2NRHA

Crystal structure of conserved putative baf family transcriptional activator from campylobacter jejuni
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
208
structure length
192
Chain Sequence
LLLCDIGNSNANFLDKYFTLNIDQFLEFIFYINVNEHLKEHLKNQKNFINLEPYFLFDTIYQGLGIDRIAACYTIEDGVVVDAGSAITIDIIHLGGFILPGIANYKKIYSHISPFNTQVSLDAFPQKTMDALSYGVFKGIYLLIKDAAQNKKLYFTGGDGQFLANYFDHAIYDKLLIFRGMKKIIKENPNLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of conserved putative Baf family transcriptional activator from Campylobacter jejuni
rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Transcriptional activator, putative, Baf family
total genus 59
structure length 192
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA01
3GL1A 3MCPA 4J8FA 1ATSA 4BRNA 2NZTA 4BR4A 1XUPO 3I33A 4NO7A 3WEEA 5AR0A 3OHRA 5AQYA 3VERA 2I7PA 3L4IA 3R8EA 1GLLO 4BRPA 3FR0A 1QQMA 2CGLA 3QB0A 3D2FA 1S22A 4H0PA 4H0TB 1E4FT 4I6MA 1HKBA 1XC3A 3GOIA 3S41A 2HF4A 2PAVA 2Q1NA 5EY4A 4B1UB 3FZMA 3UE5A 1NGFA 2J4RA 4BREA 2D1KA 5AQXA 3EN9A 3IUCA 2D0OA 3UKRB 3EZWA 1EQYA 1KAZA 1S3XA 2V7YA 2V51B 4BC3A 4AM6A 1E4GT 3O6WA 1QQOA 1NGAA 3DXKA 4BC4A 2GTDA 1SAZA 4QS9A 4JHDA 2ITMA 2QWNA 5AFUH 1T44A 4NB4A 4H5RA 4BQZA 4PKIA 5EX5A 3A5NC 1BU6O 3J8AA 3WQUA 2YJEA 4B1WB 2P9LB 4BR5A 4EHUA 2A5XA 3EKSA 4FWLA 4IO8A 5AQJA 3R6MA 5KPRA 5AQTA 4HTLA 1X9JA 5EXWA 2ASPA 3CERA 4CZJA 2F9WA 3GDQA 3ZETB 4BRHA 3TU5A 3LDPA 1LCUA 2OANA 5AQNA 3ATVA 4ISFA 2EWSA 3KVGA 4H03B 3D2EA 5AFUA 5AQOA 2ZGYA 3GG4A 2FSJA 2P9KA 1NGJA 3A5OC 5FPDA 3KHYA 4LC9B 1NGEA 5ADXH 1MDUB 1HKCA 1C0FA 3ENOA 2E2PA 3CJ1A 2GWKA 3HBTA 3D2FB 5LJVA 1DEJA 4CZHA 4RCHA 1KAXA 4XH4A 4CZEA 5B8HA 5FPMA 4RWTA 3O08A 2A6AA 5BRHA 3CJ9A 3VOVA 3FZLA 4JN4A 3ULEB 3O4WA 2Q36A 4FWSA 2D0PA 2YI1A 3GE1A 1T6DA 5JLHA 3WXJA 5AQHA 3A5MC 2W40A 3VESA 4F9OA 1TYQA 4L3QA 1TUYA 4YDUA 1BDGA 5BPLA 4A61A 2QWPA 4Y0WA 3EL2A 3UKUA 4CZGA 4ISGA 2E20A 4BR2A 2E88A 4FSVA 4CZLA 1QHAA 5AQPA 2E1YA 5LJWA 1Y64A 1QZ6A 3IMXA 3ZEUA 4HWIA 3ULEA 3D2EB 5BR9A 1G99A 3VETA 3FE1A 1IG8A 1X3NA 4BVPA 5AQSA 4O8KA 3ZX3A 3O80A 1TYQB 4CBWA 2NLXA 2P9NB 4DCHA 3SMSA 5F2RA 5KQ8A 1H1VA 3EO3A 2FXUA 4MO5A 5AQRA 1HPMA 2P9KB 3LDOA 5AQMA 5TKYA 4B1ZA 3A0IX 2QWMA 3U9DA 3WQTA 4B9QA 4QS7A 5AQLA 2HMPA 3O5BA 2IVNA 1NGBA 4M7XA 5AQZA 3A5LC 4BRCA 1ATNA 3SMPA 3CIPA 4CBUA 2H3GX 4K41A 4KBOA 1GLAG 1RDWX 4PKGA 3ZEUB 1K8KA 2VWBA 2P9UB 1NGIA 1SZ2A 3VF4A 4BRQA 3H3NO 3FLCO 5AQIA 3AY9A 2FF6A 4A62A 4MLHA 3H1VX 4WQ4C 3FZFA 2HOEA 3FZKA 3MDQA 1GLCG 3QFPA 1U2VB 2P9IB 1Q18A 2W41A 4H0VB 1X3MA 2FSKA 3VPZA 2E2NA 4IXCA 5FPNA 1JCFA 3ZX0A 3IFRA 4CD3A 2P9PB 2Q97A 3UKUB 4BGBA 3U9ZA 3I8BA 2QWQA 2V7ZA 1HX1A 3QBWA 2VYPA 3H46O 4DHYA 3CI5A 1GLEG 3H6EA 1MWKA 3CJCA 1IJJA 4FWPA 4JHDB 1ESVA 1NLVA 4B1YB 3GBTA 5AQGA 4BQLA 1GLFO 3CHWA 4CZIA 3MN9A 3P4IA 2P9PA 4PL7A 1NGHA 1BO5O 4IWVA 2ZGZA 3VGKA 1HJOA 3W3DA 3W0LA 2VCPA 3WT0A 3ZX2A 3A8YA 4M7YA 1WUAA 4FPAA 1NGGA 3VGMA 3RSEA 2YHXA 3HTVA 1KAYA 4H0XB 3QICA 2GUPA 3L0QA 4A2AA 3QFUA 1Z6RA 4IJNA 5KPTA 4BGAA 3O1BA 2CH5A 1YAGA 4FL9A 2YHYA 4JD2B 4WQ5C 1QZ5A 4MLEA 1Z05A 5LY3A 5BREA 3VEYA 3SJHA 3B8AX 5JLFA 1OKJA 1BUPA 4CI6A 1BA1A 5JMVA 3MN6A 5BPNA 3DWLA 3VEVA 2FLOA 3WXIA 4ISEA 5BRFA 4DQ8A 5F0XA 5AQVA 5AZJB 2E8AA 4XEIA 3DJCA 2QM1A 1ZXOA 3ID8A 3VF6A 4FPBA 3LL3A 3FFKB 3EKUA 1NWKA 1BG3A 3MN5A 1GLJO 4WQ4A 3TPQA 1ATRA 1DGKN 3HSCA 1GLBG 3C7NB 4BRGA 1MA9B 5AQFA 2UYTA 3DXKB 2BTFA 3DAWA 2QWLA 4QS8A 3KZBA 3QBXA 4IZ9A 3ENHA 1ZBSA 2HF3A 2WUSA 3CJAA 2PBDA 3H45C 4K42A 5ELZA 4CZFA 4BRKA 4I6MB 3FZHA 4CBXA 4BRIA 4EHTA 4BRDA 4FO0A 4BC2A 2A3ZA 5AZIA 3CJ7A 4BRFA 5KPZA 2BUPA 3QDKA 3JXUA 4AM7A 4CJ7A 3JS6A 1C0GA 3F9MA 2I7NA 4GY2B 1LOTB 4FWQA 3MMVA 4DB3A 1NGCA 2AA4A 4FWNA 4MO4A 4XH5A 4FWMA 4EIAA 4FWOA 3O1WA 4BR0A 5BPMA 5BRDA 4PKHA 4XH1A 2QW9A 2P9IA 1CZAN 2GWJA 3ZETA 4A2BA 3BUZB 3BEXA 1RGIA 2DPNA 2QXLA 4PL8A 3WEEB 3VEZA 4JD2A 4H5TA 4YDUC 3R9PA 2P9UA 4FOIA 2E1ZA 2QWRA 3UB5A 2D4WA 3SLCA 3H3OB 5F1XA 3AAPA 1BOTO 2F9TA 4H0YB 1U2VA 2YHWA 4H0OA 5AQUA 2P9SA 1NGDA 2Q0UA 1P8ZA 2P9NA 3QMLA 4EFHA 3HZ6A 3VEWA 4FOEA 5EVZA 5E26A 3CETA 3ATUA 2A41A 2CH6A 2ASMA 3VEOA 4BR7A 2GELA 4B1VA 3HM8A 1V4TA 3AARA 3IDHA 1WOQA 4JAXA 3LDQA 5ADXA 5BN9A 4K43A 4CZMA 4H5WA 2Q2RA 3CQXA 3HI0A 4RTFD 5AZIB 3O8MA 3M6GA 2CGJA 5CE3A 3U8XA 5EOYA 3AAQA 1JCEA 4GNIA 1J6ZA 2GEMA 4H5NA 2E2QA 3DXMA 1BA0A 1D4XA 4JNEA 4BRMA 5BN8A 1RFQA 3LM9A 2NRHA 1V4SA 3RSEB 3LDLA 1YXQA 4IJAA 1NMDA 3WUHA 1XQSC 4WQ5A 2IVPA 2Q31A 1NM1A 3G25A 4BROA 4C23A 2V52B 3LDNA 3C7NA 5AZJA 5I9EB 1JCGA 1NBWA 3LM2A 1QQNA 4BR9A 1TUUA 2ZWHA 5E84A 1GLDG 2FF3B 4BRAA 1DKGD 3D7EO 2ASOA 1YUWA 3CQYA 2P9SB 3BF3A 3CJBA 4B1XB 4O5FA 2AP1A 2Q0RA 4K25A 3L6QA 4BC5A 1HKGA 1U6ZA 1ZC6A 3BF1A 3H1QA 3VEXA 5JICA 2A42A 2IIRA 3MK6A 2YJFA 1SQKA 1YVNA 3UKRA 3DXMB 4H5VA 2A40A 4EAHD 1HUXA 2P9LA 1R59O 1HLUA 3MN7A 4FWRA 2YCHA 4BG9A 2IVOA 4BG8A 4FWKA 2CGKA 4E1JA 4Z94A 3M3ZA 3VF2A 1T6CA 5KQDA 3WXKA 2QWOA 4M63C 3M1FA 4WYBA 3C0BA 2E2OA 5AQKA 4CZKA 2FSNA 2ZF5O 1K8KB 3VGLA 2KHOA 5FPEA 3SK3A 3WXLA 3VENA 3U4LA 3BP8A 1MWMA 5AQWA 4CD1A 1BWFO 3FGUA 5AQQA 4BRLA 1KXPA 4BVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q82O 1ATSA 2O8CA 4BRNA 1W2BM 4JK9A 3L3UA 1QS4A 3SQ1A 3OYAA 3ASMA 1ASVA 2I7PA 4J2DA 3L4IA 1RCHA 1ASUA 3RRHA 4V19S 3TAEA 3TAMA 5CYQA 4H0PA 4JRQA 5JS2A 1E4FT 4JKDA 4CEBA 4CJRA 3GOIA 4AHUA 1UA0A 2O8DB 5EY4A 5C2FA 5CHIA 3FZMA 3OS1A 4DS5A 2D1KA 3VQCA 3NDKA 1EQYA 3F2KA 2V51B 2W42A 4N5SA 1Z26A 5MLCQ 1WBBA 1P90A 4JK8A 1BQNA 4RW6A 4KHNA 1EP4A 4PKIA 1VSEA 3ZT4A 3HPHA 5EX5A 3A5NC 3HM9A 3RMBA 4HCBA 3O9QA 4CJKA 3DLBA 4DQIA 1RBVA 1S5JA 3EKSA 3EYZA 5KRTA 2R7YA 3AO1A 4Y1DA 5KPRA 3ZSOA 1S72N 1TL3A 3CMAN 3CERA 5KGWA 4Z4CA 3DLEA 4LF4K 4NYNA 4BRHA 2HHTA 3DLGA 4W5NA 4O0IA 4H03B 3KK2A 4M3ZA 3D2EA 1XI1A 2ZM6K 1MU2A 4JV5K 1DTQA 3A5OC 3KHYA 3Q7BA 1MDUB 1C0FA 3CJ1A 2YKMA 1A5VA 4CGIA 1SV5A 4OPJA 3D2FB 4YORA 4FJIA 3WNGA 1DEJA 4DUYK 4M42A 4XH4A 2KZMA 2HSTA 3O08A 4KFBA 1YJ9N 2A6AA 4JI2K 2LSNA 4KH6A 4JN4A 3ULEB 1KQSM 4J2BA 3GE1A 3G0ZA 1VQON 1QHTA 2XO7A 4FLTA 1WSHA 3VESA 4FJ8A 4L3QA 4OJRA 1BDGA 4A61A 1C0TA 4CJWA 4CZGA 5FLXO 4ISGA 4FSVA 1QHAA 4HCCA 3ZEUA 4HWIA 3TAGA 5BR9A 4FM0A 4RW9A 1VQKN 3VETA 1IG8A 2OTLN 2VG7A 3O80A 3K9KA 2P9NB 4WCEL 3S9HA 4CHZA 4IG3A 4LF9K 5AQRA 3RMAA 1I39A 4B1ZA 3SQ2A 3NF8A 2QWMA 3K9JA 5D3GA 1CLQA 5A2QO 1W7AA 4KB1A 4O8UA 2IVNA 1LW0A 5AQZA 4BRCA 1ATNA 2H3GX 4DQPA 4KBOA 1X1PA 1NK5A 4LSLA 4IG0A 1C0MA 2VWBA 3K5LA 2ATQA 4KPYA 1QSYA 3G71N 1EX4A 3EE9A 3U3YA 3P38A 2FF6A 4O44A 1ASWA 1KCFA 3CCJN 4YOXA 3FZKA 1VHXA 3MDQA 1IBLK 3ZSZA 2UUAK 2FSKA 2E2NA 5FPNA 3ZX0A 1LV5A 2Y1IA 1EO1A 3OYEA 4DTXA 3CI5A 2QKBA 2WBNA 3V6DA 3H6EA 3CJCA 4HTUA 4OPKA 1NLVA 1CZ9A 1NJXA 4BQLA 3CHWA 3PX0A 3PO5A 4JI3K 3MN9A 5C2DA 2P9PA 4PL7A 4FLWA 3OBYA 3DLHA 3KK1A 4EP5A 4CJUA 3W0LA 3THVA 3WT0A 4E89A 4CF2A 1JLGA 2DFEA 2HBKA 1O1WA 1TV6A 3E9LA 1NGGA 3L2VA 3CPWM 3VGMA 2YHXA 1KAYA 4H0XB 5KRSA 3QICA 2GUPA 1FW6A 1Z6RA 4DV5K 1QSSA 2CH5A 1WSEA 1NOZA 1FKOA 3VEYA 3SJHA 5JLFA 4WFNL 1OKJA 3LZJA 3P83D 3K57A 1S6QA 4CHOA 5CY4A 3WXIA 4ZTFA 4OKKA 4JI5K 3LDSA 4HUFA 4CJTA 4FZYA 2GX9A 1ZXOA 3KIOA 3LL3A 1NK6A 5J2NA 5CYMA 1O13A 4B3RK 4PUOA 5FRNA 2O8BB 1GLBG 3LAMA 3I0SA 3F73A 4AHSA 3BZCA 2NRWA 1BHLA 3LP1A 3NBPA 1BISA 4QS8A 4IZ9A 3S3MA 3OYHA 3CJAA 3H45C 4A5BA 1YHQN 4CZFA 4E7JA 5I42A 4DR7K 4GVEA 4DR5K 3V4IA 2X78A 5GINA 4ID1A 3AA4A 4BC2A 2A3ZA 3LALA 4BRFA 1TVRA 1KVCA 5KPZA 2BUPA 3AO3A 4AM7A 3NF7A 2QI2A 2I7NA 4JS5A 3BDPA 1NJZA 1N34K 4OPHA 1UWBA 1T3VA 2E5LK 4B9UA 4R79A 4A5AA 3NH1A 1JXEA 2RHKA 4YOWA 3IAYA 3KK7A 3DOLA 4PKHA 4XH1A 4KTWA 1HRHA 2NRRA 3ZETA 4O55A 4CF0A 4F3OA 1REVA 1XMOK 4JD2A 4H5TA 4AHTA 3K5NA 4YFUA 1TKXA 1VQNN 2E1ZA 2P1JA 5BR8K 1Q86O 1XMQK 4H0YB 2YHWA 5AQUA 1EETA 1WSJA 3KWGA 1P8ZA 2P9NA 3QMLA 2XY7A 1VAZA 2Z1HA 4EFHA 1VQ5N 4KHPK 3HZ6A 3LP2A 1VSMA 4CJEA 2HHVA 3J80O 3VEWA 3DRPA 4M3UA 1WAJA 4E0DA 2A41A 2CH6A 3VEOA 2NRZA 2UUBK 2GELA 4B1VA 3HM8A 3IDHA 3CPEA 4JKGA 1RBSA 3AA3A 3ZT3A 1VQMN 1C1AA 4H5WA 3KLHA 3T19A 3ITHA 3SPYA 3CCUN 1VSLA 3OJSA 3CMEN 3O4QA 2E2QA 3DXMA 4Z4IA 2FBTA 1BA0A 1D4XA 3LWLA 1KLMA 3TANA 3KD1E 3L3VA 2VQEK 4JKHA 4A57A 3CM5A 1NMDA 3PSIA 5FDLA 1N33K 1I3AA 4BROA 4E7KA 1HYVA 3PX6A 1BIZA 3AVBA 3O4NA 2O8CB 1TL1A 2PFUA 4ZHRA 1JCGA 3D45A 3MAQA 1IBKK 2DY4A 1QQNA 1A5XA 1SL0A 5E84A 4BRAA 2KQ2A 2ASOA 2P9SB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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