4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase regulatory protein
publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transferase/transferase regulator
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
3JXUA 2E8AA 1GLCG 3H46O 3ENHA 4H03B 3VEVA 2QWLA 3HZ6A 1BA0A 2P9PA 1X3NA 4H0XB 5AQSA 4B1VA 5FPDA 5AQOA 2E1YA 4BVPA 3IDHA 3AAQA 1XQSC 5BR9A 3FZKA 4BRMA 5AFUA 3GG4A 3EZWA 3L0QA 3CJCA 1X9JA 3A8YA 3H45C 4DHYA 2E2OA 5AQIA 4H0PA 3O8MA 2GTDA 1GLBG 2P9PB 2QW9A 3P4IA 2D0OA 3QBWA 4LC9B 4WYBA 3GOIA 4WQ5A 1NGJA 5E26A 1MA9B 3HBTA 2P9IA 3F9MA 2Q2RA 5AR0A 3O1BA 3TPQA 3D2FA 5AQNA 3KZBA 3CHWA 1T6CA 3DXKA 3IFRA 5AQLA 3EN9A 1KAZA 3O08A 4FL9A 4QS7A 4H5NA 1QQOA 4IJNA 4B1WB 4AM7A 4BR9A 1RFQA 3ATVA 4XH5A 5FPNA 3WXLA 3R8EA 1JCFA 3FR0A 2ASOA 3CETA 4PL8A 4B1XB 4CZEA 2P9NA 2E1ZA 4JNEA 4XEIA 2P9IB 3H1VX 4DQ8A 4BR7A 3O1WA 3D2FB 4AM6A 3EKSA 3C0BA 2A42A 4BRQA 4KBOA 4BR2A 2PAVA 3DXKB 5F0XA 4M7YA 1C0FA 1TYQA 3JS6A 5AZIA 4BRFA 2QM1A 1G99A 1RGIA 4Y0WA 3ZX0A 5JICA 1TUYA 3CJ7A 3WXKA 2CGKA 4CD3A 1BO5O 2J4RA 2P9NB 5KPTA 4H5VA 1NMDA 5EVZA 4BRHA 2F9TA 1E4GT 1Y64A 5AQXA 2HF4A 1YUWA 3H3OB 3A5NC 1C0GA 2YCHA 2E2QA 1TYQB 2A6AA 4H5RA 5AZIB 3DXMA 2GUPA 3IUCA 3B8AX 3SLCA 1QZ5A 1V4SA 3LM2A 1ATSA 4IXCA 4A62A 4FWKA 1HJOA 1DKGD 4H0OA 4BQZA 4BVOA 3ZX2A 3WT0A 1NGGA 1LOTB 2A3ZA 2ZGYA 3G25A 5AQJA 2V7ZA 3W3DA 5JLHA 3UKRA 1NGCA 2GWKA 1NM1A 3DXMB 3O5BA 4K42A 4F9OA 3QDKA 4WQ4C 5KPZA 3MN7A 2V51B 3EO3A 4RWTA 5KQDA 5AQMA 1YVNA 2DPNA 5KPRA 5JMVA 4K25A 2ITMA 4XH1A 2ZF5O 2QWNA 3HTVA 3LM9A 1T44A 4Z94A 3HI0A 3CQYA 2D1KA 1BDGA 2EWSA 3EKUA 3QMLA 1T6DA 1V4TA 4FWPA 1RDWX 4MLEA 4DCHA 4I6MA 4H5WA 3BEXA 4QS9A 4BRGA 4RCHA 4YDUA 3H1QA 3QICA 2FSJA 2IVOA 2P9UA 2IVNA 3WQUA 5I9EB 4FWNA 1HX1A 3GBTA 3LDOA 4FWMA 3KHYA 4IZ9A 2GWJA 4BR5A 1YAGA 2YHYA 4GY2B 3A0IX 3FGUA 3QFUA 2A41A 2FSNA 1HUXA 4WQ5C 4FOIA 4C23A 3H6EA 3A5OC 4I6MB 1MDUB 5ELZA 5AQTA 5TKYA 5FPEA 2A5XA 2P9UB 3FFKB 5LJVA 4CBUA 3CJAA 3AY9A 4H0TB 4BC2A 3C7NA 3ULEA 3FZHA 4BRAA 1BUPA 4PKHA 4CZLA 1HKGA 3BF1A 3MCPA 4RTFD 3R9PA 4BC4A 4EAHD 1IG8A 5B8HA 2NZTA 4CZFA 4BRDA 3CJ9A 3FZFA 1JCGA 5BRHA 2Q0RA 2VYPA 3UE5A 1NGDA 3CI5A 3VEWA 5AQZA 5AQUA 2YJEA 4CZGA 4EHUA 1NLVA 1NGBA 5E84A 3C7NB 2F9WA 3SJHA 5BPNA 1S3XA 4JHDA 4JN4A 3WXIA 4K41A 1S22A 3M3ZA 3CERA 4JD2A 4QS8A 4MLHA 5AQGA 5AQRA 1X3MA 3M1FA 2GELA 3W0LA 3A5LC 5AZJA 3CIPA 4EFHA 1GLLO 3ID8A 2E20A 2HF3A 4FWRA 1XC3A 2WUSA 5JLFA 4BR0A 1J6ZA 3CJ1A 4FWSA 1HKCA 2BUPA 4PKGA 5EX5A 3VETA 4BGBA 1ATRA 4JHDB 4JD2B 1DGKN 3VGMA 1P8ZA 1ZXOA 2GEMA 4BC5A 3U4LA 1HLUA 2QWMA 3GE1A 3I8BA 3ZETA 1R59O 2A40A 1NGEA 5AZJB 1ZBSA 3LDLA 1LCUA 2E88A 1ESVA 2FSKA 1QHAA 3D7EO 4NB4A 3WEEA 2QXLA 3HM8A 3OHRA 1QZ6A 4BRPA 4BC3A 4ISEA 4FO0A 4HWIA 4M7XA 1GLAG 2BTFA 2I7NA 2VWBA 5AQHA 4BG8A 3WXJA 3D2EA 3ZETB 3SMSA 5EOYA 3KVGA 2ZWHA 4O8KA 2IIRA 3VENA 3WEEB 3VF2A 1JCEA 4K43A 2H3GX 2VCPA 4A2AA 5BRFA 4EIAA 1GLJO 4H5TA 3DAWA 3MN9A 3UKUA 3O4WA 4BROA 4BRNA 3D2EB 3UKRB 1SZ2A 4FWQA 1QQNA 4MO5A 1WOQA 4CZIA 1BA1A 2AP1A 2FLOA 3L6QA 4MO4A 4CZKA 4CZHA 1MWKA 2W40A 5AQWA 2QWOA 1NGIA 4B1YB 3U8XA 4WQ4A 2E2PA 3WUHA 5AQVA 4O5FA 3UKUB 3J8AA 3LDQA 3DJCA 1SAZA 4ISFA 1KXPA 3FE1A 2NRHA 3U9ZA 3VEOA 5AQFA 2W41A 4CI6A 3QFPA 1BOTO 4PL7A 4CD1A 4A61A 1ZC6A 1NGHA 3BUZB 4FSVA 4IO8A 3A5MC 1DEJA 3AAPA 3ZEUA 4H0VB 3SK3A 3TU5A 3IMXA 2D4WA 1IJJA 2P9SA 4FPBA 4XH4A 2V7YA 2YI1A 2E2NA 5BN9A 4DB3A 2P9LA 3ENOA 1CZAN 4BR4A 4IWVA 3L4IA 2P9KA 1TUUA 2FF3B 1GLDG 1H1VA 1E4FT 3VPZA 3VF6A 3VGKA 1Z05A 3ULEB 3ZEUB 3M6GA 5LJWA 1BU6O 2Q97A 3S41A 4FWOA 4BRIA 2P9SB 3FZLA 4ISGA 5EY4A 5LY3A 3MN6A 2I7PA 2P9LB 2OANA 5EXWA 1EQYA 2P9KB 1HPMA 3LDPA 3UB5A 2IVPA 2YHWA 1U2VA 2UYTA 1QQMA 3ZX3A 3U9DA 4JAXA 2YJFA 4NO7A 5AQYA 4E1JA 5BPMA 1BWFO 3GDQA 1HKBA 5F2RA 4BQLA 1KAYA 2Q31A 3EL2A 3O80A 3VGLA 2CH6A 3LL3A 3HSCA 4GNIA 3VF4A 5F1XA 1XUPO 3VEZA 4BRCA 3BF3A 5AQPA 2D0PA 2AA4A 2QWQA 5ADXH 2HOEA 1U2VB 2ZGZA 4FPAA 4CBWA 3I33A 2CGJA 2HMPA 3GL1A 4B1UB 1Z6RA 3RSEA 3H3NO 4H0YB 4M63C 4BREA 2PBDA 3CJBA 1WUAA 2Q0UA 3ATUA 1BG3A 4L3QA 5BPLA 4FWLA 3MN5A 1GLEG 3FZMA 3DWLA 2QWPA 1K8KA 2V52B 5FPMA 4BGAA 5BREA 2KHOA 3SMPA 4BG9A 3WQTA 4CZJA 5BN8A 4BRKA 1D4XA 1OKJA 1ATNA 3FLCO 2Q1NA 5AQKA 1NBWA 1NGFA 2YHXA 4J8FA 4CZMA 3LDNA 3BP8A 3RSEB 1NWKA 4B1ZA 4BRLA 4PKIA 4B9QA 1NGAA 5BRDA 1SQKA 4YDUC 1Q18A 3O6WA 3QBXA 1K8KB 2ASMA 4A2BA 5AFUH 4CJ7A 3MK6A 1KAXA 2NLXA 3VOVA 3VEXA 3AARA 5ADXA 4FOEA 3QB0A 3CQXA 4CBXA 2ASPA 2CGLA 5KQ8A 2FF6A 5AQQA 2QWRA 3VEYA 2CH5A 4IJAA 2FXUA 3VESA 4EHTA 3VERA 1YXQA 5CE3A 3MDQA 1GLFO 3R6MA 1MWMA 4HTLA 3MMVA 2Q36A 1U6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JXUA 2E8AA 3D0PA 3V1RA 3NMUA 4JKHA 3P38A 1Q7YO 3HZ6A 3U3YA 4O5BA 3QEIA 4JI7K 4O55A 4CF0A 1X3NA 3EY1A 4H0XB 4CJTA 3OJUA 3KK3A 4LF6K 3AVJA 4DHYA 2G8IA 3TARA 4H0PA 5LMNK 2GTDA 2QW9A 3P4IA 2D0OA 1A5VA 4WQ5A 3SPYA 1MA9B 5JS2A 1XMOK 5AR0A 3OYEA 3KZBA 3CHWA 3CCRN 5MLCQ 4FJNA 4C8MA 4F2SA 4DV5K 1QQOA 1BGXT 4IJNA 4AM7A 1L3VA 1TL1A 3M8QA 1JCFA 4PL8A 3CETA 4B1XB 4DS4A 3CQ8A 4DF4A 2P9IB 3K5OA 3K5LA 3HRGA 1NU0A 1NNEA 3O1WA 2XY7A 2O4GA 3VA0A 3VQ5A 1K6YA 1JLQA 2O8DA 4KH6A 3CPWM 5AZIA 4BRFA 2RKIA 4Y0WA 5JICA 4JK7A 3WXKA 4CD3A 3DYAA 1BO5O 2J4RA 1SKWA 1W2BM 1Y97A 3MWTA 4ID1A 1EP4A 1BCOA 1C0TA 3PV8A 3DLRA 1NMDA 2ATQA 3OYNA 3JAMO 4FZYA 1IH7A 1QE1A 3A5NC 1C0GA 3MEDA 3CCEN 3C6AA 3AVLA 3SLCA 1QZ5A 3VQCA 4FJXA 4KV8A 1NKEA 4FWKA 1S1XA 4XIUA 1RBUA 1DTQA 1DKGD 4H0OA 2HHXA 4IOXA 1W9HA 3ZX2A 3HM9A 4BE0A 2A3ZA 1OH7A 2ZGYA 5J2QA 1WBBA 2E5LK 5AQJA 4F4KA 1UA0A 4C8NA 3W3DA 4CGFA 5JLHA 4DR2K 4F3TA 1NM1A 3DXMB 2UXCK 1XC9A 3LP1A 3QDKA 5KPZA 2V51B 2FBXA 3SAFA 2A1RA 3NF7A 5AQMA 3THXA 2DPNA 3TR8A 4KO0A 4C1NI 4XH1A 2QWNA 3SUOA 4EZ6A 1T44A 4LF8K 3HI0A 4W5RA 3CQYA 2D1KA 3VQBA 1IG9A 3NFAA 3QMLA 1T6DA 5K14A 2F8TA 3PLAA 4QS9A 4Z4HA 1U4BA 2IVNA 1TKXA 2O8BA 1L3SA 3GBTA 4YOVA 3SBTA 4IZ9A 3KD5E 1RBVA 2GWJA 1S6QA 1CXUA 2LSNA 4MFBA 1RT6A 2YHYA 3TAQA 1CXQA 3TAMA 3TANA 2QXFA 4CF2A 4BWJA 1N5YA 1U49A 4FLXA 4KHSA 4A5BA 3WNFA 1JXEA 4KFBA 5KGWA 1MDUB 2QTDA 5ELZA 3ULDA 3OBYA 4JRQA 3ISNC 3AY9A 4IFYA 1HKGA 3IG1A 3EZ5A 4OLBA 4PY5A 3LDSA 1OH8A 1IG8A 3SYZA 2EHGA 2NNWA 5B8HA 4CZFA 4BRDA 1FK9A 4B8CA 1HNWK 5AQUA 4J2DA 4FJ9A 4CZGA 3V9SA 4EHUA 1NGBA 5E84A 2F9WA 3DLEA 4C1NK 5BPNA 2GUIA 4E1NA 4MLHA 1VQ4N 4EFHA 3MEGA 4FM2A 4AHVA 2E20A 3AA3A 4FWRA 4OVLA 3QESA 4FVUA 4X62K 5JLFA 3CJ1A 4FWSA 3CCLN 4PKGA 1DT9A 4YHHK 1ATRA 3VA3A 4JI5K 3VTIA 1P8ZA 4CHPA 1RBSA 2QWMA 4M3WA 3I8BA 1JLCA 1R59O 5AZJB 3ZETA 5C2DA 1ZBSA 4DR7K 3LDLA 1NK9A 3RR7A 1HRHA 1YIJN 2OPPA 4OPHA 1IBLK 1QHAA 3WEEA 3HL8A 3M8PA 4FJ8A 3TABA 4BRPA 1XHXA 4HWIA 2ZD1A 3IKMA 5C12A 4CGDA 5AQHA 4CJFA 5M1QA 4B9NA 3KLHA 2IGIA 3KVGA 5GAGP 2GBZA 2ZWHA 3G6EN 1IBMK 4ZHRA 2WTUA 5J1EA 4K43A 4EIAA 1GLJO 2B6AA 1YJ9N 1CLQA 4CFBA 4H5TA 2YNGA 3MN9A 3JYTA 3OVNA 4WFBL 1YTAA 4BRNA 1SZ2A 1BA1A 1RT1A 4MO4A 4CZHA 4DV3K 1VSJA 5I42A 3MX5A 2W40A 1ZBUA 5AQWA 1BQNA 2YV0X 4FVMA 4AHUA 3U8XA 3H08A 2O4IA 4O5FA 3LDQA 3CD6N 1YI2N 1SAZA 3DRSA 3ID6A 4ISFA 1NKBA 2NRHA 3NH0A 4CJSA 4JI6K 4LF9K 3QFPA 4DFMA 3THYA 5AJ3K 1K8AO 2PYLA 3PO4A 1YHQN 4V19S 3O9UA 4N76A 2G8HA 2P9SA 4XH4A 2V7YA 2YI1A 2E2NA 5J2MA 3L2WA 3VQ8A 4CGGA 3L4IA 2BANA 1TUUA 2FF3B 1E4FT 1RDAA 4NYNA 1Z05A 3L2QA 3M6GA 5LJWA 1GOBA 4K8ZA 2E4LA 2Q97A 4ILJA 4CJ4A 3K5NA 4FWOA 3NH2A 1DLOA 4ISGA 5LY3A 3MN6A 2I7PA 4JKEA 3SZ2A 3K58A 2P9LB 5FDLA 1VQ5N 5SWMA 1EX4A 2UYTA 1TKDA 2HHVA 1FJGK 2VGMA 4NO7A 3QETA 1U45A 3AVKA 4CVNE 1WSEA 4YOWA 4Z4FA 4JKGA 5KI6A 4CESA 1KFDA 3O80A 2CH6A 3VF4A 2ZJQL 1RTHA 1NK5A 5HLFA 2OTJN 1VSLA 1NJWA 3BZKA 4BDPA 4CFAA 1U04A 2HOEA 4YOTA 4FPAA 2HSTA 3VQ9A 1LW2A 3I33A 2HMPA 4DTPA 5J2PA 4M63C 1S1UA 2HBMA 4H0YB 4B3TK 3CJBA 1EETA 4PA1A 2Q0UA 3V1OA 3ATUA 4FWLA 4LF7K 2V52B 4BGAA 5BREA 1BI4B 4LH5A 3SMPA 1NK4A 1S9EA 2O8CA 3U3GA 2UXBK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4OGC A;  4B8A B;  4BQL A;  3O3G A;  4KHP K;  4GNI A;  4BE2 A;  1XNR K;  3VEZ A;  2OTL N;  5AQP A;  2D0P A;  4Y1D A;  2AA4 A;  1VRU A;  3P39 A;  5ADX H;  1RCH A;  2CGJ A;  4N41 A;  3AVI A;  2IAJ A;  1LAV A;  1Z6R A;  3H3N O;  3L4Q A;  4DTM A;  2PBD A;  3CCQ N;  3ZT3 A;  4DR5 K;  1WUA A;  4JKG B;  4L3Q A;  3VQE A;  5BPL A;  5FPM A;  4IDK A;  4B3M K;  2YX6 A;  3OS2 A;  2KHO A;  5DK5 A;  5BN8 A;  4QCL A;  4DTS A;  2VG7 A;  4ZTJ A;  2YHX A;  1RT2 A;  4FJL A;  4B1Z A;  2F96 A;  4I2P A;  3DLK A;  4IOC L;  3L3V A;  3ZYY X;  5FRN A;  2AJQ A;  4G1Q A;  1BQM A;  3V9X A;  3TAP A;  5AFU H;  3I8D A;  1ASW A;  3MK6 A;  1W97 L;  3VN5 A;  3AAR A;  2W6K A;  3QB0 A;  1QSY A;  4KPY A;  3NBP A;  2QKK A;  3VEY A;  4Z4I A;  2P51 A;  3LAM A;  1L3T A;  3CFO A;  1LV5 A;  5CE3 A;  4FLZ A;  3L3U A;  4WFA L;  2D0A A;  3R6M A;  4CEC A;  5CZ1 A;  3ZSR A;  4DB3 A;  1U6Z A;  3KWI A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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