5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
1MDUB 3KHYA 3MN9A 4BRQA 4FPAA 3VEVA 1BUPA 1Q18A 1XQSC 4FWMA 4ISEA 2FXUA 3SMSA 5AFUA 3WXLA 2QWLA 4H03B 3F9MA 3ATUA 4O5FA 3O6WA 4FOEA 3VEYA 4HTLA 4BR9A 1SAZA 5AR0A 1WUAA 1J6ZA 2QWQA 1BA1A 3A5NC 2Q0UA 3U9DA 3VF6A 1BA0A 2A3ZA 2D4WA 3ZX0A 5BRDA 1U2VA 4K43A 3DWLA 2QWOA 1P8ZA 3UKUB 4C23A 2PBDA 5AQMA 4FWNA 4JHDB 4MO5A 3UKRA 1S3XA 1NGAA 2A42A 3ULEA 5TKYA 4BRCA 2P9LA 4QS8A 2P9SA 3VENA 2E8AA 1KAZA 1ZBSA 3AAPA 4DB3A 4EHTA 3WT0A 4PKHA 1R59O 3VGLA 4A2BA 4PKIA 5FPMA 2QWNA 4IO8A 5BN9A 4FWQA 5BR9A 3G25A 1BDGA 3MCPA 3GL1A 1BG3A 3OHRA 4E1JA 4FWSA 4BVOA 1NGDA 3M3ZA 5AQKA 3L6QA 3VEWA 5EVZA 4BR7A 2E2OA 3CI5A 1HKBA 2E2PA 3EL2A 3CJ9A 3MK6A 5ADXH 3DJCA 4CZEA 4F9OA 3DXMA 3R8EA 3ENOA 2ITMA 3QFUA 4BQLA 3LM9A 3QDKA 1NGJA 5AQJA 2IVPA 3QICA 4BRKA 3KZBA 1K8KA 4BGBA 4CZJA 2AP1A 3GE1A 5F2RA 2HMPA 3AAQA 1T44A 5AQTA 2NRHA 3B8AX 4CBUA 3ULEB 3MN7A 2P9NB 3H3NO 3IMXA 3EN9A 3WQUA 4CZHA 3MN5A 1NMDA 1HLUA 3CQYA 3UE5A 3W3DA 1NGCA 3C7NA 3A8YA 1Y64A 3GG4A 1KAXA 1NGHA 2UYTA 3WEEB 5KPTA 2E1ZA 4IZ9A 3LDLA 4H0XB 1ESVA 4A2AA 4GNIA 1NGEA 1HX1A 4NO7A 4DQ8A 5AQXA 3EZWA 3VF2A 3GBTA 1WOQA 5BPLA 1YAGA 1DEJA 2YJFA 1ATSA 3CIPA 1T6DA 3QFPA 3RSEB 4A61A 5AQFA 4M7XA 3FR0A 4BRIA 5LY3A 4MLEA 4H0YB 4CI6A 2HF4A 4BQZA 4FL9A 4EHUA 5F0XA 3O80A 3UKUA 2VYPA 3SJHA 5AQYA 2QXLA 4BG9A 1OKJA 1TUUA 4BRNA 2CH5A 2V51B 5AQIA 4WQ4A 3VESA 1K8KB 3W0LA 2P9LB 3M6GA 4XH1A 2FSKA 4BRHA 5AQRA 3BEXA 4BR2A 2P9SB 2I7NA 2Q97A 3H6EA 4B1XB 5B8HA 3LM2A 5AQGA 5EX5A 1MWKA 4XEIA 5AZJA 3VERA 4CZIA 2V7YA 1C0FA 3CJAA 2GWKA 2IVOA 3ENHA 5AQWA 3FZFA 4WQ5A 1NGIA 2BTFA 2QWPA 1QHAA 1NM1A 4PL7A 1ATRA 3KVGA 3AY9A 5FPDA 4FWOA 2YHWA 4FWPA 3RSEA 1LOTB 2A6AA 3FLCO 3SMPA 4EAHD 3ZETA 4LC9B 3WUHA 5AQPA 2FF6A 2A5XA 3DXMB 1BU6O 2QWMA 3LL3A 5F1XA 4H5WA 5AQNA 5BN8A 5AQQA 1ZC6A 4M7YA 1MWMA 5E26A 3BF1A 1Z05A 2YI1A 3I8BA 2GEMA 2HF3A 5AQUA 5KPZA 2BUPA 3L0QA 3WXIA 5JLHA 3C7NB 3CHWA 3D2FA 1IJJA 3FE1A 2E1YA 3WEEA 2Q36A 3VEZA 4BRFA 3CQXA 5AZJB 4AM7A 4CZKA 3ID8A 4BROA 4XH5A 1GLBG 1TYQA 1NGFA 4H0VB 4Z94A 4MLHA 4FSVA 3C0BA 5BPMA 5KQDA 3H1QA 1QQMA 4WQ5C 3EO3A 4H0OA 4B1YB 4B1WB 3ZX2A 4YDUA 3EKSA 4CD3A 1ATNA 3BF3A 1NGBA 2YJEA 3CJBA 3J8AA 4BC2A 1QZ5A 1BOTO 1S22A 4FO0A 2Q1NA 1QQNA 3UB5A 3R9PA 4BG8A 3A5OC 4ISFA 2ZF5O 4BRAA 4L3QA 4JD2A 4HWIA 2AA4A 3VF4A 3D7EO 3MMVA 4CD1A 4B9QA 3VEOA 3P4IA 4BRDA 2QM1A 4K41A 1E4FT 4IJAA 4Y0WA 3D2FB 3MN6A 5AQHA 2OANA 1ZXOA 2P9PA 3MDQA 4BVPA 5AZIA 4BC3A 5CE3A 3EKUA 3I33A 3CETA 3BP8A 1TYQB 4IWVA 4DCHA 4PL8A 3HBTA 4NB4A 3ZETB 5BREA 1HJOA 2ASMA 4H5NA 3R6MA 3U4LA 2CGJA 3HSCA 1E4GT 4CJ7A 4K25A 4FWKA 1NGGA 2Q2RA 3SLCA 1X9JA 4CZMA 4DHYA 4IXCA 5E84A 3H46O 2E2NA 1TUYA 3M1FA 4CBWA 2CH6A 4B1ZA 3VGKA 2NZTA 5AQVA 4I6MA 3H1VX 3QBWA 1CZAN 2Q31A 1KAYA 5LJVA 1BO5O 2CGLA 3HM8A 3JXUA 2ZWHA 1DKGD 1GLDG 4K42A 2EWSA 1QZ6A 2P9KA 1GLAG 5BRFA 5LJWA 4EFHA 1GLLO 2YHXA 4H5TA 3H45C 5AQSA 4MO4A 1RFQA 4BR5A 2DPNA 3LDOA 4CZGA 2VWBA 3LDPA 2YCHA 2V7ZA 4H5RA 4AM6A 2GWJA 3VOVA 4FWRA 2A41A 3BUZB 4JD2B 2J4RA 1BWFO 3CJCA 4H5VA 1C0GA 2FF3B 3ZEUA 5EY4A 1G99A 4H0PA 4BRLA 1IG8A 4YDUC 4I6MB 2HOEA 2W41A 1KXPA 5EOYA 4JN4A 1LCUA 1YXQA 3QBXA 3WXJA 2P9PB 4BR4A 2P9IA 5AZIB 3LDQA 3FZHA 2Q0RA 1GLCG 1X3MA 1U6ZA 1NLVA 5EXWA 3O4WA 3GDQA 4IJNA 2VCPA 3WXKA 2H3GX 4FWLA 5I9EB 5AQOA 5FPNA 3O08A 3O1WA 1XC3A 2FSJA 4FOIA 4CBXA 2P9UB 3CJ7A 5JLFA 3QB0A 2ASPA 2F9WA 3VGMA 4BC5A 3DXKA 4XH4A 4H0TB 4FPBA 4JNEA 3HZ6A 5ADXA 4ISGA 2D0OA 3LDNA 1YUWA 3U8XA 3HI0A 2GTDA 4JAXA 3SK3A 3TPQA 2GELA 3HTVA 3L4IA 1RGIA 1HUXA 4GY2B 2NLXA 3VEXA 3CJ1A 1SZ2A 4PKGA 2A40A 5KQ8A 1SQKA 1Z6RA 1D4XA 1V4TA 1GLEG 1XUPO 5BRHA 2IIRA 3FZKA 3AARA 1NBWA 3ATVA 2P9KB 4BRPA 5ELZA 1JCFA 2YHYA 3O5BA 4WYBA 4BR0A 4BRGA 4KBOA 2E20A 1EQYA 2KHOA 3S41A 4B1UB 5JMVA 4J8FA 2I7PA 4RTFD 1X3NA 3D2EA 2E88A 3GOIA 3JS6A 3IDHA 3UKRB 5AQZA 3O1BA 1DGKN 1JCEA 2V52B 2IVNA 3IUCA 5AQLA 3DXKB 3A5LC 2W40A 4O8KA 1NWKA 3CERA 2FLOA 4CZFA 4WQ4C 3FZLA 3ZEUB 3FGUA 1HPMA 3FZMA 4RCHA 2ZGYA 1QQOA 5FPEA 3U9ZA 3QMLA 1GLJO 5AFUH 1GLFO 2ZGZA 4BGAA 3VPZA 2PAVA 3IFRA 2F9TA 4QS9A 2P9IB 1T6CA 2D1KA 5KPRA 5JICA 1MA9B 1U2VB 4EIAA 4BREA 2QW9A 1YVNA 3ZX3A 2E2QA 4M63C 2ASOA 3O8MA 3A5MC 4QS7A 2WUSA 1HKCA 2CGKA 2QWRA 4BRMA 3H3OB 4JHDA 1H1VA 1V4SA 2FSNA 3DAWA 2P9UA 3VETA 1JCGA 3TU5A 2D0PA 3D2EB 1HKGA 3WQTA 4A62A 5BPNA 1RDWX 4B1VA 4CZLA 2P9NA 2GUPA 3FFKB 4BC4A 4RWTA 3A0IX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LWCA 4BRQA 3K2PA 1Q18A 1XQSC 4FWMA 2FXUA 3LP3A 3AVFA 4DR7K 5M1QA 4X66K 2ZJRL 3K57A 4FJLA 2QWLA 3CM6A 3ATUA 2D0AA 1YTAA 4FOEA 3VEYA 4HTLA 4BR9A 4CJPA 2QKKA 5AR0A 1WUAA 1J6ZA 5FLXO 2O4IA 1BA0A 1JLFA 4Q0BA 2D4WA 4LFCK 3L4QA 2ITGA 3SYZA 3PIOL 4CEAA 1L3UA 3QEIA 4B3OA 4CGFA 1SL2A 4JI2K 4FJJA 4FK4A 1SUQA 1P8ZA 2D0BA 1RT6A 5GIPA 3CQ8A 3HP6A 3HPOA 5GAHP 5KK4A 4GVMA 2JDQD 4FJ9A 4CF1A 1NJYA 2LY5A 4BE0A 4DB3A 4M3RA 4PQUA 5GAEP 2BH1A 4JKGB 1XI1A 1C55A 4LF6K 1EO1A 2YHAA 1TKDA 1L3VA 1R59O 3CM5A 5JS1A 4PKIA 5BN9A 1VK0A 4V1DC 1BDGA 3D45A 4LF9K 3C6UA 1NGDA 5AQKA 4BR7A 4H4MA 3S3NA 1KQSM 1WAJA 2RKIA 2E2OA 4Z0UA 5I42A 5ADXH 3CJ9A 1ASWA 3DJCA 4Z4HA 3OY9A 4DR3K 2HHIA 3R8EA 4BQLA 4FLXA 1KVAA 3QDKA 3AO5A 5AQJA 3F2KA 1RBTA 3AO2A 3L2VA 1HRHA 3CMEN 3KZBA 3CD6N 2OTJN 3G4SN 2O8DB 3GE1A 1I94K 2HMPA 1UAXA 2NRHA 2RN2A 4CBUA 1N36K 3M8SA 3AGRA 1D9DA 1NJZA 2JLEA 3WQUA 2Z1GA 3DLHA 4IO9L 4GMJB 1HLUA 3CQYA 4LF5K 2LT8A 4JLHA 3QEWA 3C7NA 1YITN 4IDHA 4JYAK 5FROA 5KPTA 3KWGA 2ETJA 1U45A 2HBKA 4CK3A 4GNIA 2VY6A 1EWRA 1HMVA 4DQ8A 5FDLA 3O3HA 3GBTA 2XO7A 3IS9A 3KLHA 3SQ2A 5AQFA 4EZ9A 4U7BA 4H0YB 2D0CA 4CI6A 2HF4A 3O80A 5KRTA 4K8ZA 3HVTA 4IG0A 1S6PA 3C6HA 1I6GA 2PZSA 1OKJA 2Z1IA 4WQ4A 1K8KB 4KTZA 4MDAA 4U67L 2G8VA 4YOUA 3ZT1A 2MN5A 1JL2A 1NKCA 4DR1K 2FBVA 3UIQA 2E4LA 3NAEA 2VQEK 3NGIA 1WNSA 3CCJN 4DV4K 5AQWA 3KOYA 3FZFA 4CK2A 1XMQK 3AO4A 1QHAA 4PL7A 4DTRA 3KVGA 4OPHA 5FPDA 4BWJA 2YHWA 3V9ZA 3THYB 4LH4A 3FLCO 3ZETA 2HHSA 1ZBLA 3WUHA 4BDPA 1KFDA 4W5QA 3PLAA 5F1XA 1RNHA 4O4GA 1S72N 5AQNA 5BN8A 2N69A 1RDCA 2KBKA 4CGDA 4A5AA 3OBWA 2WBNA 4FZZA 4AAZA 1CN2A 2KZZA 3BF1A 4DS4A 2E6LA 2YI1A 2GEMA 2HF3A 5AQUA 3L0QA 5M1FA 5KRSA 3O3FA 2AJQA 4DUZK 3C7NB 3D2FA 4IFEA 2G8IA 2BGGA 1U49A 2LJMA 2KKZA 1C6VA 1DTQA 2B4JA 4KHQA 2KFNA 1CXUA 2K35A 4AH9A 3LAKA 4F4KA 5FRNA 3OYIA 3DMJA 1NK6A 2VWKA 3ZSXA 2X6NA 3EO3A 5CY4A 3LAMA 4JS4A 3THXA 3HJFA 4B1WB 2QTDA 4KH6A 3EKSA 2W42A 1ATNA 4KO0A 1NGBA 1KRPA 1VSIA 5LMNK 1S22A 4FO0A 4OPAA 3VQ5A 3A5OC 3K9KA 1YTUA 4JD2A 3JSMA 4MQ3A 1K9MO 4OKEA 1NK9A 3VF4A 4C1NI 2BDPA 2PYJA 2RF2A 3AA4A 4LSLA 5HROA 5CYMA 4ILJA 3D2FB 3ZSWA 2OA8A 4OO1J 3G10A 3MEDA 2P9PA 2P5OA 4JV5K 3EKUA 4JK8A 4DKWA 4N56A 5GIOA 3VQ8A 4IWVA 3FFIA 3T3FA 4NB4A 4FJ8A 3OYJA 5CYQA 2ASMA 3TR8A 4FW2A 1UA0A 4CJ7A 3CC4N 2UUBK 4PUOA 4FWKA 2Q2RA 3VQ7A 4C8NA 3JAMO 1J53A 1BQNA 1JXEA 4YY3K 4JI7K 5E84A 5JS2A 1TUYA 4WFNL 3R3LA 4CBWA 1DJTA 3R2VA 1HJRA 5DM7L 2QXFA 1CZAN 3P31A 1TGOA 4DV5K 5TKWA 4GW6A 1T05A 3HM8A 1JZBA 2F96A 4WE1A 3HOSA 3CCQN 2G8WA 4DFMA 3CC2N 3H45C 4NCBA 3ASMA 3M8PA 4BE1A 4BR5A 4E72A 2HHXA 2DTUA 2HMIA 1ILYA 1RT1A 3ZSQA 4FM1A 4N47A 1YJNN 4KHYA 2E0HA 4AM6A 3L56A 3VOVA 3TWHA 3MWTA 3K5OA 3BUZB 3LPUA 2BE2A 3R1XA 2J4RA 2FF3B 3ZEUA 4BRLA 4O0IA 2OTLN 3D6RA 4IEIA 4OX9K 2ZE2A 4JN4A 1LCUA 4Y1DA 1B7DA 1YXQA 3QBXA 4KTWA 3J7YP 5AZIB 3NCIA 3IKMA 3THVA 3NFAA 3FZHA 1GLCG 1X3MA 4GV3A 3GKUA 2RPIA 3WXKA 4E1NA 3KD1E 2LJ7A 4FWLA 1RDDA 3CFOA 3CYGA 3O9TA 1JKHA 4JI3K 3O08A 1JKZA 4IFYA 4M45A 1C0MA 1Z25A 4W5OA 1MU2A 1ZVEA 1SS6A 4CBXA 2HHHK 3QB0A 2ASPA 4BEBA 3VGMA 4FZYA 4CGHA 3P83D 1OVQA 2VG7A 4Q5VA 2DFFA 3SK3A 3E9OA 3TPQA 2GELA 2A1SA 3OYHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LWC A;  4BRQ A;  3K2P A;  1Q18 A;  1XQS C;  4FWM A;  2FXU A;  3LP3 A;  3AVF A;  4DR7 K;  5M1Q A;  4X66 K;  2ZJR L;  3K57 A;  4FJL A;  2QWL A;  3CM6 A;  3ATU A;  2D0A A;  1YTA A;  4FOE A;  3VEY A;  4HTL A;  4BR9 A;  4CJP A;  2QKK A;  5AR0 A;  1WUA A;  1J6Z A;  5FLX O;  2O4I A;  1BA0 A;  1JLF A;  4Q0B A;  2D4W A;  4LFC K;  3L4Q A;  2ITG A;  3SYZ A;  3PIO L;  4CEA A;  1L3U A;  3QEI A;  4B3O A;  4CGF A;  1SL2 A;  4JI2 K;  4FJJ A;  4FK4 A;  1SUQ A;  1P8Z A;  2D0B A;  1RT6 A;  5GIP A;  3CQ8 A;  3HP6 A;  3HPO A;  5GAH P;  5KK4 A;  4GVM A;  2JDQ D;  4FJ9 A;  4CF1 A;  1NJY A;  2LY5 A;  4BE0 A;  4DB3 A;  4M3R A;  4PQU A;  5GAE P;  2BH1 A;  4JKG B;  1XI1 A;  1C55 A;  4LF6 K;  1EO1 A;  2YHA A;  1TKD A;  1L3V A;  1R59 O;  3CM5 A;  5JS1 A;  4PKI A;  5BN9 A;  1VK0 A;  4V1D C;  1BDG A;  3D45 A;  4LF9 K;  3C6U A;  1NGD A;  5AQK A;  4BR7 A;  4H4M A;  3S3N A;  1KQS M;  1WAJ A;  2RKI A;  2E2O A;  4Z0U A;  5I42 A;  5ADX H;  3CJ9 A;  1ASW A;  3DJC A;  4Z4H A;  3OY9 A;  4DR3 K;  2HHI A;  3R8E A;  4BQL A;  4FLX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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