3HZ6A

Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
500
structure length
497
Chain Sequence
SLAFYIATFDIGTTEVKAALADRDGGLHFQRSIALETYGDGNGPVEQDAGDWYDAVQRIASSWWQSGVDARRVSAIVLSGQMQNFLPLDQDHEPLHRAVLYSDKRPLKEAEEINARHGADNLWSALENPMTAASILPKLVFWRASFPQAFGRLRHVVLGAKDYVVLRLTGRHATDRTNASTTGLYRPKDDAWHVELLADYGFSLDLMPRLLEPGEQVGGVSALAARQTGFVSGTPVLCGLGDAGAATLGVGVLDDEDAYLHLGTTGWLARLTQTDPVGDMPVGTIFRLAGIIAGKTLQVAPVLNAGNILQWALTLVGHRPGEDCAEYFHMAAAEVQGVTVPDGLLFVPYLHAERCPVELPAPRGALLGVTGATTRAQILLAVLEGAALSLRWCAELLGMEKVGLLKVVGGGARSEAWLRMIADNLNVSLLVKPDAHLHPLRGLAALAAVELEWSHSIQDFLREADLRSNILHPQPCDEGRRRRKFERFKQCVETLGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Xylulokinase
publication title Crystal structure of xylulokinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
source organism Chromobacterium violaceum
molecule tags Transferase
total genus 162
structure length 497
sequence length 500
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2009-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A01
2IVPA 3ATVA 3FGUA 3FZMA 2Q0UA 3VGLA 2P9PA 3HBTA 2V51B 3CIPA 3HZ6A 3KVGA 4BVPA 1U2VA 1NGEA 3BF3A 4FWPA 5ADXA 3CETA 2Q0RA 1KAZA 5LY3A 4H03B 1BOTO 1X9JA 4BGAA 5AFUH 3I33A 2W40A 4BRMA 2QWPA 3O1WA 5F0XA 3WQUA 3FFKB 1NGIA 1TYQB 1MWMA 4H5NA 2D4WA 2YHXA 1NGCA 1BDGA 1NLVA 1S3XA 3AARA 3QFPA 2P9SB 4H0YB 1BUPA 4L3QA 2E88A 3O4WA 1BO5O 2YCHA 5I9EB 3SMSA 3M1FA 4BROA 3ULEB 5FPNA 5BPMA 5BPNA 1YAGA 2ZWHA 1ZXOA 4F9OA 5AQVA 5ELZA 5AZIA 4BRPA 3DXMA 5AQIA 2IIRA 2OANA 3LDLA 4XH5A 3SJHA 5F2RA 2YI1A 1RGIA 3L4IA 3RSEA 2ZF5O 4FWQA 1E4GT 4CZIA 4BR0A 4FWMA 1QQMA 3MN9A 3F9MA 1RFQA 2UYTA 2QW9A 4B1YB 2A3ZA 4BRNA 3EN9A 1OKJA 2IVNA 2BTFA 2D1KA 2HMPA 2NRHA 2WUSA 2HF4A 2ZGZA 3EZWA 4FWNA 5BRHA 1DEJA 3VEZA 5CE3A 3H1QA 4K43A 4BRKA 4CZGA 3IMXA 1KAXA 4M63C 1NGDA 2FSJA 5LJWA 1XUPO 3BUZB 4CZJA 2P9LB 3GL1A 3WUHA 2Q36A 2ASPA 4BR7A 5KPRA 1NGGA 1QZ6A 3VEOA 1JCFA 3O5BA 1BG3A 1IJJA 3FZKA 5AR0A 3WQTA 4KBOA 2E2OA 3FZFA 4XEIA 3CJAA 1S22A 3WXJA 4RCHA 4FWSA 3CI5A 4EHUA 1J6ZA 3D2EB 3VEVA 1HX1A 3FLCO 3P4IA 4FWRA 3U9ZA 5AQNA 1YVNA 3GG4A 3QMLA 3H3OB 4RTFD 5AQUA 4BVOA 1BA0A 1HUXA 2VWBA 3D2FB 4HWIA 4CI6A 3LDPA 3D2EA 3A5OC 5BR9A 3AAPA 3VPZA 3LM2A 3WXLA 3KZBA 1K8KB 4H5TA 3BP8A 3UKRB 1HKBA 3HM8A 3WEEA 3LL3A 3D2FA 3ATUA 1NGBA 4DCHA 1RDWX 1TUUA 4CZKA 1SAZA 1K8KA 5AQRA 1U6ZA 1DKGD 3UKRA 2YJEA 1ESVA 3VEYA 1GLDG 4PL7A 1YXQA 3FZLA 5JICA 2ZGYA 1NM1A 1G99A 4I6MA 2FSKA 3VEWA 3D7EO 5E84A 3EL2A 3A5NC 5AQZA 4MO4A 3U9DA 4BG8A 1NMDA 4A61A 2FF6A 4BQLA 1NBWA 2QM1A 5KPTA 4H0VB 3QBXA 3UB5A 4FSVA 1QQOA 2D0OA 4XH1A 1ZC6A 4IWVA 4BR9A 3O80A 5BPLA 4IO8A 3BF1A 1Z05A 5AQLA 3LDQA 3QFUA 2ASOA 1QQNA 3DXKA 2QWRA 1GLJO 2A41A 3HTVA 3UKUA 3OHRA 4JD2B 2Q97A 1LCUA 1SQKA 4CBXA 5AZIB 3DXMB 2AA4A 4H5RA 2IVOA 4FL9A 2ITMA 2HOEA 5AQWA 3IFRA 5LJVA 4EFHA 4HTLA 5AFUA 3MCPA 3O08A 4JD2A 1Q18A 5AQGA 4H0TB 3RSEB 2GELA 3WXIA 3QDKA 2QWQA 5JLHA 3MDQA 3O6WA 5BRFA 4IJNA 1ATRA 4EAHD 3DAWA 5KQ8A 3VF2A 3C7NA 3IDHA 3LDOA 4FPAA 1YUWA 4E1JA 1HLUA 4BREA 5AQTA 1NGJA 2D0PA 2NLXA 4DHYA 4WYBA 4CZMA 3ENHA 1D4XA 3CJBA 3JXUA 2CH5A 1GLCG 2BUPA 5AQFA 4CJ7A 1BWFO 2YJFA 4BC2A 4GY2B 2I7NA 1MA9B 4PL8A 1GLLO 3U8XA 1GLBG 3VF4A 4B1ZA 4CZEA 4EHTA 2DPNA 2YHWA 1EQYA 4WQ5A 3VGKA 1HPMA 2HF3A 4JN4A 1Z6RA 3ZX3A 4A2AA 1X3NA 5EOYA 4CD1A 1HKCA 4BRGA 2E2QA 4BC4A 2GWKA 4ISFA 2ASMA 3O8MA 1KXPA 5FPEA 3FR0A 2PAVA 3GDQA 4WQ5C 4CBUA 4DB3A 3I8BA 4ISEA 3KHYA 2QXLA 4Z94A 4JAXA 3ZEUA 1P8ZA 2V7ZA 4CZFA 1DGKN 5AQXA 2F9WA 3CJ7A 3ID8A 2YHYA 4K42A 2W41A 5EY4A 1E4FT 2FF3B 4QS7A 3WEEB 3R6MA 3H1VX 2Q2RA 1BA1A 1JCGA 4GNIA 4FOEA 3HI0A 2H3GX 4BG9A 3VOVA 1MWKA 1MDUB 4DQ8A 2A5XA 3CJ9A 1NGFA 3C0BA 1KAYA 1JCEA 3FE1A 4M7YA 3ZX2A 4H0PA 3S41A 5AQYA 1NGHA 2P9KA 2P9IA 4AM6A 4LC9B 4J8FA 4B1XB 4ISGA 2CH6A 3W0LA 5AQOA 5JLFA 2Q31A 2QWMA 1NWKA 1NGAA 3L0QA 2VYPA 4I6MB 3CJCA 2KHOA 1CZAN 4M7XA 1WOQA 1LOTB 2V7YA 5E26A 3A5LC 4NO7A 4FWKA 5BREA 3SMPA 4AM7A 2GWJA 4BRHA 1V4SA 5ADXH 1TUYA 1T6DA 4PKIA 5F1XA 2A40A 3CJ1A 3DXKB 3M3ZA 3UKUB 2CGJA 2A6AA 3CQXA 4JNEA 1X3MA 2VCPA 3QBWA 3A0IX 2Q1NA 2P9UA 2GUPA 1ATNA 5AZJB 4BRIA 2QWNA 1GLFO 1ZBSA 2QWLA 3VGMA 3VENA 4BC5A 3ZETA 3QICA 3VEXA 3U4LA 4A2BA 4RWTA 5BN8A 2E2NA 5EVZA 4O8KA 2GEMA 5AZJA 4MLEA 3C7NB 1SZ2A 5JMVA 2FLOA 4BR4A 2FXUA 3BEXA 1Y64A 3UE5A 3DJCA 5B8HA 4WQ4A 5BRDA 3CHWA 3H3NO 3A5MC 3DWLA 1R59O 3VERA 1TYQA 3MMVA 2A42A 4Y0WA 3R9PA 2P9NB 4BRDA 2V52B 2FSNA 2P9SA 4WQ4C 2NZTA 1GLAG 3H6EA 3TPQA 4CD3A 4MO5A 4QS8A 5FPMA 3ULEA 4BQZA 4FWOA 1XC3A 2P9NA 1IG8A 4FO0A 4YDUA 5FPDA 2E2PA 3LDNA 3VETA 5AQKA 4B1UB 4O5FA 3JS6A 2E1ZA 4JHDB 5BN9A 4C23A 4B1VA 3FZHA 3CQYA 4K25A 2QWOA 4IJAA 2CGKA 4NB4A 5EX5A 4H0OA 3B8AX 3VESA 1WUAA 3SK3A 3W3DA 3ZX0A 2GTDA 3ZEUB 4A62A 4YDUC 4JHDA 3SLCA 4BC3A 4BRLA 4H5VA 4H0XB 2J4RA 5AQSA 1T44A 4MLHA 3A8YA 4IXCA 4BRQA 1QZ5A 3EKUA 4PKGA 5AQJA 3J8AA 4CZHA 4XH4A 3TU5A 4FWLA 1C0FA 5AQQA 2EWSA 4K41A 4CZLA 3MK6A 5KPZA 2E1YA 1HJOA 3AAQA 1HKGA 4BRCA 3R8EA 3H46O 3IUCA 1GLEG 2CGLA 5AQMA 1QHAA 4BRFA 5TKYA 5AQHA 2I7PA 1C0GA 3GBTA 2P9LA 3VF6A 2P9KB 2P9IB 1XQSC 4B1WB 3M6GA 1ATSA 3ENOA 3MN6A 3WT0A 1T6CA 3MN5A 3WXKA 4PKHA 4B9QA 4EIAA 5AQPA 3EO3A 4BR5A 2E8AA 3AY9A 2F9TA 4H5WA 4IZ9A 4BGBA 4CBWA 3G25A 3EKSA 4BRAA 3L6QA 3MN7A 4FOIA 1V4TA 4BR2A 3GE1A 4QS9A 3H45C 3GOIA 2E20A 3HSCA 3O1BA 4FPBA 5EXWA 2P9UB 3CERA 2P9PB 1H1VA 2AP1A 3QB0A 5KQDA 2PBDA 1U2VB 1BU6O 3ZETB 3LM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IVPA 3VA0A 4FJJA 3FGUA 3FZMA 3PX6A 5T7BA 4M3RA 3HZ6A 4FZXC 1NGEA 3BF3A 2Q0RA 5A2QO 3NVKA 4BGAA 5AFUH 2B4JA 3I33A 2HW3A 3MX5A 1QE1A 4BRMA 3L3UA 5I3UA 2X6SA 2UUCK 3NF6A 4O55A 3CYMA 4MDBA 2YHXA 4W5NA 1NLVA 1S3XA 2WOMA 1NJYA 4JKEA 3TSQA 4H0YB 3CFPA 2YCHA 3G0ZA 3SMSA 3M1FA 2OA8A 5J2NA 5ELZA 2VG7A 3SI6A 3CFRA 3SJHA 5F2RA 2YI1A 3CM5A 4KPYA 1NK7A 2IAJA 1EETA 3AVBA 3KJVA 4FWQA 1E4GT 4CECA 4CZIA 4DR2K 4CF1A 4R5PA 3OS1A 1QQMA 2UYTA 3RWUA 3C65A 4B1YB 4HUFA 1JLEA 3PUFA 2BTFA 3AVMA 2RHKA 2ZGZA 3HOSA 3EZWA 4FWNA 1S9GA 1WSEA 5BRHA 3J7ZO 2O8EB 4IOXA 3OY9A 3IMXA 1JLQA 1NG9A 3RVCA 3BY5A 4FJ9A 5MLCQ 3BZCA 5J1EA 4B9MA 3IAYA 1D8YA 2ASPA 2VG6A 3P1GA 3VEOA 1BG3A 3PIPL 4KBOA 1EWQA 4XEIA 4CEBA 4I7FA 1WLJA 1IBKK 3CPWM 3CI5A 2NRZA 3DOKA 3ZT4A 4PQUA 4F2SA 3GG4A 3TARA 5AQUA 4BVOA 2ZD1A 3AVHA 1NKEA 3ZYYX 4FJKA 2E6LA 1N32K 3QO9A 3D2EA 3OYLA 1YTAA 3HP9A 3DOLA 4R79A 1CZBA 2ETJA 3BP8A 3D2FA 3ATUA 4KH4A 3OW2M 1NNEA 3HL8A 1LWCA 2KW4A 3HRGA 4CZKA 1SAZA 2Y1IA 4DUZK 3CD6N 4I9QA 5CYMA 4Z0UA 1BCOA 3SAGA 3OTOK 4J2BA 4CIGA 4B3RK 2XY5A 2PFUA 4KTWA 2WC9A 4YOUA 4CEOA 4I6MA 3CCSN 1N36K 5GADP 4LY7A 4MO4A 2ATQA 5JVGL 4A61A 1NBWA 2QM1A 2Z1IA 1M1KO 3T1HK 3VQAA 1VK0A 1RT2A 4JKCA 3LP2A 2A41A 4OGEA 4AHCA 4LSLA 2UXCK 1Z26A 4CF9A 4GKJK 3QEXA 1LCUA 3P5JA 4MQ3A 5AZIB 3DXMB 2IVOA 4FL9A 3LANA 4JKDA 5AQWA 3THYB 1YT3A 4EFHA 4HTLA 5AFUA 3QNNA 4FZZA 4H0TB 3RSEB 5HROA 3LPUA 3NGYA 3ZSOA 3LZIA 1XMQK 1BQNA 2HHHK 3LP3A 3MDQA 3O6WA 2HHTA 4B8AB 4JI3K 1KVAA 1NOZA 3R1XA 5KQ8A 3C7NA 5FLXO 1HLUA 4BREA 1VQKN 1WSFA 2D0PA 2HBMA 5FROA 4DHYA 1M90O 4N47A 3RMDA 1JL1A 1GLCG 4DQIA 2BUPA 4RW8A 4FJ5A 1SUQA 2I5JA 4BC2A 5TKWA 4GY2B 1MA9B 4CHPA 1W97L 4A5AA 1UA1A 1BI4B 3U8XA 1GLBG 3NGZA 2PYLA 3E9PA 1IKVA 2HF3A 4JN4A 1Z6RA 3FFIA 4X66K 2OZMA 3K5LA 4PY5A 3V9XA 1X1PA 3WNEA 3HM9A 1QVGM 4YOTA 3K58A 3HJFA 3CQ8A 3KK7A 2JGUA 3UIQA 1C1AA 2QEXN 3A2FA 1ZYQA 1RBTA 1OVQA 1VQ4N 3ZEUA 4JI1K 1U47A 3ZSVA 4CZFA 5HRPA 4FCYA 2YHYA 1HQEA 3CC2N 1IKWA 4WFNL 4QS7A 3WEEB 4B9SA 2Q2RA 3TABA 4KRFA 1BA1A 2G8WA 4CJUA 3TAMA 3ZSZA 1YJNN 2VG5A 5M1FA 4AQYK 2OPPA 4M7YA 4H0PA 3MEDA 5AQYA 2P9KA 1EWRA 4LC9B 3Q7CA 4M42A 5AQOA 4AH9A 2YX6A 1NGAA 4BWMA 1RBUA 4OGCA 4M7XA 4B08A 4YOYA 2A1RA 2YHAA 2ZJRL 1GOCA 5BREA 3E1YA 5ADXH 4DV6K 3SBGA 1T6DA 4CF8A 1U45A 3V1RA 3NE6A 2PZSA 3DXKB 3M8QA 2OTJN 2G8HA 2A6AA 4KHWA 5JS2A 1RDUA 3NH1A 1IG9A 3A0IX 4OO1J 3AVNA 2G8FA 1EXQA 4O8UA 4LF7K 2D0BA 3VEXA 4CJWA 4OX9K 4FW2A 1C1CA 3G6EN 4LD0A 3IS9A 1YJWN 4KHSA 5EVZA 4TSXA 3ZSWA 5AZJA 4MLEA 2NUBA 1SZ2A 1KFSA 4DV2K 3BEXA 1KSPA 5B8HA 4BDPA 4NLCA 4DS5A 2JWLA 3DWLA 4IFYA 4GVEA 1VSEA 4EP5A 1O13A 3V9ZA 2P51A 2P9NB 3K2PA 4E7HA 5J2MA 3J7YP 2VWKA 2P9SA 3MEEA 4M41A 2NZTA 4AHRA 1GLAG 4Y1CA 3TPQA 4CD3A 4CJTA 3CF5L 4BQZA 1IG8A 3KLIA 4FO0A 4YDUA 3PSIA 3THXB 2B6AA 5KI6A 4WFAL 3QEPA 1IBMK 4CGJA 5LL6Z 4ZTJA 3K9JA 1JL2A 3NH0A 4CESA 4ILGB 4K25A 4B1VA 4PUOA 4IJAA 2FBYA 3KK1A 4F2RA 1WUAA 2GTDA 4YDUC 1YITN 1Q86O 3A8YA 5HBMA 1IO2A 4IXCA 4BRQA 3PSFA 3TSUA 4PKGA 1S5JA 4W5RA 3TU5A 4DV3K 4FWLA 2EWSA 4DU3A 5K14A 4K41A 1K8AO 2E1YA 3AAQA 3OBYA 1VSFA 3IUCA 5AQHA 2VQFK 2I7PA 4JK8A 2P9LA 2XO7A 4FJ8A 5J2QA 3N4PA 1E3MA 5CYQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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