1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
4JNEA 4CI6A 5JMVA 2A6AA 4H0YB 3D2EA 4PL8A 3AAPA 1NGHA 1RFQA 2QXLA 3BP8A 3QMLA 1GLJO 3ZX3A 1IJJA 3SMPA 1U6ZA 1MWMA 5FPMA 2Q0UA 2QWNA 3JS6A 4B1WB 4H5VA 2CGKA 5EVZA 1ESVA 3FGUA 3VOVA 5AZIA 1HUXA 2VWBA 4B9QA 1NGCA 2IVNA 4FWRA 1YXQA 4CZLA 2H3GX 3L0QA 3R9PA 5ELZA 2P9IA 2I7NA 3AY9A 3IMXA 4B1UB 3CIPA 4K25A 2QWRA 3MN9A 4RCHA 2D4WA 4BR4A 1BU6O 3SMSA 2CH5A 2GWJA 4BRQA 4IO8A 3D2FB 1P8ZA 4BGBA 1QZ5A 1HKCA 3FZFA 3ZETA 1U2VB 1J6ZA 1QZ6A 4B1VA 3EKSA 3LDOA 4XH4A 4Y0WA 2BUPA 1GLLO 3MN6A 5KQDA 3WEEA 3IFRA 5AQSA 1BOTO 3VGKA 1HKGA 3VGMA 2YJEA 4A2AA 4BQLA 4XH5A 4BC3A 3RSEA 3WXIA 3H6EA 4FWMA 3O1WA 1DKGD 5EXWA 2W40A 3C7NA 2EWSA 3UKRA 4BGAA 3MCPA 2IVOA 3ZEUB 3CI5A 5AFUH 3WQUA 2Q31A 1T6CA 3VF4A 2E88A 3KHYA 4FO0A 3VEWA 1D4XA 2YJFA 1XC3A 1EQYA 1QQOA 1JCGA 1ATSA 1NMDA 2P9KA 4BC4A 4I6MB 3DXMA 1X3MA 1K8KB 4PKIA 3IUCA 1KXPA 3VGLA 5JICA 2J4RA 2D0OA 1RGIA 3QFPA 1C0FA 4FWNA 3SK3A 1HKBA 5E84A 4FWQA 1ATRA 4WQ5C 3WXKA 4K41A 3VEZA 2P9PB 3ATVA 1GLEG 4KBOA 2VCPA 3C7NB 2QWMA 4GNIA 1ZBSA 4K43A 4JHDA 2QWQA 4ISEA 3H3NO 3CJ7A 4HWIA 1Z6RA 3BEXA 5EOYA 3VEOA 3MDQA 3LDPA 1IG8A 2ZWHA 3GL1A 4BRCA 3HTVA 4Z94A 3LDLA 1NWKA 4I6MA 3GBTA 1ZC6A 3ZX2A 1NGAA 5AQTA 1NGDA 4M63C 4H03B 2A42A 3UE5A 5AQFA 3QBXA 2CGLA 1NGIA 2Q2RA 4O5FA 3U9DA 2E20A 1GLFO 5AQHA 1HJOA 4IZ9A 3LL3A 5KQ8A 2Q36A 2ZGZA 2KHOA 4EHUA 5BREA 5TKYA 1TUUA 2DPNA 4BRLA 4FWOA 2GWKA 4YDUA 3BF3A 3ZETB 2E2PA 3VF2A 3ZX0A 5AQYA 4BQZA 1V4SA 3VPZA 1Y64A 5AQIA 3VEVA 1BDGA 5F0XA 1H1VA 5BN8A 2QW9A 1Z05A 1X9JA 1XUPO 1NBWA 5KPZA 3QDKA 1NLVA 4BRHA 2CGJA 3H1VX 2UYTA 1BA1A 4K42A 4CZFA 3CERA 3QB0A 3TPQA 4BC5A 5AQVA 3D7EO 4CD1A 5E26A 1DEJA 5ADXH 2QWPA 2GELA 1BA0A 1V4TA 2P9UB 3ATUA 5AQRA 2Q1NA 2Q97A 1NGGA 4BR2A 1SAZA 5ADXA 3ENHA 1S22A 2AA4A 3GDQA 2FSNA 5JLFA 1NGBA 3LM9A 5BN9A 5KPTA 1T44A 1JCEA 3D2EB 3IDHA 2OANA 4JD2B 4A62A 3DXKB 1OKJA 2P9LA 4JAXA 3UKUA 3HM8A 3HSCA 4C23A 2E1ZA 4CBUA 2P9SB 2P9SA 2P9NB 2D0PA 1TUYA 2ASPA 2A40A 3VEYA 3U4LA 3VEXA 3UKUB 4MLHA 3VERA 4FWKA 3GOIA 3O80A 3DWLA 4IJNA 4MO5A 4BRPA 4JD2A 4BRFA 3FZLA 5JLHA 2ASOA 3O6WA 5AZJB 4EHTA 3HZ6A 3AARA 3VETA 1HLUA 3G25A 4M7XA 4BVOA 5FPEA 4BVPA 4BRIA 1GLBG 1Q18A 1X3NA 5AQMA 3F9MA 3A0IX 3OHRA 4H0VB 5AQWA 2GTDA 4CBXA 4WQ4C 2ZGYA 4B1ZA 3H1QA 4BG8A 3EO3A 3JXUA 4H5TA 1GLDG 4BRDA 4FSVA 1YVNA 5FPNA 5FPDA 4PL7A 3DAWA 4AM6A 1ZXOA 3LDNA 4BR9A 1R59O 3CHWA 1KAZA 3QICA 3MK6A 5EY4A 1QHAA 3R6MA 3I8BA 4MLEA 2E2QA 4CZGA 4FOEA 4EFHA 1E4FT 3VENA 3W0LA 3KVGA 4WQ5A 1NM1A 1TYQA 3BUZB 3L4IA 2WUSA 4JHDB 4QS7A 2A5XA 3FFKB 3CQYA 1GLAG 4E1JA 1JCFA 5AQXA 2FXUA 4WQ4A 4FOIA 4H0OA 4IJAA 1MDUB 3CQXA 1T6DA 3WQTA 3O8MA 4BRKA 4CD3A 4CZJA 5LY3A 5AQUA 2QWOA 3L6QA 2HF4A 5AQNA 2QM1A 2YHYA 3A5MC 3M3ZA 4BR0A 4YDUC 4DCHA 4PKHA 4FL9A 4FWSA 1C0GA 4MO4A 2Q0RA 1CZAN 3UB5A 1GLCG 2BTFA 1XQSC 5BRFA 2IVPA 2V51B 3ID8A 1BWFO 1KAYA 2P9KB 1NGFA 4CZHA 3ULEA 4CZKA 3H3OB 3EN9A 1WOQA 2NZTA 1ATNA 5AR0A 4DB3A 4BR5A 3BF1A 3ZEUA 4CZMA 2HOEA 4H0XB 5AQZA 3R8EA 1E4GT 3UKRB 1S3XA 2ITMA 1HPMA 1LOTB 4O8KA 3TU5A 3RSEB 3U9ZA 4EAHD 1YAGA 3QBWA 4NO7A 2F9TA 5F1XA 1TYQB 2P9PA 4M7YA 4BRAA 4BG9A 2A3ZA 4H0PA 4GY2B 5AQJA 3WUHA 4DQ8A 2PBDA 3ULEB 3MMVA 3FZMA 1K8KA 3A8YA 5EX5A 4BREA 3DXMB 3FR0A 5AQOA 2E1YA 5I9EB 5AQQA 4QS9A 4BR7A 3WXLA 3O08A 2A41A 1BUPA 2AP1A 2HF3A 1G99A 2V52B 5BRDA 3B8AX 4LC9B 2QWLA 3HI0A 4FWLA 4CBWA 4J8FA 4F9OA 1BG3A 2CH6A 3CJAA 1RDWX 2YCHA 5B8HA 5KPRA 1QQNA 4JN4A 1WUAA 3M1FA 3J8AA 4BROA 5AZIB 2V7ZA 3CETA 3GG4A 4PKGA 4FPAA 4BRMA 5F2RA 2PAVA 3A5NC 3C0BA 4B1YB 1NGJA 3DJCA 4A2BA 4CJ7A 3CJ9A 3WEEB 3CJCA 3HBTA 1MWKA 3EKUA 1YUWA 2D1KA 4BC2A 4FPBA 1DGKN 4IXCA 1U2VA 2FSKA 5BR9A 5AZJA 2E8AA 4A61A 4ISFA 2YHWA 3A5OC 4CZIA 1KAXA 5AQPA 3D2FA 2E2NA 2ZF5O 4AM7A 2FF3B 5AQLA 4WYBA 3W3DA 1HX1A 2NLXA 3P4IA 4H5NA 3U8XA 4FWPA 3O4WA 2P9NA 4IWVA 4XEIA 3O1BA 3GE1A 2P9IB 5BPNA 2IIRA 2W41A 4HTLA 3WXJA 1BO5O 5AQKA 3EZWA 3AAQA 5CE3A 5LJVA 2ASMA 5AFUA 5BRHA 4RWTA 3H45C 3ENOA 3MN5A 5BPMA 3QFUA 4B1XB 1SZ2A 3CJ1A 4RTFD 1SQKA 3FZHA 2YI1A 1LCUA 1QQMA 3S41A 4EIAA 2HMPA 4H5WA 2P9UA 2F9WA 3A5LC 3WT0A 2FF6A 3LDQA 2GUPA 2NRHA 2VYPA 3LM2A 3M6GA 3MN7A 3FZKA 1NGEA 2YHXA 1MA9B 3SLCA 3H46O 2E2OA 4BRNA 5BPLA 3FLCO 4NB4A 4L3QA 4XH1A 4H5RA 3VESA 3EL2A 4DHYA 3CJBA 3I33A 4H0TB 5AQGA 4QS8A 4BRGA 4ISGA 2FSJA 3SJHA 5LJWA 2FLOA 2I7PA 2P9LB 3KZBA 4CZEA 3O5BA 3VF6A 3DXKA 2V7YA 2GEMA 3FE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLTA 4HUGA 1TK5A 3ID6A 3D2EA 4PL8A 1NGHA 1RFQA 2FBVA 3ZX3A 1IJJA 2WTUA 2Q0UA 2QWNA 4AHTA 5DMRA 2RE2A 4H5VA 4DV4K 4HUEA 5KI6A 4FLZA 2ZE2A 1IBMK 2VWBA 4B9QA 1YXQA 4NYFA 3TAFA 1Q86O 5ELZA 2P9IA 4CEDA 4O4GA 1CZ9A 4OGCA 4AQYK 4DV2K 3CIPA 4N5SA 2D0CA 2GWJA 4BRQA 3D2FB 1L3SA 2HHXA 1QZ5A 2HSTA 2IC3A 5LMNK 5M1QA 1U2VB 1IO2A 4NLCA 4XH4A 4DTRA 4RG8A 3RWUA 3WEEA 1NKEA 2YJEA 3WXIA 1ZBHA 3VQDA 3WNHA 4X65K 2O8FB 5EXWA 1XI1A 4E7LA 2WBNA 2IVOA 3QINA 5AFUH 1WSFA 3VF4A 2E88A 3OS1A 1EQYA 1QQOA 4X62K 1LWCA 4JS5A 3LPUA 1VSDA 4OGEA 3T1AA 3RR8A 2QXFA 1K8KB 4PKIA 3VGLA 1Y97A 2J4RA 3QFPA 4KH4A 3O9RA 2G8FA 2HHSA 1U45A 4FJ5A 3AVCA 1GOAA 1DTQA 1ATRA 4C8NA 2QA4N 2HNYA 4K41A 3OY9A 3DLKA 1ZBFA 1I94K 1GLEG 4JKAA 1D9FA 3TAEA 5GIPA 5MLCQ 2QWMA 1LW0A 3ZT1A 4Y1DA 3KK1A 1YT3A 3QETA 2QWQA 2WC9A 4KHWA 4ISEA 3LALA 3CJ7A 4HWIA 3SQ2A 1FW6A 3LAMA 2ZWHA 1C1CA 3SPZA 4BRCA 3RRGA 4KH5A 2GX9A 2GBZA 3LDLA 1NWKA 1JLCA 3P31A 1YHQN 2O8DA 1RCHA 3GBTA 1NK0A 1XNRK 3CC4N 5HROA 3ZX2A 3F9KA 5C15A 3MXMA 3ZSXA 2R7YA 3JSMA 5HOOA 3OS2A 4H03B 4E89A 5AQFA 3QBXA 2CGLA 3D45A 4FJGA 4OLBA 5CZ2A 4FJNA 1NJXA 1C1BA 3NH1A 4F4KA 5BREA 3AVAA 1VQPN 3V9ZA 1TUUA 2DPNA 3IKMA 1SL1A 3LDSA 3ZSOA 4F3OA 1ZBUA 2E2PA 1BCOA 3ZX0A 3KD1E 1RNHA 1N32K 1V4SA 4HHTA 5AQIA 3EEQA 2NRZA 1H1VA 2QW9A 4CJUA 3DRPA 3HT3A 3QDKA 4BRHA 3H1VX 3OW2M 1NKCA 4AHSA 3CERA 3QB0A 4ID1A 4AH9A 5GAHP 4CK1A 3DM2A 2P1JA 3L2VA 1HYZA 4DLGA 5E26A 4OLAA 5M1NA 2GELA 4CGFA 2X74A 2Q1NA 1S9EA 2Q97A 1NGGA 4IFEA 4RW9A 4BR2A 3T3FA 4JI3K 2KW4A 4Z4FA 2HVHA 3K5MA 1DTTA 3QNOA 2FSNA 5JLFA 3QO9A 3R1XA 1Q82O 1BL3A 2ZJRL 1KFDA 4E7IA 3IDHA 1IG9A 3HSCA 2UU9K 4FK2A 4X66K 1L3VA 2P51A 5M1KA 2ASPA 2A40A 3ZCMA 4Z4EA 4MLHA 3GOIA 4CGDA 3MEDA 3NFAA 3OJUA 4IFVA 4BRFA 3FZLA 3MCAB 4DS5A 5C2FA 4M45A 3O6WA 3EY1A 2OYQA 3JYTA 4CJLA 3VETA 2E6LA 5H1SQ 4LF9K 4G1QA 4Y1CA 3G25A 4CF9A 4AHVA 2ITGA 5FPEA 4BVPA 3EE8A 4CEEA 4KTZA 1MU2A 2XHBA 3AO5A 3OHRA 3NH2A 5AQWA 3C94A 1A5XA 1WSJA 4BG8A 4H5TA 3CF5L 3MAQA 3HVTA 1JXEA 4EZ6A 1YVNA 3VQCA 4GV9A 3OYIA 4O0JA 3DLBA 4FJIA 2O8CA 3MK6A 1QHAA 3R6MA 4LFCK 4DUZK 1L3TA 1DLOA 1N6QA 3RVCA 1JJ2M 4YOTA 4IKFA 3K2PA 4K0KK 4DTXA 4LF6K 1JXBA 2E2QA 1WSIA 1E4FT 3DLGA 3O9QA 3U6FA 3KVGA 1ZBLA 1S72N 1U4BA 1SKWA 2HBJA 4YOVA 3BUZB 3L4IA 5K14A 1VSHA 2EHGA 5KRSA 4CJQA 3FFKB 4JI6K 3CPWM 1GOBA 2IAJA 4CZJA 4W5RA 3LWLA 3O8MA 4BRKA 4DTUA 4CEOA 2YHYA 5C10A 3P38A 4W5TA 1HYSA 3B6OA 4B9UA 1FK9A 4FL9A 4C8KA 2Q0RA 1HYVA 4FW2A 2QK9A 1KC8O 3UB5A 3NVKA 1NK8A 2O8DB 2V51B 1BWFO 2P9KB 2O4IA 4CZKA 2LSNA 5AR0A 1WOQA 3AVMA 4DB3A 3ZEUA 1VQKN 4OKKA 3ZT3A 2BANA 1S3XA 3TU5A 4CJKA 1CZBA 4EAHD 1YAGA 1T8EA 5J1EA 4B3TK 1TYQB 3SAHA 5JVGL 3ITHA 3N4QA 4M7YA 4FJMA 1TVRA 3J7YP 3M8QA 2PBDA 3QEIA 3VQBA 4BDZA 1JL1A 1SV5A 1K8KA 3OVNA 3A8YA 5EX5A 3L3VA 3HRGA 5AQOA 2E1YA 3K9JA 5J2PA 1JL2A 1VSIA 2HF3A 5SWMA 4CBWA 4J8FA 4F9OA 5KPRA 1XMOK 4JI7K 2HNZA 5AZIB 3CETA 4O8UA 1BHLA 4CJ7A 3WEEB 5HP1A 5A2QO 1YUWA 2YNFA 2D1KA 3VQPA 2IGIA 4DSEA 5J2NA 1U2VA 2FSKA 4A61A 5GIOA 1J5EK 1HNWK 4CGHA 2FF3B 1VQ8N 1HX1A 4I7FA 1IBKK 4JI1K 4IWVA 3M8SA 4DSKA 5BPNA 3AGRA 4E7KA 3VQAA 2W41A 4WFBL 4BY9C 1BO5O 2RPIA 3EZWA 1QQCA 5AFUA 4CFAA 5BRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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