5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
5BN8A 5F0XA 1RFQA 4YDUC 3TU5A 3J8AA 2BTFA 3WUHA 4CZKA 1BDGA 1DEJA 4Y0WA 1Q18A 1XC3A 3ZX0A 4CZIA 3O8MA 1QHAA 3GOIA 3CETA 2F9TA 3CJAA 2ZF5O 2YHXA 4IZ9A 1TYQA 4B1XB 4A2AA 4PKGA 2IVOA 2QXLA 4I6MB 4BROA 4CBXA 1TUUA 2QWRA 4O8KA 5AQJA 2WUSA 3VETA 1GLLO 5AZJA 1EQYA 1BA0A 3EL2A 1NM1A 4B9QA 1ESVA 4MLEA 4O5FA 1RDWX 3FLCO 2YJFA 4H5RA 2YJEA 2VCPA 3A5MC 3LM2A 3A5LC 3RSEA 4BR2A 2FSKA 3A8YA 4IJAA 1GLDG 1HX1A 5AQOA 5AQUA 3CJ9A 3DXKB 3EKSA 2GWKA 1HLUA 4PKHA 2AP1A 3CJCA 4FWQA 1NGGA 1HKCA 1HUXA 2P9SA 1TUYA 4FPAA 5EVZA 1JCEA 3EZWA 4GY2B 4EHTA 4KBOA 3B8AX 3LDLA 1RGIA 1MA9B 3BF3A 2D0OA 1NMDA 3D2FB 4DQ8A 4ISGA 2FF3B 3FE1A 1NGEA 1SQKA 1ATNA 3VESA 2FXUA 4A62A 5JLHA 4BG9A 2GWJA 4JNEA 3FFKB 3U8XA 3SJHA 5BRDA 5FPNA 4FO0A 4FWKA 2ZWHA 3D2EB 5AQFA 4JAXA 4WYBA 3VPZA 2P9PA 3FZHA 1WOQA 3MN9A 1H1VA 4DB3A 2ZGZA 2PBDA 3VEVA 2PAVA 4E1JA 5LJVA 2V7ZA 2QWPA 2FSNA 1YVNA 1OKJA 3VF4A 3L6QA 1SZ2A 5AQPA 4FWRA 4EFHA 1GLJO 3ATVA 3QB0A 3C0BA 3VGKA 3JXUA 4FWLA 4BC2A 3QFPA 2Q1NA 2FF6A 4PL8A 5KPZA 3DAWA 5JLFA 5EXWA 1C0FA 5EX5A 2P9PB 4NB4A 3H1QA 3O08A 2QW9A 1QZ5A 5AQGA 2P9SB 3H45C 5AQRA 4ISFA 4WQ4C 5AQHA 4HTLA 4IXCA 4BRPA 5KQ8A 1XUPO 4BC4A 4BRGA 3FGUA 3QBXA 4BVOA 4Z94A 3MCPA 3BEXA 2GUPA 1IJJA 4M7YA 4BQLA 3MN6A 4XH5A 5KPRA 3CIPA 2DPNA 5E26A 1NGAA 3CJ1A 4JD2B 5AZIA 3U9ZA 4BRQA 2NZTA 3VF6A 5FPEA 1YAGA 2ASMA 3LDQA 2YI1A 1S22A 4AM7A 4C23A 1QZ6A 4H0TB 2FLOA 2P9UA 1GLBG 5B8HA 1HJOA 4CJ7A 3WEEB 5AQVA 3EO3A 5E84A 4WQ5A 4I6MA 3O4WA 3H46O 3VEOA 1ATSA 1KAXA 3VEWA 2V7YA 2IVNA 3EKUA 1BUPA 1NWKA 2QWOA 4B1WB 3A5NC 3WXLA 3ZX3A 3LL3A 4B1YB 2CH6A 3U4LA 1X3MA 4CD3A 4H5WA 2YHYA 4NO7A 3DWLA 5FPMA 1NGIA 4J8FA 4A2BA 1IG8A 3ULEA 3WT0A 3QMLA 5AQTA 2QWQA 2YCHA 4JN4A 2E2PA 4CI6A 4CZMA 3S41A 4BC5A 1S3XA 5ADXH 1G99A 1SAZA 1TYQB 3L4IA 4H0PA 3O6WA 2FSJA 3WEEA 4F9OA 2VWBA 2V52B 2Q97A 4FL9A 4H5TA 2ZGYA 3HM8A 2E2NA 3FZFA 5AR0A 3C7NA 2CGJA 1NGCA 3W3DA 4EIAA 3CHWA 1LOTB 1YXQA 3L0QA 1NGDA 2EWSA 1HKBA 1JCGA 4MO5A 2VYPA 2P9KA 2CGLA 3ZEUB 4WQ4A 3JS6A 5AQIA 3AAPA 2Q36A 4BR0A 3HSCA 1GLCG 3BF1A 4BQZA 2P9NB 2P9LB 2E20A 4K41A 2QWMA 1NBWA 2A41A 4K43A 4XEIA 3M3ZA 4H0XB 5AQSA 2J4RA 3H3NO 3GG4A 3H6EA 4K25A 5AQNA 4PL7A 3BP8A 4BG8A 5AQLA 3AY9A 3UE5A 1ZBSA 4WQ5C 4BVPA 3P4IA 1Y64A 3BUZB 4ISEA 3UB5A 4BREA 5EY4A 1YUWA 3VEYA 3MMVA 1NGFA 3IMXA 3MN7A 3I33A 1NGBA 4IJNA 3QBWA 4BRIA 2P9IA 4CD1A 1C0GA 1KXPA 2QM1A 3ENHA 3QFUA 3CQYA 5JMVA 4FSVA 4BRKA 5BPLA 3GBTA 4H03B 3DJCA 2AA4A 2ASPA 5AQZA 1GLFO 3VOVA 2Q2RA 3FZKA 5FPDA 2OANA 4BRNA 4MO4A 4FOEA 1E4FT 1X3NA 2Q0UA 4XH1A 3UKRA 3KVGA 3O80A 2ASOA 2E88A 3CJ7A 3IDHA 4H5VA 3WQTA 4CZFA 3ZX2A 3SMPA 5I9EB 4BR5A 4QS8A 4RWTA 3D2FA 4K42A 1KAYA 4BR7A 4BRLA 2CGKA 5LJWA 3SMSA 2YHWA 1BA1A 5BRFA 3VGLA 3W0LA 4BGAA 3MK6A 2I7NA 3HBTA 4BRDA 1DKGD 2A42A 2HOEA 4M63C 4B1UB 1LCUA 3A0IX 4H5NA 1BU6O 5KPTA 5EOYA 2GELA 5TKYA 1Z05A 4FWPA 3FZMA 1CZAN 3A5OC 2Q0RA 1BOTO 1KAZA 4FWSA 5BR9A 1V4TA 1K8KB 5JICA 4EAHD 4AM6A 3IUCA 1ATRA 5AQYA 4A61A 2HF4A 2IVPA 3AAQA 2KHOA 3I8BA 2W40A 4GNIA 4BRAA 4DCHA 1K8KA 2A5XA 3ZETA 2I7PA 3GL1A 3ID8A 5KQDA 2E8AA 3O5BA 3KHYA 2W41A 4IO8A 3O1BA 3U9DA 3AARA 5ADXA 3HI0A 1DGKN 2D4WA 3QDKA 4CZGA 1T6DA 5BPNA 3HZ6A 3WXIA 2NLXA 4RTFD 2P9UB 3G25A 4FWMA 3MDQA 3SK3A 4JHDB 4BRMA 2ITMA 3OHRA 4DHYA 1QQNA 3LDPA 1V4SA 1GLEG 2D1KA 4RCHA 3WXKA 3ZETB 5ELZA 5AQWA 4H0VB 1X9JA 4JD2A 3CI5A 3MN5A 5BPMA 5BREA 3D2EA 4BGBA 3ENOA 4FWNA 1HPMA 4MLHA 3FZLA 4FOIA 3CJBA 3F9MA 4BR9A 4XH4A 1BWFO 3GDQA 3DXKA 4HWIA 2A6AA 1NLVA 4CZLA 1NGHA 3UKRB 2A40A 3RSEB 5AQXA 1GLAG 2F9WA 2IIRA 5AQMA 4M7XA 5F2RA 2H3GX 3LDNA 3R9PA 3TPQA 4IWVA 2E2OA 3M6GA 2QWNA 5AFUA 3C7NB 1MDUB 5AFUH 2E1ZA 4JHDA 5AZJB 4B1ZA 3WXJA 2P9IB 4BR4A 3ATUA 3CERA 3EN9A 4BRFA 3VF2A 5AQKA 4CBUA 5LY3A 1U2VB 1U6ZA 2E2QA 3M1FA 5BN9A 4YDUA 4EHUA 4FWOA 4CZHA 3H1VX 4BRCA 4CZJA 1HKGA 3VEZA 3GE1A 1MWKA 2HF3A 3UKUA 3DXMB 4H0YB 4LC9B 3WQUA 3UKUB 5AQQA 1WUAA 2UYTA 2D0PA 2GEMA 3O1WA 3QICA 4CZEA 2P9NA 1D4XA 4L3QA 3LM9A 3KZBA 4BRHA 2Q31A 4BC3A 4QS7A 2P9KB 3LDOA 1U2VA 4FPBA 4H0OA 2HMPA 2A3ZA 3SLCA 3D7EO 2E1YA 5BRHA 2V51B 1P8ZA 2CH5A 3IFRA 1ZC6A 1XQSC 3VENA 5F1XA 1BG3A 4QS9A 2BUPA 3HTVA 1QQOA 1NGJA 1QQMA 1J6ZA 2NRHA 5AZIB 2GTDA 3VERA 3CQXA 1ZXOA 1BO5O 4B1VA 1JCFA 2P9LA 5CE3A 1MWMA 3R8EA 1T6CA 1R59O 4CBWA 1E4GT 3H3OB 3R6MA 3VGMA 3FR0A 1Z6RA 3ULEB 3ZEUA 1T44A 3VEXA 2QWLA 4PKIA 3DXMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ6N 5F0XA 1RFQA 4YDUC 1NPIA 3L2VA 4CZKA 1FK9A 3LP2A 4CFDA 3O8MA 4AHTA 3OJUA 1XNQK 4IZ9A 1TYQA 5KRSA 2IVOA 3VQ8A 1QQCA 3AGKA 4O8KA 4CK1A 1RT4A 5AQJA 5AZJA 2HBKA 3AO5A 1NM1A 2E5LK 1ESVA 4MLEA 2XY8A 3AVJA 4BE2A 1DTQA 2YJFA 1WNSA 3V6DA 3A5MC 4CJQA 3U6FA 2A1RA 4FJXA 4DR5K 3D45A 3K59A 4BR2A 1C1BA 4IJAA 1W9HA 2IOCA 3DLEA 4Z4HA 3TTFA 3SZ2A 2GWKA 2E6LA 3VN5A 3KP0A 4M3UA 1NGGA 1HKCA 4FLUA 1YTAA 2HNZA 1YJNN 3HPGA 1T7PA 5EVZA 3RMBA 4EHTA 4FJGA 5A2QO 4JKAA 2P51A 3DRPA 2EHGA 3MWPA 1NMDA 1N33K 3C6AA 3NCIA 2F8TA 2UUCK 4DTSA 2FF3B 4B9UA 3SI6A 3DM2A 4ILGB 1NGEA 4KFBA 1SQKA 4E7IA 3HXMA 4ELVA 4A62A 3KOXA 4I2QA 4JNEA 2XRIA 5FPNA 4FWKA 3D2EB 4FK2A 3O3FA 5SZTA 4DFJA 1HNZK 4E19A 3ZSXA 3NBPA 3MN9A 1OH8A 2FBYA 1H1VA 4I9LA 2O8DA 4N47A 2QWPA 2FSNA 2N2QA 5AQPA 4C1NK 3EE9A 1XMOK 3DLBA 3VGKA 5JVHL 4FWLA 3QFPA 1QVFM 3TARA 3LAKA 4B9TA 2HBLA 1VSDA 5JLFA 1N8RO 4ID5A 1NJYA 3O08A 2RPIA 1D5AA 2YC1C 2OPRA 3CM5A 4C8NA 2GV9A 3KJVA 1K8AO 1KV0A 2RKIA 3QNNA 1POIA 5HRSA 1NK9A 1Q9XA 1ZVGA 1FXXA 4IDHA 4XH5A 5KPRA 3CIPA 4CGGA 3AVLA 4G9ZA 1B9FA 4JD2B 1U04A 2NZTA 3VF6A 3O9RA 4NCBA 2ASMA 3TI0A 2HHHK 4M45A 4DR4K 4NLBA 1S22A 4JK7A 4AM7A 4WCEL 3G4SN 3P83D 5JS2A 1C1AA 4Y1DA 5E84A 3EO3A 4CEAA 4DWIA 3O4WA 3H46O 3VEOA 4CJ5A 5HRNA 1KAXA 1N36K 5CY4A 2V7YA 2IVNA 1NOYA 4C8OA 1J5EK 3TAQA 3DRRA 4DSKA 4JI4K 4M3ZA 5KGXA 1NWKA 2QWOA 1HJRA 3THXA 3LP3A 3VQ7A 3LL3A 2CH6A 2KFNA 2PY5A 4H5WA 1Z25A 4NO7A 3N4PA 1OH5A 3LZIA 3QMLA 1FKOA 1L3TA 2YCHA 2E3FA 4CIFA 4B3RK 2YBRC 1QSSA 4JN4A 1NG9A 3S41A 1EKEA 1S3XA 4CJSA 3E7UX 4LSNA 4CVNE 2C1IA 4FJJA 2FSJA 1YITN 2VWBA 2Q97A 1E3MA 3BGRA 3HM8A 4I9QA 3FZFA 1NGCA 3W3DA 4K8XA 1YXQA 3L0QA 3OYJA 5M1QA 1HKBA 1JCGA 2CGLA 4U67L 4DTPA 4WQ4A 1NE5A 3O9UA 2QWMA 1T0ZA 4K43A 4DSJA 3AV9A 1BRZA 3H6EA 4A59A 3CPWM 3KLEA 1LWCA 3RMCA 3AY9A 3PIOL 4KTQA 2XY7A 3CC7N 4RW7A 3UB5A 1REVA 2N69A 3TAPA 3C6TA 5KGWA 1TI5A 1YUWA 3MN7A 2YHAA 4KB1A 5LL6Z 2LR3A 3QBWA 4JKBA 3MX2A 2HW3A 3ENHA 3CQYA 5E41A 3ITHA 2ASPA 1GLFO 3VOVA 2Q2RA 3BZKA 3FZKA 2GMOA 4KAZA 1FW6A 1IKWA 3OS0A 4FOEA 3CFOA 3UKRA 4W5OA 2O4IA 2ATQA 5M1NA 1B7DA 3EEQA 3K9JA 1S72N 4C8KA 3K5NA 1T3VA 3ZX2A 4IEEA 4QS8A 4WFAL 4DTNA 4A5BA 3E7RL 5GIOA 4XIUA 4L8RB 1SEGA 2XO7A 4K42A 1TKTA 4ILJA 3SMSA 2YHWA 5C42A 1VQ5N 5H1SQ 1DJTA 2ZJRL 2KPYA 1I2UA 4LSLA 1JLEA 1NKEA 3RRGA 4X66K 3W0LA 1IKVA 4BGAA 4BRDA 1TKZA 4RW8A 4LFCK 3NGYA 1VQ7N 3A0IX 3L4QA 4DFPA 3PO4A 4NYNA 4J2EA 3O3GA 4FM2A 3TAGA 1WLJA 1NJZA 5CHIA 1ZVEA 3PLAA 1Z05A 1RDCA 3FZMA 3AO4A 1NK5A 1VSMA 1AYJA 1K8KB 3L2UA 4Z4GA 4AM6A 1ATRA 4JK9A 3QI7A 4A61A 4DV5K 4O8UA 1U4BA 3I8BA 1WT7A 4NCAA 1BIZA 4JKHA 1RT5A 2A5XA 3A2FA 1BCGA 1KLNA 1T03A 4CESA 3MX5A 4HVJA 3KHYA 3THYA 3KTQA 2W6KA 3O1BA 4CJTA 3V1QA 3HO1A 2JLEA 3VQAA 4EZ6A 1DGKN 1K6YA 1BIUA 2NLXA 3K9KA 2P9UB 1KFDA 4M3XA 3SK3A 4CHYA 1EETA 1QQNA 4KI4A 4H0VB 2O8BB 4OLAA 1EX4A 2PZSA 1N4NA 2KZZA 2KFZA 3FZLA 4CEEA 3CJBA 4DS5A 4BR9A 2XHBA 1BCMA 5CZ2A 4CZLA 4AHUA 1T7EA 2IIRA 3F5TA 5AQMA 3SUOA 3G71N 3V9XA 2H3GX 3LDNA 4MDAA 3TPQA 1B92A 1QVGM 4FK0A 5AFUH 2E1ZA 4JHDA 5AZJB 5FLXO 1NK7A 3DLGA 3NDKA 2P9IB 2QKKA 1WB9A 2KTQA 3EN9A 3VF2A 3AVBA 3KKRA 1RTIA 5BN9A 4DV6K 3ALYA 1JL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VQ6 N;  5F0X A;  1RFQ A;  4YDU C;  1NPI A;  3L2V A;  4CZK A;  1FK9 A;  3LP2 A;  4CFD A;  3O8M A;  4AHT A;  3OJU A;  1XNQ K;  4IZ9 A;  1TYQ A;  5KRS A;  2IVO A;  3VQ8 A;  1QQC A;  3AGK A;  4O8K A;  4CK1 A;  1RT4 A;  5AQJ A;  5AZJ A;  2HBK A;  3AO5 A;  1NM1 A;  2E5L K;  1ESV A;  4MLE A;  2XY8 A;  3AVJ A;  4BE2 A;  1DTQ A;  2YJF A;  1WNS A;  3V6D A;  3A5M C;  4CJQ A;  3U6F A;  2A1R A;  4FJX A;  4DR5 K;  3D45 A;  3K59 A;  4BR2 A;  1C1B A;  4IJA A;  1W9H A;  2IOC A;  3DLE A;  4Z4H A;  3TTF A;  3SZ2 A;  2GWK A;  2E6L A;  3VN5 A;  3KP0 A;  4M3U A;  1NGG A;  1HKC A;  4FLU A;  1YTA A;  2HNZ A;  1YJN N;  3HPG A;  1T7P A;  5EVZ A;  3RMB A;  4EHT A;  4FJG A;  5A2Q O;  4JKA A;  2P51 A;  3DRP A;  2EHG A;  3MWP A;  1NMD A;  1N33 K;  3C6A A;  3NCI A;  2F8T A;  2UUC K;  4DTS A;  2FF3 B;  4B9U A;  3SI6 A;  3DM2 A;  4ILG B;  1NGE A;  4KFB A;  1SQK A;  4E7I A;  3HXM A;  4ELV A;  4A62 A;  3KOX A;  4I2Q A;  4JNE A;  2XRI A;  5FPN A;  4FWK A;  3D2E B;  4FK2 A;  3O3F A;  5SZT A;  4DFJ A;  1HNZ K;  4E19 A;  3ZSX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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