4B1WB

Structure of the phactr1 rpel-2 domain bound to actin
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
369
structure length
361
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVARPRHQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
total genus 131
structure length 361
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1wB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1wB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1wB03
3SJHA 3D2EB 1K8KB 2V51B 3EN9A 4BG8A 4BQZA 1C0FA 5I9EB 3QDKA 2OANA 4CZMA 4CZKA 4FWMA 2KHOA 5CE3A 4BQLA 1P8ZA 5AQWA 3R9PA 4A2BA 3VEVA 5KPZA 1Z05A 1H1VA 1ATNA 3WUHA 2HF4A 3DXKA 3BEXA 3HZ6A 4EHUA 2Q0UA 3O5BA 5AQJA 4EIAA 4Y0WA 4BR7A 2A42A 3D7EO 2E8AA 4IO8A 1NGBA 3ENHA 5AQYA 1RGIA 3H1VX 1X3MA 3EZWA 3HM8A 5JICA 3FFKB 5JLFA 1ZC6A 4PKIA 2QW9A 1TUUA 1GLLO 4YDUC 3RSEB 4H0TB 3O4WA 5FPMA 4FWKA 2A6AA 4CI6A 5AQPA 4FWOA 3EO3A 3WQUA 1KXPA 1SQKA 2ZF5O 3LM2A 5FPNA 4DHYA 1ZXOA 4BG9A 2ASMA 3HBTA 3I33A 1HKCA 3A5NC 3FR0A 1XUPO 1JCFA 4H0VB 2E2OA 2VYPA 3MMVA 2CGKA 2HMPA 1SZ2A 4PKGA 1K8KA 1Z6RA 2FF3B 4BRPA 4H5WA 5ADXH 1QQNA 4J8FA 4B1XB 4BRLA 3WT0A 4FWRA 4L3QA 3EKSA 2FLOA 2ITMA 4BROA 2PBDA 3MN7A 3W3DA 3B8AX 1BA1A 1GLAG 2Q0RA 5AQSA 2P9NB 3AARA 3CQXA 2YJFA 3MDQA 3ULEA 1TUYA 2CH6A 2ZGYA 2Q31A 4YDUA 2QWMA 3IUCA 1T44A 3SK3A 4CD3A 4BC5A 5FPDA 3IFRA 5AQZA 4BC2A 1TYQB 2QWOA 3C0BA 5KQ8A 4A61A 3IDHA 4LC9B 4BRAA 2ZGZA 2QM1A 3QMLA 3VPZA 3BUZB 5AR0A 3VEXA 1ATSA 1DEJA 1ZBSA 3LM9A 3EKUA 4M7YA 2P9KA 4CBUA 5KQDA 4K42A 4CZFA 4CD1A 4AM6A 4I6MA 3A5MC 2P9IA 5EVZA 5AQUA 3VETA 4BRQA 4BRCA 4WQ5A 1GLEG 3QBXA 1OKJA 3UB5A 5AQLA 3CJ7A 3D2FB 4CBXA 5F1XA 1LOTB 4H5TA 5AQKA 5AQGA 3CJ9A 3VF4A 4PL8A 3D2EA 3ZX0A 1GLDG 3LDNA 1KAYA 1G99A 5F0XA 2A40A 2Q1NA 1BOTO 4DCHA 3ENOA 3ZEUB 1X3NA 3H6EA 2F9WA 4BR4A 4H5NA 3WXKA 1HLUA 3MN5A 1ESVA 3CQYA 1YXQA 2YHXA 3P4IA 3TPQA 4O8KA 2F9TA 1NGGA 3L6QA 4ISFA 3HSCA 5LJVA 3FZFA 2E1YA 1GLJO 5JLHA 3M3ZA 2GELA 1RDWX 3GG4A 5AZJB 3WEEB 4JHDB 2D0PA 3FZMA 3O1WA 4H0XB 3SLCA 1U2VA 4WQ5C 4RCHA 2Q97A 4CZJA 2YCHA 2FSNA 3D2FA 5ADXA 2HOEA 4I6MB 4PKHA 3WXIA 3QFPA 4B9QA 4BR9A 4PL7A 4BREA 4FOIA 4K41A 2Q36A 2GUPA 5BPMA 5BPNA 2A3ZA 3LDLA 5LY3A 5BPLA 1ATRA 3O08A 4B1WB 2QWRA 3M6GA 4BR5A 4EAHD 4XH4A 5BR9A 1BUPA 1WUAA 3QBWA 3GDQA 5AFUA 4BRIA 4IXCA 4JNEA 2V7ZA 3VOVA 4HWIA 4QS9A 3AY9A 3VENA 1MWKA 2P9NA 2GEMA 1MA9B 3FZLA 5E84A 5AQRA 2P9SA 4JAXA 3ULEB 1NMDA 3W0LA 4BC3A 1J6ZA 4H0YB 3JXUA 2I7NA 4IJNA 1U2VB 3CERA 3ID8A 3VEYA 4H5VA 1JCGA 3FZHA 1QZ6A 2E88A 4M63C 2DPNA 3WEEA 4BVPA 4NB4A 3CIPA 2E20A 3MN9A 2VWBA 1NWKA 3QFUA 4MLHA 4E1JA 3O80A 4JN4A 1YUWA 1JCEA 2HF3A 5EXWA 4F9OA 5AQQA 1HKGA 3GOIA 2YHYA 1GLBG 2V52B 3CJAA 1YAGA 1IG8A 4MLEA 4MO5A 4BR0A 3JS6A 2P9IB 2BUPA 2FSKA 5ELZA 3ZX2A 3ZX3A 3UKUB 2P9PB 5EOYA 5BRHA 3BF1A 3H46O 3ZETA 5AZIA 3VERA 4BVOA 4H0PA 4EFHA 4GNIA 2EWSA 2W41A 2UYTA 4MO4A 1HPMA 3U8XA 3WXLA 1BDGA 2D4WA 4IZ9A 4QS7A 2IIRA 5EY4A 5AQFA 4BRNA 4GY2B 3QICA 4ISEA 3G25A 4CZLA 4CZEA 2P9UA 1HJOA 3RSEA 3MK6A 3UKRB 4FL9A 4IJAA 4K25A 4O5FA 4WQ4C 5B8HA 1BG3A 3QB0A 2QXLA 4K43A 1GLCG 4RTFD 3GBTA 3VF6A 1QQMA 4FWNA 4CJ7A 2D1KA 3MN6A 4H5RA 1C0GA 3FGUA 2ZWHA 2GWJA 3CI5A 5TKYA 3BP8A 2ASPA 1XQSC 2QWNA 4B1VA 5BRDA 3DXMB 1S3XA 3ATVA 2E1ZA 5BN8A 3A8YA 3DAWA 3OHRA 3H1QA 5AQIA 5AZIB 5AFUH 3VEOA 4BRFA 4RWTA 4A2AA 3A0IX 2J4RA 3MCPA 2P9PA 4DB3A 1BA0A 3I8BA 3H3OB 2FXUA 3CJ1A 1QQOA 1RFQA 1CZAN 2ASOA 3LDQA 1U6ZA 1NGJA 4BRDA 2P9LA 2BTFA 4M7XA 1NLVA 3ZETB 4FO0A 5AQOA 4CZHA 5BRFA 3DJCA 4C23A 4BRMA 3R8EA 3U9ZA 4BGBA 3LDPA 3KVGA 1HX1A 5LJWA 4JD2A 1KAXA 4XEIA 2AP1A 4CZGA 4WQ4A 2CH5A 4FPAA 3ZEUA 4H03B 1V4TA 2IVNA 3VGMA 3LL3A 1R59O 3AAQA 4FSVA 5AQNA 3CETA 3CJCA 2A5XA 4ISGA 2P9SB 3VESA 4FOEA 1EQYA 3L4IA 2YJEA 3DXMA 3LDOA 2E2PA 3L0QA 2QWQA 3SMPA 3HTVA 3ATUA 4FPBA 3EL2A 1T6CA 3IMXA 4FWQA 4Z94A 2GTDA 3FZKA 2D0OA 3GL1A 4AM7A 1DGKN 1HUXA 1KAZA 1NM1A 3U4LA 4KBOA 4FWLA 3R6MA 5BREA 5E26A 2VCPA 3DXKB 1X9JA 2WUSA 1WOQA 3UE5A 3C7NB 3VEWA 4FWSA 2NLXA 2YHWA 4A62A 3F9MA 3WQTA 1YVNA 2H3GX 1NGEA 1HKBA 3A5LC 2NRHA 3UKUA 1BWFO 1NGDA 3M1FA 3WXJA 4IWVA 2IVPA 4BC4A 2IVOA 2V7YA 2YI1A 1E4FT 3O1BA 5AQHA 1NGCA 5AZJA 1QHAA 3CJBA 1GLFO 3VGLA 3GE1A 1IJJA 3FE1A 3U9DA 2PAVA 1NGIA 2CGJA 5KPRA 5JMVA 3H3NO 3FLCO 3KHYA 4CZIA 1QZ5A 4FWPA 2Q2RA 4BR2A 5BN9A 4BRKA 2I7PA 4DQ8A 3S41A 4CBWA 1NGHA 4QS8A 1NBWA 1MDUB 2GWKA 3O6WA 3SMSA 4XH5A 5KPTA 4B1UB 4BRHA 3C7NA 2NZTA 5AQVA 4HTLA 5AQMA 2QWPA 2A41A 4B1ZA 3CHWA 2FSJA 3TU5A 4B1YB 1NGAA 5EX5A 1XC3A 1BU6O 2E2QA 4EHTA 1S22A 3AAPA 1NGFA 1E4GT 1SAZA 4JHDA 1TYQA 2W40A 3KZBA 3UKRA 2P9UB 2AA4A 4WYBA 1D4XA 2E2NA 2CGLA 3VEZA 4NO7A 2QWLA 4BGAA 2P9LB 2P9KB 3H45C 3VF2A 4BRGA 1V4SA 1DKGD 1Q18A 1Y64A 1BO5O 3J8AA 5FPEA 3A5OC 2FF6A 3VGKA 3HI0A 1LCUA 1T6DA 5AQTA 5AQXA 4H0OA 1MWMA 3O8MA 3DWLA 4JD2B 5F2RA 4XH1A 3BF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SJHA 2KFNA 4ILJA 4RG8A 4JI4K 4O0IA 3WNHA 5LMUK 2O8BB 4YOUA 5CE3A 3S3MA 4B9VA 3THWA 4KTZA 4Q0BA 3C6HA 2FBTA 4N41A 1HYSA 2JLEA 2RF2A 4JKHA 3WUHA 1TL3A 4IBNA 2O8DB 3CM5A 3O5BA 3P31A 2ITGA 3D7EO 3ENHA 3IRXA 3HOSA 1X3MA 3SPYA 1NKBA 4IG3A 4CFCA 2VQFK 3MWPA 4FLYA 1WN7A 3O3GA 4PKIA 1CZ9A 2XHBA 3O4WA 3AVGA 3NF6A 4FYDA 4BWMA 5DM7L 4LH4A 1FW6A 5AQPA 1T05A 2VWKA 5GAHP 1ZXOA 2P1JA 3CQ8A 3I33A 4CECA 3ZT1A 3FR0A 1KRPA 1XUPO 4H0VB 2E2OA 4ID1A 2CGKA 3NH0A 4PKGA 3O4QA 4BRPA 5GINA 5ADXH 3S9HA 3NH1A 4OLAA 4DFJA 4FWRA 1VQ4N 4L3QA 3RMAA 1NJWA 3CCLN 3AARA 1LAVA 4HTUA 2RN2A 3AA4A 3CFRA 1TUYA 1T8EA 2ZE2A 4JI0K 1LV5A 3AGRA 3I0RA 1C1AA 3KJVA 4KAZA 4M3YA 3EY1A 4E3SA 4IOXA 4BC2A 1TYQB 2FBVA 4XJXA 4JEPA 3QMLA 5AR0A 3LM9A 1WBBA 4M7YA 1TKTA 2O8EA 1OVQA 5KTQA 3RMBA 3MCAB 1NG9A 3H08A 4C8LA 4CZFA 4AM6A 4I6MA 3IG1A 3L3UA 3P5JA 3KK1A 3DLBA 2YNFA 4PHTX 4YOXA 3LP2A 4IDKA 4B9TA 1LOTB 4H5TA 4C8OA 1GLDG 4BWJA 1O1WA 2Y1IA 4EP5A 4HVJA 3ZEUB 1X3NA 1UWBA 2HB5A 2F9WA 2HHIA 4A5AA 5KRSA 1YVUA 5J1EA 3MN5A 1KD1O 4DUYK 4O8KA 3L6QA 3HSCA 4BE1A 4AHRA 1VQNN 3QINA 2E1YA 4IG0A 5GAGP 5K14A 1RDWX 3L4QA 2D0PA 4KH4A 4DMNA 1VSLA 4GVMA 1EWQA 2Q97A 4KHWA 2FSNA 1RT3A 4B9QA 2WTUA 4BR9A 4K41A 4W5RA 1VRTA 2YV0X 2ETJA 4BY9C 4BECA 5BPNA 3LDLA 1X1PA 4L8RB 1RT4A 5C10A 3M6GA 4EAHD 4XH4A 3CC2N 5HLFA 1NKEA 1RT5A 3NH2A 4IXCA 4QCLA 3HPGA 1LWEA 1VSEA 5JS1A 3ZSYA 3ZSWA 4NCBA 3OYNA 4YFUA 3DLKA 4CIFA 4A5BA 4ILHA 4V19S 1ASWA 1SL1A 2D0CA 4OGCA 4Z0UA 1JLBA 4DTUA 4BDYA 3I55N 4RW7A 4JAXA 1NMDA 3W0LA 4CEEA 4N5SA 4CESA 1XWLA 3OS1A 2YNGA 2BH1A 1IKVA 3DRSA 1KQSM 3ENBA 4H5VA 1DT9A 1FXXA 1YJ9N 3A2FA 4WCEL 3TANA 3V9ZA 2VWBA 3TTCA 4NLCA 4WF9L 3DRRA 4E1JA 1C0UA 1GOCA 4BDPA 3RR8A 3QEXA 3OYFA 3AO5A 4PUOA 4KHUA 3V9SA 3JS6A 1HQEA 3KKRA 3PV8A 3T3FA 4FZXC 4DV0K 4DV4K 3L2WA 4WE1A 4OX9K 1XMQK 1RTIA 2VG5A 4DR5K 5GIOA 4CEBA 5KGXA 1BDGA 4IZ9A 1Z26A 2QK9A 4BRNA 2O8EB 4FW1A 4GY2B 3QICA 1XNQK 3G25A 3KK7A 4CZEA 2P9UA 1E3MA 3J81O 3RSEA 2OPSA 4JKDA 3UKRB 4YOVA 1TV6A 4O5FA 4K43A 4BE2A 4ZTJA 1OH8A 2HHWA 4GKJK 2O8CB 4LF6K 1W9HA 4DSLA 2RHKA 5JVGL 1HJRA 1S6QA 4FLWA 3BP8A 2W6LA 5BRDA 3HYFA 1X9WA 1BISA 2EHGA 2XY7A 4RWTA 5AQIA 2OTJN 3OVNA 3A0IX 3OYIA 2P9PA 3O9RA 1BA0A 3VA3A 3VQEA 1A5XA 1RFQA 3AVMA 3V1RA 1NGJA 4BE7B 1NLVA 3ZETB 1IBMK 3ZCMA 5BRFA 3DJCA 4BRMA 4KTWA 3L2UA 3AO2A 1GOAA 4AHSA 3D45A 3LDPA 3KVGA 3LPUA 4KO0A 1HX1A 3QNOA 5LJWA 4OPAA 1J9AA 4CZGA 3AVFA 4WQ4A 4FJ5A 2UXDK 1EKEA 4FJ8A 1FK9A 1RILA 1C1BA 1V4TA 1L3UA 4JK9A 4FSVA 1A5WA 3DRPA 3AVBA 1YT3A 4ISGA 1S1UA 4E89A 3K0SA 1Q8IA 3ATUA 3NFAA 2XRIA 1B9DA 3V1OA 2UXCK 5KRTA 4FWQA 3TWHA 3G0ZA 1RNHA 4AM7A 2E6LA 1NM1A 1RT7A 4RW6A 3DXKB 2NRTA 1X9JA 4CJ5A 5C12A 1FKOA 3K5MA 1N34K 3CXCM 5C2DA 1Q9XA 3AO3A 3A5LC 4B3SK 1BWFO 3MEDA 3OW2M 3M1FA 3WXJA 3PX6A 2HVIA 3QEPA 3CMAN 1JJ2M 3SUPA 3ITHA 1HNIA 4JS4A 1S9EA 4CEDA 1VQON 4DU4A 2HHHK 1ZBHA 4CGIA 4O5BA 3BZKA 4KH6A 3AO4A 4YHHK 1QZ5A 4LSNA 1HMVA 3SZ2A 4BR2A 2I7PA 4DQ8A 1NU0A 3KLIA 1N5YA 1WSEA 3SMSA 3SV4A 3HVTA 1W0HA 4DSKA 4I2PA 3MAQA 3DMJA 2HBLA 3CHWA 3V81A 3TU5A 2HHUA 5C0YA 4DV3K 1NGFA 3ZYYX 1E4GT 4DSIA 1VQ6N 4C1NK 4JHDA 2P9UB 1K9MO 2HHQA 1ZBFA 4BGAA 1IH7A 3EYZA 2UXBK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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