5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
3J8AA 3I8BA 3CJBA 1HKCA 2Q31A 2HMPA 3QFPA 3EZWA 4QS9A 3IDHA 2P9IA 3CJAA 5AQWA 4FPBA 5AR0A 4H03B 4HTLA 2DPNA 4B9QA 3MN6A 3HZ6A 1QHAA 3SLCA 4CZLA 5KQDA 2NZTA 2CH6A 3WQTA 1XUPO 3LM2A 4H0VB 5AQGA 2ITMA 5FPEA 4PL8A 5AQYA 4JAXA 1GLEG 3FZKA 3VERA 4CI6A 2A41A 2E2NA 1MWKA 3DXKA 3ZETB 4GNIA 1NGDA 1HKBA 1RGIA 1J6ZA 1YXQA 3ENOA 3H1VX 4I6MA 1ATSA 2FLOA 3VEVA 4H0PA 3O80A 4WYBA 4IJNA 3VENA 3VEZA 3CJCA 4AM7A 2YHYA 3DXMA 1BOTO 3WEEA 3LDQA 3H3NO 5AZIA 1BA0A 1GLAG 3SMSA 1NGJA 1H1VA 4H0OA 2A5XA 1NGFA 2ZF5O 4B1XB 3MK6A 3ULEB 2ASMA 5BPMA 2VYPA 2P9UB 5EXWA 2PAVA 1ATRA 3ENHA 3L0QA 5KPZA 2P9KA 3GOIA 5AQQA 2V7YA 4BC3A 3O4WA 2P9NA 1NBWA 1T44A 2EWSA 4BC2A 1YUWA 4FOIA 5LY3A 4IZ9A 4PL7A 5F1XA 2NLXA 3BP8A 3EKSA 4BGBA 3AARA 4E1JA 1MA9B 5AQJA 2HOEA 3ZX0A 2GEMA 1GLCG 4BR2A 2QWOA 4BRQA 4FO0A 3RSEB 3W0LA 4H5WA 3F9MA 3H46O 4JD2A 4H5NA 4BG9A 4H0TB 3HSCA 4JHDB 1ESVA 4CZEA 2FSNA 3VGMA 4K25A 3CI5A 5AFUH 3MN7A 4RTFD 4A2BA 4BRIA 2FSKA 3KZBA 4BRLA 2A40A 3TU5A 5AQMA 4FWQA 4YDUA 4XH5A 2ZGYA 2F9TA 3FLCO 3DAWA 3UKRA 4CBUA 3DJCA 4FWRA 4O5FA 4EAHD 3WT0A 2CGJA 3CJ1A 4XH4A 5KPRA 2CGLA 2P9PB 5EX5A 2IIRA 3VF2A 3FE1A 2GTDA 3BUZB 4L3QA 3HM8A 4BR9A 4PKIA 2A42A 4A62A 1ZXOA 1BDGA 3JS6A 4Y0WA 5AQIA 2ZWHA 4H5TA 5AQFA 1DKGD 1ZC6A 1X3NA 1NGHA 4K42A 4BROA 5B8HA 1HLUA 2I7NA 1BWFO 4CD1A 5AZJB 4EFHA 2QXLA 4JN4A 4YDUC 4BR7A 3VEYA 5AQRA 3B8AX 3WQUA 1BUPA 3DWLA 3H1QA 3CJ7A 5JICA 4BG8A 4BC5A 3C7NB 3HI0A 4BR4A 3MCPA 3BEXA 2Q0UA 3LDPA 2P9LA 1TUYA 3DXKB 2E88A 3O1BA 3QICA 3O08A 4XEIA 3WXLA 4BQZA 5AQOA 5EVZA 1LOTB 4I6MB 3TPQA 1TUUA 4FWMA 3VPZA 3O6WA 2GWKA 5FPDA 4H5RA 1T6CA 2YHXA 3S41A 1GLFO 3UKUB 1TYQA 4CZKA 5BRFA 4RCHA 1KAZA 3CERA 1E4FT 2GWJA 3QBWA 3A8YA 1Y64A 1LCUA 1QQNA 4BRPA 4FWSA 3DXMB 3WEEB 3D2EA 3FZMA 3BF1A 2QW9A 3CETA 4CBXA 4IJAA 3QB0A 4H0YB 4BRNA 4CZFA 3G25A 4CZMA 5LJVA 5F2RA 3AAPA 1JCFA 4BRMA 4EIAA 3O5BA 4IWVA 4CZHA 4B1UB 4H0XB 2P9KB 2QWLA 2P9NB 3ZX2A 2UYTA 4FWOA 2KHOA 5AQHA 3CQYA 4M63C 3FGUA 4IO8A 4BRAA 5BN8A 4BRKA 4DCHA 3UB5A 1XQSC 3U9DA 3O1WA 4FSVA 5AQVA 2E1YA 3KHYA 3QBXA 3WUHA 3FFKB 2F9WA 5BN9A 3A5OC 1OKJA 2CGKA 2IVNA 2GELA 1NWKA 2V51B 3WXKA 4JD2B 3CIPA 3VOVA 3W3DA 4B1VA 1GLJO 2V52B 4FWNA 5EOYA 2P9SB 1XC3A 4A61A 3VGKA 4FWLA 4CD3A 4B1WB 1DGKN 3WXJA 3O8MA 1GLDG 1QQOA 2I7PA 3UKRB 3AY9A 3IUCA 3ATUA 4CBWA 2ZGZA 3VEOA 3R8EA 2BUPA 5AQXA 2YJFA 3HTVA 3FR0A 5F0XA 3L4IA 4WQ5A 3SK3A 4HWIA 3H6EA 1HJOA 2NRHA 2FF6A 5AQLA 1U2VB 1BG3A 1KXPA 1NGIA 3SMPA 3C0BA 2Q97A 5AQKA 3D2FA 1T6DA 3M3ZA 4A2AA 5BRDA 1X9JA 4IXCA 3EN9A 3WXIA 4DHYA 1Z05A 2AA4A 2J4RA 4BGAA 1KAYA 2W40A 2FXUA 1YVNA 4B1ZA 4C23A 4FWKA 4WQ4A 4K43A 2CH5A 2YHWA 3GBTA 1S3XA 1MDUB 2P9IB 1X3MA 4BRGA 5ADXA 1EQYA 5AQSA 3IFRA 5CE3A 4MO4A 4EHUA 2IVOA 4ISGA 2E2OA 4WQ5C 1HX1A 2E20A 3EKUA 5EY4A 3LDLA 1K8KA 2OANA 2A3ZA 3JXUA 1S22A 2FSJA 3VEXA 4QS8A 3ZEUA 1Q18A 3HBTA 4CZIA 2D0OA 4JNEA 4ISEA 1MWMA 2P9PA 4H5VA 4DB3A 1P8ZA 1V4TA 3VF6A 2GUPA 3IMXA 4XH1A 3FZFA 1NGCA 1RDWX 3EL2A 5LJWA 4DQ8A 1NGGA 2ASPA 4WQ4C 3M1FA 3D2EB 3BF3A 4EHTA 3VESA 4BC4A 4FL9A 4MO5A 3A0IX 2A6AA 2YCHA 5AZJA 1U6ZA 3H45C 5KQ8A 3VF4A 5AZIB 4BRDA 5JLFA 3U4LA 1NMDA 4ISFA 4PKGA 1NGEA 4LC9B 3C7NA 1QZ6A 2Q36A 1JCEA 3QDKA 5E84A 4BRHA 3GDQA 3L6QA 5AQTA 4BVOA 3VEWA 2YI1A 4PKHA 3UKUA 1R59O 3KVGA 1KAXA 1SAZA 2D0PA 2AP1A 3ZETA 1Z6RA 2QWQA 1SQKA 2QM1A 3A5MC 1RFQA 2H3GX 5AQUA 2HF4A 1BA1A 3MDQA 4MLEA 4B1YB 3U8XA 3MN9A 4Z94A 1NGAA 1G99A 3MN5A 1BU6O 3R6MA 2E2QA 5E26A 4RWTA 5FPNA 2YJEA 3SJHA 4BQLA 5TKYA 4QS7A 1SZ2A 3GL1A 3D7EO 4F9OA 2ASOA 2D4WA 2E2PA 1C0FA 5I9EB 1NLVA 1V4SA 4J8FA 4BR0A 3I33A 2QWMA 3GG4A 3QMLA 3VGLA 3A5NC 3VETA 1QQMA 4FWPA 1WUAA 3ULEA 4M7YA 2V7ZA 4NO7A 4FOEA 2P9UA 3M6GA 4O8KA 2QWRA 5ELZA 2D1KA 1HUXA 5JLHA 3D2FB 1IJJA 4MLHA 5AQNA 1HPMA 3EO3A 4FPAA 4CJ7A 3LL3A 4M7XA 5AFUA 3ATVA 1IG8A 1ATNA 2E8AA 3ID8A 3CQXA 2QWPA 3QFUA 5AQZA 5BPNA 3AAQA 2Q2RA 1ZBSA 2Q1NA 3CHWA 3LDNA 2QWNA 5FPMA 3FZHA 1NM1A 2P9SA 4BREA 1DEJA 5BR9A 3R9PA 5AQPA 3RSEA 3LDOA 3FZLA 1GLBG 4JHDA 4NB4A 1E4GT 4CZGA 3LM9A 1NGBA 3UE5A 1HKGA 1K8KB 5BREA 1YAGA 3ZEUB 1GLLO 4KBOA 1CZAN 2VWBA 3P4IA 3MMVA 1C0GA 3H3OB 2W41A 2FF3B 5BPLA 1JCGA 2P9LB 4CZJA 3GE1A 4BRCA 1QZ5A 3OHRA 5KPTA 3U9ZA 2Q0RA 1BO5O 2HF3A 1U2VA 4BVPA 2WUSA 5JMVA 4GY2B 5ADXH 4BR5A 2PBDA 4AM6A 2IVPA 1D4XA 1WOQA 1TYQB 5BRHA 3A5LC 4BRFA 3ZX3A 2E1ZA 4K41A 3CJ9A 2VCPA 2BTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BGRA 3I8BA 2VQFK 1VK0A 3EZWA 3QFPA 4QS9A 3CJAA 4DTNA 4KREA 4FPBA 1QHAA 1WSHA 2KZZA 1YHQN 1JXEA 1SS6A 3KP0A 3O4QA 4HUGA 4JI0K 3P31A 5AQYA 2BH1A 4JAXA 1GLEG 1NK8A 3CFRA 1MWKA 4QCLA 3ZETB 4KV8A 1RGIA 1YXQA 3TI0A 3ENOA 1LQIA 3TARA 1ATSA 3CQ8A 4Q5VA 3L4QA 4WYBA 3JYTA 4DTMA 4UY8O 2LY5A 2VGNA 4B3SK 5M1OA 2AJQA 3OBYA 1BOTO 3WEEA 2E5LK 2QKBA 5DMRA 3V1QA 3LDQA 3H3NO 5AZIA 3OYBA 1H1VA 5KI6A 2A5XA 4LF6K 4B1XB 1YT3A 5BPMA 2VYPA 2HVIA 1VSIA 1NRAA 2QEXN 3O9SA 3C6AA 1I6FA 4A59A 3C94A 2JWKA 3THYB 3ENHA 3L0QA 4C1NK 5KPZA 3CCJN 1NBWA 3LDSA 2EWSA 4BC2A 1LWCA 3TSPA 4M3WA 5LY3A 4FOIA 5LMUK 5F1XA 3OTOK 4BACA 2G2KA 1RTHA 4LD0A 4ID5A 2KFZA 3KK7A 4N41A 4NCBA 4E0DA 1YTAA 4KB0A 1TKXA 2ZJPL 2HOEA 2W42A 1OH7A 4YOYA 1O1WA 4HHFA 4CFDA 3CW4A 1EKEA 1HQEA 3K5OA 4ILHA 3B6OA 3RSEB 4CJQA 3S5TA 3H46O 4JD2A 4U7BA 3HSCA 2MBKA 2EHGA 1TK5A 1Y97A 4K25A 3D6RA 3S3MA 4JK7A 4A2BA 3TU5A 4FWQA 4OVLA 4YDUA 4XH5A 3E66A 2OCEA 1WSGA 2NRXA 3MEDA 3SUQA 2IDOA 4EAHD 2CGJA 2RE2A 5EX5A 1KSPA 3MCAB 4KHQA 1LWEA 4DFMA 1RBUA 1NJWA 3VQ8A 3FE1A 1WB9A 4KKOA 3NH1A 3ENBA 3U3GA 4FXDA 3KOZA 3SUPA 1BDGA 3OY9A 4JKGA 1NK6A 5AQIA 1KV0A 4H5TA 4CGJA 3VN5A 1D8YA 4BROA 4F3OA 1HLUA 2I7NA 4B3OA 4Z4EA 1FK9A 5AZJB 4CFBA 5JENA 2YEOA 4AHRA 4BDPA 4JN4A 1MU2A 1ASUA 1WN7A 3VEYA 4FM2A 1BIZA 3RR7A 3DI6A 1TV6A 3CJ7A 2Z1GA 2UXCK 3C7NB 4BR4A 3CCQN 4LFAK 2LSNA 1RT5A 4N5SA 4RW7A 3O1BA 1GOAA 3O08A 1HQUA 3O9TA 3WXLA 5EVZA 3TPQA 4FWMA 5GADP 3V1OA 3VPZA 2GWKA 4UQGA 2F8SA 1TYQA 2D0BA 4HTUA 3J7YP 4RCHA 2P5GA 1ZYQA 1NOZA 1KAZA 3CERA 1E4FT 2GWJA 3A8YA 1Y64A 3VQ5A 4BRPA 4AEIA 4FWSA 3WEEB 1VSEA 3D2EA 1WMTA 5JS2A 4OPJA 2VWJA 3BF1A 1IBMK 2ATQA 4JKHA 3CETA 3NF8A 3OJUA 3QB0A 4CK3A 2LJ7A 4BRNA 4E7LA 3PO5A 2F7TA 4DV2K 2E3FA 4BRMA 4DR7K 3K5MA 3O5BA 4IWVA 1VSJA 4B1UB 3VQDA 3PSMA 2UYTA 3AVLA 2JWLA 3BZKA 5KGWA 4BRAA 3I55N 1C55A 2FBXA 2NRVA 3TTFA 1C0TA 3C6TA 3O1WA 1VRUA 2FC0A 3CC7N 1IG9A 1RBVA 3SQ4A 3OS1A 3V6DA 4N47A 3VQCA 3A5OC 2ZM6K 4NYFA 3OYNA 1WT7A 5I42A 4CJRA 1NWKA 4HHTA 3QIPA 4JD2B 3CM5A 4E72A 5J2MA 3NE6A 2UXBK 2HHVA 3V9SA 4GV6A 1KVBA 5CYMA 5M1FA 3SPZA 4LH5A 1S9EA 1Q81O 3VGKA 3DM2A 3AVGA 3HXMA 1GLDG 1QQOA 2HBLA 4FJ9A 3HK2A 4KTQA 4FVMA 1KCFA 4HWIA 2NRHA 1SKSA 1MR4A 4CJPA 3KK3A 2HHIA 3SMPA 3QERA 3C0BA 3L2VA 1KTQA 4JKGB 4A2AA 3M8RA 4IXCA 2AA4A 2J4RA 4CCHA 4E7JA 2JDQD 1M1KO 3CCMN 2ZD1A 4C23A 4FWKA 4CHZA 4K43A 1IO2A 1SEGA 4KPYA 5SZTA 2P9IB 2YIPA 1EQYA 4FJIA 5AQSA 4MO4A 2IVOA 5DM6L 4WQ5C 1HX1A 3ALYA 1S5JA 2OZMA 1JJ2M 4DLGA 4PUOA 1VSDA 4Z4IA 4CIEA 2FSJA 1K73O 3VEXA 4QS8A 4CZIA 3HBTA 3VQ9A 3HPHA 4H5VA 1P0AA 2Z1JA 1Q7YO 4CK2A 3CCRN 2VG7A 3FZFA 2KLAA 3AGRA 2UXDK 3J7AP 4DQ8A 1NGGA 2ASPA 4JI1K 5J2PA 3U3YA 3M1FA 3SNNA 2K35A 3D2EB 3KOYA 3N4QA 4DV6K 3WNEA 4EHTA 5DK5A 1HNZK 3G10A 2PZSA 2NRTA 1U6ZA 2FBTA 4G9ZA 3KK2A 3VF4A 3HVRA 4HUEA 2O8BA 3SQ1A 3P38A 3U4LA 4ISFA 3DLHA 1NGEA 4LC9B 4RW9A 3QEIA 4BRHA 3AVKA 3K5NA 4JK8A 1ZUTA 4GV9A 1SUQA 1I6GA 1NK4A 3P1GA 3CXCM 4R79A 2O4IA 1JKHA 4EP5A 3KLIA 1W7AA 4DV3K 1NK5A 1KAXA 2D0PA 1NNEA 4DU3A 4O4GA 3KLFA 1SQKA 1S1XA 2X6SA 4E7HA 4LF9K 3MDQA 5CR4A 3OYMA 3MN9A 3TAQA 1NGAA 3MN5A 1BU6O 4RWTA 4NXNK 4J2AA 1HNIA 1ASWA 3SJHA 1JXCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BGR A;  3I8B A;  2VQF K;  1VK0 A;  3EZW A;  3QFP A;  4QS9 A;  3CJA A;  4DTN A;  4KRE A;  4FPB A;  1QHA A;  1WSH A;  2KZZ A;  1YHQ N;  1JXE A;  1SS6 A;  3KP0 A;  3O4Q A;  4HUG A;  4JI0 K;  3P31 A;  5AQY A;  2BH1 A;  4JAX A;  1GLE G;  1NK8 A;  3CFR A;  1MWK A;  4QCL A;  3ZET B;  4KV8 A;  1RGI A;  1YXQ A;  3TI0 A;  3ENO A;  1LQI A;  3TAR A;  1ATS A;  3CQ8 A;  4Q5V A;  3L4Q A;  4WYB A;  3JYT A;  4DTM A;  4UY8 O;  2LY5 A;  2VGN A;  4B3S K;  5M1O A;  2AJQ A;  3OBY A;  1BOT O;  3WEE A;  2E5L K;  2QKB A;  5DMR A;  3V1Q A;  3LDQ A;  3H3N O;  5AZI A;  3OYB A;  1H1V A;  5KI6 A;  2A5X A;  4LF6 K;  4B1X B;  1YT3 A;  5BPM A;  2VYP A;  2HVI A;  1VSI A;  1NRA A;  2QEX N;  3O9S A;  3C6A A;  1I6F A;  4A59 A;  3C94 A;  2JWK A;  3THY B;  3ENH A;  3L0Q A;  4C1N K;  5KPZ A;  3CCJ N;  1NBW A;  3LDS A;  2EWS A;  4BC2 A;  1LWC A;  3TSP A;  4M3W A;  5LY3 A;  4FOI A;  5LMU K;  5F1X A;  3OTO K;  4BAC A;  2G2K A;  1RTH A;  4LD0 A;  4ID5 A;  2KFZ A;  3KK7 A;  4N41 A;  4NCB A;  4E0D A;  1YTA A;  4KB0 A;  1TKX A;  2ZJP L; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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