3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Pre mRNA splicing protein
publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Transferase
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
5GINA 4BY9C 5GIOA 2NNWA 3NVMA 3NVKA 5GIPA 3NMUA 3T7ZA 3ID6A 3PLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PKIA 4JV5K 1JXBA 1U2VA 1VRTA 5GIOA 3HJFA 4FLZA 3SJJA 5FPNA 4Z94A 4JHDB 4W5NA 2HVHA 4PY5A 4RW6A 3FFKB 3AVLA 2EWSA 3VOVA 3SUQA 3PX4A 3O9SA 2RE2A 3DOLA 4FJMA 3V81A 2FSNA 1TYQA 4DQQA 1RTDA 4ILHA 3M8RA 4WCEL 3VEOA 2O8EB 3C65A 2XY5A 1C1AA 1IKWA 2ZJRL 3U6FA 3UE5A 2O8BA 4JK9A 2YHAA 5LJVA 4JI0K 1JCEA 1GLDG 4K25A 2NRRA 3H1VX 1L3VA 2F96A 4PL7A 3NE6A 2VG5A 1U47A 3VGLA 3KKSA 2OPPA 4I6MA 4B08A 1K8KA 1SQKA 3JAMO 4NLCA 3U9ZA 5JICA 3AA3A 1VSLA 4XEIA 4XIUA 3LWLA 1T03A 2NRWA 1VRUA 3AO1A 4M3TA 4JAXA 3GL1A 1IKYA 5CYQA 3AVAA 4AHTA 3HRGA 4HWIA 1NGGA 3G25A 1JCGA 3Q7CA 4BDPA 4J2AA 1IH7A 3MX2A 3SNNA 2Q0UA 1IBLK 2ZD1A 3H08A 3G4SN 4A5BA 1KTQA 3DJCA 4DB3A 5BPNA 2HHQA 3VQ6A 4BG8A 2NRTA 4CFBA 3A8YA 1NGFA 4E7IA 5F0XA 3EZWA 4AQYK 4M3YA 3KD5E 4DTXA 2F9TA 5KPTA 1RBUA 4I7FA 5CZ1A 3O3GA 3THYB 1NWKA 3HI0A 1TYQB 4ELVA 3O3HA 3S3OA 3KHYA 3L6QA 4DQSA 4CF9A 2QWQA 2ZM6K 3LZIA 3JYTA 2UYTA 2KQ2A 2GEMA 4FPBA 4DFKA 1HQEA 4CGFA 4CJUA 3QEXA 3NBPA 3T1AA 1D8YA 1E4GT 4MDBA 3R3LA 4NYNA 1NJXA 3SV3A 1K9MO 2P9IB 2GWJA 4ISEA 3TANA 1K8KB 4YOUA 3SBTA 3TAGA 3RRHA 5CE3A 3FFIA 1X3NA 3A2FA 1ZBUA 4H0VB 1RCHA 5AQTA 1JCFA 3ZSOA 2ZJQL 3A0IX 4CHPA 2Z1JA 3RMAA 1KC8O 2G8UA 4CZMA 3AARA 4BE2A 4Y1DA 3L2WA 3SUNA 2NRZA 5CY4A 5GAEP 4F3OA 1K6YA 3DXKB 2DFFA 4FSVA 4B1VA 4DV1K 4ID5A 3CMAN 4KHYA 4FM2A 2XRIA 4IOCL 3SAFA 1TL1A 2YHXA 4BRCA 3AY9A 4B9TA 1CXUA 4A57A 5HRRA 4YOVA 3K9JA 3SJHA 3NHGA 2NUBA 1P8ZA 4XH5A 3CCVN 1NGJA 2WFBA 4GMJB 3V1OA 4NCBA 3UIQA 1Z26A 2VG6A 4B1ZA 4DV4K 2CGKA 2IS3A 2AP1A 3ULDA 3NH1A 1NBWA 4CGDA 1KVAA 3CQ8A 4HUEA 1CZ9A 1X9MA 4RW8A 1HQUA 3SV4A 4CJLA 1BOTO 3BEXA 1BU6O 3PSIA 3F2KA 2HNYA 3LM9A 1K73O 2ZJPL 4OX9K 4LH5A 4WF9L 4M42A 3ULEB 1UA0A 2OTLN 4NCAA 4YFUA 1RT1A 3L8BA 3HK2A 1S1UA 3G10A 2CH6A 2GUPA 3NMUA 1NJYA 1BL3A 3ID8A 4DLGA 1TKXA 3HM9A 1JL1A 1ASVA 5GAGP 2A1RA 3KK3A 4BR4A 4QS7A 4AHSA 1NKBA 4B9SA 1XMOK 3LANA 5F1XA 4C8MA 1Q82O 4M3RA 4JKDA 4O5FA 2A5XA 3MN7A 4K42A 3A5MC 2VQFK 4CZJA 3CPEA 2PZSA 4F2SA 4LF9K 5FPMA 1BISA 3NDKA 1E4FT 1KAYA 3G0ZA 2HSTA 4NCGA 1W2BM 1Q86O 5B8HA 3LP2A 3CM5A 4FLUA 1L3SA 4EAHD 4CEQA 4CHQA 1QHTA 1YT3A 3V9WA 2RPIA 2G8IA 5D3GA 2IVOA 3I33A 3QFUA 1X1PA 3O4NA 4BR0A 1RTJA 1SZ2A 4IEIA 1RT2A 1HMVA 3V9UA 3CJBA 3O5BA 2F8SA 3ZT0A 3CYMA 1MU2A 4LD0A 4KH6A 1I3AA 1C1BA 4OVLA 4CJQA 2D0BA 2O8DA 3SQ4A 3SCXA 4YOYA 3D45A 2Q31A 2E2QA 3WQUA 4PWDA 4DSFA 3D2EB 3DMJA 1YF5L 3J8AA 5AQFA 1Y97A 2HMPA 2D4WA 1VSEA 3P38A 4ZHRA 3PIPL 4B3TK 3AVHA 4KBOA 4CJ3A 3LDSA 4H8KA 2FF3B 4TSXA 4FWOA 3KWGA 4DR7K 2VG7A 3THVA 4CZLA 1T8EA 2PBDA 2B6AA 3LPTA 3P1GA 3VEXA 1GOCA 2HF3A 1ZBHA 3SPZA 1HYSA 4DUYK 5BN8A 1WBBA 3AVJA 4EZ6A 2DFEA 3PO4A 1TK8A 1VQNN 1WSFA 1IG9A 3CJ1A 2QKBA 4BGBA 3WNEA 4EP5A 3ZT4A 3SMSA 1KXPA 1MDUB 3OYMA 4RW7A 3CHWA 3L4QA 1O1WA 3RMCA 3N4QA 4GVEA 4AHVA 2QXLA 4DU3A 4B3SK 4R5PA 2P5OA 2FLOA 3D2FB 2GTDA 1FK9A 5BRDA 4NO7A 2VCPA 1KLMA 2XHBA 3U4LA 2O4GA 4B3RK 2HMIA 4MFBA 3SK3A 3OY9A 1JLQA 4FCYA 3B6PA 3IS9A 3B6OA 3E9PA 1EQYA 5KGXA 3C94A 3LZJA 3DLHA 3CERA 4BC2A 3LP3A 4J2BA 4X64K 2J4RA 4M3UA 2WUSA 4GV9A 4MDAA 3HPGA 5AQKA 3M8PA 2FBYA 4E1NA 4MO5A 3GE1A 2UUBK 3GOIA 2KKZA 4EHUA 1N36K 3C0BA 3VQ8A 3ITHA 3SUOA 4H03B 5AFUA 4IO9L 3EYZA 2QWOA 3CMEN 4W5OA 2WONA 1W7AA 4WFNL 4B9MA 3VQBA 5HRSA 4BWMA 2UXCK 4BRQA 4JKCA 2FF6A 5AQRA 5EOYA 5AZIA 3SBGA 1RT4A 4BY9C 4B9LA 4OO1J 2Q1NA 3NF9A 2A1SA 3VA0A 3ZSZA 3OYIA 4F8RA 3HVTA 3ZEUA 2XY8A 4X66K 1JL2A 3HPHA 3DWLA 1S1TA 4E7LA 3H45C 5AFUH 2E6LA 3U3YA 4IJNA 3UKUB 4CEAA 4IKFA 2UUCK 1NGEA 1U45A 1DKGD 3K5MA 1FXXA 1LWFA 3LAMA 4CZGA 1BIUA 1NK8A 3B8AX 1KSPA 2E2OA 3QNNA 5EX5A 1BG3A 2YJFA 2ZGZA 3VQCA 4HUGA 5T7BA 4MQ3A 4O5BA 5C10A 3VQPA 2FSKA 4CEBA 2IC3A 1TGOA 1EWRA 3N4PA 4W5TA 1C0MA 5M1PA 3Q7BA 2GUIA 2YV0X 4KKOA 4DV3K 4GKKK 2HW3A 4DS5A 2RF2A 4ELTA 2IGIA 3GDQA 3L2UA 3QDKA 4OKEA 2PAVA 1NK9A 1NGDA 1RILA 4ILJA 4DF4A 4OLBA 4BDYA 1S9GA 2OZMA 5C42A 3OVNA 1J5OA 3OYKA 1EXQA 4H0OA 3CCQN 4DTUA 1LCUA 1D5AA 4M3WA 4KFBA 2Z1HA 5I42A 3CETA 4FLVA 4Y0WA 5AZIB 3ID6A 2HHUA 4C8KA 2O8FA 4KHQA 1ZBFA 3H1QA 4FJKA 1NJIO 3ZEUB 3J80O 1IBKK 3DRPA 4OGCA 1YIJN 3S9HA 4CD3A 2P9UA 1JKHA 2DPNA 5LMUK 1JLGA 4C1NK 4DQIA 1OH7A 4DQPA 1TAQA 5AQMA 3MN9A 3JS6A 4LSNA 1B9FA 4CF2A 1GLEG 4CFDA 5JS1A 1VQLN 4EP4A 3AO3A 4OPHA 2VQEK 3FE1A 3IAYA 3VEYA 4DCHA 2GBZA 4O0JA 4FJ5A 3WXJA 3DM2A 4CJVA 2P9NB 5M1QA 4JKFA 5AR0A 3OYJA 1S72N 2QK9A 2ATQA 1ATRA 2P9PA 1WN7A 4HUFA 3WNFA 4GKJK 2HB5A 3IMXA 4FZYA 3NF8A 3CQYA 1HNIA 4RW4A 2X6NA 3QBXA 1ILYA 3I0RA 3BF1A 4DTOA 1IG8A 3D6RA 4FJ9A 2X78A 4O44A 1XC9A 2E88A 2BTFA 3MXMA 3DLRA 3CFOA 3P39A 4DMNA 3VGKA 4FOEA 2HHVA 4YOTA 4B9NA 1EETA 2DFHA 1VSMA 1YVNA 2YNIA 1RDDA 2Q36A 4BACA 3MK6A 2UU9K 3VTIA 4KTQA 5JMVA 1NGAA 4MLHA 5AQYA 5BPLA 2JLEA 5BR9A 3AGRA 1C6VA 4FWLA 4BRAA 3K5OA 4Z4CA 4DR1K 4CHZA 1E3MA 3H3NO 4L8RB 2P9SB 4DV6K 1BDGA 4DR3K 3L2RA 4LF8K 1BQNA 4ILGB 4IDHA 1QQMA 1RT6A 1NMDA 2RHKA 3HM8A 1EWQA 3GBTA 1TV6A 4Y1CA 3V9ZA 2DY4A 4BC3A 2HF4A 1NNEA 3K0SA 3AVGA 5M1KA 1RDCA 2PY5A 4NXMK 5AQOA 1CZAN 3THXB 2A6AA 2NRXA 3KLFA 3CJ9A 4EZ9A 2IAJA 2V52B 1X3MA 3MN6A 3VQQA 4GV3A 3F5TA 3MN5A 3O08A 4F9OA 4E7JA 2YNHA 1SAZA 1WUAA 2QWRA 4A61A 3L3VA 3PY8A 4GNIA 4BVOA 1V4SA 4WQ5A 5LJWA 4CZIA 4HTLA 4CK3A 1KFDA 3QIOA 4CZFA 1U2VB 2KLAA 3TR8A 2YKNA 4FVUA 2YI1A 4FWNA 5LMNK 2CGJA 3NAEA 1KFSA 2F7TA 4KHPK 5LY3A 2ZQBA 3OYLA 3T1YK 2W41A 5GIPA 4Z0UA 4ZTFA 3KTQA 1RBRA 2YCHA 3DLLL 4B1XB 5CYMA 4KHSA 2HBMA 4R79A 4JI8K 4WE1A 1DT9A 1VAZA 1ZYQA 2ETJA 3L0QA 4YHHK 1TUUA 4KREA 2P1JA 4BRNA 4DQRA 2O8BB 1TUYA 1L3TA 5AQWA 4QCLA 3NGZA 4CK2A 4FJNA 3VF4A 1RT7A 3J7ZO 3O9RA 3NH2A 4NB4A 2Y1JA 1Q9YA 4FPAA 2KHOA 4I6MB 3V1QA 4XH4A 1R0AA 1BUPA 4DTPA 3PLAA 1OH5A 3KVGA 4QAGA 3CCEN 1XNRK 1S3XA 5KI6A 3K59A 3MEGA 4OLAA 1D9FA 4JYAK 3DLKA 4GY2B 4YDUC 4CBXA 2YKMA 3RVCA 2X6SA 3THWA 4AHCA 2IVNA 1QQOA 2Z1GA 4WQ4C 3RR8A 2QI2A 3P4IA 2BH1A 2P51A 4FWMA 2G8WA 3ZT3A 1TKZA 4CEZA 1IBMK 5J2MA 1HNWK 3O9TA 1YTUA 3SQ1A 3DAWA 3IUCA 2YHWA 4M7YA 3WXKA 1Z25A 4BDZA 4I9QA 3BZCA 1LOTB 4Z4EA 3QICA 1LW2A 4KRFA 1KAZA 4FWPA 5C2FA 1HYZA 1VSFA 2ZF5O 1HR0K 1EP4A 4ID1A 2JWKA 2ZWHA 3VENA 1NK0A 4JS4A 2NLXA 4NLBA 1JLFA 3T7ZA 3TAMA 4O55A 3E9LA 1J53A 4FWRA 3WQTA 4BVPA 3K5NA 4J2EA 2UXBK 4X65K 5JLFA 4FM0A 3O6WA 1NK4A 3C6UA 1DTTA 1BWFO 3LP1A 3TAQA 3R6MA 3DLGA 5C25A 1YI2N 4A59A 4PQUA 3L2QA 5FPDA 3CM6A 4C23A 2XY7A 3M1FA 5AQNA 3THWB 2G8FA 3ZSQA 1U04A 1DEJA 1KAXA 5KGWA 3JSMA 3OJSA 3OHRA 1ESVA 2YNGA 4E0DA 5DM6L 3K9KA 4CJ5A 2G8KA 1QSYA 5C0YA 2D0OA 3E66A 3M8QA 4CFAA 3D0PA 1J9AA 2QWNA 2W42A 2HVIA 4IFYA 4LH4A 4C1NI 4BRHA 5E26A 1QSLA 3MXJA 1ITGA 3I56N 3TABA 3K58A 1RBSA 4IOXA 3CFRA 1QVGM 1NGCA 3EEQA 1S22A 4FJ8A 3CC4N 1QQNA 1XC3A 3FZLA 1HNVA 1LWCA 1FJGK 3CG7A 1U6ZA 1BIZA 2HHHK 3QMLA 3HPOA 4E7HA 1BHLA 3TAFA 4DR4K 2F9WA 2ZGYA 3KWIA 3TTFA 1W9HA 3G6EN 5AQJA 3KLIA 4AM7A 1HKBA 2G8HA 1MWKA 3AAPA 5AQIA 1SL0A 4FLWA 3DRSA 1EX4A 1G99A 4CBWA 1XUPO 4E3SA 3SZ2A 3LDPA 1FKOA 4Z4HA 3K2PA 1XQSC 1WSJA 2A42A 2P9LA 3RR7A 5SWMA 4KHWA 3ZSVA 3ZYYX 3OYGA 3ISNC 2QXFA 3TSQA 3SYZA 4M7XA 5BR8K 4FLYA 1BCOA 2D1KA 1KD1O 3ZT2A 4F4KA 5AQXA 3GG4A 1XHXA 1UA1A 4KO0A 1TKTA 4EIAA 4CVNE 4DTJA 4KI6A 3UKRA 4KH4A 4QOZB 1HNZK 3DXMA 3H6EA 4H0PA 4AF1A 5TKWA 5BRFA 1L5UA 4K8ZA 4FJGA 5CZ2A 4PUOA 4W5QA 4B9QA 3HOTA 1VQKN 3SQ0A 3UB5A 4UY8O 3NGIA 1NGHA 3AVMA 2E2PA 5KPRA 3FR0A 4U7BA 3NH0A 4DR6K 1RDAA 4JS5A 4Z4IA 3ZCMA 2PYJA 4JKEA 3ATVA 2ITGA 3QIPA 2IVPA 3TTDA 3AO2A 4I9LA 4FK2A 4A2BA 2Q0RA 2GWKA 3VF2A 4PKHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GIN A;  4BY9 C;  5GIO A;  2NNW A;  3NVM A;  3NVK A;  5GIP A;  3NMU A;  3T7Z A;  3ID6 A;  3PLA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PKI A;  4JV5 K;  1JXB A;  1U2V A;  1VRT A;  5GIO A;  3HJF A;  4FLZ A;  3SJJ A;  5FPN A;  4Z94 A;  4JHD B;  4W5N A;  2HVH A;  4PY5 A;  4RW6 A;  3FFK B;  3AVL A;  2EWS A;  3VOV A;  3SUQ A;  3PX4 A;  3O9S A;  2RE2 A;  3DOL A;  4FJM A;  3V81 A;  2FSN A;  1TYQ A;  4DQQ A;  1RTD A;  4ILH A;  3M8R A;  4WCE L;  3VEO A;  2O8E B;  3C65 A;  2XY5 A;  1C1A A;  1IKW A;  2ZJR L;  3U6F A;  3UE5 A;  2O8B A;  4JK9 A;  2YHA A;  5LJV A;  4JI0 K;  1JCE A;  1GLD G;  4K25 A;  2NRR A;  3H1V X;  1L3V A;  2F96 A;  4PL7 A;  3NE6 A;  2VG5 A;  1U47 A;  3VGL A;  3KKS A;  2OPP A;  4I6M A;  4B08 A;  1K8K A;  1SQK A;  3JAM O;  4NLC A;  3U9Z A;  5JIC A;  3AA3 A;  1VSL A;  4XEI A;  4XIU A;  3LWL A;  1T03 A;  2NRW A;  1VRU A;  3AO1 A;  4M3T A;  4JAX A;  3GL1 A;  1IKY A;  5CYQ A;  3AVA A;  4AHT A;  3HRG A;  4HWI A;  1NGG A;  3G25 A;  1JCG A;  3Q7C A;  4BDP A;  4J2A A;  1IH7 A;  3MX2 A;  3SNN A;  2Q0U A;  1IBL K;  2ZD1 A;  3H08 A;  3G4S N;  4A5B A;  1KTQ A;  3DJC A;  4DB3 A;  5BPN A;  2HHQ A;  3VQ6 A;  4BG8 A;  2NRT A;  4CFB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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