5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
3LL3A 3U4LA 3WT0A 1DKGD 5AQGA 4K42A 1NGFA 4BRLA 4EAHD 2ASMA 4FOEA 4BGAA 4JD2B 3O8MA 4DQ8A 1YVNA 2P9UB 4CJ7A 4EFHA 4CZJA 4ISGA 5BR9A 4BQZA 4I6MB 3WQUA 1GLCG 3ULEA 1QZ6A 3P4IA 2GTDA 1MDUB 4FOIA 3TPQA 1GLEG 2F9WA 1V4TA 1ATNA 4PKIA 4CD3A 4PL8A 2KHOA 1BA1A 3BP8A 2QWPA 3FZMA 3C7NA 4BR9A 3GDQA 4K25A 4BR5A 5ADXA 4O8KA 3M1FA 1G99A 5AFUH 1QHAA 3I8BA 4H0PA 2CGLA 2E88A 4K41A 1DEJA 4IXCA 1BO5O 4DB3A 4A62A 1KAZA 5FPDA 3AAQA 1U2VA 3O6WA 2Q31A 1KAXA 1WOQA 2P9NB 4JAXA 4H0OA 3IUCA 4E1JA 1NGGA 4BGBA 4BRPA 3UKRB 1NGJA 3D2EA 4CBXA 4PKGA 3CJCA 3L0QA 4BC3A 2D0OA 3B8AX 2P9SA 2W41A 4FWSA 4AM7A 3IMXA 4DCHA 4EHUA 2E20A 2IVOA 3SLCA 4B1XB 1EQYA 1NBWA 1YAGA 1BOTO 2FF3B 4A2AA 2A41A 2QWLA 5AQWA 3EKUA 3BF3A 1K8KB 2P9PB 2ASOA 3EL2A 3FLCO 4J8FA 1ZXOA 5LJVA 2E2OA 3SJHA 2PBDA 4HWIA 1T6DA 5EXWA 2CH5A 4A2BA 5AQOA 1TUUA 3CIPA 3WEEB 3GOIA 3QB0A 3C0BA 5BPLA 5FPNA 2VYPA 3H3NO 3HI0A 3D2FB 3VEXA 1HJOA 5EY4A 5AQHA 5KPZA 5AQXA 5AZJB 3WXLA 1NGDA 1ESVA 1V4SA 2CGJA 3VOVA 4HTLA 4FWQA 3FZLA 2Q97A 2E1ZA 3J8AA 1BWFO 1MWKA 4H0VB 4BREA 2V7YA 5AQRA 4BRQA 3SK3A 4K43A 1TYQA 1CZAN 4A61A 4BROA 2AP1A 1GLAG 1Z05A 3RSEB 2VWBA 3ATUA 3VEOA 3CERA 4CD1A 2H3GX 3VF6A 5F2RA 3KHYA 4LC9B 2FSJA 4MO5A 2Q36A 2A40A 2NZTA 5KQDA 2D0PA 4BRHA 2QXLA 2OANA 5E84A 2QWMA 1KAYA 1GLJO 4BRAA 4PKHA 1JCFA 4FWKA 3A0IX 1K8KA 2P9PA 4DHYA 5AQJA 4IZ9A 4XEIA 2V51B 4BG9A 2QW9A 4CBWA 2P9LB 5AQIA 2P9IA 1YUWA 2P9IB 2P9LA 3ZX0A 1NGAA 3QFUA 3VGKA 2V52B 1XUPO 3R6MA 2FXUA 2E1YA 4H5NA 4I6MA 4WQ5A 4BQLA 4CZKA 1NGEA 1T44A 3A5OC 4C23A 3UE5A 4B1ZA 3L6QA 3CJ1A 2HOEA 4H0YB 4ISFA 1BDGA 4IJAA 3KVGA 3QBWA 3LDNA 4XH5A 5I9EB 4AM6A 2W40A 3H6EA 3C7NB 5KQ8A 4CZGA 5JICA 5BN9A 4NO7A 3EZWA 4O5FA 1BG3A 3AAPA 4BRMA 3BEXA 3D7EO 5AQMA 4H0XB 2J4RA 3O5BA 3MMVA 1R59O 5AQVA 1X9JA 5AQNA 3UKUB 3LDPA 3WXJA 4B1YB 2QWNA 1XC3A 5LJWA 2QWQA 3CETA 3DXMA 5AZIB 3H1VX 3D2EB 3MN5A 3ULEB 2I7NA 3UB5A 3ZETA 4BC5A 1YXQA 4XH1A 3AARA 2NRHA 4BRIA 5KPRA 4JD2A 4BRNA 3ZX3A 2BTFA 2PAVA 1ATRA 2CGKA 1RDWX 1TUYA 1SQKA 2QWRA 3QICA 4M7YA 3IFRA 3DAWA 4FL9A 4XH4A 2GELA 2ASPA 2IVNA 4CZIA 3CJ7A 3W0LA 1T6CA 5F0XA 4BC2A 3FZKA 5AQKA 3A8YA 2HF3A 3BUZB 3FFKB 3MDQA 3WXIA 4Z94A 2GUPA 2P9NA 3JXUA 1XQSC 2YJEA 3ENHA 4BVOA 3O4WA 3S41A 4BR0A 1DGKN 1MA9B 5JLHA 4CBUA 3O1BA 4YDUC 2YI1A 4Y0WA 3R9PA 3DWLA 3F9MA 3GBTA 3CJAA 3ATVA 4MLEA 5FPMA 4BC4A 3ZETB 2GWJA 4CZLA 3VEZA 1J6ZA 1ZBSA 1BU6O 1C0GA 1GLBG 5LY3A 4B1VA 4M7XA 1IG8A 5BN8A 4H03B 4FSVA 3A5MC 4H5WA 3LDOA 1NGHA 1HPMA 4CZHA 1U2VB 1NWKA 1ZC6A 2YHYA 3WEEA 5AZIA 4BR4A 1GLLO 3GL1A 2EWSA 2ZWHA 4FWRA 5BPMA 2I7PA 2YCHA 3D2FA 1HUXA 3TU5A 3VGMA 4BRFA 5BRDA 4JHDB 3FE1A 1LOTB 2UYTA 4RCHA 3HZ6A 3U8XA 1S22A 4FWMA 3M3ZA 2HMPA 4WQ4A 3VPZA 3LDQA 3HSCA 2A6AA 4H5VA 1HKGA 3A5LC 4QS8A 3VF2A 3L4IA 1KXPA 1X3MA 3DXKA 1D4XA 5BRHA 1JCEA 3RSEA 4H5RA 4H5TA 5FPEA 2E2NA 2HF4A 3CQYA 5F1XA 4F9OA 5JLFA 2Q1NA 3A5NC 3ZX2A 3WXKA 5AQYA 5AQSA 3EO3A 4FO0A 5BRFA 2YHXA 3CQXA 3SMSA 4ISEA 3HM8A 4IO8A 1Q18A 5AZJA 5ELZA 3SMPA 1BUPA 3MK6A 3H3OB 1X3NA 2Q0RA 4M63C 2F9TA 3QFPA 2FSKA 2A42A 4QS7A 1NMDA 4GY2B 3IDHA 3GG4A 5EX5A 3ZEUB 3LM2A 1NM1A 1RGIA 2FSNA 2NLXA 4GNIA 5AQQA 5AQLA 5AQPA 4PL7A 2ZGYA 1H1VA 2A3ZA 1QQOA 4KBOA 3HBTA 4WQ5C 3GE1A 4CZEA 2GWKA 3QMLA 3EKSA 4QS9A 3G25A 4MLHA 3FZHA 5JMVA 1C0FA 5CE3A 3FR0A 2DPNA 3HTVA 2ZGZA 3VGLA 4FWOA 3QDKA 3H46O 3CJ9A 3ID8A 2CH6A 1BA0A 4IWVA 5KPTA 3VERA 3WQTA 4WQ4C 3M6GA 1HX1A 4JHDA 3VESA 1NGBA 5E26A 4BR7A 2WUSA 2A5XA 4BG8A 1ATSA 1IJJA 2BUPA 1U6ZA 3CI5A 1QZ5A 3ENOA 5AQUA 4BRCA 4BRGA 3AY9A 1Z6RA 2Q0UA 3U9ZA 1Y64A 2P9UA 3ZEUA 4MO4A 3FGUA 4B1UB 4B1WB 1SZ2A 2QM1A 3KZBA 3R8EA 4L3QA 2D4WA 3MCPA 3DJCA 1HKBA 5ADXH 4H0TB 4FWNA 1WUAA 3UKRA 1E4GT 3VEVA 3CHWA 3H45C 2P9KA 3O08A 4WYBA 2E2QA 1P8ZA 2VCPA 3O80A 1S3XA 4CI6A 1RFQA 2E2PA 2ZF5O 1GLDG 3VEWA 5BPNA 1TYQB 3WUHA 3I33A 1E4FT 2D1KA 1OKJA 2GEMA 4JNEA 3H1QA 4IJNA 3EN9A 2YJFA 4FPAA 1GLFO 1QQMA 3VF4A 4NB4A 5BREA 1MWMA 3DXKB 2IVPA 4YDUA 3VETA 5AQTA 1HKCA 2FLOA 3LDLA 5B8HA 3DXMB 1NLVA 3QBXA 3MN9A 4B9QA 1LCUA 1SAZA 5AR0A 3VEYA 3JS6A 3W3DA 4BVPA 4BR2A 4CZFA 2P9SB 5AFUA 4FWPA 3FZFA 4RTFD 4EHTA 1NGIA 3O1WA 4JN4A 4RWTA 4FPBA 3MN6A 2YHWA 2IIRA 3CJBA 5TKYA 4FWLA 3MN7A 4BRKA 3UKUA 1NGCA 2E8AA 3BF1A 2ITMA 5AQZA 5EOYA 3LM9A 1QQNA 2QWOA 1HLUA 5AQFA 2Q2RA 3OHRA 2V7ZA 2AA4A 3U9DA 4CZMA 3VENA 4BRDA 2FF6A 5EVZA 1JCGA 4EIAA 2P9KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2SA 3VQCA 4K42A 1S5JA 4YHHK 1YTAA 4JD2B 2YKNA 3O9SA 5J2PA 3NVKA 2W00A 4CZJA 3J80O 4ISGA 3KK2A 3L2WA 4BQZA 5IT9O 1GLCG 2KBJA 2ZD1A 1X9MA 3TABA 4LF7K 5JENA 1HYSA 4AEIA 1MR4A 3CCQN 4CD3A 3TR8A 2YEOA 3ZSRA 1BA1A 2XY6A 1ZYQA 2PFUA 2QWPA 4V1DC 2UXCK 1G15A 1WSJA 3PIOL 4K25A 4BR5A 1GPSA 4O8KA 5ADXA 5AFUH 2XY5A 1CXQA 2CGLA 3NH2A 2HB5A 4K41A 2Z1IA 1P0AA 4IXCA 3TAPA 4FM1A 1BO5O 4CJPA 3AAQA 4H8KA 4YOTA 3AO2A 4JAXA 3PUFA 4FLYA 1JLCA 3C94A 4E1JA 1CZ9A 1TVRA 4FYDA 3J7AP 1L4VA 4UAEF 2HNYA 3AO5A 4CE9A 4PKGA 4W5QA 3DYAA 1K73O 3R3LA 1IBLK 1EX4A 2D0OA 3B8AX 2W41A 3O9RA 4IFYA 4FW1A 1YAGA 2QWLA 3LWMA 5HP1A 1K8KB 2FBTA 3V9UA 4DLEA 4J8FA 3FLCO 2E2OA 3SJHA 4DQSA 2PBDA 1S9GA 2F7TA 1T6DA 5EXWA 5AJ3K 4B9LA 5CY4A 1GOCA 3QB0A 4NYFA 4EZ9A 4Q0BA 2IGIA 3PO5A 4N5SA 3D2FB 1HJOA 5KRTA 3WXMB 5EY4A 3PX0A 3L3UA 4IG0A 1ESVA 3QLHA 3E7UX 3SQ1A 3FZLA 2Q97A 4W5RA 4CFAA 3KOZA 4BREA 2RPIA 2PYLA 2Y1JA 4K43A 1CZAN 3BZCA 1B3CA 1GLAG 1RT5A 1J53A 1B9FA 3T7ZA 4C8NA 2O8BB 3SQ0A 5F2RA 4MQ3A 3SQ4A 3KHYA 4ILJA 1HJRA 3SV3A 3VQ4A 1QVFM 4MO5A 2A40A 3ZSOA 3NGYA 4KAZA 1ZBIA 1VSLA 4LH5A 5E41A 1NJYA 3LP3A 1SKSA 1VQ8N 1GOBA 4LSNA 4MDAA 2QWMA 3AGKA 4CGGA 2YX6A 1C0UA 1Z26A 1CHZA 1YIJN 2KKZA 1GLJO 1HYVA 4CESA 2PZSA 3KD1E 3I56N 4DV6K 4B8AB 2P51A 4IO9L 1K8KA 4BEBA 4IZ9A 4BG9A 2QW9A 3VQEA 2OTLN 5AQIA 1JXEA 1WAFA 3TTCA 2P9IB 2P9LA 2DFHA 1ZYVA 1WAJA 3VGKA 4BDPA 2V52B 3AVCA 2E2FA 1BCOA 1FK9A 1TGOA 5J1EA 4I6MA 4RW6A 1NE5A 3L4QA 4C23A 3WNGA 1RT6A 4H0YB 4DMNA 4ISFA 4IJAA 1U47A 2UXDK 4XH5A 3V1OA 5I9EB 1WN7A 3H6EA 3OVNA 5KQ8A 1BIZA 3AGRA 5BN9A 3MEDA 4NO7A 4CZGA 4O5FA 4CVNE 3AAPA 2GV9A 3PX6A 1DT9A 4KHNA 1R59O 3T3FA 4DFMA 3IKMA 3LDPA 4B1YB 1HNZK 5KI6A 1XC3A 1BQMA 1XWLA 3ZT4A 4UQGA 3H1VX 2B4JA 3ZETA 4CW7B 4LD0A 3OYHA 3SBTA 3KTQA 4BRIA 5HBMA 1XMOK 2MN5A 3QNOA 1CLQA 4CIGA 2G8HA 5J2MA 3L2UA 1J5EK 1SQKA 2QWRA 1YITN 4AHSA 3SV4A 4XH4A 4JEPA 2IVNA 3NH1A 3DMJA 3CJ7A 4CECA 3QETA 3SNNA 2XY7A 4JKGA 4JK7A 5I42A 4DV3K 3V81A 3FFKB 3T19A 4QOZB 4BR0A 3O1BA 1P00A 3F9MA 1KD1O 2N66A 2HNZA 3K2PA 3SQ2A 1S1TA 2GWJA 4CIEA 1NOZA 1YI2N 1ZBSA 1GLBG 4JKAA 4B1VA 2C1GA 4H5WA 3CFRA 3K5NA 4CZHA 3OYGA 2VGMA 1ASWA 3S3NA 4PHTX 4CEDA 3WEEA 4MDBA 4PQUA 4BR4A 1S6PA 2KJAA 4R79A 1QHTA 3OYAA 1K8BA 2I7PA 3T1HK 4JYAK 3KP0A 4FJ8A 4GVMA 1WWNA 1ZBLA 1JZAA 1C0TA 3KLFA 1QS4A 2UYTA 3HZ6A 3AV9A 4CHQA 1T7BA 4FZYA 4E7HA 4DTXA 4H5VA 3A5LC 2B5JA 4JK8A 4A5AA 1NK0A 1HMVA 1JCEA 1NG9A 1XHZA 4DU4A 3CQYA 4H5TA 5FPEA 2IOCA 5JLFA 5FRMA 4CGDA 3HL8A 5LMUK 4CJ5A 3L2VA 1QQCA 3AVBA 4FO0A 5BRFA 2YHXA 3SMSA 3MWPA 3HPHA 2Q3SA 5DMRA 2O8DA 2EHGA 4IO8A 4DSFA 2G8KA 3H3OB 1IKWA 2Q0RA 1VQ4N 2VG5A 3CM6A 4CJSA 4QS7A 4DV7K 4X65K 3VQDA 1Q9XA 3GG4A 1S9EA 4DSLA 3UIQA 3ISNC 4I2QA 1RGIA 3KD5E 4C8MA 4M45A 4BWJA 1H1VA 3AVLA 4CZEA 3EKSA 5C42A 3MECA 2LI7A 4KTZA 1BIUA 5C10A 1LW2A 4F2RA 3G4SN 4HTUA 3CJ9A 4FJ5A 3WQTA 3VESA 4OKJA 2NNWA 4JHDA 3ZT2A 4PY5A 3CCRN 2WUSA 2QKKA 3C65A 4HCBA 3F2KA 4JI7K 3CI5A 1EP4A 1KQSM 1QZ5A 3HO1A 3DOLA 1OMYA 5AQUA 4BRCA 3HPOA 4YOXA 1SS6A 5TKWA 4BRGA 3HJFA 2DFFA 1EWQA 1N32K 1C56A 3ZEUA 4M3ZA 1A5WA 4FXDA 1NKBA 4L8RB 3O9QA 1I2VA 2P5OA 1WSGA 4YORA 3C6UA 2F8SA 3THXB 1VQON 4WYBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4F2S A;  3VQC A;  4K42 A;  1S5J A;  4YHH K;  1YTA A;  4JD2 B;  2YKN A;  3O9S A;  5J2P A;  3NVK A;  2W00 A;  4CZJ A;  3J80 O;  4ISG A;  3KK2 A;  3L2W A;  4BQZ A;  5IT9 O;  1GLC G;  2KBJ A;  2ZD1 A;  1X9M A;  3TAB A;  4LF7 K;  5JEN A;  1HYS A;  4AEI A;  1MR4 A;  3CCQ N;  4CD3 A;  3TR8 A;  2YEO A;  3ZSR A;  1BA1 A;  2XY6 A;  1ZYQ A;  2PFU A;  2QWP A;  4V1D C;  2UXC K;  1G15 A;  1WSJ A;  3PIO L;  4K25 A;  4BR5 A;  1GPS A;  4O8K A;  5ADX A;  5AFU H;  2XY5 A;  1CXQ A;  2CGL A;  3NH2 A;  2HB5 A;  4K41 A;  2Z1I A;  1P0A A;  4IXC A;  3TAP A;  4FM1 A;  1BO5 O;  4CJP A;  3AAQ A;  4H8K A;  4YOT A;  3AO2 A;  4JAX A;  3PUF A;  4FLY A;  1JLC A;  3C94 A;  4E1J A;  1CZ9 A;  1TVR A;  4FYD A;  3J7A P;  1L4V A;  4UAE F;  2HNY A;  3AO5 A;  4CE9 A;  4PKG A;  4W5Q A;  3DYA A;  1K73 O;  3R3L A;  1IBL K;  1EX4 A;  2D0O A;  3B8A X;  2W41 A;  3O9R A;  4IFY A;  4FW1 A;  1YAG A;  2QWL A;  3LWM A;  5HP1 A;  1K8K B;  2FBT A;  3V9U A;  4DLE A;  4J8F A;  3FLC O;  2E2O A;  3SJH A;  4DQS A;  2PBD A;  1S9G A;  2F7T A;  1T6D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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