4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase regulator
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase regulatory protein
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
2I7PA 3ZEUB 3ATUA 5EOYA 1NGGA 3ZETA 1CZAN 4FWMA 3VGMA 1DEJA 5AQNA 3CIPA 3CI5A 4MO5A 5AQVA 2P9NB 3VEVA 2A5XA 2P9SA 5BPMA 4JN4A 3FLCO 2P9UB 3H46O 2ASOA 3QFUA 4CBWA 4CZFA 3FGUA 4EAHD 5FPNA 1IG8A 3I33A 4BG8A 4DCHA 3AAPA 4EHTA 1BUPA 4YDUC 4H03B 4DHYA 3DJCA 1HLUA 2E8AA 3KVGA 4QS7A 5ADXH 1BA1A 5AQOA 2FSKA 4CZKA 3FR0A 4EFHA 2FF3B 3ZX0A 2V52B 5EVZA 3EL2A 4H0PA 1NM1A 2Q97A 2A6AA 2YI1A 1T44A 2ZGZA 4B1WB 4NO7A 1SZ2A 4BRAA 5E26A 2FSJA 3D2EB 3CJ9A 4XEIA 1EQYA 2V7ZA 4FOEA 3JXUA 3O5BA 4B1ZA 1NGHA 4RTFD 2V7YA 3A5OC 5AQJA 4BVOA 2YHXA 2EWSA 5EX5A 3L4IA 2P9IB 1T6DA 4JD2B 4IWVA 4BRKA 5KPTA 3F9MA 3R8EA 1QHAA 4M7YA 3R6MA 3ZX3A 5AQHA 3ZX2A 2KHOA 4K41A 4H5VA 1RFQA 2NRHA 3TPQA 3U9DA 3WT0A 5KPZA 3LDNA 1Z6RA 4CZLA 4H0OA 3B8AX 2W40A 3D2FA 5EXWA 2F9TA 1NGBA 4BRIA 5AFUH 2QWQA 3D7EO 1ATRA 2P9LB 1LCUA 5JMVA 5BN8A 3VOVA 4FPAA 4EHUA 3HZ6A 5LY3A 1HKCA 3ENHA 3WEEA 2YCHA 3M1FA 4B1XB 2Q36A 3GL1A 1HUXA 1QQMA 3QBWA 4IZ9A 1NGFA 3AAQA 3DXKA 5BN9A 4F9OA 1JCFA 4JD2A 3IDHA 2GTDA 4CZGA 3VENA 5AQIA 4IO8A 1BOTO 2P9PA 4FWNA 4J8FA 1V4SA 3HI0A 3A5MC 3H1VX 3MN7A 5TKYA 3ATVA 3LM9A 4FSVA 5AQSA 3VF2A 1S22A 2Q31A 3O80A 5F1XA 5I9EB 4XH4A 1YUWA 4B9QA 4BRQA 4MLEA 3ULEA 4BREA 4FL9A 4CZIA 3C7NB 2Q2RA 3H1QA 4BROA 4IJAA 4MO4A 2BTFA 1R59O 2E2QA 3O4WA 3U9ZA 4BC4A 5JICA 2CH6A 3R9PA 2CGKA 3SJHA 1TUYA 1BU6O 3DWLA 3SK3A 5KPRA 1QZ5A 3LDOA 4BR5A 2CH5A 3QFPA 5LJWA 5AQPA 4H5NA 3FFKB 3EZWA 1U2VA 3IUCA 2YHWA 3LDLA 3MN5A 3MN6A 4BR0A 4ISFA 2E1YA 2QWNA 4O5FA 5F2RA 1Y64A 3CJCA 5AZJA 2Q1NA 3WXJA 3BUZB 3HBTA 1Z05A 2QWLA 3MK6A 1NGIA 3VEYA 3FZHA 3MCPA 1NGCA 4K25A 2V51B 1E4GT 3FZLA 3UKRB 2A40A 3VEWA 3ENOA 4A61A 4CZJA 3M6GA 4FWKA 5BPNA 1Q18A 5ELZA 5AQQA 2QWMA 3W3DA 2W41A 4JHDA 2IIRA 4QS8A 4M63C 3UKUB 1LOTB 5AQRA 5AQTA 3QBXA 4IXCA 4CD1A 1HX1A 2E2OA 3TU5A 1DGKN 1RGIA 4NB4A 1TYQB 4RCHA 3GBTA 1QQOA 3VF4A 1WOQA 5AQFA 3ZEUA 3KZBA 3CJAA 4BRPA 5AZIB 2IVPA 5AQUA 4I6MB 2HF3A 3FZKA 3DXMB 1GLAG 3H3NO 2A3ZA 5BRDA 1X3NA 2HOEA 4HTLA 2P9NA 3W0LA 5FPEA 3H45C 4BC2A 2NLXA 2P9UA 1GLFO 3WXIA 2E88A 1ATSA 1OKJA 2IVOA 2D4WA 1XC3A 5CE3A 2D0PA 3WQUA 3VEOA 1YXQA 4DB3A 3CETA 2P9KB 4WQ5A 5B8HA 4Y0WA 3GOIA 1MDUB 3EKUA 1QZ6A 1NGAA 4WQ4A 5AQGA 2A41A 3KHYA 3H6EA 5BPLA 3IMXA 3U8XA 4BRLA 2FF6A 4BRHA 3I8BA 3L0QA 3CQXA 4BC3A 2GUPA 3D2EA 1GLJO 4O8KA 1NWKA 1NMDA 3QICA 1BA0A 1KAXA 1X3MA 2QM1A 3P4IA 4L3QA 4QS9A 2VWBA 4FWQA 5AQWA 3ID8A 1YAGA 4BG9A 4BGBA 3BP8A 2ITMA 5F0XA 4GY2B 3J8AA 5BRHA 2P9IA 3QMLA 1NGDA 5AR0A 2VCPA 3L6QA 2QW9A 3EKSA 4FWRA 5BREA 4BRCA 3VETA 2YJFA 3HM8A 4A2BA 1KXPA 1K8KB 4BQZA 4FO0A 3GG4A 1U6ZA 1ZXOA 3UE5A 3UB5A 3O6WA 1D4XA 2Q0UA 1H1VA 2ASPA 1WUAA 2P9LA 5AQLA 3SMPA 4JAXA 3ZETB 3VEZA 3LDPA 5AQKA 1SQKA 4DQ8A 5AQYA 1C0GA 3JS6A 3C0BA 4GNIA 3CJBA 2E2PA 3O1WA 5KQDA 1E4FT 2Q0RA 1GLBG 3A0IX 4K42A 4H0XB 4EIAA 5JLHA 4RWTA 4H0TB 3WQTA 5ADXA 3QDKA 4ISGA 3RSEB 2AP1A 4LC9B 1C0FA 1JCEA 1MWMA 1P8ZA 4AM7A 2H3GX 1ESVA 4BC5A 2DPNA 3DAWA 4BR7A 4PL8A 3CHWA 3C7NA 3O8MA 3CQYA 1X9JA 1XQSC 2E2NA 1NGJA 3IFRA 4CZEA 2QWOA 4CZHA 4BQLA 4PKIA 2ZWHA 2ASMA 3AARA 1DKGD 4WYBA 1MWKA 1KAYA 3CJ1A 5AQZA 4B1VA 3EO3A 4FWSA 3WXLA 2FSNA 2GEMA 4H5TA 3S41A 3U4LA 1XUPO 2QXLA 4H0VB 2OANA 1ZC6A 3A5LC 3RSEA 2ZGYA 3VGLA 3VESA 4BRMA 5AQMA 4BR4A 4CBUA 3A8YA 1HKGA 3UKRA 4CJ7A 4PL7A 3GE1A 2HMPA 3SMSA 2PAVA 2BUPA 1G99A 4WQ5C 5AFUA 4WQ4C 2AA4A 2UYTA 4YDUA 3O1BA 1NGEA 1ZBSA 3UKUA 2CGLA 3D2FB 3H3OB 2A42A 4MLHA 5KQ8A 2HF4A 3A5NC 1GLLO 3MMVA 4BRNA 4JNEA 4KBOA 2FXUA 2GWJA 1TYQA 1S3XA 2F9WA 3O08A 4CI6A 4CZMA 3VERA 3BEXA 3VEXA 4M7XA 3WEEB 4FPBA 2FLOA 1ATNA 4CD3A 1GLEG 5FPDA 5AZIA 5EY4A 4I6MA 4BGAA 3DXKB 3DXMA 3OHRA 4IJNA 4BRGA 3EN9A 4H5RA 1BO5O 4FWOA 2P9PB 3LDQA 2E1ZA 1KAZA 3MDQA 1NBWA 4H0YB 1TUUA 3WUHA 1BDGA 3G25A 4BRFA 1NLVA 4FWPA 1J6ZA 4K43A 1T6CA 3ULEB 2IVNA 3SLCA 1HJOA 3VPZA 3VGKA 3FZMA 3GDQA 5FPMA 1V4TA 2I7NA 1HKBA 2P9KA 3MN9A 2CGJA 3WXKA 5LJVA 1GLCG 3VF6A 2D0OA 4C23A 4B1UB 1QQNA 4PKGA 3BF3A 3CERA 4Z94A 1U2VB 1MA9B 4H5WA 3HSCA 4A62A 2VYPA 2WUSA 3CJ7A 5AZJB 1JCGA 3FZFA 4BVPA 1GLDG 2J4RA 5JLFA 3BF1A 2QWPA 1YVNA 4ISEA 3M3ZA 4E1JA 2P9SB 4HWIA 2GELA 2GWKA 2QWRA 1HPMA 4B1YB 4BR2A 2ZF5O 3QB0A 1IJJA 3HTVA 2NZTA 1RDWX 2PBDA 4JHDB 3LL3A 4FOIA 4XH5A 1SAZA 4PKHA 4BRDA 4BR9A 1BG3A 2D1KA 2YJEA 3LM2A 4FWLA 5BR9A 3FE1A 4CBXA 5BRFA 4AM6A 4A2AA 5E84A 5AQXA 2E20A 1K8KA 2YHYA 1BWFO 3AY9A 4XH1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNFA 4LY7A 2I7PA 3ATUA 3OYDA 3DM2A 3P31A 1SL0A 3R3LA 5AQNA 3CIPA 3CI5A 3CM6A 2BE2A 2F8SA 3VEVA 2ZJPL 4DV2K 4JI4K 5BPMA 4JN4A 3TSPA 2ASOA 4EAHD 4FJKA 1B92A 4I2QA 2X74A 4YDUC 1BI4B 3VQEA 4B9VA 1HLUA 3C94A 1M90O 4BE2A 3PV8A 5CZ2A 2GUIA 4ID5A 5ADXH 5HL7L 3L8BA 2UXDK 3VQ6A 1BA1A 4CF9A 3ZSYA 1T3VA 2HB5A 4IEIA 4A5BA 2FF3B 3ZX0A 3HT3A 2VGMA 1NM1A 2A6AA 2ZGZA 3OW2M 1YITN 5E26A 2HHWA 5HROA 1IKWA 2A1RA 3JXUA 4B1ZA 4JKDA 4CK3A 3P5JA 4DTPA 3SPYA 4JD2B 3KK2A 1HRHA 3F9MA 3R8EA 4M7YA 3ZX2A 3PIOL 3K57A 2FBXA 4WFAL 2NRHA 1RDDA 4Q5VA 3KJVA 1LAVA 3LDNA 3B8AX 3HPGA 3AVIA 1NGBA 4NCGA 2QWQA 3D7EO 1ATRA 4FLXA 1S5JA 5JMVA 1RDAA 3VQ8A 4B3TK 3HZ6A 2AJQA 3WEEA 4B1XB 2KFNA 2HBKA 3DOLA 1OH8A 1QQMA 4DSKA 3O3FA 4IDKA 3QEXA 5BN9A 1J5EK 2F7TA 3EZ5A 5AQIA 4IO8A 4FWNA 4KHWA 4J8FA 2QA4N 1V4SA 3H1VX 2FBVA 3SI6A 4JKGB 4W5RA 4FSVA 3MEEA 3DLHA 4MLEA 3QETA 1LAWA 4ZHRA 3H1QA 1SKRA 2YKMA 3O4WA 4NYNA 4RW6A 3L3VA 2CH6A 3SJHA 1TUYA 3AVLA 4FK4A 3DWLA 1RDCA 4E3SA 3QFPA 3KLGA 4M3XA 4FJ5A 1U2VA 3CFOA 1HJRA 3IUCA 2JLEA 3MN6A 4BR0A 2XY7A 4KHPK 3IKMA 3OJUA 3VQ5A 3BUZB 3ZLJA 3HBTA 4R79A 3O9SA 3ZT1A 3MK6A 3FZHA 4YOTA 3SQ2A 1E4GT 3FZLA 3SAGA 3TTFA 4CFAA 1VHXA 4YOXA 4OO1J 5BPNA 3M6GA 3CMAN 3VMFB 1EO1A 5ELZA 5AQQA 3CF5L 3HO1A 4BE1A 4CD1A 1ASVA 1VSFA 4FZXC 2OPSA 3KK3A 3CCJN 1TYQB 3GBTA 1KQSM 1WOQA 4B8AB 4HUFA 3ZEUA 1ILYA 3OBWA 5DM6L 2HF3A 4NLCA 1GLAG 2HBJA 3VQQA 1R0AA 5BRDA 3B6PA 3LALA 4YOVA 3RRGA 1Q7YO 3OYHA 5DM7L 2ZM6K 1NK7A 4OKKA 3CMEN 3NGZA 1TL3A 2W6LA 5CE3A 4YHHK 5FRMA 3QLHA 1YXQA 2OPPA 4DB3A 4WE1A 3CETA 3OYGA 2Y1JA 4JKEA 3WNEA 4B3SK 3HPHA 1TGOA 1MDUB 3VQAA 1VSKA 1QZ6A 3EKUA 5AQGA 4M3YA 4DSLA 2WBNA 3CXCM 5BPLA 3IMXA 4BRLA 2FF6A 3CQXA 3NVMA 2O8EA 3TABA 4CVNE 5J2MA 1GLJO 2OCEA 1SKSA 1FW6A 3V9UA 1C6VA 1YF5L 1X3MA 3HM9A 3K58A 4L3QA 4KFBA 4KHNA 1VQ6N 1RT6A 4ZTJA 4G1QA 1NJIO 2ITMA 3AVFA 4HUEA 5J1EA 2P9IA 3QEWA 1NGDA 5AR0A 3VQPA 3QEIA 2D5RA 4M3TA 4HTUA 3DLEA 1JLBA 3HM8A 4KKOA 1K8KB 4JI1K 4BQZA 1WSFA 4H4OA 1U6ZA 4CFBA 5LL6Z 3UE5A 4GKKK 5FDLA 1D4XA 1NKBA 4JS5A 2P9LA 1K6YA 2EX3A 4JAXA 3VEZA 3ID6A 1K9MO 4DQ8A 3JS6A 4CJEA 4B9LA 4GNIA 1N34K 4DSIA 3CJBA 3KWIA 2O4GA 5KQDA 3O1WA 2B4JA 3LP2A 3M8RA 4CJRA 4EIAA 4N5SA 4RWTA 3E9LA 3WQTA 4GV6A 4CHQA 4B9SA 3RSEB 3LZJA 4LC9B 4FM0A 3O3GA 1XC9A 1MWMA 4YNQA 1P8ZA 3RMDA 4AM7A 4KI6A 2G8IA 4WCEL 1YT3A 4BR7A 1N5YA 1U48A 1XMQK 1XQSC 5KRSA 1BL3A 2QWOA 3T1AA 2PY5A 1KTQA 4CZHA 4BQLA 1QS4A 2ZWHA 2ASMA 3LP3A 2XY6A 4KPYA 2FSNA 4CHOA 5E41A 3AVJA 1W9HA 2PZSA 4KAZA 4Z4CA 4DR2K 1L3VA 1SL1A 3VESA 3G0ZA 4BRMA 1I94K 4PL7A 4Y1DA 4CJ7A 3UKRA 4JV5K 1WAFA 2HMPA 3VQCA 1RDUA 4WQ5C 3U6FA 3AVGA 5AFUA 4WQ4C 2UYTA 3SUOA 4LF9K 2GV9A 4CEQA 3H3OB 2IAJA 2HBMA 3DYAA 1EWRA 3RWUA 3DLLL 3A5NC 1UA1A 2GWJA 3OYBA 1S3XA 4FJ9A 4O55A 3ZT4A 1JLAA 1Q9YA 1NK9A 3VEXA 3WEEB 5MLCQ 4FPBA 2FLOA 2DY4A 4CD3A 3LWMA 2E6LA 4DUZK 1I3AA 1VRTA 3DXMA 1YIJN 3KTQA 2NRTA 3I0RA 3EN9A 1Q8IA 1ZBHA 1TV6A 1KAZA 5J2QA 4H0YB 1TUUA 4U67L 1BDGA 3AVNA 2ZD1A 3AO1A 4FWPA 1J6ZA 1L3UA 4AHUA 2PYLA 1T6CA 2IVNA 1HJOA 3VTHA 2QXFA 4CJVA 4CIEA 1V4TA 2YNIA 2CGJA 2P5OA 1NK5A 3NF8A 5LJVA 2KZZA 4CIGA 4A5AA 1QQNA 4PKGA 3LAMA 4Z94A 1CXQA 5I3UA 1U2VB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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