2NRHA

Crystal structure of conserved putative baf family transcriptional activator from campylobacter jejuni
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
208
structure length
192
Chain Sequence
LLLCDIGNSNANFLDKYFTLNIDQFLEFIFYINVNEHLKEHLKNQKNFINLEPYFLFDTIYQGLGIDRIAACYTIEDGVVVDAGSAITIDIIHLGGFILPGIANYKKIYSHISPFNTQVSLDAFPQKTMDALSYGVFKGIYLLIKDAAQNKKLYFTGGDGQFLANYFDHAIYDKLLIFRGMKKIIKENPNLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Campylobacter jejuni
publication title Crystal structure of conserved putative Baf family transcriptional activator from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule keywords Transcriptional activator, putative, Baf family
total genus 59
structure length 192
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA01
1HKGA 3WXKA 2AA4A 2A3ZA 2A6AA 1C0GA 2CGJA 5AQUA 4RTFD 2GUPA 3AAPA 3SMPA 3QMLA 4BR7A 5AQXA 4NO7A 5AQFA 4IWVA 3IMXA 2DPNA 3O08A 1SAZA 2FXUA 4BRHA 1NGFA 2PBDA 3CJCA 1BOTO 3D2FB 1X9JA 4WQ5C 3OHRA 2ASMA 5AQTA 2AP1A 1XC3A 1G99A 3L0QA 5AQLA 4CBWA 1Z6RA 3GE1A 2D1KA 3ZX0A 4CZLA 1KAZA 1QQNA 3VEOA 3D2FA 5FPDA 4DHYA 5LJVA 1X3NA 4BRCA 5KQDA 1DGKN 2ASPA 4CZJA 1HX1A 3VGLA 3VOVA 5JLHA 3A8YA 2GWJA 3ENHA 4IZ9A 4XH5A 4YDUC 2A40A 3M3ZA 1T6DA 1C0FA 4BRNA 3MN5A 4JAXA 3H3OB 4PL7A 4FWMA 4C23A 5AQJA 1QQOA 1WUAA 4XH4A 4IO8A 1RDWX 5JMVA 3CI5A 3FGUA 5BPLA 2E8AA 1Y64A 2Q2RA 3SLCA 5BPMA 1U6ZA 3ENOA 4BRPA 3VGMA 3H6EA 1S3XA 1HKBA 4BRDA 1XUPO 3U4LA 2YHXA 1GLAG 3WXJA 3QBXA 3MN7A 3H46O 1X3MA 1BA1A 2HOEA 3LL3A 4FWQA 2V7YA 1WOQA 1JCFA 4I6MB 4BRLA 1TUYA 2BTFA 4PKGA 1NGGA 2CGLA 2GELA 2GEMA 3LM9A 3AARA 2V51B 1NGAA 2E88A 4A2BA 1BA0A 2E1YA 3WT0A 2YHWA 5TKYA 3HM8A 4I6MA 3QBWA 2V52B 3A0IX 3MMVA 4HWIA 5AR0A 3BF1A 5BR9A 4H0XB 4L3QA 2W40A 2CGKA 3H45C 3LDQA 3WUHA 3ZEUB 4H5NA 3SK3A 3MK6A 2J4RA 4EIAA 4XEIA 2IIRA 3I8BA 2QWOA 3GL1A 4BGAA 3ATUA 3EZWA 3JXUA 2E1ZA 1GLCG 2GWKA 2KHOA 5EOYA 5F0XA 3KHYA 5KQ8A 2ASOA 3VPZA 4B1YB 5BRDA 5AQIA 1HPMA 2FLOA 3CJAA 4H5VA 4EFHA 4LC9B 2Q1NA 4ISFA 1YUWA 4FWOA 2VCPA 4FWLA 4K41A 1SQKA 1BU6O 1OKJA 2IVNA 2ZF5O 5AZIB 4CZFA 4WYBA 3VENA 2P9LB 3QICA 3A5OC 3BEXA 5KPTA 4WQ4A 1GLJO 4AM6A 2FF6A 3CJ9A 4O8KA 2QWRA 3A5NC 3EO3A 5AZIA 2QWMA 4BR4A 3CJ1A 3HSCA 3LDPA 4H5RA 2P9LA 3MN9A 1NGCA 2BUPA 1K8KB 3LDNA 4KBOA 2E20A 2Q31A 3BF3A 2Q0UA 1QHAA 2F9WA 2QW9A 3QFUA 3LDLA 3GG4A 4IXCA 1U2VA 2P9SB 3ZX2A 1IJJA 3L4IA 3D2EB 1NGBA 2EWSA 1V4SA 2YCHA 1NGHA 3O1WA 3O4WA 4MO5A 5FPMA 4B1ZA 4CZEA 1ZBSA 1K8KA 2E2PA 3IFRA 4BRQA 2NRHA 2A5XA 4H03B 3FZMA 3BP8A 2ZGZA 1S22A 3O6WA 4FSVA 2P9SA 1NBWA 5FPEA 3D2EA 4DCHA 3VF4A 5CE3A 2E2QA 3MDQA 5AQKA 4BRGA 2YHYA 1DKGD 1ZXOA 2D0OA 4BREA 1HKCA 2QWNA 2W41A 3GBTA 4BC2A 1HLUA 3CJ7A 3DXMB 1YXQA 4CD3A 3W3DA 3I33A 4H5WA 2VWBA 4B9QA 3FZHA 1J6ZA 3ZETB 4J8FA 4EAHD 5AQOA 4AM7A 4A62A 1NGDA 2P9KB 3DXMA 4BVPA 1MA9B 5LY3A 3JS6A 5ELZA 4BGBA 1GLLO 2QWQA 4BROA 3BUZB 3FFKB 3F9MA 3L6QA 3FZKA 3MCPA 4GY2B 5B8HA 4BVOA 4BC5A 4QS9A 3ZETA 3VEYA 1H1VA 4H0OA 1RFQA 1T6CA 2P9KA 4DQ8A 3H1QA 4A2AA 4QS7A 2D0PA 4CZMA 4BR5A 3VF6A 2IVPA 1GLBG 3AAQA 2OANA 3UKRB 3H3NO 1NGJA 2A41A 3VEXA 3KVGA 5E26A 4PL8A 1LCUA 1ATRA 3A5LC 3B8AX 5AQHA 4YDUA 3UKRA 3QB0A 3CJBA 2QWPA 3IDHA 3HBTA 4Z94A 1SZ2A 4BQLA 4CBUA 5EY4A 3IUCA 3ZX3A 1MWKA 4BQZA 1T44A 4XH1A 1BG3A 4FL9A 4FWNA 1ESVA 4Y0WA 4BG8A 4BRFA 4WQ4C 4BRIA 1NLVA 1V4TA 3C7NA 3QDKA 4FPAA 4CBXA 2QXLA 3VERA 3UKUB 1KAYA 2Q36A 3U9ZA 1R59O 2HF4A 4MO4A 2H3GX 4ISEA 1HUXA 3FZFA 3R8EA 4BRMA 4H0PA 4MLEA 1QZ5A 5AQNA 3VETA 4RCHA 1TUUA 3SMSA 1CZAN 4BRKA 2YI1A 5F2RA 3M1FA 3VF2A 3EKSA 3FLCO 3UKUA 4RWTA 5ADXA 3VEZA 5AQQA 1BUPA 3O1BA 3S41A 3SJHA 3WQTA 4CD1A 3UE5A 4O5FA 5BPNA 2I7NA 1IG8A 4BC4A 5AFUA 1BDGA 3EL2A 3HZ6A 4FWKA 3GOIA 1U2VB 2CH6A 1NM1A 3DXKB 4K42A 1GLFO 2F9TA 4ISGA 1YAGA 5I9EB 2WUSA 3UB5A 1ZC6A 2FSKA 5AQRA 5BREA 3AY9A 3FR0A 3DXKA 3QFPA 1NWKA 2P9IA 4FO0A 2ITMA 1GLEG 1P8ZA 2P9UB 3W0LA 1D4XA 3RSEB 2UYTA 1MDUB 2E2OA 3U9DA 4CI6A 4BC3A 4K43A 4FWSA 3ULEB 4F9OA 2P9UA 4H0YB 1E4FT 3WQUA 3RSEA 2QM1A 4B1VA 5AQVA 4BR9A 3WXIA 3CERA 4B1WB 3ULEA 5AQGA 2D4WA 1NGEA 5AQPA 3HI0A 3LM2A 4M7YA 3VGKA 1KAXA 3O80A 4FOEA 4EHTA 4BRAA 1TYQB 2GTDA 4FWRA 3CHWA 5AQYA 4BR0A 5KPRA 5LJWA 1NGIA 3FE1A 4JD2B 2P9NB 1QZ6A 2VYPA 4GNIA 2PAVA 3WXLA 3DAWA 1EQYA 1HJOA 3R6MA 1TYQA 1YVNA 3G25A 5AQSA 5ADXH 4WQ5A 3DJCA 4JD2A 2P9NA 2FSJA 4HTLA 4QS8A 1QQMA 1GLDG 2NZTA 4IJAA 5AFUH 2FSNA 3A5MC 3VEWA 4K25A 4B1XB 2P9PB 1XQSC 4JN4A 5EXWA 1NMDA 5JICA 3U8XA 3H1VX 1E4GT 2YJEA 3EN9A 4MLHA 3CIPA 3MN6A 1LOTB 4M7XA 2I7PA 4CZHA 1Q18A 1BO5O 5BRFA 2E2NA 4NB4A 2P9PA 1JCGA 4FOIA 3ATVA 3CQYA 4CJ7A 5AQMA 3C7NB 3DWLA 4H0VB 5FPNA 3HTVA 1ATSA 4JNEA 5BRHA 1BWFO 4M63C 5KPZA 3O5BA 2FF3B 2V7ZA 5E84A 5F1XA 3WEEB 4CZIA 3GDQA 2Q97A 4H5TA 5AZJB 2HF3A 4PKIA 3CQXA 4BG9A 4CZKA 3D7EO 4E1JA 4FPBA 4H0TB 2NLXA 1RGIA 3R9PA 4FWPA 5EX5A 3WEEA 4CZGA 2A42A 2QWLA 3P4IA 3C0BA 3TU5A 5AZJA 3LDOA 4JHDB 3VEVA 1KXPA 2YJFA 3CETA 5EVZA 3ZEUA 3ID8A 4A61A 5BN9A 3VESA 4B1UB 5JLFA 3M6GA 3FZLA 4PKHA 1MWMA 4IJNA 4JHDA 2Q0RA 1ATNA 3O8MA 3EKUA 2ZWHA 5AQZA 2P9IB 2ZGYA 2HMPA 1Z05A 1DEJA 5AQWA 4BR2A 4EHUA 3J8AA 2IVOA 3TPQA 2CH5A 3KZBA 5BN8A 1JCEA 4DB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQUA 4CHYA 2A3ZA 2A6AA 4RTFD 1HNIA 4Z4IA 1J54A 3DMJA 4AQYK 3QMLA 4BR7A 4NO7A 5JS1A 5AQFA 1WB9A 2HVHA 4IOAL 3KLGA 2BH1A 1RT3A 2O8EB 4JKFA 1NOZA 1G99A 1U04A 5AQLA 2D1KA 3LAMA 4DHYA 5LJVA 3UIQA 1HX1A 4KHPK 3LP1A 2GWJA 4IZ9A 2HHTA 3M3ZA 1T6DA 3CPEA 1SV5A 3H3OB 4FWMA 4RG8A 3VA0A 2A1RA 4W5TA 1NJIO 4M3UA 3PX6A 1IKYA 1QQOA 1WUAA 1QSLA 1LWEA 4BDYA 5JMVA 1P90A 3MCAB 3FGUA 3DRSA 4ZTFA 4CJ5A 2D0BA 3SLCA 1U6ZA 1VRUA 3VGMA 1S3XA 3KJVA 4E7HA 1RCHA 1XUPO 4CF8A 2PYJA 1VSFA 3LL3A 4ILGB 2V7YA 1BQNA 4I6MB 1KVCA 4BRLA 3AO5A 1YITN 4J2BA 1NGGA 3QIPA 1LW0A 3AVAA 3HRGA 4RW8A 4XIUA 3I0RA 2E88A 3WT0A 4N76A 1BQMA 5TKYA 1D9DA 2Q3SA 4B9MA 3MMVA 5AR0A 3OYNA 5BR9A 4H0XB 4WFAL 4H4MA 4CK2A 3WUHA 1U47A 4PWDA 3DI6A 3MK6A 4XEIA 4W5OA 5D3GA 3KKSA 3TSUA 4O55A 5BR8K 3JAMO 4IBNA 3AVNA 3ATUA 3JXUA 4JI2K 2E1ZA 4O44A 4DTNA 3KK1A 5KQ8A 2ASOA 3VPZA 4JEPA 3AVKA 1KD1O 4ISFA 3KLIA 1FKPA 4V19S 1VSDA 4WYBA 2WONA 5DM6L 1WSIA 3A5OC 5KPTA 4KV8A 4KTQA 1NJXA 1OH5A 2QWMA 1YVUA 4DTJA 4DU1A 2G8HA 3V1RA 2Q31A 3BF3A 4JI0K 2QW9A 4IXCA 3LDLA 1SUQA 2HHUA 3ASMA 2YCHA 4GV9A 1K8KA 3NH2A 2AJQA 4YORA 3ZT2A 4H03B 2RHKA 4IEIA 3J7YP 1O1WA 5FPEA 3D2EA 4DCHA 3DLBA 1TAQA 3PUFA 5AQKA 2X6SA 3T69A 1IO2A 4IOCL 1I94K 3K5LA 4QOZB 3PV8A 3QINA 1CXUA 1HKCA 3AA2A 4CJ3A 3S3OA 3DLRA 1X9WA 1TL3A 1IKXA 1FK9A 1Q82O 2I5JA 1KRPA 4CD3A 3QEXA 1TV6A 4F2RA 4H5WA 2RN2A 2VWBA 4CGDA 3HOSA 4DSIA 5AQOA 1NGDA 1MA9B 5ELZA 4PUOA 1QVFM 2D5RA 3BUZB 3F9MA 1S9EA 3DM2A 3MCPA 2W6LA 4DR1K 4H0OA 1RFQA 4OGEA 2XY7A 4CVNE 3QLHA 4ELTA 1HNWK 4GKJK 4CZMA 4B9LA 2IVPA 3QEWA 4C8OA 3H3NO 5KI6A 3P38A 3S3NA 1XNRK 4F3TA 2Z1HA 3SAHA 4A59A 3HXMA 1TK0A 1RTIA 3M8RA 1L3UA 2QWPA 2P51A 1J5OA 1SZ2A 3VQ7A 4CHQA 5J2PA 3O9TA 5EY4A 2VQFK 3IUCA 1JLAA 1RDCA 2JGUA 3NFAA 3HO1A 1QVGM 1BG3A 1ESVA 2XY8A 3SQ1A 4JV5K 5FROA 5LL6Z 1DTQA 3CCVN 4DV7K 4JI1K 3QDKA 2ZJRL 4CBXA 1R59O 3SUPA 1U49A 3KK2A 5C2FA 3K2PA 4BRKA 3ZSOA 3N4QA 3T3FA 3VEZA 5M1NA 3HT3A 3O1BA 5M1QA 1B92A 1WAFA 3AVJA 1HQEA 3OS0A 3ZT3A 4JKBA 2I7NA 3VQ4A 4BC4A 5AFUA 2E6LA 3TR8A 3EL2A 5JS2A 3NH0A 1NM1A 5GAEP 1L3TA 1GLFO 5I9EB 4CERA 4CGJA 4FZXC 2IAJA 1IBMK 2FSKA 5KRTA 4KFBA 1X9MA 1NWKA 2W6KA 3VQEA 2ITMA 4U67L 1FW6A 1D4XA 1HNXK 3AO3A 5KTQA 1WSJA 1MDUB 3G71N 3SI6A 2QKKA 2YX6A 4ILHA 1S6QA 3QEPA 4K43A 2G8VA 4DSJA 2F8TA 1BL3A 5GAGP 2P9UA 4H0YB 3L3VA 3DLGA 4NLBA 4B1VA 4BR9A 2LSNA 3AA3A 4OPJA 3V9ZA 2RF2A 3V9UA 1JLCA 1VQ7N 2D4WA 3WXMB 4FZYA 1IKVA 3IS9A 2ZE2A 3KD5E 2ATQA 3VGKA 1Q8IA 3O80A 2O8FB 4FWRA 1TK8A 1W7AA 3CHWA 1RBVA 3D45A 3M8QA 4BR0A 3VQ6A 4Q0BA 1C1CA 1KFDA 4KB1A 3FE1A 4FZZA 4GNIA 2O4GA 4KHYA 3WXLA 2WTUA 5FRNA 3SJJA 3F5TA 4FVUA 3CCRN 4LFAK 4GMJB 1KCFA 1VSMA 3FFIA 2NRRA 3DJCA 4JD2A 3NAEA 2P9NA 4ZTJA 2FSJA 4OPHA 4WFNL 3AVMA 5AFUH 3A5MC 4OO1J 3VEWA 1C0MA 4CJTA 3SQ2A 1NMDA 4CEQA 4CFBA 3U8XA 3CIPA 1B9FA 3RR7A 2KFNA 3CG7A 3TAQA 3K57A 1BO5O 5BRFA 1SS6A 1S1TA 2P9PA 4CEEA 3L4QA 3ATVA 3SV4A 5AQMA 2KLAA 1VSKA 4CIGA 5FPNA 4JNEA 2NRZA 1BWFO 4LD0A 4RW6A 1VSHA 1ASWA 1VQ8N 2YNIA 3GDQA 2Q97A 4JRPA 4FJLA 5AZJB 3OYJA 4DQPA 4CZKA 3D7EO 2NLXA 3TAGA 4B9SA 4K0KK 3R9PA 1JLBA 2UUAK 4CZGA 1RT5A 2OZMA 1TK5A 4KTWA 3TU5A 3ZT1A 3LDOA 4JHDB 3ZSQA 4M42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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