4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
1NBWA 4B1UB 3ENHA 4FWOA 4JD2B 4BRNA 1GLEG 2E1ZA 4MLEA 5AQUA 4IO8A 3LM9A 1HKGA 3FZLA 5EY4A 3HBTA 4A62A 3FZMA 3O1WA 4DHYA 1U6ZA 1GLDG 1HX1A 3VGLA 1ZBSA 2QWOA 3O08A 3M6GA 3D2FA 4PL7A 1E4GT 1BA0A 5F1XA 1MWKA 1S3XA 2Q0RA 3CIPA 3UKRA 4BRMA 2BUPA 2E2QA 3O80A 4CI6A 1K8KB 3VGMA 4BRAA 1ATNA 1SZ2A 4FWLA 3HZ6A 1HJOA 2PBDA 2YI1A 3H1QA 4K41A 1NGJA 3CQXA 5BREA 1S22A 5CE3A 1T6DA 3FFKB 4FPAA 2QWMA 4BRFA 3U4LA 5I9EB 1NLVA 3BUZB 1NGDA 1NGCA 5BPMA 1IJJA 5AQXA 3SJHA 5KPRA 3DWLA 3ID8A 3H45C 2ZGYA 3WT0A 3EN9A 4H0PA 3AARA 4CBXA 2J4RA 1GLAG 5BRDA 3WUHA 4FO0A 1NGAA 5AQPA 3UKUB 1QQNA 2Q0UA 4RTFD 3ZEUA 1NGBA 3CJ1A 5AZJA 1SQKA 3LM2A 2D0PA 3VOVA 1YVNA 4BGBA 1IG8A 2Q97A 4BREA 3HSCA 2P9LA 3QB0A 1TUUA 3DXMA 3CHWA 4H5TA 4DCHA 3KZBA 4CZHA 2P9KA 4CD3A 1ATSA 1XC3A 4IZ9A 5ADXA 3A5LC 3MMVA 2IIRA 4GY2B 5FPMA 3ULEA 1JCFA 3W3DA 3BP8A 3U9ZA 1QQOA 4FWSA 4M7XA 4HWIA 5AQSA 3EKSA 2CGKA 4CJ7A 2QWPA 3CERA 1R59O 2PAVA 4J8FA 3A5NC 3MCPA 2GELA 2QXLA 4BC2A 1NGEA 3TU5A 1YAGA 1GLCG 2YHXA 1BOTO 4JD2A 3EL2A 3UE5A 4FWRA 4ISFA 1KAXA 2E88A 2GWJA 4FWNA 3WEEA 3A0IX 4JNEA 1YUWA 2HF3A 3AAQA 4BC4A 5EXWA 1X9JA 3LDOA 5AQYA 5ADXH 4QS8A 2VWBA 4CBWA 1WOQA 1HUXA 4MO4A 5E26A 1NGGA 4K43A 4RCHA 4BQZA 2FXUA 1K8KA 1CZAN 3O8MA 3BEXA 3O5BA 5AZIB 4IWVA 2ASOA 5F2RA 1Y64A 1GLLO 2HMPA 3JS6A 2ZF5O 3RSEA 2A3ZA 2E1YA 1MDUB 4WQ5C 3HTVA 4EHTA 3VESA 2FSJA 3A5MC 2A42A 3CJ7A 4XH4A 1JCGA 4BGAA 1QZ5A 2H3GX 3GG4A 4EHUA 4O8KA 4I6MA 2KHOA 2I7NA 2CH6A 3ATUA 2E20A 2E8AA 3U8XA 4BG9A 2HOEA 5KQDA 2YJEA 2FF3B 1NGIA 4AM6A 4C23A 4EFHA 4L3QA 2NZTA 4B1YB 4CZLA 2E2OA 2A40A 3A5OC 3D2EA 4HTLA 4BRLA 3W0LA 4BR4A 3SMPA 3U9DA 3UKUA 4QS7A 1WUAA 1RGIA 4DQ8A 2Q2RA 1TYQB 3FLCO 3WXJA 4BRIA 2QWQA 3SMSA 3SK3A 1HPMA 2A5XA 4IJNA 5AQIA 5BPNA 3VF4A 3QBXA 5JICA 4RWTA 4A2AA 4B1XB 4BR9A 4PKGA 2P9NB 2GEMA 2YJFA 1NMDA 2GWKA 3VGKA 3SLCA 3LDLA 4BR7A 3MN7A 3AAPA 4BRHA 2ZGZA 4JHDB 1GLFO 5AQKA 5BN9A 5EVZA 3KHYA 4Y0WA 1Z6RA 4FWPA 3H1VX 4BR2A 3MDQA 3L4IA 4CBUA 4LC9B 5BN8A 4H5WA 4WQ5A 3FZHA 3F9MA 4BRDA 4H0OA 2QWRA 4WQ4A 3QFUA 1EQYA 1MWMA 1G99A 2UYTA 2Q31A 4IJAA 2F9TA 4MLHA 4XH5A 2EWSA 5AQQA 2FSKA 3WXIA 2D0OA 1BWFO 2P9UB 1BA1A 2NLXA 2QM1A 5AZIA 1P8ZA 3ZETB 2YCHA 1C0GA 3WXLA 4CZEA 1D4XA 3CJAA 3LL3A 3I33A 3H6EA 3HM8A 3MN5A 2F9WA 3O1BA 1NM1A 2P9PB 5AFUA 4E1JA 1U2VB 2A41A 2ASMA 3QMLA 2BTFA 4Z94A 4FOIA 5AQMA 4M63C 4NO7A 1QQMA 3C7NB 3FZFA 3H3NO 5AQLA 2P9IB 1ZXOA 3TPQA 4FWKA 4BR5A 3BF3A 3FGUA 5AQOA 2D4WA 2AA4A 1BDGA 3LDPA 3ZX3A 3CJBA 4BROA 4BRKA 1NWKA 4B1VA 3VETA 3H3OB 4BRGA 1NGHA 3O4WA 1TYQA 3GL1A 3KVGA 3QFPA 5AR0A 1T6CA 4MO5A 4H0VB 3FR0A 4ISGA 3GBTA 3G25A 5AQVA 3GE1A 1MA9B 3L0QA 2P9NA 5AFUH 3S41A 3WQUA 3VEYA 5JMVA 4CZKA 5KPTA 1LCUA 4B1ZA 4PKIA 4YDUC 1H1VA 4FSVA 4WQ4C 3LDQA 4GNIA 2IVPA 1ZC6A 3IMXA 1Q18A 3J8AA 4CZFA 5BRHA 1V4SA 5JLFA 4JHDA 2W41A 5F0XA 2P9LB 2ZWHA 2P9KB 2D1KA 3ULEB 3ZX0A 3VENA 2ASPA 3VEVA 5TKYA 3VF6A 2V51B 3ENOA 4CZJA 2Q36A 2VYPA 3MK6A 5FPEA 3OHRA 1BU6O 3A8YA 3GDQA 4H0TB 1DGKN 4PL8A 5E84A 2NRHA 5AQTA 2P9UA 1BUPA 3CJCA 3CETA 3IUCA 1QZ6A 3WEEB 2QWLA 1JCEA 1OKJA 3ZETA 3AY9A 4BRCA 3I8BA 2GUPA 4BG8A 3ATVA 3CQYA 3QICA 4FOEA 2P9SB 1DEJA 2QW9A 2YHYA 3DXKB 2P9PA 4H0YB 4IXCA 4BR0A 4ISEA 2I7PA 5FPNA 1U2VA 2V52B 3QDKA 3B8AX 1QHAA 4M7YA 1C0FA 4FL9A 5BPLA 3DAWA 2HF4A 2QWNA 2YHWA 3C7NA 3RSEB 2P9IA 3WXKA 2FLOA 4KBOA 4QS9A 1HKBA 4FWQA 3WQTA 4YDUA 4PKHA 5AQGA 3VPZA 3EKUA 3VEWA 5JLHA 5LY3A 4I6MB 3VF2A 3BF1A 3ZX2A 2DPNA 2CGLA 5EOYA 3R9PA 4WYBA 4BQLA 1GLJO 3O6WA 2GTDA 5AQFA 4H03B 4CD1A 3IFRA 4H5RA 4CZGA 4BVOA 1ATRA 3D2EB 3JXUA 2WUSA 3D2FB 4BRPA 4FWMA 1NGFA 4BC3A 3UKRB 4A2BA 2OANA 5B8HA 3M1FA 2FF6A 3IDHA 3R6MA 2IVOA 5EX5A 3CJ9A 2W40A 1YXQA 5AQZA 5LJVA 3QBWA 4XH1A 1X3MA 5KPZA 4XEIA 5AQRA 3DJCA 3GOIA 5BR9A 1RDWX 1KXPA 2AP1A 4B1WB 3C0BA 4JAXA 5BRFA 2VCPA 1BO5O 5AQWA 4K42A 4FPBA 5AQJA 3FE1A 3D7EO 4K25A 1BG3A 1HLUA 3UB5A 3LDNA 3VEXA 4BRQA 3MN9A 1TUYA 1ESVA 5AQHA 3VEZA 1V4TA 2E2PA 1J6ZA 2E2NA 3CI5A 5FPDA 4JN4A 4NB4A 4O5FA 5LJWA 1GLBG 4H5VA 4B9QA 4DB3A 4CZIA 1KAZA 4A61A 4H5NA 1DKGD 5ELZA 3R8EA 3VEOA 3ZEUB 1KAYA 5AQNA 3VERA 4H0XB 5AZJB 2CGJA 1SAZA 1XUPO 1X3NA 2P9SA 4EIAA 2CH5A 4AM7A 3DXMB 3HI0A 1XQSC 4F9OA 3DXKA 1T44A 3MN6A 2Q1NA 4BC5A 2IVNA 1RFQA 1HKCA 3EO3A 1Z05A 2A6AA 2V7ZA 1E4FT 3H46O 5KQ8A 4EAHD 4CZMA 1LOTB 3L6QA 2ITMA 3P4IA 2V7YA 3EZWA 3FZKA 2FSNA 3M3ZA 4BVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLBA 4IOAL 1JLQA 3HM9A 4DQRA 5AQUA 4DV0K 3VQ5A 3D45A 1HRHA 4J2AA 4G9ZA 1BI4B 4A62A 3O1WA 2E4LA 3V6DA 3QLHA 4F3OA 1ZBSA 2DFHA 4DS5A 1K6YA 1E4GT 4FW1A 4A57A 3J81O 3OYCA 3M8RA 2VG5A 1BL3A 5JVGL 1HNVA 4CI6A 1K8KB 3AVNA 5MLCQ 2E6LA 2NRVA 3C6HA 1ATNA 4HUEA 4CCHA 2ZD1A 3HZ6A 4K41A 1NK6A 2VQFK 4OPAA 1S22A 3NE6A 1T6DA 1RT6A 1NG9A 3V81A 2QWMA 4X65K 5I9EB 3DLHA 1NGDA 4OPKA 3IG1A 4DR5K 5BPMA 2JGUA 3MEEA 3M5RA 1SKWA 2YX6A 3EN9A 5HRPA 3EE8A 3AARA 4WF9L 4CIFA 3QEIA 1BISA 3THXB 4CE9A 5HBMA 5AQPA 4E19A 2Q0UA 4IG3A 1NGBA 3L2WA 3CJ1A 3G6EN 4BGBA 3KIOA 4JKAA 1IG8A 4KTZA 1N6QA 4JKBA 3HSCA 4DTJA 2DY4A 1XC3A 3NGZA 1JCFA 3SYZA 2HHXA 4HWIA 3PX4A 2O8FA 3VA3A 3TANA 3PUFA 2VQEK 1B92A 5C24A 3TTFA 3DRSA 2QXLA 2D5RA 3EE9A 4AF1A 4FWRA 1KAXA 2PY5A 2E88A 2GWJA 1SS6A 3WEEA 3THYB 3NGIA 1RDCA 4BC4A 3HPGA 1B9DA 3TSPA 2VWBA 1WOQA 1HUXA 4KHYA 4MO4A 5E26A 4K43A 4RCHA 4FJLA 2HHTA 1RT5A 4LFCK 1IBMK 2VWKA 3O8MA 5AZIB 2ASOA 3V9SA 1XMOK 4FVMA 2OZMA 3VQ4A 2ZF5O 2A3ZA 4DR6K 1MDUB 3PX0A 3K5OA 4WQ5C 4C8OA 3HTVA 4N5SA 4MQ3A 4DTXA 5GAHP 3CCQN 1Q82O 2KHOA 1SKSA 2CH6A 3ATUA 3VQDA 2HOEA 5KQDA 3Q7CA 2KLAA 4DLGA 3FFIA 1KFDA 2WOMA 4CZLA 3O9TA 1RDDA 3LP2A 4JK9A 4DU4A 4Q5VA 2A40A 3A5OC 3D2EA 3HT3A 4HTLA 3W0LA 4BR4A 4QS7A 4CEOA 4B9UA 4LD0A 3FLCO 3WXJA 5K14A 3TTDA 2QWQA 3SK3A 3O4NA 1T7PA 4J2DA 3QBXA 3HXMA 2P9NB 3VTHA 2AJQA 1FW6A 3SLCA 4GVMA 3K0SA 3E9PA 3MN7A 3QEPA 2UXBK 4N56A 3TAFA 1A5WA 2ZGZA 2G8WA 1NK5A 4JHDB 4CGHA 1GLFO 3T1AA 4LF5K 1XWLA 1VQ5N 4DLEA 4DSIA 3TSUA 2P5GA 3CD6N 2WBNA 3ZSVA 1CZ9A 3KLHA 3THWB 4CBUA 4LC9B 4BRDA 1VQMN 2A1SA 1YHQN 4YOUA 3L2VA 1S1VA 1EQYA 1G99A 1Z25A 3I56N 4CEQA 2EWSA 3TTCA 2NRZA 3ZETB 1HYZA 2YCHA 3WXLA 3DLRA 3CJAA 2UXCK 1E3MA 4RG8A 4KPYA 3O1BA 5AFUA 4TSXA 4E1JA 3KWGA 2BTFA 4B8CA 4PY5A 1FKOA 1C1BA 3L2UA 4CJUA 4X64K 1YJ9N 4FWKA 5AQOA 2RN2A 3LAMA 3ZX3A 3F9KA 1RBRA 2O4GA 1NWKA 4BROA 2YNIA 3VETA 4BRGA 4CJWA 4XIUA 4ILHA 5SZTA 5AR0A 4X66K 4GKJK 2UU9K 2VG7A 4MO5A 4CJLA 5C15A 2OCEA 4H0VB 2DFFA 5GAEP 3SCXA 4IEIA 2HBMA 5AQVA 1KLNA 2NRTA 4FJ9A 3S3MA 3VQ6A 3P5JA 5KGXA 2W42A 3WQUA 4DQSA 3DLKA 1HPZA 5JMVA 2BH1A 4WQ4C 3NF7A 3IMXA 4GNIA 4OGCA 1Q18A 4CZFA 4G1QA 2W41A 1GOBA 4BWMA 2ZWHA 4FJKA 3VEVA 4FZZA 4CK3A 4CZJA 2VYPA 1HYSA 5FPEA 3A8YA 3GDQA 1GOAA 2OA8A 2IGIA 4PL8A 2ZJPL 4O0JA 2G8IA 5AQTA 2P9UA 2G8FA 4B9NA 4Y1CA 3JYTA 1J5EK 3PSIA 2HHUA 4KTQA 2Y1JA 3ATVA 2YKMA 2QKBA 1TGOA 1OH7A 1HNXK 1YI2N 4FOEA 2YNGA 4JEPA 4O8UA 3LANA 4A59A 1D8YA 1XNRK 1RBSA 2UXDK 4DR3K 1JLGA 3LALA 2P9PA 4H0YB 4BR0A 5FPNA 4ILGB 3TAMA 2HBLA 3DRPA 4FCYA 1C0FA 3OYKA 4QCLA 4KREA 4FL9A 5BPLA 4DFJA 3DAWA 2HF4A 3VQ9A 3WXKA 4FK2A 1HNIA 4QS9A 4CEEA 2HB5A 3ID6A 1VRUA 3CCJN 4CJFA 3AVIA 4RW6A 3VEWA 3MX2A 4HUFA 3VF2A 2XY6A 3BF1A 3ZX2A 2DPNA 1J9AA 3HPHA 3ULDA 3K5LA 4NLCA 1UA0A 4WYBA 4BQLA 1T05A 3SUNA 4H8KA 2B6AA 3KLIA 3CCUN 3IFRA 1NK8A 3T69A 1VQNN 3D2FB 1NK4A 5M1PA 4FWMA 3K5MA 1IV0A 3UKRB 5GIOA 5EX5A 4KHSA 5KPZA 4O44A 1X3MA 2JWLA 3C0BA 3ZSWA 4JAXA 2XRIA 4E7HA 3RVCA 4K42A 4FLWA 1EKEA 1ZYQA 4B3MK 3OS0A 4E7IA 1C0MA 4JRQA 3KK1A 4DF8A 5AQHA 3SV4A 1LW2A 2E2PA 4DSEA 1J6ZA 3AA4A 3CI5A 4U7BA 3KLEA 3E01A 4I2PA 1TV6A 3K57A 2JLEA 4O5FA 1GLBG 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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