3CCUN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccuN00
3I55N 2OTJN 4WFBL 2ZJQL 5JVGL 3CMEN 3CCVN 1M90O 1JJ2M 4U67L 4UY8O 3CCLN 1Q82O 1VQNN 4WF9L 3CC4N 1Q81O 1ILYA 1VQ9N 1VQON 1QVGM 1VQ6N 1VQLN 1YJWN 3CCUN 1YJ9N 2QEXN 1VQKN 1YHQN 1M1KO 3OW2M 4WCEL 3CCQN 1YITN 3PIOL 1NJIO 1VQ7N 1VQPN 4WFAL 2ZJRL 5GADP 3CPWM 1VQ5N 1Q86O 1KQSM 1Q7YO 1S72N 4IOCL 3CC2N 3CC7N 3G4SN 1VQ4N 5JVHL 5MLCQ 1K8AO 3G71N 5H1SQ 1W2BM 3CCMN 2ZJPL 3J7ZO 5HL7L 3G6EN 1KD1O 3CF5L 1KC8O 1YI2N 5DM7L 3CCSN 2OTLN 3PIPL 5GAEP 3CCRN 1YJNN 3CCJN 1K9MO 4WFNL 1OVYA 4IOAL 3CXCM 4IO9L 3CD6N 3DLLL 5GAGP 3CCEN 3CMAN 2QA4N 3I56N 1K73O 1QVFM 1VQMN 5GAHP 1VQ8N 1YIJN 5DM6L 1N8RO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NZTA 4PQUA 5EOYA 4CFCA 1NKEA 3F9MA 2P9IB 3QEPA 4KI4A 5M1NA 5D3GA 3HP9A 4JK9A 2D5RA 4YOVA 2HW3A 1LW0A 3ZT2A 5JS1A 2YCHA 1XHXA 4Z4HA 2QI2A 4F3OA 3THXA 2F4VK 1HQEA 4MDAA 1GLAG 3P83D 2FF3B 3BP8A 3K2PA 3DI6A 4H8KA 3A0IX 4CEQA 1SL1A 3VQCA 5C25A 3ZLJA 4E1MA 5C2DA 3RMDA 2OPRA 1QS4A 1VRTA 4DV6K 2VYPA 4MO5A 3SAGA 3S41A 1YJWN 2O8EA 4OGCA 1YJ9N 3GOIA 2FF6A 5BPNA 5JMVA 4JD2B 4FWRA 3FZKA 4DSIA 3TSQA 3JAMO 1BCOA 4B9LA 4LF8K 3ZSXA 1T6CA 3MECA 4WE1A 1BIZA 3CPWM 3RRGA 1RTIA 3ZT3A 3T1AA 1NGIA 1XC9A 3OYEA 3W3DA 4K8ZA 3CJ9A 3E01A 4OKEA 3M8RA 5KTQA 5AQSA 2JWLA 4GY2B 5C2FA 3C6AA 2KFNA 1SAZA 4EZ9A 1EWRA 3ZT0A 2ITMA 5H1SQ 1W2BM 1X9JA 3MWTA 3HPOA 3A5OC 1WN7A 4AF1A 2FBXA 3CM6A 3LP3A 2G8KA 4LFCK 2BH1A 1JLGA 1J5EK 4CJPA 3D2FB 1DT9A 3FGUA 1YJNN 3V9XA 2RPIA 2HNZA 3SV4A 3D45A 5HP1A 3VF2A 2A6AA 4YY3K 3K9JA 4DV1K 5FRNA 5AQTA 3VENA 2G8FA 1C1AA 1N8RO 5M1FA 1T7PA 1TL3A 2ZJQL 3NF9A 1TAQA 2FSKA 3FZFA 1T03A 1SKSA 2HBJA 4CJ4A 3CQYA 5E84A 3M8SA 3GG4A 3DLRA 2FBYA 5J2MA 3SZ2A 2Q31A 1Q18A 4FOIA 1VSMA 2OCEA 4X65K 1U2VB 4LD0A 3MXJA 3QMLA 4DTPA 1HNWK 4B1XB 2O8CB 3H1VX 4DQIA 2YHYA 2UXBK 3RSEA 4OO1J 3M1FA 3PO4A 4CI6A 3MWPA 4QCLA 4LY7A 3CCUN 2W6KA 3WXJA 3JS6A 2UU9K 4JS4A 3S3MA 4OKJA 3VEOA 2YHBA 1RGIA 1S9EA 4M7YA 1NGDA 3WQTA 4EHUA 2NRXA 4DSLA 3G25A 1LCUA 1LWEA 5GADP 3MN9A 1LWCA 1MU2A 1P8ZA 3BY5A 4PUOA 3DOKA 2Q2RA 4CZHA 1HQUA 2ZGYA 1HNVA 3ZCMA 4HHTA 3VEWA 2X6SA 1ZBSA 3QBWA 2P9KB 3O9UA 1B9DA 1HKCA 4N76A 1NJZA 3LDQA 3WNGA 4KHNA 3SUPA 3RRHA 4IFVA 3I0SA 1BU6O 1WSIA 1RDBA 2QXFA 4KREA 4RW7A 4YOYA 4IJAA 1KC8O 3NH0A 4CGFA 5CY4A 3WNHA 2OZMA 4WQ4C 4BC3A 3MEDA 3V9WA 1IKVA 1QQMA 3EYZA 3AA2A 1FW6A 4DF4A 3DLLL 2NNWA 3D6RA 3OTOK 3K0SA 4U7BA 1KCFA 3LL3A 4IO8A 2WBNA 3DXKA 3IDHA 1XHZA 1S1TA 3A5MC 3OYBA 2KZMA 1DKGD 3SBGA 4FJ8A 4B8CA 2A5XA 1SKWA 5BRDA 4KH5A 1IH7A 2G8WA 4BRGA 2KLAA 4K41A 2FXUA 1E4FT 5HOOA 3NVMA 1CZAN 1S1XA 4DFPA 2P9PA 1HPZA 4NO7A 2XHBA 1WSFA 4X64K 3S3OA 2VG5A 1QQCA 1OKJA 1HNIA 1ZYQA 2D0CA 1Q81O 3CG7A 4KO0A 4IDKA 3ULEB 5BPLA 4JV5K 4XH4A 3OYFA 4WQ5C 1VQON 3O4NA 4KB1A 5CYMA 5JLFA 4W5RA 4MQ3A 5BRHA 4CJUA 3SBTA 2A3ZA 3AVNA 5FROA 1YHQN 4DR6K 5FPMA 2V7ZA 4ELTA 1NK7A 1WSHA 2XY5A 4LF4K 4G1QA 2DY4A 3LANA 3SV3A 2NRTA 2WC9A 1SUQA 4FLYA 3BZKA 3I33A 3SI6A 1X9SA 4BRQA 3O1BA 1KAYA 1RT1A 1TL1A 4LC9B 5KPRA 4NCBA 5C15A 2FLOA 3HSCA 4CF0A 3L2RA 3IFRA 2CGKA 3ZSZA 3AO4A 3OYKA 4FM0A 2IVNA 2ASMA 4DHYA 3WNEA 3CF5L 3NGIA 1LOTB 4E0DA 4M45A 2FBVA 4CHZA 4X66K 4CE9A 4JKFA 4BRKA 3O9SA 1NM1A 4FVUA 1WSGA 5J2PA 1BL3A 1Q8IA 3EL2A 3QESA 2DFEA 1YVUA 4J2EA 3CCEN 3UIQA 3VETA 4FJ5A 3C6UA 3U4LA 3EE8A 2E8AA 5CZ1A 3FFKB 3J7YP 1NGJA 3VF6A 3BF1A 3KJVA 2B4JA 2OPSA 3AO3A 2HHVA 4JI0K 2YHWA 1J6ZA 4IJNA 4JKGA 1RTHA 3R3LA 4AM6A 2UUAK 1BWFO 1DTQA 1RBRA 1UA1A 2E2QA 4N56A 3VQPA 3ZEUA 4I6MB 4XH5A 3UB5A 3ID6A 3ZSWA 4QS9A 1C1CA 4X62K 3L2QA 4KTWA 4CIFA 4JHDA 3SUOA 4CZGA 2NRHA 1BI4B 4B1ZA 1NU0A 1U45A 4FL9A 4KTZA 4CJWA 1HX1A 4E7KA 4AILC 5KPTA 1KAXA 4C8KA 3QEIA 2E4LA 4K43A 3OYIA 4JI1K 2B5JA 3WQUA 2YNGA 1YUWA 2GX9A 3IMXA 4C1NI 5BN8A 3EE9A 2ITGA 4NXMK 1Z05A 1O1WA 4I9QA 3HPHA 4A2AA 5BR9A 2BE2A 3UKRA 1XMOK 1LAVA 1BCMA 5C0YA 3ZT4A 3KK1A 3L4IA 3VQAA 4CGHA 5AZJA 1F21A 1HR0K 1QSSA 3T3FA 4FJKA 1IJJA 3LWLA 1HUXA 2P51A 3PLAA 1JLEA 1U48A 4KB0A 4LF9K 3CC7N 3OYDA 2LSNA 5MLCQ 1GOCA 4OX9K 1RBUA 3PSFA 1RFQA 2VWBA 1C6VA 3HZ6A 3SQ4A 1KTQA 3QDKA 3DRSA 1KD1O 4BQLA 2VQFK 4EHTA 4Q5VA 4DTXA 4PWDA 3VQ4A 3HOTA 1LWFA 2UXDK 1ASWA 5IT9O 5KI6A 3OBYA 3SYZA 1QQNA 4RG8A 4YDUC 1GOAA 2P9LB 3L8BA 3MEGA 4M3YA 3CIPA 3RWUA 4DR7K 1RDUA 2KQ2A 4CGIA 3DLEA 4DG1A 2RHKA 5HRPA 5AQKA 1ZC6A 2GV9A 1TUUA 2QM1A 2JGUA 3CMEN 3QFPA 4DLGA 1L3UA 4HTUA 3AVJA 3LZJA 4IG0A 4IWVA 3V9SA 2B6AA 2O8DB 1GLDG 4HVJA 4O55A 4FWMA 1BGXT 3THYA 3HO1A 3SPYA 3KVGA 1WBDA 4Q0BA 4FYDA 3E9LA 3THWB 3J7AP 4CHOA 3MX5A 2QTDA 3HRGA 4ISGA 3WEEB 3LP2A 3RMBA 3AO5A 3M3ZA 3BDPA 1QVGM 4DR5K 1RILA 3CPEA 3HM8A 4CFDA 4XIUA 2ASOA 5AQWA 3C0BA 1I94K 3V6DA 5LL6Z 3AA3A 2X6NA 2G8IA 4JRQA 1L3SA 3LDLA 2E2NA 4JI8K 3F73A 4DTMA 2Q1NA 4Z4EA 1DGKN 3A5NC 2JWKA 4KV8A 4RTFD 2D0OA 4B9NA 1CXQA 2KKZA 1G15A 3OS2A 3P31A 4FCYA 5GIPA 1NK8A 3RR7A 3V9UA 4KHPK 2HHSA 4DV2K 4AHUA 3HTVA 3O3GA 2PYJA 1WSEA 3G71N 2FBTA 3C7NB 4ZTJA 3SNNA 4MO4A 5J2QA 2HHUA 3AA5X 1UWBA 5HL7L 1S6QA 2HMIA 3O80A 4DTUA 3NFAA 4CZEA 3OJUA 4J2BA 3DAWA 4CK3A 5GAEP 2P1JA 4BRIA 3HJFA 3CFRA 4CJEA 1VSJA 2E20A 3CD6N 4FLUA 1RT3A 4BC5A 4BC2A 4OKKA 3RVCA 5GAGP 2O8FA 1Z26A 5DK5A 2WUSA 5LMNK 2Z1GA 1BISA 1YIJN 2GELA 1RT6A 5ADXH 4ZTFA 3L3VA 3I55N 2O8FB 1W0HA 5JVGL 2HHWA 4NYFA 1TV6A 1ASVA 3LP1A 3PSIA 4GW6A 4FZXC 3K5NA 3KD5E 2UYTA 3NVKA 3LP0A 1VSFA 3HM9A 2YKNA 3SJJA 1QSYA 1WUAA 5CYQA 1X9WA 3K5OA 2YNHA 1J53A 4GV3A 4FLWA 1GLCG 1ASUA 4DSJA 3L6QA 3EZ5A 3R9PA 3SPZA 4ILJA 3M8QA 3O6WA 4H4MA 1MWKA 4C8MA 4IOXA 3MXIA 5M1OA 2YJEA 1L5UA 4FZYA 4BRMA 3NH2A 4GNIA 3SQ2A 3DXMA 4K0KK 2OANA 2OPQA 4FM1A 3O5BA 4O0JA 3THXB 3KLGA 4O5BA 3NH1A 3ATVA 2E2PA 5TKWA 1SV5A 4FLZA 3PX4A 5GIOA 4CHNA 3EY1A 3HYFA 1ZBLA 3H3OB 4FLXA 1VSDA 3PO5A 1Q9YA 3DOLA 3VTHA 2QWQA 2YJFA 1D5AA 2GWJA 2O8EB 4WYBA 4A59A 2P9SA 4DV5K 2DFFA 3CXCM 3DJCA 1JXEA 1WOQA 3LM9A 3TSUA 4FXDA 1KXPA 4DMNA 1UOCA 3AVMA 4YNQA 3AO1A 5EY4A 4FLTA 2E5LK 4C1NK 5AQMA 3FZMA 4FJJA 4BDZA 3H08A 3IS9A 1HPMA 1ESVA 4HUGA 4IDHA 4B9SA 3TPQA 4FW1A 3RR8A 3OYCA 4BG9A 1XUPO 2QWLA 1CZ9A 1UA0A 3HK2A 3VTIA 4U67L 4CJSA 3TANA 4M41A 1JL1A 2V51B 1EP4A 5E41A 4E1JA 4DKWA 3CJBA 1KVCA 3CFOA 1S5JA 3ZETA 4XEIA 4CW7B 1HYZA 5I42A 4N47A 3K5MA 3DMJA 5EVZA 4BRDA 4JI5K 4FVMA 1MA9B 1VK0A 2W42A 3RTVA 3QEWA 5J2NA 5AFUA 4GKKK 4CZFA 1RT5A 3LAMA 1NK0A 3VOVA 4WCEL 1IKYA 5CE3A 1JCFA 3A5LC 3R8EA 2QWOA 1NJXA 1WLJA 4CIGA 3OYLA 4H0OA 2EX3A 2QWNA 3MEEA 1GLBG 4I2PA 2KZZA 3T1HK 1N6QA 4PKIA 4M3RA 4MFBA 5FPEA 4KRFA 3RSEB 2ZJPL 4FK2A 2O4GA 4LF6K 4KHYA 2F8SA 1C0MA 3MCPA 4CJTA 4DCHA 1A5WA 2WONA 4GVEA 1Q9XA 4DUZK 3FZHA 5A2QO 4N5SA 2ZM6K 3QETA 1MWMA 1JLBA 3JYTA 3THVA 4ID1A 4FJGA 4OPHA 4F9OA 3I56N 5AQJA 4DTJA 5BN9A 1YXQA 4JRPA 2V52B 4ELVA 2Y1IA 2VG7A 4CIEA 2VG6A 4R79A 2YHXA 4WQ4A 4CD3A 4WFBL 4BR4A 4CK2A 4AHRA 3MN6A 4OJRA 2PFUA 4CGJA 1BA0A 4JI3K 3QEXA 4NLBA 3AAQA 2KFZA 3I0RA 2O8BA 3SCXA 1C0FA 1EETA 3HBTA 5F0XA 4FPBA 3BUZB 4W5NA 4PY5A 1JCEA 4CCHA 1D9FA 2WTUA 3SAFA 2FC0A 1RDDA 2VGNA 3NDKA 2QKKA 5FPNA 3DXKB 4KTQA 4E1NA 3DLGA 4B8AB 1RNHA 4BQZA 3KTQA 4IFEA 3TTFA 2BDPA 3MK6A 2HOEA 4IKFA 3CI5A 4B9UA 4BRAA 2ZWHA 3OYGA 3KWIA 3ENHA 1IG9A 3HPGA 1IBMK 3AGKA 2GWKA 3QBXA 1P90A 2XY6A 3CYMA 4WQ5A 4C23A 1OH6A 2P9PB 1NOYA 4CJQA 3QERA 1Q7YO 2G8VA 2E6MA 4HCCA 1S9GA 4MLHA 1NMDA 2IDOA 4LH4A 1A5VA 1EX4A 3VPZA 4DQSA 2BUPA 3TWHA 4FLVA 4M63C 3OVNA 3CJ7A 2IS3A 4LFAK 4PKHA 3FZLA 4H0PA 4DFJA 3NE6A 1WBBA 1L3TA 2VWKA 3U8XA 3FE1A 1EKEA 4FPAA 4RW9A 4WFNL 4IEEA 5HBMA 4EAHD 5JICA 4IO9L 3U6FA 4A5BA 1A5XA 3ZSYA 1RTDA 4BR5A 4Z4GA 3ENBA 4AH9A 4B3OA 3KWGA 4KAZA 4DR1K 3MMVA 1W7AA 5I9EB 3CJAA 2Q0UA 5GAHP 1VQ8N 3J8AA 5CR4A 4E19A 3V1QA 4CJ5A 1B9FA 1NKBA 1Z25A 4BRFA 5AQLA 3ATUA 4E7JA 3DLHA 1SS6A 3BZCA 4CZMA 4YFUA 5IWAK 4CHYA 1JLQA 1QHTA 3UKUA 1BQNA 2A1SA 2AP1A 3O3FA 2A41A 2F9WA 3TTDA 4O0IA 3O3HA 3K9KA 2I7PA 3MX2A 2I7NA 1GLFO 1TAUA 4BVPA 4O44A 1ATRA 4W5OA 2V7YA 3CETA 4OLBA 5HRNA 1BQMA 3IUCA 1KSPA 3KLIA 3VQEA 5E26A 3LWMA 4JKGB 3NAEA 4CD1A 1RBVA 3DYAA 4B3RK 3VEXA 2DPNA 1HNXK 2PAVA 3ZEUB 4JI4K 4FJ7A 3AVFA 4CERA 1TYQA 4JLHA 5EX5A 1YTAA 1S1VA 4CGDA 3PX6A 4JHDB 1NGEA 1D9DA 4L3QA 5KQ8A 4DUYK 4BDPA 2AJQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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