2P9PB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
190
structure length
184
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEVGVAELLFNTIQADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 50
structure length 184
sequence length 190
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9pB02
1BOTO 5FPMA 1RFQA 3O6WA 4WQ4A 1X9JA 3H45C 4M63C 3U9ZA 2WUSA 4H0TB 2OANA 3KZBA 3KVGA 1C0FA 1NWKA 3U8XA 1Z05A 2E2QA 3HM8A 2NLXA 4XH1A 3C7NA 2YHWA 4CZFA 4PKIA 4BROA 4BC2A 3H6EA 5AQRA 3VETA 2ASPA 3GBTA 1RGIA 1QZ6A 2QWRA 4BR9A 1JCFA 4M7YA 4JHDA 2E20A 4MLHA 3A5OC 2E1YA 4B9QA 5JMVA 2E2NA 3IDHA 2FSKA 4O8KA 2QM1A 3FR0A 4GY2B 1ATRA 3AAPA 2E1ZA 3VEXA 1LOTB 5BN9A 2A40A 3UKRA 3AY9A 5EOYA 4BRKA 4B1VA 3I8BA 3SMSA 1ESVA 1T6CA 4QS7A 3HZ6A 2YJFA 1TYQB 5KPRA 3CERA 4B1WB 1HPMA 1HJOA 3ULEB 4MO4A 4CZJA 4FWMA 5BPMA 3ATVA 4H0XB 1G99A 3CIPA 5E84A 5AQYA 3RSEA 3M3ZA 5AQZA 3WEEB 4JN4A 3CETA 5EXWA 1NM1A 2P9LB 3CQYA 4JNEA 4IXCA 4BRCA 3CJ7A 2FSJA 4WQ5C 1MA9B 3M6GA 5AQJA 2A3ZA 2A5XA 2AA4A 4H5TA 2QWQA 3DXMA 3MCPA 4H5VA 1KXPA 2HF3A 4FWSA 2F9TA 5JLHA 2CH5A 3GG4A 3ZETA 3DXKA 3VGMA 3CJAA 4B1XB 3CHWA 4CZIA 1D4XA 1U2VA 3VEZA 4B1UB 5AZIA 3MK6A 1HKCA 3WQTA 3VEOA 4K25A 3IMXA 5AQSA 2Q2RA 4H0OA 4CBXA 5JICA 1NGHA 1U6ZA 2NRHA 1YAGA 4EAHD 3D2FA 3FZFA 4CI6A 3MDQA 1NGAA 4QS8A 4EHTA 2QXLA 2ZGZA 3HTVA 2V7ZA 4CZMA 2P9UA 4CD1A 3L6QA 2YCHA 4ISEA 3FLCO 3MN7A 1J6ZA 3A8YA 5FPNA 2KHOA 3IFRA 3W3DA 2PBDA 3ENOA 4I6MB 4Y0WA 2Q0RA 3LDNA 4QS9A 4CZEA 3R8EA 4BR5A 4A61A 3LM9A 5AQKA 3ZEUB 4PL8A 2GEMA 1EQYA 1X3MA 3G25A 1CZAN 3WUHA 3BF3A 3EL2A 3A5MC 3FZMA 3EKUA 3WXKA 5KPZA 2D0OA 2Q31A 3O80A 2IIRA 3VESA 2YHYA 1BWFO 1X3NA 5BN8A 3D2EB 2P9IA 4BC4A 2W41A 4FWRA 3VEVA 4CZKA 1BA0A 1Q18A 2QW9A 1GLEG 1YXQA 5AQOA 3W0LA 4BRGA 3P4IA 3DWLA 2Q0UA 3U9DA 2GUPA 1KAYA 2V7YA 3FE1A 1BA1A 4BC5A 4FPAA 4O5FA 4Z94A 5AQGA 4ISFA 2VCPA 1WUAA 1TYQA 2P9PA 1BG3A 2P9KB 4YDUC 5AFUH 3J8AA 2YJEA 4JD2B 5AZJB 2P9SA 3H1QA 4ISGA 3MMVA 5AR0A 5F0XA 2YI1A 3WEEA 1SAZA 2P9LA 4KBOA 1NGIA 4EIAA 5AQVA 3LL3A 4H03B 4DQ8A 1TUYA 2F9WA 4DCHA 2A6AA 3VERA 3HSCA 1GLLO 1T6DA 4FWOA 3EN9A 3HBTA 2E8AA 4CZLA 3LDPA 1DEJA 3A0IX 4YDUA 5AQPA 3IUCA 3F9MA 5EX5A 5AQFA 1NLVA 4XH5A 4BVOA 2GTDA 3CJBA 3QMLA 2P9NB 5AQQA 3A5NC 3FZKA 4GNIA 3WXJA 1H1VA 3VF6A 4B1ZA 4K42A 3MN6A 5BPNA 1C0GA 4IO8A 2E2OA 2ASOA 4JHDB 4BGAA 4BGBA 5F2RA 3VPZA 3CQXA 5LJWA 3LM2A 1IG8A 1E4FT 3VEYA 1RDWX 2I7PA 3A5LC 3FFKB 1GLCG 5EY4A 3O8MA 4M7XA 4AM7A 3BUZB 3UKRB 1NGDA 1V4SA 2H3GX 2FSNA 4IZ9A 5KQDA 1MDUB 3LDOA 3SMPA 4XEIA 4RCHA 4K41A 2HOEA 4NB4A 3WXLA 5BRFA 1NGFA 4BRAA 3QICA 4BVPA 1E4GT 3ZEUA 3LDLA 4WQ5A 1WOQA 1K8KA 1JCGA 1SQKA 4C23A 1OKJA 4BRLA 5ELZA 2A42A 4PKHA 3RSEB 3BP8A 3O08A 1QQOA 3GL1A 5AQMA 2QWMA 5FPEA 1YVNA 1P8ZA 4RTFD 3FZHA 3D2EA 3SK3A 2J4RA 2HMPA 1YUWA 2FF3B 3DXMB 4J8FA 1MWKA 2Q1NA 4BR7A 4BRHA 5FPDA 2AP1A 4BRPA 4XH4A 5BPLA 1XQSC 3OHRA 3VGLA 4NO7A 5ADXA 4RWTA 1KAZA 4FPBA 4MLEA 1GLJO 2CGKA 3C0BA 3U4LA 3UKUB 4CD3A 1U2VB 1ZC6A 5E26A 5AQLA 4BRIA 2VYPA 5CE3A 4EHUA 1HKBA 3VOVA 1HX1A 5F1XA 3CJCA 3S41A 4BRNA 1MWMA 5AZJA 4IWVA 3R6MA 1BO5O 4K43A 4BR2A 3H1VX 3D2FB 1XUPO 4CBWA 4AM6A 4IJNA 2EWSA 4FSVA 3O1WA 1JCEA 2I7NA 2QWNA 2ZGYA 4CZGA 1HKGA 5I9EB 4MO5A 4L3QA 1SZ2A 4BC3A 3QDKA 4PKGA 4BRDA 3QBWA 4B1YB 3ULEA 3QFPA 1ATSA 3SLCA 3ZX0A 3AARA 1Z6RA 2E88A 1BU6O 2NZTA 5AQUA 1NBWA 2CGJA 1BUPA 1HUXA 1ZXOA 2P9NA 3BEXA 3TPQA 2DPNA 2E2PA 2QWOA 4JAXA 2A41A 4A62A 2GWKA 3O1BA 4FWNA 4FOEA 3AAQA 4FOIA 1BDGA 4HTLA 5AQHA 1QHAA 3EO3A 3TU5A 2BUPA 5BRDA 2FXUA 2P9IB 4BRMA 1NMDA 2QWPA 5AQWA 4BR4A 3WXIA 1IJJA 3C7NB 5B8HA 3L4IA 4FO0A 4H5RA 1S3XA 3JS6A 3VF2A 4FWKA 3B8AX 2GELA 3GOIA 2BTFA 3DAWA 3CI5A 1NGGA 4FWQA 3H3OB 5LJVA 2IVNA 1NGEA 4A2BA 5ADXH 2P9PB 3CJ1A 2CH6A 4DB3A 3UB5A 3BF1A 5AQIA 1V4TA 5TKYA 4A2AA 4F9OA 2IVOA 2P9SB 2D1KA 3L0QA 4LC9B 4DHYA 3CJ9A 3EZWA 2VWBA 1R59O 2IVPA 2PAVA 3QB0A 1DGKN 4EFHA 2UYTA 3O5BA 1XC3A 1NGBA 1NGCA 5JLFA 3GE1A 4H5WA 3JXUA 4I6MA 2FF6A 3VENA 4BG9A 1DKGD 4BRQA 1GLBG 1ZBSA 3VGKA 2V52B 4BREA 4CBUA 1Y64A 4H0VB 4FL9A 1LCUA 1ATNA 5AFUA 1S22A 3UKUA 3MN9A 5EVZA 3ENHA 2Q97A 3R9PA 4BRFA 1QZ5A 3H46O 3FGUA 3EKSA 2D0PA 2FLOA 4BQLA 5BRHA 4CZHA 4H0YB 1QQNA 3M1FA 5BR9A 3O4WA 4IJAA 3WQUA 2CGLA 4E1JA 2ZF5O 4BQZA 1QQMA 2GWJA 2YHXA 4BR0A 5LY3A 1T44A 3SJHA 1NGJA 3I33A 2W40A 4FWLA 1GLDG 2D4WA 5BREA 3UE5A 3ZETB 4PL7A 5KPTA 3DXKB 4WYBA 4CJ7A 1GLFO 3QBXA 3HI0A 3H3NO 4WQ4C 5AZIB 2V51B 2HF4A 2P9KA 4H0PA 3ATUA 3D7EO 1KAXA 4H5NA 4HWIA 4JD2A 5AQNA 3ZX2A 3QFUA 5KQ8A 2ASMA 3VF4A 1K8KB 2Q36A 4FWPA 5AQXA 2ITMA 3GDQA 3VEWA 3LDQA 1GLAG 2ZWHA 1HLUA 3ID8A 3KHYA 5AQTA 3MN5A 3WT0A 2P9UB 4BG8A 3FZLA 1TUUA 3DJCA 2QWLA 3ZX3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GV9A 1D8YA 5FPMA 4KB0A 3O6WA 4KH4A 4WQ4A 3NMUA 1S1UA 1NJIO 3DI6A 1FK9A 3J7YP 1LWCA 2NLXA 3NF7A 4E19A 4CJSA 3SUQA 2YHWA 2NNWA 4BC2A 3MX2A 1W2BM 5AQRA 3VETA 4X65K 3CCVN 1X9SA 4M7YA 3DRRA 4MLHA 1YTUA 4FJ9A 4C1NI 4B9QA 4FM2A 5JMVA 2FSKA 2HHTA 4FZZA 3AAPA 3TI0A 4DSLA 4N56A 1GOBA 3CCEN 1YF5L 3UKRA 4JI0K 3VQPA 3AY9A 3DLRA 3OYAA 3SMSA 2G8HA 3QLHA 4CW7B 2PFUA 2BDPA 5KPRA 3VQ6A 5GIOA 1HPMA 3LALA 4CJLA 4CZJA 2HNYA 1G99A 4F2RA 4WFAL 2PY5A 3RSEA 5AQYA 2BE2A 2O8EA 3PO4A 1NK4A 1W9HA 1ASWA 2O8BB 4OGEA 3V9WA 3A2FA 4ID5A 4BRCA 3CJ7A 2A3ZA 3T3FA 4DSFA 4YOXA 3OBYA 3S9HA 4CJTA 4DQQA 3VGMA 5M1KA 3CD6N 1U2VA 1T03A 4CERA 1HNXK 4YOTA 1QSYA 3MK6A 3SUNA 1WBDA 4K25A 1Y97A 2HBKA 5JICA 3KLFA 2NRHA 1BIUA 4EAHD 4OKJA 3KK1A 2W42A 2QXLA 1QSSA 3EYZA 2F8SA 2IDOA 4CD1A 3L6QA 4HHTA 5LL6Z 2Y1IA 3CG7A 3J81O 1YJWN 3SBGA 4NYNA 3LDSA 4JI3K 2KHOA 4KH5A 3IFRA 3ZSQA 2O8DB 2PBDA 4DQIA 4Y0WA 3LM9A 3ZEUB 3HYFA 2HNZA 2GEMA 1C1BA 4J2AA 1X3MA 1CZAN 4JI6K 3FZMA 4JKEA 3WXKA 4OJRA 5M1NA 1BWFO 1WBBA 3THXA 4JK7A 1YI2N 3VQQA 5J2PA 3D2EB 2ATQA 3NF9A 2P9IA 1ZBHA 3OJSA 4AHTA 3VEVA 3OYDA 4MDBA 5FRMA 3RMDA 3FE1A 1WUAA 2HNDA 4DSKA 4YDUC 2YJEA 3BZKA 3WNEA 4C8KA 3SUPA 3CXCM 4JKFA 3E9OA 3CC7N 1K6YA 2P9LA 4RW6A 1NGIA 2NRTA 2A6AA 3HSCA 1EX4A 2WC9A 4I7FA 3AVCA 3QNNA 3IRXA 4FWOA 1UA1A 3NVKA 3J80O 1NJWA 4YDUA 1DEJA 4IO9L 3F9MA 5EX5A 1NLVA 2D0CA 2HHHK 1S72N 3A5NC 1IKVA 1KFSA 5I3UA 5BPNA 1HNVA 1QVFM 1TK8A 4BGAA 4NLBA 4ZTJA 5LJWA 3CQXA 3SYZA 4KI6A 4CK3A 5J2QA 2KKZA 1NNEA 3VEYA 1RDWX 3O9TA 1GOAA 3HK2A 5M1PA 4AM7A 3WNHA 3BUZB 3OW2M 3UKRB 5KQDA 4ILJA 3KLIA 3CFRA 4XEIA 4RCHA 3ZSZA 3CCQN 2RHKA 4DR1K 4G1QA 3L2WA 2YV0X 4KH6A 4WQ5A 1U48A 5KI6A 1JJ2M 3NE6A 1SQKA 3LZIA 4DV3K 5DK5A 3QIOA 1OKJA 4JS4A 1D5AA 2QA4N 3RSEB 1NKEA 2IS3A 3L3VA 2G8IA 3KLHA 4DTXA 1YVNA 3C94A 3FZHA 4RTFD 1RBTA 4A59A 3AVLA 2J4RA 4AHCA 3V9SA 4E1MA 2E6MA 5CZ1A 1XQSC 2QTDA 4DR5K 4FPBA 4CEDA 4M41A 1GLJO 2CGKA 4CHPA 1HNIA 1U2VB 1ZC6A 2VYPA 1XNQK 3M8PA 4J2DA 4OLBA 3CPEA 1D9DA 4MDAA 4DTJA 1A5VA 3MXJA 2O4IA 3D45A 3SQ0A 5HL7L 1K8AO 2QWNA 4A5BA 1SKSA 1TGOA 1SZ2A 3K5MA 4E3SA 2D0AA 4DR2K 1VQMN 3U3GA 5M1OA 4CHZA 5C25A 3QFPA 3TSPA 2UXDK 1C1CA 1Z6RA 1N32K 1DTTA 2VWKA 2GX9A 3LP3A 2DPNA 3L4QA 4TSXA 4KI4A 4KB1A 1S6PA 1NK7A 4AHUA 1BDGA 3PSIA 4HTLA 3NDKA 3THXB 1CZ9A 3P38A 3EO3A 3TU5A 5BRDA 2P9IB 4BRMA 3G10A 4HCCA 1VQLN 4AF1A 2HHQA 2JWLA 3CYGA 3CCJN 5DM6L 4DTNA 1WB9A 2BTFA 4AQYK 3MXIA 1NOYA 3AO3A 2HHWA 2F7TA 3UB5A 1F21A 3KD1E 4M3UA 3M8QA 1HR0K 4H4OA 2VWBA 3HPOA 3SPZA 2IVPA 3NCIA 4EFHA 2UXCK 1RTJA 2R7YA 1SL0A 1SUQA 4CK2A 1FW6A 4Z4EA 5LMNK 4F2SA 4CVNE 4BRQA 4CIGA 4OLAA 4CBUA 1Y64A 4H0VB 3NGZA 3F9KA 4FL9A 3BY5A 5C2DA 1TKTA 3UKUA 3PX4A 3MN9A 2FBTA 3ENHA 3R9PA 4FLYA 2FBYA 1EXQA 3EKSA 2D0PA 1ILYA 4BQLA 5BRHA 3ZCMA 1JLCA 1WSGA 4AILC 2CGLA 2ZF5O 1ZBUA 2YHXA 4KHPK 4FJLA 3SJHA 4FWLA 2W40A 1Q9XA 3LWLA 1N6QA 4IFVA 3ZSWA 4B3OA 3UE5A 1S6QA 3HXMA 5C24A 3BZCA 4GVMA 4DKWA 5C42A 4HUGA 5AZIB 3O4QA 2XY5A 2V51B 1L3UA 1I39A 3EY1A 3OVNA 3EEQA 4DQRA 1VK0A 1VSLA 3F73A 4I2QA 1FKOA 4O0IA 4OX9K 5KQ8A 2QEXN 2F8TA 4CEEA 1X9WA 3ITHA 3AGKA 3DLGA 3TSUA 1HLUA 3ID8A 2ZJRL 4FJ7A 1FKPA 3FZLA 4B9MA 1WLJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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