MX2A 2CH6A 4JK8A 3NH2A 3NH1A 1RT7A 1KLMA 3HVRA 4FLZA 4FWQA 1BWFO 3WNEA 1HJRA 4PA1A 2VQFK 2RKIA 4ELVA 1WSIA 1GLCG 2RN2A 4K25A 4IXCA 1WSEA 3ISNC 4W5QA 4B9SA 2E5LK 1VSLA 5CR4A 4E7IA 1WUAA 4RW4A 1VQPN 3AVBA 3MEGA 4O0JA 4JI5K 1Z25A 2RHKA 3FR0A 1BA1A 2Y1JA 1R59O 3WXIA 3FZLA 5FDLA 4JI1K 4IZ9A 5E26A 4JNEA 4PWDA 4DTNA 4L8RB 3DXKB 5FLXO 3LAMA 3M1FA 2V7ZA 4CGGA 4DG1A 3W0LA 1HUXA 3NMUA 1IBMK 3ZSOA 4HCCA 4GV6A 4GV9A 3VEYA 2Q0UA 3TSUA 4KHSA 3VGLA 1OH6A 1VRTA 3T1YK 1JLQA 4FWMA 3AVCA 2P9KB 4O0IA 1T6CA 4ISEA 3S3MA 1HRHA 1C1BA 3W3DA 4CGFA 4M42A 5FPEA 4BRMA 1U04A 4YDUC 4BY9C 2D5RA 3MCPA 4FLYA 1TGOA 4JD2B 4JN4A 4ZHRA 3CCJN 4OGEA 1TAQA 2HVHA 3CJ9A 4BGAA 2GWJA 4H0OA 5HROA 3MN9A 3SUOA 3DXKA 2I7PA 3NF9A 3KLFA 4OKKA 3E9PA 4IJNA 1ZBFA 3H46O 1WNSA 4PL8A 1YTUA 2ZE2A 5AQZA 4KREA 1NOZA 3EE8A 1LAWA 2G8IA 4FJGA 1C0UA 2E6LA 2QWLA 2W41A 2FF3B 4Q5VA 3NCIA 3MECA 4H0XB 1QS4A 2P9KA 3SI6A 2HW3A 3CQ8A 3SQ1A 1YTAA 3E1YA 4CEEA 3FZFA 4C1NK 3ID6A 1NMDA 2VQEK 4CK2A 4Q0BA 3VEOA 2NNWA 1DTTA 2VGNA 3HOSA 3O9TA 4WQ4A 4JD2A 4CF8A 4KTQA 5M1NA 1NM1A 3THXB 1S1XA 3PO5A 2XY7A 1P8ZA 2UXBK 4MLHA 1RFQA 5AQJA 1TUUA 2GV9A 4E89A 4FLUA 4CHPA 4FWRA 3AVHA 3U8XA 3TPQA 1JCGA 1UA0A 4YY3K 4IG0A 4WQ5C 4HUGA 2FF6A 1S72N 4DLEA 1TVRA 1SUQA 4CF1A 5J2MA 3IFRA 4H0YB 3RSEB 4EZ9A 3GDQA 1C0TA 1Z6RA 1XHZA 1VSEA 3D0PA 1QE1A 3F9KA 4FJMA 3PUFA 1RCHA 1D9DA 5CZ2A 1S5JA 4FJKA 1RTJA 4DR1K 1Z05A 2ZJPL 4YDUA 3H3OB 4NCBA 4BDYA 4B3SK 4J8FA 1HQEA 4MO5A 1QVFM 4H4OA 3QIPA 4DV2K 3MK6A 5AQPA 3THXA 1WN7A 4FVMA 3QEIA 4FJ8A 4MLEA 2PFUA 3OYAA 5GAHP 1VAZA 2PYLA 4HCBA 2JWKA 5KPZA 4LF5K 1Q8IA 3K5NA 1E4FT 1HJOA 3HP6A 2VGMA 4JYAK 4B9NA 5DM7L 4RW8A 5K14A 2IOCA 1Q86O 1XQSC 2DFEA 2YJEA 3RSEA 3SK3A 2QW9A 3M8SA 2ASOA 4KH5A 5BRHA 3P4IA 1EO1A 1VQ4N 3ZCMA 2VG5A 3MMVA 3EKUA 3AV9A 2GEMA 4CJPA 3DLRA 4F4KA 1S3XA 4JAXA 1NK4A 2E8AA 4JK9A 2ZGZA 1JCFA 5E84A 4DWIA 2QWMA 4FLWA 1NWKA 1IG9A 5C25A 4MDAA 4YOTA 1QHAA 3TU5A 4YHHK 4ICLA 2VG6A 1OH5A 1QSSA 1NK6A 1S1VA 1VQMN 2Q36A 3ZX3A 3AA5X 4BRCA 1Q81O 3LP0A 4C8NA 1SL1A 3GOIA 1ZBIA 3MEEA 4FW1A 3PIPL 4O8UA 1SKRA 3BF1A 4YOUA 3WT0A 1VQ8N 1TK0A 3MXMA 5F1XA 3IS9A 2KKZA 1U45A 4QS7A 3S3NA 3ZX2A 4E1NA 4ILHA 4FJNA 4CZJA 5DM6L 2NRWA 1G15A 4X65K 4KI4A 4N56A 3I0SA 3SAGA 4KH6A 1BG3A 3EY1A 2QK9A 5D3GA 3JSMA 3V9SA 1IV0A 3KLHA 4CVNE 3UB5A 4F3TA 3CM6A 1KVAA 1T44A 4CEQA 4RW6A 5CZ1A 4BDPA 4A5AA 3D45A 1JXEA 1LWEA 4BC2A 5I9EB 4XH1A 4DQSA 4CEFA 1R0AA 1NK7A 1JLCA 1XWLA 3D6RA 4B3OA 3H45C 3G71N 2P9IB 3TAQA 3RR8A 1E3MA 3PIOL 3NVMA 4UQGA 1TK5A 2YNHA 5AFUH 3NF6A 4DCHA 4IO9L 4HTLA 2OANA 3C65A 2IAJA 1XUPO 1DGKN 3TTCA 3BEXA 3K5LA 3H6EA 1D4XA 1TV6A 3WXLA 3AVAA 4C8MA 1VSMA 4EAHD 2D1KA 1RBVA 1HLUA 2E1YA 4BRPA 2HHTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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