5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
4H5TA 5JICA 3VENA 1BG3A 3L0QA 3B8AX 3QBWA 4XH5A 5JLFA 4CBXA 5BREA 3WQUA 3QMLA 3MK6A 3AY9A 4FPBA 1IG8A 1LOTB 2QWRA 1R59O 5JLHA 4H5NA 4BC3A 4CJ7A 1QQMA 1ATSA 3I33A 4IJAA 4BQLA 3GBTA 5AQVA 2GTDA 4KBOA 2GWJA 2VYPA 4BRCA 2A5XA 4B1VA 3FZHA 2D4WA 4H0OA 4PL7A 3VEXA 3GE1A 4EIAA 4XEIA 3LDLA 4B1ZA 5F0XA 3VEYA 3A5NC 4WYBA 5BPMA 5AQTA 3JXUA 3TPQA 2E2NA 2GUPA 3U9DA 1DGKN 3U4LA 4H5WA 1BO5O 1ATNA 3AAPA 4B1YB 3AAQA 4MO4A 3KVGA 2QWNA 5EX5A 2FF3B 1K8KA 1X3MA 3LM2A 3H1VX 4BR4A 2E2OA 4FO0A 4B1WB 1YAGA 3WXJA 4MO5A 4E1JA 5F2RA 4XH4A 3D7EO 3JS6A 3SJHA 5KPRA 4FPAA 4CZMA 4YDUA 3ZX3A 3A5OC 4PKHA 3ZEUB 1BA1A 3VOVA 3SMSA 4BRKA 1GLLO 1RFQA 1TYQA 4K43A 5KQ8A 1NBWA 1NWKA 4JHDB 1KAZA 1HKGA 3CETA 3GDQA 3DXMA 3DXMB 2FF6A 4CD1A 4FSVA 4B1UB 2A3ZA 5TKYA 2P9NA 4BQZA 3LDOA 3EN9A 3WXKA 3MCPA 5E26A 5FPNA 2QXLA 3QB0A 5AQYA 2EWSA 1Q18A 4WQ4A 4M63C 4FWQA 2V7YA 2NLXA 5AQLA 3WQTA 4F9OA 3TU5A 2GELA 3HTVA 4CZGA 4BRPA 4BRAA 3EO3A 3MDQA 2GWKA 2P9UB 1GLDG 1JCEA 4M7XA 4IWVA 4FL9A 3HZ6A 1BWFO 1NGBA 2E1YA 4QS7A 2ITMA 4JNEA 3ULEA 4IZ9A 4CZLA 3IDHA 4CBUA 3ULEB 4K41A 2A42A 4B9QA 5AQRA 3CERA 2Q1NA 1G99A 1GLCG 3LDPA 3IMXA 1GLJO 1NGGA 4IO8A 3FZLA 3ZX0A 3MN9A 2BUPA 1NGDA 2CGJA 2KHOA 1LCUA 4LC9B 2OANA 4A61A 1NGAA 1ZC6A 4JD2A 4NO7A 1T44A 1MWMA 1QQNA 2YHXA 4Z94A 4CI6A 4FWNA 1NGHA 4BGBA 3DXKB 5AQQA 3S41A 5AZJA 3IUCA 2V7ZA 4HTLA 5AZJB 1SZ2A 1QHAA 2ASOA 3O5BA 4CZFA 4BRIA 4BR0A 4H5VA 1QQOA 1ZXOA 3VESA 5EXWA 3BUZB 3ENHA 1NGFA 1X3NA 3MN5A 2A40A 2YI1A 2P9SA 1C0FA 1V4TA 2P9SB 2A6AA 3CHWA 5LJWA 1DKGD 2E88A 5AQKA 5EY4A 5BN8A 2E2QA 4FWMA 4BG8A 1T6CA 3U8XA 5F1XA 1SQKA 1XQSC 3VPZA 4CZHA 2BTFA 3DJCA 3BF3A 3MN7A 4GNIA 5AQWA 4BRFA 4CZJA 3O8MA 3H3OB 5AR0A 1NGCA 5CE3A 3FFKB 5AQZA 3GL1A 2YHWA 4BRGA 1YUWA 2J4RA 1U2VB 3U9ZA 1HKCA 2E1ZA 3LM9A 3ZEUA 1DEJA 4QS9A 2IIRA 4BRDA 3L4IA 4RCHA 4RWTA 2Q31A 5BPNA 1C0GA 1CZAN 3C0BA 4JHDA 2ZGYA 3CJCA 3G25A 5JMVA 5AQFA 1QZ5A 1WOQA 4Y0WA 3KZBA 5ELZA 5AQGA 2E2PA 2YHYA 3MMVA 4FWSA 5E84A 1HX1A 5AQPA 3KHYA 3VEOA 3I8BA 4BVPA 1NGJA 4WQ4C 4ISGA 3CIPA 1NLVA 3QFPA 4HWIA 2AP1A 3M6GA 5AQXA 5AQUA 3EL2A 4BVOA 3WXIA 4B1XB 2VCPA 2VWBA 5AZIA 3H1QA 1IJJA 4H03B 2FSNA 3O1WA 5AZIB 2P9UA 3EKSA 1J6ZA 2FSJA 4BRQA 4WQ5C 5KQDA 4O5FA 3ZETA 1GLEG 1YXQA 3A5LC 5AQOA 3ZETB 4CZEA 3J8AA 2QWMA 3H6EA 3VETA 4IXCA 4CZKA 2AA4A 2CGLA 3R6MA 3QICA 5AFUA 4A2AA 5AQHA 3AARA 2IVNA 2Q97A 2V52B 3WXLA 3CJAA 1MWKA 3D2FB 3CJ9A 3UKUA 2YJEA 1YVNA 3UKUB 1BOTO 4BRNA 4DCHA 2ZF5O 5LJVA 1BA0A 2Q0RA 1XUPO 2W40A 2P9LA 1ZBSA 2P9LB 4BRLA 5AQMA 4A62A 4EAHD 3FGUA 5FPMA 1BUPA 1BU6O 3QBXA 3DXKA 4H0XB 4I6MB 5KPZA 2E8AA 4FWKA 5ADXH 3DWLA 4CZIA 4FWOA 1HJOA 2F9TA 1KXPA 3GG4A 2DPNA 3VEVA 5LY3A 2P9IA 3BEXA 2P9IB 3F9MA 4QS8A 2WUSA 3FE1A 4CBWA 3RSEB 4BR9A 2NRHA 1Z05A 2ASPA 2PAVA 4FOIA 2I7NA 3O1BA 3VGMA 3VF4A 1P8ZA 4DB3A 2H3GX 1TUYA 2P9KB 2P9PA 3OHRA 4J8FA 3W0LA 2HF3A 2P9PB 4L3QA 3CQYA 2HMPA 2CH6A 5FPDA 4K25A 1XC3A 5BR9A 5BRHA 1Y64A 2HOEA 1S3XA 4EHUA 2QM1A 5FPEA 3VEZA 4EFHA 3FZKA 1KAYA 3MN6A 3HBTA 3UKRA 3UKRB 5AQIA 3VF6A 1HLUA 3H46O 2QWOA 4MLEA 3DAWA 3HM8A 3W3DA 1U6ZA 2D0PA 1WUAA 4DHYA 5KPTA 4BRMA 4CD3A 1U2VA 2D0OA 3LDNA 3A5MC 4YDUC 4BRHA 4K42A 1H1VA 5BRDA 3ENOA 3VERA 3UB5A 3SK3A 5BPLA 2QWLA 4FWLA 3ATVA 3FZMA 4BROA 1OKJA 1NMDA 5BRFA 4PKGA 3SLCA 2HF4A 4ISFA 4GY2B 1V4SA 1K8KB 4BREA 3ATUA 2I7PA 3FLCO 5AQNA 4BR5A 3FR0A 2ZGZA 1D4XA 3IFRA 3O6WA 4H0YB 1BDGA 3CI5A 3LL3A 3BP8A 1JCGA 1E4FT 5EVZA 4XH1A 2ZWHA 1HPMA 3H45C 2E20A 1TUUA 2Q36A 1KAXA 2FXUA 1E4GT 1TYQB 3A0IX 4IJNA 5BN9A 4M7YA 1SAZA 4JAXA 3H3NO 2UYTA 1QZ6A 2IVOA 4H0TB 1T6DA 1GLBG 3WT0A 4RTFD 3VEWA 4BGAA 1NM1A 2CGKA 5AQJA 1EQYA 1HUXA 2A41A 2Q2RA 2P9NB 4FOEA 3BF1A 4O8KA 3A8YA 4H5RA 1MDUB 3CQXA 3R9PA 1ESVA 3CJ1A 2FLOA 1RGIA 3O08A 4BC5A 1S22A 2GEMA 1MA9B 3GOIA 4A2BA 2QW9A 2QWQA 3WUHA 3L6QA 5B8HA 5AFUH 3D2FA 1Z6RA 1GLFO 2CH5A 3ID8A 3C7NA 2FSKA 3C7NB 3HSCA 2NZTA 1JCFA 3O80A 4WQ5A 3UE5A 4PKIA 4FWRA 3D2EA 2IVPA 3VF2A 3M3ZA 4ISEA 3M1FA 3VGLA 4JN4A 4C23A 3D2EB 3CJ7A 3FZFA 4NB4A 4BG9A 2F9WA 4BC4A 4BR7A 1ATRA 2YCHA 4H0VB 5I9EB 4AM6A 3P4IA 4I6MA 5EOYA 1X9JA 3WEEA 3SMPA 1RDWX 3WEEB 3O4WA 3ZX2A 3QDKA 2V51B 2YJFA 4PL8A 2W41A 4DQ8A 3RSEA 2D1KA 4AM7A 1NGIA 2ASMA 4H0PA 4BC2A 3HI0A 3R8EA 1HKBA 2QWPA 3EZWA 1GLAG 4FWPA 2PBDA 2Q0UA 4JD2B 4MLHA 3CJBA 3LDQA 1NGEA 2P9KA 3EKUA 3VGKA 4BR2A 5AQSA 3QFUA 5ADXA 4EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S9HA 3VENA 3V1RA 3SUOA 4MQ3A 4LD0A 4WFBL 5BREA 1T05A 1IG8A 4DR5K 1LOTB 2QWRA 1R59O 3LAMA 4OJRA 3RWUA 4FJ8A 4H5NA 2G8KA 4B3TK 3I33A 2FBYA 3OVNA 4IBNA 1IKXA 4A5BA 2GTDA 2VYPA 3G10A 3VEXA 1GPTA 4Z4IA 5M1FA 4CHPA 2FBXA 4JKDA 3VEYA 1LW2A 3A5NC 5BPMA 5AQTA 3TPQA 2E2NA 2RE2A 1DGKN 5C15A 1BO5O 1RT4A 2LSNA 2PY5A 2HVHA 3AAPA 4Z4FA 4DTRA 2FF3B 1X3MA 2X74A 3LM2A 4IEEA 1KVAA 3D45A 4JK9A 4FJNA 3QEXA 1YAGA 3SJHA 4HUFA 5KPRA 4FPAA 4CZMA 4QAGA 3KD1E 4KFBA 4FYDA 4PKHA 3SMSA 2UXCK 1RFQA 4K43A 3PV8A 1KAZA 1VAZA 4ID5A 2IDOA 4DKWA 3GDQA 4MDAA 1D5AA 4BECA 1B7DA 2FF6A 4CD1A 3EY1A 3RMDA 3LWMA 2O8FA 3LDSA 4BDZA 1KFSA 3AO5A 2QXLA 4GV9A 4CEZA 3ALYA 1M1KO 4KTWA 2V7YA 3WQTA 1K73O 1WNSA 2O4IA 1JL2A 4BRAA 3AO1A 1IBKK 1T7PA 1WBBA 2OYQA 2P9UB 3ZLJA 3VA0A 1BK8A 1JCEA 2OPQA 4IDHA 1SKSA 1OH7A 4AHVA 4O8UA 4DFJA 4QS7A 3PX0A 4JI6K 2ITMA 4CZLA 3AO3A 2HNZA 4OLBA 3KIOA 4K41A 4B9QA 1N6QA 1N8RO 2OPPA 2HSTA 1U04A 3LP2A 1ZBFA 1R0AA 3H08A 1KLNA 3FZLA 2O8BA 2BUPA 1BHLA 3DYAA 1SN4A 2ATBA 1B3CA 1LCUA 3T7ZA 5KRSA 4B9UA 4RW8A 4A61A 3SUQA 3S5TA 3TARA 1VRUA 1QQNA 3KKRA 2XY7A 3QINA 5DK5A 3CMEN 2G8WA 3NGZA 4FWNA 4BGBA 1K8BA 5AQQA 4DSLA 3NFAA 4HTLA 2V7ZA 1QQOA 5EXWA 5CYMA 1RBUA 3DI6A 5I42A 1NPIA 4YOUA 3IRXA 1NKEA 2P9SB 3NVMA 4IG0A 1MYNA 3V1QA 5BN8A 4BG8A 1A5XA 2XO7A 1C0UA 4DV4K 1VSFA 5HL7L 5F1XA 2VWJA 4DR3K 4GKJK 1N36K 3SBTA 1QHTA 5GIOA 3VPZA 4CZHA 3SI6A 3AVJA 4CGJA 2VQFK 4CZJA 2YIPA 4N5SA 3ZYYX 2GL1A 1QQCA 3SUNA 5CE3A 2RPIA 4B3OA 1DTTA 1RDAA 2YHWA 2J4RA 2YHBA 3CYGA 1HKCA 4QS9A 4BRDA 4RCHA 1JLBA 2Q31A 3LP0A 3C0BA 5CHIA 1IBMK 3BZKA 3G25A 2DTUA 2W6KA 3M5RA 4GVEA 4Y0WA 4M3ZA 1I6FA 1HX1A 3MXIA 1EP4A 4DTOA 4YFUA 3OW2M 4QCLA 4E1MA 1NLVA 3QFPA 4OPKA 4DV3K 1QE1A 3WXIA 4V1DC 4RW4A 4B1XB 3PIPL 3KOWA 4FLUA 2O8EA 2VWBA 1NJXA 2R7YA 3R3LA 4H03B 4A57A 2P9UA 3EKSA 1J6ZA 4F3OA 4CK3A 4NCGA 4DSJA 4M42A 3NF8A 1VSJA 4G9ZA 1BGXT 4O5FA 3ZETA 2ZJQL 2LY6A 3TR8A 4CZEA 2D5RA 3LP3A 3J8AA 2N66A 3V1OA 3VETA 3VQ8A 1WN7A 4CZKA 2CGLA 3NH0A 4E7KA 1T7AA 1NKBA 4J2AA 1REVA 1B9FA 3WXLA 1MWKA 5HRPA 1EKEA 4TSXA 3C65A 4I9LA 4IDKA 1BI4B 4OKJA 3KK7A 2YIOA 2ZF5O 4CJKA 1BQMA 2O8DA 4B9TA 3AGRA 2W40A 1ZBSA 3WNFA 2P9LB 1NNEA 3QLHA 4YOXA 5C42A 2QTDA 3FGUA 2YX6A 1NK8A 3T3FA 3PSFA 5ADXH 2BE2A 4FWOA 3S3MA 4CJFA 2P9IA 1SV5A 4CFCA 5LY3A 2XHBA 3BEXA 3GKUA 1UAXA 2WUSA 3FE1A 4CESA 4DSIA 3V81A 4FJIA 3I56N 1VQNN 4FLTA 4CJEA 1J5EK 4FLXA 1P8ZA 1XMQK 2H3GX 3DLEA 4CK2A 2P9KB 4WF9L 1KVCA 3OHRA 4KKOA 2HF3A 3MAQA 3CQYA 4N47A 4KO0A 4CEAA 4ELVA 1XC3A 3MEGA 4W5TA 4KHUA 5BRHA 2HOEA 1ZBIA 1TKTA 1S3XA 1JLAA 3VEZA 1CXUA 3DLRA 3UKRA 3HL8A 2AJQA 4ELUA 3VF6A 4DV1K 4NCBA 1T3VA 3SV3A 4KRFA 3U6FA 4YOTA 1C1AA 1OVYA 1VSIA 2D0PA 4BWJA 4CVNE 4O0IA 2W00A 1RTDA 3O9SA 2E0HA 3BDPA 2D0OA 1H1VA 2D0CA 1S5JA 3CW4A 2VG7A 5BPLA 2QWLA 3NF7A 3P31A 3DLHA 3FZMA 4O0JA 1OKJA 5BRFA 5IWAK 1W0HA 2XY6A 4HVJA 2FBTA 2BGGA 3FLCO 4JKFA 3FR0A 2ZGZA 1D4XA 3IFRA 2DFFA 3R1XA 4DFPA 1YI2N 3O6WA 4DU1A 1BDGA 1VSHA 3BP8A 1E4FT 5EVZA 3ID6A 3H45C 3OBYA 2WOMA 1K9MO 1TUUA 4DR1K 3QEVA 3RTVA 3PSIA 1TKZA 1KAXA 3TAPA 1Q82O 3OYGA 1TYQB 1Q8IA 4AHUA 1SAZA 1QTMA 2UYTA 4CGDA 3WT0A 3KOZA 4RTFD 4FM1A 1D8YA 2GMOA 5AQJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S9H A;  3VEN A;  3V1R A;  3SUO A;  4MQ3 A;  4LD0 A;  4WFB L;  5BRE A;  1T05 A;  1IG8 A;  4DR5 K;  1LOT B;  2QWR A;  1R59 O;  3LAM A;  4OJR A;  3RWU A;  4FJ8 A;  4H5N A;  2G8K A;  4B3T K;  3I33 A;  2FBY A;  3OVN A;  4IBN A;  1IKX A;  4A5B A;  2GTD A;  2VYP A;  3G10 A;  3VEX A;  1GPT A;  4Z4I A;  5M1F A;  4CHP A;  2FBX A;  4JKD A;  3VEY A;  1LW2 A;  3A5N C;  5BPM A;  5AQT A;  3TPQ A;  2E2N A;  2RE2 A;  1DGK N;  5C15 A;  1BO5 O;  1RT4 A;  2LSN A;  2PY5 A;  2HVH A;  3AAP A;  4Z4F A;  4DTR A;  2FF3 B;  1X3M A;  2X74 A;  3LM2 A;  4IEE A;  1KVA A;  3D45 A;  4JK9 A;  4FJN A;  3QEX A;  1YAG A;  3SJH A;  4HUF A;  5KPR A;  4FPA A;  4CZM A;  4QAG A;  3KD1 E;  4KFB A;  4FYD A;  4PKH A;  3SMS A;  2UXC K;  1RFQ A;  4K43 A;  3PV8 A;  1KAZ A;  1VAZ A;  4ID5 A;  2IDO A;  4DKW A;  3GDQ A;  4MDA A;  1D5A A;  4BEC A;  1B7D A;  2FF6 A;  4CD1 A;  3EY1 A;  3RMD A;  3LWM A;  2O8F A;  3LDS A;  4BDZ A;  1KFS A;  3AO5 A;  2QXL A;  4GV9 A;  4CEZ A;  3ALY A;  1M1K O;  4KTW A;  2V7Y A;  3WQT A;  1K73 O;  1WNS A;  2O4I A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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