1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Phosphotransferase
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
4B1VA 4BR2A 5AZJB 1YAGA 4CI6A 1ATSA 4BRCA 2ITMA 1QHAA 2H3GX 4L3QA 3WQTA 5BREA 5LY3A 2GWJA 4A61A 3EKUA 2QWRA 1ZC6A 2E2QA 3U8XA 4CD3A 3A8YA 3SMPA 4BRHA 1BWFO 3ZETA 5AQWA 4BREA 3AAQA 2E8AA 1HJOA 3D2FB 4JHDA 3FZHA 2V7YA 3DJCA 3FGUA 1GLEG 3SLCA 2P9KA 3I33A 4CBXA 4FWSA 4PKGA 5AQNA 3UB5A 4BR0A 2A6AA 1NGAA 5JLHA 5BRDA 4HWIA 4WYBA 2E1ZA 3ID8A 5EY4A 1NBWA 1S3XA 4A62A 3DXMA 2E20A 3ULEB 5F0XA 1ESVA 4BRQA 2BTFA 2P9IB 1K8KA 5AQTA 2QWOA 5EVZA 4B1YB 4EFHA 1S22A 4DB3A 4YDUC 3L0QA 2NLXA 3A5LC 1GLLO 4AM7A 1BDGA 4RCHA 5BPLA 3FLCO 1XC3A 4CZKA 1J6ZA 1G99A 2E2NA 2YJFA 3ZETB 5AQFA 5BR9A 4BRLA 4BRNA 4RTFD 1JCFA 1T6CA 2CGKA 4IXCA 4K41A 5CE3A 4JHDB 4H0XB 2ZF5O 1KAZA 3VETA 3WXLA 3IFRA 4O5FA 4O8KA 2P9KB 4BG9A 4JNEA 3CJ7A 5AQGA 4ISFA 1D4XA 3MN7A 2W40A 4FL9A 1BO5O 3MN9A 4XH4A 1DEJA 2GTDA 2AA4A 5AQIA 3HM8A 1TUUA 3WXIA 4LC9B 2D0PA 4BVPA 1BG3A 3CI5A 2YI1A 1K8KB 2J4RA 5ELZA 3SK3A 1C0GA 1ATNA 1Y64A 4XH5A 4CZJA 3QICA 4FOEA 4K43A 4FWLA 2PAVA 3MCPA 2IVPA 4K25A 2QWLA 4DCHA 2A42A 3VEXA 1ZBSA 4H0YB 1CZAN 2A5XA 3VERA 4DQ8A 3ENHA 1MDUB 3MN5A 4Z94A 5BPMA 3FR0A 3D2EA 2UYTA 5LJVA 3ENOA 1T44A 4FWKA 1GLBG 2QWQA 2QW9A 3CQYA 1Q18A 2YCHA 4CZGA 3TU5A 3LDOA 2A40A 3EO3A 3BF1A 3L4IA 2E2PA 3O80A 1HKGA 4MO4A 2AP1A 1GLJO 2HOEA 5AQMA 5I9EB 3HZ6A 3QDKA 4FPAA 4PL7A 4QS8A 4H0VB 3IUCA 3LDNA 4CZMA 3UE5A 2P9LA 3H1QA 3CJCA 1NGCA 4B1XB 4CZFA 3A0IX 5JICA 5LJWA 3ZX0A 3UKRA 5BN8A 3WXKA 4FOIA 3MMVA 1MWKA 4YDUA 5JLFA 2YHYA 3BEXA 2CGLA 4NO7A 2FSJA 3QMLA 2FSKA 3H3NO 5AQVA 3MK6A 1BA1A 2YHXA 1QZ5A 3CQXA 1BA0A 3BUZB 3BF3A 3FFKB 5AQSA 2Q1NA 2QM1A 1QZ6A 3D2EB 2QWNA 1EQYA 2FLOA 2QXLA 3QFUA 3U9DA 3VF6A 4BRGA 4BGBA 5AQZA 2E2OA 4BC3A 1KAXA 4B1UB 4CBWA 2F9TA 4IWVA 3CJ1A 2D0OA 3VENA 1HKBA 2QWPA 1BUPA 2D4WA 2FF6A 4IO8A 1NGGA 3G25A 3WXJA 1LCUA 3I8BA 3ZX3A 2GWKA 3VF4A 3QB0A 4EIAA 1NLVA 3A5MC 3LL3A 3KHYA 1X9JA 2P9LB 3ATVA 3H45C 3H3OB 1NGHA 2A3ZA 1SQKA 3R9PA 4H5RA 1HLUA 2V7ZA 5BPNA 3UKRB 2IIRA 1T6DA 5AQUA 3VGLA 4B9QA 1HKCA 3H6EA 3FZMA 4JAXA 2HF4A 4GNIA 2YJEA 1WOQA 2VWBA 3O6WA 1NWKA 3HTVA 3M6GA 4MO5A 4H0PA 3TPQA 3QBXA 4BG8A 2VCPA 3QFPA 2DPNA 3ATUA 3WT0A 3VOVA 1MWMA 3O1BA 1NM1A 2FF3B 3FE1A 1NGEA 1X3MA 4CZEA 1Z05A 4PL8A 4C23A 4BRIA 4H5VA 3EZWA 2KHOA 4ISGA 5E84A 2QWMA 4JN4A 2IVNA 1SAZA 3DXMB 3VEYA 3AAPA 3SJHA 2GELA 1GLAG 5AQQA 4FO0A 4IJNA 5TKYA 3ZEUA 1YUWA 1QQOA 1HPMA 1DKGD 1NGIA 2CH6A 2Q0RA 3SMSA 4NB4A 3ZX2A 3KZBA 1BOTO 4FWRA 4BRAA 1IG8A 1QQMA 2EWSA 2FXUA 4BRFA 2P9SA 4BR9A 4H0TB 1MA9B 3M3ZA 4XH1A 4CD1A 5ADXA 3VEVA 2P9UA 3CETA 1GLFO 2ZWHA 3S41A 3W3DA 2CGJA 4BR5A 1ZXOA 4FWPA 4Y0WA 4MLHA 3FZLA 1E4GT 4M7XA 4BR7A 2P9PA 2ZGZA 4FPBA 1KAYA 1NMDA 4BRPA 2HMPA 5B8HA 1XUPO 4RWTA 1GLCG 1YXQA 3JXUA 3O8MA 3VGKA 4BC5A 4PKIA 3EKSA 4K42A 1YVNA 4JD2A 4HTLA 3ZEUB 4WQ4C 1Z6RA 3AY9A 3JS6A 4CJ7A 5FPDA 2GEMA 3O08A 5AQJA 3IMXA 5KQDA 1BU6O 1NGDA 4FWMA 5FPNA 1JCEA 2P9SB 3CJBA 3O1WA 3R6MA 4BQZA 3BP8A 1X3NA 2A41A 1DGKN 1RGIA 2ASPA 2IVOA 3CIPA 2P9UB 3J8AA 3GOIA 3VF2A 3L6QA 3RSEA 1H1VA 2ASOA 3HSCA 3HBTA 5AZIA 3DAWA 2WUSA 3LDPA 5AQHA 4PKHA 4QS9A 1LOTB 3O5BA 4BQLA 3GE1A 4CZIA 4BROA 3F9MA 1JCGA 2P9PB 3B8AX 3CERA 2P9NA 5FPMA 2NRHA 5ADXH 3GDQA 5E26A 1QQNA 4B1ZA 4AM6A 4CZLA 2OANA 5AFUA 2V51B 4JD2B 3M1FA 4H0OA 4WQ5C 5AQXA 4XEIA 3VEWA 1V4TA 5F2RA 4I6MA 4M63C 4BRKA 4H03B 5KPZA 2PBDA 3MDQA 3VEZA 3WEEA 5EX5A 3R8EA 3MN6A 5AQRA 2I7PA 4A2AA 4CBUA 3KVGA 2CH5A 5EOYA 3C7NA 3QBWA 2Q36A 2BUPA 3RSEB 5FPEA 3EL2A 3LM9A 3DWLA 2Q97A 5AZIB 3WQUA 1OKJA 3D7EO 3GL1A 4A2BA 4BC2A 2ASMA 1U2VA 4J8FA 4DHYA 3O4WA 3UKUA 5KPRA 2P9NB 3CJ9A 1RFQA 2Q0UA 4BVOA 3DXKA 5AQYA 3C0BA 1NGJA 4H5TA 4EHTA 3VGMA 1P8ZA 1TYQA 2W41A 3VEOA 3VESA 5BRFA 4IZ9A 4FSVA 4BGAA 4BC4A 4BRDA 4F9OA 4WQ4A 3EN9A 4FWOA 3U4LA 5BN9A 5KPTA 5AQPA 4I6MB 5JMVA 4EAHD 4QS7A 3IDHA 3GBTA 1R59O 3CHWA 3WEEB 4IJAA 1TUYA 5AZJA 1HX1A 5F1XA 5AFUH 4MLEA 4GY2B 4H5NA 1HUXA 3C7NB 3U9ZA 3HI0A 3WUHA 4ISEA 3P4IA 5AR0A 1V4SA 2Q31A 2Q2RA 1NGFA 5AQKA 2E1YA 2GUPA 5BRHA 1GLDG 2F9WA 3OHRA 3A5OC 3LDLA 1U2VB 3AARA 4EHUA 1KXPA 1C0FA 4B1WB 3FZKA 4FWQA 3UKUB 2E88A 2NZTA 4M7YA 3D2FA 3FZFA 3W0LA 2YHWA 4E1JA 1U6ZA 2FSNA 3DXKB 5AQOA 5EXWA 3A5NC 1WUAA 5KQ8A 1NGBA 1XQSC 2VYPA 1E4FT 3CJAA 1TYQB 4KBOA 3LDQA 1SZ2A 5AQLA 1ATRA 2D1KA 3H1VX 4FWNA 2HF3A 2V52B 2ZGYA 3LM2A 4BRMA 4H5WA 3VPZA 4WQ5A 1IJJA 2I7NA 3GG4A 4BR4A 3H46O 3ULEA 1RDWX 2P9IA 4CZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M8RA 3P39A 1VQPN 1YAGA 4U7BA 1J53A 1HQEA 4WE1A 3L4QA 4H4OA 1WNSA 3SQ2A 5DMRA 4KI6A 3R3LA 5HBMA 4A61A 4DR7K 1EXQA 1L3TA 3QEXA 3A8YA 2G8IA 4BRHA 3ZT4A 3TSPA 5AQWA 4Z4EA 3AAQA 2RF2A 4JI4K 1HJOA 4CE9A 3VQ5A 4F3OA 4C1NI 3FGUA 1ASWA 1GLEG 4I2PA 2OZSA 3MXIA 3KIOA 2P9KA 3I33A 3NF6A 4FWSA 3PO4A 4BR0A 4B3MK 1NGAA 4FZYA 5BRDA 4KH5A 4HWIA 1WBBA 5GADP 5EY4A 4E7HA 2E20A 1KLNA 3CM6A 4BRQA 2P9IB 2ZE2A 4IEIA 5C2FA 4RW9A 4DQRA 3HRGA 2ZJRL 4FVMA 2NLXA 1LWEA 2YHAA 3A5LC 2IC3A 1UA0A 2JWLA 3WNHA 2QXFA 5BPLA 3FLCO 4W5OA 2I5JA 5J2MA 2ITGA 3O9RA 4F3TA 3HP9A 2EX3A 3OYCA 3AVAA 1KC8O 3ZT0A 1VQMN 5CE3A 1T3VA 3VQ4A 3SAHA 1BI4A 3VETA 1Z25A 4O8KA 2P9KB 2BH1A 4Z4GA 4JNEA 2DFEA 1B9DA 4R5PA 1I39A 2G8FA 5AQGA 1L3UA 4GVEA 3DYAA 4DWIA 3BZKA 3EZ5A 4V19S 1RTHA 2YX6A 3HM9A 4XH4A 5CHIA 4DV4K 4J2BA 5M1FA 4DTUA 4LC9B 5C2DA 5CR4A 4B3SK 4FJJA 4FW2A 1C0GA 3NGZA 1EX4A 4I9LA 1HNIA 4IBNA 4BE2A 3AO4A 3O9UA 4DCHA 2A42A 2YNGA 2QK9A 1ZBSA 3M8SA 4DQ8A 5DM7L 1MDUB 3DLRA 1CLQA 3P38A 4LD0A 4B9MA 4KHPK 5BPMA 1YT3A 3RTVA 1BI4B 1RDBA 3ENOA 1EETA 1Q18A 5HL7L 3TU5A 2A40A 1IKXA 3BF1A 3L4IA 3O9QA 1WSFA 1J5OA 2AP1A 4FK2A 5I9EB 4LF9K 4PL7A 3VQBA 3PLAA 1N5YA 3H1QA 5EU7A 1F21A 3H08A 1O1WA 2VG5A 4O0JA 4CZFA 4F2SA 4IOCL 3HL8A 3UKRA 4ID5A 4YOUA 5JLFA 2UUCK 4NO7A 2FSKA 3MK6A 4CIFA 4FJGA 4Z4CA 1BA1A 3L2WA 1FJGK 2YHXA 3CQXA 4HVJA 4OKJA 4B9VA 1BCOA 1BL3A 3DOLA 3LP2A 3VTHA 5AQSA 2Q1NA 5M1OA 2QM1A 3KLFA 3VF6A 2E2OA 1Y97A 3ZSWA 4W5RA 4B1UB 2F9TA 3VENA 4HTUA 3KWGA 1HKBA 1BUPA 2FF6A 4IO8A 1TAQA 3G25A 3VQ8A 3WXJA 1Q8IA 3I8BA 4KTZA 4CJFA 3LAKA 4JI1K 4RG8A 4PUOA 1D5AA 4QAGA 5LMUK 1QVFM 4LSLA 4GKKK 4DSEA 5D3GA 3SUNA 1DLOA 2QA4N 5J1EA 4DTXA 2A3ZA 5SWMA 3P31A 4QCLA 3UKRB 4E7LA 3CD6N 4DV1K 1HKCA 1HYSA 3FZMA 3SUQA 4JKDA 2HF4A 2DY4A 4HUEA 3M6GA 2VG7A 4H0PA 1NJIO 4GV9A 4BG8A 3A2FA 1SL1A 4CCHA 1K8AO 1NM1A 2RN2A 4FJLA 3U3GA 4CZEA 1Z05A 4PL8A 4C23A 4H5VA 2KHOA 4ISGA 4FW1A 4JN4A 3TAPA 2IVNA 3DXMB 1U49A 1Q9YA 3LPTA 3SJHA 4M3UA 3PIOL 1Q81O 1QSYA 3AA5X 1VSEA 4CJUA 4LF7K 1IKWA 1NGIA 2Q0RA 4CF1A 2RE2A 3ZX2A 4FWRA 4G9ZA 2UXBK 3CCUN 1QQMA 3ZSQA 3IG1A 2FXUA 4K0KK 4CECA 1ZBIA 1KVBA 4CK2A 3M5RA 4YFUA 3BGRA 3M3ZA 4XH1A 2O8FB 4YY3K 5CYQA 1WSGA 1GLFO 2ZWHA 1JLGA 4FJ8A 1HNXK 3CCVN 3NH2A 1ZXOA 4FWPA 4Z4HA 3NH0A 4MLHA 2P5OA 4C8OA 4M7XA 4BR7A 1VSMA 3HP6A 1J5EK 4OPAA 4LY7A 4DQIA 1VQNN 1S1UA 2HMPA 4DMNA 1GLCG 1YXQA 3O8MA 4DV0K 3CC2N 1ZBFA 4EP4A 1S72N 3SCXA 1OH8A 1RT5A 3OYLA 1NKCA 4CFCA 3ZLJA 2HHQA 3AY9A 4CJ7A 5AQJA 1TKXA 1BU6O 4FWMA 1JCEA 3MCAB 5I3UA 1RBSA 4GW6A 3BP8A 1U48A 3O9TA 1DGKN 2IVOA 3CIPA 3VF2A 5MLCQ 4EZ9A 2KFZA 4Q0BA 3L6QA 1VQ6N 1VSJA 5KRTA 5J2NA 4I9QA 5AZIA 1IKVA 2OZMA 3B8AX 4IG0A 2P9NA 2XY5A 1NKEA 2B6AA 3HSTB 5JVHL 4ELVA 1QQNA 4AM6A 3OA9A 4J2EA 3DRRA 4DTRA 3DI6A 1NNEA 1HYVA 3M1FA 1QE1A 5AQXA 3V6DA 2HBKA 4I6MA 4CF2A 1SV5A 4M3ZA 3IAYA 2KZZA 2PBDA 3MDQA 3R8EA 5HLFA 3AO2A 5EOYA 3CCLN 3CXCM 4B8AB 3CCSN 5AZIB 3WQUA 2RPIA 3B6OA 4DFJA 3PUFA 4J8FA 5HROA 4Z4IA 2ZD1A 4BDYA 3V9WA 2P9NB 4OX9K 3CJ9A 5C12A 4KB1A 3LPUA 3C0BA 4N41A 4JK8A 4BWMA 3V9XA 3VEOA 5GAHP 3QEVA 4DSIA 1HNWK 4BC4A 4BRDA 4M3WA 4FWOA 3U4LA 2E6LA 3P1GA 4I6MB 4EAHD 4QS7A 3IDHA 1CXUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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