1R59O

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
487
structure length
480
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structures of Enterococcal Glycerol Kinase in the Absence and Presence of Glycerol: Correlation of conformation to substrate binding and a mechanism of activation by phosphorylation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 83
structure length 480
sequence length 487
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2003-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1r59O01
4BREA 4CI6A 2FF6A 3WT0A 3H1VX 3BEXA 4H0OA 3VGMA 2D0PA 1U2VA 5EX5A 3O80A 5F2RA 2NRHA 1HKGA 5BN8A 3SK3A 1BDGA 4DCHA 4BROA 2HOEA 2E1ZA 5AZIA 5AQLA 4I6MA 4C23A 2P9IB 4XEIA 3WQTA 2YHWA 4QS9A 2CH5A 3VEOA 2Q2RA 3MK6A 5EVZA 3GDQA 5BRFA 4WQ4A 4CZIA 1GLJO 5AFUH 4H5TA 1T6DA 3LDPA 4B1YB 2I7PA 4H5NA 1BO5O 5BPNA 4BRFA 1OKJA 3HBTA 3WXLA 2BUPA 2OANA 3GOIA 3KZBA 3QBXA 3S41A 3H6EA 2QWRA 4RCHA 3AAPA 3AAQA 5AQYA 1KXPA 2YHXA 4BGAA 1HUXA 2P9IA 3CQXA 5BN9A 3O4WA 4PL8A 3ZETB 1WUAA 2EWSA 4CBUA 1WOQA 1XQSC 4EAHD 2CGLA 3GG4A 2A40A 3A5NC 4CZGA 3JXUA 4CZEA 4A2BA 3CJAA 3BF1A 2IIRA 2FLOA 2ZWHA 5AQZA 3CIPA 3HSCA 2E2QA 4PKGA 5BRDA 2P9UB 3D2EB 4K43A 4FWSA 2VWBA 1NWKA 5EOYA 3DXKB 3KHYA 3H45C 5AQSA 4BR0A 1T6CA 1NGGA 1NMDA 1XC3A 4FO0A 2PBDA 3ZETA 3FR0A 3IUCA 4BVPA 2A42A 1HX1A 4QS8A 2E1YA 4IJNA 5AQNA 1KAYA 1ESVA 2YCHA 3IDHA 4H5RA 1U6ZA 2P9UA 4BQLA 3D2EA 4EIAA 2E88A 3WEEA 2WUSA 3ZX3A 3DXKA 4EHUA 1NBWA 5KQDA 5KQ8A 4BRKA 1ZC6A 3W3DA 2E2PA 4BRGA 3JS6A 3UKUA 4L3QA 4BR2A 2ZGZA 2QWPA 3QBWA 1KAXA 2F9TA 4YDUC 4CZJA 1NGIA 4NO7A 5AQPA 1BUPA 3A8YA 1ATSA 3UKRB 2A6AA 1GLEG 3FZKA 3HTVA 2D0OA 4JAXA 4BC3A 4EFHA 4H0TB 2UYTA 2W40A 3VERA 4BC4A 1TYQB 2P9KB 4IO8A 4XH1A 3H3NO 4CZKA 3U4LA 3VEVA 3LM9A 1DGKN 1BWFO 2CGJA 3EZWA 2Q1NA 2FXUA 1Y64A 3WXIA 1DEJA 4B1XB 5BR9A 2E2NA 4BG9A 2FSNA 5LY3A 2Q31A 2D4WA 2NLXA 2A5XA 3ZX0A 3UKRA 3CI5A 2VCPA 5JLHA 1MA9B 4BRHA 4B9QA 5JMVA 4FWNA 3ID8A 3MN7A 1TYQA 1Z05A 4JHDB 3EL2A 2P9KA 4RWTA 1TUUA 4BRAA 2QXLA 3WUHA 4M7YA 3VOVA 2VYPA 3MN5A 3RSEB 4M63C 3MN9A 1K8KB 3CETA 3FGUA 3EKUA 2P9NB 3CERA 4BR9A 3BUZB 3O8MA 4MLHA 1C0GA 3GE1A 4PL7A 5ELZA 3LDQA 5AQTA 4JHDA 5EXWA 1JCFA 5AQFA 4BC5A 4B1WB 1Q18A 3C7NB 4F9OA 2Q36A 4XH5A 2HF3A 1NGAA 2CGKA 2E2OA 3HZ6A 3VF6A 1NGFA 2AP1A 4H0VB 3RSEA 1ATRA 3QFPA 2YI1A 3GBTA 3ZEUB 1E4GT 4FSVA 1K8KA 3CJ9A 2P9NA 3ATVA 4IZ9A 4FWPA 5B8HA 4FPBA 3FLCO 1DKGD 4YDUA 4A62A 4O5FA 1YVNA 4B1ZA 4Y0WA 5AR0A 5AFUA 1LOTB 4FWMA 1GLDG 1HKBA 4CD3A 4CZFA 4KBOA 3C7NA 3AY9A 4BRNA 3MMVA 2H3GX 3IFRA 4H03B 1NGDA 3DAWA 1EQYA 5KPRA 4A2AA 2ASMA 1BU6O 3O1WA 1V4TA 3LDOA 1BA1A 4BRLA 3FZFA 4WYBA 1GLLO 3O08A 1NGJA 3QFUA 1RDWX 1C0FA 2E20A 3SMPA 5LJVA 1X3MA 2HF4A 3M3ZA 3IMXA 3A0IX 4K42A 4FWQA 4AM7A 1BA0A 1IG8A 3M6GA 4GY2B 2I7NA 3VPZA 3MDQA 3WQUA 4M7XA 3EKSA 3O5BA 4CZHA 3FZMA 2IVOA 1MDUB 2IVNA 2V7ZA 5JICA 2YJFA 3VF4A 1QZ6A 4FWRA 3CQYA 4CD1A 1TUYA 2A41A 3AARA 4BRMA 5BPLA 3ULEB 4CJ7A 4DQ8A 2QWOA 1ZXOA 4BR7A 4BRPA 4HTLA 4BG8A 2CH6A 4GNIA 4RTFD 1NM1A 1YXQA 3KVGA 2V51B 4HWIA 4CZLA 5E26A 5AQVA 1NGHA 3CJ1A 2GELA 3F9MA 2BTFA 5BRHA 2QWLA 2FF3B 4MO5A 3FFKB 4K25A 2P9LB 3VEYA 5AQMA 5BREA 2AA4A 2NZTA 1LCUA 3ENOA 4ISFA 4BRQA 5AQRA 3GL1A 5TKYA 4FL9A 3CHWA 4LC9B 2GWKA 1QZ5A 3A5LC 5JLFA 1SQKA 5FPEA 2P9PB 1NGCA 3W0LA 2QW9A 1YAGA 5AZIB 3LDLA 5I9EB 3P4IA 4DHYA 3HI0A 2P9SB 3R6MA 4JN4A 4XH4A 2J4RA 1RFQA 2ITMA 2GEMA 4MO4A 2P9LA 3EO3A 5CE3A 3H46O 4BRCA 4AM6A 1QQMA 5AQHA 5AQOA 4BRDA 2ZF5O 5AQJA 3D7EO 3UB5A 1YUWA 3DXMB 3U9DA 5KPZA 5FPMA 3TPQA 4O8KA 1XUPO 1CZAN 3TU5A 3G25A 2P9PA 3VETA 2IVPA 2Q0RA 1KAZA 3I8BA 3VESA 2P9SA 4E1JA 4FOIA 1J6ZA 3O6WA 2A3ZA 4BC2A 3M1FA 5FPNA 4Z94A 4WQ5C 1MWMA 1BG3A 2FSJA 4JD2B 1S22A 4ISEA 3VGLA 3QB0A 5LJWA 4FWOA 1QHAA 3H3OB 1NLVA 3BP8A 3DXMA 5AQIA 1H1VA 1R59O 4BR4A 5KPTA 1GLFO 2YJEA 3R9PA 1X3NA 3UE5A 1GLBG 3FZLA 3ATUA 4FWKA 4PKHA 3LM2A 1ZBSA 4B1VA 1NGBA 1E4FT 2ASOA 3B8AX 3ZEUA 2FSKA 3QICA 2Q0UA 5AZJB 1HLUA 1MWKA 3VEXA 2QM1A 5AQKA 3VEWA 1D4XA 4JD2A 2V52B 3FZHA 5BPMA 3U9ZA 2QWQA 1QQOA 2V7YA 3SMSA 3L0QA 4DB3A 5ADXH 4MLEA 3SJHA 1V4SA 1HKCA 2ASPA 3MCPA 3A5MC 3WEEB 4IWVA 5E84A 4CZMA 3ZX2A 3U8XA 3CJBA 5F0XA 3L4IA 3UKUB 3A5OC 5AQWA 1Z6RA 5FPDA 4BVOA 3VF2A 3D2FB 4J8FA 2Q97A 3HM8A 4WQ4C 4CBWA 3C0BA 5AZJA 3R8EA 4CBXA 2DPNA 3WXKA 3OHRA 3BF3A 4NB4A 2D1KA 1SAZA 4H0XB 5AQQA 2E8AA 1JCGA 5F1XA 4BR5A 5ADXA 4A61A 4B1UB 3DJCA 3QMLA 3DWLA 2GWJA 1JCEA 3O1BA 3LDNA 1T44A 2QWNA 3VEZA 5AQXA 4K41A 1RGIA 3D2FA 4PKIA 4BQZA 1X9JA 3SLCA 2ZGYA 3CJ7A 3QDKA 2YHYA 3I33A 3EN9A 1GLCG 1ATNA 4FWLA 4ISGA 4FPAA 3MN6A 3CJCA 2GUPA 4WQ5A 1S3XA 1SZ2A 4H0YB 4EHTA 3H1QA 1HPMA 2GTDA 5AQUA 1GLAG 3ULEA 1HJOA 1U2VB 2W41A 3VGKA 1BOTO 5EY4A 1G99A 2HMPA 4JNEA 1IJJA 5AQGA 3VENA 4BGBA 2PAVA 4BRIA 4H5VA 3FE1A 3WXJA 4QS7A 4I6MB 1QQNA 3ENHA 4IXCA 3J8AA 2F9WA 1NGEA 4H5WA 3LL3A 1P8ZA 3L6QA 4H0PA 2QWMA 2KHOA 4FOEA 4IJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF6A 3WT0A 3NGIA 2HSTA 1IBLK 2W6KA 3LP2A 3O4NA 1U2VA 3P39A 3O80A 5EX5A 3K5LA 5BN8A 2O4GA 4N76A 3VMFB 3SK3A 3BZCA 3T69A 5AZIA 4I6MA 4IOCL 4C23A 2PZSA 2UUBK 2WC9A 2YHWA 4QS9A 1SKRA 3VEOA 3HP6A 5EVZA 3CQ8A 3AO2A 3GDQA 5BRFA 2KZMA 4CZIA 1GLJO 2OZSA 4KHWA 4JKCA 1T6DA 3OW2M 4JKGA 3LDPA 3OYJA 1KVBA 1IKXA 1KLMA 1OKJA 3HBTA 3AA4A 4KHSA 3HYFA 3I0RA 4RCHA 1KXPA 1TL1A 2YHXA 4BGAA 2P9IA 3O4WA 3CPEA 2EWSA 4CBUA 1S1WA 1WOQA 1XQSC 3G4SN 1I94K 4ILJA 4EAHD 2CGLA 4B8AB 2A40A 3A5NC 1A5XA 4FVUA 1D9FA 4E0DA 3VN5A 3QEVA 1RTDA 5BRDA 3DLEA 2IC3A 5C10A 3RMCA 4A5BA 4JI8K 4IFYA 4DTNA 4K43A 4FWSA 1VSFA 2VWBA 5CYQA 3KHYA 3H45C 3RMBA 4KI6A 1NMDA 1RTHA 4NXNK 3ZETA 1CZBA 4WFBL 1ILYA 3V4IA 4HTUA 3E9OA 4IJNA 2O8FA 4AILC 1KSPA 2Z1HA 1BQMA 4J2AA 2P9UA 3SUOA 3D2EA 1YT3A 1C1CA 3WEEA 5KQDA 3ISNC 4EHUA 4CJQA 3SQ2A 3SUNA 1YTAA 3W3DA 4CGIA 4BRGA 4CVNE 3UKUA 4B3OA 2QWPA 1S5JA 4O8UA 3AVFA 4NO7A 1BUPA 3UKRB 3PX4A 3HTVA 2D0OA 3K2PA 1BL3A 2HBMA 4NLBA 2NRVA 2VG6A 4IO8A 4XH1A 2KTQA 4F8RA 4DQSA 4M3XA 4CEDA 1TVRA 2JGUA 1Y64A 3TAQA 3NVMA 1DEJA 1IO2A 2E2NA 2A5XA 5JMVA 4FWNA 4LSNA 4DU3A 3HOSA 1CZ9A 3RVCA 4CHNA 4FK4A 2P1JA 4OKKA 3EL2A 3P38A 4DG1A 4JKHA 3LPTA 3OYLA 1TKDA 3SAHA 2QXLA 3K5NA 3NF9A 2VYPA 3OYIA 4M63C 5JS2A 4OJRA 4CJVA 1K8KB 4CK3A 1U04A 3EKUA 4JKDA 2RHKA 3CERA 4FJKA 3SNNA 2QTDA 1TKTA 3GE1A 1RT3A 1R0AA 4YY3K 1NJXA 4PL7A 2DTUA 4M3UA 2XY5A 4M3ZA 3WNGA 5GAGP 4FLTA 5AQFA 1VQON 1LW0A 3DLLL 4EZ9A 3SBGA 3RSEA 4FM1A 1WSFA 1B9DA 3ZEUB 3VQCA 1E4GT 4MDBA 3O9TA 4CJRA 1XMQK 3FLCO 4A62A 3DMJA 4DTOA 2PY5A 5E41A 1KTQA 4I2QA 5AFUA 1LOTB 4FWMA 3NF7A 1JLCA 4OPHA 4RW4A 4JI0K 3IFRA 5KTQA 3D6RA 3SV4A 3IS9A 4DFMA 3AV9A 3LDOA 4JKFA 4DS5A 4M45A 4BRLA 5GINA 3KLFA 4BE2A 4WYBA 4C8NA 1QSSA 4QCLA 1GLLO 3O08A 3QFUA 4KH4A 2HF4A 3M3ZA 4IEIA 4K42A 2QK9A 4FWQA 5M1NA 2UXCK 4H4MA 1QVGM 1E3MA 4C1NK 1HNIA 3CCMN 1LV5A 4LFCK 1L3TA 2KFNA 1SKWA 2I7NA 3UIQA 2HBLA 3MDQA 4YOYA 1XI1A 2VGMA 1W0HA 4M7XA 3EKSA 2UXBK 1KC8O 2D0AA 1MDUB 2V7ZA 3THWA 4B08A 1VSIA 4ZTJA 1RT1A 1TUYA 2AJQA 3AARA 2VG5A 4BRMA 4RW7A 5BPLA 4FJ5A 3CD6N 4CJ7A 4DQ8A 3HK2A 3F5TA 4PUOA 4BR7A 3B6OA 1BIZA 3SI6A 3EE9A 4GNIA 4IKFA 1NM1A 3E1YA 3NH1A 3CCVN 2WONA 3AVIA 1ZBIA 2NRZA 3KVGA 2Z1GA 5GAHP 4ICLA 5E26A 1NGHA 2YKNA 2G8FA 1RT4A 3HO1A 5BRHA 4K25A 1Q9YA 2Y1JA 1TGOA 2NZTA 3ENOA 4B9SA 3J7AP 3TR8A 1NJWA 4F4KA 3VA0A 3RR7A 1RNHA 4DQPA 2KW4A 4RW6A 4KI4A 3AO3A 1YI2N 4N56A 3W0LA 4FCYA 4CHQA 4M41A 4JN4A 4XH4A 2FBTA 3K59A 1LWCA 2X74A 4MO4A 2P9LA 4JYAK 1GOCA 4CF9A 1VQ8N 1QQMA 1ZBUA 2ZF5O 4JV5K 3C65A 4U67L 4YORA 2HNYA 3TPQA 4O8KA 3AGRA 3VTHA 3AO4A 3TU5A 1TL3A 2IVPA 2O8EA 3HT3A 3VESA 1RBSA 4DS4A 4FOIA 3O6WA 2HNZA 1HR0K 2FSJA 4ISEA 1KD1O 3ZCMA 4AHSA 5LL6Z 1N8RO 3AA5X 4FWOA 4E1MA 1R59O 4BR4A 4CESA 2YJEA 1RTIA 4JI2K 1WBDA 1NK6A 4IOXA 2VQEK 3NVKA 5GIPA 1JL1A 4HVJA 1NK8A 4W5OA 3THYB 4KTQA 1VQNN 3QERA 1E4FT 4BWJA 3B8AX 4MFBA 4MDAA 3ZEUA 3CMEN 2FSKA 4IG3A 4KHYA 2P5GA 3OYBA 1HLUA 4IFEA 1GOAA 3NAEA 1D4XA 4JD2A 1UWBA 2V52B 3J7YP 5BPMA 3SMSA 4IG0A 4DB3A 5SWMA 3NHGA 4MLEA 3SUPA 1V4SA 2ASPA 3MCPA 4DTUA 4IFVA 4CJEA 2IOCA 3A5OC 5HBMA 3HXMA 1WSJA 4YOWA 3HM8A 2O8BA 3WXKA 3OS0A 3NCIA 5CZ2A 3K57A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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