5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
3S41A 4BC2A 1GLLO 3ZX2A 1NGIA 2V51B 4FWQA 2A5XA 4BREA 1BOTO 3I33A 2D0PA 3R6MA 3CJCA 2QWMA 1DEJA 3AARA 3FZFA 5AQTA 2GELA 3O8MA 3QDKA 2Q0RA 5AZIA 4FO0A 1T44A 4M7XA 1E4GT 3VETA 5AQXA 3ATVA 1NGBA 4BRNA 1NGFA 5AQQA 4CD3A 4M7YA 3LM9A 3OHRA 3HTVA 4RTFD 4B9QA 3GL1A 2A40A 4BQZA 3O5BA 1HJOA 4BGAA 1GLCG 3FZMA 4FWKA 2ASPA 3SLCA 4HWIA 1ATNA 2YHYA 4A2BA 3A5OC 3VPZA 3H3NO 5AR0A 4LC9B 3M1FA 3VERA 2GUPA 4FOIA 4K25A 3EKSA 2UYTA 2YJEA 3D2FA 1RFQA 2FXUA 3CIPA 1V4SA 4QS9A 2P9KB 1J6ZA 2NLXA 5EVZA 5BPMA 1QQMA 4BRPA 1KXPA 4E1JA 4Z94A 2Q97A 5KPTA 1GLJO 2HF3A 5LY3A 3VEWA 2ASMA 3A5MC 5CE3A 5BR9A 1ATSA 1NBWA 3O1WA 3LL3A 1NGCA 2CGLA 4BR5A 3W0LA 5AQHA 1WUAA 2FSKA 4M63C 3VGLA 3WT0A 3EL2A 1ZXOA 1JCGA 5BRFA 2HF4A 4MO4A 3SJHA 5E84A 3AAQA 1QQNA 5EXWA 3CJBA 3DWLA 4MO5A 3RSEB 3KZBA 3UKRB 4XEIA 3ZEUA 4EIAA 3KHYA 2I7NA 3O08A 2A41A 3EO3A 4YDUC 1OKJA 3L6QA 2PBDA 3VOVA 4ISGA 1HKCA 4PL7A 3EN9A 1BA1A 4B1WB 2CGKA 2DPNA 5ELZA 2E8AA 3CQYA 4RWTA 3MN7A 4PKHA 3WXIA 3ENOA 1E4FT 2Q0UA 2IVNA 3FLCO 4GNIA 2P9SA 2NZTA 1SQKA 3LDLA 2FF6A 1K8KA 3RSEA 1NWKA 3CI5A 3UE5A 4H5WA 1GLEG 2V7YA 4WQ4C 2YJFA 3QICA 2V7ZA 4MLEA 2GWJA 2QWOA 5AQKA 2E2NA 2NRHA 5FPDA 3U9DA 4NB4A 3WUHA 1X9JA 3CERA 1NMDA 3GBTA 3FGUA 3H46O 3H1QA 4B1VA 4BRKA 5BRHA 3VGKA 2Q1NA 3BF3A 1NGHA 4JD2A 4FWRA 3IDHA 4DCHA 5AZIB 4FSVA 5AQJA 1BWFO 5KQDA 4BG9A 2E88A 5BPLA 1TUUA 5AQNA 4JN4A 3MN6A 4PKIA 4K42A 4CZFA 3LDNA 3J8AA 3ZX3A 2BUPA 3TPQA 2FF3B 2IVOA 3BF1A 4WQ5C 3VENA 4FWNA 1GLAG 3EKUA 1ZC6A 2E2PA 1BDGA 4A2AA 5FPMA 2H3GX 1S22A 4BC3A 5B8HA 2HMPA 5AQUA 5F2RA 3IFRA 5ADXA 1MWKA 4BVPA 3H1VX 4O5FA 4H03B 4MLHA 4FWOA 3D2FB 2E20A 4CZGA 2QWNA 3TU5A 5BREA 3WXLA 4FOEA 4CD1A 4BRFA 2Q36A 1NLVA 1EQYA 2ASOA 3CJ9A 5EOYA 4F9OA 3D7EO 3A0IX 4H5NA 4H0VB 2J4RA 4K41A 3WXKA 4BVOA 4B1YB 4BRCA 2YI1A 3WQUA 3AY9A 1TYQA 2P9UB 3QFPA 4CI6A 1U2VB 1GLDG 4BRHA 4IJAA 3H3OB 2YHWA 5AQYA 1D4XA 5AFUH 4NO7A 2P9LA 4AM7A 1HUXA 1ATRA 3ZEUB 3R8EA 4DHYA 4H5VA 3VGMA 2GTDA 5JMVA 3IUCA 3GDQA 1CZAN 2F9TA 5BPNA 4H0OA 3H6EA 4IO8A 1TUYA 3MN5A 4CBXA 3A5NC 3WEEA 3CQXA 2P9UA 3UKUA 4CZJA 1U2VA 3DXMA 4BQLA 3I8BA 1SZ2A 2V52B 3VEYA 1Q18A 5BN9A 2Q31A 5AQRA 3JXUA 2P9SB 4H5TA 3H45C 3MCPA 5AQZA 1K8KB 4H0XB 1QQOA 1P8ZA 1S3XA 4AM6A 3O80A 2VWBA 5AQGA 1ESVA 3VESA 1RGIA 3F9MA 3MN9A 2D4WA 2ZWHA 2F9WA 2WUSA 2Q2RA 1WOQA 3HBTA 4BG8A 1X3MA 4WYBA 2ZGYA 3GG4A 5AQFA 4FL9A 4CZKA 2BTFA 5EY4A 1SAZA 3ZETA 3GOIA 3P4IA 4JD2B 4BR4A 2AP1A 4J8FA 4K43A 3R9PA 5KPRA 4IJNA 4BGBA 4CZHA 4H0YB 5F1XA 3M6GA 3EZWA 5E26A 2E2OA 3FE1A 5ADXH 4BRGA 2P9IA 4QS8A 2GWKA 4GY2B 3O4WA 3DJCA 3FZHA 4FWPA 2CH5A 1HPMA 1Y64A 4PL8A 1LCUA 3DXKA 4CZEA 3U9ZA 2E2QA 4EFHA 3CHWA 3VEOA 1BA0A 2YCHA 1Z05A 4B1UB 3QFUA 3HM8A 4DQ8A 1BU6O 4EHTA 4WQ5A 2QXLA 3ID8A 4C23A 2KHOA 4H5RA 4DB3A 1V4TA 1C0GA 2I7PA 3C7NA 4FWSA 4CZMA 4JHDB 2CH6A 3VF4A 3W3DA 5I9EB 4A62A 4O8KA 5KPZA 4XH1A 4CZIA 1TYQB 1GLBG 2E1ZA 3DAWA 4BROA 5AQSA 5AZJA 2YHXA 3IMXA 2ITMA 3LM2A 4H0TB 2OANA 1U6ZA 3QBXA 1DGKN 3VF2A 2D1KA 4RCHA 3WQTA 4B1ZA 2P9LB 2D0OA 3JS6A 5JICA 1KAYA 4FWLA 4QS7A 4B1XB 4JAXA 4H0PA 2FSJA 3VEVA 3U8XA 3CETA 4BRAA 1NGAA 1BG3A 4JHDA 4BC4A 1XQSC 2ZGZA 1R59O 5FPEA 2P9PA 4BRMA 1XC3A 3FZKA 3ZX0A 3WEEB 3UKUB 3MDQA 3WXJA 3DXMB 1T6CA 3FZLA 3LDQA 3FR0A 3GE1A 3HI0A 5BRDA 3HZ6A 1NGGA 1YAGA 3ULEA 1BUPA 3A5LC 3MMVA 4BRQA 2GEMA 4BR7A 3KVGA 3LDPA 4HTLA 2EWSA 1DKGD 3CJAA 2AA4A 1LOTB 4XH4A 1GLFO 4IXCA 4IZ9A 1BO5O 5AQMA 2QM1A 5BN8A 1C0FA 3L0QA 3HSCA 3G25A 2VYPA 4A61A 3QB0A 3BEXA 3QMLA 4ISFA 2ZF5O 4FWMA 4YDUA 2QWRA 1KAXA 3SK3A 4CBWA 3MK6A 3ZETB 1NGEA 4JNEA 3AAPA 2PAVA 2QWQA 5JLHA 1NGDA 2W41A 4BC5A 2QW9A 1MA9B 4FPAA 4CBUA 5AQVA 3D2EB 4FPBA 5TKYA 3ATUA 3VEZA 1MDUB 3M3ZA 4BRLA 3C0BA 4EHUA 1X3NA 1ZBSA 2P9IB 4EAHD 4PKGA 1T6DA 1Z6RA 4WQ4A 1IG8A 1QZ5A 1HKGA 3DXKB 3LDOA 1HLUA 4CZLA 3L4IA 2P9KA 1KAZA 4ISEA 1IJJA 5AQWA 3ENHA 4I6MB 3UB5A 4CJ7A 2IIRA 3CJ7A 4BR0A 3D2EA 2QWLA 1QZ6A 4BRIA 5AQIA 1YXQA 5AFUA 5LJWA 5KQ8A 1JCEA 4XH5A 3VEXA 5AQPA 3C7NB 3U4LA 2IVPA 1NGJA 2A6AA 2FSNA 5JLFA 1HX1A 1MWMA 2W40A 5LJVA 5EX5A 5AZJB 1H1VA 3UKRA 3O1BA 3A8YA 2A3ZA 2P9NB 3FFKB 2A42A 4Y0WA 2CGJA 4BR9A 4I6MA 4BR2A 3BP8A 3SMSA 2FLOA 5AQLA 4L3QA 2HOEA 4IWVA 5FPNA 1HKBA 1YVNA 1JCFA 1QHAA 4BRDA 2E1YA 1NM1A 4KBOA 3O6WA 3VF6A 2P9PB 3CJ1A 1YUWA 3QBWA 3SMPA 2VCPA 3B8AX 2P9NA 5AQOA 3BUZB 1RDWX 2QWPA 5F0XA 1XUPO 1G99A 3ULEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ILHA 1GLLO 1KVBA 1NGIA 2KTQA 4BREA 1BOTO 3I33A 1HNZK 4LH4A 2Z1JA 1GOCA 3PY8A 4CF1A 3SQ1A 4I7FA 3O8MA 3F9KA 4FJ9A 3K5NA 3QDKA 1JLEA 5AZIA 4FO0A 2LN8A 1NOYA 3ATVA 4BRNA 1NGFA 4CD3A 1RNHA 4WF9L 3GL1A 2A40A 4GVMA 2JDQD 1HJOA 4BGAA 2HBKA 4FYDA 1GLCG 3ZT1A 2VWJA 3CM6A 3VQ8A 4V1DC 1KVAA 1ATNA 4GVEA 3VPZA 3H3NO 4MDAA 4LFBK 4LC9B 3PV8A 5SWMA 4HUEA 3NF9A 4F4KA 5C2DA 1KCFA 3CMAN 3D2FA 1RFQA 2FXUA 2OZMA 4QS9A 4CJ4A 2P9KB 5D3GA 3PX4A 1GPTA 4CJRA 2HW3A 1IG9A 4C8NA 4FJKA 3LL3A 5M1OA 2HHXA 4X64K 5AQHA 1WUAA 3VGLA 3WT0A 1UWBA 1ZXOA 2ATQA 1REVA 5C25A 3KJVA 4DTOA 1AHOA 3SJHA 5E84A 4JS5A 3PSMA 3CJBA 5FROA 2IS3A 3RSEB 2YX6A 3A2FA 2R7YA 3KHYA 3E9LA 1W2BM 2GL1A 1OKJA 1QSYA 2YNFA 4ISGA 2KQ2A 5GINA 4CGFA 3MAQA 2CGKA 1OMYA 3NGYA 1QSSA 2E8AA 3CFOA 4E3SA 4CF0A 3CD6N 1BRZA 3DOLA 4DSFA 3ENOA 1SL2A 4DV3K 2IVNA 5C12A 3EY1A 1KVCA 2N2RA 4WCEL 3KP1A 3DLLL 2LKBA 4H5WA 4B8AB 4W5QA 5CZ1A 2UUBK 3DRPA 2DTUA 3ZSXA 2NRHA 1VQPN 2G8VA 3FGUA 4B1VA 4BRKA 5FRMA 5BRHA 1N34K 4O5BA 2IOCA 4FJ7A 3V81A 4FJMA 1TI5A 1ZFUA 5JVHL 4FJ8A 3C6UA 3IDHA 4DCHA 3OVNA 5AZIB 3Q7CA 3BGRA 5KQDA 4CERA 3V1QA 2O8DA 4E1NA 4DR7K 1JLFA 5BPLA 4JN4A 4K42A 1BIUA 3ZX3A 4DQRA 2QK9A 4YFUA 4CJWA 4JI0K 2FF3B 4FWNA 5EU7A 1GLAG 1RDUA 2YHAA 1F21A 2UXDK 4DF4A 1C0UA 1S72N 4A2AA 1IBMK 1S22A 3SUPA 1ZU3A 1DQ7A 4FK2A 1NKCA 4KHNA 3H1VX 4H03B 1S5JA 3P1GA 2VGNA 3D2FB 2E20A 4XJXA 5BREA 4X62K 3WXLA 4CD1A 1NLVA 1EQYA 2LJ7A 3V9WA 4WE1A 4H5NA 2UUAK 4BRCA 2YI1A 3ZCMA 4QAGA 1JXBA 2P9UB 3QFPA 4ZTJA 1AYJA 1GOBA 5AQYA 1HNVA 1B9DA 4AQYK 4GV6A 3T69A 3RTVA 3CCJN 1S1WA 2VQEK 3OBWA 3KK1A 2YILA 3AO4A 5JMVA 4IFVA 4IO9L 4H0OA 1TUYA 4B9LA 2C1GA 1VNAA 3AVBA 4YOTA 4OKJA 1BGXT 1CLQA 1U2VA 1VSEA 4HTUA 3CG7A 4E0DA 3I8BA 1CXUA 3VEYA 4AHVA 1LWFA 5AQRA 3JXUA 1RBVA 5CY0A 5AQZA 1KSPA 3S5TA 1RTJA 1QQOA 4A57A 4C8OA 1P8ZA 1S3XA 3TTFA 3DRRA 2X6NA 2VWBA 3THXA 3LP2A 5AQGA 3VESA 2WTUA 1RCHA 4KB1A 2WUSA 1LAWA 1KV0A 4M42A 4DR3K 4KTQA 3KOXA 2MN5A 1HMVA 1UGLA 1JLQA 2D0AA 4LD0A 4K43A 2E6MA 1YT3A 3PO5A 3HP9A 1I6FA 4OO1J 2O8BA 5KPRA 1IKYA 2KJAA 4DR2K 5ADXH 4CIFA 2YNGA 3K9JA 4CQKA 2P9IA 4QS8A 1HNIA 3O4WA 3SBGA 3DJCA 2P5GA 3N4PA 3PUFA 4KI4A 3TAFA 4CHYA 1Q9YA 3L4QA 4CZEA 4FK4A 2E2QA 3G0ZA 4YORA 3U3GA 3UIQA 4DU1A 1SNBA 1Z05A 2HHIA 3J7AP 3CCMN 2KKZA 1XC9A 1SL0A 3CQ8A 2P5OA 1YJ9N 2KZMA 3ZSWA 2KHOA 3I55N 1NG9A 1RT7A 1C0GA 2B5JA 2Y1IA 4FWSA 3O4QA 3LP0A 3SNNA 4OPAA 4Z4EA 4DV5K 2FC0A 2LSNA 4FZYA 3CCLN 5M1PA 2F8SA 3JS6A 1ICAA 4FWLA 4CEZA 4JAXA 4UQGA 3OYFA 1BG3A 3S9HA 1XQSC 3OYBA 1DJTA 4O0IA 1R59O 4BRMA 3FZKA 2FBXA 1I6GA 3ZX0A 1ASWA 2KYQA 1U48A 3MX2A 3WXJA 4FW2A 1CXQA 2QKKA 3K5OA 2NUBA 2KLAA 5CY4A 3A5LC 3V1RA 1NE5A 2MBKA 4KHPK 3LDPA 3PIOL 1NOZA 2EWSA 3CJAA 3I8DA 3AVFA 2AA4A 1FH3A 4CGHA 4IXCA 3THXB 3SI6A 3HSCA 4B3SK 3L3UA 3T19A 3G25A 3QB0A 1VQ7N 3AA3A 4LFCK 4FWMA 1ASVA 4MDBA 2ZJQL 1KLNA 4CBWA 5GADP 3MK6A 3BZKA 5I3UA 5JLHA 4EZ6A 1NGDA 4JI4K 4N41A 3SPYA 2OTJN 3WNFA 4AHCA 4E7IA 4BWMA 4H4OA 1B3CA 4FPAA 5M1KA 4CBUA 3D2EB 3QETA 4JKFA 4KAZA 5TKYA 3VEZA 3NBPA 1MDUB 5C2FA 1Z25A 3C6HA 3C0BA 2P9IB 4CEDA 1N36K 4CEFA 4JRPA 1Z6RA 3AA4A 1IG8A 3WXMB 1HYVA 3V9SA 3QIPA 1RILA 2NRTA 3SQ2A 1ZYQA 1KAZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ILH A;  1GLL O;  1KVB A;  1NGI A;  2KTQ A;  4BRE A;  1BOT O;  3I33 A;  1HNZ K;  4LH4 A;  2Z1J A;  1GOC A;  3PY8 A;  4CF1 A;  3SQ1 A;  4I7F A;  3O8M A;  3F9K A;  4FJ9 A;  3K5N A;  3QDK A;  1JLE A;  5AZI A;  4FO0 A;  2LN8 A;  1NOY A;  3ATV A;  4BRN A;  1NGF A;  4CD3 A;  1RNH A;  4WF9 L;  3GL1 A;  2A40 A;  4GVM A;  2JDQ D;  1HJO A;  4BGA A;  2HBK A;  4FYD A;  1GLC G;  3ZT1 A;  2VWJ A;  3CM6 A;  3VQ8 A;  4V1D C;  1KVA A;  1ATN A;  4GVE A;  3VPZ A;  3H3N O;  4MDA A;  4LFB K;  4LC9 B;  3PV8 A;  5SWM A;  4HUE A;  3NF9 A;  4F4K A;  5C2D A;  1KCF A;  3CMA N;  3D2F A;  1RFQ A;  2FXU A;  2OZM A;  4QS9 A;  4CJ4 A;  2P9K B;  5D3G A;  3PX4 A;  1GPT A;  4CJR A;  2HW3 A;  1IG9 A;  4C8N A;  4FJK A;  3LL3 A;  5M1O A;  2HHX A;  4X64 K;  5AQH A;  1WUA A;  3VGL A;  3WT0 A;  1UWB A;  1ZXO A;  2ATQ A;  1REV A;  5C25 A;  3KJV A;  4DTO A;  1AHO A;  3SJH A;  5E84 A;  4JS5 A;  3PSM A;  3CJB A;  5FRO A;  2IS3 A;  3RSE B;  2YX6 A;  3A2F A;  2R7Y A;  3KHY A;  3E9L A;  1W2B M;  2GL1 A;  1OKJ A;  1QSY A;  2YNF A;  4ISG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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