5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
2ASMA 3VEVA 1Z6RA 3CQYA 2FF3B 4FO0A 3DXKA 5AQMA 2QXLA 1HKGA 3JXUA 4ISGA 3W0LA 2P9SB 3CJ1A 3U9DA 3A5OC 5B8HA 4BR5A 2V51B 5AQXA 2A41A 3CI5A 3W3DA 3EKUA 3BF3A 4BVOA 3FZFA 3VESA 3BF1A 4FWKA 5BRDA 1ATRA 3VPZA 1SZ2A 1U6ZA 1TYQA 4H0TB 5BR9A 1GLBG 5AQKA 2D4WA 5AQRA 2CGJA 4ISEA 4MO4A 3O80A 3GE1A 1S22A 2P9KB 3LDQA 5AQPA 4A62A 1HLUA 1BOTO 5F1XA 1IG8A 2YCHA 4FOEA 4CBUA 3CJ7A 1NWKA 2IVOA 4IJAA 4CBWA 2D0PA 2P9UB 3L6QA 1JCFA 3VETA 3VEYA 2WUSA 4RCHA 1BUPA 5F0XA 3HTVA 2QWMA 3GL1A 1TUUA 2UYTA 2YI1A 3ZX0A 1QQMA 5AQLA 1GLDG 4XH4A 4H5RA 4BG8A 4IWVA 2P9NB 3U4LA 3M1FA 4BRGA 3IFRA 4QS7A 3ID8A 2FSJA 3L4IA 3UKUB 2QWNA 4JN4A 1HJOA 1X9JA 4GY2B 3UB5A 3AAQA 3ENOA 2KHOA 3ENHA 4GNIA 5E26A 4BRQA 2Q36A 4A61A 4BRDA 2Q0UA 3CJCA 3MN6A 1MDUB 1WOQA 3WT0A 1NGAA 1K8KA 2I7NA 3O5BA 3CJBA 4PL7A 4HTLA 1YVNA 5AZIA 4FOIA 3WQUA 4H5NA 4K42A 5KQ8A 5BN8A 1DEJA 3O08A 3LDOA 3FZHA 3U9ZA 1NLVA 3RSEA 1BA1A 4BRIA 3B8AX 3ULEB 5LY3A 3HZ6A 2AA4A 2GUPA 2IVNA 4XH5A 5AR0A 3ZX2A 3OHRA 4BQLA 4BQZA 2P9SA 4LC9B 5KPZA 3C7NB 4QS8A 3ZX3A 4BC3A 1BDGA 1E4FT 2E1YA 3TU5A 2GTDA 3ATVA 3L0QA 4BGAA 4BC4A 1BG3A 5AQVA 3H1QA 3VOVA 4HWIA 3DXMB 2FF6A 3IDHA 3A5LC 1NGEA 4BRPA 4L3QA 1ESVA 3EKSA 4PL8A 5BPMA 4EIAA 3D2FB 3VGLA 4BVPA 5KQDA 5AQZA 2P9KA 1U2VB 3VF4A 5KPTA 4MLEA 4JD2B 3VEWA 3CQXA 3A5MC 4B9QA 2EWSA 4CZEA 5FPMA 4PKGA 3KHYA 3LDPA 5F2RA 1T6CA 4WYBA 2BTFA 5BPNA 5I9EB 1HKBA 4JHDB 2E20A 5AQGA 5JLFA 1Y64A 2P9LB 1MA9B 3DWLA 2A40A 4B1YB 4FWSA 2YHYA 3BEXA 4PKHA 1T44A 1GLLO 3R8EA 2P9NA 1ATNA 1BA0A 3H1VX 4CZHA 5AQWA 2NLXA 4BR2A 4BC2A 3VENA 3A8YA 2FSNA 1KAXA 5LJVA 3UKUA 3F9MA 2E1ZA 4BRAA 4BRFA 2QWLA 3QMLA 2Q0RA 3WXIA 4B1UB 1RGIA 2QWOA 2QWRA 3WQTA 2QW9A 1RFQA 4H0VB 5JLHA 1QZ5A 3VERA 3H3NO 4BR7A 4WQ4C 1YAGA 2W40A 4IZ9A 4BGBA 3O1WA 4EAHD 4XEIA 2E88A 1EQYA 1XQSC 2GELA 1G99A 2Q1NA 4M63C 3DJCA 4CZIA 2YJFA 2FLOA 2ZF5O 3H3OB 2E2OA 2D1KA 4I6MB 1ZC6A 2F9TA 1KAZA 3ULEA 3CHWA 3CETA 1QZ6A 3H6EA 3LDNA 4H5WA 3EZWA 2CH6A 3AARA 2E2NA 4FPAA 3C7NA 1R59O 5BRFA 4Z94A 4DB3A 3GOIA 4FL9A 1KAYA 5LJWA 2D0OA 1V4TA 4FWNA 3FFKB 1DKGD 3CERA 4BR0A 4FWMA 4WQ5C 1SAZA 5AZJB 4RWTA 1E4GT 3QB0A 4NB4A 3DXMA 1WUAA 4CJ7A 1GLCG 1QQNA 3IMXA 5ELZA 3LL3A 3KVGA 1NGFA 3D2FA 1GLFO 1MWMA 4JNEA 1NGCA 3WXKA 1U2VA 4FWQA 3VEOA 4CZGA 4BRCA 1XUPO 2NRHA 4JAXA 3DAWA 4J8FA 4JD2A 3WEEB 4CD3A 3QFUA 1JCEA 2F9WA 4K41A 2I7PA 5AQSA 1GLAG 4WQ5A 2H3GX 4JHDA 1IJJA 4BRKA 4B1WB 2FXUA 4CI6A 4KBOA 2ZGYA 2P9LA 5AQFA 3QBWA 4BC5A 2W41A 4CZLA 3HM8A 4M7YA 3I8BA 5AQJA 4FSVA 1P8ZA 3LDLA 3VF2A 2P9PB 3S41A 3JS6A 3AY9A 2Q97A 3SMSA 2GWKA 5AQOA 5JICA 3R6MA 4DCHA 3WUHA 2HF4A 5FPNA 1T6DA 2PAVA 3FZLA 1BWFO 4A2AA 2Q31A 2HMPA 3EN9A 1CZAN 5AFUH 3FE1A 4EHUA 1NM1A 4BR9A 3MMVA 4DHYA 1HPMA 1NGBA 1C0FA 5BN9A 2YHWA 1X3NA 3CIPA 2E2QA 4O8KA 4O5FA 1NGHA 2P9IB 1GLJO 4RTFD 3AAPA 1Z05A 2DPNA 2QWQA 4FWOA 3ATUA 1H1VA 3H46O 1YXQA 5BPLA 3VEXA 5ADXA 1HKCA 4I6MA 3FLCO 1RDWX 2GEMA 4A2BA 2BUPA 2NZTA 3QDKA 2QWPA 5EX5A 4IJNA 4BRMA 3GG4A 4IXCA 1X3MA 3A0IX 4H0OA 4B1ZA 4QS9A 2E2PA 2A3ZA 2VWBA 1QQOA 2V7YA 1DGKN 1LOTB 4BROA 4FPBA 5CE3A 3FR0A 5AZJA 5TKYA 3H45C 5AQYA 4FWRA 1TUYA 2VYPA 4C23A 4M7XA 1NGDA 3EO3A 4H5VA 3J8AA 2A5XA 4XH1A 5JMVA 3D2EB 3GDQA 4AM7A 5EVZA 5AQNA 3QBXA 3IUCA 4B1VA 2OANA 1BU6O 2GWJA 5ADXH 3FZMA 3WEEA 3UKRB 3FZKA 3I33A 2ITMA 3ZEUB 1XC3A 2FSKA 1NBWA 4CZFA 3ZETB 4PKIA 3O6WA 4H03B 4ISFA 2Q2RA 4WQ4A 4NO7A 3QICA 4F9OA 4MLHA 4Y0WA 3R9PA 1Q18A 4EHTA 4EFHA 3DXKB 1OKJA 4BRLA 2HOEA 3G25A 1QHAA 2P9PA 1NGJA 1S3XA 2HF3A 3LM2A 2V52B 4H0YB 3VEZA 2IIRA 3WXJA 4BRNA 2E8AA 1LCUA 5AQIA 1ZBSA 2CGKA 3TPQA 1BO5O 1JCGA 1J6ZA 5AQHA 3MN5A 3HSCA 5AFUA 2AP1A 2PBDA 1TYQB 1KXPA 4H5TA 2ZGZA 4BG9A 2VCPA 5E84A 3M3ZA 2QM1A 3HI0A 5KPRA 1MWKA 5EY4A 2YJEA 3P4IA 2ZWHA 3O4WA 4CD1A 2P9IA 3KZBA 3WXLA 3SJHA 3EL2A 2IVPA 1D4XA 3MN9A 4DQ8A 4FWPA 2A6AA 3MDQA 4BR4A 5EOYA 4CBXA 1V4SA 4H0XB 3MN7A 3SMPA 3QFPA 3M6GA 1NGGA 3VF6A 3U8XA 5FPEA 2YHXA 4K25A 4YDUC 3BP8A 3HBTA 4H0PA 4CZMA 3CJ9A 3C0BA 4BRHA 2ASPA 4MO5A 2CH5A 3GBTA 1GLEG 2ASOA 3MCPA 4E1JA 3FGUA 3MK6A 3O1BA 3A5NC 5EXWA 3CJAA 4CZJA 3O8MA 3SK3A 5BREA 4AM6A 4BREA 3SLCA 4FWLA 1YUWA 5AQQA 3D2EA 5AQUA 5AQTA 4YDUA 3VGMA 1HUXA 2CGLA 1ZXOA 2A42A 4K43A 5FPDA 1ATSA 2V7ZA 1C0GA 1K8KB 1SQKA 3D7EO 1NMDA 3UKRA 4CZKA 4B1XB 2J4RA 5AZIB 3LM9A 3ZEUA 3UE5A 3BUZB 3VGKA 1NGIA 3ZETA 5BRHA 3RSEB 2P9UA 1HX1A 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1HA 1Z6RA 3PX0A 3VQ6A 4Y1CA 2HHXA 1VSFA 3CJ1A 4DR1K 3A5OC 2UXCK 3D6RA 4BVOA 1ZFUA 4LFBK 1X9SA 1TL3A 3BF1A 4M42A 3L2WA 2QA4N 3V1OA 1U6ZA 5JS2A 1D9DA 4CFAA 1OH6A 1GLBG 1VQNN 4CF2A 4DSIA 5SWMA 1VAZA 3C95A 4Y1DA 1BCOA 3VQCA 4A62A 4GKKK 2B4JA 4HVJA 1BCMA 2X6SA 3HYFA 3CFPA 2IVOA 2G8WA 1I6GA 2D0PA 4KH4A 1J5EK 1VQ9N 3P31A 2AJQA 2O8DB 1T0ZA 3KKSA 1SKSA 4CJSA 2QWMA 1TUUA 4KB0A 4CIFA 4ILJA 4DLEA 4ILHA 1QQMA 5AQLA 2BRZA 3F5TA 4XH4A 5KTQA 4BG8A 1KVCA 4DR3K 3VQ7A 1T03A 3M1FA 3PSFA 3FFIA 3ZSXA 3SAGA 3R3LA 1VQPN 1S1WA 2KZZA 3OYLA 1HJOA 4OLBA 4Z4FA 3CM5A 3ZSWA 4GNIA 3K9JA 1NMNA 3ZT2A 2Q36A 5FRMA 3SV3A 3RR8A 1NKBA 2I7NA 2HVHA 4E7KA 4KHQA 1YVNA 5AZIA 4DQRA 4H5NA 1QHTA 2GBZA 3MEGA 3TSUA 3QEIA 5BN8A 4JI6K 3VQ9A 4DSFA 3U9ZA 4JKGA 3DLKA 1NLVA 3RSEA 3KWIA 2LT8A 3CG7A 3NF8A 3OYAA 2GUPA 2HNDA 1SEGA 4CGHA 3PUFA 4M3UA 2HW3A 4NLBA 1JLCA 4IOXA 3CYGA 4FLVA 3CC2N 3LDSA 4OPAA 5AQVA 1HQEA 1N34K 3VOVA 1XMOK 2HBLA 4HWIA 2FF6A 5GAEP 1NGEA 2HHWA 4BRPA 4L3QA 4DTOA 3DMJA 4PL8A 1C55A 3AO2A 3E9PA 1VSHA 1CLQA 1VSDA 3AVNA 2Y1IA 4PHTX 5KRSA 3VF4A 1WN7A 1QVFM 4B9QA 4PKGA 3ULDA 4IEIA 2DY4A 3ITHA 4WYBA 2YV0X 1NJXA 1Y64A 2KBJA 1XHXA 4FLXA 4DTNA 1SL1A 2P9LB 2VGMA 3DOLA 3HO1A 4LFCK 1NNEA 2HHHK 4DFPA 4CHOA 4Z0UA 1WT7A 3OYIA 1EO1A 1JKHA 3H1VX 3P5JA 3R8EA 2KBKA 1RT4A 2YBRC 2NLXA 3VENA 3A8YA 1KAXA 3F9MA 2E1ZA 5EU7A 4BRAA 1VSJA 3DLRA 2QWOA 5HRPA 4DTMA 1VQKN 2QW9A 1RFQA 4H0VB 3MXMA 3H3NO 4BR7A 4ELTA 3O3FA 4CK2A 4CE9A 5CYQA 1WSHA 3CCLN 4HCCA 2PZSA 1BISA 4O55A 1XQSC 4ELUA 2Q1NA 3O4NA 4CZIA 4CJ4A 2FLOA 4QCLA 4W5OA 2ZF5O 2E2OA 2VQFK 4FM0A 4I6MB 1VSKA 3CD6N 4OJRA 1KAZA 3CYMA 1WWNA 2HNZA 4CHQA 4AHTA 1RT2A 1QZ6A 3H6EA 5DK5A 3LPUA 4C8LA 4L8RB 3OYMA 2CH6A 1KC8O 4NYFA 4B9SA 1C0TA 4FWNA 3FFKB 1KLNA 3TI0A 1SAZA 5AZJB 3ID6A 1HYVA 4NB4A 2BDPA 4A57A 3O9TA 4ICLA 4DV5K 3SUPA 4JLHA 3QEPA 3SQ0A 4FJ9A 1GLFO 2EHGA 1NGCA 3M8SA 1U2VA 5GADP 1TK5A 4HTUA 1CN2A 3HXMA 3VQEA 1U4BA 2F9WA 1P90A 3OS0A 1NH5A 4K41A 3KP1A 3JSMA 4JI3K 1GLAG 2H3GX 2NRRA 1IJJA 4JHDA 4E3SA 4DFKA 4DSEA 4CF8A 3K58A 4DQPA 3QBWA 4BC5A 2YHBA 3LDLA 4DUZK 3JS6A 2GWKA 2KBHA 2VY6A 3VQAA 4DUYK 1IBLK 5I3UA 2YHAA 4FJGA 2KFZA 3FZLA 4B3TK 2E3FA 1VSLA 5TKWA 3K9KA 5KGXA 3OJSA 2E4LA 4BR9A 3KLFA 3KIOA 1C0FA 3MWTA 1I3AA 1LWCA 3AGRA 3P38A 4O8KA 4O5FA 3IG1A 4RTFD 4JRPA 4KHPK 3AAPA 1ZUTA 3DOKA 4CIGA 2OPSA 4B8CA 2DPNA 3SCXA 4FWOA 3ATUA 1H1VA 1SS6A 5BPLA 3VEXA 3PSIA 4M3WA 5ADXA 4WF9L 1RDWX 3K5OA 3TR8A 4A2BA 3ZT4A 3QETA 2NZTA 1XNQK 4M3YA 2QWPA 1I6FA 4BRMA 4F2RA 1JKZA 2VWBA 1QQOA 1DGKN 1O13A 4BROA 4FPBA 5TKYA 2NUBA 4DS5A 4FWRA 4FK2A 4M7XA 1P00A 3V9SA 3N4QA 3SJJA 2XRIA 5CHIA 4B9UA 1UAXA 1NPIA 4XH1A 3C6HA 1ASVA 4NXMK 4H4OA 4F2SA 3AVLA 1JLEA 3LP3A 1IH7A 2UXDK 1ZBUA 3J7AP 1TGOA 3TABA 3G71N 1YIJN 4J2DA 3FZKA 4JS4A 1XC3A 4W5NA 1J9AA 2LJ7A 2O4GA 4JKHA 4ISFA 1VSIA 1YTAA 3V1QA 5CZ1A 3QICA 2OYQA 2VWJA 4CEZA 4EFHA 3SZ2A 1JL1A 4LFAK 3LM2A 2YEOA 4DTSA 3DLLL 3WXJA 2IGIA 4CHYA 1Q82O 3NVMA 2E5LK 2PBDA 1Z26A 1IKVA 4MQ3A 5M1OA 1HYSA 4H5TA 4IEEA 4BG9A 3CW4A 4CJTA 3HI0A 2Q3SA 1LW2A 3P4IA 3KZBA 2HHTA 2QK9A 2IVPA 3IS9A 4FWPA 2YNFA 4CBXA 1V4SA 4H0XB 3L2VA 4B9MA 3OYGA 3AO4A 1R0AA 3AVIA 4LF7K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Z1H A;  1Z6R A;  3PX0 A;  3VQ6 A;  4Y1C A;  2HHX A;  1VSF A;  3CJ1 A;  4DR1 K;  3A5O C;  2UXC K;  3D6R A;  4BVO A;  1ZFU A;  4LFB K;  1X9S A;  1TL3 A;  3BF1 A;  4M42 A;  3L2W A;  2QA4 N;  3V1O A;  1U6Z A;  5JS2 A;  1D9D A;  4CFA A;  1OH6 A;  1GLB G;  1VQN N;  4CF2 A;  4DSI A;  5SWM A;  1VAZ A;  3C95 A;  4Y1D A;  1BCO A;  3VQC A;  4A62 A;  4GKK K;  2B4J A;  4HVJ A;  1BCM A;  2X6S A;  3HYF A;  3CFP A;  2IVO A;  2G8W A;  1I6G A;  2D0P A;  4KH4 A;  1J5E K;  1VQ9 N;  3P31 A;  2AJQ A;  2O8D B;  1T0Z A;  3KKS A;  1SKS A;  4CJS A;  2QWM A;  1TUU A;  4KB0 A;  4CIF A;  4ILJ A;  4DLE A;  4ILH A;  1QQM A;  5AQL A;  2BRZ A;  3F5T A;  4XH4 A;  5KTQ A;  4BG8 A;  1KVC A;  4DR3 K;  3VQ7 A;  1T03 A;  3M1F A;  3PSF A;  3FFI A;  3ZSX A;  3SAG A;  3R3L A;  1VQP N;  1S1W A;  2KZZ A;  3OYL A;  1HJO A;  4OLB A;  4Z4F A;  3CM5 A;  3ZSW A;  4GNI A;  3K9J A;  1NMN A;  3ZT2 A;  2Q36 A;  5FRM A;  3SV3 A;  3RR8 A;  1NKB A;  2I7N A;  2HVH A;  4E7K A;  4KHQ A;  1YVN A;  5AZI A;  4DQR A;  4H5N A;  1QHT A;  2GBZ A;  3MEG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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