3CJCA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with dnase i and gelsolin-segment 1
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/hydrolase
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 99
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjcA04
2OANA 1XC3A 3U4LA 3EKUA 4L3QA 3A5OC 2Q2RA 5F2RA 5FPMA 4MO4A 2D0OA 3LM9A 1SQKA 4BR7A 5AQRA 3ENHA 2DPNA 1QQMA 2NRHA 3L6QA 3JS6A 3IDHA 3IMXA 3KZBA 3MMVA 1QHAA 5BREA 1BUPA 4FPBA 2E2NA 4H5NA 1R59O 3MK6A 3ZEUA 1ATSA 3WQUA 3VEZA 1NGGA 4FWRA 3ZX2A 3LDLA 3UB5A 5AQHA 4EAHD 4NB4A 1T6DA 4F9OA 4DB3A 4QS9A 3AAPA 3VERA 3VETA 4IJAA 4K25A 1NGHA 1NGJA 2QWLA 4JHDA 1GLBG 3H6EA 4ISFA 4BRQA 4BC3A 3LDNA 3HSCA 3I33A 4M7XA 3W3DA 1X3MA 2PAVA 2FF6A 3O80A 1LCUA 1JCFA 3AY9A 3L0QA 2HF3A 3GE1A 3WT0A 1IJJA 4J8FA 1HLUA 1GLCG 5JLFA 5ADXH 3EL2A 4BQLA 5AQZA 2ZGZA 2CH5A 3SK3A 3UKRB 5KPRA 3D2EA 4CZJA 3LDQA 2QM1A 4EIAA 5AZJA 1ZC6A 1BDGA 2E2OA 4WQ5C 3HM8A 3JXUA 4B1UB 4BRPA 5B8HA 1HKBA 4K42A 3VESA 4DHYA 1E4GT 2V51B 2BTFA 4H0XB 4PKIA 2E88A 1U2VB 3CETA 3ID8A 5AQOA 1C0GA 4CZLA 5BPNA 2W40A 1YUWA 2P9NA 3CIPA 3H45C 1BA1A 5EX5A 1ESVA 1XQSC 3FLCO 2YHXA 4BRNA 1OKJA 1NLVA 3D7EO 1T6CA 3U9DA 2WUSA 3HTVA 3BUZB 5AFUA 5FPNA 1GLJO 4GNIA 4O5FA 1QZ6A 4MLEA 1SZ2A 1HUXA 1BOTO 4A62A 1TUYA 4BGAA 3BF1A 3IFRA 2AA4A 2P9IB 3CQYA 5AQMA 5AQPA 2VCPA 4Z94A 2ASMA 2QWPA 4CD1A 2E2PA 2Q0RA 2VWBA 5AQSA 1ATRA 1YVNA 2Q0UA 4XEIA 4BR0A 4O8KA 3ZX3A 3BP8A 4BROA 2GUPA 2UYTA 5F0XA 1YAGA 3SMPA 4FL9A 2CH6A 4B1ZA 3VPZA 2ASPA 3ZX0A 3R9PA 4AM6A 2FLOA 3O4WA 5AQFA 5BRDA 3O1WA 3QFUA 3ENOA 4BVOA 3W0LA 3D2FB 3ULEA 4WQ5A 4QS8A 1TYQB 5AQXA 2P9LB 3FGUA 2Q97A 1GLEG 4I6MA 3FE1A 5BR9A 4FWOA 2AP1A 4RTFD 3VEVA 1MWKA 3CQXA 3H1VX 3VEYA 3ATVA 2P9UA 3WEEA 2E8AA 2QWOA 3O1BA 2V7ZA 4BQZA 4MO5A 1KXPA 2P9UB 4FWLA 1BO5O 4B9QA 3A5LC 3IUCA 1HKGA 3A5NC 4CZFA 2KHOA 3HBTA 5EVZA 1GLFO 4FSVA 4GY2B 2A42A 1C0FA 3CJ1A 5JICA 3P4IA 4FWKA 4BC2A 4I6MB 2P9PB 1V4SA 1KAXA 4EHUA 2NZTA 4IO8A 2IVOA 4FWQA 5BPLA 2FSJA 3VENA 3FZLA 5AQQA 2EWSA 1NMDA 3G25A 3DXMB 1MDUB 3UKUB 3HZ6A 5BRHA 3WXIA 4WQ4A 1V4TA 4BGBA 3DAWA 1KAZA 2J4RA 4EFHA 3VF4A 2QWQA 3UE5A 2W41A 2E2QA 2VYPA 4CBWA 2E20A 2YJFA 2HF4A 1RDWX 3OHRA 3I8BA 1BG3A 3VGMA 1G99A 3RSEA 4KBOA 4CZIA 2BUPA 2P9IA 1BA0A 1NGFA 3FZKA 1T44A 1NGAA 4E1JA 4EHTA 2YCHA 5E84A 4H03B 2P9KB 3J8AA 3FZHA 4NO7A 1K8KB 3ZEUB 4BRMA 3CJ7A 4B1VA 2P9SB 1U6ZA 3QICA 4BRGA 3U9ZA 5FPDA 3L4IA 4FOIA 1DEJA 4PKHA 4FPAA 3F9MA 2A40A 3WXKA 4CD3A 3VEXA 4BRFA 1ATNA 5AQKA 3WEEB 3C0BA 2P9NB 4CI6A 3A0IX 2ZWHA 1GLLO 5AQUA 1HPMA 2ASOA 1P8ZA 3VEOA 4BG9A 5JMVA 2P9LA 2ITMA 3GOIA 4BRDA 5AQLA 4ISGA 1HX1A 4RWTA 1JCEA 1EQYA 2IVNA 1ZXOA 5AQWA 4XH5A 1NGIA 3QBWA 4DQ8A 3VF6A 1NM1A 4HTLA 3WXLA 4CBXA 5ADXA 5AZIB 4XH4A 3AAQA 3WXJA 2QXLA 3DXKA 5F1XA 5BPMA 2A3ZA 3VF2A 2GWJA 4A2BA 3C7NB 3KVGA 2PBDA 3VOVA 4CZHA 3FR0A 5KQDA 2QWMA 5TKYA 3MDQA 2GELA 3O5BA 4JHDB 3MCPA 1BWFO 5AR0A 5BN9A 4DCHA 4JD2A 2D0PA 4JNEA 1DKGD 3SMSA 4CBUA 3WQTA 2P9PA 5AQNA 4M7YA 2HMPA 1Y64A 4IWVA 2Q1NA 3ULEB 4BR5A 1GLAG 3O08A 1GLDG 1YXQA 1TYQA 4LC9B 5E26A 3SJHA 3RSEB 2GWKA 4A61A 1WUAA 3MN9A 3TPQA 1D4XA 2I7NA 3EN9A 4PKGA 3QFPA 1CZAN 3DXKB 2A6AA 3ZETA 5AQYA 1X9JA 2H3GX 3LL3A 5AFUH 1Q18A 4B1XB 3LDPA 3EO3A 3BEXA 3QB0A 3UKUA 4BVPA 3A8YA 2IVPA 3SLCA 1U2VA 1IG8A 1DGKN 3O8MA 4B1WB 3H3OB 4BR2A 1RFQA 1TUUA 2I7PA 3ATUA 1QQOA 4BREA 3GG4A 1Z6RA 1HJOA 2F9WA 4PL8A 2YHWA 4H0VB 4HWIA 4JAXA 3M3ZA 5AQVA 5BRFA 2ZF5O 5AZJB 1KAYA 4AM7A 2YI1A 2D4WA 4XH1A 3EZWA 3U8XA 3FZFA 4WYBA 3CI5A 3ZETB 3EKSA 4BRKA 3FZMA 2V7YA 2GTDA 3BF3A 3R6MA 3MN6A 1XUPO 1MA9B 1K8KA 4BC5A 1NGCA 4CZEA 2Q31A 5ELZA 2GEMA 4BRHA 3CJBA 3S41A 2IIRA 3B8AX 3VGKA 4H5TA 3FFKB 1NGBA 1NWKA 4JN4A 5KPZA 4H0TB 4MLHA 4FOEA 4FWNA 3D2FA 4K41A 4BR4A 4PL7A 4CZKA 3H46O 4YDUC 2YHYA 3UKRA 4RCHA 4FO0A 3M6GA 5EXWA 3QDKA 1E4FT 2FF3B 3LDOA 1BU6O 3C7NA 2QWRA 2QW9A 3VEWA 4BRIA 1J6ZA 3LM2A 2Q36A 3DXMA 2YJEA 5AZIA 4CJ7A 1NGEA 5KPTA 1LOTB 2CGKA 1QQNA 3HI0A 4CZMA 3O6WA 1JCGA 4BC4A 2D1KA 3CHWA 3VGLA 3CJ9A 4IXCA 3GBTA 2FXUA 1NGDA 3MN5A 1MWMA 4M63C 3H1QA 3GDQA 5KQ8A 4H0OA 4WQ4C 4C23A 5JLHA 5BN8A 2CGLA 4Y0WA 1ZBSA 2ZGYA 4H0YB 2P9KA 4H5VA 4FWSA 4CZGA 1RGIA 3CERA 2CGJA 4YDUA 5CE3A 3CJAA 3TU5A 4H5WA 2F9TA 3M1FA 2NLXA 5AQGA 5AQJA 4BRCA 2V52B 5AQIA 4B1YB 4BRAA 4BRLA 5EY4A 4A2AA 3A5MC 1Z05A 4JD2B 3WUHA 4FWMA 5FPEA 2QWNA 3R8EA 3H3NO 3MN7A 5LJVA 3GL1A 3D2EB 3QBXA 4FWPA 1HKCA 4BG8A 3DWLA 4IJNA 1S22A 1H1VA 2FSKA 5LJWA 3DJCA 4ISEA 1QZ5A 4QS7A 2P9SA 3KHYA 5AQTA 2E1YA 5I9EB 1X3NA 4IZ9A 2FSNA 4H0PA 5EOYA 1NBWA 4H5RA 3QMLA 3AARA 4K43A 1SAZA 1WOQA 2HOEA 2A5XA 1S3XA 2A41A 5LY3A 3CJCA 2E1ZA 4BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ6A 4FJ5A 1LWCA 1VSHA 5FPMA 1XNQK 2O8EB 3SQ0A 3HXMA 2DPNA 2VG7A 2NRHA 4O55A 3L6QA 3JS6A 3IDHA 4FM0A 1N5YA 3KZBA 3MMVA 4IEEA 2D5RA 4DMNA 4ELVA 1ATSA 3WQUA 4NB4A 3NH0A 4BDZA 4QS9A 4W5OA 3ZSZA 1I39A 2QWLA 4JHDA 3H6EA 4BC3A 3LDNA 1RT4A 1X3MA 1WSIA 1FKPA 2WFBA 1DT9A 3L2RA 3WXMB 1X9MA 2NRVA 2WC9A 2PYJA 3QESA 3WT0A 4J8FA 3SV4A 3QEPA 5ADXH 4DSEA 2OPSA 3D45A 2JGUA 4M3UA 4CZJA 3L8BA 3LDQA 4CHOA 3LZJA 4CF0A 2G8WA 3V9XA 1J54A 1U04A 3WNHA 5CYMA 4WFNL 3TAFA 4DTOA 2F8TA 3C95A 4WQ5C 1S9GA 3QIOA 3OY9A 3O9UA 4BRPA 4B1UB 3O4NA 4M3ZA 3MECA 2HVHA 4DHYA 4X64K 1E4GT 2V51B 4O5BA 4DQQA 3LP0A 3ID8A 5AQOA 4FLUA 1C0GA 2W40A 4JI0K 3CIPA 3OS0A 4BRNA 3D7EO 1NLVA 3ZSQA 4GW6A 3QETA 4B9TA 1K6YA 3OYGA 3BUZB 2HHUA 1ZBLA 3AO5A 3P5JA 1BOTO 4FJ8A 1TUYA 3U3YA 1BI4B 1TKZA 1IBLK 1Q9YA 2AJQA 3CQYA 3I55N 2OZSA 4Z94A 5SZTA 2QWPA 3CFPA 2BGGA 4DQSA 5C10A 1ATRA 4EP5A 1HNWK 4ILJA 2Q0UA 3RMDA 3BY5A 5FRMA 4IFEA 3ZX3A 3THXA 1WAJA 2YV0X 4IKFA 3K2PA 5C42A 4HVJA 1UWBA 4M3WA 3SMPA 4B1ZA 3T7ZA 3ZX0A 4JI5K 3W0LA 1WSGA 1WB9A 5DM7L 1TYQB 4I6MA 4KFBA 1NG9A 2FBXA 3SQ2A 3I56N 5I42A 3THYA 3S3MA 1JLAA 4OGEA 4IG0A 2HHQA 3C6UA 3QO9A 1CXQA 2QWOA 3O1BA 2V7ZA 4BE2A 3DLHA 3SAFA 3WNFA 1HQEA 4JV5K 5C0YA 4B9SA 5J2QA 2QI2A 1KCFA 1EX4A 3A5NC 2OZMA 4OPHA 3KIOA 3HBTA 4FSVA 4GY2B 2A42A 1C0FA 2E6LA 3KLIA 4M3RA 4BC2A 1XHXA 1KAXA 5IT9O 2HMIA 5BPLA 4IO8A 4FWQA 1A5VA 3VENA 5AQQA 4E7JA 2EWSA 3G25A 1BCMA 4JLHA 3UKUB 4LF5K 2QA4N 1U47A 1ASWA 4JKBA 1CLQA 1V4TA 2J4RA 4DFKA 4KH6A 2ZD1A 3CG7A 2QWQA 3VF4A 4FM1A 2O8BA 2RHKA 3CFRA 2VYPA 2E20A 2OPPA 2F96A 2DTUA 3RR8A 3AVJA 4Z4CA 4FJIA 3I8BA 1BG3A 3VGMA 5KTQA 4YOWA 3L2VA 5IWAK 2O8DA 5C2FA 2G8UA 4E1JA 4E72A 4KTZA 1ZBUA 4PA1A 4KHYA 3OBYA 4YOUA 1T03A 3JYTA 4BRGA 3WNEA 3L4IA 4DTMA 3MCAB 1DEJA 3UIQA 4FPAA 3CD6N 1P90A 4TSXA 5AQKA 3WEEB 4BWJA 5HLFA 2ZWHA 1NU0A 2JLEA 4CESA 4M42A 2ASOA 1P8ZA 4PY5A 3RWUA 1T3VA 1Z25A 2P9LA 3VA3A 4CEZA 4BRDA 4CEBA 1HX1A 1RBTA 2IVNA 1EQYA 3PO5A 1ZXOA 1BI4A 3MAQA 5DK5A 4JI8K 1W9HA 3TTFA 1NM1A 3WXLA 2IC3A 4WE1A 1RT3A 3CCRN 3WXJA 2QXLA 3DXKA 3HL8A 5BPMA 4IOCL 4DWIA 3OYDA 4A2BA 3KVGA 4CZHA 1EKEA 2QWMA 5TKYA 2GELA 5H1SQ 1SUQA 4JHDB 3MCPA 1BWFO 4PQUA 5AR0A 2BE2A 4JD2A 2D0PA 3SMSA 4CBUA 3ZSVA 4FJLA 1A5XA 3SAHA 2HMPA 2Q1NA 1W0HA 1GLDG 2NRXA 3O08A 4RW8A 4CJ4A 5E26A 2VWJA 4HUGA 4C8KA 1W2BM 2FBTA 3TPQA 3PO4A 2XRIA 1NK8A 3NMUA 3EN9A 3DXKB 2W6KA 3PSIA 4FXDA 1S1UA 3L3UA 3NFAA 3QB0A 4Z4GA 1TGOA 1L5UA 3A8YA 4E19A 4CGDA 4DR7K 1VQPN 1U2VA 4B1WB 4BR2A 1RTIA 1VQ7N 2Y1IA 4OLAA 3VA0A 1JLEA 1KSPA 1NK4A 4JAXA 4YY3K 3KLEA 3CMAN 1NKCA 4XH1A 3EZWA 3DRPA 3U8XA 4WYBA 1VSFA 4FZYA 4BRKA 3FZMA 1KQSM 1XUPO 4GV3A 4BC5A 4NXMK 4CZEA 4JI7K 1IKXA 4I7FA 1IV0A 4BRHA 4CJEA 3S41A 4CJ5A 3B8AX 3VQDA 4FW2A 4OKEA 3VGKA 3I8DA 4BECA 1BQNA 4WFBL 2O8FB 2HB5A 3G4SN 3LP3A 3VQBA 3TSUA 5KPZA 2RE2A 3AA4A 4O4GA 4DUZK 1Z26A 3K5LA 1TK8A 2YHAA 4YDUC 4CFAA 1Q81O 3VQEA 4KHWA 3UKRA 4JKDA 4FO0A 1O1WA 3A2FA 1M90O 3M6GA 3CCVN 4Q0BA 3THVA 4Z4EA 3OYMA 2BH1A 3M8QA 2A1RA 3OBWA 4LF6K 4DTJA 2QWRA 3VQPA 4ELUA 3F9KA 4JK7A 3ALYA 1L3TA 2VG5A 4FJMA 3VQ9A 4F3OA 4DF4A 2O4IA 1NJZA 4O8UA 4CJ7A 1JLBA 2ETJA 1ZBHA 3HJFA 1GOCA 2VGMA 5KPTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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