3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Pre mRNA splicing protein
publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
3NMUA 3PLAA 3NVKA 5GINA 5GIOA 2NNWA 4BY9C 5GIPA 3ID6A 3T7ZA 3NVMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NRZA 5FRNA 4JK8A 1N8RO 4FJ9A 2ZJPL 4DLEA 1NKEA 3KWGA 3SQ0A 1LAWA 3SAHA 5HRSA 5GIOA 1S1UA 2E1ZA 2P5GA 1XNRK 2NRRA 3HBTA 1F21A 3ZSQA 2P9UB 4JHDB 2QKBA 3FFKB 1JL2A 2EHGA 4O8UA 2DFEA 2YJEA 4N47A 4NCGA 1S1VA 3VGMA 4BR0A 1NGGA 2HBLA 1X1PA 2YHYA 4B9TA 3WXKA 3BGRA 2Q31A 2GUIA 3H3NO 1ATSA 1WBBA 4JKEA 4IBNA 2JWKA 1IH7A 1TKDA 5CY4A 3CCRN 1U4BA 3C7NB 3G4SN 4E0DA 3TAMA 1NK8A 2FBTA 2IC3A 3M6GA 4BGAA 1KAXA 5I42A 4LF9K 4CD1A 5CE3A 2F4VK 2E20A 4X65K 3LZIA 1RTJA 3PIPL 3HP9A 3OYIA 5AQQA 1YTUA 3VQ7A 3DXMB 4LC9B 3DLBA 1NOYA 3DLEA 5AQNA 3WEEA 4CZLA 4FL9A 2CGJA 5AQWA 1DTQA 1D8YA 2FSJA 2D0OA 3SV4A 3LWMA 4CBWA 1LAVA 4DS5A 4Z4IA 1JCFA 4CGGA 1UAXA 2ZD1A 2HF4A 3V9SA 2P9SA 5HBMA 1FK9A 4Z4CA 3PSIA 4Z4EA 3EN9A 1U2VA 4A62A 4ZTJA 4KHSA 4CJUA 4RG8A 1J5OA 3ZT3A 1FJGK 1U48A 1G99A 1TK0A 1VSHA 1ZBFA 3BZKA 2WC9A 3R9PA 3D0PA 1GLEG 3EE8A 3DOKA 3G25A 1QZ5A 1IKVA 1VQ4N 3KIOA 3H1QA 3D2EB 4OO1J 1VQMN 3KWIA 1KFSA 4E7LA 3CCVN 4B9NA 1RDBA 3OS2A 2NRXA 5AR0A 3I56N 2KLAA 2X78A 5M1PA 1BQNA 1NK6A 3VEVA 4FPAA 3OYNA 4WCEL 1HJRA 4QOZB 3HJFA 1YAGA 1XHZA 2HMIA 4NCAA 2QM1A 3M8QA 3D45A 4KO0A 3VPZA 3PLAA 3HZ6A 4E1NA 3DRSA 1NNEA 4QAGA 4BVPA 4FWSA 2BH1A 2ZJRL 3KK2A 3RRHA 2UXCK 1WLJA 4CE9A 3A5OC 1VQON 2NUBA 3O6WA 3ZSRA 3HOSA 4FWKA 2E2QA 1C0UA 1A5VA 1ASVA 1V4SA 3AARA 4ICLA 3M5RA 3CQ8A 2KZMA 4X66K 2YNHA 3VQ8A 2X74A 3NH1A 3WUHA 4CJ4A 2VQEK 2E2OA 4YDUC 3PX0A 3WXMB 4K41A 5FDLA 1S1TA 5AQHA 4OPKA 1RDWX 1VQ8N 3VEOA 1W97L 3AVGA 1U47A 4A5AA 1QSLA 3HT3A 3HM9A 2Y1JA 1BCOA 4KHPK 3V4IA 1D4XA 2QWPA 3FZFA 5AFUH 2H3GX 4KREA 3SUOA 1RT3A 4CHOA 4FOIA 1S6QA 4DSJA 1UWBA 2BTFA 3AVFA 1RT4A 3PV8A 4DR2K 1S9EA 5AQMA 3LDOA 2PYLA 4J8FA 2WTUA 4PA1A 3QFPA 2IVNA 4WFBL 3QFUA 1C1BA 1P90A 3LM2A 4CFBA 1MDUB 3W3DA 3EKUA 3QINA 2B4JA 1OVQA 3GE1A 4DQIA 2OYQA 4H0XB 3CC2N 3C65A 4BR4A 4LY7A 5JS1A 2IS3A 3QESA 4BRGA 3I8DA 4I9QA 4JS4A 5KRTA 3KLGA 2P9LA 4JI8K 1OKJA 3SBTA 3QB0A 1SL0A 4HCCA 1NJYA 4OKEA 4CGJA 4JI2K 2E4LA 2Z1HA 4LFCK 4CHZA 4O55A 3F9KA 1KTQA 3MDQA 5C0YA 1SQKA 2RKIA 3I55N 1QVFM 1C1AA 4BRNA 3SJHA 2QXFA 3THWA 4CZMA 3THVA 3J80O 2FXUA 1DTTA 2FSNA 3VN5A 3NFAA 4PWDA 4HTUA 5AQZA 3CERA 5FPNA 2YHAA 4JI7K 4ELTA 3THXB 4WQ4A 3ZETA 5AQSA 3AVLA 1ATRA 1YHQN 3DLKA 3SBGA 3QETA 1S3XA 1YJ9N 3THYA 1I3AA 2D1KA 4DQQA 4JD2B 4RW9A 4Q5VA 4NB4A 3BUZB 3MXMA 2VWBA 1U2VB 3VQQA 3NHGA 3S41A 3CCQN 3VA0A 3ID6A 5FROA 3AVNA 3CD6N 3FZHA 1VQKN 2AP1A 2YHXA 4PL8A 4CJKA 2A42A 3D2FB 1B9DA 5J2PA 4N41A 3OYMA 1S22A 1SUQA 1NGCA 1XI1A 4BRCA 3HO1A 4FJMA 3QEPA 4DSLA 3CCLN 4CEFA 3MMVA 4DUZK 4K8XA 4BDPA 3S3MA 1QQCA 3O9TA 1KAZA 5AQIA 1E4GT 4E89A 4BE1A 4I2PA 3MK6A 5BRFA 4WFNL 3E1YA 4AH9A 3SLCA 5AFUA 1NJXA 3V9UA 1D9DA 4FLZA 4J2BA 4JK7A 4W5TA 4KB0A 2G8HA 2W42A 4PKHA 3CCUN 1HYZA 5F2RA 2E6LA 4DSKA 3IDHA 4FWRA 3V9ZA 1BGXT 4U7BA 2UU9K 3RWUA 3CM5A 4BQLA 1BA0A 4DQ8A 4B1YB 3V9XA 2HHHK 1UOCA 1CXUA 1GLDG 1NM1A 4DB3A 1V4TA 3AVCA 2YKNA 2BUPA 4DFMA 5GAGP 3VQ5A 3E9PA 1NK5A 2W6KA 3JXUA 2ASMA 4JKDA 4OJRA 4BQZA 4PY5A 5K14A 3NVKA 3O4QA 3MWTA 4FWLA 1ASWA 4ID1A 4BC5A 1QHTA 3FFIA 3R6MA 2YHBA 3CQXA 1NGHA 4B1ZA 1SL2A 4KKOA 3VQBA 4OVLA 4PL7A 4XEIA 1RT2A 3L6QA 5KGWA 2GELA 3T3FA 4L3QA 3E9LA 3KKRA 1NG9A 2YNIA 1HLUA 3V1RA 5FPDA 5BR9A 4JI6K 2OPQA 4QS9A 1UA0A 1X9SA 2G8IA 5AJ3K 4IOXA 4GVEA 4DV5K 1WSFA 3HSCA 5C15A 3OTOK 4HUFA 3KTQA 3ZEUA 5GIPA 1S1XA 3KK7A 3NF7A 4FWNA 5C25A 3FR0A 3WNHA 3KD1E 4RCHA 2P9KB 3JAMO 4CEQA 3H45C 4CHQA 5HROA 1NJZA 1HYSA 3QMLA 2D5RA 2DY4A 4CFDA 1IJJA 3KHYA 4KTZA 4CEOA 2DTUA 3K9KA 4FVMA 1Q9YA 4E19A 2OZSA 2O8BB 1NGEA 3T69A 5LJWA 2JGUA 3O9UA 3M3ZA 1NMNA 4PQUA 1Q86O 2HNYA 3ZX3A 1YI2N 5M1OA 2AA4A 2P9LB 4JKHA 5JVHL 3KD5E 3V1QA 4CEZA 2W40A 1XNQK 1XC9A 4IWVA 4TSXA 4E1MA 2PAVA 3FGUA 1KXPA 3K5OA 4IG0A 2KTQA 2PYJA 2XY7A 3KZBA 1NOZA 3AAPA 4F2RA 4H5NA 1NK7A 5JVGL 3LP1A 4CK2A 1YTAA 4FK2A 3G10A 1IBLK 3BDPA 3NMUA 4DCHA 1NGAA 1EXQA 3C6AA 2P1JA 2DFFA 3M8RA 5J2NA 1GOAA 2YNGA 4EP5A 4YDUA 3CJBA 4NO7A 2P9NA 2NLXA 4FWPA 4I6MA 3QDKA 1K9MO 1SZ2A 1CXQA 5E41A 3ZLJA 3HSTB 3HOTA 4BE0A 4NXNK 4BC2A 1HNZK 4RW8A 4BDZA 3SJJA 3H3OB 4M41A 2P9PA 3L0QA 2NRHA 4O0IA 5M1NA 3QLHA 1NMDA 5BRHA 3MN9A 3O8MA 5CYMA 3KLIA 2PBDA 2QWQA 4WQ4C 3CJAA 5AQYA 3MX2A 2VCPA 3CYMA 1S6PA 3H08A 3LZJA 4RW7A 1XMOK 2RHKA 1S1WA 2VGNA 4CD3A 1WAJA 4W5OA 2HOEA 1S5JA 3OYAA 3OYLA 4FLYA 2A1RA 1OH6A 2ZF5O 5LJVA 1WSEA 1BI4A 3M1FA 3T1AA 4DV6K 4G9ZA 4MLEA 5HOOA 4L8RB 3H1VX 3GBTA 5BR8K 1GLBG 1TAUA 4IG3A 3C95A 3L2WA 3O3GA 3O80A 1DGKN 3PO5A 2GX9A 1ASUA 2Q3SA 3P1GA 4JN4A 3L2UA 4H5TA 3Q7BA 4M3RA 3L8BA 4JRQA 3J7AP 1NGBA 4B3RK 3OBWA 4M3WA 1IBMK 2O4IA 2O8EA 1VRTA 4FJXA 4LF6K 4W5RA 3RMDA 2UUCK 4LFBK 3OHRA 3IAYA 3NBPA 4JI4K 1N5YA 3O9QA 3QNNA 3KLEA 5CYQA 5AQJA 1LW0A 3SCXA 1BG3A 3PUFA 2KKZA 4CZEA 3ZT0A 3OVNA 5M1KA 2HF3A 4O4GA 4UY8O 3C6HA 1ZBUA 4RW6A 4LFAK 2BDPA 4BDYA 1IG8A 4CJSA 4BRHA 1K8KB 2HB5A 1HYVA 3ZSXA 4NYFA 3T19A 4CJTA 3TANA 4LF4K 3MN7A 4CJQA 1T05A 4QCLA 3CC4N 3DXKA 2QKKA 4WQ5C 3L2QA 2GTDA 1WNSA 5AQLA 1TUUA 3ULDA 2UXBK 4IDHA 4IJNA 2NNWA 4CJPA 1XQSC 4Y0WA 2HVHA 3K5LA 3HM8A 2HBJA 4BREA 4ID5A 2E8AA 3KKSA 1H1VA 1EQYA 4JKGB 5J2QA 1HNVA 4B8CA 3OYDA 1C0GA 2DFHA 4BE2A 1TKZA 4LSNA 4DU1A 2ASPA 3U6FA 1C0TA 3TAEA 1VSIA 4FM1A 4IJAA 4NLCA 3L3UA 4FZXC 4AHTA 4FLTA 4IO8A 2ZM6K 3WNGA 1XUPO 4BRMA 4XH1A 2V51B 4CJ7A 1TV6A 3VQPA 3LAKA 3E66A 4K25A 4FJKA 4B3SK 3O4WA 1Q81O 3EO3A 3CJ9A 4FSVA 1QVGM 2CGKA 3LP3A 4CK1A 1T6CA 3RMAA 3QBWA 4A59A 4B1WB 3ZSYA 2Q97A 2E5LK 3G6EN 3LDSA 4M7YA 3A2FA 5KTQA 3C94A 2Q2RA 4KFBA 4FK4A 4KV8A 4M42A 1MA9B 2YHWA 5BN8A 2P9IB 1Z25A 1NGDA 4DG1A 2HHTA 5GINA 2G8WA 4CGFA 1NWKA 4C8NA 1FKPA 3CFRA 3ZSOA 4IXCA 4A57A 5FLXO 1VQNN 5FRMA 4IFEA 3CJ7A 4BG9A 3UIQA 4KI6A 1VQ5N 2OZMA 4DTJA 4K0KK 3J81O 4DTOA 3ZT1A 1U04A 2ZJQL 4FLVA 2XY6A 2P9PB 4OKJA 4YOWA 3PX6A 1L5UA 2O8CB 4ISEA 3WXIA 2O8FB 4C23A 1NU0A 4CERA 3CF5L 2HVIA 4FJ7A 1JLGA 4DFKA 1GLAG 4A61A 1WB9A 2BGGA 3NF8A 1L3TA 4ISFA 1ZBHA 3OJUA 4YOTA 1HJOA 1REVA 5BN9A 2OA8A 5C12A 4WE1A 3O3HA 5LY3A 1CLQA 1RILA 2VGMA 3E01A 4B1XB 4UQGA 3QEXA 1LWEA 2FBXA 2FBYA 3MEEA 4KHWA 2Q0UA 1RTDA 4NXMK 1Q8IA 5E26A 1RT1A 1K6YA 2Z1JA 4JI0K 4YOUA 3CETA 3WXLA 3FLCO 1R0AA 2R7YA 4GV6A 1JJ2M 2FF6A 3NGIA 3UKRA 1YT3A 3WQTA 3VQAA 3ZSVA 2F8SA 4KHUA 4M3XA 3O1WA 1GLFO 3NDKA 4EHUA 4YORA 1DEJA 4DR7K 1JCGA 4BR5A 4FM0A 4FWQA 4YNQA 1ZBLA 4BRAA 2X6NA 3AA5X 3J7YP 4OGEA 4BR9A 3OYCA 4E1JA 3I33A 4YY3K 3ENBA 3LDNA 1LV5A 4FJJA 5T7BA 3CI5A 3ASMA 1EWRA 3BZCA 4OX9K 2OTJN 3E9OA 3ZCMA 3MXIA 3VESA 1HMVA 5KQDA 5JLFA 5KI6A 4IOCL 5GAEP 3DXKB 2Q0RA 3RSEA 4DTUA 4YOXA 5IWAK 3G71N 1VSDA 4EAHD 4CJRA 4CK3A 2XY8A 1X3NA 1NK9A 4JRPA 3MEGA 4BR7A 4M63C 2A40A 1K73O 4ILJA 1TAQA 2YX6A 2QWOA 5AZIA 3WEEB 2YJFA 4OPJA 1KSPA 1NGFA 3MCPA 1MWKA 3U3GA 4R5PA 3RMBA 4CJ5A 4BRKA 3JS6A 2KHOA 3ULEA 4CECA 2P9SB 1BQMA 1IO2A 1U45A 1DKGD 4DQPA 1FW6A 5BRDA 4H5RA 5KQ8A 2A1SA 4B1VA 4KI4A 3KLHA 5J1EA 5AZJA 1U49A 1Q18A 3V6DA 1C1CA 1VQLN 4DWIA 3L4IA 3HVTA 3AA2A 4CBUA 4DTPA 3OYJA 4N56A 4CJFA 1WOQA 3LP0A 1ILYA 2ZE2A 3IG1A 4DTSA 1X9MA 5JMVA 3MWPA 2UXDK 3WXJA 4LF8K 3R8EA 3ID8A 4DTRA 4CF0A 3A5MC 5B8HA 2QW9A 4H0VB 3VF6A 1YJNN 4RW4A 4FZZA 3LDLA 1JKHA 3D6RA 5DM6L 3OY9A 4JK9A 4BROA 1L3SA 2VG7A 4DSIA 2E2PA 1I39A 3V9WA 4DMNA 4KRFA 4AM7A 1WUAA 4N76A 3K58A 1BWFO 2CGLA 3TWHA 3EEQA 1TGOA 4I2QA 2XO7A 4Z94A 1SKSA 5HRNA 2GWKA 5MLCQ 4EIAA 3CCJN 1TL1A 3SV3A 1B92A 2ITGA 1HKBA 3DMJA 1RNHA 1TYQA 4PHTX 2JWLA 3LPTA 2RE2A 5A2QO 3OYBA 2QEXN 4DSEA 2RF2A 2IVPA 4WYBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NMU A;  3PLA A;  3NVK A;  5GIN A;  5GIO A;  2NNW A;  4BY9 C;  5GIP A;  3ID6 A;  3T7Z A;  3NVM A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NRZ A;  5FRN A;  4JK8 A;  1N8R O;  4FJ9 A;  2ZJP L;  4DLE A;  1NKE A;  3KWG A;  3SQ0 A;  1LAW A;  3SAH A;  5HRS A;  5GIO A;  1S1U A;  2E1Z A;  2P5G A;  1XNR K;  2NRR A;  3HBT A;  1F21 A;  3ZSQ A;  2P9U B;  4JHD B;  2QKB A;  3FFK B;  1JL2 A;  2EHG A;  4O8U A;  2DFE A;  2YJE A;  4N47 A;  4NCG A;  1S1V A;  3VGM A;  4BR0 A;  1NGG A;  2HBL A;  1X1P A;  2YHY A;  4B9T A;  3WXK A;  3BGR A;  2Q31 A;  2GUI A;  3H3N O;  1ATS A;  1WBB A;  4JKE A;  4IBN A;  2JWK A;  1IH7 A;  1TKD A;  5CY4 A;  3CCR N;  1U4B A;  3C7N B;  3G4S N;  4E0D A;  3TAM A;  1NK8 A;  2FBT A;  2IC3 A;  3M6G A;  4BGA A;  1KAX A;  5I42 A;  4LF9 K;  4CD1 A;  5CE3 A;  2F4V K;  2E20 A;  4X65 K;  3LZI A;  1RTJ A;  3PIP L;  3HP9 A;  3OYI A;  5AQQ A;  1YTU A;  3VQ7 A;  3DXM B;  4LC9 B;  3DLB A;  1NOY A;  3DLE A;  5AQN A;  3WEE A;  4CZL A;  4FL9 A;  2CGJ A;  5AQW A;  1DTQ A;  1D8Y A;  2FSJ A;  2D0O A;  3SV4 A;  3LWM A;  4CBW A;  1LAV A;  4DS5 A;  4Z4I A;  1JCF A;  4CGG A;  1UAX A;  2ZD1 A;  2HF4 A;  3V9S A;  2P9S A;  5HBM A;  1FK9 A;  4Z4C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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