5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
3EO3A 5EX5A 4BRLA 1OKJA 5AQQA 5AFUA 2E88A 4H0OA 1TUUA 2PBDA 3ZETA 4BR9A 5AQRA 1NGBA 1ATRA 3AAQA 1Z6RA 3WXJA 3FZFA 2QWMA 3ATUA 3CHWA 2Q31A 4WQ5A 2A40A 3LL3A 5KQDA 4M7XA 5JLHA 4CZFA 3J8AA 3WUHA 5ADXA 2CGLA 3LDQA 1IJJA 1GLDG 3MK6A 2E2NA 2Q97A 3WT0A 1E4GT 2CGJA 4FWMA 1KAXA 4FPAA 1U2VB 4DHYA 3HZ6A 4RWTA 3HTVA 3CJBA 4PKIA 4LC9B 1NMDA 3GBTA 4FWPA 1ATSA 3C7NB 4K41A 4QS8A 5AZIB 4DB3A 2QXLA 4BR4A 3W0LA 4H0YB 4BREA 2P9LB 4BQZA 5KPZA 1NBWA 3BP8A 4KBOA 3VF6A 4BG8A 3FFKB 3VEVA 4O5FA 3RSEA 3JXUA 1RFQA 2P9UA 2GELA 3VEYA 5AQNA 2FSJA 4BRCA 3MN6A 3CJ1A 3ATVA 2ASOA 3A5LC 4FO0A 3WXLA 1U6ZA 2FXUA 4A2AA 2ASMA 4WYBA 3CJ9A 2P9SA 3U8XA 5BPMA 2BUPA 1D4XA 4FOIA 2QWPA 3BEXA 3WXIA 3WEEA 3ZX3A 1S22A 4WQ5C 4HTLA 1BO5O 2EWSA 2HF4A 2WUSA 3VOVA 3WQUA 1C0FA 1HKCA 4H5WA 5AQMA 1RDWX 3MDQA 3O5BA 4BGBA 2A41A 3UKRB 2ZGZA 2I7NA 4B1UB 3LM2A 5AZJA 3UE5A 4CZMA 3ZX2A 2YHYA 4MO5A 3VERA 1SQKA 4CZEA 1IG8A 2YJFA 5JLFA 3SJHA 1GLJO 5FPEA 4FWSA 4B1WB 5AQGA 2D1KA 4J8FA 4CZGA 2Q0RA 3DXMB 3VEXA 3LDOA 3GL1A 3UKUB 3HM8A 4BR0A 5AR0A 2ZWHA 4M63C 1QQOA 4BRPA 1XUPO 1Z05A 1NGDA 1T6CA 1HX1A 5F1XA 2YCHA 3IUCA 4FWLA 1GLFO 5BRFA 2E1ZA 2VWBA 4BC3A 4NB4A 4BRGA 1NGIA 2VYPA 3SMPA 3GG4A 3FZMA 2AA4A 3EL2A 4QS9A 1WOQA 2YI1A 2QWLA 3AY9A 4BR2A 4H5RA 2P9KA 3VETA 1TYQA 2P9IB 3FGUA 3MN5A 3ENHA 1H1VA 3HSCA 3LDPA 3KZBA 4I6MB 4H0PA 4EAHD 1HUXA 3P4IA 4HWIA 3ENOA 3VESA 4CI6A 2CGKA 3D7EO 1Q18A 3A5NC 3BUZB 1C0GA 1KAYA 5F0XA 1BA1A 4B1XB 4BROA 3IFRA 2E2OA 2P9NB 5AQIA 3VEWA 5TKYA 2QWOA 1BWFO 3CERA 3HBTA 5AQJA 3UB5A 1QQMA 3H45C 3CJCA 2GWKA 4IJNA 1BDGA 4ISFA 5BN9A 2E8AA 1ZXOA 1KXPA 4CJ7A 3OHRA 1HPMA 1SZ2A 1WUAA 3W3DA 2ZF5O 2YHWA 3EZWA 3KHYA 4DCHA 2UYTA 3DAWA 2QWQA 3QBWA 2IVPA 2QW9A 2ASPA 2PAVA 3M6GA 5FPNA 4EIAA 5BRDA 5AZIA 5AFUH 3BF3A 2HOEA 4JAXA 3G25A 3VPZA 3FZLA 2P9LA 1YVNA 3TPQA 3LDNA 2FSKA 5AQVA 1MWKA 3VF2A 3ULEB 5KPTA 3H3NO 4K25A 1MWMA 3JS6A 5ADXH 3VENA 4CZKA 3F9MA 1P8ZA 1JCFA 4BRHA 3AAPA 4AM6A 1ZC6A 2IIRA 1MA9B 1NLVA 1BOTO 1JCEA 4CZLA 2GEMA 3D2EB 5LJVA 3QICA 3M3ZA 1XQSC 4JHDA 5AQTA 4BRIA 1V4SA 3L0QA 5AQWA 5E26A 5FPMA 2P9UB 1NWKA 1NGGA 1YUWA 1NGAA 1DKGD 5EY4A 3U9ZA 3A5MC 2A6AA 3UKRA 2D4WA 2OANA 2CH6A 2E2QA 2FF6A 3H6EA 1HLUA 5BR9A 3CQXA 4CBXA 4IJAA 4JD2B 3I33A 1NGFA 4M7YA 5AQSA 3U9DA 2P9SB 4RCHA 4MO4A 5AQOA 3VGLA 2P9PB 3WEEB 1JCGA 2E1YA 4BRQA 4CBUA 1BG3A 3DXMA 4BG9A 3O1BA 5AQUA 3UKUA 4JNEA 4FPBA 4K42A 1RGIA 1GLCG 1NGEA 3O08A 2IVOA 4XEIA 3MCPA 5B8HA 1GLEG 1BA0A 2Q2RA 3IMXA 3DWLA 4FWQA 2KHOA 2J4RA 2DPNA 4GY2B 1NGCA 1HKBA 3O80A 3ZEUA 4BVOA 4B1YB 5LY3A 2GUPA 5EVZA 3H1VX 1T6DA 3QB0A 3L4IA 4H0XB 3O8MA 3VF4A 2I7PA 4CZIA 4WQ4A 4PL8A 5BN8A 1LOTB 4BR5A 4CD1A 3D2FB 4GNIA 3WQTA 3DXKB 1K8KB 4PL7A 1TUYA 4BVPA 3L6QA 2QWNA 3GOIA 3DJCA 1X3MA 1R59O 1YAGA 4FWKA 4ISEA 4JN4A 3MMVA 4CBWA 5CE3A 1G99A 3CJ7A 3QBXA 2AP1A 3QFPA 3CI5A 3MN7A 4IWVA 2A5XA 2V7ZA 2E20A 4XH4A 4Y0WA 1CZAN 1BU6O 3R8EA 1NGJA 4BC4A 3FLCO 4B1VA 4BRNA 5BREA 2Q36A 3KVGA 1MDUB 4YDUA 3AARA 4CZHA 3VEOA 4DQ8A 4H0TB 5AQPA 5AQKA 2W40A 5AQXA 1U2VA 5BRHA 1DEJA 2V7YA 4A61A 3C7NA 3QMLA 3ZETB 4FL9A 5JICA 4H5NA 4MLEA 3QDKA 3TU5A 4BQLA 3O1WA 3SK3A 4BRDA 4WQ4C 3ULEA 4BR7A 2QWRA 1KAZA 3SMSA 5I9EB 4BC5A 4NO7A 4FWRA 1NGHA 4PKHA 4RTFD 1QQNA 4BRMA 3CIPA 4AM7A 1ATNA 1E4FT 2A3ZA 4IZ9A 4XH1A 2HMPA 3FR0A 2V52B 3I8BA 4C23A 3S41A 4A2BA 3D2EA 4FWNA 1LCUA 4FOEA 3C0BA 5ELZA 3GDQA 5EXWA 3RSEB 4IXCA 4BRKA 4BRAA 3FE1A 5BPNA 3VGMA 2NZTA 3R9PA 1SAZA 4YDUC 1GLAG 1BUPA 3U4LA 4CZJA 5EOYA 4H5VA 1J6ZA 5AQFA 5FPDA 2HF3A 5BPLA 2D0PA 1YXQA 4JD2A 4H0VB 3GE1A 5AQLA 5JMVA 2F9WA 3H46O 3R6MA 2Q1NA 4JHDB 3A0IX 1QZ5A 2ITMA 2P9PA 4B1ZA 3EKUA 2FF3B 4EFHA 2GWJA 4BGAA 3MN9A 3FZHA 5KPRA 3O4WA 4F9OA 5AZJB 1T44A 4O8KA 3EN9A 2A42A 1HKGA 2ZGYA 2YHXA 3BF1A 4EHTA 2IVNA 1X3NA 3VGKA 5AQHA 3CJAA 2W41A 3QFUA 1EQYA 5LJWA 4A62A 2GTDA 3M1FA 1X9JA 1Y64A 3EKSA 4XH5A 4BRFA 2P9IA 4H5TA 3FZKA 1XC3A 1GLBG 4MLHA 3ZX0A 2BTFA 4I6MA 4FSVA 3CQYA 3O6WA 1ESVA 3H3OB 2NRHA 4Z94A 1QZ6A 3D2FA 2E2PA 3DXKA 1K8KA 3LM9A 3LDLA 3HI0A 1DGKN 1GLLO 2F9TA 5KQ8A 1ZBSA 5F2RA 2CH5A 3A5OC 4H03B 2QM1A 2YJEA 4IO8A 2FSNA 2NLXA 5AQZA 4E1JA 2P9NA 3ID8A 3ZEUB 4B9QA 2H3GX 5AQYA 3H1QA 1QHAA 2P9KB 1S3XA 5E84A 1TYQB 2V51B 3VEZA 2VCPA 2D0OA 4CD3A 1NM1A 1HJOA 4PKGA 3B8AX 3SLCA 3IDHA 3WXKA 3A8YA 4FWOA 4ISGA 1V4TA 4BC2A 2FLOA 2Q0UA 4EHUA 4QS7A 4K43A 3CETA 4L3QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T7EA 1TKXA 3EO3A 4C1NI 5EX5A 2KBJA 3QLHA 1WSJA 3AA4A 4B8AB 1ZVEA 4IFYA 1WN7A 2SN3A 1W9HA 1GPSA 4H0OA 1SEGA 1FH3A 2HNYA 3AAQA 4JRQA 3D45A 2QWMA 2GL1A 1OH5A 4DFMA 2A40A 2HBKA 3LL3A 1X9MA 1QVFM 4CZFA 1T3VA 2CGLA 1JZBA 3LDQA 4IFEA 4WFNL 4B9NA 1XNRK 4QOZB 4Z4IA 2P5GA 1IH7A 2YNHA 1E4GT 5HRPA 4X65K 1KAXA 4K8ZA 3AVCA 1REVA 3C7NB 4K41A 5AZIB 3L8BA 2QXLA 3W0LA 3EYZA 2YKNA 3DLGA 4FW1A 4O5FA 1G15A 1RFQA 2P9UA 2GELA 5AQNA 1JLQA 1YT3A 3CJ1A 4DSFA 3CFRA 3SNNA 4EP4A 3K5OA 3QO9A 1U6ZA 2FXUA 4A2AA 4WYBA 3CJ9A 3AVHA 2P9SA 4WFBL 3KK1A 5J2NA 2BUPA 4FOIA 1ILYA 1T8EA 3KD5E 1TK8A 4DFKA 2HF4A 3VOVA 3OJSA 3ZYYX 3MDQA 4H5WA 3GKUA 5AQMA 3O3GA 1U04A 2YKMA 1SV5A 2I7NA 3AO4A 3R2VA 3AVNA 3LM2A 4FYDA 3WNGA 3VQ9A 3UE5A 3ZX2A 2YHYA 3DLRA 3H08A 4MO5A 3V1OA 1SQKA 4CZEA 4F3TA 2HHVA 3THYA 2YJFA 3OS1A 4B1WB 4OGEA 1XMOK 1C1AA 4BDYA 3LANA 4CZGA 1PTXA 4WE1A 3AGRA 1AHOA 3GL1A 4FM0A 2W6LA 3TABA 5JS2A 1S5JA 4Z4HA 4M63C 1QQOA 4IEIA 3HO1A 1N6QA 1HX1A 1DTTA 4O0IA 3N4PA 4PQUA 2C1GA 3MAQA 2VWBA 4NB4A 3VTIA 4BRGA 2Z1GA 2ZJPL 3EL2A 4QS9A 2LJMA 3OYMA 3MWPA 1YF5L 1IG9A 4BR2A 4IG0A 3VETA 3V9WA 1JXBA 1KFSA 1C1BA 1ASVA 4OPJA 3KOYA 3ENHA 3U3GA 4EAHD 3P4IA 4GKKK 3ENOA 4NCGA 2GV9A 1CLQA 3VQBA 3E01A 5F0XA 1YITN 4WFAL 4E7IA 1SKRA 1A5WA 2P9NB 2QWOA 1BWFO 5CYMA 1KSPA 4F3OA 4M45A 3THWA 3U6FA 3CERA 4E89A 5AQJA 4DR2K 3UB5A 3TTDA 4LH5A 3CCQN 5HRSA 1BDGA 3SAHA 4HHTA 3DOKA 2LY5A 5BN9A 1X9WA 3OHRA 1HPMA 3W3DA 3EZWA 2UYTA 4DR4K 3MXIA 4B3MK 2ASPA 2PAVA 3M6GA 4EIAA 3SQ4A 3DM2A 4IEEA 2DTUA 4A5BA 3BF3A 4JAXA 4MDBA 2P9LA 5GIOA 3ZSOA 1UA0A 2YIPA 1YVNA 3L2RA 2HMIA 3ENBA 3KD1E 4CFCA 5SWMA 1D9FA 2YILA 1RT4A 2KQ2A 4CJ3A 1J9AA 1RT5A 3CCEN 1NLVA 3ALYA 2GEMA 4KV8A 3D2EB 4O0JA 4YHHK 4LF7K 1LW0A 5AQTA 1GOAA 5J2MA 4ZTFA 3L0QA 3QIPA 4AHCA 2P9UB 1VQ7N 4ELUA 1NWKA 1A5VA 1YHQN 3SZ2A 4CJSA 3U9ZA 3CYGA 3A5MC 1WSIA 2E2QA 1HLUA 4BE0A 1XC9A 4M7YA 4F2SA 3CW4A 3U9DA 4O55A 2P9SB 4RCHA 2UXDK 4IOXA 4NLCA 4OPKA 4JKEA 1NJZA 1VQPN 4R5PA 3DXMA 4HUEA 3AO1A 1C6VA 4JNEA 1PE4A 1KV0A 1Q82O 3IS9A 2O4IA 4DLGA 1NK4A 1POIA 3DRSA 1J5EK 3O08A 4CF2A 1IKWA 4XEIA 2XHBA 4W5OA 2D56A 1BA0A 1GLEG 5IWAK 1NE5A 3DOLA 3F5TA 2IOCA 3E9LA 4FWQA 2KHOA 2J4RA 2PY5A 2DPNA 4KO0A 1N5YA 1NGCA 1HKBA 4BVOA 4NXMK 4B1YB 2QKBA 2HB5A 1YTAA 5LY3A 1RTJA 4KHPK 3QB0A 2NRWA 2ASCA 3O8MA 2G2KA 3CC4N 3NGYA 3CM5A 4PL8A 4BR5A 4Z4FA 3WQTA 2F8SA 2LJ7A 3KK7A 3D0PA 2QWNA 2X78A 3CC2N 2QEXN 3DJCA 4FWKA 2JWLA 4JN4A 5CE3A 3CJ7A 2AP1A 3G10A 4CIGA 3I8DA 4IWVA 4DUZK 2N69A 4KPYA 4IDKA 2YV0X 2OZMA 4NCBA 1KVBA 4BC4A 4WCEL 4DTMA 2DFEA 1Z25A 3FLCO 3O9TA 4B1VA 3PLAA 2Q36A 4FW2A 3T1AA 1RTHA 1VQ4N 5LMUK 1VSLA 4C1NK 3WNHA 4H0TB 1BHLA 1C0MA 1S1WA 1U2VA 4DQSA 4A61A 3IRXA 3NF8A 1T1TA 1C0TA 5JICA 4L8RB 4BQLA 3O1WA 3EZ5A 2VQFK 4BRDA 1KVAA 3V9UA 2QWRA 1ZUTA 4CJUA 1BCGA 4BC5A 3SV3A 3BY5A 1VQ8N 1QQNA 4BRMA 1ATNA 4E3SA 1EWQA 5C2FA 3SPZA 1TK0A 3AVKA 3HVRA 3PX0A 2BE2A 2ETJA 4CK2A 4CJ5A 4U67L 1J54A 3HT3A 1S9GA 3VQ7A 4BRAA 4M3UA 5BPNA 3R9PA 3KLGA 4CZJA 5EOYA 2KZZA 2MZ0A 4YY3K 1WSEA 1YXQA 3O9SA 4E72A 2F4VK 2VGNA 4FLXA 2F9WA 3OA9A 3MXJA 4AH9A 2NY8X 3A0IX 4H4MA 4EFHA 4JI4K 4PY5A 4CHZA 4DTXA 1YJ9N 2LKBA 3THVA 4DV7K 2O8EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T7E A;  1TKX A;  3EO3 A;  4C1N I;  5EX5 A;  2KBJ A;  3QLH A;  1WSJ A;  3AA4 A;  4B8A B;  1ZVE A;  4IFY A;  1WN7 A;  2SN3 A;  1W9H A;  1GPS A;  4H0O A;  1SEG A;  1FH3 A;  2HNY A;  3AAQ A;  4JRQ A;  3D45 A;  2QWM A;  2GL1 A;  1OH5 A;  4DFM A;  2A40 A;  2HBK A;  3LL3 A;  1X9M A;  1QVF M;  4CZF A;  1T3V A;  2CGL A;  1JZB A;  3LDQ A;  4IFE A;  4WFN L;  4B9N A;  1XNR K;  4QOZ B;  4Z4I A;  2P5G A;  1IH7 A;  2YNH A;  1E4G T;  5HRP A;  4X65 K;  1KAX A;  4K8Z A;  3AVC A;  1REV A;  3C7N B;  4K41 A;  5AZI B;  3L8B A;  2QXL A;  3W0L A;  3EYZ A;  2YKN A;  3DLG A;  4FW1 A;  4O5F A;  1G15 A;  1RFQ A;  2P9U A;  2GEL A;  5AQN A;  1JLQ A;  1YT3 A;  3CJ1 A;  4DSF A;  3CFR A;  3SNN A;  4EP4 A;  3K5O A;  3QO9 A;  1U6Z A;  2FXU A;  4A2A A;  4WYB A;  3CJ9 A;  3AVH A;  2P9S A;  4WFB L;  3KK1 A;  5J2N A;  2BUP A;  4FOI A;  1ILY A;  1T8E A;  3KD5 E;  1TK8 A;  4DFK A;  2HF4 A;  3VOV A;  3OJS A;  3ZYY X;  3MDQ A;  4H5W A;  3GKU A;  5AQM A;  3O3G A;  1U04 A;  2YKM A;  1SV5 A;  2I7N A;  3AO4 A;  3R2V A;  3AVN A;  3LM2 A; 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