5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
1U2VB 3VGLA 5BPMA 4DB3A 3VGMA 4ISGA 3LDPA 1NGAA 2FF6A 1LCUA 1TUYA 3QDKA 1GLFO 1J6ZA 4WQ4A 3IFRA 2V7ZA 4FWLA 3EZWA 4B1YB 2VWBA 3VEWA 4FL9A 4BVPA 1TUUA 3ZETB 2W40A 3ZETA 2Q1NA 5ELZA 4GNIA 4JNEA 2P9NB 1GLDG 4RTFD 2P9NA 4CBUA 1X9JA 1ATSA 4RWTA 2QWQA 4H5RA 3U4LA 1HPMA 1XUPO 2GWJA 4NO7A 5AQQA 3I8BA 1IG8A 1YXQA 3H1QA 2E88A 4C23A 1ATNA 2E2OA 2VCPA 3QB0A 1BA0A 3GL1A 1HKBA 3M6GA 3MMVA 5JICA 1HX1A 3VOVA 3FZKA 4A2AA 4H5WA 4BC5A 5AQKA 4CZKA 4H5VA 2V51B 3WEEB 1KAZA 1BDGA 3WEEA 3LDOA 3HM8A 2A5XA 2Q31A 4PKGA 3H46O 3WQUA 3VF2A 4BC3A 2P9SB 2P9SA 2QXLA 2ITMA 3BP8A 3UB5A 3D2EA 3LM2A 4BRPA 4BQZA 3H45C 2EWSA 3CJBA 2A42A 3W3DA 5AFUA 1T6CA 4Z94A 4DHYA 2F9TA 4CZIA 2P9KB 4FOEA 2P9KA 4ISFA 5BRFA 2P9PB 1NGBA 3VETA 1SAZA 5FPNA 1NGJA 3A5OC 3FGUA 4O8KA 2V7YA 3O80A 1QZ5A 5I9EB 3ATVA 3ULEB 4BRAA 3ULEA 1S22A 2A41A 2AP1A 4WQ5A 2PBDA 3CETA 3MK6A 4BR0A 3A0IX 5F2RA 3O8MA 3B8AX 3JS6A 1HKCA 1BA1A 5AQVA 4AM6A 3EL2A 3HI0A 3I33A 3FZHA 2QWMA 1XQSC 2IVNA 3QBWA 4M63C 4H03B 1KAYA 3EKUA 1E4FT 1RDWX 2ZF5O 5AZIA 5CE3A 5AQPA 1Y64A 2FXUA 1SZ2A 1ZBSA 1HKGA 3MN5A 5KPRA 5F1XA 4YDUC 5AQZA 2FSKA 4IJAA 5BPLA 3D2FB 4BVOA 3D2FA 4CI6A 1EQYA 3WQTA 5BR9A 4BRLA 5ADXA 2DPNA 1YUWA 1C0FA 5JMVA 5JLHA 1U6ZA 2HF3A 4EAHD 2FSJA 3AARA 2BUPA 2FLOA 4BR4A 2KHOA 5AQTA 2Q97A 2BTFA 5KQDA 2D0OA 2ASPA 2E1ZA 4FWQA 5BPNA 2QM1A 1IJJA 2HMPA 1QQOA 3GOIA 4ISEA 3O4WA 2GEMA 2GTDA 1X3MA 3FFKB 3DXKB 3MN9A 1YVNA 3EO3A 4FWRA 3FZFA 3VEOA 1HJOA 2Q0RA 3VERA 4BRGA 3VF4A 3H3OB 3FLCO 4AM7A 2HOEA 5AQYA 2J4RA 3KVGA 1RFQA 3BUZB 4H0XB 2I7NA 4O5FA 2YHWA 2IVPA 4BRMA 3MN7A 3U8XA 3ID8A 4MLEA 1RGIA 4J8FA 4IJNA 3VEVA 5AQUA 3GBTA 3HZ6A 2ZGZA 3C7NB 4BGAA 2E8AA 3C7NA 3HTVA 4BRIA 1DKGD 2W41A 3P4IA 4CBWA 1HUXA 4QS8A 1NGFA 3HBTA 5BREA 1KAXA 4HWIA 2QWPA 1BO5O 5AQNA 1BUPA 3CI5A 1YAGA 1NGGA 4WYBA 3WXKA 3LDNA 2WUSA 5BRHA 2YHYA 2ZWHA 4XH5A 3WXLA 4BGBA 2E20A 4BC4A 1K8KB 1NGEA 2UYTA 5AQGA 1K8KA 2YI1A 5EY4A 4H0YB 4DQ8A 2IIRA 3FR0A 3MN6A 1QQMA 1BG3A 3DXMB 4KBOA 3DXMA 3F9MA 3QFPA 1C0GA 3DAWA 2QW9A 4XH1A 4FPAA 4IO8A 1BOTO 4JAXA 5AZJB 4IZ9A 5AZJA 4Y0WA 1R59O 3D2EB 5F0XA 3UE5A 3O6WA 4L3QA 4JD2B 4JD2A 4WQ5C 4EFHA 4LC9B 4K25A 4QS9A 4B1WB 4CZJA 4FPBA 5AQWA 5KPZA 3LDQA 4BG8A 3MDQA 3QBXA 4E1JA 1G99A 2E2QA 1JCGA 3JXUA 4JHDA 1WUAA 3VF6A 1JCEA 3S41A 1NGIA 4K43A 3OHRA 4BRQA 3MCPA 5JLFA 2FF3B 2QWRA 4FWPA 5AZIB 2HF4A 4GY2B 4CBXA 1DEJA 4K41A 5B8HA 4FWSA 4PKHA 4H0TB 2ASOA 3W0LA 1NM1A 3J8AA 1NGDA 3ZEUB 3CJAA 3ZEUA 3QFUA 4BR7A 5AQIA 2H3GX 2CH5A 4FWOA 4A61A 3EKSA 4I6MB 1GLJO 4I6MA 4FWKA 5TKYA 2ZGYA 3G25A 4JN4A 4B1VA 4B1XB 5BN8A 3A8YA 2PAVA 3VESA 4BRDA 3R8EA 3DJCA 3H3NO 4MO5A 2A3ZA 3SK3A 3SLCA 1DGKN 3QMLA 5EVZA 3SMSA 2NRHA 3H1VX 4BC2A 3KZBA 5FPMA 1S3XA 1ESVA 4WQ4C 4EIAA 2GELA 4PL8A 1NMDA 4H5NA 3VPZA 2D1KA 1LOTB 2FSNA 3L6QA 2A6AA 3R6MA 4BRKA 3A5MC 4QS7A 4B1UB 3TU5A 1T44A 3LM9A 2I7PA 3WXJA 3VEYA 1WOQA 3U9DA 2D4WA 3SMPA 1GLCG 4PKIA 1MWKA 4FOIA 2IVOA 5AFUH 3CJ9A 1NGHA 1Z05A 5KQ8A 3ENOA 3GDQA 5AQXA 3FZLA 2GUPA 1NGCA 2NZTA 3VENA 4H0PA 3ZX0A 1V4SA 3EN9A 1U2VA 2QWNA 4M7YA 4FWNA 1GLLO 4BRNA 1Z6RA 1ZXOA 5EXWA 4MLHA 5AQLA 3A5NC 1ATRA 5E26A 3UKUB 3GG4A 4MO4A 3UKUA 1NBWA 1V4TA 4IWVA 2CGKA 3BEXA 4CZEA 2QWOA 1QQNA 1ZC6A 2CGJA 4BQLA 4CJ7A 4FSVA 5AQSA 3QICA 3O1WA 3BF1A 3H6EA 4H0VB 5BRDA 4IXCA 5LJWA 4CD1A 4CZFA 4CZLA 2V52B 3AAQA 1GLBG 3O5BA 2YJFA 1OKJA 3AY9A 4H5TA 1JCFA 3A5LC 1NLVA 4BROA 3CERA 3VEZA 3CQXA 4M7XA 5AQHA 5AQMA 1MA9B 2E2NA 2Q0UA 4BRFA 2QWLA 5ADXH 2P9UB 3ZX3A 2P9UA 3FZMA 1BU6O 2Q2RA 3D7EO 1XC3A 4BR9A 3CQYA 5LJVA 1CZAN 1KXPA 1GLAG 3R9PA 3ATUA 4CZGA 5EX5A 2Q36A 5AQOA 1TYQB 3M1FA 4CZMA 5AQRA 1TYQA 4JHDB 4F9OA 2A40A 4PL7A 3SJHA 5KPTA 3ENHA 1BWFO 1QZ6A 1X3NA 3IMXA 3VEXA 4A62A 5FPDA 1T6DA 4XEIA 3L0QA 5AQJA 4FWMA 1MWMA 4EHUA 3O1BA 2P9PA 4B9QA 3C0BA 4K42A 2YCHA 3WUHA 4H0OA 5EOYA 2AA4A 4CD3A 4XH4A 4BR2A 3L4IA 4FO0A 2OANA 2D0PA 1E4GT 4B1ZA 3WXIA 2YJEA 1H1VA 1GLEG 2P9LB 2P9LA 3CJ1A 3AAPA 4HTLA 3GE1A 2ASMA 3VGKA 3CJCA 2F9WA 2VYPA 4EHTA 3DWLA 5FPEA 1NWKA 4A2BA 5BN9A 4DCHA 2NLXA 1MDUB 3IDHA 2YHXA 2E2PA 4BREA 4BRHA 3M3ZA 2E1YA 3CHWA 2GWKA 4NB4A 3CJ7A 4BR5A 1SQKA 4BG9A 3BF3A 4BRCA 1HLUA 3UKRB 3UKRA 3LDLA 1QHAA 3FE1A 2CH6A 2P9IB 4YDUA 1P8ZA 2P9IA 4CZHA 3LL3A 3HSCA 2CGLA 3TPQA 1Q18A 4RCHA 5AQFA 3ZX2A 3RSEB 3RSEA 3WT0A 3CIPA 3O08A 3KHYA 5E84A 3IUCA 5LY3A 5AR0A 3U9ZA 3DXKA 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8CB 3KC6A 3VGLA 1JLAA 5BPMA 4BECA 4FJ7A 2RHKA 3VGMA 3OYEA 4ILGB 4CCHA 3QDKA 2O8BA 3KLFA 2V7ZA 4KH4A 1LQIA 4AF1A 1YITN 3EYZA 4V1DC 3OW2M 2VWBA 4I2PA 4M41A 3OS2A 4BVPA 4BDPA 2KYQA 2XY8A 3G4SN 1D5AA 4JKAA 3ZETA 1I2VA 5C10A 4ID5A 2Q1NA 3BGRA 4RTFD 2Y1IA 4LH4A 2NY9X 4LY7A 4U7BA 1Q7YO 4H5RA 3U4LA 4HHFA 3C65A 3OYJA 2HHXA 3HL8A 2OPPA 2GWJA 3HT3A 4CHYA 4FXDA 4CK1A 3RR7A 2E88A 2I61A 1E3MA 1BA0A 1RBVA 3M6GA 5GAEP 3SBTA 4A2AA 5HL7L 3O9UA 3CM5A 1IKWA 4FLZA 3VN5A 3G71N 3TABA 3P39A 4HVJA 3H46O 3WQUA 2G8VA 1TK8A 3THYB 3PSMA 3D2EA 2WBNA 3LM2A 4BQZA 4JI8K 1U4BA 3O9TA 4KRFA 3J7AP 4DTJA 2B6AA 1K8AO 3L4QA 1VQNN 4CZIA 3KTQA 3VA3A 3LPUA 1SAZA 4WFBL 1RT7A 4M3ZA 3A5OC 1JXCA 3V6DA 4O8KA 1IO2A 5C12A 1K73O 3ATVA 1T7EA 5CY0A 2PBDA 3CETA 3VQPA 5K14A 3A0IX 4CHPA 1HKCA 5AQVA 4AM6A 3EL2A 3HI0A 1BMRA 4IO9L 4X64K 2W00A 1KTQA 3ZYYX 5CE3A 3AA2A 3ASMA 5AQPA 3K9JA 1Y64A 1SZ2A 1F21A 1HKGA 3E01A 1RT5A 2HNDA 4CI6A 3L2RA 2GMOA 3K5NA 2LY5A 5ADXA 4Z4CA 2B68A 5JLHA 2HF3A 2W6LA 4B9VA 3CCQN 1B9DA 3NF8A 2FLOA 3NVMA 2OTJN 2KHOA 5EU7A 3P31A 4F8RA 4C8OA 4JI1K 2YNGA 2OTLN 5BPNA 2QM1A 2QEXN 2GEMA 2KW4A 3U3GA 3MN9A 1Y97A 4W5TA 3VF4A 2VWKA 3WNFA 1RTJA 1RFQA 4PY5A 4OKKA 3EE8A 4O5FA 3J81O 4X65K 2C1IA 3QEPA 4DR3K 3U8XA 1FK9A 3JAMO 4J8FA 2YEOA 3O9QA 4IJNA 5AQUA 4FZXC 3HTVA 4BRIA 1YIJN 2KBKA 1HUXA 4CECA 3MEGA 1XWLA 2MBKA 3K59A 2HHHK 4Q5VA 1BO5O 2WOMA 3VQ5A 1YAGA 1NGGA 1K6YA 4DUZK 3CCVN 1NK4A 4UJ0A 5GAGP 3RTVA 4CESA 4FYDA 2HSTA 4XH5A 3M8RA 4DR5K 1K8KA 4FLXA 1P0AA 4AHUA 3MN6A 1BG3A 1RT1A 1HNVA 1VQ6N 4LF7K 2QW9A 3DRPA 4DV2K 4FPAA 4JAXA 3HO1A 2KBJA 3AVLA 2GV9A 4DTNA 3D2EB 3KWIA 1VRTA 3V1OA 3ZCMA 1NKEA 4JD2B 3THXB 4OPKA 3TAMA 2G8FA 1SKWA 1UA1A 1QE1A 3KP1A 1CHZA 4DSJA 4LC9B 4K25A 3TSUA 4OX9K 3OYBA 4FM1A 3L8BA 2FBVA 3M8QA 4M45A 3OYNA 3NE6A 3LDQA 3MDQA 4CJPA 4FLUA 2NRXA 1G99A 1ICAA 1JCGA 2KZZA 3PX0A 4WCEL 2GL1A 2YKMA 1SUQA 4FJ9A 1JCEA 3S41A 1TVRA 1N32K 2XY5A 5JLFA 2QWRA 4DSKA 3KK3A 4DFJA 4FWPA 3C95A 4IOCL 3RMBA 2LY6A 4IG0A 4FWSA 3J80O 4PA1A 4H0TB 1O13A 4IEEA 2E3FA 2O8EA 3J8AA 3ZEUB 1Q86O 1L3SA 4ELUA 3BZKA 3QFUA 4LFBK 4CIFA 4AILC 1WSJA 2DFHA 4KI6A 4A61A 4FWOA 4EP5A 3T1AA 2LKBA 3EKSA 1GLJO 2HHVA 4JN4A 3A8YA 3VESA 1CN2A 3ZT4A 4MO5A 4DV6K 4DQRA 1DGKN 2NRHA 3DYAA 1DT9A 3NGYA 1KVBA 1MYNA 2GELA 4PL8A 1NMDA 4E89A 2D1KA 1IBKK 1LOTB 2FSNA 4JYAK 3DLHA 1VQ4N 5FRMA 3HK2A 2B3CA 4K8ZA 2A6AA 2BRZA 1SL2A 3HYFA 4QS7A 1LAWA 2N2RA 4CJLA 4OGEA 2F7TA 2I7PA 3WXJA 3VEYA 1WOQA 4YNQA 4N41A 4FCYA 3SMPA 3ZSOA 3SZ2A 3CPEA 1GLCG 1MWKA 4FOIA 2G8WA 3CCSN 2IVOA 3CJ9A 5KQ8A 1RTHA 3I0RA 4PWDA 3CPWM 3FZLA 2GUPA 2D0BA 3M8PA 2E6LA 1LWFA 1GPSA 1KLMA 4H0PA 3VENA 3ZX0A 1GPTA 1O1WA 2UUBK 3EN9A 2QWNA 4DUYK 1GLLO 4BRNA 1XI1A 1YVUA 1W97L 1G15A 3HP9A 1HMVA 4MLHA 5AQLA 3V9XA 1C1BA 3FFIA 5E26A 4MO4A 2P5GA 1SNBA 3VQBA 2W6KA 3KJVA 4M3XA 2CGKA 4CZEA 4A5BA 4YOYA 5JVHL 1QQNA 4CJKA 2G8HA 4CJ7A 1WSIA 2O8DA 4H0VB 4IXCA 5LJWA 4KTWA 2BE2A 4CZFA 5T7BA 1CXUA 4UAFE 4NYNA 2YNHA 1EXQA 3K5LA 3NGZA 3AY9A 1EWRA 4JS4A 5IT9O 1GOBA 2MZ0A 3CERA 3CQXA 1MA9B 3WXMB 4B9MA 4JS5A 1TL1A 5SZTA 4WF9L 1QTMA 4DSIA 2RF2A 2QKBA 3D7EO 4ICLA 1DLOA 2Y1JA 1NKCA 3RMCA 1A5VA 1N8RO 3V4IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2O8C B;  3KC6 A;  3VGL A;  1JLA A;  5BPM A;  4BEC A;  4FJ7 A;  2RHK A;  3VGM A;  3OYE A;  4ILG B;  4CCH A;  3QDK A;  2O8B A;  3KLF A;  2V7Z A;  4KH4 A;  1LQI A;  4AF1 A;  1YIT N;  3EYZ A;  4V1D C;  3OW2 M;  2VWB A;  4I2P A;  4M41 A;  3OS2 A;  4BVP A;  4BDP A;  2KYQ A;  2XY8 A;  3G4S N;  1D5A A;  4JKA A;  3ZET A;  1I2V A;  5C10 A;  4ID5 A;  2Q1N A;  3BGR A;  4RTF D;  2Y1I A;  4LH4 A;  2NY9 X;  4LY7 A;  4U7B A;  1Q7Y O;  4H5R A;  3U4L A;  4HHF A;  3C65 A;  3OYJ A;  2HHX A;  3HL8 A;  2OPP A;  2GWJ A;  3HT3 A;  4CHY A;  4FXD A;  4CK1 A;  3RR7 A;  2E88 A;  2I61 A;  1E3M A;  1BA0 A;  1RBV A;  3M6G A;  5GAE P;  3SBT A;  4A2A A;  5HL7 L;  3O9U A;  3CM5 A;  1IKW A;  4FLZ A;  3VN5 A;  3G71 N;  3TAB A;  3P39 A;  4HVJ A;  3H46 O;  3WQU A;  2G8V A;  1TK8 A;  3THY B;  3PSM A;  3D2E A;  2WBN A;  3LM2 A;  4BQZ A;  4JI8 K;  1U4B A;  3O9T A;  4KRF A;  3J7A P;  4DTJ A;  2B6A A;  1K8A O;  3L4Q A;  1VQN N;  4CZI A;  3KTQ A;  3VA3 A;  3LPU A;  1SAZ A;  4WFB L;  1RT7 A;  4M3Z A;  3A5O C;  1JXC A;  3V6D A;  4O8K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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