4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
1Q18A 5LJWA 1X3MA 2D0PA 4H0OA 5AQRA 3EZWA 3VF4A 4H0VB 4BC3A 1HUXA 1KAZA 3FFKB 3R9PA 4BR5A 4H03B 4Y0WA 1E4FT 2E8AA 2E2QA 2CGKA 2QW9A 2P9SA 3FZKA 4RWTA 4O5FA 4CZKA 1NGEA 4MLEA 2UYTA 2EWSA 1NWKA 3GE1A 3VERA 3C0BA 4CZJA 5KPZA 2FLOA 1NGBA 4FWQA 2QWPA 1NMDA 3D2EA 4GY2B 1C0GA 4FOEA 3C7NB 1KAYA 3A5OC 4B1UB 3CJ7A 5AR0A 3DXKA 3O1BA 3FLCO 2CH6A 1ATNA 4MO4A 5AQMA 3GG4A 4IO8A 5JLFA 3EKSA 2V52B 5B8HA 4MO5A 1QZ6A 3L4IA 5BRDA 1TUUA 1MWMA 2BTFA 3M6GA 3QMLA 3A5NC 2P9NB 3H3OB 4BR2A 4B1WB 3FZMA 1HKBA 4EHTA 5LY3A 2PBDA 2ASPA 3WEEB 3BF3A 2A41A 3OHRA 3U9ZA 1QZ5A 4FWPA 3A0IX 3U9DA 2CH5A 3ULEB 5E26A 5AZIB 2P9IA 4CZMA 2QM1A 3CJBA 4BC4A 3P4IA 3CHWA 1V4SA 3ZX0A 5EXWA 2QWRA 4DHYA 3MN7A 5AZJA 3D7EO 4BG9A 3IMXA 1C0FA 3ZX2A 4WQ5A 3CJ1A 4CZFA 5AQNA 1Y64A 4CZHA 2IVPA 1BG3A 4BRPA 2P9SB 1U2VA 5BPLA 2E88A 1GLFO 3S41A 3GL1A 4H0PA 2GWKA 2E20A 4K41A 4FOIA 1GLBG 3VGMA 1HJOA 3H3NO 3O08A 3DXKB 2ZGZA 3ID8A 1HPMA 3UKUA 4HWIA 3BUZB 3LDLA 4CZEA 5F0XA 4H0YB 3A8YA 4K43A 2I7PA 1S3XA 3FZFA 1LOTB 4JNEA 2IVNA 3SJHA 3WUHA 3FGUA 3IDHA 2AA4A 4WQ4A 5AQTA 4ISGA 1G99A 5AQFA 4H0TB 3VPZA 3ATVA 4BRQA 2YHWA 3AARA 1DGKN 3A5MC 3QB0A 1R59O 4BRDA 2OANA 2QWNA 5AQLA 4BR4A 1GLLO 2QWLA 4BQZA 4BREA 3TPQA 3CQYA 4BRHA 3WEEA 4ISFA 5AZJB 5E84A 3DWLA 2YI1A 4K42A 3M3ZA 2YCHA 3VEYA 5BREA 1U2VB 3MDQA 3QDKA 1J6ZA 3QFUA 5ELZA 1JCGA 4WYBA 3CJ9A 1NGCA 4YDUA 3VOVA 3DXMA 4CZIA 1ZXOA 4BQLA 2CGLA 2FF6A 2HMPA 3O1WA 1TUYA 4FWKA 3FZLA 5AQKA 2P9LA 4FWRA 4A2AA 1JCFA 4MLHA 1NLVA 3UKUB 3WQTA 3EO3A 2HF4A 3MN9A 2P9UA 3WXKA 4Z94A 4IWVA 5AQQA 3J8AA 3L6QA 4BGBA 4F9OA 2VYPA 4B1XB 3HI0A 4H5TA 4JN4A 2J4RA 5AQOA 5AQVA 2FSNA 4IJNA 3L0QA 3VF6A 5JICA 2F9WA 1CZAN 1NGAA 3KHYA 1SAZA 1QQOA 3EL2A 5KQDA 3D2FA 4I6MB 3UKRB 3VEWA 4M7YA 1XC3A 3SMSA 1SQKA 1XUPO 3VEVA 1YAGA 2YHYA 3CETA 3FE1A 4BRCA 4L3QA 4RTFD 2IIRA 1TYQB 5JLHA 3HTVA 4BRNA 3CJCA 1XQSC 4BR9A 5AQWA 2ASOA 2D4WA 3ATUA 3WT0A 4H5VA 4IZ9A 5FPDA 1Z6RA 2Q0RA 1EQYA 2VWBA 5FPMA 5I9EB 5JMVA 3DXMB 2E1ZA 3LDNA 4WQ5C 2Q0UA 4BRLA 5AQZA 1BO5O 4JAXA 3IUCA 3HSCA 4H0XB 5KQ8A 2P9LB 4NB4A 4XH5A 3WXIA 5FPEA 4BRAA 1BA0A 2NLXA 1QHAA 2P9UB 1BWFO 5EY4A 5BRFA 5LJVA 2QWQA 2NZTA 2W41A 3BEXA 5F1XA 4B1VA 5F2RA 2GUPA 2I7NA 2GWJA 3AY9A 1T44A 2CGJA 4IJAA 3LDPA 2GTDA 1MDUB 4BRMA 1WUAA 2P9PA 3RSEA 3G25A 5KPTA 4AM6A 4RCHA 3CI5A 2NRHA 4PKHA 2YJFA 2QXLA 4NO7A 5AQGA 3WQUA 2V7YA 4BC5A 3O4WA 4EFHA 5TKYA 3D2FB 1BUPA 5FPNA 3CERA 1QQNA 4BR0A 2Q97A 4H5RA 4WQ4C 2E1YA 2E2PA 4PL7A 1ATSA 4A61A 2ITMA 2GELA 3FZHA 3VGKA 2FXUA 1NGDA 2DPNA 3HM8A 1JCEA 5BN9A 2D1KA 3SK3A 5CE3A 4FWLA 4CD1A 4I6MA 3UKRA 4FSVA 2E2OA 4AM7A 3ZX3A 3I8BA 5AQUA 4M7XA 1KAXA 2A6AA 1K8KA 1NM1A 1H1VA 3BF1A 1TYQA 4JHDA 3VEZA 2Q36A 4BROA 4YDUC 5AFUA 3QICA 1GLJO 5AQSA 1RFQA 4C23A 3HBTA 1IJJA 3O8MA 2ZGYA 3O80A 4BG8A 4A2BA 3U4LA 5KPRA 1OKJA 1NGIA 4BR7A 5BPNA 1BDGA 1HX1A 1U6ZA 4BVPA 1T6DA 5AQYA 4LC9B 3TU5A 1E4GT 2P9PB 3RSEB 3MN6A 5EOYA 3VF2A 4PKIA 3F9MA 3U8XA 5AQHA 5AFUH 3ZETA 1ZBSA 3A5LC 4HTLA 1HKCA 3ZEUA 1YUWA 3EN9A 3ENOA 4CZGA 1ESVA 2Q1NA 1NGGA 3LL3A 2V7ZA 1P8ZA 4CBWA 5ADXA 4ISEA 1HKGA 2VCPA 3DAWA 4FO0A 2V51B 3QFPA 4BRKA 4O8KA 3UE5A 3W0LA 5BR9A 2QWOA 2FSKA 4JD2A 4A62A 4DCHA 4FPAA 4GNIA 3UB5A 1SZ2A 4M63C 4J8FA 2P9KA 3MN5A 1K8KB 2WUSA 4BC2A 2GEMA 4BGAA 1WOQA 3MCPA 4JHDB 2A42A 2AP1A 4QS9A 5ADXH 5BN8A 5EVZA 4QS8A 3VETA 2H3GX 1BA1A 3M1FA 1NBWA 4BRIA 1NGFA 4BRGA 1QQMA 1NGHA 3R8EA 1KXPA 3LDOA 3JS6A 2E2NA 1DKGD 3AAQA 2YJEA 3WXJA 4QS7A 3KVGA 4E1JA 1YVNA 2YHXA 3ZETB 2A40A 3R6MA 4CBUA 4B1YB 5AQJA 3ZEUB 1DEJA 3JXUA 4IXCA 3AAPA 4CZLA 1RGIA 2QWMA 4CBXA 1S22A 1X3NA 3H46O 3KZBA 2BUPA 3H1QA 4XH1A 3VEOA 2KHOA 3CIPA 3IFRA 4CI6A 2IVOA 4JD2B 4FL9A 2A3ZA 3H1VX 1ZC6A 3HZ6A 3GBTA 3B8AX 4DB3A 2ZWHA 4FWNA 4KBOA 5AQPA 3LM9A 3VGLA 3QBWA 3VEXA 2A5XA 3H6EA 3VENA 1MA9B 2P9KB 4FWMA 4K25A 3I33A 3D2EB 3CJAA 1GLEG 3VESA 3MMVA 1MWKA 2D0OA 3SLCA 5BPMA 1T6CA 3O5BA 4DQ8A 4FWSA 3EKUA 4CJ7A 1V4TA 2HF3A 3BP8A 3MK6A 4FWOA 3W3DA 2W40A 4CD3A 3CQXA 1ATRA 3QBXA 1BOTO 4H5NA 1D4XA 5EX5A 1IG8A 3C7NA 3GOIA 1X9JA 4FPBA 3LM2A 4XEIA 1GLCG 5AQXA 3DJCA 5BRHA 2F9TA 2HOEA 3FR0A 3WXLA 3LDQA 2P9IB 1GLAG 1HLUA 2P9NA 2Q31A 4XH4A 2FF3B 2Q2RA 1GLDG 3SMPA 1RDWX 2PAVA 3H45C 1LCUA 3GDQA 2ZF5O 4PKGA 3ENHA 4EHUA 4B9QA 2ASMA 4H5WA 4EIAA 1Z05A 4PL8A 5AQIA 4BVOA 3ULEA 1BU6O 5AZIA 3O6WA 4B1ZA 1YXQA 4EAHD 2FSJA 4BRFA 1NGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ELVA 2D0PA 5AQRA 1C0MA 4Y1DA 3HPGA 4H0VB 2XY7A 4BR5A 4HUEA 1W97L 1MU2A 1E4FT 2E4LA 2E2QA 2CGKA 1KSPA 3MCAB 2F8SA 4O5FA 1WSFA 1VQPN 4LD0A 4DV4K 4CZJA 2HHXA 1WN7A 1VSDA 2FLOA 1NGBA 4IFYA 2QWPA 4CGIA 2G8VA 3DRPA 4M41A 3CJ7A 4N47A 4W5RA 1ATNA 4MO4A 4IO8A 3THXB 2V52B 5B8HA 5T7BA 4MO5A 1QZ6A 2KTQA 3V1QA 2KZMA 1CLQA 3AVNA 4YOYA 4ILJA 4WE1A 4BWJA 1TAUA 2HMIA 3U9DA 1S1VA 3KD1E 3I56N 2G8HA 3ID6A 3O9UA 4JEPA 5FRMA 2LSNA 3VQDA 3SUQA 4BC4A 4OGCA 3P4IA 5C25A 3CHWA 1KC8O 4KTQA 3ZX0A 5M1KA 1CZ9A 2RHKA 2G8FA 3NVMA 2P1JA 1T7PA 5EXWA 3LP1A 1L3TA 2VG5A 1C0FA 2D0CA 4JV5K 3VQEA 1WB9A 3QLHA 2D0AA 3QIOA 1HQEA 4CERA 3AVKA 2EX3A 4KHWA 4JI7K 3MWTA 4M3WA 5CR4A 2E20A 1YJWN 3NAEA 1A5XA 3H3NO 4FLUA 5KGXA 4CE9A 3ID8A 3UKUA 1T8EA 3RR8A 1N34K 4RG8A 3C6AA 2A1SA 3OYEA 3VA3A 4IOXA 2I7PA 2O4IA 2OZMA 3HRGA 3AA5X 4E89A 1BI4B 1LOTB 4JNEA 4LSNA 5GINA 1XMOK 3LP2A 1YI2N 5AQTA 1BQMA 4OO1J 2HBJA 4ISGA 1K6YA 1DGKN 1XC9A 2QEXN 5C15A 4BR4A 3V1OA 3VQCA 1HR0K 3TPQA 3CQYA 5DM7L 5AZJB 3KLEA 4DMNA 2HB5A 3ZYYX 4KI4A 2YCHA 3VEYA 5JS2A 3EEQA 1WSGA 1YTAA 5BREA 1JLCA 3QDKA 3KLGA 3QFUA 2IAJA 3RR7A 3PX4A 1OVQA 1TUYA 3FZLA 1JCFA 4IG0A 3OJSA 4KV8A 1D5AA 4CF8A 4DSEA 4LFAK 3EO3A 1X9WA 3V9XA 3WXKA 1GOAA 3O9TA 3RMBA 4X64K 4DFKA 1CXQA 4F9OA 3BY5A 4JN4A 3OYDA 3S3OA 4CEZA 3RRHA 3VF6A 1QE1A 2F9WA 1CZAN 1NGAA 3ZSXA 5FRNA 2BDPA 1SAZA 1UWBA 3UKRB 1T3VA 3P1GA 3SMSA 4C1NK 3L2RA 5HOOA 5AJ3K 3RMDA 4KB1A 1YAGA 4E7HA 1VSEA 3FE1A 4BRCA 1N32K 1HMVA 4L3QA 2VG6A 4GVEA 4GKKK 1IO2A 3TSPA 3HTVA 2FC0A 4BRNA 4ICLA 1XQSC 3BZCA 3AVLA 1S9GA 1RTIA 5LMUK 2VWBA 1SL1A 4M3ZA 3OYJA 3DXMB 4WQ5C 3LDNA 3RWUA 2Q3SA 1BO5O 2O4GA 3NFAA 4B3SK 3EE8A 4DTSA 3HSCA 5KQ8A 4NB4A 5FPEA 3WXIA 3VTHA 4BRAA 2Y1IA 1BL3A 4FJMA 1BA0A 1SL0A 1LAVA 4KB0A 5LMNK 1BWFO 3CCJN 3P83D 2QWQA 3T3FA 4A5AA 4B1VA 3OW2M 1TKXA 4FW1A 4CEOA 5F2RA 1RDCA 1VSFA 3AA2A 2I7NA 4FVUA 3OJUA 2CGJA 4YNQA 1RT5A 2GTDA 4BDPA 3DLEA 4JS5A 2P9PA 1LWFA 1U49A 4AM6A 3CM6A 3P31A 2YJFA 1JLAA 4BC5A 4DF4A 4FK0A 3O4WA 1W9HA 4CEAA 4ZTJA 4E19A 4XIUA 4LY7A 3ULDA 4AILC 3VQ8A 4A61A 2NUBA 4JI5K 3VQ6A 3DRSA 3FZHA 3VGKA 2VQEK 3L8BA 4DFPA 1R0AA 2D1KA 1P90A 5KGWA 3SK3A 3UKRA 3TARA 3NF9A 1XHZA 1KFSA 2OTJN 4FJ8A 3ZSVA 4AM7A 4Y1CA 5AQUA 4IOCL 1WSEA 3BDPA 2A6AA 1I39A 1K8KA 4CECA 3UIQA 2NRWA 2XY6A 4JI2K 1TK5A 4BROA 4OLBA 4CIGA 2D0BA 1GLJO 3QICA 1RFQA 3ALYA 1VQON 3CQ8A 4NLCA 4CHYA 3O8MA 3O80A 3SI6A 3LWLA 4A2BA 3AO1A 4DQSA 1SS6A 4BR7A 5BPNA 1BDGA 2G8WA 3SQ4A 4DS5A 1NJIO 3KD5E 5AQYA 3TU5A 5M1QA 5EOYA 1OH7A 5D3GA 2UUAK 3U8XA 5DK5A 3OS2A 5AQHA 5AFUH 3ZETA 1KTQA 1RDBA 1ZBIA 4CZGA 1ESVA 4FVMA 2HNDA 3ZSWA 4IO9L 4M45A 2QKKA 1B9DA 2Z1IA 1NK6A 2HBMA 3W0LA 2QWOA 2FSKA 4DCHA 4BE1A 5SWMA 3JSMA 2EHGA 4M42A 4FM0A 4BGAA 2NRVA 3CMAN 3QERA 1RT1A 4IFEA 4FJHA 3HPHA 1VHXA 5EVZA 3THYA 2H3GX 4DV0K 3K5MA 4Z4GA 4EP4A 2O8DA 2KFZA 3TTFA 4IBNA 1NGFA 2O8FB 1L3UA 1QQCA 2KW4A 3G0ZA 2RE2A 3J80O 4B9NA 2HHTA 5HRSA 1IKXA 5A2QO 2YJEA 3WXJA 1DLOA 2IC3A 1YVNA 4DR6K 2A40A 4B1YB 4OKJA 2YX6A 4CEBA 4LF7K 4CZLA 4HTUA 3OYFA 4DR4K 2VG7A 2GV9A 4DV1K 2WONA 4W5TA 3H46O 4CHNA 1C1AA 3KZBA 2BUPA 4XH1A 3CIPA 1N6QA 2X6NA 4CI6A 4Z0UA 1TKZA 5J2MA 3H1VX 5C2DA 3ZT3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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