1J9AA

Oligoribonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SHMSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERIKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords OLIGORIBONUCLEASE
publication title The Crystal Structure of Haemophilus Influenzae HI1715, an Oligoribonuclease
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2001-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1j9aA00
1SL1A 2KQ2A 4GMJB 4DQPA 4NCAA 3L2WA 4Y1CA 2D5RA 3ASMA 3VQPA 3KK2A 4N56A 1WSIA 1LAWA 3AVAA 4M45A 1HYZA 4CJ5A 1Q8IA 4NCGA 4CF1A 4QCLA 1RBUA 1J54A 3T19A 3AA5X 3VQEA 3QESA 1NK7A 3KTQA 4CEBA 4CF9A 1FKPA 3QNOA 1C0MA 4I7FA 2YV0X 3VQ5A 3V81A 3NDKA 3QNNA 1ZYQA 3SQ0A 4EZ6A 1BI4A 4O4GA 3DRRA 2HNYA 1Z25A 4FJLA 3HPOA 3T3FA 5HP1A 2BE2A 3A2FA 4IFYA 3OYMA 4B8AB 3PO5A 1G15A 4PA1A 3RMDA 4FK2A 4AHRA 1KRPA 3I0SA 5KRSA 3I8DA 1HNVA 3S3MA 4CK2A 3L2QA 1IKVA 1QSSA 1N6QA 3KKSA 1CZ9A 1EXQA 3V9ZA 1FKOA 3ZSZA 1DLOA 1ITGA 2JLEA 4HUGA 1BQNA 4RW8A 4DSEA 1NKBA 1BIUA 2G8WA 1WSEA 2PZSA 3V9UA 3BDPA 2B5JA 1IH7A 4C8OA 4OKEA 4CHOA 3NH2A 1S9GA 4C8MA 1ZBLA 4JS4A 1NJZA 3FFIA 1RDCA 3DM2A 4FLUA 1JXBA 4Q0BA 1C1AA 1RDDA 4OJRA 1U47A 3ZCMA 3HO1A 3AO4A 3ZT0A 4KHNA 4DTJA 4HTUA 1SUQA 1LWCA 1LW2A 3AVHA 3NH0A 2VG5A 1HQUA 1XWLA 2FC0A 2A1RA 4IKFA 3SV4A 3AVCA 3RRHA 2HVIA 2VWJA 3ZSXA 4E7IA 3AA4A 3DRSA 1DTQA 3OYNA 3TAFA 3HP9A 1KTQA 4I2QA 1LAVA 3AA2A 4FCYA 3LZIA 1JL2A 3T1AA 3TARA 2D0CA 4KTZA 1WSHA 2P5GA 4CJQA 4CGDA 4CJVA 4CGGA 3NBPA 1IKWA 4J2BA 4M3YA 4ELVA 2OPPA 4F2RA 4PY5A 4H8KA 3K58A 5SWMA 1FXXA 1BI4B 1SV5A 4G1QA 3QERA 1T8EA 1ZBIA 1S1XA 1L3TA 1KFDA 4DSIA 1WLJA 3K59A 3IS9A 1C1CA 4OLAA 5CZ1A 3SQ1A 3DLGA 2DY4A 3WNFA 3OYGA 2YKMA 4MFBA 3SUNA 4DWIA 4Z0UA 5J2MA 1VSFA 4IG3A 4OPKA 1B92A 5KI6A 4JLHA 3EZ5A 2DTUA 4KHUA 2G8UA 4HHTA 5HRPA 3HSTB 5C24A 1SKWA 3L8BA 2OYQA 1L3UA 1D9DA 1TVRA 2GUIA 3DLBA 4FJMA 4KI6A 2G8IA 1JKHA 3NE6A 3U6FA 5CYQA 3TAQA 1TGOA 3QINA 3HL8A 4N5SA 3QEIA 4F2SA 5HRNA 5CY4A 4AHVA 2D0AA 3OVNA 4CF2A 3HK2A 4AHTA 4IDKA 2W42A 3F73A 2E6MA 4CEQA 3QEWA 3D45A 2B4JA 3KD1E 1RT7A 3SYZA 3KLHA 2QK9A 5KGWA 4FK0A 3QLHA 2BGGA 2Y1IA 4F3TA 4B9SA 4DMNA 2OPRA 3HVTA 1BHLA 1KSPA 4N76A 3CG7A 5JS2A 3TI0A 2YNGA 1W0HA 4IBNA 1T7PA 1X1PA 3UIQA 2I5JA 2KW4A 4HCCA 1NKCA 3AO3A 4JRPA 4FM2A 4LD0A 1QQCA 1D8YA 1ASVA 1F21A 4B9TA 4CF0A 1A5XA 3HYFA 4DLGA 4DQIA 2F8SA 3LZJA 3ITHA 4E7LA 4CGFA 1RT4A 3V1OA 4J2EA 4RW7A 1BQMA 1UOCA 4B08A 2XY7A 3V6DA 5HROA 3OJSA 1NK6A 1RTDA 3S3OA 1RILA 1UWBA 2QKBA 1WSJA 3QIOA 4JS5A 4E7JA 4O0IA 3THVA 1J5OA 4CJ3A 2KFZA 3DRPA 3M8RA 4R5PA 1SKSA 3RR7A 4FW2A 2X6SA 4FJNA 4CFCA 4CE9A 2BANA 3KIOA 3LWMA 1Q9YA 1YTAA 1CXQA 4CERA 4MQ3A 4PWDA 1NOYA 4FLYA 1CLQA 3AVNA 4AHSA 3WNEA 2YNIA 2PY5A 2YKNA 4RW9A 3LP1A 5EU7A 1EX4A 3K57A 3V9SA 3OYAA 1X9SA 4DS4A 3AVBA 4CK3A 1S1UA 4DU4A 4DTNA 1VSEA 1FK9A 2DFFA 3QO9A 4AHUA 4CJKA 5CYMA 4YNQA 3L2RA 4DTSA 4FJHA 4OKJA 2HHWA 3C95A 1IO2A 3P5JA 4DU1A 3DOKA 2GV9A 5FRMA 3TWHA 4FJKA 3LWLA 2F96A 1NKEA 4CESA 4C8NA 2IOCA 3TAMA 4C8LA 1LWFA 4E1NA 4FVMA 1C0UA 2OZMA 1I3AA 3QIPA 1S6QA 3L2UA 1SL2A 4F4KA 2O4IA 1VRTA 1L3VA 1NOZA 3CYMA 4CK1A 2HNDA 5HBMA 4DTOA 1VSDA 4JRQA 5HLFA 1JLFA 4ELTA 3SJJA 2WOMA 4TSXA 1QE1A 4CEDA 4CJSA 4KHQA 3JYTA 1U4BA 2DFEA 4ZHRA 3ZSYA 1BL3A 1Z26A 4Z4IA 1N5YA 1IKYA 1KCFA 3MEGA 4W5TA 4CEEA 3OYKA 1TK0A 3V1RA 3OYDA 2JGUA 3CFOA 1B9FA 2ATQA 3K5NA 3OYJA 1T05A 3I0RA 3ISNC 3KKRA 3KLGA 2HHXA 2BDPA 4DG1A 4CCHA 1GOBA 3ZT2A 3PX4A 1NK4A 2F8TA 4RW4A 2Z1HA 4Z4CA 1VSIA 3VQAA 4M3XA 4E1MA 4DFKA 2XO7A 4FJGA 3NFAA 2B6AA 4CJLA 3LANA 2Q3SA 3AVIA 1KFSA 3OJUA 2FBTA 3C6TA 1EP4A 2HB5A 4W5RA 3SQ4A 2FBYA 5FDLA 1QSYA 4DTUA 4DQRA 4CHZA 1UAXA 4B9NA 4FLTA 3LPTA 5D3GA 4FJ5A 1JLBA 2P5OA 2RKIA 1U49A 3DI6A 4Y1DA 4BWJA 1RBRA 1JLQA 4ICLA 3MXJA 3TAPA 4Q5VA 4CGIA 5K14A 1UA1A 1RCHA 2D0BA 4DS5A 4KHWA 3E01A 1J9AA 4M3RA 4KHSA 2ZD1A 3U3GA 4DQQA 3QEVA 3KK3A 3RMCA 4O5BA 1IG9A 1NK0A 3HPHA 3DMJA 3P1GA 1S1WA 2FBVA 4M3WA 3SNNA 3K2PA 3KD5E 3DLEA 5HRSA 4NCBA 3TANA 2YNHA 4ZTFA 4FJJA 1KVBA 4UQGA 4CHNA 1CXUA 3D0PA 3HP6A 2X74A 3NH1A 3VA0A 2E4LA 1NJWA 3QEPA 4CJTA 1YTUA 3AV9A 1HPZA 1BISA 4DTRA 4ID1A 1S9EA 4E89A 2P51A 1CZBA 2IGIA 1U45A 1VRUA 3ZSWA 3LAKA 1KVCA 3LALA 1RT6A 4IG0A 2EHGA 4KTWA 2EX3A 1EKEA 5FROA 4CJEA 4FK4A 4FXDA 4CGHA 4CJUA 3NF6A 3O3HA 4DQSA 3NHGA 1JLCA 1I39A 2ITGA 3SPZA 1NK9A 4FJIA 1TL1A 1SKRA 4K8ZA 3QETA 2RF2A 2HNZA 4FJ7A 4KTQA 4KHYA 2Y1JA 3CFRA 4GVMA 3LAMA 3ZSRA 3RMAA 4B9MA 3HJFA 3OS2A 4PUOA 1VSHA 3HPGA 1XC9A 4W5OA 4RG8A 3VQCA 1L3SA 3EY1A 2HHVA 1RTHA 3RMBA 1WNSA 1K6YA 4I9QA 3SUQA 4XIUA 1BGXT 3OYLA 4E7KA 3MXIA 4HVJA 5DMRA 5SZTA 3KLEA 4CGJA 2HHQA 4BWMA 4Z4HA 5KGXA 2GBZA 3G0ZA 2DFHA 3MXMA 2Z1GA 1TV6A 3LP0A 3K5MA 4DF4A 3AO5A 3AVFA 4LY7A 1JLGA 1REVA 3AA3A 1LV5A 4HCBA 3RRGA 2NUBA 3B6OA 5C25A 5J2PA 1VSLA 3O4QA 4CIGA 5T7BA 3NGYA 5J2QA 1QHTA 3S3NA 3MEDA 1B9DA 2Z1IA 3VQ7A 1QTMA 3PY8A 1MU2A 4Z4EA 3ZT4A 4OKKA 4CFDA 1WAFA 2OA8A 4FZYA 4KKOA 4FLXA 3WNGA 5DK5A 3PV8A 3WNHA 1LW0A 3HM9A 3TABA 1NJYA 2ETJA 2YHAA 3SPYA 1GOCA 1R0AA 3IG1A 4NYNA 4M3ZA 1XHZA 1C0TA 1YVUA 1VK0A 2ZQBA 3AVMA 3O4NA 3HXMA 3VQ4A 4KI4A 3V1QA 3DLRA 3TAEA 4FM1A 1ASWA 4W5NA 2X6NA 2HHTA 4H4OA 3ZSOA 1HQEA 3G10A 2KZZA 4O44A 4KREA 3VQQA 2IDOA 5J2NA 4BDPA 3IAYA 4Z4GA 4EZ9A 4QAGA 1RTJA 2OPSA 4E19A 1J53A 4FZZA 4KRFA 3AVKA 4B9UA 4FYDA 4CJRA 1Q9XA 3NF9A 4CJFA 5J1EA 3MAQA 4KB1A 4J2DA 2XY6A 2LSNA 1A5WA 4OVLA 3VQ9A 3LDSA 3V9XA 2HHSA 3V4IA 4EP4A 3AO1A 2VWKA 1TL3A 2A1SA 3MEEA 3L2VA 3VQ6A 4K8XA 1UA0A 1D5AA 4LH5A 4E3SA 3VQDA 3V9WA 3PX0A 5FRNA 1BIZA 1U04A 4NYFA 3AVJA 3B6PA 4FJ8A 3NF7A 3RTVA 3ZSVA 4FLVA 1SL0A 3HVRA 4CEAA 3O3FA 1TKXA 4CFAA 4CJ4A 1S1VA 1U48A 4M42A 1VSKA 3NAEA 1XI1A 4FW1A 2IS3A 4CJWA 4DSKA 4FJXA 3ZSQA 1NJXA 4M3TA 1BCMA 3M8PA 3CFPA 5E41A 1JXEA 3U3YA 4CFBA 3SUOA 3O3GA 2XY8A 4CJPA 5JS1A 1RDBA 4Z4FA 1HMVA 4FLWA 3AO2A 4DFPA 3TAGA 4B9VA 2HMIA 2XRIA 3L3UA 3DYAA 4LH4A 3BGRA 4ZTJA 4CEFA 1RT3A 1WSGA 5I3UA 1WSFA 3KLFA 4BE1A 1IKXA 3IRXA 4CF8A 2HW3A 1VSMA 1HRHA 4OPJA 4N41A 1HYSA 1HJRA 4YFUA 4FJ9A 2KZMA 2ZE2A 2QKKA 1ZBFA 3LP3A 4DU3A 3QEXA 1TK8A 4DSLA 3LP2A 3CM5A 3NGZA 3OYBA 3ULDA 4DTPA 1KLNA 1RDAA 3NCIA 4BDYA 4DLEA 4QOZB 2KTQA 4B3OA 4O55A 3SUPA 3VQ8A 4GW6A 5C42A 3H08A 4E7HA 3P83D 3M8SA 5KTQA 1RT2A 1O1WA 4HUFA 1EETA 1LWEA 1TAQA 3ALYA 3L3VA 3OS0A 4FM0A 4DSJA 2G8KA 4KAZA 1S6PA 3ZT1A 4E0DA 1ASUA 1XHXA 1RTIA 1ZBUA 4CHPA 4DFMA 2R7YA 4CHYA 1W9HA 2PYLA 3SV3A 3KLIA 2OPQA 3OYHA 1RBSA 3OYEA 3C94A 2HHUA 1A5VA 1QSLA 2G8HA 1BCOA 2RN2A 3AVGA 4CIEA 3OS1A 2YHBA 4HUEA 4DTMA 3SI6A 1X9MA 1QS4A 4I9LA 2WONA 4OGCA 3VQBA 3SCXA 4KB0A 4W5QA 1KVAA 4H4MA 3VN5A 1VSJA 1DTTA 4AHCA 3F9KA 3SZ2A 4M41A 4LSNA 4BDZA 4B9LA 2YNFA 4KV8A 5I42A 1RT1A 4ELUA 3CQ8A 4F3OA 3PUFA 1HYVA 4B8CA 4CHQA 1TKZA 2XY5A 4C8KA 4AILC 2XHBA 1JLEA 1C6VA 4KO0A 4DTXA 4DFJA 3M8QA 1NK8A 4KPYA 1RBTA 1RBVA 1S5JA 3AVLA 5CZ2A 4PQUA 3PO4A 1TKTA 3VA3A 2Z1JA 1C1BA 2OZSA 1L5UA 2FBXA 1ZBHA 2O4GA 1GOAA 4F8RA 2IAJA 3DOLA 3OYFA 1TK5A 4IFVA 2VG7A 1KLMA 4O0JA 4CEOA 4FLZA 3NF8A 4I2PA 4WE1A 3RWUA 1WAJA 3LPUA 3SQ2A 4N47A 4DSFA 4CIFA 1RNHA 4OLBA 1NK5A 2QXFA 1YT3A 3HT3A 2HVHA 2G8FA 4DF8A 2RPIA 2VG6A 4OGEA 3OYIA 3CM6A 3KJVA 3PX6A 1T03A 1TKDA 3JSMA 4J2AA 1JLAA 1TAUA 1WN7A 3OY9A 3DLKA 2X78A 4ID5A 4BE0A 2IC3A 3K5OA 4RW6A 3DLHA 4L8RB 4M3UA 2PYJA 2G8VA 2KFNA 3KK1A 4KFBA 4BACA 5KRTA 4FZXC 4CECA 1RT5A 3ZT3A 5HRRA 2AJQA 3NGIA 3OYCA 1JL1A 1Y97A 2E6LA 3EYZA 4CEZA 2P1JA 3RR8A 3C6UA 3K5LA 3S9HA 1D9FA 1S1TA 4EP5A 4BE2A 4AH9A 1X9WA 1HNIA 3TR8A 3MECA 4LSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL1A 3TTDA 3L2WA 2YJEA 1VQ4N 2D5RA 1WSIA 3AVAA 4M45A 1Q82O 1HYZA 4CF1A 1RBUA 3KTQA 1P8ZA 3CMAN 4JEPA 1XC3A 1FKPA 3DAWA 3I33A 3OTOK 4CZGA 3QNNA 4JD2B 2I7PA 4O4GA 1Z25A 3T3FA 4H5VA 3O1WA 2NZTA 5AQFA 4PA1A 4Y0WA 4FVUA 1CZAN 3OW2M 4FOEA 1HKGA 1IKVA 2GUPA 3KKSA 1FKOA 1DLOA 3KZBA 4OX9K 1NKBA 4RW8A 2DPNA 2B5JA 3AAPA 1RDCA 3DM2A 4FLUA 3THWB 4Q0BA 1RDDA 2Q97A 3VEOA 1Q86O 1ATNA 1YITN 1XWLA 3K9JA 3WQTA 1GLFO 2VWJA 4E7IA 3OYNA 3TAFA 3AA2A 4BVPA 3LZIA 4FCYA 3G6EN 4LF4K 4J2BA 4ELVA 2YHYA 4F2RA 3U9ZA 3DXMA 3THXA 1OVQA 3QBWA 3VETA 4YDUC 3BZCA 4Z0UA 3PIPL 1VSFA 3D7EO 4KHUA 4CZHA 2YHXA 1KQSM 5C24A 2YI1A 5M1QA 4KI6A 3CJAA 3U6FA 5F1XA 3QEIA 4AHTA 3EN9A 3U9DA 1NG9A 3QEWA 3KD1E 3MN7A 2V7YA 3WEEA 2RHKA 3QLHA 2OPRA 1Z05A 1I94K 2QM1A 5E26A 3HJFA 3UIQA 2YNGA 4IBNA 4IDHA 3CCRN 2KW4A 1ASVA 4RWTA 1A5XA 4DQIA 1T6CA 4J2EA 1YUWA 3R3LA 1UOCA 2GX9A 1RTDA 2QKBA 3I55N 4K42A 1J5OA 3MK6A 4O0IA 4FJNA 2NRXA 4CFCA 4JI6K 3CQYA 2BANA 3DXMB 3ENBA 3THXB 3LDOA 1YTAA 4CERA 2V52B 4PWDA 1NOYA 3SMSA 2ZJQL 4AHSA 4RW9A 1NGDA 1EX4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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