3CCMN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2611u
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccmN00
3CCQN 2QEXN 3G71N 3CCRN 1JJ2M 5HL7L 3I55N 3CCMN 1VQ5N 1OVYA 3CMEN 4IOAL 3CCLN 4WFNL 1VQ4N 1VQ8N 1W2BM 1YI2N 3CCUN 1VQ6N 5H1SQ 1M1KO 3CC2N 5GAGP 1VQ9N 1YJWN 1VQNN 4U67L 1QVGM 5JVHL 2OTLN 1NJIO 1YIJN 1Q7YO 3CC7N 1K9MO 4IOCL 2ZJQL 4WF9L 1KC8O 3CMAN 5MLCQ 1N8RO 3CD6N 5GADP 1S72N 3CF5L 1VQON 1YJNN 5DM6L 3G4SN 3OW2M 5GAHP 3CCSN 5JVGL 1M90O 1VQPN 3PIPL 1YITN 3CCEN 3CCVN 1K8AO 3PIOL 1VQ7N 4WCEL 2QA4N 1YJ9N 4WFAL 5GAEP 3J7ZO 3CXCM 1Q82O 3DLLL 3CCJN 2OTJN 1Q86O 1K73O 1ILYA 3I56N 1KQSM 4WFBL 3CC4N 4IO9L 1YHQN 1KD1O 1VQMN 3G6EN 1VQKN 3CPWM 2ZJRL 2ZJPL 4UY8O 5DM7L 1VQLN 1QVFM 1Q81O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C8OA 1BG3A 4CF1A 1HUXA 3EZ5A 2ZD1A 3AVIA 3DLRA 4KKOA 2QK9A 4ILJA 3I55N 2NRRA 1LWCA 3CJ1A 2G8VA 3NF9A 4E7KA 4Z94A 2QWNA 1N33K 1Z26A 3A5OC 5FDLA 4ZHRA 5HOOA 3VGKA 2F9WA 5LJWA 3A0IX 2X6NA 1HKCA 2NUBA 5KPTA 1DT9A 5BPMA 3THVA 3DJCA 3QEIA 4CF9A 5EX5A 4LF4K 4Q5VA 4BR7A 2HBJA 4DFPA 3AO5A 3U4LA 5AR0A 3C6HA 3EY1A 4CBWA 1WOQA 3M3ZA 3HYFA 3BF3A 5AQXA 5CE3A 4DF4A 4KHPK 1RT7A 2G8IA 5EOYA 2QWQA 2O4IA 4A5AA 4W5NA 3BZCA 3IRXA 3K5NA 4GVMA 3ASMA 1YJNN 3LM2A 3O4WA 4GKJK 1ATSA 2Y1IA 4NYNA 3DMJA 3L4QA 1RT5A 5DMRA 4EZ6A 1S1XA 3NF8A 4FYDA 4CZLA 2FC0A 1IBKK 4ISEA 3O3GA 2P9PA 3M8SA 1GLJO 1C0TA 4H0YB 4DFMA 3H3NO 4DTXA 3CXCM 3ZSVA 2O8EA 1U48A 2HHVA 2IGIA 2ZM6K 3KJVA 5C2FA 3CYMA 1TKDA 1ZBFA 1KAZA 5FPNA 4FJHA 3VQBA 2V52B 1C0UA 2KFZA 1EP4A 1UOCA 4WFBL 3CQYA 3VEVA 1U45A 4BQLA 4JI2K 4B1WB 4YOXA 1WLJA 5JS2A 3AV9A 1NK8A 5FRNA 2OPRA 3U9DA 1SKRA 4PL7A 3AVCA 4FCYA 4HCBA 3IS9A 4LF7K 1SUQA 1VSDA 4EFHA 1TVRA 4ID1A 3UE5A 1TYQB 2P9IB 1T6DA 4H5RA 4JKCA 4FK4A 4FWMA 1HQUA 4Z4HA 2P9LB 5IT9O 1OVYA 5AFUH 3H6EA 1HNVA 4IOAL 4YOWA 3OYLA 4E1NA 3LDNA 3VQQA 5GIOA 1O13A 3QBXA 3D2EB 3OBWA 1XC3A 3HXMA 4CHQA 4LF8K 3RSEB 3OYDA 3DLBA 4CJ7A 4BGAA 4IOCL 3QETA 4EP5A 1ZBUA 2IVOA 3AVNA 2B5JA 2YCHA 3AA5X 3UB5A 3R6MA 1RBRA 1EWRA 2KQ2A 1ASUA 4FJLA 1RTHA 3NE6A 2P9KB 2P9NB 3DOKA 3HM9A 3KK7A 4YORA 4MQ3A 3ZEUB 3V9SA 1YJ9N 4FJ5A 2B4JA 1S6PA 3P1GA 1ESVA 4CHOA 2Q36A 1NMNA 1S5JA 3HOTA 3O9TA 2BDPA 4BDPA 1XNRK 2OTJN 4LH4A 4JN4A 4N47A 1XHZA 2FBTA 4ID5A 3RMCA 3SAHA 4CK1A 1RFQA 2CH6A 1RGIA 3SQ1A 1NJXA 3FGUA 2QKKA 1YT3A 1KAXA 1VRTA 2ZJPL 5LL6Z 3T1YK 3VQ6A 4H8KA 1U47A 4PKIA 1HNZK 2F9TA 3AVFA 3DRPA 3CCQN 3MEDA 4GY2B 3LM9A 3UKRB 1K8KB 3HM8A 2VQFK 2E6MA 3G10A 2PYLA 4AM6A 5BN8A 5EU7A 4FWRA 3QLHA 3BUZB 4M7XA 3CCMN 1HJOA 4B08A 3DRSA 4DCHA 4RW4A 3W3DA 3S9HA 5FLXO 2ZE2A 4GV9A 4DTUA 4KTWA 3I0SA 3NDKA 4BE1A 3BZKA 1NJZA 3ZLJA 4QS8A 3KVGA 3KK1A 2EX3A 3FZFA 3A5NC 1K6YA 4CIEA 4N41A 5JS1A 2E2PA 3SBTA 4K0KK 4FW2A 3M8QA 1K9MO 2R7YA 3CFOA 1KC8O 3HTVA 3WXKA 4HTUA 3KD1E 2Q97A 2YNHA 4YHHK 1UA1A 4RW8A 3VGLA 1BIZA 4BRMA 4F2SA 4ELVA 4YFUA 4OKKA 5DM6L 2V7ZA 3KWGA 3PSFA 1VSHA 1N5YA 1LW2A 2D0BA 2OANA 1QSSA 1L3SA 4PQUA 3AVJA 3MDQA 4KB0A 3K59A 2G8KA 2E20A 4CEDA 5AQIA 3E9OA 3THWB 3RTVA 4M3UA 3MN5A 1NKEA 1BISA 1UA0A 4HCCA 1OH6A 1SKWA 3B8AX 1RBVA 4F2RA 3AVGA 2Z1HA 2VGMA 4JK7A 4CD1A 5LMUK 1EQYA 3OHRA 1WBBA 2B6AA 3MECA 1O1WA 3VETA 3C6AA 2X78A 2GBZA 4QAGA 4H0PA 5C24A 1WSIA 3WNGA 5TKYA 3NFAA 3HBTA 3A2FA 3AO3A 4FM0A 4U7BA 1HKGA 3E66A 1RT1A 3VQEA 4CJFA 4GV3A 4W5TA 1S3XA 4AHCA 4BRNA 2UXBK 1I3AA 1S6QA 1BL3A 1QE1A 2UXDK 4FWNA 1Q81O 3TI0A 5ELZA 1RT6A 1KAYA 5AQNA 1QTMA 3E1YA 2JGUA 3SYZA 3ATVA 3G71N 3A5LC 3IKMA 3U6FA 3FLCO 1RDWX 5SWMA 3SPZA 1JLCA 5JLFA 3F2KA 2IOCA 1HPMA 4NLCA 4FJKA 4DTNA 4DSEA 3SZ2A 3VQ8A 3DI6A 3HJFA 1X3NA 4WFNL 1W2BM 4LFBK 1EWQA 3LDOA 1X9SA 3O1WA 4J2AA 1IBLK 4QOZB 1NGJA 2H3GX 4IBNA 2AJQA 4JD2B 2X6SA 5AZIA 4DV5K 1YIJN 2XRIA 3WNEA 2HVHA 4PKHA 3NMUA 2P9PB 3DLEA 1OH5A 2UUAK 1XQSC 1B9DA 4H4MA 5CHIA 3JYTA 5IWAK 4BDYA 4DQRA 3AA4A 2O8EB 4KPYA 2DTUA 4JKHA 1NJWA 3C65A 3CD6N 2UUBK 4C8MA 4YOUA 3SUPA 4DV6K 3J7AP 4BC5A 2DFEA 4PKGA 2UU9K 3F73A 5BR8K 1NK0A 3V1OA 1JLQA 2I7PA 1HNIA 5F2RA 1Y64A 3CJBA 3R3LA 3TAEA 2GWJA 1K8AO 4DF8A 2Q2RA 3M8PA 3QNOA 3SQ0A 2E5LK 1EX4A 2P9IA 1RDDA 3UKUA 4WYBA 2ITMA 1JXBA 1FJGK 4OPAA 4CEEA 1SAZA 3QINA 4GMJB 4X62K 1IG8A 4F3TA 2DFFA 2W40A 3KK2A 3VQ4A 3O3FA 3PY8A 5KI6A 5AQSA 1Q86O 4I2PA 3D2EA 3L2WA 4FOIA 3V9UA 1NNEA 3AARA 2PY5A 4O8KA 2A1RA 3LP0A 3LP1A 2RKIA 4FJ9A 3LL3A 4FVUA 2ETJA 3C6TA 1J53A 3TWHA 3TABA 4RTFD 3PX4A 4CEZA 3TTCA 1OKJA 3AVHA 3P31A 3J7YP 1C1CA 2UYTA 5AQKA 3HK2A 4IG0A 1QS4A 3ZYYX 4DTMA 3V6DA 4BRGA 1BCMA 4IOXA 1ZBIA 3EYZA 4KI6A 3O6WA 4MO5A 4IDKA 4FZXC 4DSIA 3CCRN 5C12A 1GLFO 1CLQA 1RTIA 3OJUA 3L2QA 2BH1A 2P1JA 2I7NA 3OYNA 5AQGA 4DV7K 4Z4FA 4CZIA 1KXPA 3ZEUA 1U2VA 3RRGA 4KREA 4PHTX 1BWFO 1YJWN 1WAJA 3ULEA 4BE2A 4H4OA 3VEXA 3SJJA 1CZ9A 5M1NA 4BROA 3KWIA 1GLDG 3WNHA 3CJ9A 3HP9A 1SZ2A 4KH5A 4CFCA 4FZZA 5E41A 5KPRA 4HUGA 4W5QA 4BC2A 2D0PA 1NGEA 1YVNA 5SZTA 3V9WA 1S1UA 4DR7K 3WQTA 1KCFA 1YUWA 4IJAA 4BRDA 4FLWA 2YHWA 3DXMB 2UXCK 4I6MA 4FWOA 3MXMA 1DKGD 3UKRA 4DUZK 4MFBA 4ISFA 2HNZA 5CZ1A 1YTUA 2ZGYA 3D6RA 3VQCA 2ATQA 4DV4K 1KRPA 3NVMA 3THYA 3NBPA 1L3TA 4O4GA 4RCHA 1T7PA 4DV0K 1C1BA 3THXB 1J9AA 1XMOK 2EWSA 5J2MA 3SLCA 4K25A 1K73O 3ZT3A 1D4XA 1BOTO 1F21A 1ATRA 3L3UA 3DWLA 1RT4A 4QS9A 4DTOA 2QWLA 1KD1O 2ITGA 2NRZA 1CZBA 4RG8A 4CESA 2P51A 3LDSA 3RRHA 1IJJA 4AHRA 3DAWA 2WTUA 4CK3A 1VQLN 1XWLA 4JNEA 2F4VK 5EY4A 4FO0A 3LAMA 4HUFA 4C8KA 3K2PA 1G99A 1KTQA 3V1RA 1OH7A 3SMSA 3VF2A 5KRSA 3EE8A 3T1HK 4M63C 2DY4A 3CIPA 2VQEK 3HVRA 3ATUA 4YDUC 1LV5A 1RTJA 4CGJA 3M6GA 3N4QA 4JK8A 4GKKK 2YNFA 5C15A 2A3ZA 1VQ4N 3O80A 1S1TA 4O0JA 5AQQA 3DLKA 2XY8A 1YI2N 4DR4K 2QM1A 2Q0UA 1RILA 2YNGA 2ZWHA 5GAGP 3HP6A 2Q3SA 1W9HA 2VYPA 2QWOA 1VSFA 5C10A 5AQFA 1MA9B 3I8BA 3QICA 4EIAA 1HMVA 2HNYA 1YXQA 2GEMA 4OPHA 1QQMA 1WSEA 1VSMA 3U3YA 1NGHA 1T03A 1LCUA 3ID6A 1IBMK 4FXDA 3ZETB 4AQYK 4CGHA 2G8FA 1KVCA 5A2QO 2E1YA 3PIPL 2YHBA 3CG7A 3DYAA 3MMVA 1WSFA 3N4PA 1JL1A 2QA4N 1ZBHA 3VEZA 3O4NA 4BACA 3EKSA 5KGWA 3J80O 2W6LA 3MXIA 2D4WA 1ZBLA 1WN7A 1EETA 3AO2A 3QFUA 4JHDB 4CW7B 3HOSA 2NRHA 4WE1A 3SK3A 5FPDA 3NVKA 5AQUA 4Z4EA 3LP3A 4CK2A 4DU1A 2FBVA 2F7TA 4JD2A 4C23A 3CC4N 3KLHA 2AP1A 4EHUA 3GOIA 2HBMA 3L8BA 3KHYA 3P4IA 3SQ4A 4MDAA 3MAQA 2HHUA 5KQDA 4K42A 1YVUA 3NF7A 4LC9B 3GE1A 4KTZA 3S41A 4CJTA 3OYEA 4DWIA 4W5RA 2W41A 3AGRA 1NU0A 5AZIB 4DR2K 1NGDA 2QWMA 4ISGA 2QEXN 1HQEA 4O5BA 2VWBA 4JS4A 1SL2A 3HT3A 3GBTA 3I0RA 3SUQA 4CD3A 1X3MA 3QO9A 3LPTA 1BCOA 1JLEA 1D9DA 1LW0A 4I9LA 5HRRA 3VN5A 3VA3A 4CFDA 4CFBA 5H1SQ 3FZMA 4H0TB 2KLAA 2E8AA 1C0FA 2W42A 2J4RA 4JKBA 5T7BA 3MCPA 2ZJQL 3UKUB 3TAQA 2Y1JA 3SV4A 3TARA 1B92A 1QSLA 2E2NA 3ENBA 5ADXH 1VQON 2HBLA 1N36K 3OBYA 4JS5A 3L2VA 2QXFA 4CJRA 1M90O 1Q9YA 1TK8A 3CCVN 1NOZA 1JKHA 3PIOL 1KLNA 3RR8A 1YAGA 1TK5A 1ASWA 1BGXT 4BC3A 1VSKA 4DMNA 3WXMB 1RDAA 4WFAL 5GAEP 1QQCA 4CZGA 3K5MA 5AQJA 2P5GA 1BHLA 1NM1A 4FPAA 3BF1A 4CZJA 4B1XB 1LAWA 3ZSXA 5I9EB 3OS0A 3V4IA 1FXXA 3VOVA 3NH2A 2Z1GA 1Q18A 2NLXA 4NYFA 4K41A 3H45C 4V19S 5LY3A 2HBKA 4LF5K 3C6UA 1U2VB 2D0CA 4JEPA 3GL1A 5AQOA 4B9NA 3PSIA 4FL9A 4ZTJA 5E84A 4DFKA 3ULEB 1NK5A 2Z1IA 1NK6A 2BTFA 3QMLA 3PO5A 4KHWA 4UQGA 3ZSWA 2HMIA 2CGKA 2D1KA 5M1PA 3SUOA 3R8EA 1NGCA 1JJ2M 3QERA 3DXMA 1IKXA 3RMBA 2HNDA 4FJMA 4M3ZA 2OA8A 3ISNC 3VQ5A 4CGDA 1N32K 3MN6A 3S3NA 1FK9A 3L4IA 3HSTB 3SNNA 3CERA 1NJYA 3CC2N 4I6MB 4JKFA 4FM2A 3PX6A 3THXA 4B9UA 4NCAA 4BRIA 1C0MA 1ZXOA 3OYCA 4QS7A 1FKOA 4DR6K 4A57A 1TGOA 2I5JA 3THYB 3OYMA 5BRFA 3TSPA 5HP1A 3IMXA 1WBDA 4FSVA 3NCIA 3HPGA 4IFEA 4CBXA 4JI4K 1C6VA 1E4GT 5AQZA 4AHVA 1VSEA 4FWPA 1VQ7N 2RF2A 4BVPA 3MCAB 3NGYA 4M3TA 1I39A 1Z6RA 1NLVA 3KZBA 4BVOA 1BA1A 1BI4A 3DLLL 4FK2A 3LWLA 5JLHA 3NAEA 3WXIA 3KLFA 4EHTA 2YKMA 5AJ3K 1Q8IA 5C25A 4ELTA 2O8DB 2IS3A 1CZAN 1VK0A 3OYBA 1IKYA 4WQ5A 3CJ7A 1EKEA 3AO1A 4BRPA 3K5LA 2E88A 4WQ5C 3G6EN 1VQKN 1NGIA 1E4FT 3VTIA 4AHUA 3CQ8A 3HVTA 4DQPA 5C42A 3EO3A 3QEVA 3T69A 4FW1A 2QTDA 3C0BA 3CETA 1QVFM 4Y1DA 1B9FA 3LZIA 3A5MC 2ZF5O 1XC9A 4DLEA 3IFRA 3ZETA 4L3QA 5JICA 3WXLA 4C8LA 4CEAA 5F0XA 2YV0X 1DLOA 1V4TA 3AGKA 3MWPA 2KW4A 4JK9A 4DTSA 1LAVA 3ULDA 2A1SA 2YI1A 4H5NA 4I2QA 4CJKA 2GV9A 4CERA 4KHYA 4JHDA 3F9KA 4DSJA 4FJGA 5HRPA 4JAXA 2IAJA 4CZHA 3AY9A 4FWKA 4IFYA 1WSHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCQ N;  2QEX N;  3G71 N;  3CCR N;  1JJ2 M;  5HL7 L;  3I55 N;  3CCM N;  1VQ5 N;  1OVY A;  3CME N;  4IOA L;  3CCL N;  4WFN L;  1VQ4 N;  1VQ8 N;  1W2B M;  1YI2 N;  3CCU N;  1VQ6 N;  5H1S Q;  1M1K O;  3CC2 N;  5GAG P;  1VQ9 N;  1YJW N;  1VQN N;  4U67 L;  1QVG M;  5JVH L;  2OTL N;  1NJI O;  1YIJ N;  1Q7Y O;  3CC7 N;  1K9M O;  4IOC L;  2ZJQ L;  4WF9 L;  1KC8 O;  3CMA N;  5MLC Q;  1N8R O;  3CD6 N;  5GAD P;  1S72 N;  3CF5 L;  1VQO N;  1YJN N;  5DM6 L;  3G4S N;  3OW2 M;  5GAH P;  3CCS N;  5JVG L;  1M90 O;  1VQP N;  3PIP L;  1YIT N;  3CCE N;  3CCV N;  1K8A O;  3PIO L;  1VQ7 N;  4WCE L;  2QA4 N;  1YJ9 N;  4WFA L;  5GAE P;  3J7Z O;  3CXC M;  1Q82 O;  3DLL L;  3CCJ N;  2OTJ N;  1Q86 O;  1K73 O;  1ILY A;  3I56 N;  1KQS M;  4WFB L;  3CC4 N;  4IO9 L;  1YHQ N;  1KD1 O;  1VQM N;  3G6E N;  1VQK N;  3CPW M;  2ZJR L;  2ZJP L;  4UY8 O;  5DM7 L;  1VQL N;  1QVF M;  1Q81 O; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4C8O A;  1BG3 A;  4CF1 A;  1HUX A;  3EZ5 A;  2ZD1 A;  3AVI A;  3DLR A;  4KKO A;  2QK9 A;  4ILJ A;  3I55 N;  2NRR A;  1LWC A;  3CJ1 A;  2G8V A;  3NF9 A;  4E7K A;  4Z94 A;  2QWN A;  1N33 K;  1Z26 A;  3A5O C;  5FDL A;  4ZHR A;  5HOO A;  3VGK A;  2F9W A;  5LJW A;  3A0I X;  2X6N A;  1HKC A;  2NUB A;  5KPT A;  1DT9 A;  5BPM A;  3THV A;  3DJC A;  3QEI A;  4CF9 A;  5EX5 A;  4LF4 K;  4Q5V A;  4BR7 A;  2HBJ A;  4DFP A;  3AO5 A;  3U4L A;  5AR0 A;  3C6H A;  3EY1 A;  4CBW A;  1WOQ A;  3M3Z A;  3HYF A;  3BF3 A;  5AQX A;  5CE3 A;  4DF4 A;  4KHP K;  1RT7 A;  2G8I A;  5EOY A;  2QWQ A;  2O4I A;  4A5A A;  4W5N A;  3BZC A;  3IRX A;  3K5N A;  4GVM A;  3ASM A;  1YJN N;  3LM2 A;  3O4W A;  4GKJ K;  1ATS A;  2Y1I A;  4NYN A;  3DMJ A;  3L4Q A;  1RT5 A;  5DMR A;  4EZ6 A;  1S1X A;  3NF8 A;  4FYD A;  4CZL A;  2FC0 A;  1IBK K;  4ISE A;  3O3G A;  2P9P A;  3M8S A;  1GLJ O;  1C0T A;  4H0Y B;  4DFM A;  3H3N O;  4DTX A;  3CXC M;  3ZSV A;  2O8E A;  1U48 A;  2HHV A;  2IGI A;  2ZM6 K;  3KJV A;  5C2F A;  3CYM A;  1TKD A;  1ZBF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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