1R59O

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
487
structure length
480
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structures of Enterococcal Glycerol Kinase in the Absence and Presence of Glycerol: Correlation of conformation to substrate binding and a mechanism of activation by phosphorylation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 83
structure length 480
sequence length 487
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2003-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O01
2A6AA 3KZBA 1E4GT 3BP8A 1NGCA 3ULEB 2IVOA 4EIAA 1NGJA 2A41A 2E1ZA 1GLCG 5LY3A 3ZEUB 3BUZB 3I8BA 4XH5A 1JCGA 5F0XA 4XEIA 5AR0A 5AZIB 3VEVA 2AP1A 3U9DA 1HPMA 2YHYA 1NMDA 2D4WA 4FPAA 3ULEA 1KAYA 4LC9B 4A62A 3D2FB 2ITMA 1QZ5A 4CZGA 2FXUA 2P9KA 1OKJA 2IVPA 4H03B 1D4XA 4QS9A 5AZIA 3HZ6A 1YUWA 2W41A 3VESA 4BR7A 3D2FA 4CZLA 5AQKA 3CHWA 2CGLA 2DPNA 5EX5A 2IVNA 4YDUC 5CE3A 3LDQA 5AQSA 5BR9A 4H0OA 1GLEG 4BRFA 3DAWA 4A2BA 2HF4A 1XC3A 1C0FA 2QWMA 2AA4A 3M6GA 4O8KA 4FWOA 3FFKB 2QWLA 3ID8A 3HSCA 4IO8A 3BEXA 3SMPA 1QQOA 3HBTA 3S41A 4BC2A 1NGGA 2V51B 4PL8A 3MN7A 1C0GA 3UKUB 1BOTO 1GLFO 3JS6A 1RGIA 4MLHA 5AQVA 4F9OA 2BTFA 5E26A 3EZWA 2ASPA 3VPZA 4JD2A 1GLBG 3F9MA 3CQXA 1WUAA 4IWVA 3UKUA 4BRCA 1K8KB 2QXLA 2A5XA 5BRHA 4YDUA 1NM1A 5AFUA 4EAHD 1BUPA 1NGEA 4M7XA 3EKUA 3ZETA 4BR5A 3QB0A 5AQUA 1LCUA 1K8KA 3L6QA 1G99A 2YHXA 4FWPA 4BR9A 2QM1A 3W0LA 4BRKA 5BN8A 1QQNA 4FWMA 3VGKA 3ENOA 1GLAG 4FOIA 2GWKA 3U4LA 4WQ4C 5FPNA 3AARA 2ZF5O 3VEZA 4H5VA 1X3NA 3LDPA 4L3QA 4BRGA 3M1FA 1ESVA 3O1WA 3O8MA 1XQSC 2Q0UA 3DXMB 3MMVA 3O1BA 1NGFA 3CJ1A 5AQFA 3AAPA 4BGBA 2QWRA 2QWNA 2P9UB 3WT0A 4QS8A 4RCHA 2FF6A 3CQYA 2VWBA 3LDNA 2QW9A 4C23A 4DB3A 5AZJA 3ATUA 4FWNA 4XH1A 3H3NO 2BUPA 2OANA 4BR2A 2CGJA 2I7PA 1HX1A 3A0IX 1HKGA 4Z94A 1Z6RA 4HTLA 4WQ4A 1R59O 3MN5A 3B8AX 3WXLA 5JMVA 1TYQB 1IJJA 1T6CA 1DGKN 1V4SA 3H46O 3H3OB 3WQTA 3KVGA 4FWQA 3FGUA 3GL1A 3TPQA 4E1JA 4A61A 4JHDA 3MCPA 4BR0A 3O08A 3R9PA 5EXWA 5JICA 3TU5A 1TYQA 5TKYA 4BR4A 3QBXA 3CJ9A 4H0PA 2NLXA 4FWLA 2V52B 1TUYA 2HMPA 5BPLA 2HOEA 1CZAN 3QMLA 4H5NA 4CZIA 4CZEA 3KHYA 3R8EA 1HJOA 1BU6O 1KAZA 4QS7A 3VGMA 3GDQA 3CETA 3QICA 4BRDA 3SJHA 3CJ7A 4EHTA 3ZEUA 3CJBA 1HKBA 2P9NB 1NLVA 1Z05A 3VOVA 4BC5A 4FSVA 3G25A 3HTVA 5AQTA 2FSKA 5EOYA 4BGAA 1Y64A 3FR0A 4DHYA 3GE1A 5KPZA 3ZX0A 3ZX3A 2V7YA 1GLDG 2A40A 3LM2A 4PKIA 4PKHA 3UKRB 4JNEA 5AQQA 4M7YA 4FOEA 1RFQA 2J4RA 3WQUA 5ADXH 1MWKA 4WYBA 3IDHA 3GG4A 3MN6A 1TUUA 3EL2A 3RSEB 2H3GX 3EN9A 3ZX2A 1ZBSA 3OHRA 4Y0WA 5AQJA 5B8HA 4NB4A 3VGLA 3QFUA 3SMSA 4FWKA 3WXKA 4EHUA 3BF1A 2Q2RA 3LDLA 3FZMA 2NZTA 2F9TA 4NO7A 3RSEA 3HI0A 5KQDA 2QWPA 3HM8A 3QDKA 4CD1A 3L4IA 2E8AA 4J8FA 5AQLA 3W3DA 1U6ZA 4BQZA 2D0PA 4BRMA 2CH6A 5EVZA 3C7NB 4BC4A 4BRAA 1SAZA 4BRPA 2D1KA 2E2NA 5LJWA 3M3ZA 5AQNA 2PBDA 1GLLO 4H5RA 2YHWA 3C7NA 1NWKA 2ASOA 4H0YB 1NGAA 4BQLA 2E1YA 5AQWA 2I7NA 4FO0A 3R6MA 4M63C 4O5FA 3U8XA 4B1XB 2FSJA 1T6DA 2V7ZA 5AQMA 4H0VB 3H6EA 4B9QA 3WXJA 2YI1A 1YVNA 2KHOA 4CZKA 4FPBA 1Q18A 3VENA 4MLEA 3D7EO 4A2AA 4CZHA 3H1VX 3GOIA 1ATSA 4IJNA 1SZ2A 2P9LB 3LDOA 3O80A 3VF6A 4B1WB 5FPEA 1V4TA 1BWFO 1QHAA 3FZHA 1ZC6A 3FLCO 3DXMA 3SK3A 2GELA 1H1VA 1S22A 3ATVA 2P9UA 4AM6A 1YXQA 1MA9B 4PKGA 3DXKB 4BG9A 2P9PB 5F1XA 4CD3A 2P9IB 5F2RA 2GTDA 3A5OC 4FWRA 2ZGYA 4CZMA 3D2EB 5BPMA 2E88A 3O5BA 5JLHA 2FLOA 3FE1A 3JXUA 4BVOA 4IZ9A 3VF4A 1NGIA 3ENHA 3J8AA 1DEJA 4BG8A 1NGHA 2ZGZA 5I9EB 3WEEB 4KBOA 5ELZA 1ZXOA 4B1YB 5AQOA 4BVPA 5AQGA 5BRFA 4B1VA 3LL3A 1ATRA 3VEXA 4CBXA 3P4IA 4RWTA 4K25A 2Q0RA 3VETA 4JN4A 3MK6A 1IG8A 5BPNA 4ISEA 1HKCA 1QQMA 1U2VB 4AM7A 3A5LC 2P9KB 3CI5A 2ASMA 2IIRA 1KXPA 2P9NA 4BC3A 2HF3A 5AFUH 1X9JA 2P9SB 1U2VA 2VCPA 1MWMA 5AQXA 1RDWX 1MDUB 4H0XB 4CZFA 3L0QA 3UKRA 3FZLA 2GWJA 2P9SA 2PAVA 3CIPA 5AQHA 2GUPA 2YJFA 3VEOA 1BA0A 5BRDA 4DQ8A 1LOTB 4B1ZA 4K43A 5AQPA 5LJVA 2VYPA 3A5MC 1P8ZA 5JLFA 1WOQA 1YAGA 3LM9A 3IUCA 3CJCA 2Q31A 4JAXA 4I6MB 4ISFA 4JD2B 4XH4A 2QWOA 3FZFA 5AQZA 4I6MA 3SLCA 5KQ8A 4H0TB 1NGBA 3A8YA 1NBWA 3ZETB 2W40A 3EKSA 2YCHA 3O6WA 3WUHA 5AQYA 3DJCA 2EWSA 3H45C 1SQKA 3IMXA 3C0BA 1J6ZA 1NGDA 4H5TA 4PL7A 1XUPO 4GNIA 5KPRA 1E4FT 1ATNA 1BDGA 3AY9A 4IJAA 5ADXA 1KAXA 3EO3A 2E2QA 3GBTA 2Q36A 4WQ5C 3DWLA 2F9WA 2WUSA 5AQRA 4CBUA 4K41A 4BRNA 2A3ZA 1DKGD 4H5WA 3AAQA 3QBWA 4BREA 3BF3A 5EY4A 4CBWA 3UB5A 2CGKA 1QZ6A 1HUXA 4DCHA 4IXCA 3WXIA 4HWIA 2YJEA 2QWQA 5E84A 1T44A 1HLUA 2P9LA 3MN9A 4CI6A 3VERA 3A5NC 5BREA 4BRQA 3FZKA 3I33A 4BRLA 4BRIA 4B1UB 5AZJB 3VF2A 4K42A 2E2PA 3UE5A 4MO4A 5FPMA 4FL9A 4CJ7A 3CERA 3VEWA 3O4WA 2FSNA 1BA1A 3DXKA 3H1QA 2P9PA 5AQIA 5BN9A 2E2OA 4WQ5A 2P9IA 4GY2B 3QFPA 5FPDA 3MDQA 4RTFD 2Q1NA 3D2EA 2UYTA 1EQYA 4CZJA 4BRHA 2CH5A 3IFRA 1JCFA 1GLJO 2D0OA 4ISGA 4JHDB 4FWSA 1BG3A 1X3MA 3U9ZA 2NRHA 1JCEA 4EFHA 2E20A 2FF3B 2Q97A 3VEYA 2ZWHA 3WEEA 5KPTA 2GEMA 3CJAA 4BROA 2A42A 1S3XA 4MO5A 1BO5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ7N 4BWJA 1CXQA 1NGCA 2IVOA 1C1AA 1NGJA 1GLCG 1HJRA 3OS1A 3ITHA 2O8CB 5F0XA 1DTQA 1HMVA 3J7AP 3IS9A 4KI4A 2WOMA 3UIQA 3C6UA 1QZ5A 4CZGA 4LSLA 1T8EA 4JKGB 2IVPA 2F7TA 3SUOA 1YUWA 3Q7BA 5I3UA 1KLNA 3KKRA 4FLUA 3D2FA 3ZT0A 2G8IA 1RT1A 2HHWA 3C65A 3LDQA 5BR9A 1GLEG 4BRFA 2QA4N 3EY1A 3DAWA 2HF4A 3E1YA 4DV7K 3CF5L 1IBLK 1BI4B 3L3UA 4E7JA 2X78A 4M3ZA 1KC8O 3ID8A 4CEFA 2JGUA 5GADP 4IO8A 3ZSWA 4Z0UA 3HBTA 3S41A 5SZTA 1BOTO 1GLFO 1KVAA 3AA2A 4OGCA 4F2SA 5HROA 2FBTA 2ASPA 3THWA 3QNNA 4GV3A 3UKUA 1Q9YA 2XHBA 2NRZA 4JYAK 1NM1A 1BUPA 1VQMN 4M7XA 2BE2A 4FJXA 5AQUA 4IOXA 3WNFA 1LCUA 2LSNA 3CG7A 4BRKA 3TTDA 4DSKA 5C42A 3LDSA 4LFCK 3DLGA 4EP5A 4LFBK 3U4LA 4QOZB 1RT4A 5FPNA 3AARA 1VSJA 3VEZA 4L3QA 1ZYQA 3LP3A 3B6PA 3L4QA 3ZT3A 3K5LA 3T1HK 3ISNC 3O1WA 1SS6A 4JRQA 2Y1JA 4OLBA 3AAPA 3O4QA 4BGBA 2QWNA 3OYMA 2P9UB 3WT0A 4ILHA 4QS8A 1RBRA 3LDNA 3M5RA 4C23A 1RT6A 1J5EK 3PSIA 3B6OA 4C8KA 2OANA 3T3FA 5I42A 2I7PA 1HX1A 3A0IX 2OZSA 1OVQA 4WQ4A 3B8AX 4DLEA 3OYNA 1TYQB 4RW8A 1V4SA 2W6LA 4CGDA 1SL1A 3FGUA 3NCIA 4DLGA 2YKNA 3QERA 4LH5A 4H0PA 4CIGA 2NLXA 2V52B 3NFAA 4BE1A 1WSJA 3NGYA 3IRXA 4H5NA 4CZEA 1C1BA 3KHYA 3E9PA 5M1QA 4J2BA 1BU6O 1KAZA 4QS7A 1VQNN 3GDQA 3NAEA 3QICA 4BRDA 1HRHA 3CJ7A 4CGFA 4W5QA 5CZ1A 1NLVA 1Z05A 3DRRA 4YOTA 3G25A 3LP2A 4I9QA 1Y64A 3FR0A 2GUIA 1NMNA 3RMAA 3AVLA 3H08A 3ZX0A 1X9SA 1Y97A 3LP1A 4ELUA 2IGIA 1RTJA 4PKHA 1SKSA 4GW6A 1KSPA 4JI1K 4CHYA 4FOEA 1RFQA 2J4RA 3O3FA 1MWKA 4WYBA 4HCCA 4KPYA 3RSEB 3T19A 3LALA 4E7HA 3CCLN 3HXMA 3BY5A 4FLYA 4FWKA 4AQYK 3PLAA 4C8LA 3CCQN 2Q2RA 3SJJA 4O5BA 4DWIA 1VSHA 4OPKA 4ID1A 5KQDA 2WTUA 1WLJA 4J8FA 3W3DA 2O8FB 1D5AA 1LWCA 4FCYA 1JLFA 3VA3A 3AVFA 3E01A 4CECA 4CHNA 3M3ZA 1TL3A 1EWQA 3AVHA 4EP4A 4DR6K 2QKKA 4E7IA 3N4PA 3OYIA 4FZXC 2I7NA 3R6MA 3HPHA 3PIPL 4LF4K 3QESA 1RDBA 1T6DA 5DM6L 4YOVA 3J7YP 4B3MK 1IBKK 4CFCA 1X9MA 1TKTA 3RWUA 1TAQA 4WE1A 4CZKA 2NRXA 3VENA 2JLEA 4LF6K 3D7EO 4R79A 1TKDA 1J53A 3H1VX 3DMJA 4CJ3A 4DFPA 4DKWA 3VF6A 4FJ9A 1XMQK 1BWFO 1QHAA 3KKSA 3LANA 1M90O 4FM0A 1QVFM 1FKPA 1J5OA 2UUAK 4DF4A 3L3VA 3C6AA 1S22A 2BGGA 2G8KA 4AM6A 4A57A 4DV0K 4JI7K 4AHRA 1ITGA 4CD3A 1F21A 5F2RA 1NKCA 2GTDA 3D6RA 3D2EB 5BPMA 1S6QA 4M3WA 5CYQA 1S1WA 2FLOA 3FE1A 4IZ9A 2OA8A 3CC4N 3ZSZA 3VF4A 1NGIA 4FJ5A 1DEJA 2YHBA 4TSXA 2ZGZA 3TSPA 3WEEB 1C1CA 4LF8K 1ZXOA 1Q81O 4DSFA 5AQGA 5BRFA 4DR3K 3O9UA 4N47A 4K25A 3CYMA 2Q0RA 3VETA 3TAMA 3MK6A 1IG8A 3VTIA 3RRHA 1FKOA 3K9JA 4ISEA 1J54A 4B8CA 1ZBIA 4V19S 3HM9A 4JKEA 3A5LC 3QEIA 2P9KB 3RVCA 5BR8K 1O1WA 2P9NA 3NVKA 1WBDA 5KGWA 2R7YA 4FJIA 1M1KO 2P9SB 1I39A 5AQXA 4DV6K 4KHYA 3FZLA 2GUPA 5CR4A 1U47A 1BA0A 2QEXN 4DR4K 2HBLA 3OYLA 2HNDA 2RHKA 4B1ZA 1VQ9N 3THVA 3MWTA 5JLFA 5GIPA 4DTNA 5FROA 3QIOA 4NYNA 2Q31A 3VQ6A 4DR5K 1HNXK 1TKZA 3NGZA 2OPSA 1CZ9A 2BDPA 3P39A 2UUBK 3E66A 4IDKA 3JSMA 1KTQA 2KQ2A 4PQUA 4H8KA 2W40A 3NF8A 3I8DA 2QKBA 5AQYA 1SQKA 3IMXA 4NYFA 1XNQK 1J6ZA 4PL7A 4H5TA 4DV1K 1XUPO 1NJZA 4Y1CA 4CJFA 3OYBA 4B3SK 5ADXA 1KAXA 1ZBUA 1XNRK 4BWMA 2Q36A 2F9WA 5HRRA 4FLXA 2A3ZA 2O8DA 3DRSA 3G71N 3BF3A 5EY4A 4OO1J 1RT3A 1QZ6A 1HUXA 4DCHA 5M1OA 3J80O 2Y1IA 1S5JA 2QWQA 5E84A 2KFZA 4CI6A 3VERA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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