5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
2V7YA 3MN9A 2FSJA 3IUCA 5EX5A 4H0OA 3SK3A 5JLHA 3VEVA 1NWKA 3TPQA 1XC3A 1SZ2A 3L4IA 1QQMA 2D1KA 2YHXA 3U9DA 4H0PA 2GEMA 3MN7A 4A62A 2FF3B 3MK6A 4H0VB 4BRIA 3G25A 2QWNA 1MA9B 2FSNA 5AFUH 2P9KB 5AQWA 1HX1A 3FR0A 3O1WA 4JD2B 2PAVA 4FWQA 1XQSC 2BTFA 5E84A 2YHWA 3JS6A 4CBWA 5AQXA 4DCHA 5AQSA 1ATSA 3L6QA 3HM8A 3QICA 4LC9B 1GLBG 4H0YB 3SJHA 5FPNA 1KAXA 2D4WA 2P9NB 4JHDA 4M63C 2P9LA 4IZ9A 4KBOA 1YVNA 3ATUA 2IIRA 3U4LA 2P9PB 5JMVA 2QWRA 3RSEB 2NRHA 3VERA 3ZX2A 1X9JA 5F1XA 4H5WA 3EL2A 4EFHA 3HSCA 3SMPA 1DEJA 4WQ4C 3CETA 1SAZA 4PKIA 4BROA 2E2NA 3H3NO 1NBWA 3VPZA 4O8KA 5EXWA 4IJAA 4FWLA 4BRDA 5BRHA 2AP1A 4EHTA 3QB0A 4BRLA 2ASOA 2P9UA 5B8HA 5FPMA 3CHWA 4BR4A 3R6MA 3WXJA 5BN8A 3VESA 1ATRA 3VEWA 2CGKA 2QWMA 4IWVA 4AM7A 3GL1A 4L3QA 1OKJA 4FWMA 2E20A 5KQDA 4CBUA 5AFUA 4M7XA 1H1VA 1TUUA 3VEZA 1C0FA 1NGGA 3GG4A 4JHDB 2P9LB 4PKHA 4PL7A 4O5FA 1QZ5A 2YJEA 3QDKA 1GLFO 1RDWX 3WEEA 4FWKA 3M6GA 4RWTA 3ZETA 4NB4A 5F0XA 1Z6RA 2WUSA 3VETA 1CZAN 4B1UB 1HKCA 5AQLA 1NGCA 1G99A 1R59O 3EKUA 4FWSA 4CZMA 3ZX0A 4FPBA 3ATVA 2A41A 5AR0A 1U2VA 2Q1NA 3CIPA 3LDPA 4CZEA 5KPZA 3D7EO 1V4SA 2P9UB 4HTLA 5AQQA 3CQXA 4AM6A 3F9MA 3GE1A 2FSKA 3HTVA 2P9KA 3W3DA 4FWPA 4ISEA 3QMLA 4EHUA 2BUPA 4WQ5C 1QZ6A 4JAXA 1TYQA 3UB5A 2Q97A 3ENOA 3A5NC 2ZGZA 3CQYA 3AY9A 4H5RA 2GELA 4BR5A 3WEEB 4QS9A 5CE3A 5TKYA 2QWPA 3ZETB 4XH4A 5AQMA 3WXLA 4BR9A 1T6CA 3U9ZA 3B8AX 3C7NA 3S41A 3TU5A 3W0LA 5AQRA 4E1JA 4MO4A 2HOEA 4WQ4A 3KZBA 3VGKA 5AQHA 1Q18A 4B1WB 1RGIA 1ZXOA 3VGMA 5AQUA 1U2VB 2GTDA 4BC2A 5ADXH 1T44A 2NZTA 3O80A 1GLDG 2H3GX 4NO7A 5E26A 3WQTA 3FFKB 3CJ1A 4A2AA 3LDOA 3U8XA 3HZ6A 3DXMA 5AQJA 1GLCG 5AZIA 2W40A 4CBXA 3MMVA 2HF4A 5KPRA 1QQOA 1RFQA 1TYQB 4FOEA 3D2EA 4YDUC 1GLAG 1T6DA 3ENHA 3EN9A 4K43A 3SMSA 1HKGA 2GUPA 1NMDA 2ZWHA 1BA0A 2FF6A 4A2BA 1V4TA 5EOYA 3C7NB 3M3ZA 4H5NA 3QFPA 3BF1A 1HJOA 2ASPA 4BR7A 3A5OC 3R9PA 1GLLO 2VCPA 2FXUA 2Q0RA 4CZFA 4IJNA 3QBWA 4ISFA 4BGBA 4CZGA 3O1BA 2V7ZA 3BF3A 4DHYA 4CZKA 3O4WA 2P9SA 2IVPA 3DXMB 5BRFA 3VEXA 3P4IA 5AZIB 4ISGA 3ULEA 3ZEUA 4K42A 2E1YA 5ADXA 2P9IA 1LCUA 3DWLA 3JXUA 3WXIA 1U6ZA 4WQ5A 1NGEA 2A42A 4BRCA 4J8FA 3UKRB 3D2EB 1D4XA 4GNIA 3MCPA 3A5MC 5AQZA 1BG3A 4B9QA 3IFRA 2QXLA 2YI1A 4BC5A 5LJVA 5KPTA 2E8AA 4QS7A 2OANA 1SQKA 3DAWA 4IO8A 2YCHA 3WT0A 5LY3A 3A5LC 3H3OB 2QWOA 3BP8A 1S3XA 4FWNA 3J8AA 4BR2A 3H1QA 2FLOA 4BQLA 4XH1A 4FO0A 4FPAA 4FSVA 1X3MA 3KHYA 2CGLA 4CZIA 4I6MA 3FZHA 2Q0UA 3LL3A 2P9SB 3IMXA 2ASMA 2CGJA 3ULEB 3VF4A 3ZEUB 4CZHA 3BUZB 2ITMA 4CJ7A 1YUWA 2J4RA 2P9IB 2V52B 2Q2RA 3ID8A 3LDNA 1GLJO 1E4FT 1HUXA 5AQVA 4BRFA 4BG9A 4JNEA 4CI6A 4BRGA 2QM1A 4EAHD 4RTFD 3FZMA 4YDUA 1P8ZA 3FZFA 1GLEG 5BREA 1YXQA 1BWFO 1JCFA 4BRAA 3EZWA 1QHAA 1BU6O 4BVPA 5AQFA 3GBTA 3VOVA 5ELZA 4BR0A 1NGFA 3O6WA 2E88A 3VENA 4K25A 1MDUB 2DPNA 3C0BA 3CERA 4IXCA 2VYPA 3I8BA 4I6MB 5FPEA 5BR9A 2KHOA 4BRQA 1NGDA 2EWSA 4B1VA 5AQGA 4F9OA 3QBXA 2NLXA 2ZF5O 4FL9A 3KVGA 4B1XB 4H5VA 4BQZA 5BRDA 1JCGA 4A61A 3M1FA 4DB3A 4HWIA 2GWKA 2F9WA 1E4GT 3UE5A 3D2FA 2IVOA 3UKRA 3MDQA 2A6AA 3LDLA 1HLUA 1IJJA 1QQNA 4BGAA 1XUPO 5LJWA 3MN5A 2AA4A 1LOTB 1C0GA 4PL8A 3LM9A 3H1VX 1DGKN 1KAZA 4BRKA 5JICA 3L0QA 4H5TA 4BC3A 3ZX3A 4BG8A 3LDQA 3A0IX 4PKGA 4DQ8A 1IG8A 1KAYA 2Q31A 3CJBA 2YHYA 4BREA 5AQIA 1BOTO 2E1ZA 4H0TB 1EQYA 1DKGD 3VEYA 4FWOA 1BO5O 1NGAA 4FWRA 4BC4A 3WXKA 5AQNA 1NGBA 1KXPA 2CH5A 2W41A 4XEIA 1MWMA 1K8KA 4WYBA 4GY2B 4Y0WA 4BRNA 2QW9A 2A40A 3CJ9A 3D2FB 2HMPA 1BDGA 1Y64A 3O08A 5BPLA 3CJAA 3DJCA 4BRPA 2A5XA 2D0OA 5BN9A 4CZLA 3CJCA 4BVOA 3H45C 1NLVA 3OHRA 1WOQA 1BUPA 2GWJA 2QWQA 3EKSA 3FGUA 4B1YB 2CH6A 3VF2A 5FPDA 3UKUA 2F9TA 3FLCO 5AZJA 4B1ZA 4BRHA 2UYTA 1MWKA 3LM2A 4QS8A 1JCEA 2I7NA 5AQKA 2YJFA 1BA1A 3CJ7A 3AAPA 3AARA 4BRMA 1NGHA 4CD1A 5KQ8A 3AAQA 1HKBA 1K8KB 2D0PA 4JN4A 5AQYA 3DXKA 3SLCA 1NGJA 1HPMA 4CZJA 2HF3A 5AQPA 5I9EB 5EY4A 3O8MA 5AQOA 2E2OA 3WQUA 3HI0A 4C23A 1ATNA 1YAGA 2ZGYA 3A8YA 3EO3A 4H03B 1X3NA 2PBDA 3VEOA 4FOIA 2QWLA 2I7PA 1S22A 2VWBA 4K41A 4H0XB 5JLFA 2E2PA 1ESVA 3GDQA 5F2RA 1TUYA 3HBTA 5BPNA 3UKUB 4XH5A 5AZJB 4JD2A 5AQTA 1WUAA 3FE1A 3FZLA 1NGIA 3VF6A 1J6ZA 4M7YA 2E2QA 3FZKA 1NM1A 3GOIA 4MLEA 3CI5A 3H6EA 3O5BA 2A3ZA 4EIAA 1Z05A 3QFUA 2Q36A 4Z94A 3MN6A 2IVNA 3I33A 3R8EA 3H46O 3VGLA 4MO5A 3DXKB 1ZBSA 4MLHA 1ZC6A 2P9NA 4RCHA 5BPMA 5EVZA 4CD3A 3WUHA 3BEXA 2P9PA 2V51B 3IDHA 3RSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V7YA 3MN9A 4EZ9A 3IUCA 5M1KA 4DTPA 3VEVA 1C6VA 5M1FA 3L4IA 4LFCK 2D1KA 4V19S 3R2VA 3CMEN 4H0PA 2GEMA 2FF3B 3MK6A 5AFUH 2KFNA 3E7RL 2AJQA 3O1WA 4JD2B 2Y1IA 1EWQA 2O8EB 2PAVA 1XQSC 4GKJK 1XMOK 2N2RA 4DSLA 1JLGA 4AHTA 1MR4A 4A5AA 1ZVGA 3DOKA 4UAEF 3SJHA 5FPNA 1KAXA 2P9NB 4JHDA 1JJ2M 4CJTA 1YVNA 3ATUA 2N69A 3U4LA 5JMVA 3RSEB 3G4SN 4KI6A 4N76A 1TKZA 1FXXA 3CETA 4TSXA 5FDLA 5JENA 3PO5A 4CHQA 3TTFA 3CCMN 2F96A 2KBHA 2HBJA 1X9SA 1TKDA 1K73O 3DMJA 4BRDA 1LQQA 3NHGA 3OBYA 2ZJPL 3THVA 3CC4N 3CHWA 4BR4A 3MWPA 2MBKA 3OYJA 5H1SQ 1LWEA 3OYMA 3OTOK 1OKJA 4IOAL 4YOTA 1RTIA 4MFBA 1EETA 2KW4A 4JHDB 3PSMA 3BZCA 1HQEA 4IEIA 2WBNA 4Y1DA 4O5FA 4PL7A 1GLFO 1RDWX 1YJ9N 3LZJA 1N34K 3SCXA 1WT7A 4CJRA 4ELUA 2Y1JA 4CJQA 2IDOA 3I0SA 5DK5A 4B1UB 4CZMA 2OA8A 2F8TA 4DV1K 5KGXA 3K5NA 3BY5A 2Q1NA 4ID5A 4DQIA 4JYAK 2QKKA 1T7EA 3LANA 4KH4A 2P9KA 3QEPA 3C94A 3DLHA 3QMLA 2B6AA 3VTIA 2BUPA 2ZQBA 4EHUA 3T7ZA 1W7AA 1QZ6A 1IV0A 1TYQA 5KK4A 4CHYA 4LF9K 2Q97A 1JZAA 2D0BA 4JK7A 4H5RA 2GELA 3LAKA 3F2KA 4BR5A 3M8PA 3HOTA 4CECA 4OKEA 3CPEA 3PV8A 3TAEA 4FJJA 4XH4A 3K5OA 4JI8K 1T6CA 4DG1A 3U9ZA 3B8AX 3C7NA 3P31A 4ILHA 4WQ4A 5AQUA 3KLEA 1SKRA 2I61A 2NZTA 2H3GX 4NO7A 4CHNA 4IKFA 3LDOA 4E19A 3AO5A 4Z4CA 3V81A 4R5PA 1RT1A 3MMVA 1TYQB 2RPIA 3CCVN 4FOEA 4CFBA 3O4QA 4YDUC 4E7KA 2BDPA 4I2QA 4FZXC 1DT9A 2YNIA 3EN9A 2O8CA 4IOXA 1N6QA 1CXUA 2P51A 5GAEP 1BGXT 3TAFA 3LP0A 3C7NB 3QNOA 1UGLA 4QAGA 3PX0A 1U48A 4B9UA 5CZ2A 3KK1A 1AYJA 2Z1GA 1KFDA 1Y97A 2FXUA 1ILYA 1FH3A 1JXCA 1EKEA 4JEPA 4CZKA 3O4WA 2YNHA 2IVPA 4JKCA 4F2SA 3VEXA 3ZSVA 4CF1A 3ZEUA 4K42A 2E1YA 2HHQA 3DWLA 2NUBA 3JXUA 1VHXA 3QIPA 4WQ5A 3WXIA 1NGEA 2OZMA 3AO1A 1WSHA 1D4XA 2O8CB 2G2KA 4FJXA 2YC1C 4AB0A 4CEEA 2YI1A 5C25A 1TL1A 4IO8A 1DQ7A 3VQ5A 2VG7A 3A5LC 2WONA 1S3XA 4FWNA 4B3TK 1KCFA 2FLOA 1HPZA 4FO0A 4FPAA 4EP4A 3SZ2A 3CC2N 3V9WA 4FSVA 1VQ7N 1U49A 3KHYA 2CGLA 4CZIA 5SZTA 4C8MA 2VY6A 2YV0X 3IMXA 1XWLA 2CGJA 2OPPA 3ZEUB 2ITMA 4CJ7A 4KHYA 2V52B 3SPZA 3KWGA 4DU4A 1ICAA 1HUXA 1VSFA 4U67L 4BG9A 3V1QA 3L2VA 4EAHD 2RN2A 3LALA 2HHWA 3DRSA 3WXMB 4BRAA 2JDQD 4PHTX 3FFIA 3MX5A 5E41A 5AQFA 3HT3A 3GBTA 5ELZA 4LF5K 1SL1A 3O6WA 4CF8A 4K8ZA 2E88A 1EO1A 1YIJN 4HCCA 4FW1A 5JS2A 3LDSA 3C0BA 2NRVA 4DV6K 1LWCA 4H4OA 4DWIA 2FBYA 4CFDA 2DFHA 4BRQA 4DS5A 3F5TA 4DFKA 3E01A 4CEAA 1HMVA 3QBXA 2P1JA 1L3SA 2NLXA 4FL9A 4B3SK 1OVQA 4X64K 4FJGA 1GOBA 3SUQA 4CEFA 3ZSYA 2VGMA 1FKPA 2YKMA 4E1NA 4M42A 3UKRA 4RW9A 1HLUA 1QQNA 1XUPO 1DJTA 1BCGA 3CCJN 3OYNA 1Q9XA 2VGNA 4WFAL 2B5JA 2KZMA 4PL8A 3H1VX 1RCHA 4DQQA 1J9AA 2PY5A 1KC8O 3OS0A 4O55A 4BG8A 3LDQA 4DQ8A 1KAYA 3CJBA 2YHYA 3ZT0A 3OYGA 2E1ZA 4GW6A 1OH7A 1RTDA 3NH1A 1BO5O 3KOZA 4OKJA 2YHBA 5C42A 5HLFA 5CYMA 1NGBA 1KXPA 1BQNA 2W41A 2M8BB 4WYBA 4GY2B 4Y0WA 4BRNA 1RDAA 3PX6A 3K0SA 4DFMA 3SUOA 3F9KA 3RMDA 3L3VA 1BQMA 3AO4A 3CJAA 3DJCA 1I6FA 3C6HA 4LF4K 3Q7CA 1DLOA 4NYNA 1ASVA 3H45C 5HOOA 4A57A 3NGZA 4NCBA 3THWA 3E7UX 4JKHA 2KKZA 3O9RA 2GMOA 4BRHA 4FJ9A 1JCEA 3V9UA 1D9DA 1B9DA 3RR7A 1SEGA 4BRMA 1PX9A 4BE0A 1O13A 3AA3A 3AAQA 1HKBA 3WNGA 1SNBA 3EEQA 2D0PA 3OYEA 1IBMK 4JN4A 2KPYA 1BISA 1YHQN 2HMIA 3BK3C 1JLQA 3TANA 1TV6A 4CFAA 5EY4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2V7Y A;  3MN9 A;  4EZ9 A;  3IUC A;  5M1K A;  4DTP A;  3VEV A;  1C6V A;  5M1F A;  3L4I A;  4LFC K;  2D1K A;  4V19 S;  3R2V A;  3CME N;  4H0P A;  2GEM A;  2FF3 B;  3MK6 A;  5AFU H;  2KFN A;  3E7R L;  2AJQ A;  3O1W A;  4JD2 B;  2Y1I A;  1EWQ A;  2O8E B;  2PAV A;  1XQS C;  4GKJ K;  1XMO K;  2N2R A;  4DSL A;  1JLG A;  4AHT A;  1MR4 A;  4A5A A;  1ZVG A;  3DOK A;  4UAE F;  3SJH A;  5FPN A;  1KAX A;  2P9N B;  4JHD A;  1JJ2 M;  4CJT A;  1YVN A;  3ATU A;  2N69 A;  3U4L A;  5JMV A;  3RSE B;  3G4S N;  4KI6 A;  4N76 A;  1TKZ A;  1FXX A;  3CET A;  4TSX A;  5FDL A;  5JEN A;  3PO5 A;  4CHQ A;  3TTF A;  3CCM N;  2F96 A;  2KBH A;  2HBJ A;  1X9S A;  1TKD A;  1K73 O;  3DMJ A;  4BRD A;  1LQQ A;  3NHG A;  3OBY A;  2ZJP L;  3THV A;  3CC4 N;  3CHW A;  4BR4 A;  3MWP A;  2MBK A;  3OYJ A;  5H1S Q;  1LWE A;  3OYM A;  3OTO K;  1OKJ A;  4IOA L;  4YOT A;  1RTI A;  4MFB A;  1EET A;  2KW4 A;  4JHD B;  3PSM A;  3BZC A;  1HQE A;  4IEI A;  2WBN A;  4Y1D A;  4O5F A;  4PL7 A;  1GLF O;  1RDW X;  1YJ9 N;  3LZJ A;  1N34 K;  3SCX A; 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