3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Transferase
molecule keywords Pre mRNA splicing protein
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
5GIOA 3T7ZA 3NVMA 3NMUA 3PLAA 3NVKA 2NNWA 5GIPA 3ID6A 5GINA 4BY9C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9KB 1SL0A 5LL6Z 2WC9A 3H3NO 5J1EA 1SZ2A 5K14A 4LF8K 3ZT4A 1HKBA 5BR9A 4BRNA 4CESA 4MDBA 3F73A 3O4WA 1X9WA 1XUPO 5EY4A 5A2QO 3SUOA 4RG8A 1CZAN 3U6FA 1KVAA 1FJGK 3F9KA 4EFHA 2D0BA 3DI6A 2ZM6K 3WXMB 2FXUA 4H03B 3KLEA 1WAJA 3NH1A 4KB0A 1VQ5N 4NLCA 3PO5A 3EE9A 1DEJA 3HJFA 3VEOA 4FWRA 3ASMA 5GIOA 4B9LA 4WF9L 5C15A 5JVHL 4BE0A 4U7BA 1A5XA 2QI2A 1K73O 2O8FB 4DV0K 3UKUB 3UKRB 2ZJQL 3LAMA 4BRQA 3C95A 1RDDA 3K59A 3QETA 2HF4A 1QVFM 3AAQA 3OW2M 3THYB 5BPLA 3L2WA 4DQSA 2YHYA 1IBMK 2FC0A 3H46O 4IJNA 3DXMB 3CMEN 3P39A 3GOIA 4AM6A 4DTPA 3NAEA 4YFUA 4CF8A 1KAZA 2VCPA 3IRXA 1D8YA 3DLBA 1ZC6A 4BGAA 3OYKA 4JK8A 4CEZA 2JWKA 1E4GT 3QO9A 4JI4K 3QBXA 4FJJA 1ZBSA 2D0OA 5LMUK 2XRIA 2HHUA 3AVHA 1QSSA 2OCEA 1J9AA 3HXMA 4BRCA 3FLCO 3TTFA 4BRFA 4F2SA 1LWFA 3MN9A 2CH6A 2ZQBA 3LDPA 2PZSA 3P83D 3ZETB 2YKMA 1ZBIA 1HNZK 1NKBA 4FLYA 1LWCA 3K2PA 3VQ5A 4BQLA 4H4OA 3RMBA 4CJPA 3DRRA 4ZHRA 5HRPA 4JI2K 3G4SN 2Q2RA 5FLXO 1RTJA 2KZZA 5AFUA 1XC9A 4ZTFA 4QAGA 4IFEA 2O8BA 3HP6A 1S1XA 2NZTA 4OGCA 3AO3A 2CGKA 4BR9A 1JLFA 4IG3A 2O8CB 5AQQA 4CERA 4CHOA 3AO1A 1WSJA 5FRNA 3HO1A 3CPWM 3NF9A 1JCEA 3MN6A 3VQQA 4A2AA 1TYQA 1K8KA 4N5SA 1Y97A 3O4QA 4QS8A 1D9FA 4FJ8A 4PHTX 2W6LA 4KFBA 3VQ4A 1TKZA 3EYZA 3RSEA 4FO0A 1ZBLA 1YTUA 5DK5A 3IFRA 2OPSA 3CIPA 4M7XA 3MCAB 4AF1A 4CJ4A 4CK3A 3P1GA 1CZBA 4R5PA 2RPIA 3ZCMA 3WXKA 1HRHA 3HPOA 2EX3A 4HTLA 4BQZA 4FLTA 3OYJA 1HYZA 2NRWA 3SMSA 5BN9A 4BRDA 1BOTO 1QQMA 2IOCA 5F1XA 1GLAG 1KXPA 3CXCM 2V7YA 2P9UB 1X9SA 1LWEA 3C6UA 4FWPA 4JD2A 1MWMA 2HHWA 3RR7A 2HMPA 2ZJPL 1JCFA 1B9FA 3VGMA 1NMDA 1HR0K 4K43A 4HCBA 3NH2A 3TAPA 1M1KO 1VSMA 2OPQA 3AVAA 4I9LA 2E1YA 4HVJA 3R1XA 4B08A 1VQ8N 3A8YA 4DF8A 4FWQA 3GL1A 3CJ1A 3LL3A 1BU6O 2G8VA 1GLFO 4BG8A 3AAPA 3TR8A 1CZ9A 2KFNA 4JI5K 3L8BA 4FZXC 3AVCA 5SWMA 4E1JA 2J4RA 3OYMA 2OYQA 3M1FA 2O8DA 3RMCA 4BRLA 2QK9A 5AQJA 3AVKA 4BR4A 3EY1A 4B9QA 1HJOA 3VMFB 1VQLN 4Y1DA 2A40A 3MWTA 3NFAA 4F9OA 3CJBA 3M3ZA 3ULDA 3M8PA 4CF2A 3PX6A 1U2VA 4BRPA 2P1JA 2KKZA 4O55A 1LAWA 2I7PA 3ALYA 4AHRA 4DR5K 3IUCA 2NRHA 3QERA 4B1YB 5J2NA 4FJMA 1BCOA 4QS9A 3DLGA 4NO7A 5BRHA 1U4BA 4GW6A 1DTQA 3DLEA 3H1VX 1L3SA 4M3YA 3QEIA 3K57A 3CG7A 1FKPA 3CFOA 4E7IA 4RWTA 1WSGA 4M3XA 4JS5A 5I9EB 4K41A 3AVMA 3VPZA 4FVUA 2WOMA 3UE5A 3OYEA 4DV7K 3V9ZA 1T6DA 2O8EB 4DV4K 3NCIA 3SMPA 1BQMA 1OVQA 1REVA 1C0MA 1HQUA 3AVGA 4KH5A 3TTDA 3K58A 2UXCK 1N33K 2CGLA 3AVNA 1BO5O 3SUNA 4FJHA 3OYGA 1HJRA 2OZMA 3M8QA 4K8ZA 2YKNA 5EOYA 3SJJA 3K9JA 4FL9A 1NGFA 3P31A 4ELUA 4BC3A 4BRMA 4JV5K 1Y64A 4EZ9A 1RDUA 3FZLA 3TU5A 1GOAA 4IWVA 3CJ7A 2P9NA 4F3TA 3AVBA 4B9MA 1LW0A 5M1OA 1QS4A 2A42A 1BDGA 4CEOA 4CBWA 1IH7A 2ASOA 4JK9A 4OO1J 3QFPA 3U3YA 5KPTA 3D6RA 2V7ZA 4DSJA 3S41A 4DV6K 3HM8A 5AQWA 4Z4HA 1HLUA 4Q0BA 4IEEA 2DFHA 5FPEA 3QICA 4GKKK 4KREA 4B9NA 4J2EA 3C6HA 3ATUA 3C6AA 4C8NA 2GUIA 5FROA 2Q3SA 2UU9K 3KD5E 4CFDA 1YVNA 3MECA 1RNHA 1R59O 4AHTA 2GWJA 4FSVA 4CZHA 5C42A 1K9MO 1Z25A 1S6QA 2GX9A 2QWLA 4E7LA 5KRTA 3I8BA 3U3GA 1NJYA 3T69A 4PQUA 4LF9K 3FE1A 5C2FA 4Z4FA 3OYDA 5KPZA 2G8UA 2B6AA 3CC2N 4H0VB 1VSFA 3WXLA 2X78A 3JAMO 2YJEA 2UYTA 3ZLJA 3O9TA 4JKDA 3LDNA 4FLWA 3MEEA 4KRFA 2JGUA 3FFKB 1OH7A 4L8RB 4C8OA 3KTQA 2O8EA 4AILC 4LC9B 2HHTA 2VWBA 2QXFA 4CJQA 4M3WA 1W2BM 2E8AA 1Z05A 3MXMA 5HL7L 3WXIA 3BGRA 1RTHA 4Z94A 3QEVA 4BRHA 1ZXOA 2NLXA 4B9VA 2P9LA 3THXB 5C0YA 1OH6A 3DYAA 3MEGA 4MDAA 2P9IB 4KI6A 2DY4A 4DV2K 5HROA 5AQHA 1RBSA 4IO9L 3NBPA 4XH4A 1RT6A 1BUPA 4E3SA 1SKWA 4DV1K 2Z1GA 4FJ9A 4IDHA 1VQPN 4DR6K 3DAWA 2P5OA 4FJGA 3TAMA 1T7PA 3ZSZA 1NGBA 3LM9A 5AQXA 4FK2A 1NK6A 4B1ZA 4CBUA 5CZ2A 4FWOA 2QA4N 4H5WA 4CJTA 3KVGA 3JS6A 3NF6A 3CERA 5AQVA 3AGRA 2AP1A 1SKRA 3L3VA 4W5TA 2KW4A 1NMNA 1XMQK 1HQEA 1YAGA 3NH0A 5CYMA 3LM2A 4C1NK 2IGIA 2F7TA 4OKKA 1ASWA 4JK7A 1W9HA 4JKEA 5AZIB 3SAHA 4FJNA 1QVGM 5E26A 3O1WA 4CZFA 3VGLA 2P9SA 3KIOA 1FK9A 4BRGA 1ZBFA 1K6YA 4Q5VA 3I55N 3L2RA 1G99A 3J8AA 5JMVA 3C65A 3HRGA 4BR0A 4KPYA 1C1BA 4B3RK 4DUYK 1NGHA 4HUFA 4DUZK 4WQ5A 3CJ9A 1WOQA 4FM2A 1IKXA 4CGFA 4DQRA 3SZ2A 1FXXA 4FXDA 5AQRA 1YJWN 3O3HA 2CH5A 2GEMA 4IDKA 4FLXA 5HOOA 4FJKA 1X3NA 4YOTA 5AJ3K 1M90O 1VQ7N 3VOVA 5AQNA 4E19A 2QWPA 5TKWA 4PA1A 2G8FA 3B6OA 2B5JA 1R0AA 4CJKA 3AA5X 2ZWHA 5CE3A 4U67L 3J81O 2E1ZA 5LMNK 4JI8K 3SQ4A 1RBTA 2FBVA 1EKEA 3A5NC 4CEAA 3ZSWA 4XIUA 3SPZA 3OYLA 3H1QA 3GDQA 4UQGA 1BL3A 3BF1A 4JLHA 4BDZA 3CD6N 1VK0A 3CF5L 2ASMA 3CC4N 1S5JA 4I9QA 3RTVA 2I7NA 3AGKA 3HSCA 4EHTA 1MU2A 4FWLA 3TAQA 1RT2A 1IKYA 5BR8K 3W3DA 2IIRA 2KLAA 4LY7A 3ENOA 3U9DA 4OGEA 3ATVA 2FF6A 1TL1A 1VHXA 1RTDA 3DOKA 4IKFA 4JI6K 3QNOA 2Q31A 3E66A 3OS2A 3O6WA 1TVRA 4MLEA 3JSMA 1W7AA 3P4IA 1N34K 1VSHA 2F8SA 3DRSA 4CVNE 4IJAA 2D1KA 1T44A 4DS5A 1ZBUA 3RRGA 3WNFA 4I6MA 4KHSA 2G8WA 4CEQA 1LAVA 2ITGA 3DLHA 4FJXA 5FDLA 5HBMA 4JI0K 3QEWA 2QM1A 5LY3A 3L6QA 3T1HK 2YV0X 4RW4A 4JYAK 1XHZA 1J5OA 1KD1O 1TK0A 4K8XA 2OA8A 3VF2A 2QTDA 4NYFA 2FSKA 4O0IA 3TAEA 2QKKA 2FSNA 3AY9A 2GWKA 3ZETA 1U47A 4RW8A 2YHBA 3RR8A 3QEXA 4EHUA 1JLBA 4FZZA 2IVNA 3QDKA 4A2BA 4CGJA 4XH5A 3KJVA 2HHHK 4B3OA 4DU3A 1I39A 4ISGA 5BPMA 4HTUA 4CCHA 3OY9A 3O9QA 1IBKK 1VSDA 4CW7B 1CLQA 1RDAA 3G25A 2GBZA 3THWB 3AA4A 3KWIA 3FGUA 3LDQA 4FYDA 1RDCA 1ITGA 1GLDG 4EZ6A 4GV6A 5HLFA 1DTTA 5JLFA 3BF3A 1NLVA 4YORA 1JJ2M 2HSTA 3R8EA 4BRAA 1HNXK 1ILYA 4CF9A 3D45A 3JXUA 1L5UA 1NNEA 4C23A 4BC4A 3FR0A 5ELZA 3VQ6A 3AVIA 3O9SA 3CJAA 3LPTA 2DFEA 3RMDA 4CFCA 1BWFO 3U9ZA 1VQKN 3C6TA 3DMJA 1KAXA 2ASPA 3AA3A 4CZKA 4BROA 3FFIA 2A5XA 3TANA 1SKSA 3OTOK 4YDUC 1YT3A 3ZSOA 5LJWA 3J7YP 4NXMK 1WUAA 2P51A 2D4WA 3ENHA 5AQGA 4BC5A 5LJVA 3TI0A 1BIUA 4O0JA 1KLNA 2E4LA 5BREA 1NK5A 3E9PA 3VA3A 1QSLA 3A5MC 2A41A 4DTJA 1RFQA 1BA0A 2JWLA 4JHDA 1Q9XA 4OLBA 3MEDA 4QCLA 3CMAN 1BISA 1Q8IA 3KHYA 4CJ7A 2OTLN 2QWMA 1BGXT 1BA1A 3QBWA 1GLCG 3CC7N 2FLOA 2QWNA 1L3VA 1YVUA 3CPEA 3M6GA 3RSEB 2UUBK 2HBLA 1OKJA 4B3SK 1JXEA 2WFBA 1C0GA 2H3GX 3EKUA 4CIFA 4DFKA 2W42A 1EP4A 4H5TA 4YNQA 3EO3A 3PY8A 4ELVA 2E6LA 4AH9A 3PSFA 4YOYA 1T6CA 1H1VA 4PKIA 4CZIA 5C12A 4CEFA 3T1YK 3TABA 1IO2A 2YHWA 1I3AA 1U45A 1KAYA 4CI6A 1QQCA 1VSLA 4X65K 3LWLA 4O8KA 1EWQA 4K0KK 3V6DA 2IDOA 5JS2A 1TUYA 2KZMA 4H0XB 2X6NA 1BQNA 5AQFA 5AQYA 4KO0A 1KQSM 3THWA 3A2FA 4WCEL 1TKXA 5DM6L 3QEPA 4GNIA 3BDPA 3VEVA 4B1VA 1J54A 2WTUA 4N41A 4G1QA 3EZ5A 4CHYA 4DTNA 3SV4A 2UUAK 3D0PA 2AA4A 3KK2A 3ID6A 3OYHA 1ATRA 5AZJA 3T1AA 1RT1A 5SZTA 3D7EO 3O3FA 4CGHA 1N32K 2NUBA 3TWHA 1GLJO 4WQ4C 1RDWX 1Q9YA 1TGOA 3CCJN 4NXNK 3RRHA 4IEIA 2YCHA 1UA1A 2ITMA 3CFPA 4JS4A 1ATSA 3CCSN 1IG8A 5I3UA 2E2NA 4PL8A 2NRRA 4KAZA 3FZMA 3ZSYA 2PY5A 2D0CA 4N76A 1VQ6N 1DKGD 1OH5A 1NJWA 4DSKA 1JL2A 4I6MB 1W0HA 5AQUA 4M42A 4KH4A 2E2PA 1WSIA 2VG5A 3V9UA 3L0QA 1CXQA 4MO5A 5KPRA 1TK5A 4O5FA 3QB0A 3DXMA 4J2AA 2W6KA 2X74A 2ZF5O 1LOTB 4JI1K 3CCVN 4DV3K 3RWUA 1JLGA 3A5LC 4FPAA 4LF6K 3GBTA 5FPNA 2EWSA 1QSYA 4RW9A 3CCQN 4EP5A 5M1KA 3HPHA 3UKUA 3U8XA 3VEXA 1WSFA 2E2OA 5FRMA 3I56N 3I8DA 4FLUA 2YNIA 4XEIA 1WSEA 3SJHA 4OPHA 3KLFA 3O9UA 2HW3A 1QQOA 5GINA 4N56A 2VGMA 4TSXA 3ZT2A 2EHGA 3EZWA 3K9KA 4DR1K 4KHQA 3TAFA 4DQPA 4IBNA 2BH1A 5IT9O 4H8KA 1EQYA 4JHDB 4DTSA 1Q82O 2BE2A 4E7HA 3THVA 4H0OA 4DWIA 2GV9A 1SQKA 4CIEA 5AQMA 1NBWA 4DB3A 4ZTJA 1DGKN 2FBXA 4IFVA 2UUCK 3AVLA 4LF7K 3TARA 4QOZB 3VESA 3N4QA 1RT3A 4E89A 3V1RA 3S3MA 4MO4A 2PYLA 2LSNA 3L3UA 5AQOA 5MLCQ 1XNRK 4OPJA 3BEXA 3HI0A 3WEEA 3OVNA 5AFUH 3QLHA 1FKOA 1BI4A 3ZX2A 5CR4A 4O4GA 4CHPA 4V19S 1B92A 1UOCA 4B8CA 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1NGGA 3D2FB 3H45C 3OHRA 1NGJA 3MCPA 4FZYA 4FWKA 3LPUA 1Q86O 1V4TA 1J6ZA 4CHZA 5DMRA 3MDQA 3P38A 3ISNC 3R3LA 3SUQA 4DTRA 5JLHA 1VSIA 1TV6A 4AQYK 3SQ2A 3SNNA 4YHHK 1S1UA 3VF6A 3CCMN 3HT3A 1NOYA 1ASVA 5GAGP 3LDOA 2P9NB 2HF3A 3ZSVA 1NK7A 3T19A 1B9DA 4FJIA 4GKJK 2IAJA 1KCFA 4CZJA 4IO8A 4LF4K 4KH6A 3PX0A 2P9SB 2FBTA 3DRPA 3HP9A 5HRNA 3QIOA 3MXJA 2UXDK 2E88A 2E2QA 4FOIA 3F2KA 3VQEA 5EVZA 3C0BA 5M1QA 3EE8A 4BR7A 1K8AO 4B8AB 3TSUA 2G8KA 3IMXA 4CD1A 3CQ8A 1QZ6A 3ZT1A 3PSIA 3L2UA 3E9LA 3PUFA 4JI7K 4H4MA 4BWJA 2QEXN 3HPGA 2ZE2A 5BRDA 1DLOA 1KFSA 4LF5K 4Z4IA 1A5VA 2NRZA 3O80A 5KTQA 2BGGA 2HB5A 2FBYA 4DQQA 4BRKA 2XY8A 1WN7A 5DM7L 2VQEK 1S9GA 1P90A 2DPNA 3M8SA 3OYIA 1X9MA 4L3QA 2VYPA 3I33A 1RGIA 3KLIA 4BVOA 5EU7A 2NRXA 1KRPA 2D0AA 3SLCA 4O5BA 4Z0UA 3L4QA 1RBUA 4E7KA 3O9RA 3KKRA 2GUPA 5E84A 1GLEG 2JLEA 5KI6A 4CE9A 4DU1A 3LDSA 1WLJA 1Q81O 2P9IA 3IDHA 4BE1A 1EWRA 3VQ9A 1GLLO 2P9LB 3THXA 3OYFA 2HBKA 1SL2A 1IKWA 3AVJA 4MQ3A 4BACA 5KQDA 3LAKA 3DWLA 3SAFA 4FCYA 3V9XA 5KGXA 1JLAA 1SS6A 4DSEA 2YNFA 4CF1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GIO A;  3T7Z A;  3NVM A;  3NMU A;  3PLA A;  3NVK A;  2NNW A;  5GIP A;  3ID6 A;  5GIN A;  4BY9 C; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P9K B;  1SL0 A;  5LL6 Z;  2WC9 A;  3H3N O;  5J1E A;  1SZ2 A;  5K14 A;  4LF8 K;  3ZT4 A;  1HKB A;  5BR9 A;  4BRN A;  4CES A;  4MDB A;  3F73 A;  3O4W A;  1X9W A;  1XUP O;  5EY4 A;  5A2Q O;  3SUO A;  4RG8 A;  1CZA N;  3U6F A;  1KVA A;  1FJG K;  3F9K A;  4EFH A;  2D0B A;  3DI6 A;  2ZM6 K;  3WXM B;  2FXU A;  4H03 B;  3KLE A;  1WAJ A;  3NH1 A;  4KB0 A;  1VQ5 N;  4NLC A;  3PO5 A;  3EE9 A;  1DEJ A;  3HJF A;  3VEO A;  4FWR A;  3ASM A;  5GIO A;  4B9L A;  4WF9 L;  5C15 A;  5JVH L;  4BE0 A;  4U7B A;  1A5X A;  2QI2 A;  1K73 O;  2O8F B;  4DV0 K;  3UKU B;  3UKR B;  2ZJQ L;  3LAM A;  4BRQ A;  3C95 A;  1RDD A;  3K59 A;  3QET A;  2HF4 A;  1QVF M;  3AAQ A;  3OW2 M;  3THY B;  5BPL A;  3L2W A;  4DQS A;  2YHY A;  1IBM K;  2FC0 A;  3H46 O;  4IJN A;  3DXM B;  3CME N;  3P39 A;  3GOI A;  4AM6 A;  4DTP A;  3NAE A;  4YFU A;  4CF8 A;  1KAZ A;  2VCP A;  3IRX A;  1D8Y A;  3DLB A;  1ZC6 A;  4BGA A;  3OYK A;  4JK8 A;  4CEZ A;  2JWK A;  1E4G T;  3QO9 A;  4JI4 K;  3QBX A;  4FJJ A;  1ZBS A;  2D0O A;  5LMU K;  2XRI A;  2HHU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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