3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
2A6AA 3WT0A 2D0OA 5AQFA 4BRPA 4RCHA 2ZGZA 4BRHA 2CGKA 5CE3A 4XH4A 3SJHA 2D0PA 2E2OA 3U8XA 4A2AA 3TU5A 4ISFA 4AM7A 1IG8A 5LJVA 3VEOA 4QS8A 4BRQA 4JD2B 1X3MA 1Z05A 3CERA 1NGDA 4DB3A 1G99A 1HUXA 2Q1NA 3MN7A 2QWMA 4M63C 3AAQA 1NGIA 1DGKN 2P9IB 3GL1A 1GLEG 3M3ZA 5KQ8A 3O4WA 4IXCA 2AP1A 4F9OA 4EIAA 3VGLA 5EVZA 4BRKA 4LC9B 3U9DA 2ZF5O 2AA4A 2E2QA 3ENHA 3MN5A 2H3GX 4DCHA 2V51B 3LL3A 3O5BA 1BWFO 1MA9B 3H46O 5BPMA 1D4XA 1E4GT 1GLFO 1NMDA 1RGIA 2GTDA 4BR0A 4K42A 4CZKA 3H45C 3CI5A 3ZETB 2YJEA 2QWQA 1X9JA 1NWKA 1Z6RA 4H0YB 3O8MA 4H03B 3H3OB 3MCPA 1NGEA 3U4LA 3EL2A 1BUPA 1BO5O 3EKUA 3VETA 4B1ZA 1HJOA 3IUCA 2I7NA 3ZEUA 5BRDA 2FSKA 3A0IX 2J4RA 3L0QA 3O1WA 4IO8A 4BVOA 5AQKA 2P9UA 1TYQB 3RSEB 2ASPA 2E8AA 1BDGA 5BPNA 4RTFD 5AQGA 2HMPA 1Q18A 3LM9A 4O8KA 3ATUA 1NGFA 2CH5A 4FWLA 4B9QA 1V4SA 3FFKB 4BR2A 3QFPA 4FWKA 4EFHA 5AQPA 3UKRA 4A2BA 1KAZA 1GLAG 4XH5A 4BQLA 5JLFA 3ZX3A 3CJ9A 3WQTA 5JMVA 3D2EB 3I8BA 4B1VA 1NGAA 2NZTA 1T44A 2P9KA 1NLVA 3IMXA 4Z94A 2GWJA 1MWKA 2PAVA 4BRNA 1BA0A 1NBWA 4H0TB 3WXKA 2BTFA 3VEZA 1QHAA 2W41A 1YUWA 4BRMA 3SMPA 3UB5A 4HTLA 1BG3A 4I6MA 4K25A 4ISGA 1YAGA 2Q2RA 3VEXA 3WQUA 4BC2A 3O80A 2I7PA 2F9TA 4FWPA 1GLBG 4YDUA 2P9SA 4BGAA 1HLUA 4FPBA 1RDWX 4H0XB 3A5MC 2DPNA 3LDLA 1K8KA 2W40A 2FF3B 1J6ZA 1C0GA 5EX5A 4FWMA 4B1WB 5AZJA 3VF2A 5BPLA 2E88A 2IIRA 3L6QA 3VF6A 4H5NA 4AM6A 3WXJA 4WQ4A 3BF3A 4PKGA 3A5NC 3CJCA 4FWRA 3CQXA 3W3DA 4CZMA 3AARA 3CETA 1T6CA 4FWNA 5AZIA 5AQHA 3UKUA 3QDKA 2NRHA 4CI6A 2QWRA 4WQ5A 1ZC6A 3CHWA 3FZFA 3HBTA 3M1FA 1T6DA 4H0VB 3BF1A 1YVNA 3DAWA 4DQ8A 2GUPA 3MMVA 4FO0A 4H5WA 1EQYA 4IJNA 4BC3A 3QB0A 1WUAA 3F9MA 2ASMA 5AQIA 1KAYA 2IVOA 3G25A 5BRHA 4JHDB 4CBWA 1E4FT 2F9WA 4BRGA 4C23A 3FE1A 1ATNA 2A41A 5I9EB 1QQMA 3KHYA 3O6WA 4QS9A 2FLOA 5AQJA 3DWLA 2UYTA 3GBTA 4K41A 4CZLA 2GEMA 5FPEA 1QZ6A 1HKBA 2HF4A 1U6ZA 4A61A 1NGHA 2CGJA 1QQOA 3FZLA 3H3NO 1HKCA 2E1YA 3JXUA 5AQSA 3UE5A 3WEEA 4CZGA 3A5OC 3LDOA 4L3QA 1KXPA 2YHYA 4CZJA 3QBWA 2ASOA 3R6MA 2QWNA 3H6EA 3AY9A 4XH1A 3KVGA 4H0PA 3HI0A 5ADXH 3H1QA 3ZEUB 4BVPA 2V7ZA 3BEXA 2YI1A 3ATVA 4PL8A 4WYBA 3KZBA 4CZFA 5ADXA 2Q97A 3DXMA 3LDQA 2E20A 4RWTA 3EZWA 2A40A 2P9UB 5AQNA 3VEYA 3QFUA 1XC3A 3ULEA 4YDUC 5F2RA 4IWVA 3GG4A 5AQOA 1LOTB 3O1BA 4FL9A 4BRDA 5BRFA 5JLHA 3B8AX 1SQKA 1NGJA 1S22A 3CIPA 5F1XA 3LM2A 3BP8A 4BRFA 2E2NA 3D7EO 5LJWA 2VCPA 1YXQA 3VERA 5AQZA 5KPZA 1HKGA 3GOIA 5AFUA 2P9KB 3EKSA 4EHTA 4WQ4C 4BRAA 1MWMA 2QWOA 5FPDA 4EHUA 3SLCA 4CZEA 2P9PA 4PKIA 4BQZA 4WQ5C 3DXKB 3SK3A 4J8FA 3AAPA 3VPZA 3QBXA 3D2EA 2A3ZA 3HSCA 3MN9A 5E84A 4QS7A 4I6MB 4BRLA 3S41A 3DJCA 2GWKA 2HOEA 4BR5A 3CJBA 2P9SB 3JS6A 5BN9A 3GE1A 3R8EA 2IVNA 2VWBA 1NGBA 1QZ5A 2P9NA 1K8KB 5BREA 5JICA 5KPTA 5KPRA 1S3XA 2QM1A 4NB4A 4PL7A 4CBUA 3MK6A 4JN4A 3D2FB 1NGGA 1U2VB 5E26A 3VOVA 4M7YA 2EWSA 2A5XA 2Q0UA 3WXLA 3J8AA 2OANA 4MO4A 3HM8A 2P9LA 3H1VX 1WOQA 3VF4A 5AZIB 1HPMA 5B8HA 3TPQA 1ZXOA 1BOTO 2E1ZA 3I33A 4BC4A 2HF3A 3C7NA 3EN9A 1X3NA 3LDNA 1HX1A 3L4IA 2VYPA 2FSNA 4BREA 2QWLA 2YCHA 3CJ7A 3VEVA 2YHXA 4FWQA 2YHWA 4BRCA 2D1KA 4CJ7A 1NGCA 2PBDA 5EY4A 3P4IA 2QW9A 2Q31A 4H5RA 4JD2A 4A62A 3VEWA 3WUHA 3ENOA 3O08A 2IVPA 5KQDA 4FOEA 1IJJA 5AQRA 3HZ6A 5FPMA 1TUYA 2P9IA 4JHDA 5AQQA 3FLCO 4E1JA 1JCEA 4KBOA 2YJFA 4FSVA 1GLJO 1ZBSA 5AQXA 3LDPA 4MLEA 4O5FA 5AR0A 3GDQA 1C0FA 2A42A 2BUPA 1JCFA 3WEEB 4H0OA 1ESVA 3FZMA 3VENA 3VESA 1BU6O 2WUSA 4FPAA 4GY2B 4B1UB 4BRIA 1V4TA 4CZHA 2CGLA 3FZKA 3QMLA 4JAXA 5AQMA 1RFQA 3CJAA 3CQYA 2ZGYA 3BUZB 3ZETA 3MN6A 4M7XA 5BN8A 3DXMB 4HWIA 5AQYA 3VGKA 4BC5A 2NLXA 4MO5A 5FPNA 3ULEB 2KHOA 4CZIA 1Y64A 1JCGA 3FZHA 2FSJA 4IJAA 2CH6A 1SAZA 2FXUA 5AFUH 3UKRB 1TYQA 4DHYA 1ATRA 3OHRA 3RSEA 4BGBA 4BG8A 5AQUA 3U9ZA 4BR9A 4ISEA 4NO7A 5AQTA 1XQSC 1GLLO 3A5LC 1MDUB 5AQLA 2E2PA 5BR9A 4BROA 4EAHD 5F0XA 4IZ9A 4B1XB 4JNEA 2P9PB 5EXWA 1SZ2A 2QXLA 4CD1A 2FF6A 4H5TA 3HTVA 3FGUA 2Q36A 3M6GA 1QQNA 3WXIA 2ZWHA 3SMSA 1ATSA 1OKJA 3VGMA 5EOYA 3MDQA 5AQVA 1R59O 3QICA 4FWOA 2V7YA 3DXKA 2D4WA 5AQWA 3IDHA 5LY3A 1CZAN 3CJ1A 1NM1A 2P9NB 3C0BA 4MLHA 5AZJB 4CD3A 1DEJA 1H1VA 3EO3A 4K43A 4BR4A 2QWPA 2GELA 3W0LA 2Q0RA 3ZX0A 2ITMA 4H5VA 3R9PA 3FR0A 1P8ZA 1KAXA 1BA1A 1GLCG 3UKUB 1DKGD 5TKYA 2P9LB 5ELZA 4GNIA 4BG9A 1TUUA 4FWSA 4FOIA 4PKHA 2V52B 3ZX2A 3A8YA 3ID8A 4B1YB 4XEIA 1XUPO 1GLDG 3IFRA 4CBXA 3D2FA 4Y0WA 1LCUA 1U2VA 4BR7A 3C7NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2W6KA 3K9JA 2ZJPL 3V9ZA 5HP1A 3N4PA 4R5PA 5AQFA 3PX4A 4RCHA 4EP5A 1YJNN 3TR8A 3AVLA 3L4QA 2F96A 2E2OA 3TU5A 4MQ3A 1IG8A 4AHSA 2WTUA 4KKOA 2YNHA 3TTFA 1X3MA 1OH6A 3LAKA 1EO1A 1NGDA 4BWMA 3I55N 3SYZA 3RRGA 1RT3A 1QSLA 3AVCA 3MN7A 2P9IB 2RN2A 3G6EN 4CEAA 5KQ8A 4NYFA 5M1NA 2AP1A 4NCAA 3BZKA 4F9OA 4JLHA 1WSEA 4EIAA 3T69A 3VGLA 4W5RA 2B6AA 3IRXA 3PSFA 3MEEA 4BRKA 3NAEA 1TV6A 3K9KA 1L3VA 4RW6A 2E2QA 3ENHA 3MN5A 3K5LA 3AVGA 2V51B 3LL3A 3O5BA 4B9MA 1WSHA 4PQUA 3B6OA 1NMDA 3IKMA 3S3MA 2GTDA 3HRGA 4BR0A 3LALA 3H45C 4K8ZA 4DLGA 4IFVA 1NWKA 2DFEA 3O8MA 3VQEA 3RMAA 2KQ2A 4OVLA 3MCPA 3U4LA 4M42A 3QEXA 3EKUA 4OPHA 3C6AA 3VQDA 3BZCA 5BRDA 3A0IX 2J4RA 5SZTA 4IO8A 4CECA 3TAPA 3TTDA 1BDGA 1NU0A 4RTFD 4AHCA 2HMPA 1S5JA 4OLBA 5LL6Z 1Q18A 3L2VA 1L5UA 5GAEP 3ATUA 4FWLA 4LFCK 2AJQA 4EFHA 5J2QA 4JK8A 3MXMA 4BQLA 1I3AA 4XH5A 1KFSA 3WQTA 5J2MA 5JMVA 4HCCA 4CF2A 1RNHA 2JLEA 5HRPA 1VQMN 3THXB 3SJJA 1MWKA 1BGXT 4CEDA 3TAEA 4JRQA 1BA0A 4C8NA 3E66A 3U3GA 4H0TB 4IDKA 4N47A 1RBTA 1ILYA 4BRMA 1QS4A 4BC2A 1YAGA 4ID1A 2YHBA 4KB1A 1VQ4N 3L2RA 1TK5A 2F9TA 4LSLA 4BGAA 2HNZA 1TKTA 2WOMA 4H0XB 3NGZA 3LDLA 3QIPA 1K8KA 4LH5A 1HNXK 2FF3B 1Q86O 4B1WB 4Z4CA 3VF2A 5BPLA 2E88A 5M1PA 3VF6A 1VQ8N 4PY5A 3HOSA 3C65A 4FW2A 1Q9YA 5AZIA 5AQHA 4FZXC 3QDKA 3JYTA 4CI6A 2QWRA 1UA1A 4M45A 1BHLA 2E5LK 4FM2A 4H0VB 3AA3A 4KHSA 4CF8A 4KH6A 4YOYA 4FO0A 4H5WA 2FBVA 3D45A 1WUAA 3F9MA 3PV8A 4FJHA 4GKJK 1YITN 2UXCK 1RT2A 3AVHA 4B9UA 1VSDA 3CM5A 3PX6A 1Q7YO 1CZ9A 1ZBIA 3DLRA 3DRPA 1T3VA 1YIJN 3FE1A 3WNHA 3IAYA 1QQMA 3KHYA 2NRZA 2FLOA 3QETA 1RT5A 5J1EA 3MEGA 4EP4A 3DWLA 3NF9A 3AVKA 2KTQA 3NHGA 4CJKA 2YKNA 1LW0A 2GEMA 1NG9A 2VGMA 4CVNE 4MFBA 4KTWA 1U6ZA 2CGJA 3FZLA 3H3NO 4CZGA 3KKRA 1RT4A 3NCIA 4HCBA 3LDOA 4L3QA 2YHYA 4CZJA 3QEVA 3H6EA 3KVGA 2IDOA 5K14A 2HVIA 3HI0A 1QHTA 5ADXH 1SV5A 4UY8O 3LP1A 2YI1A 1T7PA 4DR1K 3M5RA 3C6TA 4FJ5A 1CZBA 3LDQA 4RWTA 2E20A 2DY4A 4KTZA 3ZT4A 2A40A 1VQNN 4ILHA 5AQNA 3OYAA 1NKEA 3AA4A 5M1KA 3AA2A 4E7JA 2XY7A 1BISA 3SAHA 1J54A 3J80O 4JRPA 5AQOA 4CJFA 4CF0A 3SPZA 4JI7K 4M3YA 4IOAL 4FLTA 2W42A 1RDCA 1NGJA 3ASMA 4OGCA 1S22A 3CIPA 4IG3A 5F1XA 4YOWA 3AVIA 3D7EO 1W2BM 4FJJA 3OS1A 4QCLA 5AQZA 1BL3A 2P9KB 4DTOA 3VA0A 3G0ZA 1VQPN 3O3FA 3F2KA 3CCVN 2P9PA 4BQZA 2RPIA 3DXKB 3C6UA 4J8FA 4HVJA 1HNIA 2OA8A 3VPZA 3CG7A 1OH5A 3D2EA 4A5AA 2YX6A 4UQGA 4QS7A 4E19A 4BRLA 2HB5A 3SQ1A 3SQ4A 2FC0A 4Y1DA 4JI6K 4WFBL 2GWKA 1REVA 2XY6A 1VHXA 4BR5A 2NNWA 3SI6A 5FROA 3TI0A 3S3OA 4B9VA 3R8EA 1TGOA 5LMNK 1VQKN 1XC9A 3SV4A 2XY8A 3I0RA 3ZSRA 4CBUA 4CK3A 1U2VB 3HPOA 3VOVA 3G4SN 3PUFA 5CY4A 2IAJA 3HM8A 2O4GA 3E9OA 2NRVA 4JKFA 5B8HA 3C6HA 1ZXOA 4ELVA 1UAXA 2KW4A 1HR0K 3F73A 3I33A 4BC4A 4PA1A 2OTLN 2HF3A 3C7NA 4IEIA 2Z1IA 3LDNA 4JKGB 2VGNA 4LH4A 2FSNA 1BI4B 3SAGA 4CIGA 2QWLA 2YHWA 1D8YA 4CEOA 5CZ1A 1NGCA 2PBDA 4GMJB 4CESA 4DQQA 3C94A 4DFMA 3L8BA 1S1XA 2QW9A 2Q31A 1N5YA 2KZZA 4ICLA 5KQDA 4FOEA 1IJJA 4LF4K 3HZ6A 2P9IA 2Y1JA 3SUQA 4AHRA 3FLCO 1X9WA 3MEDA 4DKWA 4BE2A 4FSVA 4CFAA 3WNFA 4IOXA 1BCOA 4MLEA 4O5FA 1RT1A 3I0SA 4IFEA 4I9QA 4OPKA 3FZMA 4C8MA 2D0BA 1BU6O 2WUSA 3ZLJA 4AILC 4DUYK 1ASWA 1GOBA 2E4LA 2X6NA 5AQMA 3AO2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1S1W A;  2R7Y A;  4ELT A;  1XQS C;  1GLL O;  3A5L C;  1MDU B;  1VRT A;  5AQL A;  2E2P A;  2YV0 X;  4BRO A;  1S9E A;  4CIE A;  4DQR A;  4B9N A;  4K0K K;  5JS1 A;  4JS4 A;  3PX0 A;  3KK2 A;  2P9P B;  1SZ2 A;  2FF6 A;  1MU2 A;  4H5T A;  1NOY A;  4IDH A;  4DSF A;  4TSX A;  2Q36 A;  3M6G A;  3OW2 M;  3MXI A;  3WXI A;  4JKE A;  5AQV A;  4DV6 K;  4N56 A;  3DXK A;  4DQI A;  4CFD A;  3IDH A;  1CZA N;  3M8P A;  1NJX A;  3U3Y A;  3CJ1 A;  4H4M A;  2VQE K;  3N4Q A;  4DTP A;  3SAF A;  4Z4E A;  2DFF A;  1H1V A;  4IO9 L;  1YTA A;  1NOZ A;  4K43 A;  4YOR A;  3Q7C A;  3CCL N;  4BR4 A;  2Q0R A;  1FJG K;  2ITM A;  3IG1 A;  4E1N A;  3O9S A;  3HPG A;  4DR7 K;  2G8H A;  4B9L A;  2PYL A;  1FXX A;  4DSJ A;  3AVA A;  1NJI O;  4GNI A;  4BG9 A;  4CF1 A;  1YT3 A;  4B1Y B;  2HBL A;  4XEI A;  2HW3 A;  1U47 A;  1LCU A;  1U2V A;  4CE9 A;  4YOU A;  3C7N B;  2FBT A;  4LF8 K;  1XI1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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