3CJCA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with dnase i and gelsolin-segment 1
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/hydrolase
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjcA04
3H3OB 3QDKA 3H3NO 2P9IA 3KZBA 1OKJA 3FR0A 3EO3A 4FL9A 5AQTA 2W41A 3WQUA 5AR0A 3ZEUB 1V4SA 5AQYA 2Q36A 1DEJA 5ADXA 4DHYA 3CQYA 2P9PB 3QBWA 4BC4A 3HI0A 4RWTA 4CD3A 3ZX2A 3ATUA 1BO5O 1U2VB 3VERA 3DXMA 1DGKN 4BR4A 2H3GX 5AQMA 1ZXOA 3EKSA 2A40A 4MLEA 4QS9A 3I33A 2CH6A 4CBXA 2BUPA 4BQZA 2FF6A 3LM2A 2ZGYA 2E20A 4PKGA 3KVGA 3QBXA 3VOVA 4BR2A 5B8HA 5JLFA 2P9SB 3D2FB 3R6MA 3D2EA 3MK6A 5AQQA 1X9JA 2P9UA 4BROA 2ASOA 2V7ZA 3KHYA 3SJHA 1NLVA 1KAZA 3O1BA 3UKUA 2J4RA 2IVPA 3C0BA 3WQTA 4CBWA 2E88A 3M6GA 3MCPA 3MN7A 4BRHA 4JN4A 4A2AA 1J6ZA 4A2BA 4BGBA 3L6QA 1JCGA 1HKGA 5AQRA 4JAXA 4BRAA 1BG3A 1U6ZA 3EN9A 3GE1A 3H6EA 3LDOA 4FWKA 4BVPA 2QW9A 3A5OC 1BA1A 4BC3A 2ITMA 1R59O 2YHWA 5AZJA 2E2NA 2I7NA 3A8YA 3H46O 4H03B 1KAYA 3ENHA 4B1WB 1GLEG 1DKGD 2UYTA 2E1ZA 4WQ5C 2WUSA 3FZHA 4FOEA 5AQLA 1G99A 2P9KB 5BRDA 3CJ1A 2Q0UA 2NLXA 2QWMA 5AFUH 3BP8A 4FSVA 3U9ZA 3BF1A 3MN6A 4BR9A 3ZETA 3FZFA 4H0TB 2QWOA 4M7YA 3H1QA 5AQIA 3A5MC 1RDWX 3F9MA 5F2RA 3QMLA 3VGKA 4Y0WA 4IJNA 4F9OA 1NM1A 4IJAA 3R8EA 3UB5A 2HF3A 4BRIA 5FPMA 3WUHA 1LCUA 2Q2RA 5AZIB 3WEEA 2EWSA 1S3XA 3VEZA 1QQNA 4IXCA 4RCHA 2NRHA 3W3DA 3HZ6A 4FPBA 4K42A 4CD1A 5BPMA 2CH5A 2E2QA 2E1YA 3WT0A 5JICA 4CZIA 3C7NB 3RSEB 3WXJA 4K43A 4JHDA 4H0PA 2A5XA 4FWMA 1XUPO 2KHOA 4HTLA 5LJVA 3QICA 4WYBA 3VEXA 3QB0A 2QWPA 3D7EO 4BR7A 4B9QA 4CZJA 1SQKA 2BTFA 2QWRA 4L3QA 4AM7A 3CJ9A 3O4WA 3DJCA 1GLJO 4CZEA 5I9EB 4CJ7A 4EAHD 1QZ5A 3CQXA 2F9TA 3DXKB 1HJOA 3MDQA 1P8ZA 4BREA 2GEMA 2NZTA 3ULEA 3VGMA 1LOTB 1Z6RA 1IG8A 3JS6A 1X3MA 1HKBA 4Z94A 2P9NA 3H1VX 3QFUA 4BRPA 3CJBA 3IMXA 2FLOA 1HLUA 4BRMA 5EY4A 4ISEA 3A5NC 4O8KA 3TU5A 4XEIA 2YI1A 3M1FA 2D0PA 5AQWA 4MO4A 4BRQA 3UKRB 1NGJA 3S41A 4M7XA 3MN5A 5CE3A 1RGIA 1HKCA 5FPNA 1T6DA 2ASPA 1ESVA 5AQXA 4B1ZA 4CZFA 4FWNA 4CZGA 4RTFD 3IUCA 1GLCG 1NGHA 4CI6A 4BRCA 1QQOA 2P9LA 3BF3A 4CZLA 3CETA 4CZKA 1MWMA 1MA9B 3LDQA 4JD2B 2A41A 5JLHA 2Q31A 2QWNA 1TUUA 3AAPA 4CZHA 3DAWA 3VEYA 4KBOA 1ATSA 3AAQA 5KQDA 3A5LC 2AP1A 1CZAN 1NGBA 3FGUA 1T44A 5FPDA 4B1VA 3O5BA 3O80A 5BR9A 2QWLA 2FSJA 3ZEUA 5AQKA 1K8KB 1GLBG 5EOYA 3VEWA 1TYQB 5AQOA 1NMDA 2P9PA 4C23A 1GLLO 3VF6A 2VWBA 3OHRA 1C0GA 5KQ8A 1YAGA 2OANA 1U2VA 4BRNA 1SAZA 4BC2A 3B8AX 3EZWA 1GLFO 5EXWA 4GY2B 3HBTA 4EFHA 2Q1NA 1WUAA 4BR5A 2P9IB 4BRFA 3LDLA 2CGKA 3FZKA 5AQSA 2P9SA 3D2FA 1MDUB 3LM9A 3SMSA 3TPQA 4K25A 4NO7A 2CGJA 4H0XB 4H5VA 4J8FA 3IDHA 1T6CA 3R9PA 3VETA 2ZGZA 3MMVA 3M3ZA 3DXMB 2VCPA 4FWRA 4H0YB 4IWVA 3L4IA 3P4IA 3LDNA 3VENA 2D0OA 3SLCA 3W0LA 2PBDA 1NGGA 3AARA 4MLHA 1ATRA 4O5FA 3O08A 3WXIA 5AQGA 5AQVA 3VEOA 5KPRA 1NGCA 1QZ6A 1D4XA 4IO8A 1BWFO 5AQHA 2FSKA 3CJAA 3GBTA 4CBUA 3ZX0A 1WOQA 3O1WA 1Z05A 3FLCO 3EL2A 3D2EB 4FWQA 4JNEA 2A42A 2P9UB 3MN9A 2ZF5O 3LDPA 1GLAG 2Q97A 5BRFA 4H5TA 2E8AA 3VPZA 2V52B 3SK3A 1NBWA 1NGDA 2AA4A 3UKUB 2D4WA 2GUPA 2P9KA 3O8MA 3ID8A 1GLDG 5KPZA 4IZ9A 3LL3A 1H1VA 4XH4A 2Q0RA 1ATNA 5BN8A 5AQPA 2V51B 2D1KA 1ZC6A 2QM1A 5ADXH 1BDGA 3GOIA 1XC3A 4EIAA 4QS7A 5AZJB 1JCFA 4WQ4A 1NGEA 4K41A 5TKYA 2I7PA 5AZIA 3FZMA 1HPMA 3GL1A 3U9DA 5E84A 4BQLA 4FWSA 1JCEA 3C7NA 3RSEA 4FOIA 1MWKA 4B1YB 3ZETB 1BOTO 4BRGA 2YHYA 4WQ4C 1KXPA 2GELA 2YJEA 3DWLA 4PL8A 5LY3A 2ZWHA 4MO5A 4I6MA 2FF3B 3CI5A 3L0QA 3BUZB 4BRLA 3WEEB 2YCHA 5AQUA 3U8XA 2F9WA 1NWKA 4H5RA 4DQ8A 2GWKA 2E2PA 2HMPA 4CZMA 4YDUA 3J8AA 5KPTA 2W40A 2YHXA 4FWLA 3IFRA 2FSNA 1Q18A 2A6AA 4JHDB 3CHWA 4DB3A 3WXLA 1SZ2A 5JMVA 5AQNA 3ZX3A 4WQ5A 3DXKA 5AQZA 3HSCA 1BUPA 4HWIA 1S22A 1NGFA 1X3NA 2IVNA 3EKUA 3GDQA 4XH5A 5FPEA 2E2OA 3H45C 1RFQA 1BU6O 3I8BA 4YDUC 1QQMA 4FPAA 4ISFA 1C0FA 3HM8A 4BG9A 4H0OA 4PL7A 1EQYA 4PKHA 5AFUA 4FO0A 5BREA 5F1XA 2IIRA 4B1XB 3BEXA 2V7YA 2GTDA 2VYPA 5ELZA 3UKRA 1KAXA 3SMPA 4NB4A 4E1JA 4A62A 3ENOA 4B1UB 5BPLA 5BPNA 2HOEA 3CIPA 4H5WA 3ULEB 2YJFA 2HF4A 1YXQA 4ISGA 1XQSC 5BN9A 3WXKA 2P9NB 1NGIA 3VESA 4BRKA 5E26A 3UE5A 4DCHA 3U4LA 1YVNA 4FWOA 2GWJA 4PKIA 1E4FT 4JD2A 4XH1A 4BVOA 2IVOA 3VEVA 3FZLA 4M63C 2QWQA 2CGLA 4BG8A 1Y64A 3GG4A 1YUWA 1HUXA 3FFKB 3AY9A 5LJWA 4GNIA 3VF2A 3CERA 3CJCA 1ZBSA 1QHAA 2PAVA 4EHTA 3CJ7A 4BGAA 3FE1A 1BA0A 3QFPA 4BC5A 4EHUA 1K8KA 4BRDA 3JXUA 1V4TA 2DPNA 4QS8A 4BR0A 5AQJA 1TYQA 1HX1A 4FWPA 3ATVA 4AM6A 4H0VB 3VGLA 5EX5A 1IJJA 2P9LB 3O6WA 5BRHA 2FXUA 4H5NA 1NGAA 2QXLA 4I6MB 3A0IX 3HTVA 3VF4A 2ASMA 2A3ZA 5AQFA 3G25A 1E4GT 4A61A 5EVZA 4LC9B 1TUYA 5F0XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C65A 3VA0A 3FR0A 4FL9A 4IEIA 1RDAA 3WQUA 2OZMA 4KH5A 4DV5K 3VN5A 4DHYA 3TI0A 3HVRA 4LF7K 3S3NA 4Y1DA 3ZX2A 4CF0A 3K58A 4AHRA 1L3SA 3V1QA 3ZSYA 2RN2A 2H3GX 1NOZA 2A40A 3NGIA 1VQ8N 4CBXA 3DLBA 2BUPA 3LM2A 1ZBFA 4KI6A 4ZTFA 3CC2N 3CPEA 4PKGA 1SS6A 4Z4HA 1DTTA 1BCOA 2QKBA 3NF7A 1VQ4N 5JLFA 4I7FA 3MK6A 3C6UA 1X9JA 4LFAK 4NCAA 5GADP 2V7ZA 3KHYA 1KAZA 4DR1K 1EX4A 3IS9A 4CBWA 1X9WA 4MDBA 3G71N 2O8FB 3MN7A 4BRHA 4OLBA 2WTUA 3AA5X 4DV0K 4ELTA 3PSFA 1RT1A 1U6ZA 4JK8A 4DWIA 2HHQA 4DFPA 3GE1A 3LDOA 4DQIA 3P1GA 4FWKA 1NJZA 1BA1A 2ITMA 4LH5A 5CYMA 4RW8A 3DLGA 3ENHA 4LF4K 1DKGD 5C2DA 3WNGA 2E1ZA 1WSHA 2UU9K 4M3UA 2WUSA 4CJUA 2YKMA 5KRSA 4FOEA 3OS1A 3E66A 4IO9L 2NLXA 1N5YA 5AFUH 4FLZA 2XHBA 2I5JA 4CGHA 1RT6A 5DK5A 3A5MC 1RDWX 3VGKA 5A2QO 4IJAA 2GV9A 3K9JA 3THWA 2HF3A 2DFFA 3E9LA 1LCUA 3WEEA 2EWSA 1NKCA 3VEZA 5HROA 3LAMA 3TAGA 3OYEA 4RCHA 1RBTA 5M1NA 1S5JA 3HZ6A 1WBBA 5DM6L 2HSTA 3AVKA 5BPMA 2CH5A 4CZIA 3C7NB 4H0PA 1S1UA 5CR4A 4BE7B 2O4IA 4M3XA 3EE9A 3NGYA 4WYBA 3OJSA 3VEXA 5HLFA 3QB0A 1NOYA 2RHKA 2OYQA 4C1NI 1TAUA 3RMCA 3QNNA 4PY5A 2Z1GA 3V1OA 1Q82O 1KC8O 4IDKA 4NCBA 4KI4A 1LAVA 1MU2A 4A5BA 3PX6A 4AHCA 3T7ZA 3RMBA 3S9HA 4FJIA 3LP3A 4I9LA 5FLXO 1LW2A 3KLFA 3CQXA 4C1NK 1L3UA 4DSKA 1HJOA 4PUOA 1P8ZA 2GEMA 2NZTA 4ICLA 3V9ZA 4DMNA 3C6AA 3L8BA 1QSSA 2O8DB 1RT2A 3QFUA 4BRPA 4F3OA 4GV3A 3IMXA 1CXQA 3NAEA 5EY4A 4CW7B 3TU5A 2ZQBA 2YI1A 4ELUA 4BRQA 3UKRB 4KHPK 4J2EA 4GKJK 1RGIA 1HKCA 3SNNA 4PQUA 5AQXA 4CESA 4PA1A 1FKPA 4B1ZA 2X78A 4CZFA 4JKGA 4RTFD 3IUCA 1GLCG 1VQ9N 2QEXN 1C0MA 1MWMA 1F21A 1CZ9A 1TUUA 3AAPA 3DAWA 3AAQA 3ZSVA 3A5LC 3DOKA 1CZAN 1NGBA 3FGUA 4OKKA 1HYSA 4CEAA 1IBKK 5FPDA 4O5BA 3O80A 5BR9A 2O8CB 3QEIA 4CGJA 1GLBG 3AO3A 3Q7BA 3VEWA 4DR6K 1TYQB 4EP5A 1NMDA 3CC7N 4FZYA 3VF6A 4B9SA 2VWBA 1C0GA 1SL1A 1I3AA 4JI1K 1LWFA 4CHOA 1SAZA 4A5AA 3EZWA 2HHWA 4DQSA 2D0AA 1EXQA 4CJSA 3SUPA 4BE2A 1WAFA 4OX9K 2P9IB 3ZYYX 3O4QA 1TK8A 4MQ3A 3KTQA 4BDYA 5CY4A 4B3MK 1Q86O 5AQSA 1DLOA 3ISNC 1BISA 4NO7A 4DR4K 2OCEA 4B8AB 3IDHA 3L2QA 4FVUA 5HBMA 2GX9A 3VETA 2ZGZA 3MMVA 2VG7A 5GINA 3DXMB 3F9KA 2O8FA 2VCPA 2OPQA 3T3FA 3ZSQA 3LDNA 4CJFA 2D0OA 1NGGA 4MLHA 3KK1A 1GOCA 1WSIA 4DV7K 1YI2N 3VEOA 3E1YA 5KPRA 4CECA 1QZ6A 1D4XA 1S6PA 2FC0A 3GBTA 3VQAA 4CBUA 3ZX0A 2Y1IA 1WOQA 2IS3A 1JKHA 3P31A 3HOSA 3FLCO 3CMEN 3D2EB 3SQ2A 1B92A 3L2RA 1VHXA 4JNEA 2P9UB 5BRFA 3VPZA 4CCHA 4CJQA 2NUBA 1VK0A 1HRHA 1NGDA 1VQ7N 3DOLA 3CCRN 1BI4B 1SL0A 1UAXA 4IG0A 4HCBA 2UUAK 1T7PA 3QESA 3D0PA 3CMAN 2Q0RA 5KGWA 5AQPA 3CCUN 2QM1A 5ADXH 1BDGA 1VSEA 1XC3A 4EIAA 1JL2A 1JCFA 5M1OA 3HL8A 4GVMA 2I7PA 5LMUK 3FZMA 2YHBA 1RDCA 4FJGA 1HPMA 1HNVA 4FLYA 3QEVA 1NG9A 3MEGA 4BQLA 1YT3A 3HP9A 1JCEA 3C7NA 2ZM6K 4FOIA 3ZETB 1ASVA 3DRRA 4M42A 2XO7A 3OTOK 2YJEA 2VGMA 3ZCMA 5J1EA 4QAGA 3L0QA 2YCHA 1Q8IA 3CCEN 2F9WA 3VQBA 2A1RA 4YDUA 3T1AA 3KJVA 4DU4A 2FSNA 2A6AA 1VQPN 4JKBA 3ZT0A 3CHWA 4DB3A 2ZJRL 5AQNA 4ILGB 4FYDA 2RE2A 5AQZA 2G8WA 1L5UA 4LF9K 1S22A 3L3UA 3EKUA 5TKWA 3SYZA 2O8DA 4XH5A 3AVJA 2QKKA 1KD1O 3U6FA 4LF5K 4PL7A 3AGRA 1S1VA 4DSFA 2IIRA 2WOMA 1TGOA 5ELZA 3B6PA 3UKRA 3SMPA 4WFNL 4DQRA 3ENOA 5BPLA 1JLAA 4CJ4A 2WFBA 5J2NA 4CEFA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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