4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
4BR7A 3SK3A 2NRHA 4Y0WA 3QMLA 4DHYA 1TUYA 3HI0A 5AQXA 3M3ZA 3QICA 4MO5A 3UKRA 3DXKB 3DXMA 2P9LA 5JLFA 2KHOA 4NB4A 4CZGA 2QWQA 5ELZA 1TUUA 3CJ7A 1J6ZA 4FWMA 3VEZA 5BPNA 5KPZA 1S22A 4BC4A 1KAXA 4FWPA 4MLHA 3HSCA 1Z6RA 3HTVA 3EKSA 5BRDA 3VEWA 5LY3A 3WEEA 5BRHA 1CZAN 4CBXA 2A40A 3O1BA 4BRAA 1ZXOA 3R6MA 4BRKA 3VF4A 3ULEA 5AFUH 4BRHA 4IZ9A 1JCFA 2E8AA 5AQQA 2V52B 2PBDA 3WXJA 2F9TA 5AQWA 4RWTA 4H5VA 3U8XA 3H46O 4CZKA 1H1VA 3VESA 4B1XB 1V4TA 4H5RA 1U2VA 3H6EA 3TU5A 2GUPA 1SAZA 5LJWA 1T6CA 4CZFA 3FLCO 3VPZA 5AFUA 2PAVA 2D0OA 1ATNA 2QM1A 3QB0A 3EO3A 3ZX0A 1DGKN 3FZHA 4ISGA 3QFPA 5AQMA 4FOEA 1NLVA 1TYQA 3IUCA 4DCHA 2YHYA 4BRGA 3VEXA 4H5NA 2BUPA 4QS8A 2YI1A 3LL3A 1GLDG 1YXQA 3H1VX 1HKBA 3IMXA 5E26A 2E2NA 3FZMA 3WQTA 1HKGA 1X3NA 2VYPA 3HM8A 4QS7A 1MDUB 3VF2A 1BOTO 3QFUA 1KAYA 4AM7A 4IJAA 3A8YA 4K25A 4FWLA 2Q31A 4CZIA 1KAZA 4PKIA 3DXKA 5LJVA 3VEYA 4O5FA 4O8KA 4JD2B 3VEVA 4QS9A 1P8ZA 5AQGA 3SLCA 4BR5A 4DB3A 4BRNA 5AQUA 3O08A 4FWQA 4LC9B 3AY9A 4IXCA 3ZEUB 3HBTA 4CBUA 1Q18A 2QWMA 3SJHA 4EHTA 4BROA 3FZLA 2FXUA 2QWPA 3LDQA 4XEIA 3A5NC 2V7ZA 3B8AX 3G25A 4I6MB 4CZEA 1ESVA 1RGIA 2D0PA 2P9KB 3M6GA 2V51B 3U9ZA 2CGJA 1U6ZA 2E2QA 3MK6A 4AM6A 4XH1A 5AQRA 5AQHA 4B1YB 2HOEA 5EY4A 3ATVA 3GBTA 3VGLA 1K8KB 4Z94A 3FGUA 2E20A 3UE5A 3HZ6A 1HJOA 2I7PA 5AQZA 4ISFA 3CQXA 2YHWA 2P9NB 4BRQA 4JN4A 5AQFA 3BF3A 1LOTB 4H0OA 3MN6A 1BO5O 3CJAA 1QQMA 2Q1NA 4CZMA 3WUHA 1NMDA 2CGKA 5FPNA 4K42A 2ZGYA 4M63C 3FE1A 5BPLA 3LM2A 3KHYA 1GLFO 2CGLA 3KZBA 2I7NA 1MWMA 4BRDA 5BRFA 3ZX3A 4NO7A 3I8BA 3EL2A 1NWKA 2QWRA 2E2OA 3CQYA 3H3NO 1BDGA 4M7XA 4CZHA 3QDKA 4BR0A 4IJNA 4PL7A 3ZETB 4CZJA 4H5WA 1SQKA 1HPMA 3BEXA 4H5TA 2FSJA 5FPMA 1SZ2A 3H3OB 2ZGZA 2P9SB 2P9PB 5KPRA 4JD2A 5AQJA 3SMSA 4FWNA 3BUZB 4GY2B 3I33A 3ID8A 4B9QA 3M1FA 5AQKA 5AQPA 1HKCA 3TPQA 4FO0A 5BPMA 1NGDA 4PL8A 3FFKB 5AQVA 3SMPA 1MA9B 1GLEG 1NBWA 1T6DA 3VGKA 4CZLA 4DQ8A 4E1JA 1D4XA 2IIRA 2P9IB 5BR9A 1NGCA 4IO8A 5BN9A 4I6MA 3WXKA 4XH4A 3JS6A 3LDNA 4BRFA 1X9JA 1QQOA 2P9KA 3R8EA 3FZFA 2UYTA 5JMVA 3CHWA 1YVNA 3QBXA 2IVNA 4HTLA 3WXIA 2QWOA 3CJ1A 2FSKA 2QWNA 3OHRA 1K8KA 3FZKA 2YJEA 3IFRA 2ITMA 4A62A 2GELA 5AQTA 5KPTA 4BR2A 5TKYA 3DXMB 1C0GA 2P9NA 4H0TB 3UKUB 4WQ4C 1GLJO 5EVZA 4WQ4A 2ZWHA 3MN7A 3VOVA 3CI5A 4PKHA 4BGAA 4M7YA 2HMPA 3L6QA 5FPEA 1S3XA 3BP8A 4MLEA 4BVOA 5BREA 2Q0RA 4A61A 5JLHA 4BRIA 2YJFA 3O4WA 2GTDA 2P9UB 3VETA 3D2EB 1QHAA 4FWOA 4BRLA 4K43A 4CD1A 1C0FA 2VWBA 3J8AA 1XQSC 2Q2RA 4H0XB 4ISEA 4JNEA 1ATRA 4BVPA 4BG8A 2IVOA 3RSEB 1HUXA 3AAQA 1MWKA 3A5LC 1DEJA 3DWLA 3UB5A 3U9DA 3D2FB 2QW9A 1IG8A 3O80A 2GWJA 3MDQA 3ZETA 3CERA 4H03B 1X3MA 5AR0A 3GL1A 1BA0A 1EQYA 2A3ZA 5B8HA 1ZC6A 2P9SA 2A42A 4BQLA 2WUSA 4YDUC 3AARA 3CJCA 4JHDB 1GLCG 4EFHA 4JAXA 4YDUA 1NGHA 3ZX2A 5F2RA 2YHXA 1NGEA 4J8FA 5AQOA 3P4IA 1WOQA 1RFQA 3O8MA 5KQDA 2ASMA 2P9IA 3DJCA 2ZF5O 1NGJA 4A2AA 5I9EB 1JCGA 2NLXA 2F9WA 2E1YA 5AZJB 3MN9A 2QXLA 1DKGD 3W0LA 4B1VA 2A41A 3H45C 1ZBSA 5EOYA 1ATSA 3ENOA 4FPBA 5EX5A 5AQLA 3F9MA 3EN9A 4BC2A 1KXPA 4CD3A 3D7EO 2ASOA 4XH5A 3BF1A 2GEMA 3CJBA 1NGIA 5AQSA 2HF3A 3UKUA 1BUPA 2D1KA 1Y64A 1Z05A 2IVPA 3H1QA 2E2PA 5F0XA 2E1ZA 3LDPA 1G99A 5EXWA 5F1XA 4BRPA 4FL9A 2FSNA 1BWFO 5KQ8A 2A6AA 1E4GT 1LCUA 4FWSA 2W41A 3VERA 2P9UA 2H3GX 3D2EA 1NGFA 3A5OC 4IWVA 3A0IX 3CIPA 4BC3A 3ENHA 5JICA 4RTFD 3VENA 3LM9A 3C7NB 5AQNA 2FLOA 3ZEUA 4H0PA 5AZIB 2CH6A 3RSEA 1WUAA 4WQ5C 1XUPO 1JCEA 4WQ5A 3D2FA 1QQNA 3S41A 4A2BA 5FPDA 3MCPA 4BRMA 4K41A 4EIAA 3JXUA 4BRCA 4FPAA 1NGAA 4BC5A 1BU6O 2EWSA 1GLAG 2AP1A 4KBOA 4GNIA 2D4WA 3ATUA 2Q36A 4JHDA 4C23A 3MMVA 3UKRB 1RDWX 2W40A 1YUWA 2P9LB 3CJ9A 3KVGA 1V4SA 3L0QA 3L4IA 4BG9A 4BR9A 5CE3A 3VF6A 4PKGA 2V7YA 3LDOA 3EKUA 4FSVA 4MO4A 4CJ7A 2DPNA 3R9PA 4EHUA 2J4RA 3O5BA 2A5XA 5E84A 1GLBG 3VEOA 4F9OA 5AZJA 3WEEB 3GDQA 3WT0A 1HX1A 3GG4A 2HF4A 4BGBA 3ULEB 3GOIA 1GLLO 2BTFA 3CETA 4B1WB 4FWRA 5AQYA 1U2VB 2FF6A 4FWKA 3LDLA 4FOIA 5ADXH 3WQUA 1NGGA 2VCPA 3QBWA 3U4LA 3EZWA 3WXLA 1QZ5A 2Q0UA 1HLUA 4RCHA 4BR4A 3FR0A 2P9PA 4WYBA 2CH5A 1BA1A 4CI6A 1NGBA 3VGMA 3O6WA 4B1ZA 4BREA 2FF3B 1E4FT 1XC3A 2OANA 1OKJA 2ASPA 3O1WA 3GE1A 1TYQB 1R59O 2Q97A 3C0BA 3C7NA 5BN8A 1NM1A 4L3QA 3W3DA 5ADXA 3A5MC 5AZIA 3IDHA 3DAWA 1YAGA 2NZTA 2AA4A 4CBWA 3AAPA 4HWIA 4B1UB 4H0VB 2GWKA 4H0YB 1BG3A 2YCHA 1IJJA 1QZ6A 1T44A 5AQIA 4BQZA 4EAHD 2E88A 3MN5A 2QWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SK3A 5CZ2A 3QO9A 4Y0WA 3D45A 4DHYA 3HI0A 3M3ZA 3AVIA 1U45A 4B8CA 4FZZA 4GKKK 4KHPK 3DXMA 3I55N 2KHOA 5SWMA 3N4QA 4HCBA 1J6ZA 3ULDA 5BPNA 3NAEA 4CHYA 1LWCA 3OJUA 1TVRA 3VEWA 1TAUA 5BRHA 4CBXA 3WXMB 4DSIA 3O1BA 4BRAA 4BRKA 4IFVA 3ULEA 3TSPA 4DLGA 4IZ9A 1JCFA 1VK0A 3O4QA 2PBDA 5AQWA 1QE1A 3U8XA 3Q7BA 2FBXA 4PUOA 4CERA 3SUOA 5H1SQ 1NG9A 4BACA 3QETA 4CJWA 1NK7A 4CZFA 3FLCO 3VQ6A 3K5LA 3VPZA 2PAVA 3LANA 3V81A 3QB0A 3EO3A 3DLEA 3LZJA 4ISGA 4FLUA 3PO5A 5IWAK 1U4BA 4HUFA 5AQMA 4CJEA 4DFJA 1T05A 3IUCA 4B9UA 3VEXA 4H5NA 3VQDA 4DTUA 4X64K 1VSEA 4FVUA 4KH5A 1HQEA 4CJVA 5C42A 3PV8A 2OZMA 4K8ZA 1NJYA 1HNIA 3WQTA 3AO5A 4DG1A 2VYPA 4QS7A 3VQ9A 5TKWA 3VF2A 1BOTO 3CXCM 4CF8A 3HXMA 1FKOA 1BI4B 2Q31A 3P83D 3J81O 4M3TA 3U3YA 4QS9A 3SLCA 4DB3A 4BRNA 3RMCA 4Z4EA 2QEXN 5CR4A 4C8LA 3ZEUB 4FK0A 3RRHA 2GUIA 4OLAA 3LWLA 4BROA 3O9RA 2QWPA 3O3FA 3B8AX 4L8RB 4CHOA 1RGIA 4FK2A 3RVCA 1D9DA 4YOTA 2XHBA 4AM6A 1EETA 3K0SA 2HOEA 3ATVA 3GBTA 4OO1J 2E20A 3UE5A 1YTUA 4LFBK 3S3OA 1VQ9N 3NBPA 4BRQA 4W5OA 5KTQA 2KFZA 3I8DA 3BF3A 1R0AA 1BO5O 3CC7N 3CJAA 1IBKK 4CZMA 3VMFB 4CHNA 4W5RA 4OVLA 3LZIA 2YNFA 4BE0A 1EX4A 3K59A 3FE1A 4BWJA 1U49A 5BPLA 3LM2A 3KHYA 2BH1A 3BGRA 3AVCA 4AHVA 2CGLA 4N56A 4CEDA 3I8BA 4DWIA 4NYNA 2QWRA 5HRPA 5E41A 1RTIA 3SQ0A 1Q81O 4H5WA 4FLTA 4GV6A 3IG1A 3BEXA 3QERA 4GV9A 4H5TA 3BZKA 1SZ2A 4F2RA 2RPIA 2E4LA 5C2FA 3CCQN 1KD1O 5HBMA 4M42A 2ZJQL 3ID8A 4HUEA 4B9QA 1VSHA 1KCFA 3OYLA 4E1NA 4CJ3A 2O8DB 3ZT2A 3HOTA 1TK0A 1KFSA 1N8RO 4LFCK 4IO8A 2O8FB 4XH4A 3JS6A 3LDNA 3SCXA 2P9KA 5JVHL 3FZFA 1KLMA 1LW0A 1K8AO 2VGMA 3KD5E 2G8KA 4ELTA 1REVA 2NNWA 3OHRA 4JI2K 2ITMA 2UXDK 4E19A 4MDAA 5AQTA 5TKYA 3TABA 2P9NA 3ISNC 1A5WA 3MN7A 4CHPA 3VOVA 2VG5A 3CI5A 1JXBA 4M7YA 2HMPA 5GAEP 4WFAL 5FPEA 1S3XA 4I7FA 4DR2K 5JLHA 4A61A 4BRIA 3NH1A 3VA3A 4CFDA 2GTDA 2P9UB 2YKNA 4Z0UA 3VETA 4FLWA 4JV5K 4KHNA 1TGOA 4BDZA 2ATQA 3NHGA 1VRUA 2YV0X 3RMAA 3RSEB 2HHSA 3A5LC 1MWKA 3DWLA 3UB5A 3PUFA 1LAWA 1TV6A 4JI6K 1YHQN 4UY8O 3NF8A 1QQCA 3CERA 4H03B 1NK6A 3NH0A 2YKMA 4FM2A 1IG9A 2OPPA 1M90O 2P9SA 4CEBA 3ZT3A 3E01A 5C12A 4BQLA 1XHZA 4DR7K 3V1QA 4CW7B 3PLAA 1GLCG 4YDUA 4FW1A 1W97L 5F2RA 1VAZA 4OPJA 2IAJA 4J8FA 1DTTA 1X9WA 1JXEA 3O8MA 3O9QA 4IFYA 3T7ZA 4DMNA 5HOOA 4NCGA 2ASMA 3C6TA 1BCOA 3RR8A 4QCLA 3THVA 4CEZA 1IO2A 3CD6N 1RDAA 3C65A 2QA4N 3W0LA 2A41A 2O8BB 3H45C 1ZBSA 3TTDA 1ATSA 4KFBA 3VQ7A 4O4GA 3CCEN 1ZBUA 4BC2A 1KXPA 2Y1IA 4DR4K 4CEAA 3L3VA 4DSLA 5AQSA 3K9KA 5HRRA 1OVYA 4DSFA 5CY4A 4B8AB 2ZQBA 2E2PA 1YIJN 2BGGA 4MQ3A 1G99A 2OCEA 2WC9A 3HM9A 2FSNA 4M3YA 1KVCA 1E4GT 1NJWA 3VERA 3CPWM 3F2KA 1O1WA 3M8RA 1Q82O 3CIPA 4BC3A 3ZEUA 2Z1IA 5AQNA 1NK5A 2FLOA 4FJIA 1RILA 4RW4A 4PY5A 4DV3K 1IKXA 3G71N 3DI6A 5J2MA 5M1OA 3D2FA 4KREA 1QSYA 1DT9A 4A2BA 5FPDA 4LF4K 4K41A 4NLCA 3SZ2A 1OH6A 5A2QO 4GKJK 2XY5A 4JKDA 3O9SA 4BC5A 3S3MA 3MEDA 3QNNA 2VG7A 1YF5L 4GNIA 2FBVA 3ATUA 4JHDA 4H4MA 4C8MA 1Q7YO 1YUWA 3L0QA 4CF1A 4BR9A 2KFNA 3KLGA 1IKWA 2B5JA 4OPAA 4DR3K 2JGUA 3CM5A 2QTDA 1XNRK 1QVGM 3EKUA 4FSVA 2DPNA 1Q9XA 4EHUA 1JL2A 1I3AA 4CFAA 3T3FA 4M3UA 3HP6A 1T03A 3PSFA 3TTCA 2HHQA 4JK7A 3ULEB 3IAYA 4KTWA 1GLLO 4DU4A 4KPYA 5C10A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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