3CJCA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with dnase i and gelsolin-segment 1
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/hydrolase
total genus 99
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjcA04
3P4IA 5EXWA 3VF6A 1BU6O 2P9NB 1NM1A 1HLUA 4RTFD 5AQYA 3AY9A 5TKYA 1BWFO 3AAQA 3SMPA 4BG8A 3H3NO 2ASPA 1NGDA 5AQJA 3QFUA 5JMVA 3WXKA 1ZBSA 3MDQA 4FWQA 1X3MA 4FOEA 5BPNA 5AQSA 5AZIA 1R59O 1DGKN 4CZMA 2FF3B 2YCHA 3LDLA 4BG9A 4EHUA 3IMXA 2YI1A 2P9IA 3ZEUB 4CBUA 5AZJB 4BR4A 1NGFA 5AQLA 4XH5A 2P9PB 1E4FT 4FWOA 2QWPA 4PKGA 3DXKB 2E1ZA 2PAVA 4BRQA 4BQLA 1ZC6A 2FSKA 3UB5A 5KQDA 4FSVA 4FWPA 4H5NA 2Q36A 3VPZA 1DKGD 2AA4A 3HM8A 1XC3A 3QICA 3SJHA 2E1YA 3AARA 3CQXA 4MLHA 2YJFA 4JD2A 2A42A 2J4RA 3FZKA 1YUWA 3CERA 3CJBA 3CJ7A 4WQ5A 4XH1A 5BN9A 3WEEA 5AQTA 1QZ6A 1TUYA 2V7ZA 3O1BA 2QWOA 2QW9A 1ATSA 4M7XA 1XUPO 3FLCO 2F9TA 2QWMA 4EFHA 1GLJO 5JLFA 4C23A 4H0YB 4EIAA 1QQNA 4BC5A 2P9NA 5AQOA 4IJNA 1NGGA 2I7PA 2VWBA 4B1UB 3M6GA 4I6MB 4BRIA 2W41A 4B1XB 4B1WB 1YXQA 4BRDA 4BROA 3ATVA 3LDOA 4H0OA 3A5MC 2D0OA 1HUXA 1YAGA 4MLEA 4MO5A 4H03B 5LJVA 1JCEA 2ZF5O 2IVNA 1HKGA 4BC3A 3CI5A 5AQXA 1Z05A 2P9KB 3O08A 3L0QA 4BR2A 4L3QA 3ZEUA 5AZJA 2P9LB 1Y64A 2P9PA 1T6CA 4B1VA 3DXKA 3ZETB 2A40A 2Q97A 4BRCA 4A61A 5FPMA 2V52B 3GG4A 3TU5A 3M1FA 2GELA 2FLOA 4CZFA 3GL1A 2ZGYA 2GTDA 4JHDB 4CZEA 2UYTA 3EL2A 3GBTA 5JICA 1NGHA 5B8HA 3ZX3A 1X9JA 4XH4A 1KAZA 5E26A 3DJCA 3ID8A 1SQKA 2QM1A 1ESVA 4E1JA 3H1QA 1NGAA 3I8BA 5AQUA 1T6DA 3CIPA 2F9WA 1C0FA 3L4IA 1NGCA 1H1VA 4H5RA 4PL8A 4FO0A 4FWKA 3BF1A 3FFKB 4CZGA 2CH6A 3VF2A 4XEIA 3IFRA 3HTVA 1QZ5A 4K41A 5EY4A 4H0VB 5E84A 3VEVA 3A0IX 2NLXA 5KPRA 3MN5A 1K8KA 2ZWHA 1WUAA 4H5WA 4I6MA 3VEOA 4DQ8A 5FPNA 5FPEA 1J6ZA 4BGAA 1GLEG 3D2EB 2D1KA 2E88A 3FR0A 3G25A 3WT0A 1IJJA 1U2VB 5EOYA 3SMSA 3VESA 1MWMA 4IWVA 5AQNA 5BREA 4CZIA 3L6QA 5F2RA 3U8XA 4BR5A 1TUUA 4K42A 2P9KA 2D0PA 2QWLA 1QHAA 3R6MA 2AP1A 2P9UB 2P9LA 3O1WA 1P8ZA 2BUPA 3R9PA 1IG8A 3J8AA 3BUZB 3QMLA 4WQ4A 3A8YA 3ZETA 5BPLA 3VGLA 4KBOA 3LM9A 5EVZA 5ADXA 3VEZA 3IUCA 4EAHD 4M63C 3DAWA 4DCHA 2D4WA 5FPDA 3FE1A 1JCFA 1XQSC 4CBXA 5BN8A 2IVOA 4JHDA 4F9OA 4JNEA 3ATUA 2IVPA 2HF3A 2NZTA 4A2AA 4EHTA 3BP8A 1S22A 1BOTO 4BR9A 4A2BA 5AFUH 3HSCA 1NGBA 5AQMA 2V51B 2E2QA 2FSNA 5LJWA 4YDUA 2CGLA 3FZLA 3KZBA 2Q31A 4BQZA 4BRKA 4BRAA 4BRGA 1BA0A 4B1ZA 1KAXA 3WXJA 3O8MA 1K8KB 3VERA 5BRHA 2HOEA 3QDKA 4DB3A 2ZGZA 3VEXA 4IO8A 3D2FB 5AQPA 3VEWA 1KXPA 1U6ZA 4IJAA 3ENHA 4CI6A 3O80A 5KPZA 1TYQB 5AQHA 3ZX0A 3D2EA 1NMDA 2WUSA 3UKRB 3RSEB 4PKIA 3QFPA 3VF4A 3CHWA 1HKBA 1CZAN 1U2VA 3GE1A 2A5XA 2FXUA 1WOQA 3BF3A 2YHXA 4BR7A 4FOIA 3MN6A 2HF4A 3CJAA 3U9ZA 3WXIA 1DEJA 4JAXA 1BO5O 1V4SA 1MWKA 3BEXA 2P9UA 4J8FA 3VGMA 2VYPA 3ULEB 4FWRA 4BR0A 3VGKA 3A5LC 3FGUA 3QB0A 4B9QA 3FZHA 2P9SB 3CJCA 2HMPA 5EX5A 2ASOA 4BVOA 4IXCA 4BRFA 3UE5A 3CJ9A 5KPTA 1YVNA 2DPNA 1HX1A 4QS9A 1NLVA 3H45C 3GOIA 1EQYA 3U4LA 4CZHA 3MK6A 4WYBA 5BRFA 4FL9A 2FF6A 3EN9A 2YHWA 5AQVA 4BC2A 4CBWA 1E4GT 1HPMA 4A62A 3W3DA 4PL7A 4BC4A 3H3OB 5ADXH 4ISFA 2OANA 1OKJA 4MO4A 1ATRA 3CQYA 1RDWX 4WQ5C 3QBXA 3LL3A 1SAZA 3CJ1A 3JXUA 1RFQA 3ENOA 4HTLA 4Y0WA 5AQRA 1HKCA 3MMVA 2CH5A 3DWLA 4FPAA 3VENA 2GUPA 3C7NB 1GLDG 3HI0A 4H0PA 4BRHA 5BPMA 3D2FA 4YDUC 3W0LA 4CZKA 3D7EO 5F1XA 2A3ZA 4DHYA 1NBWA 4H5VA 1ATNA 1X3NA 3EZWA 2I7NA 1TYQA 4ISEA 3I33A 3UKRA 3RSEA 1RGIA 3A5OC 5AQFA 3O4WA 4K43A 3LM2A 2BTFA 4CZJA 5BRDA 4BGBA 2VCPA 4BRLA 4BRNA 2Q2RA 5F0XA 2A41A 3ULEA 3TPQA 1BA1A 3IDHA 3O5BA 3UKUB 5AQWA 3U9DA 5AQZA 4NO7A 1BG3A 1QQMA 3H1VX 3DXMB 4RWTA 2P9SA 3A5NC 1NGIA 3VETA 2IIRA 4B1YB 1NGJA 4QS7A 3B8AX 2EWSA 1NGEA 1GLCG 3WXLA 3M3ZA 1V4TA 3GDQA 2E20A 2E2OA 2Q0UA 3FZMA 3LDPA 4JN4A 4IZ9A 1GLFO 2YHYA 4O5FA 5BR9A 2FSJA 1D4XA 4FWSA 1MDUB 4BRPA 4LC9B 4QS8A 1GLLO 3F9MA 4BRMA 4PKHA 1JCGA 4BREA 2YJEA 4AM6A 4Z94A 3JS6A 4ISGA 2KHOA 3FZFA 2A6AA 5AQIA 4CZLA 3H46O 5AQQA 1Q18A 4O8KA 1LCUA 3QBWA 4FWLA 5JLHA 1SZ2A 1Z6RA 3OHRA 3C7NA 2QWRA 2Q1NA 3WUHA 4H0XB 5CE3A 4AM7A 2W40A 3AAPA 3VEYA 4CD3A 1LOTB 2GWKA 2E8AA 3EKSA 3WQUA 4CJ7A 3LDQA 5I9EB 2ASMA 4GY2B 4HWIA 2GEMA 1MA9B 5AZIB 1C0GA 5AR0A 2PBDA 3SLCA 3KHYA 4NB4A 2V7YA 4M7YA 2Q0RA 3MN9A 2P9IB 2GWJA 5LY3A 1BDGA 3VOVA 4H5TA 4H0TB 2NRHA 4RCHA 2CGJA 3UKUA 5AQKA 3ZX2A 3CETA 3R8EA 1HJOA 1GLBG 1QQOA 4BVPA 3MN7A 4K25A 3DXMA 3EO3A 5AFUA 4WQ4C 1KAYA 5ELZA 3LDNA 3SK3A 5KQ8A 2H3GX 3HBTA 2ITMA 3H6EA 3EKUA 3KVGA 1GLAG 4JD2B 1G99A 4GNIA 1BUPA 4CD1A 5AQGA 1NWKA 2QWNA 2E2NA 3WEEB 1S3XA 2QWQA 3C0BA 4FWNA 1T44A 1ZXOA 2QXLA 3O6WA 3S41A 2E2PA 4FPBA 3MCPA 4FWMA 3HZ6A 3WQTA 2CGKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D5RA 3DMJA 3P4IA 5EXWA 4CW7B 5FRMA 3C95A 3AVJA 4M3ZA 2IOCA 3AY9A 3WNHA 4DR5K 4R79A 3V9SA 4NCAA 2QKKA 4YY3K 1OVQA 1HQUA 3ID6A 2HHSA 2QKBA 3CCMN 4E72A 1WBDA 4JKCA 1DGKN 4JI7K 4F3TA 1NU0A 2OPQA 4CBUA 2PYJA 1NGFA 4AHTA 4LF7K 4CF9A 4FWOA 1BI4B 3DXKB 4M45A 2PAVA 3DM2A 4BQLA 3MX5A 3UB5A 3AVIA 4FWPA 2RN2A 4FJIA 1BL3A 3E01A 3AO4A 1DTQA 4FLTA 3CC7N 3QICA 3OJSA 2W6KA 3K9KA 4HCBA 1U45A 3CQXA 4MLHA 4B8CA 4OJRA 3RR7A 3HPOA 3OS1A 2J4RA 1RTHA 4JKFA 3CJBA 3J80O 4CHQA 2V7ZA 4OPHA 1TAQA 1VAZA 3MXMA 4G1QA 1ATSA 3DLEA 1XUPO 3FLCO 4DG1A 2UXDK 4IKFA 3KJVA 4HUFA 3K58A 3S3NA 4FVUA 4EIAA 1SL1A 4DU1A 2HVIA 1D5AA 1HYZA 4B1UB 4I6MB 1RILA 1RNHA 4CEOA 1VRUA 2LSNA 4B1WB 4BROA 1VRTA 3K5OA 3LDOA 3KK7A 4DU4A 1WSHA 2XO7A 1K6YA 4O8UA 4H03B 5CZ1A 5LJVA 4DV5K 3SAGA 3KWIA 2OZMA 1WAFA 4E1MA 3CPWM 4BR2A 3L0QA 4JI3K 4L3QA 1YTUA 4B9TA 3RMAA 4CECA 2ITGA 4E3SA 3TSPA 3V1OA 4B1VA 1NK6A 2IDOA 2A40A 2Q97A 5KRSA 1KCFA 1IH7A 4UY8O 5MLCQ 3GG4A 1VQMN 1VSMA 1NJZA 4CZFA 5D3GA 1VQ8N 3GBTA 1S6QA 1NGHA 1Q8IA 3VQDA 1X9JA 4FZZA 3L8BA 4CEZA 3AA2A 2VG5A 5CZ2A 5E26A 4EP5A 4Y1DA 1UWBA 4ZHRA 1SUQA 4X64K 3I8BA 1C1AA 5AQUA 1IKXA 3SPZA 3MXIA 3HOSA 2D0BA 1H1VA 4H5RA 4FW1A 2OTLN 4Q0BA 5HRSA 4XEIA 3IFRA 1QZ5A 4CJLA 3LZIA 4BDYA 3P1GA 3LPTA 1ZBUA 4BDPA 3BZCA 3VEVA 3MN5A 3KLEA 4YOTA 1WUAA 3VEOA 1RT2A 4AHVA 4JYAK 4WFNL 5CHIA 4FLVA 4BWMA 1JLAA 2O8EA 1MWMA 4IWVA 1BHLA 3LWLA 3JAMO 5BREA 4DTUA 4LF4K 3U8XA 4CGJA 2D0PA 4N41A 4I7FA 3K0SA 2P9LA 3WNEA 4WQ4A 1Q7YO 4ELVA 4E1NA 4KHSA 3ZETA 4KHPK 4JKEA 5HBMA 3FFIA 4HHTA 5GAGP 3AO2A 4EAHD 1IG9A 4PWDA 4DCHA 4IBNA 5FPDA 3FE1A 3AVNA 3OJUA 5BN8A 3ZLJA 4F9OA 3ATUA 2NZTA 3TSUA 2NRVA 1YITN 3CF5L 4B3SK 1ZBFA 4DV1K 2BANA 2IS3A 5AFUH 1QHTA 2E2QA 3E1YA 1SKSA 5LJWA 3ULDA 3ZT4A 1BQMA 4ZTFA 3BY5A 4CGIA 1UA0A 2HHUA 4CF0A 1KAXA 1NJXA 4OLBA 3QDKA 3VQPA 4N76A 4WE1A 3VEXA 5AQPA 3ENHA 2O4IA 3V81A 5KPZA 3DLRA 3D2EA 1ITGA 3UKRB 3RSEB 1HJRA 1CZAN 2QA4N 3GE1A 4H4MA 4FOIA 4KB1A 3WXIA 1DEJA 1V4SA 3AGRA 3NH0A 4FM2A 1M90O 3QEWA 2ZD1A 2X6NA 3G0ZA 4FWRA 3MCAB 4OVLA 3FZHA 2HMPA 2G8WA 4FJHA 4GKJK 3KD1E 4IXCA 4BRFA 3Q7BA 1NG9A 4X65K 1SL0A 2DPNA 4EZ9A 1WB9A 2NRXA 2OTJN 1RT7A 3B6OA 4FM1A 3F5TA 3MK6A 4WYBA 4FL9A 4DR7K 4DS4A 2FF6A 3EN9A 2YHWA 2UU9K 1YVUA 4PHTX 1HPMA 1WSEA 3W3DA 4GMJB 5ADXH 1HR0K 3SUOA 3OYNA 1ATRA 4CEDA 4WQ5C 1LW0A 3QBXA 4O0JA 3QNOA 5IT9O 4JEPA 3D6RA 4HTLA 2KLAA 2KW4A 3MMVA 4DV2K 4FPAA 1O13A 3J7AP 1GLDG 4H0PA 2KQ2A 4CZKA 3D7EO 4CJPA 5JVHL 1KVBA 4DHYA 2JWLA 4H5VA 4JI1K 3M8SA 3K2PA 2RPIA 4ISEA 5BR8K 3HXMA 4PY5A 3QETA 4LSLA 1KFDA 3M8QA 3O3FA 1NOYA 2G8UA 1N5YA 2YNIA 4C8NA 2Y1IA 4K43A 1VQNN 1OH8A 3HPHA 4LH4A 5E41A 4O5BA 3UKUB 4C8OA 3U9DA 3QERA 5AQZA 3J7ZO 4RWTA 4JK8A 3SBGA 3VETA 1BGXT 4B1YB 4C1NK 4R5PA 3THWA 1VQ7N 1C1CA 1NGEA 4LFCK 2FBXA 3AVLA 1RDAA 3M3ZA 4WFBL 3OYAA 3TTFA 5CYMA 4PQUA 4CE9A 4O5FA 4DWIA 4CF8A 5BR9A 4JKBA 1WLJA 1D4XA 4ZTJA 1MDUB 1DTTA 1SKRA 4DFMA 3F9MA 4CHYA 2YJEA 5HOOA 5C2FA 1WN7A 5JLHA 5GIPA 2ZJPL 2QWRA 5DK5A 5LL6Z 3VQ6A 5CE3A 4B9SA 2P51A 4AM7A 3HK2A 2O8BA 1LOTB 3EKSA 1JLGA 3WQUA 4BE1A 2R7YA 4DLGA 1RBUA 4YORA 1VQ6N 1IBMK 1C0GA 5AR0A 3SLCA 3NE6A 3BGRA 3KD5E 2Q0RA 3AVKA 2D0CA 3VMFB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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