3CCUN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccuN00
3CC2N 1YHQN 1JJ2M 5DM6L 1YJWN 4WF9L 2OTLN 1K8AO 1M90O 3CC7N 1VQNN 1Q86O 1KD1O 5MLCQ 5H1SQ 3DLLL 4IOAL 1K73O 5GAHP 2QA4N 3CD6N 3I56N 3CCJN 3PIOL 4WFAL 1Q82O 1VQ8N 3G6EN 2ZJQL 1W2BM 1ILYA 1Q81O 1VQPN 4IOCL 5JVGL 3CF5L 1YI2N 3CMAN 1VQMN 1QVGM 3CXCM 5JVHL 3CCMN 3CCUN 4U67L 4IO9L 4WFNL 3CCRN 3CCVN 4WCEL 3PIPL 1VQ6N 1VQ7N 1K9MO 1VQ4N 1OVYA 1VQKN 4WFBL 2OTJN 1Q7YO 1YJNN 1VQ5N 1VQLN 3CPWM 1VQON 1YIJN 3CCQN 5GAGP 3CCLN 1NJIO 3CMEN 5GAEP 5DM7L 5HL7L 1YITN 1QVFM 3CCEN 3G4SN 1VQ9N 3CCSN 2ZJRL 1N8RO 3OW2M 3CC4N 1YJ9N 3I55N 4UY8O 1S72N 1KC8O 5GADP 3G71N 1KQSM 2QEXN 1M1KO 2ZJPL 3J7ZO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2VA 3JS6A 1VHXA 1JXBA 3HP9A 4BC3A 3PY8A 4J2BA 1YJWN 1T03A 3NVKA 2OTLN 4JN4A 3F9MA 2O8BA 4M3ZA 1UWBA 3VF4A 1ZXOA 1BIZA 4ILJA 3EEQA 4RW9A 1Q9YA 1C0TA 2RN2A 3ZT3A 1FKPA 1T6CA 3QMLA 3GG4A 3I56N 4KO0A 3VQ9A 3PO5A 3MDQA 1RTIA 2HHHK 4JI2K 1NGFA 3QERA 5JS1A 4B08A 2KQ2A 1YTUA 2JGUA 3A5NC 1JKHA 3R8EA 3TAGA 4DTOA 5KRTA 3AVHA 1TK0A 3O9UA 4FCYA 4DQIA 4BQZA 1VQMN 4WQ4C 3HJFA 2E1ZA 4EAHD 5EU7A 3ULEB 3SYZA 3WT0A 4GY2B 4IOXA 4CJSA 4MO5A 3HXMA 4GV6A 3LWLA 3J7AP 1JLGA 3T1YK 4HTUA 4DSJA 3K9KA 3ULEA 4B3MK 4QOZB 4ISGA 4CEZA 5E26A 3OYMA 1JXEA 4BACA 5KGWA 4AQYK 2HBJA 3EKSA 3SMPA 4CGJA 1L3VA 3CPWM 4CFBA 4AHUA 1DTTA 2D0CA 1G99A 2Q0UA 2Q97A 2F7TA 3WEEA 3ZT1A 3U9ZA 4CJUA 2V51B 2AJQA 1HNZK 4B3SK 2RF2A 3K2PA 3U4LA 4PY5A 4JAXA 3ENOA 3AO3A 4JKBA 3WEEB 1LAWA 3U3YA 4FWSA 1VRTA 2E20A 1U45A 3CQXA 3SBTA 2QK9A 1YVUA 2UXDK 2V7ZA 4FZXC 4W5OA 3J80O 1S5JA 3AVIA 4KHWA 4DSKA 3O1WA 3Q7CA 4H5RA 4W5QA 3MN7A 4WF9L 3KJVA 4O44A 3NHGA 3ID8A 1K8AO 3KWGA 4DQQA 4M41A 4BG8A 5HRRA 4OPKA 1EWRA 3VQBA 3SAFA 3LAKA 4H0OA 3VGKA 3L2WA 4E1NA 3EY1A 5JLHA 3T1HK 4FJXA 4IOAL 5E84A 5EXWA 2X78A 2Q36A 1Q82O 1BCOA 3ID6A 4HWIA 4GKKK 2P9UB 1XI1A 1U2VB 1RT6A 1T8EA 2GV9A 5AQXA 1MA9B 4CIEA 2PZSA 2X6NA 5AQYA 1SS6A 3TWHA 1LWFA 3T3FA 3D2EB 4AILC 1B9FA 1X1PA 5I9EB 3E1YA 3TARA 3V9WA 2WTUA 3HPOA 1ZYQA 3E9OA 4YOWA 2F96A 3VQAA 1ZBUA 3P39A 3RMDA 3C6AA 4N5SA 1RBRA 4A2AA 2QWNA 3FZHA 4RWTA 3VQ6A 3L2UA 3ZSYA 3O3FA 4JS4A 4FOEA 5CY4A 3KWIA 4CJ3A 4IFYA 4BR0A 3VPZA 2D0PA 2QTDA 4YNQA 3CPEA 3GBTA 3OS1A 2FBVA 3FFIA 4Q5VA 3OJUA 3CFPA 1SUQA 1GLJO 3AVLA 1N8RO 3AA4A 3C94A 2O8EA 3WXLA 2P9PA 3QO9A 1IKWA 3F5TA 4DMNA 4EP4A 2E2OA 3HT3A 5JLFA 1JLFA 1OVQA 3WQTA 1GLCG 3M8PA 3CC2N 3LDNA 1HMVA 4CECA 1L3SA 1J5EK 4KTWA 3R9PA 4FJJA 1X3MA 3VA0A 4CJWA 4DTPA 1NGEA 5ADXH 1NGJA 4XH4A 4JNEA 5AQSA 4DV5K 2O8FA 3K59A 3OTOK 5GAHP 1ZBFA 3CQYA 4WFAL 1IV0A 1QS4A 1RT3A 3G6EN 1KLNA 2ZJQL 3K5NA 5A2QO 2WONA 1W2BM 4M45A 3NH1A 2NRVA 2ZM6K 2P9IA 1BQMA 4FW2A 3CJAA 2P9LB 1VSFA 4BWJA 1TUYA 2P9IB 1IKXA 5LJWA 1GLLO 3NGIA 3VGMA 3ZSVA 1H1VA 4DR5K 4OLBA 3AA2A 3M8SA 4LF8K 3OYNA 5HRSA 4O8KA 1JL2A 3SUQA 4M3TA 2WFBA 5C2FA 4BR2A 3DMJA 4KTZA 1LW0A 2BUPA 4FWMA 4BREA 3IG1A 3HOTA 2EWSA 1OH6A 1VQ4N 3SV4A 5FPNA 4WFBL 2YNGA 4Y1DA 3KLFA 2HBKA 3EZWA 1YIJN 4B9SA 4NYFA 1HKGA 1FJGK 4NLCA 3VMFB 4JKAA 1EETA 4O5FA 4IDHA 1VSJA 5LMNK 3W3DA 2AP1A 1JLBA 3THYB 4C8OA 3QLHA 5AQPA 4EHUA 3LALA 2ASOA 4B9NA 4E7HA 2VWKA 3NF7A 1NGIA 2FBXA 4MDAA 1S9GA 3CJ9A 5AR0A 1XUPO 4PA1A 4CJEA 5AFUH 1HQEA 2FBTA 1HNXK 2WBNA 4K25A 1NJXA 2GX9A 3OVNA 1MU2A 4W5TA 3DLRA 4YOTA 4BRKA 3GL1A 1J53A 2HMPA 2EHGA 2GELA 2HVIA 4RW8A 3B8AX 1WN7A 4O0JA 1JCEA 5C2DA 4EZ9A 3LDQA 5H1SQ 4KHYA 3A5MC 3NH0A 4BROA 4CFDA 5FRNA 2DFEA 1E3MA 1RTJA 5BN9A 4QAGA 1NMDA 3G10A 4CVNE 3PO4A 2D1KA 1KAXA 4Y1CA 3CG7A 4BRFA 5BR9A 3OYIA 2NNWA 4GKJK 3MEGA 1QQCA 3M3ZA 2D0OA 4BRIA 2QXLA 3BF1A 4JKEA 3B6OA 4FZYA 3C95A 3CCMN 4NB4A 2UUCK 4IG3A 1VSMA 4U67L 3R3LA 1IBLK 3RVCA 5FPDA 1JCGA 3L2QA 1UOCA 1XQSC 1OH5A 1K9MO 1ZBIA 4OGEA 2D4WA 4FLVA 1TAQA 4CBXA 4AF1A 5JICA 1CXUA 3HPGA 1Q8IA 3LP2A 3OY9A 4J2AA 1NWKA 4DTRA 3SLCA 2UYTA 4BRMA 3ZT0A 4N56A 4H8KA 4FJ8A 1HKBA 2ZE2A 3OYLA 3MWTA 1X9MA 2YKNA 3PX6A 4LSLA 1EQYA 3A8YA 3MECA 3THXB 4DFPA 3TPQA 2B5JA 3I55N 4ELUA 3MMVA 4DFJA 4DV2K 3KLIA 4FWPA 3SV3A 4FM2A 3I33A 5AQFA 2YNIA 4BGAA 1ZBSA 2VQFK 4JK9A 2A1RA 4FVUA 1LCUA 5EVZA 4ZHRA 4PKIA 3P5JA 4Z4HA 2E4LA 2O8BB 2JWKA 3MX5A 1C1CA 2V7YA 4FK4A 2RKIA 5AQTA 2P9KB 2HVHA 3JYTA 4BQLA 3CC7N 3ASMA 5AQWA 3F9KA 4FYDA 2DY4A 4BDZA 1RGIA 5KRSA 4IO8A 4L8RB 4H0XB 2P9KA 1K73O 3MCAB 3D6RA 2Q3SA 2YCHA 2FBYA 4NLBA 5AQRA 1HNVA 2XY8A 3VN5A 1HR0K 1KFDA 5AQGA 3K0SA 1WSGA 4XH1A 3D2FB 4FOIA 4W5RA 3V9ZA 2O8CB 4JYAK 5JS2A 3AVGA 2P9NB 2G8IA 4CJVA 1HYZA 4HHTA 4JHDA 2XY5A 1D9FA 3CM5A 1GLBG 4CJFA 3TSPA 2KKZA 5HROA 1ASWA 4JI5K 2A6AA 2YHBA 2YHWA 1P8ZA 1NKBA 5J2NA 4KHUA 3AVFA 3J8AA 1VQKN 3AVAA 4KHQA 1VQ5N 3W0LA 5LMUK 5C0YA 4JKFA 3NF9A 2HSTA 4I6MB 2J4RA 5J2MA 3DYAA 4B9LA 4DTJA 1RT4A 1ATRA 4YDUC 4JD2A 1ITGA 4N41A 5FROA 1C6VA 1IBMK 4PQUA 1A5VA 2YHYA 3KK1A 2FLOA 5GIOA 3R1XA 3THVA 3SPZA 2VG7A 1Q9XA 3M6GA 3AVNA 4WQ5C 1UA0A 1QQNA 4FWKA 4C8NA 4G1QA 1EO1A 2VQEK 1KQSM 3VQPA 1C0GA 5M1QA 1V4SA 4IXCA 4DS4A 3C6TA 4DTXA 3UE5A 3OYDA 4JI0K 5EOYA 2Y1JA 2A41A 4K8XA 1TK8A 1Z25A 3MN9A 4CD1A 3SMSA 4DB3A 1U47A 3KLHA 2NRRA 3CERA 1SKRA 4OLAA 2G8HA 3NVMA 1QHTA 4F9OA 3CD6N 1HNWK 1YXQA 1HKCA 4MFBA 3DLHA 4FWRA 3O5BA 4CZLA 4X64K 5LL6Z 1VQPN 4R79A 4DUZK 2XHBA 4FSVA 2P51A 2KZZA 1J9AA 1KVCA 1JCFA 3VERA 4CHOA 3K5MA 5J2QA 4FM1A 1G15A 1BHLA 3SUNA 1IG9A 4GV9A 3FR0A 4XH5A 4CZFA 1K8KA 4YY3K 4CJPA 1TKXA 1RDCA 3D7EO 3OHRA 1J5OA 3H1QA 1TAUA 2YHAA 3UKRB 1QSLA 1K8KB 3QIPA 2IGIA 4IG0A 3VENA 4AHSA 3OS2A 3DXMA 1TUUA 2PY5A 5HBMA 2IVPA 4CEOA 4Z4EA 4M7XA 4IWVA 5KQDA 4LH4A 2F8SA 4LF9K 3H6EA 2HNZA 4B9MA 5FRMA 2IVOA 3PUFA 1VAZA 1NK4A 2YHXA 3CMEN 3FZMA 1DT9A 4J2DA 4BRHA 3OYFA 3KLGA 3CHWA 3KK2A 4DR4K 4CEEA 1S6PA 1L3TA 2UUAK 1R0AA 3O9RA 4F8RA 4O55A 3VF6A 4CZEA 2YX6A 3ZYYX 2E2QA 2E5LK 4DR6K 1BCMA 3CJBA 2A42A 1P90A 3AVBA 4A57A 3FGUA 1D4XA 3LDPA 1FW6A 2H3GX 3G71N 2QEXN 2F9WA 3KIOA 2NRHA 3SQ4A 3TSQA 3ZEUA 3SNNA 4AM7A 1NM1A 4MO4A 1TL1A 3MEDA 1RBVA 3MXIA 1X9WA 1TYQB 1KCFA 4JKGB 4CGDA 4GVEA 3O1BA 1U04A 2ASPA 1VQNN 3L6QA 1IG8A 2DTUA 1ESVA 4E1JA 2FF6A 4EHTA 4KAZA 2IVNA 5CR4A 5AQOA 4BR5A 4GVMA 4FM0A 1RT7A 1WB9A 3O4QA 1BISA 2XO7A 3DLEA 3QEXA 4DU4A 4IKFA 4M42A 4E0DA 4DLEA 3C7NA 4RW4A 3L4QA 1YAGA 1XWLA 4IFEA 4KKOA 1NKCA 4IJNA 3AO5A 1BOTO 2HHTA 3TTCA 4OGCA 1SKSA 3CXCM 3AGKA 3AA3A 4E7JA 4BRPA 3SBGA 2HHXA 5SZTA 3CFRA 4F2SA 1YUWA 1GOCA 5I3UA 5IT9O 4CJLA 4WQ4A 2Y1IA 5GIPA 2NUBA 4Z4FA 1DTQA 5BRHA 3HSTB 1GOAA 5ELZA 3AARA 3ZLJA 2QWRA 5GAGP 5M1OA 4DV4K 3QNNA 3S9HA 1KVBA 3A5OC 4HTLA 1RT5A 4IFVA 1NK0A 1W0HA 4CK3A 2HNYA 2UU9K 3SK3A 3KK7A 1SL0A 4LC9B 4AHRA 1KVAA 3TAFA 3SQ1A 3KK3A 3VQ7A 3CCSN 1RDAA 1BA1A 1LV5A 2O8DB 3O3GA 1X3NA 2GEMA 3HO1A 3VGLA 3AVJA 3TAMA 2D0BA 4CHYA 1RBTA 1KFSA 2O8DA 4C8LA 4XEIA 4E89A 2O4GA 1XHXA 3VEYA 1HYVA 3M8RA 2V52B 3MXJA 1MWMA 2P1JA 3MCPA 5DM6L 4KB1A 2FC0A 3OYHA 4PHTX 2P9SB 1NGBA 4YOVA 2G8KA 1M90O 3DOKA 4ZTJA 4OPAA 2HHSA 2FSJA 1QQOA 2GWJA 1HX1A 2P9SA 2W42A 4CGGA 1HRHA 3H3OB 2P9UA 2VGMA 3NDKA 4FLYA 4AHTA 4BR7A 3PIOL 1N5YA 3NAEA 4H4MA 1QE1A 2HF3A 3ULDA 3P38A 4M3RA 4B9VA 1SZ2A 3KZBA 4EIAA 1WAJA 3G25A 3F73A 3LL3A 3WXMB 3D2EA 4KFBA 5AJ3K 4CZIA 2DFHA 2KLAA 1RT2A 5BN8A 4XIUA 4JRQA 3RWUA 1YI2N 1RDWX 2XRIA 4FZZA 2ITMA 3EZ5A 5AQZA 2CGLA 4LFCK 4CI6A 3UKUA 3DJCA 5BREA 1XMQK 3FFKB 1NNEA 4OKJA 4FVMA 4WCEL 3PIPL 2E6LA 3O9TA 3RMBA 4JV5K 3LM9A 1GLDG 2WOMA 3A2FA 3CFOA 1C1BA 1LWEA 1WLJA 4O8UA 3GOIA 4JLHA 4Q0BA 3T69A 4A61A 4K41A 3IAYA 3CCQN 4CF8A 1NJIO 1XNQK 1CXQA 3CJ1A 3CM6A 5DM7L 1D8YA 1JL1A 4A59A 3SI6A 4JI6K 2NRXA 3P83D 2JWLA 3CCEN 4X62K 3G4SN 3DRPA 3AO2A 1VSIA 3V81A 3RRGA 1BDGA 3NF6A 4BE0A 1QTMA 1CZBA 1O13A 2UUBK 2A1SA 2HBMA 3TAQA 1SQKA 1WSEA 1REVA 1ATNA 3H1VX 2P9PB 2VWJA 4N47A 5CE3A 3MAQA 3CJ7A 4FK0A 1IH7A 1S1TA 2RPIA 3QFUA 4H0PA 3DLKA 3RTVA 1CZ9A 5BRDA 1I39A 1QZ5A 4A5BA 2KHOA 1N6QA 2BE2A 1A5XA 4CHNA 3QETA 4HUEA 3K9JA 4R5PA 1U6ZA 4DFMA 2E6MA 2OCEA 3CJCA 2KFNA 2FXUA 3ZT4A 3QICA 2QI2A 1IBKK 5CYQA 4ISEA 3BZCA 3T19A 5LJVA 5HOOA 2IC3A 3H45C 3V9SA 2PAVA 3WXJA 4RTFD 3V1OA 3CMAN 4DFKA 1QVGM 4DF8A 3U6FA 3LP1A 1IKVA 2PYJA 3UIQA 3QFPA 5JVHL 1U4BA 2P9LA 4H5TA 3WNGA 2W40A 4B1YB 5AQIA 1NJZA 2HMIA 4PUOA 1CZAN 3M8QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L2V A;  3JS6 A;  1VHX A;  1JXB A;  3HP9 A;  4BC3 A;  3PY8 A;  4J2B A;  1YJW N;  1T03 A;  3NVK A;  2OTL N;  4JN4 A;  3F9M A;  2O8B A;  4M3Z A;  1UWB A;  3VF4 A;  1ZXO A;  1BIZ A;  4ILJ A;  3EEQ A;  4RW9 A;  1Q9Y A;  1C0T A;  2RN2 A;  3ZT3 A;  1FKP A;  1T6C A;  3QML A;  3GG4 A;  3I56 N;  4KO0 A;  3VQ9 A;  3PO5 A;  3MDQ A;  1RTI A;  2HHH K;  4JI2 K;  1NGF A;  3QER A;  5JS1 A;  4B08 A;  2KQ2 A;  1YTU A;  2JGU A;  3A5N C;  1JKH A;  3R8E A;  3TAG A;  4DTO A;  5KRT A;  3AVH A;  1TK0 A;  3O9U A;  4FCY A;  4DQI A;  4BQZ A;  1VQM N;  4WQ4 C;  3HJF A;  2E1Z A;  4EAH D;  5EU7 A;  3ULE B;  3SYZ A;  3WT0 A;  4GY2 B;  4IOX A;  4CJS A;  4MO5 A;  3HXM A;  4GV6 A;  3LWL A;  3J7A P;  1JLG A;  3T1Y K;  4HTU A;  4DSJ A;  3K9K A;  3ULE A;  4B3M K;  4QOZ B;  4ISG A;  4CEZ A;  5E26 A;  3OYM A;  1JXE A;  4BAC A;  5KGW A;  4AQY K;  2HBJ A;  3EKS A;  3SMP A;  4CGJ A;  1L3V A;  3CPW M;  4CFB A;  4AHU A;  1DTT A;  2D0C A;  1G99 A;  2Q0U A;  2Q97 A;  2F7T A;  3WEE A;  3ZT1 A;  3U9Z A;  4CJU A;  2V51 B;  2AJQ A;  1HNZ K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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