4MLHA

Human glucokinase in complex with a novel amino thiazole allosteric activator
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 163
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mlhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mlhA01
3MDQA 5AQRA 1T44A 5BPNA 4IWVA 4H0XB 5AQZA 2P9SB 3CETA 1JCGA 4AM6A 5KPZA 3QBXA 3LL3A 2E1YA 4H5RA 4NB4A 4BC4A 1U2VA 2GWJA 3OHRA 4XH4A 5AQSA 4C23A 5AQXA 3VEXA 4FWPA 4BC5A 1ZC6A 3HI0A 3ULEA 2ZGZA 3LM9A 3CJBA 4FWRA 4RTFD 1NGBA 1T6DA 2A42A 2P9IB 4XH1A 1KXPA 3SLCA 3U9DA 3AAPA 3U9ZA 1KAZA 3R8EA 2QWMA 3EL2A 4BR4A 2Q1NA 3LDLA 1YVNA 1U6ZA 5AQIA 5JLFA 2I7NA 4PKGA 5AQOA 4CZEA 4CZKA 1G99A 2YJFA 2VCPA 3C7NB 5ADXH 3A0IX 1KAYA 4A61A 4BR9A 1Y64A 1P8ZA 2BTFA 2FSJA 2V7ZA 3EZWA 4IO8A 3CERA 1ATRA 1E4FT 3HM8A 5I9EB 1HPMA 1HX1A 4IJNA 4CBXA 3SK3A 3WXIA 4H0VB 3HBTA 3U4LA 4WQ5C 4BG9A 2HF3A 2OANA 4BC2A 3ZX3A 5AQMA 4CZJA 5AQVA 4XH5A 2V51B 4FWLA 3WQTA 1Z6RA 5E84A 3VF6A 5AQKA 2P9LA 1YXQA 1NGIA 3MK6A 5EX5A 2P9KB 2NZTA 3A5OC 4O8KA 4CBUA 2E2PA 4BGAA 4FL9A 4K43A 3O1WA 3QFUA 1TYQB 4WQ5A 2H3GX 5AZIA 3MN6A 3WXKA 2QXLA 4QS7A 1V4SA 3QMLA 2E2OA 2GTDA 3VPZA 1HUXA 3VOVA 4CZMA 5FPNA 3EKUA 1LOTB 1SQKA 5TKYA 2E8AA 3GL1A 3A5LC 1T6CA 4A2BA 2P9NA 4BGBA 1ATSA 3H1VX 4H5VA 4GNIA 3LDPA 4BQLA 2W41A 4FWSA 4FWQA 3EN9A 4FOIA 4ISFA 2P9UB 2E20A 1QQMA 1OKJA 2PAVA 1HJOA 1QQOA 3AARA 4EHTA 4PL8A 2GELA 5CE3A 3D2EA 2QWPA 4CZLA 1TUYA 3O4WA 4BRPA 3AAQA 3FZHA 4A62A 2W40A 4BRLA 1HKCA 2FLOA 4BG8A 4BVPA 1ZXOA 3QICA 2A41A 4BROA 2QW9A 1ZBSA 5AZJB 3JXUA 5BN8A 3ENHA 4HWIA 3GE1A 3UKUA 1SAZA 5AQPA 2FSKA 1XC3A 4CZHA 3HTVA 2E2NA 1BU6O 1MWKA 3MN9A 3ENOA 3IUCA 1RGIA 5BRFA 1XUPO 2VWBA 2I7PA 3BF3A 3B8AX 3LDQA 3WEEA 2Q97A 1YUWA 2IVPA 1NGGA 2GEMA 4K41A 4BR0A 4CI6A 3CIPA 2FF6A 3HSCA 3D2FB 4CD1A 4H0TB 3TPQA 3VGLA 3VEOA 4IJAA 2ASOA 5KQ8A 3VF2A 1C0GA 2GUPA 3ULEB 2E88A 4JAXA 4ISEA 3ID8A 3VGMA 1WOQA 5AQJA 1GLDG 3O6WA 2P9SA 4O5FA 3WT0A 1IJJA 5JICA 4I6MB 3G25A 3S41A 2Q0RA 3CJAA 3H1QA 4BRAA 3M6GA 3CQXA 1BOTO 5EXWA 3UKRB 2ITMA 2CGLA 4WQ4C 3O1BA 3GBTA 5F0XA 3DAWA 1NMDA 2A40A 3FLCO 2HOEA 3FR0A 4H5WA 1X9JA 2HMPA 3BUZB 3IFRA 3IMXA 5ADXA 5AQQA 5JLHA 1IG8A 4A2AA 3CI5A 3O8MA 2Q0UA 4WQ4A 3D7EO 2P9PB 2ZF5O 1NBWA 3O08A 4JD2B 4CBWA 5AQLA 4AM7A 2F9TA 1Q18A 5F1XA 1RDWX 3FZKA 1K8KB 3MMVA 2A3ZA 3VEWA 2A5XA 1Z05A 4JN4A 4FOEA 2PBDA 1EQYA 4EAHD 4BRKA 3SJHA 3ZETA 5AQNA 5AQTA 4CZIA 3HZ6A 4M7YA 2E1ZA 3VGKA 3CJCA 1NM1A 3CQYA 2UYTA 4RCHA 2NLXA 2ZGYA 2YHXA 4NO7A 1DGKN 2YI1A 4MLEA 2QM1A 3BF1A 5BR9A 1BG3A 3QB0A 4BREA 4K25A 5BN9A 3JS6A 5AQYA 1QZ5A 3FZMA 2QWOA 1TYQA 5AFUH 4E1JA 4B1WB 3A5MC 3H46O 4B1YB 5AQUA 4B1ZA 2P9NB 4CJ7A 3I33A 3FZFA 4FSVA 3VEZA 3WUHA 5AFUA 3DWLA 1GLAG 3J8AA 4BRHA 4JHDA 3LM2A 4DQ8A 5KPRA 2IIRA 2EWSA 1NGEA 5AQFA 2FF3B 4LC9B 2CH6A 1BO5O 2Q31A 3DXMB 1E4GT 1JCFA 3LDOA 4M63C 3VENA 2P9UA 3W3DA 4EFHA 2IVNA 1NGHA 4EHUA 5FPMA 1NGFA 1QZ6A 4PL7A 2CGKA 4BRNA 3KHYA 2AP1A 3RSEB 4Z94A 3ATUA 3DJCA 3QBWA 3TU5A 3DXKB 4QS9A 3ZEUB 2A6AA 4BVOA 3A8YA 4BRIA 1H1VA 5BRHA 3LDNA 4BR7A 4DCHA 2QWQA 2AA4A 4HTLA 4H5NA 5AZJA 1WUAA 3VEVA 4DHYA 1GLLO 4PKHA 5FPDA 3EKSA 3GOIA 3CJ7A 4FO0A 3GG4A 5AQHA 5BPLA 4FPAA 4MO5A 4H03B 3ZX2A 1U2VB 4IZ9A 1BA0A 2WUSA 4RWTA 5AR0A 5EVZA 4YDUC 4H5TA 3UE5A 3BP8A 4FWKA 3ZX0A 3FE1A 3CJ9A 2QWNA 3IDHA 2F9WA 4KBOA 5E26A 3O5BA 3QFPA 3D2FA 1BDGA 3M1FA 4JNEA 3QDKA 4IXCA 4DB3A 1NGDA 2FSNA 3O80A 2P9IA 3KZBA 3MCPA 3VETA 4CZGA 1QHAA 4B1VA 4BRFA 2J4RA 4B1UB 1ATNA 1GLFO 4BRQA 2V52B 4YDUA 5BREA 4I6MA 1MDUB 3M3ZA 3KVGA 2YJEA 3A5NC 4BR5A 2FXUA 1TUUA 3UKRA 1S22A 2D4WA 1DEJA 3FFKB 5BPMA 2Q36A 3C7NA 4PKIA 1J6ZA 1LCUA 5FPEA 1X3MA 3SMPA 1NWKA 4CD3A 2ASPA 5AQGA 1KAXA 2P9LB 4J8FA 4GY2B 2ZWHA 4B1XB 3VF4A 3W0LA 4EIAA 2CGJA 4MLHA 4WYBA 4BC3A 2P9PA 3UB5A 1MA9B 5KPTA 3CHWA 3MN5A 4H0YB 4JD2A 5EY4A 5AZIB 3H3OB 4L3QA 3ZETB 2E2QA 1CZAN 2YHYA 1GLCG 1K8KA 3I8BA 2QWRA 4FPBA 2P9KA 1BWFO 5AQWA 1QQNA 3VESA 4ISGA 5KQDA 1RFQA 1V4TA 4BRCA 1DKGD 1BUPA 3VEYA 2YHWA 1NGAA 4FWOA 4H0PA 3AY9A 5ELZA 2Q2RA 3U8XA 3WXJA 1NLVA 4BRMA 5LJWA 3H45C 3CJ1A 3WQUA 1JCEA 1HKGA 1C0FA 3MN7A 4K42A 1BA1A 1GLJO 1XQSC 1HKBA 2DPNA 3R6MA 3R9PA 4BQZA 1GLBG 4XEIA 1NGCA 3WXLA 3D2EB 4JHDB 2QWLA 3L4IA 5F2RA 3VERA 3EO3A 3H6EA 4BRGA 2BUPA 2VYPA 3H3NO 2D1KA 3FGUA 2GWKA 4CZFA 1S3XA 1ESVA 1SZ2A 3UKUB 3C0BA 1D4XA 1NGJA 3F9MA 2V7YA 4M7XA 2HF4A 4H0OA 5LY3A 2NRHA 3FZLA 3SMSA 2YCHA 2D0PA 3DXMA 3L6QA 5LJVA 4BRDA 4MO4A 2D0OA 1YAGA 3BEXA 3WEEB 5B8HA 3L0QA 4FWNA 1R59O 1HLUA 1MWMA 4F9OA 3P4IA 4B9QA 2KHOA 2CH5A 5BRDA 3RSEA 5JMVA 5EOYA 3ATVA 4FWMA 3GDQA 4QS8A 1GLEG 3DXKA 3ZEUA 1X3NA 4BR2A 2ASMA 4Y0WA 2IVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KWGA 3R3LA 1T44A 4H0XB 3CCSN 1JCGA 1LAWA 4AM6A 2VQEK 2W6KA 3OYCA 5AQXA 4CEAA 4W5RA 3HPHA 3ULEA 2A1RA 1K73O 4RTFD 5I3UA 1T6DA 2A42A 3SLCA 3VQ7A 1DT9A 2QTDA 1KAZA 4B3OA 5J2PA 3SUNA 1TK5A 3EL2A 3I0SA 4OGEA 3KKSA 4BDYA 1U6ZA 4DLEA 5AQIA 1BISA 5JLFA 3M8PA 4E7LA 4IG3A 1B9DA 2I7NA 2QI2A 2VGNA 1VQON 1WSJA 5AQOA 4CZEA 1RDAA 3A0IX 3VQ4A 1KAYA 4A61A 5KI6A 4G1QA 2FSJA 3G0ZA 1ATRA 1NNEA 1ASVA 4WF9L 2JWLA 4KB1A 3O3FA 5C0YA 1NOZA 4CE9A 4PQUA 4H0VB 3KKRA 4CFAA 4CEOA 3NH2A 4BG9A 1RT2A 4WQ5C 1HQUA 1TAQA 3I8DA 4WFNL 3F5TA 4CZJA 1KVAA 2JLEA 4KTWA 4A59A 3SQ0A 2V51B 4A5AA 4EP4A 3WQTA 3VF6A 5AQKA 5EX5A 3J7YP 3AO5A 4A57A 2HNYA 4JI5K 3QFUA 2H3GX 3P31A 2QXLA 4QS7A 1V4SA 4EZ9A 2NRWA 3VOVA 4IKFA 1LOTB 3TAMA 3NE6A 2F96A 1QE1A 4CHPA 2HNZA 1OVYA 5HRRA 4MDBA 3A5LC 2VWKA 4OVLA 4J2BA 3VQ8A 4GNIA 4H4MA 4BQLA 1CXQA 2W41A 4N41A 2YNHA 1D5AA 3VQCA 4PA1A 1QQMA 1IKVA 1OKJA 2RKIA 1YHQN 1IBMK 4GKKK 3N4QA 4CFCA 3TTDA 2VG7A 4JYAK 3SI6A 4BRPA 3FZHA 4A62A 3OYMA 1VRUA 1ZXOA 2A41A 4B9SA 3C6AA 3V9XA 4FLWA 2G8FA 1X1PA 3UKUA 3MX2A 2FSKA 1IH7A 3DLLL 2KFZA 1MWKA 3ENOA 4H8KA 5BRFA 4BY9C 2O8BA 3B8AX 3V9WA 4LD0A 3WEEA 4FCYA 1BCOA 4DTJA 5HBMA 1YTAA 4K41A 3CXCM 3SAHA 4KI4A 2RF2A 1LAVA 2X6NA 3QESA 1SKRA 4FJ7A 1GOBA 4E89A 3TPQA 3KK3A 5H1SQ 3VEOA 4FLXA 2ASOA 1JLCA 2O8DA 4KAZA 1WOQA 4CJ5A 4OLBA 1I3AA 3E9LA 1RT3A 3WT0A 3I55N 3K2PA 5JICA 3OYKA 4I6MB 1YTUA 1WSFA 1EP4A 4M3TA 3CJAA 3TARA 4IBNA 3HXMA 4BRAA 3M6GA 3CQXA 4WCEL 1GOCA 2ITMA 2CGLA 4WQ4C 3O4QA 4DFMA 3O1BA 1IG9A 5M1NA 1WSEA 2PZSA 3DAWA 1NMDA 3FR0A 3VQEA 2HMPA 1BI4B 3IMXA 3ZSWA 1CXUA 4ILHA 3V6DA 2G8IA 4A2AA 3L2QA 2VG6A 3L2UA 3WXMB 1FKPA 1JXBA 2ZE2A 1UAXA 2GX9A 4DV0K 4IO9L 4ZTFA 5C10A 1RT4A 2F9TA 5SZTA 5F1XA 1RDWX 1U04A 3E9PA 3MMVA 2A3ZA 4M41A 2O8CA 3V1QA 4M3WA 4YY3K 1OH8A 1S1UA 3OW2M 1XC9A 3O4NA 4CZIA 5AQTA 4JI4K 3NGZA 1T3VA 2E1ZA 4Q5VA 1NM1A 1NKCA 1ILYA 3KJVA 2YHXA 4NO7A 4F3TA 1WN7A 2YI1A 4MLEA 1NMNA 1NJYA 3BGRA 3ZT1A 3OYEA 3CYMA 4K25A 5C24A 3JS6A 4MQ3A 5AFUH 3CFRA 3KK2A 5AQUA 3A2FA 1S9GA 3V9SA 3MEDA 1KFSA 3WUHA 4B9UA 3J81O 3RMBA 1GLAG 3M5RA 4JHDA 3LM2A 5E41A 5KPRA 5J1EA 3JAMO 4LC9B 4JKBA 1QS4A 1I94K 5GAGP 2X6SA 1U49A 1LW2A 1F21A 2IVNA 3AGRA 1BCMA 3THWB 3HJFA 4DS4A 1RBSA 1NJZA 4DTUA 4PL7A 1S1XA 2CGKA 3LANA 1Q86O 5LL6Z 1S72N 3QBWA 3TU5A 1G15A 5M1KA 3A8YA 4DTOA 4CEFA 4BWMA 3HO1A 2RN2A 3VQ6A 3UIQA 3WNEA 1WUAA 3VEVA 5D3GA 1T8EA 2HBMA 3JYTA 3GOIA 4B9VA 1FW6A 1HYSA 2HHUA 3GG4A 3SUPA 1VSDA 4H03B 1BA0A 3DLHA 3NF8A 4CIEA 4CVNE 1A5XA 4M3UA 1HYZA 4DV3K 3ZSXA 3V4IA 2WTUA 3BP8A 3ZX0A 3IDHA 5E26A 3CJ9A 2F9WA 2WONA 3O5BA 4Y1DA 4DTSA 2GBZA 4DB3A 3PIPL 2FSNA 3NMUA 4KHYA 2P9IA 1HPZA 3VETA 1QHAA 4FK0A 4KHSA 3SBGA 5BREA 3ZT3A 4I6MA 4KRFA 1HNIA 3M3ZA 4AH9A 5HLFA 1N36K 3VTHA 3SQ4A 4B9NA 1TUUA 3OJUA 1VQNN 3FFKB 3TSUA 4X64K 4PKIA 3K5LA 1X3MA 4CEEA 1IKXA 4JKCA 4FW2A 3SV4A 4BE2A 5AQGA 4QCLA 3U3YA 3TSPA 4PUOA 3LPTA 1NKBA 2E6MA 2P9LB 3DYAA 3EEQA 1JLQA 4GY2B 4EIAA 1NU0A 3ZYYX 3CHWA 3HP6A 3QO9A 2OTJN 4I9QA 3K9KA 4FLYA 3AO1A 3I8BA 4FPBA 3I0RA 4ILGB 2P9KA 5CY4A 3SQ2A 5C42A 3HPOA 1L3VA 1D9DA 5M1PA 1DKGD 4H0PA 1NGAA 1KLMA 5ELZA 3U8XA 3QEIA 4K0KK 4BRMA 3OVNA 2O4IA 1FK9A 1XQSC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3TWH A;  5KGX A;  1BWF O;  3VES A;  1QQN A;  3LPU A;  4Z4I A;  2OPS A;  1RFQ A;  3JSM A;  3AVB A;  4FWO A;  2WC9 A;  3ID6 A;  3V81 A;  4KB0 A;  1NK5 A;  1IKY A;  1M90 O;  2Z1I A;  4FJI A;  1XHX A;  4O5B A;  4DFK A;  2KW4 A;  2O8F B;  1J5O A;  1GLJ O;  4FZZ A;  1SKW A;  1NGC A;  4U67 L;  3QLH A;  3OYH A;  3WXL A;  3HST B;  5CZ2 A;  2QWL A;  4H4O A;  5KTQ A;  4LY7 A;  5KGW A;  1Q7Y O;  1B92 A;  5JS1 A;  3MEE A;  3OTO K;  1S3X A;  3UKU B;  2WOM A;  2F4V K;  1D4X A;  1VSL A;  3IG1 A;  2V7Y A;  1NK7 A;  2YNI A;  2X78 A;  4H0O A;  1C0M A;  5LY3 A;  1J53 A;  2O8B B;  3OJS A;  3WEE B;  3Q7C A;  1RT1 A;  2Q3S A;  3T3F A;  4JI3 K;  4FWN A;  1R59 O;  1T7P A;  1HLU A;  4CIG A;  2HHX A;  4F9O A;  1YT3 A;  1S1V A;  4CCH A;  3I56 N;  1EXQ A;  1REV A;  2CH5 A;  5BRD A;  5JMV A;  4Z4H A;  3GDQ A;  3QET A;  4KHP K;  4JRQ A;  2NRX A;  2OTL N;  1Y97 A;  1SS6 A;  3LDS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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