1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Phosphotransferase
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
4FSVA 2ASOA 3KVGA 2A41A 2YJFA 4BC4A 1T6DA 1SQKA 2CGJA 4BR0A 1H1VA 2A3ZA 4FPBA 2EWSA 4QS9A 3WXKA 5AZJA 4FPAA 2YHYA 4M63C 5KQ8A 2E1YA 1GLDG 3GOIA 2IVOA 3VENA 4QS8A 3VPZA 4A2AA 5EVZA 4FWQA 5EOYA 5B8HA 3AARA 4XEIA 3O8MA 2VWBA 3D2EB 4FWMA 2QXLA 1ESVA 2YHXA 3MN6A 3VGLA 5BREA 3UKRA 4O8KA 3CJAA 3LDPA 3QBWA 3OHRA 4FL9A 3LDNA 1NGAA 2E8AA 3R6MA 4B1XB 3CJ7A 4PKIA 3CHWA 4CZIA 4IZ9A 1P8ZA 4FOEA 4BRGA 2ZF5O 5EY4A 5JLFA 2D4WA 3HM8A 2GEMA 1YUWA 4JD2A 2IIRA 5AQGA 3BP8A 4K25A 4JAXA 5BPLA 5AQJA 1XUPO 4BRHA 3ZX2A 1U2VB 4BG9A 4XH4A 4M7XA 5AQSA 3D2EA 2IVPA 3EKUA 3JS6A 4BQLA 2UYTA 2FXUA 2E20A 3BUZB 3ATUA 5AQPA 3I33A 3WQUA 1NGBA 4RTFD 4JNEA 2Q97A 2E2OA 1C0GA 3O08A 3VESA 3ZX3A 2QWLA 4BR5A 2Q31A 2ZWHA 3CETA 1RGIA 3C7NA 1IG8A 2Q2RA 1KAZA 4JHDB 4BR7A 2D0OA 4PL8A 1HKGA 3GG4A 2GUPA 3IDHA 2ASMA 5TKYA 4LC9B 2QWQA 1U2VA 3CQYA 3W0LA 5LJWA 1K8KA 1HKBA 5JICA 2W41A 4L3QA 5AQHA 3SK3A 3F9MA 1TUYA 5AQQA 3EN9A 1E4GT 4BRQA 1NGDA 3J8AA 2P9IA 4B1VA 3WXJA 5AQYA 3GL1A 4BRIA 3LL3A 3CJBA 5AQKA 2WUSA 3RSEB 4B1WB 3QMLA 4GY2B 3UKUB 2E88A 4FO0A 4BRFA 4MLEA 4BQZA 3WT0A 2P9NB 3WEEB 2YJEA 4B1YB 1GLJO 2GTDA 3O1BA 2Q0UA 1LOTB 3HTVA 3LM2A 4QS7A 3A5MC 3ENOA 4K42A 3ENHA 5AQFA 3O80A 3I8BA 2FF3B 1QQOA 3SLCA 3VEWA 3KHYA 1X9JA 4RWTA 2DPNA 1JCEA 4BR4A 1NWKA 1V4TA 4HWIA 5AQXA 4H5RA 3SJHA 3WQTA 4Z94A 4E1JA 2D1KA 1GLCG 3ZETA 5BPMA 2FSNA 4H5WA 3U8XA 4ISFA 2PAVA 3VEZA 5BRFA 1ATNA 1RFQA 3DXKA 2V7ZA 4BR2A 1NLVA 3H3NO 3VETA 4BRKA 4FWLA 1Z05A 1HUXA 4BVOA 1BG3A 2QWRA 3TU5A 4WYBA 4BROA 4B1ZA 2E2QA 5ADXA 2P9PB 2VCPA 5EXWA 3CERA 3GE1A 2E1ZA 3H6EA 1ZBSA 3A8YA 2J4RA 3ZEUA 3FZMA 4DHYA 4XH1A 3HI0A 2V7YA 4BG8A 2P9UB 2ZGZA 1OKJA 1HJOA 2P9SA 1ATSA 1HX1A 3UE5A 4DQ8A 1NGEA 3G25A 1S3XA 5AQMA 2V51B 1BWFO 1IJJA 3FE1A 4BRDA 1JCFA 2QWPA 5AQVA 4J8FA 4PKGA 3SMSA 4MO5A 4FWRA 4ISGA 5BPNA 4CZEA 4YDUC 2QWOA 3FZKA 2AP1A 3U9DA 5EX5A 3MN5A 1BA1A 2P9UA 1GLAG 3FZHA 4H5VA 3KZBA 5LJVA 1NGJA 1T44A 4CZJA 3CJCA 3DXMB 3MDQA 3ULEB 1EQYA 2E2NA 5ELZA 3VEXA 4H0TB 3A5NC 3QICA 5F1XA 4H0OA 2Q36A 3VF4A 2FLOA 3AAQA 3DJCA 4ISEA 1BA0A 3VEOA 4MLHA 1X3NA 3AY9A 4DCHA 1SAZA 5F2RA 5AZIB 2W40A 3BEXA 3VGKA 2QW9A 1RDWX 2CH6A 1WUAA 3EL2A 4CZHA 2H3GX 4M7YA 5F0XA 4IJAA 5E26A 3TPQA 3CJ9A 4XH5A 4RCHA 1BU6O 2HF3A 1BDGA 1MDUB 2CGKA 4H03B 1QHAA 5I9EB 5LY3A 2NRHA 3IUCA 3MK6A 2BTFA 1GLEG 1NMDA 2HF4A 2P9LB 3FZFA 3GDQA 2V52B 3L4IA 4JHDA 4WQ5C 3U4LA 3FFKB 5FPMA 3CI5A 5CE3A 1NGCA 4KBOA 3O1WA 2VYPA 3O6WA 3WXIA 1NGFA 3FGUA 3O4WA 2BUPA 3HZ6A 4CZKA 1MA9B 2ASPA 1HLUA 5KQDA 3FLCO 4BR9A 2YI1A 3EKSA 3B8AX 5FPEA 1QQMA 1U6ZA 2A5XA 3R9PA 3LDLA 4BGAA 4CZMA 1BUPA 5BR9A 1DEJA 1QZ6A 2P9KB 3L6QA 4BRCA 3FZLA 3RSEA 4BRNA 4BVPA 5AQNA 3UKUA 1KAYA 3D2FB 1GLLO 4A62A 2CH5A 5AQRA 2P9LA 3VF6A 3H1VX 4A2BA 4BRAA 2P9NA 5AQUA 1ZXOA 3WEEA 3QB0A 1DGKN 2HOEA 5E84A 5AZJB 4PL7A 5BRHA 3U9ZA 4BRMA 4Y0WA 3MMVA 3LM9A 3ZX0A 4NO7A 4WQ4C 4CBUA 1TUUA 3EZWA 1T6CA 1SZ2A 4K41A 4EAHD 4I6MB 5FPDA 2F9TA 4BREA 3VERA 1YVNA 2GWKA 3QBXA 5AQOA 4CD3A 2Q1NA 1QZ5A 3UKRB 4FWKA 4A61A 2OANA 5AQZA 3BF3A 5AR0A 5KPZA 5KPRA 3IMXA 4H0YB 1MWKA 2D0PA 3W3DA 2HMPA 3M6GA 4H0XB 4EIAA 4B1UB 4PKHA 5AFUH 4BC3A 3BF1A 4H5NA 4AM6A 3GBTA 4JD2B 1E4FT 2GWJA 3DWLA 4H0PA 2KHOA 1NGGA 3WUHA 2FF6A 3ATVA 3CJ1A 4IJNA 1DKGD 2ITMA 5FPNA 4H0VB 3VF2A 2P9PA 1NGHA 4I6MA 4FWNA 2QWNA 1NBWA 4CZLA 3EO3A 4JN4A 5AQTA 3IFRA 3M1FA 3MN9A 4IO8A 4IXCA 1NGIA 1Z6RA 4WQ5A 4BC2A 2F9WA 3H45C 2ZGYA 3M3ZA 4FWSA 3C7NB 1CZAN 4IWVA 5AFUA 1S22A 2AA4A 4H5TA 3A0IX 4CBXA 2PBDA 3LDQA 4FOIA 4HTLA 4CZFA 1GLBG 1D4XA 3D7EO 4GNIA 2I7PA 2NLXA 5BRDA 1K8KB 2CGLA 2I7NA 3JXUA 3FR0A 2E2PA 4FWPA 1R59O 4CJ7A 1G99A 2IVNA 4O5FA 2A42A 3C0BA 2P9IB 1BO5O 5AQIA 1LCUA 2A6AA 4CD1A 1V4SA 3HBTA 1KXPA 1HPMA 3DXMA 3ULEA 1Y64A 2YCHA 3VGMA 3AAPA 1C0FA 1QQNA 1BOTO 3QDKA 4BC5A 1HKCA 3MCPA 4WQ4A 1TYQB 3LDOA 3ID8A 5AQWA 1ATRA 2Q0RA 5KPTA 5BN8A 4FWOA 3QFPA 4DB3A 5AQLA 5AZIA 4CZGA 3R8EA 3MN7A 1XC3A 1J6ZA 3ZETB 4MO4A 4CI6A 2FSKA 2GELA 4BRPA 1GLFO 2FSJA 3WXLA 4BGBA 5JMVA 4AM7A 3DXKB 2A40A 3VOVA 3S41A 4NB4A 1TYQA 5BN9A 1WOQA 3A5OC 2QM1A 4YDUA 3VEVA 4CBWA 3A5LC 1MWMA 4BRLA 2NZTA 1YAGA 1ZC6A 3P4IA 1Q18A 4EFHA 5ADXH 1KAXA 3H3OB 3VEYA 3CIPA 5JLHA 3H46O 1JCGA 1X3MA 1XQSC 2YHWA 3L0QA 3SMPA 3ZEUB 3CQXA 4EHUA 4F9OA 3DAWA 2QWMA 4B9QA 3QFUA 3H1QA 1NM1A 1YXQA 2P9KA 3UB5A 2P9SB 3HSCA 3O5BA 4C23A 4K43A 4EHTA 3D2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L3VA 2YJFA 3VQ4A 1T6DA 3T1HK 1L3SA 4BR0A 1H1VA 4DLEA 1VQLN 2A3ZA 4C8NA 1SV5A 4QS9A 3WXKA 3AA4A 4CHNA 5KQ8A 1GLDG 4YORA 4CEDA 2D5RA 3HT3A 2X6NA 1EP4A 5EVZA 1C0UA 2PYJA 1D8YA 1Q81O 2PY5A 4J2AA 1KVCA 1ESVA 5BREA 2O8BB 4O8KA 1RT3A 4JKFA 1VQON 4DFJA 3R6MA 1IG9A 3K9JA 4PKIA 4RW7A 4WFAL 2IIRA 1NOZA 2IS3A 3ITHA 3BP8A 4CJWA 1C1CA 1GOCA 1NMNA 1T8EA 5AJ3K 1XUPO 3ZX2A 5MLCQ 4M7XA 5KRSA 3D2EA 2IVPA 3EKUA 2VQFK 3OBWA 3L2VA 5BR8K 3VQDA 3BUZB 4I9LA 1NGBA 1VK0A 4RW8A 4JI2K 3VESA 2QWLA 3SYZA 3ZT1A 3V6DA 1T05A 1L3UA 2E6MA 1NKEA 1RGIA 1RBUA 1IG8A 1KCFA 3C7NA 1KAZA 4JHDB 3THYB 4BR7A 2D0OA 1L3TA 4KH6A 4OPHA 4WFNL 3T19A 3TSQA 3OY9A 2QWQA 1U2VA 3CQYA 2W41A 4RW4A 4BE1A 4M41A 3ZCMA 3F9MA 3EN9A 4GVEA 4AHSA 2JGUA 1RTDA 4B1WB 1N34K 3QMLA 2YV0X 1X9WA 4DMNA 3EE8A 4CJUA 4KH5A 3WEEB 4B1YB 2KFNA 1W97L 4FJJA 4CEFA 2Q0UA 1LOTB 4QS7A 5CYQA 3A5MC 1UOCA 4YNQA 3O80A 3JSMA 4N41A 1QQOA 3VEWA 3L2QA 3G71N 4BR4A 4U7BA 2Y1IA 2HBJA 4H4OA 4OLBA 1IBLK 2PAVA 1NJXA 4YOWA 1WB9A 5HP1A 3V9ZA 1ATNA 3C6UA 1LAWA 2V7ZA 2AJQA 3H3NO 2G8WA 1IKVA 4RG8A 4LSNA 4BRKA 1C0TA 3OA9A 1HUXA 4JRQA 3VN5A 4WYBA 4B3MK 1KVAA 2E2QA 3PSFA 4J2EA 2J4RA 3QESA 4CGDA 3ZEUA 3FZMA 4KV8A 3MEGA 4XH1A 3HI0A 4IEEA 2QEXN 3E9PA 4JS5A 4BG8A 2P9UB 4MFBA 1OVQA 2ZGZA 4LD0A 1ATSA 2XHBA 2D0AA 4CJEA 3RVCA 4M3XA 2B5JA 3OS1A 2V51B 1JCFA 2QWPA 5AQVA 4R79A 3H08A 3HVTA 3M8RA 4PKGA 3V9XA 4MO5A 3V1RA 4FWRA 4KPYA 4C1NK 4KHPK 3K5LA 4YDUC 4GV3A 4OPKA 1JXEA 1TAUA 4CJKA 3L2RA 2AP1A 1RT1A 4OPJA 3QEIA 3V4IA 4H5VA 5LJVA 4YOYA 4HUFA 4DV4K 4CZJA 3QINA 1HYZA 3AO2A 3DXMB 1EQYA 4J2DA 3NE6A 4H0TB 3A2FA 2WBNA 3A5NC 1QSSA 5M1NA 3PX4A 2KQ2A 4NCAA 1G15A 2O4IA 1L3VA 1VQ6N 2Q36A 4HHTA 4DR7K 1O13A 2FLOA 3AAQA 3TAPA 4W5TA 1BA0A 3VEOA 3AY9A 1SAZA 1XNQK 2HHXA 5JS1A 2FBTA 4FM0A 1JLAA 4FLTA 3EL2A 4CZHA 2H3GX 3CCSN 3HPHA 3TPQA 3SPZA 1QSLA 3CJ9A 1RBRA 4EP5A 1BU6O 5C12A 4F3OA 1JXBA 2HHUA 4FVMA 1BDGA 5KGWA 1MDUB 4CHOA 1D9DA 5I9EB 3C65A 2FBVA 3MK6A 2WONA 3IAYA 4JI1K 2HF4A 4WQ5C 2P9LB 2Q3SA 2V52B 3L4IA 1SL2A 2OTLN 4B9MA 4CGHA 3FFKB 1YJWN 5CE3A 1NGCA 4CW7B 3MEDA 2VYPA 2X6SA 3FGUA 1JKHA 2HVIA 3G10A 1TKZA 1TK0A 3VQQA 1HLUA 4OVLA 1RTIA 4LF6K 3B8AX 4DTNA 3LDLA 4BGAA 4CZMA 2P9KB 3Q7CA 3L6QA 3RSEA 4BVPA 5AQNA 3UKUA 3VQBA 4M45A 1BIZA 1TKDA 1RT2A 4A2BA 1ZXOA 5E84A 4PL7A 5BRHA 3LWLA 4BACA 2W6LA 3MMVA 1CLQA 3ZX0A 4NO7A 2HHHK 4FJGA 1BISA 1Z25A 1VAZA 4I6MB 4KKOA 5FPDA 2F9TA 3DOLA 4BREA 3VERA 3CCUN 5AQOA 3DRSA 1QZ5A 2YKNA 3DLLL 1YI2N 1KQSM 3DLRA 1XMOK 5HRNA 5KPRA 4A5AA 3IMXA 3SI6A 4IG3A 1VQMN 3ZT4A 3OS2A 3VTHA 4EIAA 4B1UB 5AFUH 1WSIA 3CFOA 3FFIA 4H5NA 3AGKA 1KVBA 2GWJA 4FJ5A 3WUHA 2G8KA 1C1BA 2FF6A 2ITMA 5GIOA 4AHCA 1YJ9N 4NCBA 3NGYA 4FWNA 2XY8A 4JN4A 5AQTA 3CYMA 4RW9A 4M3RA 4IXCA 4EZ6A 1RDDA 3BZKA 3V1OA 1Z6RA 2OPSA 1WSGA 2F9WA 2Z1IA 1KD1O 3CCEN 1RDBA 4KHUA 3C7NB 2WTUA 3E01A 1S22A 2AA4A 1TL1A 1RT6A 4HTLA 1EWQA 4TSXA 4GNIA 4FK0A 4A59A 2NRRA 2E2PA 4FWPA 1UA1A 1G99A 4E7KA 1VQ4N 4ID5A 2A6AA 4CD1A 1T3VA 1YTUA 3Q7BA 4B3OA 3LALA 2A1SA 4DR6K 4JKGA 3L8BA 3P1GA 4AILC 1WAFA 3CF5L 3ISNC 4AHRA 3QDKA 1HKCA 3VQ9A 5HRSA 4WQ4A 3SV3A 4NXNK 1TYQB 4HTUA 3BY5A 3R3LA 2W6KA 5KPTA 1WAJA 1XHXA 5TKWA 4DSIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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