3QFPA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) atpase domain
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
377
structure length
367
Chain Sequence
YGTVIGIDLGTTYSCVAVMKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDILPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 107
structure length 367
sequence length 377
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfpA04
4JD2A 2DPNA 1ATSA 3ULEB 1K8KB 1Q18A 1NGJA 5EX5A 3IFRA 1GLAG 3VEVA 1BDGA 1MA9B 4MO4A 3U9DA 4B1YB 3CQYA 1NGCA 2AA4A 3DXMA 3SK3A 4MO5A 5ADXH 4IJAA 3IUCA 2E2QA 2IVNA 2CH6A 1DGKN 3DXKB 2CGJA 4IZ9A 5AQXA 3FZHA 3BF1A 3UB5A 4B1VA 4H5TA 1NGIA 4BRIA 2KHOA 4PKIA 3SMPA 2I7NA 3L6QA 5BPMA 3D7EO 3VGKA 4CZJA 3VF6A 2P9IB 3FE1A 2YHXA 3DJCA 1HKGA 2A40A 5ELZA 3HBTA 2P9SA 2FF6A 1BWFO 4EHUA 5JMVA 2YCHA 4FWMA 3EKUA 3R8EA 3ZEUA 1NGBA 4DHYA 2D1KA 2VCPA 3MCPA 3VENA 3HM8A 3H46O 3RSEA 2FF3B 1ATNA 1X3NA 4H03B 1J6ZA 1DEJA 1QZ5A 1OKJA 4ISGA 3QB0A 1BUPA 3QICA 1HJOA 4YDUC 4FSVA 2QWPA 1S3XA 1JCEA 1U6ZA 4H0VB 1TUYA 1MWMA 1U2VB 3MMVA 3O1WA 5EVZA 4BRGA 1GLEG 2P9KA 1BG3A 2Q0UA 3VGLA 3VESA 3J8AA 2QW9A 3GL1A 5CE3A 3FZMA 3AY9A 3MN5A 4M7XA 4CBUA 3H3NO 3QFPA 1JCGA 3QBWA 3CJ9A 1KAZA 4JHDB 4BVOA 1ZC6A 1MWKA 3A0IX 5LJWA 3C7NA 3WEEB 1LOTB 2E2OA 3ID8A 4FO0A 3FGUA 4K25A 3W3DA 4I6MA 5AZJB 3LM9A 2FLOA 2E1YA 3UKRB 5F1XA 1YXQA 4FOEA 5AQFA 3DAWA 3O6WA 5BRDA 3VEOA 2NRHA 3CETA 4FWSA 4CZLA 5B8HA 5AQMA 2FXUA 2UYTA 2Q31A 3D2EA 1DKGD 1GLBG 2P9LA 4EAHD 4BG8A 3CQXA 4WQ5A 4BVPA 2A42A 2Q36A 2OANA 1NMDA 3KHYA 3ZETA 1RFQA 4KBOA 2YJFA 4GY2B 3MN6A 2CGKA 3EZWA 4DCHA 2P9UB 2J4RA 2V7ZA 3FZKA 4EHTA 1YUWA 3LDNA 2ASOA 1GLCG 5FPMA 4QS8A 4BRQA 4M63C 4B1ZA 5AQIA 1KXPA 1TYQA 4BRHA 2YJEA 3QBXA 3OHRA 3G25A 3LM2A 4EFHA 4BG9A 3GE1A 3HI0A 3MN9A 5LY3A 2ZGYA 4F9OA 3TPQA 3ATVA 2GELA 2E8AA 4WYBA 1X9JA 3IMXA 1G99A 2HF3A 4IWVA 3VEXA 4BRAA 2P9PA 4H5VA 4FWOA 5AZIB 1YVNA 4IJNA 3ZEUB 2P9NA 3ENOA 2AP1A 1SAZA 5KQ8A 2ASPA 4BR0A 2Q2RA 5AR0A 4BRNA 3A5MC 3FLCO 2FSNA 1C0FA 2W40A 3U4LA 3JXUA 4PKHA 1T6CA 3SJHA 4BGBA 4XH5A 2E1ZA 3ULEA 3VF4A 3DWLA 5EY4A 4H0OA 3A5OC 1ATRA 3JS6A 4EIAA 3GBTA 3O5BA 1H1VA 2P9KB 3LDLA 1Z05A 4BQZA 1QZ6A 3BF3A 5LJVA 3EL2A 5JLFA 5BRHA 3IDHA 1BA0A 1V4SA 4DQ8A 3DXKA 5AQGA 4K42A 3EKSA 1KAYA 1HPMA 1NGGA 1WOQA 4CJ7A 1BU6O 2IIRA 3BUZB 1TUUA 4JN4A 5AQJA 2P9IA 5BREA 2IVPA 5AQOA 4RWTA 4JNEA 1QHAA 4CD3A 4XH4A 3H45C 3VEZA 3SLCA 2GUPA 1BOTO 5BPNA 5AQHA 3M3ZA 3O80A 2E2PA 2QWLA 3D2FB 2YI1A 5AQKA 4IXCA 1P8ZA 3VEYA 2QWRA 3D2EB 1HKCA 5KPZA 4WQ4C 3BP8A 2P9LB 1XUPO 2A3ZA 1RGIA 5AQRA 4CBXA 1Z6RA 4L3QA 4CZFA 3A8YA 2I7PA 4BRMA 3O4WA 3HZ6A 4Y0WA 4H0XB 5BR9A 5AQVA 4B1WB 3WQTA 1SZ2A 3GOIA 1NM1A 1XQSC 2PBDA 1NGAA 3VEWA 4YDUA 1WUAA 3A5NC 1X3MA 3O8MA 2BTFA 3W0LA 4A61A 4JD2B 1U2VA 3LL3A 3MDQA 4A2AA 1HX1A 4RCHA 3CJ7A 3HSCA 2HOEA 1Y64A 1EQYA 3VETA 5KPRA 2YHYA 2ASMA 4DB3A 4H5NA 4J8FA 3KVGA 2VYPA 2IVOA 4Z94A 1QQNA 3O1BA 3CIPA 3FZFA 4FL9A 3LDOA 5BN8A 4H0PA 3DXMB 3BEXA 3QFUA 1QQOA 4B9QA 1E4FT 5AQTA 5AQQA 1ZBSA 2WUSA 2Q0RA 4BC4A 4PL7A 4K41A 3UKUA 2QXLA 4JHDA 3ATUA 3I33A 3H6EA 3WEEA 2P9NB 3ZX2A 4FPAA 4BC2A 2PAVA 1HUXA 1MDUB 3LDQA 4HTLA 2V51B 5AZJA 5TKYA 4BRCA 4BRKA 3I8BA 1NBWA 3A5LC 5F0XA 4LC9B 4BR2A 3VGMA 3QMLA 3WXIA 3R6MA 2A41A 2E20A 5BN9A 2P9SB 3CERA 3L4IA 4B1UB 1E4GT 5AQWA 4MLEA 3U8XA 3ZX0A 4FWKA 2QWOA 4CBWA 2ITMA 4FWQA 3ZX3A 5AFUA 5I9EB 4ISEA 4M7YA 4B1XB 3CI5A 2F9TA 1NGEA 1NLVA 5AQZA 2CGLA 3WUHA 2A5XA 3CJCA 3WXLA 3RSEB 2EWSA 2D0PA 2HMPA 2P9UA 4AM7A 1D4XA 3VOVA 2FSJA 1NGDA 5FPDA 3CJAA 3VERA 4BRPA 2E2NA 3CJBA 2GTDA 2CH5A 2V7YA 4BR5A 3TU5A 3MK6A 3HTVA 2ZF5O 2QM1A 5E26A 3O08A 1HKBA 3FR0A 1K8KA 1NGFA 1GLDG 4H5RA 3AARA 2GWJA 3QDKA 3CHWA 2YHWA 5FPEA 4BQLA 4QS7A 5JLHA 3EO3A 4O8KA 4RTFD 3VPZA 2VWBA 4E1JA 2QWMA 1NGHA 3FFKB 1CZAN 3R9PA 1BO5O 3AAQA 3EN9A 2H3GX 4CZHA 3LDPA 3U9ZA 4CD1A 3B8AX 1R59O 5AQSA 1YAGA 3UE5A 4BR9A 5AZIA 4JAXA 3H1VX 4QS9A 2V52B 4HWIA 3M6GA 4XEIA 5F2RA 1SQKA 2D4WA 4BR4A 3SMSA 5AQPA 2NLXA 3P4IA 3C7NB 4CZMA 2QWQA 3WQUA 3M1FA 2F9WA 1ESVA 4I6MB 4CZGA 3VF2A 2W41A 2ZWHA 5AQUA 3MN7A 5AQNA 1T6DA 3WT0A 3CJ1A 5AFUH 2D0OA 4FPBA 4FWPA 1IJJA 4CZIA 3WXKA 3KZBA 2HF4A 2E88A 4BRDA 1KAXA 5KPTA 3ENHA 3H1QA 3WXJA 5BPLA 1S22A 1NWKA 2A6AA 4WQ5C 5EOYA 4FWRA 3ZETB 2Q1NA 2FSKA 4IO8A 5E84A 5FPNA 1LCUA 1ZXOA 4H5WA 1GLLO 4A62A 5ADXA 2GEMA 4MLHA 3UKUB 4CI6A 1IG8A 3F9MA 2Q97A 1TYQB 3S41A 4BC5A 5EXWA 1RDWX 2GWKA 3GG4A 1GLJO 3H3OB 4BGAA 4BC3A 4A2BA 3C0BA 5JICA 4BRFA 1C0GA 4CZKA 1GLFO 4K43A 4CZEA 4O5FA 3GDQA 4NO7A 3D2FA 4ISFA 1XC3A 5AQYA 2P9PB 4BRLA 5KQDA 4FWNA 1JCFA 1HLUA 4H0YB 2BUPA 1T44A 4FWLA 4PL8A 4WQ4A 3L0QA 4PKGA 4NB4A 2QWNA 5BRFA 5AQLA 4BREA 4C23A 1V4TA 4XH1A 4FOIA 4BROA 4GNIA 3UKRA 1BA1A 2ZGZA 4AM6A 3FZLA 4BR7A 2NZTA 4H0TB 3AAPA 1QQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DPNA 4IBNA 1JXBA 1REVA 5GIPA 1EO1A 4CIEA 1KRPA 3AA5X 2HHIA 1NGJA 1L3UA 3C6HA 3VEVA 4CHOA 4DR6K 4CJTA 4MO4A 1VRTA 3I8DA 1C1CA 3HO1A 1TGOA 1I94K 3IUCA 2E2QA 3L2UA 4FJJA 3DXKB 1BI4B 3OW2M 5HRPA 3H08A 5D3GA 4ID5A 4CGFA 3E9PA 1RT5A 4B1VA 4FLTA 2UU9K 4Z4HA 4DTOA 1OZZA 3D7EO 1YT3A 4KHQA 4FJKA 2P9IB 1VK0A 2Z1JA 3P31A 1LW0A 3TABA 3CC7N 2ASCA 2FF6A 4Z0UA 1MYNA 3TTDA 4M45A 1NK6A 3ZEUA 3K0SA 1NGBA 3C65A 5H1SQ 3G10A 2YIOA 3VENA 4CK1A 4DUYK 3DLHA 3OA9A 4KHWA 1ATNA 5JENA 4NLCA 3RWUA 3L3VA 4YOVA 4DKWA 4BE1A 2KBHA 1QZ5A 4AILC 4E19A 1QVGM 1JCEA 3O1WA 4JYAK 2ZJQL 2HHXA 4WFBL 1KCFA 1ZBFA 4BRGA 2P9KA 3SYZA 2QKKA 3HPGA 3AVCA 3R2VA 3VESA 3B6PA 5GINA 3RR7A 2G8UA 3AY9A 2ETJA 4O55A 4IO9L 3NH1A 1Q86O 1RT6A 4BVOA 4KHPK 3M8PA 4E7LA 1LAWA 1LOTB 2QXFA 4FO0A 4LF9K 1QSSA 5AZJB 4IFYA 4YOTA 2FLOA 3DRPA 3K57A 3TSUA 2E1YA 3UKRB 5F1XA 4FOEA 5AQFA 3O6WA 5BRDA 3VEOA 2NRHA 1XHZA 1U4BA 4FJGA 4UAFE 4FWSA 1D5AA 2VG7A 3IS9A 3OYEA 4ZHRA 2Q31A 2WTUA 3C6UA 1DKGD 2KW4A 3P83D 4RW4A 5FRMA 2OANA 1NMDA 3THWA 3CYGA 3TWHA 3CCRN 3MN6A 2CGKA 4DCHA 2V7ZA 3FZKA 1NJZA 4EHTA 2E5LK 3NGYA 5IWAK 4BDYA 2ATBA 3DM2A 3CCUN 4M63C 2FBVA 4CGJA 4LFCK 5AQIA 1KXPA 1TYQA 4BRHA 1WSFA 2YJEA 3VQCA 1JZAA 2NNWA 1HR0K 3KP0A 4EFHA 1GPSA 3AGRA 3HI0A 3L8BA 1IBMK 2ZGYA 4ILGB 1KFSA 2GELA 4CEEA 3ULDA 4KHYA 2N2QA 3IMXA 1G99A 4FK2A 1TK0A 4BRAA 4N41A 3SPYA 2OYQA 1W7AA 2DFHA 1YVNA 3G6EN 2P9NA 3O3FA 4CJPA 4GKKK 3L2WA 1B7DA 1E3MA 3CCQN 5GAEP 3K5MA 4HHTA 1ZYQA 1KSPA 3A5MC 2BDPA 3FLCO 2FSNA 4U67L 2HHQA 1T7AA 4JKBA 4H8KA 3U4LA 4PKHA 5IT9O 4BGBA 1WAFA 4GV3A 1A5WA 2UUCK 3S9HA 1NKEA 4H0OA 1P00A 1ATRA 2GX9A 3PIOL 4CHQA 4J2EA 3O5BA 4C8LA 4CJWA 1H1VA 2RE2A 5LJVA 3LZJA 4DV5K 2YBRC 5JLFA 3IDHA 3L2QA 1SKRA 2A1SA 3DXKA 1BI4A 1PTXA 1RT1A 1U45A 2NRZA 1FXXA 4NXMK 2VQEK 4IDHA 1HPMA 3SZ2A 1HQEA 1BU6O 3HP9A 4DUZK 2O8EA 4MDBA 3PIPL 1IKVA 2P9IA 4IOAL 5SWMA 2NRRA 4YOXA 3HJFA 3V9UA 4CD3A 2D56A 2MBKA 1HNZK 1KLMA 4DTSA 1VSLA 3H45C 5M1PA 2VWKA 1JL2A 3AVFA 2N66A 4FLZA 4FJXA 5BPNA 5LMUK 4E7KA 2QWLA 1J54A 1TKXA 1VSJA 2YI1A 4BWJA 4Y1DA 2QWRA 3D2EB 4DTXA 1A5VA 4WQ4C 3QEVA 3A8YA 4DQPA 3MEEA 4Y0WA 3TSQA 4H0XB 1YITN 5AQVA 1SUQA 3L2RA 3WQTA 1ASVA 3E7UX 2F7TA 3ZT0A 4CGGA 2PBDA 1W9HA 1X3MA 3W0LA 4A61A 4JD2B 3MX5A 5C24A 4DQRA 1I2UA 2VGNA 2LN8A 1S1VA 2M8BB 3VETA 4CECA 4ZTFA 4NCAA 1K8BA 4GKJK 2ZD1A 4I9LA 5FLXO 4H5NA 4J8FA 4DR5K 4BECA 2VYPA 4Z94A 4Y1CA 3O1BA 4A59A 1JLBA 1RTJA 2P1JA 3CIPA 3DXMB 3WNHA 2FC0A 3NVMA 1QQOA 1RBSA 4B9QA 4CF2A 4KREA 2Q0RA 4OGCA 2LR3A 4YNQA 3H6EA 1RDAA 3KK2A 5FROA 1M90O 1J9AA 1RNHA 3L4QA 5C0YA 1SKSA 4FPAA 1Q81O 5AZJA 2WONA 4FJ7A 1HNXK 2YIPA 5TKYA 4BRCA 4DR7K 4CEQA 3I8BA 1YHQN 1X9SA 3ZT1A 3R6MA 3OYNA 4Z4FA 1KLNA 4CFBA 3SAHA 4JKAA 4B9NA 3ZSZA 1ZVEA 3TAGA 3CERA 4E7JA 4B1UB 1E4GT 1S72N 2QWOA 4N56A 2ITMA 4KFBA 2F9TA 3G71N 1S1XA 3S3MA 2MN5A 4B3RK 2QEXN 1TAUA 2GTDA 3ITHA 2CH5A 2V7YA 3CM6A 3HTVA 5K14A 1IH7A 2ZF5O 2JWLA 3DLLL 1HKBA 1GLDG 3P1GA 2GWJA 3TAQA 2GV9A 2YHWA 3MXIA 1NRAA 5JLHA 1VQON 1TAQA 4RTFD 1NNEA 4DSKA 2YHBA 5HBMA 4CEDA 4BE0A 2BH1A 3R9PA 1X9MA 4JRQA 3RRHA 1XNQK 3LDPA 4DV6K 1JKZA 1R59O 3AVJA 3A2FA 1TKZA 4JAXA 4QS9A 4KB1A 4XEIA 2HNYA 4NYNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2DPN A;  4IBN A;  1JXB A;  1REV A;  5GIP A;  1EO1 A;  4CIE A;  1KRP A;  3AA5 X;  2HHI A;  1NGJ A;  1L3U A;  3C6H A;  3VEV A;  4CHO A;  4DR6 K;  4CJT A;  4MO4 A;  1VRT A;  3I8D A;  1C1C A;  3HO1 A;  1TGO A;  1I94 K;  3IUC A;  2E2Q A;  3L2U A;  4FJJ A;  3DXK B;  1BI4 B;  3OW2 M;  5HRP A;  3H08 A;  5D3G A;  4ID5 A;  4CGF A;  3E9P A;  1RT5 A;  4B1V A;  4FLT A;  2UU9 K;  4Z4H A;  4DTO A;  1OZZ A;  3D7E O;  1YT3 A;  4KHQ A;  4FJK A;  2P9I B;  1VK0 A;  2Z1J A;  3P31 A;  1LW0 A;  3TAB A;  3CC7 N;  2ASC A;  2FF6 A;  4Z0U A;  1MYN A;  3TTD A;  4M45 A;  1NK6 A;  3ZEU A;  3K0S A;  1NGB A;  3C65 A;  5H1S Q;  3G10 A;  2YIO A;  3VEN A;  4CK1 A;  4DUY K;  3DLH A;  3OA9 A;  4KHW A;  1ATN A;  5JEN A;  4NLC A;  3RWU A;  3L3V A;  4YOV A;  4DKW A;  4BE1 A;  2KBH A;  1QZ5 A;  4AIL C;  4E19 A;  1QVG M;  1JCE A;  3O1W A;  4JYA K;  2ZJQ L;  2HHX A;  4WFB L;  1KCF A;  1ZBF A;  4BRG A;  2P9K A;  3SYZ A;  2QKK A;  3HPG A;  3AVC A;  3R2V A;  3VES A;  3B6P A;  5GIN A;  3RR7 A;  2G8U A;  3AY9 A;  2ETJ A;  4O55 A;  4IO9 L; 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