3LDNA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in apo form
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldnA04
3FZHA 4L3QA 3VENA 4FOEA 3AAQA 4FWLA 3HZ6A 2W41A 3HI0A 3R8EA 3FFKB 5AQSA 2NLXA 2Q1NA 5BRHA 5AQUA 3A5OC 4BGAA 2E8AA 3MN7A 4WQ4A 5AR0A 4M7YA 3C7NA 1HKGA 5BRDA 4BRKA 4FWNA 4YDUC 1LCUA 3IDHA 2ASOA 3FZMA 3CQXA 4MLEA 5AFUA 4H0TB 2ZGYA 5BPLA 3ATVA 1WOQA 1QQMA 2Q0RA 3UKUB 3ZETA 4JN4A 1SAZA 4BRDA 3IMXA 4BRPA 5F1XA 3DXMA 2QWQA 3EKUA 3WXIA 4B1XB 3U4LA 5AZIB 3H1QA 3M6GA 1DGKN 1C0FA 3WT0A 5TKYA 2A41A 2A5XA 2I7NA 4RWTA 1KXPA 2OANA 5AZIA 2IVNA 3SJHA 4XH4A 2V7ZA 3IUCA 4A62A 4B9QA 4BRIA 3QFPA 4A61A 2KHOA 1Y64A 3BF3A 3FZLA 2E2QA 3CHWA 4JNEA 4I6MB 4CZMA 4CZHA 5AQMA 5BRFA 1KAZA 2GUPA 3ZX0A 3A5NC 3H46O 3P4IA 5AZJA 2YHXA 4H5RA 4JD2B 1P8ZA 5AQLA 1NWKA 3A5LC 2YHWA 1S22A 3LL3A 4BR2A 3BEXA 3ID8A 5AQOA 1XQSC 2QWPA 2FF6A 1R59O 1BDGA 3DAWA 4XEIA 4BROA 4QS9A 1QZ5A 3BF1A 5KPTA 3I33A 4BC2A 2ITMA 3H3OB 2P9KB 4H0PA 4Z94A 5AQPA 5F2RA 1GLAG 3CJ1A 3AAPA 4MLHA 2HMPA 4CJ7A 4IJNA 5AQQA 2ZF5O 1JCEA 3M1FA 3FR0A 1TUUA 5LY3A 3O8MA 3A5MC 4MO5A 5BR9A 5ADXA 1BA1A 4PKIA 4O5FA 1T44A 3FE1A 5BREA 1S3XA 3U9ZA 3L4IA 3O5BA 2YHYA 4JHDB 4CZLA 4BRAA 4DCHA 1T6CA 3BP8A 4NO7A 2P9PB 1NGFA 1HJOA 2CH5A 5AZJB 2BTFA 3I8BA 2QWOA 5EOYA 2E88A 2ASMA 3HBTA 1NGGA 1E4FT 4M7XA 4RTFD 3ZETB 5LJVA 1YUWA 2FLOA 1BU6O 3VGMA 2E1YA 1OKJA 2D0OA 3VGKA 4BR7A 1Q18A 4FWSA 3H3NO 5E26A 5AQZA 1H1VA 3W0LA 3FGUA 5BN8A 5AQXA 4MO4A 1BO5O 2CGLA 2A6AA 3RSEA 2P9LA 4EIAA 4CZJA 1MDUB 4K42A 3GL1A 2QM1A 5AQHA 4FSVA 3QMLA 3EN9A 3R6MA 3CJ9A 1K8KA 3MN6A 4PL8A 2D0PA 1C0GA 1CZAN 3UKRB 2VYPA 2P9SA 4JD2A 4EHUA 1RFQA 3VGLA 3WQTA 3UKRA 5FPMA 3DWLA 4CD3A 3KVGA 2Q97A 3O1BA 3CETA 4BRFA 4IO8A 3SLCA 1NGDA 4CD1A 1BA0A 3GBTA 2I7PA 2GEMA 2YJEA 4H0VB 3WXLA 3EZWA 1U6ZA 5E84A 1NGHA 4EAHD 1MWKA 1TYQB 3MMVA 3D7EO 1V4SA 1ZC6A 5AQKA 4CZGA 5FPDA 1ATSA 3D2EA 2HF4A 4QS8A 3VEOA 1BUPA 1NGIA 5BN9A 2YCHA 3VESA 2P9LB 2HOEA 2FSNA 2A40A 3GOIA 3VEYA 1GLFO 2CH6A 3H45C 4E1JA 3H1VX 3QBXA 2V7YA 1GLJO 3CJBA 5BPNA 3MN9A 4BR9A 3ATUA 1YAGA 3U9DA 1E4GT 3H6EA 4K41A 4H0XB 4WYBA 2P9PA 4IJAA 2E1ZA 1DEJA 1V4TA 1J6ZA 1QQNA 1U2VB 2QWMA 2AA4A 4B1YB 3VETA 1IJJA 2H3GX 3VOVA 5JICA 4FWRA 1MWMA 2P9KA 3F9MA 4FWMA 5ELZA 2YJFA 4BRGA 1X3MA 4XH5A 4WQ5C 2E2NA 3CJAA 4B1ZA 3O08A 1NBWA 3A0IX 5AFUH 3LDLA 4CBXA 5FPNA 3VF6A 2WUSA 1SQKA 2F9TA 2P9UA 3LDPA 3RSEB 3JS6A 5LJWA 1ZXOA 4H5WA 2AP1A 1ATNA 5FPEA 1HKBA 1HX1A 2FXUA 5KQDA 4JHDA 4C23A 1K8KB 4CBUA 4B1UB 4H0OA 5JLFA 5KQ8A 1RDWX 5AQGA 4KBOA 3EO3A 1IG8A 4BQLA 5CE3A 4FOIA 4RCHA 1DKGD 2IVOA 1HKCA 3VF2A 1X9JA 3KHYA 2ZWHA 1GLDG 4A2AA 4BG9A 1Z6RA 1NM1A 3TPQA 4CI6A 2E20A 5I9EB 5AQIA 3L0QA 3WEEB 5EY4A 4H5VA 3AY9A 5KPZA 5AQFA 5EVZA 3WEEA 3D2EB 4ISFA 3SMPA 2P9UB 1MA9B 4FO0A 2DPNA 3FZKA 4BVOA 3O4WA 3U8XA 4FWOA 4A2BA 4FPAA 4YDUA 4ISGA 2GELA 3CJCA 4H03B 2A42A 2P9SB 3LDOA 5F0XA 2IIRA 2FSKA 4M63C 2YI1A 3FLCO 2PAVA 4K43A 2VWBA 2NRHA 1G99A 3ZX2A 3UE5A 3IFRA 1YVNA 1U2VA 1BWFO 4IXCA 3VEWA 4Y0WA 4GY2B 3OHRA 4WQ5A 1ATRA 1BOTO 3JXUA 2FF3B 3AARA 1HUXA 2NZTA 3MK6A 3MN5A 3WQUA 3DXKA 1NGEA 3ULEB 3WUHA 2A3ZA 3J8AA 4EFHA 1NLVA 4O8KA 1SZ2A 2HF3A 3ENOA 4BREA 4LC9B 1TYQA 2CGJA 3GG4A 4FPBA 3WXJA 5B8HA 2ZGZA 4F9OA 2ASPA 3DJCA 2IVPA 1BG3A 5AQRA 4H0YB 4PKHA 3C0BA 5AQYA 4BR4A 1KAXA 3SK3A 4CZFA 3C7NB 2E2PA 3VERA 1Z05A 2P9IA 2GWJA 3S41A 3QICA 3CQYA 1HPMA 5AQJA 4JAXA 2D4WA 3CJ7A 4BRNA 2J4RA 4CBWA 4DHYA 3LDQA 1XC3A 4BC4A 4GNIA 2BUPA 2QWLA 1WUAA 4CZKA 3MCPA 4K25A 4BRHA 4FL9A 3VEXA 2F9WA 3TU5A 2GWKA 5JMVA 4AM6A 1LOTB 3HM8A 3SMSA 1NGAA 4BC3A 4H5NA 1GLLO 3GE1A 4BG8A 4WQ4C 2E2OA 3R9PA 1D4XA 4XH1A 3LM2A 2Q36A 4BR5A 1X3NA 4BC5A 3HSCA 3O6WA 3ZEUA 4NB4A 1TUYA 3MDQA 3O1WA 3O80A 3L6QA 1GLEG 3ZX3A 1ZBSA 4B1VA 1QQOA 3VPZA 3WXKA 1YXQA 3M3ZA 5EX5A 2FSJA 1T6DA 3HTVA 4BGBA 3QB0A 5AQNA 2VCPA 2UYTA 3CERA 3LM9A 4AM7A 3KZBA 4PL7A 4PKGA 1XUPO 4BVPA 5AQWA 1NGCA 3CIPA 2D1KA 3W3DA 4BRMA 1JCGA 3DXKB 3ENHA 3ULEA 3DXMB 4IZ9A 2P9NA 1GLCG 1NGBA 4DB3A 4BRQA 1JCFA 4H5TA 1QZ6A 3GDQA 3FZFA 3CI5A 5BPMA 3VEZA 2QWRA 2QWNA 5EXWA 2EWSA 4BR0A 3LDNA 2GTDA 4BRLA 2Q2RA 1NMDA 4HWIA 5ADXH 4FWKA 3ZEUB 4J8FA 4FWPA 1ESVA 1GLBG 3EL2A 4CZIA 2P9IB 4I6MA 5JLHA 4QS7A 3A8YA 4DQ8A 3BUZB 2QXLA 2V51B 1QHAA 2W40A 2V52B 1NGJA 3UKUA 5AQTA 3EKSA 3UB5A 1KAYA 5KPRA 3QFUA 3G25A 4HTLA 4BRCA 3QBWA 1RGIA 2CGKA 4ISEA 4BQZA 2Q0UA 2PBDA 2Q31A 4FWQA 3D2FA 3QDKA 4IWVA 1EQYA 4EHTA 4B1WB 3VEVA 3B8AX 3VF4A 5AQVA 1HLUA 2QW9A 3D2FB 2P9NB 4CZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VENA 4FOEA 4DTNA 4IOAL 4HCBA 4C1NI 3FFKB 5AQSA 1T03A 1RILA 5BRHA 1YI2N 4CHNA 3A5OC 4LSNA 3C65A 4WQ4A 4I7FA 4K8XA 3K9KA 2EHGA 3F5TA 1HKGA 4B3MK 5BRDA 4A59A 4X62K 1XI1A 1J5OA 3NVKA 1C56A 4XJXA 1LCUA 3T69A 2ASOA 3CCRN 3FZMA 3NH1A 5AFUA 4H0TB 1J9AA 1CZBA 2E3FA 1C0MA 1QQMA 4Y1DA 2HHSA 2GX9A 1DTQA 4JN4A 1Z26A 1U04A 3O4NA 1SAZA 4CK1A 3IMXA 2B3CA 2LR3A 2UXCK 1PE4A 4CHPA 3U4LA 5CYMA 3T19A 3WT0A 4LF7K 3QEWA 1RT4A 1TV6A 2A5XA 5AZIA 3VQ5A 3SJHA 1LWEA 1WAFA 1VAZA 2YHAA 3M5RA 3CHWA 1VNBA 3QNNA 4CZHA 4DF8A 4FLUA 3NGIA 1GPTA 5DM6L 1WWNA 3KK7A 4DU3A 1P8ZA 1NWKA 1U49A 3KK1A 4WE1A 1QVFM 4FLZA 4W5NA 5AQOA 1XQSC 2QWPA 4CJUA 1R59O 3QEIA 1TAUA 3O3GA 3V9SA 4XEIA 3MCAB 4QS9A 4DTXA 1NOYA 3I33A 1YTUA 1LAVA 2MN5A 3AVMA 2ZJRL 3H3OB 1SN4A 3ID6A 1OH6A 1NJXA 4CE9A 2G8FA 4JI2K 5F2RA 4MLHA 4KO0A 5M1NA 4Z4GA 2JWKA 3S3MA 3KP0A 2HBJA 5AQQA 4A57A 1VSHA 4LD0A 4IFEA 2F8TA 3SAHA 3FR0A 1XRSB 3QERA 1BA1A 2LSNA 2YHYA 4CZLA 3BP8A 3LPUA 2KSKA 4M3ZA 1JKHA 2BTFA 2QWOA 1EP4A 4CW7B 3HBTA 4DG1A 1E4FT 3SUNA 4FLXA 3NAEA 3MWPA 3VGMA 3IS9A 2YC1C 4ICLA 4BR7A 2BH1A 4FWSA 5C2FA 1D9FA 4XIUA 3V6DA 1S9GA 1NNEA 1VSJA 1QTMA 5AQZA 4DTPA 1H1VA 1FKPA 3W0LA 3SAFA 3M8SA 1NK9A 3M8RA 1J5EK 4MO4A 3TTDA 1JL2A 2Z1IA 3Q7BA 5I42A 1NK5A 3RSEA 4MDBA 4GV3A 4EIAA 3PIOL 5AQHA 4FSVA 1IG9A 4KKOA 1ZVEA 4PL8A 2X78A 2D0BA 1C0GA 2HHQA 4GVEA 4MQ3A 1CZAN 3UKRB 1I6GA 1WSEA 4EHUA 4HHFA 3LP1A 2HW3A 3WQTA 4KREA 1SS6A 4IEIA 1ZU3A 3CETA 3DLLL 2WBNA 2G8VA 4FZXC 2SN3A 4DV2K 1KVAA 1WT7A 4CJEA 3I8DA 2YJEA 4E19A 4WFAL 2FBVA 5E84A 3P83D 4LF8K 5FPDA 3D2EA 2HF4A 2YCHA 3DRRA 1Q81O 1MR4A 1ZYVA 2P9LB 1JLBA 2CH6A 3H45C 3NMUA 3N4QA 3H1VX 3MN9A 3CJBA 3KLGA 4M3TA 1NJYA 4K41A 4KHNA 2JDQD 4OPJA 1ITGA 2P9PA 4FJKA 3N4PA 2NRVA 4E0DA 1QQNA 2UUCK 2AA4A 4FLYA 1TL3A 4PQUA 2DFHA 5JICA 2O8CA 1HJRA 1XHXA 2P9KA 5D3GA 5ELZA 3KKRA 3P31A 5TKWA 4BRGA 3JSMA 4XH5A 1VQLN 5HBMA 4WQ5C 1O13A 2BE2A 5DK5A 5FLXO 2UXDK 5CZ2A 1NBWA 3LDLA 4FVUA 2QA4N 4YOTA 3TAQA 4CJTA 3LDPA 1T7AA 1ZXOA 4EP5A 4H5WA 1BIZA 2AP1A 5C12A 3OYIA 2HHTA 3VQAA 3THYA 2A1RA 4C23A 1BCMA 5KRSA 5GAGP 4CBUA 1C1AA 3AGRA 4Z4IA 5JLFA 5KQ8A 4HTUA 4KBOA 2PYLA 2KBKA 5CE3A 1HNWK 4FOIA 4FVMA 4Z4FA 4CEOA 3DOKA 1QHTA 3DM2A 2KFNA 3VF2A 4JV5K 3KHYA 4DLGA 3C6UA 4A2AA 2O4GA 1Z6RA 3F2KA 4CESA 3K58A 1NM1A 4LF9K 2E4LA 2E20A 4FJGA 1BI4A 5AQIA 3MAQA 4OLAA 3SMPA 1ASVA 4FO0A 4EZ6A 1RBRA 3SYZA 4B9VA 3CQ8A 4A2BA 4ISGA 3PIPL 4M3YA 2FSKA 3FLCO 3DLBA 1G99A 3UE5A 4YORA 4OPAA 5HRSA 2OZSA 1UGLA 3HPHA 4GY2B 3OHRA 4WQ5A 1ATRA 3DLHA 3KC6A 1HUXA 2ZJPL 3EEQA 3DXKA 3ULEB 5KRTA 1NK0A 1KQSM 1TYQA 1T1TA 4FPBA 4CHYA 4PWDA 1A5VA 3WXJA 1OMYA 5B8HA 3E9LA 4JKHA 3THWA 4ID5A 2IVPA 4F4KA 4CJPA 1NG9A 4HUFA 3KOZA 5AQYA 4CJ5A 3QESA 4BR4A 3SK3A 3OYGA 1MYNA 3OBYA 4NYNA 5GIOA 2E2PA 3VERA 2KKZA 3V9WA 2I5JA 4N41A 3TWHA 3CQYA 1S9EA 1HPMA 1VSEA 2D4WA 3WNEA 2Y1IA 4CEBA 4CFDA 1XC3A 1HMVA 4GNIA 1PTXA 2BUPA 1NOZA 4E1NA 5HP1A 1KTQA 1KC8O 2E5LK 3MCPA 3LWLA 5FRMA 3R3LA 1JZBA 1A5WA 3P38A 1T7EA 2F9WA 4DUYK 4DTRA 4AHCA 1NGAA 5C42A 2FBXA 4C8KA 4WQ4C 1D4XA 3IKMA 3KOWA 3O9RA 3KLEA 1VQPN 1RTJA 3O1WA 1UA1A 1GLEG 3ZX3A 3EZ5A 4AHUA 1ZBHA 1HNIA 1RT3A 1QQOA 4JI4K 3VPZA 2G8IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VEN A;  4FOE A;  4DTN A;  4IOA L;  4HCB A;  4C1N I;  3FFK B;  5AQS A;  1T03 A;  1RIL A;  5BRH A;  1YI2 N;  4CHN A;  3A5O C;  4LSN A;  3C65 A;  4WQ4 A;  4I7F A;  4K8X A;  3K9K A;  2EHG A;  3F5T A;  1HKG A;  4B3M K;  5BRD A;  4A59 A;  4X62 K;  1XI1 A;  1J5O A;  3NVK A;  1C56 A;  4XJX A;  1LCU A;  3T69 A;  2ASO A;  3CCR N;  3FZM A;  3NH1 A;  5AFU A;  4H0T B;  1J9A A;  1CZB A;  2E3F A;  1C0M A;  1QQM A;  4Y1D A;  2HHS A;  2GX9 A;  1DTQ A;  4JN4 A;  1Z26 A;  1U04 A;  3O4N A;  1SAZ A;  4CK1 A;  3IMX A;  2B3C A;  2LR3 A;  2UXC K;  1PE4 A;  4CHP A;  3U4L A;  5CYM A;  3T19 A;  3WT0 A;  4LF7 K;  3QEW A;  1RT4 A;  1TV6 A;  2A5X A;  5AZI A;  3VQ5 A;  3SJH A;  1LWE A;  1WAF A;  1VAZ A;  2YHA A;  3M5R A;  3CHW A;  1VNB A;  3QNN A;  4CZH A;  4DF8 A;  4FLU A;  3NGI A;  1GPT A;  5DM6 L;  1WWN A;  3KK7 A;  4DU3 A;  1P8Z A;  1NWK A;  1U49 A;  3KK1 A;  4WE1 A;  1QVF M;  4FLZ A;  4W5N A;  5AQO A;  1XQS C;  2QWP A;  4CJU A;  1R59 O;  3QEI A;  1TAU A;  3O3G A;  3V9S A;  4XEI A;  3MCA B;  4QS9 A;  4DTX A;  1NOY A; 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