3CCMN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2611u
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccmN00
4U67L 1Q7YO 3OW2M 3CCLN 1M90O 2OTJN 1VQPN 3CMAN 1YJWN 1VQKN 3CXCM 3CCQN 3G6EN 4WFAL 5JVGL 4WCEL 4WFBL 1K73O 1YI2N 1KC8O 4WF9L 1VQ4N 5JVHL 4WFNL 3PIPL 1YIJN 2ZJRL 3I56N 3CD6N 3CCSN 3CCEN 1QVFM 2ZJQL 1QVGM 3G4SN 3CC4N 1K8AO 1KQSM 5HL7L 3CCJN 3CPWM 1S72N 1VQNN 3CCVN 3CCUN 5GADP 5GAHP 1YHQN 1VQ7N 3CCMN 3G71N 1VQ5N 1YJ9N 1YJNN 5DM6L 1VQLN 1N8RO 1VQMN 5GAEP 1JJ2M 1YITN 1Q86O 1OVYA 5GAGP 1NJIO 4IOAL 1W2BM 1Q82O 5H1SQ 2ZJPL 3J7ZO 1VQ9N 2OTLN 3CF5L 1K9MO 3CCRN 4UY8O 3I55N 5MLCQ 1M1KO 5DM7L 4IOCL 1VQ8N 3CMEN 3CC2N 1KD1O 2QEXN 3PIOL 1Q81O 1ILYA 3DLLL 2QA4N 1VQ6N 4IO9L 3CC7N 1VQON
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N76A 4CECA 1XUPO 2P9SB 1EWRA 3PSFA 1BCMA 4M41A 4A62A 2BDPA 4PA1A 2CH6A 4LF6K 5CHIA 4WCEL 4I6MA 4E0DA 1B9DA 3KK2A 1S9EA 4FJLA 4NXMK 4BR7A 1IBLK 3VF6A 1JCFA 2CGKA 4DV2K 4CZMA 3MWPA 3AVBA 3AV9A 5KTQA 5C0YA 3O4QA 2A5XA 4E7IA 2PY5A 3NH2A 3ASMA 3SQ1A 3I33A 4FM0A 4CFCA 4DUYK 4MQ3A 4YDUC 4CZEA 5AQMA 4IBNA 4EFHA 4H03B 1LWCA 1IKYA 4H5TA 4WQ4C 2QK9A 3PX4A 2RKIA 2VQFK 3K5NA 3LDSA 4DLGA 5FPDA 1WBDA 5BPMA 5IT9O 4FJKA 2HHWA 3PLAA 5AQIA 2W42A 1HPZA 3CETA 3OY9A 2PYJA 1NK8A 5GAGP 2EWSA 1W2BM 3C94A 4ID5A 2W41A 4QS9A 5CR4A 5BN8A 3VF2A 4E3SA 4C8LA 1VQ9N 5FLXO 4N41A 1X9WA 1N5YA 3TARA 3M5RA 3ZT4A 3ISNC 4FK0A 3U9DA 2D0OA 4KPYA 4CD1A 4JKGA 3U3GA 4OLAA 3O4WA 3HZ6A 1K6YA 4DV6K 3UKUA 1RDUA 2F7TA 2FBYA 3DI6A 4JN4A 3VQAA 1WB9A 2F96A 4CEOA 3AY9A 2PAVA 1ITGA 4BRFA 1U6ZA 4JD2B 2QA4N 3OYMA 2OPQA 4JI0K 4W5TA 3H3OB 2KZMA 4KTZA 2NUBA 2UU9K 1B92A 3U6FA 1VSIA 2ASPA 4FO0A 3OYJA 5CE3A 1XHXA 3B6OA 3THWB 5M1OA 4FJJA 1JLBA 3KD1E 4CW7B 2CGLA 1QHTA 3P1GA 1NGCA 1WSHA 1VQKN 2AP1A 1BOTO 4CZHA 3AVLA 5C24A 1G99A 4K8ZA 1IKXA 4CGJA 1RT2A 3K58A 3WXJA 3TTDA 1NK7A 2HBJA 2JWKA 2P9KA 1R0AA 4PQUA 2R7YA 4KB1A 1SL1A 3O5BA 4GV3A 3VQ9A 4DR3K 4V19S 1NU0A 3FFKB 1OH8A 1BI4A 2P9NA 4FWNA 4JNEA 4B3RK 1J54A 4GV9A 1KAZA 1Q9YA 3OJUA 1JLGA 4DTPA 3L4QA 1SL2A 1BHLA 3ALYA 2NRZA 4JKAA 3JSMA 4CJEA 4DG1A 2V51B 5EOYA 5C12A 3V6DA 1NK9A 3T7ZA 3L4IA 1X1PA 4OPKA 4NXNK 5GAEP 1JJ2M 2V7ZA 3LP3A 4DB3A 2WFBA 1NJIO 1REVA 1RGIA 4FYDA 1T44A 4DF8A 5JICA 3J7ZO 3C6HA 1BG3A 1BL3A 2Y1IA 4C8KA 2B5JA 2QWPA 4CJ4A 2E2NA 2HVIA 4MDBA 4XEIA 2YV0X 4O44A 4DV4K 1X3MA 3ZSWA 4C1NK 3VERA 5AFUA 4PKIA 1S1WA 1ATRA 1WN7A 1NGFA 4I2PA 1J53A 3SBGA 3VN5A 4J2DA 1CZBA 3E9LA 1RNHA 3RR7A 5JS2A 4BRIA 3VQ8A 5KGXA 3BZCA 3AVIA 3ZEUA 1JLFA 1QS4A 1EP4A 1VK0A 1IG8A 4LF7K 4JKDA 2HSTA 1S1UA 2XY7A 3VEZA 3PY8A 1MU2A 4I9LA 1VQPN 1VSHA 3NH0A 1JLCA 1VRTA 2JGUA 3O8MA 5AZJA 3MWTA 1OVQA 3RVCA 4WFBL 1BQMA 5A2QO 4PL7A 4WE1A 4ID1A 4WF9L 2Q0RA 4ISFA 2FF3B 5HLFA 2GEMA 5M1QA 4EP4A 3I56N 5GINA 4DR1K 3CCEN 3D2FA 4CJQA 2OANA 3LANA 1HJOA 2HW3A 3EE9A 3KZBA 1ESVA 2VYPA 3IFRA 3WNFA 2P9UB 2A6AA 3N4QA 4K43A 1QSYA 1LAVA 3J7YP 1U49A 3O9SA 4DTXA 3AVHA 3MX2A 4RW8A 3LL3A 5GAHP 4H8KA 2F8SA 3MK6A 4CGIA 3ZT2A 3TAMA 3SAHA 1D5AA 1RDDA 3TAGA 4JI1K 4O4GA 1WAJA 4HWIA 4JI8K 3H1VX 5FPMA 4CZJA 3T1YK 1NGEA 4A5BA 3RMBA 3G0ZA 3QIPA 3TI0A 2O8CB 3ZX0A 4JK7A 1EWQA 4O8KA 1NKEA 4JEPA 4JHDB 1WBBA 4CEAA 1QQCA 1NK4A 3NGYA 3ULDA 5AQXA 3K57A 4LH4A 4FJ5A 4CESA 2NZTA 3EY1A 1ZBUA 3OYNA 3I0SA 2Z1JA 1ILYA 2IIRA 2H3GX 3I8DA 1QQMA 3E9PA 4FWRA 3SQ4A 4H0YB 5CZ2A 3DRRA 2P5OA 3WQUA 3L3UA 4M42A 1WOQA 4U67L 1WSIA 4KKOA 3QNNA 3HT3A 4KI4A 3DXMB 3ZYYX 2G8IA 1N36K 2QKBA 2HHXA 3H1QA 3TPQA 1YTUA 4F4KA 3OYFA 3CMAN 2KZZA 5T7BA 4CIFA 2ASMA 5C10A 1S1TA 4CHNA 3WEEA 3H08A 1XC3A 3E9OA 4CF1A 3PV8A 3SAGA 1HKCA 1YI2N 4Q0BA 5BR9A 1KFDA 1UA0A 4F9OA 2VG6A 4E1JA 4F3TA 3MN5A 1CZ9A 1Z05A 1ATSA 2GTDA 3VPZA 4CF0A 5AQKA 3RSEA 4OGEA 4LF9K 2X74A 3G4SN 4CEEA 2HVHA 3LZJA 4E19A 1W0HA 3LP1A 1J5EK 1KQSM 4LY7A 1QTMA 2YHXA 4IG3A 3KKRA 2E6MA 4W5OA 2KFNA 4DQQA 3DXKB 3WNGA 1RTIA 3EZWA 3C65A 4JS5A 2QWOA 5FRMA 1UAXA 4CHZA 1Q82O 4DKWA 2P9IA 4AHVA 2VCPA 2GELA 2Q1NA 3PX0A 2FSKA 3L2WA 3V9ZA 2YHWA 1N33K 4HHTA 3MN9A 4RTFD 3BGRA 4R79A 5JS1A 2NRRA 1P8ZA 3HPHA 3WXIA 3OHRA 4H5WA 1KAXA 3K5LA 2XO7A 1RBUA 3V4IA 4CE9A 4RG8A 2OPPA 1TKXA 2DFHA 4FJ8A 4KHSA 4CJPA 4CGFA 1QQNA 4FWQA 5K14A 3AA3A 4B1ZA 4CIEA 4IO9L 3CQ8A 1L3TA 4CK2A 1EKEA 3T19A 2D0BA 3QLHA 2G8FA 1IV0A 3LDLA 4CZLA 3QETA 4IFYA 3CFOA 3O9QA 5BRDA 2I5JA 1H1VA 1WNSA 3MXIA 2YNIA 1O13A 4JK9A 4K8XA 3HO1A 2XY5A 1NK6A 4LD0A 3MEDA 3LAKA 2NRVA 1S3XA 4BQLA 2D0CA 3DM2A 4ELTA 3ZSZA 2YHYA 2VG5A 3BDPA 3ATVA 3L2VA 3MCPA 2QM1A 3MX5A 2FSJA 5KRSA 5C2FA 4DR2K 3QFUA 2GX9A 1EO1A 1MWMA 3CQXA 3AA2A 4O55A 2ZJQL 2ATQA 5ELZA 3OYEA 1TYQA 2A42A 3HI0A 4BRHA 1JL2A 4DCHA 1C6VA 2FF6A 4B1WB 4BROA 3A5OC 5HL7L 1D9FA 3C7NA 4FWLA 1SKWA 1S6QA 3QEWA 4FWMA 4B3SK 3CCVN 3SMPA 1QZ6A 1CXUA 3GL1A 4AQYK 3IUCA 3KKSA 3NE6A 4NCAA 3SPYA 3FE1A 4Z4CA 1A5WA 3ZSYA 2YKNA 2IC3A 5CYMA 1C0UA 1VQMN 2RE2A 4KH4A 4GW6A 5AQHA 3NMUA 3PUFA 4IOAL 3QIOA 4OJRA 2ZWHA 3W3DA 3LP2A 3OS2A 1NGBA 5FPNA 4CEZA 4DTRA 1MDUB 5EVZA 3K9JA 4B1UB 1DTQA 3CCRN 4BVPA 4E89A 1NOZA 5EX5A 4EIAA 1U4BA 3I55N 5MLCQ 3NH1A 3HPOA 4R5PA 5AQWA 2QEXN 3DRPA 3JYTA 5AQUA 3F5TA 3PIOL 3NCIA 4H0XB 5EY4A 4DTMA 2YNGA 5KPZA 2YHBA 1TKZA 1FJGK 4OKEA 4CBUA 3HP6A 2E2QA 4FZZA 4A2BA 1C0TA 3RMAA 3ZETA 1FW6A 4DSKA 4DV5K 3SUOA 4J2EA 4BC4A 2PZSA 1IKVA 4DTJA 3NGZA 4I7FA 3D45A 1GOCA 4FPBA 1Y97A 3U8XA 4PL8A 3H45C 4B3MK 3T1HK 2VWBA 3AVMA 4BR2A 4DFMA 4IKFA 1R59O 3DWLA 3VQ4A 5JLHA 3MXJA 3GDQA 4BDPA 4PHTX 4CHQA 1QZ5A 3CCJN 3F73A 4DS4A 3VQDA 2Q97A 2YCHA 2F9WA 4B3OA 3CCMN 3G71N 5J2PA 3EKSA 4LH5A 4ZTFA 2UUCK 1VSKA 4KRFA 4DV0K 4ELUA 2KQ2A 4C8MA 4CZFA 4QCLA 3CERA 4CJWA 1O1WA 1SKSA 2PYLA 3A5MC 4BGAA 4CIGA 2ZJPL 2Z1HA 4FLTA 1IO2A 4AILC 3V9SA 2O8EB 1G15A 2HF3A 4FL9A 3KK7A 3MN6A 5AFUH 3HPGA 2KHOA 1YXQA 2P9LB 2HHQA 1U2VB 4O5FA 3BF1A 1WUAA 1TGOA 2B4JA 2ZQBA 3EO3A 1HLUA 2A40A 3CPEA 4OKJA 3D2EB 3P4IA 1KVCA 2DPNA 3S9HA 1W7AA 3EZ5A 4HCCA 1BQNA 2YHAA 5D3GA 2RN2A 1V4TA 1N6QA 4DFKA 1ZBFA 3HYFA 4K42A 3VA3A 3PX6A 3TSUA 2UXBK 3E01A 3DYAA 3SK3A 1I39A 4B9VA 3OYBA 3SV3A 5BN9A 4FJXA 1BGXT 4FM1A 3K2PA 4IDHA 2F9TA 3CXCM 2O4GA 3HSTB 2YI1A 3U9ZA 2F8TA 4A5AA 1RTJA 1CLQA 2QXFA 4AHTA 4DR4K 3MAQA 1NJWA 2WTUA 4BGBA 3PIPL 3L2QA 4I6MB 1YIJN 3K59A 4H4OA 4CI6A 3NHGA 1OH5A 4M7XA 2YX6A 3KLIA 1NOYA 4F2SA 3O6WA 5FPEA 3NGIA 1YVNA 3BF3A 2RHKA 5CY4A 1E3MA 3B8AX 3CHWA 1I94K 1BDGA 2IVNA 5BRHA 1BUPA 4KHUA 1IJJA 3OS1A 2UUAK 2HF4A 4JKBA 4F3OA 3AVGA 3HRGA 1NGDA 3P83D 3NF7A 3DLHA 4H5VA 1VQLN 2DFEA 3VMFB 1K8KA 3OJSA 4OKKA 3WT0A 3JXUA 4DQRA 2GUIA 5EU7A 1VAZA 3FR0A 4BWJA 3CIPA 4DFPA 4WQ5A 2X6NA 5DK5A 1U47A 4CJ7A 1NK5A 3CJ7A 1A5VA 1T6CA 1TV6A 2ZM6K 4DS5A 4BRNA 4JRQA 1T6DA 2GBZA 3C6AA 4UY8O 2IDOA 4CJSA 3BY5A 1UOCA 1TVRA 1U04A 3FZMA 4BC2A 1GLLO 4JKGB 1C0FA 4DR7K 1KCFA 2P9PA 3OS0A 3F9KA 1Q81O 4HVJA 1TK0A 3L2UA 4JKEA 4DWIA 2HHHK 2BH1A 3M3ZA 3C6UA 1ASWA 4H4MA 4CEQA 2P51A 4X64K 3HJFA 4DV7K 1X9SA 1BWFO 4Y1CA 4EZ9A 2Z1IA 3EEQA 2ETJA 4DR5K 2OYQA 1RBTA 2HNYA 3THXA 4GY2B 4M3UA 3T1AA 4FLYA 3G6EN 1HPMA 3ENHA 3G25A 3J8AA 1GOBA 5ADXH 3D7EO 3GOIA 3LM2A 4MLEA 3AO5A 4FLXA 1BIUA 2BE2A 4NCBA 3CQYA 5JVHL 1MA9B 2ZGYA 3TAPA 2FLOA 3CI5A 2YJEA 2OZSA 1J9AA 2W6LA 2P9KB 1NGGA 5C25A 4YOTA 1W9HA 4C23A 4DTOA 4OPJA 3MMVA 1RDBA 2YKMA 1K8AO 4AHRA 3ZT3A 1YTAA 4HUEA 1BI4B 2P9NB 3WXLA 3V9WA 4DU3A 1C1BA 2FBTA 4QS7A 3KLFA 4DU4A 4OX9K 3ID8A 4Z0UA 1DGKN 1KVAA 3O4NA 1RDCA 4DTUA 4IEEA 3O9RA 1WAFA 3OVNA 4H5RA 5AQGA 3Q7CA 2UUBK 2KKZA 3O3FA 2HNDA 1RTHA 4AHCA 1NG9A 3FLCO 3ZSRA 5F1XA 1WSEA 4H0TB 2QTDA 4DSLA 3L8BA 3M8PA 1KXPA 4BRPA 2HMIA 4L3QA 3EL2A 4IWVA 1J6ZA 2GUPA 4BG8A 3AVNA 4JRPA 1L5UA 3AO4A 1NJZA 1GLCG 3DMJA 4O8UA 5DM7L 1HNWK 3CG7A 1JLAA 4ILGB 1NGAA 4ISGA 2ASOA 1HUXA 1HRHA 3O1BA 2WOMA 2OPSA 1LAWA 4IZ9A 1GLDG 3MXMA 5M1KA 1HJRA 3DLGA 5HBMA 3ZEUB 3CYMA 1Y64A 4CEDA 1Q7YO 3OW2M 1FKPA 4JI5K 3R3LA 4BDZA 5AQLA 1TUUA 4H0VB 3VEVA 3V9XA 4DTSA 4NO7A 4JI7K 1KLNA 5HP1A 3THYA 3J81O 3VTHA 4CBWA 3A5LC 4W5RA 3O9TA 1VQ4N 5AZJB 5LMNK 2ZF5O 3SJHA 4FOIA 3OYCA 2Y1JA 3VGLA 4Z4GA 4RCHA 2ZJRL 1YAGA 4DF4A 3K5MA 1UA1A 3QEPA 2E5LK 2G8KA 3MCAB 4KFBA 5KQ8A 2OZMA 4CJUA 1L3UA 4FXDA 3D2FB 4TSXA 4B1XB 3HOTA 4M3TA 3E66A 1BA0A 1HQEA 3VESA 5ADXA 4HTUA 1SZ2A 3CCUN 2VWKA 4FCYA 5AQPA 4CK1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4U67 L;  1Q7Y O;  3OW2 M;  3CCL N;  1M90 O;  2OTJ N;  1VQP N;  3CMA N;  1YJW N;  1VQK N;  3CXC M;  3CCQ N;  3G6E N;  4WFA L;  5JVG L;  4WCE L;  4WFB L;  1K73 O;  1YI2 N;  1KC8 O;  4WF9 L;  1VQ4 N;  5JVH L;  4WFN L;  3PIP L;  1YIJ N;  2ZJR L;  3I56 N;  3CD6 N;  3CCS N;  3CCE N;  1QVF M;  2ZJQ L;  1QVG M;  3G4S N;  3CC4 N;  1K8A O;  1KQS M;  5HL7 L;  3CCJ N;  3CPW M;  1S72 N;  1VQN N;  3CCV N;  3CCU N;  5GAD P;  5GAH P;  1YHQ N;  1VQ7 N;  3CCM N;  3G71 N;  1VQ5 N;  1YJ9 N;  1YJN N;  5DM6 L;  1VQL N;  1N8R O;  1VQM N;  5GAE P;  1JJ2 M;  1YIT N;  1Q86 O;  1OVY A;  5GAG P;  1NJI O;  4IOA L;  1W2B M;  1Q82 O;  5H1S Q;  2ZJP L;  3J7Z O;  1VQ9 N;  2OTL N;  3CF5 L;  1K9M O;  3CCR N;  4UY8 O;  3I55 N;  5MLC Q;  1M1K O;  5DM7 L;  4IOC L;  1VQ8 N;  3CME N;  3CC2 N;  1KD1 O;  2QEX N;  3PIO L;  1Q81 O;  1ILY A;  3DLL L;  2QA4 N;  1VQ6 N;  4IO9 L;  3CC7 N;  1VQO N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4N76 A;  4CEC A;  1XUP O;  2P9S B;  1EWR A;  3PSF A;  1BCM A;  4M41 A;  4A62 A;  2BDP A;  4PA1 A;  2CH6 A;  4LF6 K;  5CHI A;  4WCE L;  4I6M A;  4E0D A;  1B9D A;  3KK2 A;  1S9E A;  4FJL A;  4NXM K;  4BR7 A;  1IBL K;  3VF6 A;  1JCF A;  2CGK A;  4DV2 K;  4CZM A;  3MWP A;  3AVB A;  3AV9 A;  5KTQ A;  5C0Y A;  3O4Q A;  2A5X A;  4E7I A;  2PY5 A;  3NH2 A;  3ASM A;  3SQ1 A;  3I33 A;  4FM0 A;  4CFC A;  4DUY K;  4MQ3 A;  4YDU C;  4CZE A;  5AQM A;  4IBN A;  4EFH A;  4H03 B;  1LWC A;  1IKY A;  4H5T A;  4WQ4 C;  2QK9 A;  3PX4 A;  2RKI A;  2VQF K;  3K5N A;  3LDS A;  4DLG A;  5FPD A;  1WBD A;  5BPM A;  5IT9 O;  4FJK A;  2HHW A;  3PLA A;  5AQI A;  2W42 A;  1HPZ A;  3CET A;  3OY9 A;  2PYJ A;  1NK8 A;  5GAG P;  2EWS A;  1W2B M;  3C94 A;  4ID5 A;  2W41 A;  4QS9 A;  5CR4 A;  5BN8 A;  3VF2 A;  4E3S A;  4C8L A;  1VQ9 N;  5FLX O;  4N41 A;  1X9W A;  1N5Y A;  3TAR A;  3M5R A;  3ZT4 A;  3ISN C;  4FK0 A;  3U9D A;  2D0O A;  4KPY A;  4CD1 A;  4JKG A;  3U3G A;  4OLA A;  3O4W A;  3HZ6 A;  1K6Y A;  4DV6 K;  3UKU A;  1RDU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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