3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
2E1YA 4FPAA 5AZIA 2AA4A 5KPTA 3VESA 3TPQA 2E20A 5BREA 3HTVA 4ISFA 4H0TB 4CZKA 1GLFO 4CZMA 2P9UA 1HKCA 5AQRA 5AQHA 1LCUA 1NGIA 3M3ZA 3H3OB 3KVGA 2IVPA 3U4LA 3FLCO 3AAPA 4EHUA 2P9IA 4JAXA 3VGKA 4BRNA 2P9PB 1BO5O 3QFUA 2QM1A 3IMXA 3WQTA 1ATNA 3D2FA 2D1KA 1R59O 3D2EB 1DGKN 1NLVA 1NWKA 3H1QA 1DKGD 4K43A 4L3QA 4XEIA 1KAYA 3ULEA 4IJAA 2W41A 3MN9A 3O80A 4YDUC 3L6QA 3CETA 1XC3A 4CZLA 4BROA 3QBWA 4C23A 1BG3A 3ZEUA 5AZJB 3UKUA 4H03B 1QZ6A 4BR2A 5KPRA 1MDUB 3MCPA 3CJCA 1IG8A 1WOQA 2P9PA 2F9TA 2D0OA 3CJ1A 3JXUA 1TUUA 2J4RA 4QS7A 4BR9A 5BPLA 3FGUA 4B1ZA 2FSJA 4JD2B 4BRKA 4E1JA 3WXLA 3ENHA 3EKUA 4BRHA 4IXCA 2GWKA 5AQYA 4Y0WA 4BVPA 2A6AA 1S22A 5EVZA 3O5BA 4FWLA 3LDNA 5BN9A 1GLAG 1X3NA 4FWKA 1Q18A 3VF4A 2QWOA 4XH1A 1NM1A 4A62A 3LDLA 3A5NC 5ADXH 3A5OC 3ID8A 4BGBA 1Z05A 5AFUH 2E88A 2A42A 4FO0A 2WUSA 4PL7A 4FWNA 1GLDG 5F2RA 2CGLA 2Q2RA 1HKBA 2P9NA 4O5FA 5LJWA 2P9KA 5AQIA 2A3ZA 4WQ5C 3WXJA 4BRGA 5FPDA 3EN9A 1KAXA 2A41A 4B1UB 1MWMA 5LJVA 1ZBSA 4RCHA 4CBUA 3A5MC 5JMVA 3QMLA 4Z94A 3CERA 3BF3A 4PL8A 2QWMA 5BPMA 2I7NA 3BUZB 3MK6A 4I6MB 4EAHD 3U9DA 2BTFA 3VETA 4EIAA 4F9OA 2NRHA 5F1XA 3CJBA 5AQPA 1GLLO 3CHWA 2YI1A 1TYQA 4GNIA 3MN5A 3HZ6A 2QWNA 3HI0A 4BC5A 3GL1A 1MWKA 1S3XA 1NGCA 5CE3A 2P9SA 4FWSA 1G99A 3LDOA 3IDHA 3CJAA 4JHDB 3M6GA 2QWLA 2ASMA 3UKRB 4H5WA 3G25A 3FE1A 5AQTA 1YAGA 4A2AA 1HJOA 1RFQA 3H1VX 2PBDA 4FWOA 3O1WA 4MO4A 4H0VB 2FF6A 5AZIB 4LC9B 5F0XA 5JLHA 1GLJO 5AQKA 1NGGA 1RDWX 4FOIA 1NGBA 2YCHA 1NGDA 3VGMA 3HBTA 3DXMB 5AR0A 4H0OA 2AP1A 3L4IA 1P8ZA 4WQ4A 3SJHA 3I8BA 4WQ5A 4WYBA 5AQVA 1BWFO 1K8KA 3CIPA 4CBWA 2E2OA 4DQ8A 3IFRA 1NGEA 3KHYA 2A5XA 2GTDA 1JCFA 1U2VA 4BR4A 1C0GA 1E4GT 3L0QA 2VCPA 4BGAA 3OHRA 3S41A 1XQSC 3EKSA 2Q0RA 2P9LA 4MLEA 5EOYA 5B8HA 1X9JA 3H3NO 2CH6A 3DXKA 2CGKA 2A40A 2Q31A 5JICA 4BC2A 3VEYA 1HPMA 3VENA 3GE1A 3MN7A 4CZEA 3VERA 3WT0A 4H5NA 4QS9A 1QQNA 4HWIA 3TU5A 5LY3A 3A8YA 3ZETA 3WXIA 4H0PA 2Q0UA 4BRDA 3O08A 2IVOA 5E26A 1KAZA 1C0FA 2E2NA 1HX1A 2ZWHA 2OANA 3CJ9A 3UE5A 5EXWA 1H1VA 5AZJA 1E4FT 5AQNA 2CH5A 3RSEA 1YUWA 5AQJA 2CGJA 3QDKA 4MLHA 3DWLA 3MDQA 4K25A 4DCHA 3A0IX 5ELZA 1XUPO 3LL3A 4CZHA 2E2QA 5ADXA 3AARA 3H6EA 4DHYA 2QW9A 4H5RA 5AQWA 3FZKA 2VYPA 2IVNA 1BA0A 1GLBG 2E1ZA 4CI6A 5AQFA 4NO7A 1ESVA 3O8MA 2NZTA 4PKGA 1X3MA 2VWBA 3BEXA 4PKHA 4WQ4C 2FXUA 3LM9A 3QBXA 3GBTA 4BR0A 4B1XB 5AQXA 3A5LC 1ZC6A 5JLFA 4H0XB 2Q97A 3ZX2A 3WXKA 2FF3B 4BRFA 3WUHA 4JNEA 1RGIA 3DJCA 3VOVA 5AQSA 3U9ZA 4M7YA 2QXLA 3O4WA 1NMDA 2F9WA 1V4TA 2HOEA 4B1VA 2YJEA 4EHTA 1V4SA 2KHOA 3KZBA 3QB0A 2EWSA 2PAVA 3R6MA 1HUXA 5AQZA 3EL2A 4QS8A 3IUCA 4FWQA 4FOEA 3D7EO 4RTFD 3JS6A 3R8EA 2V52B 4JN4A 4RWTA 3EZWA 4A61A 1NBWA 5AQQA 3HM8A 3LDPA 4JD2A 1T44A 5EX5A 3VGLA 4AM6A 3D2EA 5AQUA 5AQMA 4ISGA 3VF6A 4B1WB 3SMSA 2W40A 1GLEG 3CQXA 1NGHA 2I7PA 3BP8A 3UB5A 1NGJA 4NB4A 4FPBA 4FWPA 3UKUB 1ZXOA 4FWRA 1YVNA 4BRPA 2YHWA 5FPMA 3O6WA 2Q1NA 5TKYA 2QWQA 1SAZA 4IJNA 1HLUA 3W3DA 3C0BA 2D4WA 2UYTA 3ULEB 4BRMA 1QHAA 3CI5A 3VF2A 2ZGYA 1BOTO 2ZGZA 3CJ7A 4FWMA 2NLXA 5FPNA 3GOIA 2ZF5O 3ZX0A 4BRCA 2HMPA 4XH4A 3D2FB 3BF1A 3B8AX 2Q36A 2P9SB 1LOTB 3F9MA 4IZ9A 3ZETB 2P9IB 3VEWA 4FL9A 4FSVA 4BVOA 4CZIA 2GWJA 1U6ZA 2E8AA 2FSKA 2FSNA 2QWRA 5BN8A 4M7XA 3VEOA 3VEVA 4CZJA 1TUYA 3DXKB 1NGAA 2DPNA 4CZGA 4J8FA 1CZAN 3WEEB 3AY9A 3O1BA 1BA1A 4AM7A 2HF3A 2P9LB 5E84A 1QQOA 1GLCG 4BQLA 3FZLA 4M63C 3C7NB 4K42A 3MN6A 4PKIA 2ITMA 5BRDA 2P9NB 5I9EB 1U2VB 3ENOA 3H46O 1D4XA 3GDQA 1ATSA 2GELA 2GUPA 3FFKB 2YJFA 4BR5A 1YXQA 2IIRA 3MMVA 3FZFA 4BG8A 4CJ7A 2V7ZA 4IO8A 1SQKA 1MA9B 1BU6O 2ASOA 4XH5A 3VEZA 4B9QA 4GY2B 1DEJA 3ATVA 4CZFA 3DAWA 3LM2A 1Y64A 3ATUA 2V7YA 1SZ2A 4A2BA 4H5VA 1KXPA 5KQ8A 3SLCA 4BQZA 4HTLA 5BRFA 3R9PA 1BUPA 3U8XA 3WEEA 3P4IA 3FR0A 3RSEB 4BREA 1QZ5A 2YHYA 4JHDA 3UKRA 3J8AA 3M1FA 5EY4A 2FLOA 4BC4A 1QQMA 2ASPA 1T6CA 4BRIA 4BR7A 4CD1A 3LDQA 2QWPA 3I33A 4B1YB 4BRAA 3ZX3A 1TYQB 4YDUA 2V51B 3HSCA 5AQOA 2YHXA 4KBOA 3CQYA 3EO3A 4I6MA 3ZEUB 4DB3A 5KQDA 5KPZA 1WUAA 1IJJA 1EQYA 2H3GX 1JCEA 3SMPA 4BC3A 3H45C 1HKGA 2D0PA 4K41A 1ATRA 2BUPA 3SK3A 4BRLA 2GEMA 2P9KB 5BPNA 1NGFA 4H5TA 4EFHA 1Z6RA 4BG9A 3AAQA 5AQGA 3FZMA 4H0YB 5AQLA 2E2PA 1K8KB 3W0LA 3FZHA 3VPZA 1J6ZA 1T6DA 2HF4A 4O8KA 5BRHA 3VEXA 1OKJA 4CBXA 3QFPA 5FPEA 3DXMA 4MO5A 5BR9A 1JCGA 5AFUA 4CD3A 4ISEA 4BRQA 2P9UB 1BDGA 3GG4A 3WQUA 3QICA 3C7NA 4IWVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E1YA 4V19S 4Z4IA 1KLMA 2LT8A 3N4PA 4JI7K 3AA5X 2E20A 4ISFA 2W6KA 1ZBFA 3KP1A 4CZKA 1WAJA 4CZMA 4R5PA 1HKCA 1YTUA 3NHGA 3QO9A 1NGIA 3M3ZA 3H08A 3H3OB 1I2UA 4EHUA 4JI0K 3VGKA 4FJ9A 3OYBA 2BE2A 2P9PB 2B6AA 4CJ3A 4NLBA 3IMXA 2QM1A 4DSKA 1ATNA 2D1KA 1R59O 3D2EB 1DGKN 2KLAA 3K5LA 2F8SA 3PO5A 1NLVA 3H1QA 1DKGD 1CZ9A 4OPJA 4DQQA 2YV0X 2ZE2A 1POIA 4L8RB 1BCGA 1EO1A 3V9UA 3I55N 2ATBA 3CF5L 4ELVA 4CEDA 3AVLA 3UKUA 3NH1A 1VRTA 3TR8A 3MCPA 3OBYA 4Z4CA 4FW2A 2WBNA 4B8AB 1X9WA 3L56A 1WOQA 4O0IA 1Q81O 3BZKA 4B08A 3CJ1A 1TUUA 3K57A 1TKXA 5J2NA 3T19A 4YY3K 1HNZK 3MWPA 1ZYWA 4FM0A 3E66A 1BIUA 4HCCA 3E01A 4IFEA 4R79A 4QAGA 4DLGA 2HNDA 1GLAG 1HPZA 1X3NA 4CJEA 3P83D 1Q18A 3VF4A 1NM1A 4A62A 3CCLN 5HLFA 1K6YA 1R0AA 3ID8A 2K35A 4BGBA 1Z05A 1BCOA 2P1JA 1WWNA 4KHWA 3K9JA 1OZZA 1KSPA 3NVKA 4XJXA 5F2RA 3ITHA 3D45A 3T1YK 2CGLA 1NU0A 3CC7N 4M3RA 2LKBA 2P9NA 3OYJA 5LJWA 5AQIA 2HW3A 5M1NA 1UA1A 3U3GA 3EN9A 1EP4A 3VA3A 5LJVA 1ZBSA 5JMVA 1Z25A 4DS5A 1KVBA 3QMLA 4Z94A 3T69A 2N2RA 4PL8A 4JKDA 2QWMA 4B9VA 2NRHA 1C6VA 1C1CA 4KHQA 2D0AA 1GLLO 1TYQA 1NJWA 1N36K 4CEAA 4Z4FA 4I7FA 5CE3A 3RMDA 1LQIA 3CCMN 5C2DA 2RPIA 1RT4A 4H5WA 2ZM6K 5AQTA 1YAGA 3DOKA 5FLXO 5GIPA 4KHPK 3OYDA 4DF8A 1KRPA 4FJNA 1B3CA 2E2FA 5I42A 5F0XA 4LD0A 3KWIA 1DTTA 5JLHA 4DTNA 1GLJO 3AA4A 2F7TA 1LW0A 4FOIA 1NGBA 3TSPA 2IAJA 1JLEA 4GMJB 1SKSA 1VSEA 1LW2A 2OPSA 4G1QA 5AR0A 4ILJA 3L4IA 3AV9A 1DQ7A 1UOCA 3T3FA 4UQGA 3SQ0A 3CIPA 3QI7A 5KGXA 1KV0A 2E2OA 3OYFA 1S9EA 4CJKA 3OJSA 1ZBIA 2G2KA 5DK5A 1BI4B 1NKCA 1C0GA 1E4GT 3CCRN 5GAHP 1NRBA 3SF4D 3ENBA 2YNGA 5EOYA 3V6DA 1X9JA 4CF1A 3KLGA 3SQ4A 2Q31A 3MN7A 4M41A 3WT0A 4H5NA 4DQIA 4HWIA 4FJLA 2ATQA 3A8YA 1Q86O 3WXIA 4Y1CA 3O08A 3P38A 4LF8K 1JXEA 1W0HA 2E2NA 3M5RA 1LAVA 2ZWHA 3CJ9A 5EXWA 4JKGB 2CH5A 2IS3A 1T7EA 5AQJA 1OH5A 2XRIA 4FJIA 4GKJK 1N32K 3DLBA 3SJJA 1RBUA 4K25A 4DCHA 1KVCA 2KGQA 3C95A 1DTQA 1NJYA 1ICAA 3TAMA 1NJXA 2E2QA 5H1SQ 4DTRA 3FZKA 1BA0A 3K5OA 1BQMA 3TTDA 3CCVN 3MXJA 1VQ6N 3P5JA 4CI6A 3K5NA 4CEBA 3RRHA 5MLCQ 2ASCA 2G8KA 4KTQA 1X3MA 4PKHA 3OY9A 1CZBA 1XC9A 3GBTA 4BR0A 2G8WA 4B9NA 3L2QA 1HQUA 3KIOA 3WXKA 1JZBA 2BGGA 4JNEA 3ALYA 3PO4A 1L3TA 3OA9A 4CK3A 1NG9A 3VOVA 4B3RK 3U9ZA 2FBYA 2QXLA 3SAHA 4FJ5A 3O4WA 1RT3A 4RW4A 3E9PA 3OBWA 2HOEA 4B1VA 2VY6A 3OW2M 3KK3A 4OX9K 3KZBA 3QB0A 1GPTA 4U67L 1HUXA 4J2EA 5AQZA 4FWQA 1ZU3A 3D7EO 3HPOA 3LANA 1JLGA 3R8EA 2D0CA 3CPEA 2V52B 3J81O 3Q7BA 4JI6K 3BGRA 3EZWA 4LY7A 4IOXA 3SAGA 4LSLA 3K59A 1QSSA 4FLWA 1U04A 4B3OA 2ETJA 2W42A 1RTHA 1ZYQA 3CQXA 5HBMA 1Y97A 2I7PA 3BP8A 1NNEA 1HNWK 3UKUB 4FLVA 1CXQA 4DTUA 5KK4A 4FW1A 1YVNA 1NJZA 1ZBLA 1RBVA 3F5TA 4CJRA 3OYAA 1K73O 1K8AO 1T0ZA 3C0BA 1RT6A 3KK7A 4W5OA 2WONA 4NYFA 1QVGM 3I0SA 4KYPA 2XY8A 5FDLA 5C42A 1KTQA 3DLHA 3BF1A 3CMEN 4RG8A 4YOUA 3F9MA 5SWMA 2O8CB 5LMUK 4ELTA 4FK4A 4IZ9A 4CK2A 3TSUA 5IWAK 1OH7A 4DSJA 1P0AA 3VEWA 1N6QA 4FL9A 1OVYA 5C24A 3VQ8A 4C1NK 4CZIA 4YFUA 3VQ7A 2FSKA 4JKCA 3VEOA 4M7XA 1G15A 4CZJA 1NGAA 5EU7A 2HVIA 4J8FA 3J7ZO 1CZAN 3V9WA 3AY9A 5M1OA 4UJ0A 5E84A 4W5RA 4E7LA 4B9TA 4CF9A 3J7YP 4CEOA 3MN6A 4CJSA 4DTMA 5BRDA 2NRZA 3H46O 4C8OA 2GELA 4KB0A 2YJFA 1WSIA 3ZT1A 1VQ8N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E1Y A;  4V19 S;  4Z4I A;  1KLM A;  2LT8 A;  3N4P A;  4JI7 K;  3AA5 X;  2E20 A;  4ISF A;  2W6K A;  1ZBF A;  3KP1 A;  4CZK A;  1WAJ A;  4CZM A;  4R5P A;  1HKC A;  1YTU A;  3NHG A;  3QO9 A;  1NGI A;  3M3Z A;  3H08 A;  3H3O B;  1I2U A;  4EHU A;  4JI0 K;  3VGK A;  4FJ9 A;  3OYB A;  2BE2 A;  2P9P B;  2B6A A;  4CJ3 A;  4NLB A;  3IMX A;  2QM1 A;  4DSK A;  1ATN A;  2D1K A;  1R59 O;  3D2E B;  1DGK N;  2KLA A;  3K5L A;  2F8S A;  3PO5 A;  1NLV A;  3H1Q A;  1DKG D;  1CZ9 A;  4OPJ A;  4DQQ A;  2YV0 X;  2ZE2 A;  1POI A;  4L8R B;  1BCG A;  1EO1 A;  3V9U A;  3I55 N;  2ATB A;  3CF5 L;  4ELV A;  4CED A;  3AVL A;  3UKU A;  3NH1 A;  1VRT A;  3TR8 A;  3MCP A;  3OBY A;  4Z4C A;  4FW2 A;  2WBN A;  4B8A B;  1X9W A;  3L56 A;  1WOQ A;  4O0I A;  1Q81 O;  3BZK A;  4B08 A;  3CJ1 A;  1TUU A;  3K57 A;  1TKX A;  5J2N A;  3T19 A;  4YY3 K;  1HNZ K;  3MWP A;  1ZYW A;  4FM0 A;  3E66 A;  1BIU A;  4HCC A;  3E01 A;  4IFE A;  4R79 A;  4QAG A;  4DLG A;  2HND A;  1GLA G;  1HPZ A;  1X3N A;  4CJE A;  3P83 D;  1Q18 A;  3VF4 A;  1NM1 A; 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