3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Pre mRNA splicing protein
publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Transferase
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
5GIPA 5GINA 3NVMA 3ID6A 2NNWA 5GIOA 3NVKA 3NMUA 3T7ZA 4BY9C 3PLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T6DA 4GNIA 4JKFA 5AQFA 5FPEA 4DTPA 4QS9A 5A2QO 4QAGA 4CEQA 2RF2A 3H6EA 4JI3K 5KRSA 3ULEB 3KLEA 3FR0A 2UXBK 3MX5A 4HUEA 4JS5A 4FWSA 2FC0A 1MWKA 3DRSA 3QEVA 2GBZA 3CF5L 1X9WA 3WNFA 1KAXA 4PA1A 4KO0A 1RDDA 4HUGA 2KLAA 5CYMA 3S9HA 3SK3A 4O55A 1JL2A 1A5VA 4DLEA 3AVBA 4O44A 2JLEA 4IFVA 1TUYA 5AQKA 3VQ8A 1NMNA 3V1OA 4HUFA 4F8RA 4HCBA 2PY5A 4FL9A 3F73A 3KK2A 3OYCA 4FCYA 1Q18A 4FSVA 4M42A 1KC8O 4ILGB 5FPDA 1XQSC 3H1QA 4IWVA 4ELTA 3O9UA 4H0XB 2FF6A 4CGGA 4DR1K 3LDPA 1X3MA 1B9DA 2DFHA 3FZFA 4AHSA 4QCLA 3QEPA 4B9SA 3QICA 4DTRA 5EVZA 5KQDA 1SV5A 4B9LA 2OANA 3OY9A 1Q86O 4FJKA 1I3AA 2IDOA 2P51A 1EWQA 1QE1A 1VSKA 2CGJA 3DI6A 2FLOA 5AZIA 4B1WB 4DB3A 3I0RA 3CFPA 4PY5A 3VEZA 1S6QA 5I9EB 4FLTA 2DPNA 1IG8A 3PY8A 3EZ5A 1OH7A 4UQGA 3H08A 4CF9A 3NGIA 4H03B 4DV4K 4JI4K 5BREA 4BY9C 1XMOK 4FJ5A 2HNDA 2HHXA 4F2RA 3IDHA 1QQCA 5EX5A 4FOEA 5CY4A 4CK2A 4DSJA 4E1MA 1FKOA 4A2BA 3WXLA 3LP2A 3AA2A 3TR8A 2ZQBA 1VQNN 3VQPA 4BREA 5J2MA 4AHVA 2NRWA 5J2QA 2IGIA 3NFAA 4ELVA 2A6AA 2IS3A 1ZXOA 3AGRA 2YHXA 4BR5A 3MXMA 3VQAA 3DRRA 5B8HA 5GADP 3D2EA 1OH6A 1IKYA 3L4IA 1HKCA 4FJGA 4AILC 4AHUA 4ISGA 2G8KA 4BR0A 5T7BA 5AQLA 2AP1A 3J81O 3SUNA 3T1HK 4LD0A 3THWB 3CJAA 3KLIA 2PBDA 4M3TA 1Z26A 5AQHA 4YORA 1NK0A 4O0IA 1HNZK 3CQXA 4A59A 4DU4A 3ZSYA 2UYTA 4IOXA 4CZLA 3WNGA 4J2DA 3DXMA 2W41A 4CGIA 2UXDK 3MEGA 4CK3A 4JKGA 4OLAA 2UUCK 4BRIA 4DV1K 3OYLA 2GTDA 3AY9A 3VOVA 1I39A 2HHSA 1RCHA 4CHOA 1D9FA 2A3ZA 5AZIB 2A1RA 4MLHA 4BRCA 1S1VA 1NJZA 2G8HA 2A40A 2F9WA 4ISFA 3C6UA 4NCBA 2I7PA 1IKWA 3HPHA 4KH4A 4CECA 4F3OA 1RFQA 4IO8A 3MXJA 5F1XA 1WBBA 4GVMA 5IWAK 3SAFA 3AA3A 2UU9K 4LF7K 2GUPA 2E8AA 3P4IA 3KK1A 5CHIA 5BPMA 3LALA 3HOTA 3SAGA 4DV7K 2D0OA 3GBTA 4M3UA 4BR7A 3HXMA 3LDSA 3CC7N 1JLAA 1XWLA 4DR6K 3VEVA 2F4VK 2VWKA 3RMBA 3D2EB 2Y1IA 2IVPA 3EEQA 4X64K 3U9DA 1HR0K 1TK5A 4DTJA 2NRTA 3RR7A 4JK8A 4FLUA 2QK9A 1K73O 2G8WA 2A41A 3W0LA 3P39A 4DV6K 3DLKA 3DM2A 2E6MA 1NJYA 1U48A 1BU6O 1X9MA 4BDYA 4B3SK 4DUYK 1VSDA 3DXMB 4DTNA 1Q82O 4FW2A 2FBVA 4JKGB 4AF1A 2DTUA 4Z4EA 1XNRK 1HJRA 2VQEK 4B8CA 3SCXA 3ZT2A 1CZAN 4DUZK 3EN9A 3CCMN 4PKHA 2HHQA 5FLXO 3AO5A 4A2AA 4BDZA 3AVGA 3DAWA 4N47A 4LF6K 1C0UA 1X3NA 4H5RA 4CZEA 1RBTA 4Q5VA 3IKMA 4DKWA 4IKFA 3LDNA 1YTUA 3ZSVA 3QNOA 1ASVA 3VQ5A 4X66K 5AQUA 2V52B 3HM9A 5TKWA 4CHQA 3OYEA 5MLCQ 4XH5A 4XH1A 4WFBL 4CJRA 4YNQA 3V1QA 3QETA 1QQNA 4DS5A 3O9RA 3UKRB 2XHBA 4BC4A 4C8LA 3QEIA 3J8AA 3PO4A 2FSNA 4O4GA 3NF7A 1P8ZA 1EXQA 1NK7A 3AV9A 3AVMA 4C8NA 2Z1IA 4CF0A 1HUXA 3SBGA 1ATRA 3WUHA 4CEDA 4J8FA 1XUPO 3NDKA 3HP9A 5E26A 4GV9A 2B4JA 1TK8A 4H0YB 3EKUA 3HT3A 1WSEA 5KGWA 5HRRA 5EU7A 3MN9A 1NG9A 2ITMA 5AQXA 1HNWK 4JS4A 4M63C 5I3UA 1TK0A 2LSNA 3VEYA 3SMSA 3HM8A 1EX4A 3LDLA 3MWPA 4Z4CA 1BQMA 2NUBA 4DQPA 1Q8IA 4E3SA 2OA8A 1T03A 4FM0A 3QEXA 1S9GA 3O80A 1YVUA 4FO0A 3CETA 1KCFA 4YOUA 2FF3B 4WFNL 3DLLL 4J2BA 3DXKA 4HTLA 4AM7A 3VF6A 1NJIO 4IOAL 4CERA 1NGHA 3I56N 1M90O 2OPSA 3HL8A 3C65A 3CC2N 2VWBA 2E20A 4F3TA 4ZHRA 3SPZA 1J54A 3U3YA 1HKGA 4JKEA 1S22A 1VSEA 3NCIA 2WFBA 4B3OA 1VQ8N 4JI5K 1NKBA 3HZ6A 4IDKA 3CCVN 4CESA 4OKKA 3NGYA 3SQ0A 3T1AA 3MN5A 3AO4A 2Y1JA 4DSEA 2PAVA 1XHXA 1NKEA 4CIEA 1DGKN 4WQ5A 4WE1A 3TPQA 1QSYA 1SKSA 1CZ9A 1S1XA 4FJ8A 1Q9YA 2QKBA 2VQFK 4DWIA 3DRPA 1GLAG 3DLBA 4DSKA 2P9PB 4DR2K 4OLBA 2ASOA 4E7HA 3ZCMA 2Z1JA 3O4WA 1J5OA 2IIRA 1L3VA 4B1XB 4BC5A 3V9SA 4DG1A 5I42A 4YOYA 2G8IA 3G6EN 1S6PA 5AFUH 2UUAK 2GEMA 4DQSA 2A5XA 1HPMA 1HNXK 4IOCL 4Z0UA 1S9EA 1KTQA 4JKAA 4M3YA 2F7TA 4LF8K 1N33K 2V7YA 1T05A 3DXKB 4NCGA 1ASWA 4E7JA 3HYFA 1RDUA 2E1YA 3FZHA 3IRXA 3K58A 4BDPA 5M1OA 1NK9A 1GLFO 1HX1A 2Q0RA 3K0SA 3CMAN 5H1SQ 4A5AA 3KD5E 4C23A 5KTQA 1LWCA 3QESA 3JXUA 1NJXA 3RRGA 4CZIA 3VMFB 4JKCA 3HTVA 5FDLA 3IMXA 4YHHK 1MA9B 3ENBA 3AA5X 1TKXA 3FFIA 1TV6A 3O9SA 4AHRA 3H46O 4BR4A 5SZTA 3HOSA 4MDBA 4FOIA 3TAGA 5FRMA 5AQGA 3C6AA 2KZMA 3R8EA 3L4QA 1DKGD 3ZT0A 3TARA 1XC9A 3VQ7A 3ZX0A 3D0PA 3U3GA 2EWSA 1B92A 3TAFA 1YUWA 5FROA 4FWQA 4RWTA 2O8BA 5LY3A 3M5RA 4LC9B 2HVHA 3T69A 1QTMA 4M3ZA 2GELA 3CERA 3KLHA 4AQYK 1B9FA 3U8XA 3EZWA 3VA3A 3M8RA 1LOTB 2O4GA 3BP8A 3U4LA 1XI1A 3FFKB 4B9NA 2KW4A 3IG1A 3ITHA 4CJPA 3HBTA 2A1SA 3TSUA 5ADXH 3GE1A 3LP0A 2FXUA 4CEFA 3G71N 5KI6A 4BE0A 1UOCA 1RBVA 2BDPA 3MMVA 3LZJA 3DOLA 1BIZA 3KLGA 3HRGA 3LL3A 1HYZA 4N41A 3RSEA 3QERA 3B6PA 5GAHP 1WB9A 1WSIA 5LL6Z 2J4RA 4B9VA 3VEXA 1ZBLA 3QFPA 4LFBK 2P9UA 4BWMA 4MO5A 3F5TA 3LZIA 4M41A 3E01A 3UE5A 1XNQK 1Q7YO 2IOCA 2CGKA 3UKUA 1L3TA 1BQNA 1RNHA 3BUZB 4H5TA 3VEOA 1HNVA 4PKGA 4BRNA 2JWKA 3L2QA 4H5NA 3O1WA 2AJQA 1SKWA 3S41A 4YDUA 3SQ2A 3LP1A 3BZCA 5BPNA 3CM5A 3E1YA 1S1TA 3TANA 2ZJRL 1N36K 4JI1K 2YNHA 4C1NK 1JLBA 2O8BB 2NRZA 4WF9L 3O8MA 4BR9A 3PX6A 2HHWA 3AVJA 3CD6N 4ILJA 4KB1A 1UWBA 1CZBA 3CCSN 3V4IA 1RDCA 4DQ8A 3AO2A 1G15A 3R3LA 1W9HA 4EP5A 4FVMA 1LAVA 4DHYA 4DFMA 4FJHA 4C1NI 5CYQA 1ZBFA 2YX6A 3OBWA 4HCCA 3G10A 4DTUA 3ZX3A 4K8ZA 3Q7BA 4FWMA 4B8AB 2DY4A 3LAMA 3RSEB 2X74A 1E3MA 3SV3A 2P9UB 1NWKA 3L2VA 3SUPA 4RW6A 3SLCA 4FK0A 3QO9A 3UKUB 3THWA 3CQ8A 4OKEA 4CJUA 3PIOL 5AQPA 4CJ7A 3EY1A 5HOOA 1VAZA 3SYZA 4FM2A 3MN6A 2Q97A 3ZX2A 3BEXA 2O8EA 3OYMA 3KK3A 4E1NA 4GW6A 3FZKA 1ITGA 4FJJA 3O6WA 1KFSA 1RT4A 4CZHA 3LWMA 3UB5A 3N4PA 3LWLA 4FLZA 1NK5A 4FWNA 1U04A 4KTWA 4H0OA 1ZBHA 2B5JA 2Z1GA 3ZYYX 3M6GA 3VENA 3OYGA 4KTQA 5TKYA 2VGNA 2E4LA 3OW2M 1L3SA 3MN7A 2IAJA 3RWUA 4Z4GA 4MQ3A 1JLQA 1VSMA 1BA1A 3PSFA 4M3RA 4H0VB 3P83D 2D0PA 3TSQA 5J2PA 3AVIA 4EFHA 3HK2A 4MLEA 2NRXA 5KPRA 1ZBUA 4HTUA 1D8YA 2Q0UA 2IVOA 2HNYA 3TAPA 3SUOA 4K42A 2Q3SA 4FJMA 3SZ2A 1Z6RA 2EX3A 4J2AA 1VQ5N 1NGAA 2P5GA 2VCPA 2W6KA 2P9LA 3H3OB 3IS9A 5GAGP 3THYA 2ASPA 3P38A 4KTZA 4Y0WA 3KIOA 4JI2K 1NOZA 2HBLA 1UA1A 2KHOA 1H1VA 1JCEA 4BVPA 4JHDA 2YKMA 3E9LA 2O8EB 1KRPA 2VG6A 3ZSQA 4LF5K 4CJTA 4M7XA 2P9KA 4AHTA 2YNIA 2X78A 1YITN 3AAPA 4E7IA 3VQ6A 1QHAA 3EE8A 3OHRA 2Q31A 3PX0A 4BRMA 2QWOA 3LANA 2D0AA 2YNFA 4EHTA 3T3FA 4BRHA 4B3TK 1QHTA 4NO7A 2BE2A 3HVTA 2VYPA 3F2KA 2A42A 2R7YA 4CZFA 5BN8A 3RTVA 4WQ5C 4CJWA 3CCEN 1NJWA 4W5NA 4I2QA 4FK2A 3EKSA 3E9OA 2UUBK 3K2PA 4WYBA 1T7PA 1IH7A 2DFEA 1K9MO 1YIJN 2QWPA 2F9TA 4DTMA 1LWEA 3GL1A 5BRHA 1LCUA 3MWTA 3ZSWA 4FWRA 5JMVA 3UKRA 2NZTA 5FRNA 5CZ1A 3MDQA 5GINA 3CCUN 4DR7K 1C0FA 4OX9K 4JNEA 3O1BA 4O5BA 4RW4A 2CH5A 4FWPA 3MEEA 3WXIA 3QLHA 3KD1E 2QWNA 4CJ4A 2P9LB 3THYB 4CGDA 4CFAA 3I0SA 3TTCA 3KKSA 3V6DA 4JN4A 3AVLA 4FPBA 3E66A 3TI0A 2F96A 4GY2B 4F4KA 1VSIA 3HVRA 3RMDA 4JHDB 2IVNA 4PHTX 3KTQA 3CIPA 4J2EA 4GV6A 3O3GA 3LM9A 3CCLN 3OYAA 1WUAA 2E5LK 4H0TB 3ATVA 3OYDA 1BWFO 2P9KB 3NE6A 1RTIA 3C95A 1HPZA 2ZWHA 3HI0A 4W5QA 2QWQA 1M1KO 4DTSA 1JJ2M 3V9ZA 3O5BA 1T3VA 1GLLO 3KVGA 3DJCA 2QM1A 3VPZA 3J7YP 1RGIA 5AQSA 3WQUA 1NGFA 2HHVA 2F8TA 5DMRA 1RBRA 4XIUA 1VQ6N 4LF4K 1NM1A 4BROA 3H45C 3QFUA 2BUPA 1HJOA 4CFDA 1TKZA 4OGEA 2YHYA 1NGCA 4AH9A 4CEZA 2X6SA 1U45A 4YY3K 3KLFA 2ZE2A 4KAZA 2P9SA 1BA0A 3ZETA 3BGRA 2OTLN 1QVGM 1QQOA 1SL2A 1OH8A 2VGMA 4DSIA 3ZT1A 3A2FA 3TABA 1J9AA 3SMPA 2FSJA 4CGFA 3WEEB 1NGEA 4IZ9A 3QEWA 1T6CA 1NK4A 4FJLA 4RW9A 3QBXA 4NYFA 1U49A 1OH5A 1EWRA 4IO9L 3SJJA 4ID1A 2YV0X 3AARA 4ISEA 1WSFA 4RCHA 1RT5A 3THXA 4IXCA 1JL1A 4LY7A 2RE2A 1WN7A 3O3HA 3ZSRA 4HVJA 3ULDA 5BR8K 3HJFA 2E2PA 3VERA 1NK6A 1NBWA 2VG7A 1JLFA 4BQLA 4CE9A 3EL2A 4A61A 5AQRA 3HPGA 3VF4A 1OVQA 3VTIA 5FPMA 4IFEA 1RILA 3R6MA 3CG7A 3WT0A 2P9PA 4E1JA 4DSFA 1TYQA 1I94K 1HMVA 2WONA 1JLEA 2ASMA 3NVMA 2FBTA 5C15A 2OYQA 1VQLN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GIP A;  5GIN A;  3NVM A;  3ID6 A;  2NNW A;  5GIO A;  3NVK A;  3NMU A;  3T7Z A;  4BY9 C;  3PLA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T6D A;  4GNI A;  4JKF A;  5AQF A;  5FPE A;  4DTP A;  4QS9 A;  5A2Q O;  4QAG A;  4CEQ A;  2RF2 A;  3H6E A;  4JI3 K;  5KRS A;  3ULE B;  3KLE A;  3FR0 A;  2UXB K;  3MX5 A;  4HUE A;  4JS5 A;  4FWS A;  2FC0 A;  1MWK A;  3DRS A;  3QEV A;  2GBZ A;  3CF5 L;  1X9W A;  3WNF A;  1KAX A;  4PA1 A;  4KO0 A;  1RDD A;  4HUG A;  2KLA A;  5CYM A;  3S9H A;  3SK3 A;  4O55 A;  1JL2 A;  1A5V A;  4DLE A;  3AVB A;  4O44 A;  2JLE A;  4IFV A;  1TUY A;  5AQK A;  3VQ8 A;  1NMN A;  3V1O A;  4HUF A;  4F8R A;  4HCB A;  2PY5 A;  4FL9 A;  3F73 A;  3KK2 A;  3OYC A;  4FCY A;  1Q18 A;  4FSV A;  4M42 A;  1KC8 O;  4ILG B;  5FPD A;  1XQS C;  3H1Q A;  4IWV A;  4ELT A;  3O9U A;  4H0X B;  2FF6 A;  4CGG A;  4DR1 K;  3LDP A;  1X3M A;  1B9D A;  2DFH A;  3FZF A;  4AHS A;  4QCL A;  3QEP A;  4B9S A;  3QIC A;  4DTR A;  5EVZ A;  5KQD A;  1SV5 A;  4B9L A;  2OAN A;  3OY9 A;  1Q86 O;  4FJK A;  1I3A A;  2IDO A;  2P51 A;  1EWQ A;  1QE1 A;  1VSK A;  2CGJ A;  3DI6 A;  2FLO A;  5AZI A;  4B1W B;  4DB3 A;  3I0R A;  3CFP A;  4PY5 A;  3VEZ A;  1S6Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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