3HZ6A

Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
500
structure length
497
Chain Sequence
SLAFYIATFDIGTTEVKAALADRDGGLHFQRSIALETYGDGNGPVEQDAGDWYDAVQRIASSWWQSGVDARRVSAIVLSGQMQNFLPLDQDHEPLHRAVLYSDKRPLKEAEEINARHGADNLWSALENPMTAASILPKLVFWRASFPQAFGRLRHVVLGAKDYVVLRLTGRHATDRTNASTTGLYRPKDDAWHVELLADYGFSLDLMPRLLEPGEQVGGVSALAARQTGFVSGTPVLCGLGDAGAATLGVGVLDDEDAYLHLGTTGWLARLTQTDPVGDMPVGTIFRLAGIIAGKTLQVAPVLNAGNILQWALTLVGHRPGEDCAEYFHMAAAEVQGVTVPDGLLFVPYLHAERCPVELPAPRGALLGVTGATTRAQILLAVLEGAALSLRWCAELLGMEKVGLLKVVGGGARSEAWLRMIADNLNVSLLVKPDAHLHPLRGLAALAAVELEWSHSIQDFLREADLRSNILHPQPCDEGRRRRKFERFKQCVETLGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Xylulokinase
publication title Crystal structure of xylulokinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
source organism Chromobacterium violaceum
molecule tags Transferase
total genus 162
structure length 497
sequence length 500
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2009-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A01
5E26A 4BR7A 1Z6RA 3BUZB 1NGHA 3B8AX 4I6MA 3O1BA 2P9UA 3U4LA 2Q31A 2F9TA 3AY9A 4H5WA 4EHUA 4RTFD 5AQRA 4FWQA 3H3NO 3GE1A 4CZJA 4BRHA 2FF6A 3LDNA 3M1FA 5EVZA 4BQZA 1GLEG 1GLDG 4DCHA 1D4XA 1ATRA 4PKIA 3VF6A 3RSEA 1RFQA 4H03B 1K8KA 2CGLA 2Q1NA 1GLFO 4WQ4A 2P9LA 3EL2A 1KAXA 3DXKA 3CJ1A 2PBDA 3FE1A 3O4WA 1JCEA 2Q2RA 3LL3A 5AQHA 3QMLA 3ZEUA 3VERA 2E2OA 5ELZA 2E88A 4PKHA 4BC2A 4M7YA 2YJEA 4FWMA 4MO5A 2UYTA 3VPZA 1Q18A 1U6ZA 2ZGZA 4BRKA 2CGKA 5AFUA 1BDGA 4NO7A 1YAGA 1NM1A 5BRFA 3H3OB 3CERA 4O8KA 1P8ZA 3U9ZA 2Q97A 4BRNA 3LM9A 1BG3A 3MN9A 2ZF5O 5F2RA 3U9DA 4CZMA 3ULEB 3GBTA 2FLOA 4CZFA 1R59O 4I6MB 4FO0A 2DPNA 2P9UB 5LJVA 4H0OA 1QQNA 2V7YA 1NGEA 1ATNA 3CIPA 4CBUA 3DXMA 1QQOA 2IVPA 3J8AA 4FL9A 4BC5A 3CJ9A 3M3ZA 3VEZA 3MCPA 1X3NA 3HM8A 2FSNA 1JCFA 1KAYA 1NGFA 1YVNA 4BRGA 3R6MA 3CI5A 4H0TB 3SMSA 1IJJA 5EOYA 5AQQA 3VETA 1XC3A 2P9KA 2Q0UA 5AQSA 5FPMA 2AA4A 5KQ8A 4B1YB 4BC3A 5AZJA 3S41A 4BRDA 4CBWA 5KPTA 1JCGA 4FWRA 1MWKA 1SZ2A 3CHWA 1U2VA 4K41A 1QHAA 1C0FA 4BRIA 2GUPA 1BA0A 4AM7A 3EO3A 3O08A 3R9PA 3H46O 4L3QA 3W3DA 2NZTA 1LOTB 1T6CA 3CETA 3UKRB 4MO4A 3DJCA 4YDUA 3D2EA 3D7EO 4MLHA 3UKUB 3ATUA 3IUCA 2Q0RA 4A2BA 3F9MA 3MN5A 2YJFA 2D0OA 1LCUA 3QICA 3SLCA 2VCPA 1J6ZA 4BREA 2BUPA 2QWPA 5E84A 3KZBA 3KHYA 3QFPA 5AFUH 3DXMB 3GG4A 5KPRA 4JAXA 5AQFA 3O1WA 4RCHA 2H3GX 3A5MC 3AAPA 2PAVA 3BF3A 3VEYA 1NGAA 3QBXA 2YHXA 3FZHA 4ISGA 4KBOA 4EHTA 5AQZA 2D4WA 2WUSA 3HZ6A 5BRHA 3D2FA 5BR9A 4CZHA 3FZKA 3SJHA 3UB5A 4EFHA 2A3ZA 1NGIA 4B1WB 5LY3A 4FWOA 3IMXA 3O5BA 1H1VA 2E1ZA 2QWOA 1KXPA 5BRDA 2QM1A 2QWRA 1C0GA 3EKUA 2P9PA 4GNIA 4GY2B 4JN4A 3VEVA 1U2VB 5KPZA 2NRHA 2HF3A 3TPQA 2E2QA 3ZX0A 4XH5A 5AQNA 3MN6A 3VESA 3A0IX 2ITMA 3ZX2A 2QWQA 4MLEA 2FF3B 2CH5A 3P4IA 4H5VA 5FPNA 3WQTA 2P9SA 4QS7A 4BRQA 1NGDA 1SQKA 2FSKA 4ISFA 5AQWA 1WOQA 3WT0A 4B1XB 4BR5A 3O80A 4AM6A 4Z94A 5AQVA 4JD2A 4H5NA 3W0LA 5EX5A 2ASPA 5I9EB 2A41A 1T6DA 4CI6A 4XH1A 4CZEA 5AZIA 1V4SA 2QWNA 2D0PA 3KVGA 3CJAA 3H45C 3C7NA 4BVOA 3QFUA 4FWLA 4CZIA 1XUPO 3VF2A 4IO8A 4BVPA 4M7XA 5CE3A 2CGJA 2FSJA 1NLVA 2V7ZA 5AQJA 3WEEA 3EZWA 4A2AA 1DEJA 1GLJO 2YCHA 2VWBA 4C23A 2AP1A 3O6WA 3D2FB 3RSEB 5KQDA 1OKJA 1K8KB 4BGBA 2YHWA 5JMVA 3VOVA 4B1UB 1IG8A 1NGBA 1XQSC 4DB3A 1NWKA 1X9JA 2GELA 3R8EA 1V4TA 4BR0A 4CZLA 2P9LB 1WUAA 2QWMA 2P9PB 3A8YA 1BUPA 2QXLA 3DWLA 3DXKB 4Y0WA 4WQ5A 2D1KA 3GDQA 3H6EA 3ENHA 3A5NC 3ZEUB 1GLCG 4JNEA 5AQOA 5AQTA 4EAHD 2P9IA 3FR0A 2KHOA 4BRMA 3CJCA 4J8FA 1QQMA 1NGCA 4IJNA 3AARA 4DHYA 1Z05A 4DQ8A 1S3XA 2CH6A 4H0PA 5AQGA 3HBTA 3C0BA 3ATVA 3CQYA 1TUYA 3WXKA 4O5FA 4FWNA 3VEOA 1ATSA 4LC9B 3LM2A 3HSCA 5AQXA 3ZETA 5AR0A 2IVOA 3JXUA 5AZIB 1E4GT 4FWKA 5BN9A 1RDWX 3VEWA 3FZLA 4BR2A 3AAQA 3QBWA 1ESVA 3SMPA 5TKYA 4BR9A 4IJAA 3FZMA 5LJWA 2ASMA 3WEEB 4BG9A 2P9NA 2ASOA 4B9QA 2HMPA 4FWSA 3TU5A 4B1VA 1HKBA 4HTLA 4WQ4C 5F1XA 2V52B 2A6AA 1S22A 2E8AA 5JLHA 4IXCA 4F9OA 4ISEA 4QS8A 4M63C 5BPMA 2QW9A 1BO5O 3A5OC 1X3MA 3MMVA 4FWPA 2A42A 1TYQA 1QZ6A 2P9KB 5AQKA 4K43A 3VGKA 4BC4A 1NBWA 5AZJB 4E1JA 3HI0A 3FLCO 2OANA 3VGLA 3OHRA 1CZAN 4BRLA 3IFRA 5AQYA 4PL8A 5ADXH 1YXQA 4QS9A 4IZ9A 1SAZA 2W41A 4BRPA 1MDUB 2E1YA 2P9IB 2VYPA 3WXLA 3O8MA 3IDHA 4CD1A 4A61A 3HTVA 4PKGA 1HUXA 1NMDA 2I7PA 1QZ5A 1MWMA 1Y64A 3D2EB 3QB0A 3UE5A 2E2PA 4K42A 4A62A 4JHDA 5FPDA 3ZETB 1ZXOA 2EWSA 1TUUA 3CJ7A 4CZGA 3VENA 2E2NA 3EN9A 4CD3A 3LDLA 3WQUA 3M6GA 2Q36A 3LDPA 3MDQA 2J4RA 1G99A 3SK3A 5B8HA 5F0XA 1NGGA 4BR4A 2HF4A 3GL1A 2A40A 3LDOA 3DAWA 5BPNA 2GWJA 3H1QA 1HJOA 5AQIA 2P9NB 4FOIA 3VF4A 1HX1A 2GWKA 4CBXA 2A5XA 4HWIA 3WXIA 3UKRA 2F9WA 2YI1A 4H0YB 2GTDA 5AQPA 4WQ5C 5ADXA 3FFKB 3FGUA 2FXUA 5EXWA 4NB4A 3UKUA 4BROA 1TYQB 5AQUA 1HPMA 5BN8A 5JLFA 1DKGD 1MA9B 5AQLA 1GLAG 4H5RA 1YUWA 1GLBG 3H1VX 3JS6A 3LDQA 1T44A 4FPAA 3L4IA 4YDUC 4BGAA 2IVNA 3GOIA 1HKCA 4BRCA 5BREA 4FPBA 1KAZA 2ZGYA 3G25A 3FZFA 1ZBSA 5EY4A 5BPLA 4FSVA 2P9SB 4H5TA 1BWFO 1EQYA 1HKGA 4IWVA 4JHDB 1DGKN 3CJBA 4JD2B 4CZKA 1BOTO 3EKSA 3L0QA 4PL7A 4H0VB 2ZWHA 3U8XA 3VEXA 3WUHA 1ZC6A 3BF1A 2E20A 3CQXA 3I8BA 3WXJA 4EIAA 3ZX3A 3C7NB 2I7NA 4B1ZA 3L6QA 4WYBA 4RWTA 2QWLA 5AQMA 4FOEA 1RGIA 3VGMA 4XH4A 3ID8A 4BRAA 1BU6O 5JICA 2HOEA 3MN7A 4BQLA 2YHYA 3I33A 4BRFA 1NGJA 1BA1A 4BG8A 5FPEA 2BTFA 2W40A 2V51B 1E4FT 4K25A 4XEIA 1HLUA 3MK6A 1GLLO 2GEMA 3ENOA 4H0XB 2IIRA 3BEXA 3QDKA 4CJ7A 2NLXA 3A5LC 3BP8A 3ULEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E26A 1SL0A 4CJ3A 1NGHA 2P9UA 3U4LA 4KH5A 3AY9A 5EU7A 3K9JA 4EHUA 4DV2K 3GE1A 1JL2A 1UA0A 4DTMA 4WFNL 3LDNA 2OPSA 3E9PA 1GLDG 4CHPA 4DCHA 3VF6A 1S9EA 3F5TA 1LW0A 4M3RA 4AHVA 4FK2A 4Z0UA 4CW7B 3RMCA 1SL2A 3HSTB 3KWIA 3T1YK 3PIOL 2IC3A 1ZBFA 2P9LA 4DTSA 1KAXA 2QI2A 3FE1A 2HBMA 2Q2RA 3LL3A 4UQGA 2E2OA 3LPUA 4OPHA 1C6VA 4PKHA 4BC2A 3CFRA 3HO1A 4FWMA 1OVQA 2UYTA 2FBTA 3KWGA 3SCXA 1U6ZA 3TAPA 1XMOK 1KLNA 1RDAA 4CEFA 1BDGA 4NO7A 1YAGA 1NM1A 4KFBA 3M8SA 4FZZA 1VHXA 4M3WA 3CERA 2Q97A 1IO2A 3L4QA 4DLEA 1BG3A 3VMFB 3MN9A 4LFCK 4CZMA 3F9KA 4KKOA 3ZSZA 5LJVA 4B3SK 2V7YA 1QHTA 3NH0A 3CIPA 4YFUA 3ZT0A 4HUEA 4YOYA 3KIOA 4DV7K 3TAQA 1YVNA 4H0TB 4E3SA 2UU9K 3SMSA 4RW9A 3OJUA 5EOYA 5AQQA 3L2VA 3VETA 3KK1A 5IT9O 2P9KA 4ID5A 2AA4A 4Y1CA 5AZJA 4DSJA 4DS4A 4YORA 5KPTA 1VRUA 2HHXA 4FWRA 3CHWA 4DFJA 4K41A 3BZCA 4FK0A 3LANA 4B9LA 2WOMA 1C0MA 4AM7A 3H46O 1GOAA 4ZHRA 3CETA 3UKRB 3K57A 2RE2A 4C8KA 4CF1A 4WCEL 2DY4A 3D7EO 4X64K 2ATQA 4MLHA 3ULDA 2ZE2A 3FFIA 4W5NA 4CIGA 4OJRA 3SLCA 2BUPA 4ID1A 5E84A 3ASMA 3KHYA 3QFPA 3WXMB 1C1BA 1Q7YO 3GG4A 5KPRA 3QNNA 4JAXA 1VQ7N 3O9UA 1A5XA 2YHXA 4EHTA 2Z1JA 2D4WA 3AVCA 1T7PA 4FJJA 3BY5A 3OVNA 5CZ1A 3FZKA 4PY5A 3CXCM 3OYLA 3CFOA 1H1VA 1LWFA 3C65A 4FJLA 3HPHA 2VQEK 4BWMA 4JKHA 4HHTA 2QWRA 4CJQA 4JI8K 5AQNA 3P38A 1VSFA 4JKEA 2ITMA 2QWQA 2DFEA 2FF3B 3P4IA 4BRQA 1NK9A 2UXDK 1IBMK 4I2PA 3WT0A 1WOQA 4BR5A 3G6EN 4IFEA 1VSKA 3SAHA 2OPRA 4JI2K 5EX5A 2ASPA 2PYLA 4GV6A 3H45C 1T05A 1T03A 4BVOA 4DFKA 4DLGA 3THYA 2IAJA 4DU4A 3QFUA 1YJ9N 3PX4A 2FSJA 3WEEA 3EZWA 2O8EA 3HK2A 3RRHA 1CZ9A 3I56N 2XO7A 3EZ5A 3CQ8A 1KVCA 1B9FA 4DQSA 2O8CB 1OKJA 3TWHA 4M3YA 4BGBA 4IOXA 1LWEA 4IBNA 2YHBA 4B1UB 3OYNA 1IG8A 1XQSC 1S1WA 3HP6A 4JKDA 1RT5A 2QWMA 1LAWA 2QXLA 3DXKB 5J2MA 3HVRA 1NJZA 4V19S 4HTUA 3EYZA 3PO5A 2FC0A 4NYNA 2D1KA 2OTLN 4KTQA 5I42A 1GLCG 4CCHA 4JRQA 3M5RA 3VQBA 1QQMA 4Z4FA 3NGZA 4JV5K 4DHYA 4B3TK 4H0PA 4CJWA 3ATVA 1ZBHA 3CQYA 4DQIA 3OS2A 4Q5VA 4O5FA 4QOZB 3LM2A 2HNYA 3JXUA 5AZIB 1T3VA 1KCFA 4FJIA 5BN9A 4KRFA 2UXBK 5J2PA 4DSKA 2WC9A 3AAQA 4B3RK 3OYGA 3NHGA 3VQPA 4CF9A 2PZSA 5LJWA 2RF2A 1DTTA 4C8LA 4DU3A 1RT3A 4N41A 5F1XA 1HKBA 4WQ4C 4E7JA 4JI1K 4AHSA 3JAMO 2W42A 2JWKA 3AVKA 4EZ9A 4AHTA 5C25A 1NMNA 3MEGA 3VGKA 4DF4A 4BC4A 4E1JA 4I2QA 2OANA 1CZAN 3E9LA 1YXQA 1A5WA 3NGIA 4QS9A 1N8RO 4IZ9A 4BRPA 3JYTA 3VTHA 4C8MA 5E41A 3V9XA 2KZMA 2PFUA 1I39A 3HTVA 3NAEA 4GVMA 1XHZA 3AA5X 2HHHK 1QZ5A 1HPZA 4OGCA 1Y64A 4C1NI 1OH7A 3D2EB 3UE5A 3AVJA 3OYEA 3Q7CA 2EWSA 4L8RB 4CD3A 1VSEA 3LDLA 3M6GA 4FLZA 4CFCA 4FLVA 2Q36A 1QE1A 2JLEA 1QVFM 3EE8A 4FYDA 4DTUA 5BPNA 5KRSA 3H1QA 1J53A 2NNWA 1HJOA 2P9NB 3MWTA 4FOIA 1K8AO 3MX2A 2GWKA 4LSNA 2BH1A 3THXB 3WXIA 3J7YP 3UKRA 2YI1A 1WSHA 2GTDA 4B9TA 3FFKB 4IEEA 2G8WA 3RRGA 4NB4A 3S3NA 4BROA 1D9FA 1TYQB 4WFBL 4NCBA 5JLFA 1DKGD 1JLCA 1MA9B 2Z1GA 4KHSA 1Q82O 2O4GA 2RHKA 3K9KA 3VQ4A 4F2SA 1ILYA 3L4IA 4BRCA 5HOOA 3P5JA 5BREA 1P90A 2EHGA 2ZGYA 3G25A 5BPLA 4ILGB 4H5TA 1HKGA 2W6KA 4PUOA 4IWVA 1QS4A 4K8ZA 4JD2B 1BOTO 3AV9A 4CFBA 5HRNA 4F8RA 4H0VB 2ZWHA 3PV8A 2OPQA 2HNDA 1ZC6A 2E20A 3WXJA 4LF6K 3ZX3A 2I7NA 3P1GA 1I94K 4E7HA 4OPAA 2QWLA 3QEXA 4G1QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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