3DAWA

Structure of the actin-depolymerizing factor homology domain in complex with actin
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein/structural protein regulator
source organism Mus musculus
publication title Structure of the actin-depolymerizing factor homology domain in complex with actin
pubmed doi rcsb
total genus 111
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3dawA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dawA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dawA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dawA04
5KQDA 2VYPA 2V7YA 1RFQA 3I8BA 2P9KB 3W3DA 2YCHA 3ZX3A 4CZGA 1ATSA 4BR9A 4FWOA 3VF4A 4BRHA 3UKRA 4CZIA 1ATRA 5ADXH 4CZLA 3WXKA 4YDUA 5LY3A 3MDQA 4DCHA 4JD2B 1BG3A 3L0QA 3KVGA 3ULEB 3DWLA 1QZ6A 3FZLA 3P4IA 4BC3A 4JHDA 1MWMA 3GOIA 3D2EB 4BR2A 5BRFA 4ISFA 3ATVA 5TKYA 4H0YB 2ZF5O 4EFHA 2E2QA 4H5NA 3CJ7A 4WQ4C 3R9PA 1V4SA 4IZ9A 4O8KA 5BRHA 1ZC6A 2PAVA 3FFKB 3FE1A 2A41A 1X9JA 2IVPA 4K42A 5FPNA 2YHXA 1GLEG 1NMDA 5EX5A 3VEOA 1BU6O 2CGKA 1P8ZA 1DGKN 1JCEA 5BPNA 2OANA 1K8KA 2AA4A 3VERA 3U9ZA 3H1VX 3RSEA 2Q0UA 3D2FA 4YDUC 4H0VB 5BRDA 2E88A 2P9PA 1BO5O 4PKIA 2E2PA 4BG9A 3IMXA 3VENA 4B1XB 3BUZB 1T44A 4RCHA 2NRHA 1YAGA 4JD2A 3G25A 4H0OA 4FWSA 1NGDA 4B1UB 2A6AA 2YHWA 5AQFA 1HJOA 1ATNA 1C0GA 2QM1A 4FSVA 3R8EA 1BWFO 3H45C 3GDQA 5FPMA 1XQSC 4JAXA 1T6DA 4BREA 4WQ5C 2J4RA 3H3OB 3L4IA 4KBOA 3LDPA 3QB0A 1HUXA 3QBXA 2E1ZA 2QWNA 1NGAA 4BRQA 3F9MA 4JNEA 4BRGA 2ASPA 2DPNA 4FWMA 3M1FA 3VEYA 3MN9A 4DHYA 3HI0A 3HM8A 2I7PA 4BRKA 4Z94A 2YJFA 1JCGA 4BVPA 3EO3A 4CD1A 3GE1A 4XH1A 3WUHA 3A5MC 2QWMA 3A0IX 1BA0A 2P9SB 3AARA 3LM9A 4PKHA 2P9UA 4B1ZA 3ENOA 1Z05A 4O5FA 1Y64A 4FOEA 2Q0RA 3VOVA 1LCUA 2P9UB 1NWKA 1QZ5A 1BA1A 2P9IA 2QWPA 1YVNA 3GL1A 4RWTA 4FWQA 4BR7A 4FWPA 3ENHA 2VCPA 4DQ8A 4CI6A 3A8YA 3VEXA 1HX1A 3IDHA 2YI1A 2D4WA 3H46O 5KPRA 1YXQA 4JN4A 2CGJA 2D1KA 2E8AA 3HZ6A 4LC9B 3VF2A 4CD3A 1BDGA 5AR0A 4HWIA 1E4FT 2AP1A 3DXKA 3FGUA 5AQPA 4CZFA 3MK6A 3JXUA 4BRPA 2GTDA 1V4TA 4B9QA 2FXUA 1CZAN 5ADXA 4IXCA 2QWQA 3GBTA 3UKUB 5EVZA 1IJJA 2VWBA 3ZX2A 2A42A 1SAZA 3LDLA 5F2RA 5AQWA 4NB4A 3VEWA 3O4WA 2NZTA 2HMPA 1KAXA 3ZEUA 2Q97A 4B1YB 3C7NB 2GUPA 2NLXA 3WXLA 5BR9A 2E2OA 3QFUA 4BRIA 4BG8A 3SJHA 4BRAA 2FF6A 2P9SA 3FZKA 3CQXA 3O1WA 2QW9A 4MO5A 4FPAA 3WXJA 4XH4A 3R6MA 1WUAA 5AQTA 1MWKA 4B1WB 3B8AX 3OHRA 1TUUA 3ULEA 4XH5A 3BP8A 3LL3A 3M6GA 3AAQA 3DXKB 4QS9A 1HLUA 2FSJA 1JCFA 3UE5A 4M7YA 4BR0A 3QICA 3UKRB 1KAYA 3DAWA 2A3ZA 2ASMA 3EKUA 3FZMA 3WEEA 4I6MA 3TPQA 1S22A 2YJEA 2CGLA 3WXIA 4BVOA 1SZ2A 1WOQA 4EIAA 3JS6A 4BRDA 4CBWA 2FLOA 4CZJA 1DEJA 2BTFA 5AQQA 4H5TA 3UKUA 2QXLA 3WT0A 1GLCG 1GLBG 2WUSA 4WQ5A 3H3NO 1RGIA 3VEZA 1NGHA 4IO8A 4AM6A 2IIRA 2F9WA 1YUWA 5LJVA 4A2AA 5AQRA 3A5NC 2Q36A 2A40A 4BQLA 4BGAA 2YHYA 5KQ8A 5B8HA 3CIPA 2ZWHA 4H0TB 1GLFO 5BREA 3KZBA 1NM1A 3D2FB 1G99A 3ID8A 4H5VA 2EWSA 4HTLA 4BC4A 5AQYA 4EHTA 3LM2A 4IJAA 5AQJA 3QBWA 4BQZA 3LDQA 2CH6A 4BRFA 4BROA 3DXMA 1ZBSA 3A5OC 3FZFA 4QS8A 3QMLA 1NGJA 2GWKA 1TYQB 3CQYA 1S3XA 3ZX0A 4B1VA 3C7NA 4GY2B 4BGBA 4BRMA 3EZWA 4EHUA 4GNIA 1MA9B 3O1BA 3EL2A 4IJNA 4Y0WA 2HF3A 2BUPA 2W41A 4BRLA 4CZEA 4L3QA 4M63C 3AAPA 2P9NA 3CERA 5BN9A 4ISEA 5AQIA 1ESVA 1HKGA 4MLEA 4K41A 1QHAA 3U9DA 3WQUA 4BR5A 3CJ9A 1K8KB 3LDNA 4H03B 2UYTA 5AQVA 2W40A 3IFRA 3ZETA 5CE3A 1X3MA 2A5XA 1NGFA 4M7XA 2GELA 1R59O 3AY9A 3VGKA 3ZETB 2P9LB 4ISGA 3WQTA 2Q31A 2KHOA 3M3ZA 1KXPA 1NGCA 5AQLA 2FSKA 2ZGZA 1QQOA 4FWLA 4A62A 4CZKA 3VGLA 3CJBA 1U6ZA 3BF1A 5AZIB 4J8FA 1XUPO 3BEXA 4BC2A 5AQSA 4PL8A 4MO4A 5JLHA 4E1JA 3MCPA 3D2EA 1IG8A 5AQNA 1TYQA 5F0XA 2GWJA 2HOEA 1OKJA 2GEMA 2IVOA 3DXMB 1RDWX 3TU5A 3HBTA 5AZIA 2E2NA 5EY4A 3H6EA 5JICA 1NGBA 4CJ7A 1QQMA 2Q1NA 4BC5A 3MN5A 5AZJB 1H1VA 4FOIA 3ZEUB 3O5BA 1EQYA 4H5WA 4FO0A 5AQXA 5E26A 3MN6A 3I33A 1Q18A 4WYBA 3LDOA 1U2VB 2ITMA 1TUYA 1NBWA 1NLVA 2IVNA 2HF4A 3W0LA 3FR0A 3C0BA 2F9TA 4EAHD 4PKGA 2P9PB 3GG4A 5BPMA 1C0FA 4A2BA 4C23A 3EKSA 3SMPA 1QQNA 5EOYA 1E4GT 3MMVA 1HKBA 1X3NA 1DKGD 5KPZA 5AQHA 4CBUA 1LOTB 1J6ZA 2PBDA 3CJ1A 3O80A 2QWRA 3SK3A 1NGGA 3VGMA 5BN8A 3VEVA 5F1XA 4H5RA 1GLDG 3CJCA 5ELZA 5I9EB 5AQOA 4FWNA 5AQUA 4PL7A 3CHWA 5JLFA 2H3GX 3FZHA 3U4LA 3J8AA 2V52B 4CBXA 3DJCA 4AM7A 4K25A 3VPZA 5LJWA 4QS7A 5AFUH 5E84A 2P9NB 2QWOA 2ASOA 3U8XA 1MDUB 2ZGYA 4FWKA 2D0PA 3D7EO 1U2VA 3KHYA 4H0PA 1NGIA 3HSCA 4RTFD 5FPEA 4CZHA 5FPDA 3VETA 4FPBA 2E1YA 4BRNA 3QFPA 3O6WA 1SQKA 4BRCA 2P9KA 3RSEB 4FWRA 2P9LA 1GLLO 2P9IB 3FLCO 3O8MA 4F9OA 3CJAA 1Z6RA 2FSNA 5AQMA 1GLAG 2E20A 5KPTA 3A5LC 4NO7A 1HKCA 4WQ4A 4DB3A 3HTVA 2D0OA 4A61A 3H1QA 3MN7A 3SLCA 2I7NA 3VF6A 2Q2RA 4FL9A 3SMSA 3EN9A 4I6MB 4MLHA 2FF3B 3O08A 5AZJA 4CZMA 1ZXOA 3BF3A 1NGEA 3S41A 3WEEB 5AFUA 4IWVA 3CETA 1XC3A 4JHDB 3UB5A 3QDKA 4K43A 5AQZA 1HPMA 2V51B 2V7ZA 3IUCA 4BR4A 4XEIA 1BUPA 3ATUA 5EXWA 1T6CA 4H0XB 5JMVA 3L6QA 1KAZA 5AQKA 3VESA 1D4XA 5BPLA 3CI5A 1BOTO 2CH5A 2QWLA 1GLJO 5AQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y1IA 3LWLA 2P9KB 3W3DA 4CK1A 2KFNA 2ZJQL 1RDBA 1NK0A 3DLKA 2HW3A 4CZIA 1VQPN 3RR7A 4CZLA 3AV9A 3DLGA 4WFNL 5I42A 4JLHA 3ZLJA 4BC3A 4G1QA 2JWKA 5FROA 3JAMO 3HPHA 3D2EB 3MX2A 4ISFA 4LH5A 4H5NA 3CJ7A 2PY5A 1V4SA 4IZ9A 2PAVA 4CGDA 3SQ2A 4LFCK 4O0IA 4AHVA 3E9PA 2NRZA 2E6MA 3FE1A 4B8CA 3D45A 4HUGA 1X9JA 2IVPA 5FPNA 4JI7K 4DTSA 5JVHL 1SV5A 1BU6O 2CGKA 1DGKN 5BPNA 2O8CA 3O3FA 2NRRA 1K73O 4B9LA 1YVUA 1SS6A 3CM6A 4NYNA 2X78A 1K8KA 2XY7A 2KW4A 1JXEA 1RBTA 3QLHA 2KFZA 3RSEA 4OKEA 2HBLA 1EWRA 2P9PA 1BO5O 3ZCMA 4PKIA 2E2PA 4NCBA 5J1EA 3IMXA 3E1YA 1QS4A 4PWDA 1S6QA 1U04A 2A6AA 3NCIA 5J2NA 4FJIA 1C0GA 4GV3A 1VSHA 3R8EA 3NGZA 1RT5A 3SAGA 1E3MA 1W97L 1XQSC 3ZSOA 4BREA 1OH5A 3PIOL 1VSMA 3VMFB 4DFJA 3QBXA 2QWNA 1NGAA 4KI6A 4LSNA 4Y1CA 3HP6A 1C0UA 3VQAA 1RT7A 3M1FA 2ZJRL 1VSIA 3OYLA 3MN9A 4OPJA 2NRWA 4BRKA 4V19S 2YKMA 1JCGA 5GIOA 3WUHA 2NRTA 2QXFA 3A5MC 4OLBA 4Q5VA 1BA0A 4JKFA 4PKHA 4C8KA 4O5FA 2Q0RA 2OPPA 1LCUA 4KI4A 3ZSZA 1NWKA 2QWPA 1YVNA 1EX4A 5AJ3K 4CF8A 4QOZB 3QNNA 3L8BA 4FWPA 4N41A 2VCPA 3S3MA 1XWLA 2HHWA 3IS9A 5JS2A 4DTOA 1HX1A 3JYTA 2D4WA 2PFUA 3PV8A 3OY9A 4JI1K 3NH0A 2D1KA 3CCEN 1ZBHA 4C8OA 1BDGA 1B92A 4HWIA 3K57A 1BQNA 1VRUA 3MK6A 3ITHA 2GTDA 4B9QA 3I55N 3SUQA 4N76A 2QWQA 3GBTA 2F7TA 1GOBA 3C65A 4DFKA 4KTZA 2IAJA 2VWBA 2A42A 2VG6A 3LDLA 4DR6K 5F2RA 3OJUA 4KHNA 3SAFA 1A5WA 5C12A 4AHTA 4M45A 5HRSA 1G15A 2Q97A 1A5VA 1K8AO 4JRPA 3SQ4A 3CMAN 1RNHA 3SQ1A 3OVNA 2Q3SA 1XMOK 3CC7N 4BRIA 4CK3A 4O0JA 2P9SA 4AHSA 1SL2A 2NNWA 3HSTB 3CFRA 3OYFA 4LD0A 1UA0A 3THVA 1WUAA 4CHNA 3OHRA 1LV5A 4BWMA 4O55A 3AAQA 3DXKB 3VQPA 2FSJA 1JCFA 1NK9A 1KAYA 3DAWA 2A3ZA 3EKUA 4ILJA 3EE8A 3WXIA 1L3UA 4IDHA 3AO2A 3CXCM 4BE7B 5GIPA 1VSKA 1CZ9A 3T1YK 2O8BA 2OPSA 1XI1A 1SL1A 4DR4K 2KZZA 1T8EA 2IS3A 2WUSA 1WAJA 5KI6A 3VEZA 4IO8A 1KCFA 4AM6A 3LPTA 1NJZA 4F3OA 4B3RK 1YUWA 3A5NC 4FW2A 2ZWHA 1GLFO 2FBTA 3AVCA 2WONA 1G99A 3J80O 5CZ1A 1TKXA 2EWSA 4M3WA 5AQYA 4CJQA 1L3TA 2E5LK 5AQJA 3QESA 3T69A 1FW6A 4XJXA 1UOCA 3QMLA 4FCYA 2GWKA 3SUPA 5I3UA 1TYQB 5M1PA 3ZX0A 2LSNA 4B9UA 4BRMA 2IOCA 3EZWA 4X64K 1X9WA 2WOMA 3DMJA 1FXXA 2ITGA 2FC0A 4Y0WA 4CZEA 4L3QA 2OYQA 1JLCA 2P9NA 3OS1A 2YNIA 4U67L 3VQ8A 1J9AA 4KKOA 1WN7A 2HHIA 2UYTA 3VQ7A 4DU3A 4DR7K 2I5JA 3ZETB 4YNQA 3HXMA 4ISGA 5KGXA 1KXPA 4B9TA 4FWLA 4CZKA 1QHTA 3DLHA 4CEFA 5AZIB 3BEXA 4BC2A 2JWLA 3TAEA 3RVCA 2AJQA 3ZSRA 3C95A 1IG8A 4DTRA 2YHAA 3B6PA 1TYQA 3IRXA 4ELVA 4IOAL 1M90O 3OS0A 2HOEA 1OKJA 4J2AA 4IFEA 3BY5A 1KD1O 1J5OA 1BI4B 4AILC 4CJ5A 1YTUA 2B4JA 3MEEA 4ID5A 4AF1A 2PZSA 4FOIA 4LY7A 2O8DA 5GAEP 2W6KA 1D8YA 3O5BA 4FO0A 3NF9A 3D0PA 4FZXC 1Q18A 3HOSA 4CIFA 3DI6A 4B3TK 1U2VB 2HF4A 1NLVA 1WBDA 2BANA 4EAHD 2P9PB 1LWFA 2ATQA 4C23A 3KLHA 3SYZA 4GKJK 3EKSA 2Z1HA 3K59A 2ETJA 1ZBFA 3PSIA 3KK7A 1HKBA 4CBUA 3PIPL 1LOTB 3O80A 2QWRA 4CF1A 1KSPA 1NGGA 5BN8A 4OPKA 2Y1JA 4H5RA 4CHOA 5DK5A 3CJCA 5ELZA 4KREA 4L8RB 3E9OA 5AQOA 4B08A 1NU0A 5JS1A 4DU4A 4BEBA 3LALA 4Z4CA 3J7ZO 1CLQA 5J2QA 3PX0A 4LF4K 4CHPA 2ZGYA 2D0PA 4JK8A 1NK4A 1NK8A 5SWMA 3AA2A 1BIUA 4CZHA 1RBUA 2EX3A 3O6WA 3QEIA 2P9KA 3RSEB 2P9LA 1GLLO 2P9IB 3VQDA 4K8ZA 2FSNA 3RMDA 2YV0X 3TAPA 1S1VA 3TSPA 4DV4K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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