3CJAA

Structure of rattus norvegicus ntpdase2 in complex with calcium and amppnp
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
426
structure length
419
Chain Sequence
PALKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYANDPSKAGQSLVRCLEQALRDVPRDRHASTPLYLGATAGMRLLNLTSPEATARVLEAVTQTLTQYPFDFRGARILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGRWIRPRKGTLGAMDLGGASTQITFETTSPSEDPGNEVHLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQILLRLLASALQIHRFHPCWPKGYSTQVLLQEVYQSPCTMGQSAIVSLSGTSNATLCRDLVSRLFNISSCPFSQCSFNGVFQPPVAGNFIAFSAFYYTVDFLTTVMGLPVGTLKQLEEATEITCNQTWTELQARVPGQKTRLADYCAVAMFIHQLLSRGYHFDERSFREVVFQKKAADTAVGWALGYMLNLTNLIPADLPGLRKGTHF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2
publication title Structural insight into signal conversion and inactivation by NTPDase2 in purinergic signaling
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Hydrolase
total genus 134
structure length 419
sequence length 426
ec nomenclature ec 3.6.1.5: Apyrase.
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjaA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3cjaA02
3ATVA 3MN5A 1V4TA 5AQLA 2IVPA 3RSEA 2ZF5O 3G25A 3ZETB 4BRMA 2CH6A 3KVGA 1QQOA 3LDQA 3WXIA 5E84A 4WQ4C 5AZIB 1Q18A 3QMLA 4XH4A 1RDWX 2W40A 2E1ZA 4FOEA 3FZLA 3CJAA 3D2EA 3CJCA 1GLDG 1EQYA 1XUPO 4BC4A 2GUPA 3ENHA 4Y0WA 1QQNA 1NM1A 1HLUA 2P9PB 4BRNA 2QXLA 3SMPA 5AQXA 5FPDA 5EXWA 3DAWA 3O6WA 3D7EO 5FPMA 1WOQA 3WXKA 2Q97A 4BRIA 5LJWA 4H0TB 3J8AA 4WQ4A 1QHAA 3O08A 5AFUA 3M3ZA 4O8KA 4FPAA 5AQYA 3I8BA 1NGHA 4A2AA 4FWPA 1HX1A 4CJ7A 1R59O 5EY4A 2V7YA 3AAPA 3ULEB 3MN6A 2FF3B 1U6ZA 4J8FA 5ELZA 4BRDA 3HSCA 5BN8A 4C23A 1S22A 4CZJA 3CHWA 4O5FA 4JD2A 3GBTA 5AQWA 2Q0UA 1KAYA 2FLOA 3WQUA 1Y64A 3HI0A 5AQNA 4CZGA 3EL2A 2GELA 4MO4A 1ATRA 3U4LA 4BQZA 5AZIA 3C7NB 2QWLA 3L4IA 1C0FA 5AQIA 4BRLA 1BDGA 4I6MB 3RSEB 2FSJA 4CZMA 5BPMA 1HKCA 4MLHA 4A62A 2HMPA 4LC9B 1TUUA 2AA4A 3VF2A 3A0IX 2P9PA 3WUHA 5F2RA 5JLFA 1X3NA 4RTFD 4BRCA 3D2EB 5BPNA 5TKYA 3FZFA 3WXLA 4XH1A 3DXMB 1NBWA 4CZHA 1NGDA 5AQMA 2P9SB 4H5NA 4FWQA 5FPNA 1XQSC 4M63C 3H46O 3H1VX 4CBUA 3SLCA 4M7XA 3GG4A 3QDKA 4FWLA 2GWKA 3ULEA 4WQ5C 3AAQA 4B1XB 2YHXA 1BG3A 4PL8A 3FZHA 5AZJA 3VGLA 2P9IB 1DEJA 4H5VA 3VESA 3WEEA 1TUYA 1TYQB 2FSKA 2PBDA 4CD1A 1MWKA 4H5RA 1NGGA 3AY9A 5AQQA 4FWMA 1QZ5A 4IZ9A 3EZWA 3VEOA 1S3XA 4AM6A 2H3GX 4FOIA 2EWSA 4HTLA 4FPBA 3U8XA 5BRDA 3I33A 2CGKA 2NZTA 3W3DA 2FXUA 5EOYA 2D0PA 5KQDA 4JD2B 5BPLA 5AQPA 3ATUA 1NGBA 2YHWA 4IO8A 4CBXA 4YDUC 4BR2A 3D2FB 3OHRA 4H5TA 3BF1A 3CQXA 4WQ5A 3VEXA 5JICA 4I6MA 5ADXA 4B1ZA 4IXCA 1KXPA 2P9KB 3QBXA 1SAZA 3O1BA 1GLEG 2A42A 2GTDA 2P9LA 2E1YA 4BGAA 1BU6O 3IDHA 3GOIA 1ESVA 2PAVA 3BEXA 5BRHA 1LOTB 3A8YA 1OKJA 4PKIA 5AR0A 3DXMA 1HPMA 3UKUB 5BN9A 4H0XB 4RCHA 1YVNA 2P9SA 4YDUA 5AQFA 3VOVA 1NGAA 1XC3A 4XH5A 1NGCA 2Q2RA 3A5LC 3CI5A 2W41A 4JHDB 5E26A 2F9WA 4H0YB 5AQHA 3U9ZA 2P9NA 2CGJA 1E4GT 3DJCA 3LDPA 2YJEA 2P9IA 3LDOA 3QB0A 3UB5A 2V7ZA 3DXKB 3M1FA 4DCHA 1TYQA 2QWNA 4JNEA 2CH5A 2E2NA 3IUCA 1JCGA 3R8EA 2ZGZA 2E88A 4CZLA 4K41A 5AQJA 3ZX2A 1HKBA 3HTVA 3LDNA 2HF3A 3L6QA 5AZJB 3VEYA 3GDQA 4FWSA 4WYBA 4BGBA 3WEEB 4BRPA 1WUAA 1X3MA 3CETA 5AFUH 4CZIA 2Q0RA 3UE5A 3UKRA 5BRFA 1NMDA 3FLCO 3WXJA 4BQLA 4M7YA 3D2FA 4B1VA 3MMVA 5AQUA 4Z94A 4BG9A 4FWRA 3EN9A 4BVPA 2P9KA 4HWIA 1GLBG 3FE1A 3MN7A 1IJJA 1T44A 4FSVA 3H6EA 4JN4A 4MO5A 3TPQA 4BRKA 2BTFA 3FFKB 2NLXA 3EO3A 4H0PA 4K43A 2AP1A 3UKUA 5KPTA 3O5BA 4H03B 2F9TA 2P9LB 3W0LA 2ASPA 4B1UB 2FSNA 1NGIA 3LM2A 2E8AA 4JHDA 1BA1A 4H0VB 4DB3A 1NGFA 4BRQA 3LL3A 2A3ZA 4IWVA 3ZX0A 3QFUA 3DXKA 3U9DA 3ZX3A 2YI1A 1E4FT 1BWFO 2QWPA 4FWOA 4H0OA 1JCFA 3VEVA 3H3NO 5B8HA 3EKSA 1X9JA 3O80A 2E2QA 2P9NB 3CQYA 4CZFA 3MN9A 3QBWA 3H1QA 4EIAA 3H45C 4BVOA 4KBOA 1V4SA 1YXQA 5F0XA 3KZBA 5AQGA 3ID8A 3FGUA 3A5NC 1QQMA 2D4WA 1HJOA 3CERA 3FZKA 4K42A 3FZMA 3VEZA 4BG8A 3MCPA 2ASMA 4BC5A 3M6GA 4FL9A 3SJHA 2ASOA 1C0GA 1T6CA 3FR0A 3UKRB 3JXUA 1IG8A 3HBTA 3VEWA 4BR0A 1K8KA 4FWKA 4BR4A 4BC2A 4DHYA 3ENOA 5LY3A 2HF4A 2QM1A 5AQOA 3EKUA 4FO0A 4K25A 3GE1A 3JS6A 1G99A 5KPRA 3R6MA 4PKGA 4QS8A 4A2BA 4CD3A 3VGKA 2ZGYA 2D1KA 5ADXH 4BRHA 4CZKA 3VPZA 3VETA 2QW9A 4BRFA 1LCUA 2OANA 1BA0A 4H5WA 5FPEA 1BOTO 4CBWA 2VWBA 5AQRA 2VYPA 4QS9A 3B8AX 5AQSA 3CIPA 3DWLA 4ISEA 3HM8A 2KHOA 4B1WB 1U2VB 1HUXA 2YCHA 2QWRA 2HOEA 1Z05A 3BF3A 1HKGA 1P8ZA 1GLLO 5KPZA 4NO7A 4IJAA 5BR9A 3WQTA 2YHYA 1QZ6A 1MDUB 3A5OC 5AQKA 1JCEA 2IVNA 2A5XA 4AM7A 1ZC6A 3AARA 3ZEUA 2GWJA 2Q36A 4IJNA 2BUPA 4ISFA 4EHTA 3QICA 2Q31A 3CJBA 2ZWHA 1DGKN 4JAXA 4BREA 3KHYA 4E1JA 1KAXA 2E2OA 4B1YB 3BP8A 3O1WA 4QS7A 1T6DA 1RFQA 4DQ8A 4FWNA 1K8KB 1NGJA 3MDQA 2GEMA 2Q1NA 1ATSA 4BR7A 3SK3A 1NWKA 4NB4A 5CE3A 3VERA 3IFRA 2QWQA 1ATNA 3O4WA 4L3QA 4PKHA 3TU5A 1GLFO 2E20A 2P9UB 2A41A 3ZETA 3H3OB 2UYTA 3IMXA 3CJ9A 2V51B 1RGIA 4EFHA 5BREA 3HZ6A 4BRAA 2WUSA 1U2VA 4BC3A 5LJVA 4CZEA 2NRHA 2FF6A 3R9PA 4GNIA 2E2PA 1KAZA 1ZXOA 3O8MA 4ISGA 5JMVA 2V52B 3CJ1A 5EX5A 2VCPA 1ZBSA 2CGLA 1H1VA 3MK6A 2QWMA 1DKGD 4BROA 4BR5A 2J4RA 3QFPA 4A61A 2A40A 1GLJO 1NGEA 4EHUA 2YJFA 2QWOA 3SMSA 1J6ZA 1GLCG 1BUPA 2D0OA 3L0QA 3ZEUB 4BR9A 3VGMA 4MLEA 1GLAG 5EVZA 2I7PA 2A6AA 1SZ2A 3VF4A 1NLVA 3S41A 1CZAN 5AQZA 3LDLA 4PL7A 2DPNA 3CJ7A 1D4XA 2IIRA 5JLHA 4XEIA 5F1XA 3LM9A 2IVOA 4RWTA 1YAGA 1YUWA 1BO5O 1MA9B 3A5MC 3F9MA 5AQVA 2P9UA 4CI6A 4F9OA 3C0BA 2I7NA 1Z6RA 2ITMA 3VF6A 3BUZB 1SQKA 3WT0A 5AQTA 3P4IA 4EAHD 4BRGA 4GY2B 3GL1A 3C7NA 5KQ8A 4B9QA 5I9EB 3VENA 1MWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5M1OA 2YHBA 3MN5A 3ZETB 4U67L 3OA9A 1GOAA 4BWJA 1QQOA 3HP6A 3LDQA 2G8FA 3THVA 3WXIA 5E84A 4FYDA 3PO4A 2E1ZA 4FOEA 3FZLA 5FDLA 3ZSXA 3AO4A 1EQYA 2RF2A 2BGGA 1QQNA 1HLUA 1L3SA 1IKXA 3SUQA 1UA1A 3EE9A 1OVQA 4JEPA 5C2FA 3DMJA 5EXWA 1MU2A 3DAWA 3CC2N 5DM7L 3KD1E 4DV4K 4OPJA 1WOQA 3V9UA 3TAMA 4H0TB 1JLAA 4CIGA 1QHAA 4BE1A 3O08A 5AFUA 3SUPA 1C0UA 4FWPA 1HX1A 3THXA 5J1EA 4GKKK 3WNFA 3HPOA 2XRIA 4YOTA 4J8FA 5ELZA 1IBKK 2O8FA 4ICLA 5BN8A 5HRRA 4JD2A 4KB0A 1S1WA 4GVMA 3QNNA 2E5LK 1Y64A 1OH8A 1TKXA 1BQMA 4OKEA 2X74A 2PYJA 5M1QA 3T19A 2IS3A 4WF9L 2HHUA 3PIOL 1BDGA 4I6MB 4JKFA 3DYAA 3RSEB 3SBTA 2FSJA 4CZMA 1KFDA 4DMNA 4MLHA 3J81O 4CJVA 4BY9C 1HNXK 1RTJA 4C8KA 3ASMA 1RT2A 4BRCA 3D2EB 2NRWA 1N6QA 1QTMA 4UY8O 1NBWA 5AQMA 3HXMA 1HNIA 4H5NA 3D45A 3ZSQA 3IRXA 5A2QO 3H46O 3NGYA 3C65A 3JAMO 2GWKA 3EYZA 5KGWA 1HMVA 3KK7A 1QHTA 1XI1A 2P9IB 3MEEA 4H5VA 4TSXA 3WEEA 1JLBA 3O9SA 4F3OA 1MWKA 2XO7A 2Z1GA 5AQQA 4HTLA 1BL3A 4JLHA 4OGEA 3C94A 1RCHA 2D0AA 3W3DA 4IDHA 5EOYA 1NU0A 1X9MA 4O8UA 4BR2A 3M8SA 4DU4A 3D2FB 4H5TA 2HHVA 3BF1A 3SQ1A 1QVFM 5JICA 4CFAA 4I6MA 4ILHA 4LH5A 4IXCA 4Z0UA 1T7PA 3OYIA 1GLEG 2GTDA 4K0KK 4BGAA 1BU6O 3IDHA 3TABA 3L3UA 5GAEP 1ESVA 3K0SA 2UUBK 1FXXA 3A8YA 4FJKA 1OKJA 4FW2A 5BR8K 5AR0A 1G15A 4CHNA 1LWEA 4WCEL 4W5TA 1TAUA 4H0XB 1K6YA 3KLFA 1GOCA 4YDUA 3G0ZA 1XC3A 1VQ5N 4BE2A 3A5LC 3CI5A 2P5GA 5E26A 4DSFA 3U9ZA 3THWA 1E4GT 2G8HA 1JL2A 4LF9K 4DFPA 2P9IA 3QB0A 3PUFA 1Q8IA 4KRFA 3K5OA 1VSHA 1B92A 4DV6K 3SZ2A 2RKIA 3TI0A 3AVAA 3HTVA 3LDNA 4E7IA 1EXQA 3VQ7A 1C1BA 4WYBA 4BGBA 1LW2A 1WUAA 4KV8A 1EO1A 3IS9A 3TAFA 3LALA 3HPHA 1NOYA 3FLCO 3WXJA 4EP4A 4M7YA 1WB9A 3D2FA 2FBXA 1WSIA 2BANA 4ID5A 2FBYA 4DLGA 1TK8A 3LPUA 1HRHA 1GLBG 3K9KA 3MN7A 4YNQA 5M1PA 2YNFA 1TKTA 1J5EK 3J7YP 4BWMA 4DV0K 1JKHA 1S1VA 3K9JA 3CCSN 1YT3A 4FJGA 3TTCA 2B4JA 3K2PA 3NE6A 2P9LB 3CCEN 3W0LA 4E3SA 4EZ9A 2ZJRL 2FSNA 1NGIA 2E8AA 4LF4K 4BRQA 1RTDA 1YI2N 2A3ZA 4GVEA 3DOKA 3T1AA 1RBRA 3ZX3A 4B08A 2YI1A 1RBTA 1NMNA 5B8HA 3EKSA 1ILYA 2E2QA 2X78A 2WOMA 4HTUA 4KHWA 4DLEA 4I2QA 4CF9A 4KHPK 4KBOA 3VQ4A 1XMQK 1YXQA 2BDPA 3KZBA 2BH1A 3F73A 3RR7A 3V81A 2HNYA 3U3GA 3FGUA 1QQMA 3CERA 3LDSA 4K42A 1YF5L 4ELVA 2F96A 4X62K 3MCPA 1UWBA 2ASMA 3E9LA 1FW6A 1RT4A 4AHCA 3HM9A 1LWCA 3SJHA 4FM2A 2KTQA 3D0PA 1C0GA 3CD6N 3UKRB 4IFEA 2VG6A 1U45A 3ENOA 3JYTA 4DR5K 2HF4A 1I39A 3KLHA 4O44A 3GE1A 1RT3A 4F3TA 5CR4A 4DF8A 2NUBA 5KPRA 4IG0A 4PKGA 4DV5K 2FC0A 1QE1A 2IDOA 1UAXA 3I0SA 2D0BA 1WNSA 3VETA 2QW9A 1KFSA 4ELTA 3K58A 2E6MA 3TSUA 4CBWA 3HO1A 5J2QA 4QS9A 1VRUA 4JRQA 3OYNA 3KK1A 1VAZA 5FRNA 3DWLA 4CEEA 5MLCQ 2ITGA 3ZSYA 1U2VB 4CJ5A 5J2PA 2QWRA 2RHKA 4CJQA 1Z05A 3LP3A 1GLLO 4Q5VA 3CC7N 4QOZB 1NJIO 3TAPA 4LF6K 4C1NI 3SNNA 3WQTA 4ID1A 3KKRA 5AQKA 2IVNA 2A5XA 2KFNA 1NJXA 4FJHA 4E1NA 2DTUA 2UXBK 3QEXA 3TAEA 4ISFA 3QIPA 3CJBA 3VA0A 4I9QA 3ZCMA 4CEBA 1O13A 4B1YB 3OYJA 3BP8A 2ZJQL 3NGIA 5GINA 1T6DA 4B3MK 2Y1IA 4DQ8A 3SI6A 3P31A 2Z1HA 4DFMA 2KKZA 4CJTA 3MDQA 4FZYA 1ATSA 3SK3A 4B8CA 1S1UA 1NWKA 2RN2A 4Z4FA 3MECA 4PKHA 4N56A 3AA2A 4I7FA 2P9UB 2B5JA 2UYTA 3CJ9A 4YORA 3MEDA 2V51B 1TGOA 4CJWA 3AVKA 4GV6A 4OKKA 4BRAA 2WUSA 2ZD1A 1U2VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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