3HZ6A

Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
500
structure length
497
Chain Sequence
b'SLAFYIATFDIGTTEVKAALADRDGGLHFQRSIALETYGDGNGPVEQDAGDWYDAVQRIASSWWQSGVDARRVSAIVLSGQMQNFLPLDQDHEPLHRAVLYSDKRPLKEAEEINARHGADNLWSALENPMTAASILPKLVFWRASFPQAFGRLRHVVLGAKDYVVLRLTGRHATDRTNASTTGLYRPKDDAWHVELLADYGFSLDLMPRLLEPGEQVGGVSALAARQTGFVSGTPVLCGLGDAGAATLGVGVLDDEDAYLHLGTTGWLARLTQTDPVGDMPVGTIFRLAGIIAGKTLQVAPVLNAGNILQWALTLVGHRPGEDCAEYFHMAAAEVQGVTVPDGLLFVPYLHAERCPVELPAPRGALLGVTGATTRAQILLAVLEGAALSLRWCAELLGMEKVGLLKVVGGGARSEAWLRMIADNLNVSLLVKPDAHLHPLRGLAALAAVELEWSHSIQDFLREADLRSNILHPQPCDEGRRRRKFERFKQCVETLGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Xylulokinase
publication title Crystal structure of xylulokinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
source organism Chromobacterium violaceum
molecule tags Transferase
total genus 162
structure length 497
sequence length 500
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2009-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A01
2V7YA 5E26A 3P4IA 1SAZA 4BRDA 4FOIA 1DKGD 2FSKA 1GLLO 3M6GA 5AFUA 3VENA 2HMPA 3UKUA 4RWTA 2QWLA 5AQHA 2E2PA 4EFHA 3ZX2A 4PKHA 2FLOA 4BR4A 2QW9A 5AQSA 2EWSA 4JD2B 2E2NA 4MLEA 5BPLA 4H03B 2Q1NA 4HWIA 3ZETB 4ISFA 4H0PA 1WOQA 5AFUH 3CJ9A 4MO5A 3AY9A 3FR0A 3BF1A 4A2AA 1DEJA 2Q36A 5AQUA 4FSVA 4BC3A 4LC9B 5AQZA 1SZ2A 3MMVA 5AQXA 4DB3A 1BG3A 2P9KB 4B1XB 3KZBA 3UKRA 5B8HA 1Z6RA 2D0OA 3GDQA 2FSNA 5KPRA 3R6MA 3DXMA 3ZEUB 5KPZA 5AZIA 5AZJB 3WUHA 4JN4A 4WQ5A 1E4GT 4PKGA 4CBWA 2YHYA 1HKBA 2V52B 3HZ6A 1NMDA 4CZHA 3CHWA 1QQNA 4IWVA 1KAXA 2V7ZA 5KPTA 5KQDA 4H5RA 1QZ5A 4I6MA 4QS8A 4FPAA 4GY2B 1NGEA 3EO3A 1TYQB 2P9SB 4JHDA 5E84A 5JMVA 3W3DA 5EX5A 1BA1A 5LY3A 2CGKA 1BA0A 3HSCA 2A6AA 5AQOA 1GLBG 3FLCO 2ZGYA 5AQMA 3WT0A 3R9PA 1R59O 3L6QA 3S41A 4FPBA 2NLXA 4B1UB 4XH4A 3MN7A 3VGLA 1S22A 4AM6A 4BRLA 3VERA 1LOTB 1U2VB 3KVGA 4ISGA 2H3GX 3DAWA 3L4IA 2IVPA 2P9LB 3BF3A 3IMXA 4XH5A 2OANA 3D7EO 1HUXA 3DXKB 3QDKA 3SK3A 3FZLA 3U9DA 2BUPA 3H3OB 3FGUA 4Y0WA 3SLCA 5BPMA 1YXQA 3I8BA 2GTDA 4FWKA 4CZKA 1MWMA 1GLAG 2NZTA 2V51B 3M3ZA 4MO4A 5BN9A 2ZF5O 5FPDA 4CJ7A 3D2FB 3IDHA 1GLJO 1XC3A 3A0IX 2D1KA 3ZETA 4BRGA 4XEIA 2D4WA 1BOTO 1T6DA 4B1VA 4BC4A 3CJ7A 4E1JA 2QWQA 3U8XA 1Y64A 4BRAA 4FWOA 4H0YB 2Q2RA 4C23A 2FF3B 4J8FA 4EIAA 3GG4A 2P9KA 3KHYA 3GE1A 1C0GA 2VCPA 4BGAA 3MDQA 5JICA 3H46O 1JCEA 3LDPA 5ELZA 4WQ4C 3ZEUA 2E20A 5ADXA 3JXUA 4BROA 3A5LC 4H0OA 4CD3A 3LDOA 4WYBA 5AQRA 4BREA 3FZHA 3U9ZA 4BC2A 2WUSA 2P9UB 3A5OC 3QFUA 3QMLA 4IZ9A 4H0TB 4BRHA 4CZLA 2QWOA 1TYQA 2P9SA 3SJHA 1SQKA 3DJCA 3H3NO 5ADXH 1NGCA 1HKGA 4BRNA 2CGLA 4JAXA 3CETA 1QHAA 4BR7A 1NGFA 1RFQA 1YVNA 3VEYA 1YAGA 1TUUA 5F0XA 2E1YA 3VETA 5EY4A 3LM9A 1NWKA 3AARA 1HX1A 1NM1A 2GELA 2I7NA 2P9LA 2W41A 3CIPA 4BR9A 1BDGA 4BRQA 5AQNA 3QICA 4EHTA 3ULEB 2P9IB 1J6ZA 3VGMA 3F9MA 1EQYA 1GLCG 1BWFO 3WEEB 2DPNA 1T6CA 1YUWA 1GLEG 3D2FA 5AQQA 5AQPA 1ESVA 4BR2A 2QM1A 3HBTA 1T44A 3FZKA 3VF6A 1U6ZA 5AQFA 2E8AA 3EZWA 1GLDG 4B1WB 5LJVA 3RSEB 1NBWA 3R8EA 1ATNA 2CH5A 3M1FA 3CERA 4CBUA 3HI0A 3C7NB 4K42A 2Q97A 2IIRA 3FE1A 3LL3A 4M7YA 3QB0A 5F1XA 4BRMA 2QWPA 2YI1A 2GWKA 3HTVA 5EVZA 1P8ZA 5BN8A 3I33A 4BVPA 3GOIA 1GLFO 2A3ZA 2D0PA 1H1VA 3CQXA 3UKUB 5BR9A 2P9PB 2AA4A 3IFRA 4QS7A 3ID8A 4XH1A 4EHUA 3A8YA 2P9UA 3GL1A 2FSJA 1QQMA 1K8KB 5TKYA 1NGDA 3LM2A 5BRFA 3H45C 3MK6A 3G25A 2YJEA 2GUPA 2CGJA 4JNEA 4CZEA 3J8AA 1JCFA 3O5BA 3ATVA 4A2BA 2ASOA 4JD2A 1IG8A 2GWJA 5FPEA 3FFKB 3EN9A 2QWRA 3FZFA 1ATRA 3VEVA 1RGIA 3ATUA 1D4XA 2PBDA 2A41A 4WQ4A 3BP8A 3VEZA 5JLFA 1KAZA 2F9WA 3TPQA 3WXKA 5JLHA 5AZIB 3UB5A 3CJBA 2HF4A 1BUPA 5AQWA 4GNIA 2IVNA 1HJOA 3TU5A 3VESA 4H0VB 1DGKN 1X3MA 2ASMA 5AQIA 1NGBA 3ULEA 1V4SA 3QBWA 2P9IA 4BGBA 3VGKA 2Q0RA 3CI5A 5AZJA 1Z05A 2AP1A 3FZMA 4O8KA 5AQTA 4H5WA 2GEMA 5AQVA 4JHDB 3W0LA 4FOEA 5AR0A 2F9TA 4BVOA 4DQ8A 3CJCA 4H5VA 3B8AX 3RSEA 4H0XB 4KBOA 1BU6O 1TUYA 5EXWA 3A5MC 3AAQA 4NO7A 4CZFA 3MN5A 3C7NA 2FF6A 4CD1A 1X9JA 3EL2A 2Q0UA 3LDLA 1JCGA 1MA9B 3VF4A 4CZGA 4YDUC 3ZX3A 3H1VX 1NLVA 2VYPA 3O1BA 3O8MA 4H5TA 1KXPA 4NB4A 3IUCA 4BQZA 5KQ8A 1WUAA 4FWQA 2HOEA 2HF3A 1U2VA 4FWMA 3L0QA 4Z94A 2UYTA 2P9NB 2P9PA 3D2EB 2ZGZA 3O6WA 3WXIA 1ATSA 4BQLA 4BC5A 3DXKA 1K8KA 1MWKA 2PAVA 2A5XA 2W40A 3CJ1A 3CJAA 4FL9A 4BR5A 4RTFD 1NGIA 1V4TA 5AQYA 3A5NC 5BPNA 3QBXA 1NGHA 2A42A 3U4LA 2ASPA 4IJNA 4PL8A 1XQSC 4B1YB 1HLUA 3AAPA 3VEOA 2YCHA 4BRIA 3CQYA 5BRHA 4B1ZA 4FWNA 1BO5O 2I7PA 4DCHA 2A40A 4BG9A 2BTFA 1NGGA 4B9QA 4ISEA 2E2QA 4QS9A 1RDWX 4IO8A 2E1ZA 3EKSA 3VPZA 2CH6A 1HPMA 3SMPA 3VEWA 1QQOA 1X3NA 3HM8A 3C0BA 3ENOA 1LCUA 5AQJA 3WXJA 1C0FA 1G99A 4CZMA 5AQLA 4WQ5C 4FWSA 3O08A 2YJFA 1QZ6A 3O80A 3QFPA 5F2RA 3ZX0A 5BRDA 1CZAN 3VEXA 4L3QA 4FWLA 2IVOA 2QXLA 5AQKA 5CE3A 2ZWHA 2ITMA 5FPMA 1MDUB 3VF2A 1E4FT 4FWRA 4HTLA 3EKUA 4CBXA 4F9OA 5FPNA 2KHOA 4O5FA 3WQTA 2FXUA 3O1WA 3UE5A 2NRHA 4RCHA 4EAHD 4MLHA 5EOYA 3BEXA 2VWBA 2Q31A 3WXLA 3UKRB 3O4WA 4DHYA 1IJJA 3SMSA 4A61A 4M7XA 4H5NA 1XUPO 1Q18A 3DXMB 1ZXOA 4FWPA 1OKJA 1NGJA 2J4RA 4BRCA 2P9NA 3D2EA 3WQUA 4A62A 1HKCA 5AQGA 1ZC6A 4BRFA 1S3XA 2E88A 3H6EA 4BG8A 4PL7A 2YHWA 3OHRA 4M63C 4BRKA 4CZJA 4IJAA 1NGAA 4BRPA 3H1QA 3WEEA 3JS6A 4I6MB 5LJWA 5I9EB 4AM7A 4FO0A 3GBTA 3MN6A 4BR0A 2QWMA 3ENHA 1KAYA 3VOVA 3DWLA 4YDUA 2E2OA 5BREA 3MN9A 4K43A 4PKIA 3MCPA 4IXCA 4CZIA 3BUZB 3LDNA 2YHXA 3LDQA 1ZBSA 4K25A 4CI6A 4K41A 2QWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2RA 2HHQA 1TKTA 3K5NA 1KVAA 3KK2A 4BRDA 2HHUA 1A5VA 3M6GA 2ZE2A 3LP2A 4KI4A 2RPIA 3OJUA 2HMPA 5CR4A 4OPKA 1YITN 1W2BM 1JXEA 4M3RA 1QSYA 1UAXA 3PO5A 2QW9A 3G10A 4Y1CA 1JJ2M 1VK0A 4CGIA 1G15A 5BPLA 4H03B 3CCVN 4BY9C 5AFUH 3CYMA 3C94A 3AY9A 4FJIA 4A2AA 5HROA 1DEJA 3ZT2A 2Q36A 5AQUA 3B6OA 5C42A 4BC3A 5AQZA 2O8BB 3MMVA 3S3OA 1BG3A 5A2QO 3S3MA 3UKRA 2NRWA 3MXJA 4KTWA 2WTUA 1T03A 3R6MA 2UUCK 1RCHA 2WOMA 3N4PA 4WQ5A 3MEDA 2YX6A 4PKGA 4HUEA 4DF8A 4E7HA 4DTXA 4KI6A 1NMDA 4CZHA 1VSIA 3VA0A 1QQNA 4IWVA 1M1KO 1N8RO 5M1OA 1EKEA 4ELUA 1U4BA 3V1OA 4EP5A 5KPTA 4M3XA 1KVCA 4H5RA 1QZ5A 1TL1A 4I6MA 2WONA 3L2QA 4FW2A 3O4QA 2P9SB 5E84A 5JMVA 4AQYK 3PV8A 5AQOA 1GLBG 4DSEA 1FXXA 1ASUA 3ULDA 4FZXC 1R59O 1UA0A 2XY7A 1L5UA 4DF4A 2NLXA 3O9UA 4CF1A 3VERA 1LOTB 3QETA 4UY8O 3U6FA 4ISGA 4CEAA 3SJJA 3L4IA 1OH7A 3H08A 4NYFA 4XH5A 3OY9A 4F2SA 3D7EO 1HUXA 4O5BA 3NE6A 4BDZA 3FZLA 3U9DA 4Y0WA 4DKWA 4Z4EA 4CZKA 4YHHK 1MWMA 1GLAG 1WSGA 4MO4A 4QOZB 2BANA 1WSHA 5BN9A 1Q86O 4AHTA 4IG3A 3A0IX 2D1KA 3ZETA 4XEIA 4BC4A 3CJ7A 5E41A 3CM6A 4IOXA 2D0BA 3OYAA 2FF3B 4J8FA 4W5RA 1C1BA 3GG4A 4AHVA 3SUQA 3KHYA 1C0GA 2VCPA 4NXNK 3L2WA 4BGAA 3G71N 5HOOA 5JICA 4JKCA 1JCEA 3LDPA 4LF5K 1JLFA 3I0RA 5SZTA 3C6AA 5HRSA 1W9HA 4ID5A 5C2FA 1JLGA 3A5LC 3QLHA 4H0OA 4CD3A 3THWA 2KFNA 4BC2A 3G4SN 2KKZA 2HNZA 1VQ6N 3TAMA 1WBDA 4JV5K 4IFEA 1TYQA 2G8UA 1NGCA 1YJNN 1L3VA 4X65K 4YOWA 1TK8A 4JAXA 1LWCA 3CETA 4Z4FA 3J7ZO 1XNRK 4CHYA 1NGFA 4M3ZA 4A5BA 1SL2A 1EWRA 2HBJA 3K5LA 1HNVA 3FFIA 1YAGA 3BGRA 4G1QA 3TTFA 5DK5A 3J7YP 3SAHA 3AARA 1M90O 1HX1A 3Q7BA 3BDPA 1JLCA 1EETA 2W41A 3AVJA 1HYVA 3AA4A 4BR9A 4PHTX 2BDPA 3QICA 4EHTA 2KLAA 2JWLA 3ENBA 2FC0A 4LH4A 4CK3A 3SQ4A 4M3YA 1BWFO 4W5OA 3NH1A 1T6CA 1YUWA 5AQQA 4BDPA 5AQPA 1ESVA 2QM1A 3SAFA 2D0AA 1T44A 3DYAA 4KKOA 3VF6A 5AQFA 5LJVA 1NBWA 1ATNA 2CH5A 4RW9A 4OO1J 5J2QA 3AVFA 1W0HA 3K57A 2IIRA 3TARA 3LL3A 4BACA 1ZBLA 3D6RA 1NJXA 3T69A 3SAGA 2O8DA 1SS6A 2OPSA 2F8SA 4LSLA 1IKVA 1GLFO 5BR9A 2PFUA 3DLRA 4BWJA 4CJEA 4FK2A 2P9UA 3HPGA 4DSJA 5BRFA 3V6DA 2HNYA 4A59A 4DU1A 3EY1A 2F96A 2GUPA 4CZEA 3PIOL 3J8AA 4YNQA 3TANA 3K59A 4CHQA 3QESA 1RT6A 1X9SA 4FLYA 4F3TA 3L2RA 4BE2A 3F2KA 5I3UA 1RGIA 1D4XA 1JXBA 2PBDA 3VEZA 4FVMA 2HBMA 4Z4GA 2F9WA 3TPQA 1K73O 4JKBA 4JI8K 4C8LA 2IVNA 3MXMA 3OYJA 4H0VB 4LD0A 4DQIA 1V4SA 4JS5A 3T1YK 4LF6K 3VGKA 3KIOA 4O8KA 1KFDA 3EYZA 5FDLA 3I56N 4CVNE 4CERA 5AQVA 4GV3A 4JHDB 5AR0A 4JKHA 4DQ8A 2QTDA 3RSEA 1T8EA 3CM5A 4H0XB 2ZJQL 4AHRA 2IC3A 2FF6A 1K6YA 4C1NI 4FLXA 2OA8A 1CZBA 2Q0UA 1JCGA 4CJ4A 1MA9B 4CEOA 4CZGA 2IOCA 3H1VX 3HK2A 2VYPA 3O1BA 3O8MA 4FLZA 1TKXA 1LV5A 3IUCA 4OPAA 4OLBA 1U2VA 1FKPA 3LZIA 4W5NA 4GV9A 3WNFA 2P9PA 3D2EB 1C0TA 2ZGZA 2ZJRL 4BQLA 4BC5A 4ILHA 1OVQA 1K8KA 2PAVA 3DXKA 4DSKA 3VA3A 4V19S 5BPNA 3QBXA 1RDUA 3JSMA 4PL8A 1XQSC 2W6LA 4B1YB 4CIFA 4DR3K 2YCHA 3CFPA 4DV0K 1VQON 5BRHA 4DV4K 4DCHA 3O3GA 4E7JA 5J2MA 2E2QA 4WF9L 3EKSA 2OZMA 4CJQA 2ITGA 4N5SA 3OYFA 3AVCA 4JI6K 5FRNA 3IAYA 1LCUA 3WXJA 1G99A 3OYKA 1JLBA 3OBWA 5DMRA 3SZ2A 1JKHA 1KC8O 1NOYA 4CF8A 4H4MA 1QZ6A 4B9NA 1OH8A 4CESA 1NK9A 3B6PA 4JI4K 4WFAL 3ZX0A 4FWLA 3KLFA 4CF2A 4CHPA 4JI5K 2ITMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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