3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
2GTDA 5AQUA 4K25A 3DXMA 3RSEA 4B1WB 5BRDA 1HKCA 1SAZA 2GWJA 3MCPA 4BR5A 2P9NA 4EAHD 2PAVA 1YXQA 4QS9A 4WQ5C 4BROA 3L6QA 3H3OB 5EX5A 3B8AX 4B1VA 1LOTB 5KQ8A 3QMLA 3AAPA 3D2EA 2J4RA 1GLLO 3H45C 3FZHA 4BC3A 2NRHA 4MLHA 3W0LA 4BC5A 1BA1A 1RGIA 3H3NO 3C0BA 1R59O 3VEOA 1IJJA 4BRNA 3A5NC 4CZMA 3WUHA 1JCFA 2D0PA 3O6WA 2NLXA 4H5TA 4K43A 1T6DA 4JHDB 4RCHA 3LL3A 3HI0A 4BRIA 1T44A 3BEXA 4CZHA 5LJWA 3VEVA 4EHUA 3F9MA 1KAXA 3MMVA 4E1JA 3CJ7A 2IVOA 4FWSA 3ZEUA 4AM6A 2WUSA 1GLEG 4NO7A 2QWOA 5AQGA 4RTFD 5F2RA 4M7XA 4FWNA 1WOQA 2UYTA 5AQQA 4B1YB 3EO3A 4BR9A 3ID8A 3QFUA 1K8KA 5FPMA 3R8EA 2QWLA 3CERA 5AQKA 2BTFA 3FZMA 1J6ZA 3QB0A 4FPAA 3S41A 2P9PB 1NBWA 1BA0A 4CZFA 3H6EA 5AQSA 3VGLA 2V7YA 2P9KB 4A62A 5FPNA 4FO0A 1BWFO 1MWMA 5KPZA 1C0FA 3HTVA 4YDUC 1U2VB 2CH6A 1Z6RA 3U4LA 1QZ6A 2A3ZA 4BRMA 3HBTA 4DB3A 1TYQB 3LDQA 2D1KA 1HPMA 1YAGA 3DXKA 2YHYA 3LDPA 4H03B 4A2AA 2A41A 2FXUA 1SQKA 4YDUA 3ZX0A 3A5LC 4BRPA 1GLCG 2CH5A 2YJEA 1DKGD 3M6GA 2E1ZA 4BRHA 2E2PA 3HSCA 1TUYA 3IMXA 3O1BA 2QWMA 4IWVA 3ZX2A 5AZJA 1NGIA 3O5BA 3KZBA 3VGKA 1TUUA 2FF3B 2FSNA 4BG8A 4CD3A 2YHXA 5AQPA 4MO5A 1NLVA 1H1VA 4O5FA 2E2NA 4LC9B 4BRCA 3U9ZA 4K41A 1KAZA 3L4IA 5BRHA 3DJCA 4FOEA 3BUZB 3SJHA 4BGAA 3CHWA 4CJ7A 2FLOA 3ZETB 4FWLA 2I7NA 3UB5A 3VENA 1MWKA 3CIPA 2D0OA 3UKRA 2YJFA 1HX1A 2P9LB 1OKJA 4BQZA 2P9SB 2AA4A 2F9TA 2VCPA 4JD2A 3O4WA 3TU5A 2Q0RA 1BOTO 4WYBA 1EQYA 4B1UB 3VF2A 2GUPA 4C23A 3D7EO 3MDQA 1P8ZA 3WXIA 3D2FB 4HWIA 4JHDA 2QWQA 4CZGA 2A5XA 3WXJA 2CGJA 5BREA 2Q31A 3VETA 3EN9A 5BN9A 3A0IX 1E4GT 1KAYA 2IIRA 4QS7A 3VERA 4F9OA 2QWPA 5AZIB 4PL7A 1T6CA 3BF3A 2QXLA 3A5MC 1XC3A 3M1FA 4B9QA 3ZX3A 4H5RA 1QQNA 4BRQA 5CE3A 4WQ5A 4FWPA 3EZWA 2KHOA 1NGGA 1XQSC 2W41A 2E1YA 3J8AA 2P9PA 4AM7A 4BRAA 1LCUA 3MN5A 2PBDA 1U6ZA 1HUXA 3H1VX 2E8AA 2ITMA 4KBOA 3CJAA 5AQFA 1CZAN 3LM9A 3DXMB 5F0XA 4WQ4C 5BPLA 3UKUA 3IUCA 3SK3A 2GEMA 2ZWHA 5KQDA 4CZKA 4BRKA 1TYQA 4K42A 3H46O 1NGAA 4BRLA 1JCEA 3CQXA 3MK6A 4CZJA 4JAXA 5AQVA 5EOYA 4BC4A 2E2OA 3GOIA 4I6MB 1GLAG 1ZXOA 3CJ1A 4WQ4A 1ATRA 2VWBA 4GY2B 1NGJA 1KXPA 5EXWA 4CBXA 3VGMA 1RFQA 2V52B 4DHYA 4XH1A 4HTLA 3AARA 2YCHA 1S22A 4MLEA 4FL9A 4Y0WA 3L0QA 3C7NB 3FFKB 2FSJA 3JXUA 2DPNA 5AQWA 4IO8A 3U8XA 3QBXA 1ZC6A 3LDNA 4J8FA 1MDUB 1HJOA 5B8HA 2IVPA 2V7ZA 3A8YA 4BR4A 2D4WA 1Q18A 3LDOA 3O8MA 3ZETA 4EIAA 5ADXH 1DEJA 2QWNA 3WT0A 1ATSA 3VEWA 1QQOA 1V4SA 2P9SA 4RWTA 3CJCA 1HKBA 4PL8A 4JNEA 4CI6A 3DWLA 4FOIA 5KPTA 4IXCA 3FGUA 1D4XA 3FZFA 2V51B 1GLBG 3QFPA 2A42A 4MO4A 4IJNA 3GDQA 3G25A 3O08A 5AQHA 3WXLA 4BVOA 2NZTA 3CI5A 3D2FA 3ATUA 3CETA 4BG9A 1NM1A 4H0XB 3VEZA 3KVGA 3GL1A 4CD1A 2AP1A 4H5WA 3U9DA 3JS6A 3WEEB 5AZIA 1NGDA 2E2QA 3SMPA 1E4FT 3SLCA 1X3NA 4CBUA 3LM2A 1BO5O 5AQZA 1HKGA 1GLDG 1NMDA 2P9UB 2ZGYA 5AFUA 5BR9A 3HZ6A 4XEIA 4BRDA 1Y64A 5AQOA 3MN6A 2HF4A 3FR0A 2GWKA 1XUPO 2IVNA 5JLFA 1MA9B 2Q0UA 3KHYA 2YHWA 4BRGA 2A6AA 1RDWX 3H1QA 3HM8A 5BRFA 3CJBA 4BQLA 5ADXA 5AZJB 5JLHA 2OANA 3VOVA 4DCHA 4Z94A 5AQLA 4BR0A 5ELZA 5F1XA 4BREA 2P9IB 3IFRA 1GLJO 4PKIA 4CZEA 3DAWA 2YI1A 3ULEB 5TKYA 1C0GA 3MN9A 1SZ2A 2FSKA 2QM1A 3WQTA 4FWQA 4A2BA 4I6MA 4BR7A 4L3QA 1ESVA 2ASPA 3W3DA 2P9KA 1JCGA 3P4IA 4ISEA 4CZLA 3UKRB 2Q1NA 4H0YB 3QDKA 5E26A 3WXKA 2CGLA 4FWOA 2ZGZA 2ASOA 4B1ZA 4EHTA 3CQYA 4JD2B 1U2VA 3GBTA 1Z05A 3C7NA 3RSEB 2W40A 4PKGA 2P9NB 4A61A 4CBWA 1X9JA 3IDHA 4H5NA 1ZBSA 1DGKN 5I9EB 4H0PA 1X3MA 4DQ8A 3I8BA 4ISGA 5AQYA 4BRFA 1NGBA 5AQTA 4IJAA 4BGBA 2FF6A 4BR2A 3TPQA 2HOEA 4CZIA 1BDGA 5BPMA 5JICA 3D2EB 3QICA 3R6MA 3VPZA 2HMPA 2Q36A 1NGFA 2A40A 2HF3A 4FSVA 5AFUH 4H0TB 1NWKA 3AY9A 2BUPA 4O8KA 1IG8A 3FLCO 3M3ZA 4H0OA 4JN4A 3VESA 2E88A 1NGCA 4QS8A 3GG4A 3AAQA 1BG3A 2GELA 2QWRA 3O1WA 4NB4A 4B1XB 3WEEA 3VF6A 1NGEA 5LY3A 5AQNA 3ZEUB 2QW9A 1ATNA 3MN7A 4FWRA 5E84A 3FE1A 1BUPA 3VEYA 2P9LA 5EVZA 4H5VA 3UKUB 4XH5A 2P9UA 3SMSA 1K8KB 1QQMA 3BP8A 2Q2RA 5KPRA 3VEXA 3CJ9A 4ISFA 4BVPA 4IZ9A 1V4TA 3OHRA 4BC2A 5JMVA 4XH4A 4FWMA 5LJVA 1YUWA 3EKSA 2I7PA 5AQJA 4GNIA 5AQXA 3EL2A 4FWKA 3ATVA 1HLUA 1S3XA 3EKUA 5AQIA 3QBWA 4H0VB 3UE5A 3GE1A 3R9PA 3LDLA 3BF1A 2E20A 1BU6O 5AQMA 2ZF5O 3ENHA 4PKHA 2Q97A 3WQUA 5EY4A 1QHAA 2CGKA 2P9IA 4FPBA 3ENOA 3I33A 2EWSA 3ULEA 2VYPA 3O80A 4M7YA 5BPNA 3FZLA 1QZ5A 3DXKB 1GLFO 1NGHA 3FZKA 3A5OC 5AR0A 1G99A 5FPEA 5BN8A 2H3GX 2ASMA 4M63C 3VF4A 4EFHA 5FPDA 5AQRA 1WUAA 2F9WA 1YVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBHA 1SKSA 1YITN 4LF5K 3U3YA 1YXQA 4KI4A 3H3OB 3SBGA 3OYGA 5KQ8A 3KD1E 3QMLA 3OA9A 3D2EA 1LAWA 3FZHA 3RWUA 3OYJA 1RBSA 2RN2A 3MXIA 5GAHP 3SAFA 3AVJA 4H4MA 1CXUA 4DU4A 2VGNA 1R59O 2Q3SA 3VEOA 1XI1A 4ELTA 3WUHA 4CIFA 4WFBL 4KHNA 3O6WA 2IS3A 1IBKK 4KB0A 1T6DA 4JHDB 3F2KA 4RCHA 3HI0A 3SPZA 5M1PA 3BEXA 3CFPA 3OYKA 4FWSA 1M1KO 3DLHA 2WUSA 3AO3A 4C8LA 1GLEG 4NO7A 4RTFD 3EEQA 5F2RA 2PYJA 3DOKA 2DFHA 4B1YB 5CY4A 3IG1A 5KRSA 1K8KA 2GX9A 5FPMA 3TSPA 1WAFA 1YTUA 5JS1A 1NJYA 1OH7A 4B8CA 3PUFA 1NBWA 3V9ZA 1VSMA 4QAGA 3S9HA 5AQSA 3VGLA 3OTOK 4NLCA 4CE9A 4RW4A 4PUOA 3G10A 3RR7A 1C0FA 4LF8K 3HTVA 3KWGA 1RT4A 4Z4GA 3G6EN 4CHYA 2A3ZA 4BRMA 4JI8K 4DB3A 3OYLA 2D1KA 1HPMA 4M3RA 3L2RA 4H03B 2FXUA 4YDUA 3ZX0A 3NAEA 3A5LC 4F8RA 3SBTA 5DK5A 3G0ZA 2O8EB 1U48A 4DQRA 4PA1A 4OPHA 4DR2K 1NOYA 1OH5A 3O5BA 1UWBA 3KZBA 3VGKA 1JLCA 2YHXA 3LANA 3AVHA 1QQCA 4MO5A 1H1VA 3DM2A 4N47A 2E2NA 4BRCA 1KSPA 1QHTA 5C0YA 4FOEA 4JLHA 4B9NA 1SUQA 5CZ2A 3SJHA 4OPJA 2FLOA 4FWLA 3QEIA 4FZXC 3Q7BA 3EE9A 3LAKA 2P9LB 1OKJA 2P9SB 1XC9A 1X9MA 3C95A 3NF7A 4JD2A 3O4WA 2HB5A 1BOTO 4ILGB 3KKSA 4B1UB 1Y97A 2GUPA 3CYMA 3VQDA 3AVGA 3D7EO 3C94A 3QEWA 2XRIA 3O9UA 3NH1A 1L3SA 3OW2M 4C8OA 3AA4A 1JLBA 2A5XA 3K5MA 2G8VA 4O0JA 1BCOA 3V4IA 3EN9A 5D3GA 1JXEA 5BN9A 4M3WA 4CJQA 2B5JA 4QS7A 2QWPA 3SCXA 3IRXA 1T6CA 3BF3A 1XC3A 4DTUA 4FWPA 4DV6K 5DM7L 1CZBA 1VQMN 4OO1J 3K2PA 2A1SA 4HUFA 1X1PA 3ZYYX 2Z1JA 4JV5K 1K73O 2P9PA 3CFRA 1LCUA 4O55A 1A5XA 1U6ZA 2VG6A 1NKBA 2KFNA 4FLYA 2YKNA 4FJ7A 1LW2A 5C42A 3CF5L 3E1YA 3CJAA 5AQFA 1ASUA 4OGCA 4WQ4C 3CM6A 3UKUA 2Y1JA 4BRKA 1TYQA 1ILYA 1D8YA 2WC9A 5HROA 3T1YK 4BDPA 3MK6A 4YOYA 3FFIA 3HK2A 3SAHA 1GLAG 3B6OA 1RT6A 1YTAA 3HT3A 2VWBA 1NGJA 4CBXA 2V52B 4DHYA 4U67L 1ASVA 3RMDA 4LH5A 4FL9A 4MLEA 2YX6A 1QVFM 3ITHA 3JXUA 5AQWA 4IO8A 1I94K 3UIQA 3U8XA 1RTHA 4JK8A 2UUBK 2HVHA 3TAEA 1YJ9N 1YHQN 1LW0A 3KK7A 2IVPA 2D4WA 4JK9A 2QWNA 5LL6Z 3CCRN 2WONA 1ATSA 5HRPA 4E7HA 2BDPA 3CJCA 4PL8A 5H1SQ 4CI6A 3DWLA 4FOIA 5KPTA 1BQNA 3SNNA 3KD5E 1D4XA 3D0PA 2V51B 3CMAN 2BANA 2WBNA 3ZSRA 4B9MA 2NZTA 1KVBA 1LWFA 3D2FA 3THYA 4FZZA 3CETA 3K5OA 3RMAA 3GL1A 4F4KA 1KVAA 4H5WA 3JS6A 3M8SA 5C2FA 4X65K 5AZIA 1KRPA 4OLAA 1E4FT 5GIOA 3PIOL 2ZGYA 2WTUA 4KO0A 1Y64A 4J2DA 3M5RA 1J5EK 2HF4A 1QSYA 3LP0A 1XUPO 5JLFA 1MA9B 1BIUA 4YOUA 3G4SN 3HYFA 3LZJA 4F3TA 3HM8A 5BRFA 3CJBA 2XO7A 4BQLA 1J53A 1RTIA 4W5TA 3BGRA 3CD6N 2OANA 1TAUA 2HVIA 3AA2A 4AHSA 4DR6K 3K59A 3O9QA 3HO1A 4CZEA 2YI1A 4A5AA 1SZ2A 4C8KA 2QM1A 4FWQA 3CC4N 2ATQA 3CCLN 3CPEA 2YNHA 4L3QA 5FLXO 1ESVA 4AF1A 1GOBA 4DTJA 4ISEA 2OCEA 4CZLA 1U45A 3TAQA 2ASOA 1C1CA 1NJZA 4JD2B 3T7ZA 4IFYA 4B3OA 3C7NA 3RSEB 1IO2A 1T3VA 3DMJA 1OH6A 2FBXA 3SQ0A 3IDHA 1RDCA 1X3MA 4DQ8A 5AQYA 3LWMA 4E7LA 5J2NA 4DV2K 1XNQK 1NK9A 4BR2A 3TPQA 4DV4K 3QICA 3VQ8A 3R6MA 1NGFA 3MWTA 1KLMA 3OYAA 3K9JA 3O4QA 4H0TB 1OH8A 2PZSA 1GOAA 4Z4HA 3AY9A 4CCHA 2BUPA 5E41A 3ZSXA 3OYMA 4N41A 4QS8A 3GG4A 3WNFA 5KGWA 2UU9K 1REVA 4B1XB 4A59A 4LF6K 3VF6A 3HPGA 2FBYA 3MN7A 1UAXA 4FWRA 4DSJA 4H5VA 3ZT1A 3UKUB 2P9UA 4YHHK 1EX4A 1T05A 1RDBA 5FDLA 4BY9C 4ISFA 4OKJA 1B9FA 3AVIA 1YI2N 4BC2A 4DTOA 4XH4A 3P31A 4FWKA 3ATVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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