1RGIA

Crystal structure of gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title Structure of the N-terminal half of gelsolin bound to actin: roles in severing, apoptosis and FAF
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 109
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1rgiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1rgiA04
2KHOA 4K25A 3A5LC 3CIPA 1DKGD 4BC4A 4B1UB 3GOIA 4BRDA 4FL9A 3H1VX 3ZX2A 1U2VB 2V51B 2IVNA 2NLXA 3C0BA 4XH4A 3ATUA 2YHYA 2Q36A 2Q0RA 3U9ZA 1BUPA 3EN9A 3I8BA 4L3QA 2ZGZA 4BGAA 4CZGA 5KQ8A 1Z6RA 4CBWA 3A0IX 3FLCO 4H5RA 2Q31A 1GLCG 2QWPA 2E2OA 2BTFA 4JHDA 5AZJA 1DEJA 3LDOA 1D4XA 3HZ6A 4WQ4C 2FSJA 1MDUB 4BREA 1WOQA 2FXUA 4MO4A 4PKHA 2A41A 2NZTA 4BC3A 1NLVA 2F9TA 1YUWA 4CBUA 3U8XA 1BA0A 2W41A 3JS6A 3FZHA 1RDWX 3GBTA 2CGLA 3ZEUB 3ENOA 1S22A 4BR5A 2V7YA 3U4LA 1GLBG 4JAXA 5AQNA 4A61A 5AQPA 1IJJA 1NWKA 2NRHA 3CQXA 1P8ZA 3WT0A 5FPNA 3B8AX 3ZX0A 4BRLA 4CZLA 2ZF5O 5JMVA 2PBDA 2QWLA 1HX1A 1XUPO 2FSNA 5JLFA 5AQQA 3LL3A 2QWOA 2YHWA 4C23A 5EVZA 1QZ5A 4CD1A 1J6ZA 1TUYA 3R6MA 3BEXA 2P9UA 1YXQA 4LC9B 5AQSA 4H0OA 3WQTA 4DCHA 4GY2B 2A6AA 3BF3A 2WUSA 4CZJA 3TPQA 2E88A 4BR9A 1K8KA 2ZGYA 1RGIA 3FZKA 4FO0A 4JHDB 5AZJB 1E4FT 3U9DA 3O1BA 4BRAA 5F1XA 3D7EO 3VEXA 5AQWA 3VETA 5BPMA 2QWNA 4YDUA 1WUAA 4CI6A 4BRMA 1HKGA 3UKRA 4O5FA 2CH5A 4H0PA 1T6CA 5KPTA 4H03B 3A5NC 2PAVA 3IDHA 5AQRA 2CGKA 2CH6A 1YVNA 3R8EA 3CJ7A 2YCHA 3GG4A 3F9MA 4H5WA 3FE1A 4B9QA 4FOEA 4F9OA 1NGBA 3L0QA 1SQKA 5FPMA 4CD3A 1E4GT 1QQOA 5LJWA 4FWLA 2HF3A 4MLEA 1GLDG 1Z05A 3UB5A 5LJVA 1TUUA 2FLOA 2Q2RA 1LOTB 4IXCA 2I7NA 1JCGA 4WQ5A 3QICA 1KAXA 3VOVA 3WXLA 1XQSC 3WXIA 3D2FA 4FPAA 3M3ZA 3VGLA 4KBOA 1SAZA 2P9UB 4B1YB 5E84A 3CJCA 3D2EA 4IJNA 5AQVA 1RFQA 3HBTA 1KXPA 4CZEA 3CETA 1V4TA 3KHYA 5AZIA 3MN6A 1S3XA 4B1ZA 1K8KB 1X3NA 4M63C 5ADXH 2YJEA 2GWKA 4RCHA 1JCEA 3GE1A 1ZXOA 3AAQA 3HM8A 3HSCA 5AQGA 1NMDA 5KPZA 4BRHA 2YJFA 3FZLA 4H5VA 3H46O 4BRCA 4NB4A 2EWSA 1KAZA 2QWRA 2A42A 5BRHA 4XH5A 3RSEA 3UKRB 5BN8A 3R9PA 4ISGA 4BG8A 2BUPA 5AQFA 5AQXA 2VCPA 1ATRA 2AA4A 4B1XB 1NGCA 2FF3B 2HMPA 3KVGA 4IZ9A 5AQJA 4BRKA 3AY9A 4CZHA 5AQMA 4JD2A 5LY3A 3O08A 5AFUH 3QFUA 1V4SA 4JN4A 3O5BA 3WEEA 5AQIA 5ADXA 4K42A 2YHXA 1BO5O 3L4IA 1HKCA 1BG3A 4CZMA 4ISFA 3H3NO 1QZ6A 5F0XA 3QBXA 4XEIA 1CZAN 3D2FB 4A2BA 2E2PA 1H1VA 3IMXA 3DXMA 1U6ZA 4BVOA 3D2EB 1X9JA 4RTFD 3LM9A 2HOEA 5EY4A 1BOTO 3UE5A 3VEZA 1GLJO 3MDQA 5AZIB 3MCPA 1IG8A 2IVPA 4MO5A 4QS9A 4NO7A 2UYTA 3CJAA 1KAYA 4BQZA 5AQUA 2ASMA 2IVOA 3JXUA 3MK6A 4H5NA 2D1KA 2ZWHA 5AFUA 3C7NA 4IWVA 4CZIA 3CJ1A 3M6GA 1T6DA 2A3ZA 5TKYA 3RSEB 3MMVA 1NGEA 2P9IA 1NGDA 5ELZA 5BRDA 2FSKA 5CE3A 5AR0A 4HWIA 3VGMA 3WUHA 3EO3A 5EXWA 3I33A 3VGKA 4WYBA 4CBXA 1GLAG 1HJOA 4A62A 4IO8A 4JD2B 5AQTA 4BC2A 5BREA 3WXJA 3ZX3A 3LDPA 3O1WA 3ZETA 2E20A 2IIRA 3A5MC 3QFPA 4M7YA 3WEEB 4FPBA 4BRNA 3O80A 2W40A 4BGBA 4FWPA 1T44A 4BC5A 4BRIA 3J8AA 1X3MA 3AAPA 2QWMA 3W0LA 5BR9A 5AQZA 2P9LA 5I9EB 4CZFA 4HTLA 3DXMB 4WQ4A 2V7ZA 2OANA 4PKIA 1NBWA 3IFRA 1C0GA 3LDLA 4I6MA 3A8YA 3EZWA 3HI0A 3QDKA 1Y64A 1ATSA 4JNEA 1HPMA 3VEVA 3CHWA 1R59O 2QW9A 3LDQA 1GLFO 2YI1A 3ID8A 3VEWA 4B1WB 3SLCA 5FPEA 4BRFA 3DAWA 2J4RA 3FFKB 4DHYA 2ASOA 1QHAA 4EAHD 4BROA 2CGJA 4FSVA 1QQMA 1NM1A 3C7NB 4BR2A 1HUXA 4BR7A 4EHUA 3MN7A 4J8FA 3DXKA 1LCUA 3VF4A 2P9PA 2F9WA 2P9IB 4ISEA 4QS8A 3TU5A 3DWLA 3W3DA 3EKSA 1ZC6A 2ASPA 2ITMA 3FZMA 3ENHA 3SJHA 3H1QA 2E2QA 3CI5A 2E2NA 1YAGA 3HTVA 3ZETB 5AQKA 4AM7A 4IJAA 4FWQA 4H0YB 4BRQA 1G99A 4EFHA 4YDUC 2P9SA 3MN9A 3EL2A 2HF4A 2GTDA 4H0TB 2GELA 3UKUA 2P9LB 4FWRA 3L6QA 1BWFO 1BU6O 4PL8A 1TYQA 5KPRA 3VENA 1EQYA 2V52B 3FGUA 4DB3A 4I6MB 2QWQA 3ATVA 4BRGA 2VWBA 4K43A 2D0OA 5FPDA 1MA9B 5JICA 2A40A 3GL1A 5AQYA 1NGGA 4XH1A 3BUZB 3O4WA 4FWKA 5E26A 2A5XA 1SZ2A 2H3GX 4WQ5C 4BR0A 3P4IA 3DXKB 3VF2A 5EX5A 2P9PB 4O8KA 4PKGA 5B8HA 3O6WA 1ZBSA 5BPNA 2GUPA 5AQOA 3WXKA 3QMLA 3ULEA 4H0VB 3H6EA 4EIAA 5KQDA 4QS7A 2P9KA 3A5OC 3VEOA 3QBWA 2Q97A 1MWKA 3H3OB 4FWOA 4CZKA 3H45C 3OHRA 3VEYA 2P9NA 3EKUA 2GEMA 4RWTA 5BPLA 5AQLA 4BVPA 1HLUA 3SMSA 5BN9A 2AP1A 1C0FA 3FR0A 2P9SB 3VESA 3AARA 2Q1NA 4Z94A 4FWMA 4H0XB 4K41A 3UKUB 3VPZA 4EHTA 4GNIA 1NGAA 4DQ8A 2Q0UA 4AM6A 3QB0A 1NGIA 3WQUA 4BQLA 1HKBA 1GLLO 1TYQB 1ATNA 1Q18A 2FF6A 3S41A 1U2VA 2VYPA 2GWJA 4BRPA 3LDNA 1NGFA 1NGHA 3BF1A 3FZFA 4B1VA 1QQNA 2D0PA 1NGJA 3GDQA 4FWSA 5F2RA 1ESVA 3CJ9A 3VF6A 3O8MA 4FOIA 5EOYA 2D4WA 1BA1A 3M1FA 3SMPA 2QM1A 1XC3A 2I7PA 3SK3A 2E8AA 1JCFA 4H5TA 3IUCA 4M7XA 3CQYA 3MN5A 4A2AA 4E1JA 4Y0WA 4BR4A 2DPNA 3ULEB 4BG9A 2P9KB 3CERA 3LM2A 1MWMA 2QXLA 3KZBA 3G25A 2E1ZA 3DJCA 4CJ7A 2P9NB 3BP8A 4PL7A 1DGKN 1GLEG 3CJBA 1BDGA 3ZEUA 5AQHA 4FWNA 1OKJA 2E1YA 4MLHA 5BRFA 3VERA 5JLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K25A 3CIPA 1DKGD 4BC4A 1VSMA 4FL9A 4WCEL 3AA5X 3ZX2A 1ZBUA 2IVNA 3AVKA 5KRTA 3RMDA 4JI3K 4F2SA 1IKVA 4IKFA 4B3SK 2ZGZA 1G15A 4FJNA 3RRHA 3NAEA 4ELUA 4ID5A 1Z6RA 2LSNA 4DUYK 1WAJA 3IAYA 4H5RA 4JI5K 3SAFA 3SQ2A 4JHDA 1DEJA 2GV9A 3DYAA 3HP9A 4BREA 3NF9A 1WOQA 2FXUA 1DTTA 4PKHA 4FM1A 3NMUA 3NF7A 4CHOA 3TANA 5LMNK 3CCLN 3DOKA 3PUFA 3JS6A 3ZSVA 2CGLA 3PY8A 1KFSA 4GKKK 1EP4A 3VQ6A 1IH7A 4BE2A 3CCVN 1NWKA 4RG8A 1ASVA 1Y97A 2ZE2A 5FPNA 3ZX0A 1VSIA 3V6DA 2KZZA 4JI0K 2PBDA 2QWLA 1XUPO 4J2EA 5C2FA 4E1NA 4DUZK 1TUYA 1YXQA 4FJXA 3DLRA 4FVUA 3J7ZO 4W5OA 5J2NA 2HVHA 3KJVA 1HMVA 3CCRN 2WUSA 4CZJA 2ZJRL 3DLBA 2G8WA 2ZGYA 3FZKA 4JHDB 4BACA 4BWJA 4FJ8A 5D3GA 1RDBA 3SI6A 4FYDA 4O5FA 2HHQA 5KPTA 3IDHA 2UUCK 4CEFA 1YVNA 3AVHA 2D0CA 4AHRA 2KQ2A 4H5WA 3FE1A 1OVYA 4F9OA 1HR0K 4CD3A 4IFVA 2NRZA 2HF3A 1GLDG 3UB5A 3CPEA 4Z4HA 2QKKA 4B8CA 3KLEA 2FLOA 2Q2RA 1LOTB 1HNZK 3QICA 3WXLA 1XQSC 3WXIA 3PLAA 5HRRA 3G6EN 3SJJA 2IC3A 3QEWA 2DFEA 4B1YB 1C1AA 4CHNA 3CJCA 3AO5A 5AQVA 3HBTA 3MN6A 1S72N 3HVRA 3M8QA 3AVAA 4RCHA 1C0UA 3GE1A 3VQ9A 4B9MA 3AAQA 3AO3A 4KHYA 3MCAB 4YFUA 2HMIA 3HOSA 5HBMA 4R5PA 3ZSXA 1KAZA 4XH5A 3RSEA 3M8PA 4DFMA 4KB1A 3QO9A 4CHPA 2BUPA 3IS9A 5C24A 4B1XB 3HL8A 2FF3B 2HMPA 5IT9O 4CK2A 4ILHA 2NRTA 1U45A 4BRKA 3OS0A 3AY9A 4JKGA 3O08A 1O13A 2B4JA 1WSJA 4C8NA 3KWIA 4CGJA 3CF5L 4K8XA 1C1BA 4LF8K 3L2QA 5GADP 2HHHK 1BG3A 4CZMA 1YTUA 4E19A 4A2BA 5GIPA 1CZAN 3M8RA 2O4GA 3NF8A 4ILJA 3WXMB 4AHTA 1FJGK 1RILA 4RTFD 5EY4A 3VEZA 3PX4A 2XY8A 4IEIA 1IG8A 1LWFA 1VK0A 4QS9A 4DWIA 1J54A 3CM5A 2IVOA 1XC9A 1KLNA 4H5NA 3O3HA 4E7IA 2FBYA 4G9ZA 4ILGB 4NYFA 3ZCMA 3RSEB 5DMRA 1GOCA 4KO0A 3HOTA 3PX0A 4KI4A 1NGDA 5ELZA 1IO2A 5AR0A 3VGMA 2HBMA 4OPAA 1BHLA 3EO3A 3MWTA 3NH1A 3AVGA 2HHIA 4JKGB 3ZSRA 3K58A 4BC2A 5BREA 3P5JA 3ZETA 4O0IA 4FPBA 2AJQA 4BGBA 3QIOA 1UAXA 3K9KA 5J1EA 1D9FA 1T44A 4BC5A 4E3SA 1XMQK 1VQNN 3AAPA 3OYMA 2QWMA 3W0LA 5BR9A 4JKBA 2UUBK 3C6AA 2NNWA 1S6QA 4IO9L 3A8YA 1KVAA 1HPMA 1ASUA 4YOWA 4YORA 1GLFO 4B1WB 3SLCA 3FFKB 3E9PA 3J7YP 3SV3A 4K8ZA 4CERA 1RT6A 1QHAA 2CGJA 4FSVA 1QQMA 4BR7A 1NK8A 4EHUA 4AHSA 4J8FA 4BWMA 3VF4A 4CGHA 1K6YA 2Q3SA 1GOBA 5SWMA 3IG1A 1I94K 1VQ9N 3SQ1A 4CIGA 3P1GA 3DWLA 1JJ2M 2BH1A 1ILYA 1HJRA 1L5UA 4OX9K 2E2NA 2QI2A 3ZETB 3VQAA 4BRQA 3RMCA 1G99A 3I56N 4YDUC 3SBGA 1ZBFA 2G8VA 2GELA 5C12A 3KKSA 3KKRA 4PL8A 2RHKA 1Q9XA 4I9QA 2QXFA 1UA0A 3OYLA 3G4SN 3SCXA 2QWQA 3ATVA 2ZD1A 3Q7BA 5FROA 1WSEA 1IKWA 4K43A 5FPDA 1MA9B 1X9MA 3LWMA 1EKEA 3QEPA 2HHUA 1TL3A 2WOMA 1IBMK 2KW4A 4FWKA 4XIUA 2HHXA 3U3GA 5M1FA 2FC0A 5E26A 1TK8A 4IOCL 4WQ5C 4Q0BA 3P4IA 4DSKA 3HPOA 3VF2A 4MDBA 4O8KA 4PKGA 5I3UA 3O4NA 2OPRA 2G8FA 5E41A 1KTQA 1VQON 3TAMA 4CGFA 2X78A 2P9KA 5FDLA 4CJ3A 3SUNA 2Q97A 1MWKA 3H3OB 4FWOA 5H1SQ 1UA1A 1VSJA 4DV0K 4DV3K 4YOUA 1HLUA 3U6FA 5BN9A 1WSHA 4GV9A 5HOOA 3VESA 4KFBA 1D8YA 3MXMA 4PQUA 2Q1NA 4Z94A 4JEPA 4H0XB 4K41A 4EHTA 4LSNA 1DT9A 4HHTA 1NK7A 2Y1JA 3ZYYX 1TK0A 2FF6A 2VYPA 1NKCA 4DTPA 2BE2A 4MFBA 3ITHA 4B1VA 3HXMA 3SPZA 1RT7A 4FWSA 2D0AA 1KD1O 5LMUK 4PWDA 3V9XA 3SMPA 1J9AA 3SK3A 4PY5A 3AVMA 5DK5A 4F4KA 1T7PA 3KTQA 3CQYA 4A2AA 3P31A 3CG7A 4Y0WA 1T3VA 2DPNA 5FLXO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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