4CZJA

C. crescentus mreb, double filament, amppnp
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
323
structure length
314
Chain Sequence
DIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
molecule tags Structural protein
total genus 94
structure length 314
sequence length 323
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czjA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czjA03
4FWSA 3DWLA 4BR4A 4CZKA 4CBUA 3M3ZA 3EKUA 5ELZA 3UKUA 3H1VX 1SQKA 4BRDA 4BR5A 4FWPA 5JLHA 2I7NA 2YHYA 1NGAA 4WQ5C 5AFUH 2H3GX 2D1KA 4BREA 4L3QA 4B1ZA 2HMPA 3O1WA 5AQOA 1E4GT 1NGJA 5AQUA 4XH1A 1P8ZA 1XC3A 3IFRA 4BC3A 4CD3A 1DKGD 2KHOA 2A40A 3MMVA 2QWRA 1QQNA 1S3XA 3BF3A 3O5BA 1ATRA 2E1YA 1GLDG 4BROA 4RWTA 1BG3A 2EWSA 3FZHA 3DXKA 4HTLA 3LM9A 1KAXA 2QM1A 2P9KA 5AQZA 1YVNA 1BUPA 5JMVA 4FWKA 4XH4A 1G99A 5I9EB 4MO4A 1TYQB 1V4SA 2YHXA 3H6EA 3M1FA 4YDUA 2YJEA 2Q0RA 3H3OB 4CZHA 3S41A 4O5FA 2Q1NA 4H0VB 2OANA 5AQYA 4CZIA 3ENHA 1K8KB 4E1JA 3L6QA 3DJCA 3O4WA 1HLUA 2E2NA 3WT0A 1JCEA 4A2AA 4BRHA 4B1YB 5AQFA 2P9SA 1NGGA 1JCFA 1CZAN 4H5TA 4PKIA 1HKBA 3CETA 5JICA 2E88A 3LDLA 2ASOA 3DXMB 4JD2B 4FOIA 3A5LC 3KVGA 1LCUA 3VF6A 1S22A 2Q31A 4BRQA 1GLJO 1GLEG 1ZXOA 3I33A 4JAXA 1NGFA 5KQ8A 3BEXA 3FZFA 5AQJA 2QW9A 2AP1A 1QZ5A 5EVZA 2FF3B 4QS7A 1HUXA 1T6CA 5AQLA 3CJ9A 4BC5A 3CJCA 4BC2A 1WUAA 4K42A 1SAZA 5AZIB 3QBXA 3ZX2A 2QWPA 1V4TA 3MN5A 2ASPA 2CGKA 3C7NB 3VOVA 1NGIA 3MN9A 1GLCG 3VERA 1GLFO 1YAGA 4BR0A 2V51B 2Q0UA 1ATNA 5AFUA 3SMSA 5ADXA 1K8KA 1WOQA 3D2FB 4NO7A 4CJ7A 3VETA 5KPRA 1GLAG 3DXKB 3A5NC 3JS6A 3AARA 3ULEB 3ZEUB 3LDNA 2E2QA 3ZX3A 1ESVA 3A5MC 3CI5A 3FLCO 2GTDA 3CHWA 3FFKB 3AAQA 3LDOA 2D4WA 2FF6A 3DXMA 4JD2A 4XH5A 5E26A 1BU6O 4DCHA 4CZLA 2E2PA 3MN7A 2PAVA 5KPTA 5F0XA 4WQ4A 3W0LA 4CZEA 2P9IB 4BR2A 5AQVA 4BQLA 4CZMA 2D0PA 3BUZB 3W3DA 2P9SB 3CIPA 5AQKA 1XUPO 3EKSA 5BN8A 1BWFO 4M7YA 4A2BA 4BGBA 4H5VA 3UKRB 3WEEB 2HF4A 3D7EO 4IJNA 5AQMA 2Q36A 2P9NB 5AZIA 2FXUA 1QQMA 2A6AA 3QMLA 1NGHA 4EHUA 3A8YA 3VEZA 3C7NA 3O80A 4RTFD 3GG4A 1NLVA 3MDQA 2CGJA 2ZGYA 2AA4A 3CERA 4B9QA 3AAPA 3HM8A 1Z05A 4GY2B 4H5RA 5EXWA 1GLLO 5BREA 2E2OA 1ATSA 2NLXA 3LDQA 2FSJA 4CBWA 2WUSA 3D2FA 3EO3A 3CJ1A 2GWJA 4BRNA 4WQ5A 2HF3A 2DPNA 3HZ6A 4EAHD 3ULEA 3ZEUA 2UYTA 5BN9A 5LJVA 2GELA 3VGMA 2IVNA 2IVPA 4B1UB 1SZ2A 5AQRA 2P9UB 4FWRA 3VEXA 1XQSC 4BVOA 4PL7A 1T6DA 3LDPA 1NGCA 2HOEA 4RCHA 5FPNA 1BOTO 1NM1A 4CI6A 2ASMA 5BRDA 2CGLA 3AY9A 4BQZA 2ZF5O 1LOTB 1BA0A 3MN6A 4NB4A 2P9IA 4ISFA 1GLBG 3SMPA 1MWMA 4FWMA 2FSNA 2QWMA 3ZX0A 2YHWA 1T44A 3A5OC 3B8AX 1BDGA 4H0XB 2V7ZA 4FPAA 5EY4A 3O6WA 4BRAA 3WEEA 2VYPA 3UKRA 1C0FA 2FSKA 2P9NA 4H0YB 2IVOA 4AM6A 2F9WA 3EZWA 4XEIA 4FWOA 4A62A 3R8EA 5F2RA 3WXIA 3ZETB 4I6MB 4M63C 4QS9A 1DGKN 3C0BA 3FZMA 3FZLA 3QICA 5FPDA 5LJWA 1HKGA 1ZBSA 1YXQA 4IZ9A 4CZJA 4H0OA 1NBWA 5AQGA 2BTFA 4IWVA 3WXKA 1EQYA 3U8XA 2E20A 2PBDA 4GNIA 5AQIA 1IJJA 2QWLA 3VF2A 4DHYA 3SLCA 4J8FA 3VESA 3FR0A 2P9UA 4WYBA 3RSEB 2YJFA 1H1VA 1Z6RA 3O1BA 3GL1A 3R6MA 3VGKA 1Q18A 2P9LB 5LY3A 2ZGZA 3WUHA 3JXUA 3HI0A 2A3ZA 3SK3A 4F9OA 5AQXA 2A42A 1HJOA 3CJAA 2QXLA 3P4IA 3QDKA 5CE3A 3O08A 3BF1A 2GUPA 3VEOA 2QWQA 2CH6A 4IJAA 4A61A 3M6GA 4BRMA 3FE1A 5AQTA 4MO5A 1RDWX 5EOYA 5EX5A 1KAYA 2V52B 1R59O 4FWLA 1X3MA 4H0PA 3ZETA 4I6MA 4Y0WA 4EFHA 3EL2A 4EIAA 3L4IA 1X9JA 3QB0A 4K25A 2CH5A 1NMDA 4B1WB 4BRKA 3VEYA 1QQOA 3ENOA 3GDQA 3CJBA 3VGLA 1NWKA 3O8MA 4ISEA 1HX1A 5KQDA 1C0GA 4CD1A 1NGBA 3BP8A 3FZKA 2E1ZA 4H03B 1E4FT 4FOEA 1MWKA 3HTVA 5AQPA 2ZWHA 3WQUA 3RSEA 5KPZA 4B1XB 5JLFA 4JN4A 3R9PA 2FLOA 4PKGA 4IO8A 4HWIA 1DEJA 2F9TA 2V7YA 2P9LA 3IUCA 3D2EB 4MLEA 4BC4A 4BRIA 1IG8A 5AQSA 5BPLA 3CJ7A 5BPMA 3VEWA 3IMXA 3HBTA 5ADXH 4JHDB 1NGDA 1U2VB 4BVPA 4KBOA 4DB3A 4BG9A 4CZGA 3F9MA 1Y64A 2YCHA 2A41A 3MCPA 1KAZA 5AR0A 4BRLA 4YDUC 3A0IX 3I8BA 1BA1A 4EHTA 5FPMA 1JCGA 3VENA 4BRGA 3ID8A 1HKCA 2GEMA 4PL8A 3CQXA 5AQQA 4PKHA 3H46O 3KHYA 4LC9B 1MA9B 4K43A 3U9DA 5F1XA 1TUYA 3MK6A 5B8HA 1RFQA 3VF4A 3WXJA 2J4RA 1HPMA 1QZ6A 4FWQA 3KZBA 4MLHA 2W41A 3G25A 3TU5A 3DAWA 2E8AA 1NGEA 4DQ8A 4K41A 3VEVA 5BRFA 4IXCA 3J8AA 2P9PB 4BGAA 3D2EA 5AZJB 3GBTA 2D0OA 3LL3A 1X3NA 1TUUA 2QWOA 3U4LA 1J6ZA 5BR9A 4C23A 1YUWA 1D4XA 3GOIA 4JHDA 2Q2RA 3OHRA 4FO0A 4BRCA 5BPNA 2QWNA 4FPBA 1U2VA 3H1QA 5AQWA 5E84A 3WQTA 5BRHA 2VCPA 3QFPA 3U9ZA 1RGIA 3H3NO 4B1VA 5AQNA 5AQHA 3SJHA 3UKUB 3VPZA 1MDUB 2NZTA 3HSCA 1BO5O 1ZC6A 4H5WA 3TPQA 2NRHA 2VWBA 4O8KA 4CBXA 3QFUA 4BR9A 4M7XA 3FGUA 2GWKA 4AM7A 3CQYA 1TYQA 4H5NA 4BG8A 4BR7A 3ATUA 3QBWA 3GE1A 3LM2A 5FPEA 4JNEA 2ITMA 4WQ4C 1QHAA 4H0TB 2Q97A 4FSVA 2IIRA 4CZFA 3EN9A 4FL9A 3UE5A 4Z94A 4BRFA 4FWNA 2P9KB 3ATVA 2BUPA 2P9PA 4QS8A 5AZJA 4ISGA 1KXPA 2YI1A 3WXLA 2A5XA 3H45C 5TKYA 2W40A 3IDHA 3UB5A 4BRPA 1OKJA 1U6ZA 2I7PA 3L0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EYZA 2FBVA 1TKDA 5C12A 3DWLA 2HHQA 1Z25A 4CBUA 4CEFA 4EP4A 3EKUA 2C1IA 5GAEP 2VG7A 3P5JA 2F8TA 1SQKA 2JGUA 4FWPA 5JLHA 1KSPA 3TTFA 3V81A 4M3TA 4L3QA 4CJQA 4CIEA 3O1WA 5AQOA 3I55N 2OA8A 5CY4A 3VQ4A 2FBTA 4XH1A 4R5PA 1XC3A 3QEXA 1Q8IA 1BGXT 3IFRA 4JKHA 3ZCMA 4CD3A 4E1NA 2ZD1A 2A40A 1ILYA 1S1UA 3V1OA 3DRSA 3L3VA 5AJ3K 4DTSA 1ATRA 3ZSXA 4BROA 1BG3A 1J53A 2EWSA 3FZHA 1TAQA 4CECA 3NVMA 5C2DA 5AQZA 4CGGA 1YVNA 1BUPA 2HHIA 3AVFA 1G99A 3O9QA 3ENBA 1MU2A 1TYQB 1V4SA 3CQ8A 3RWUA 3TSUA 3HVRA 2OPPA 3WNFA 4FLYA 4KHPK 2Q1NA 1Q7YO 4DR4K 3T1AA 2E2NA 5AQFA 3K5MA 1JCFA 2OCEA 4H5TA 4DR6K 4BECA 1HNZK 5JVGL 5JS1A 3TAMA 1LAVA 4NYNA 3KVGA 4IFVA 1LCUA 2P1JA 1S22A 2Q31A 3OYGA 3M8SA 4B9NA 3SPZA 1D5AA 4EZ6A 1NGFA 5KQ8A 3FZFA 3CCJN 2QW9A 2AP1A 1HMVA 3OYDA 5GAHP 2W00A 1C0UA 4KO0A 2NRXA 3CC7N 1QVGM 2O8BA 4MQ3A 3OYCA 4FLVA 4QCLA 2O8DA 4BC5A 3HK2A 3CJCA 5CZ2A 1WUAA 4K42A 1RDBA 2X6SA 2UUCK 5FRMA 4RW7A 4UQGA 3K57A 2CGKA 1XI1A 2G8HA 1OH8A 1XMOK 2O8FA 3NF8A 3MEDA 1VQON 3VERA 3OTOK 2HNYA 2V51B 1XHXA 4CF2A 3SQ1A 1SUQA 1K8KA 3D2FB 4NO7A 4CF0A 3NHGA 1W7AA 5KPRA 4X64K 1QQCA 1CLQA 4FJJA 3LDNA 2E2QA 1VSFA 3O3HA 1BISA 3CHWA 3PSIA 3OJSA 3AAQA 2D4WA 3WNHA 4JD2A 4AHSA 1U4BA 4OX9K 4KB0A 4B3OA 3RRGA 2IAJA 3TSQA 4OO1J 4KV8A 4JKFA 5KPTA 5F0XA 3LANA 3J80O 2VWJA 4OJRA 4CGJA 4CZMA 3SUPA 3BUZB 4M41A 3RMCA 3CIPA 5AQKA 3VQ5A 1YJNN 1IH7A 1A5XA 3KKSA 3TR8A 3UKRB 1BQMA 4W5RA 3BGRA 1RTHA 4KTZA 3AVJA 1HNIA 3HPOA 3VQ7A 4BDPA 3K58A 3GG4A 4OGEA 4DR5K 1WSGA 3MDQA 2ZGYA 3CERA 2QXFA 4AHVA 1RT7A 4GY2B 4IEIA 4GKKK 2NLXA 3LDQA 1L3TA 2WUSA 3EO3A 3E1YA 1RT1A 4JEPA 4M3YA 2XHBA 3HZ6A 4EAHD 4G1QA 5BN9A 2VG6A 2GELA 3TTCA 4JI4K 2P9UB 1XQSC 4C8MA 2D0BA 4RCHA 2BDPA 1T8EA 4CI6A 3WXMB 3ZSYA 1FJGK 2IGIA 2E6LA 2PYLA 4DTJA 4K8ZA 4FWMA 1K6YA 1TK5A 2QWMA 3ZX0A 1T44A 2V7ZA 4AHUA 5HRNA 3WEEA 4GVMA 4DFJA 4Y1DA 3CCRN 3V9ZA 2W6LA 5HL7L 4DS5A 2P9NA 3MWPA 2IVOA 5HRRA 3TABA 4O4GA 1DTQA 1NKEA 4FWOA 3KTQA 5F2RA 3ZETB 4QS9A 4CVNE 3QICA 4GMJB 4IZ9A 1NBWA 2E6MA 4CJKA 1W97L 4IWVA 3DLRA 3KJVA 1VQ8N 4JI0K 2PFUA 2PBDA 3AV9A 4CJWA 4IFEA 1RTDA 3VESA 3CPWM 2G8KA 4CJFA 3RSEB 4NCBA 3FFIA 1SKSA 3C6TA 3GL1A 4JK8A 3AO2A 4YOYA 3V6DA 4I9LA 5J2QA 4HCBA 1S9EA 3QNNA 2ZGZA 3JXUA 4JKGA 3SK3A 4F9OA 1BI4A 2A42A 3DMJA 3G0ZA 4FM2A 3O08A 1VAZA 2GUPA 4A57A 4IJAA 3I56N 1RT2A 3IKMA 4AILC 1Q9YA 4N47A 4MO5A 1O13A 2ZJQL 4OLBA 2V52B 1R59O 2F7TA 1X3MA 3MCAB 4I6MA 5I3UA 1QSLA 2DY4A 1QSYA 4B1WB 3VEYA 1JL2A 3ZSZA 2WOMA 3V9SA 3GDQA 3KWIA 3VGLA 3BY5A 4C8NA 1WAJA 1NGBA 3OW2M 3SUOA 1ASWA 3ZLJA 4LF9K 4KHWA 4DR1K 4IO9L 5M1KA 1E4FT 3AVBA 1NMNA 4OKJA 1RNHA 1T7PA 4PUOA 5KPZA 1UOCA 1E3MA 4JN4A 2FLOA 1Y97A 2P9LA 4MLEA 3VTIA 1JLGA 1VRTA 4ELVA 3CJ7A 3THWA 3HBTA 1WLJA 4FJIA 3KLEA 3NMUA 4JHDB 3RRHA 5I42A 4DQPA 4DG1A 2HVIA 2YCHA 3RR8A 3L3UA 3E9OA 3MCPA 3HL8A 1L5UA 1JLCA 4JV5K 3I8BA 1BA1A 4EHTA 1S1XA 1WSFA 4LF7K 3VENA 4BRGA 4PL8A 3CQXA 3E01A 4PKHA 4A5BA 4BE1A 3L2UA 1SL0A 3J7AP 1S9GA 3CCLN 2RKIA 4B8CA 2EHGA 5B8HA 3ASMA 4DQQA 3V9XA 4DU1A 4FLWA 2NRZA 4RW4A 2G8IA 3WNEA 4E1MA 4A5AA 5JS2A 3TU5A 2E8AA 1FK9A 2IOCA 3HJFA 2NRRA 4YNQA 4NYFA 3SPYA 1XC9A 1S6PA 1ASUA 2P9PB 4BY9C 4F2SA 5AZJB 2D0OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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