4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase regulator
molecule keywords Glucokinase regulatory protein
publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
1TUYA 3UKRA 3O1BA 1IG8A 5KQ8A 3WEEB 2A42A 2D0PA 2QM1A 4A62A 4BR2A 2EWSA 3WXLA 4JD2B 4O5FA 3IDHA 3WQTA 4BGBA 5BRFA 1ZC6A 4MLEA 1T44A 3CJ7A 4CI6A 3WXJA 3CJAA 3EO3A 2D0OA 4PL8A 3WXKA 3VERA 2GTDA 1U2VA 3HBTA 4BRDA 2FLOA 1MDUB 1K8KB 3M1FA 5EXWA 2GEMA 1E4FT 4F9OA 5JLFA 1TUUA 4XH1A 1NGDA 5BR9A 2A41A 3WXIA 3A5LC 3CHWA 1SAZA 4KBOA 3D2EB 4IWVA 5FPMA 5AFUH 4B1WB 2YCHA 5F1XA 1MA9B 2F9WA 2V51B 2A3ZA 3O1WA 3EKSA 4H0VB 3M3ZA 4AM7A 3QFPA 1QQMA 4CZIA 3ENHA 3UKUA 3P4IA 4WQ5C 4CZHA 4RWTA 1NM1A 3R6MA 1BU6O 3LL3A 4J8FA 5AQVA 3ATVA 4EFHA 1BA1A 2P9PB 3HTVA 2A40A 5BN9A 3VESA 1XUPO 2P9IB 5AQXA 2Q31A 1NGFA 5FPDA 3C7NB 3TU5A 3DXMB 2P9KB 3D7EO 3FZHA 4JHDB 5AQGA 3FR0A 1OKJA 4GNIA 4H0XB 2P9UB 2FF6A 2A5XA 4Z94A 1X3NA 4IZ9A 2VCPA 4B1XB 4EIAA 4BC4A 3I8BA 3ULEA 3SJHA 3QICA 4M63C 2YHYA 2E8AA 4BG9A 1T6DA 3HM8A 3R9PA 3VF6A 3HSCA 3BUZB 3CJ1A 4FPBA 4H0OA 5EX5A 1YUWA 5AQIA 3VGLA 3WQUA 1NGJA 2NRHA 3LDOA 1NMDA 1TYQB 3AAQA 5AQFA 3QFUA 5BPMA 1U2VB 5I9EB 2GELA 2W41A 2PAVA 3CI5A 4H5VA 2NZTA 4H5NA 2ITMA 3U9DA 2BTFA 3FZFA 1ESVA 2F9TA 4CZFA 2ASPA 3O4WA 4BRNA 1HPMA 1P8ZA 4WYBA 4CD3A 4FWRA 1YAGA 4JAXA 2DPNA 5AQNA 4IJAA 4WQ4C 3GBTA 1HKGA 2Q1NA 4CBWA 2V52B 4B1ZA 2HMPA 5AR0A 4BR9A 2P9SA 3GL1A 2QWLA 3S41A 2E2NA 1C0GA 3L4IA 4FOEA 3A0IX 1NGCA 4RCHA 4BQZA 3UKUB 5AQMA 1DGKN 1NGBA 2CGLA 1KAZA 3DXKA 3RSEB 4DQ8A 3VEWA 4XEIA 3H1QA 1HKBA 1QQOA 3LDQA 5E26A 4BR5A 2VWBA 1BWFO 1SQKA 3IMXA 4BRGA 3HI0A 1NLVA 5FPNA 4EAHD 4WQ5A 5AQJA 1C0FA 5BRHA 2QWMA 1MWMA 1SZ2A 1QHAA 3CJCA 4BRQA 3CETA 1HJOA 1BG3A 4BR4A 3ZETA 3LDNA 3ATUA 2ZGYA 4C23A 4EHTA 5AQSA 2IVNA 3LM9A 3ZEUB 3O80A 3J8AA 4I6MA 1XQSC 3A5MC 3H3NO 3JS6A 4BRPA 3FGUA 1HUXA 1LCUA 4HTLA 4H0PA 4K42A 1GLJO 1NGAA 2E2OA 3H1VX 5ELZA 4FWNA 1Z05A 5AQZA 5BRDA 1R59O 4BGAA 2GUPA 3WT0A 3MN6A 4ISEA 1NGEA 4CZLA 3SLCA 2IVPA 4O8KA 4K43A 3ZX0A 3VEVA 3ZX2A 4RTFD 1S3XA 3CQYA 3ID8A 5AZIA 3VOVA 4FO0A 3VEXA 3A5OC 4H5RA 1GLCG 1BDGA 3VF2A 3AARA 2E2PA 5AQLA 3ENOA 5AQWA 5BREA 3UE5A 5BN8A 2E1YA 3D2FB 2YHWA 4BR7A 4A61A 3VEOA 1DKGD 1RGIA 2D4WA 5KQDA 4H5TA 2HOEA 4GY2B 3U8XA 1BO5O 1NGHA 1YVNA 4M7YA 2P9SB 4XH5A 4CD1A 5LY3A 5AQUA 3WUHA 1NGIA 2H3GX 4HWIA 3WEEA 4LC9B 3UKRB 3H3OB 5AZJA 2QWOA 4WQ4A 4K25A 3GDQA 1WOQA 2YJEA 4FWLA 5JLHA 1GLFO 2CH5A 3LDPA 4B9QA 4BR0A 1KAXA 4CBUA 1BOTO 4CZKA 3SMSA 1HKCA 4BVPA 2Q0RA 2QWQA 4IO8A 3W0LA 3DWLA 4BRHA 4M7XA 4BVOA 3VPZA 4BC2A 3AY9A 1X3MA 4JN4A 4BRIA 3FZLA 1EQYA 3VGMA 4NB4A 4A2AA 4DHYA 3MDQA 5B8HA 3O6WA 4MO4A 4PKGA 3CIPA 1GLAG 2KHOA 4FPAA 4I6MB 3OHRA 5JICA 3FE1A 4BRMA 3BF1A 5AQKA 2FSKA 2ZWHA 4K41A 3MK6A 3IUCA 4CBXA 4FWOA 3H46O 3QMLA 3VEZA 5ADXA 4FSVA 3KVGA 2V7YA 4PKHA 1QZ5A 2VYPA 4BRLA 1RFQA 2IIRA 4H0YB 3I33A 2HF4A 1QZ6A 2Q0UA 2I7PA 4YDUC 4DB3A 3F9MA 2OANA 2P9NA 3QBWA 3UB5A 3H6EA 3EN9A 4BROA 1J6ZA 2P9PA 2E20A 3JXUA 3LDLA 4FWMA 4ISFA 4BRAA 2FSNA 4BREA 4FWQA 2P9IA 3VGKA 1ZXOA 3VEYA 3C7NA 3DXMA 3EKUA 2P9KA 4EHUA 5AQOA 4JHDA 5AQQA 3KZBA 2W40A 4A2BA 1GLLO 2P9LA 3L0QA 3GOIA 2IVOA 1Q18A 2P9UA 5AQYA 2CGKA 1T6CA 4PL7A 3FZMA 1V4SA 4FWPA 4B1YB 2D1KA 5AZJB 3O5BA 4QS7A 3BF3A 5TKYA 3IFRA 3KHYA 1NBWA 3HZ6A 2QWNA 3L6QA 1KAYA 3AAPA 5F0XA 4XH4A 4BRFA 3DAWA 2FF3B 3ULEB 5CE3A 4Y0WA 2ZGZA 4FWKA 1TYQA 1BUPA 4B1UB 3FZKA 5AQTA 2NLXA 5AFUA 2I7NA 1D4XA 4CZJA 5FPEA 1BA0A 1IJJA 3QBXA 2QWPA 4FWSA 3U9ZA 2BUPA 1MWKA 4BRCA 3MN9A 1X9JA 1WUAA 4ISGA 1HX1A 1NGGA 2E88A 3GE1A 4CJ7A 1JCEA 1G99A 2WUSA 3LM2A 1ATSA 2ASOA 1ATNA 4QS8A 4H03B 2QWRA 5F2RA 1Y64A 2A6AA 5BPNA 4CZGA 3A5NC 2GWJA 3RSEA 1ZBSA 2P9NB 2AP1A 1JCGA 3A8YA 4JD2A 3DXKB 4YDUA 3SK3A 2YJFA 4BRKA 1HLUA 1V4TA 2Q2RA 3VENA 2Q36A 5EOYA 3W3DA 3O8MA 3MN7A 3CERA 3QB0A 3O08A 5AQPA 5LJWA 4H5WA 4E1JA 1YXQA 3QDKA 2E1ZA 1QQNA 3MN5A 5AQRA 1JCFA 3ZETB 2P9LB 1DEJA 3ZEUA 5BPLA 1RDWX 1H1VA 2Q97A 3C0BA 3FLCO 3H45C 1K8KA 1LOTB 2ASMA 2HF3A 2QW9A 4FOIA 3VETA 3EL2A 5LJVA 4H0TB 2ZF5O 4JNEA 2PBDA 2FSJA 1GLDG 3D2EA 1S22A 1CZAN 1KXPA 2AA4A 4PKIA 3EZWA 3VF4A 3BP8A 2UYTA 3BEXA 1GLEG 4MO5A 5KPTA 1E4GT 4BG8A 1ATRA 4QS9A 4BC3A 2CH6A 5AQHA 4CZEA 4FL9A 4CZMA 2GWKA 3GG4A 3MCPA 5ADXH 5AZIB 3FFKB 2E2QA 3SMPA 4BQLA 1NWKA 2FXUA 3M6GA 4B1VA 1U6ZA 3U4LA 1Z6RA 3D2FA 5JMVA 4IJNA 2QXLA 1XC3A 2J4RA 4NO7A 3CJ9A 3R8EA 5KPRA 5EVZA 3MMVA 4IXCA 2YI1A 3CJBA 1GLBG 2YHXA 3DJCA 5E84A 3G25A 3B8AX 3CQXA 4L3QA 3TPQA 4MLHA 4DCHA 4AM6A 2CGJA 3ZX3A 5EY4A 5KPZA 4BC5A 2V7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VWJA 5T7BA 1QE1A 2A1RA 4M3RA 4FLVA 4BR2A 3KLGA 2QXFA 4BGBA 5BRFA 4Z0UA 3SQ4A 1T7PA 4N5SA 3R1XA 3O4NA 3CJAA 4DR5K 4UQGA 3LWLA 4E7JA 4M42A 2X6SA 4BRDA 3NAEA 3KLFA 3KLHA 1IG9A 3THYA 1K9MO 1UA0A 1TL3A 4A57A 4CFAA 4OKEA 4AILC 3VQQA 1SS6A 4ID5A 1TUUA 4XH1A 3SNNA 1NGDA 3WXIA 4JKGA 2YNGA 1IV0A 3CHWA 5FPMA 1S1VA 4FM1A 2E6LA 2ZJRL 4MFBA 3L2RA 4KHPK 3NGIA 3TAQA 2A3ZA 2O8DA 3EKSA 4H0VB 2X74A 4AM7A 3V9SA 4KKOA 4IDKA 2WBNA 4J2AA 3K9JA 3DYAA 5M1NA 3DLGA 4GV6A 1YVUA 2HNZA 3LL3A 1IBMK 4J8FA 5AQVA 1FKOA 4OLBA 4YY3K 3HTVA 1S1TA 3RR7A 1SUQA 4CEFA 5FPDA 2IOCA 3DXMB 4KB0A 3ZT3A 4JHDB 4DR1K 4CJ4A 4GNIA 4BACA 4R79A 4LY7A 2P9UB 3CCVN 4GKJK 2KTQA 4GW6A 1RBSA 2RKIA 3G0ZA 4KI4A 4M63C 2G8VA 4DV0K 4BG9A 1T6DA 3TTFA 3CJ1A 1W0HA 5EX5A 1YUWA 5AQIA 2NRHA 1TYQB 5AQFA 3LAMA 1BCMA 1XMOK 2GELA 4OPAA 2W41A 4H5VA 4IEIA 2RPIA 3CC4N 1NK7A 2Z1JA 1T03A 3OVNA 5J2MA 1IKXA 4DTSA 3L2VA 1ESVA 4H4OA 2BGGA 3PSFA 5AJ3K 4KHUA 4LF7K 1D9DA 4BRNA 3O4WA 4CK1A 1HPMA 1P8ZA 3VQ9A 4FJNA 4CD3A 1HNXK 4FWRA 4JAXA 4W5RA 3DRPA 3NCIA 3SV4A 2YNIA 2HMIA 4DSEA 3GBTA 4B1ZA 2HMPA 5AR0A 4PUOA 3GL1A 4DV7K 3A0IX 3AVNA 4JI3K 4BE0A 4CFCA 3VQPA 4DQ8A 3MAQA 3RSEB 3CM5A 1QSLA 2HHQA 1NG9A 3QETA 1HKBA 3TI0A 1I39A 1N6QA 4FJ9A 4EZ9A 2IC3A 3HI0A 3RVCA 5AQJA 4JKCA 1HJOA 4DQRA 3V1OA 4C23A 4EHTA 3HVRA 1EWQA 1VQ9N 3ZEUB 4I6MA 1XQSC 4CIFA 1S6QA 3H3NO 3TTDA 3AA4A 3FGUA 1LCUA 4CJEA 1GLJO 4BE2A 2A1SA 3H1VX 3AVIA 3TAEA 4QOZB 3ZSYA 3NGZA 4RG8A 2XY6A 4DTUA 3WT0A 3PX0A 4V19S 4ILHA 2W42A 4CZLA 3HRGA 4JKFA 1N33K 4DSJA 3T7ZA 1WSIA 4HTUA 1JLBA 2D0AA 1U4BA 4J2DA 3VOVA 4FO0A 3A5OC 4H5RA 3VF2A 3AARA 5AQLA 4KHWA 3ENOA 3UE5A 3ZSVA 5BN8A 1VK0A 4KHQA 5CYQA 4BR7A 5C25A 3OYFA 1XHZA 4RW6A 3SBGA 1TAUA 4KI6A 5H1SQ 4GY2B 4Z4FA 5LL6Z 4I7FA 1N8RO 4M7YA 5DMRA 4XH5A 2F8TA 4HWIA 3BZCA 1VHXA 5AZJA 5CYMA 4FWLA 3ZT0A 4HUEA 2CH5A 4CBUA 1BOTO 1NK8A 3SMSA 5M1QA 4IO8A 2QWQA 3W0LA 4DTJA 4BC2A 4AHVA 4C8KA 4A2AA 4DHYA 4KREA 3K5MA 1NKBA 3AVHA 3CIPA 3N4QA 2HB5A 4EP5A 1GLAG 4FPAA 3CCSN 5J2PA 4CEQA 1RT3A 5JICA 3BF1A 5KTQA 5AQKA 3THYB 2ZWHA 4K41A 2E4LA 2VGMA 4PKHA 4YORA 4E7IA 3I55N 2GX9A 4JI6K 4AHSA 4BRLA 1DTTA 4OLAA 2IIRA 3NMUA 2O8DB 4CEOA 3KIOA 4DTOA 3MWPA 3V1RA 3QBWA 1GOAA 3Q7BA 4Z4IA 3AO5A 4BDYA 3O3GA 4YOTA 1J6ZA 3HL8A 3LDLA 4B9LA 4KTQA 1S9EA 1RBVA 4BRAA 4B3OA 4FWQA 2P9IA 4CF9A 1ZXOA 4FLWA 2QEXN 2VG5A 5AQQA 3L8BA 4DU3A 2GV9A 2KLAA 1GLLO 3L2WA 1LWEA 3DLRA 3SPYA 1Q18A 3S9HA 2CGKA 4YOWA 1ILYA 1V4SA 4QS7A 3CPEA 3TWHA 3UIQA 3IFRA 4DKWA 1HNZK 4DR6K 3F5TA 3FFIA 4XH4A 4CGJA 3DAWA 4C1NI 1JLAA 3HK2A 1N5YA 4JK8A 3HXMA 3HPOA 3SUOA 1Q8IA 3V4IA 4FWKA 4B3RK 4B1UB 2PFUA 3PO5A 5AFUA 1B92A 3T1AA 4BDPA 1WSHA 3HOSA 4DTRA 1VSJA 1IJJA 2OZMA 4DV3K 1YT3A 2QWPA 3DRSA 3E9LA 3T69A 3U9ZA 4YFUA 1I3AA 2W6KA 4N47A 4GVMA 1VQON 4IFVA 1HX1A 3LM2A 4LF5K 3U3GA 3G10A 4JKEA 4CJTA 3DM2A 4CZGA 4FW2A 4J2BA 4RW7A 2VG6A 2P9NB 2ZE2A 3M8QA 3A8YA 3O9TA 3IRXA 3SK3A 1EKEA 4B8CA 2YHAA 4KO0A 4KRFA 3I56N 3AGKA 2Q2RA 3VENA 2AJQA 1RDBA 2HW3A 4H5WA 4ELUA 2QKBA 1GOCA 3QDKA 4CJLA 3MN5A 1IH7A 4CHZA 3O4QA 4QAGA 1OH5A 1Q81O 3V9XA 4OGCA 5A2QO 1HQEA 3NE6A 3ZT4A 4JNEA 1VSDA 2FSJA 1GLDG 2D0CA 3EYZA 1KXPA 3HPHA 2WFBA 3EZWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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