3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
5AQOA 5BPNA 4CZEA 5AQWA 1KAYA 1X3NA 2V7YA 4CZGA 5KPRA 2E2QA 5B8HA 5AQFA 4B1YB 4CBWA 3L0QA 4CZKA 2HMPA 1J6ZA 3UKRB 2AA4A 2A6AA 4QS9A 3W3DA 2P9UB 1K8KA 4E1JA 4GNIA 4PL8A 2UYTA 2A3ZA 5AQNA 1RGIA 4CJ7A 4FL9A 5AQZA 1RFQA 2KHOA 4H0OA 4BR7A 5CE3A 5FPDA 2E1ZA 4CD1A 2H3GX 3O4WA 4BG8A 2A41A 4JAXA 4M7YA 3AY9A 3VEZA 2IIRA 4DB3A 1QQMA 2QXLA 3HSCA 4A2BA 5AR0A 2FSJA 4BR0A 3VEYA 3QICA 4BR2A 4H0XB 3BF3A 4MO5A 1MA9B 1R59O 1G99A 5KPZA 3MN7A 4JHDB 4BGAA 3VF4A 3LL3A 3RSEA 3ULEA 3O5BA 2EWSA 3ATUA 1XUPO 4CZHA 4M7XA 3GG4A 4NB4A 3VGKA 2CH5A 1C0FA 1T44A 4FWLA 1QQOA 3FZKA 3CJCA 2Q31A 3D7EO 1YVNA 2GWKA 1DKGD 1WUAA 3VOVA 3WT0A 4FPBA 4L3QA 2QWMA 5JLHA 5ADXA 2D1KA 4RWTA 4CI6A 1Q18A 5BPMA 2QWRA 3OHRA 2QWOA 3H1QA 4JD2A 4EAHD 3QBXA 2P9NB 3MN6A 1HKBA 4H5NA 4Y0WA 4B1ZA 4BVPA 5AZIA 1TYQA 4CBUA 3TU5A 2W40A 2I7PA 1DEJA 3HBTA 3DXMB 3U9ZA 3SJHA 2E2NA 2PBDA 3QBWA 5AQTA 2BUPA 3FZFA 3KZBA 3DXKB 3WQUA 3QMLA 3BP8A 3DJCA 1QHAA 4ISGA 4BRGA 4PKIA 1MWMA 1QZ5A 3AAPA 3CJ7A 5AQHA 4BC5A 2Q36A 2IVNA 2E20A 1XC3A 1JCEA 5LJVA 4IWVA 3VERA 3O1WA 1IJJA 4BR4A 4BR5A 1ZXOA 3L6QA 2ASPA 5LJWA 2W41A 1NGFA 1BDGA 1NGJA 1RDWX 4CD3A 2ZWHA 1H1VA 2QWPA 5ELZA 2V52B 4DCHA 3LDLA 2QW9A 3BEXA 3M3ZA 3H45C 4A2AA 3R9PA 1SZ2A 5AQJA 1S22A 3RSEB 2D0PA 4BRHA 3D2FB 4DQ8A 3MDQA 1JCFA 4FWSA 5AQIA 2P9PB 3GL1A 3EO3A 3EZWA 3O08A 1T6DA 3CIPA 2ZGZA 2VYPA 4HWIA 2YHXA 3CQYA 4FWPA 4AM7A 1ATRA 3DAWA 1YXQA 2FF3B 3U9DA 2D0OA 3ENHA 4B1WB 5FPNA 3FFKB 2IVPA 3SK3A 1SAZA 1BA1A 2P9LB 1NGHA 5AFUH 3EKUA 4JD2B 5BN8A 2CGJA 1WOQA 3O1BA 3ZEUA 3KVGA 5AZIB 1GLCG 1TYQB 3M6GA 1NMDA 1U2VB 4FWOA 4KBOA 2P9KB 3SLCA 4K25A 4XH5A 4B1XB 3U8XA 2A5XA 5AQKA 3UKUA 2E1YA 1BO5O 3IDHA 2GUPA 3MMVA 3H6EA 3VEXA 1KXPA 3WEEA 2E8AA 2GELA 4AM6A 5LY3A 4HTLA 3D2EB 5E26A 4BRQA 3BUZB 1BUPA 1X3MA 4O8KA 3GE1A 5JICA 1HKGA 3MK6A 5AQGA 2Q0UA 3H1VX 4FOEA 4BRLA 4H5WA 3AARA 3CI5A 2IVOA 4Z94A 2CGLA 2YHYA 4IO8A 4RTFD 4BQLA 3ID8A 4NO7A 3JS6A 4QS8A 4C23A 1EQYA 4BVOA 2J4RA 3EL2A 5EX5A 3FZMA 2NZTA 3H3NO 1IG8A 3P4IA 2GEMA 5KQ8A 3F9MA 3A5NC 5FPMA 4I6MA 1ZBSA 3ZETA 5AQPA 2GTDA 4FWRA 2FF6A 1GLLO 3EKSA 4H0TB 4F9OA 2ZGYA 4B9QA 1NGAA 5KQDA 3SMSA 4MO4A 4A62A 4IXCA 2QWNA 4PKHA 2D4WA 3VEOA 5ADXH 4A61A 3HI0A 1MDUB 3L4IA 1MWKA 3FZHA 2NRHA 3UKRA 4BQZA 2QWQA 4H5VA 1HJOA 1BOTO 3AAQA 2QM1A 4FWMA 1K8KB 5EVZA 4MLHA 3O80A 4BG9A 4PL7A 4J8FA 1QQNA 3ZX3A 5BRDA 4QS7A 3ZEUB 4BGBA 3GOIA 4EHUA 3R6MA 4K42A 2Q2RA 3EN9A 3MCPA 1HLUA 3WXIA 1Y64A 5BPLA 3MN5A 2ASMA 5I9EB 3FE1A 3FLCO 3VGLA 3UKUB 3VEWA 3HM8A 2PAVA 1NGGA 3LDPA 3WEEB 5AQYA 4GY2B 1HPMA 3A5LC 2OANA 4BRMA 5AQVA 4ISEA 3A8YA 3CJ9A 3GDQA 2F9TA 3ULEB 5EXWA 5AQXA 2E2OA 5F2RA 1C0GA 5AQMA 1CZAN 4PKGA 4XH1A 1GLBG 4BRPA 2I7NA 2A42A 4XEIA 3UE5A 1TUUA 1E4GT 4FWQA 4EFHA 1NWKA 4WQ4C 1HKCA 4CZFA 3MN9A 3FZLA 1NBWA 2P9SA 3LDNA 4BRFA 2ZF5O 2HF3A 2Q1NA 3HZ6A 3CHWA 1GLFO 5AQRA 2HF4A 5AZJA 3WXJA 2YJEA 4IJAA 4BRKA 5AQUA 3I33A 4FO0A 3O6WA 1D4XA 5TKYA 4H0YB 5JMVA 3VGMA 5BR9A 1GLEG 1HX1A 5F1XA 3C7NA 3QFUA 2DPNA 4DHYA 4FOIA 5BREA 2Q97A 3W0LA 1KAXA 4BRIA 3DXMA 1BG3A 3KHYA 3DXKA 4XH4A 4YDUC 3UB5A 4ISFA 4BRNA 1V4TA 2FSKA 3C0BA 2GWJA 4WYBA 1QZ6A 5BRFA 3BF1A 3VEVA 1BWFO 2CGKA 3JXUA 3R8EA 2P9IA 4FWKA 3I8BA 3H3OB 2AP1A 3CJ1A 3IFRA 1V4SA 2HOEA 1ESVA 4CZJA 2E88A 4EHTA 1NLVA 1JCGA 3O8MA 2VWBA 1DGKN 3CQXA 3VF2A 1SQKA 3QFPA 4BR9A 5JLFA 5AQSA 3IUCA 1LOTB 4JN4A 3LM2A 1ATSA 1NM1A 4CZLA 3D2FA 5EOYA 3FGUA 4WQ5C 3WQTA 4BRAA 4BC4A 2WUSA 3J8AA 2P9PA 4IZ9A 1BU6O 1ZC6A 2NLXA 3VPZA 3ENOA 4WQ4A 3WXKA 4B1UB 5AQQA 2YCHA 3IMXA 3A5OC 1NGEA 3CJAA 5E84A 3VENA 2P9SB 1GLDG 1Z05A 4B1VA 3G25A 1NGIA 2P9UA 4BRCA 4CZMA 2P9LA 2CH6A 1P8ZA 1XQSC 2FXUA 1Z6RA 5AZJB 5BN9A 1LCUA 4FWNA 1S3XA 3B8AX 4RCHA 5AQLA 3U4LA 3GBTA 4EIAA 1U2VA 3C7NB 4H5TA 4BREA 1NGCA 2FLOA 1OKJA 4JNEA 4K43A 4H5RA 4CBXA 4YDUA 1GLJO 2Q0RA 3WXLA 1NGBA 2P9KA 4IJNA 3QB0A 4LC9B 2QWLA 1HUXA 3S41A 5KPTA 3M1FA 3WUHA 5F0XA 2VCPA 3LM9A 2ASOA 4FPAA 3CJBA 4BRDA 4JHDA 3TPQA 3D2EA 2BTFA 3HTVA 3ATVA 2P9IB 3H46O 3A0IX 1X9JA 1YAGA 2YJFA 2V51B 2F9WA 3A5MC 2A40A 1BA0A 3DWLA 4H0PA 3VF6A 3ZX0A 2E2PA 5BRHA 3VETA 1KAZA 4BROA 1E4FT 3QDKA 1T6CA 1U6ZA 5FPEA 1TUYA 4O5FA 4M63C 3CETA 4BC2A 4CZIA 3VESA 1NGDA 1GLAG 3LDOA 2ITMA 4WQ5A 1YUWA 3LDQA 2P9NA 3FR0A 3ZX2A 2YHWA 4H0VB 2FSNA 5EY4A 2YI1A 4I6MB 3ZETB 1ATNA 5AFUA 4FSVA 3CERA 2V7ZA 4H03B 4K41A 4MLEA 3SMPA 4BC3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8DB 5BPNA 3PIOL 4CZEA 4IFVA 1QSLA 3TSUA 2E2QA 4B1YB 4CBWA 4CZKA 1B3CA 3G10A 2ZE2A 3PX6A 3UKRB 2AA4A 2RF2A 1ICAA 4K8XA 1KTQA 2P9UB 5GAEP 4DF4A 4W5TA 4RW7A 1YHQN 5JVHL 4DFMA 4PL8A 1X1PA 1LWFA 1J9AA 2C1GA 4RG8A 1NG9A 5FPDA 4F2SA 2E1ZA 3O4WA 2A41A 4JAXA 3VEZA 1OH8A 3ZT4A 4PUOA 5C10A 3DRSA 4KTZA 4CERA 1MA9B 2D56A 2E6LA 3MN7A 4E0DA 4BGAA 3J7AP 3DLRA 3LL3A 2WONA 4HTUA 3O5BA 2HBMA 3ATUA 4M7XA 4OJRA 4NB4A 3AVKA 1NRAA 1QQOA 3ITHA 1VSEA 2Q31A 2QK9A 2IDOA 5KGXA 1QE1A 3E9OA 1WUAA 1WLJA 4HHFA 3WNHA 4K0KK 1IBLK 4IEIA 1N5YA 4FJ7A 3CMAN 4JD2A 2OA8A 2BANA 1VHXA 3QBXA 4YOWA 4CF9A 1HKBA 1RDDA 4H5NA 1U4BA 4CK1A 4BVPA 3I0RA 5J2NA 2W6KA 2W40A 1DEJA 2VQEK 4NCAA 2D5RA 3U9ZA 1BI4A 3SJHA 2PBDA 1NK6A 4M3XA 2KGQA 3FZFA 4B3RK 3DXKB 4KREA 4RW4A 4JS4A 3QMLA 4IOCL 1RT5A 1KFDA 4KH5A 4JI2K 5J2MA 4DFKA 2E20A 1XC3A 3THVA 1JCEA 5LJVA 2NY8X 3KC6A 3KJVA 4FLUA 4BR4A 1I94K 2F8SA 1ZBFA 5CYQA 3L6QA 4AHSA 3MECA 4M3RA 3THXA 1J5OA 2E4LA 3PO4A 4CD3A 4LF4K 1OVQA 2ZWHA 1WSGA 1JL2A 5MLCQ 2HHUA 3LDLA 2QW9A 3NBPA 3H45C 3OA9A 1S22A 1N34K 2D0PA 3D2FB 4UJ0A 3LAKA 3MDQA 1JCFA 3O9QA 4IFYA 4DTRA 1T6DA 4HWIA 2YHXA 3CQYA 2YIPA 2YKMA 1OMYA 4JKHA 4LD0A 4JYAK 3CFRA 1PX9A 3K2PA 2IVPA 3VQEA 4JKCA 1SAZA 3QEIA 3KOWA 2QXFA 3CMEN 4DSKA 4JD2B 1JXEA 2DTUA 1WOQA 2N69A 3VQQA 1VQ6N 3RRGA 1C1AA 4FWOA 5GIOA 4DV2K 4F3OA 1SN1A 1BI4B 3NF9A 4XH5A 2NRZA 3UKUA 3NF6A 1IG9A 3SQ1A 3MMVA 3H6EA 2HMIA 3WEEA 2GELA 2W6LA 3VQBA 5LY3A 1NNEA 1WAJA 3IG1A 3K0SA 2N2QA 3QERA 1NJYA 1X9WA 4CESA 2B4JA 5M1OA 2A1RA 3TAQA 1VSDA 1SN4A 5FRMA 4BRLA 4DV6K 3AARA 4WF9L 3CI5A 3K5MA 2IVOA 3T1AA 4IO8A 1F21A 3M8PA 3HOSA 3MX2A 3THXB 2RHKA 3ID8A 4BVOA 3G0ZA 3ZSZA 4E89A 1VNBA 1KRPA 2PYJA 2J4RA 4AQYK 5KGWA 1L3UA 3H3NO 1I2UA 3HXMA 4JI7K 3RMCA 4CIGA 5FLXO 3CD6N 2O8BA 1VQ5N 4IDHA 2GTDA 1M1KO 2FF6A 4JV5K 4CHQA 1L5UA 3EKSA 4H0TB 1CLQA 2HHQA 1SS6A 1A5XA 1DJTA 4IXCA 3VEOA 1SUQA 1MWKA 3HVTA 5JS1A 3QESA 5DMRA 2QM1A 4FWMA 3NVMA 3SNNA 4MLHA 4A5BA 1RT2A 3LPTA 4FVUA 4NCGA 3P5JA 2P51A 5BRDA 4FLYA 4KHQA 4ID1A 4BGBA 4EHUA 4O8UA 3PSIA 2DY4A 5BPLA 3E9PA 2ASMA 1RDUA 2ATQA 4OPHA 3AVLA 4CHZA 3FLCO 3VGLA 3SUOA 3UKUB 3KK7A 1MYNA 1HPZA 4LY7A 1QS4A 2YILA 3KP1A 4CJRA 4CJTA 3WEEB 3Q7BA 1ZYQA 3A5LC 4BRMA 1NK0A 5A2QO 3CJ9A 2F9TA 3ULEB 5AQMA 3T69A 4JKAA 1CZAN 2D0AA 2I7NA 2M8BB 5I3UA 4M3ZA 4I9LA 1NWKA 4WQ4C 3MAQA 3CC7N 2P9SA 1OVYA 4BRFA 2ZF5O 1NPIA 1JKZA 1FKPA 3PIPL 3S3OA 4CCHA 4NXNK 4KAZA 3CW4A 3WXJA 1VSIA 3T1YK 4FO0A 3O6WA 1D4XA 1IKYA 2O8BB 2NRWA 4H0YB 5JMVA 4DSFA 2UUAK 1GLEG 2MBKA 5FDLA 3AO1A 3C7NA 5T7BA 4EZ9A 3V9SA 4FOIA 4RW6A 1KAXA 1TKTA 3ZSRA 4FJMA 1BG3A 4B08A 4UAEF 2B6AA 3VEVA 1BWFO 4DR4K 4O0JA 2LI7A 4CFCA 3L2VA 4JKBA 3R8EA 1ZBHA 3OYKA 5KK4A 3VQ5A 1EXQA 1NJIO 4H8KA 3DMJA 2HVHA 3QO9A 3PO5A 5SZTA 5GIPA 1V4SA 3KOYA 2OYQA 2E88A 4FM2A 2VG6A 3CQXA 3VF2A 1W0HA 4NXMK 1NJXA 3QFPA 1DQ7A 4BR9A 5JLFA 3G4SN 4JN4A 4DV1K 3KP0A 4EZ6A 4JI8K 4Z4IA 2KTQA 1ATSA 1N36K 1HQEA 3TTFA 4FK0A 1S1UA 1RCHA 2WUSA 3AVNA 3C6UA 1FH3A 1UOCA 4FCYA 1EKEA 4IZ9A 3SQ0A 3VPZA 3OYMA 3HYFA 3KLGA 4WQ4A 3EEQA 3WXKA 4B1UB 4L8RB 4BDPA 3A5OC 5E84A 1ILYA 3VENA 2P9SB 2YNIA 4HVJA 4B1VA 1ZBIA 4JKGA 4E7JA 4CZMA 3HT3A 3T3FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2O8D B;  5BPN A;  3PIO L;  4CZE A;  4IFV A;  1QSL A;  3TSU A;  2E2Q A;  4B1Y B;  4CBW A;  4CZK A;  1B3C A;  3G10 A;  2ZE2 A;  3PX6 A;  3UKR B;  2AA4 A;  2RF2 A;  1ICA A;  4K8X A;  1KTQ A;  2P9U B;  5GAE P;  4DF4 A;  4W5T A;  4RW7 A;  1YHQ N;  5JVH L;  4DFM A;  4PL8 A;  1X1P A;  1LWF A;  1J9A A;  2C1G A;  4RG8 A;  1NG9 A;  5FPD A;  4F2S A;  2E1Z A;  3O4W A;  2A41 A;  4JAX A;  3VEZ A;  1OH8 A;  3ZT4 A;  4PUO A;  5C10 A;  3DRS A;  4KTZ A;  4CER A;  1MA9 B;  2D56 A;  2E6L A;  3MN7 A;  4E0D A;  4BGA A;  3J7A P;  3DLR A;  3LL3 A;  2WON A;  4HTU A;  3O5B A;  2HBM A;  3ATU A;  4M7X A;  4OJR A;  4NB4 A;  3AVK A;  1NRA A;  1QQO A;  3ITH A;  1VSE A;  2Q31 A;  2QK9 A;  2IDO A;  5KGX A;  1QE1 A;  3E9O A;  1WUA A;  1WLJ A;  4HHF A;  3WNH A;  4K0K K;  1IBL K;  4IEI A;  1N5Y A;  4FJ7 A;  3CMA N;  4JD2 A;  2OA8 A;  2BAN A;  1VHX A;  3QBX A;  4YOW A;  4CF9 A;  1HKB A;  1RDD A;  4H5N A;  1U4B A;  4CK1 A;  4BVP A;  3I0R A;  5J2N A;  2W6K A;  2W40 A;  1DEJ A;  2VQE K;  4NCA A;  2D5R A;  3U9Z A;  1BI4 A;  3SJH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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