3CCUN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccuN00
3J7ZO 3CCLN 3DLLL 1YI2N 3CF5L 3CCVN 1VQLN 3I56N 1K8AO 1YIJN 5HL7L 3CCJN 1KC8O 1KD1O 3CPWM 5GAEP 3I55N 4WF9L 2ZJPL 1Q82O 1M1KO 1N8RO 1VQ4N 3G6EN 3CCMN 1YJWN 4IOAL 4WFBL 5GADP 3CCUN 3CXCM 1ILYA 3CCEN 1VQMN 3PIOL 3PIPL 1YJNN 2QEXN 4IOCL 1NJIO 3CD6N 3CMAN 1OVYA 3OW2M 4UY8O 1KQSM 1Q81O 5GAGP 2OTJN 3CC4N 1VQ9N 1QVGM 1VQON 5DM7L 2ZJRL 2QA4N 5JVGL 1YJ9N 3CCRN 5MLCQ 1YHQN 1K73O 2OTLN 1VQ7N 1VQ5N 3CCSN 3CC2N 4IO9L 4WFNL 1JJ2M 1VQPN 1VQ8N 5DM6L 5GAHP 3CCQN 1W2BM 1VQKN 4U67L 3CMEN 1M90O 1S72N 5JVHL 1Q7YO 5H1SQ 4WFAL 1K9MO 2ZJQL 1Q86O 1QVFM 3G4SN 1YITN 4WCEL 3CC7N 1VQ6N 3G71N 1VQNN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MDUB 4M7YA 4AILC 1N33K 4E0DA 2NRZA 1ATNA 2Q3SA 4Z4FA 5BPMA 3CCVN 4CZFA 3O6WA 4KO0A 1WOQA 2F8SA 3NVMA 3O9SA 4ELUA 3DLKA 4IG0A 4YY3K 3SPYA 2HW3A 2A42A 4Z4IA 1LWEA 3VERA 2BANA 3ZYYX 1WBDA 4FWQA 2W6LA 4JK9A 1VRTA 3VGLA 1M1KO 2HBMA 4RWTA 1ZBLA 4DTRA 2UXBK 1YT3A 3LPUA 3O80A 4A5AA 5IT9O 4GW6A 4BE1A 1OH8A 3FZHA 3CFRA 4EHTA 4KI6A 4I7FA 3JXUA 2NUBA 4MLHA 5HP1A 1BA1A 4DU3A 2KLAA 1RBRA 3VMFB 1NGEA 4DU4A 1N5YA 4DR4K 1X9JA 4FLTA 5ADXH 2RKIA 1J54A 3P83D 1Q81O 1BCOA 3EZWA 3K0SA 3SQ2A 1Q9YA 4NXNK 5ADXA 4Y1CA 3AAQA 1RT4A 4JKGA 3T19A 3CM6A 2Q0UA 1XQSC 4IO8A 3B8AX 2F4VK 1GLAG 1YJ9N 3OY9A 4IBNA 4X66K 4DSJA 1R59O 4H0PA 4YOWA 2W41A 3D7EO 1NK9A 1VQPN 3NGIA 2IIRA 4PQUA 1SQKA 5GAHP 3AVMA 1C1BA 3VEZA 1VHXA 3RR7A 2VGMA 3VPZA 4U67L 4LF5K 3QEIA 2HNYA 2VG7A 3RMCA 1KAXA 1BDGA 4CEZA 3H3NO 2G8KA 5I9EB 1RT5A 4JS4A 2BUPA 1YTUA 5E84A 4K43A 4BC2A 4CW7B 3OYIA 4WE1A 1QSLA 4HCCA 4CJFA 2Q1NA 4IFYA 2BE2A 2NRTA 2G8UA 2E5LK 1W97L 4BR2A 1U48A 5KRTA 1S1TA 5M1QA 5J2NA 4PL8A 4DR1K 4DV1K 3TSPA 2CGLA 4KPYA 4RW6A 5LMUK 3RMBA 3J7YP 3DRSA 1RTJA 2HBKA 5KRSA 3J81O 4KH6A 2UUCK 4CZJA 4DUYK 4CE9A 3E1YA 3J8AA 1QHTA 5AQOA 5GIPA 1ZBSA 2AJQA 2DPNA 2FSJA 3BF3A 1N36K 4GV9A 3HM9A 1NLVA 1V4TA 3QEPA 1ATRA 3ENHA 1VQ4N 2BH1A 4JKEA 3N4PA 3KWGA 3JAMO 1VSEA 1BQNA 1TYQB 1WUAA 2E2QA 4KHQA 3SJJA 3KLIA 3MN9A 1N6QA 3MEGA 3TU5A 4H0YB 3D0PA 4KB0A 3TAMA 2HVIA 2YX6A 3B6OA 2P9SB 1EETA 2YI1A 5FPEA 4KH5A 1LCUA 1B9DA 3WNGA 3SLCA 4KHNA 4GKKK 3AVGA 3BGRA 2KFZA 3EYZA 3WQUA 4HTUA 3ULDA 4CCHA 3E9PA 3QICA 4CFDA 4CZGA 5B8HA 1N32K 1U04A 3AVLA 5JVGL 4WQ5A 5M1KA 3IMXA 1GLJO 4EFHA 5BN9A 3T69A 2IGIA 1FKOA 2QWPA 3ZT3A 5C42A 3HTVA 3SAGA 1HYZA 4DCHA 3VESA 3OVNA 2HOEA 2UUAK 2I7PA 1A5XA 3OYKA 1RTIA 5JICA 4C8OA 1WAFA 1ASWA 2NRWA 3ZCMA 5BR8K 3ZSZA 1Q18A 2G8FA 1HMVA 2A40A 2ZJQL 1NGDA 4KH4A 4WQ5C 4QCLA 1NKEA 3DM2A 1WSJA 2PY5A 3MXJA 3HXMA 3KKSA 2P5OA 4FJ7A 5AQUA 4JN4A 4FVUA 3K59A 3NH1A 3I0SA 3U3GA 4LSNA 4DFPA 4BR0A 3DAWA 3DMJA 1IBLK 2ZM6K 4JI4K 5AQWA 1XUPO 2VWBA 3J7AP 2QXFA 4CESA 4CJRA 1WAJA 2A1RA 5AZIA 4JI0K 1SUQA 3U8XA 4K8XA 5LL6Z 4JRPA 1NJWA 2UXDK 4CEDA 1HLUA 4O4GA 2G8HA 2ZJPL 1KLMA 4MLEA 1GLEG 4H4OA 4I2QA 4KTQA 4FJXA 4B1UB 5C25A 3RMAA 1J5EK 1P90A 2D0OA 2HB5A 4GV6A 4H0XB 4HWIA 4EAHD 2Y1IA 1D9DA 3MXIA 2FC0A 4HUGA 4A59A 4CEBA 3UKRB 4CERA 1VK0A 1RT6A 1IJJA 1BHLA 1D8YA 1NKBA 4C8MA 3L6QA 3L2RA 3ZEUB 1LAVA 2B4JA 4BROA 3PY8A 5EY4A 4CJTA 3PX6A 2P5GA 4OPJA 4KRFA 2O8EB 4YDUA 3SAHA 3A2FA 4FZYA 1QVGM 4A62A 3MXMA 2P9UB 3ZSOA 5J2PA 3MDQA 3DOKA 4CBUA 4OPKA 3RTVA 3V9SA 3AVKA 1DLOA 1E3MA 1WLJA 2FF6A 3QFUA 1VSLA 3C7NB 4KREA 3O8MA 2E2NA 3L2WA 3CCQN 3AA2A 5C0YA 3QERA 3U6FA 1GLDG 4YDUC 1CZAN 3SBGA 5AR0A 3SMPA 2YHWA 2YNGA 3DXMA 3K5MA 3CJCA 3QEVA 2OYQA 4H8KA 3QNOA 1K8KA 4FK0A 4FOEA 4CHOA 1IBKK 4AM6A 3PV8A 4DHYA 2P9LA 4IDHA 4PUOA 1SS6A 2RF2A 2F96A 2WUSA 4O8UA 1D9FA 4FW1A 2D0BA 4AM7A 4XH5A 5T7BA 4FWKA 2VWKA 1YTAA 3OYDA 1HNVA 5BR9A 4LD0A 3FFIA 1C1AA 4DF8A 3GG4A 4BQLA 5HL7L 3DXMB 1RILA 3V6DA 3CCJN 3OYCA 1BG3A 4BRNA 1KC8O 2QTDA 3ZETA 2Z1HA 3CPWM 4CIGA 4FSVA 2ZWHA 1GLBG 1S5JA 2Z1GA 3S3MA 1QS4A 1H1VA 1NJYA 1HJOA 1JLEA 4MO4A 4IEEA 4DTUA 1QQOA 1ILYA 1EKEA 2YHAA 4DTNA 2QW9A 1SL2A 3CJBA 3D6RA 4BREA 1OH5A 4CGGA 1GLLO 1JLFA 2JWKA 3NH2A 1GLFO 3AVHA 2WTUA 1HNZK 1KXPA 3ZETB 4GV3A 3OW2M 1Q9XA 3KLEA 3Q7CA 4BR4A 4GNIA 3S3OA 3LP3A 4FK4A 4PL7A 1Y64A 4CIFA 2D0PA 5DM7L 2YJFA 3CETA 4O44A 1TKDA 2P9KB 3SV3A 5F2RA 1YHQN 1X9SA 4E7LA 4Y1DA 1RTDA 3JSMA 1T7PA 2HF3A 5A2QO 5KPTA 3O9UA 1BWFO 2KZMA 1S6QA 4UQGA 4KTWA 3MEEA 3HVTA 4HHTA 4NCAA 3AVAA 3ID8A 4B8CA 4WQ4C 1NOYA 1JCGA 4DTXA 2GUPA 3GE1A 3NF7A 1C0UA 2XY6A 3DYAA 5JLHA 2GTDA 5JVHL 3MX2A 4CFBA 1LWCA 4DSEA 3VQ6A 3TAQA 2WFBA 3AA3A 4GY2B 3SBTA 5AQXA 4AHUA 4BRQA 3I33A 4CGIA 1OH7A 5AZJA 3L2UA 3G71N 1K6YA 1LW2A 3VA3A 3J7ZO 2E8AA 2X6NA 1BU6O 3O3HA 4I6MA 3GOIA 3CF5L 4DU1A 4DSIA 4CGDA 3HSCA 4A61A 4B9TA 4B3TK 3SNNA 1JL1A 4IOXA 2KTQA 4BR7A 4Q5VA 4YOXA 4IKFA 1NBWA 1QSYA 4OGEA 3TPQA 3L8BA 4XEIA 1XWLA 5C10A 5AQJA 2D4WA 3L4QA 5AZJB 3V9WA 3CQ8A 4RW9A 3VQEA 5GADP 1HYVA 4E1NA 4FPBA 1QQMA 4DKWA 1L3SA 3KLHA 2PBDA 3NCIA 1QZ6A 3M6GA 1HKBA 4JD2B 3O9RA 4RW7A 4H5TA 2BTFA 4CJ7A 3AGKA 4OPHA 5FPMA 3K5OA 4E7HA 1BL3A 2HHTA 4FWLA 3K9JA 3U3YA 1KQSM 1J6ZA 5LY3A 3EN9A 4W5NA 3DI6A 3HM8A 2YV0X 3C95A 1RBTA 4OJRA 1JLGA 2HHXA 3OS1A 1EXQA 3NHGA 4M45A 4DQPA 5EX5A 3HRGA 1RT3A 4X65K 1VSDA 5BN8A 2QA4N 3GDQA 2O8DB 4RW4A 3SZ2A 4ZTFA 1D5AA 2A41A 3TSUA 2XY7A 3VF4A 1JJ2M 4W5TA 2QM1A 3M8QA 3I0RA 2QWNA 3MCPA 4DV7K 1HNIA 2Z1JA 4PKHA 3A5NC 4NO7A 4IFEA 3QETA 3LDQA 5SWMA 1VQKN 3CM5A 5BREA 1WSGA 3CERA 4CZMA 4H4MA 1K9MO 2E88A 2YNHA 1NK6A 1Q86O 2O8CA 4W5RA 2D5RA 3VTHA 1QTMA 3C0BA 3PO5A 3HP6A 4CF0A 3DXKB 2Q2RA 1J5OA 2RN2A 3V1OA 3MCAB 3M1FA 4ILHA 1CZ9A 3IKMA 1YIJN 2IOCA 3U9ZA 3SUPA 3O08A 3LAKA 4JKBA 2IAJA 4M3XA 2IVOA 3HT3A 1KD1O 1WSEA 2O8CB 1NMDA 1U6ZA 3AO3A 4LH5A 4K0KK 3L0QA 1VSIA 2AA4A 3TTDA 1IKYA 1U2VB 4Q0BA 5IWAK 1SZ2A 3L2QA 3VEVA 2AP1A 2A5XA 1TUYA 2W40A 3L3UA 4DR6K 1RBSA 3QESA 1ESVA 2KHOA 1S3XA 1Z25A 1NK7A 4BRAA 2WBNA 3KHYA 3V9ZA 3THYB 4IOCL 4LF4K 4C8NA 2NLXA 5FRMA 4CHZA 1XHXA 1NM1A 4CEFA 2VG6A 2G8IA 5EOYA 2OTJN 3CC4N 3VOVA 3EE8A 1IG9A 4K42A 1C0FA 3TTCA 5K14A 5J2QA 2JLEA 3CCRN 4FZXC 4Z4CA 1K73O 4CEEA 3NF6A 1UOCA 3WNHA 4FOIA 4DLEA 3AVNA 3WXIA 3ATUA 3PSFA 3V81A 5AQQA 2FBYA 2IS3A 3VQAA 3KJVA 4QAGA 5AQLA 4CZLA 4YOVA 4JK8A 4F8RA 4FM0A 1HPMA 3QLHA 4CIEA 1SKSA 2HVHA 3G4SN 2EX3A 2UYTA 4Z4HA 3K2PA 3O9QA 3KKRA 3AO1A 3L3VA 2NNWA 3A5MC 1YI2N 3JS6A 2IVNA 1KLNA 5AQFA 4B8AB 3AA4A 4A57A 5HRPA 4FJIA 4BWJA 1NMNA 4N5SA 1S1XA 4GVMA 2YNFA 1S9EA 3THXB 4ILGB 1JKHA 4KAZA 1E4GT 4B3MK 3WUHA 1WN7A 4O5BA 3ASMA 5CR4A 3RMDA 2B5JA 4JS5A 4BRLA 4BE2A 1N8RO 4H5RA 1EX4A 4ID1A 4FJKA 1TYQA 3ZX3A 2P9NB 3DLHA 3ZSVA 1NK8A 4CJPA 2WC9A 3H1QA 4CJQA 1TAUA 4IWVA 3MN5A 4C23A 4E89A 4M42A 2ASPA 1WBBA 1T3VA 2P9SA 2O4GA 3GL1A 3EZ5A 4FJGA 4FLYA 4BC3A 3CD6N 3C65A 3T1YK 1OVYA 3M8SA 4JV5K 4TSXA 4CJ3A 2HHWA 3DLBA 4L3QA 2PYJA 3R6MA 4QS8A 2XHBA 1LAWA 5LJVA 1BISA 2I7NA 5AQYA 5E41A 1E4FT 1R0AA 1G15A 3T7ZA 3NBPA 2FF3B 5CZ1A 4AQYK 3IRXA 3UKUB 3VTIA 3VQQA 4GVEA 1QHAA 4AHTA 3K9KA 3H45C 4WFNL 3CC2N 3EO3A 1DKGD 3BDPA 3DWLA 4YOYA 1Q8IA 1IKXA 1TKXA 2FXUA 4HVJA 3VF6A 1W2BM 4F3TA 3OYFA 2VYPA 2UU9K 1TKTA 4FWPA 4H5VA 1M90O 3A0IX 3P38A 3TR8A 4B9UA 4Z0UA 5BPNA 1Q7YO 3SI6A 4BRIA 3NE6A 4BACA 3CJ9A 4Z94A 4E7IA 4MO5A 4CVNE 1S22A 2PZSA 4FLWA 1KCFA 1I39A 2ASOA 4EZ6A 4M63C 3CQXA 1RDCA 1HNWK 1X1PA 1RT7A 1FJGK 4B1ZA 2HF4A 1VSFA 4I9QA 1NJZA 1Z26A 4Z4GA 4ISFA 4ELTA 3UKRA 2OA8A 3O3GA 4B3RK 3H1VX 1YVNA 1YJNN 5LMNK 4BR5A 2O8BA 3IFRA 3LAMA 3ZSRA 2KW4A 3ZEUA 4K41A 4CK2A 3M8PA 5AQIA 5GAGP 3NMUA 2O8EA 3V1RA 3K5NA 4NYFA 1S1VA 2R7YA 3WXJA 4H03B 4B08A 2P9UA 3LP0A 5ELZA 3K57A 4CD1A 2OPSA 3THWB 4AF1A 3LZIA 3IS9A 3ITHA 4JKCA 4DUZK 4IFVA 5KQDA 4CJUA 3M8RA 3C7NA 4X62K 3DLEA 1F21A 3HOSA 4BVPA 2LSNA 1VQ8N 2O8BB 4NCBA 3VETA 3KK1A 5AQVA 3LWLA 1C6VA 1O13A 2YHYA 1ZYQA 3TSQA 1DEJA 3NF9A 3HYFA 4JKFA 3CYMA 4MQ3A 3AO5A 4YNQA 1X3NA 3BZKA 4DV2K 2VG5A 1JLQA 4BY9C 4DV5K 3VQPA 4BRKA 5JS1A 4BC4A 1RCHA 5I3UA 4CK1A 1KVBA 4AHRA 3TAFA 3VQ4A 3TABA 2IVPA 3CIPA 4OKKA 3AO2A 3ZT4A 1VSJA 3OHRA 4LSLA 4CBWA 1ZBIA 3N4QA 4YOUA 3OJSA 2VGNA 4MDAA 4FLZA 3P39A 1NGGA 2HNDA 3AVJA 1B92A 1XNQK 1XMOK 1UAXA 3T1AA 5AJ3K 2QWOA 3SJHA 2ASMA 1JLCA 4XH1A 3QNNA 1BIZA 3HVRA 4ICLA 5BRHA 3WXKA 1ZBHA 1TL1A 4FJMA 5KQ8A 4B1YB 3WXLA 3CCUN 1BUPA 2BGGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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