2NRHA

Crystal structure of conserved putative baf family transcriptional activator from campylobacter jejuni
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
208
structure length
192
Chain Sequence
LLLCDIGNSNANFLDKYFTLNIDQFLEFIFYINVNEHLKEHLKNQKNFINLEPYFLFDTIYQGLGIDRIAACYTIEDGVVVDAGSAITIDIIHLGGFILPGIANYKKIYSHISPFNTQVSLDAFPQKTMDALSYGVFKGIYLLIKDAAQNKKLYFTGGDGQFLANYFDHAIYDKLLIFRGMKKIIKENPNLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Transcriptional activator, putative, Baf family
publication title Crystal structure of conserved putative Baf family transcriptional activator from Campylobacter jejuni
rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 59
structure length 192
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA01
3CIPA 4FL9A 3HSCA 1Q18A 4BREA 3GE1A 2P9SA 4K41A 3LDNA 2YJEA 3VOVA 3HI0A 3CHWA 4CZHA 2QWPA 4EHTA 1ZC6A 1X3MA 4BRQA 5FPEA 4CZKA 4FPBA 5BPMA 3RSEB 3DWLA 2FF3B 2IIRA 5BN8A 4PKIA 3FZMA 2V7YA 4MLEA 2YHWA 1DEJA 1BO5O 4I6MB 5ADXA 3R9PA 3LDOA 3MDQA 4FSVA 2W41A 1XQSC 4XEIA 4HWIA 3C7NA 1U2VA 2I7PA 4XH4A 2FSNA 1KXPA 1X9JA 3WXKA 5BPNA 3VGMA 2P9LB 3H3NO 5AQOA 4GNIA 3UKRA 1QQMA 4EAHD 4PKGA 4EHUA 1XUPO 2ZGZA 4FWNA 2D1KA 3CJ9A 1XC3A 3QB0A 4QS7A 3AAPA 2IVPA 4IWVA 5TKYA 2VWBA 3WQUA 5AR0A 1P8ZA 2YHYA 3GOIA 4BRNA 4DHYA 3O80A 3BP8A 3D2FA 3D2EA 3H6EA 3KZBA 2D0PA 3FFKB 3A5LC 4Y0WA 2KHOA 5AZIA 4ISFA 3VF6A 4JNEA 1NGIA 4MO5A 1NGBA 3BF1A 3A5NC 2E2PA 1HUXA 5AQSA 2W40A 4BR9A 2HF3A 1T44A 4BRHA 3ZX2A 5CE3A 5AQGA 3FZFA 1QZ5A 2DPNA 2NZTA 2V7ZA 3AY9A 3CI5A 4WQ4A 3VENA 4B1VA 4IJAA 1YAGA 1NLVA 4FOIA 1D4XA 4FWMA 1NBWA 3U4LA 4F9OA 3DXMB 1X3NA 1V4TA 3EO3A 3WT0A 4M7YA 4NB4A 3DXKB 4EIAA 1HKGA 1NMDA 4BQZA 4DB3A 5AQRA 3A8YA 2F9WA 2GUPA 1LOTB 4PKHA 1ZXOA 2E20A 3OHRA 4CBUA 2E2OA 1QQNA 2QWQA 3EZWA 3AAQA 3VEOA 1Y64A 1KAXA 4RTFD 3FR0A 4CI6A 3FGUA 3FZKA 5E26A 3HZ6A 2A3ZA 4H0PA 3VERA 1BA1A 5AQMA 4CZJA 3LDLA 5AQWA 1C0FA 2P9IA 2QWLA 1J6ZA 1ATRA 4CZFA 2VCPA 5AQZA 3I8BA 2P9KA 5BPLA 4PL8A 1T6CA 2PBDA 1GLCG 2FF6A 3L0QA 4O5FA 2NLXA 3ZX0A 3O8MA 4WQ4C 3U9DA 2P9UB 3A0IX 5KQDA 3L4IA 4LC9B 4BVOA 2Q1NA 1S3XA 1WOQA 1E4FT 2GWJA 4L3QA 2OANA 3ZX3A 2YCHA 1TYQA 4BROA 2A6AA 3GG4A 2E2NA 2YJFA 3IMXA 3ZETB 5LJVA 1GLBG 2CH5A 4XH1A 4CJ7A 2QWOA 1QZ6A 3ATUA 4ISEA 4KBOA 5F0XA 4B1UB 4AM7A 2QWRA 5AFUH 1NM1A 4WQ5C 3H1QA 1GLAG 1GLEG 4B1ZA 4CZEA 1HKCA 3ID8A 1MWKA 4JHDA 5AQFA 5JLFA 3B8AX 2I7NA 2Q31A 3TPQA 2E8AA 3UE5A 1HX1A 1K8KA 3EN9A 3TU5A 3ZEUA 3H46O 2ASPA 3UKUA 5KPTA 2ASMA 4FWPA 1U2VB 1NGGA 5B8HA 1ATNA 1RDWX 2NRHA 4CZGA 1YXQA 2YHXA 2HF4A 2V51B 4JN4A 4BR7A 4C23A 2VYPA 2Q2RA 1H1VA 2J4RA 2HOEA 3QFPA 4BC4A 1OKJA 4ISGA 5BRDA 2E1ZA 1NWKA 3HTVA 3P4IA 2EWSA 3EL2A 3O1WA 3O6WA 3W0LA 2QM1A 4YDUA 4CBWA 2P9LA 2QXLA 3LDQA 3MK6A 5KQ8A 2QW9A 3D7EO 2A42A 3DJCA 1C0GA 5E84A 4BRGA 3H1VX 1ATSA 4BVPA 3ENOA 4H5WA 3O1BA 5AQXA 3D2FB 1G99A 3D2EB 4Z94A 3SJHA 5AZJA 3IUCA 3CQXA 5AZIB 2AP1A 3ULEB 2Q0RA 1MWMA 2ZF5O 1ESVA 3IDHA 4E1JA 4BRMA 3CJ7A 1JCGA 3VF4A 2GWKA 2IVNA 2A40A 1BG3A 3SK3A 3WQTA 2CH6A 4H03B 3WEEA 2QWMA 3QMLA 2H3GX 5AQYA 1SZ2A 1BU6O 4H5RA 3SMPA 4IXCA 1SQKA 4J8FA 4H5VA 4A2AA 2GEMA 1Z05A 4BRPA 4BC5A 4H5NA 5BREA 3MN6A 3L6QA 4MO4A 2BUPA 1ZBSA 1KAYA 4BR4A 4H0OA 4K42A 4IZ9A 4M7XA 4B1YB 4FWQA 3M1FA 4XH5A 3VEXA 4CZMA 5FPNA 2P9PA 4BR2A 1TUUA 4FWRA 4BG9A 3W3DA 3WXIA 3GL1A 4CD3A 1R59O 5JMVA 4H0TB 4BC2A 5JICA 4FWSA 1IJJA 3R6MA 5BN9A 1EQYA 5AQLA 3CJ1A 1JCFA 3MN9A 3FZHA 4QS9A 3DAWA 5EY4A 4GY2B 3EKSA 3U8XA 4H0XB 4MLHA 2E88A 4JD2B 3ENHA 3VEZA 4BGBA 1BDGA 2P9KB 2P9SB 1SAZA 5ADXH 2ZWHA 3EKUA 5KPRA 3VETA 1BA0A 3QBXA 3QFUA 4B1WB 3JXUA 4BC3A 5AQJA 1YUWA 3O5BA 2P9NA 1KAZA 3SLCA 2ASOA 3GDQA 2HMPA 3BF3A 2CGJA 1TYQB 3MN7A 3CJBA 3VESA 1RFQA 2P9UA 3BEXA 4O8KA 4BRDA 2FSKA 2FSJA 5EXWA 3J8AA 4K25A 2Q36A 3CQYA 4BG8A 1V4SA 3VEVA 1GLJO 5BR9A 3M6GA 2UYTA 3HBTA 4BRIA 3RSEA 4JHDB 3AARA 5AQKA 3ZETA 1HJOA 3IFRA 4B9QA 4BRKA 1NGEA 1HKBA 2V52B 4BR5A 3C7NB 4H5TA 4CD1A 1K8KB 3ZEUB 3UKUB 5BRFA 1TUYA 4FPAA 4I6MA 3I33A 5AQVA 4CZLA 5AQNA 5AQTA 3WUHA 3R8EA 3UKRB 3VEYA 1BWFO 2GTDA 5ELZA 3FE1A 3VEWA 3MN5A 1QHAA 3C0BA 1BUPA 4A62A 1IG8A 2FXUA 2A41A 3CETA 4FOEA 5FPMA 3VPZA 5KPZA 4QS8A 3S41A 3A5MC 3KVGA 5AFUA 3GBTA 1DGKN 2Q0UA 1JCEA 3CJCA 3HM8A 5EX5A 4A61A 4FO0A 2Q97A 1U6ZA 4PL7A 5F2RA 4NO7A 1NGFA 3ATVA 5AZJB 4BQLA 4EFHA 1HLUA 2CGLA 3O4WA 1DKGD 4A2BA 4B1XB 1MDUB 3FZLA 1NGDA 4BRAA 1MA9B 3FLCO 3MMVA 3VGKA 5F1XA 1CZAN 3G25A 1NGJA 4BRLA 3ULEA 2FLOA 5LY3A 4HTLA 4RWTA 3WEEB 3KHYA 2QWNA 2A5XA 2AA4A 3H3OB 4WYBA 4CBXA 1GLLO 1NGAA 1BOTO 1E4GT 1T6DA 3CJAA 5AQHA 4BGAA 3SMSA 5I9EB 4FWLA 5EVZA 3M3ZA 1NGCA 4BRFA 4H0VB 2ITMA 4FWOA 3U9ZA 4AM6A 2BTFA 2ZGYA 5AQQA 4H0YB 2E2QA 4CZIA 4YDUC 1YVNA 3JS6A 3DXMA 3LDPA 1GLFO 2IVOA 3LM9A 3MCPA 5LJWA 3DXKA 2P9PB 4M63C 5AQPA 4FWKA 2F9TA 3QDKA 1Z6RA 4RCHA 4WQ5A 2WUSA 3QICA 2YI1A 1LCUA 2D0OA 2PAVA 3LL3A 1QQOA 5AQUA 3F9MA 4BRCA 1NGHA 3LM2A 1WUAA 3QBWA 4DQ8A 2P9IB 2D4WA 4IO8A 3VF2A 5AQIA 3BUZB 5EOYA 3VGLA 4K43A 4BR0A 1S22A 2GELA 4DCHA 4JAXA 1GLDG 5JLHA 1HPMA 5FPDA 3A5OC 4IJNA 3CERA 3H45C 3WXJA 3WXLA 2P9NB 3UB5A 2CGKA 5BRHA 3O08A 1RGIA 4JD2A 2E1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7FA 3HSCA 4CJ4A 1P90A 1QQCA 4A5AA 2HHTA 2YX6A 3VOVA 5M1PA 4X62K 3HI0A 4EHTA 4ZTJA 4B3RK 4H8KA 5C2FA 2UUAK 4OX9K 4Z4HA 5BPMA 1EP4A 4FPBA 4JI5K 2IAJA 3WNHA 2FF3B 4DUZK 5T7BA 5BN8A 3FZMA 2PFUA 3C94A 4I6MB 5ADXA 1G15A 4E19A 4FJLA 3LDOA 4KHYA 3ZSOA 3O3FA 3RRGA 1S1WA 2O4IA 2HBLA 2KKZA 4CJFA 3DI6A 3C7NA 2I7PA 3D0PA 4PUOA 2KFNA 2FSNA 1KXPA 4DV4K 4KKOA 3VGMA 4MDBA 2OYQA 5AQOA 3TR8A 1RILA 3UKRA 3CCMN 4DU4A 2GV9A 3IG1A 1XUPO 1NK6A 3M5RA 2ZGZA 4M3WA 4FVMA 4FWNA 2D1KA 3AGRA 1TKZA 4W5QA 4JLHA 1Q82O 4QCLA 4QS7A 3AAPA 2IVPA 4IWVA 4KHQA 5AR0A 4GKKK 2OPSA 5GIPA 2P5GA 3BP8A 4OPJA 2KW4A 2D0PA 3RWUA 4U67L 4ISFA 3BZCA 4CEQA 3AO1A 4MO5A 4AHVA 3QEXA 4DSJA 2W6KA 1XNRK 1HUXA 3ZSXA 2ZD1A 2HF3A 1T44A 3FZFA 2OPRA 4I9LA 3CYMA 3CCVN 3DRPA 1QVFM 1D4XA 4E1NA 4FK0A 4CF8A 1RCHA 3AA2A 3NMUA 1YJWN 4F9OA 1BIZA 3DXMB 1X3NA 1VAZA 3AVFA 3THYA 3O9QA 1HKGA 1NMDA 1S72N 4BQZA 2JGUA 4I2PA 3RR7A 2GUPA 5GAHP 1ZXOA 4C1NK 3DOKA 2ZE2A 3DRSA 1XWLA 4WE1A 1QQNA 2QWQA 3EZWA 1Y64A 1KAXA 3TTCA 3MX2A 3FZKA 3J7AP 2ZQBA 4OKJA 5E26A 3HZ6A 5HLFA 3VERA 3C65A 5AQMA 1NKCA 4DTOA 4IFYA 5CZ2A 3SJJA 2P9IA 1Q81O 1VK0A 3N4PA 2P9KA 1RT5A 3L0QA 3CM6A 2NLXA 4C8KA 1KCFA 5KQDA 4BVOA 3VQDA 2IGIA 1WSGA 3L2RA 4E3SA 3JAMO 3ZX3A 2YCHA 1TYQA 3HP6A 1TGOA 2O8DB 2E2NA 4CK3A 1I94K 1GLBG 4M3RA 3AO5A 4B1UB 2QWRA 3O4QA 3VQAA 4IFEA 1GLAG 3K5MA 1GLEG 4FZXC 4ILHA 3OS1A 4JKGB 2YHBA 3D6RA 5J2PA 4JHDA 5JLFA 3B8AX 2I7NA 3TAQA 2D0CA 5CR4A 3AGKA 3G71N 1K73O 1HRHA 3OYDA 1BISA 4FK4A 1BGXT 4DQPA 1HX1A 2YNIA 1K8KA 3EN9A 3TU5A 5KPTA 3KLEA 2ASMA 4FWPA 3TAFA 3JSMA 5I3UA 2NRHA 4CEEA 1UWBA 5CY4A 4C23A 1O1WA 3OYKA 2VYPA 2Q2RA 4N41A 2J4RA 3HRGA 2KFZA 1BQMA 4BC4A 4OLBA 2PY5A 3OS2A 4KHWA 2E1ZA 4ZTFA 4HUEA 1TKDA 5KGXA 4DFJA 2QM1A 4QOZB 4CBWA 3L3VA 5M1QA 2QXLA 4FLTA 4BE1A 3D7EO 1J5EK 5E84A 4BRGA 4CECA 4BVPA 3THWA 3D2EB 4FJ9A 5AZJA 4J2BA 3IUCA 5K14A 4AHTA 1NK8A 1MWMA 4CIFA 2RE2A 2ZF5O 1RT6A 4E1JA 1KD1O 1HR0K 1TVRA 2GWKA 2IVNA 1XC9A 4DTUA 2QTDA 2ATQA 2CH6A 1ILYA 1A5XA 3QMLA 3VQBA 4CGHA 3WNFA 2VG7A 4J8FA 3V6DA 5HBMA 4KI6A 1JXEA 3ZLJA 3ENBA 4FXDA 3LP0A 1CZBA 4Y1CA 1X9SA 4DFKA 4IZ9A 4NLCA 1L5UA 4OPHA 1NK4A 4KHSA 1W0HA 3W3DA 1KLNA 5JMVA 4A59A 2ZJPL 1IH7A 1IKWA 3SUPA 4HTUA 4FWSA 4E0DA 3R6MA 3CJ1A 1JCFA 4ELVA 1IBKK 3U8XA 3NHGA 2KTQA 3QNOA 4H0XB 3NF6A 3HYFA 4FM2A 2NRRA 4M45A 2DY4A 3VEZA 2OTJN 5ADXH 2ZWHA 3VETA 1BA0A 1BL3A 1YIJN 2OZMA 4QAGA 3JXUA 2D5RA 4DTRA 4JI3K 2F7TA 1WSEA 3SLCA 2ASOA 4F8RA 2HMPA 3I55N 4B8AB 3BF3A 4E7HA 3ZT3A 1T7PA 1DLOA 1RFQA 1GOAA 2Z1IA 4BRDA 3CFRA 1Q8IA 2FSKA 2KLAA 2FSJA 2W6LA 3AA5X 2Q36A 3CQYA 4BG8A 1GLJO 3M6GA 4JI1K 2QK9A 4FM1A 5AQKA 4C8NA 3IFRA 4BRKA 4W5TA 1HKBA 2V52B 3C7NB 4H5TA 2JLEA 3NE6A 4CFAA 1KVAA 1S5JA 4FPAA 4I6MA 3I33A 5J1EA 4LFCK 1HQUA 1JLQA 3UKRB 3VQ9A 2NRXA 4JRPA 5HP1A 3MN5A 1LW2A 1IG8A 3CETA 5FPMA 3ULDA 2E4LA 4N47A 3A5MC 1YTAA 3LP3A 4DQQA 4FM0A 3CJCA 4LFBK 4KH4A 2R7YA 3HM8A 4KPYA 4A61A 3KTQA 1VHXA 3KD1E 4JK8A 1TK8A 1OH8A 3NGYA 3ZT0A 1QTMA 3HT3A 2CGLA 4DR2K 1DKGD 3CFOA 1Q9YA 4IBNA 4CE9A 4JYAK 4CEAA 4JS4A 4DR1K 1UOCA 2AJQA 3HM9A 1YVUA 2F8TA 1NGJA 4DG1A 4W5NA 4OLAA 4BRLA 1HNWK 2BE2A 5LY3A 3ZSZA 4RWTA 3KHYA 2WONA 3NBPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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