1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphotransferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
5AQZA 4XH4A 4DQ8A 1NM1A 4GY2B 4WYBA 2V7ZA 3WQUA 1KXPA 3LL3A 3MN5A 2YI1A 2IVOA 3VPZA 2E2NA 1BU6O 3SMSA 3U9DA 4JAXA 1H1VA 2P9UB 1BOTO 4B1YB 3GG4A 5BRDA 4HTLA 1NGBA 4KBOA 3AAQA 3QB0A 4B9QA 3M3ZA 3ENOA 3WT0A 1QQNA 4F9OA 3RSEB 4M7YA 4O8KA 4O5FA 4FWRA 4BRMA 5JLHA 1GLFO 3GBTA 1MDUB 5JICA 4B1VA 5BPLA 5LY3A 5AQJA 4BRLA 2VWBA 4BG9A 1YXQA 4AM7A 2KHOA 3U9ZA 1C0GA 5AFUA 4CBUA 4K43A 2QXLA 1GLBG 3A0IX 3R8EA 2E88A 3O4WA 5AR0A 2ITMA 1XUPO 4CZGA 4IJNA 3RSEA 3O8MA 4CZFA 3O1WA 1HJOA 4FWOA 4MLHA 5AQVA 2D0OA 2Q0UA 1KAXA 2E1YA 2BUPA 1BA1A 1CZAN 1E4GT 4Z94A 4FWKA 5ELZA 4BROA 5FPEA 4EIAA 2ASMA 1GLAG 2GEMA 5AQLA 3SMPA 4PKGA 1HKBA 3DXMB 3EKUA 2QWRA 2HMPA 3ATVA 5EY4A 4BC4A 4H03B 5JMVA 2CGJA 3FGUA 1HKGA 3MCPA 2CGKA 4FSVA 3LM2A 2NRHA 4CI6A 4K25A 1T44A 3DXKB 3LDQA 2YJFA 4FWSA 1C0FA 4IJAA 4AM6A 2QM1A 5AQFA 4B1XB 2I7PA 4E1JA 3WUHA 2HOEA 3BF1A 3WXIA 1HPMA 1X3MA 3J8AA 3CIPA 3DXMA 4BGAA 4MO4A 3O80A 3FZHA 1S22A 3WQTA 5EX5A 1E4FT 2IIRA 4PL7A 3AAPA 5KQDA 3CJAA 1IJJA 4NB4A 3CJ1A 3ZETB 4L3QA 2YJEA 3DXKA 3FLCO 3ZEUB 5AFUH 2W40A 2NZTA 1SZ2A 2HF3A 3D2EB 1QQOA 4PKIA 2AA4A 2Q31A 2IVPA 3VEWA 1KAZA 4CZJA 2QWQA 5AZJB 2VYPA 3IFRA 1RGIA 1HLUA 4DHYA 3M6GA 5AQKA 4CD1A 1DEJA 3CETA 4FWPA 4H5TA 5LJVA 3GDQA 4BRHA 2UYTA 4EFHA 3WXLA 5F2RA 4JN4A 3ATUA 3EZWA 2QWMA 2WUSA 3LDOA 2QWLA 3ZEUA 5AZIB 4BRAA 4A61A 2GWJA 3D2EA 3UKUA 3AY9A 1U2VB 3DJCA 5AQPA 4BR0A 3MN7A 3BP8A 3O6WA 5AZJA 3WEEB 4JD2B 3LDNA 1NGGA 5AQTA 5BN8A 3I33A 5KPTA 5LJWA 1YVNA 3FFKB 3MDQA 4BVOA 5ADXH 1NGJA 1EQYA 2E8AA 1ZBSA 5AQUA 5AZIA 3P4IA 2GELA 4CZEA 3VF2A 4H5VA 3H1QA 3HZ6A 3MN6A 3VEXA 3L0QA 3DWLA 5BRHA 1GLLO 2F9TA 4YDUA 3SLCA 5AQRA 3WEEA 5AQYA 2QW9A 3ZX3A 1ATRA 4BRPA 4JNEA 4JD2A 5EOYA 2FSKA 3QICA 2P9UA 3FE1A 4ISGA 5AQHA 1YUWA 1RDWX 5E84A 5AQIA 3MK6A 4GNIA 3CERA 5FPDA 4BRIA 2ZWHA 3VGLA 3H3OB 3FZKA 1XC3A 3CHWA 4A62A 2EWSA 2P9NB 5AQMA 3QFUA 2ZF5O 1K8KB 4BR4A 3W3DA 4HWIA 4BGBA 3DAWA 4M7XA 3A5MC 3VEYA 3A5OC 4CZIA 2FF3B 2V52B 1DKGD 4FPAA 1BA0A 3VEVA 1QQMA 1NGIA 3CJ7A 3O5BA 4H5WA 3VF4A 2W41A 1ATNA 4H5NA 5E26A 3HBTA 2J4RA 5EVZA 1BWFO 3LDPA 2V7YA 3UE5A 3A5NC 1X9JA 1HKCA 2ZGZA 2P9NA 1G99A 2YHWA 4ISFA 4BRKA 3EO3A 2F9WA 5ADXA 5KPRA 3FZLA 2OANA 4H0YB 1LOTB 3WXKA 1Q18A 1SQKA 5AQSA 2FSJA 4WQ5A 4IO8A 4C23A 1NBWA 2Q2RA 3KVGA 1T6CA 2Q97A 3ENHA 4BQZA 1SAZA 4RTFD 5BREA 5AQNA 2PAVA 2BTFA 4BVPA 2E2PA 2D0PA 3D2FB 3QMLA 3ULEB 3UB5A 3HTVA 1T6DA 3G25A 5I9EB 4B1UB 3HI0A 3C7NB 3BEXA 1P8ZA 3LDLA 1GLCG 3H3NO 1V4TA 1R59O 4FWLA 4H0OA 5F0XA 1NGDA 2ZGYA 3LM9A 1HX1A 4K42A 3GL1A 4FL9A 4FWMA 3FZFA 4QS9A 2DPNA 2P9IB 4BC5A 3ID8A 3D2FA 4YDUC 3F9MA 3C0BA 3ULEA 4B1WB 3EN9A 3ZETA 4BREA 4CD3A 1NGFA 4BR5A 4BRCA 2CGLA 1QZ5A 4H0TB 4CZMA 3C7NA 1RFQA 3HM8A 4QS7A 3O08A 2QWOA 3CQYA 1GLEG 2A6AA 4K41A 4ISEA 4FOIA 4IZ9A 4MLEA 3CJBA 4H0XB 3I8BA 2I7NA 2YCHA 4BC2A 4FWQA 1ZXOA 5AQQA 4EHUA 4JHDB 3BUZB 2NLXA 1DGKN 4J8FA 2PBDA 2P9IA 5TKYA 4CZLA 3IUCA 4FO0A 2HF4A 3QBXA 3A5LC 4BQLA 4EAHD 4BRFA 3QDKA 3CJ9A 4XH5A 2E20A 2P9LB 1KAYA 3VERA 3TPQA 4A2AA 1TUYA 1U2VA 3HSCA 3VF6A 1LCUA 4CJ7A 4JHDA 3S41A 1HUXA 4WQ4A 1IG8A 2P9PB 2GWKA 2CH5A 4BRDA 5BN9A 1OKJA 5AQGA 1NLVA 1NGHA 2E1ZA 1NGCA 1WOQA 3B8AX 4WQ5C 2A5XA 2P9LA 3W0LA 4CBXA 4H5RA 2YHYA 4IWVA 1YAGA 1XQSC 2GUPA 1GLJO 1QHAA 2FF6A 4XH1A 1WUAA 2P9SB 3EL2A 3SJHA 2P9PA 1BG3A 3A8YA 2YHXA 4PKHA 1MWMA 2ASOA 2FSNA 5AQWA 3U8XA 3FZMA 5CE3A 1ZC6A 3GOIA 2Q0RA 3L6QA 3MN9A 2FXUA 2FLOA 3QFPA 4Y0WA 3TU5A 2AP1A 5FPMA 4M63C 5FPNA 4CBWA 5AQXA 1X3NA 3IMXA 4NO7A 4RCHA 4BRNA 5BRFA 4RWTA 2E2QA 5BPNA 2D1KA 1MWKA 5EXWA 1K8KA 4BRGA 2E2OA 4BR7A 2P9SA 3JS6A 3VENA 3H45C 2P9KB 5JLFA 3KZBA 2QWNA 2A3ZA 3VOVA 5AQOA 1NGEA 1JCEA 2H3GX 3CQXA 2A40A 4DCHA 3H1VX 3WXJA 2V51B 5KQ8A 3CJCA 3SK3A 2ASPA 4BRQA 2Q1NA 3UKRB 3EKSA 4I6MB 3VESA 4MO5A 2GTDA 4IXCA 3AARA 4FWNA 1NMDA 1J6ZA 2Q36A 4LC9B 4BR9A 3VGMA 2P9KA 1TYQB 2VCPA 3L4IA 2IVNA 1GLDG 5F1XA 1MA9B 2D4WA 1D4XA 3IDHA 4BR2A 1Y64A 1BUPA 3QBWA 3VEZA 4CZKA 4EHTA 3VETA 3R9PA 4XEIA 3M1FA 2QWPA 1BDGA 3UKRA 3BF3A 3GE1A 4I6MA 4BG8A 5BR9A 1V4SA 4WQ4C 3H6EA 4PL8A 3O1BA 1ESVA 2A42A 1U6ZA 1JCGA 3FR0A 3UKUB 1TYQA 3OHRA 1Z05A 3ZX0A 1QZ6A 5B8HA 3U4LA 3R6MA 4B1ZA 3H46O 2CH6A 4H0PA 3VGKA 4BC3A 1TUUA 1BO5O 3CI5A 1S3XA 1JCFA 4FPBA 4CZHA 1Z6RA 3D7EO 3MMVA 4QS8A 4FOEA 5BPMA 4DB3A 4H0VB 4A2BA 5KPZA 3VEOA 1ATSA 3ZX2A 3KHYA 3JXUA 1NGAA 2A41A 1NWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYNA 3G6EN 3DI6A 4PQUA 4DQ8A 4FCYA 4BDZA 4WYBA 4BE1A 2OYQA 1S1VA 1LAWA 3E9OA 4DFJA 1WAFA 3SUQA 1BU6O 3SMSA 1KLMA 1H1VA 2P9UB 1NGBA 2OPRA 4B08A 4FJNA 4B9QA 3WT0A 3SAHA 5DMRA 3GBTA 2HB5A 1NK8A 4HTUA 1HNXK 4KHQA 4FLUA 4KRFA 1RTHA 5AQJA 4F3TA 2G8FA 2VWBA 4ICLA 1ASWA 1C0GA 3SQ2A 4IEEA 1XWLA 1VSJA 4CBUA 4B9TA 1TK5A 4DS4A 1RDDA 3A0IX 3O4WA 2ITMA 5C25A 1R0AA 3RSEA 2VWJA 4B8AB 3RMCA 3Q7BA 5DK5A 3NAEA 4DR5K 3M8QA 1C0MA 2GBZA 3K9JA 2XY6A 5CYQA 1FW6A 4EIAA 3P1GA 2ASMA 3RR7A 3PX6A 4CHNA 1N5YA 3DXMB 3KK2A 2QWRA 3AO5A 3VQAA 3MX2A 1D5AA 5JMVA 4JI5K 1BI4B 1SL0A 1U48A 2CGKA 4FSVA 4W5OA 4K25A 1RCHA 3TSPA 4FWSA 4GV3A 4IJAA 4AM6A 2QM1A 2VG7A 3MWTA 4E1JA 4Z4HA 3WUHA 1ZBLA 1HPMA 4BGAA 3FZHA 4M3WA 2NNWA 4GMJB 3KKRA 1E4FT 5EX5A 2UU9K 4FZZA 3S3NA 2HNZA 4HVJA 2YHBA 4FXDA 4NB4A 3CJ1A 4L3QA 5GAGP 3DXKA 3FLCO 3TAPA 3K5LA 1BHLA 3MAQA 3U3GA 1S1WA 1SZ2A 4CGJA 3VEWA 2QWQA 2VYPA 1RGIA 4DHYA 1QS4A 2ZE2A 1TAQA 1DEJA 4Z4EA 3GDQA 3O9RA 4BRHA 4CJLA 4B9SA 4JKGA 1EXQA 3HO1A 2QWLA 2YNHA 3ZEUA 2E6LA 3L2RA 5JVGL 1VQ8N 2F8SA 1GOBA 4FLWA 2GWJA 3D2EA 3AO3A 3WNEA 1VRUA 4JK8A 3DJCA 4BR0A 3V6DA 3KK3A 5AZJA 2OPQA 1REVA 3QEXA 1NGGA 5KPTA 2RN2A 3CD6N 3MDQA 2HHHK 4O8UA 4W5QA 5AZIA 3K5OA 4CZEA 4CFDA 3L0QA 2QXFA 3AVCA 3CM5A 3T1HK 5AQRA 5BR8K 2D0BA 3ZX3A 1ATRA 4BRPA 4JNEA 4JD2A 5EOYA 2FSKA 3QICA 1HQUA 3HXMA 4BE0A 2XY8A 1NJYA 4OLBA 4GNIA 1DTQA 1TKTA 3CERA 5FPDA 3HM9A 1J5EK 3H3OB 1HQEA 3KWIA 1XC3A 3NHGA 2F4VK 1BIZA 3CHWA 4A62A 2XY5A 3E66A 2YKMA 3QFUA 2ZF5O 1WSEA 4HWIA 3DAWA 5SWMA 3OYBA 3A5OC 1VQKN 2V52B 1YIJN 4Q5VA 5KTQA 2NRVA 3C6UA 1NGIA 2JWKA 3O5BA 2D5RA 4B9NA 1ATNA 2FBYA 4H5NA 5E26A 3TANA 3LDPA 3AVKA 3A5NC 1KFDA 1HKCA 1BQNA 1G99A 5HRPA 3DLLL 4PA1A 3FZLA 1LOTB 4NYNA 4CECA 4WCEL 2XO7A 5FDLA 3AO2A 1NBWA 1T6CA 2Q97A 3NFAA 4FLXA 3SV3A 4OPJA 1I94K 2PAVA 4JKDA 4BVPA 2E2PA 3ZT2A 3T1YK 2HHWA 2RHKA 1T6DA 5I9EB 3ULDA 4CEAA 3BEXA 2JGUA 1P8ZA 3BY5A 3QNOA 4CJWA 1V4TA 3IKMA 4FWLA 4CERA 3THYA 5F0XA 1NGDA 1SKSA 1Y97A 1D9FA 4K42A 5KGWA 4FWMA 1VQ9N 4O44A 4QS9A 2DPNA 4BC5A 3ID8A 1S6PA 3C0BA 4B1WB 4Z4GA 1RDAA 3CPWM 4CJQA 1T03A 1LWCA 4BR5A 4CESA 1QZ5A 4CZMA 3HOTA 3O9TA 2B5JA 4QS7A 3O08A 4AHCA 2UUBK 4ISEA 1XI1A 4IZ9A 3OS2A 3THXB 3I8BA 2YCHA 4FWQA 3N4PA 1ZXOA 2VGNA 4EHUA 1DGKN 5CZ2A 2PBDA 4FLZA 3QIPA 2VG6A 4FO0A 1TL3A 1CXQA 4KTQA 3RRGA 3SCXA 3QBXA 1WSGA 3SAFA 4OPAA 4EAHD 4YFUA 3QDKA 4YY3K 3JSMA 3VMFB 1N6QA 2P9LB 4FJLA 1TUYA 1WNSA 1SS6A 4E3SA 3VF6A 4KI4A 1IG8A 2P9PB 2GWKA 3HP9A 1JLCA 5BN9A 4DS5A 4H4MA 1O13A 1NK9A 3DRRA 4WQ5C 2A5XA 4OGEA 4UQGA 3RMAA 1C1CA 1I39A 1JLFA 3ZYYX 4DQQA 1WN7A 4NYFA 4JV5K 3SUOA 4B3SK 4WE1A 2P9SB 3EL2A 4GVEA 3T1AA 3AVJA 3C6AA 1NK0A 1RTDA 4NXMK 3A8YA 4DR4K 4PKHA 3T3FA 5AQWA 4AHSA 3OYGA 3H08A 3FZMA 1IV0A 1ZC6A 2Q0RA 2YNGA 4KAZA 3QFPA 1KC8O 1KD1O 4RW4A 4CJPA 5AQXA 1X3NA 4ZHRA 2E2QA 1A5WA 4O4GA 1MWKA 5EXWA 4KHNA 3I0SA 3IG1A 2O4IA 4G9ZA 4BRGA 4AH9A 1Z25A 4BR7A 4HHTA 3NF6A 5JLFA 4J2AA 2F96A 1D8YA 2QWNA 1VQ4N 2UUCK 2HVHA 4Y1CA 1JCEA 1N33K 1FKPA 4JI1K 2RPIA 3H1VX 4CJFA 3LAKA 2V51B 3SK3A 1ZBIA 2Q1NA 3EKSA 4I6MB 3VESA 3QLHA 3AARA 3AV9A 3RMBA 3HPGA 3KD5E 4LC9B 3L4IA 2VCPA 2VQEK 1M90O 3ALYA 1RBSA 3NF9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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