3WXIA

Crystal structure of trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase (ligand-free form)
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
513
structure length
513
Chain Sequence
b'FTMKYVGSIDQGTTSTRFIIFDERQRPVSVHQVPHTQHTPHPGWLEHDPMEIFRSACKCMSVAIAKLRQKDASFRKIEAIGITNQRETTVAWDRVTKEPLCYAPVWNDLRTYDITKKVTAELGGGDSMFASKITGLPVSTYFAAFKMRWMLENVPAVADACRRGTLCFGTIDTWLMYKLSGGKAFVTDVTNASRTFLMDLRTRKWSPELCEKLKIPMETLPEIRSNSELFGYVETDECGVAAALNERTPIMGSIGDQQSALFGNMCFEKGEAKNTYGTGCFLLMNVGEEARFSKHGLLSTVGFQVGRDGPCYYALEGAIACAGATVEWMRRNMNLFSHITECEKLARSVPGTQGIVFVPAFSGLLAPYWDPSARGTIVGMTLKTTRAHVIRAALQAIALQLNDVVGSMKRDAGLNLSSLRVDGGLSKNGLLMEIQASLLGVDILVPSMHETTALGAALCAGLAAGVWTSLEEVKAVSRRENSWKTVSPSGSAMEREAMIAEWREALKRTKWAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense
molecule tags Transferase
total genus 168
structure length 513
sequence length 513
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2014-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wxiA01
3M1FA 4XH5A 3VEYA 2NLXA 1J6ZA 1CZAN 2E88A 5AQIA 4A61A 2AP1A 4WQ5C 1QQOA 4JAXA 4EHTA 5JLFA 2A6AA 4GNIA 3VETA 4I6MA 2Q31A 2Q1NA 4BRFA 3GG4A 3JXUA 5AQTA 3ZX0A 3A8YA 5I9EB 1QHAA 2E2NA 3C0BA 4PL8A 4AM7A 1ATSA 3MN9A 3O4WA 3A0IX 2D0OA 4RTFD 4B1YB 4CZIA 2Q2RA 2E2OA 4H5RA 4NB4A 1HKBA 4PKIA 1RDWX 3EKSA 3D2FA 2IVOA 1XC3A 1HX1A 2J4RA 4WYBA 1SQKA 3U9ZA 4BR7A 3ID8A 2EWSA 4BC3A 1G99A 1QQNA 2ZF5O 4BG9A 5LY3A 1K8KB 2ZWHA 1NGEA 3UKUB 3VGMA 1TUYA 1GLEG 1YVNA 5AQSA 3EL2A 3WQUA 3R8EA 3FR0A 1XUPO 2E2PA 3CI5A 5AQXA 2E20A 4DQ8A 3I33A 4HTLA 5ELZA 3HSCA 1BO5O 4CZEA 2E2QA 5AQRA 4IO8A 4BR9A 5JLHA 3SK3A 3LDLA 3GOIA 2OANA 4A62A 5AQVA 3DAWA 1NMDA 4ISEA 3BF3A 1NGFA 4ISGA 1V4TA 3H6EA 2VWBA 4WQ4C 2P9IB 4CZMA 3BP8A 4CZJA 1ATRA 4FOEA 2YHXA 3HZ6A 1TYQA 1LCUA 3QICA 1C0GA 2GWKA 2P9PA 4K43A 2IIRA 3UB5A 4FWMA 2I7PA 3QB0A 1U6ZA 1NGGA 3IDHA 1TUUA 3H46O 2GEMA 3DXMA 3WT0A 2WUSA 4MLEA 3ENOA 3MN7A 2Q36A 4H0PA 1HKCA 5AQKA 2AA4A 3J8AA 3M3ZA 1Y64A 4BC5A 2A3ZA 5AQQA 2YI1A 1U2VA 3D2EB 4FO0A 1NGHA 1KAZA 5AQMA 3C7NB 2FSJA 5BN8A 1ESVA 3VERA 3WEEB 1EQYA 3VF4A 4CBWA 5AQHA 4BGAA 5FPEA 3F9MA 1HJOA 1BU6O 1GLLO 4DCHA 1BA0A 5AFUA 5CE3A 4IXCA 5AQGA 4BR5A 2A40A 1MA9B 4BC2A 1KAXA 1BDGA 2V7ZA 4C23A 3ATUA 3O1WA 4RWTA 3FZMA 1HPMA 4QS7A 3B8AX 3ZEUA 2VYPA 4IZ9A 1NM1A 3QBXA 3LDPA 1KXPA 3ULEA 3HTVA 3DWLA 4FPAA 2P9NA 1P8ZA 2IVNA 3R9PA 2VCPA 2GTDA 1NBWA 4B1WB 2ASPA 4B1ZA 3H45C 4IJAA 4BRLA 5BN9A 3VPZA 1JCEA 5KPTA 3BEXA 4BROA 3EKUA 3W0LA 3VENA 4JD2B 5AQLA 2CGLA 1SZ2A 2HMPA 3CJ9A 2D0PA 4CBXA 4MLHA 5AZJB 2E8AA 4FWLA 3ZETB 5KPRA 2PAVA 3FFKB 1NGJA 5ADXH 3TU5A 2P9SB 4CD1A 3ATVA 2ZGYA 2E1ZA 4I6MB 3AAPA 2YJFA 1QZ5A 3P4IA 4CZFA 1BOTO 3GDQA 3IFRA 2YCHA 4JNEA 5TKYA 2NRHA 4L3QA 4MO4A 4B9QA 3A5MC 4DB3A 5AZIB 2QWRA 2V52B 3EZWA 3FZKA 2A42A 4PL7A 4K25A 2QM1A 3L4IA 2QWOA 1E4FT 1NGCA 1WUAA 4H0YB 1YAGA 2QWQA 5BRDA 2P9LB 3CERA 3VGKA 4BRMA 3VEXA 3L0QA 4XEIA 3RSEB 3IUCA 2P9IA 3ZX2A 4BQLA 5E84A 1BWFO 2GUPA 3CJCA 4B1VA 3FLCO 3CJAA 3ENHA 1KAYA 3WXIA 5JICA 5F2RA 1GLAG 1XQSC 5AQJA 4H5VA 3HBTA 3LDQA 2YHYA 2QWMA 4XH1A 1X3NA 3BF1A 3VEZA 4Y0WA 3CQXA 3AARA 3CJBA 3CJ7A 3MK6A 4A2AA 4BRPA 1MDUB 2A41A 4GY2B 4BRDA 3H3NO 4EIAA 1MWKA 2W40A 4YDUA 4DHYA 3GL1A 4B1UB 4FWSA 1ZXOA 3DXKA 3UKRB 2BUPA 1S22A 4BRNA 2P9PB 4M7XA 3BUZB 4PKGA 4CBUA 2UYTA 3OHRA 2FF6A 3QDKA 1V4SA 3FZHA 4BG8A 4BRCA 5BREA 3VOVA 1Z6RA 1Z05A 2A5XA 1OKJA 1ZBSA 4FPBA 4BRIA 1GLBG 3U8XA 1GLCG 2F9WA 2P9UA 3U9DA 2QWNA 4BREA 4FWKA 1U2VB 1GLFO 1GLDG 3R6MA 2HF3A 3HI0A 4JHDB 5EVZA 4FOIA 4F9OA 5E26A 1YXQA 2YJEA 2NZTA 4BRAA 4Z94A 3FZFA 3QFUA 5AQYA 5FPMA 2QXLA 3MMVA 2QW9A 5AQWA 1ZC6A 2P9KB 5JMVA 1C0FA 2CGKA 1IG8A 5EXWA 1T44A 1HKGA 1E4GT 1RGIA 1NGIA 4FWNA 4NO7A 4E1JA 3LM2A 3FZLA 2PBDA 5BPNA 5BRHA 1GLJO 3H3OB 3FGUA 3O5BA 2V51B 3VF6A 1DKGD 4KBOA 4JD2A 2ZGZA 3SLCA 2Q0RA 1BG3A 1S3XA 1NGAA 4MO5A 2FLOA 5AZJA 3VF2A 1RFQA 5AQOA 4H0VB 1IJJA 3SMSA 4EFHA 3VGLA 4BR4A 2P9SA 2GWJA 2P9NB 2I7NA 5KQ8A 5BR9A 3L6QA 5FPNA 3KZBA 3FE1A 2IVPA 1K8KA 2QWLA 3UKUA 4FSVA 5AFUH 2W41A 3WQTA 3QMLA 4J8FA 5EY4A 3WUHA 3VEWA 4IWVA 3KHYA 3MCPA 1Q18A 5AZIA 3A5LC 3ULEB 2HF4A 3AY9A 3HM8A 4YDUC 1NGBA 3VEOA 3GE1A 1HLUA 2D1KA 5AQNA 5BPLA 4IJNA 3D2FB 1NLVA 2CH6A 3O6WA 4BGBA 3LM9A 2P9LA 4FWPA 3RSEA 2Q0UA 3O1BA 5KQDA 2F9TA 3LL3A 3CETA 2ASOA 4HWIA 4CD3A 3CJ1A 5EX5A 2CH5A 5AQUA 2DPNA 4EAHD 4EHUA 3CQYA 1JCFA 1DEJA 4BR2A 4H0OA 2KHOA 4BVPA 5KPZA 4FWQA 3ZX3A 2YHWA 2V7YA 1WOQA 2FXUA 2FSKA 3WXKA 4WQ5A 3I8BA 4AM6A 3CHWA 2H3GX 3G25A 3CIPA 4LC9B 2BTFA 1ATNA 4A2BA 4H0TB 4H5NA 4B1XB 3LDOA 3EN9A 4BR0A 4K42A 4ISFA 3MN5A 2FF3B 1NWKA 3D2EA 3UKRA 4CZLA 3S41A 4BVOA 3EO3A 5BPMA 1TYQB 3C7NA 4H5TA 3U4LA 3H1QA 3WEEA 4JN4A 3VESA 4BRHA 1T6DA 2QWPA 1QZ6A 1QQMA 5F0XA 1SAZA 5AQPA 3DXMB 1YUWA 3DJCA 3O80A 4FL9A 4FWRA 3GBTA 5LJWA 3W3DA 3LDNA 4H5WA 2HOEA 3MN6A 2FSNA 4O5FA 4CZHA 1BUPA 3H1VX 4BC4A 3D7EO 3DXKB 4CZGA 3SJHA 1BA1A 4JHDA 1DGKN 4H03B 3MDQA 5F1XA 3A5NC 4QS9A 4M7YA 3KVGA 3AAQA 3TPQA 5BRFA 2E1YA 2P9KA 4BRQA 4WQ4A 2Q97A 3IMXA 3SMPA 4RCHA 5ADXA 1HUXA 1LOTB 2D4WA 5B8HA 2GELA 3A5OC 4XH4A 5EOYA 3JS6A 2P9UB 4BQZA 3QFPA 4QS8A 4CJ7A 5LJVA 1JCGA 4BRKA 3WXJA 1D4XA 4CI6A 1X9JA 1X3MA 4FWOA 5AQFA 2ITMA 3VEVA 1T6CA 1MWMA 3UE5A 1R59O 2ASMA 4O8KA 3O08A 4H0XB 3ZEUB 1NGDA 3O8MA 4K41A 3QBWA 5AR0A 5AQZA 4M63C 1H1VA 3M6GA 3WXLA 3ZETA 4CZKA 4PKHA 4BRGA 2CGJA 5FPDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J1EA 1J6ZA 1CZAN 4IG0A 1Q8IA 4DS5A 4WQ5C 3PIOL 2OTLN 4I6MA 2Q31A 4JKGB 5K14A 1YIJN 5AQTA 4OKKA 3D0PA 1WSHA 4IFEA 1KSPA 4CK3A 4OO1J 3LZJA 1RDCA 1ASWA 4PL8A 3TAMA 4AM7A 1ATSA 3MN9A 2PYLA 3O4WA 2OPSA 5C24A 2Q2RA 4JI2K 2HSTA 3D2FA 3LP2A 1XC3A 4U7BA 4BR7A 3CCMN 3PX6A 4BG9A 5LY3A 1K8KB 2RN2A 1YVNA 3R8EA 4FJJA 3AVKA 2E2PA 4JI1K 1EXQA 3ALYA 2E20A 1K6YA 5ELZA 1BO5O 5AQRA 3KKSA 2KTQA 4IO8A 3MXIA 4OVLA 4CK1A 3V4IA 2BH1A 4B9VA 4A62A 4B9NA 1NMDA 4ISEA 3BF3A 4Z4GA 3C65A 3VTIA 3OS0A 2VWBA 3EE9A 3G0ZA 4CZMA 3BP8A 4FOEA 4DU3A 3HZ6A 1TYQA 1LCUA 1BCMA 2GWKA 4DU4A 3UB5A 1P90A 3LANA 3IDHA 1KD1O 4J2AA 5EU7A 1HQUA 3DXMA 4X62K 4JYAK 3ENOA 3MN7A 3NAEA 2Q36A 3J8AA 3HOSA 3HT3A 4BC5A 2A3ZA 1ILYA 4IBNA 2YI1A 1U2VA 1FW6A 4JS4A 3DOLA 2I5JA 4MDBA 5BN8A 4FXDA 3AVHA 3HO1A 3RWUA 2QI2A 3AVCA 3ZT0A 3V81A 4LFBK 3H08A 2PY5A 1EQYA 1JLFA 4EZ9A 1RBRA 3IRXA 3ZSWA 4DCHA 4CJ5A 3AGRA 4FK4A 4CJFA 4BC2A 3MWTA 3SV3A 1NK7A 2E6MA 2OZSA 4BWMA 1IO2A 3O1WA 3VMFB 4AQYK 1WAJA 4QS7A 3B8AX 3OYNA 3ZSQA 1VQ9N 3T69A 1YVUA 3LPTA 4FK0A 4YOVA 2NRXA 4JKFA 4O55A 3DWLA 4FPAA 2HHUA 1P8ZA 1FKOA 2ASPA 4FLWA 2O8DA 3OYFA 1JCEA 4N41A 4O0IA 1Z26A 1C0TA 4CJRA 3HPOA 1YI2N 2OPRA 5KTQA 2CGLA 4JI8K 2HMPA 2D0PA 1FKPA 4OPHA 3ZSVA 3ZETB 2PAVA 1J5OA 1C6VA 1S5JA 3KLFA 1U04A 3T7ZA 3AVJA 2D0BA 4GKKK 2E1ZA 1A5XA 3J81O 5C10A 3RMAA 2KFNA 2B4JA 2G8KA 4IFVA 1QZ5A 1FJGK 4G1QA 1WSFA 3T1YK 4WE1A 4PQUA 4KHPK 2NRHA 4L3QA 4B9QA 2X74A 1DLOA 2FBVA 2DTUA 4DB3A 4DV4K 4KRFA 1T05A 3FZKA 2A42A 4JK9A 1HNIA 4KI4A 4OLBA 4OKEA 5CZ1A 3MECA 3DRSA 5BRDA 4A5BA 4BRMA 3VEXA 4E7JA 3CJCA 3NBPA 4DTOA 4CFDA 3RMCA 5LL6Z 1L5UA 5JICA 4Q5VA 3QEPA 3LDQA 3HPHA 4DUYK 1JKHA 3FFIA 3BF1A 3VEZA 4GW6A 1BI4B 4IDHA 4XIUA 3PUFA 1FK9A 3CJ7A 4BRPA 2A41A 4GY2B 4BRDA 4NCBA 3H3NO 5HOOA 4EIAA 1TK0A 1HYZA 1MWKA 3IS9A 4KTZA 3GL1A 4A59A 3HP9A 2WFBA 1EP4A 4FJ7A 1TGOA 4PKGA 5M1FA 3THWA 2IGIA 5GAEP 1Z6RA 3SAFA 4CIFA 2UUCK 5J2PA 4KO0A 1EX4A 4OGEA 1ZBSA 2A1SA 1GLBG 3OYCA 4FJ5A 3U8XA 4TSXA 4DTNA 3KK2A 3U9DA 3OYAA 4FJ8A 1RTDA 4DR4K 4DSKA 1EETA 3CF5L 2KZZA 3R6MA 4BWJA 1XNRK 4JHDB 1HMVA 3Q7CA 5EVZA 4F9OA 3SJJA 3KD5E 1LW2A 1YXQA 2NZTA 4JKAA 3FZFA 3QFUA 1HYSA 4CIEA 2P9KB 1HNXK 2WOMA 1IKWA 1HYVA 1OH5A 4IOAL 4E1JA 1E4GT 4O8UA 4JI5K 4Z4IA 3DYAA 4LSNA 2PBDA 1K8AO 4PY5A 3M8SA 3KKRA 3MXMA 2OPQA 2AJQA 4CCHA 1DKGD 2DY4A 4JD2A 3M8QA 3F73A 3TAFA 2G8HA 2Q0RA 1BG3A 1NGAA 4DTRA 2FLOA 1KC8O 5AQOA 3QERA 4L8RB 4X65K 3VGLA 3JAMO 2P9SA 5KQ8A 4KHNA 3AGKA 3KZBA 1IV0A 3AVAA 1K8KA 2QWLA 2DFFA 2Z1HA 4J8FA 3WUHA 1NK5A 4Z0UA 2ZM6K 1VQKN 4M3UA 3KHYA 4LF8K 3VEOA 1RT2A 4CF2A 1RT7A 2NNWA 3P5JA 3ZSXA 3MEEA 2D1KA 5BPLA 4IJNA 4RW7A 3D2FB 4W5QA 1RBUA 2WBNA 2BDPA 4DSEA 3RR8A 4JRPA 3HK2A 4OPKA 4M3RA 5KQDA 3HVRA 3CFPA 2F9TA 1JL1A 4M45A 3OYMA 2QKKA 1EO1A 1NJXA 4EAHD 4EHUA 4BR2A 1F21A 2KHOA 5KPZA 4FLZA 1TAQA 2HBMA 2FSKA 3NGZA 2F8TA 3QINA 3CHWA 1S1XA 1VQON 2HBJA 4CHPA 3P83D 4A2BA 1VSDA 4H5NA 2XHBA 3EN9A 2RKIA 5KGWA 4K42A 4ISFA 5KRTA 4W5NA 1R0AA 3UKRA 4CZLA 3EO3A 2OYQA 4OLAA 1TYQB 4MQ3A 4H5TA 4FYDA 3RMBA 1KFSA 1IKXA 1T6DA 2QWPA 1QZ6A 3DXMB 2WONA 1KLMA 3C95A 2BANA 4YFUA 1S1TA 3SBTA 2YX6A 4DR3K 4FJLA 1ZBLA 3LDNA 4H5WA 2JWLA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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