3JS6A

Crystal structure of apo psk41 parm protein
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
342
structure length
321
Chain Sequence
SNVYVMALDFGNGFVKGKINDEKFVIPSRIGRKTNENNQLKGFVDNKLDVSEFIINGNNDEVLLFGNDLDKTTNTGKDTASTNDRYDIKSFKDLVECSIGLLAREVPEEVVNVVIATGMPSNEIGTDKQAKFEKLLNKSRLIEIDGIAKTINVKGVKIVAQPMGTLLDLNMENGKVFKAFTEGKYSVLDFGSGTTIIDTYQNMKRVEEESFVINKGTIDFYKRIASHVSTPRMIEKGLEFKDEFYKEQDSLIEEVMSNFEITVGNINSIDRIIVTGGGANIHFDSLSHYYSDVFEKADDSQFSNVRGYEKLGELLKNKVEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Unknown function
molecule keywords Uncharacterized ParM protein
publication title Structure and filament dynamics of the pSK41 actin-like ParM protein: implications for plasmid DNA segregation.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 98
structure length 321
sequence length 342
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3js6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3js6A01
4BR4A 4JHDA 3IUCA 3QDKA 4C23A 1BOTO 2BUPA 1HLUA 1S22A 4CD3A 1OKJA 3FZMA 2CGJA 1QZ6A 2QWRA 4CZMA 5AQYA 2E2OA 1GLDG 1V4SA 4YDUC 4EFHA 3JXUA 4EIAA 5EY4A 1NGBA 2W40A 3QFUA 1D4XA 3O6WA 3VESA 2YJFA 3ULEA 3WQTA 1GLCG 3DXKA 1LOTB 2P9NA 1TUYA 4FWPA 2OANA 2QWOA 3MN5A 2YHXA 3DWLA 4H0OA 3EKUA 4B1YB 2GWKA 2YI1A 3W3DA 4H5TA 3M6GA 2V7ZA 3I33A 2VYPA 3ATVA 1JCEA 1QQMA 4BC2A 1V4TA 5BN8A 4L3QA 3VEZA 2P9IB 2D0PA 1HPMA 1RFQA 1T6CA 2E20A 2CGLA 2FF3B 4O5FA 4B1UB 4FWOA 2D4WA 4BR2A 1BU6O 1U2VB 4ISFA 3QICA 5AQPA 2IVNA 4RCHA 4Y0WA 3R9PA 1WOQA 2QWNA 4FWNA 2ZF5O 4BRKA 2A6AA 5AQLA 3MN9A 4EAHD 3WXIA 1G99A 3EO3A 1J6ZA 4BR0A 5F1XA 4YDUA 3IFRA 3HBTA 4K42A 4BRMA 4FPAA 3MDQA 4FWRA 4FWQA 4BRCA 1HKCA 4JAXA 4CZEA 4CZFA 3LL3A 4BQLA 1NGJA 2E1YA 3FGUA 4NO7A 5FPMA 3RSEA 3W0LA 3VEXA 3VENA 1U6ZA 3EL2A 5ADXH 3MK6A 4QS7A 2E2PA 4BR7A 2CH5A 5AQWA 3ZETB 3FZFA 2QWLA 4JNEA 3O8MA 4BG8A 3R6MA 3F9MA 3ENHA 3WUHA 3A5MC 3FR0A 2Q36A 4RWTA 3UKUA 2YHWA 1ATNA 3VERA 3CETA 3ZX0A 5LJWA 4A2BA 5AQZA 3IMXA 3QFPA 4IXCA 4KBOA 3VEWA 3LDLA 3FZLA 2QWMA 3H3OB 4ISEA 3TU5A 5AQHA 3ENOA 3KHYA 4FL9A 2YCHA 5KQ8A 3MN7A 1HKBA 4CZJA 4H5RA 3UKRB 3FZKA 4XH5A 3WQUA 1C0FA 1JCFA 3JS6A 2IIRA 1ATSA 4PL8A 1ZXOA 3QBXA 4MO5A 5AQKA 2ZGZA 1YXQA 2Q2RA 4PKIA 4B1VA 1NLVA 3KVGA 5F2RA 3WEEB 4Z94A 4H0PA 3CIPA 2J4RA 1GLFO 4BRNA 4FPBA 2QXLA 3QBWA 4FSVA 3CI5A 3WXJA 2P9LB 2P9PB 2AP1A 3BF3A 4AM6A 3D2EA 3SJHA 4I6MB 3EKSA 4IZ9A 5FPEA 2I7NA 1GLAG 3VEVA 4A2AA 4FWMA 2FXUA 4BC5A 4B9QA 4GY2B 5AQVA 1NGGA 1LCUA 3SMSA 5AFUH 5AZJB 1IG8A 2YJEA 3CERA 2P9SB 1DEJA 3M3ZA 5AQRA 4B1XB 1NBWA 2FSJA 1YUWA 4QS8A 5KPZA 4J8FA 3I8BA 1HUXA 3VEYA 4BRAA 2QWPA 3LM9A 4HTLA 2W41A 4PKGA 3WXKA 4CZIA 4MO4A 5AQUA 2ZWHA 4BR9A 3O1WA 1IJJA 5E84A 5AZIB 2ZGYA 1T44A 5AQOA 2I7PA 4M7XA 3ZETA 5BPMA 1RGIA 1NGIA 4CJ7A 1R59O 3GE1A 1KXPA 3CQXA 4ISGA 1QZ5A 1X3NA 4CBXA 2ASOA 5I9EB 2QW9A 4B1WB 2Q31A 2FF6A 3GG4A 3L0QA 3D7EO 4IJAA 5BRDA 3H1VX 1K8KB 5BN9A 1BWFO 2WUSA 2Q97A 2P9UB 3O1BA 1HJOA 1X9JA 1NM1A 5AQJA 3H45C 4CZKA 3D2FA 3CJAA 2A40A 5E26A 2PAVA 1T6DA 1NMDA 4E1JA 2GEMA 3U9ZA 3VETA 4CBUA 1CZAN 4H5NA 3UB5A 4BVPA 4XH4A 2A3ZA 1QQOA 4JD2B 5AQGA 5B8HA 3ZX3A 3CQYA 1GLLO 3A0IX 2IVOA 2CGKA 4H03B 2P9LA 2P9PA 4MLHA 5AQMA 5FPNA 2ASPA 4CBWA 1Y64A 4I6MA 2D0OA 4BRQA 1NGCA 4XH1A 3HZ6A 2FSNA 1BUPA 4DB3A 3S41A 1MWKA 5AQIA 5F0XA 3GL1A 1X3MA 3FE1A 5AZJA 2DPNA 3FLCO 2P9KB 3FFKB 2A41A 2P9NB 3DJCA 4CZHA 5BPNA 3BUZB 3HTVA 3ID8A 2H3GX 3LDNA 4A61A 2HF3A 3O5BA 4H5VA 4IJNA 1P8ZA 3DAWA 1YAGA 3VF6A 4BREA 1NGHA 3MMVA 3FZHA 4CI6A 3AAPA 2YHYA 4H0TB 3LM2A 3EN9A 4BC3A 4PKHA 5JLFA 4QS9A 4M63C 1ZC6A 2P9IA 3SK3A 2ITMA 3VGLA 3VPZA 3ZEUB 4BGBA 2HF4A 1BO5O 3A5NC 3QMLA 1U2VA 3AAQA 5BPLA 5AQTA 2V51B 1XQSC 4K25A 5AQNA 3M1FA 3U8XA 2QWQA 5AQSA 1C0GA 5KPRA 2Q0RA 4K43A 5AQXA 4FOEA 5AR0A 4BGAA 3U9DA 2BTFA 2FSKA 4FOIA 1TYQB 2D1KA 3CHWA 4H0XB 4BRDA 2V52B 4WQ5C 3BP8A 1H1VA 4FWLA 2NLXA 3C7NB 1ATRA 5EX5A 4B1ZA 3ATUA 3R8EA 4BRIA 1RDWX 5EVZA 3TPQA 5JICA 2A5XA 2ASMA 3GBTA 1HKGA 3GOIA 4BQZA 4DHYA 3BEXA 1NWKA 3HI0A 5JLHA 3BF1A 3H46O 1QHAA 1HX1A 2AA4A 3VGKA 4BROA 2GUPA 4IO8A 3A5LC 4FWSA 1KAXA 3RSEB 3UE5A 4RTFD 2GWJA 3U4LA 3G25A 4FO0A 1SAZA 1BA0A 3CJ7A 2EWSA 3HM8A 5TKYA 4K41A 2QM1A 1NGDA 3MCPA 4BRHA 3CJ9A 4WYBA 2V7YA 4WQ4C 2P9KA 4DCHA 4EHUA 5EXWA 4AM7A 2F9TA 5KQDA 4F9OA 3H3NO 4HWIA 3UKUB 1BG3A 1NGAA 3LDQA 4XEIA 3C0BA 1TUUA 1BA1A 3OHRA 3WXLA 5AQQA 3VGMA 5AQFA 1Z05A 5ELZA 2E88A 4BRFA 5BR9A 1Z6RA 4WQ5A 3MN6A 2KHOA 4PL7A 5JMVA 3ZEUA 2VCPA 3UKRA 2FLOA 3O08A 2A42A 1KAYA 2E2NA 1BDGA 4MLEA 3DXMB 4BR5A 3L6QA 5BREA 3SLCA 1EQYA 3KZBA 3O80A 4CZGA 4BC4A 1E4GT 4JHDB 3CJCA 3WEEA 5LJVA 1WUAA 1GLJO 4CD1A 1YVNA 4JN4A 4EHTA 5ADXA 5BRHA 1TYQA 1MA9B 1JCGA 1ESVA 4H0YB 3VF2A 4GNIA 3C7NA 4NB4A 2E2QA 3D2EB 2IVPA 3A5OC 1NGEA 3VF4A 2HMPA 2E1ZA 2VWBA 3J8AA 5LY3A 3IDHA 4WQ4A 2CH6A 3ULEB 2P9SA 3P4IA 4FWKA 3DXKB 3B8AX 2PBDA 5CE3A 2HOEA 3O4WA 3H1QA 4BRPA 4DQ8A 1S3XA 3EZWA 2Q1NA 1DKGD 1XUPO 1KAZA 3L4IA 3HSCA 1SQKA 4BRGA 1NGFA 5AZIA 3SMPA 3LDOA 2NZTA 3VOVA 3CJ1A 1DGKN 1ZBSA 4CZLA 3LDPA 4H0VB 1MDUB 4IWVA 4BG9A 4O8KA 2Q0UA 1Q18A 3WT0A 3A8YA 5BRFA 1QQNA 4BVOA 3GDQA 1E4FT 2F9WA 1SZ2A 3AY9A 3CJBA 3AARA 1K8KA 4LC9B 2GELA 2NRHA 4M7YA 2UYTA 4BRLA 2P9UA 1GLEG 5FPDA 2E8AA 4A62A 3QB0A 3H6EA 3VEOA 5AFUA 3ZX2A 3DXMA 5KPTA 5EOYA 2GTDA 1XC3A 4H5WA 3D2FB 1GLBG 1MWMA 4JD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CM6A 3AVAA 3IUCA 4CHOA 5LMNK 1XMOK 4HUEA 4GW6A 3NVKA 5CR4A 4AHCA 3SQ4A 2BANA 3K5MA 4FLXA 1QSYA 3QETA 2VWJA 4BE1A 3DOLA 3AA4A 1S1XA 1GOAA 2KFNA 3JXUA 4FM2A 4EIAA 5EY4A 1NGBA 2W40A 3QFUA 3VESA 3WQTA 3THYA 4LF5K 3L2VA 1GLCG 3SAHA 1LOTB 2KZMA 1TUYA 1FKPA 2QWOA 1K73O 5M1PA 5GIOA 3OBYA 4H0OA 3PX4A 1C0UA 1S1VA 1D9FA 4XIUA 1XC9A 3M6GA 2V7ZA 3I33A 4J2BA 4KTZA 3ATVA 4I9QA 1QQMA 5BN8A 4YOWA 1HMVA 2D0PA 4O5FA 1I94K 1Q8IA 4JRQA 3L8BA 1BU6O 1WB9A 3S3MA 3QICA 3DLGA 4AQYK 4F8RA 3R9PA 3CCLN 1JLCA 2B6AA 3BZKA 3AO5A 4E3SA 4JKFA 2GX9A 3LP2A 4LF7K 3MN9A 4DFMA 3WXIA 4RW4A 3CMEN 3B6OA 5F1XA 2KW4A 4CF2A 2IAJA 2YKNA 3K2PA 3NBPA 4PQUA 3QEIA 4FPAA 4BDZA 1JLGA 3EE8A 3CFRA 3RRGA 5J2PA 3V9XA 3IAYA 1YVUA 4JI4K 1HKCA 3VQ5A 3LL3A 4JKAA 2P5OA 2O8CB 4NO7A 1YI2N 4W5NA 4AHTA 3HRGA 3NF9A 5C12A 1U6ZA 2YHAA 5CYMA 1HR0K 1NK8A 2PZSA 4M3UA 4FZXC 1B9DA 1NNEA 5FRNA 1U49A 3ZETB 1TGOA 2DFHA 4C8OA 3ENHA 2PFUA 2G8VA 3U3YA 2UUAK 2RPIA 3V4IA 2B5JA 5LJWA 1B92A 3QFPA 4KREA 3VEWA 3WNHA 2RHKA 3H3OB 3SZ2A 3C6TA 1RT5A 3PIOL 1Q9XA 4KTWA 3TR8A 1REVA 1QTMA 3P83D 1SKRA 5I42A 3JS6A 1ASUA 5HLFA 1K9MO 1RDAA 1ATSA 4PL8A 4GKKK 3E1YA 1Q9YA 1YXQA 2NRXA 1NLVA 3KVGA 4N41A 4FK4A 5D3GA 2E4LA 5LMUK 3WEEB 4Z94A 3CIPA 3CPEA 4IG0A 1GLFO 4FPBA 2DFEA 4FSVA 3BF3A 3RMDA 3D6RA 1NKEA 3ZCMA 1RBSA 4YOYA 5M1QA 3D2EA 3SJHA 4K8ZA 3PO4A 2I7NA 5C10A 4Z4CA 3VEVA 1WNSA 4BC5A 5AQVA 1NGGA 1SL2A 1LCUA 3AVMA 2HHXA 2PYLA 4LF8K 5AZJB 2YNGA 2G8IA 4IFEA 3OYBA 2VGNA 1HNWK 3NFAA 2FSJA 4QS8A 4J8FA 1WN7A 4B3OA 4HTLA 4CGIA 1WSEA 1HNXK 1IJJA 5AZIB 2OZSA 2I7PA 1RGIA 2P1JA 1NGIA 3HP9A 1YJWN 3GE1A 1KXPA 1KLNA 1X3NA 3OS0A 5I9EB 4BY9C 1FK9A 3G6EN 2RN2A 3L0QA 1NKBA 4IJAA 4YOTA 3H1VX 1TV6A 5HRRA 3O1BA 1TKTA 5DM7L 1IBLK 1WSFA 4FLUA 2WC9A 1T6DA 1NMDA 4E1JA 1UA1A 4CBUA 4H5NA 2EX3A 2A3ZA 4JD2B 3U3GA 3QNOA 4AHVA 4DU1A 3CQYA 2IVOA 2X78A 3AVGA 2CGKA 1WSGA 2P9LA 5AQMA 5FPNA 3V1QA 4F2SA 4CBWA 4DUYK 1N32K 4I6MA 1NGCA 3A2FA 1QHTA 1JLBA 2OZMA 1WBBA 1T03A 3QEWA 3F73A 5F0XA 2O4IA 3GL1A 1EO1A 4DS5A 3V1RA 3FE1A 4MFBA 3V9ZA 3B6PA 4X66K 3NH1A 2P9KB 4JI1K 1T8EA 2Z1GA 2H3GX 4IJNA 2GV9A 3LM2A 1RDBA 4DR2K 5JLFA 3NF8A 1RT1A 2ETJA 2P9IA 2NRZA 3THXB 3VPZA 2G8UA 3ZEUB 2O8EB 4BGBA 2NNWA 4LSNA 2V51B 3CG7A 1KFDA 4ZHRA 2OTJN 3NAEA 1NJIO 3U8XA 2QWQA 5AQSA 1C0GA 2Q0RA 5AQXA 4WFAL 1OVYA 2BTFA 4FOIA 2D1KA 4BRDA 2V52B 2E5LK 2UXCK 3BP8A 5FDLA 3KTQA 4CEQA 1Q86O 1EWQA 1NK6A 1DTTA 2G8WA 5JICA 2A5XA 3GBTA 4GKJK 4OO1J 3H08A 4DHYA 4B9SA 1KLMA 1NWKA 1SKSA 1HX1A 4CJVA 3VGKA 2PYJA 1GOBA 4EZ6A 1DT9A 3A5LC 1RT7A 3PX0A 4J2EA 4RTFD 2GWJA 4FO0A 3KLIA 3RWUA 3O9SA 4B9MA 1VSFA 3S3OA 3VQ4A 3CFOA 5TKYA 4DTPA 3NMUA 5IWAK 4K41A 1NGDA 3MCPA 2VQFK 4O44A 1Q7YO 2BH1A 4YNQA 2HHTA 2WBNA 1D5AA 5EXWA 1U04A 5KQDA 4DQIA 2NRTA 1HJRA 4F9OA 2E6LA 3LANA 1BCMA 3HT3A 4ILGB 3OYAA 4KO0A 3LDQA 4XEIA 4E19A 4CJWA 3VGMA 3IKMA 4CJ3A 1RTJA 2X6SA 3N4QA 4IFYA 2KHOA 4TSXA 2ZJRL 3U6FA 3PIPL 3JYTA 3UKRA 2FLOA 2OTLN 3T1HK 1KAYA 5C2DA 2E2NA 5HL7L 1BDGA 1XMQK 4NLBA 3SLCA 4DFJA 3WNEA 2HBLA 4BC4A 3CJCA 5LJVA 4Q0BA 1JLFA 5ADXA 5BRHA 3TWHA 1MA9B 1TK5A 3VF2A 2O8DB 4KI6A 2IVPA 3J7ZO 4ELUA 1IBKK 1RDUA 4I2PA 5C25A 2E1ZA 4FK0A 1NJYA 2CH6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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