3UKRB

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
193
structure length
193
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
total genus 54
structure length 193
sequence length 193
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrB02
3I8BA 4H0OA 5AQYA 2E1YA 5FPMA 1RFQA 4H5RA 1NGCA 2YHXA 3FZMA 3GBTA 2WUSA 2NRHA 3O8MA 4CZFA 2P9KB 3H3NO 3EO3A 3WXKA 2D0OA 5AQWA 3QDKA 1GLAG 4M63C 3FE1A 1GLJO 2E2PA 4CBXA 2E1ZA 1BG3A 1JCFA 4ISEA 4BRHA 1X3NA 1U2VA 2D1KA 4BGBA 4BR5A 2P9SB 3CIPA 2YHWA 1V4TA 1MWMA 3CJAA 1CZAN 2FF6A 3JS6A 2CGJA 5AQMA 2NLXA 3DXKB 4O5FA 2QWLA 3KZBA 2ZGYA 5JMVA 2P9UB 4A2BA 5F2RA 2QWRA 4BC5A 2PBDA 2HMPA 2P9IB 4FWLA 4PL8A 1YVNA 3H1VX 3LDNA 5F1XA 4H0XB 4CZGA 5B8HA 3VEOA 2YJEA 1NM1A 4ISGA 4PKGA 1GLLO 2VYPA 3UKUA 5AQZA 1BA0A 4FOIA 4PKIA 4FWNA 3FZHA 5BPLA 1ATRA 3GDQA 2A5XA 3KHYA 2P9NB 3O5BA 4RTFD 3ULEA 3WXIA 2FF3B 4NB4A 3SK3A 3FR0A 3U9DA 1QQNA 3C0BA 3G25A 2KHOA 4H0YB 3MCPA 3RSEA 2AA4A 5FPDA 5FPNA 4EFHA 5LJVA 3VESA 1NLVA 1SAZA 4BR9A 4GY2B 5ADXH 3A5LC 3QFPA 3WUHA 2ASOA 1TYQA 1ATSA 3D2FB 2E2OA 2W41A 3ZX2A 5ADXA 4RCHA 4CZJA 3VGMA 5TKYA 3J8AA 4B1VA 2ASPA 1BWFO 4IZ9A 4BRKA 4BQZA 1MWKA 2CGKA 3WXLA 5AR0A 1GLDG 3B8AX 4FSVA 3ZEUB 2P9UA 1JCEA 1YXQA 1Q18A 4NO7A 2YI1A 3R6MA 2I7PA 1IG8A 1EQYA 3A0IX 4I6MA 4BC4A 1KAZA 4Y0WA 4WQ5C 3CJ7A 4CZHA 3EKSA 2IVPA 4FPAA 5BN9A 1XUPO 3OHRA 4B1YB 4B1WB 4JAXA 1NMDA 1BOTO 3ATUA 2BTFA 1WOQA 1LOTB 5JICA 3CJBA 5BRHA 5LJWA 1HUXA 5KPTA 3H6EA 5AQNA 3HZ6A 3SMSA 1HX1A 3HI0A 1P8ZA 4BRCA 2VWBA 2A3ZA 4XH4A 4BRFA 5BPNA 3W0LA 1HJOA 3AARA 2QWPA 4QS8A 3L4IA 2IIRA 2GWJA 3GL1A 1NBWA 4J8FA 2P9PA 1BUPA 3DXMB 3HM8A 3M1FA 3VEVA 4IXCA 5BREA 1ZBSA 2IVOA 2W40A 3ENOA 3HSCA 3LM2A 4JHDA 5CE3A 1ESVA 4QS7A 3SJHA 2GELA 3QB0A 1QQOA 3WEEB 1ZXOA 1C0GA 5EX5A 1NGFA 4K43A 2ZF5O 2IVNA 3ZEUA 2ASMA 1GLBG 3L0QA 1DEJA 5AQUA 3AAPA 4CZLA 5EY4A 3WQUA 1IJJA 5AQOA 5JLHA 5EXWA 2QXLA 4BR0A 2BUPA 4H5NA 4LC9B 3MN7A 3HBTA 3UKRA 4PKHA 3CQXA 1G99A 2E20A 5AQVA 2I7NA 2A6AA 4JD2B 3VEYA 3LDLA 5KQDA 2Q0RA 4B9QA 1T44A 5BRFA 3IFRA 4FPBA 2OANA 3ZETA 2E2QA 3H46O 3CHWA 3VENA 5AZJB 2E8AA 4CBUA 3LDOA 4BRQA 5AQPA 4QS9A 3D2EA 2FSKA 3DWLA 3IMXA 3VETA 3C7NA 3BEXA 4CI6A 3WT0A 1Z05A 3H45C 1R59O 4IO8A 4L3QA 4IJAA 4BR7A 3ATVA 2CGLA 4JNEA 1NGDA 2P9KA 1RDWX 4BRLA 3CJCA 5KPRA 4K25A 2FSNA 3VPZA 4EHTA 1J6ZA 3QICA 1QQMA 3DAWA 3LM9A 5ELZA 3WQTA 4HTLA 3GG4A 4DHYA 2V7ZA 3CJ1A 3EL2A 5AFUH 4KBOA 2P9SA 3M6GA 5BN8A 4DQ8A 1NGIA 2YJFA 4JN4A 4O8KA 5I9EB 1C0FA 2Q2RA 5AFUA 2HOEA 5EOYA 3DXKA 4JD2A 4H0VB 4M7YA 2GTDA 2FLOA 1BDGA 4FWMA 1K8KB 4YDUC 4A61A 2P9LB 5AQJA 3O6WA 4BG9A 2P9IA 1LCUA 1GLEG 2Q97A 5AQSA 3WXJA 4XEIA 4BREA 3FZLA 4CZMA 4MO5A 2V7YA 2YHYA 2E2NA 1E4GT 1RGIA 4WYBA 4FWRA 4BRDA 3CQYA 5BR9A 3FGUA 3VF4A 3SLCA 3QBWA 2A42A 1TUYA 3BF3A 2E88A 3VEXA 3CETA 2P9NA 2HF4A 3VEWA 4F9OA 1V4SA 3R8EA 1U2VB 5AQFA 2VCPA 1XQSC 1HPMA 1D4XA 3VGKA 4B1UB 3TPQA 1U6ZA 3UE5A 4K41A 1XC3A 3FFKB 4FWKA 5AQRA 4A2AA 4BRAA 4FO0A 2QWMA 3LDPA 4E1JA 1BU6O 1ZC6A 3O1BA 4FWPA 2ZGZA 4CZIA 5BPMA 2CH5A 3O1WA 3D2FA 5E26A 3ZX0A 4WQ4A 4AM7A 3M3ZA 3GOIA 2FSJA 1KAYA 2F9TA 1ATNA 2F9WA 4BROA 3LL3A 5KQ8A 1DKGD 4C23A 3MN5A 3UKUB 4CBWA 3GE1A 3P4IA 3F9MA 1QHAA 3ZX3A 2NZTA 1OKJA 3ULEB 1NGAA 5F0XA 4ISFA 4FWQA 4BR2A 3UB5A 4FWSA 4BRIA 3U8XA 3A5NC 3W3DA 3CI5A 3RSEB 2QWQA 2QWOA 3VOVA 2FXUA 4HWIA 3VF6A 2QM1A 2V51B 5FPEA 2ZWHA 4FL9A 5BRDA 3FZFA 3MK6A 4H5VA 1SZ2A 1TYQB 3VF2A 1TUUA 2Q0UA 3A8YA 3D7EO 4K42A 2D4WA 4H0TB 4AM6A 4EIAA 2CH6A 4BC2A 3IDHA 4CZKA 2Q1NA 4EHUA 1QZ5A 2AP1A 3MDQA 3QFUA 4GNIA 4BRNA 4BGAA 4CD3A 1NGBA 1JCGA 3DXMA 5KPZA 1KXPA 4H03B 3I33A 2PAVA 1X3MA 4I6MB 1E4FT 4FWOA 4BRMA 1BA1A 3WEEA 1HKBA 1GLFO 4BQLA 3VEZA 5AQHA 4DCHA 4MLEA 3MMVA 1WUAA 1S3XA 3O08A 3FLCO 4FOEA 3QBXA 3QMLA 1Z6RA 2EWSA 2A41A 3BF1A 3BP8A 1HKGA 5JLFA 3L6QA 3JXUA 1HLUA 2QWNA 3LDQA 3BUZB 5AQIA 4H5TA 1DGKN 3EKUA 1Y64A 2UYTA 3EZWA 2GUPA 4MO4A 4CJ7A 1MA9B 1T6CA 1S22A 4B1XB 3IUCA 4IJNA 2HF3A 4XH5A 3TU5A 2Q31A 5AZIB 1NGGA 2P9PB 1HKCA 3AY9A 2Q36A 3R9PA 1H1VA 5AQGA 3H3OB 2GEMA 2QW9A 4JHDB 4XH1A 5E84A 3SMPA 3AAQA 4A62A 4BG8A 2H3GX 5AZJA 1KAXA 2DPNA 1BO5O 3ID8A 3VGLA 2D0PA 5AQTA 5AQKA 4BRGA 1GLCG 3U4LA 3VERA 4Z94A 3MN6A 1X9JA 2GWKA 4EAHD 3KVGA 1NWKA 4WQ4C 4M7XA 3UKRB 4PL7A 3ENHA 1YAGA 3A5OC 4DB3A 1NGJA 3H1QA 1MDUB 1NGHA 2J4RA 5AQQA 3CJ9A 2ITMA 3O80A 3FZKA 4YDUA 3A5MC 3DJCA 4IWVA 3O4WA 3MN9A 4H5WA 4WQ5A 3CERA 4RWTA 1SQKA 1NGEA 3ZETB 5LY3A 2A40A 3EN9A 4BRPA 2YCHA 2V52B 3U9ZA 4B1ZA 1QZ6A 4CZEA 1YUWA 5AQLA 5EVZA 3HTVA 1K8KA 3S41A 1T6DA 5AQXA 4BVOA 2P9LA 3D2EB 5AZIA 4BC3A 3C7NB 4MLHA 4BR4A 4CD1A 4BVPA 4H0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F8RA 4Z4EA 4J2AA 2YHXA 1W2BM 3O8MA 2P9KB 2OPPA 3PLAA 3QEPA 3QDKA 4JS4A 4FK0A 3V1OA 3VQDA 4OPAA 2E1ZA 4BRHA 1U2VA 2A1RA 2O8BB 4BGBA 1DTQA 2P9SB 3CIPA 4OPKA 1V4TA 2GBZA 1HJRA 4AHUA 3KLEA 2CGJA 2NLXA 4Z4HA 3NGZA 4BY9C 1LW2A 2RHKA 2P9UB 4JKHA 1JLFA 3QEXA 1BI4A 2HMPA 1N33K 4KB1A 2HVHA 4DKWA 1Q82O 1YVNA 3KK7A 1VSDA 4H0XB 4B3MK 1YHQN 3NDKA 3MXMA 3AGRA 1G15A 1KRPA 3L3UA 4FW1A 2WFBA 1W9HA 3FZHA 3TSQA 2P9NB 4RTFD 4B3OA 2UXCK 2FF3B 1O1WA 4NB4A 3T3FA 4CF2A 3SAGA 4HUEA 4CHZA 3P83D 3PV8A 5FPDA 4JI4K 1XNQK 3HM9A 4F3TA 3C94A 5C15A 4BR9A 3HJFA 3DLEA 1ZYQA 1NNEA 3CCRN 2ASOA 5KI6A 3K5MA 3I0SA 3CQ8A 3UIQA 1NKBA 3DYAA 1QSLA 5ADXA 4F3OA 2HHUA 1DTTA 5TKYA 4IEIA 4B1VA 1WBDA 4IZ9A 1MWKA 2DFEA 4CGGA 1EQYA 4BC4A 4Y0WA 4WQ5C 4CZHA 5DM6L 3M8RA 3ZSYA 3I8DA 3MEDA 4B1YB 4OJRA 2YHBA 1TK0A 3IAYA 1KVAA 1WOQA 3T19A 4ELTA 4A5BA 5M1KA 3CJBA 1C0TA 3THVA 3THXA 5BRHA 3NH0A 3SMSA 1HX1A 4A59A 2OTLN 4LF4K 3DI6A 4BRCA 2VWBA 4WFAL 5K14A 3KLHA 3W0LA 3L3VA 1HJOA 4ILGB 4O55A 4FJ8A 2QWPA 5J2PA 4QS8A 2IIRA 2GWJA 2XO7A 3TSUA 3U3YA 2XY5A 4J8FA 4B9SA 1BUPA 3G71N 2YHAA 2IVOA 2W40A 4PQUA 1JL2A 2O4IA 2GELA 3AO5A 3MXIA 2IGIA 1ZBHA 3WEEB 2ATQA 5EX5A 4LFCK 1OH7A 1GLBG 1DEJA 5AQUA 1IJJA 1YTUA 2KTQA 5EXWA 2BUPA 3KD1E 4H5NA 4LC9B 2I5JA 3MN7A 3LZJA 1NJXA 3LZIA 1RTJA 3QESA 5AQVA 1B9FA 4WFNL 5KQDA 2Q0RA 5M1NA 1VQ6N 1ASWA 1C1CA 5BRFA 3M8QA 4FPBA 2OANA 4LD0A 4FYDA 4FLUA 1YTAA 3ZETA 3S5TA 3H46O 3L4QA 4ILHA 2DFFA 2GX9A 4CECA 3WNEA 3DWLA 2D0CA 3KLGA 4FJKA 3AO1A 4RW7A 3ZT1A 5CHIA 4BR7A 1NGDA 4PA1A 4DS5A 2P9KA 4BRLA 1J54A 5GIOA 5KPRA 2IOCA 1KLNA 4K25A 4X62K 2HHSA 3VPZA 3RMDA 2BANA 1Q81O 1WAFA 3DOLA 3DAWA 4IFVA 1TK5A 4JEPA 3PX6A 3T1AA 3QLHA 1RDUA 5AFUH 2O8BA 3TARA 1OVQA 2P9SA 1NGIA 2YJFA 4JN4A 3HL8A 4O8KA 5I9EB 1C0FA 2HOEA 4O8UA 4C8NA 4H0VB 5H1SQ 3JYTA 1BDGA 3O9TA 3AVLA 1S72N 3P5JA 4I2QA 4DF4A 3G10A 1WB9A 1NMNA 4BG9A 2NRVA 2Q97A 3ZYYX 4XEIA 1A5WA 4CZMA 4Z4IA 2V7YA 3R1XA 2F8TA 1P90A 4WYBA 1FKPA 5JENA 4M45A 1S1WA 2JWLA 3VMFB 1RCHA 5BR9A 1KVCA 3KJVA 1O13A 1VSKA 4CGJA 3SLCA 1U4BA 2NRTA 5HOOA 4C8OA 2W42A 1OH8A 4CJSA 2P9NA 2HF4A 1V4SA 4Y1DA 5AQFA 4AHCA 1XC9A 3VGKA 5KRTA 1NK6A 4Q5VA 2QEXN 3LWMA 1D9DA 4NCAA 3FFKB 4FVUA 4CJ3A 4DTPA 3THYA 2IC3A 5GIPA 1QSYA 3KKRA 2ZGZA 3DM2A 4N47A 4CZIA 4CJEA 4JI3K 4NLCA 5E26A 1VQ7N 3EE8A 2FSJA 4FJJA 4EZ6A 1I3AA 3LL3A 4DTRA 2VG6A 3MN5A 3P1GA 4CERA 4CBWA 2UXDK 3AA5X 2F7TA 3P4IA 3ZX3A 5KTQA 4BWMA 4WFBL 5F0XA 1SV5A 3OYLA 4ISFA 1QQCA 1JLCA 3RTVA 3ZLJA 2FBYA 3PSIA 3U8XA 3RRHA 1WBBA 1HQUA 4NXNK 3V9WA 5SWMA 4DU4A 1S9GA 1M90O 2QM1A 3RR8A 5M1QA 2ZWHA 4CVNE 3L8BA 3FZFA 1HQEA 2UUCK 3OBWA 3CCMN 4CHNA 4BACA 3VF2A 3SNNA 1FXXA 3DLGA 3D7EO 4K42A 2D4WA 3TAGA 2G8FA 2CH6A 5CZ1A 3J7AP 2Q1NA 4OGCA 4EHUA 1SKWA 4GNIA 4BGAA 3CCVN 5JS1A 4CD3A 2P5GA 1JCGA 5KPZA 3IS9A 1KXPA 2PAVA 1HR0K 3LP3A 4I6MB 3KTQA 1T05A 4ZTFA 3E9OA 3V9XA 1U04A 3BZKA 3WEEA 1HKBA 4BQLA 4DCHA 3O08A 3QBXA 3QMLA 3BF1A 4MQ3A 1NKEA 3I55N 2P51A 4DTJA 2OZMA 1N5YA 1Q86O 4Z0UA 4FCYA 5BR8K 2O8DA 5D3GA 3QIPA 1CZBA 4FK4A 4B1XB 3IUCA 5HRRA 2PZSA 4XH5A 1XHZA 3LDSA 2P9PB 1JLGA 3AY9A 3H3OB 2QW9A 2OCEA 1Z25A 1BO5O 3OW2M 5AQKA 1DLOA 4BRGA 4FJ7A 3K9JA 3VERA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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