3QFPA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) atpase domain
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
377
structure length
367
Chain Sequence
YGTVIGIDLGTTYSCVAVMKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDILPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
total genus 107
structure length 367
sequence length 377
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfpA04
4I6MB 3LDQA 2FSJA 3H46O 2GWKA 4PKHA 2E2PA 2GWJA 3WXLA 2A3ZA 5AFUA 1MWMA 1QZ5A 2Q97A 5AQHA 2YCHA 2GTDA 2QWLA 4FWQA 1U2VA 3RSEA 4CBUA 3FZLA 1NLVA 3H6EA 2F9TA 2P9PA 4IZ9A 2IVNA 5AQOA 3FR0A 4Y0WA 3GE1A 4CZIA 4CZFA 2P9LA 2Q1NA 4BG9A 3IUCA 2A40A 1JCFA 3JS6A 3WXKA 4BRDA 3GOIA 5AQZA 1KAXA 2Q2RA 3ENOA 3D2EA 3GDQA 4BGBA 1NM1A 4BRKA 3TU5A 1BO5O 4BRIA 2CGLA 3U9ZA 4BR5A 3QDKA 1U6ZA 4H0VB 3VEZA 5LJWA 1EQYA 3QB0A 4FWMA 3WQUA 3ZEUA 2P9SB 3VF6A 3DXKB 3KVGA 5AQKA 4O5FA 1NGDA 2Q0UA 2H3GX 5BN9A 3SJHA 2W40A 4ISFA 4EIAA 4BR9A 2V52B 4F9OA 3ATVA 1DKGD 2FSKA 3FLCO 4B1UB 3LDOA 1E4GT 4CZGA 5FPMA 2W41A 5EX5A 2ZWHA 3QFPA 4BRAA 2P9IA 4B1XB 4PL7A 2YJEA 4JHDA 4BRLA 3ZETA 3EN9A 3I8BA 4B1YB 1GLJO 2ASPA 3CJ1A 1ATSA 3MMVA 3AAPA 2EWSA 2P9UA 3U4LA 4BR7A 2VYPA 3MN7A 4B9QA 4H0XB 3WQTA 1NGAA 3ZX0A 1KAZA 1V4SA 4I6MA 2J4RA 5KPRA 1YVNA 4A2BA 3I33A 3FZFA 5F0XA 3R8EA 3W3DA 5AQGA 3CJCA 2QWOA 1S22A 2CH6A 4FPBA 4CZHA 3EKUA 5F2RA 3R9PA 2E1YA 4FO0A 1ATNA 2CH5A 2BTFA 2P9NA 1DEJA 1YXQA 4K25A 4CI6A 5LJVA 5BRFA 4H5VA 3CQYA 2QWPA 3U9DA 2YHWA 2GELA 1BG3A 1KXPA 2VWBA 4BRHA 3CJ7A 4WQ4C 2FF3B 3HSCA 4BGAA 3VESA 1NGFA 3DWLA 4H0OA 2UYTA 3BP8A 3UKRB 3BF3A 3LDPA 3M6GA 4BR0A 4EHTA 2QWRA 4M7XA 3R6MA 4C23A 4RWTA 3GL1A 4EAHD 5AQRA 1MA9B 1BA0A 4JAXA 3VEXA 1GLCG 3MDQA 1CZAN 4YDUC 5ADXA 4BREA 1RFQA 3DAWA 3FZHA 3VEVA 5AQSA 1ZC6A 3ULEB 3D7EO 3VEOA 5BPMA 5EVZA 4JN4A 3L0QA 4QS8A 4CD3A 3O1WA 4BQLA 5JLFA 1MDUB 4PKGA 3CHWA 3VF2A 2QWNA 2E8AA 4FWNA 1NMDA 1HPMA 3KZBA 1ESVA 3D2FB 4FOEA 2KHOA 1GLFO 3O08A 1DGKN 2GEMA 4GNIA 1K8KB 2D0OA 3BUZB 2QW9A 4IO8A 2E2QA 5AQIA 3LL3A 3BEXA 2P9KA 3HTVA 5AQFA 4JD2B 1XC3A 5BPNA 2AP1A 3CJBA 3LDNA 1NGCA 3QBXA 3LM2A 4HTLA 4BQZA 1BWFO 3EO3A 3M3ZA 4WQ5A 3IMXA 1IG8A 5KPTA 3CQXA 4E1JA 5BRHA 3ZX2A 4BC2A 1C0GA 4KBOA 1QHAA 4A62A 1G99A 4XH5A 2QXLA 4H5TA 3DJCA 4BRQA 5FPEA 5E26A 3C7NA 4J8FA 1X3MA 4MO4A 3VEYA 3CI5A 4CZMA 1GLBG 3MK6A 3UKRA 3UB5A 1Y64A 3VEWA 5AQLA 5ELZA 1NGHA 3UKUA 3VENA 1D4XA 2HOEA 1LOTB 5JICA 2QWQA 3DXMA 1JCGA 3VOVA 3MN9A 5AZIB 4H03B 1WUAA 4H0YB 5F1XA 4MLEA 1JCEA 4DB3A 1HJOA 5AR0A 1S3XA 3SMSA 3VF4A 2A42A 1TUYA 1T6CA 2CGKA 3A5NC 2V51B 5AQTA 3A0IX 3F9MA 1BDGA 3AARA 1TUUA 4B1WB 4A2AA 4H5NA 4QS9A 4EFHA 5AZJB 2Q0RA 3BF1A 3O8MA 2I7PA 3A5MC 4O8KA 1QQOA 1HKGA 3O4WA 1E4FT 3J8AA 1V4TA 4BVPA 1GLAG 2E20A 3SLCA 1QQNA 3GBTA 3O1BA 3H3OB 1NBWA 3HZ6A 4BRMA 3CJAA 4DHYA 2Q36A 4L3QA 1GLEG 3WXIA 4BG8A 2E2OA 4M63C 3LDLA 2V7YA 3ATUA 5EY4A 1NGJA 3H3NO 5BREA 4H5RA 2GUPA 2DPNA 3H45C 4GY2B 3QBWA 3RSEB 1BU6O 1SQKA 2ZGZA 2IVPA 2QWMA 2HMPA 3FGUA 2P9PB 3JXUA 3EKSA 1HKBA 1SAZA 5B8HA 4BRCA 1X3NA 4ISEA 5KQDA 2PBDA 3QFUA 4DCHA 2BUPA 5AQWA 2ZGYA 3D2EB 2D1KA 3IDHA 3UE5A 2A6AA 2P9SA 3SK3A 2ASOA 3DXKA 1MWKA 1P8ZA 3FE1A 4B1VA 4CZLA 2FF6A 4AM7A 1RGIA 3ID8A 3B8AX 3MN6A 4K42A 5KPZA 5E84A 4CZKA 3A5LC 4FOIA 4FL9A 1HX1A 1YAGA 1ZBSA 4BRFA 2E2NA 3S41A 5I9EB 1XQSC 3OHRA 5AQYA 3VPZA 4K43A 2ASMA 4IJAA 3A5OC 3HBTA 2QM1A 2FLOA 4NB4A 4BR2A 4XEIA 1Z05A 2E88A 1QQMA 4JHDB 2PAVA 3ZETB 3VGMA 4IXCA 5EOYA 4BROA 5JLHA 1SZ2A 1YUWA 4BC5A 4Z94A 5JMVA 1ATRA 3HM8A 2P9UB 3O6WA 2E1ZA 5AQMA 2OANA 3CETA 5BN8A 2A41A 4B1ZA 5TKYA 4BR4A 1NGEA 2IIRA 4FSVA 4CJ7A 3FZMA 4MO5A 4FPAA 2FXUA 2YHXA 5AQXA 1X9JA 5AQJA 5AQVA 1WOQA 1BUPA 2P9NB 4FWPA 4XH4A 4FWRA 4CZJA 4QS7A 5AFUH 4BRPA 4CBWA 2NZTA 1Z6RA 4H0TB 4JNEA 4MLHA 5BR9A 3L4IA 4A61A 3M1FA 3VGKA 2HF4A 3H1VX 3ZX3A 1H1VA 4WQ4A 2WUSA 4WYBA 3VERA 3W0LA 3ULEA 4EHUA 3A8YA 2CGJA 3U8XA 3CERA 1TYQB 3WEEB 5KQ8A 2AA4A 2Q31A 3H1QA 3P4IA 1NWKA 1R59O 4M7YA 2V7ZA 2ITMA 1NGBA 3D2FA 1OKJA 1KAYA 4YDUA 3TPQA 1K8KA 4CD1A 3GG4A 4FWOA 3AY9A 1HLUA 2D0PA 5AQPA 5CE3A 4LC9B 4CZEA 4WQ5C 4FWKA 1ZXOA 4FWSA 4JD2A 1HKCA 2YHYA 1T44A 3QMLA 4BC4A 4H5WA 1GLLO 3SMPA 4H0PA 2P9KB 5FPNA 1U2VB 4IJNA 1QZ6A 1XUPO 3MN5A 1IJJA 3G25A 4BVOA 5BRDA 2NLXA 4PKIA 3C0BA 5EXWA 4CBXA 4DQ8A 2P9LB 3QICA 3AAQA 1C0FA 3CJ9A 5AQUA 1NGIA 4NO7A 1LCUA 2D4WA 2ZF5O 2A5XA 4AM6A 5FPDA 3EL2A 3C7NB 3WUHA 3IFRA 1T6DA 2VCPA 2YI1A 3ZEUB 5AZIA 3ENHA 4HWIA 3WT0A 3WXJA 3MCPA 3FFKB 3UKUB 1TYQA 3LM9A 4BC3A 5AQNA 4BRGA 2NRHA 3FZKA 3DXMB 3L6QA 3VGLA 3WEEA 5BPLA 1BA1A 4PL8A 4FWLA 4BRNA 4ISGA 2P9IB 4XH1A 1HUXA 5LY3A 5AZJA 1NGGA 1Q18A 2I7NA 2YJFA 4IWVA 5AQQA 2FSNA 2IVOA 3VETA 1BOTO 1GLDG 5ADXH 1J6ZA 4RTFD 2F9WA 1RDWX 3O80A 3KHYA 3O5BA 3CIPA 3HI0A 3EZWA 4K41A 4RCHA 2HF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RTDA 1WN7A 2GUIA 4Y1CA 2GWJA 5DM7L 2Z1HA 3ZSVA 4DQSA 4C8KA 2O8CB 5C15A 1MWMA 1Q9YA 1NK9A 4DTOA 2B4JA 1NLVA 3QO9A 3MWTA 4IZ9A 3TSPA 3U6FA 5DMRA 4QAGA 4BG9A 2XY5A 2A40A 4JKCA 1JLBA 1HNIA 2Q2RA 3GDQA 3OBWA 2N2QA 1YJWN 1NK0A 3TU5A 3AV9A 3EY1A 1JJ2M 1TL1A 5J2MA 1BO5O 4DU3A 2O8DB 2CGLA 1VK0A 4NYFA 4FZXC 4CHOA 4BE2A 3PLAA 1EQYA 3DXKB 4O5FA 3CCMN 1XMOK 1NGDA 2Q0UA 4LF5K 4CHPA 5BN9A 4ISFA 4EIAA 2V52B 3ID6A 3ATVA 4B1UB 1KD1O 3LDOA 5M1KA 4LY7A 3K5NA 2ZWHA 1WSGA 3NGIA 3T3FA 2NRRA 4CJSA 2P9IA 3I0SA 3NF7A 3V9XA 3TAEA 4IDKA 1S1TA 3EN9A 3MCAB 1D9FA 3K9JA 2ASPA 4O5BA 1ATSA 4KO0A 4Z4IA 3AAPA 3VTHA 2N69A 4BR7A 3NGZA 1S1XA 2VYPA 4NCGA 4B9QA 4OJRA 4H0XB 3DLGA 3ZX0A 1V4SA 2D56A 3FFIA 4I6MA 2OA8A 4DFPA 3PUFA 3CF5L 1VSMA 3CJCA 2PYLA 1Q86O 3E66A 3R9PA 2E1YA 3RVCA 2D0CA 4I9LA 2P9NA 2OCEA 3V9SA 3HK2A 4CGGA 2MN5A 4FVUA 1BG3A 2YNGA 1VQ8N 4WQ4C 5KGWA 3LANA 1NGFA 2HB5A 4CEDA 2DFEA 4GMJB 4J2DA 2E4LA 1RDAA 4JK7A 1OH5A 3BF3A 3M6GA 3TTDA 2QXFA 5J1EA 4FK0A 1RT2A 2HNDA 4KB1A 1MA9B 3EEQA 3G10A 1BIUA 1U49A 1JXBA 4CHNA 5JS1A 3C95A 3MDQA 4KHNA 3MX5A 5C12A 3QEVA 4YNQA 5AQSA 2LY6A 5DM6L 4NXNK 4JN4A 4QS8A 4AHUA 3RTVA 4CJTA 3O1WA 4BQLA 3J7ZO 3L2QA 2VQFK 1ZBLA 3O9TA 2XRIA 3P5JA 2Y1JA 3VF2A 3CCLN 1LW0A 2YX6A 4FJ8A 4FOEA 2LR3A 3BUZB 4DTSA 1OH8A 1JZBA 3OTOK 3BEXA 4N47A 4OPAA 2ZQBA 1IBKK 1S1VA 2UUCK 2AP1A 3K5OA 3QBXA 3LM2A 3ZT2A 3E9PA 3V9UA 4X66K 4FK2A 1C0GA 4KBOA 2WBNA 2YHAA 2LI7A 3SAHA 4FW1A 4DV2K 4FLUA 1T7BA 1FJGK 4FJXA 4BRQA 5E26A 3C7NA 1JXCA 1D9DA 4MDAA 1VQMN 3HPGA 3VEYA 3QEXA 4QCLA 4M3YA 5GIOA 3MK6A 4XJXA 3AVMA 1YJ9N 2VG6A 3SZ2A 1ZUTA 4OX9K 5AQLA 5ELZA 3L2UA 3VENA 1D4XA 1DQ7A 2P51A 2VG7A 3VQEA 4YOWA 4ZHRA 4HE7A 5HRRA 3MN9A 1WLJA 3F5TA 4DQRA 3NHGA 2HHTA 2D0AA 3KK7A 4JEPA 1HJOA 3OYEA 1ICAA 2A42A 1TUYA 4FVMA 3G6EN 2NUBA 5LMNK 3VQPA 3F9MA 3TTCA 1BDGA 2FBXA 1TUUA 1L3SA 3OYAA 4QS9A 3O8MA 4BDZA 3O4QA 2YV0X 4O8KA 2FBVA 2YEOA 2GX9A 3ALYA 3O4WA 2Y1IA 4DQPA 4B8CA 1GLAG 4ELTA 2E20A 3KLFA 4GW6A 2O8CA 1W97L 3LDSA 1ASWA 3GBTA 4UQGA 3H3OB 1IO2A 1NBWA 2QKBA 4HVJA 1RBVA 4BG8A 2E2OA 4H8KA 1GOAA 5KGXA 3LDLA 4CEAA 2RPIA 2YC1C 5EY4A 5T7BA 2YHBA 4BECA 3KJVA 3HPOA 3TAQA 1I6GA 1RT5A 2SN3A 1KVBA 4CJPA 2QWMA 2XHBA 1REVA 4G1QA 4WE1A 4DF4A 1TAQA 3ZSRA 4DV5K 3CCJN 4LFBK 4C8MA 1BK8A 3IAYA 2B5JA 4DCHA 4FM0A 3DXKA 4LF8K 1MU2A 4NYNA 2FF6A 4M3WA 4B9LA 4K42A 3ITHA 5E84A 3SQ4A 1XI1A 3A5LC 3M8SA 1YHQN 4FL9A 3CC7N 5FDLA 4FLZA 2E2NA 3S41A 5E41A 4E7LA 4DTUA 2ZM6K 3VN5A 3CCQN 4B8AB 3VQ5A 4B9UA 3NVKA 1KCFA 2QM1A 4BR2A 4XEIA 3CCVN 4CQKA 4JHDB 1ZVEA 1XC9A 2HHWA 4KFBA 1NK5A 4DSIA 3QNOA 4BC5A 5JMVA 4CF0A 1ATRA 3HM8A 2P9UB 2VGMA 3CETA 3VQ8A 1UWBA 4AHCA 2KW4A 1NKCA 4LF4K 1EX4A 3FZMA 3QNNA 3TAMA 4DR7K 3PX0A 5GADP 2QKKA 1X9JA 4YOXA 1SV5A 2KGQA 1TL3A 1BUPA 1E3MA 4UADE 3SF4D 5A2QO 1GPSA 1X9MA 4QS7A 3ASMA 3C6HA 4H0TB 1ZBFA 1U47A 4M3RA 1MYNA 4W5NA 3SQ0A 3J7AP 1UAXA 4OPKA 3VGKA 2HMIA 4FJHA 4Q5VA 2NNWA 3MXMA 3C6AA 2LSNA 3CERA 4E89A 4WFAL 4OKKA 5KQ8A 4N56A 1QE1A 2YKNA 2Q31A 4DTJA 3H1QA 3P4IA 1UA1A 2LT8A 3PSFA 2ZJPL 1R59O 4QOZB 4FJKA 2V7ZA 2HVIA 4CIEA 1OKJA 1KAYA 4YDUA 3TPQA 4FCYA 4G9ZA 1VQ9N 3MECA 2E3FA 1FKOA 4CVNE 4LC9B 4FWKA 1J54A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RTD A;  1WN7 A;  2GUI A;  4Y1C A;  2GWJ A;  5DM7 L;  2Z1H A;  3ZSV A;  4DQS A;  4C8K A;  2O8C B;  5C15 A;  1MWM A;  1Q9Y A;  1NK9 A;  4DTO A;  2B4J A;  1NLV A;  3QO9 A;  3MWT A;  4IZ9 A;  3TSP A;  3U6F A;  5DMR A;  4QAG A;  4BG9 A;  2XY5 A;  2A40 A;  4JKC A;  1JLB A;  1HNI A;  2Q2R A;  3GDQ A;  3OBW A;  2N2Q A;  1YJW N;  1NK0 A;  3TU5 A;  3AV9 A;  3EY1 A;  1JJ2 M;  1TL1 A;  5J2M A;  1BO5 O;  4DU3 A;  2O8D B;  2CGL A;  1VK0 A;  4NYF A;  4FZX C;  4CHO A;  4BE2 A;  3PLA A;  1EQY A;  3DXK B;  4O5F A;  3CCM N;  1XMO K;  1NGD A;  2Q0U A;  4LF5 K;  4CHP A;  5BN9 A;  4ISF A;  4EIA A;  2V52 B;  3ID6 A;  3ATV A;  4B1U B;  1KD1 O;  3LDO A;  5M1K A;  4LY7 A;  3K5N A;  2ZWH A;  1WSG A;  3NGI A;  3T3F A;  2NRR A;  4CJS A;  2P9I A;  3I0S A;  3NF7 A;  3V9X A;  3TAE A;  4IDK A;  1S1T A;  3EN9 A;  3MCA B;  1D9F A;  3K9J A;  2ASP A;  4O5B A;  1ATS A;  4KO0 A;  4Z4I A;  3AAP A;  3VTH A;  2N69 A;  4BR7 A;  3NGZ A;  1S1X A;  2VYP A;  4NCG A;  4B9Q A;  4OJR A;  4H0X B;  3DLG A;  3ZX0 A;  1V4S A;  2D56 A;  3FFI A; 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