3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
4H5VA 3SLCA 3BF3A 4I6MB 4RTFD 2CGJA 4BVPA 4CD3A 3AARA 3G25A 4EIAA 3ZX3A 3ATUA 1XC3A 1JCFA 3EKUA 5AQUA 1ZXOA 3EZWA 4XEIA 2CGKA 4BR4A 4NO7A 3UKRB 2NRHA 3VEWA 3W0LA 1KAXA 1DEJA 2CGLA 3UE5A 3HM8A 3ZETB 1RDWX 4I6MA 5JLHA 2GWJA 3AY9A 3L4IA 5EX5A 4BRIA 2YI1A 4CZEA 3ZX2A 1DGKN 4H0TB 1OKJA 3QB0A 1BDGA 1QZ6A 3H3OB 3CJ7A 1NGIA 4KBOA 3CI5A 1JCGA 4GY2B 3UKRA 3HZ6A 4K43A 1D4XA 1GLLO 3WXJA 3ZETA 5B8HA 2F9TA 5LJVA 3F9MA 3U4LA 3LDQA 3UB5A 2AA4A 3A5LC 1NGGA 4IO8A 2YHWA 2ITMA 1K8KB 4B1WB 4MLHA 1V4TA 2NZTA 1ZC6A 4A2BA 1E4GT 1NLVA 4EHUA 2H3GX 3QFUA 3MN5A 3IUCA 2Q31A 3L6QA 1HX1A 3DWLA 2WUSA 3WXLA 1TYQB 3AAQA 4F9OA 1WUAA 2EWSA 3L0QA 3FZKA 3QBXA 3VEYA 4BC4A 4BC5A 5BR9A 1K8KA 1ESVA 2P9LB 2VWBA 4ISEA 4BRKA 5KQDA 4Y0WA 2GELA 4M7XA 4FWMA 4C23A 3GBTA 2HF4A 2CH6A 5AFUA 2V7YA 2E2QA 3CQYA 1TYQA 2P9IB 1GLAG 4MLEA 1MWMA 3R9PA 1P8ZA 3GE1A 2YHYA 2P9LA 3FLCO 3LL3A 1MWKA 3VGLA 2E8AA 4J8FA 5EY4A 1JCEA 4BR5A 3O1BA 2ASMA 3HTVA 1QHAA 5BREA 4BROA 5BPNA 2FSJA 1MA9B 4NB4A 3QICA 1HPMA 2ZWHA 3ZEUB 1GLFO 4M63C 3R8EA 4BG8A 3FZHA 3IDHA 5AQLA 4XH4A 2ASPA 3O1WA 3FFKB 4BRCA 5FPNA 1RGIA 2V51B 5BN9A 3TU5A 1QQNA 3D2FB 3MCPA 2P9KB 3FZFA 4BVOA 4FOEA 1Q18A 3LDPA 2D0PA 1XUPO 3ULEA 1HKCA 2P9NB 3A5NC 5AQGA 2PBDA 1ATNA 3EO3A 5BRDA 4YDUA 5AZIB 5AQQA 4K25A 3A8YA 4H5NA 3D2FA 3O5BA 2P9KA 4B9QA 1SAZA 3EKSA 3C7NB 4BGAA 4BRHA 4CBWA 3WUHA 3CERA 4FWOA 5AQXA 3LDLA 3A5OC 1Z6RA 3I8BA 3A0IX 2QWPA 5AZIA 3VESA 4B1VA 3GDQA 3ENHA 5AQSA 3SK3A 3VEXA 5AQRA 2IVPA 1MDUB 1NGFA 3U8XA 3MMVA 4B1UB 2J4RA 1YAGA 2QWMA 4B1ZA 1BOTO 3FZLA 4IZ9A 3U9ZA 3LDNA 1X9JA 4FSVA 4L3QA 4HWIA 3VF4A 3DXKB 5AQWA 4BC2A 3VGKA 4CZFA 1CZAN 3ENOA 3GOIA 1BWFO 4JNEA 3WT0A 3VF2A 5JLFA 4WQ4A 4BC3A 1U6ZA 2QWLA 2YJFA 4CD1A 4H0VB 3TPQA 3DXKA 3DXMB 2I7PA 4BRLA 2P9UB 3J8AA 1C0FA 5KQ8A 3QMLA 5AQVA 2YJEA 1X3NA 3H6EA 5LJWA 2UYTA 4K41A 4BRFA 4WQ5A 3VPZA 1GLCG 4BREA 4BR0A 4BGBA 1QZ5A 3HI0A 1BA1A 4IJNA 3VEVA 3H45C 1QQOA 2YCHA 3MN9A 2QXLA 5CE3A 3JXUA 3DXMA 4FPAA 4FWPA 2P9UA 1NGAA 1GLEG 2A3ZA 3CJ1A 5FPMA 1QQMA 4BG9A 3D2EB 4FOIA 2P9PB 3S41A 1J6ZA 4MO5A 5AQKA 2BTFA 3ATVA 4FPBA 4BQLA 5AQHA 2ASOA 5EOYA 4BRMA 1IJJA 1NM1A 3RSEB 4IJAA 5AQMA 4QS7A 3D2EA 4EAHD 1T6CA 5BPMA 1H1VA 2HMPA 3B8AX 1NGDA 2GUPA 2P9PA 3LM9A 3O80A 2E1ZA 5LY3A 5BRHA 2P9IA 3HSCA 4CZJA 5AQOA 4O8KA 1KXPA 3CJ9A 3QFPA 2FSNA 3VOVA 4CZHA 3IFRA 1C0GA 3JS6A 3KVGA 3FGUA 4EHTA 4BRPA 3RSEA 3SJHA 1HLUA 3IMXA 4H03B 4K42A 3WEEB 2KHOA 3O08A 4CBXA 1KAYA 1GLBG 3H1QA 1G99A 5JMVA 1NWKA 4QS8A 1SQKA 1BG3A 1NMDA 3CETA 4WQ4C 4CBUA 4XH1A 4CZLA 3M1FA 3ZEUA 3CJAA 2OANA 1ATRA 3H3NO 1BU6O 1HJOA 1NGCA 4CI6A 2A40A 4FO0A 3M3ZA 2V52B 3OHRA 2I7NA 3WEEA 2FF6A 3EN9A 5F0XA 4FWSA 4BRNA 5F2RA 1LCUA 4WQ5C 3MN6A 1U2VB 4O5FA 2PAVA 1NGHA 4XH5A 2QWRA 2Q2RA 4GNIA 3GL1A 2P9NA 5FPEA 1TUUA 1DKGD 3FE1A 3KZBA 4EFHA 3VEZA 1NBWA 4RCHA 2Q97A 1E4FT 4CZMA 4JD2B 4JN4A 1U2VA 3SMSA 3C7NA 2E20A 3BEXA 4B1XB 1R59O 5AFUH 3O6WA 5AQIA 4BR7A 3VEOA 1S3XA 5E84A 2W40A 3CIPA 2D4WA 2QWQA 3CJCA 2Q1NA 2IVNA 1IG8A 4JD2A 4ISGA 2QWOA 3I33A 1NGJA 5EXWA 2FF3B 3AAPA 3D7EO 3H46O 1EQYA 5KPTA 4BQZA 4H5RA 3HBTA 4BR9A 2D1KA 3VGMA 3MK6A 5F1XA 3CHWA 3EL2A 4ISFA 3VERA 1ZBSA 5AQFA 1BA0A 2A5XA 5JICA 5FPDA 2VCPA 1NGBA 5AQNA 3UKUB 4FWNA 4IXCA 1T6DA 4FWLA 1LOTB 5ELZA 2GEMA 4H5TA 4H0OA 2E88A 4BRGA 2V7ZA 4RWTA 5BPLA 2ZGYA 4YDUC 4PL8A 2FSKA 2ZF5O 2W41A 2Q0RA 5TKYA 4FL9A 3UKUA 5AR0A 3VETA 2IVOA 4MO4A 4B1YB 5AQZA 4PKIA 4AM7A 5ADXA 2E2PA 2QM1A 3QBWA 4HTLA 3MDQA 2E2OA 3ZX0A 3A5MC 2FLOA 4PKHA 1ATSA 4H0YB 3SMPA 5EVZA 2Q36A 3VENA 1XQSC 3WQTA 4JAXA 1Y64A 2NLXA 3LM2A 2P9SB 4CJ7A 1NGEA 4A2AA 5KPRA 2AP1A 4DHYA 2GWKA 3WXKA 5BN8A 2E2NA 2Q0UA 4JHDB 1KAZA 5AQPA 5E26A 1WOQA 2A41A 1BO5O 3WXIA 2VYPA 1YUWA 4WYBA 4A62A 1HKBA 1T44A 2IIRA 2P9SA 3ID8A 2D0OA 3O8MA 1S22A 4BRAA 2A6AA 1YXQA 3FZMA 4JHDA 4Z94A 4DCHA 2BUPA 4A61A 3CJBA 3M6GA 3O4WA 2FXUA 4BRQA 4CZKA 2E1YA 4H0XB 5BRFA 2HOEA 4FWQA 3GG4A 3FR0A 3LDOA 3ULEB 4DB3A 1GLJO 5AQYA 3DAWA 5I9EB 2CH5A 2F9WA 3CQXA 4QS9A 4E1JA 3BF1A 4CZGA 5AZJB 4M7YA 1HKGA 1HUXA 2A42A 4H0PA 1GLDG 1Z05A 5AQJA 3R6MA 4BRDA 5KPZA 1YVNA 3C0BA 4FWKA 4AM6A 1TUYA 4H5WA 1RFQA 3QDKA 2QWNA 3U9DA 3W3DA 3DJCA 2DPNA 4DQ8A 3BP8A 4PKGA 3VF6A 3WQUA 3KHYA 3BUZB 5AZJA 3H1VX 2HF3A 4IWVA 3MN7A 2YHXA 4BR2A 2GTDA 1SZ2A 2QW9A 4CZIA 5AQTA 1V4SA 1X3MA 2ZGZA 3P4IA 5ADXH 1BUPA 4PL7A 4LC9B 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2UA 1OH5A 3SF4D 4IDHA 4J2AA 3BF3A 3SQ4A 4I6MB 4NLCA 1HNZK 3T1YK 4BVPA 4IFVA 3EKUA 3RR7A 5C25A 2VWJA 3HT3A 1ILYA 1L3VA 3CXCM 4JK9A 4NO7A 4FJMA 3UKRB 2NRHA 1TKZA 3VEWA 1DEJA 2CGLA 5T7BA 3HM8A 3ZETB 4I6MA 1PTXA 2NRTA 3QB0A 4C1NI 3H3OB 3CJ7A 4CEAA 1JCGA 3UKRA 1NNEA 4U67L 2O4IA 2YBRC 4AF1A 5CY4A 3ZETA 4CEEA 4CJEA 5B8HA 1NJZA 4OLBA 3U4LA 4FM0A 5KTQA 1VSEA 4CJFA 1ZU3A 3CYGA 2ITMA 4CJ3A 3CF5L 4B1WB 1ZC6A 1NLVA 4H4MA 4BE2A 2O8DB 2GX9A 3L6QA 3DWLA 1FKOA 3AAQA 4F9OA 2SN3A 3MCAB 1CN2A 1WUAA 2EWSA 4KREA 3V9XA 4HUGA 3VEYA 4BC4A 5BR9A 5CZ2A 3EZ5A 4B8AB 4Y0WA 3IG1A 2GELA 3NF7A 2HF4A 3CQYA 1EWQA 1GLAG 2HHQA 1MWMA 1NKCA 2UXCK 1RT1A 1S1VA 4J8FA 4DTXA 1IKYA 2G8WA 2KBKA 4ELTA 3DI6A 4NB4A 3VTIA 1TGOA 1HPMA 4M63C 3K5MA 4FZZA 2D5RA 3SYZA 5HP1A 1BQMA 5GINA 2ASPA 3O1WA 1HRHA 5BN9A 2YEOA 3BY5A 3TI0A 1QQNA 3PY8A 2ITGA 3FZFA 3KLEA 4KH4A 1Q18A 1IKWA 3ZSZA 4JK7A 4JKBA 3OYHA 3SBGA 3MX2A 4I9LA 4LF8K 3EO3A 4K25A 2B6AA 4KTZA 3I0SA 4E7KA 5CY0A 4RW4A 1I2UA 2DY4A 2IDOA 3C7NB 2X6SA 5LMNK 3V9UA 2HB5A 4FWOA 4OGEA 3BZCA 3A5OC 1XNRK 2KSKA 3R3LA 4I2QA 3AGRA 3KC6A 3VESA 4CFDA 3ENHA 4LY7A 3EEQA 3U8XA 3AO1A 2YNGA 4B08A 5CR4A 4M42A 1YAGA 2ETJA 4DFKA 1N34K 3O9TA 2HSTA 4B3TK 3HOTA 4Z4IA 2HHTA 4DR1K 4BC2A 5DMRA 3NHGA 5C24A 3T19A 4CZFA 3PV8A 4DFPA 2HNDA 2KZMA 1KTQA 1WN7A 3O4NA 3NGZA 1TL3A 1HMVA 1ZBFA 3M8PA 3TPQA 3TTCA 1RT4A 3D6RA 2P9UB 1SNBA 2YX6A 2YJEA 3DRPA 4BRFA 3VPZA 1LWFA 4BREA 1ZBHA 4BR0A 1BA1A 4JKFA 4IJNA 2KFZA 3H45C 2YCHA 1NK9A 1GOCA 1IBMK 3A2FA 5LMUK 3V6DA 3EY1A 3CQ8A 4FPAA 2P9UA 2QI2A 2YKNA 4AHCA 5FPMA 1RT7A 2XHBA 3S41A 4B9SA 3MWTA 4CCHA 2QEXN 1OH6A 4DR4K 1NM1A 3RSEB 2ZJPL 4IJAA 5AQMA 3R1XA 4EAHD 1T6CA 4DLEA 3B8AX 3O80A 2F7TA 3J80O 1L5UA 3DM2A 2E1ZA 1L3UA 1I3AA 1T7EA 3M8SA 1T7AA 1JLFA 3WNHA 1IH7A 1JLBA 1NOYA 2Z1IA 3CJ9A 2C1IA 1CXQA 1QS4A 3Q7CA 5HRRA 3IFRA 3RTVA 1C0GA 3JS6A 1LAVA 4DWIA 5JVGL 3RSEA 3SJHA 2HBJA 3U6FA 2LKBA 1W2BM 2WTUA 1I39A 1M90O 1EO1A 4CBUA 4XH1A 5M1FA 3NDKA 3PIOL 4LD0A 3ZCMA 3SQ2A 3KK1A 4O44A 1HJOA 1NGCA 4FO0A 3M3ZA 3OHRA 4PWDA 2FF6A 3KKSA 4BRNA 1JJ2M 3ZSYA 4NCGA 2I61A 4GV6A 1RTJA 3KK3A 1U2VB 1Y97A 1IBLK 4DR3K 2HBKA 2QWRA 3CCRN 2Q2RA 4AQYK 4FVMA 2IAJA 1DKGD 1S6QA 2GMOA 2NNWA 3KHWA 4RCHA 1BL3A 2D56A 4ILJA 3HVTA 4OGCA 1TK0A 1U2VA 3LWMA 4RW9A 1SL0A 1BQNA 4BR7A 5AQIA 4JKHA 1BGXT 1ZBLA 1UOCA 1EKEA 1FW6A 1NMNA 2F96A 3CIPA 2FBVA 3WNFA 2D4WA 3CJCA 2OTLN 1HPZA 3M8RA 2QWOA 3I33A 3Q7BA 5EXWA 4GVMA 4E89A 4DSLA 3D7EO 3LZJA 2KQ2A 4CHNA 3QERA 3SQ1A 5KPTA 1CXUA 1OVYA 2DFFA 1RTIA 3HBTA 4E0DA 3VGMA 1WSIA 3MK6A 5FRMA 4M3UA 3E9PA 1XMQK 1K73O 3EL2A 1FKPA 4ISFA 2PFUA 3AA3A 4FVUA 4FLZA 4KKOA 3C6UA 4JI6K 2VGMA 4CIFA 2PZSA 1C0TA 2A5XA 4BECA 1N4NA 4UADE 2IS3A 2VCPA 4JKGA 3NF6A 3SV3A 3UKUB 4KRFA 5BR8K 1T6DA 1LOTB 1IKVA 1EWRA 3S9HA 1Q86O 2HW3A 4IEIA 2ZF5O 4CK1A 5TKWA 3RMAA 1QQCA 4NYNA 2IGIA 4FL9A 3UKUA 4B9NA 4B9TA 1JXBA 4DS5A 3RMDA 4M3XA 4HTLA 3ZX0A 2FLOA 1ATSA 3SMPA 4XIUA 4FLYA 2Q36A 3AVMA 3VENA 4JAXA 2IC3A 1WSEA 4CJ7A 1VQ7N 3QEVA 5KPRA 4PQUA 2KKZA 4IEEA 5BN8A 4LF7K 4PY5A 2E2NA 3L8BA 4DS4A 2Q0UA 4JRQA 1KAZA 4BWJA 4XJXA 1BO5O 2VYPA 4CGGA 4WYBA 3C94A 4JI2K 4A62A 1RTDA 2R7YA 4PUOA 2IIRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L2U A;  1OH5 A;  3SF4 D;  4IDH A;  4J2A A;  3BF3 A;  3SQ4 A;  4I6M B;  4NLC A;  1HNZ K;  3T1Y K;  4BVP A;  4IFV A;  3EKU A;  3RR7 A;  5C25 A;  2VWJ A;  3HT3 A;  1ILY A;  1L3V A;  3CXC M;  4JK9 A;  4NO7 A;  4FJM A;  3UKR B;  2NRH A;  1TKZ A;  3VEW A;  1DEJ A;  2CGL A;  5T7B A;  3HM8 A;  3ZET B;  4I6M A;  1PTX A;  2NRT A;  3QB0 A;  4C1N I;  3H3O B;  3CJ7 A;  4CEA A;  1JCG A;  3UKR A;  1NNE A;  4U67 L;  2O4I A;  2YBR C;  4AF1 A;  5CY4 A;  3ZET A;  4CEE A;  4CJE A;  5B8H A;  1NJZ A;  4OLB A;  3U4L A;  4FM0 A;  5KTQ A;  1VSE A;  4CJF A;  1ZU3 A;  3CYG A;  2ITM A;  4CJ3 A;  3CF5 L;  4B1W B;  1ZC6 A;  1NLV A;  4H4M A;  4BE2 A;  2O8D B;  2GX9 A;  3L6Q A;  3DWL A;  1FKO A;  3AAQ A;  4F9O A;  2SN3 A;  3MCA B;  1CN2 A;  1WUA A;  2EWS A;  4KRE A;  3V9X A;  4HUG A;  3VEY A;  4BC4 A;  5BR9 A;  5CZ2 A;  3EZ5 A;  4B8A B;  4Y0W A;  3IG1 A;  2GEL A;  3NF7 A;  2HF4 A;  3CQY A;  1EWQ A;  1GLA G;  2HHQ A;  1MWM A;  1NKC A;  2UXC K;  1RT1 A;  1S1V A;  4J8F A;  4DTX A;  1IKY A;  2G8W A;  2KBK A;  4ELT A;  3DI6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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