1RGIA

Crystal structure of gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
publication title Structure of the N-terminal half of gelsolin bound to actin: roles in severing, apoptosis and FAF
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
total genus 109
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1rgiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1rgiA04
2ZF5O 1X9JA 5JICA 1EQYA 3QFUA 2CGKA 1XC3A 4BRFA 3EKUA 3WEEA 4BQLA 1MWMA 4ISGA 4BQZA 5ADXA 1YAGA 4H5RA 3O1WA 3H45C 4O8KA 1HPMA 5AQVA 3UKRB 3GE1A 3UB5A 4B1VA 5AQYA 2A3ZA 5BRHA 5AZIA 1P8ZA 1GLCG 3LL3A 4CZGA 4FPAA 1HJOA 3M3ZA 3EO3A 1NMDA 2YI1A 4M7YA 1YVNA 1NWKA 2BTFA 5AFUA 1D4XA 3WXKA 1TYQA 1NGGA 3D2EA 3FLCO 3R6MA 5E26A 1QQOA 3O6WA 1JCGA 4BG9A 1Q18A 2BUPA 2V7ZA 3WT0A 4WQ5A 3UE5A 2ITMA 1KAZA 2NLXA 1NBWA 2E88A 3G25A 3U4LA 3M1FA 4EAHD 4FSVA 1RDWX 2Q97A 1ZBSA 1DGKN 3W3DA 1Z6RA 2YCHA 1ATNA 4FWSA 2QWMA 1CZAN 3BUZB 4LC9B 1NLVA 4BR4A 5FPEA 4BREA 4CD1A 4FWNA 5BREA 4FWKA 3DXMB 4FOEA 1GLAG 2GTDA 5F2RA 4BRIA 4AM6A 4JD2B 4EFHA 3W0LA 5AQNA 4BRPA 3SJHA 3AY9A 3BP8A 3KVGA 3SK3A 1HX1A 3R8EA 3ENHA 2Q0UA 5I9EB 1C0FA 3WUHA 4GNIA 3DXKA 4BRMA 4K42A 1HUXA 3U8XA 3VEVA 1H1VA 3R9PA 4B9QA 3LDPA 5EOYA 3EN9A 1BA1A 2CGJA 2FF3B 3HTVA 2QWNA 4JN4A 4HWIA 3CJBA 3D7EO 2A41A 3KHYA 4I6MB 4IJNA 1BG3A 1SZ2A 4PKGA 3H46O 5KQDA 5AQUA 4E1JA 1KAXA 1ATSA 3QBXA 3VESA 1HKBA 4FWPA 3WXIA 1NGEA 2IIRA 3A0IX 5AQWA 2GEMA 3ENOA 1YXQA 3GBTA 2P9LA 3MN5A 1SAZA 2P9UB 1BOTO 4BC2A 1Y64A 4FWQA 4CZLA 1DKGD 1X3MA 3IUCA 1TUUA 3WXLA 1J6ZA 3U9DA 5AQSA 3WQTA 1Z05A 2Q36A 3H3NO 3FGUA 4CZIA 3ZX0A 4K41A 3CETA 2E2QA 3QFPA 2EWSA 1T44A 5AQQA 4A2AA 1HLUA 3MN7A 1BDGA 3D2FB 3WEEB 2P9SB 4NB4A 1LOTB 2V51B 5EX5A 3FZKA 2E2PA 3ULEB 3VGKA 2HOEA 4B1UB 3ZETB 2W40A 3EKSA 2GWJA 1QQNA 2Q0RA 5LJVA 4XH4A 4A61A 3C7NA 1IJJA 5BRFA 5EY4A 4BRNA 3ZX2A 5F1XA 2E20A 3O80A 3LDLA 3VEWA 4BGAA 4JHDB 1TUYA 3ZEUA 3O8MA 1XUPO 1ZC6A 2D0OA 3ID8A 4H0PA 2HF4A 3UKUA 2QWRA 5BPLA 3RSEA 2FLOA 3LDNA 3VETA 1GLBG 2W41A 3MK6A 5E84A 4XEIA 3VF2A 2E8AA 2QWLA 5AQOA 3IFRA 3O1BA 4BC4A 2ASMA 5AQIA 3AAPA 1C0GA 3QICA 4H03B 4DQ8A 4YDUC 4IZ9A 3FZMA 1MWKA 4BR9A 3HI0A 2Q31A 3L6QA 3AAQA 1BO5O 3ZX3A 2A5XA 1NGHA 2E2OA 3L4IA 1GLLO 4CZHA 1K8KB 4H5NA 5FPMA 3SMSA 1YUWA 4B1XB 3JXUA 3CJCA 1BU6O 3L0QA 4FWLA 4XH1A 3SLCA 3VEYA 4JNEA 4K25A 2A40A 3UKRA 3WQUA 3ATVA 4DCHA 3CJ1A 3H1QA 2YJEA 4JAXA 2I7NA 4IWVA 4EHUA 1WUAA 3DXKB 2YHXA 2QWPA 1GLJO 4F9OA 2QXLA 1GLDG 4PL8A 1JCFA 3HBTA 4BRDA 3VEOA 1NGFA 5ELZA 5AQRA 3VERA 2P9KB 1MA9B 2PBDA 3B8AX 4RWTA 3VGMA 2F9WA 3FE1A 5BN8A 4NO7A 2E1ZA 3CJ9A 1DEJA 2FSJA 3CERA 1U2VB 3AARA 5AQPA 5FPNA 4H0VB 3O08A 5AZJB 3TPQA 2P9IB 3CHWA 3CJAA 4CBWA 1BWFO 4B1WB 2D0PA 2FXUA 1ESVA 1JCEA 5AR0A 2P9NB 3QDKA 4FWRA 3QBWA 4MLHA 5KPZA 2AP1A 4BR2A 3A8YA 3A5LC 2IVNA 3LM2A 3GL1A 2AA4A 4IJAA 4QS9A 5F0XA 3VEXA 4AM7A 3O5BA 3U9ZA 2HMPA 3BF3A 4CJ7A 2CH5A 4BG8A 1KXPA 4CZKA 3ATUA 4A62A 4CI6A 2ZGYA 2GUPA 4MO4A 3H3OB 3CJ7A 1U6ZA 4I6MA 4WQ4C 2VYPA 2Q1NA 3ZEUB 1V4SA 4M7XA 5AQZA 2PAVA 3FZHA 4CBUA 5AZIB 4BRKA 3QB0A 3HSCA 1NGCA 4H5WA 5JLHA 4H0OA 4PKHA 4BRQA 4CD3A 4CBXA 1E4GT 4BRAA 4BROA 2P9UA 2NZTA 1BA0A 3M6GA 3FZLA 1TYQB 3VEZA 1V4TA 2VWBA 3D2EB 4MO5A 1SQKA 4HTLA 2P9PA 3A5NC 1HKGA 4H0YB 1ATRA 4EIAA 5AQHA 3H6EA 1NGIA 3CIPA 4PKIA 3A5OC 1KAYA 2IVPA 4M63C 5AQJA 5KQ8A 3EZWA 3D2FA 1RFQA 4DB3A 1T6CA 2P9SA 2WUSA 1QZ6A 4BVPA 3DWLA 3DAWA 4BRGA 4YDUA 3ULEA 4H0TB 1NGAA 3ZETA 5AQTA 3TU5A 2VCPA 4CZFA 3VPZA 4BRLA 1T6DA 4FPBA 4MLEA 3J8AA 4BR5A 2CGLA 4B1YB 1QQMA 4BRCA 2A42A 4JHDA 3FZFA 4Y0WA 4EHTA 3CQXA 4BGBA 4WQ5C 5AQGA 4IXCA 2QWQA 3DJCA 2V7YA 1RGIA 3EL2A 1NGBA 4H0XB 3GOIA 1BUPA 4PL7A 2FF6A 4J8FA 5B8HA 3O4WA 2F9TA 4FWOA 5BN9A 3VF6A 3GDQA 1NM1A 2ASOA 1GLEG 3LDOA 4CZJA 2ZGZA 1HKCA 2QWOA 5TKYA 3SMPA 3C0BA 3IMXA 2Q2RA 4ISEA 4L3QA 5JLFA 1NGDA 1K8KA 2D1KA 2ASPA 2P9LB 5EVZA 5LJWA 4BC5A 5AQXA 5FPDA 2KHOA 3FFKB 3CQYA 4RCHA 3HZ6A 4XH5A 4Z94A 3VOVA 3QMLA 3MMVA 3HM8A 4CZMA 4FWMA 3P4IA 3A5MC 3BEXA 1GLFO 2GELA 4O5FA 1QHAA 3DXMA 4WYBA 2OANA 3F9MA 4FL9A 4RTFD 4JD2A 2V52B 4QS8A 4BC3A 4BR0A 3MDQA 4BR7A 2YJFA 1S3XA 4ISFA 4CZEA 5KPTA 3I8BA 5CE3A 2H3GX 4H5VA 2IVOA 2P9KA 4DHYA 1QZ5A 4BRHA 4A2BA 3VENA 5ADXH 2E2NA 4KBOA 1MDUB 1G99A 1OKJA 4FO0A 5JMVA 1IG8A 2UYTA 4K43A 3H1VX 5EXWA 2DPNA 5BPMA 1X3NA 3GG4A 3C7NB 1U2VA 2CH6A 3LM9A 5AQKA 3MCPA 5AZJA 2QW9A 2P9IA 3BF1A 1R59O 1ZXOA 3I33A 4H5TA 2A6AA 2E1YA 3CI5A 3MN9A 5AFUH 4GY2B 5LY3A 2P9NA 3VGLA 4WQ4A 3FR0A 4C23A 5BR9A 5KPRA 3IDHA 2P9PB 3OHRA 4QS7A 2YHYA 2QM1A 5AQFA 1E4FT 3UKUB 4BVOA 3LDQA 3RSEB 1LCUA 2GWKA 2YHWA 2FSNA 1S22A 3VF4A 4FOIA 3S41A 2J4RA 5BPNA 3KZBA 2I7PA 3MN6A 3WXJA 4B1ZA 5BRDA 3JS6A 1WOQA 2NRHA 2HF3A 2ZWHA 5AQMA 2FSKA 5AQLA 1XQSC 1NGJA 2D4WA 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZF5O 4KH4A 3OBWA 4BRFA 4BQLA 1MWMA 1VQNN 1YF5L 4DU1A 4BQZA 3QEIA 4H5RA 1YTAA 3NGIA 5J2QA 5BRHA 3OYNA 1A5XA 4CZGA 1VSDA 3M3ZA 4CHZA 1DTQA 3E9LA 1NMDA 2HHVA 4M7YA 2QK9A 4JKDA 4FVMA 3KK7A 3O9SA 3RMBA 3NCIA 5IT9O 1L5UA 3NH2A 3FLCO 2XHBA 4M3RA 5HROA 3O6WA 5HRRA 2HVIA 2BUPA 1KC8O 4WQ5A 2ITMA 1VQLN 2NLXA 1BIZA 1SL2A 1YVUA 3AV9A 4BACA 3CC2N 1NOZA 4FSVA 5FLXO 2G8KA 1ATNA 1OVYA 4FWSA 1B9DA 3IG1A 2AJQA 4BREA 4CEZA 3JSMA 1VQPN 1HYVA 4CJKA 4FWKA 3HP6A 3DXMB 3CYGA 1JLFA 2DTUA 5KGXA 3TTFA 3BP8A 3VN5A 3SK3A 3VQPA 1HX1A 1Y97A 4QCLA 5FROA 4Q5VA 2Q0UA 1I39A 3KLEA 4FJ9A 2QKBA 3DXKA 4DTRA 1TAQA 4FXDA 4K42A 3C6UA 3ZT4A 1BCOA 3EE9A 3AVCA 5EOYA 3KK3A 4E72A 3AO4A 2CGJA 2FF3B 3HTVA 4E7JA 3OW2M 1L3VA 5GINA 4ILGB 3K2PA 4B9NA 5KRSA 3CCLN 3CJBA 4OX9K 4LSNA 2A41A 4CIEA 4JRQA 1BG3A 2VWKA 4CEEA 4RW6A 4NYFA 5C42A 4CHPA 1ATSA 3WXIA 4FWPA 3O4QA 5AQWA 4DV3K 2GEMA 4DR6K 5JS1A 3SCXA 3J80O 2PFUA 2P51A 1BOTO 4X62K 1DKGD 1HJRA 2X6NA 1EWRA 3KD1E 3T1YK 2E2QA 3QFPA 5CYQA 5AQQA 3WXMB 2OZMA 1SL0A 1IKWA 1BI4B 2O8CA 2P9SB 4C8NA 3RR7A 2NRWA 3L2VA 1SKSA 3VGKA 3EKSA 4XH4A 2HBKA 1IBLK 1S1WA 2KFZA 1VQ6N 3CXCM 3KLFA 4FJHA 4FLTA 4DF4A 4BGAA 5GAEP 1TUYA 4DV0K 4DU3A 4AHTA 1J53A 5GAHP 2OPQA 4JEPA 2HF4A 1EXQA 4LH4A 4J2AA 3RSEA 4OGCA 4JYAK 1GLBG 3CCQN 2D0BA 3THVA 1OH5A 3KLHA 3MEDA 3AO3A 3IFRA 1VHXA 4KHQA 3I8DA 4JLHA 3ZSYA 3D0PA 4O55A 3AVBA 4YDUC 4M3YA 3CCRN 2HSTA 5M1FA 1LW0A 2R7YA 1NK7A 1YI2N 1ZYQA 4N5SA 1YUWA 4CGFA 1HQUA 4I9QA 1BU6O 3EY1A 3THWA 4XH1A 3PV8A 3VEYA 3DRSA 2PYLA 2YNFA 4CF0A 1YJWN 2YJEA 1Z25A 2I7NA 2YHXA 3PLAA 3OY9A 2QWPA 4F9OA 3MCAB 2IGIA 4YOUA 2OCEA 4BRDA 4B9SA 5ELZA 3Q7CA 2OA8A 3B8AX 4RWTA 3VGMA 2F9WA 4B9MA 3HPGA 4IOXA 2NRVA 3L3VA 2PY5A 2NRZA 4BDZA 2FSJA 3AARA 1X9MA 3SV3A 5CZ2A 1LAVA 2B4JA 3NF7A 3CJAA 4CBWA 1A5WA 1BWFO 2D0PA 2FXUA 4RW8A 4X66K 2P9NB 4YY3K 4FWRA 1F21A 2AP1A 4BE1A 3AGRA 2EX3A 3V9SA 4WFBL 1P90A 3RMAA 1DTTA 4Z4HA 3F2KA 1JLBA 4NCGA 3B6OA 1GOCA 3NAEA 1BCMA 4CJ7A 3ZT3A 3TAGA 4BG8A 3LANA 1NKBA 1KXPA 4A62A 4IG0A 2E6MA 2GUPA 3HPOA 3MXMA 1TK8A 1M1KO 4KHYA 3V6DA 1SL1A 1I94K 4MFBA 2NUBA 4BY9C 4LSLA 1IH7A 1U6ZA 5SZTA 5DM7L 3T69A 4DSLA 4QOZB 4M7XA 4M3ZA 3TARA 4DSFA 2OZSA 4BRKA 2JLEA 3OYGA 2O4GA 1NGCA 3HSCA 4CGIA 4X64K 5JLHA 4BRQA 4B3SK 4CD3A 1E4GT 4BRAA 3M6GA 4BDPA 4YOWA 2VWBA 3D2EB 3O9TA 3OJUA 3I0RA 1WBDA 5KRTA 2HNDA 4N47A 4EIAA 4CFDA 3A5OC 2UU9K 4E3SA 5AQJA 3ZSXA 1TKDA 4IOAL 4DKWA 1RFQA 4NXNK 3OS2A 4CHOA 2WUSA 2UUAK 4BVPA 4IFYA 3ULEA 1NGAA 3V9UA 2E5LK 5AQTA 5D3GA 4CGHA 3ULDA 4FJ7A 5KTQA 4CZFA 4BRLA 4FPBA 4JKAA 3QIOA 4FK4A 3J8AA 2CGLA 4B1YB 2W42A 3MAQA 4LF7K 2A42A 4KHWA 2ZE2A 3FZFA 4NLCA 2RF2A 3VQBA 5AQGA 2XY6A 4CHQA 2HHQA 5CY4A 4H0XB 3KTQA 5C10A 4PUOA 3S3NA 3WNEA 5B8HA 1XI1A 1NM1A 3K0SA 3VQAA 4GW6A 1DT9A 1O13A 4Y1DA 3CCMN 2W00A 3SMPA 4AHSA 2D0AA 4E0DA 4MQ3A 3IMXA 1J5EK 2Q2RA 3AVNA 3DLGA 2UUCK 5JLFA 3CM5A 2HHHK 2P9LB 5HBMA 5HLFA 3CQ8A 4CJRA 5SWMA 5AQXA 2KHOA 3LZIA 2UUBK 3FFKB 4XH5A 1TK5A 1NJIO 4Z94A 4FVUA 3RRHA 4FWMA 2G8HA 3C65A 4OKJA 1S1VA 1WLJA 4O5FA 4Z4CA 1W7AA 2OANA 3OYKA 4BC3A 2V52B 3MDQA 5GIOA 3EYZA 1QVFM 2O8FB 1NKCA 1HNWK 5KPTA 4JI3K 1JXEA 3I8BA 5CE3A 2H3GX 4DSIA 2P9KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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