4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase regulatory protein
publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transferase/transferase regulator
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
1X9JA 4CZGA 5BN9A 4BRIA 1NBWA 4BR0A 5JLFA 2AA4A 3WXIA 1ZC6A 2QWOA 3R6MA 5AQTA 2W40A 3B8AX 3UKUA 2BTFA 3ENOA 4BQZA 3M1FA 3QFUA 4EHUA 1RDWX 3W3DA 3G25A 1X3NA 3GL1A 3OHRA 3UKRB 5KQ8A 5AR0A 2E1ZA 5AQGA 5AQRA 5BREA 5AQSA 2P9UA 3C7NB 1DKGD 3WXLA 5AZIA 5AQKA 1DGKN 1ZXOA 2CGJA 5JLHA 5BRHA 3QB0A 1QHAA 3CI5A 4AM7A 3R9PA 3WXKA 2Q36A 5AQQA 2H3GX 3ENHA 3DXKA 1NGFA 5BR9A 3VGMA 4FPAA 4CJ7A 4FSVA 1NWKA 2HF3A 2A42A 2EWSA 3M6GA 4RCHA 4XH5A 3M3ZA 2ZF5O 5FPMA 3SLCA 1BDGA 1LCUA 2I7PA 1DEJA 1NGCA 5BN8A 4FWPA 4NB4A 2HOEA 4FWMA 3J8AA 3I33A 4H0PA 3DWLA 4M7XA 1TYQA 1U6ZA 2IVOA 2A6AA 4B1XB 4YDUA 2D0PA 3MK6A 3H46O 2YCHA 4YDUC 3O1WA 1GLEG 4FPBA 1QZ6A 1KAYA 1MDUB 3EL2A 3BUZB 4H0TB 5ELZA 1ZBSA 1XQSC 2E2OA 1YAGA 3MCPA 4CI6A 1YUWA 2FF6A 4BGBA 2GTDA 3DJCA 1S22A 5FPNA 2CH5A 2V52B 3EKUA 3KHYA 4IO8A 1Z05A 1T6DA 3CJ7A 4BGAA 3D2EA 2A3ZA 2CGKA 5TKYA 4RTFD 5AQUA 2FSJA 5AQIA 4K25A 3CJ1A 2GEMA 3P4IA 3LM9A 5JMVA 3RSEA 4M63C 4FWKA 4JNEA 4K42A 3MN5A 3QICA 4H5WA 5ADXH 3AAQA 5AQLA 2I7NA 5AQWA 3O4WA 4BREA 1BO5O 4PKHA 2GELA 4WQ4A 3ATUA 3ZEUB 4CZIA 1YXQA 4WQ4C 2DPNA 3IUCA 3AAPA 3BP8A 2QW9A 3I8BA 3VOVA 4B1VA 4BC4A 4DB3A 4PL8A 3VENA 2P9NB 2A41A 3WUHA 3DXKB 4WQ5C 4A2BA 4CZJA 2HMPA 1SQKA 3WXJA 2V7YA 2E2NA 3D7EO 2P9PA 3KZBA 3A5OC 5FPEA 3VEOA 4FWSA 4H5RA 4BG8A 2FF3B 4JD2B 4PL7A 4PKIA 1BOTO 1LOTB 3AARA 3JXUA 4IXCA 4BC3A 4BVPA 3VEWA 1JCEA 5AQVA 4BC2A 2CH6A 1NGIA 4BR2A 3KVGA 3CJ9A 4JN4A 3DXMB 2P9IA 2GUPA 4JHDA 2ASPA 3WEEA 2ITMA 3FE1A 1KAZA 1T6CA 3JS6A 3BEXA 3EZWA 4LC9B 4B1UB 5KPZA 1S3XA 3ID8A 5B8HA 1EQYA 4H0VB 4MO4A 3HTVA 2E1YA 4PKGA 3SMSA 1MWMA 1BUPA 1Q18A 4BRDA 4Z94A 5E84A 3AY9A 4J8FA 5F0XA 3QBXA 5FPDA 4DHYA 3U8XA 1Z6RA 3MN6A 3SMPA 4HTLA 1SAZA 2P9SB 4ISEA 1H1VA 2GWKA 2J4RA 3BF3A 1K8KB 1BU6O 1G99A 5AQXA 2YJEA 4BG9A 2PAVA 3VGKA 2F9TA 4CD1A 3ZETB 3FZKA 3ULEA 3U9DA 3FR0A 1QQNA 5AQOA 3LDNA 3LDLA 3U4LA 2YHWA 4BR7A 4E1JA 2AP1A 4O5FA 3L4IA 3CIPA 2W41A 5ADXA 4FWOA 4H5NA 4AM6A 4RWTA 4CBUA 3HBTA 2P9KA 2YI1A 3O6WA 4BROA 3HZ6A 5EXWA 2P9LB 3O08A 1SZ2A 1T44A 5AQPA 1NGEA 3WQTA 1U2VA 4H5VA 4FWQA 5AZJB 4I6MB 2Q31A 3L6QA 1OKJA 3H3NO 2A5XA 3D2FA 4K43A 1NGDA 3CETA 4CZHA 2QWRA 3CERA 3GG4A 1HPMA 4BRNA 3GDQA 5LJVA 3R8EA 2QWPA 2WUSA 4FWLA 1TUUA 1NM1A 2ASMA 2P9IB 4ISGA 4CBWA 1BWFO 1C0GA 3S41A 3UKUB 3H1VX 2UYTA 4XEIA 4XH4A 1X3MA 3C7NA 3H45C 2ASOA 5F2RA 2V7ZA 4B1WB 3IFRA 3H6EA 1GLFO 3CJCA 5EY4A 2P9UB 5BPNA 4WYBA 1BG3A 4C23A 2VWBA 5AZIB 1NGJA 4BC5A 2E20A 3SK3A 2FLOA 2QWLA 2F9WA 3LDQA 3GOIA 4MLHA 1ATNA 5AQHA 1HKCA 3LDOA 3SJHA 3WT0A 2NZTA 3GE1A 4IWVA 2A40A 4K41A 1BA1A 4H5TA 1D4XA 1QZ5A 5KPRA 3QBWA 3EKSA 3A5LC 3QFPA 5AQMA 3VF4A 5LJWA 4FL9A 4NO7A 5BPMA 3EN9A 4BQLA 4QS7A 2BUPA 5I9EB 5AQYA 3FZMA 1ATSA 4MO5A 2D1KA 3L0QA 3U9ZA 2GWJA 1NMDA 1GLBG 2E88A 4A2AA 2D0OA 4BRLA 1BA0A 1JCFA 1HLUA 5BPLA 3IMXA 1TYQB 1KAXA 3CHWA 1IG8A 2E2QA 5AQJA 2P9KB 3A5NC 4CD3A 4CZKA 4M7YA 2D4WA 3A8YA 4FO0A 5BRDA 3ATVA 3VEYA 1YVNA 4CBXA 1U2VB 1E4FT 1JCGA 3VF2A 2ZGYA 3MDQA 5AQFA 1HKBA 2NRHA 5AFUH 4BRPA 3D2FB 1GLDG 3ZX2A 2Q0UA 1GLCG 3FGUA 4DCHA 4QS9A 3HI0A 2OANA 3D2EB 1C0FA 4MLEA 4BRKA 2VYPA 3O80A 3VGLA 3BF1A 2YHXA 1V4SA 3CJBA 4HWIA 3WQUA 3O8MA 3VERA 1GLJO 4GY2B 5KPTA 3HM8A 3RSEB 3VF6A 4CZMA 4H0OA 3ZEUA 2QWQA 1NGBA 2E2PA 3VETA 2QWMA 1QQMA 3FZFA 1RGIA 3CJAA 2IIRA 5F1XA 4EHTA 4XH1A 4ISFA 1GLAG 4CZEA 4QS8A 2YHYA 2P9NA 1MA9B 3FZLA 4KBOA 3VEXA 1TUYA 2VCPA 3H3OB 3A0IX 1RFQA 3TPQA 2ZWHA 2Q1NA 4JD2A 4BRCA 1WOQA 3QMLA 5EOYA 2P9PB 1HX1A 1CZAN 1GLLO 2E8AA 2HF4A 3CQYA 2FXUA 4B1YB 4BRMA 4BR5A 5KQDA 3O5BA 3DXMA 3A5MC 2Q97A 3QDKA 4BRAA 3F9MA 4FWRA 1E4GT 5EVZA 3O1BA 4FWNA 1J6ZA 1ESVA 4JHDB 3UKRA 2NLXA 1IJJA 3WEEB 2IVPA 3LM2A 2QXLA 4B1ZA 4EFHA 3UE5A 1V4TA 4BR4A 1Y64A 5CE3A 4BRHA 2QM1A 1HJOA 3LDPA 3MN9A 4A61A 2P9SA 4F9OA 1MWKA 2PBDA 3H1QA 1K8KA 4DQ8A 4EAHD 3FFKB 3VEZA 3VESA 1QQOA 4FOIA 5AQZA 4BRQA 4FOEA 3CQXA 2FSKA 3DAWA 3MMVA 5AQNA 3ZETA 5E26A 5AFUA 3EO3A 4Y0WA 4CZLA 3LL3A 4H0XB 5BRFA 2CGLA 2FSNA 4IJAA 4H0YB 4L3QA 4CZFA 2V51B 4IJNA 4BR9A 3ULEB 4GNIA 1HKGA 2KHOA 3HSCA 4BRGA 3FZHA 3C0BA 2ZGZA 1XUPO 4BRFA 4EIAA 3UB5A 4IZ9A 3MN7A 3VEVA 4WQ5A 5LY3A 3GBTA 1R59O 1NGHA 5EX5A 3VPZA 3ZX3A 2P9LA 3FLCO 5JICA 1ATRA 1P8ZA 3IDHA 1NLVA 5AZJA 2Q2RA 1NGAA 2IVNA 4I6MA 3ZX0A 4B9QA 1XC3A 4H03B 1HUXA 2QWNA 4O8KA 4BVOA 1NGGA 2Q0RA 1WUAA 4A62A 3W0LA 3TU5A 4JAXA 1KXPA 2YJFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K73O 4KH4A 4YOUA 4N76A 3HRGA 4KHNA 3L3VA 1ZC6A 2O4GA 3R6MA 2W40A 4E3SA 3TWHA 3V1QA 5C2DA 4BQZA 4DUZK 4JI4K 4EHUA 1RDWX 3W3DA 1VSEA 3GL1A 5AQRA 5JS1A 5BREA 2G8KA 4O4GA 1YIJN 2Z1HA 3J81O 4LSLA 1DGKN 4DFKA 4CJFA 2OZSA 2P51A 5JLHA 3QB0A 5AQQA 3L2RA 2I5JA 3NGYA 5BR9A 1E3MA 5M1KA 4LF9K 2O8DB 4WE1A 1NJXA 2HF3A 2EWSA 4XH5A 4CERA 2ZF5O 4OVLA 1HYSA 4C8MA 2FC0A 2NRXA 4FWPA 3KK3A 2HOEA 4UQGA 5IT9O 1J54A 3SAFA 2A6AA 3DI6A 4JI0K 5HL7L 5GINA 5HOOA 4JKHA 2O8FB 2UXCK 3O1WA 4M3WA 2B5JA 5H1SQ 2OTJN 2WTUA 2FBXA 4O55A 4CI6A 1MU2A 3CQ8A 4JI5K 2FF6A 4DKWA 3OYIA 1RBTA 1EX4A 4KPYA 4KHUA 4DTUA 3QERA 1RCHA 3LANA 4GV9A 4Z4FA 2CH5A 4BGAA 3OW2M 2A3ZA 3NE6A 4GV3A 4CGDA 4K25A 2YNIA 3O3HA 3LM9A 3P31A 2GBZA 5M1OA 4M63C 2YNGA 2UUBK 2OPPA 3AA3A 3KWGA 4JNEA 4NYFA 3MN5A 4B9SA 4C8LA 4DF4A 4BREA 3DM2A 4WQ4A 4JKBA 4DSJA 2QK9A 2F4VK 3V1RA 1RT6A 5I3UA 3IUCA 3BP8A 4DLEA 2PYLA 3VOVA 3LP1A 4B1VA 4CIGA 4PL8A 1VSKA 2KFNA 4DV5K 4CZJA 4DR6K 2ITGA 3A5OC 3DLEA 2OA8A 3B6PA 4PKIA 3VN5A 5E41A 4M45A 1C1CA 1W2BM 3LAMA 3I8DA 1VQ7N 4I7FA 1FJGK 3TAPA 1NGIA 3OA9A 4BR2A 5C24A 3DXMB 3IKMA 2GUPA 2ASPA 4CF1A 3DRPA 3WEEA 3EE9A 4AHUA 1RDAA 5KPZA 4DTPA 4B1UB 3MX2A 1S3XA 3VQ4A 3T1HK 3HT3A 3NCIA 3JSMA 4JLHA 1Q18A 4J2BA 3K5MA 3C6TA 4I9LA 4BACA 1C0UA 3AY9A 4J8FA 2LSNA 4KH5A 3U3GA 5FPDA 4DR5K 1Z6RA 3Q7BA 4ISEA 3BF3A 1K8KB 4M3RA 1YF5L 2F9TA 2O8EA 3FZKA 3FR0A 3PIPL 1RT3A 1BQMA 1LWFA 4OGCA 1N36K 3LDLA 4WFAL 4BR7A 4E1JA 3C95A 3L4IA 2W41A 2RE2A 4I2PA 1ZBFA 4CK2A 5C2FA 3O6WA 3CM5A 3V9WA 4DV0K 1T44A 5AQPA 4U67L 4H5VA 2BANA 3QEVA 1RTHA 2XRIA 4LH4A 3H3NO 3D2FA 1NGDA 4JK8A 3CETA 3ISNC 1QHTA 1UAXA 3O3GA 3AVAA 3J80O 1KCFA 5LJVA 4FLYA 3M5RA 3RMCA 1LV5A 3VQPA 1GOCA 2P9IB 1IKVA 5C15A 1KSPA 1BWFO 4DS4A 1K8AO 4KI4A 4H4MA 4FLTA 4Z4IA 1NU0A 3CG7A 1M1KO 1VSDA 3H45C 4OPHA 4OKKA 4IEEA 2V7ZA 5F2RA 3QEXA 2YKMA 1GLFO 3RTVA 3CJCA 4CGJA 3QESA 5BPNA 3QNOA 3SK3A 3ZSOA 1KVCA 4IFVA 4PUOA 3L3UA 2A40A 4K41A 4IFEA 1NOZA 4LFCK 5HRPA 4FL9A 1RT4A 3C94A 4FM2A 1NK5A 3CFOA 4BQLA 4F3OA 3SBGA 3E66A 2BUPA 5I9EB 4AH9A 1FKOA 1VSIA 1WLJA 3FZMA 4CVNE 3NHGA 2XY6A 2W6LA 4B8AB 1QS4A 4C1NI 4DV3K 2D0OA 4FJNA 4IOCL 5BPLA 4FJHA 3IMXA 2O4IA 4LF8K 4GVEA 3ZSRA 4CIEA 1JXEA 2E2QA 2P9KB 4YFUA 3A5NC 3AO3A 2P1JA 4CEDA 4B9UA 4M7YA 4KHWA 5BRDA 3NF6A 4OO1J 1JCGA 1NKBA 2F7TA 1VQ6N 3P38A 5AQFA 1RNHA 4DFPA 3TTCA 1GLDG 2DFHA 3WXMB 4X65K 3QEWA 3CCEN 4HUEA 5CR4A 4IOXA 1W9HA 3O9TA 4A59A 4DCHA 4QS9A 1QSSA 3O4NA 4BRKA 3P5JA 1CZBA 4HWIA 2PYJA 4FJ7A 3HM8A 5GIPA 4DUYK 3VF6A 2IAJA 4ICLA 2F96A 3ZEUA 4DTNA 4AHRA 1XWLA 1TK8A 4GW6A 1QQMA 4DFMA 1XHZA 4LD0A 4XH1A 4ISFA 4C8NA 4X62K 3IS9A 2HNYA 3NH1A 3AGKA 4QS8A 3F2KA 5J2MA 3NMUA 4QOZB 3SUPA 3AO1A 3SZ2A 4G1QA 4YOYA 4OLAA 3TPQA 3ALYA 4JD2A 2Q1NA 4B3MK 4DR2K 4FCYA 1CZAN 1A5VA 5DMRA 3OBYA 2HF4A 2OZMA 5CYQA 2FXUA 1TKTA 4DG1A 1BCOA 2PY5A 1HNVA 4YY3K 1BIUA 1J6ZA 3OJSA 1IJJA 3LP3A 3NH0A 3WEEB 4EFHA 3LM2A 4KRFA 1V4TA 4LF7K 3KK7A 1N32K 4CFAA 1UOCA 4CGGA 3LDPA 4AHTA 3MN9A 3Q7CA 4A61A 4HUGA 1MWKA 4FW1A 2O8DA 3KLFA 1U04A 3HL8A 3CQXA 5J2PA 2FSKA 3CXCM 5AQNA 2VQFK 3ZETA 1IKXA 1HNIA 3EO3A 1WBDA 5KI6A 1HQUA 4O0JA 4DQSA 4H0YB 1S1XA 2XY5A 4BR9A 4FK4A 3NFAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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