4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
3FZLA 1HPMA 3UKUB 3CIPA 5FPEA 4MO4A 3VEYA 5F1XA 1NGEA 3VEOA 5AZIA 3QFPA 2NRHA 1NGIA 2P9PB 1Z6RA 3VGKA 3JXUA 5AZJB 1NGHA 4I6MA 2GUPA 4FWKA 4F9OA 4BC4A 3H6EA 3QICA 5KQ8A 3VEXA 5EVZA 4DHYA 4XH1A 3DXKA 3C7NB 4K41A 2HOEA 3SK3A 1MDUB 3M1FA 4BC3A 4K43A 3L6QA 4O5FA 1NLVA 3I33A 3LDOA 2P9KB 4GY2B 3VEWA 2YJEA 3ATVA 5KPTA 1HX1A 1GLDG 3L4IA 1CZAN 2BUPA 3UKUA 4CZFA 2E2PA 2P9SB 5AQLA 1IG8A 3B8AX 3L0QA 4DB3A 1GLLO 1DGKN 3EZWA 5B8HA 2P9PA 5BRDA 1R59O 3C0BA 3G25A 5AQHA 1WUAA 2CH5A 3A0IX 2E88A 1TYQA 3IMXA 4FOEA 2A41A 5AQIA 3WQTA 4BR0A 2D0OA 2FF6A 3LDNA 1QZ6A 3FZKA 4FO0A 1NBWA 4M7YA 2P9KA 3EKSA 3EKUA 4FWLA 1KAYA 5AQOA 1V4TA 1XC3A 4CZHA 2P9SA 3VENA 4BRDA 3GE1A 4RCHA 4JD2B 3DXMB 1C0GA 4AM7A 4H0VB 4H5VA 4FPBA 3GBTA 1BO5O 5LJVA 5JLFA 3MN5A 4EHTA 1TUYA 1ZXOA 5AQTA 3GOIA 2Q0RA 3WT0A 4BR9A 4H5NA 3RSEB 3HZ6A 1C0FA 5KPRA 4WQ5A 3LL3A 2V7YA 2VCPA 3SLCA 3WUHA 1BU6O 2Q2RA 1GLBG 4QS8A 5F0XA 5JLHA 2IIRA 2W41A 5AQQA 4JD2A 3DXMA 4H0YB 2KHOA 1X3NA 1QQOA 4BRIA 4KBOA 2QWMA 4JN4A 2FSKA 3W0LA 4FWRA 4C23A 3UKRB 2QWNA 1SZ2A 4BR7A 3VERA 5ADXH 4FPAA 4IWVA 1S22A 4XH5A 4BREA 3GDQA 5AQZA 2D4WA 4BC5A 3MDQA 5LJWA 5AR0A 2ASOA 3O1WA 4A2BA 4CZEA 3H1QA 1NGDA 3ZETB 3D7EO 4M7XA 3ATUA 3DAWA 5AQGA 2E2QA 2Q1NA 5BPNA 2FSNA 2IVNA 4IZ9A 3UB5A 1ATNA 2I7PA 1NGJA 4PKGA 3GL1A 3A5LC 3UKRA 3LDPA 3HSCA 1HKCA 3MK6A 3QBXA 1BG3A 2YJFA 4H03B 1ZBSA 1JCFA 4EHUA 2HF4A 2W40A 3FE1A 3VF2A 3ZX0A 4B1UB 3S41A 3QFUA 3H1VX 3IUCA 2AP1A 4B1ZA 4CZGA 5JICA 4MO5A 3HI0A 3ZETA 5KQDA 1JCGA 3U8XA 4RTFD 1DKGD 2NLXA 4CZMA 4H5RA 4BQZA 1K8KA 5KPZA 4H5TA 1TUUA 4FWNA 2E1YA 3MMVA 4FWOA 1HLUA 4CJ7A 3MCPA 4EFHA 4WQ4C 4L3QA 3MN7A 3IDHA 2QWPA 5FPNA 1E4FT 2P9LB 3OHRA 4CZJA 4Z94A 4IO8A 3JS6A 4YDUA 4BGAA 1T44A 2WUSA 4B1VA 4EIAA 4FSVA 4BR5A 5AZJA 1QQMA 4FL9A 2J4RA 4HTLA 4ISEA 2UYTA 3C7NA 2P9NB 1J6ZA 4H0OA 3R9PA 4GNIA 1MA9B 4ISFA 1GLEG 2P9IB 3VEZA 3H45C 4BRMA 3CJBA 4A2AA 3AAQA 4O8KA 4BRKA 1ZC6A 2V52B 2ZGYA 1G99A 1OKJA 3HTVA 1D4XA 4A61A 3O8MA 3HM8A 4XH4A 3U4LA 3M3ZA 4BG9A 5CE3A 3ZEUB 3UE5A 1GLFO 4K25A 3QDKA 1ESVA 3O08A 3AAPA 3LM9A 3VOVA 2P9NA 3KVGA 4FWMA 2Q0UA 2QW9A 4BC2A 2P9IA 1HUXA 2F9TA 3WEEB 3WXLA 5EXWA 1YUWA 1NGCA 2A40A 3EL2A 4CBUA 3R8EA 3VGMA 3SJHA 5AQSA 2F9WA 3EO3A 3EN9A 4JNEA 2E1ZA 3ZEUA 1GLAG 4CZIA 2ITMA 1XUPO 2PAVA 1V4SA 1GLCG 3RSEA 2EWSA 3CHWA 4NB4A 1NGGA 4H0TB 1ATRA 3O4WA 3QBWA 4FWPA 3DWLA 2E2NA 4JHDB 2IVPA 4H0PA 4RWTA 5LY3A 1RDWX 2YI1A 3CETA 5E26A 1YVNA 4FWQA 5BREA 3WEEA 1BA1A 3FZMA 5I9EB 4B1YB 2ASMA 1S3XA 3IFRA 5ADXA 3CJ9A 1JCEA 4PL8A 1LOTB 4H5WA 3O80A 4BRCA 2Q97A 1IJJA 2D0PA 3I8BA 4Y0WA 5BRFA 3KZBA 1WOQA 1LCUA 3KHYA 1HKBA 3ENHA 3FLCO 5BN8A 4XEIA 2FF3B 2Q31A 4BRFA 4IJAA 2H3GX 3BF1A 4PKHA 2FXUA 4BR2A 2QM1A 4JHDA 3AY9A 4I6MB 3VEVA 3FZFA 3FFKB 5AQYA 4B9QA 1T6DA 5FPDA 3DXKB 3SMSA 4QS7A 3ZX3A 2IVOA 3U9ZA 1Q18A 2GTDA 2ZWHA 1YXQA 5AQUA 4BQLA 2BTFA 2CGKA 1NGBA 3BP8A 4PKIA 4FWSA 2NZTA 5EOYA 2QWRA 5AQNA 3ENOA 2YHXA 4DQ8A 2P9UB 2DPNA 3CERA 3O6WA 1U6ZA 4H0XB 3VF6A 4BVPA 5BN9A 1Y64A 4BRNA 2FLOA 5AQKA 1BA0A 3W3DA 1SAZA 2HF3A 3WXJA 3A5OC 5BPLA 1TYQB 4CI6A 2AA4A 4BROA 4B1XB 4WQ5C 3MN9A 3LDQA 1T6CA 2Q36A 3D2EB 1NWKA 2YHWA 4IXCA 3FR0A 4JAXA 3VESA 3CQXA 2QWQA 4MLEA 4LC9B 3QMLA 4CZKA 2GWJA 3QB0A 2QXLA 5AQXA 2CGLA 4BRQA 2PBDA 2YHYA 3GG4A 5AQRA 2P9UA 4MLHA 5ELZA 3ID8A 1NM1A 1ATSA 1BWFO 2A42A 2ASPA 2VYPA 2GWKA 2P9LA 3ZX2A 1XQSC 4CD3A 2QWOA 5TKYA 5AQMA 3SMPA 1MWMA 3D2EA 1KAXA 3CJ1A 5EY4A 1E4GT 3J8AA 4CZLA 1QHAA 2E8AA 4ISGA 4DCHA 2QWLA 3WXKA 5AQFA 4BRGA 1DEJA 3O1BA 2HMPA 2OANA 1U2VB 2VWBA 2ZF5O 3CJ7A 3A5MC 5EX5A 3A8YA 1KXPA 5AFUH 4IJNA 3TPQA 4WYBA 5FPMA 4M63C 4AM6A 3H46O 1HKGA 3H3NO 4FOIA 3VETA 3M6GA 4WQ4A 1QZ5A 5F2RA 5BRHA 4BVOA 2A5XA 4BR4A 1QQNA 3TU5A 5AQJA 1RGIA 1X9JA 5BR9A 3ULEB 5E84A 2V7ZA 3BF3A 1NGFA 3P4IA 3WXIA 3FZHA 5AFUA 4CBWA 2CH6A 5AQWA 2E20A 1X3MA 3U9DA 1RFQA 1YAGA 3VGLA 4BGBA 4E1JA 1BDGA 3CI5A 3CJAA 1U2VA 3H3OB 3LDLA 2YCHA 3LM2A 1NMDA 1P8ZA 1NGAA 4K42A 2A3ZA 1BUPA 2CGJA 2ZGZA 3CQYA 4BG8A 3VF4A 3D2FB 5JMVA 2D1KA 1MWKA 3ULEA 3CJCA 3FGUA 2FSJA 4EAHD 4QS9A 2A6AA 3A5NC 1HJOA 4A62A 1SQKA 2GELA 5BPMA 4YDUC 3BUZB 4J8FA 3DJCA 3BEXA 5AZIB 3AARA 4PL7A 1BOTO 4BRLA 4CBXA 4BRHA 4BRPA 1H1VA 5AQVA 4NO7A 3O5BA 2V51B 1GLJO 3R6MA 3HBTA 4CD1A 1KAZA 3F9MA 2GEMA 3VPZA 2E2OA 1EQYA 3D2FA 1K8KB 3MN6A 2I7NA 1Z05A 4B1WB 3WQUA 4BRAA 4HWIA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FC0A 1HPMA 3UKUB 4KI6A 3SQ2A 1HNWK 1NGEA 3OYFA 5AZIA 1NOYA 4MQ3A 1C1BA 5KRTA 4OO1J 4C8OA 2ZM6K 2X6NA 1C6VA 2F4VK 4RW9A 1GOAA 2IS3A 4FWKA 3I8DA 4KHWA 3S3NA 4CFCA 4KPYA 3K5NA 2NRRA 3C7NB 4K41A 4CEFA 1MDUB 2BE2A 1EETA 1K6YA 4O5FA 4RW7A 5KPTA 3ATVA 1GLDG 1MU2A 3UKUA 5SWMA 3TAGA 2P9SB 3B8AX 1CZBA 3ITHA 3J80O 4CJRA 4G9ZA 4DB3A 4DSKA 3EZ5A 1DGKN 4NXMK 5BRDA 1R59O 5AQHA 4CESA 1EWRA 1E3MA 3IKMA 4OPJA 3WQTA 4RG8A 4BR0A 5J2MA 3S9HA 1KFDA 1HQUA 1BIZA 3I0RA 4N56A 3DRPA 1QE1A 4M7YA 2QXFA 1VK0A 4IOXA 4IEEA 5J2QA 4Y1DA 2P9SA 2OPQA 5FLXO 4FJMA 4RCHA 4JI1K 1VAZA 3GBTA 1BO5O 1VRTA 2ZJRL 5JLFA 4X66K 4JS4A 2ZJQL 4DFMA 4EHTA 4KI4A 3DI6A 4OGEA 1ZXOA 4DQPA 3SI6A 3DLEA 1VSIA 3AVGA 3TSUA 4BR9A 1ASWA 2HMIA 4H5NA 3HZ6A 1C0FA 4PQUA 2QEXN 4B3SK 1KVCA 3I55N 3LP2A 3V9SA 1RT5A 5LMUK 5F0XA 3HM9A 2IIRA 2W41A 3ENBA 1L3SA 1QQOA 3VQ6A 4BRIA 4KBOA 4JN4A 1YJNN 3PO4A 4DFJA 3UKRB 2O8FB 3LDSA 4FPAA 3KK1A 3PO5A 5AQZA 3F5TA 4E89A 3G6EN 2D0CA 1NKEA 1JL2A 3RVCA 4CK2A 1VQON 4DV4K 2LSNA 2P1JA 2VQFK 4JKDA 2FBVA 4CGJA 1NGDA 2Z1GA 4YOVA 4M7XA 2HHUA 5AQGA 1RT7A 2E2QA 3P38A 3HVTA 5BPNA 3VQPA 2IDOA 1C1CA 2IVNA 1S6PA 1KFSA 1NGJA 3UKRA 1I94K 2O8FA 3HSCA 4DTNA 4CHNA 3TAEA 4FLZA 3C6AA 3OYJA 4J2DA 3QETA 1S5JA 4B1UB 3PSFA 4JS5A 2IC3A 4B8CA 3BGRA 3IUCA 2AP1A 4B1ZA 4CZGA 3HI0A 2BANA 3U8XA 4RTFD 3HT3A 1DKGD 4IO9L 4OPKA 4BQZA 4LH4A 4M3TA 3CXCM 1K8KA 4H5TA 3SUQA 4FWNA 4LF5K 4EFHA 4WQ4C 4L3QA 1L3VA 3MXJA 5HOOA 3LANA 3KK3A 4DU3A 1EP4A 2W42A 2E6LA 2EHGA 3CC7N 3OHRA 4C1NK 3VQAA 1WBBA 4EIAA 2HHVA 4BR5A 2O8EA 4CW7B 3SZ2A 1J53A 4FL9A 4LY7A 3PX0A 2XY5A 1KRPA 3CCMN 4HTLA 4X65K 4JK9A 4CF9A 4ISEA 2UYTA 3TI0A 1R0AA 1EKEA 1Z26A 1J6ZA 2P9NB 3AA3A 3M8SA 1SKWA 2UU9K 2X74A 1GLEG 3M8PA 2QA4N 3O3HA 3NDKA 3AA4A 3H45C 4BRMA 4FCYA 5I42A 1YTAA 4L8RB 3HTVA 3PX4A 2BH1A 1NK5A 4ILJA 4QAGA 3O8MA 3U4LA 3SQ1A 1REVA 4BG9A 4R5PA 3ZEUB 2IAJA 1GLFO 4F2SA 5M1PA 1N32K 4OKJA 2XRIA 1U04A 1BI4B 4HTUA 4GVEA 4B8AB 2WONA 3VOVA 2P9NA 3U6FA 5FRNA 4F8RA 4X64K 5J2NA 3A2FA 4GKKK 4IDHA 5DK5A 2F9TA 3SPYA 5EXWA 1YUWA 1NGCA 3B6OA 1VHXA 2XY6A 3T69A 4E7KA 3VGMA 5AQSA 4FLTA 4KH5A 2KKZA 3ZEUA 4CZIA 4CJ3A 2ITMA 2PAVA 1GLCG 1BI4A 1NK6A 3VMFB 2YNHA 3O4WA 3DWLA 4BE0A 2P5OA 1FKOA 4JHDB 1XNRK 1RDWX 1FKPA 1HNZK 4B1YB 2ASMA 4KHYA 4FJKA 3JYTA 2HBKA 4E0DA 3O80A 4BRCA 3BY5A 4IBNA 4QOZB 3CCRN 4LFAK 1HKBA 4F2RA 1ILYA 1VRUA 2A1RA 4XEIA 5TKWA 2FF3B 4JKGB 3QESA 2FBTA 2H3GX 3BF1A 4FXDA 1RT2A 4JHDA 1QSSA 4I6MB 4M3RA 3ZSWA 4IG3A 4B9QA 1C0TA 3E9LA 3SMSA 4YNQA 3DMJA 1KLMA 2ZWHA 3VQBA 1YT3A 1N34K 2HBLA 4DTXA 2DY4A 3ZSQA 2CGKA 4CJSA 1N5YA 4YOTA 4HCBA 4DSLA 3SCXA 4FWSA 2NZTA 1U45A 5EOYA 1TVRA 4FJIA 1N33K 4M45A 4DQ8A 2YHXA 3RMBA 1VQPN 4H0XB 1RDBA 5BN9A 1NKCA 3CMEN 2FLOA 5AQKA 1VSDA 3OYNA 1RT1A 3A5OC 1SL0A 2AA4A 4BROA 4B3MK 3HP9A 3MN9A 2VQEK 5MLCQ 3O9RA 3RTVA 3LPTA 4LSLA 3VQQA 3VESA 2QWQA 4E3SA 2GWJA 2XY8A 3QB0A 2QKBA 4PY5A 3K5OA 3ISNC 4MLHA 1J9AA 4H4OA 1W0HA 5GAHP 1BQNA 5J2PA 2VYPA 1YHQN 3ZX2A 4DR7K 5BR8K 4FJLA 1XQSC 4CD3A 4YFUA 1S1VA 1TV6A 1TKZA 4JKBA 4OLBA 3P1GA 3MCAB 2OTLN 4DS5A 2RKIA 4HHTA 3AVFA 1QHAA 4KTWA 4DCHA 5AQFA 4WE1A 4FVMA 2HMPA 2ZF5O 1KXPA 1HYZA 4IJNA 5FPMA 4M63C 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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