3CCMN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2611u
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccmN00
3CCRN 1KD1O 3G4SN 1OVYA 1VQ7N 3CCUN 1YJ9N 3CC7N 5MLCQ 3G6EN 3J7ZO 3I56N 3CCQN 4WF9L 3PIOL 3CCSN 5DM6L 1M90O 1M1KO 3CCLN 1K8AO 3CMEN 1YHQN 5H1SQ 1ILYA 3CD6N 4WFAL 3CCJN 1VQ9N 1VQNN 4IOAL 3CXCM 1YJNN 1VQ6N 2QA4N 1VQPN 4UY8O 3CF5L 5JVGL 3PIPL 1KQSM 1YIJN 4WFNL 1KC8O 3I55N 5GAEP 1NJIO 1VQ5N 1VQ8N 1VQKN 4IOCL 3CC4N 2OTLN 1Q86O 5GAGP 3G71N 4U67L 4WFBL 1Q7YO 4IO9L 1W2BM 3CCMN 1QVGM 3DLLL 2OTJN 1YITN 3CCVN 5GAHP 1S72N 1VQ4N 5JVHL 2QEXN 3CC2N 2ZJPL 3CCEN 1K9MO 1K73O 1Q81O 1VQLN 2ZJRL 5DM7L 1QVFM 2ZJQL 5HL7L 1N8RO 1JJ2M 3CPWM 3CMAN 1YI2N 5GADP 1Q82O 4WCEL 3OW2M 1YJWN 1VQON 1VQMN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF1A 1NGIA 1N5YA 2G8HA 2P5OA 1HR0K 2WC9A 3DRRA 2A1RA 4BACA 5AZIB 4CFCA 3KLGA 1DEJA 4BR5A 3V1RA 1JLGA 1YVUA 3CCLN 1K8AO 4QOZB 1P90A 4LF4K 4LH4A 5H1SQ 1BI4B 4GVEA 4M3TA 4IDHA 4KB1A 2D0BA 5LMNK 1VQ9N 1VQNN 1RTIA 4KB0A 3TU5A 4BC2A 1BOTO 2UUAK 3OYDA 5KPRA 4OO1J 3M8PA 4DR3K 3KHYA 3ZSXA 5AQYA 3VF4A 1BQNA 3ZT1A 2CH5A 3P31A 1T6CA 4F9OA 5AQSA 2QK9A 3SBTA 3AAQA 2QW9A 5HBMA 4DUYK 3S3OA 4BWJA 4BE2A 3HYFA 4JI4K 3A0IX 1TKXA 3HP9A 3ISNC 1NGDA 1HPZA 3L4QA 5AQHA 2RPIA 3CJBA 3DXKB 3LDLA 4AF1A 1KAXA 4LSLA 2WTUA 4DLEA 4JAXA 3S41A 1ZBLA 1HNWK 4I2PA 2RF2A 4HWIA 4A2AA 4BGBA 4CBWA 2P9SB 4CZIA 3ATVA 4BDZA 5GINA 3THWA 3QEWA 2HHUA 3LP0A 4PA1A 5C2FA 3HPOA 1HNIA 1D9FA 4BRMA 4CF8A 2EHGA 2BANA 2ZD1A 5ADXH 4KHYA 5J2NA 1RBVA 1QVFM 1GLAG 2DFHA 1C1CA 3O9TA 5DK5A 4YOWA 1N32K 3NGYA 4RW4A 4KHPK 5JMVA 3JS6A 4J2AA 4JN4A 4K8XA 2PYLA 3D2EB 3MMVA 5KGXA 2X6SA 3NVKA 3O3HA 3G4SN 4YNQA 1SL2A 1S6QA 2YHXA 2QWRA 4OKJA 1YAGA 4B1WB 1HNZK 4E7HA 2GV9A 1W97L 2O8DA 4FJ8A 4IJAA 3SJHA 1U47A 1GLJO 4HHTA 3EY1A 3D2FA 4FK4A 5DMRA 5AQGA 2CH6A 3H1QA 2PZSA 4DSLA 4B3MK 3TAPA 4JKDA 3CQXA 4FK2A 3THXB 4DTMA 2E8AA 3EN9A 1Z25A 1J54A 1RT1A 4C8NA 3N4PA 3VQ9A 3R1XA 3VQ4A 1K8KB 1Q9YA 3QBXA 3O3GA 3OA9A 1KLNA 2FC0A 5AQZA 1WSHA 4BE1A 1L3VA 4AHUA 3A2FA 4E3SA 1IJJA 3DAWA 4R5PA 2F9TA 2FSJA 2E1YA 4M63C 4OJRA 2HNZA 2Q2RA 3AVFA 1QQCA 3CPEA 1OH6A 1X9JA 1TV6A 1YITN 3SYZA 4J2DA 2NUBA 4BC3A 2Q97A 4WE1A 2A5XA 3HSCA 2Z1JA 1EXQA 3V1QA 1TYQA 1VQLN 3QFUA 4PKIA 3VQBA 2A3ZA 2ZJRL 4CHPA 3SJJA 2YX6A 3VEWA 5TKWA 4FM0A 3SQ1A 5HRPA 4B1ZA 1YVNA 3SLCA 3LPTA 5GADP 4NB4A 1CZBA 1NGFA 3LZJA 4BR4A 1T05A 4LH5A 4LF5K 3J8AA 3AO1A 3M1FA 3PUFA 4BRDA 4LSNA 4AHSA 3LZIA 1SL0A 2XY5A 3O80A 4IG0A 4RG8A 3T1HK 3PX4A 1WBBA 3KTQA 1EWQA 3ZSVA 4CFAA 3M8RA 5KQDA 4QS9A 1ATRA 1RFQA 3FFKB 2YKNA 5AQRA 1QZ6A 5AFUH 3T19A 1J5EK 3V9ZA 3F9MA 1TL1A 4XEIA 4ID1A 2HVIA 4OGCA 3NMUA 3C6UA 1L3TA 1REVA 1HYVA 3RMBA 1HLUA 2GELA 4DSIA 4GKKK 1S1XA 4CIEA 3CFRA 4OKEA 3M6GA 3K5NA 1NKEA 1ASWA 1UAXA 4B9MA 2WFBA 4DV2K 1T03A 3EEQA 4IFYA 3CYMA 4IEIA 2Z1GA 5TKYA 4C1NK 4M3UA 2PFUA 1S5JA 1VHXA 2HHXA 4M3ZA 4B3TK 2OZMA 4EFHA 3MN6A 3KLEA 4LD0A 1JL1A 4U67L 4IO9L 3SCXA 2G8FA 3KK7A 2BE2A 5FROA 4CJ7A 1GLCG 3VQQA 4H0PA 2D0CA 4CIGA 1KFDA 3C95A 2IIRA 4BRHA 2UXCK 2QEXN 1LW2A 1U49A 1VSHA 5CR4A 4ICLA 3CCEN 2HNYA 1NMNA 5LJVA 3VMFB 3DLRA 4BRFA 1K73O 4OPKA 3VN5A 1HPMA 4CJPA 1RBRA 1LAWA 4CZJA 4FJKA 3VQ7A 4IEEA 3WXIA 3K2PA 1ZBUA 4PQUA 3ULEB 3VERA 3PV8A 5HL7L 3THYA 3TAQA 2UXBK 3THWB 4ELTA 3OYNA 3WNEA 4JS5A 3KK3A 2DY4A 4MO5A 4RW7A 1C0MA 3WT0A 4N41A 1A5XA 2VG7A 2P9IB 3TAEA 3ZLJA 4DB3A 4KREA 3J7ZO 1W0HA 3HK2A 3F2KA 3CCSN 3LDSA 5AFUA 1M1KO 3ZX2A 1HJOA 1CXQA 1NK8A 4Y1CA 3OVNA 4H0TB 4B9NA 3K9JA 4FJ9A 1QQOA 2RHKA 4J2BA 4FJNA 1JLAA 4ILGB 3PX0A 4NCBA 1BL3A 1MWMA 5GIOA 4IG3A 5JLHA 2B5JA 5C25A 5M1OA 4BQZA 4A2BA 3TAMA 3ZYYX 1C0UA 3P1GA 4OPHA 1WSJA 1QSSA 3E9PA 3JYTA 4CHNA 4FL9A 1IV0A 5FDLA 4B9SA 2Y1JA 4K42A 4C8LA 3D2FB 4DF4A 3O1WA 4B9UA 4CF2A 5BPMA 2W42A 1IBLK 2DFFA 3I0SA 1HYZA 4KBOA 1JKHA 2PY5A 1SL1A 5IT9O 2B6AA 1NK6A 3GG4A 3WNGA 1B9FA 4CJ3A 2YHAA 3IRXA 4WQ5C 2VGNA 2P9UB 1XMOK 2JGUA 1F21A 3TARA 3DXKA 3T1AA 4FYDA 1KXPA 3IMXA 1K6YA 3CQ8A 1C0TA 2KFNA 1ASUA 5BR9A 3TANA 4O44A 4FK0A 3OHRA 2P9SA 4C23A 2YNFA 1RTJA 3W0LA 2NRWA 4JS4A 3N4QA 5BPLA 3UKUB 1EQYA 3TSQA 1OH5A 3QEXA 2FSKA 3I8BA 3BP8A 1JLQA 1VSFA 3VTIA 3R8EA 4MDBA 1XI1A 2X78A 3CPWM 3AVJA 1N33K 2NRVA 4G9ZA 3UKRA 4NXMK 1VQON 1RDBA 1TYQB 1WAFA 4J8FA 4ID5A 2P1JA 3RSEA 4FZZA 2Q31A 2Z1IA 3CM5A 5CZ2A 5AQKA 4RW6A 4BRLA 4JI6K 4CZGA 3ZSQA 4FM1A 1J6ZA 3J7AP 3LAMA 3C6TA 2NRTA 1P8ZA 3EO3A 3VQ8A 3CCJN 3RMAA 4FO0A 3AVNA 1XHXA 4FJIA 4JKGA 1RTHA 3U8XA 1UA0A 1NLVA 4ELUA 4IFEA 3M8SA 5BRHA 3IFRA 4DF8A 4JK9A 5AQMA 3NFAA 2UU9K 4E7KA 4B3RK 2JWKA 4BWMA 3OYGA 2OYQA 4E7JA 3AVBA 1SZ2A 4IOXA 1BO5O 3I55N 4YOXA 3SUNA 1RBSA 1U6ZA 3DXMB 4B3OA 2P9KA 3W3DA 3T7ZA 5HROA 3MWPA 3NF6A 2IVNA 1X9SA 2CGKA 5I3UA 4F3TA 3IKMA 4NLBA 5CYMA 5C24A 2I7PA 4CHZA 5D3GA 1U45A 3QNOA 5CHIA 4CFDA 3CFPA 1HKBA 4BC4A 3MEEA 3U9ZA 3SI6A 2A40A 2OANA 4DV0K 4AHVA 4CF0A 3CFOA 2ZWHA 4YDUC 4FJ5A 5J2PA 1SV5A 2GUPA 2PAVA 4C8OA 2XHBA 2YHBA 1KTQA 4BRQA 4FWSA 5KPZA 4BQLA 4DS5A 5EOYA 3TR8A 1EWRA 3KLIA 3E9OA 1JJ2M 1S3XA 5AZJA 4BR9A 3MCAB 4A5AA 4CEZA 2JLEA 1YI2N 4ILHA 3FZLA 4WCEL 3MN5A 3DLGA 2IVPA 4HUGA 1NGJA 3QERA 3AVMA 3O4QA 3L6QA 3WXMB 4Q5VA 4DTSA 1IBMK 4GNIA 4AHRA 3V6DA 1HNVA 4I6MA 1WAJA 1BDGA 3PO4A 3O5BA 3SV3A 2YV0X 4CJTA 5HOOA 1NGAA 4C1NI 3SUOA 2O8BB 3SPZA 1N6QA 2QM1A 2QKBA 4AM7A 3U9DA 3QEIA 1WOQA 3VQAA 4N47A 1TKTA 1FW6A 4DWIA 3MXIA 4IOAL 4FM2A 1KVAA 3CF5L 4NO7A 2HHVA 4CFBA 4C8MA 4N5SA 4FLXA 4FLTA 3UIQA 5BRDA 1YTUA 1NBWA 3VEYA 2E88A 3NAEA 1VQKN 3SQ4A 5CE3A 4H5TA 2IGIA 1U4BA 5AQTA 3K5MA 4L3QA 1Q86O 1MA9B 3K58A 1QS4A 3HPGA 1IKVA 4DV7K 4QAGA 4BGAA 3SAGA 1Q7YO 4O5BA 2GBZA 2VWBA 1RGIA 3E9LA 4HCBA 4BVOA 3VQEA 4CK3A 3CCVN 1CXUA 1I39A 4GVMA 1RBTA 3HOSA 3DLHA 3D6RA 1J5OA 4FLWA 1ZYQA 4DTRA 2F9WA 3AGKA 3V81A 2OPSA 1QSYA 3QIOA 5E26A 3SZ2A 1ZBHA 3VPZA 4BRPA 2P9PA 1N8RO 3RRHA 1T8EA 1HMVA 3SK3A 5KQ8A 1W7AA 3ULEA 2VWKA 5AJ3K 1YJWN 4QS8A 1OH7A 3CCRN 1SAZA 3ITHA 2O8FB 3K5LA 3NE6A 4BG9A 3C65A 3HO1A 3ID8A 3E66A 5HRRA 5EX5A 4DSKA 3HOTA 3MX2A 3PIOL 2F96A 2P9IA 1JXBA 1T6DA 1Z05A 4H5RA 3PX6A 3CMEN 4JI2K 3UKRB 1IO2A 3DRSA 3AA3A 1L3UA 5KPTA 1HX1A 3I33A 3AVCA 3VA3A 1HQEA 3RSEB 4E7LA 2VYPA 3MCPA 2NRZA 1SKSA 1NK0A 4M3XA 1RNHA 1VK0A 4JK8A 3AVLA 1VSIA 2AP1A 2YNIA 1A5WA 1GLBG 3H46O 4DU4A 2KQ2A 3IDHA 3DOLA 1KC8O 4W5TA 5HRSA 4JKGB 4CI6A 2VCPA 4Z4CA 4E1MA 1D8YA 4KH4A 1V4SA 3CJ9A 5M1KA 5M1NA 4CESA 3OS0A 4EAHD 3QBWA 4IFVA 3MEDA 3QIPA 3CC4N 2KZZA 1JL2A 3G25A 5AQXA 2P9NA 3AA5X 3CI5A 3K57A 4CGHA 1WSGA 3G71N 3L3VA 1VSKA 4JI1K 4ZTFA 2P9KB 1XUPO 2P9UA 1ZC6A 3FZMA 2Q1NA 1DKGD 3KK2A 4PKGA 2E2OA 4BRNA 2VG6A 3CC2N 2HHTA 4KI6A 1YUWA 4Z4IA 1NGBA 4BC5A 1C6VA 3D45A 3CJAA 4Z4FA 1RT6A 1GLDG 3OJSA 1X9WA 3SAFA 3B8AX 2E6MA 3A5LC 1G99A 3D7EO 3UKUA 4B9LA 4IBNA 3TI0A 4NLCA 1NOYA 3NCIA 2Q0UA 1QSLA 4LY7A 5ADXA 4G1QA 1Q82O 4LF6K 4FJLA 4H4MA 1JLBA 4E19A 1RT3A 4DFMA 1LWCA 4DV3K 4CJSA 2FSNA 4DTJA 1VQ7N 1YXQA 3HJFA 1BGXT 4KPYA 4DQ8A 5BRFA 1RDUA 3O08A 2GX9A 1JCEA 3RRGA 4HTUA 5AZJB 4MO4A 4RW8A 2NLXA 2D0PA 2IC3A 4YOYA 1XC3A 5FPDA 2VQEK 5M1PA 3HZ6A 4M41A 4Z4EA 1TKZA 4JKFA 4BDYA 4DR6K 1BUPA 2YI1A 3HTVA 3QMLA 1D4XA 4F2SA 2V7YA 4BRAA 1YTAA 3O3FA 2P51A 5LMUK 3KLFA 3CXCM 4DR1K 3BUZB 4FOIA 2YCHA 1TK5A 4CD1A 4I6MB 4BE0A 3R9PA 4BRGA 2G8WA 3WUHA 3NH2A 4EZ6A 3AARA 4CBXA 1JXEA 3BF1A 1VSMA 1ITGA 3H45C 4E0DA 4CECA 5JLFA 1W9HA 4Z4GA 4CE9A 1IH7A 3HSTB 3VF6A 4C8KA 4JKHA 3VEVA 3DXMA 4AM6A 3O9QA 3BGRA 3MX5A 2W6LA 4Y1DA 1BA1A 4DCHA 3V9SA 2UUCK 5J2QA 4A57A 4WFBL 2ZGYA 4DSJA 4FLZA 3OBYA 1SKRA 3CCMN 4DU3A 5CYQA 2OTJN 1R0AA 3O4WA 3U3YA 1TL3A 3HT3A 4DR2K 4AH9A 4NCAA 1C1BA 5LJWA 4B9TA 3JSMA 2DFEA 4CJEA 3ENHA 3LP3A 4X66K 3OYJA 1C1AA 4CZLA 4BDPA 3NVMA 1NM1A 1WBDA 3ZT3A 4WQ4A 2HB5A 5BREA 3DJCA 3IS9A 3WNFA 2A42A 3BEXA 3KWGA 5CZ1A 4JHDB 2DTUA 4FJMA 4F8RA 2VG5A 4CJKA 3HRGA 4CIFA 3SMSA 3VQPA 3CCUN 4I2QA 1YJ9N 1ATNA 1HKGA 4O4GA 3JXUA 1GLLO 1RDWX 3CCQN 2P9PB 2HW3A 4PWDA 4OLAA 3DLEA 3LP1A 4CEBA 3GDQA 3V1OA 4A61A 4H0VB 1WLJA 4CZFA 2FF6A 4K25A 1XWLA 2ASOA 4FWQA 2KKZA 2PYJA 3H3OB 2O8BA 4GW6A 4B1XB 3RR8A 4DKWA 3VQ6A 1JCFA 4PY5A 4CGIA 1BA0A 5LL6Z 5JVGL 2ZE2A 3AO4A 3PLAA 4EHUA 3OYHA 4O5FA 1D9DA 1TVRA 1RDDA 3VESA 3QINA 2O4GA 2F4VK 4DV5K 4O8KA 4CEOA 4LFCK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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