1RGIA

Crystal structure of gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title Structure of the N-terminal half of gelsolin bound to actin: roles in severing, apoptosis and FAF
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 109
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1rgiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1rgiA04
3EZWA 2HF3A 1MA9B 4BGBA 4BVOA 3CQYA 4H0XB 5AR0A 3KZBA 4AM7A 4H5NA 1S3XA 2QWRA 4CBWA 2FSNA 4WQ5C 4CZLA 5AQHA 2ASMA 3D2EA 3W3DA 1TYQA 1C0FA 4CBUA 5JLFA 1GLBG 3GE1A 1NM1A 4FOEA 1KAZA 2A40A 3U9DA 3KHYA 1HUXA 4MO4A 3CIPA 1ZXOA 3LDOA 5BPLA 3R9PA 5AZJA 2CH6A 2QWPA 4H0YB 3DXKA 4WYBA 2W41A 3H46O 2A41A 5F2RA 4BR0A 4B9QA 3JXUA 4FWQA 4B1UB 1HKGA 4CZIA 2ASPA 3OHRA 1GLCG 1NGEA 5KPRA 2E2PA 3MDQA 3WXKA 4ISFA 1HX1A 2A5XA 3G25A 2ZGYA 3A5NC 1DEJA 3O1BA 5AQLA 4E1JA 2PBDA 3FZMA 3L6QA 5KPTA 2D1KA 3SLCA 3WXJA 2D0OA 3H45C 3CJAA 5LJVA 1ZBSA 1U2VB 3EKUA 4KBOA 2OANA 5AQKA 1IG8A 3B8AX 4O8KA 2UYTA 3RSEA 4FL9A 3DXMA 3HTVA 4BC5A 2YI1A 1NBWA 3WQUA 5BRHA 4QS9A 2Q0RA 4BR4A 3MN6A 3C7NB 2HF4A 3VENA 2DPNA 4H0VB 2V51B 4BRKA 5AQGA 5BPNA 3IFRA 4DB3A 2E8AA 3QFUA 3CJCA 1KAYA 1OKJA 4JHDB 4CZHA 4H03B 1WOQA 2KHOA 3I8BA 2ZF5O 3LM2A 5AQFA 4FOIA 4QS7A 3A5MC 4DCHA 3A5LC 2FF6A 3LL3A 3L4IA 3QDKA 3ATVA 1Y64A 5BREA 3VERA 3HZ6A 5AQJA 4GY2B 4FWPA 2BUPA 2E2NA 4CJ7A 2HMPA 2IVPA 2QWMA 3J8AA 3A8YA 2I7PA 2Q1NA 2E88A 2Q31A 4XEIA 2VYPA 4NO7A 3U8XA 4IXCA 3VEOA 4DHYA 4F9OA 2E2QA 2QWNA 4EFHA 3AARA 3FZFA 2V52B 1HPMA 4HWIA 3JS6A 1Z6RA 1X3MA 1T44A 2IVNA 3FFKB 4H0TB 2P9KA 4CI6A 4BR9A 4H5WA 3AAQA 2I7NA 4IJAA 4I6MB 3FR0A 1SAZA 4BQZA 5BN9A 1GLDG 3ENOA 2YHYA 4BROA 3EL2A 3FGUA 4WQ4C 1SQKA 3UKRA 1NGAA 3BEXA 5AQYA 5KQDA 1HJOA 2H3GX 3BP8A 5ADXH 2ASOA 5JMVA 1G99A 3WXIA 1TUUA 1V4SA 2QWQA 3VF4A 3WEEB 5E26A 1YAGA 2P9UB 3FLCO 1NGBA 3QBXA 4JNEA 1XUPO 4BRAA 3ZETB 3CJ7A 2E1YA 5EY4A 3LDLA 1WUAA 3L0QA 3DAWA 4PL7A 5BRDA 4YDUC 2YJEA 3H1QA 4CZFA 1NGCA 1XQSC 1QQOA 3O6WA 1BA1A 5AQTA 1KXPA 3QMLA 4FWOA 5EOYA 5CE3A 3VETA 1HKCA 3O8MA 4M7XA 2QM1A 3M6GA 5FPNA 5BN8A 3WUHA 4JD2B 5ADXA 3H3NO 3CHWA 4JHDA 3EN9A 4BG8A 4XH5A 1CZAN 5AQWA 3AAPA 3GL1A 2P9PB 1JCGA 4K41A 2ITMA 4ISEA 5F1XA 4FWMA 4EHTA 1GLFO 1RGIA 1BOTO 3KVGA 3O4WA 2E1ZA 4FWLA 1QHAA 3ENHA 3QICA 4J8FA 1H1VA 3GBTA 2QWLA 5B8HA 5AZIB 3UKUB 3MCPA 1V4TA 3SMPA 4CD1A 3LM9A 4XH4A 3U9ZA 3EKSA 1QZ6A 2W40A 1DGKN 2PAVA 4IZ9A 2WUSA 2FSKA 2VCPA 3QB0A 1NGFA 5LJWA 2BTFA 2P9NB 4BR5A 3VGLA 1LCUA 3D2FA 2P9LA 4A2AA 3R8EA 2IVOA 4B1VA 2P9IA 1BU6O 4H0OA 4IWVA 3ZEUA 1YXQA 1E4GT 2D0PA 2YHWA 3VF2A 3IDHA 3CQXA 4MO5A 4FWKA 2F9WA 4EAHD 1NLVA 4B1ZA 4H5TA 2NLXA 4BRFA 5AQZA 3QFPA 5AQVA 1BO5O 2D4WA 3C0BA 2Q36A 3D2EB 3UB5A 2CH5A 1TYQB 3VEXA 4FPAA 1NGDA 2A42A 3UE5A 2ZGZA 3R6MA 1NWKA 4Z94A 1K8KA 2GWJA 3ZX2A 4A62A 1JCFA 5KPZA 1SZ2A 4PL8A 3MN9A 2AA4A 5AZJB 1JCEA 3FZKA 4B1XB 3BF1A 4WQ5A 3DXKB 3VEYA 1BA0A 3WT0A 4MLEA 2A3ZA 4BR2A 3VGKA 1BDGA 1NGIA 4BVPA 3ULEB 1HKBA 3BF3A 1ATNA 5BRFA 5AQIA 1Z05A 1MWKA 3GOIA 4H0PA 4CZEA 5FPMA 1TUYA 2GUPA 2Q97A 2FF3B 3H1VX 5AQSA 5EVZA 4CD3A 3VGMA 1GLLO 1NGGA 3RSEB 2E20A 3DXMB 4GNIA 4FO0A 2F9TA 5AQNA 4AM6A 3FZHA 3O1WA 4ISGA 1BG3A 4HTLA 4FWNA 4BRNA 2NRHA 3LDNA 1MDUB 2YJFA 3BUZB 2YCHA 3P4IA 2IIRA 1GLEG 4B1WB 4BGAA 1U6ZA 4M7YA 5JICA 1RDWX 1U2VA 4BRHA 1NMDA 4EHUA 3H3OB 1BUPA 3O08A 1ESVA 2GTDA 2QW9A 3CJ9A 3CJBA 3EO3A 2CGLA 1ATSA 2J4RA 4RCHA 4DQ8A 1X3NA 1DKGD 2E2OA 3FZLA 5LY3A 3HBTA 3C7NA 4PKHA 5FPEA 1QZ5A 2P9SB 3WXLA 3QBWA 4BRQA 4JN4A 3MMVA 1X9JA 4K42A 3MN7A 4BRMA 2NZTA 3FE1A 3IUCA 5AQQA 4FWRA 4LC9B 3F9MA 2QXLA 3VEWA 4A2BA 2FXUA 4BRLA 2P9KB 2Q0UA 4BC2A 5EX5A 1T6DA 3GG4A 2GELA 3SMSA 3A0IX 1BWFO 1QQNA 4B1YB 1C0GA 3SK3A 3VF6A 3UKRB 2EWSA 4PKGA 2A6AA 1E4FT 4BR7A 1T6CA 3ULEA 4H5RA 3LDQA 3HM8A 3O5BA 4I6MA 3VOVA 3U4LA 4CZJA 5AQUA 3ID8A 2FLOA 3CETA 1KAXA 1GLJO 4BRGA 3I33A 4RWTA 4WQ4A 3AY9A 4BRPA 1D4XA 1Q18A 1NGJA 1YVNA 1P8ZA 4CZKA 4FWSA 2V7YA 3WEEA 5EXWA 1XC3A 2GEMA 5F0XA 2GWKA 2ZWHA 2P9UA 4M63C 4BRDA 2YHXA 4BC3A 3ZETA 2CGJA 5AQRA 4XH1A 3ATUA 1ATRA 1GLAG 5AQOA 3W0LA 4H5VA 4K43A 4MLHA 3A5OC 2AP1A 2VWBA 4JAXA 3VEZA 3WQTA 4YDUA 5E84A 4Y0WA 3VPZA 4C23A 3O80A 1QQMA 3DJCA 5AFUH 1J6ZA 1ZC6A 2CGKA 4IO8A 1EQYA 4O5FA 3VEVA 3ZX3A 4CBXA 3IMXA 3MK6A 4JD2A 5FPDA 5I9EB 5JLHA 2FSJA 2P9SA 3HI0A 5AQMA 2Q2RA 3GDQA 4BG9A 2P9PA 3D2FB 2P9LB 4BRIA 1HLUA 4RTFD 2P9IB 3TU5A 4EIAA 3H6EA 3CI5A 4NB4A 3ZEUB 5AZIA 3CJ1A 3UKUA 5KQ8A 5BPMA 3HSCA 4K25A 5TKYA 4IJNA 4BREA 3M1FA 1IJJA 3MN5A 5ELZA 3DWLA 1YUWA 4QS8A 1MWMA 3SJHA 5BR9A 1LOTB 2P9NA 4BC4A 1NGHA 3S41A 5AFUA 3VESA 2V7ZA 1R59O 3M3ZA 5AQPA 4CZMA 4FSVA 4A61A 1RFQA 5AQXA 4FPBA 4L3QA 2HOEA 4PKIA 1S22A 4BRCA 3CERA 2QWOA 3TPQA 4BQLA 3LDPA 3D7EO 4CZGA 3ZX0A 1K8KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHPA 1IO2A 3EZWA 3HK2A 3LPUA 2D0BA 2HBKA 3KK7A 4AHRA 4N76A 1ILYA 4CJEA 5HBMA 2IAJA 4CZLA 5AQHA 4OGEA 3ZCMA 4AHUA 4AHCA 4CF0A 1TK8A 3AVCA 3EEQA 3AO5A 5JENA 3QIOA 1FXXA 3BGRA 2A40A 3CIPA 3TSPA 3LDOA 5BPLA 4IOCL 1IKVA 4CE9A 3LWMA 1VSJA 3WXMB 3SQ1A 3LP0A 5F2RA 3B6OA 4NXNK 1KFDA 4CIEA 2ASPA 3OHRA 1GLCG 4AH9A 2E2PA 3MDQA 1KVBA 3WXKA 1VAZA 1TKXA 4FJXA 1VQ8N 3O1BA 3A5NC 1DEJA 1HPZA 4LF6K 3MX5A 1J5OA 2PBDA 1RBUA 2WC9A 2OA8A 4F2SA 5IWAK 4PY5A 4KH6A 2D0OA 2HHVA 1U2VB 4KBOA 3LDSA 5AQKA 3RSEA 4FL9A 1TAUA 3DXMA 2VG5A 5BRHA 4ZTFA 3PSIA 4FLZA 4KHUA 2O8DA 4QS9A 1JLAA 4JKCA 4CHZA 3LAKA 3MN6A 2HF4A 3VENA 1HYSA 4BRKA 4F2RA 5AQGA 4M41A 2E8AA 4FZXC 1RT3A 1JLEA 3TAQA 2Y1IA 4QS7A 3A5MC 4DCHA 3A5LC 4LF7K 2FF6A 4B08A 1JL1A 4DV4K 5AQJA 4GY2B 5DM7L 4IO9L 2BUPA 1RBSA 3NHGA 2HMPA 4CGJA 2IVPA 2QWMA 4YOYA 1IKXA 3KLFA 3OS2A 3K9KA 2E2QA 3S3NA 3KTQA 1QQCA 4FLVA 5C0YA 4HWIA 3C95A 3JS6A 3J81O 2F4VK 1U4BA 1VQ9N 2GBZA 3HP9A 2ETJA 2R7YA 3AAQA 4DQPA 3P5JA 1OH6A 3LALA 3RVCA 4BROA 1L3TA 4ZHRA 1SQKA 3UKRA 1NGAA 3AA3A 5HRNA 5M1KA 4NCGA 1EKEA 3V9ZA 1L5UA 4CJPA 5JMVA 1NK4A 1V4SA 4YNQA 3J80O 1YAGA 3FLCO 3CYMA 5M1OA 4G1QA 4FJKA 2KW4A 5DMRA 4BDZA 2P1JA 2NUBA 3HYFA 4KAZA 1WUAA 3DAWA 4IG0A 2UXCK 2BGGA 2Q3SA 3HP6A 4FJMA 2QKBA 4IOXA 2YJEA 3H1QA 3SAHA 4MQ3A 3QO9A 3KKSA 1OH8A 1KXPA 3SI6A 3VQCA 4DV0K 1HKCA 3AVAA 4KPYA 5GINA 3CMAN 5BN8A 2X6SA 2O8CB 4BG8A 4LH4A 4XH5A 1VRUA 3KLGA 3MEGA 3HVTA 4B8AB 4DR1K 4CJWA 2WFBA 3HL8A 1VSKA 1T7PA 3UIQA 3QICA 4DTJA 3PV8A 2QWLA 5AZIB 3SMPA 1OH7A 3U9ZA 3PX0A 1JXBA 4CEOA 3KKRA 2WUSA 1IKYA 4CJRA 4LF5K 1HNXK 2P9NB 3D45A 3VGLA 3D2FA 1VSIA 1A5XA 4M3RA 3O3FA 3OY9A 3ZSRA 1E4GT 3CM5A 3VF2A 3IDHA 3KWGA 1K9MO 4FWKA 2QEXN 4EAHD 1NLVA 4B1ZA 4DU4A 1XI1A 3V9XA 4BRFA 1VSEA 1HYVA 3DRRA 2D4WA 3HOTA 3TAEA 2HW3A 4FZZA 5SZTA 1NGDA 4RG8A 2KLAA 4CGHA 1VQ6N 1XC9A 4DG1A 1X9WA 4ILHA 3G10A 2Y1JA 3ZX2A 1JCFA 4IEIA 2AA4A 3DYAA 4OPHA 4WQ5A 4DV1K 4QOZB 3PO5A 1OH5A 4DR6K 4KV8A 1NGIA 2EX3A 4OVLA 4ID5A 3ULEB 1BISA 3BF3A 3NF6A 5BRFA 4FK2A 1Z05A 1MWKA 3GOIA 2FBXA 3MWPA 4JKBA 1I39A 3H1VX 1YVUA 5AJ3K 4JI5K 2KFZA 3M8QA 3RSEB 1NGGA 2JWKA 3M8PA 1SL1A 2RHKA 3DXMB 4RW9A 2F9TA 2Z1IA 1J54A 4AM6A 1KRPA 3L2WA 3O1WA 4ISGA 1ZBIA 2O8DB 4BY9C 4BRNA 2NRHA 3LDNA 2YJFA 1JLBA 4I9LA 4B9MA 2AJQA 1S72N 1JKHA 4DLGA 3PSFA 4BGAA 1UA0A 4A5BA 4ELTA 4FJHA 3H3OB 1BUPA 1W7AA 2G8VA 2QW9A 3EO3A 2CGLA 4DQ8A 1DKGD 4DTXA 3K57A 1BHLA 3VQQA 3HBTA 1QTMA 4JKHA 3CYGA 3F73A 4J2AA 4IKFA 4PKHA 3C6UA 2P9SB 3QBWA 4JN4A 5C12A 3MEEA 4H4OA 1CZBA 1NNEA 5AQQA 4BWJA 2Z1HA 3DLHA 4F8RA 4AF1A 1ASWA 1RDDA 3CG7A 1P90A 3SCXA 3TSQA 4BC2A 5EX5A 5CY4A 3SJJA 3OS1A 1YF5L 3GG4A 3SMSA 4I9QA 1C0GA 3V9SA 3V1QA 3UKRB 3EE8A 5KTQA 4LFBK 3DLRA 1ZYQA 1YTUA 2ZM6K 3CCVN 3AVMA 1VQ4N 1S9GA 4H5RA 3G6EN 1WSJA 4F3OA 3HM8A 3O5BA 1I94K 1BIZA 1FKOA 2NRXA 4JKFA 3CF5L 2HNZA 2OZSA 2KKZA 3S9HA 4OKEA 1ZBFA 5I3UA 4CZKA 1UA1A 2V7YA 3WEEA 2RPIA 5F0XA 1D9FA 1HMVA 4PA1A 1RCHA 2YHXA 4JK7A 2PFUA 3ZETA 5HROA 5AQRA 5CR4A 4H5VA 4K43A 4MLHA 1ASVA 3MXJA 4EP4A 3VPZA 3O80A 4C1NI 1Q9XA 1OVYA 1ZC6A 4JKDA 4TSXA 3QIPA 1EQYA 4O5FA 3ZX3A 2WOMA 3IMXA 3MK6A 5FPDA 4HUFA 1RDCA 4CJQA 1Z26A 2P9PA 4CCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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