1QZ5A

Structure of rabbit actin in complex with kabiramide c
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 358
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz5A04
4PKHA 5AQZA 3TPQA 3ZETB 4Z94A 3FFKB 3VENA 4MLEA 4K42A 5LJVA 1DEJA 1HLUA 3DWLA 2FF3B 4WQ4C 2DPNA 4B1ZA 1NWKA 2E2QA 2FSKA 4A61A 3U9ZA 3QMLA 5EY4A 3JS6A 1BO5O 4BG9A 3CI5A 3CQYA 4H0XB 3CHWA 1ESVA 4ISGA 1LOTB 4AM6A 4BRHA 4H0TB 1NGBA 5AR0A 4CD1A 3I8BA 3BUZB 4FWPA 4YDUC 5BN9A 4B1YB 1QZ5A 3UB5A 5AZJA 3DXKA 4K25A 3HTVA 3UE5A 3HSCA 3H3OB 4GNIA 4FO0A 5FPEA 5B8HA 3U4LA 5AQHA 1H1VA 3FZMA 2V52B 4BC4A 2Q97A 3CJBA 3FZHA 2V7ZA 3GG4A 4BRAA 3DAWA 1JCEA 1ATNA 5F2RA 2Q36A 4BRCA 4CBUA 3VF2A 4CZMA 2ZWHA 4FL9A 4IZ9A 2P9NB 5ADXA 2W40A 3LDPA 4FWRA 2PBDA 3CJCA 4WQ5C 1JCGA 2QW9A 1Z6RA 3CIPA 4JHDA 4MO5A 4FSVA 3ATUA 2WUSA 1GLBG 3FE1A 4CBWA 1MWMA 2H3GX 3CJ9A 5TKYA 3EKUA 4KBOA 4H03B 4I6MB 4JN4A 4WYBA 1TUUA 5AQOA 4BQZA 1Y64A 2A42A 1T6DA 4CBXA 1E4FT 2P9LB 3H6EA 5KPTA 2YHYA 5AZIB 2P9KB 3IDHA 2HF4A 1DGKN 3ZX3A 2FXUA 4H5TA 3FZFA 1BOTO 1TUYA 5BRHA 1NGHA 4RTFD 3DXMA 2GWKA 1HKGA 2ZF5O 1V4TA 3D2FB 2YI1A 4FPBA 5AQVA 5BREA 4EFHA 4CZFA 3H3NO 5AQKA 2YJFA 4BR9A 5AFUA 3W3DA 3CJAA 4A62A 3ZEUA 2BTFA 3D2EA 1K8KA 3IUCA 5AQSA 4BVOA 2EWSA 3HI0A 2E8AA 4FOEA 1YUWA 1R59O 4BRQA 4A2AA 3MCPA 1GLCG 2CH5A 4JD2B 5BR9A 1BA1A 5EVZA 4BQLA 4J8FA 1CZAN 2CGLA 3OHRA 4BR4A 4M7YA 1HX1A 5EOYA 3HM8A 3R6MA 1TYQB 3MN6A 3ZETA 1X9JA 3UKRB 1HKCA 4IXCA 4C23A 3DJCA 1T6CA 1XUPO 1KAYA 2D0OA 3FLCO 4NB4A 2NRHA 4QS7A 1NM1A 3O1BA 4K43A 4K41A 5AQRA 1C0GA 3L6QA 3GE1A 3H1VX 3MDQA 3VF6A 3VEZA 2P9SB 3AAQA 1U6ZA 3M6GA 4QS9A 4H5RA 1SAZA 4B1UB 2YHXA 3QB0A 4L3QA 3GOIA 3GBTA 2E88A 2QWQA 3O08A 1OKJA 5AQMA 3H46O 3MN9A 4BVPA 3AY9A 1ZC6A 3LM2A 3HZ6A 4FWKA 1BU6O 2PAVA 4HTLA 4PKGA 3ULEB 1ATSA 5AQNA 2HF3A 2E1ZA 3R9PA 2I7NA 1RDWX 3EL2A 4IO8A 1JCFA 1XC3A 2YHWA 2ZGZA 2Q1NA 1D4XA 1X3MA 3B8AX 5BPMA 5AQQA 4BRPA 2OANA 2IIRA 1T44A 3KZBA 1G99A 2YCHA 3VERA 3A5NC 4ISEA 3QFUA 5AQTA 1NGDA 4BRMA 3SLCA 4FOIA 5EXWA 4CZJA 4NO7A 4CZGA 2QWOA 1LCUA 1BA0A 3C7NA 4I6MA 4FPAA 1S22A 4FWSA 3SMPA 4BRGA 4IJAA 2KHOA 4BR2A 2E20A 2GTDA 1MA9B 2ITMA 2P9KA 3RSEB 5FPMA 4H5NA 5BPNA 1C0FA 4EHTA 4RWTA 3A5OC 3C0BA 5ADXH 1KAXA 3AARA 5JLHA 5LY3A 3L4IA 1NGFA 5ELZA 3R8EA 4CZLA 3BP8A 3D2FA 4RCHA 4B1XB 4BR5A 1HJOA 3KHYA 3A5MC 4IJNA 1RGIA 3KVGA 1P8ZA 5AQFA 3W0LA 4JAXA 3EZWA 2AA4A 2CGJA 4A2BA 3QFPA 3VEWA 2NLXA 2YJEA 4IWVA 2P9IB 4BROA 1ZBSA 2IVNA 3GDQA 4Y0WA 2AP1A 3VGKA 1KXPA 1RFQA 5CE3A 1KAZA 4QS8A 3EO3A 5KQDA 3U9DA 2CH6A 2F9WA 2E2NA 2P9UA 2D0PA 3IMXA 2ASMA 3VEVA 3WQTA 4JD2A 4E1JA 2ASOA 4CJ7A 4BRDA 3EN9A 2P9PB 2BUPA 4BGAA 3F9MA 1BWFO 3UKRA 4CZEA 3VF4A 5AQLA 3BF3A 4XH5A 4DB3A 4WQ4A 4BRFA 3MN5A 2QWLA 2ZGYA 3G25A 3BEXA 2FSJA 1SZ2A 5BN8A 3LDOA 2Q0RA 5F0XA 2A40A 2I7PA 3VESA 1GLFO 3UKUB 1BUPA 3S41A 2GWJA 1U2VB 5FPNA 2QXLA 4BREA 4H0PA 3LDNA 4BG8A 4CD3A 3U8XA 3D2EB 4H5VA 1NGGA 1Z05A 1NLVA 3FZKA 3MMVA 3O4WA 2VWBA 2P9SA 2F9TA 3WUHA 2FF6A 3WXLA 3HBTA 4M63C 3ENOA 1NBWA 1HPMA 1NGAA 3WEEB 1IG8A 3O8MA 1WOQA 1YVNA 2V7YA 1QQOA 3SMSA 4O5FA 3ULEA 1YAGA 2A6AA 3GL1A 3I33A 1WUAA 2QWPA 5AQIA 4BGBA 4GY2B 3ID8A 3AAPA 3JXUA 5I9EB 4B1WB 2FSNA 4AM7A 1GLEG 1YXQA 2VYPA 1NMDA 4MO4A 5AQPA 1HUXA 5FPDA 4BRKA 2QWMA 3O80A 4BC5A 3WXIA 3M3ZA 4BRNA 3VOVA 1SQKA 3MN7A 1GLLO 5KPRA 2QWNA 3FZLA 1QQNA 4WQ5A 1IJJA 5E26A 3LDQA 3FR0A 3VGMA 1QQMA 1NGCA 2P9NA 5AQWA 3QBXA 4MLHA 3A0IX 5AQGA 4BR0A 3ZX0A 3WQUA 4BR7A 2D4WA 5KQ8A 4CZHA 3CJ7A 2FLOA 3QICA 2GEMA 5AZJB 3IFRA 3LL3A 2IVOA 3RSEA 3ZX2A 3DXKB 3WXJA 1GLDG 4XH1A 3M1FA 4JNEA 3VEXA 1J6ZA 3CQXA 2P9LA 4CI6A 3VPZA 1DKGD 4H0VB 5AZIA 3O1WA 4EHUA 3VETA 1QZ6A 2VCPA 2Q31A 4BRIA 2Q2RA 2A3ZA 4PL7A 3VEYA 4FWLA 4BC2A 1EQYA 4ISFA 4PKIA 4PL8A 1BG3A 5E84A 1NGEA 5KPZA 3D7EO 2E2PA 3TU5A 1ATRA 2QWRA 2P9IA 3O5BA 3WT0A 3WXKA 3C7NB 1MDUB 2GELA 1BDGA 5AQXA 4BRLA 3VEOA 4JHDB 4M7XA 5AQUA 1GLAG 1MWKA 1ZXOA 3MK6A 4FWQA 5BRDA 4O8KA 1S3XA 5EX5A 3EKSA 1NGIA 2W41A 5BPLA 2E2OA 1X3NA 1V4SA 5BRFA 2P9PA 2QM1A 3A5LC 5AQYA 2J4RA 5LJWA 4H0YB 2D1KA 4H0OA 3J8AA 3SJHA 1Q18A 2A41A 3CJ1A 3VGLA 4EIAA 4FWMA 3H1QA 2IVPA 1TYQA 4H5WA 3QBWA 5JLFA 3LDLA 3ENHA 5F1XA 3CERA 2UYTA 3UKUA 5JICA 3DXMB 1U2VA 3L0QA 5JMVA 4LC9B 2A5XA 5AFUH 4XEIA 4FWOA 4CZIA 4BC3A 4HWIA 3LM9A 2E1YA 1XQSC 1GLJO 3A8YA 1NGJA 5AQJA 4B9QA 4CZKA 3ZEUB 4DCHA 2Q0UA 2V51B 3CETA 2P9UB 3BF1A 1K8KB 3O6WA 3WEEA 2GUPA 4XH4A 1HKBA 4YDUA 3P4IA 2NZTA 3FGUA 3SK3A 2ASPA 1QHAA 3QDKA 4DHYA 4B1VA 4EAHD 1E4GT 2CGKA 4F9OA 3ATVA 2HOEA 4FWNA 4DQ8A 2HMPA 3H45C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPKA 1TK5A 4FW2A 3IAYA 4PKHA 1T03A 3VENA 4DF4A 5I3UA 4AILC 2HBJA 2HHHK 3P38A 1DEJA 1WSJA 3DWLA 4WQ4C 1JLBA 4CHYA 3ALYA 2O8CA 4HUEA 1NWKA 1UAXA 2B5JA 2FSKA 1VQ6N 1HNXK 2G8HA 3K5MA 5EY4A 3JS6A 1BO5O 3CI5A 3CQYA 3DLGA 3CHWA 1ESVA 4BRHA 4CEFA 4H0TB 1NGBA 4CD1A 3U3YA 3THXB 1QS4A 2W6LA 3UB5A 3O3GA 3ZSZA 2HW3A 4K25A 3ASMA 3OYFA 3MXJA 3G6EN 3NE6A 3FZMA 2V52B 3HVRA 4Z4CA 3CJBA 2UXDK 1YVUA 1ATNA 3M8PA 2Q36A 1IV0A 1TL1A 4X66K 1HYVA 3K2PA 3PX0A 1D9DA 1IBKK 1VSJA 3RWUA 2P9NB 1QVGM 1GOBA 1ZBFA 3LDPA 2BDPA 1SL1A 5A2QO 4LF6K 4FJNA 4KHNA 4FSVA 4DR6K 3ATUA 2O8BA 4CBWA 4FJ7A 4CF8A 3CJ9A 1YI2N 4H03B 1YJ9N 3AVJA 1TUUA 3LDSA 4EZ6A 5AQOA 4BQZA 4LFBK 2A42A 1T6DA 4ZTJA 4BE2A 3VQCA 2YHYA 3OYHA 4CFCA 3NGYA 4F8RA 1WLJA 2FXUA 1JL1A 1VQON 3NMUA 4DV1K 4YOTA 3TAEA 4M3ZA 4KH6A 1VSEA 1HKGA 2ZF5O 1LW2A 3D2FB 4FPBA 2YI1A 4EFHA 4CZFA 3H3NO 1LAVA 3WNEA 2KQ2A 3OJUA 3PX6A 4NCAA 5GAEP 2BTFA 4B8AB 3S9HA 3KK1A 1K8KA 1N33K 5AQSA 4CJLA 2EWSA 4EP5A 3OYKA 1WN7A 1NJXA 1HPZA 3DRSA 4CF2A 4FLZA 4A2AA 1KTQA 4JLHA 4JI6K 4N41A 4BQLA 4BR4A 1KD1O 4B9VA 5J1EA 2XY7A 2OPPA 1TYQB 3MN6A 3ZETA 3QEVA 3NF6A 1S9GA 1X9JA 3T1HK 4FVUA 4DV6K 3D45A 1VQ8N 4B9MA 2FBYA 4ELVA 2JGUA 1JKHA 2HHTA 1NK5A 1LWCA 1VHXA 2D0OA 4CEEA 2XY6A 5JVGL 1TVRA 3AV9A 5C12A 3TAPA 3OS2A 4K41A 3MWPA 1BL3A 5CZ2A 3GE1A 3H1VX 3MDQA 4B9UA 1BI4A 3AVMA 5C24A 5J2PA 3M6GA 4F2SA 1U04A 4C8OA 3QB0A 4BDPA 4L3QA 4YHHK 5CYQA 2E88A 3T1AA 1YHQN 1OKJA 1L3SA 1QSYA 4HUFA 3AY9A 3QEXA 3LM2A 3HZ6A 4FWKA 4B08A 4HTLA 4N56A 5LMNK 4DR1K 1X9MA 1ASUA 2UUCK 2HF3A 1HYZA 4HUGA 4DTNA 2I7NA 4JK7A 2OYQA 3ZCMA 2XY5A 1U48A 3RMCA 1A5XA 1JLGA 2HHUA 1VK0A 3D6RA 3AO2A 2LSNA 5M1FA 4BRPA 4JKCA 3VQ9A 5AQTA 4BRMA 3SLCA 1ZYQA 1BQMA 1Q82O 5M1NA 3H08A 3V9ZA 2QWOA 3C7NA 1ASWA 4JKGB 4CHQA 3VQAA 3OYBA 4IJAA 2KHOA 4JK8A 2GTDA 2NRRA 2ITMA 1S1VA 5FPMA 1C0FA 1RDCA 2WOMA 5AJ3K 5JLHA 3MXIA 5JS1A 1W2BM 1SKRA 1XNQK 1VQ9N 4CJQA 3R8EA 4KREA 3K5LA 4CZLA 4GKJK 4B1XB 3U3GA 4BR5A 3M8RA 4DV4K 1HQUA 2W42A 2F4VK 2YKMA 3KHYA 2X74A 3F73A 2O8FB 3LP3A 2HNZA 2KZMA 4JAXA 3EZWA 4A2BA 3QFPA 3VEWA 4AH9A 2NLXA 2O8BB 4FLXA 2P9IB 4MDBA 4BROA 1VSHA 4Y0WA 3VQQA 1KXPA 1I3AA 1KAZA 4DQPA 1W9HA 3U9DA 5KQDA 3OYNA 2XO7A 2CH6A 1QQCA 2G8VA 2P9UA 2D0PA 3IMXA 2ASMA 3CCMN 2KZZA 3VA3A 1WSEA 4K0KK 4KO0A 3O9RA 3OYAA 4Z4FA 4CZEA 4JKEA 2E6MA 1XI1A 1VQ7N 4DTSA 2E4LA 4M45A 2HVHA 2O8EA 3S5TA 4DS4A 5KRSA 4IFYA 4LF7K 2GWJA 1NU0A 3T19A 4NLBA 3L2RA 2VGMA 4DS5A 2ITGA 1NLVA 1X9WA 1JL2A 3FZKA 3O4WA 3CXCM 2VWBA 3WXLA 3WUHA 2FF6A 1UA1A 3CMAN 4HCBA 1HPMA 3UIQA 1RNHA 3L4QA 4DUZK 3O8MA 1YVNA 2V7YA 4YORA 4E7KA 1KSPA 2Y1JA 4DQSA 3ULEA 1C1BA 4JI4K 5DMRA 5AQIA 3DOLA 3ID8A 3ZSVA 3HK2A 4B1WB 2YV0X 4DTUA 2D0AA 1YXQA 4MO4A 3Q7CA 3QIPA 3THWA 4KAZA 1QVFM 3OYLA 1MU2A 4Z0UA 3HRGA 3MN7A 1WB9A 1GLLO 1VSIA 2QWNA 1VRUA 3LDQA 3FR0A 3VTHA 3VGMA 3V1QA 3QBXA 4MLHA 3SI6A 1BI4B 5LMUK 1EXQA 3ZX0A 2UXCK 2D4WA 2I5JA 4CZHA 5IT9O 3E66A 2FLOA 1M90O 1C0UA 3CC4N 1NJIO 2GEMA 5AZJB 1K6YA 3RSEA 3DXKB 3WXJA 4DTRA 4OLBA 3DLRA 3TARA 2RHKA 4FXDA 4PWDA 4AHCA 1IBLK 3QERA 4BEBA 2HSTA 3O1WA 2A3ZA 3SUOA 2X78A 4BC2A 4ISFA 3E9PA 2E2PA 3O5BA 3J7ZO 3LAKA 3L2VA 1SKSA 3C7NB 4FLVA 1MDUB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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