3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
1CZAN 1GLFO 1HJOA 2CH6A 1H1VA 2E1YA 2P9SB 3GG4A 3VGMA 3L6QA 3ATVA 4DQ8A 2P9PA 2CGLA 4FOEA 2P9NB 2W40A 1YUWA 3O80A 1DEJA 2GUPA 1RFQA 3ENHA 3FE1A 2D0OA 3FZHA 3VF2A 1BA0A 3A5LC 3CHWA 3CJAA 3GDQA 4RCHA 2E2NA 3H6EA 5LJWA 4BRDA 1V4TA 3P4IA 4QS7A 1RDWX 3QBXA 1P8ZA 5EX5A 1DGKN 4JHDA 2PAVA 3WEEB 1NGDA 1X3NA 1IG8A 2D4WA 3BUZB 4FWQA 3C7NA 5AQMA 3U4LA 5KPTA 3R6MA 3DXKA 5JLHA 2QM1A 4HTLA 1HKGA 2EWSA 3VEWA 1J6ZA 3WXKA 3GBTA 4M7XA 2HMPA 2YHXA 4BVPA 5BPNA 2ASMA 4CI6A 3AAQA 3CERA 4BQZA 5AQNA 4XH5A 5I9EB 1MWMA 4BRGA 3VEZA 4FO0A 4H5TA 4CZFA 2P9KA 4BRPA 1TUUA 3DXMA 4Y0WA 5BRDA 4I6MB 1WOQA 2P9UA 5ELZA 1BOTO 1XC3A 2HF3A 3D2FB 5AQYA 5AQOA 5BR9A 1QQNA 2E8AA 4K41A 4WQ5A 4H0VB 1QZ5A 4BC5A 4FWKA 3CJ7A 4CZMA 4XH1A 4BR0A 1BA1A 3W0LA 1Z05A 3C0BA 1BU6O 4WQ4A 3R9PA 3VF6A 4CJ7A 2F9TA 3EN9A 4JD2B 3F9MA 3VEOA 3CJ1A 1YAGA 3WUHA 2BTFA 4PL8A 4JAXA 3DWLA 3QICA 4IWVA 1YXQA 4YDUA 4DB3A 5CE3A 4BGAA 3LDNA 2ASOA 4FWRA 4BRNA 5FPMA 3O4WA 4BR5A 5AQJA 1KAXA 3CJCA 4BC3A 4B1ZA 1WUAA 4NO7A 3ZEUA 3KVGA 2FF6A 2GWKA 4M7YA 5ADXA 3MMVA 1HX1A 4FWLA 2BUPA 3LL3A 3ATUA 3J8AA 2CGKA 4B1XB 1BO5O 4PKGA 4JNEA 1KAZA 4BRHA 3ULEA 3FR0A 4H0PA 1C0GA 3LDOA 3UB5A 1BWFO 2YHYA 4BC4A 3LDQA 1BUPA 1T44A 1GLDG 3U9DA 1X3MA 5AQLA 4O5FA 2D1KA 2PBDA 3M1FA 3ZETB 3M6GA 2YHWA 2CGJA 3LDPA 4FOIA 5BN8A 1HKCA 5B8HA 3GL1A 3VGLA 4WQ5C 3BEXA 5FPDA 1LCUA 2HOEA 5ADXH 1QHAA 2FSNA 5KPRA 3D2EA 4H5VA 3QMLA 3KHYA 4WQ4C 1MWKA 4BG9A 4H5NA 2OANA 5AFUA 5E84A 4B9QA 5BRHA 1KAYA 3ZX3A 2I7PA 1NGAA 3LM9A 4RTFD 5JMVA 5LJVA 4YDUC 3RSEB 4MLHA 1GLCG 4H03B 4BR9A 3IMXA 4BR2A 2P9SA 1K8KB 3MN5A 3SLCA 2A41A 1NGCA 3WQUA 5F1XA 4C23A 4EAHD 3U9ZA 3VEVA 5AQTA 4RWTA 1GLJO 4IJNA 3VF4A 4BRLA 3FZFA 3SK3A 3D7EO 4F9OA 4O8KA 2P9NA 1OKJA 5EVZA 3CJBA 4H0XB 4MO5A 1X9JA 3DXKB 4B1WB 3VEYA 3SMSA 3VPZA 3UKUB 1U6ZA 1Z6RA 4CBWA 3GOIA 3IFRA 5AFUH 3H1VX 3O1WA 3QFUA 3LDLA 2Q2RA 4M63C 4EHTA 2Q31A 3LM2A 2NRHA 1TUYA 4A62A 5FPNA 3WEEA 2QWPA 4L3QA 2E88A 5E26A 3QFPA 1MA9B 3I8BA 3A8YA 4IZ9A 1U2VB 2WUSA 2FLOA 3L0QA 3HTVA 5AQPA 2YJFA 4CBXA 5BN9A 3HI0A 2QXLA 1ESVA 2V7YA 4LC9B 1SZ2A 2VWBA 4FSVA 5AQXA 3O1BA 2E2PA 5AZJB 4H0TB 1C0FA 4FWNA 5BREA 2ZF5O 2NZTA 4QS8A 1IJJA 2E20A 2QWRA 5AZIB 1EQYA 4XH4A 4I6MA 3A5NC 1ZC6A 3H45C 5AQIA 2QWOA 4XEIA 2VCPA 3D2FA 5AQFA 3EZWA 3EKUA 4MLEA 4BRKA 2A6AA 1RGIA 1ZBSA 3H46O 4CBUA 3H1QA 3WXLA 2Q97A 2ZGYA 4BR4A 4EIAA 1NGBA 2ASPA 4PKHA 1E4FT 3HM8A 4JD2A 2A42A 4Z94A 4A2BA 2QWQA 3S41A 2A5XA 3U8XA 1S22A 5AQGA 3R8EA 3UKRB 2P9LB 1GLEG 4BC2A 2DPNA 4B1YB 5AQWA 3A5OC 1TYQB 3O5BA 3VETA 5AQKA 1GLAG 3CIPA 4BR7A 4IXCA 4FWSA 2ITMA 4WYBA 1E4GT 4IJAA 4PL7A 3CJ9A 2ZGZA 3QDKA 2P9IB 4BVOA 2ZWHA 3WXJA 2W41A 3SMPA 3WXIA 4AM6A 2GELA 3BF3A 4KBOA 1HPMA 1NGHA 3TU5A 4BRQA 3I33A 5EXWA 1BG3A 4DCHA 1D4XA 3CQYA 3VESA 4A2AA 3L4IA 2CH5A 3VERA 3WT0A 4EHUA 4FL9A 5AQZA 4IO8A 2P9PB 1NGIA 3H3NO 4B1UB 4CZIA 3M3ZA 2VYPA 3O8MA 3BF1A 4BQLA 3DJCA 4B1VA 3JS6A 4K25A 1NGJA 4H0OA 3FFKB 5KQDA 1R59O 3ZETA 3UE5A 4K42A 2IVNA 3MN6A 3JXUA 4BG8A 1HLUA 4BREA 2IVPA 1KXPA 1QZ6A 2AA4A 2GEMA 4BRAA 4BROA 2E2QA 3CQXA 2FSJA 3O6WA 4JHDB 4DHYA 1JCGA 1JCFA 1SQKA 3CETA 1NGGA 5AQRA 1DKGD 2I7NA 3A5MC 3C7NB 1XUPO 3HBTA 3HSCA 5AQUA 1MDUB 2UYTA 4FWMA 3WQTA 2Q1NA 5KPZA 4BRMA 5BRFA 2QW9A 2NLXA 1QQMA 4CZJA 3VOVA 2HF4A 4QS9A 3RSEA 1ZXOA 3B8AX 1ATNA 5F2RA 3HZ6A 3FLCO 3CI5A 1K8KA 3FZMA 2IIRA 3IUCA 4K43A 2V52B 1SAZA 4CD3A 2YI1A 3GE1A 2QWLA 3MN7A 4H5WA 2P9KB 2IVOA 4BRIA 3DXMB 4CZLA 2P9UB 3ZX0A 4A61A 3TPQA 4FWOA 4GNIA 5AR0A 1G99A 2Q36A 3VGKA 4GY2B 2FXUA 3UKUA 5BPMA 1GLLO 1NM1A 4NB4A 2GWJA 1GLBG 2AP1A 5EOYA 1XQSC 4CZHA 1NLVA 5JLFA 5F0XA 2E2OA 3FGUA 1BDGA 4FPBA 3SJHA 4ISGA 1ATSA 2YCHA 5JICA 2V51B 2A40A 4BRCA 2F9WA 3MK6A 3DAWA 1U2VA 4CZGA 4BGBA 3IDHA 4AM7A 1Q18A 3H3OB 3VEXA 2QWNA 5EY4A 5BPLA 1T6DA 3ZEUB 2GTDA 3QBWA 2H3GX 4FWPA 1NWKA 4J8FA 1NBWA 3ENOA 4H5RA 5AZJA 5TKYA 3G25A 5AZIA 2FSKA 3EL2A 3FZKA 1HUXA 1YVNA 2D0PA 3ULEB 3OHRA 2E1ZA 5AQQA 2Q0UA 3AAPA 3VENA 5AQVA 1NGFA 5FPEA 3QB0A 2FF3B 3W3DA 1ATRA 1V4SA 2QWMA 5LY3A 5KQ8A 2Q0RA 4MO4A 4HWIA 4ISEA 4JN4A 3MCPA 4BRFA 3AARA 3EKSA 5AQSA 3O08A 2V7ZA 1QQOA 4PKIA 2YJEA 3ID8A 4CZEA 2KHOA 3UKRA 3MDQA 2J4RA 2P9LA 1NMDA 3A0IX 1T6CA 3BP8A 3ZX2A 1LOTB 1TYQA 3AY9A 2A3ZA 3D2EB 1NGEA 4EFHA 4FPAA 3MN9A 3KZBA 3EO3A 4H0YB 3FZLA 1HKBA 1Y64A 2P9IA 4CD1A 5AQHA 4CZKA 4ISFA 1JCEA 1S3XA 4E1JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NBPA 1GLFO 4JI8K 1HJOA 2GV9A 4NCBA 2FBTA 1VRTA 2P9SB 3ZT4A 1N8RO 2O8CB 5CYMA 3KC6A 4J2BA 1B3CA 4E0DA 2VQEK 2YKMA 4DQ8A 1LW2A 2CGLA 4KO0A 3NF6A 2OZMA 3N4QA 1YUWA 3O80A 4BE0A 3QI7A 5LMUK 3FE1A 4IKFA 5FRMA 3G4SN 4ID1A 3T7ZA 4DTOA 2I5JA 1WBBA 3A5LC 4KHYA 2HHHK 3CHWA 4JLHA 4RCHA 1RDAA 2UXBK 3MECA 3P4IA 3DRSA 3QBXA 3JYTA 1P8ZA 2Z1GA 4F3TA 2HNZA 1DGKN 2PAVA 1X3NA 1U49A 5BR8K 1QTMA 2K35A 5KPTA 5KI6A 3U4LA 1TAUA 3R6MA 3DXKA 5JLHA 2QM1A 1HKGA 3AVHA 2G8WA 3WXKA 3CCRN 4C8KA 3QIOA 4ILJA 4CI6A 1S1WA 4DMNA 1HR0K 4KRFA 4XH5A 1PTXA 1J54A 3O9SA 1BHLA 1J53A 3AO2A 3TTFA 4BRGA 1ITGA 1SNBA 4OPAA 4CZFA 4FJJA 3SUOA 1TUUA 1U47A 4I6MB 3ISNC 3D2FB 5BR9A 4CJRA 4K41A 4WQ5A 3ZSRA 4KTWA 3NMUA 3NAEA 3P39A 3CJ7A 4CZMA 2QK9A 3K5NA 3C0BA 4CJ7A 4NCGA 3WUHA 4DTSA 1YAGA 3SNNA 3QEVA 4PA1A 2HSTA 5FDLA 3IKMA 2RPIA 4YDUA 1RT4A 4BGAA 5CE3A 4CF1A 3CYMA 4FWRA 1VQPN 4GVMA 3H08A 4CEFA 5AQJA 4OLBA 4FJXA 1NG9A 3ZSOA 4BC3A 1QS4A 3O9QA 2YHBA 4ELUA 4M3TA 3S3NA 2BRZA 4M7YA 4FJLA 2QA4N 4BACA 3NCIA 2FBVA 3CFRA 3LL3A 4CGFA 2DFEA 3J8AA 1K73O 4B1XB 3KJVA 4BE1A 4OJRA 4DLGA 4G1QA 4H0PA 5JS2A 3LDQA 2Q3SA 4DU4A 3U9DA 1X3MA 4HE7A 1NK4A 3ULDA 3CM5A 3J80O 2PBDA 3M1FA 4WF9L 2CGJA 4FOIA 4DR3K 1IBMK 4FZZA 1GOCA 2M8BB 2RF2A 4CGJA 4DV2K 3MXMA 4B9TA 4B3OA 1LCUA 1D9DA 3CMAN 1BCGA 5I3UA 4H5VA 3KHYA 1MWKA 4B3TK 2O8BA 3OJSA 1KAYA 2XY8A 3L3UA 4DFPA 3S3OA 3RSEB 1GLCG 4KB0A 4H03B 1X9WA 3RVCA 3AVLA 3IMXA 1CZ9A 1K8KB 3E9LA 3MN5A 3CCJN 2YKNA 4E89A 3THVA 4UY8O 4B9LA 3RMCA 5AQTA 2YNIA 4IJNA 2F96A 3OYEA 2P9NA 3LZIA 1DT9A 3L2QA 2HHXA 1TL3A 3ZSYA 4B1WB 3O4NA 2KZMA 2NRZA 3VPZA 4JRPA 3UKUB 1VQ4N 4CFDA 1S9GA 3G71N 1OVQA 4OPJA 3K5OA 4HHTA 1VQON 3NVKA 3GOIA 3IFRA 3LAKA 4DQQA 3H1VX 4HUGA 1TK8A 4KTZA 4JKDA 4M63C 1L4VA 4GV6A 4DS5A 3L2RA 4A62A 4YOVA 3PIPL 1UWBA 3CPEA 2O8EB 4E19A 1O13A 3B6PA 1EX4A 4L3QA 1MA9B 3I8BA 2HB5A 4CK1A 3WNGA 3T1AA 2KKZA 2WUSA 4CGGA 4DQRA 4IO9L 3HTVA 1DLOA 2YJFA 1JLFA 1VSJA 3CCUN 5BN9A 4DV7K 4KHNA 1S1XA 2KFZA 5GINA 5KRSA 1LWCA 1VSDA 2QEXN 3IRXA 4FJMA 3O1BA 4CHQA 3CYGA 2E5LK 5BREA 3PO5A 2QWRA 2KZZA 3A5NC 1NRBA 1WMTA 4I9LA 4IOAL 4E7LA 2EX3A 1RGIA 5CHIA 5HRNA 4JKHA 3KP1A 3QO9A 3H1QA 4BR4A 2ZGYA 3SQ2A 1IBLK 1HYZA 2XY6A 3CFOA 4Z94A 4A2BA 2UU9K 2HHVA 4E7IA 3S41A 3DYAA 3VQ9A 3R8EA 3UKRB 1GLEG 4CF8A 5AQWA 1N36K 4CJ4A 2IS3A 3VETA 1YITN 4ICLA 5AQKA 4BR7A 4NCAA 1S1VA 3NFAA 3QDKA 3TAFA 4BVOA 1DQ7A 2GELA 4DFJA 4HCBA 4KBOA 4JI3K 2VGMA 3KKSA 2N69A 3EE8A 1D4XA 3ALYA 2D0AA 1FKOA 4A2AA 1FJGK 1KC8O 1P0AA 1RT5A 2N2QA 1ZFUA 2VYPA 4PUOA 4BQLA 3SJJA 4A5BA 1MYNA 1RTJA 4ZTJA 1B7DA 2RE2A 4B1VA 3L2UA 4U67L 3DLEA 1NGJA 3C6TA 3FFKB 5KQDA 4DTXA 3UE5A 4K42A 3SQ0A 3K5MA 2O8CA 3ZT0A 4BRAA 1JLGA 4BROA 2FSJA 4IDHA 3CFPA 1SQKA 4YFUA 3HBTA 3HSCA 2I61A 3DOKA 1KTQA 3RTVA 1W9HA 1VSMA 5BRFA 3V9UA 3BY5A 2NLXA 1QQMA 4DTPA 1YJWN 1Q81O 1XNQK 1ATNA 1VQNN 3HZ6A 3MAQA 3SZ2A 3HVTA 4WCEL 2BH1A 4K43A 3AGRA 1SAZA 2YI1A 4H5WA 1ICAA 4CGIA 4CZLA 4A61A 3P1GA 4CEQA 3ZT1A 4DV3K 1D8YA 4DQSA 3AA5X 1IG9A 2FXUA 3O3FA 2UXDK 1GLLO 4NB4A 1IV0A 1YT3A 4O5BA 3I8DA 2OA8A 4GMJB 4BEBA 1GLBG 3CCLN 4EZ6A 2AP1A 5EOYA 3SV4A 2F8SA 1RTIA 3SUNA 1D5AA 3PX4A 1RNHA 5F0XA 5FRNA 1BDGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5EOY A;  1XQS C;  4CZH A;  1NLV A;  5JLF A;  5F0X A;  2E2O A;  3FGU A;  1BDG A;  4FPB A;  3SJH A;  4ISG A;  1ATS A;  2YCH A;  5JIC A;  2V51 B;  2A40 A;  4BRC A;  2F9W A;  3MK6 A;  3DAW A;  1U2V A;  4CZG A;  4BGB A;  3IDH A;  4AM7 A;  1Q18 A;  3H3O B;  3VEX A;  2QWN A;  5EY4 A;  5BPL A;  1T6D A;  3ZEU B;  2GTD A;  3QBW A;  2H3G X;  4FWP A;  1NWK A;  4J8F A;  1NBW A;  3ENO A;  4H5R A;  5AZJ A;  5TKY A;  3G25 A;  5AZI A;  2FSK A;  3EL2 A;  3FZK A;  1HUX A;  1YVN A;  2D0P A;  3ULE B;  3OHR A;  2E1Z A;  5AQQ A;  2Q0U A;  3AAP A;  3VEN A;  5AQV A;  1NGF A;  5FPE A;  3QB0 A;  2FF3 B;  3W3D A;  1ATR A;  1V4S A;  2QWM A;  5LY3 A;  5KQ8 A;  2Q0R A;  4MO4 A;  4HWI A;  4ISE A;  4JN4 A;  3MCP A;  4BRF A;  3AAR A;  3EKS A;  5AQS A;  3O08 A;  2V7Z A;  1QQO A;  4PKI A;  2YJE A;  3ID8 A;  4CZE A;  2KHO A;  3UKR A;  3MDQ A;  2J4R A;  2P9L A;  1NMD A;  3A0I X;  1T6C A;  3BP8 A;  3ZX2 A;  1LOT B;  1TYQ A;  3AY9 A;  2A3Z A;  3D2E B;  1NGE A;  4EFH A;  4FPA A;  3MN9 A;  3KZB A;  3EO3 A;  4H0Y B;  3FZL A;  1HKB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NBP A;  1GLF O;  4JI8 K;  1HJO A;  2GV9 A;  4NCB A;  2FBT A;  1VRT A;  2P9S B;  3ZT4 A;  1N8R O;  2O8C B;  5CYM A;  3KC6 A;  4J2B A;  1B3C A;  4E0D A;  2VQE K;  2YKM A;  4DQ8 A;  1LW2 A;  2CGL A;  4KO0 A;  3NF6 A;  2OZM A;  3N4Q A;  1YUW A;  3O80 A;  4BE0 A;  3QI7 A;  5LMU K;  3FE1 A;  4IKF A;  5FRM A;  3G4S N;  4ID1 A;  3T7Z A;  4DTO A;  2I5J A;  1WBB A;  3A5L C;  4KHY A;  2HHH K;  3CHW A;  4JLH A;  4RCH A;  1RDA A;  2UXB K;  3MEC A;  3P4I A;  3DRS A;  3QBX A;  3JYT A;  1P8Z A;  2Z1G A;  4F3T A;  2HNZ A;  1DGK N;  2PAV A;  1X3N A;  1U49 A;  5BR8 K;  1QTM A;  2K35 A;  5KPT A;  5KI6 A;  3U4L A;  1TAU A;  3R6M A;  3DXK A;  5JLH A;  2QM1 A;  1HKG A;  3AVH A;  2G8W A;  3WXK A;  3CCR N;  4C8K A;  3QIO A;  4ILJ A;  4CI6 A;  1S1W A;  4DMN A;  1HR0 K;  4KRF A;  4XH5 A;  1PTX A;  1J54 A;  3O9S A;  1BHL A;  1J53 A;  3AO2 A;  3TTF A;  4BRG A;  1ITG A;  1SNB A;  4OPA A;  4CZF A;  4FJJ A;  3SUO A;  1TUU A;  1U47 A;  4I6M B;  3ISN C;  3D2F B;  5BR9 A;  4CJR A;  4K41 A;  4WQ5 A;  3ZSR A;  4KTW A;  3NMU A; 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