5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
2CH5A 3A8YA 2VYPA 1XC3A 1JCGA 4BRMA 1HUXA 2H3GX 1GLDG 3S41A 2NZTA 3DXKA 3FFKB 4BC2A 3D2EA 5AZJA 2YJFA 2A41A 2CH6A 2HMPA 4FWOA 4FWKA 2FF3B 1G99A 2NLXA 4M7XA 3FZLA 2ZGZA 3I8BA 5BREA 2A3ZA 2P9KB 4E1JA 2D4WA 3W3DA 4B1ZA 4H03B 4CZLA 5EX5A 3WUHA 5AQWA 2AA4A 2QWMA 2IVPA 4M63C 2YHXA 1DEJA 3ENHA 4JNEA 4K41A 3VEWA 1BWFO 1SAZA 4CZIA 2QWQA 4IWVA 2P9NB 3TU5A 3EN9A 2QWLA 3RSEB 4DQ8A 4MLEA 1KAZA 3ZX2A 1NMDA 1K8KB 3BP8A 4AM6A 5BRHA 4BQZA 2Q1NA 3EO3A 4WQ5A 1Y64A 5AQRA 3LL3A 4F9OA 2A42A 2GUPA 3H45C 2QWOA 4RCHA 5E26A 4FL9A 2QWNA 1MA9B 1BDGA 2E1YA 5AQMA 4BG9A 3H3OB 1NGDA 2W40A 3UKRA 1HKBA 4MO5A 3ZETA 3QMLA 4YDUA 2ITMA 3MN5A 3M3ZA 2Q97A 2V7ZA 4IXCA 4CD1A 3D2FB 3O5BA 4FOIA 2A6AA 2QWPA 3FGUA 5AZIB 1EQYA 3MCPA 5AQXA 3UKUB 3FZMA 1NGAA 1CZAN 2GELA 1SZ2A 1IG8A 2CGKA 1YAGA 1NGCA 4BRFA 5KQ8A 2E2QA 3UB5A 4H5WA 1YVNA 4Y0WA 2HOEA 4WQ5C 3ULEA 2QXLA 2Q0RA 3KVGA 1Z05A 1NGFA 3HM8A 4IJAA 1GLJO 2FF6A 1S3XA 3D2EB 1R59O 5AQOA 3ENOA 4BRPA 4IO8A 3FE1A 3VPZA 3AY9A 3O1BA 3AAQA 1KAXA 2BTFA 1TYQA 2P9SA 4BRCA 4XH4A 4BRGA 1ZXOA 2CGJA 3L0QA 3QBXA 4BGBA 5F2RA 2YCHA 5JICA 3CQXA 1NGGA 1J6ZA 3GE1A 3IDHA 4HWIA 4XH5A 3EZWA 1ZC6A 4FPBA 3VGLA 5FPEA 2ASOA 2GEMA 2ZGYA 5AQFA 2FSKA 3IUCA 3SK3A 2KHOA 4CD3A 1ATSA 5ADXA 2EWSA 4CZFA 5LJWA 4CZKA 3LDNA 3C7NA 3CIPA 3L4IA 3AARA 3M1FA 3CJBA 2FXUA 2ASPA 3A0IX 4H0OA 3UKRB 3WXIA 2YHWA 2Q36A 3LDLA 3GBTA 3ZETB 3U9ZA 5JMVA 1BUPA 1ZBSA 1WUAA 4ISFA 4BR5A 2IVNA 5KPZA 3C0BA 1LCUA 4B1UB 5AQPA 3LDOA 2QM1A 3D7EO 3O1WA 3QBWA 2E2PA 1GLCG 4O5FA 2Q31A 4WYBA 5TKYA 3VEOA 2OANA 5EXWA 2V52B 4JN4A 2ZF5O 3OHRA 3DXMA 3QDKA 3ULEB 2VWBA 4IJNA 4BROA 2Q0UA 3SLCA 4MLHA 1HX1A 2W41A 4FWPA 1Q18A 4ISEA 5AQYA 3R6MA 4H0TB 5LY3A 1XUPO 3BUZB 2GWJA 5AFUH 1BG3A 2I7PA 3FLCO 1ESVA 3EKUA 4B1XB 4FWSA 2Q2RA 3A5LC 1TYQB 2P9SB 4CZHA 4JD2A 4BR2A 3H1VX 2BUPA 3VEXA 3EKSA 4H5RA 2P9PA 1NGHA 3MN9A 1DGKN 4CZEA 1HJOA 5BN8A 4BRKA 4BRDA 5AR0A 5AQQA 3IFRA 3R8EA 3WXKA 1GLEG 4EAHD 3MN6A 3VESA 3MDQA 5LJVA 1BA1A 1D4XA 5I9EB 3O08A 1JCEA 4BRNA 2D0OA 4MO4A 3CETA 3WXJA 4H0PA 1QQNA 3CERA 3VF6A 2GTDA 4C23A 3C7NB 4BC3A 3VF2A 3CI5A 4DB3A 4EIAA 3SMSA 4FWQA 1XQSC 4WQ4C 4EFHA 5AFUA 4BC5A 5AQTA 4CBWA 4CJ7A 1GLLO 3LDQA 4BQLA 1IJJA 4A61A 1GLAG 1HPMA 4M7YA 3LM2A 1NGIA 2PAVA 3DJCA 3H1QA 4RTFD 4BR0A 4BG8A 1JCFA 2P9UA 4H0YB 4JHDA 5AQHA 5AQSA 1V4SA 3VEYA 4BRQA 3BF3A 4GY2B 3CQYA 4J8FA 2AP1A 1HLUA 4FOEA 3WEEA 3A5MC 4CZJA 2D1KA 4BR7A 3DXMB 1TUYA 2I7NA 4NB4A 2J4RA 5F0XA 4B9QA 3GL1A 4BVPA 1BO5O 1DKGD 4HTLA 3ATUA 3P4IA 3VERA 1TUUA 1QZ6A 3H6EA 2V51B 4B1YB 4PKGA 4GNIA 3ZX0A 2F9WA 3ATVA 3CJ7A 2HF3A 3BF1A 1X9JA 4Z94A 3HBTA 3BEXA 3WXLA 3O4WA 3VEZA 5BRDA 3ZEUA 2E88A 3CJ9A 4BGAA 3SMPA 4CZMA 3FZKA 4BRHA 5BR9A 3MK6A 1BOTO 4JD2B 1NM1A 1U2VA 2P9IA 1NWKA 3HI0A 2P9PB 3WT0A 4B1VA 3GOIA 2E2OA 2WUSA 4XH1A 4H5TA 4BR4A 4BVOA 4BRLA 3QB0A 1ATRA 5EY4A 4PL7A 3DWLA 4KBOA 3JS6A 1Z6RA 2ASMA 1T6CA 1H1VA 5AQKA 1NGBA 4H0VB 1X3NA 2PBDA 3UE5A 3L6QA 4DCHA 2V7YA 3TPQA 3QFUA 3LDPA 4FPAA 5BN9A 3JXUA 2FSJA 4CBUA 3HTVA 3J8AA 1OKJA 3MMVA 3FZFA 1MDUB 1QHAA 5CE3A 3WQTA 5KPRA 1SQKA 4ISGA 3LM9A 2NRHA 1C0GA 2HF4A 1P8ZA 1WOQA 4WQ4A 1QQMA 5AQGA 3O80A 3O6WA 2P9UB 4JHDB 4H0XB 3GDQA 1HKGA 4PKIA 3HSCA 1S22A 2QWRA 2ZWHA 4CZGA 3WEEB 1V4TA 1RGIA 1LOTB 3CJCA 3O8MA 3WQUA 1MWKA 3VGKA 3AAPA 4BRIA 5EOYA 3B8AX 4K25A 1MWMA 3MN7A 1QZ5A 4CBXA 4LC9B 4I6MA 1X3MA 1GLFO 2E20A 3VEVA 3U4LA 1KAYA 2P9LB 4CI6A 3A5OC 1YUWA 3FR0A 2VCPA 2E1ZA 4BC4A 4FWLA 2E8AA 4FSVA 4FWNA 3F9MA 2FLOA 1T6DA 5AQLA 2CGLA 4A2AA 3G25A 4O8KA 3DAWA 3ZEUB 1U6ZA 5KQDA 1QQOA 4H5NA 4BRAA 5JLFA 3W0LA 1E4FT 5AQVA 1BU6O 3CHWA 5F1XA 3CJAA 1KXPA 5ELZA 5BRFA 1U2VB 1C0FA 2P9IB 2YJEA 1RDWX 2A5XA 2P9KA 4JAXA 3U8XA 1E4GT 4QS7A 2YI1A 4NO7A 3KZBA 2DPNA 4QS8A 4EHTA 5AQNA 4BREA 4K42A 4XEIA 2P9NA 4K43A 4PKHA 1RFQA 3RSEA 1NGJA 1K8KA 3H46O 2A40A 2IVOA 5B8HA 3VF4A 5JLHA 4FO0A 5KPTA 5BPLA 3IMXA 3ZX3A 5ADXH 1YXQA 1BA0A 5AQIA 3DXKB 5FPNA 5AZJB 4YDUC 4IZ9A 4PL8A 3I33A 2FSNA 3VGMA 1NGEA 4A2BA 2P9LA 3U9DA 4A62A 3ID8A 2IIRA 4QS9A 5AQJA 4FWRA 4EHUA 5E84A 3A5NC 2GWKA 3VETA 5BPMA 5FPDA 3M6GA 1HKCA 3CJ1A 3HZ6A 3D2FA 3GG4A 1NLVA 1T44A 4L3QA 2D0PA 5EVZA 4DHYA 4H5VA 3KHYA 5AZIA 3VOVA 4FWMA 3VENA 3UKUA 3FZHA 3QICA 1GLBG 2QW9A 4AM7A 3QFPA 2F9TA 4I6MB 4BR9A 3SJHA 3R9PA 5AQZA 4RWTA 3H3NO 5AQUA 1NBWA 3EL2A 5FPMA 4B1WB 2E2NA 2UYTA 2YHYA 5BPNA 1ATNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPHA 2VWKA 3SUPA 4DV5K 1KSPA 1JCGA 4ELUA 1KLNA 1YJ9N 4WE1A 3AVBA 3DXKA 3FFKB 4WFBL 3AVNA 3D2EA 2YJFA 2CH6A 4N47A 5J2PA 1VSMA 4Z4CA 3NF6A 5K14A 3NCIA 2P5OA 1YT3A 2P9KB 3ZSOA 3SZ2A 4CZLA 3AVJA 1LAVA 5EX5A 3WUHA 4A5BA 4XIUA 4Z4GA 4CFBA 4JNEA 4K41A 3VEWA 3F73A 4YHHK 2QWQA 3TAGA 1C0TA 2P9NB 3RWUA 3ZX2A 5M1OA 3KOYA 4DTMA 3OYAA 1QSYA 5FRNA 4KO0A 4LFBK 4ILJA 1RDDA 4WFAL 4DSEA 4C8MA 3V6DA 4DS4A 4CGFA 3LP1A 4WQ5A 3T7ZA 4BY9C 1DQ7A 2UUAK 1RBTA 2QWOA 5E26A 1AYJA 4DLEA 4JKCA 3VN5A 2E1YA 3RVCA 2OZSA 3H3OB 3PX0A 1T7AA 2VG7A 1RBUA 4CJVA 1HKBA 4HCBA 4YDUA 1ZYWA 3MN5A 3M3ZA 3E1YA 2V7ZA 3EE8A 4FOIA 4CF1A 4DU1A 3FGUA 2D0CA 4B3SK 3CFOA 3QEPA 4LSLA 3MCPA 2JGUA 4LH5A 4JK9A 1NGAA 1P90A 3KK2A 1DT9A 1HPZA 1IG8A 2KKZA 3IRXA 4B3TK 1P00A 3AA2A 4CJTA 3Q7CA 4C8KA 2WONA 2QXLA 4R79A 3KVGA 1Z05A 2NRTA 1NGFA 3J80O 2KFNA 1GOAA 1XNQK 3SPZA 1R59O 2YC1C 5DM6L 1PTXA 1UGLA 3T69A 3MECA 1RT2A 3FE1A 4JI1K 4KHWA 3SNNA 1TYQA 3OS2A 2NY9X 4B3MK 3L0QA 1A5VA 5F2RA 3VQ9A 2YCHA 5JICA 5FROA 5HL7L 3NF7A 1J53A 2ASOA 5KGXA 1TL3A 1EETA 3SK3A 1VQ9N 3C6UA 1N36K 4YOTA 2EWSA 3KTQA 3OYNA 1SNBA 3C7NA 2HVIA 3CJBA 2ASPA 2ETJA 2Q36A 3LDLA 4A59A 3U9ZA 1NK5A 3ZSYA 1K8BA 1ZBSA 3HP6A 3ALYA 2VGMA 2KJAA 4ICLA 2IVNA 4NCGA 4HHTA 4OO1J 4KRFA 3R3LA 1L3SA 2YEOA 1M1KO 1BL3A 3MXIA 1EX4A 1YHQN 3LP2A 1WBBA 4WYBA 5TKYA 3VEOA 5EXWA 1HYZA 4Z4IA 4PA1A 2ZQBA 1BQMA 3OHRA 4OLBA 1EWQA 1S1TA 2HHIA 2Q0UA 1S9EA 3TSQA 3FFIA 2KLAA 3TR8A 2QKKA 1LAWA 4QCLA 3MEDA 2VY6A 1D9DA 2W6LA 1F21A 3DOKA 1Q18A 4KB0A 4ISEA 4W5RA 2O8FA 3R6MA 4H0TB 3HP9A 4FVMA 3FLCO 4E3SA 4CK2A 3SAHA 4JV5K 4EZ6A 3NH2A 4JS5A 4FWSA 3M8QA 2P9SB 1WAFA 4JD2A 4BR2A 1HYSA 3EKSA 4H5RA 3MN9A 1DGKN 3SQ0A 3UIQA 4BRKA 3TAEA 5AR0A 2QXFA 3CFRA 3L3VA 3VESA 3HPOA 1BA1A 1NK9A 3MWTA 1JCEA 4X62K 2D0OA 3PSIA 5M1PA 3CERA 3DLBA 4JKBA 4AHCA 4ID5A 3HVRA 3KLHA 3OS0A 3K59A 4EIAA 4FYDA 4KKOA 1XQSC 1TV6A 3WNEA 1NK4A 4EFHA 5CY4A 1JL2A 1OH8A 4HVJA 4U7BA 3QO9A 1FKOA 3SUOA 4JI8K 3OYJA 3LDQA 1TKZA 4A61A 1HPMA 3THWB 3OTOK 4O5BA 3LM2A 1NOYA 1NGIA 4KREA 4BG8A 5EU7A 4H0YB 5AQSA 3P39A 3VEYA 1R0AA 3BF3A 2VQEK 4LFAK 3CQYA 3THYB 3ZLJA 3SCXA 2G8FA 1OMYA 1S6QA 4PQUA 3THXA 4IFEA 4NLCA 2O8DB 4B9QA 3SJJA 1L5UA 1I39A 4BVPA 1VQNN 4BWMA 3LDSA 4DU3A 1FK9A 3H6EA 4DWIA 4PKGA 3F9KA 4FK4A 2OTJN 4BDZA 3ZX0A 1X9JA 1S72N 3OYGA 4FW2A 4FLZA 4LF5K 3VEZA 4F8RA 5KTQA 4W5QA 5FRMA 3SMPA 4CEDA 3SQ1A 5A2QO 1VSHA 3FZKA 4C8LA 2XY6A 3LZJA 1QSSA 3HPHA 1T8EA 4JKAA 2K35A 4H4MA 3WT0A 4DSJA 4H5TA 3K5OA 1WAJA 4BRLA 2YHBA 4JRPA 3QB0A 1ATRA 3P38A 3MAQA 4CCHA 3L2RA 3TAMA 4DFPA 3HO1A 1NJWA 3K5LA 4H0VB 2PBDA 3L6QA 2WBNA 3K0SA 2IC3A 3PSMA 1TK0A 3NMUA 1BK8A 5BN9A 5CYQA 2HBKA 1OKJA 4KV8A 3LWLA 5HP1A 4PWDA 3T1YK 1VRTA 4KTWA 4FJ9A 1SQKA 4C1NK 2XHBA 2ATBA 2E3FA 2HF4A 1P8ZA 1WOQA 3L2UA 3S3MA 2VG6A 3AGRA 4PUOA 5J2NA 3AVGA 3Q7BA 4H0XB 1WB9A 4V19S 1UWBA 4DR3K 1LQQA 3L4QA 3J81O 3EZ5A 4LF7K 4FJHA 2ZWHA 5CY0A 4ZTFA 3OA9A 3DMJA 4O0IA 1ASUA 2FBTA 3B8AX 4JK7A 3NH1A 3BZKA 3KLEA 3SUQA 5KK4A 4FLVA 1QVGM 3QEVA 2HHQA 1KVCA 4J2AA 1KAYA 5C24A 3P5JA 1YUWA 4BC4A 4ELVA 2E1ZA 2LY5A 2IS3A 4FWLA 4FK0A 3V9XA 4FWNA 1LV5A 4A2AA 3NVKA 3QEXA 5LMUK 1LW2A 1U6ZA 1QQOA 4GW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OPH A;  2VWK A;  3SUP A;  4DV5 K;  1KSP A;  1JCG A;  4ELU A;  1KLN A;  1YJ9 N;  4WE1 A;  3AVB A;  3DXK A;  3FFK B;  4WFB L;  3AVN A;  3D2E A;  2YJF A;  2CH6 A;  4N47 A;  5J2P A;  1VSM A;  4Z4C A;  3NF6 A;  5K14 A;  3NCI A;  2P5O A;  1YT3 A;  2P9K B;  3ZSO A;  3SZ2 A;  4CZL A;  3AVJ A;  1LAV A;  5EX5 A;  3WUH A;  4A5B A;  4XIU A;  4Z4G A;  4CFB A;  4JNE A;  4K41 A;  3VEW A;  3F73 A;  4YHH K;  2QWQ A;  3TAG A;  1C0T A;  2P9N B;  3RWU A;  3ZX2 A;  5M1O A;  3KOY A;  4DTM A;  3OYA A;  1QSY A;  5FRN A;  4KO0 A;  4LFB K;  4ILJ A;  1RDD A;  4WFA L;  4DSE A;  4C8M A;  3V6D A;  4DS4 A;  4CGF A;  3LP1 A;  4WQ5 A;  3T7Z A;  4BY9 C;  1DQ7 A;  2UUA K;  1RBT A;  2QWO A;  5E26 A;  1AYJ A;  4DLE A;  4JKC A;  3VN5 A;  2E1Y A;  3RVC A;  2OZS A;  3H3O B;  3PX0 A;  1T7A A;  2VG7 A;  1RBU A;  4CJV A;  1HKB A;  4HCB A;  4YDU A;  1ZYW A;  3MN5 A;  3M3Z A;  3E1Y A;  2V7Z A;  3EE8 A;  4FOI A;  4CF1 A;  4DU1 A;  3FGU A;  2D0C A;  4B3S K;  3CFO A;  3QEP A;  4LSL A;  3MCP A;  2JGU A;  4LH5 A;  4JK9 A;  1NGA A;  1P90 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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