2P9NB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 51
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nB02
5E84A 4B1XB 4AM6A 4B1YB 2Q0RA 1NLVA 5KQ8A 2GTDA 4BRIA 3CJBA 1CZAN 2QWNA 4BVOA 4CZJA 3WQTA 3O6WA 2F9TA 2QXLA 3VEWA 3VGKA 4BRHA 2NRHA 4MLEA 1IG8A 3D2FA 3QFPA 4B1UB 2FSKA 3VETA 1RDWX 4H5WA 1V4SA 5F2RA 2A5XA 2CH6A 3UKRB 4B1ZA 3HSCA 5F0XA 5AQJA 2E1ZA 3EL2A 1GLLO 1QZ6A 5BRDA 3QMLA 4FWQA 3BF3A 4BVPA 5AQMA 1BA1A 3WXKA 2A41A 5AQTA 4BROA 5BN8A 3HM8A 2P9UB 1RFQA 3CQYA 2GEMA 3EZWA 1HKBA 3WXIA 4H5VA 1H1VA 1ZXOA 3A8YA 3GG4A 2BTFA 5FPMA 4JHDB 3IUCA 4XH4A 4WQ5C 3UKRA 2CGLA 5AZIB 3R6MA 3ATVA 1TUUA 5AQYA 3VF2A 1K8KB 2EWSA 2E1YA 4CZEA 1QZ5A 4XEIA 2E2NA 5AQQA 4BR7A 4NB4A 4BQLA 1HX1A 3FZHA 3DJCA 4IZ9A 4FOIA 4BR0A 3C0BA 3U8XA 4O5FA 2P9UA 1KAYA 1RGIA 2CGJA 4BC3A 3FZMA 3CJ9A 2BUPA 4IXCA 1YXQA 2V52B 2FXUA 2YHWA 4JHDA 1HLUA 4GY2B 5AZIA 3KZBA 4EAHD 3EN9A 2V51B 1K8KA 4RTFD 4EFHA 3U4LA 3ZEUA 2VCPA 3VENA 4H0TB 3W3DA 5EY4A 2Q31A 1BU6O 3ULEB 3L4IA 5AQGA 2W40A 3O8MA 4I6MA 4EHUA 3MN6A 3DXMB 5E26A 2E88A 3CQXA 1Z6RA 3H1VX 4LC9B 4CBWA 4ISEA 1OKJA 3F9MA 1NGDA 4BR2A 4FWKA 5JICA 1XUPO 2D4WA 5BPLA 2D0OA 5AR0A 2VYPA 4IJAA 5AZJB 3WXLA 3MN7A 3GE1A 5FPEA 5BRFA 3LDQA 4J8FA 4WYBA 2YJEA 3EKSA 4FWOA 3DWLA 4PKHA 5AQIA 4FWRA 3ULEA 4HWIA 1U6ZA 4A62A 3O1WA 1QQMA 2HF3A 2QWOA 3FLCO 3UB5A 3DXKB 4CZKA 2IVNA 1KAXA 3LL3A 3IFRA 1NGBA 2KHOA 4CD3A 2ZGZA 4H0YB 3M1FA 3P4IA 1SAZA 1YUWA 5AZJA 1E4GT 2AP1A 4EIAA 2E8AA 3CJ1A 3CI5A 3LDPA 3LDOA 2Q0UA 4BGAA 4BG8A 1Q18A 1YAGA 1GLJO 2P9IB 3I8BA 4IJNA 3VEYA 5BR9A 1NGGA 5ADXH 4FWNA 3B8AX 1C0GA 2FSNA 3LDLA 5CE3A 1MDUB 3DXKA 4A61A 1MWMA 4B1WB 5ELZA 5AQVA 4A2AA 5AQWA 5BN9A 4DB3A 3GBTA 1ATRA 1NGFA 1IJJA 2UYTA 3FZLA 3A5OC 4BR9A 4K43A 1S22A 5BPNA 3WQUA 4O8KA 1NGIA 3FGUA 2P9IA 3IMXA 5EOYA 3MCPA 5EXWA 4GNIA 2IIRA 4JN4A 3ZX2A 5AFUA 4ISFA 1C0FA 1NGEA 3ZX0A 4AM7A 5BPMA 4IO8A 2AA4A 5ADXA 3ZETB 2FF6A 2FSJA 4DHYA 3HTVA 3RSEA 1X3NA 3D2EB 5BRHA 3FFKB 2E2QA 2ASMA 3H46O 3WXJA 3VERA 4C23A 4RCHA 1DKGD 3CETA 2P9LB 2FLOA 3VEOA 5AQLA 3A5LC 5LY3A 1MWKA 1WOQA 4FOEA 4H5TA 3ZEUB 1HJOA 1NWKA 2YCHA 3QFUA 5AQUA 4BC5A 4H0PA 4I6MB 2FF3B 3ZETA 3GDQA 2DPNA 1V4TA 1J6ZA 3ATUA 1ATSA 5JLFA 3D2EA 4FPBA 5EX5A 4M7YA 1R59O 2A42A 2E2OA 3AY9A 1NGAA 3M6GA 2P9LA 4E1JA 2GELA 3TPQA 1XC3A 3SLCA 5AQXA 4H5NA 3UE5A 4CZHA 2NZTA 3QDKA 2ZWHA 5KPRA 4K42A 1NGCA 2YI1A 1X9JA 1GLEG 1HKGA 2ASPA 2VWBA 1GLAG 3AARA 3WT0A 4KBOA 2I7NA 3I33A 3CIPA 3FZFA 1GLCG 3O1BA 3U9ZA 4BRCA 5B8HA 3EKUA 2YHYA 1ZBSA 2E2PA 3WUHA 2P9SB 3AAPA 4CD1A 2HF4A 3H45C 4ISGA 2P9PB 4PKIA 4XH1A 3MMVA 4EHTA 3VGMA 3KVGA 3VF6A 2A3ZA 4FL9A 4JAXA 1GLFO 1BA0A 4BC4A 3LM9A 1ZC6A 4BC2A 2HMPA 2I7PA 2Q97A 4RWTA 1BG3A 3O80A 4M7XA 4PKGA 4H0OA 1HUXA 4XH5A 3JS6A 3SK3A 1BO5O 2E20A 4MO5A 4FPAA 5TKYA 3HZ6A 4BGBA 4QS8A 3ENHA 2P9SA 1LCUA 3QBWA 2P9PA 3CJ7A 3ENOA 3O08A 3S41A 3VOVA 5BREA 2QWMA 2H3GX 3SMPA 4BRNA 1JCGA 4YDUA 3D7EO 3ZX3A 4CZFA 1KAZA 4M63C 3SJHA 4BRFA 5I9EB 4BRGA 3HI0A 3QICA 4FSVA 4PL7A 2QWQA 4CZLA 4BREA 1QHAA 2D0PA 3RSEB 3JXUA 2GUPA 1KXPA 3OHRA 4Y0WA 1XQSC 3R8EA 3H3OB 4BR5A 4BRPA 3UKUA 3FR0A 4WQ4A 1D4XA 1NMDA 5F1XA 4Z94A 2Q2RA 2WUSA 4H5RA 1MA9B 4BG9A 4CZMA 1ESVA 3H6EA 5AQNA 1E4FT 3GL1A 4BR4A 2J4RA 2GWJA 1LOTB 3TU5A 4DCHA 3GOIA 4MO4A 5AQSA 1TYQB 3BEXA 2PAVA 5AQPA 5KPZA 3MN5A 1DGKN 4H0VB 3CJAA 2A40A 3HBTA 3A5MC 4HTLA 4FWMA 4CJ7A 4FWSA 5KPTA 5FPNA 3VEZA 1QQNA 1G99A 4MLHA 3AAQA 4BRLA 3G25A 3EO3A 4YDUC 3VPZA 1SZ2A 4JD2B 1NM1A 4F9OA 1SQKA 4L3QA 3H3NO 3BUZB 3A5NC 1EQYA 3QB0A 1TYQA 4QS7A 1T6DA 4B9QA 3ID8A 3KHYA 1HKCA 4FO0A 3L6QA 1HPMA 3BP8A 3U9DA 4JNEA 1Y64A 4WQ4C 5JLHA 5AQZA 1GLDG 3LM2A 3W0LA 1NGJA 2CGKA 3VESA 3MN9A 2ZF5O 1Z05A 1U2VB 3MK6A 2QWPA 4PL8A 2HOEA 5LJVA 1QQOA 5LJWA 4JD2A 3M3ZA 5AQOA 1T6CA 3VEXA 5AQFA 5FPDA 2QWLA 4FWPA 4QS9A 5JMVA 3WEEB 5AQRA 1P8ZA 3CERA 4B1VA 2V7ZA 1GLBG 1JCEA 2P9NB 4BRQA 5AQKA 4BQZA 3MDQA 3CJCA 3O5BA 1JCFA 3A0IX 2D1KA 3H1QA 1ATNA 1NGHA 3VEVA 4K25A 3QBXA 2ASOA 1U2VA 2Q1NA 3L0QA 5EVZA 2V7YA 1X3MA 3C7NB 2GWKA 2A6AA 2ZGYA 3WEEA 3R9PA 1BWFO 2P9KB 4BRMA 3UKUB 3CHWA 3VF4A 4CZIA 1BDGA 3FE1A 2P9NA 2Q36A 2IVPA 2QM1A 4IWVA 4CBXA 2QWRA 1YVNA 3SMSA 4H03B 4CBUA 4DQ8A 4CZGA 2QW9A 1BUPA 2NLXA 4K41A 3DXMA 4A2BA 1WUAA 2YJFA 2IVOA 1S3XA 2PBDA 3BF1A 4NO7A 2ITMA 2W41A 1TUYA 4WQ5A 1BOTO 3J8AA 3C7NA 4BRKA 4BRAA 2OANA 4H0XB 2F9WA 3FZKA 3D2FB 1DEJA 5AQHA 4FWLA 4CI6A 2P9KA 3IDHA 3O4WA 2CH5A 5KQDA 4BRDA 3VGLA 5AFUH 3LDNA 1NBWA 1T44A 2YHXA 3DAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8EB 5E84A 3CC2N 4B1YB 4CJEA 1YVUA 3B6PA 1RDUA 4DUYK 1FKOA 3CJBA 1VQPN 3SYZA 2QWNA 4BVOA 4Z4GA 3VQ5A 3O4NA 2ATQA 1OVQA 5FDLA 2QXLA 1ZBLA 4XJXA 4QCLA 4OPJA 4BRHA 1CXUA 3D2FA 2QTDA 3QFPA 4B1UB 3SV4A 1QVGM 4CFAA 1RDWX 4JKGB 2VG7A 4I9QA 5F0XA 3NDKA 2E1ZA 3P31A 1BIUA 3QO9A 2KFNA 3QMLA 2HBJA 4CJRA 1NKBA 4E3SA 1REVA 1WSEA 4E7HA 3CC4N 3WXKA 4BROA 1WSFA 3THYB 2G8KA 2WC9A 1RFQA 4O44A 4M3TA 1RNHA 3IUCA 4JI0K 3UKRA 1TUUA 3T1AA 1K8KB 3DRRA 3VQAA 3NBPA 4WF9L 3CCVN 3C0BA 5J2QA 3QNOA 1KVAA 2HHIA 4FYDA 3P5JA 4FJMA 4BC3A 4K8ZA 3CJ9A 3SAFA 3M8PA 3THWB 1KRPA 2V52B 1GOBA 2YHWA 2JWKA 1SKWA 2HHQA 4O55A 2E6LA 1HLUA 4EAHD 2XRIA 3EN9A 4JI3K 2RF2A 3O3HA 3ZEUA 2VCPA 4OLBA 2YV0X 4CFCA 4UY8O 1VQ6N 3L4IA 5AQGA 4YORA 3DXMB 3L2UA 1X9SA 4O8UA 3V9UA 4DSFA 4LC9B 4JKBA 1OKJA 4CGJA 4BR2A 4K8XA 3J7ZO 2D0OA 4ILGB 4IJAA 5AZJB 3GE1A 5BRFA 3LDQA 4J8FA 2F8TA 4WYBA 1HYSA 2ZD1A 5AQIA 1K9MO 1RDDA 3WNHA 4FVMA 4YFUA 2B4JA 1VSFA 2QWOA 1BI4A 4CJLA 1A5WA 3TAMA 1KAXA 4FJNA 2OTLN 4FZYA 2O8DA 3CCSN 2GX9A 1S6QA 4V19S 3NH2A 3TABA 4H0YB 4MDAA 4DFJA 4EIAA 1FXXA 1NJIO 1VQ5N 3DLGA 4BGAA 3HK2A 3NH1A 1NGGA 4Z4HA 3E66A 3TAGA 3LDLA 5CE3A 3SUOA 3DXKA 1SL0A 3L2WA 5ELZA 4R79A 3DLBA 2HNZA 4M3ZA 5AQVA 3JSMA 3CD6N 4ID1A 1LW0A 4M42A 1HJRA 3GBTA 2DFHA 3ZSQA 1QSLA 3ZYYX 2GV9A 2BH1A 4FLTA 5EXWA 1JLCA 4DV1K 5CY4A 2IIRA 3CMAN 4C8LA 1X1PA 1QSSA 4ISFA 1C0FA 1NGEA 4ZTFA 5KGXA 2QA4N 4FVUA 2PYJA 4RW8A 2VWJA 4MQ3A 1EP4A 4LD0A 3RSEA 4DHYA 5D3GA 4CGIA 5BRHA 2Y1IA 5HOOA 4CECA 4RCHA 4EP5A 4B9UA 1O13A 4HUEA 3PIOL 4NYFA 3VQ8A 1MWKA 1WOQA 1ZBFA 3ZEUB 1Q7YO 3QINA 4AHRA 4KKOA 3AVFA 3ZETA 3J7YP 1V4TA 4KHQA 4I2PA 3ATUA 2P5GA 5JLFA 1VQNN 3T69A 2E2OA 3SQ0A 2P9LA 5C25A 3TPQA 5AQXA 1SL2A 3UE5A 1RBVA 3QDKA 2ZWHA 5KPRA 4DU1A 2YI1A 4QAGA 3V9WA 2O4IA 3C6AA 1JLAA 4H4OA 3WT0A 1E3MA 4JEPA 2I7NA 3J81O 3ISNC 3KLFA 2O8DB 3U9ZA 1Q8IA 4IFVA 1ZBSA 2HF4A 4ISGA 2P9PB 2BGGA 4EHTA 3VGMA 3KVGA 3VQPA 3VF6A 4BWJA 3CCJN 1TL3A 4JKFA 1X9MA 4Z4CA 4CK3A 4BC4A 3HT3A 3RMAA 3OVNA 1QVFM 3O80A 4H0OA 4DSIA 3JS6A 1BO5O 2E20A 4J2AA 3DMJA 2UXCK 4QS8A 3HL8A 1Z26A 3CXCM 5EU7A 4DU4A 3TSUA 2KQ2A 3VOVA 4BDZA 4B9TA 2QWMA 2H3GX 3MECA 4YDUA 4LFBK 3ZX3A 4FLVA 3SJHA 4BRFA 3AA2A 3HI0A 3QICA 3K58A 2DY4A 4BREA 4M3XA 4DUZK 3RSEB 1FJGK 2GUPA 1XQSC 2W6LA 3CC7N 3HSTB 3NMUA 4B9VA 3KKRA 3DLKA 3LP2A 3FR0A 4M41A 3LDSA 5F1XA 4Z94A 3V4IA 2G8WA 3L4QA 5CR4A 3V81A 3EE8A 3HOSA 1N5YA 2Q2RA 4UQGA 3KK3A 3KKSA 4OJRA 2EX3A 3SCXA 3ZT0A 5DM7L 1ESVA 5AQNA 4AHSA 4B9LA 4DTSA 3ZSZA 4X64K 3ZSRA 3IKMA 3AO4A 4PY5A 1DGKN 4H0VB 3P38A 1KSPA 1XI1A 3VQEA 5KPTA 1QQNA 3AAQA 3G25A 2B5JA 3EO3A 4WFAL 4NLBA 3VPZA 3K0SA 3QEIA 4RW9A 2RPIA 3PY8A 3H3NO 4CERA 5C10A 2FBTA 1C6VA 4QS7A 4CJFA 5LL6Z 1ASUA 4FK0A 3KHYA 1BQMA 4FO0A 3L6QA 3BY5A 3BP8A 3U9DA 1W7AA 4WQ4C 4JI4K 3OS2A 3VESA 2OPSA 1VSDA 1LV5A 1IKXA 1Z25A 2ITGA 4FJHA 4CEDA 1NK5A 3WXMB 3THVA 3KD5E 2VGMA 3AGRA 3M3ZA 4F3OA 1U04A 4I7FA 3CG7A 2QI2A 2OTJN 3Q7CA 3WEEB 5AQRA 1WN7A 4FLYA 2HHXA 4E7IA 2V7ZA 2Z1GA 4U7BA 4BRQA 3QLHA 1QE1A 3O5BA 4FJLA 3K9JA 3MXMA 1WNSA 3QBXA 2ASOA 3C94A 4IDHA 1WB9A 4C8OA 2RE2A 2V7YA 3F5TA 2HSTA 3C7NB 5HBMA 2GWKA 2BANA 1VHXA 4BWMA 5DK5A 2P9KB 1N36K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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