3JS6A

Crystal structure of apo psk41 parm protein
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
342
structure length
321
Chain Sequence
b'SNVYVMALDFGNGFVKGKINDEKFVIPSRIGRKTNENNQLKGFVDNKLDVSEFIINGNNDEVLLFGNDLDKTTNTGKDTASTNDRYDIKSFKDLVECSIGLLAREVPEEVVNVVIATGMPSNEIGTDKQAKFEKLLNKSRLIEIDGIAKTINVKGVKIVAQPMGTLLDLNMENGKVFKAFTEGKYSVLDFGSGTTIIDTYQNMKRVEEESFVINKGTIDFYKRIASHVSTPRMIEKGLEFKDEFYKEQDSLIEEVMSNFEITVGNINSIDRIIVTGGGANIHFDSLSHYYSDVFEKADDSQFSNVRGYEKLGELLKNKVEQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Uncharacterized ParM protein
publication title Structure and filament dynamics of the pSK41 actin-like ParM protein: implications for plasmid DNA segregation.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Unknown function
total genus 98
structure length 321
sequence length 342
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3js6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3js6A01
4K25A 4GY2B 3IUCA 2AA4A 4BR9A 3AARA 2E8AA 1XQSC 4C23A 4BRLA 1GLBG 4CZFA 1TYQA 1ZXOA 1NGJA 3WXKA 5LY3A 2H3GX 2P9SA 1KAYA 1TUYA 2IIRA 4H0OA 3M1FA 1X3MA 2YJFA 3J8AA 4BROA 1HPMA 2QWNA 1NWKA 4B1YB 1Z6RA 5AQPA 4B9QA 4EHTA 1YXQA 3UKRB 1MA9B 3EL2A 5AQKA 1J6ZA 4Z94A 3VEYA 4BRDA 1U2VA 4BQLA 2CH5A 3WXIA 4BRIA 2ASOA 5ADXH 1MWMA 4B1XB 4BG9A 3ATVA 1NMDA 2YI1A 3H6EA 2EWSA 4H5TA 2ASMA 4FWQA 3FFKB 2P9UB 4AM6A 5AQVA 5I9EB 3A5OC 1NGIA 2F9WA 3D2EA 4CD3A 1RFQA 3FR0A 5E84A 2P9LA 5AQZA 4MLHA 1MWKA 2HMPA 2P9IB 3ZX2A 5AQTA 1ATNA 4B1WB 2VYPA 4LC9B 1BOTO 1NGEA 5KPRA 2FF6A 4EIAA 3ZEUA 3AAPA 5F2RA 4BG8A 3MCPA 5KPZA 2D0PA 3U9DA 2V7ZA 3FZHA 3QICA 1TYQB 3H1VX 2E1ZA 3M6GA 4JAXA 3VETA 3LDQA 3QMLA 1T6DA 1K8KB 1X9JA 3O8MA 4FWMA 3VGKA 5JICA 2P9SB 3AY9A 3GOIA 3O6WA 1XUPO 3CJBA 4JHDA 4A2AA 3CJCA 3EZWA 1GLFO 4BR2A 3DJCA 3VGMA 4BC3A 1MDUB 5AZIA 3CJAA 4JNEA 1NGGA 5EXWA 1ATSA 4M63C 3UE5A 4BQZA 1NGAA 4HWIA 4H5RA 3FZLA 4A62A 3O4WA 3ENOA 2VCPA 4H0VB 1NGHA 4FL9A 2Q36A 3GDQA 3I33A 4Y0WA 4CI6A 3BP8A 4IWVA 2V52B 2HF4A 1P8ZA 2KHOA 2WUSA 1CZAN 3D2EB 3HM8A 3DWLA 5KQ8A 4JD2A 1QHAA 4CD1A 2YHXA 4BVPA 4DHYA 2P9LB 1ZBSA 1ZC6A 3R8EA 3H3NO 5AQMA 3LDPA 3RSEB 3U4LA 5BRFA 3A5MC 3WQUA 2E88A 3BUZB 4QS8A 2I7NA 1C0FA 4H5WA 5TKYA 1LOTB 1HX1A 3A5NC 3CHWA 4IJAA 2D0OA 1SQKA 5AQGA 3HSCA 4QS7A 2QWRA 5AFUA 1X3NA 4JHDB 2HOEA 4BRMA 4IJNA 5AQJA 3KHYA 1GLCG 3CJ1A 3EN9A 5AZIB 3VESA 3I8BA 5EVZA 4BRGA 3CERA 4FPAA 2Q1NA 3HBTA 4CBUA 4DCHA 2OANA 1G99A 3DXMB 1GLLO 1HLUA 2YHWA 1NLVA 3TU5A 2DPNA 4MLEA 1YUWA 1JCEA 4XH1A 1BG3A 4XH4A 4IXCA 5AQUA 2Q0UA 3UKUA 2ITMA 4QS9A 4CBWA 2E20A 3JS6A 2UYTA 5AQHA 5AZJA 4BR5A 1HKBA 3O5BA 4FWPA 2A40A 5AQOA 5JLFA 2QM1A 1RDWX 5AQIA 3OHRA 3VENA 3SJHA 4WQ5A 3D7EO 1NGFA 4JD2B 3VERA 1WUAA 3VEWA 5B8HA 3LM9A 4L3QA 1KXPA 4WYBA 3VF2A 3VF6A 4A2BA 5F0XA 5AQRA 3WEEA 1QZ5A 4CBXA 3ULEA 4DQ8A 2IVPA 4PL8A 3H46O 2P9NA 3CJ7A 2D1KA 1HKCA 1ESVA 2QWOA 4BC5A 1KAZA 3SK3A 3GL1A 2CGKA 1S3XA 5FPMA 4BC2A 4K41A 2QW9A 2P9KA 2GWKA 4H0TB 1TUUA 1Y64A 2W40A 4BRHA 3ATUA 3B8AX 1XC3A 1YAGA 2Q0RA 2PAVA 3VPZA 4BR0A 4CZMA 3LM2A 4AM7A 2A6AA 5CE3A 3DXKA 4H0PA 1BDGA 2QWQA 1H1VA 3QDKA 2A41A 3ZETA 3LL3A 5BRDA 1QQOA 5BPLA 3C7NA 2FSKA 1QZ6A 2FXUA 3CETA 2BTFA 5BRHA 3WXLA 5AQXA 1IJJA 1C0GA 1U2VB 2CH6A 3ENHA 4DB3A 4E1JA 2E2OA 2NRHA 4NO7A 3EKSA 4K42A 5AFUH 4KBOA 3VEXA 1EQYA 4IO8A 3MN6A 4BRNA 4B1VA 1BU6O 3O80A 3VEZA 4FOEA 2ZGYA 2FSNA 2P9PA 4GNIA 3DAWA 3FE1A 4RTFD 4H03B 3A0IX 3ULEB 1DKGD 4CZGA 2E2NA 4NB4A 3EKUA 4WQ4A 2P9NB 4BGAA 2QWMA 1R59O 3LDOA 3S41A 3GG4A 4CZKA 4B1ZA 3ZEUB 5BN9A 4M7XA 3U8XA 2P9KB 3VEVA 5BREA 2YCHA 3BF1A 5AQFA 3P4IA 4BR4A 4PKIA 4FPBA 3QBXA 2V51B 2BUPA 5AQYA 4FSVA 2PBDA 3SMPA 3BF3A 1Q18A 4H0XB 1BO5O 2NZTA 5AQNA 3VF4A 3QFUA 5EX5A 1WOQA 1JCFA 1S22A 3WXJA 4ISEA 5AQLA 3L6QA 3C7NB 2Q97A 2V7YA 4FOIA 1GLAG 3L0QA 2P9IA 4H5VA 3TPQA 1T6CA 1GLEG 1V4SA 4BRCA 4BRKA 5JMVA 4CZIA 4BGBA 1Z05A 4CZJA 2E2PA 2GTDA 2ASPA 1SAZA 1SZ2A 2NLXA 3FZMA 4B1UB 4H0YB 2IVOA 3WQTA 4RWTA 3KVGA 3GE1A 1GLDG 5AQQA 4WQ5C 2YJEA 1V4TA 2J4RA 3R9PA 5BPMA 3AAQA 2A5XA 2ZGZA 1K8KA 4FO0A 1GLJO 4I6MA 3CQXA 3O08A 3EO3A 2GELA 3H3OB 3MN7A 3QBWA 3IFRA 5AR0A 2P9PB 1DEJA 3GBTA 5FPEA 4JN4A 2VWBA 3JXUA 3ID8A 2ZF5O 1NGDA 1JCGA 2GWJA 3CJ9A 3FZFA 4PL7A 3H1QA 4BRQA 1HUXA 5FPDA 4HTLA 3KZBA 5LJWA 1HJOA 3MK6A 4FWKA 2ZWHA 1NBWA 1ATRA 1D4XA 2QWPA 1QQNA 4K43A 4CZLA 2QXLA 2FF3B 3SLCA 4CZHA 5AQSA 3C0BA 1BA0A 2GUPA 4BC4A 3WT0A 3W3DA 3D2FA 4ISFA 3VOVA 2A3ZA 2IVNA 3O1WA 3BEXA 3HZ6A 3UB5A 3SMSA 2I7PA 4PKHA 1DGKN 4BRPA 5EOYA 3MMVA 3MN5A 1QQMA 3F9MA 3RSEA 1RGIA 3CQYA 4FWRA 5E26A 3R6MA 4J8FA 4MO5A 4FWSA 2Q31A 3U9ZA 1E4FT 3L4IA 5F1XA 4BRAA 1KAXA 3UKUB 4O8KA 2A42A 5BN8A 4FWLA 3VEOA 3WUHA 5AZJB 1YVNA 2W41A 3IDHA 3IMXA 5ADXA 2CGLA 2F9TA 5BR9A 2E1YA 2QWLA 2GEMA 4M7YA 4YDUC 3ZX3A 4I6MB 3LDLA 3W0LA 2AP1A 1NGCA 2HF3A 5JLHA 4BVOA 3FLCO 1LCUA 4MO4A 4WQ4C 1T44A 3MDQA 4BREA 3DXMA 4PKGA 4YDUA 5FPNA 3G25A 2E2QA 4FWNA 3WEEB 3A5LC 3CIPA 5KPTA 5AQWA 3HTVA 3H45C 4CZEA 4EAHD 4F9OA 4RCHA 5KQDA 3CI5A 3ZX0A 3UKRA 1HKGA 1E4GT 4O5FA 3HI0A 1IG8A 1NGBA 3A8YA 4H5NA 4XEIA 3QB0A 4BR7A 4A61A 5EY4A 3LDNA 1BUPA 3D2FB 1BWFO 4IZ9A 4BRFA 3FZKA 2D4WA 2Q2RA 2FSJA 2CGJA 2P9UA 3QFPA 2YHYA 1BA1A 4EHUA 1OKJA 3O1BA 1U6ZA 2FLOA 3DXKB 4CJ7A 3MN9A 3ZETB 3VGLA 3FGUA 5LJVA 4EFHA 1NM1A 4FWOA 5BPNA 3M3ZA 4XH5A 5ELZA 4ISGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLLL 1IKYA 2RE2A 3IUCA 4BR9A 3V9XA 1TYQA 3TSPA 4NXNK 1RBRA 1ZXOA 5CYMA 2ZM6K 2P9SA 3V9ZA 3VTIA 3OBYA 4H0OA 3LPUA 3V81A 4DV1K 2UXCK 1X3MA 3J8AA 1NOZA 4JEPA 2QWNA 5AQPA 3UKRB 4E1NA 4FLYA 1VSIA 4Z94A 1S1TA 4BRDA 4BQLA 4O44A 1EWQA 3SQ1A 4B08A 3NBPA 3THWB 4CCHA 2KFNA 1K6YA 1OVQA 1NK4A 4BG9A 4DTRA 1KLNA 2ASMA 3K5MA 4FWQA 3FFKB 3PSFA 2KLAA 2P9UB 4FZYA 1WN7A 2XY7A 4N47A 4CJFA 4O4GA 3A5OC 4QOZB 3OYKA 4OKJA 1NGIA 3T1HK 3CCJN 4GVMA 5JS1A 3CCUN 4DTNA 4E89A 3FR0A 2P9LA 4JKHA 4OGCA 4LH4A 1T7PA 3TAFA 5T7BA 4FLTA 3AAPA 4BG8A 4CJUA 5KPZA 4OKKA 2V7ZA 4CEBA 3FZHA 4CEFA 1TYQB 4X64K 3QEWA 3P38A 1T6DA 1K8KB 5M1QA 4JI4K 1YI2N 4FM0A 2P9SB 4CJRA 4EP5A 1D8YA 4A2AA 3EZWA 3KLHA 3HM9A 3RWUA 4BR2A 3WNEA 4G1QA 3DOKA 1D5AA 1A5VA 1MDUB 1XC9A 3JAMO 3HVTA 1ZBUA 4BQZA 3KD5E 4HWIA 2E6LA 4CK1A 2FBTA 3ENOA 1NGHA 3GDQA 4DWIA 1ITGA 3SZ2A 1JL2A 5J2PA 3BP8A 1DLOA 5DM6L 1P8ZA 3H08A 4DLGA 3M8SA 3CM5A 1QHAA 4CERA 3HVRA 4B3MK 2P9LB 4CJ3A 1ZBSA 1ZC6A 4B9UA 2X78A 4U67L 3RSEB 3AVGA 3BUZB 4H5WA 2HHVA 1YIJN 4CVNE 1HX1A 4CJTA 1L3UA 4LSNA 3C6HA 3LWMA 1BQMA 2QWRA 1L3VA 1K73O 2HOEA 3KKRA 4DTOA 4M3ZA 4M3YA 1VSHA 1WSIA 3QEPA 4CJWA 3SAHA 3E01A 4CHPA 3L2WA 1GLLO 2YHWA 2DPNA 1JCEA 1NJYA 4KPYA 4IXCA 2E20A 2VG6A 1EETA 1HYSA 2UYTA 1L5UA 2Z1GA 1NU0A 5JLFA 4CEZA 1RT4A 2O4GA 3OHRA 1FKPA 3SJHA 3L2QA 4LF6K 2R7YA 4LY7A 4KH4A 3VEWA 4R5PA 2PY5A 4WYBA 3VF2A 3VF6A 3CCMN 1QZ5A 3AVJA 4M45A 4NCAA 4CBXA 4FJ9A 3NGYA 2JWLA 3H46O 2WC9A 1HKCA 1N33K 2QWOA 3SCXA 1KAZA 3DLKA 3DLGA 3TSUA 4NYNA 4U7BA 3ID6A 2CGKA 1S1VA 1KLMA 4H0TB 4JK8A 4FXDA 1UA1A 2W40A 3ATUA 5GAEP 3CD6N 1YAGA 3K59A 1Q8IA 1X9MA 4M3RA 3LM2A 5HRNA 3M8QA 1BDGA 1ASVA 3ZETA 4KHNA 2FSKA 5C15A 1XNRK 4JS5A 1TGOA 1C0GA 1SKWA 3ENHA 3N4QA 1NJWA 2E2OA 3CCRN 3ZT1A 1M1KO 2NUBA 2HBMA 5KGWA 4X62K 4KBOA 3NVKA 5KTQA 3KK2A 2B4JA 4BRNA 1KCFA 3O80A 3RMBA 3VEZA 3I55N 1X9SA 1JL1A 2ZGYA 2FSNA 4RTFD 4H03B 4AH9A 3A0IX 2NRTA 1TKTA 3CCVN 4DR2K 2E2NA 4NB4A 3D0PA 3K5NA 4DTUA 3G4SN 4PHTX 2XHBA 2VWKA 3N4PA 5DK5A 2QWMA 3AVBA 3S41A 2XY8A 1NK5A 1UAXA 3U8XA 3S3MA 3MEEA 5BREA 3OYBA 1RTDA 5CZ2A 3VQ6A 2QKBA 3CPEA 2V51B 1W97L 4FJHA 1B92A 4JI5K 4IG0A 3TTFA 4V19S 4CJQA 4C8MA 3TWHA 4N41A 1OH5A 5A2QO 2HBKA 4ISEA 5AQLA 4CJEA 3V9SA 4FOIA 1TK8A 4JKCA 1D9FA 4X66K 3L0QA 1T6CA 4HCCA 4BRKA 5JMVA 3SI6A 4DV6K 4G9ZA 1SZ2A 4O55A 3EY1A 2IVOA 4KHSA 3V1RA 1VAZA 4RWTA 2ZE2A 3KVGA 3NH1A 1GLDG 4WQ5C 3K2PA 5AJ3K 4BE0A 1V4TA 5BPMA 1DTQA 2A5XA 1IG9A 2WONA 3G71N 1L3SA 3QIOA 3CQXA 2E6MA 3O08A 3MN7A 4O5BA 3IFRA 5AR0A 1HNZK 4B9LA 3TAQA 3VQDA 4OPHA 2VWBA 3JXUA 1VSFA 2ZF5O 3VQBA 5CHIA 4BDPA 3TANA 4DR3K 1NJIO 3NMUA 3H1QA 3I56N 3QNOA 4Z0UA 1P90A 1RBVA 1HJOA 2QKKA 3PY8A 4FWKA 1NBWA 3ENBA 2QWPA 1WBDA 4WE1A 4HCBA 3CMAN 2GUPA 3OYLA 1RBTA 1W7AA 4FK4A 3CCQN 3W3DA 2G8HA 1WSJA 1HNIA 3TTCA 3HZ6A 4Q0BA 2RHKA 1NKBA 5EOYA 3DLEA 3F9MA 1RGIA 3P83D 1NJXA 2O8CB 2XRIA 2HVHA 2Q31A 1RT2A 5TKWA 4BRAA 5J1EA 1A5XA 3O9QA 3TSQA 3V9WA 1ZBIA 1YVNA 4F3OA 3E9PA 4KTZA 4M7YA 3ZX3A 3NGIA 4B8CA 4FVMA 1T44A 3MDQA 2FBXA 4BREA 5FPNA 1S1WA 3G25A 3HPGA 2E2QA 2FC0A 3CIPA 5KPTA 4CESA 1RT7A 3ZX0A 1BI4A 2JLEA 1RTJA 5HRRA 1QE1A 4CEOA 1VQ7N 1VQ4N 4BR7A 5EY4A 3DOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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