3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
1U2VA 2CGKA 2DPNA 2D1KA 2D0OA 3KZBA 4DQ8A 4MO5A 4IO8A 1E4GT 1QZ6A 2A3ZA 3MMVA 3H1VX 4H5NA 3HBTA 1MWMA 1XUPO 3WXIA 2QW9A 1C0GA 3UE5A 4B1XB 3CIPA 3LDPA 3FZLA 5AQUA 4CBWA 5JLFA 1D4XA 2Q31A 3WEEB 4WQ4C 3WQUA 3AY9A 1G99A 2HF4A 3EN9A 1RFQA 2P9SA 4RCHA 5AFUH 2QM1A 2QWQA 3ZEUB 4NB4A 2V51B 1KAZA 1XQSC 4HTLA 3GOIA 2A5XA 3H6EA 3C7NA 1NBWA 3D2EA 5AQPA 2GEMA 1ATRA 3UKUA 3VERA 3AAQA 4FOIA 5BPMA 3A5LC 1MA9B 4QS7A 5AQOA 1NLVA 1Q18A 5AQFA 2IVPA 5FPNA 1SZ2A 1JCFA 3U9ZA 3BF3A 4PKHA 1T6DA 4L3QA 1Y64A 4A2BA 4H0VB 4M63C 3DXMA 1ZBSA 4WQ4A 5CE3A 5KQ8A 3D7EO 3M3ZA 3UB5A 3VF4A 5BN9A 4FPBA 3CJ1A 3A5MC 5F1XA 1NGFA 5AR0A 4ISEA 2YCHA 1Z05A 1DKGD 1DGKN 4A2AA 4EHUA 5BRDA 1BDGA 3CJBA 2ASOA 2I7PA 3VEXA 5FPDA 3MN7A 3CQYA 2F9TA 3GG4A 2YJEA 3MK6A 2E2OA 1NWKA 2GWJA 5AQIA 2Q2RA 4BR2A 3WEEA 3ATVA 4BR7A 3WUHA 5AQYA 2HF3A 1BU6O 4JNEA 4CZLA 3MCPA 3BP8A 2Q0RA 4B1YB 3DAWA 3BEXA 3ZEUA 5ELZA 2P9UB 4BQZA 3CETA 1NMDA 4CD3A 2FXUA 4K43A 1T44A 3ZETB 1GLBG 3JXUA 4FWKA 4CZEA 3FZKA 4I6MB 5EVZA 3U9DA 4PL7A 3VF2A 3LDNA 4E1JA 4H5RA 5AQJA 3QFPA 3EKUA 1U6ZA 2BTFA 4BC4A 3O80A 5EX5A 4BRQA 3H3OB 2FSJA 1TUUA 4CZHA 3VETA 4IWVA 1NGAA 2V7ZA 3O5BA 2HOEA 4MO4A 2P9NB 4JHDB 4A61A 5AZJA 3D2FB 5AQNA 4CZJA 3MN6A 3H1QA 2FF6A 3QBXA 3HM8A 3LM2A 1QHAA 2P9PB 1SAZA 4J8FA 3W0LA 3VESA 4CBUA 1X9JA 1JCGA 3UKRB 4CZKA 3U8XA 3LDLA 4BGAA 1QQNA 1RGIA 1GLDG 1IJJA 3FE1A 1R59O 2P9LB 4K42A 3SJHA 1GLAG 2HMPA 3DXKB 4EIAA 4CJ7A 2FLOA 1S3XA 5KPZA 2QWOA 1KAXA 2P9UA 4RWTA 4FWMA 5AQSA 1BG3A 3IDHA 3CJAA 5AQHA 4JAXA 3VEZA 3ZETA 4CZGA 2Q0UA 2ITMA 2E1ZA 1V4TA 4I6MA 5AQWA 3GE1A 4BRDA 3BUZB 1HKGA 3ZX0A 5FPMA 2E88A 4MLHA 1TYQB 4F9OA 4A62A 3KHYA 1MWKA 2E2QA 1YVNA 3ULEB 2Q1NA 1J6ZA 4B1UB 2YHWA 3AARA 5AZIB 2W40A 3VEOA 3CQXA 2IVOA 5AQZA 5LJWA 2P9NA 3CJ9A 5LJVA 1YUWA 4JHDA 4DB3A 1CZAN 3VF6A 2AP1A 3D2FA 3MN5A 3FFKB 5EXWA 1BA1A 3AAPA 4BVPA 3I8BA 5BRHA 2CGJA 4FWNA 1RDWX 3DJCA 2GUPA 4BRFA 1GLJO 2PBDA 1V4SA 5JICA 4FPAA 4BQLA 2P9LA 3M1FA 2KHOA 5EOYA 3HZ6A 3WXLA 3LM9A 1QZ5A 3MN9A 4H5VA 2FF3B 5F2RA 3FGUA 3IFRA 4FL9A 4M7XA 1YAGA 1GLCG 1BO5O 5BRFA 4K25A 1KAYA 5BN8A 2V7YA 4H0PA 4XH5A 3R8EA 3L6QA 1TUYA 4B1VA 3GBTA 3HTVA 2YHYA 2A42A 3TU5A 4AM7A 3EO3A 1ATNA 5AQQA 3SLCA 1TYQA 4ISFA 4KBOA 2P9IB 3O8MA 1DEJA 2E20A 5JMVA 2P9KB 2QWRA 3ULEA 4DHYA 2A6AA 3S41A 3VGKA 3W3DA 4CZMA 2ASPA 3VEVA 5KPRA 5AZIA 3BF1A 4QS9A 3QFUA 2QXLA 4B1WB 4WYBA 2GTDA 2E2PA 1E4FT 3EZWA 3P4IA 3VENA 3SK3A 2YHXA 5AQMA 3CJ7A 1GLLO 1BUPA 2QWLA 5F0XA 2CH6A 2ZGYA 1ESVA 4FWPA 4BRIA 1ATSA 4BRLA 4BR4A 4FWRA 3QB0A 4M7YA 2A41A 4O8KA 3VOVA 2ASMA 4FSVA 3O1BA 1NGGA 1Z6RA 3L4IA 1K8KB 2BUPA 1P8ZA 3O1WA 3C0BA 3L0QA 4RTFD 4BG9A 2QWNA 3FZMA 4BR9A 3EKSA 4BC5A 2AA4A 1X3NA 1H1VA 1ZC6A 2D4WA 4XH1A 4PL8A 1NGDA 5E84A 1HPMA 4HWIA 3A5NC 5BPNA 4BVOA 3FR0A 2IVNA 1SQKA 1QQMA 3IMXA 3ZX3A 4GY2B 1NGCA 5AQGA 5FPEA 1HLUA 5ADXA 3CERA 3ZX2A 4QS8A 4O5FA 4IXCA 1WUAA 2F9WA 5AQTA 4BRCA 5LY3A 2P9KA 1NGEA 4FWQA 4GNIA 4FO0A 3O4WA 4PKIA 2W41A 2CGLA 4CZFA 5ADXH 3QMLA 2YJFA 3VEWA 3EL2A 3FZHA 1NGBA 4FWLA 2PAVA 3LDOA 5AQXA 3ID8A 4AM6A 1NGJA 3JS6A 4BROA 3QICA 3ENHA 5AQRA 4CD1A 2ZWHA 3QDKA 3FZFA 4BG8A 2NZTA 3A8YA 4EAHD 5AFUA 1HKCA 5AQKA 2Q36A 4BRHA 3I33A 4K41A 1K8KA 5TKYA 1NGHA 4B1ZA 2VYPA 3RSEB 4BRKA 1JCEA 1LCUA 3WQTA 4Y0WA 2NLXA 2V52B 2A40A 3R6MA 5E26A 1HX1A 2P9PA 4WQ5C 4IZ9A 1XC3A 1LOTB 5AQVA 3TPQA 5BPLA 1WOQA 3CHWA 3UKRA 4BRAA 1C0FA 4H5WA 4NO7A 2UYTA 3DWLA 3KVGA 3FLCO 2ZF5O 1BA0A 4YDUC 4DCHA 2E8AA 3WXJA 3DXKA 2NRHA 4PKGA 4BGBA 1QQOA 2VWBA 2H3GX 5BREA 4BRNA 1EQYA 3ATUA 4H5TA 2GELA 5BR9A 4BREA 4B9QA 3F9MA 3VEYA 4IJAA 3MDQA 3J8AA 4EFHA 5AZJB 3H45C 1HKBA 1KXPA 4WQ5A 1X3MA 3GL1A 2EWSA 2D0PA 4JD2B 3GDQA 3CJCA 4XEIA 3A0IX 1OKJA 4XH4A 2VCPA 3WXKA 1T6CA 4FOEA 3G25A 3LDQA 3VGLA 4ISGA 3A5OC 2ZGZA 4YDUA 2E2NA 1U2VB 3ENOA 3CI5A 3QBWA 3LL3A 5JLHA 4H0YB 3RSEA 4EHTA 1GLEG 5AQLA 4CZIA 3HI0A 3H46O 4H0XB 4CBXA 2GWKA 3SMSA 4H0OA 4C23A 2YI1A 2Q97A 5KPTA 1MDUB 4BC3A 2OANA 3R9PA 2WUSA 1NM1A 1YXQA 2J4RA 1BOTO 1BWFO 3M6GA 2P9SB 5KQDA 3O6WA 4CI6A 3HSCA 2FSKA 2QWPA 2E1YA 3OHRA 1IG8A 5EY4A 4BRMA 1NGIA 4BC2A 5I9EB 4LC9B 4BR5A 3WT0A 3C7NB 3D2EB 4Z94A 4MLEA 1ZXOA 4BRPA 3UKUB 5B8HA 4JN4A 2IIRA 3VGMA 3VPZA 4FWOA 3SMPA 3H3NO 3U4LA 3IUCA 4BRGA 2FSNA 2P9IA 1S22A 2QWMA 4JD2A 1HUXA 4BR0A 4FWSA 2CH5A 4H0TB 2I7NA 3DXMB 3O08A 3B8AX 1GLFO 4IJNA 4H03B 1HJOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZJPL 4FM2A 3MWTA 4LH4A 4DQ8A 4MO5A 3CF5L 3P31A 1E4GT 3MMVA 4H5NA 4CF8A 3TSUA 4YOVA 3RMCA 1L3TA 1SL0A 4C8LA 1N33K 4B1XB 3O3FA 2OCEA 3A2FA 3DOKA 5AQUA 5JLFA 4DR1K 2Q31A 1XNRK 5SWMA 3AY9A 1O1WA 3EN9A 4RW7A 3AO5A 5AFUH 3CC7N 3ZEUB 1JLFA 4G9ZA 5CR4A 1TK5A 2Q3SA 4NLCA 2A5XA 3H6EA 3UKUA 5J2QA 4FOIA 1XHZA 1A5XA 1L5UA 1MA9B 4DF4A 5AQOA 4KHSA 1IKYA 1BCMA 1SZ2A 4A2BA 4IO9L 1VQ9N 5BN9A 4DG1A 4B8AB 3CJ1A 2OPQA 4JK9A 2NRZA 2YCHA 4DUZK 1DKGD 4YHHK 1DGKN 4BE1A 4NXMK 1L3VA 1M90O 3B6PA 2I7PA 1VQLN 2E2OA 2GWJA 5AQIA 1E3MA 4BR2A 3NF6A 2Z1HA 3WEEA 3DLBA 1KVCA 2VG7A 3ZT0A 5AQYA 2HF3A 2UXCK 1BU6O 3CCVN 4DTNA 4CZLA 5MLCQ 2Q0RA 3AVGA 3LP2A 3MAQA 3QEVA 3QNOA 4QOZB 5HRRA 4OPHA 4HCCA 1HYVA 5EVZA 3PUFA 4BY9C 4E1JA 3EKUA 5J2PA 3O80A 1WSJA 1MU2A 3DRPA 1YIJN 2FSJA 3F5TA 4CZHA 4O0IA 4FJXA 1HNZK 1NK6A 1Q86O 1YJWN 2A1RA 1NG9A 3D2FB 5AQNA 1K8AO 4UY8O 3E1YA 3LM2A 3G6EN 4KRFA 1Q8IA 4CBUA 3J7YP 3G0ZA 4U67L 3ULDA 3DYAA 1GLDG 1VQ5N 4CJ7A 4CJFA 2P9UA 4RWTA 4FK4A 1SKWA 4FM1A 1BG3A 4DV5K 3TTDA 2YNFA 3IDHA 3VEZA 1GOBA 3ZETA 4JRQA 4DR4K 1V4TA 4JRPA 4M3RA 3GE1A 4CJEA 5J2MA 4WCEL 2GUIA 4DSFA 4OPJA 4F9OA 4X65K 3L4QA 4B1UB 3TAFA 2YHWA 5AZIB 2W40A 4FZYA 4KH6A 3OYFA 4CK2A 1YJNN 5LJVA 1YUWA 4R79A 3VF6A 4BE2A 3HOSA 2HHVA 3OJSA 4FLXA 3O9UA 3I8BA 5FROA 4F4KA 4JLHA 1RT2A 1SKRA 2GUPA 1NK4A 1GLJO 1V4SA 1RDUA 5JICA 4FXDA 4FPAA 3WXLA 3HZ6A 4DUYK 5GAGP 2HMIA 4O0JA 4H5VA 4FVUA 3VQDA 1NMNA 1U47A 2V7YA 3VQ4A 4FJ9A 2NRWA 4B9UA 5IWAK 2E6MA 2YHYA 4CK3A 5HRNA 3OYKA 3BDPA 5JS1A 4KI6A 2OA8A 3LPTA 4GV3A 2XY7A 5H1SQ 3F2KA 3SLCA 4DSKA 4ISFA 5M1NA 3NVKA 4OJRA 4AHTA 1VQ8N 3O8MA 3ZSWA 2E20A 4PA1A 5J1EA 3THYB 1QVGM 4CZMA 4JEPA 2YNIA 3TABA 1F21A 2GTDA 3WNGA 3DRSA 3OS0A 1E4FT 1Q7YO 3P4IA 4JK7A 4M42A 4JKFA 5AQMA 1BUPA 3TTCA 4FWPA 3Q7BA 2W42A 1ATSA 4FWRA 4O8KA 4DTRA 1S6PA 4DR7K 4AILC 1NGGA 1Z6RA 3KK1A 1Q9XA 2BUPA 4ILHA 3SUOA 3C0BA 3L0QA 4RTFD 4JKDA 3FZMA 3WNEA 3TAEA 1X3NA 1ZC6A 4DV0K 3OY9A 2QKBA 2HNZA 3A5NC 2IVNA 2ZM6K 4DV7K 1ASVA 1NGCA 5AQGA 3IAYA 1LWEA 2QK9A 2F9WA 4BRCA 2HW3A 3I56N 1TL1A 3O4WA 3VQPA 4KI4A 4CFAA 2CGLA 1RDAA 4CZFA 5ADXH 1NJXA 2RPIA 4L8RB 4DTXA 4BDZA 3LDOA 5HL7L 2O8FB 4LFCK 2JWLA 5GIOA 3ENHA 4JKHA 3V9XA 4X66K 3QDKA 2PYLA 2NZTA 3A8YA 3O4QA 4EAHD 3O3GA 3V1RA 1A5WA 4FLVA 4CEZA 1K8KA 4B1ZA 2P5GA 1KTQA 3K9JA 3WXMB 2Y1IA 5E26A 1UOCA 3OYNA 4Y1DA 1HX1A 3CCMN 3KLEA 4KHUA 4DQRA 2HVIA 5AQVA 1X9MA 4CJKA 1WOQA 3UKRA 4KPYA 4DV1K 1C0FA 1BQNA 1VSLA 1CXUA 1D9DA 3KVGA 3FLCO 3ZCMA 2XO7A 4FJKA 3WXJA 2WOMA 4FLUA 4PKGA 4W5OA 3KD1E 5C42A 2BDPA 2XRIA 4IOCL 4CEAA 3ZSRA 3HP9A 4E7IA 2NRXA 4OKEA 4I9QA 4DS5A 3AVAA 3H45C 4LF8K 4CHZA 1IKVA 1NK0A 1JLGA 2HHUA 3CJCA 4XEIA 4JYAK 3SBGA 4RW9A 5M1QA 3RRGA 4KH4A 3KLIA 3OS1A 3VQ8A 3G25A 3LDQA 3NF7A 4ISGA 2QKKA 2E2NA 3PY8A 3ENOA 1S1VA 2DFEA 3LL3A 1NKBA 2HHSA 4H0YB 3RSEA 4EZ6A 4CZIA 3I8DA 1WSGA 2GWKA 4E89A 2FBXA 1VSKA 4NYNA 3SQ2A 4WFBL 2OANA 1REVA 4GVMA 3SUNA 3ITHA 2FBYA 2OPRA 3ZT2A 3V9SA 1ILYA 3THXA 1BWFO 4I2QA 4BDYA 4CI6A 1KQSM 2WBNA 4CJLA 5CY4A 4JKBA 4E1MA 4I2PA 5EY4A 3ZSVA 3TAQA 3PSFA 3C7NB 3K57A 4M3WA 3D2EB 3O9QA 4MLEA 5HP1A 1ZXOA 5B8HA 3QNNA 4JN4A 2IIRA 3ID6A 1HNVA 4OPAA 3SMPA 3CFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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