2NRHA

Crystal structure of conserved putative baf family transcriptional activator from campylobacter jejuni
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
208
structure length
192
Chain Sequence
b'LLLCDIGNSNANFLDKYFTLNIDQFLEFIFYINVNEHLKEHLKNQKNFINLEPYFLFDTIYQGLGIDRIAACYTIEDGVVVDAGSAITIDIIHLGGFILPGIANYKKIYSHISPFNTQVSLDAFPQKTMDALSYGVFKGIYLLIKDAAQNKKLYFTGGDGQFLANYFDHAIYDKLLIFRGMKKIIKENPNLL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Transcriptional activator, putative, Baf family
publication title Crystal structure of conserved putative Baf family transcriptional activator from Campylobacter jejuni
rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 59
structure length 192
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrhA01
3VGMA 3ULEA 4RCHA 1X3MA 3CJCA 2IIRA 4IZ9A 2Q1NA 1S22A 4IJAA 3ID8A 4HTLA 3IDHA 4PL8A 2IVNA 3VF2A 3CJBA 1IJJA 1BO5O 1NM1A 4B1VA 2P9PB 3HM8A 1HJOA 3EO3A 3VEZA 1GLLO 2Q31A 3KVGA 3J8AA 1SZ2A 4CZHA 4BG9A 5BRDA 3EZWA 5AZIB 3RSEB 2YHXA 4BRAA 2YJFA 3IMXA 3WXLA 3AARA 2ZWHA 5AQUA 4BC2A 3U9ZA 1QHAA 4JHDB 5AZJB 3C7NB 1QZ6A 2DPNA 2NLXA 2E8AA 3QBXA 4XH5A 1NGAA 1JCFA 3O5BA 2FSNA 4H5WA 3CJ9A 1G99A 1LCUA 3A5OC 4BVPA 3H45C 1TYQA 4EFHA 3ENOA 4BRHA 1Z6RA 3G25A 1OKJA 4PKIA 5AFUA 1Q18A 3VEVA 3MN6A 1Y64A 3SK3A 3VPZA 4BRDA 2GTDA 2CH5A 2QW9A 3HBTA 4O5FA 4BRCA 1IG8A 1KAYA 3DXMB 4BREA 4AM6A 1GLFO 1NMDA 1P8ZA 3D2FB 1HKCA 4B9QA 1C0GA 3UKUB 3WXJA 4EIAA 3H1VX 4FWKA 4K42A 1ATSA 3CQXA 4B1ZA 4XEIA 4H5VA 1U2VA 3QBWA 2Q0UA 4RTFD 4B1XB 3TPQA 4FWMA 2V7ZA 2QWNA 1QQMA 3GDQA 3RSEA 4BC3A 3IFRA 4H5NA 4A61A 3BP8A 3ULEB 5AQHA 4IO8A 4JHDA 5AQVA 3KHYA 3VGKA 5AZJA 1NGGA 2Q36A 2E2QA 2FSJA 2PAVA 2V7YA 2NZTA 2VCPA 3UB5A 3WXKA 4BRQA 1BG3A 1BA1A 3CI5A 3DXKA 2Q0RA 3HSCA 4PL7A 4BC5A 4CBUA 4CZGA 2ASPA 3W3DA 3CERA 2ASMA 3LDQA 1X3NA 2NRHA 4CJ7A 1NGHA 3H3OB 2H3GX 1S3XA 2UYTA 1BDGA 1R59O 4BR0A 5F1XA 5FPMA 4H0XB 1X9JA 2QWLA 3H1QA 5JICA 3EKSA 4A2BA 4JAXA 5AQGA 3A0IX 2P9NB 4IXCA 2GEMA 4JD2A 1TYQB 4LC9B 1XC3A 2PBDA 1BOTO 5E26A 3ATUA 1GLDG 1SQKA 1J6ZA 2P9UA 3FLCO 1GLEG 4XH1A 5AQJA 3LDLA 3CJ7A 3AY9A 2CGKA 3U9DA 2HOEA 5ADXA 4BROA 2IVPA 3DJCA 4KBOA 5BN9A 2F9WA 3GL1A 3FFKB 2VWBA 5AQLA 3BF1A 1QZ5A 1GLJO 4FSVA 1DEJA 3MK6A 1NGJA 2A40A 4YDUC 1ATNA 4BRGA 1NGDA 4FPBA 5BPMA 3O1WA 2VYPA 3W0LA 1TUYA 3AAPA 3M3ZA 1U2VB 2YI1A 5BPLA 4CZJA 1GLAG 5KQDA 5F0XA 4EAHD 4FO0A 4DB3A 3QB0A 2E20A 5KQ8A 2E2PA 1HKGA 2Q2RA 2HMPA 3LDOA 4IWVA 2A3ZA 2ASOA 5EVZA 2CH6A 2GUPA 3FZHA 5AQFA 2P9NA 4FPAA 3VGLA 1KAZA 1MA9B 3QFPA 3WQTA 3DXKB 3SLCA 2FF3B 3CJAA 5AQWA 4CBXA 2A5XA 3LL3A 4C23A 5JMVA 3VETA 4BQZA 1TUUA 5LY3A 2P9KB 2KHOA 5AQXA 2GWJA 4WQ5A 4M7YA 3ZEUA 4WQ4C 4ISFA 1HX1A 3ENHA 1YVNA 2E1YA 3LDPA 5BREA 2CGLA 1KXPA 1JCGA 4QS8A 4CD1A 3MN5A 4BC4A 5FPDA 5EOYA 4JD2B 3EL2A 2ITMA 3A5LC 3L6QA 4BRMA 5LJWA 3FZFA 4L3QA 2D0OA 2YJEA 2V52B 2GWKA 1LOTB 3I33A 4MO5A 2P9UB 5EY4A 2IVOA 5KPRA 5AQPA 3F9MA 3HI0A 3WEEB 3L4IA 2AA4A 3QFUA 2F9TA 4CZMA 2ZF5O 4BQLA 4PKGA 3WUHA 1QQNA 2YHYA 1NGCA 4M7XA 3WQUA 1V4TA 3S41A 5AQYA 3BEXA 3DWLA 2E1ZA 3MN7A 4BRNA 4CI6A 3ATVA 4JNEA 5ELZA 2W40A 2BUPA 3R8EA 2P9KA 4E1JA 3EKUA 3HZ6A 3SJHA 4FWRA 3VF4A 3VEWA 2FLOA 3JS6A 1YAGA 3ZX2A 2AP1A 3IUCA 1GLCG 4DCHA 1KAXA 3WT0A 1HKBA 4EHUA 1NGBA 1XQSC 4FWOA 5BRFA 2W41A 3M1FA 1ESVA 3O4WA 4H0OA 5AQMA 3R9PA 4H03B 1ZC6A 4CZLA 3A5NC 3CIPA 3MMVA 4HWIA 2D0PA 3BF3A 4K43A 5BR9A 3FGUA 3UKRA 2FSKA 5F2RA 3WEEA 3FE1A 2Q97A 3ZEUB 1K8KA 5AQNA 4FWQA 3CHWA 1NWKA 5CE3A 1Z05A 3FZLA 4H0YB 4I6MA 3UE5A 1ATRA 3L0QA 5AQSA 2E2OA 4BRFA 2J4RA 3HTVA 5EX5A 3D2EA 1NLVA 2GELA 3DAWA 3BUZB 4BR5A 5BN8A 3ZETA 4H5TA 3A5MC 5AFUH 4AM7A 2P9LA 3WXIA 2QWRA 1U6ZA 1BUPA 1YUWA 1QQOA 4H5RA 1NGFA 4MO4A 4NO7A 4BR9A 2QM1A 3VEXA 4CD3A 3KZBA 5BRHA 1BU6O 2FF6A 1HPMA 3MDQA 3VENA 2QWQA 1ZXOA 3O1BA 3FR0A 2V51B 2D4WA 4GNIA 5JLHA 1C0FA 2P9SA 4WYBA 4J8FA 4MLEA 3VERA 4BVOA 3GBTA 3I8BA 4FWSA 1RDWX 3VF6A 4FL9A 1NGIA 4QS7A 3GE1A 4K25A 5E84A 2D1KA 2FXUA 3LDNA 5AQQA 5I9EB 2P9IA 4ISEA 1WOQA 5FPEA 3O08A 4B1YB 4QS9A 3CQYA 3C0BA 3MN9A 3VESA 4BGBA 4CZKA 3LM2A 4CZIA 5AQZA 2HF3A 3ZX3A 3QDKA 1T44A 1RFQA 3CJ1A 3FZMA 4CBWA 2YCHA 2QXLA 4DQ8A 1YXQA 3B8AX 2QWPA 3GG4A 5AQRA 3JXUA 2I7NA 1HLUA 4BRPA 2A42A 1BWFO 2WUSA 5AR0A 3U4LA 1MDUB 4YDUA 1RGIA 4H0TB 5AQKA 4IJNA 3D7EO 2OANA 4BR7A 4XH4A 2CGJA 3R6MA 3H3NO 4FWNA 3H6EA 4A2AA 4CZEA 3U8XA 3UKRB 3EN9A 3OHRA 1K8KB 1E4GT 3TU5A 1DKGD 5BPNA 4BR2A 4I6MB 3VOVA 5AQOA 2QWMA 2YHWA 2I7PA 1GLBG 4RWTA 5FPNA 1NGEA 4MLHA 4H0VB 1CZAN 2P9PA 1DGKN 3D2EB 4FWPA 4BRKA 2QWOA 3CETA 4ISGA 4BG8A 3O6WA 2BTFA 3ZETB 1JCEA 3SMPA 5EXWA 4BR4A 4FOIA 3LM9A 4JN4A 2P9LB 5AZIA 3M6GA 4M63C 4CZFA 3GOIA 1T6DA 5ADXH 3C7NA 3FZKA 4K41A 3VEOA 1D4XA 1MWKA 4WQ4A 2P9SB 2E2NA 3QMLA 3MCPA 1SAZA 5JLFA 1BA0A 4H0PA 2ZGZA 5TKYA 3ZX0A 4FOEA 3SMSA 2P9IB 5AQTA 4PKHA 2EWSA 3DXMA 1HUXA 5KPZA 5LJVA 4A62A 3P4IA 3AAQA 3H46O 3D2FA 1EQYA 1NBWA 2ZGYA 1E4FT 1MWMA 5KPTA 4BRIA 3UKUA 2HF4A 4B1UB 4GY2B 2A41A 5B8HA 1T6CA 4B1WB 4F9OA 4DHYA 4Z94A 2E88A 4NB4A 4O8KA 4BRLA 4Y0WA 1V4SA 3A8YA 4BGAA 1ZBSA 5AQIA 3VEYA 4FWLA 4EHTA 3QICA 1WUAA 4WQ5C 3O8MA 1XUPO 2A6AA 3O80A 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VGMA 3KKRA 3AVBA 4Z4IA 1OVYA 2Q1NA 2KZMA 2HHXA 4ILGB 4E7HA 4PL8A 3IDHA 4FJNA 1Q7YO 5KRSA 4DV4K 1BQMA 1NM1A 3N4PA 4EP4A 4FK2A 3CCLN 1W9HA 4B1VA 2QKKA 1HJOA 3EO3A 3I0SA 4WF9L 1HNIA 1DLOA 3QIPA 4O0JA 3THXB 4CZHA 3ZLJA 2RPIA 3O3GA 4DWIA 1VSLA 4DQQA 1C6VA 3T7ZA 1XHXA 3AARA 3V1QA 4Q5VA 2DFHA 3AVFA 3U9ZA 2XY5A 1QHAA 3LP1A 3LALA 1JXBA 4OKKA 1LW2A 3AVHA 4QOZB 1KVCA 4DV5K 4BRHA 4CFBA 2IC3A 4CGDA 1YT3A 3VEVA 3MWPA 3SK3A 4O8UA 4LF7K 3LP2A 1ZYQA 1T7PA 2X6SA 2OCEA 4BE0A 1GOAA 1GLFO 4JI6K 5C42A 4K0KK 4DR4K 4PWDA 3L2WA 2HHWA 4DR3K 1UOCA 3CYMA 4CGGA 4AH9A 3OYNA 3RRGA 1RT5A 3WXJA 3ZCMA 4EIAA 3CCSN 3DOKA 5KRTA 4MQ3A 4H5VA 3ZSYA 1RTJA 4B1XB 1K6YA 3QEIA 3MCAB 1A5WA 4FWMA 3RSEA 4OKJA 1CXUA 3DLLL 1RNHA 4IO8A 4XIUA 1NGGA 4LF9K 1YHQN 3UB5A 4R79A 1BG3A 1XMQK 3HSCA 4C8KA 3C6TA 4AF1A 3BZKA 3OBYA 4CZGA 1QSSA 3CERA 3CCQN 1X3NA 2IGIA 4CJ7A 2O4GA 5F1XA 2UXDK 1O13A 3AVGA 3QERA 2QEXN 3DRPA 4JKGB 1XNQK 2F4VK 3OS1A 1L3VA 4IOCL 1X9JA 2KFZA 2QWLA 2UXBK 5CYMA 2G8FA 4BWJA 3EKSA 5JICA 5AQGA 2XHBA 2P9NB 4JI8K 3HL8A 1FKPA 4JD2A 4A5AA 3K2PA 4C1NK 3HT3A 4CEQA 1XC3A 5I3UA 2WFBA 3L2RA 1NK5A 4CCHA 4KI6A 3ATUA 3FLCO 2P1JA 1WLJA 4XH1A 5AQJA 3LDLA 3SUPA 2CGKA 4JKFA 4BROA 4KHSA 4KBOA 2F9WA 3SQ4A 4LF4K 2A1SA 2GUIA 5BPMA 1TL3A 1TUYA 3ZT2A 5BPLA 4N5SA 4J2AA 4CF1A 5GAEP 4N56A 2QK9A 3QB0A 3CCMN 1NJXA 2HNYA 3M8SA 2XY6A 3SBGA 3FZHA 5AQFA 4FJ7A 4KH6A 3RMCA 3WQTA 4MDAA 3SLCA 4CBXA 1QSLA 4I9LA 2A1RA 5J1EA 5JMVA 2E6MA 4BQZA 1WAFA 1TAQA 4WFAL 4U7BA 4WQ4C 1YF5L 4FLVA 1K9MO 1S1VA 4DTXA 3M8PA 2HBJA 3P5JA 4CJTA 1X9MA 4B9NA 4BC4A 3DLHA 3QEXA 1YI2N 3EE8A 4MO5A 4FLYA 1RDUA 4DV1K 4EZ6A 5AQPA 1HNWK 1NKEA 4FLTA 3J7AP 3WEEB 2NRRA 4N76A 1REVA 2AA4A 3QFUA 2F9TA 2ZF5O 4JKDA 4BQLA 3MEEA 4O4GA 3IAYA 2X78A 5TKWA 3WUHA 1QQNA 1WB9A 2D0CA 4M7XA 3RVCA 4E0DA 2EX3A 3BEXA 2DFEA 1Z25A 3DWLA 1JLAA 3MN7A 1LV5A 2HHQA 2BUPA 3EKUA 2WOMA 1DT9A 2FLOA 1KFDA 3ZX2A 1GLCG 3P39A 1EXQA 4EHUA 1NGBA 1XQSC 1TGOA 3SV4A 2W41A 3SPZA 4IDHA 5AQMA 4CGHA 4H03B 2YNIA 3A5NC 3CIPA 4C1NI 2D0PA 3MAQA 1QTMA 4PHTX 4KB0A 4K43A 4IG3A 5HROA 3LANA 5BR9A 5IWAK 3FGUA 5C10A 3VQAA 4DS4A 4B9SA 3UKRA 4RW9A 5JVHL 3M5RA 4BDPA 1K8KA 4FWQA 4LFAK 3MXIA 4I6MA 4H0YB 3L0QA 4KFBA 1VSDA 3HTVA 2XY7A 3NE6A 1NLVA 3DAWA 4KHNA 5IT9O 4DF8A 3L2UA 1BIZA 2ETJA 3WXIA 1U6ZA 4O5BA 1RTHA 4BR9A 3DOLA 4DG1A 4DQRA 4E19A 3KZBA 3TAEA 5HL7L 1C1CA 2FF6A 1JLFA 4FLUA 2JGUA 3Q7CA 4DV2K 2BDPA 3FR0A 4JKHA 4Z4HA 2V51B 4GNIA 3SUNA 1ZBHA 3RMAA 3OS2A 3GBTA 1NGIA 1HJRA 4DTPA 4WCEL 4IOXA 3E9OA 1Y97A 2P9IA 1WOQA 3O08A 3AVIA 4IOAL 1ZBFA 1SV5A 4DTUA 3R1XA 3PO4A 1WBDA 3PUFA 4DMNA 3TTFA 3ZX3A 1RFQA 3HYFA 2ZJPL 1L3UA 4ZHRA 3MXMA 1JJ2M 2O8FA 2KLAA 4YY3K 1DTTA 3A2FA 1SL1A 3HOSA 4IJNA 1YJNN 4LF8K 4BR7A 4DTMA 5CY4A 2HW3A 3HPHA 3H6EA 4CZEA 4YOWA 1JLBA 2UUCK 3OHRA 5KI6A 4BR2A 2AJQA 1S5JA 3J7YP 1W97L 4GV9A 5C2FA 4JRPA 5CR4A 3D2EB 4FK0A 3PX6A 3CETA 4ISGA 4BG8A 3O6WA 1ZBUA 3KIOA 3PIOL 1Q9XA 4BR4A 5EXWA 2VGMA 3KK1A 4FOIA 3THXA 3LM9A 1HQEA 1S1WA 2O8DB 3ZSRA 3M6GA 1KLNA 4M63C 3GOIA 3DLBA 4OKEA 3V1RA 3I55N 2RF2A 3NF6A 3TAQA 3THYB 4UY8O 1B9DA 4NXMK 2F7TA 4DFKA 2G8IA 4W5QA 3QMLA 4CF2A 1SAZA 5JLFA 2OPRA 4IEEA 1RBTA 4J2EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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