1RGIA

Crystal structure of gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Gelsolin
publication title Structure of the N-terminal half of gelsolin bound to actin: roles in severing, apoptosis and FAF
pubmed doi rcsb
total genus 109
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1rgiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1rgiA04
1ATRA 5AZIB 1DKGD 3M6GA 5EXWA 3WT0A 5E84A 1OKJA 2NLXA 4BR7A 1TUYA 1SQKA 1MWKA 5AQRA 1D4XA 2CGJA 3ZETA 3VGKA 2P9UB 1HKGA 1WUAA 4JAXA 4FSVA 5BR9A 1NLVA 3SMSA 2KHOA 4H0YB 2E1ZA 3D2EA 4BG9A 3H6EA 5FPNA 3UE5A 4IWVA 3WXJA 4FWOA 4H0OA 3DJCA 3DXMB 3FZFA 4K42A 3VERA 4IJNA 2FSKA 1ATSA 4EHTA 1E4FT 4IXCA 5AQIA 4H5NA 2FXUA 4MLEA 1ZC6A 3VENA 3W0LA 4BRDA 4BR4A 3MCPA 4MO4A 1HLUA 1NGBA 3DXKA 3VOVA 3QFPA 3WXLA 5KPTA 2IVPA 4Z94A 3L4IA 1HUXA 2NRHA 5FPMA 3VGMA 4JD2B 2Q2RA 4F9OA 5BREA 4AM7A 3KZBA 3P4IA 1HX1A 3M3ZA 4GY2B 2ZF5O 3CQXA 5AQLA 3A5MC 2ITMA 3OHRA 3DAWA 4WQ5A 5AQKA 4BQZA 4EIAA 2E88A 2QWOA 2FSNA 1QQMA 4CZHA 3B8AX 3FLCO 2H3GX 4WQ4C 4CBUA 4YDUC 4XH1A 3VGLA 5EY4A 3F9MA 1Z05A 3BF3A 5I9EB 1NGCA 3VESA 3IDHA 1T6DA 5JLHA 1HKCA 5AZIA 2P9PB 1NGAA 3GDQA 3IFRA 1KAYA 2QWQA 2QWMA 3HZ6A 3R6MA 4BRNA 1T6CA 4RWTA 3BP8A 3BEXA 3H3NO 4RTFD 3LDPA 2V51B 1NGFA 5TKYA 1MDUB 3VEWA 2P9UA 3IUCA 5AQUA 4B9QA 2GWKA 2P9LB 2BUPA 1HKBA 5KPZA 4ISEA 3UKRB 2I7NA 5BPMA 4AM6A 2BTFA 1WOQA 4FWRA 4FO0A 3BUZB 3EKSA 4JHDB 2IVNA 4IJAA 3MN7A 3AY9A 3CJCA 3IMXA 4H5RA 3QFUA 3SMPA 4BC3A 3KHYA 3LDOA 3DXMA 2P9SB 5BN9A 3BF1A 5EVZA 4B1VA 4FWLA 1KAXA 4PKHA 3MN6A 3ZX2A 3KVGA 3MN5A 3A5OC 2D1KA 4EHUA 4BVPA 1U2VB 2YI1A 2EWSA 2CGLA 2WUSA 4CBWA 1V4TA 1E4GT 1NGDA 1SZ2A 2E2NA 3EL2A 4FPAA 3VPZA 4HWIA 5BPLA 1ZXOA 3FFKB 4BRGA 3CHWA 2A5XA 2D0PA 3QMLA 5ELZA 3H1VX 4JD2A 4QS8A 2E2OA 1NGJA 3LDQA 3ULEB 4BRAA 3A5LC 1RFQA 4B1ZA 3GG4A 5AQXA 1NGGA 1RDWX 3WXKA 4K43A 4WQ5C 1Y64A 5AZJA 3G25A 4XH4A 2FSJA 3H3OB 3EZWA 1ZBSA 2YJFA 2HOEA 3R8EA 4NO7A 4FWQA 3GL1A 2E2QA 5BRDA 4BGAA 2YHXA 4J8FA 4BROA 3WXIA 3QDKA 1QZ6A 4CZFA 1S3XA 3O8MA 5FPDA 1LCUA 4A62A 1X3MA 2P9PA 3RSEB 3ZEUA 5JLFA 2E8AA 2Q97A 5FPEA 5F1XA 4CZLA 2Q1NA 4FWSA 2IIRA 2QW9A 2ASOA 1GLAG 1IG8A 4BREA 2CH5A 1TYQB 4BRQA 3FE1A 3LDLA 2P9LA 3LDNA 4BRCA 2Q36A 3ATUA 3UKRA 5AQWA 1XQSC 1NGIA 2A40A 1NM1A 2IVOA 2P9IA 1Q18A 5AQPA 4BRKA 4JHDA 3O1BA 2V7ZA 1NBWA 3TU5A 4A61A 3WUHA 4LC9B 4PL8A 4CD1A 2P9SA 3I8BA 3QBWA 5AFUH 1MA9B 3CJ7A 4XH5A 4ISGA 4WYBA 3FZMA 4BC5A 4E1JA 4BC2A 1ATNA 3HTVA 3WQTA 2E2PA 1P8ZA 1GLCG 1X9JA 3ENOA 1YXQA 2V7YA 4CZMA 5AFUA 2E20A 3AAPA 4B1XB 3D2FA 4CZEA 4BRMA 3U9ZA 3VEZA 4BRIA 1GLJO 2QWLA 2GWJA 3H1QA 3FZHA 1T44A 3CERA 1NWKA 3ULEA 4M63C 3FGUA 2E1YA 4FOEA 4C23A 5EOYA 4EFHA 2PBDA 3L6QA 3O4WA 2CH6A 3ZX0A 5F2RA 4CI6A 3SJHA 4ISFA 4L3QA 1QHAA 4EAHD 2VYPA 2A42A 3A8YA 1Z6RA 1C0GA 3FZKA 3CI5A 5BN8A 3HM8A 3ENHA 2ZWHA 5AQOA 1BOTO 2P9KB 3EKUA 3C0BA 3JS6A 4BC4A 2W41A 2F9TA 3RSEA 2OANA 1NGHA 2YHWA 3QBXA 2VCPA 4IZ9A 2DPNA 2UYTA 1NGEA 2P9NB 5AQGA 4PL7A 4BR5A 1TYQA 2FF6A 3HBTA 3SLCA 3SK3A 3LM9A 1QQOA 5KQDA 2ZGZA 1U6ZA 1BWFO 1YVNA 1KAZA 1CZAN 2YJEA 5AQSA 5AQFA 3MK6A 4CZIA 1R59O 5B8HA 5JMVA 5KQ8A 4CZGA 4FWNA 3DWLA 4PKGA 3HSCA 1GLLO 5AQZA 4JNEA 3EO3A 5KPRA 2QWNA 4H0VB 2F9WA 1HJOA 5AR0A 3TPQA 2J4RA 3D7EO 3GBTA 5JICA 4HTLA 5F0XA 3O1WA 3VF2A 4H03B 3H46O 3WEEB 3VEOA 1IJJA 3AAQA 3O80A 4JN4A 5BRFA 1HPMA 3GOIA 4BR9A 3U8XA 2Q31A 2FF3B 4BVOA 1QQNA 4DHYA 3M1FA 4M7XA 1BG3A 2HMPA 3CIPA 2QWRA 1DEJA 3MN9A 3C7NB 3EN9A 2YHYA 3ATVA 4H0PA 3UKUB 1J6ZA 3A0IX 4I6MB 1YUWA 1K8KB 4PKIA 2HF3A 2D4WA 4BQLA 4QS9A 4K25A 4CBXA 2CGKA 2P9KA 4GNIA 2D0OA 3VF4A 1X3NA 2I7PA 4BRLA 2GUPA 1BDGA 3VF6A 1H1VA 1BU6O 1QZ5A 1DGKN 3W3DA 4H0XB 3FZLA 4H5WA 4DB3A 1XC3A 3R9PA 1JCGA 4IO8A 1BA0A 4BR2A 2P9NA 4FL9A 4MO5A 2QWPA 1U2VA 3VEVA 3CJ9A 3GE1A 1GLEG 3A5NC 5CE3A 5AQNA 3CETA 3LL3A 1S22A 4B1WB 1BO5O 2QXLA 5AQYA 3HI0A 4O8KA 1JCEA 3H45C 4FOIA 5AQVA 5AZJB 4K41A 1GLDG 4BG8A 3L0QA 1JCFA 2A6AA 4O5FA 1LOTB 3ZETB 5LJVA 1BA1A 3MMVA 4CJ7A 2Q0RA 3CJ1A 4DCHA 1G99A 5LY3A 5AQJA 5AQTA 3J8AA 2PAVA 3AARA 4CZKA 1NMDA 3JXUA 3D2EB 5LJWA 1BUPA 4FWKA 3ZX3A 1SAZA 4H0TB 4BRPA 4BR0A 2A3ZA 2V52B 3LM2A 5ADXH 2AA4A 4Y0WA 1XUPO 2GEMA 4CZJA 5BPNA 3QB0A 5E26A 1GLBG 3QICA 3WEEA 3CJBA 3ZEUB 4BGBA 5ADXA 3O08A 4QS7A 5BRHA 5AQMA 4RCHA 3CQYA 1YAGA 1ESVA 2GTDA 3ID8A 3DXKB 4MLHA 2FLOA 2VWBA 1RGIA 1V4SA 2Q0UA 2HF4A 3U9DA 2W40A 2ZGYA 3CJAA 2P9IB 3C7NA 3I33A 1KXPA 2ASMA 4KBOA 4A2BA 4DQ8A 5EX5A 3UKUA 5AQQA 1TUUA 2QM1A 4I6MA 4BRFA 4A2AA 1K8KA 4CD3A 3O6WA 1GLFO 3O5BA 3WQUA 2GELA 4H5VA 3MDQA 2A41A 4NB4A 4B1UB 1MWMA 3VETA 2ASPA 3VEYA 3U4LA 1EQYA 1C0FA 4FPBA 5AQHA 2YCHA 4WQ4A 3D2FB 4XEIA 4FWPA 4FWMA 4YDUA 3S41A 3UB5A 4M7YA 4H5TA 3VEXA 4B1YB 2AP1A 4BRHA 3FR0A 2NZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 3WT0A 5EXWA 3CCEN 4CGDA 3HXMA 1DLOA 1OKJA 1S6QA 1SQKA 5AQRA 5JS2A 2G8WA 4JI1K 3HVRA 4Z0UA 3VGKA 4E7KA 4LH4A 1A5VA 1S9GA 4JAXA 4FSVA 1VSEA 1JLCA 1LWCA 1Q9XA 3D2EA 3TARA 1ILYA 3FFIA 5FPNA 4DFMA 3O9SA 5LMUK 3UIQA 4O0JA 4E1MA 3VERA 3MEDA 4CJQA 3W0LA 4DMNA 3QIOA 3MCPA 3SV4A 2HHUA 1B9DA 3HPGA 4H8KA 4DV2K 3VOVA 3QFPA 3WXLA 4DTPA 2W6LA 2IVPA 1IBKK 3V1RA 4Z94A 2NRHA 3VQ5A 3B6OA 3J81O 3OHRA 3DAWA 4WQ5A 3SPZA 1NOYA 3B8AX 4XH1A 3LWLA 4M3TA 5EY4A 3L3VA 3F9MA 1Z05A 5I9EB 4CEFA 3ZSVA 4I9QA 5C0YA 3AGRA 5AZIA 3NGYA 2P9PB 4EZ9A 3CCRN 3GDQA 2HVIA 2QWMA 4WFBL 1C0UA 1QS4A 3NDKA 4DS4A 1DT9A 3BEXA 3KJVA 4KB0A 2V51B 2O8CB 3C95A 5TKYA 3VEWA 2IC3A 3DLBA 3SUOA 2KW4A 4BE7B 3OYCA 4B3TK 1REVA 1YF5L 1HKBA 5DMRA 4FM0A 3UKRB 1WSFA 4FWRA 3BUZB 3AVCA 4JHDB 4JV5K 3MN7A 1VQ5N 4NLCA 4CJTA 4FZXC 4DG1A 1VQNN 4DTNA 4I2QA 5KRTA 3DXMA 2P9SB 1BISA 4AILC 2HNZA 1HNXK 2Y1JA 4KHPK 5DM6L 4MFBA 4GV6A 4EHUA 3P39A 4O55A 1KTQA 3KIOA 1Z26A 1E4GT 1NGDA 3CFOA 5BPLA 3FFKB 5HRNA 4CEEA 4AQYK 2DFHA 1NGJA 4NYNA 5T7BA 4B1ZA 5AQXA 1NKEA 3WXKA 4K43A 2OCEA 4WQ5C 1VQPN 1SKWA 3HO1A 2FSJA 1ZBSA 4IEIA 1T03A 3CD6N 2HOEA 3T69A 4FWQA 4KHSA 1UA0A 1Q82O 3GL1A 4RW4A 3AA2A 4CIEA 3QDKA 1QZ6A 2HMIA 4JK9A 3NAEA 1Q9YA 4ELUA 3AVKA 2VWKA 4JKFA 1J53A 4RW8A 5FPDA 1T8EA 1VAZA 2KTQA 1X3MA 1XNRK 2DY4A 1IKVA 4GKKK 3ZEUA 3M5RA 2Q97A 3AA4A 5F1XA 3MXMA 2Q1NA 3F73A 3NVKA 2ASOA 4YOUA 4BREA 4KHUA 3QEIA 3E01A 4BRQA 3S3OA 2P9LA 3PUFA 4RW7A 3THWB 2Q36A 1S6PA 1KVBA 1NGIA 2A40A 3SZ2A 1LWFA 4Q5VA 3BDPA 1NBWA 3BZKA 3SAHA 1WNSA 4B3RK 1NK5A 3QEVA 2XY8A 3WUHA 4PL8A 1SKRA 2E6MA 3CG7A 3I8BA 1U48A 4OX9K 4BC5A 1ZYQA 1ATNA 1VSIA 2E2PA 1X9JA 1YXQA 4CZMA 1SL1A 2E20A 3CC7N 3NCIA 4B8CA 4CZEA 5AJ3K 3F5TA 3H1QA 2UXBK 1T44A 1LW0A 1TAUA 4DSIA 3ULEA 5HROA 3ASMA 4M63C 3LANA 2F7TA 1VSDA 4CJEA 4WF9L 4H4OA 4AHUA 2KLAA 5J2QA 5C2FA 1NJYA 4I7FA 4X65K 4BDPA 4L3QA 4KI6A 2VYPA 1ASVA 4EZ6A 1CLQA 3CI5A 3E9OA 3HM8A 2P9KB 1BGXT 3EKUA 1UA1A 1S5JA 2W41A 1JLGA 2O8EA 3CM6A 2GBZA 2OANA 4FVMA 2OPQA 3IG1A 1RTDA 2VCPA 3CC2N 2HHHK 2DPNA 1NNEA 2FBYA 1N6QA 3SQ1A 1M1KO 1TYQA 1IH7A 1TGOA 3SNNA 4K8ZA 1EETA 1HNIA 3L2VA 3HYFA 4CJKA 3G10A 2LSNA 4RG8A 4QCLA 2VGNA 1RTJA 5KQDA 1U6ZA 1BWFO 3VMFB 2JWLA 5AQFA 4DU3A 3L2QA 1R59O 5JMVA 5KQ8A 4CZGA 4E3SA 4PA1A 2XO7A 3OJSA 1VK0A 3EO3A 5KPRA 4B9VA 5GAHP 4H0VB 1NJIO 1HJOA 1N32K 2BH1A 3VQ9A 1JL2A 4GVEA 3PLAA 3SBTA 4KHWA 1I39A 5JICA 5C24A 4NXMK 4FJ8A 3MWPA 1TKXA 3O1WA 3VF2A 5GAGP 4DSJA 1YITN 2O8DB 3AAQA 1NOZA 2NRXA 5CYMA 1RTIA 1YJ9N 1NJXA 1KVCA 4BWMA 4E1NA 3C6HA 4CCHA 3M8RA 1FKOA 3VTHA 3NE6A 1W9HA 2HVHA 2UUBK 4M7XA 1BG3A 3CIPA 1HJRA 5HRRA 3WNHA 3MN9A 3C7NB 4RW9A 2YHYA 3OYFA 1IBLK 3RVCA 2ZJPL 1CXQA 3V9ZA 2D4WA 5HP1A 4F8RA 1SV5A 4Z4GA 3VF4A 1X3NA 3VF6A 1BU6O 1DGKN 4KHYA 4DSEA 3F9KA 4DF4A 4H5WA 2G8IA 3LZIA 1BI4B 4DR6K 5HLFA 2VGMA 4BR2A 1BA0A 4MO5A 4ICLA 2PY5A 3CJ9A 3GE1A 1J5EK 3A5NC 5CE3A 3CETA 3CM5A 4J2AA 2BE2A 1NK7A 3CPEA 1JCEA 4CGFA 5IT9O 1RDDA 2FBTA 3ZETB 4O5FA 3S5TA 2Q0RA 3HP9A 1NMNA 4DCHA 1G99A 4M41A 3AARA 4DLGA 3AVNA 5LJWA 4NLBA 4BRPA 4M3UA 3LM2A 3IRXA 3JYTA 1Q81O 4Y0WA 4PY5A 3KLIA 4CZJA 1VSKA 5E26A 3Q7CA 4MDBA 4DFPA 3WEEA 3ZEUB 3OYEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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