3UKRB

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
193
structure length
193
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 54
structure length 193
sequence length 193
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrB02
1MDUB 1GLAG 4H5TA 1T44A 5BRFA 5FPDA 3ENHA 4PKGA 3VGKA 3L6QA 3CI5A 4NB4A 2UYTA 3S41A 3SMPA 4JN4A 1E4FT 4CI6A 3RSEB 2D0OA 1YAGA 4RCHA 3ZEUA 3VEOA 4EFHA 1CZAN 1J6ZA 4BRFA 3A5OC 3LDNA 2YCHA 3H6EA 4EHUA 1YXQA 2P9UA 3QDKA 3ULEB 3VOVA 3F9MA 3D2FA 5AQLA 1S22A 1U2VA 3H45C 5AQZA 5AQSA 3FZKA 2QW9A 3WEEB 4F9OA 3O80A 3HM8A 2P9NB 4WQ4C 3IFRA 5B8HA 1ESVA 1RDWX 5LJWA 3IMXA 3UB5A 4FO0A 1NLVA 1K8KB 3GOIA 1BWFO 3SK3A 5AQHA 5AZIB 1HKBA 5JLFA 4O5FA 2E8AA 4ISGA 4MLHA 1YUWA 1KAZA 1Z05A 5ADXH 3GE1A 5LJVA 1ZXOA 3U8XA 3CJ9A 2ZF5O 4QS7A 3BF1A 4CBUA 3BEXA 2AA4A 1X9JA 1HLUA 2ASOA 2QM1A 3C7NB 3KZBA 3O1WA 3R9PA 3KVGA 3DAWA 3DXKB 4BG9A 4CZFA 2YI1A 4QS9A 3FZLA 5F1XA 3A5MC 4B1WB 1JCFA 2ZWHA 4BRCA 4XH4A 2Q36A 4YDUC 4A2BA 5KPTA 5FPMA 2GUPA 1NGFA 2QXLA 3MMVA 2Q97A 3AAQA 4CZLA 3WQTA 2WUSA 1QQNA 4CZGA 1QZ6A 3EZWA 2A5XA 1LOTB 2D4WA 3DJCA 3A0IX 2OANA 4B1ZA 4BR9A 2P9PB 3L4IA 5BPLA 5EOYA 3WQUA 5AQYA 4KBOA 5AQTA 4RTFD 1DGKN 4WQ5C 1NGDA 4FSVA 3VETA 4DQ8A 1GLEG 1C0FA 2QWMA 2E1YA 2QWLA 3JXUA 4FOEA 4FWSA 4IJNA 4I6MB 3VEVA 2PBDA 3QB0A 3LDOA 4JHDB 3CETA 4BR0A 3LDLA 5BN9A 3CIPA 2EWSA 2V52B 2D1KA 2P9SA 4JD2A 4XEIA 3CJ1A 1GLJO 3FGUA 2E88A 4PKHA 2W41A 2P9KB 3U4LA 4MLEA 4CBXA 3IUCA 2YJFA 3CJBA 4H5NA 4BRLA 1XC3A 4IWVA 3H1VX 4GY2B 4PL7A 4JAXA 4HWIA 1KXPA 2GWKA 2V7ZA 3W3DA 4CZMA 4XH5A 1HUXA 4IJAA 3MN7A 3RSEA 5E84A 3H3OB 1TUYA 5BR9A 4RWTA 3UKRB 1ZBSA 2V51B 5F0XA 3GBTA 3ULEA 4CZKA 3FLCO 4ISEA 4J8FA 4BRMA 4BVPA 4Z94A 4BGBA 3O6WA 3WUHA 4FWKA 3O5BA 3ZX0A 3WEEA 1BOTO 5AQJA 2FF3B 1S3XA 2P9NA 3J8AA 2F9TA 4YDUA 1JCEA 4FWOA 3ZETB 2A40A 3VGMA 2QWQA 4IO8A 1K8KA 3AAPA 4A2AA 4CZEA 1BO5O 1IJJA 3DWLA 1NGHA 4Y0WA 4A62A 2NZTA 3WXJA 1BG3A 3D2EB 2IVPA 2ASPA 4M7XA 4BRIA 1V4TA 3GL1A 4B1UB 2IVOA 3WXIA 3VENA 4B1YB 4BROA 3ID8A 1U2VB 3WT0A 4WQ5A 4BR7A 4H0YB 5KQ8A 4K41A 4FPAA 1DKGD 2VYPA 1JCGA 3C7NA 3ATUA 4H5WA 3HZ6A 4CD1A 4QS8A 5AZJB 1WUAA 4L3QA 3B8AX 3G25A 3O1BA 1TUUA 2HOEA 1QZ5A 2ASMA 4JNEA 4CBWA 4BRDA 2FSNA 3U9DA 2E2QA 2GELA 5AFUA 2P9IB 4MO5A 3FZMA 2FXUA 2W40A 3CQXA 5EX5A 3A5LC 1KAYA 5FPNA 3BP8A 5AR0A 2FSKA 2BTFA 1MA9B 3QFUA 2NRHA 5LY3A 3A5NC 4FWPA 1QQMA 1NGEA 1H1VA 2FF6A 2Q0RA 3O08A 2P9PA 4O8KA 2Q1NA 1OKJA 5AQQA 3UKUB 4BR4A 2E20A 1G99A 4BR5A 1GLBG 5BPNA 1T6DA 3LDQA 4FWRA 3H3NO 4BC2A 3WXKA 3I33A 3R8EA 4BGAA 3DXMB 4JHDA 4EHTA 4BRPA 2ZGYA 3GDQA 3QICA 2P9LB 4GNIA 4K25A 3M3ZA 1P8ZA 1WOQA 3IDHA 2E2PA 3VF4A 3WXLA 1BA0A 3U9ZA 4IZ9A 4AM7A 3EO3A 2E2NA 2A3ZA 3MN5A 1HPMA 1ATNA 4H0VB 3HI0A 4EAHD 4H5VA 2D0PA 3VF2A 3KHYA 5AQMA 5AQNA 2CGLA 2CGJA 3MN6A 3FFKB 2P9KA 2Q2RA 4WYBA 5BN8A 4BRKA 2E1ZA 1BU6O 1GLDG 3EKSA 2PAVA 3QMLA 4BREA 3SMSA 5BREA 4M7YA 3FR0A 4FL9A 1HJOA 3MDQA 4BRGA 1GLFO 1NGAA 3R6MA 2QWRA 1C0GA 1Z6RA 3CERA 3HBTA 2QWPA 5JMVA 3O4WA 1T6CA 2QWNA 3D7EO 3JS6A 3OHRA 4PKIA 4XH1A 5AFUH 1TYQB 4DB3A 4CJ7A 1SQKA 5BRHA 1HKGA 2CH6A 4IXCA 3FZFA 2HMPA 4BRNA 4H03B 2A41A 4BQZA 1MWKA 2A6AA 4ISFA 2BUPA 3HTVA 2V7YA 3ZETA 3TU5A 1MWMA 2F9WA 3P4IA 2FLOA 4BRHA 4LC9B 5AQFA 3EN9A 2E2OA 5BPMA 4M63C 3CJ7A 3ZX3A 5AQRA 4B9QA 4EIAA 5AQXA 3QBWA 5EVZA 1XUPO 5AZIA 3ZEUB 4BC4A 3VF6A 3D2EA 2GTDA 3BUZB 5ELZA 1ZC6A 3C0BA 3CHWA 5AQUA 5TKYA 3BF3A 2P9UB 1QQOA 1BA1A 4H0XB 3D2FB 3EL2A 3FE1A 1NM1A 1SZ2A 5BRDA 3LM9A 1DEJA 3L0QA 5AZJA 3AY9A 4NO7A 4BC3A 4MO4A 2IVNA 3DXKA 4H0TB 4AM6A 2H3GX 2CH5A 4FWQA 3VEYA 2VCPA 2DPNA 5AQKA 3M6GA 3VEXA 3VEZA 4DCHA 1Q18A 3UE5A 3A8YA 2P9IA 2KHOA 3VGLA 4CZIA 1V4SA 1QHAA 3O8MA 4CZJA 5AQVA 3LDPA 4FWNA 5KPZA 4CZHA 2A42A 3LL3A 2ITMA 2GEMA 4B1VA 3VESA 2YHYA 1KAXA 2YJEA 3CJCA 3AARA 4FPBA 3CQYA 3HSCA 3UKUA 4BRAA 3H1QA 1NGGA 5AQWA 1ATRA 3MK6A 5KQDA 5CE3A 3EKUA 3W0LA 1RFQA 4DHYA 5JLHA 1EQYA 3DXMA 3VERA 4A61A 4I6MA 1E4GT 2YHWA 1NGBA 4H0PA 2P9LA 4FOIA 1NGIA 2J4RA 1HKCA 3SLCA 1NGCA 2FSJA 2NLXA 3ZX2A 1HX1A 3ATVA 5KPRA 4BC5A 2GWJA 4FWMA 1ATSA 4C23A 1NMDA 1R59O 5EY4A 3VEWA 5EXWA 3QBXA 3M1FA 1NWKA 4HTLA 4K43A 4BVOA 1U6ZA 3I8BA 4B1XB 4BG8A 4CD3A 1RGIA 2ZGZA 2VWBA 4K42A 3H46O 3LM2A 5ADXA 2AP1A 1YVNA 3FZHA 4H0OA 4BQLA 4H5RA 2IIRA 1X3MA 1BUPA 4BR2A 5I9EB 3MCPA 5E26A 1D4XA 1X3NA 2QWOA 1LCUA 1GLLO 2P9SB 4JD2B 1GLCG 5AQPA 1SAZA 3VPZA 1IG8A 5F2RA 3CJAA 5AQIA 2Q0UA 4BRQA 5JICA 2CGKA 4WQ4A 1Y64A 2HF4A 1TYQA 3UKRA 3ENOA 3GG4A 4FWLA 5AQGA 4E1JA 1BDGA 1NBWA 2Q31A 2I7PA 3MN9A 4PL8A 2YHXA 3SJHA 3TPQA 5FPEA 2HF3A 5AQOA 1NGJA 3QFPA 2I7NA 1XQSC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLAG 4FJKA 2B5JA 5HLFA 2ETJA 1OH8A 4LFCK 3CPEA 1C1BA 3RSEB 3VEOA 3L2VA 3TARA 3VQQA 1RT3A 4CJRA 3AVIA 1T03A 1YXQA 3ULEB 4B9MA 1Q9YA 1IBLK 5AQLA 5AQZA 3SUQA 3FFIA 3FZKA 4CJVA 1ASUA 4YFUA 4M3UA 2QKBA 3IFRA 4NYFA 1ESVA 3OS0A 5LJWA 3UB5A 2VGMA 4DF8A 1IKXA 3RTVA 1CZBA 2QA4N 3BGRA 4O4GA 4JI7K 4ISGA 1VSLA 1KAZA 1Z05A 1WSIA 2GUIA 1RNHA 1HR0K 5MLCQ 1O1WA 3MX5A 3CJ9A 2UU9K 4WFAL 3LP1A 4I9QA 4LF4K 4CBUA 1X9JA 3MX2A 3R9PA 1WSJA 3KVGA 4JKEA 3JAMO 3OYIA 4DR6K 2YI1A 4QS9A 1WSEA 5F1XA 1UA0A 5M1FA 2W6KA 4KFBA 2Q36A 3V81A 2BGGA 4BE0A 3K2PA 1RTDA 1OVYA 4DQRA 3K5OA 4CZLA 1QZ6A 3J7YP 1P90A 3A0IX 2OANA 5LL6Z 4CECA 5KRTA 4RW9A 4OX9K 5GINA 1WNSA 3K5NA 4FLZA 4WQ5C 3KLIA 3G0ZA 3TR8A 1C0FA 5HRRA 2QWLA 1S1TA 4FWSA 4JKGA 4I6MB 5J1EA 3U3GA 3LDOA 4XIUA 1A5XA 3QO9A 2RF2A 3OVNA 3CIPA 4Z0UA 1SKRA 3C95A 4TSXA 3V9ZA 2OPPA 2V52B 4JD2A 3NF7A 3J7AP 4DFMA 3NMUA 4FJ7A 1SL2A 4XEIA 3CJ1A 3NE6A 3V6DA 3DRSA 4NLBA 2Q3SA 3MWTA 3IKMA 2W41A 1HQEA 5FRMA 2W00A 3IUCA 1TK5A 3HYFA 2YJFA 4BRLA 3DLLL 2IOCA 4IWVA 3H1VX 4GY2B 3LWMA 2Y1JA 3VQ4A 2HBJA 4HWIA 1W7AA 4Z4FA 2V7ZA 2G8IA 4FM2A 2O8CA 4XH5A 1HUXA 4BACA 5HBMA 2OTJN 4ZTFA 1L3TA 4GV3A 5BR9A 4RWTA 3HVTA 4ISEA 4CEQA 4J8FA 4Z4EA 4DQPA 1C0MA 3WEEA 1C6VA 3ZSYA 2DFEA 2F9TA 1JCEA 4ID1A 3ZETB 1N6QA 4G1QA 2KW4A 3NH0A 3AVGA 4IOXA 4Y0WA 4GV6A 1KFSA 3J81O 1Q82O 2Z1GA 5DMRA 4O55A 4B1UB 2IVOA 4K8XA 3THXA 4DTNA 2UXBK 4X66K 3ATUA 3HZ6A 4CD1A 4Z4GA 1WUAA 4L3QA 1RDBA 3LP3A 4M3WA 2HOEA 1QZ5A 2E6LA 3TAMA 4CJPA 4A59A 4L8RB 4YOYA 2GELA 1A5WA 2HHSA 2VG6A 2W40A 3A5LC 3BZKA 5FPNA 5T7BA 4CW7B 2HHVA 5KRSA 3L4QA 4CIGA 3OS1A 4BE2A 3A5NC 4W5RA 4DR5K 4MDAA 1QQMA 1NGEA 4JS5A 4O8KA 4CHZA 1CZ9A 4F4KA 1C0UA 3DOLA 2FC0A 2E20A 4CHPA 1K6YA 4Y1DA 1G99A 4HVJA 3O9SA 4C8NA 4E7JA 2KFZA 1T6DA 4J2DA 3MEDA 3I33A 3DXMB 4FXDA 4JHDA 4EHTA 3THWB 3P31A 1J9AA 2ZGYA 1P8ZA 1TVRA 3OTOK 5J2MA 3G6EN 4F3TA 2E2NA 4H0VB 4C8LA 2D0PA 3LAMA 3EE9A 3M8QA 5AQMA 5AJ3K 4JEPA 5AQNA 2CGLA 3MN6A 1RDUA 2P9KA 3ZT4A 1UA1A 4WYBA 5BN8A 3NF6A 1GLDG 3QMLA 2PAVA 4CGDA 4CEZA 4FJGA 3SMSA 4NCGA 3FR0A 2G8UA 1HJOA 3ASMA 3DLGA 5C42A 3AO1A 2QWPA 5JMVA 1BIUA 3O4WA 3ZYYX 4CIFA 3D7EO 2ZE2A 3VA0A 1TYQB 4DB3A 4JK8A 1HNXK 5HROA 3MXIA 1QVGM 2CH6A 3E1YA 4DV2K 1U48A 4BRNA 4H03B 3MXJA 2A41A 4BQZA 4U7BA 1YI2N 2YNGA 3OBWA 4FLWA 4ISFA 2YHBA 3DMJA 5CYMA 3HOTA 2V7YA 4KHUA 3TU5A 2O8EB 2O8CB 1KVAA 3OYFA 4BRHA 4LF6K 1VQ8N 4AHCA 3NCIA 2KQ2A 2XRIA 3EN9A 3ZX3A 3OYHA 3ZEUB 5AZIA 3AGKA 3D2EA 4EP5A 2PY5A 5TKYA 3BF3A 5CZ2A 1BA1A 3D2FB 3CCUN 2QEXN 4FLVA 3IS9A 5AZJA 4N56A 3AY9A 1JXBA 3HO1A 4BC3A 5CYQA 1J54A 2CH5A 2H3GX 3CCEN 3VEYA 5LMUK 3ZLJA 2WOMA 2VCPA 3PIPL 4IG3A 5AQKA 4DCHA 4FJHA 4CZIA 3TWHA 3RRHA 1QE1A 1QHAA 3D45A 1XHXA 3O8MA 4GVEA 5AQVA 4AHTA 3KK2A 2A42A 1IKYA 1JKHA 4B1VA 1KAXA 1HMVA 3HSCA 2QKKA 1GOCA 4KH6A 4PUOA 4DS5A 4I9LA 4DR2K 1VQNN 4H4MA 3EKUA 5LMNK 4DHYA 5CHIA 1EQYA 1K8AO 1IKWA 2YHWA 1KD1O 2P9LA 4E7LA 1NGIA 2J4RA 3ITHA 3ZX2A 4DU3A 3OYGA 2KTQA 4X62K 2GWJA 3HPHA 4GMJB 3KK3A 4OLAA 1I3AA 1RBTA 4YORA 1S1VA 1ATSA 3O9TA 3TTDA 3C6UA 5EY4A 5FROA 4BVOA 3CCLN 1NWKA 4IKFA 4CD3A 4FZXC 3I8BA 4DTJA 4K42A 2OYQA 1BI4A 2AP1A 4H0OA 2HHTA 4H5RA 3IAYA 3VQAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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