5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
3VETA 1V4SA 4K42A 4CBXA 2GELA 4CD3A 4O8KA 5BRHA 5JLHA 3F9MA 1T44A 4KBOA 2P9UB 1KAZA 1DGKN 1MWMA 1TUUA 4CZFA 1HX1A 1SAZA 3VESA 4K25A 3LDLA 4ISGA 3O6WA 3VGLA 4MO5A 4FWOA 5BR9A 3QBWA 1GLCG 1D4XA 4IJNA 4FL9A 4H5VA 4FOEA 4BRKA 2FLOA 1MWKA 2W41A 4BG8A 1KAXA 4WQ4A 4WYBA 1DKGD 3VEVA 4NO7A 3FZHA 1S22A 4XH1A 1GLFO 2P9PB 2GUPA 3IFRA 2FSJA 3M1FA 4B1YB 3EKUA 3H1QA 3HBTA 4YDUA 4FWLA 5AQNA 4A62A 4DCHA 3ZEUB 1ATSA 3ZX0A 1HKGA 3EO3A 1S3XA 5AZJB 4H5WA 2AA4A 3LDOA 1NGGA 1NGIA 3C7NB 3J8AA 5AQYA 5KPZA 5KQDA 3FLCO 4CBUA 3M3ZA 2GEMA 1MDUB 3UKRA 4H0VB 3H3NO 4FPBA 3KZBA 1BG3A 3A5MC 3JS6A 3CI5A 2CH5A 5EX5A 3CETA 3ATVA 3ZETA 4BR2A 3MCPA 3ZX3A 5ADXA 2I7NA 5AZIA 3HSCA 1SZ2A 3BP8A 3A5NC 3DXKB 3UKUA 3S41A 4BRGA 4BREA 1NGJA 2H3GX 1ATRA 1RGIA 2E2OA 3U9ZA 3GBTA 3LDNA 4B1XB 2W40A 3ZX2A 3EL2A 5AQMA 3FGUA 4BC3A 2Q2RA 1G99A 1U6ZA 3H3OB 2Q97A 4JAXA 3FZKA 1K8KA 4B1UB 4B9QA 4CZGA 3WXJA 4BRLA 4FWPA 3CJBA 2Q0UA 3H45C 1R59O 1KXPA 3ENHA 4CJ7A 2HF3A 4FWRA 5EOYA 3SMPA 5BN8A 4FWKA 4BGBA 4B1VA 5EVZA 1XQSC 5F1XA 2PBDA 2P9KB 3IMXA 3QDKA 1BO5O 4NB4A 4QS7A 2HMPA 2F9WA 3SLCA 1LCUA 2UYTA 5AFUH 5B8HA 2CGJA 2E2PA 1NGFA 4FWNA 4FWSA 3CJCA 3O08A 4FWQA 2A5XA 3W0LA 2YHWA 3O5BA 1C0GA 2E1YA 3FZFA 5AQPA 1NBWA 1Z05A 4BRNA 2NRHA 1P8ZA 2FSNA 4BR9A 4FO0A 3VGKA 3WQTA 1NM1A 1NMDA 1C0FA 2Q0RA 2YCHA 3LDPA 3TPQA 1SQKA 3MN6A 3VEXA 3KHYA 3BF1A 3GDQA 5I9EB 3R6MA 5AR0A 5KPTA 5AQLA 1TYQB 4IO8A 4BRFA 3AARA 5BPMA 5AQUA 5E26A 1Z6RA 3D2FB 3DWLA 2E20A 4BRHA 4XH4A 1NGDA 1BUPA 3VGMA 3G25A 4MLHA 3VERA 1NWKA 4BC2A 4FSVA 3JXUA 1GLEG 4MLEA 3GG4A 1YXQA 1JCFA 4BRQA 4EHTA 3DXMB 2P9UA 3SJHA 3QBXA 1U2VB 1GLAG 1NGEA 2PAVA 4H0OA 3C0BA 4JNEA 1NGCA 3D2EB 3ULEB 4JD2B 4ISEA 3RSEB 2YHYA 2A6AA 1QHAA 2EWSA 5AQQA 2ASPA 1RDWX 2YI1A 5TKYA 4CI6A 3QMLA 3BEXA 2D0PA 5E84A 4EFHA 3CERA 2QWOA 3WXIA 2QWNA 2FF6A 1X9JA 3HI0A 5AQTA 2P9PA 5ELZA 1E4GT 5AFUA 1IG8A 5FPMA 3CJAA 3OHRA 1ZC6A 4RCHA 3ZEUA 2QW9A 1XC3A 1BDGA 5AZJA 2D4WA 1YVNA 2Q31A 2P9LB 2IIRA 2V7YA 2QWLA 3DJCA 2E1ZA 3C7NA 2QXLA 3MK6A 4BRMA 4AM6A 5AQXA 3O4WA 1NGBA 1Q18A 1QZ6A 5BPLA 2P9IB 4H0PA 1ZBSA 4IJAA 3UE5A 4BGAA 5BN9A 2ZWHA 2ITMA 5KQ8A 3M6GA 4JHDB 4CZKA 3VENA 4IWVA 4WQ5C 3VPZA 2D1KA 1ESVA 2V51B 3ATUA 3FFKB 4DQ8A 3O8MA 4FOIA 4Y0WA 4BQZA 3DAWA 4QS8A 2D0OA 4XH5A 4PKIA 4GNIA 2J4RA 3DXKA 1HUXA 5FPNA 3A5OC 5F2RA 2QWQA 2P9SB 2P9NB 4J8FA 4ISFA 4B1ZA 5LY3A 4E1JA 2CGKA 3HM8A 2A3ZA 3QB0A 1XUPO 3TU5A 1ZXOA 2P9NA 1WOQA 2KHOA 4AM7A 4A61A 1DEJA 5FPDA 4H5NA 3KVGA 4CZLA 1YUWA 1BOTO 2Q1NA 4K41A 4DB3A 2I7PA 3L4IA 1CZAN 2FXUA 3P4IA 2F9TA 2BTFA 3GE1A 2ZGZA 3VOVA 2A40A 2P9KA 5AQOA 3GOIA 2IVOA 3WUHA 5JLFA 4BR7A 2QWMA 3A8YA 3A0IX 4M63C 1H1VA 3CQYA 3CIPA 2E8AA 3R8EA 4BRIA 3O1WA 2ASOA 3VF2A 4BROA 3BUZB 3SMSA 3FE1A 1HLUA 5LJVA 2QWRA 3WEEB 2FF3B 4L3QA 5EY4A 1X3MA 3O80A 5AQRA 2CH6A 4CZMA 4IZ9A 4BR5A 2A42A 4BRCA 4I6MB 1WUAA 5F0XA 4CD1A 2CGLA 3W3DA 3EN9A 2VCPA 4WQ4C 3IUCA 4HWIA 3HZ6A 4I6MA 3LM2A 2HOEA 4CZIA 1TYQA 2VWBA 5AQZA 3QFUA 1EQYA 1X3NA 5BREA 3L6QA 3D2FA 4XEIA 3CJ9A 4YDUC 4RWTA 2GWJA 5BRDA 5BRFA 5ADXH 3CQXA 5BPNA 1HKBA 1YAGA 2NZTA 3AAPA 4MO4A 3GL1A 1BA0A 4BRDA 2Q36A 5EXWA 1BU6O 3FR0A 3DXMA 4QS9A 1KAYA 3VEYA 4CBWA 1U2VA 3I33A 5AQIA 3ULEA 3D2EA 4JD2A 3RSEA 5AQVA 1NLVA 2GWKA 3LM9A 4CZJA 3MN7A 1GLLO 3D7EO 1TUYA 4B1WB 4BVOA 4CZEA 4PKHA 3HTVA 4FWMA 3A5LC 2ZGYA 2VYPA 3B8AX 3VEOA 2AP1A 4H5TA 5JICA 2P9LA 1HKCA 3MMVA 3I8BA 3QFPA 4H5RA 4BVPA 4H0YB 4BC4A 4F9OA 2P9IA 3CJ1A 3VF6A 4BR4A 4BG9A 1IJJA 1QZ5A 5CE3A 5AQWA 2QM1A 3FZMA 4JHDA 4H03B 1E4FT 3UKRB 3VEWA 2YJFA 4GY2B 3ENOA 3VEZA 4BR0A 3WQUA 3ZETB 3LL3A 5AZIB 2OANA 5AQFA 2QWPA 1BWFO 3UKUB 4EIAA 3WXKA 1Y64A 4HTLA 2P9SA 1QQNA 2FSKA 3WXLA 3U9DA 4PKGA 3H1VX 4EHUA 2V52B 1BA1A 1HPMA 2HF4A 2DPNA 3SK3A 3H46O 4EAHD 3CHWA 3EKSA 2E88A 3AY9A 1JCEA 2GTDA 1MA9B 3QICA 4FPAA 5AQJA 1K8KB 3MN5A 4Z94A 4PL8A 1RFQA 2A41A 3CJ7A 1GLDG 4LC9B 1GLBG 5AQHA 5LJWA 4RTFD 4O5FA 2E2NA 4PL7A 4DHYA 5FPEA 1V4TA 5KPRA 4M7YA 2NLXA 4WQ5A 2E2QA 3MDQA 4BRPA 1OKJA 4C23A 1NGAA 2IVPA 2YHXA 3O1BA 3VF4A 1J6ZA 2V7ZA 4CZHA 5JMVA 3UB5A 3WEEA 3U4LA 3U8XA 4BC5A 2BUPA 5AQSA 4A2BA 4A2AA 3FZLA 3L0QA 3BF3A 4M7XA 3H6EA 4H0XB 4IXCA 5AQGA 2ASMA 3IDHA 1GLJO 3ID8A 3R9PA 1ATNA 2IVNA 5AQKA 3EZWA 3AAQA 4BRAA 1T6CA 1T6DA 1HJOA 2WUSA 3LDQA 1LOTB 2ZF5O 4H0TB 4JN4A 4BQLA 1QQOA 3MN9A 2YJEA 4K43A 1JCGA 3WT0A 1QQMA 1NGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NK 4M3UA 1V4SA 4K42A 3EY1A 2GELA 2WBNA 3F9MA 3LP2A 3HPOA 4DR7K 2OPPA 2KFNA 2P9UB 1QHTA 1MWMA 1TUUA 3ZCMA 1WT7A 4ISGA 3VGLA 4BWMA 4FWOA 5BR9A 3KK1A 1EXQA 3LPTA 1TV6A 4NXMK 1WSFA 1GLCG 1RBUA 4IJNA 5J1EA 4BDYA 3KJVA 3U3YA 4JS4A 2WFBA 1MWKA 1LAWA 5T7BA 1VSMA 3M8SA 3NBPA 1TKDA 4EZ6A 1XNRK 1O13A 1ITGA 3K59A 3M1FA 2QA4N 4FLZA 1HYSA 3AVNA 3NE6A 3O9TA 4A62A 3Q7BA 4DCHA 4NCGA 1ATSA 2KJAA 3VA3A 1HNWK 4FJXA 3NF7A 4E1NA 1HR0K 2AA4A 5CYMA 3E9PA 4HUEA 3C7NB 3J8AA 5AQYA 5KPZA 1L3SA 4LFCK 1TK0A 1SKSA 3FLCO 1EWRA 3CD6N 4JRQA 2B68A 1VSHA 1NK8A 4H0VB 3H3NO 3PO4A 2DFEA 3CI5A 3AA4A 2CH5A 2D0BA 1WSHA 3TSPA 4F3OA 5C24A 5ADXA 3SV3A 4O0JA 1X9SA 4LF7K 3HSCA 4RG8A 4BRGA 1NGJA 2I5JA 4OKKA 1EWQA 5M1FA 1ATRA 4JI5K 2LR3A 3U9ZA 2Q2RA 5HLFA 2G8IA 1G99A 5CZ2A 3H3OB 3KOWA 3L3UA 3VQQA 1J9AA 2Q97A 5M1NA 3OYMA 3CC7N 4FWPA 3TAFA 3SPYA 4HCBA 1C55A 3C6HA 4CJ7A 2LN8A 4FWKA 5F1XA 3S9HA 3MXIA 2UU9K 3QDKA 1BO5O 4NB4A 4DF8A 3KOZA 4FJHA 2E2PA 4OKEA 2A5XA 2BRZA 4O8UA 3C6AA 3FZFA 1Z05A 4BRNA 1A5WA 1VSIA 1YF5L 4IOAL 1SL0A 1KSPA 3AVLA 1NMDA 4DTPA 4HE7A 4OPJA 3J7AP 1SQKA 2D56A 1VRTA 3TANA 3KHYA 1LQQA 1JLEA 1EX4A 1NKEA 2N2RA 3GDQA 4OX9K 2Z1HA 4N41A 5C15A 3QEXA 4CF0A 4X64K 4YFUA 3DYAA 3HO1A 5AQUA 1Z6RA 3D2FB 2E20A 3KK3A 1NGDA 3OYCA 1BUPA 4IG3A 2FC0A 1KVBA 2LY6A 4BC2A 3VQPA 4MLEA 3TWHA 3RRGA 3GG4A 4Z4EA 4LH5A 3C6TA 3MEGA 2MBKA 1Q82O 2HHWA 4BWJA 2KTQA 4I2PA 3NGYA 1JLQA 1NOZA 1NGEA 2PAVA 4JNEA 1NGCA 4BDPA 4B3RK 1NKCA 4E7HA 3RSEB 2YHYA 1QHAA 2HNYA 4FM1A 3OS1A 3OS2A 5E84A 4B9TA 3S5TA 3DLEA 3CERA 4YOXA 2QWNA 3R1XA 4DFJA 3T1AA 5ELZA 1E4GT 3CJAA 3ZSZA 4NLCA 1RT7A 4RCHA 2UUCK 2NY8X 3QI7A 2YHAA 3SZ2A 3DJCA 2QXLA 2RHKA 2BGGA 3SNNA 3F2KA 1ZBSA 3O9RA 3UE5A 1NJZA 3TABA 3RMCA 2D5RA 4WFNL 3SQ1A 3QEVA 3M6GA 4CZKA 4IWVA 4Q0BA 3ATUA 4CF1A 1YT3A 4KHQA 2Z1JA 4FOIA 3VQ8A 2D0OA 3V9UA 4JV5K 3CCJN 4PKIA 1K8AO 3EYZA 1S1TA 3CCVN 4JKEA 4PWDA 5FRMA 2ZE2A 1VQMN 4B1ZA 3KKRA 2A3ZA 1JZAA 2UUAK 5H1SQ 2P9NA 2IS3A 4OGEA 1MYNA 2G8UA 1I6GA 4JI0K 5FPDA 4JI1K 5C42A 1XMOK 3ITHA 4CZLA 1XI1A 1BOTO 3NH0A 2KZMA 4RW6A 2Q1NA 4CESA 2O4GA 3P4IA 2ZGZA 2A40A 3I55N 1C0UA 3ZSWA 3TR8A 4M63C 1N36K 3CQYA 1RDBA 3EEQA 4FYDA 3R8EA 2VG6A 2GBZA 4FJ7A 2P5OA 4RW8A 3VF2A 1IV0A 1G15A 1EETA 1HLUA 1TK8A 3CM5A 4YOVA 5EY4A 1U47A 3CMAN 3NVKA 3ZSQA 1NOYA 4BR5A 3NH1A 4BRCA 3CPWM 5F0XA 1S9EA 1NE5A 3RVCA 4FJ5A 4E19A 1M90O 4GV6A 4E7JA 4PUOA 4HWIA 4ELVA 4ELUA 2VQFK 4KI6A 2HOEA 4O55A 1RT1A 2QK9A 5AQZA 1U48A 4B3MK 1IG9A 1X3NA 5BREA 1VQ8N 1NK5A 3CYGA 3IRXA 1BCOA 4RWTA 1D5AA 5BRDA 2RN2A 3HVTA 5BRFA 1YAGA 3AAPA 4MO4A 2YX6A 1BA0A 4BRDA 2Q36A 3FR0A 2G8HA 1RBSA 4E7KA 1KAYA 4A5AA 2E3FA 2ATQA 3DLKA 3KLEA 4UY8O 1VQ6N 2C1GA 1JLGA 1Y97A 2YNFA 2JGUA 3CFOA 1AYJA 4RW9A 1HPZA 3MN7A 4CZJA 2HB5A 4DV4K 2HHIA 1OZZA 3KWIA 2IDOA 4PKHA 3HTVA 4DV7K 4CGIA 3P83D 3VQ7A 4ELTA 3O9QA 3AVBA 4CJ5A 2VYPA 4H5TA 2MN5A 4CCHA 2QTDA 2P9LA 4DV0K 2O4IA 1YIJN 4BC4A 4JK9A 1FKPA 1E3MA 3CJ1A 1BRZA 3KTQA 5GADP 1NH5A 4DQQA 1K9MO 4WCEL 5CE3A 5AQWA 4JHDA 4KHYA 5C0YA 3G0ZA 1E4FT 3P1GA 3VEWA 2DTUA 4GY2B 3THVA 3ENOA 4NCBA 4DMNA 4U7BA 1N6QA 1RT2A 3ZETB 3OJSA 1T0ZA 3ZT3A 1FJGK 5BR8K 1ZBLA 5AZIB 2OANA 1BWFO 3UKUB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4C1N K;  4M3U A;  1V4S A;  4K42 A;  3EY1 A;  2GEL A;  2WBN A;  3F9M A;  3LP2 A;  3HPO A;  4DR7 K;  2OPP A;  2KFN A;  2P9U B;  1QHT A;  1MWM A;  1TUU A;  3ZCM A;  1WT7 A;  4ISG A;  3VGL A;  4BWM A;  4FWO A;  5BR9 A;  3KK1 A;  1EXQ A;  3LPT A;  1TV6 A;  4NXM K;  1WSF A;  1GLC G;  1RBU A;  4IJN A;  5J1E A;  4BDY A;  3KJV A;  3U3Y A;  4JS4 A;  2WFB A;  1MWK A;  1LAW A;  5T7B A;  1VSM A;  3M8S A;  3NBP A;  1TKD A;  4EZ6 A;  1XNR K;  1O13 A;  1ITG A;  3K59 A;  3M1F A;  2QA4 N;  4FLZ A;  1HYS A;  3AVN A;  3NE6 A;  3O9T A;  4A62 A;  3Q7B A;  4DCH A;  4NCG A;  1ATS A;  2KJA A;  3VA3 A;  1HNW K;  4FJX A;  3NF7 A;  4E1N A;  1HR0 K;  2AA4 A;  5CYM A;  3E9P A;  4HUE A;  3C7N B;  3J8A A;  5AQY A;  5KPZ A;  1L3S A;  4LFC K;  1TK0 A;  1SKS A;  3FLC O;  1EWR A;  3CD6 N;  4JRQ A;  2B68 A;  1VSH A;  1NK8 A;  4H0V B;  3H3N O;  3PO4 A;  2DFE A;  3CI5 A;  3AA4 A;  2CH5 A;  2D0B A;  1WSH A;  3TSP A;  4F3O A;  5C24 A;  5ADX A;  3SV3 A;  4O0J A;  1X9S A;  4LF7 K;  3HSC A;  4RG8 A;  4BRG A;  1NGJ A;  2I5J A;  4OKK A; 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