5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
3HZ6A 3ZETA 3M6GA 3CJBA 3SMPA 3U9ZA 3VESA 3QFUA 5AQOA 3WUHA 2YCHA 4IJNA 4MLHA 3FE1A 3ZETB 2V51B 4JHDA 3R6MA 4BRMA 4FL9A 1H1VA 2E8AA 3VERA 3H3OB 1TYQA 4M7XA 2QWMA 4MLEA 4JHDB 1DGKN 1RFQA 5AQRA 3VF6A 1TYQB 1BU6O 4BG9A 2FF6A 3JXUA 1MWMA 4H5NA 4O5FA 1SQKA 4PKGA 3MN9A 2ASPA 1XUPO 2A42A 2D0OA 1NGHA 5FPDA 3A5MC 3GBTA 1S3XA 2A40A 4IWVA 4BQLA 2V7ZA 5AQSA 2IVOA 4FWQA 2E2OA 5EVZA 2FLOA 3FLCO 3R9PA 3VGLA 5AQTA 5AQQA 3ULEA 3H45C 4ISEA 4FWKA 4QS8A 3ENOA 5ADXA 1KAXA 5I9EB 3ULEB 3IDHA 3C0BA 1QQOA 4PL8A 1T6DA 4A2AA 3H46O 3DWLA 4B1UB 3BP8A 3IUCA 3L6QA 2A41A 1R59O 3O1BA 3VEYA 4PKHA 2ASMA 3H1QA 2GUPA 1V4TA 3UE5A 2ZGYA 4YDUA 3M1FA 4JAXA 1NMDA 1T44A 1NGIA 4CZMA 2NRHA 3CHWA 3P4IA 5JMVA 1U2VA 4H03B 5KPRA 5AQGA 1HKCA 4QS7A 3VEZA 1GLFO 2QXLA 1U2VB 3GL1A 3HSCA 2P9SA 1QZ5A 1MDUB 2P9SB 2D1KA 1YXQA 4RWTA 4IO8A 2Q0RA 4H5WA 4CZEA 3VEXA 2YHYA 4DQ8A 1ATNA 4WQ4C 3W0LA 3SLCA 1QQNA 4FPAA 3F9MA 3UKUA 4BVPA 5LY3A 3CERA 3BEXA 3CETA 3UKUB 1NGFA 2GWJA 1S22A 3CQXA 2E2PA 4F9OA 5BPMA 4FWLA 4XH5A 3VEWA 5AQYA 2W40A 1U6ZA 4PL7A 4EIAA 3FGUA 1XC3A 4I6MA 2FSNA 4CD1A 2IIRA 5BN8A 3IMXA 3ATVA 1BOTO 4I6MB 4AM6A 2DPNA 1QHAA 2YJFA 2P9KA 3H3NO 3VENA 1HX1A 5FPMA 2Q97A 2A5XA 2P9KB 4PKIA 1JCFA 4E1JA 2NLXA 3BF3A 2QWLA 3GDQA 2IVPA 3O6WA 4BRDA 1BA0A 3LDQA 4BR4A 4FWOA 3VF2A 3B8AX 2BUPA 3LDLA 2AA4A 3CJAA 3U9DA 3VEOA 1BDGA 3WXKA 2VWBA 2W41A 2I7PA 1RGIA 5JICA 3LL3A 5FPEA 1YUWA 3OHRA 5BRFA 4QS9A 1JCEA 2ITMA 4BRGA 2E1ZA 2H3GX 3WXJA 4BRHA 4BRNA 3VPZA 3MN6A 1IJJA 3QFPA 3O8MA 3U8XA 2FSJA 3G25A 2PAVA 1NGCA 5AQNA 1YVNA 4H0PA 1ZBSA 3O4WA 4CZKA 5AFUH 4BRLA 1DKGD 5ELZA 4DCHA 5AQHA 3JS6A 3CJ1A 3A5OC 1LCUA 1WUAA 4BRKA 4EHTA 3CQYA 4C23A 1NGGA 2E1YA 5BPNA 2P9UA 1HUXA 2GTDA 2BTFA 2P9UB 3VETA 3L0QA 4CJ7A 2ZGZA 4K41A 5EX5A 1GLLO 3CIPA 4B1YB 3FZFA 3HBTA 4J8FA 3IFRA 1ZXOA 4Y0WA 3I33A 3M3ZA 4H0OA 3VEVA 4HWIA 1LOTB 3MMVA 3KVGA 1HKGA 4B9QA 1MA9B 4NO7A 5F1XA 5AQZA 2HOEA 4IXCA 5E26A 4FWPA 4CZHA 4H0XB 1C0GA 2P9LA 4O8KA 2Q1NA 4WQ5A 2HMPA 1DEJA 4BRIA 2P9LB 2VCPA 2CH5A 4DB3A 2A3ZA 4M63C 3AARA 4CZLA 5FPNA 5EOYA 2CH6A 5KQDA 4H5RA 2KHOA 3H6EA 1GLCG 4XH1A 1ZC6A 4FSVA 3J8AA 1X3MA 5BPLA 3WQTA 5AQLA 3TU5A 4BVOA 5BRDA 3AAPA 3ZX0A 4CZFA 5E84A 3QMLA 3VGMA 4A2BA 3ATUA 2P9IA 1HLUA 4MO5A 4A62A 3U4LA 1KXPA 2P9IB 2F9WA 4FO0A 5AZIA 1NWKA 3ENHA 3MDQA 1P8ZA 5AFUA 1Q18A 3O08A 3BUZB 4CBXA 5AZIB 3LDPA 1QZ6A 3FZMA 3A5LC 5AQJA 4CZIA 1D4XA 5AQXA 5EY4A 5KPZA 3TPQA 1V4SA 1X9JA 1BO5O 3SJHA 3ZEUA 1Y64A 2F9TA 3DXMA 5AQVA 4K42A 2FSKA 2PBDA 2YHXA 3ZEUB 5AQKA 2QWNA 5AQFA 4CD3A 3DXMB 5AQPA 4BC2A 3L4IA 1NLVA 1BWFO 4AM7A 5F0XA 4NB4A 2QW9A 3CJ7A 2FF3B 3QBXA 4JN4A 3SMSA 3QBWA 4BQZA 2QWQA 5BN9A 2CGKA 1EQYA 5ADXH 1ATSA 2ZWHA 4FWRA 5TKYA 5BRHA 4JNEA 3BF1A 3WQUA 4BRCA 4CZGA 4H0VB 2A6AA 5JLHA 4BRFA 2YI1A 4XEIA 1MWKA 3A5NC 4M7YA 5EXWA 1OKJA 2V52B 3WXIA 4WQ4A 4BROA 1JCGA 2GWKA 2YHWA 2D0PA 3CI5A 3AAQA 5AQMA 4BRAA 2E88A 2D4WA 3MN5A 4BC3A 4YDUC 5KPTA 2QWOA 4KBOA 3EO3A 3RSEA 1GLJO 4H0TB 3QICA 3RSEB 1X3NA 5AQIA 1GLAG 3R8EA 1KAYA 2IVNA 3D2EA 2QM1A 3ID8A 1TUUA 5CE3A 3EL2A 3D2EB 4BR9A 3ZX3A 4H5VA 3A8YA 2E2NA 3D2FA 3DXKA 3ZX2A 4BR5A 5AZJA 5B8HA 2E2QA 2Q31A 5KQ8A 3D2FB 3DXKB 3C7NA 1C0FA 5AZJB 3SK3A 4CBWA 4CBUA 4EFHA 2AP1A 3MK6A 1QQMA 3C7NB 2GEMA 1BUPA 5F2RA 4JD2A 3WEEA 4BGBA 4BRQA 2HF3A 5LJWA 1G99A 3DAWA 4JD2B 3WEEB 1J6ZA 4FWSA 1KAZA 4DHYA 3HI0A 2QWRA 3UB5A 3FZLA 4GY2B 4FOIA 3H1VX 1K8KA 2VYPA 4CZJA 4H0YB 3CJCA 3VOVA 1K8KB 2HF4A 4B1WB 1HPMA 4ISGA 2EWSA 2NZTA 4BR7A 1YAGA 1GLBG 1GLEG 4EAHD 4BR0A 3HTVA 4WYBA 4BC4A 3FZKA 4XH4A 4BR2A 3LM9A 1HJOA 3FZHA 4LC9B 3UKRA 3I8BA 1SAZA 2E20A 2UYTA 1SZ2A 2Q2RA 3EN9A 1NGAA 1ATRA 3UKRB 2P9NA 4B1VA 3QDKA 4H5TA 3AY9A 3O80A 3FFKB 1E4FT 2P9NB 3LM2A 4EHUA 1Z05A 3LDOA 3QB0A 3WXLA 1NGEA 3MN7A 4Z94A 1NM1A 2OANA 3EKSA 5AQWA 3WT0A 5LJVA 4CI6A 4GNIA 1BG3A 3O5BA 5AR0A 4RTFD 4BRPA 5AQUA 2WUSA 3GG4A 4RCHA 1BA1A 3VGKA 1TUYA 2CGJA 3EZWA 4FOEA 1Z6RA 2V7YA 1GLDG 1XQSC 5JLFA 1ESVA 3GE1A 2P9PA 4A61A 2I7NA 3KHYA 3O1WA 3EKUA 2P9PB 1CZAN 1T6CA 2GELA 3DJCA 4FWNA 4B1XB 3KZBA 1NGJA 4K43A 4MO4A 1RDWX 3MCPA 3LDNA 4ISFA 3S41A 4B1ZA 4BREA 4BC5A 2QWPA 3W3DA 4FPBA 2Q36A 2YJEA 3A0IX 1IG8A 1WOQA 4L3QA 3HM8A 5BREA 3D7EO 1NGDA 1NBWA 4FWMA 3VF4A 2ZF5O 3GOIA 1HKBA 1E4GT 4WQ5C 2CGLA 2J4RA 4BG8A 4IZ9A 2Q0UA 4K25A 4BGAA 3CJ9A 1NGBA 4HTLA 5BR9A 3FR0A 4IJAA 2FXUA 2ASOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D8YA 5C15A 1B7DA 3CJBA 3M6GA 3VESA 4I2QA 3I0SA 5AQOA 3PUFA 1RT6A 2NY9X 2XHBA 4OGCA 4M42A 4M7XA 2E3FA 3AVAA 3L2RA 2YV0X 1ZBUA 4QOZB 3DLEA 5JS2A 2W42A 1BISA 1PTXA 2A42A 1ZYWA 2D0OA 4W5QA 4LFCK 4DR4K 3GBTA 2A40A 2QEXN 4IWVA 2IVOA 2E2OA 2FLOA 3VGLA 3V9UA 3NGIA 1S1UA 2X78A 1KVBA 3ENOA 3T19A 1U47A 4PL8A 3C0BA 4KV8A 3DWLA 3ZSXA 3L6QA 2I61A 2A7TA 4PKHA 2ASMA 3H1QA 2GUPA 5HRSA 4CF0A 4YDUA 4FLUA 2KBHA 4B9LA 4W5NA 1B9DA 5JENA 3V9ZA 1NMDA 3VQ9A 1TV6A 5JMVA 2OZMA 4CFDA 4H03B 4B9NA 4IDKA 5AQGA 3DI6A 5GIPA 4AB0A 3CCSN 2QXLA 4DQRA 3HSCA 1QZ5A 2GX9A 3DLGA 1C0UA 1TKZA 3WNEA 2Z1HA 4F2SA 1YXQA 3JAMO 4RWTA 1C6VA 4I9LA 4CEEA 2OTLN 3V1OA 3THYA 4LF8K 4RW6A 4B08A 4WQ4C 3THYB 3W0LA 1QQNA 3QLHA 4BVPA 4HCCA 1LW0A 2NUBA 2PZSA 2X6NA 1FXXA 4WF9L 1T0ZA 5BPMA 3E9OA 4RG8A 1JLCA 2W40A 3FGUA 4OKJA 1NJZA 1NE5A 4X62K 4BEBA 4CJRA 3OYHA 4CD1A 4PY5A 3TTFA 1I39A 1XHXA 2P9KA 4QAGA 2UUCK 3HJFA 2Q97A 4IG0A 2KZMA 2A5XA 2P9KB 4KHPK 1UWBA 2GMOA 4E1JA 3BF3A 3L2QA 4RW9A 1YJ9N 3O6WA 4CJ4A 5AJ3K 3LDQA 4BR4A 4FWOA 4CF2A 2BUPA 3LDLA 4DV2K 3AVHA 3VEOA 1L3TA 3WXKA 4FJHA 2VWBA 3ALYA 4ELVA 1L5UA 3WXMB 1RGIA 1LWEA 1YUWA 3OHRA 3VA3A 1ASVA 4GVEA 1JCEA 4JI8K 4BRGA 3BDPA 4FJXA 2H3GX 4J2BA 3NE6A 4BRHA 4J2AA 1D9FA 3IS9A 3MX2A 5JVGL 2HBMA 4UAEF 2E2FA 3O4WA 3SUPA 4JKHA 5ELZA 3HSTB 5AQHA 3RVCA 1BCOA 2HHIA 1LQIA 1GPSA 4AQYK 4FJJA 1RDDA 1WUAA 1S5JA 5C25A 4KYPA 2KTQA 4C23A 2M8BB 1HYVA 3NAEA 1YJNN 1HUXA 3CQ8A 4E7LA 2BTFA 4NYFA 3L0QA 2P5GA 1Z26A 4LH4A 3CIPA 3D0PA 1ICAA 4CJSA 3IFRA 3HOSA 4DV0K 1ZXOA 2IC3A 3I33A 4H0OA 4BWJA 1ASWA 3VEVA 1LOTB 1TKTA 4ELUA 3QI7A 1NOYA 4BE2A 1Q86O 3Q7BA 1MA9B 1SL0A 3TI0A 2G8FA 4FWPA 2HVHA 4H0XB 1C0GA 2P9LA 4O8KA 1XMQK 2Q1NA 4CK1A 1HYZA 1DEJA 4FM0A 2QTDA 4FZZA 2P9LB 5HRPA 1DQ7A 1OH8A 4M63C 4CEZA 1S72N 1HJRA 1CZBA 3VQ6A 4H5RA 2KHOA 1VQ7N 3FFIA 2UU9K 1FKPA 1VNAA 1GLCG 1VHXA 2KBJA 3QEVA 1T7EA 5AQLA 2K35A 1Q82O 1OH7A 3G0ZA 4JKAA 2HBKA 4KFBA 5E84A 1NPIA 3VQ4A 2P9IA 1VQ9N 1TK8A 2UXCK 1HLUA 3P31A 2P9IB 2NRXA 3CW4A 4FO0A 5AZIA 3VQ5A 2KFNA 3ENHA 4JV5K 5AFUA 4AHCA 3CXCM 4DTXA 1Q8IA 2OTJN 2HHQA 5AZIB 3LDPA 1WSHA 4KHQA 1QZ6A 4GW6A 3OYNA 4CZIA 5AQJA 3L8BA 4CF1A 4FJIA 1D4XA 5EY4A 1RTJA 4KPYA 4CGJA 3ZSQA 1WSGA 1V4SA 3AA5X 1T05A 3WNFA 4A5BA 4IOXA 2PBDA 2YHXA 2QWNA 1NLVA 5F0XA 4NB4A 2QW9A 5HOOA 3KP0A 2FF3B 4JN4A 4BQZA 4KKOA 1EX4A 4OO1J 2C1GA 2ZWHA 3CC2N 3DLRA 3IKMA 4JNEA 5BRHA 3QESA 4CZGA 3J7YP 1P0AA 4DSFA 2G8IA 4CQKA 2HHXA 2HNZA 2X6SA 1WMTA 4PWDA 4FJ5A 3I8DA 2F96A 4JI6K 2D0PA 1VNBA 3CI5A 4B9UA 1JZAA 1JXBA 5AQMA 1RTHA 2KLAA 4CJVA 2E88A 1IH7A 3DOLA 4BC3A 4YDUC 4DLEA 2QWOA 3S9HA 1JJ2M 2BH1A 5DK5A 1G15A 1X3NA 4AILC 4LD0A 2XY7A 1QQCA 4LF4K 2IVNA 3D2EA 4DUYK 2BGGA 5CHIA 2UXBK 3ZT4A 4DU1A 3VQQA 4YNQA 1XRSB 3D2EB 3MXIA 4BR9A 3E01A 3A8YA 3DXKA 3ZX2A 4UQGA 2E2QA 2Q31A 3DXKB 4CBWA 4EZ6A 1VQ6N 3HVTA 2AP1A 1U48A 1NJIO 1YJWN 3SZ2A 1KVCA 5F2RA 4BGBA 3V9SA 1WN7A 1ZBIA 2WBNA 2QWRA 4CE9A 1CHZA 2BANA 3QERA 1GOBA 4FLYA 1Q7YO 1RBSA 1IKVA 1KFSA 4HCBA 4B8AB 1HPMA 4CJLA 1QS4A 4FK0A 1KLMA 4Q0BA 4BR0A 4JI7K 4XIUA 4CJEA 1S6PA 4CHZA 3TR8A 3CG7A 1BCGA 4B3RK 3VTIA 1SAZA 2E20A 2Q2RA 3EN9A 4FJ7A 3BGRA 1BGXT 5CZ1A 4B1VA 2ZQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1D8Y A;  5C15 A;  1B7D A;  3CJB A;  3M6G A;  3VES A;  4I2Q A;  3I0S A;  5AQO A;  3PUF A;  1RT6 A;  2NY9 X;  2XHB A;  4OGC A;  4M42 A;  4M7X A;  2E3F A;  3AVA A;  3L2R A;  2YV0 X;  1ZBU A;  4QOZ B;  3DLE A;  5JS2 A;  2W42 A;  1BIS A;  1PTX A;  2A42 A;  1ZYW A;  2D0O A;  4W5Q A;  4LFC K;  4DR4 K;  3GBT A;  2A40 A;  2QEX N;  4IWV A;  2IVO A;  2E2O A;  2FLO A;  3VGL A;  3V9U A;  3NGI A;  1S1U A;  2X78 A;  1KVB A;  3ENO A;  3T19 A;  1U47 A;  4PL8 A;  3C0B A;  4KV8 A;  3DWL A;  3ZSX A;  3L6Q A;  2I61 A;  2A7T A;  4PKH A;  2ASM A;  3H1Q A;  2GUP A;  5HRS A;  4CF0 A;  4YDU A;  4FLU A;  2KBH A;  4B9L A;  4W5N A;  1B9D A;  5JEN A;  3V9Z A;  1NMD A;  3VQ9 A;  1TV6 A;  5JMV A;  2OZM A;  4CFD A;  4H03 B;  4B9N A;  4IDK A;  5AQG A;  3DI6 A;  5GIP A;  4AB0 A;  3CCS N;  2QXL A;  4DQR A;  3HSC A;  1QZ5 A;  2GX9 A;  3DLG A;  1C0U A;  1TKZ A;  3WNE A;  2Z1H A;  4F2S A;  1YXQ A;  3JAM O;  4RWT A;  1C6V A;  4I9L A;  4CEE A;  2OTL N;  3V1O A;  3THY A;  4LF8 K;  4RW6 A;  4B08 A;  4WQ4 C;  3THY B;  3W0L A;  1QQN A; 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