4MLHA

Human glucokinase in complex with a novel amino thiazole allosteric activator
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 163
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mlhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mlhA01
3H3OB 4JAXA 4BQLA 5BPNA 3EL2A 3BF1A 3GE1A 5AZIA 1Z05A 3ATVA 3D7EO 3CQYA 2D1KA 1D4XA 2I7PA 2AA4A 1IJJA 3FE1A 4EHTA 4BGAA 1GLLO 4BVPA 3IUCA 5ADXH 3U9ZA 2ZGZA 4A62A 2A6AA 3SK3A 1T6DA 3ZEUA 4YDUC 4M7XA 3VERA 3CJ9A 5AQSA 4BRQA 2F9TA 3CJ1A 4BR5A 3ZETB 3IMXA 4Y0WA 2P9LA 3MN7A 4BRAA 2E20A 1NGHA 3WUHA 1ATSA 2QM1A 4I6MB 1P8ZA 5EXWA 4CZHA 4CBWA 3IDHA 1S22A 1IG8A 4BRCA 1ATRA 2P9UA 1KXPA 3CQXA 5AQFA 4MLEA 1KAZA 1T6CA 1BDGA 3SLCA 1NLVA 3JXUA 5AQLA 3C0BA 4IWVA 3U4LA 1ESVA 2E2NA 4FO0A 4CZIA 3H3NO 2Q0UA 3VF6A 4CZMA 5AZJA 3FGUA 4FL9A 1MDUB 1BUPA 5AQWA 5FPNA 4A2BA 3D2FA 5FPMA 4BRPA 3QFUA 4IO8A 2V52B 3LDNA 1GLJO 1XUPO 5E84A 5AQIA 2W41A 5AQQA 4JN4A 1ZXOA 1SAZA 2P9PB 2YJEA 4B1WB 2CH6A 2CGJA 1K8KB 3RSEB 5FPDA 3DXKA 4O5FA 4BRLA 4BRGA 4BQZA 2PAVA 1BWFO 4H0VB 5KPTA 4AM7A 2P9SB 2VCPA 1QHAA 3DAWA 3DXMB 4A61A 5KPRA 2P9IB 3CJAA 2QWOA 3MCPA 4WQ4A 1HKGA 4BRFA 1V4TA 1V4SA 1HLUA 4L3QA 2KHOA 2QW9A 4H0OA 2YCHA 3VOVA 3GDQA 2F9WA 5AQOA 1XC3A 2E2PA 3WQTA 5BPLA 1RFQA 4BREA 1LCUA 3CIPA 3LDLA 1NGDA 5AQPA 3MN5A 3D2EA 2HMPA 2PBDA 1Z6RA 1EQYA 1U2VB 3UKRB 3I33A 3UB5A 2P9KB 1ZBSA 3CHWA 5BN8A 3BF3A 3CETA 1BA1A 4FOIA 5AQVA 4FSVA 2GTDA 4CZEA 4K25A 2ZWHA 3VEXA 1TYQA 1HKCA 2IVPA 2OANA 2Q31A 4B1XB 5AQHA 1YXQA 3HSCA 3WXKA 4FWQA 2FF3B 2A5XA 2CH5A 2QWLA 3W3DA 2Q1NA 5AQTA 1XQSC 3C7NB 4FWMA 1LOTB 3O80A 4BC2A 3AARA 4H0XB 4JHDB 5AQXA 4H5VA 1QQNA 3FZMA 1BOTO 1R59O 1QQOA 3FFKB 3QB0A 2V7ZA 2YHXA 3UKUB 4BR2A 1QZ5A 4BR4A 3W0LA 3WEEB 3ZX2A 1YVNA 2FSNA 5AQJA 3ID8A 3A5NC 3CJCA 3QMLA 3ENOA 2ZF5O 2QWRA 3FZFA 4WQ5A 1BO5O 3HM8A 5AQNA 3UE5A 2E1YA 4FWOA 4JD2B 1NGAA 4XEIA 1BU6O 4I6MA 1DKGD 2YHWA 1SQKA 4J8FA 4MLHA 3ZX3A 4C23A 4AM6A 3VGLA 4MO4A 4ISGA 4GY2B 3KVGA 5F1XA 5ELZA 3HZ6A 1TUYA 4MO5A 1YAGA 4B1VA 4BROA 2QWPA 4H5WA 2D4WA 4FWLA 1G99A 2BTFA 2VWBA 4DQ8A 3J8AA 3ZEUB 4A2AA 4BG9A 2CGLA 3O5BA 3AAQA 3VEWA 3M1FA 2ASPA 1HJOA 4WQ5C 4HWIA 3U9DA 2P9LB 4QS8A 3MN9A 3VENA 1DEJA 2E8AA 2W40A 1U6ZA 3VF4A 5BRHA 2P9UB 2WUSA 4PKIA 1GLEG 2ZGYA 3WQUA 3EZWA 3TU5A 1K8KA 3VEYA 5AFUA 5E26A 4B1UB 3VF2A 4FPAA 4XH5A 1KAXA 3FZHA 2ITMA 3VGKA 4BR7A 2P9SA 3LM2A 5EX5A 3DXMA 3G25A 2P9NA 2QWQA 5AZJB 4E1JA 1NM1A 1NGFA 3D2FB 3CI5A 3U8XA 1HPMA 1RGIA 4EIAA 1NBWA 3A0IX 3ULEA 4B9QA 2IIRA 1NGBA 3O4WA 4DCHA 4IZ9A 1JCFA 4H5NA 4O8KA 4DB3A 4KBOA 5EOYA 1WOQA 4BC3A 2FSKA 3MDQA 1J6ZA 3P4IA 3M6GA 3GG4A 3O08A 4FPBA 3WT0A 5JLFA 3UKRA 4GNIA 3EO3A 3LM9A 4RWTA 2A3ZA 2YI1A 4CZKA 5BPMA 4CZGA 1Q18A 1GLFO 1RDWX 4EHUA 3H46O 4WQ4C 3KZBA 4ISEA 3EN9A 5EVZA 4H0PA 2BUPA 2GWJA 4CJ7A 4EAHD 5BREA 4CZLA 4PL7A 2V51B 1HKBA 2A40A 4CI6A 3DWLA 4B1ZA 3D2EB 3QICA 4FWPA 4JHDA 4BR0A 1HUXA 3L0QA 5FPEA 3BP8A 1BA0A 1Y64A 3UKUA 2GWKA 3HBTA 2Q0RA 4M7YA 3WEEA 3HTVA 2FSJA 2E88A 5CE3A 4BG8A 3VETA 4FWSA 2HF3A 1TYQB 4CBXA 4CD1A 2NZTA 1JCEA 3CERA 3KHYA 3FR0A 4M63C 4RCHA 4BRKA 3FLCO 4CZFA 5BRFA 4K43A 4CZJA 1MWMA 1JCGA 5EY4A 2I7NA 4JD2A 5AQGA 3ZETA 3H6EA 2ASOA 3EKSA 2YJFA 1ZC6A 2V7YA 5LJVA 4H5TA 5B8HA 2ASMA 5AQMA 3O1BA 2E1ZA 3LDPA 3AAPA 3A8YA 3B8AX 5AZIB 2DPNA 3QBWA 5TKYA 1X3MA 3FZKA 3LDQA 2YHYA 3VEVA 4F9OA 2E2OA 4H0YB 3MK6A 4QS7A 3F9MA 3H45C 3R8EA 4PL8A 4QS9A 2HF4A 5AFUH 3H1VX 2GELA 3EKUA 3O1WA 4IJNA 2Q2RA 4HTLA 3WXLA 2NLXA 2FF6A 3VGMA 3VEOA 3R6MA 4H03B 2HOEA 2VYPA 3O8MA 4BRHA 3S41A 5ADXA 2IVOA 3GBTA 3VESA 4BRDA 2GEMA 3GOIA 4IJAA 1WUAA 2E2QA 2P9PA 1GLCG 4CD3A 4K41A 4Z94A 3QDKA 5F0XA 5I9EB 5JICA 2EWSA 4NB4A 1BG3A 3WXIA 3RSEA 1QQMA 3O6WA 1HX1A 3MMVA 5AQUA 4K42A 4FWNA 3ZX0A 5KPZA 1NMDA 1GLDG 4PKGA 3HI0A 3BUZB 2D0OA 2P9IA 1YUWA 5KQDA 3M3ZA 1X3NA 4H5RA 1NGEA 1TUUA 5AQZA 3R9PA 4ISFA 3ATUA 2QWNA 5KQ8A 1GLBG 4XH4A 1ATNA 1E4FT 3OHRA 4BC5A 5BN9A 4XH1A 4BRMA 3A5OC 4EFHA 1QZ6A 3A5LC 2Q36A 3JS6A 5JMVA 4BGBA 2J4RA 2UYTA 4FOEA 4H0TB 1NGJA 4IXCA 3DXKB 1U2VA 2FLOA 5AQRA 3WXJA 3BEXA 1X9JA 2P9NB 2P9KA 3FZLA 3H1QA 4FWKA 1C0GA 1E4GT 2AP1A 5AQKA 1OKJA 3L4IA 4DHYA 2CGKA 3A5MC 4WYBA 5LY3A 5LJWA 3ENHA 2A42A 3AY9A 5BRDA 3VPZA 1NGGA 1NWKA 3GL1A 3SMPA 3ULEB 1KAYA 1T44A 5AQYA 5F2RA 1NGCA 1MA9B 4BC4A 3C7NA 1CZAN 4NO7A 4LC9B 3SJHA 4RTFD 3IFRA 5JLHA 4BRIA 2A41A 4JNEA 4BRNA 2FXUA 2H3GX 3L6QA 3MN6A 2Q97A 2GUPA 3CJ7A 2QXLA 1NGIA 3LDOA 3CJBA 1MWKA 3DJCA 3QBXA 4YDUA 4PKHA 4B1YB 1SZ2A 1GLAG 2QWMA 3SMSA 4CBUA 2NRHA 4FWRA 3TPQA 2IVNA 3LL3A 1DGKN 1S3XA 4BR9A 1C0FA 3VEZA 5BR9A 3I8BA 3QFPA 5AR0A 4BVOA 2D0PA 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZD1A 3H3OB 2ETJA 4O55A 4O5BA 4BQLA 1EXQA 5BPNA 5MLCQ 3QEXA 1SKWA 1QS4A 1IBLK 3BF1A 4CGJA 3GE1A 1JJ2M 3KWGA 3D7EO 1RTJA 4EHTA 4BGAA 4CFAA 4BACA 4LY7A 2NRZA 4JKGB 3U9ZA 5C10A 4DUYK 3SK3A 2B5JA 4E3SA 4WFNL 3SV3A 5AQSA 4QCLA 4J2BA 3CJ1A 1Q7YO 5K14A 5KTQA 4IFEA 3THYA 4F3OA 4Y0WA 5J1EA 4KHSA 3EZ5A 4I6MB 4CZHA 4CHQA 4DUZK 1IG8A 3RR8A 2FBVA 1KXPA 1E3MA 3K5MA 1T6CA 3WNEA 4B9MA 5C2DA 5J2NA 3C0BA 3EY1A 4FO0A 1DT9A 3PSFA 4OGEA 1TV6A 3VQBA 4CEEA 3VF6A 3FGUA 1BUPA 1N33K 5AQWA 3NMUA 2O8DB 4A2BA 1HPZA 4QOZB 2VG5A 4NYFA 4CK1A 3NGIA 3F5TA 2P51A 3LDNA 5CR4A 1NOYA 3C6UA 1J53A 2G8VA 4DFKA 1QSYA 4YY3K 2Z1JA 3P83D 4W5QA 4OGCA 4Y1DA 3QIOA 5DM6L 3RSEB 4CF2A 4AM7A 1QVGM 1C0TA 4B9TA 3AO4A 2UXCK 3NGYA 1HLUA 3OYNA 2QW9A 4JV5K 1W97L 3C65A 3VOVA 2F9WA 2ZJRL 3K58A 1FXXA 4LF6K 4CCHA 3QLHA 4JI3K 4N41A 4DQIA 3CIPA 3K2PA 3LDLA 2OYQA 4KRFA 1IH7A 2YNGA 2PBDA 1KRPA 3SAFA 3NHGA 4C8KA 3I33A 3E9OA 1DLOA 2NRXA 2P9KB 1TKDA 4FSVA 4K25A 4LH4A 5C24A 1HKCA 4YOUA 4FK2A 1C0UA 3HSCA 2CH5A 2Q1NA 5AQTA 4FWMA 3DM2A 4M45A 3I0RA 4BC2A 3CCMN 2YHAA 4H0XB 4JHDB 4H5VA 3K9KA 1R59O 5LMNK 3FFKB 3UKUB 4DS4A 4DWIA 4BR4A 3W0LA 3ZX2A 1YVNA 4RW4A 4DV7K 4C1NI 3ID8A 5HROA 3F73A 4DR3K 2QKKA 1B9DA 4NCAA 1SUQA 3ENOA 3SAGA 3NE6A 3HJFA 3KK2A 4E1MA 3FZFA 4OVLA 3J80O 4CJEA 1W2BM 3HM8A 3UE5A 1KVBA 4JD2B 4XEIA 4FJJA 3NDKA 4N56A 4C8MA 3TANA 4GKKK 4MLHA 4TSXA 4AM6A 4MO4A 4GY2B 3KVGA 3L2QA 4A57A 5ELZA 5M1NA 3IG1A 3HZ6A 1WLJA 4CE9A 2O8EA 4HHTA 4B1VA 4WE1A 1J5OA 2VGMA 4FLUA 2D4WA 3SV4A 3O5BA 3ZSVA 2HNDA 3QETA 4DR5K 3DOKA 2ASPA 3PLAA 3LP3A 4WQ5C 5E41A 3MN9A 2GX9A 4KHUA 3SQ2A 3PX4A 3HK2A 1J9AA 3LZIA 4Q5VA 2WUSA 1JLFA 1JLAA 1XC9A 4BDZA 1IKYA 2HHVA 3WNHA 4IDHA 1J5EK 2NRTA 1N8RO 2ITGA 5E26A 3SCXA 2E6LA 1OH6A 3VF2A 4XH5A 1KAXA 1M1KO 4BR7A 2P9SA 3CCSN 5AZJB 2QWQA 4YOTA 4YORA 4Z4EA 3CI5A 3KWIA 3SZ2A 1HPMA 1RGIA 4OJRA 2IIRA 2O8BA 4DCHA 4DB3A 3L2RA 2G8FA 4Q0BA 3MDQA 1GOCA 3THXA 3M6GA 2QI2A 5DK5A 4CIFA 4IEEA 4LF9K 3LWMA 4RWTA 2HBJA 2UXBK 2YI1A 1GOAA 5BPMA 4DFPA 2WC9A 1RDWX 4EHUA 3H46O 4RW9A 5T7BA 3K5LA 4B3SK 3EN9A 5EVZA 3HXMA 4ILJA 2BUPA 4CJ7A 4EAHD 4DTSA 4CZLA 2P1JA 1K73O 1FK9A 4CI6A 3RVCA 3MEGA 4FWPA 1EP4A 1YHQN 3L0QA 5KRSA 3K0SA 4FJ5A 1BA0A 1Y64A 3AO1A 4IEIA 4FM1A 2YNFA 2QK9A 3RMCA 5FLXO 5CE3A 4BG8A 1NK4A 4CD1A 3LP0A 3RR7A 1JCEA 3CERA 4YOYA 4JKGA 1NKBA 2OPRA 3VQAA 4CZFA 3MXMA 1MWMA 4RW6A 5EY4A 4XIUA 1UOCA 4KH5A 4DSFA 2UUAK 1ZC6A 2I5JA 1WAFA 3M8SA 4KHPK 4B8AB 3QEPA 4KHYA 4BY9C 1YIJN 4ELUA 3AVHA 2FBTA 3LAKA 4LSLA 2VQFK 4F4KA 4LF4K 2YHYA 2E2OA 3U6FA 3MK6A 3F9MA 2Y1IA 4CJPA 3VQPA 4PL8A 2Z1IA 2GELA 2WTUA 5FDLA 3ZSQA 1VSJA 3O1WA 1RTHA 4HTLA 4DQRA 3JSMA 3THYB 2NLXA 4E1NA 3VEOA 1NNEA 4BRDA 2GEMA 4KTZA 4M41A 4GV3A 2GUIA 2EWSA 4CFDA 1JKHA 4NB4A 3WXIA 1N36K 3RSEA 2HHHK 1QQMA 3O6WA 3TAQA 4JLHA 1HNWK 3HT3A 4FWNA 3ZX0A 4JK8A 3BUZB 4GVMA 4YFUA 4H5RA 4W5NA 1TUUA 3HPGA 5A2QO 4CK3A 3E66A 3EE8A 1UWBA 3OYMA 3KD5E 2XY5A 4XH1A 3A5OC 1J54A 4B9UA 5JMVA 2UYTA 3T1HK 4GV9A 1S6QA 2FLOA 3QNNA 1X9JA 4FWKA 2P9KA 3UIQA 3DRSA 4JI6K 2ZJPL 1E4GT 3BZKA 4CFCA 5LJWA 4CK2A 4FJGA 1O13A 2F8TA 1NGGA 1NWKA 3TABA 2Z1GA 1NGCA 1GOBA 4PA1A 1CZAN 1CLQA 4FLVA 2B4JA 4M3UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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