3W3DA

Crystal structure of smooth muscle g actin dnase i complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
b'EEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, gamma-enteric smooth muscle
publication title Refined structure and solvent network of chicken gizzard G-actin DNase 1 complex at 1.8A resolution
rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 122
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3w3dA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w3dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w3dA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3w3dA04
1H1VA 2I7NA 4CZGA 3O80A 3MN7A 4M7XA 3L0QA 5BREA 4B1XB 3EN9A 4QS9A 5FPEA 4I6MB 3FZFA 1HJOA 4PKHA 4J8FA 1GLLO 5AQKA 3CJAA 4BVPA 5BRHA 3QFUA 3BF3A 3A5NC 4YDUC 2E2NA 3LDNA 5ADXH 2OANA 4PKIA 2FSJA 1JCFA 1ATRA 3FFKB 1U2VB 3DXMB 3MDQA 4GY2B 5KQDA 2GELA 2HF4A 4FO0A 3DJCA 5EVZA 3FZHA 3CJBA 3M1FA 3A0IX 2VCPA 1ZC6A 3A5MC 4WQ5A 3OHRA 4WYBA 4BR0A 2D0PA 2FSKA 3O1WA 4GNIA 1Z6RA 3H46O 4MLEA 2NRHA 1HKCA 2P9KB 1Z05A 2E2PA 3HBTA 5AQPA 3ATUA 3CIPA 2GUPA 3ZX2A 4CZIA 3WXJA 5JICA 5EX5A 3VETA 1GLEG 2YI1A 1BA0A 2KHOA 1D4XA 2P9SB 5JMVA 4B1VA 2IVPA 4H5WA 3J8AA 4I6MA 3LM9A 2NZTA 5BN9A 3CQYA 4BQLA 4FWKA 4JHDB 4JN4A 1HX1A 2AA4A 1X3NA 5EY4A 1U6ZA 1U2VA 3DXMA 3SLCA 3C0BA 4XH4A 4CZKA 3VEVA 1Q18A 3F9MA 5KQ8A 3M3ZA 4H0TB 2A3ZA 3HTVA 1XUPO 3QDKA 2ZGYA 5FPMA 3U4LA 5BRDA 4WQ5C 5F0XA 1X3MA 2P9KA 5KPTA 3EKUA 3GG4A 4O5FA 2H3GX 1HUXA 3TU5A 5I9EB 1NGIA 4MLHA 1ATNA 3O1BA 3EZWA 2QWOA 1KAZA 1QQNA 1DKGD 2YCHA 5AQRA 4DQ8A 3O5BA 4IXCA 2P9SA 2D0OA 4CBWA 2ASPA 3QFPA 4CZFA 1MWMA 3ULEB 1JCEA 1G99A 3AY9A 4H0OA 4BRQA 2HF3A 5AZIB 5B8HA 5AQYA 1CZAN 4CZLA 4JHDA 3LDPA 2D4WA 3FZMA 3VESA 3VF4A 3JS6A 5AQNA 4EIAA 2E1YA 1QHAA 4PL8A 4BRIA 1J6ZA 3VEOA 2P9IB 1NGEA 1P8ZA 3UKRB 3I33A 4K42A 5BRFA 2FSNA 3VGLA 3VGMA 1V4TA 4RCHA 4CZEA 4H0VB 2QWQA 3D7EO 3O8MA 3HM8A 4BQZA 4H5VA 4M7YA 3MN9A 5AQJA 1ESVA 4B9QA 1DGKN 2AP1A 3UKUB 4RWTA 1BU6O 2F9TA 4BR7A 2QXLA 4M63C 3ATVA 2A6AA 3HZ6A 4FWSA 3MMVA 1BUPA 4BRHA 1V4SA 4FWPA 2V52B 5E26A 3ULEA 1BA1A 2E2QA 4B1YB 3QB0A 2PAVA 2A5XA 5AZIA 3GOIA 3ENHA 3BF1A 1YVNA 3O6WA 2FXUA 3LL3A 3RSEB 3MN6A 2QWMA 4IWVA 1MA9B 3S41A 1C0GA 1KAXA 4BGAA 4FPBA 2P9IA 3UKRA 1GLAG 5AQIA 3H3OB 3WXLA 2QWNA 3ZX3A 1RGIA 4B1WB 2FF6A 2YJEA 5CE3A 2NLXA 2E2OA 4FWQA 4WQ4C 4IO8A 3HSCA 4BC2A 5AFUA 5AZJB 1E4GT 1BOTO 3VENA 2ASMA 1RDWX 4KBOA 3UKUA 2YJFA 4FPAA 5FPNA 4BR5A 4H0XB 4H5NA 1E4FT 3O08A 1Y64A 4BRPA 2Q1NA 1DEJA 4DB3A 1NGAA 3H1QA 5AQGA 3WXKA 5BR9A 3IMXA 3WQTA 4MO5A 3H3NO 3VEXA 4FWNA 3GDQA 3FR0A 1QZ5A 1XC3A 3RSEA 1QQMA 1BWFO 2BUPA 1LOTB 2CGJA 1YXQA 3CI5A 5AQTA 2IVNA 3FE1A 4BRDA 4BR2A 4O8KA 1WUAA 3I8BA 3DXKB 5BPNA 4BC5A 1WOQA 4ISGA 2ITMA 1ZBSA 2V7ZA 4A2AA 4L3QA 2E1ZA 4BC4A 3FGUA 3VF6A 1ATSA 1TYQB 4K41A 3W3DA 4CD3A 5AZJA 1NLVA 4FL9A 1GLBG 5AQVA 1GLFO 3WQUA 4BRLA 3VF2A 2EWSA 4IZ9A 3VERA 4ISEA 5F1XA 1OKJA 3G25A 3KVGA 3LDQA 3L4IA 3CJ1A 3R9PA 3VPZA 1QZ6A 5BPLA 3KZBA 1NBWA 5AQZA 1IJJA 1MWKA 4AM7A 3UE5A 3A5OC 1NGGA 3C7NB 3H45C 4XH1A 3EO3A 5AR0A 4EHTA 2QWPA 3H6EA 3LM2A 1NGHA 3LDOA 1S22A 3MCPA 1ZXOA 1TUYA 5KPZA 3DXKA 2HOEA 4WQ4A 2CH5A 4DCHA 3L6QA 3W0LA 3LDLA 2E88A 4BR9A 4CD1A 2HMPA 3QBWA 1GLDG 4CZJA 3QICA 3M6GA 3ZEUB 3CETA 3IUCA 1NWKA 4QS7A 3GL1A 1TYQA 3BP8A 4BROA 4JD2B 3QMLA 2YHYA 2Q2RA 4IJAA 4H03B 2I7PA 3MN5A 5FPDA 2YHWA 4BG8A 4BRMA 4FWOA 3SJHA 4E1JA 3FZKA 2Q0RA 5AFUH 1LCUA 4CBUA 5AQQA 1K8KB 4EAHD 2A40A 1XQSC 2GEMA 3SK3A 2CH6A 3WXIA 3KHYA 1HKBA 1NGFA 2Q31A 3CJ9A 3WEEB 2ZGZA 4BRFA 3ENOA 3C7NA 4Y0WA 2CGLA 4AM6A 4HWIA 1JCGA 4NO7A 5AQFA 4H5TA 4A61A 2P9PB 3IDHA 2W40A 1YAGA 4IJNA 3TPQA 2YHXA 3D2FB 3CJCA 2FLOA 5ELZA 1EQYA 2GWKA 4BRAA 4Z94A 4QS8A 5EOYA 2P9UB 5AQOA 3ID8A 3ZEUA 1QQOA 4ISFA 4BRNA 3U9ZA 1BG3A 3SMPA 5BN8A 5EXWA 4JD2A 2FF3B 4B1UB 2IIRA 1IG8A 1X9JA 2BTFA 3BEXA 4EFHA 1HLUA 1NGCA 1S3XA 3DWLA 4NB4A 3DAWA 4MO4A 1RFQA 2A42A 3O4WA 2P9NB 1NGJA 1MDUB 2WUSA 4HTLA 5LJVA 1C0FA 2W41A 1HPMA 2A41A 4BR4A 5ADXA 2CGKA 1K8KA 3CERA 4JNEA 2Q0UA 2V7YA 3BUZB 3JXUA 1T6CA 4FOEA 4K25A 3A8YA 3WEEA 4PL7A 2D1KA 4DHYA 2F9WA 3CQXA 3ZETB 1NM1A 2V51B 3FZLA 2P9PA 1HKGA 1YUWA 4H0PA 5AQXA 3ZX0A 4LC9B 2J4RA 3D2FA 3CJ7A 5E84A 5LY3A 4BG9A 5LJWA 2GTDA 2P9UA 3GBTA 3VOVA 2ZF5O 1NMDA 3IFRA 4H0YB 4BC3A 5JLFA 4XEIA 4JAXA 4RTFD 2P9LB 4K43A 2ASOA 4BREA 2QW9A 2VYPA 4FWMA 3WUHA 5AQLA 4CZHA 5KPRA 3VEWA 4BRKA 4FOIA 4BVOA 1KXPA 4XH5A 4H5RA 3R6MA 4PKGA 3D2EB 5TKYA 2ZWHA 2P9NA 3GE1A 1R59O 3U8XA 4C23A 3UB5A 3AAPA 3VEYA 3AARA 4CJ7A 4B1ZA 3EKSA 1T44A 3QBXA 4BRGA 2E8AA 3SMSA 1NGBA 3VEZA 3VGKA 1SZ2A 4FSVA 3B8AX 3WT0A 3ZETA 3AAQA 5JLHA 1GLJO 3A5LC 4YDUA 3H1VX 5AQMA 2UYTA 2PBDA 2VWBA 2DPNA 3EL2A 5F2RA 3U9DA 4EHUA 1GLCG 3CHWA 1BDGA 2QWRA 1BO5O 3HI0A 4A62A 5AQWA 2Q36A 2IVOA 3MK6A 4BGBA 1TUUA 2P9LA 1T6DA 4CI6A 1SQKA 3R8EA 4CBXA 1KAYA 5AQSA 1SAZA 5BPMA 4CZMA 1NGDA 2Q97A 3D2EA 2QM1A 5AQHA 2E20A 4A2BA 4BRCA 3FLCO 2GWJA 4FWRA 3P4IA 5AQUA 4F9OA 2QWLA 4FWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FK4A 4CFAA 3O9QA 2YHBA 4JEPA 1IG9A 4B1XB 4OPAA 3ZT1A 5CR4A 4U67L 4I6MB 4M3UA 1LAVA 5DK5A 3QFUA 3DOKA 4XIUA 4O55A 4DTXA 1T05A 4EP5A 1QE1A 2WFBA 3LDNA 1TAUA 4FM1A 4PKIA 4JI7K 3LALA 4CF2A 3WNGA 1LV5A 3FFKB 4W5QA 3MDQA 2GELA 3MEGA 1VSKA 3TABA 3CJBA 3M1FA 3TR8A 1ZC6A 4CECA 4DFPA 1HYSA 4JRPA 1YJWN 4CHPA 4MLEA 3VQ5A 2E2PA 3WXJA 1BI4A 1GOCA 3VETA 1GLEG 4GVMA 3VQ6A 1BA0A 2F4VK 1VAZA 4E7KA 1VQMN 1NNEA 3DLBA 4B1VA 4FVMA 4H5WA 1N32K 3J8AA 5CY4A 3M8RA 4YOYA 2NZTA 3CQYA 4QOZB 1W2BM 4JHDB 3DLHA 3QLHA 5EY4A 1U6ZA 3AVLA 3C0BA 4ELUA 4XH4A 4CZKA 3VEVA 2X74A 4FCYA 2O8FA 5KQ8A 1N33K 3LP2A 4LSLA 3BDPA 4E3SA 4DV2K 3HTVA 1UOCA 1VHXA 1U4BA 2IS3A 1MU2A 5BRDA 2P1JA 1Q9YA 3G6EN 2Y1IA 4B9SA 2P9KA 3QEVA 3GG4A 3A2FA 1ATNA 4IOXA 4OPJA 1KAZA 1TKZA 2YCHA 4NLBA 4IXCA 5HRNA 4BDZA 1R0AA 2D0OA 3DLEA 2FBXA 4DV0K 1ITGA 4H0OA 3QIOA 1HQUA 3C95A 3J81O 3HXMA 3K0SA 1DT9A 1EKEA 2D4WA 1P90A 3E9PA 3VESA 1S9EA 3JS6A 2XO7A 4FZYA 3L3UA 3NH0A 2WOMA 1CXQA 2P9IB 1NGEA 4ID5A 1RDBA 4K0KK 1IKXA 3VGLA 1V4TA 3VGMA 4A57A 4C8NA 4G1QA 3O8MA 3I56N 3HM8A 4MDBA 1S1VA 4FW2A 1C0TA 5HLFA 4PA1A 3THXA 1HR0K 3M8PA 4BR7A 4DSEA 2NNWA 2QXLA 1VQON 2IDOA 3J7YP 3S9HA 3RR7A 1QTMA 1D9FA 4O0JA 3OBYA 3MXMA 2WBNA 3GOIA 2RE2A 3SBTA 3V81A 4IEIA 2FXUA 3MN6A 2W6KA 1MA9B 3L4QA 4CJPA 4DTRA 1KRPA 3UKRA 4AHSA 4KTWA 4M3XA 3KWGA 4DV7K 4DR7K 3C6HA 3ASMA 5C42A 1HYVA 2YJEA 3VQAA 1OH5A 5GAEP 4JS5A 4KH5A 4W5RA 4CFDA 4AHCA 1BOTO 3VENA 2ASMA 3AO1A 4KBOA 4BR5A 1ZBUA 4H5NA 3AVJA 1Y64A 4CJ3A 2VGNA 4JKBA 4Q5VA 2Y1JA 3NGIA 2Q1NA 4EZ9A 1SKRA 2JWKA 2RHKA 1BISA 4MO5A 1QSYA 3K9KA 3H3NO 3VEXA 2VQEK 3CC2N 2W42A 3CC7N 1XC3A 4CJFA 3EYZA 3AO4A 4LF8K 1KVAA 1IBLK 3HPGA 1NJZA 1Y97A 1YXQA 5AQTA 4CJVA 2IVNA 3FE1A 4BRDA 2C1GA 4KHYA 4BECA 1WUAA 4F3TA 4Z4CA 4BC5A 1WOQA 2HHIA 5GINA 3EEQA 4BC4A 3VF6A 1ATSA 1U04A 2HHTA 4FK0A 3O9SA 5AQVA 3OYIA 3V9WA 1GLFO 3WQUA 3JAMO 3NMUA 4UQGA 2GBZA 1YHQN 2ATQA 2E4LA 3VERA 4CJSA 1XNQK 3R9PA 2P5OA 1QVFM 4M3RA 1NBWA 5KGXA 3NGZA 3TSQA 3M5RA 3SZ2A 1KCFA 3KLFA 1MWKA 4AQYK 1JLGA 4X64K 3VQCA 3UE5A 3OJUA 3BY5A 3T1AA 3AVAA 1ASVA 3T1HK 1TV6A 2B6AA 3TAPA 2WTUA 1Q7YO 3L6QA 3W0LA 4CD1A 4GV9A 3HP9A 1GLDG 3CXCM 3RMAA 3M6GA 3K5NA 1TYQA 3QEIA 4BROA 3IRXA 2R7YA 2YHYA 5CYQA 4B8AB 4IJAA 4H03B 4DF8A 3P5JA 3MN5A 4DFMA 4ELVA 1IV0A 4FW1A 3AA4A 3PX4A 1VQ4N 3VQ4A 3ITHA 4N5SA 2O8EA 5AQQA 3LPUA 4CJKA 2A40A 4XJXA 2Q31A 3CJ9A 3SNNA 2ZGZA 3ENOA 4OGEA 1ASUA 2KKZA 2KW4A 3C6UA 1JCGA 4A61A 4GKJK 3IDHA 5HRSA 4H8KA 3AVNA 3D2FB 2XY6A 2UU9K 3VQ7A 5ELZA 4ZTJA 5EOYA 2P9UB 3HVTA 3U6FA 1OVQA 3B6OA 3SMPA 4E19A 2UUBK 5DM7L 5HRPA 1TKXA 3BEXA 2KQ2A 1NGCA 1S3XA 4NB4A 4FZXC 1RFQA 3CF5L 3ZSRA 4DS4A 1KC8O 5KGWA 1J54A 2XY8A 1SL0A 1ASWA 3V9ZA 2IGIA 4JNEA 3SAHA 2Q0UA 3JXUA 4FOEA 3A8YA 1K6YA 1GOBA 1TVRA 3CCLN 3CQXA 3V1QA 3P83D 2V51B 3FZLA 1RDCA 1HKGA 1YUWA 5AQXA 3ZX0A 4CHNA 4F2RA 1A5XA 2J4RA 3RR8A 4BDPA 4LF9K 3AVBA 4BG9A 4DSLA 3GBTA 3VOVA 4Z4GA 4AHUA 2GV9A 4JLHA 3E01A 3AVFA 4BACA 2IC3A 4PQUA 1EWQA 2ZWHA 3J80O 1R59O 3U8XA 3TSPA 4M41A 4YOTA 3D6RA 2D0AA 4IDKA 4RW9A 4J2DA 3PY8A 3VEYA 1O1WA 1FJGK 4CJ7A 3SQ0A 2E8AA 4C8OA 4DR6K 1RDUA 4OPHA 1NK4A 3G71N 1B92A 3ZETA 3SJJA 3M8QA 2X6SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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