3QFPA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) atpase domain
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
377
structure length
367
Chain Sequence
YGTVIGIDLGTTYSCVAVMKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDILPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 107
structure length 367
sequence length 377
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfpA04
2PBDA 2EWSA 4M7XA 2CGLA 2FF6A 3CHWA 3H3NO 1K8KA 1SAZA 3VETA 3VGKA 2NRHA 4CZMA 1S3XA 4WQ4A 2CGJA 4FSVA 3R8EA 2E2PA 3FE1A 3P4IA 4EFHA 3BUZB 4BQZA 4O8KA 4FOIA 4MO4A 3FGUA 2YI1A 1BA0A 5AQNA 2W41A 5EY4A 1U6ZA 1JCEA 1SZ2A 2F9WA 4DHYA 3JS6A 2I7NA 3DXMB 1HLUA 1NLVA 5AZIB 4H5VA 4DCHA 3O08A 3BF1A 3QBXA 3VEVA 5FPEA 5JLHA 3TU5A 1HKBA 4BR0A 3GOIA 5ADXA 4Y0WA 5ELZA 4A2AA 1K8KB 3LDOA 3CJAA 3HSCA 1BDGA 3EZWA 3MMVA 4CD1A 1X3MA 4BC3A 2ITMA 1XC3A 2GUPA 1Z05A 4Z94A 1QHAA 3SK3A 3FZHA 3LDLA 4K42A 3ZX2A 3CERA 3VEWA 4BGBA 3KZBA 3RSEB 2D1KA 3U4LA 3LDQA 3J8AA 2OANA 1NGFA 1RGIA 4BR9A 5AQJA 1DEJA 4BRAA 3I33A 3QFUA 3HI0A 3GE1A 5LJWA 1T44A 3ID8A 4IO8A 4MLHA 1NGGA 2A3ZA 5BPLA 4WQ4C 2QWNA 1NMDA 2YJEA 4PL8A 1IJJA 3ULEB 2ZGYA 3VF6A 4BRNA 2ASOA 2P9NA 4BRDA 1ZC6A 4I6MA 2ZWHA 4C23A 5AQKA 5B8HA 2AA4A 2VWBA 4MO5A 3QICA 2VCPA 3M3ZA 1NBWA 3C0BA 4BRHA 1TYQA 2YJFA 4B1ZA 2E1ZA 1GLAG 4GNIA 2QWQA 5E84A 4JHDA 1ZXOA 3MDQA 5AQPA 2IIRA 5FPMA 1T6DA 2PAVA 2CH5A 3R6MA 4PKHA 3QBWA 4JNEA 5JICA 1RDWX 2P9NB 2P9LA 4BVOA 4I6MB 3EKSA 3M6GA 1CZAN 2P9PB 4BGAA 3A5LC 2A40A 2Q97A 3O5BA 3VF2A 3H1VX 4NO7A 4CBUA 3WXLA 5BRHA 1MDUB 1TUYA 5AQYA 3VEOA 5AQIA 3W0LA 2QWPA 2YHXA 3FZFA 3QDKA 5ADXH 1MA9B 3LM9A 4A61A 4BRPA 4BR7A 1HJOA 4PL7A 1NGIA 4BRIA 3KVGA 3CQYA 3D7EO 1WOQA 5TKYA 4IWVA 1NWKA 4EAHD 3GDQA 1T6CA 3FLCO 2P9LB 5AQUA 3A0IX 4CBXA 4BRLA 5AQOA 1WUAA 2I7PA 5AQHA 3O6WA 1U2VB 5BREA 3ZETA 3O8MA 3BEXA 3VEXA 4FWPA 4FPBA 3L4IA 1HX1A 5E26A 3VERA 3AAQA 2ZGZA 4K25A 4IZ9A 4BC5A 4QS9A 2E2QA 1BWFO 1BUPA 4XEIA 3AY9A 2P9IA 3GBTA 3LDPA 4CZKA 2FLOA 1HKCA 1QZ5A 3B8AX 3LM2A 3A5OC 2Q0UA 3DXKB 3U9ZA 3ENHA 2A41A 5BR9A 5EXWA 1GLLO 2Q36A 2QW9A 2P9SA 1YXQA 5KQDA 1ESVA 3O4WA 2BUPA 1GLJO 3FFKB 2W40A 3CJBA 3VGLA 3HM8A 2NLXA 5AQFA 4IXCA 1TUUA 2GWJA 1X3NA 3CJ1A 2V7YA 3SLCA 2NZTA 4FOEA 3SMPA 4FWLA 3ATUA 1S22A 4EHTA 3H6EA 1MWMA 4O5FA 4KBOA 5KPRA 3L0QA 3WXKA 5EVZA 1IG8A 2A6AA 1DGKN 1E4GT 5BRFA 2P9SB 2UYTA 3FZKA 5EX5A 4LC9B 5BRDA 5BPMA 4H0YB 2V52B 3FR0A 3JXUA 2CGKA 4JAXA 2Q31A 4FWKA 3VEYA 1MWKA 4M7YA 1BG3A 4CZLA 1QQMA 2GTDA 3H46O 3EN9A 1NGAA 4DB3A 4QS8A 3WQUA 3C7NA 1NGHA 3M1FA 3CQXA 1YVNA 2QM1A 2E2OA 3A5MC 3ZEUA 2D0PA 4GY2B 3IFRA 4BROA 1ATRA 4EHUA 5AZJA 4BRMA 2V7ZA 4BR4A 5AQLA 3KHYA 4L3QA 4H03B 3UE5A 4E1JA 3G25A 1ATSA 3DAWA 4CZEA 4H0XB 4RWTA 1NGEA 3FZLA 3CJ9A 5KPTA 3TPQA 3EO3A 4WYBA 3LL3A 3O1WA 4IJNA 5AQZA 3UKUA 2KHOA 2QWMA 3MCPA 2FXUA 4QS7A 4FO0A 4NB4A 3D2EA 1NGBA 1YUWA 1GLCG 3ENOA 4BRFA 2HMPA 2ASPA 4PKIA 4XH4A 4FL9A 5AQVA 1QQOA 4IJAA 3S41A 3QFPA 1TYQB 3MN5A 5AZJB 5JLFA 1LOTB 1NGCA 1XUPO 3ZX3A 3AAPA 4JHDB 5AR0A 3SMSA 1ZBSA 3SJHA 1Q18A 4B1VA 4PKGA 4FWSA 4BRGA 3IMXA 4YDUA 3A8YA 2GWKA 3UKRA 4DQ8A 3ATVA 5F0XA 4ISFA 4CZJA 5LY3A 3UKUB 2Q0RA 4CZIA 4AM7A 4B9QA 1V4TA 5AQMA 3MN7A 3MN9A 2QWRA 1KAYA 5F2RA 2J4RA 3BP8A 4BRKA 5BPNA 2YHWA 1D4XA 3CIPA 1X9JA 5AFUA 2Q1NA 3VGMA 4B1WB 5CE3A 2A42A 1ATNA 3DJCA 3WT0A 4BG8A 1KAXA 2E20A 2FSNA 5LJVA 2F9TA 4B1UB 3UKRB 3QMLA 3CJ7A 1BU6O 3CI5A 1GLEG 2FSKA 2Q2RA 1HKGA 1BA1A 1KAZA 4HWIA 5I9EB 1NM1A 3WQTA 3W3DA 4FPAA 1Y64A 3VOVA 3ZETB 5F1XA 1GLFO 3GL1A 4H5NA 3DWLA 4A2BA 4ISEA 3WXJA 4BG9A 4H0VB 2P9UA 2WUSA 4H5RA 2FSJA 2GEMA 3HBTA 4XH5A 1Z6RA 5AQGA 4H0TB 3RSEA 1NGDA 4FWQA 2P9IB 1QZ6A 2E1YA 3EKUA 5KQ8A 1KXPA 4J8FA 4YDUC 3D2FA 2BTFA 4BVPA 1EQYA 4XH1A 4WQ5A 2A5XA 4BRCA 3F9MA 5AQSA 3BF3A 2H3GX 3EL2A 5FPDA 1DKGD 2YCHA 4H0PA 3ULEA 2P9UB 3ZX0A 3WXIA 3VENA 3VESA 5EOYA 3OHRA 2HF4A 2D4WA 2ZF5O 4CD3A 4M63C 1J6ZA 1V4SA 3D2FB 2ASMA 1HPMA 2E88A 4FWMA 3I8BA 4CBWA 2P9KA 1P8ZA 4FWRA 3FZMA 1G99A 3H1QA 2QXLA 1H1VA 5AQQA 1SQKA 3MK6A 3WEEA 3GG4A 1HUXA 4F9OA 2GELA 5FPNA 3LDNA 2YHYA 5AFUH 4FWNA 2HOEA 2IVOA 2P9PA 4MLEA 1E4FT 3C7NB 4BR2A 1RFQA 1YAGA 4JN4A 3O80A 4CJ7A 5AQRA 4A62A 2CH6A 4HTLA 3MN6A 4H5TA 1BO5O 3ZEUB 4FWOA 2P9KB 1BOTO 3UB5A 3HTVA 1OKJA 2VYPA 4H0OA 5AQTA 1GLBG 4BRQA 4JD2A 4WQ5C 3L6QA 2DPNA 1R59O 4B1XB 4BQLA 4RCHA 3AARA 3WUHA 4ISGA 3WEEB 3U8XA 2V51B 5AQXA 4RTFD 2E2NA 3VF4A 1NGJA 1JCGA 4CZFA 3CJCA 5BN8A 1LCUA 2QWLA 3QB0A 3U9DA 3VPZA 1QQNA 3D2EB 4CZGA 1U2VA 3O1BA 4CI6A 3A5NC 1GLDG 2FF3B 3HZ6A 5AQWA 4K43A 5BN9A 3CETA 4AM6A 5KPZA 4H5WA 2AP1A 4JD2B 4EIAA 4BC4A 4B1YB 3VEZA 4BC2A 3H45C 3IDHA 3H3OB 2IVNA 4BREA 1XQSC 3DXKA 1C0GA 4K41A 3DXMA 4CZHA 2HF3A 3IUCA 5AZIA 2D0OA 4BR5A 3R9PA 2QWOA 2E8AA 2IVPA 1C0FA 5JMVA 1JCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PBDA 3N4PA 2EWSA 2UUBK 5C10A 1CZBA 1NJZA 4B9TA 3VGKA 3P31A 3QNNA 1S3XA 2CGJA 1XMOK 2E2PA 1UA0A 1HNXK 3B6PA 1M90O 2YIOA 1J53A 3BUZB 3VQ5A 2QEXN 1Q9XA 4O8KA 3O9SA 4PWDA 1Q9YA 2VGNA 1U6ZA 2IS3A 1ICAA 1QQCA 4CK2A 3DXMB 3RR7A 1IKXA 2QI2A 1S6PA 4DCHA 4DF4A 3QBXA 4X65K 3LPTA 3RMCA 2D5RA 2F4VK 5HRNA 4DF8A 3M8QA 3EZWA 5GINA 3C65A 1X3MA 1SS6A 1TAUA 2GL1A 1XC3A 1K9MO 3RWUA 3NCIA 4Z94A 1QVFM 1QHAA 1AHOA 3SPZA 3KD5E 4IBNA 5JS2A 4FXDA 3VEWA 3U4LA 3NAEA 3MEEA 3CPWM 1B92A 2OANA 4AHRA 4KH5A 3L56A 1LQHA 3I33A 3OYIA 3QFUA 3SNNA 3HI0A 3L8BA 4HUFA 3ID8A 3P5JA 3MEDA 1J5EK 4IO8A 2RKIA 2G8HA 5BPLA 4DR1K 1ZU3A 4DTMA 4JKGB 4WQ4C 2O8DB 3KOWA 5SWMA 3WNGA 1EWRA 4CF1A 1LV5A 4MQ3A 3ULEB 3K57A 4FJNA 2ASOA 5J1EA 3EY1A 1TK5A 1RBVA 4MO5A 2VCPA 3HM9A 3C0BA 4RW4A 4I9LA 3HPOA 2ZE2A 2YJFA 5M1PA 1GLAG 1JLQA 3HPGA 3VQBA 4HUGA 1HYZA 2FBYA 3NH2A 1NJWA 1NE5A 2BANA 4CJUA 1RT3A 5AQPA 5FPMA 1S9EA 1VQPN 4CHYA 3I56N 3TI0A 4PKHA 5JICA 4JNEA 3WXMB 2P9NB 2VG5A 1Q7YO 1NKBA 3EKSA 1CZAN 4N56A 3VQ8A 3HOSA 4JRQA 4RG8A 5BRHA 3AGRA 1IV0A 3TAQA 5AQIA 5ADXH 4KB0A 1WSIA 2BH1A 4E0DA 4AHVA 3V9ZA 1WSEA 4BRPA 4A61A 3O3FA 3O3GA 4IO9L 3G10A 3M8RA 5CY0A 1WOQA 4CEBA 2KZZA 2B4JA 4IWVA 1JLFA 4EAHD 5J2QA 3PX6A 3V1RA 2VWKA 4ID1A 3ZSRA 4BRLA 2I7PA 4C8OA 3O6WA 3ZETA 4FPBA 4A5BA 5E26A 4HHTA 1BQMA 3AAQA 2IOCA 1ASVA 2YNHA 2KQ2A 1NH5A 1UWBA 4LFAK 1RDDA 2LKBA 4O8UA 3AY9A 2YNFA 3K5OA 1ZYQA 3HO1A 1ZVEA 4JI6K 3A5OC 4G1QA 3L3UA 2MZ0A 2A41A 5BR9A 1GLLO 3T1YK 2Q36A 4ICLA 3AO1A 4CJ4A 2BUPA 1GLJO 2NRRA 1OH5A 2MBKA 1IKWA 1RT7A 2NLXA 3OJSA 1T7PA 4JI3K 4IKFA 1GPTA 1TUUA 3SLCA 2V7YA 3VQ6A 1L3VA 2NZTA 4FWLA 3K9KA 1BI4A 2QKBA 4DR4K 3H6EA 4DV7K 1MWMA 1KC8O 1VSMA 3C94A 5KPRA 3L0QA 1YJ9N 3DLRA 3HP9A 2A6AA 4YNQA 2P9SB 4JI1K 5JVHL 4MDAA 4KI6A 4LC9B 1KVCA 3NF6A 2YV0X 2C1GA 4C8LA 4KAZA 2HHSA 2YILA 1ZBIA 3C95A 2VGMA 5HRSA 3AVMA 4KREA 3H46O 3KKSA 4DB3A 1QSYA 3TTFA 1BIZA 4QS8A 1NK7A 4AILC 3DRRA 3HK2A 1MR4A 1VQ8N 1N32K 2O8BA 3QEWA 1NRAA 4HUEA 1S1WA 4O5BA 4GW6A 1ATRA 2RHKA 1NRBA 4BR4A 3THYB 4H03B 1NKEA 5IWAK 2O8FA 3DAWA 3VMFB 1NGEA 2XO7A 2LR3A 4JK7A 4B9SA 1LAVA 4M3UA 3O1WA 1SUQA 3UKUA 4B3MK 4NXMK 2QWMA 3ZYYX 3OW2M 5HP1A 1O13A 3CCEN 1YJWN 4ELUA 2OYQA 4EP5A 4OKKA 4FL9A 5AQVA 4DS5A 3QFPA 1SKWA 4J2EA 4CIFA 1NJXA 5AZJB 1LOTB 2NRWA 4HE7A 4DUZK 3MECA 3SJHA 4B1VA 4AF1A 3IMXA 5J2PA 4CZJA 5JMVA 4RW6A 3HT3A 4CJKA 4B9QA 3F73A 4HCCA 3NE6A 4H8KA 3MN7A 1QE1A 4DTUA 5F2RA 2X6NA 2J4RA 1VQMN 4BRKA 3CQ8A 5BPNA 1NK5A 5GAEP 4BE2A 4CF2A 2G8KA 4CGIA 3CCVN 3VGMA 2HVIA 2LSNA 4E1NA 1P90A 1RDUA 1VQ9N 4BG8A 2BGGA 2FSNA 2KSKA 2LT8A 3UKRB 2QXFA 4FJIA 3P38A 3KJVA 1JKHA 3CI5A 4DU3A 1HKGA 1EWQA 3M8PA 1KAZA 1C55A 3KLGA 1NM1A 1KFSA 4EZ9A 3VOVA 4LF6K 3SV4A 3AV9A 3ZETB 5I3UA 1GLFO 3GL1A 4H5NA 3L2QA 2WOMA 4V19S 1U45A 2IGIA 2WUSA 4E7LA 2GEMA 3HBTA 4XH5A 3CC4N 2QTDA 1NGDA 4FWQA 3L2UA 3CYGA 1QZ6A 4Z4HA 5HRPA 1KQSM 3VQ7A 3NF9A 4NYFA 1C6VA 3QEIA 4KPYA 3U3YA 2A5XA 1N8RO 1EP4A 4BRCA 3F9MA 1TL1A 3NGZA 3BF3A 4LF5K 3V9XA 1XNQK 4CJWA 5FPDA 3VA0A 1VQ7N 4UAEF 2KTQA 2EX3A 2ATBA 1J54A 5M1FA 3AA5X 1WB9A 1WN7A 2YHAA 3VESA 5EOYA 4LF8K 2D4WA 2HHIA 1ASWA 1V4SA 4F4KA 3KOZA 3D0PA 1WSHA 1HPMA 2E88A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2PBD A;  3N4P A;  2EWS A;  2UUB K;  5C10 A;  1CZB A;  1NJZ A;  4B9T A;  3VGK A;  3P31 A;  3QNN A;  1S3X A;  2CGJ A;  1XMO K;  2E2P A;  1UA0 A;  1HNX K;  3B6P A;  1M90 O;  2YIO A;  1J53 A;  3BUZ B;  3VQ5 A;  2QEX N;  1Q9X A;  4O8K A;  3O9S A;  4PWD A;  1Q9Y A;  2VGN A;  1U6Z A;  2IS3 A;  1ICA A;  1QQC A;  4CK2 A;  3DXM B;  3RR7 A;  1IKX A;  2QI2 A;  1S6P A;  4DCH A;  4DF4 A;  3QBX A;  4X65 K;  3LPT A;  3RMC A;  2D5R A;  2F4V K;  5HRN A;  4DF8 A;  3M8Q A;  3EZW A;  5GIN A;  3C65 A;  1X3M A;  1SS6 A;  1TAU A;  2GL1 A;  1XC3 A;  1K9M O;  3RWU A;  3NCI A;  4Z94 A;  1QVF M;  1QHA A;  1AHO A;  3SPZ A;  3KD5 E;  4IBN A;  5JS2 A;  4FXD A;  3VEW A;  3U4L A;  3NAE A;  3MEE A;  3CPW M;  1B92 A;  2OAN A;  4AHR A;  4KH5 A;  3L56 A;  1LQH A;  3I33 A;  3OYI A;  3QFU A;  3SNN A;  3HI0 A;  3L8B A;  4HUF A;  3ID8 A;  3P5J A;  3MED A;  1J5E K;  4IO8 A;  2RKI A;  2G8H A;  5BPL A;  4DR1 K;  1ZU3 A;  4DTM A;  4JKG B;  4WQ4 C;  2O8D B;  3KOW A;  5SWM A;  3WNG A;  1EWR A;  4CF1 A;  1LV5 A;  4MQ3 A;  3ULE B;  3K57 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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