1R59O

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
487
structure length
480
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structures of Enterococcal Glycerol Kinase in the Absence and Presence of Glycerol: Correlation of conformation to substrate binding and a mechanism of activation by phosphorylation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 83
structure length 480
sequence length 487
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2003-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O01
3LDOA 3R6MA 5AQVA 3L0QA 3QFPA 3QB0A 3QBXA 5EXWA 3ULEA 3IUCA 3DJCA 4ISFA 4BREA 5KQ8A 1YXQA 3SMSA 3BP8A 2HF4A 1GLCG 3AAPA 2V52B 2A5XA 1GLBG 2A3ZA 1Q18A 4FPBA 4EIAA 4BRMA 2OANA 3WEEB 3HTVA 1BA0A 4ISEA 2QW9A 2A6AA 2J4RA 1IG8A 2E1YA 4WQ5C 4FWQA 1NMDA 4HTLA 3S41A 4QS9A 5AQZA 3TPQA 5AZIA 2BUPA 3FLCO 3O8MA 3ZX2A 2NLXA 5AQSA 2Q36A 1T44A 4B1VA 1E4GT 3CHWA 2ZGZA 4CZHA 2GTDA 5BRHA 4FWKA 4CBWA 5TKYA 4A62A 1RDWX 3QFUA 2E2OA 4BGAA 3LDNA 3CJ1A 3VF4A 4CBXA 3U9ZA 2YHWA 1DEJA 3GOIA 2ZWHA 3FE1A 4H0OA 2V7ZA 4BQZA 2A41A 2A40A 2IVOA 2QWQA 1K8KB 1U2VB 1X9JA 3EO3A 3H45C 3KVGA 5EVZA 3VEOA 2E1ZA 3IMXA 3MN6A 1X3NA 4EHUA 3LM2A 4H03B 3VEVA 1S3XA 2E2PA 3OHRA 3H3NO 4CBUA 5F1XA 3WQTA 1CZAN 5AZIB 3UKRB 3SLCA 1ZBSA 3WXKA 4FPAA 3W3DA 1QZ6A 4JD2B 2FSNA 1HUXA 4PL8A 4MO4A 3G25A 4IXCA 1BWFO 4BRGA 3DXMA 3VENA 4A2AA 4Z94A 3GL1A 2YHYA 3DXKA 3H1VX 5BRFA 2QM1A 3ATVA 4K41A 2YJFA 3VEYA 2P9LA 3P4IA 5AQIA 1J6ZA 2D1KA 5I9EB 1C0GA 4FWNA 3QDKA 1OKJA 1XQSC 3CETA 4XH5A 3L6QA 2P9IA 2IVPA 5AQPA 1HKGA 4WQ4A 4BRDA 2D0PA 3BUZB 1NBWA 4WQ4C 4BR7A 5BRDA 1NGDA 4MLHA 3L4IA 4JN4A 1V4TA 1Z05A 2GWKA 3EZWA 3VGLA 4CZGA 2CGJA 4BRIA 4EHTA 1G99A 4H0VB 5AQYA 3UKUA 3BF1A 4E1JA 5F0XA 2GELA 3ENOA 2CGKA 1NWKA 2E8AA 2HOEA 4YDUA 5BPMA 1T6DA 3ATUA 3CIPA 1BDGA 4PKIA 3JXUA 3O80A 5ADXH 1DKGD 1NGFA 2DPNA 4F9OA 1ZC6A 3D2FB 5AQXA 4LC9B 1GLEG 2QXLA 1IJJA 3VETA 2PAVA 4BR2A 3QBWA 4BR0A 4CI6A 4BR5A 2P9IB 5JLFA 5BR9A 5FPEA 3R9PA 4I6MA 5AFUH 4FWSA 3BF3A 4FWLA 3FZLA 4EFHA 4K25A 4IWVA 4JHDB 4H5TA 4DB3A 5KPTA 4BG9A 2YHXA 1HLUA 3FGUA 3O1BA 4CD1A 3DAWA 4O5FA 4H0YB 5FPDA 1BO5O 4K43A 3HBTA 3BEXA 3R8EA 1HX1A 4MLEA 5AR0A 5B8HA 1KAZA 3CJAA 3O08A 2V51B 5AQLA 5AQNA 5EX5A 3RSEB 4KBOA 4H5VA 1TYQA 5AQTA 5BN9A 2P9NA 3DWLA 3M3ZA 2W40A 1ATSA 2WUSA 4NO7A 5AQJA 3IFRA 1YUWA 3H6EA 4IJAA 2AP1A 3GBTA 3GG4A 4BC2A 5E84A 1XC3A 2NRHA 4DQ8A 1MWKA 3M6GA 4JNEA 2I7NA 2ZGYA 3ZETA 4XH4A 2QWRA 4FWRA 4PKHA 1YAGA 4H5NA 3ULEB 4CZIA 1WOQA 3C7NA 2D0OA 1BA1A 3ZX0A 4DHYA 3M1FA 4H5RA 4A2BA 4HWIA 2HMPA 2Q31A 1BG3A 2NZTA 1JCFA 3LM9A 2FSKA 1T6CA 1NGEA 1V4SA 5JMVA 3CJBA 3A5MC 2QWPA 4M7XA 1BU6O 2F9TA 3FZKA 1JCEA 3A5LC 2FLOA 2YJEA 3J8AA 1SZ2A 1HKCA 4Y0WA 3TU5A 4BRHA 3D2EA 4L3QA 3ZEUA 5KPZA 2CH6A 4H5WA 4BGBA 1E4FT 5BPLA 4BC3A 2P9KA 1NGJA 2P9UA 1HPMA 1P8ZA 2Q0RA 1WUAA 1H1VA 2GWJA 2P9SA 4BRQA 3AY9A 4BRPA 4FO0A 3MK6A 4C23A 3H46O 2P9PA 1SQKA 4K42A 4QS7A 4BVPA 4IO8A 4CZKA 1KAXA 1NLVA 2GUPA 5AZJA 4FOIA 5AQQA 3MN7A 2YCHA 3CJ7A 4BQLA 1GLJO 5BN8A 4H0TB 3EL2A 2QWNA 3FZFA 3DXMB 4YDUC 5JICA 5BREA 3VGKA 3DXKB 4CJ7A 5KQDA 3ZEUB 3MN9A 2H3GX 2IVNA 4BRKA 2P9LB 4B1XB 5AQWA 4BRCA 1NGCA 3SK3A 3FR0A 5AQOA 3WT0A 4FL9A 2Q0UA 4BRAA 3VPZA 1RFQA 3FFKB 1ATNA 2BTFA 1HJOA 3H1QA 2ASMA 1GLFO 3I8BA 3WEEA 1S22A 3EKUA 3SMPA 3A5NC 1KAYA 2VCPA 2AA4A 3I33A 3VGMA 4DCHA 3HI0A 1RGIA 1ESVA 3D7EO 3UKUB 3VOVA 4BC4A 2E2NA 2FF3B 3EN9A 4FWPA 2F9WA 4FWOA 1SAZA 3VF2A 2FF6A 3KHYA 4MO5A 4BRFA 3A8YA 2KHOA 1GLLO 2PBDA 1JCGA 3GDQA 4CZMA 1QQNA 2ZF5O 1MA9B 2E88A 1GLDG 4PKGA 3LDQA 2A42A 1D4XA 2Q2RA 4QS8A 1TUYA 5BPNA 3IDHA 3A0IX 4XH1A 2VWBA 1ATRA 1K8KA 1U2VA 4I6MB 4XEIA 3ZX3A 5AQMA 3W0LA 3VF6A 4JAXA 4FOEA 4WQ5A 5AQGA 1TUUA 4ISGA 3O1WA 4B1ZA 3WUHA 4IJNA 1QZ5A 3MCPA 4WYBA 4BVOA 5AQKA 1NGAA 1LOTB 2FSJA 3UKRA 3WQUA 4BR9A 4H0XB 3LDLA 4JD2A 5FPNA 2HF3A 5LJVA 3B8AX 4M63C 1BUPA 1QQMA 2ASPA 1R59O 4CZJA 2I7PA 2ITMA 1TYQB 3HSCA 4CZEA 1U6ZA 2P9NB 2QWOA 3CI5A 4M7YA 5KPRA 4FWMA 3FZHA 5F2RA 1NGHA 3MDQA 3A5OC 2QWMA 4BRLA 1KXPA 4PL7A 3VESA 4RWTA 4O8KA 4B1YB 5ADXA 5E26A 5EOYA 3VERA 2UYTA 4A61A 1MDUB 3EKSA 3O6WA 1LCUA 3F9MA 5AQFA 2W41A 3ZETB 2QWLA 3C7NB 5FPMA 2VYPA 5AFUA 3JS6A 1BOTO 3H3OB 3U9DA 3AAQA 3QICA 2V7YA 2Q97A 3U8XA 1C0FA 5ELZA 3CQYA 2YI1A 5AQRA 3CJCA 4J8FA 2E20A 2ASOA 3KZBA 4FSVA 4BR4A 3U4LA 4RTFD 3UB5A 3D2FA 4RCHA 1GLAG 3UE5A 3ID8A 4NB4A 2Q1NA 3FZMA 3C0BA 3SJHA 4B1WB 5CE3A 1QQOA 3LL3A 4CZLA 5LY3A 3QMLA 3CJ9A 3O5BA 3HZ6A 3MMVA 3WXIA 3D2EB 1YVNA 1ZXOA 4GY2B 5JLHA 5LJWA 4B9QA 4JHDA 5AQHA 1NM1A 2CGLA 1Y64A 2P9KB 3VEXA 3WXLA 1NGIA 2P9UB 4BC5A 5AQUA 2D4WA 3VEWA 4BROA 3O4WA 5EY4A 1Z6RA 4AM7A 4B1UB 2P9SB 1DGKN 3LDPA 1HKBA 3VEZA 1MWMA 4CZFA 3CERA 1NGBA 3HM8A 1QHAA 2IIRA 2P9PB 1EQYA 1X3MA 3AARA 3CQXA 2EWSA 3RSEA 2CH5A 5AZJB 4GNIA 4BG8A 2GEMA 4H0PA 2E2QA 4CD3A 1XUPO 2FXUA 3MN5A 1NGGA 4BRNA 3ENHA 4EAHD 4AM6A 4IZ9A 3GE1A 3WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CMAN 3OS0A 1JLEA 3QBXA 1VSKA 3V1RA 5EXWA 3IUCA 4CERA 3L2UA 1VQ8N 3S3MA 3SMSA 2HF4A 1VSFA 1NG9A 4I9LA 2A5XA 4O5BA 1B92A 2P1JA 2G8VA 5FRMA 4EIAA 5KI6A 1BA0A 1TKXA 4JK9A 4E7KA 4FWQA 3S41A 3ZSWA 4J2DA 5AZIA 4DQPA 3DLEA 3FLCO 3ZX2A 1KCFA 4O8UA 1T44A 4JRQA 3ZT1A 3OBYA 5C25A 5LMUK 1TKTA 4LSLA 3MXJA 1RBRA 4CBWA 4CGDA 3CCVN 4A62A 3QFUA 2E2OA 3IG1A 1RT2A 1FKOA 4FXDA 3VQBA 3DLHA 4AF1A 2KTQA 2ZWHA 3FE1A 2V7ZA 4CFDA 4OGCA 1VRTA 2IVOA 3EO3A 1K8KB 5EVZA 4HCBA 1KVBA 3OYGA 4Z4FA 1D8YA 2E1ZA 4DR5K 2D0BA 4YORA 5HL7L 3KLFA 2PY5A 1WN7A 4DSJA 4IFYA 4X64K 4CBUA 3WQTA 4B8CA 4HUEA 3KWIA 3UKRB 3NH0A 4DUZK 3MXMA 1QZ6A 3S3NA 3I0SA 1RT6A 4OKEA 3NHGA 3CMEN 1BL3A 4IXCA 1NJIO 4Z94A 1YJ9N 3GL1A 4GV6A 1VQ5N 1RDAA 3TAGA 5BRFA 4Q5VA 2YNGA 3NAEA 4V19S 2YJFA 4RW9A 2P9LA 5I9EB 2D1KA 5CZ1A 4LF4K 4FWNA 4XH5A 1YI2N 4CK2A 4BRDA 3TABA 1XI1A 2O8DA 4GVEA 1LAWA 4MLHA 4A59A 2OPQA 1YHQN 3EZWA 4CJPA 5C0YA 5JS2A 4CJQA 1BCMA 1WSEA 2O8FA 3G71N 2PYJA 3UKUA 4FJ5A 3BF1A 4DQQA 4W5OA 2GELA 4LF6K 3CC2N 4NXMK 1Q86O 2YHBA 1BQNA 4F9OA 3D2FB 1N33K 4O0IA 2QXLA 1IJJA 3M5RA 3KK2A 4BR2A 4BR0A 3V6DA 3ZCMA 4BR5A 5FPEA 3N4PA 1IKYA 2XRIA 4FWSA 2F4VK 4H5TA 5CR4A 1TAUA 5T7BA 4BG9A 3FGUA 4CD1A 5FPDA 3CCJN 4K43A 3HBTA 2A1RA 4JYAK 3HYFA 1WBBA 3RSEB 4KBOA 1TYQA 3LZJA 2OTLN 3OYBA 3R3LA 2W40A 4F8RA 4YOYA 3P38A 1N32K 4F2SA 4DR4K 2O8BB 1RDDA 3D0PA 3GBTA 2NRHA 1W9HA 4IBNA 2RE2A 3OYHA 2ZGYA 3ZETA 4KB1A 4XH4A 3ULEB 2HW3A 3M1FA 1S1TA 1K6YA 4A2BA 3B6PA 3WNGA 1BG3A 4HUFA 2HHXA 2ZQBA 1YJNN 1T6CA 1S6QA 3CJBA 4YOTA 3ZSYA 3A5MC 4JKCA 2QWPA 2RHKA 4M7XA 4KRFA 3PSFA 3AO1A 2F9TA 3FZKA 1JCEA 1RT3A 3L3VA 3F2KA 2DFFA 4N76A 4LY7A 3QEXA 1W2BM 5DM7L 3HVTA 2P9UA 1WBDA 1KD1O 5MLCQ 1WUAA 4CF2A 2HHUA 1VQ4N 1W7AA 3PIOL 3HO1A 4C23A 4FO0A 3SBTA 2P9PA 4NCAA 3QEVA 4IOXA 3OJUA 5LMNK 3OVNA 4CJKA 4UY8O 4FLVA 1KAXA 4K8XA 2GUPA 1SV5A 4NYNA 3ZSZA 4FOIA 4N41A 3RMCA 1NJXA 3V9UA 4YOWA 1N5YA 3QEPA 4M45A 2NUBA 4FK0A 4OGEA 4CEOA 1TK8A 4CJVA 4C1NK 3VGKA 3AVCA 4CJ7A 3E9OA 1QHTA 2H3GX 2IVNA 5C2FA 1L3SA 2XO7A 1NGCA 4JI0K 3SK3A 3FR0A 1NJWA 5AQOA 2Q0UA 4FCYA 3SQ2A 1ATNA 1GLFO 1K9MO 3KK7A 3WEEA 4GMJB 1S22A 3EKUA 3A5NC 1KAYA 1VQMN 5CYMA 4KAZA 1W97L 3U3GA 4Z0UA 2FBXA 2E2NA 5FDLA 4KH4A 4B9SA 4E7LA 4FWOA 1SAZA 3OYCA 2HVIA 3CYMA 1XMQK 3SPYA 4MO5A 3KLEA 1JCGA 3SAFA 3GDQA 3EE8A 4GV3A 1KVCA 3K5NA 4FK2A 2UXCK 5C2DA 2ZF5O 1MA9B 2F8TA 1GLDG 4PKGA 4X66K 3LDQA 4CEQA 1D4XA 2DY4A 1BIZA 1TUYA 1U4BA 4CJRA 4DR7K 4MDAA 2E5LK 3IDHA 3QINA 4YFUA 4E19A 1O13A 5HRNA 3NH1A 4I6MB 3CPEA 3U6FA 1XC9A 1EO1A 1KVAA 3TSPA 4WQ5A 4B1ZA 1BHLA 3MX2A 3LWLA 3MCPA 1HYZA 5DM6L 4FJJA 3U3YA 4DSKA 1JLGA 4JI3K 4BR9A 5M1PA 1JLQA 4M3YA 2A1SA 4DV2K 3SAGA 2ASPA 3HT3A 3NGIA 2O8EA 3HSCA 4CZEA 2P9NB 3HK2A 5F2RA 1MU2A 3DMJA 3MDQA 1UA0A 4LFAK 1NK4A 3VESA 1VQLN 4B1YB 5KTQA 3LAKA 4DV5K 5EOYA 3NH2A 1ASUA 1MDUB 3EKSA 3O6WA 5SWMA 5HOOA 3HOSA 3F73A 2W41A 2KKZA 2B4JA 3C7NB 2VYPA 5AFUA 4DFKA 3VQCA 1BOTO 2IAJA 2O4GA 3J80O 1VQKN 3G6EN 3U8XA 2ETJA 1C0FA 4Z4IA 3CJCA 5J2NA 3KK3A 1XNRK 4JI7K 2E20A 3U4LA 5DK5A 3UB5A 3AA5X 3MEDA 1IH7A 2Q1NA 3CCMN 3FZMA 3SJHA 1OH6A 4B3SK 1DTQA 3P1GA 3K5OA 5C24A 2O8CB 3O5BA 2OPRA 3MEGA 2VWJA 1S1WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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