4IZ9A

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
383
structure length
381
Chain Sequence
DGARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIGESPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
molecule tags Transferase
total genus 135
structure length 381
sequence length 383
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2013-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A02
4YDUC 4BQLA 4BVOA 2FF3B 4BRIA 1BA1A 5AQPA 3WEEA 1MDUB 4EHUA 1G99A 4CI6A 3MN9A 2YCHA 1JCFA 5BR9A 4EHTA 1WUAA 4CBUA 2P9UA 3FZFA 1DGKN 2VWBA 4H0PA 4B1XB 2F9TA 2V52B 4BGBA 3GL1A 2YJEA 5AQZA 2CH6A 3GE1A 3MN5A 1BU6O 1NGAA 1K8KA 2Q97A 2YJFA 5KPTA 5AQIA 5AZIB 5BRHA 4FOEA 4XH4A 3WXJA 3U9ZA 3D2EA 2GWKA 2ZWHA 3FE1A 1HPMA 4B1YB 3A0IX 5ELZA 1LOTB 4CZLA 1TUUA 4H5RA 1HUXA 4JHDB 5AQTA 3VEVA 4CD3A 1NWKA 1D4XA 1SQKA 3KZBA 1LCUA 1X3NA 4IZ9A 3CJCA 3FR0A 5FPNA 3SJHA 3WT0A 4L3QA 3L6QA 3VF2A 2I7NA 4DQ8A 4FWNA 3HSCA 2FXUA 2F9WA 4BC3A 1T6DA 2ZF5O 2ASOA 3M6GA 5E26A 2DPNA 3DAWA 5JICA 1MA9B 3U8XA 3A8YA 4ISEA 4WQ4A 3U4LA 4BG9A 5LJVA 3MDQA 3VF6A 2W40A 2NZTA 2W41A 2NRHA 2E1ZA 4IJAA 1HKCA 1HX1A 2UYTA 3BF3A 3P4IA 4FPAA 4CZJA 3UKUB 1ZBSA 4AM6A 2P9PB 4XH1A 5F1XA 4E1JA 4FWSA 1Q18A 3SMPA 2P9SA 3BF1A 3H3OB 4FWMA 1NGHA 1HKBA 4BR4A 3ULEB 4CZGA 4H03B 1MWMA 4AM7A 3MK6A 5F2RA 1Y64A 4CZKA 5CE3A 5AQQA 3FZHA 5LY3A 2D1KA 5KQ8A 4FL9A 2CGKA 1XC3A 3F9MA 2A41A 4WQ4C 3UB5A 3CERA 4BROA 4CBWA 2HOEA 5AFUA 4BRDA 4RWTA 1RDWX 2KHOA 4BR5A 3ZX2A 1NGJA 4FWOA 3D2FB 3IDHA 1TYQA 3ZEUA 3MMVA 4BRNA 2PAVA 1QZ6A 1NGGA 1T6CA 2P9IB 2D0OA 3DXKB 3O6WA 3O08A 1NGDA 3CETA 3ENHA 4BRLA 3O80A 5AZIA 3GDQA 5AZJB 2FF6A 1EQYA 1NGIA 1U2VA 2FSJA 3WQUA 3QFPA 1KAZA 3SK3A 3A5OC 3CJ1A 4O8KA 4JHDA 2YHXA 4BRGA 4BR7A 3C7NB 3LDOA 3R8EA 1YXQA 4ISFA 3BP8A 1QZ5A 1TUYA 2OANA 4C23A 3QBWA 1GLLO 2CH5A 4BC5A 3LDPA 2BUPA 4CBXA 4M7XA 4JD2B 3WXLA 1BDGA 4I6MA 3C0BA 2ASPA 3EN9A 3W0LA 1NGEA 3CIPA 1RFQA 1V4SA 4A62A 5AQOA 1GLDG 4BRCA 2A5XA 5KQDA 1S22A 1BO5O 4K25A 4BRFA 3H1VX 1ZXOA 1NGCA 1WOQA 4BRQA 4PKGA 1XQSC 4IWVA 4FOIA 3UKUA 3VPZA 2P9PA 4B1VA 5AQLA 3CJAA 3VOVA 4FPBA 5BREA 4JN4A 4LC9B 1YAGA 2IVOA 5LJWA 3ATUA 3OHRA 4BR9A 3AAPA 3ULEA 4M63C 4BRAA 1RGIA 3ATVA 3O8MA 3ENOA 3FLCO 3LM2A 2VYPA 4PL8A 3VESA 4RTFD 3HZ6A 5JLFA 3A5NC 3GG4A 1NGBA 3DXMB 5AQJA 1JCEA 1MWKA 4RCHA 4WQ5C 5AQGA 4CD1A 4K41A 3U9DA 3A5LC 3D2FA 2QWMA 3VERA 5BN9A 4CJ7A 5AQXA 5AQSA 3TPQA 5EVZA 2P9IA 5B8HA 2Q36A 3DXKA 3EL2A 1DKGD 3H46O 3FZKA 5AQWA 5I9EB 3AAQA 2ASMA 1IG8A 5AZJA 5AQUA 3ZX0A 1GLAG 2ZGYA 3SMSA 1GLEG 2QWOA 4EAHD 5BRDA 4A61A 5FPMA 2GUPA 3JXUA 3MN6A 3FGUA 3D7EO 3DWLA 2GTDA 4K42A 2FSNA 5BN8A 3GOIA 4BVPA 3C7NA 2HMPA 3VETA 4FWRA 1OKJA 5E84A 3O1WA 2H3GX 1DEJA 4O5FA 1Z05A 4BR0A 4JD2A 4B1WB 3KVGA 1X3MA 3H3NO 1GLJO 1NMDA 1BUPA 2YHWA 1U6ZA 1E4FT 4BQZA 4PL7A 5FPEA 1P8ZA 4A2BA 2QWRA 3UKRB 2Q31A 4H0OA 4MO4A 3D2EB 3VGKA 2QWQA 2VCPA 3VGMA 3IFRA 5BPMA 3VEYA 3O5BA 2PBDA 5KPZA 1KAXA 1E4GT 2E1YA 1V4TA 5AQHA 3DJCA 2YI1A 3HI0A 3R6MA 2J4RA 5BPLA 3ZETB 2IVNA 3VEWA 3VF4A 1C0GA 4BRHA 5BRFA 3WUHA 3DXMA 2QW9A 2P9LB 1KXPA 4H0TB 5ADXH 3H6EA 4PKIA 3M1FA 5F0XA 2HF3A 1BA0A 3O4WA 3CQXA 5TKYA 3I33A 1HJOA 3RSEB 3VEXA 1BG3A 3LDNA 1QQMA 5EY4A 4BGAA 2P9SB 1IJJA 4MLHA 3TU5A 4BC4A 3QB0A 2HF4A 4WQ5A 1QHAA 2A42A 3CHWA 3CJ9A 2ITMA 3CI5A 4IO8A 4BREA 3QDKA 2D4WA 1S3XA 2E2NA 2E20A 4M7YA 4EIAA 3H45C 1SZ2A 4A2AA 1ZC6A 5AQNA 3ZX3A 2Q0UA 4H5VA 5JMVA 1JCGA 3EKSA 1KAYA 1TYQB 2E2PA 3ZEUB 2YHYA 4BG8A 4FO0A 4BR2A 4BRKA 2P9KB 3BEXA 3H1QA 4CZIA 1X9JA 4MO5A 4IJNA 2V7ZA 3UKRA 3FZMA 3LDQA 4FSVA 4H5TA 1U2VB 2ZGZA 4GY2B 4J8FA 2CGJA 4FWLA 3VEZA 1GLFO 1T44A 4K43A 4KBOA 3WXIA 3EZWA 5FPDA 2FSKA 2BTFA 3IMXA 3GBTA 2P9NB 3I8BA 3WXKA 3KHYA 2Q0RA 3CQYA 3UE5A 3VGLA 4Y0WA 4JAXA 1NBWA 4B1ZA 4CZFA 4H5NA 5AQVA 4DCHA 1H1VA 4B9QA 3WEEB 1HLUA 2QXLA 4H0XB 3LL3A 4H0YB 1C0FA 4FWKA 5AQKA 4I6MB 2E8AA 3SLCA 3ID8A 1CZAN 3HBTA 3ZETA 1NLVA 2A3ZA 5AQFA 1XUPO 3QBXA 5AQYA 5KPRA 2A6AA 3G25A 4QS8A 3CJBA 4MLEA 4BRMA 2P9LA 2P9UB 3QICA 4QS7A 4B1UB 5EXWA 4BC2A 3S41A 4Z94A 3MN7A 2I7PA 3BUZB 4XH5A 2AP1A 4PKHA 3EKUA 3WQTA 2WUSA 1K8KB 2GWJA 2IVPA 4FWQA 5EX5A 1R59O 3RSEA 3VEOA 1ATSA 2Q2RA 4H0VB 3LM9A 4HTLA 2IIRA 3FZLA 5AQRA 5AQMA 2GEMA 2QM1A 3B8AX 4NB4A 4F9OA 3L0QA 3QMLA 1SAZA 5AR0A 1NGFA 2FLOA 3EO3A 3O1BA 4QS9A 5ADXA 3IUCA 2EWSA 2V51B 3HTVA 1Z6RA 4H5WA 3W3DA 1ATRA 4CZHA 2QWLA 1QQNA 3LDLA 3L4IA 4DHYA 3J8AA 4CZMA 3CJ7A 2D0PA 1J6ZA 3M3ZA 3JS6A 4YDUA 5EOYA 3A5MC 4EFHA 2Q1NA 3FFKB 1BWFO 1YVNA 1NM1A 1ESVA 1YUWA 2E2OA 4CZEA 1QQOA 2P9KA 1ATNA 1HKGA 4JNEA 4XEIA 5JLHA 2QWPA 2V7YA 3R9PA 2QWNA 3AARA 2A40A 3MCPA 4NO7A 3HM8A 4GNIA 4WYBA 4FWPA 4ISGA 2AA4A 2GELA 4DB3A 3QFUA 5BPNA 2E88A 2NLXA 3AY9A 4IXCA 2E2QA 4HWIA 1BOTO 2CGLA 3VENA 5AFUH 1GLCG 2P9NA 4BRPA 1GLBG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF1A 4DU3A 5C2DA 1N32K 4BQLA 4BVOA 4BRIA 3V1OA 3WEEA 3LP2A 4H8KA 3AVGA 1J9AA 1XC9A 4FJ7A 3KK3A 5DM6L 3LPUA 3RR7A 4ZTFA 5IT9O 1JCFA 4EHTA 2UXBK 4CBUA 2P9UA 3HO1A 3AVKA 4B8CA 1HNZK 4BGBA 2YJEA 5AQZA 2HNZA 3TABA 3M8SA 1NGAA 2Q97A 5LL6Z 4UQGA 2F8SA 5M1QA 5HL7L 3WXJA 3U9ZA 2P5GA 3ISNC 3D2EA 4CF9A 1HPMA 2OYQA 1LOTB 4JHDB 1D4XA 3DLKA 3CCRN 2HVIA 4C1NI 4JI7K 5IWAK 1LCUA 1X3NA 4IZ9A 3CJCA 5FPNA 4M3TA 1KVBA 2PFUA 4L3QA 3VF2A 4NXNK 2F9WA 3SQ4A 4OGCA 2QXFA 5DM7L 4CJLA 2ZJRL 4KHQA 2EX3A 3U8XA 4AH9A 3HXMA 4Z4EA 1JLGA 4GKKK 4X62K 3MDQA 4DFJA 3BZCA 2W41A 4CJ3A 4CGGA 1HKCA 3DLEA 2D0AA 3BF3A 3P4IA 3CXCM 4RW4A 3BDPA 1KVAA 5F1XA 4R79A 1VQON 1Q18A 1Q7YO 2OTJN 2IDOA 5SWMA 4CK3A 3O3HA 4BR4A 3LPTA 3CC4N 4AM7A 4CZKA 1Y64A 5CE3A 5LY3A 2E4LA 2A41A 1VHXA 3MX2A 3SUPA 4WQ4C 3TR8A 1S6PA 4CBWA 1D9FA 4CFDA 3RWUA 1ILYA 3A2FA 2IC3A 5KI6A 1K6YA 4BRNA 1VQ5N 2PAVA 3PUFA 3U3YA 1YJWN 3VQDA 1NOZA 3TAQA 3OA9A 3ZSXA 4ICLA 3O6WA 3O08A 1IBMK 3ENHA 3WNGA 3OYCA 4C8MA 5AZIA 1FXXA 3GDQA 2FF6A 1U2VA 4I9LA 1NNEA 3NH2A 2Z1IA 3P5JA 2O8BB 1IV0A 3R1XA 3SK3A 3P83D 4O8KA 4M3RA 1MU2A 4DQQA 2W42A 3NE6A 4B3TK 3N4PA 4DTPA 1TUYA 3K5OA 1X9WA 3QBWA 2CH5A 1W97L 1N34K 3AVCA 3SAFA 3EN9A 1EXQA 5HRRA 2E6MA 1VQ4N 1V4SA 1Q82O 2IS3A 2XY7A 5AQOA 2ETJA 4BRCA 4JKGA 4QCLA 4BRFA 3H1VX 1ZXOA 3K9JA 4FM0A 3KD5E 4KTQA 2KZZA 4FOIA 4R5PA 3NFAA 4F2SA 3KTQA 3OYNA 2P9PA 4OLAA 3B6PA 4CJ4A 1ASUA 1KFSA 2HBLA 3CJAA 4DV5K 5BREA 4ELUA 3PIPL 5HRSA 4RW6A 5LJWA 3SAGA 2VGNA 3ATUA 1LWCA 2FC0A 3L2WA 3ULEA 4Q5VA 2VYPA 2OPPA 3GG4A 3AA2A 4CD1A 1FKPA 4CEEA 3CCQN 3U9DA 1GOBA 3D2FA 2HMIA 2QWMA 1TK0A 5EVZA 4DU4A 1JL2A 3SYZA 5C15A 3NDKA 1DKGD 1IKWA 5I9EB 3CFOA 3SNNA 1RBUA 1GLAG 4IKFA 2ZGYA 3LDSA 4WF9L 2QWOA 2RPIA 2XY8A 4A61A 5BRDA 2GUPA 2GTDA 4KH5A 3VETA 4C8NA 3WNFA 1OKJA 2ATQA 5E84A 1HNIA 4DTNA 2QA4N 1K9MO 2H3GX 1BISA 5DMRA 4O5FA 1Z05A 3VQCA 2QKKA 1ITGA 4FLYA 4KB1A 4B1WB 4ILHA 1BUPA 3QNOA 2YV0X 5FPEA 1P8ZA 4A2BA 4G9ZA 5C0YA 1L5UA 1J5OA 3MEGA 2Q31A 1T7PA 1TK8A 3AO5A 3OYBA 3D2EB 4E7HA 4DLEA 4OVLA 4YNQA 3E9LA 3CM6A 4OJRA 4KTWA 1VSDA 4CJRA 1S9EA 4DSFA 1V4TA 4N56A 3DJCA 1X1PA 3R6MA 4CE9A 2J4RA 4JKCA 1RDBA 3DI6A 3K0SA 3VEWA 3DLBA 1W0HA 4NCAA 1YJ9N 2RN2A 3NGYA 3K57A 3DLLL 5C10A 2P9LB 5GADP 5ADXH 1XNQK 3KIOA 4ID1A 2JGUA 5F0XA 4FVUA 3OYJA 3RR8A 4JI3K 1FK9A 1HJRA 4FVMA 3CQXA 5TKYA 3I33A 4JKAA 1BG3A 3M5RA 4BDPA 4FJGA 3SUQA 1IJJA 4JEPA 4E7KA 1RT1A 4CJWA 4CHZA 2ITMA 1OH7A 3ZSQA 1WAFA 3QDKA 1NJZA 4M7YA 3TAGA 3DLGA 3CC7N 1SZ2A 4E0DA 4HTUA 4CHNA 2GUIA 4LFAK 3O9TA 2YHAA 4JI1K 1KAYA 3CG7A 1Q9XA 4FLWA 3THYA 2D0CA 3AO2A 3BEXA 3HSTB 3DLRA 2D0BA 4CZIA 4J2DA 1DT9A 4IJNA 3CFPA 1WSFA 4AF1A 4CIEA 3UKRA 1QSLA 1U2VB 4PA1A 1BI4A 2ZGZA 4BDYA 4FWLA 1Z25A 4YHHK 3QESA 1GLFO 4E1NA 4IOAL 2FSKA 3K2PA 3VQAA 3PLAA 1ZBHA 4FJKA 2HHUA 3UE5A 4JAXA 1D8YA 4CZFA 3U3GA 4DCHA 1TVRA 3O9SA 2I5JA 2QXLA 4H0YB 4N5SA 3OS1A 1S6QA 3CMAN 3SLCA 3L4QA 4W5OA 1YJNN 1RTJA 4FM1A 3HBTA 3ZETA 4BWJA 5AQFA 5AQYA 4GV6A 1XUPO 4CESA 4BWMA 4QS8A 5H1SQ 4BRMA 3KLIA 4DQPA 1A5XA 3MN7A 3OYHA 1ZYQA 3BUZB 2O8DA 4FLZA 3EKUA 3WQTA 3VQ5A 2GWJA 1VQMN 1R59O 3RSEA 3DRSA 1K8AO 1WBDA 2IIRA 2HW3A 3FZLA 5AQRA 3VQ8A 4CF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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