1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
molecule tags Phosphotransferase
source organism Homo sapiens
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
1LCUA 2E2OA 4FWLA 2AP1A 1BUPA 4H0PA 2P9KB 4BC4A 2P9SB 4FO0A 1E4GT 2VCPA 4BC3A 5AQWA 2QWOA 3VEVA 1GLLO 3ZX0A 4BR0A 3UKRA 5AQTA 4CBWA 3VEXA 3H46O 3QB0A 3CQYA 4XH1A 1KAYA 5KPTA 3QDKA 4MLEA 4CZGA 1SAZA 1NGGA 3HBTA 4JHDA 3H3NO 3D2EA 2AA4A 4FWSA 2YCHA 4CZKA 4DQ8A 2IVPA 1NGDA 3LL3A 1LOTB 5BRFA 3D2FA 3LDQA 1GLEG 3A5MC 4H0VB 3DXMB 3HTVA 1GLCG 1NGHA 1WUAA 5EY4A 3CERA 4PL7A 3C7NA 3WQTA 1G99A 2A6AA 1XUPO 1S22A 3O80A 3VEZA 3VETA 4RCHA 1QZ6A 1T6DA 2YHXA 3VERA 4BRDA 3BF3A 3W0LA 3EZWA 1IJJA 2P9PA 2ASMA 1V4SA 4A2AA 4BRKA 4FPAA 1H1VA 4H5NA 4O8KA 5B8HA 3H45C 4BR7A 3KHYA 1SZ2A 3LDPA 3ZETA 3WXJA 3EL2A 2P9UA 1NGCA 4FWPA 3M6GA 3WT0A 4BG8A 4JD2B 5EXWA 2WUSA 4B1XB 5AFUA 1T44A 1RFQA 1KXPA 5AQZA 3ZX3A 2E2PA 4FWQA 1X3MA 1MDUB 4H0TB 3H3OB 1HKCA 4HTLA 3GL1A 3UKUB 2FXUA 3DJCA 3DWLA 3EO3A 4XH5A 1NWKA 4H0OA 3SLCA 3IMXA 4K43A 3ATUA 1SQKA 3CHWA 2YHYA 4PKHA 3LM9A 2CGLA 3UB5A 5AQOA 4BVPA 2Q36A 3WXKA 3HM8A 4BR4A 1HX1A 1HKBA 5KPZA 4JN4A 2QWMA 1GLAG 4BROA 3LDNA 3VF2A 4M63C 1ATNA 2FLOA 2YJFA 3SJHA 2HF3A 3CJ9A 4CBUA 3D7EO 3FZKA 2ASOA 4FWKA 4IJNA 4CZJA 5BRDA 4AM7A 5LJVA 4CZFA 4H5RA 3LDLA 4CZLA 5BPNA 3UKRB 2E1YA 2A3ZA 2QWQA 3QICA 4BG9A 3R9PA 5KQDA 2YHWA 1BA0A 2E20A 4KBOA 3U4LA 1ATSA 3MMVA 5AQYA 2NLXA 4LC9B 3ULEA 3MDQA 1D4XA 3D2EB 5AQLA 2ZGYA 5AR0A 3FZMA 2W41A 3GDQA 5JICA 2GTDA 1MWKA 4BRFA 3OHRA 3EKUA 3TPQA 3A8YA 3VGMA 1QQOA 2QWNA 4CZEA 2D0OA 3VEWA 4NO7A 1R59O 5FPNA 1BA1A 1MWMA 3AAPA 1GLFO 3A5OC 3WEEA 3SK3A 2I7NA 3FLCO 5AQRA 3VPZA 2W40A 3FFKB 1U2VA 1QQMA 3HZ6A 2P9PB 3ATVA 1ZC6A 2Q0RA 3LDOA 4PL8A 4WYBA 2A40A 4M7XA 3BUZB 4B1VA 4CJ7A 1BWFO 3DXKA 4FOEA 4WQ4A 3L4IA 1BOTO 4ISEA 3IDHA 2V7YA 4PKGA 2P9UB 3BF1A 3O8MA 3HSCA 1OKJA 1IG8A 5AQHA 2FSNA 2ZF5O 2KHOA 5AZIA 2D0PA 3MK6A 1WOQA 1MA9B 2ZWHA 1QZ5A 3J8AA 4H03B 5BRHA 4K42A 2P9LA 4WQ5A 3WXLA 1HJOA 3FZHA 3QMLA 2Q31A 4E1JA 4GNIA 4BRNA 3H6EA 4HWIA 3CJ7A 2V52B 5AQIA 4M7YA 2CGJA 4BQZA 4IO8A 3F9MA 3BEXA 3MN5A 4BRPA 5BREA 1Z6RA 5KPRA 3QBXA 3FR0A 5AQKA 2V7ZA 5BN8A 4K25A 2H3GX 5AFUH 5AQPA 2BUPA 5AQNA 2P9KA 5I9EB 1NLVA 5LY3A 1HKGA 3KZBA 3SMPA 2IVNA 3M1FA 1TYQA 3ZEUA 4BRQA 2ASPA 4BRMA 2PBDA 4JNEA 5AZJA 4IJAA 1XQSC 3O08A 3EKSA 4B1WB 1BDGA 2GWKA 4FOIA 5AQMA 5F2RA 4B9QA 1Y64A 5E26A 4BR9A 3WUHA 2HOEA 4EHUA 3I33A 2FSKA 4H5TA 1Q18A 1X3NA 3RSEB 4F9OA 1T6CA 4ISGA 3ULEB 4EIAA 3DXMA 2I7PA 5ADXH 4PKIA 1BG3A 1GLBG 4QS7A 1NGAA 4YDUC 1QHAA 4BRGA 4BR5A 3GBTA 4CZHA 3MN6A 4AM6A 4QS8A 4C23A 4QS9A 3ID8A 4H5VA 1DKGD 1CZAN 1X9JA 1HUXA 3KVGA 3WEEB 4CD3A 4A61A 4FL9A 1P8ZA 4H0XB 1NGIA 4FPBA 3H1QA 2D4WA 2CH5A 1U6ZA 1TUUA 3O4WA 4CD1A 1ZXOA 2E2NA 3CIPA 4H5WA 2QM1A 3JXUA 5EVZA 3AARA 1NMDA 4BREA 1YUWA 4JD2A 1RDWX 4B1ZA 4MO5A 4JHDB 3BP8A 1GLDG 3ZX2A 1YAGA 3CQXA 3D2FB 2VYPA 5TKYA 4EHTA 3UKUA 3DAWA 5AQQA 1HLUA 4BGAA 4Y0WA 1EQYA 3O5BA 3WXIA 4FWOA 4BQLA 3VOVA 3C7NB 2E8AA 3R8EA 3B8AX 4WQ5C 1NGBA 2P9LB 1NGEA 1C0GA 4B1UB 3A0IX 3H1VX 4FWMA 4RWTA 4L3QA 2YJEA 2Q97A 2F9WA 1C0FA 4H0YB 4CZMA 4GY2B 2P9NA 5F1XA 3LM2A 3O6WA 5BR9A 3ZETB 3ENHA 3CJCA 4BRLA 4DB3A 3VEYA 3I8BA 5JLFA 5E84A 3WQUA 5F0XA 4RTFD 2P9IA 3HI0A 4ISFA 3GE1A 1TYQB 3ZEUB 3U9ZA 1KAXA 4A2BA 1ZBSA 5AZJB 4K41A 5BN9A 4BRCA 2QW9A 1BU6O 4CBXA 3CJBA 3S41A 5AQSA 4JAXA 5FPDA 1J6ZA 4DCHA 4BVOA 3CETA 1K8KA 3G25A 2UYTA 2PAVA 3FZFA 4BRHA 3IFRA 2Q2RA 4I6MA 5CE3A 5LJWA 1GLJO 3QFUA 1JCEA 2A5XA 2BTFA 3O1BA 4BGBA 5FPEA 2D1KA 2GWJA 4BC2A 1DGKN 4DHYA 3GG4A 2E2QA 2A42A 2P9SA 4MO4A 3VGKA 1NGJA 2QWRA 2CH6A 3FZLA 3CJAA 1QQNA 3C0BA 3QBWA 4CI6A 4IZ9A 1KAZA 4B1YB 4FWRA 3SMSA 3FGUA 2HMPA 3O1WA 5KQ8A 3L6QA 4FSVA 4MLHA 5JLHA 2ITMA 1NGFA 3AAQA 3MCPA 3U8XA 4EAHD 1DEJA 2Q1NA 2FF3B 2V51B 5ELZA 3TU5A 2IIRA 5BPMA 1RGIA 3VEOA 5EOYA 2QXLA 2CGKA 3JS6A 4J8FA 2HF4A 1YVNA 3EN9A 1NM1A 5EX5A 2A41A 3VF6A 3VENA 2NZTA 2EWSA 4FWNA 4XH4A 1XC3A 3GOIA 2E88A 3R6MA 2Q0UA 3P4IA 2GUPA 2J4RA 1BO5O 4IXCA 5FPMA 3IUCA 3MN7A 2OANA 2FF6A 3CI5A 4Z94A 3M3ZA 1S3XA 3QFPA 5AQGA 2QWLA 1U2VB 5ADXA 5AQFA 3VF4A 1NBWA 3W3DA 2IVOA 1JCFA 4EFHA 2E1ZA 3VESA 2P9NB 4CZIA 4WQ4C 2GEMA 1ATRA 2NRHA 1ESVA 3DXKB 1YXQA 3A5NC 2VWBA 3VGLA 1TUYA 2ZGZA 4A62A 1Z05A 1HPMA 3A5LC 2P9IB 4IWVA 1JCGA 1V4TA 2GELA 2QWPA 3AY9A 5AZIB 3U9DA 3CJ1A 4XEIA 4NB4A 3L0QA 5AQXA 2DPNA 2F9TA 5AQVA 4BC5A 4BR2A 3FE1A 3ENOA 3MN9A 3RSEA 5AQJA 2FSJA 5AQUA 1K8KB 4O5FA 5JMVA 3UE5A 4YDUA 4BRAA 5BPLA 2YI1A 1E4FT 4I6MB 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJ9N 4PUOA 3B6PA 2W42A 3HPGA 2AP1A 2O4IA 3VQDA 4M3TA 2FBXA 1RNHA 2NRWA 3KKRA 1E4GT 1KSPA 1VQ7N 1QE1A 2IDOA 2OPPA 3VEVA 1GLLO 2I5JA 3RWUA 3MCAB 3TAFA 1KAYA 1NKBA 1NGGA 3TWHA 4JHDA 3M5RA 4EP4A 2D0CA 2YCHA 1RTIA 4CZKA 2IVPA 4DUZK 5BRFA 3QESA 2OZSA 4JI6K 1TV6A 4DFPA 4FJJA 3CERA 1SL1A 3P39A 3ZLJA 2G8VA 1XUPO 3VEZA 4OLBA 4CCHA 4RCHA 1QZ6A 1T6DA 2YHXA 3P38A 3V1OA 4BY9C 2HVHA 3W0LA 4O4GA 4O55A 4DKWA 1T3VA 1V4SA 3THWA 5GIOA 1H1VA 2E6MA 4H4OA 3CCSN 2XRIA 3ZETA 4NXMK 1JLEA 3EL2A 1ZBIA 1ZBHA 4X66K 4BG8A 5EXWA 3L3UA 1RFQA 4B9TA 1CXUA 2QTDA 3ZX3A 4RW8A 1VSJA 4FLXA 5SWMA 1L3VA 1VQON 3AGRA 4DV5K 2FXUA 4DTJA 4ELTA 4DWIA 2GUIA 1NWKA 4CVNE 3IMXA 3ULDA 4DTSA 3RMBA 3CHWA 1EETA 4GKKK 4PKHA 1NKCA 4RW9A 4M42A 4BVPA 2Q36A 3KLGA 4G9ZA 4C1NI 3HM8A 2BH1A 4LF8K 1HKBA 3QNOA 4BROA 4OLAA 1IKXA 3AVLA 4M63C 2F7TA 3CJ9A 1N32K 3D7EO 3CCQN 2KQ2A 1SL0A 2G8IA 4IJNA 5BRDA 4AM7A 3J7YP 4CZFA 4H5RA 3K57A 1HYZA 5KGWA 5BPNA 2XY7A 5J2MA 3F5TA 3QICA 3RMDA 1BA0A 2E20A 3MMVA 4E7JA 1UA1A 3OTOK 5FROA 4WE1A 3D2EB 5AQLA 2ZGYA 4E7HA 4UY8O 1S6QA 2FBYA 4OGCA 4B8CA 2QWNA 1NU0A 3HYFA 4QOZB 3VEWA 1YITN 3AAPA 4CGHA 2LSNA 3A5OC 3WEEA 1NNEA 4K0KK 4DTXA 3SK3A 4JYAK 5AQRA 4KHWA 3S9HA 4ZTFA 5C0YA 4ZHRA 5HRSA 1U2VA 4PL8A 2P9PB 1ZC6A 4I7FA 4WYBA 1C0UA 3OYFA 4CJ7A 4WQ4A 1BOTO 3QNNA 3IDHA 3CMAN 1KC8O 4PKGA 1RT4A 3C6TA 1OKJA 4QCLA 1N6QA 5AQHA 2FSNA 3LP2A 3K5NA 4YHHK 5AZIA 2D0PA 1WOQA 2ZWHA 4KH4A 5FRMA 4AHTA 4CHQA 3OVNA 4K42A 1MU2A 2P9LA 3WXLA 1HJOA 3AVBA 4HWIA 4CFDA 2E6LA 4M7YA 5CR4A 4IO8A 2RPIA 4X64K 4O0IA 4KI6A 5BREA 5KPRA 4DF4A 3OBYA 1C0TA 1EXQA 1NJXA 3C6HA 2PYJA 4K25A 2P9KA 5I9EB 3S3OA 3KTQA 3ZEUA 2ASPA 3RTVA 4DV6K 3V6DA 5AZJA 3NE6A 4C8NA 2X6NA 3AVIA 3EKSA 1EWQA 5GIPA 4YOYA 1X9WA 1JXEA 3F2KA 1ZYQA 3PV8A 3WUHA 2HOEA 1CZ9A 5C25A 3D0PA 2ZJPL 3HP9A 4H5TA 1Q18A 3MX5A 1T6CA 3TANA 3I0SA 3DXMA 2I7PA 3ZSRA 1K8AO 5ADXH 3HO1A 1GLBG 3L2QA 1RBTA 5IWAK 3LPUA 3RRGA 2WFBA 3E9LA 3CD6N 3GBTA 4CZHA 3MXMA 2O8CB 2D0AA 2A1RA 2HNYA 1NMNA 4QS9A 3ID8A 1RDAA 1K73O 3QLHA 1DKGD 2IAJA 4M3ZA 4E7LA 4CJUA 3J80O 3H1QA 4DQRA 4LH4A 3J7ZO 5HBMA 3D45A 3R3LA 1ZXOA 2E2NA 3ZT1A 1NMDA 2KW4A 4BREA 4X65K 1YUWA 4JD2A 4MO5A 3BP8A 1GLDG 4DTNA 1B92A 5LMUK 4JI8K 2RHKA 4GW6A 3RMCA 2VYPA 5TKYA 4EHTA 3UKUA 3DAWA 4J2EA 4HUGA 3DLKA 4LSNA 4M3RA 4BGAA 4BQLA 3WXIA 3C7NB 3NF8A 3CCMN 1RTDA 1BI4B 4M3WA 4OKEA 4WFBL 2E4LA 3OW2M 4ZTJA 1ASUA 2VG5A 2YJEA 1KVAA 4DF8A 2Q97A 2F9WA 2YX6A 3B6OA 1IV0A 1EX4A 1NK4A 2HNZA 3VQPA 3VEYA 3I8BA 4MDBA 2VWJA 3DOLA 5E84A 1NOYA 3O9SA 1WN7A 4DV7K 3HI0A 4AQYK 1JLAA 3ZT2A 1KAXA 4BDPA 4FCYA 1LV5A 4BRCA 1BU6O 3OS2A 3CJBA 1HNIA 1D9DA 4M41A 1VAZA 1ITGA 5E41A 1XNRK 2NNWA 5H1SQ 3G25A 1YVUA 4O5BA 4BRHA 4LF4K 3DYAA 2R7YA 2BGGA 1JLBA 5LJWA 3C95A 3QFUA 4FJ9A 4FJ5A 5C12A 1TK8A 3ALYA 2D1KA 2GWJA 4BC2A 5GAGP 3A2FA 3GG4A 4IFYA 2P9SA 5HL7L 3TI0A 1QQNA 3M8RA 4LH5A 4CI6A 4JK9A 3VQ9A 4FWRA 2W6KA 2BANA 3C94A 5KQ8A 5JS1A 2YNFA 3PUFA 2ITMA 3AAQA 5M1KA 3K58A 4EAHD 3G4SN 1L3TA 1DEJA 3TU5A 2IIRA 3I55N 1RGIA 5EOYA 4KO0A 2HF4A 1NM1A 5EX5A 2A41A 3VF6A 3PX0A 3DRPA 3GOIA 4JKGA 2P5GA 1WNSA 2E88A 4BACA 4G1QA 2Q0UA 3RR7A 1BO5O 1WSIA 3V81A 1HYSA 1HPZA 3CMEN 3MN7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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