1J9AA

Oligoribonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SHMSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERIKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords OLIGORIBONUCLEASE
publication title The Crystal Structure of Haemophilus Influenzae HI1715, an Oligoribonuclease
rcsb
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2001-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1j9aA00
3QERA 3V1QA 1RDAA 1REVA 4YFUA 4EZ6A 1C0MA 5FRNA 2ZD1A 1UA1A 1EXQA 3V9UA 4CEEA 4LSLA 3KKSA 4CIGA 4QOZB 4FJJA 2AJQA 3K5OA 4AHVA 4IFYA 3OYAA 1U4BA 1BL3A 4DSIA 2IGIA 3QESA 1WAJA 3MECA 2BGGA 3E01A 4I7FA 4CF1A 4W5TA 3HPOA 4CJQA 3L2RA 4BDYA 4DFJA 4E0DA 4ELTA 4BWJA 4CIFA 2GUIA 3OJUA 2G8FA 3MEGA 1W0HA 4FCYA 4BDPA 1L3UA 2HHXA 3ULDA 4PWDA 5HLFA 1L3SA 4F2RA 1JLFA 3SUOA 3OYLA 4O4GA 1VSKA 3SUNA 1IG9A 3SYZA 3AO4A 3VQAA 4H4OA 1WNSA 2LSNA 3C94A 3O3GA 3V9XA 2HHUA 1ZBUA 4CEQA 1LV5A 1U48A 1QHTA 1U45A 2KW4A 4KHWA 1G15A 3AO3A 4J2AA 1RCHA 4LH5A 3IG1A 2EX3A 4DTJA 1D5AA 2R7YA 4CEOA 4ID1A 2E6LA 3DMJA 3UIQA 4KHNA 4YNQA 1Q8IA 3BGRA 4E19A 4FM2A 4JS5A 4E3SA 4FW1A 3ITHA 3CFOA 5KTQA 2HHSA 1RBUA 2F96A 4DF8A 4DTXA 3PO4A 1TK0A 3OYKA 4OKKA 1JXEA 1WSIA 1NOZA 3DLEA 3L2VA 4KV8A 1KLNA 4CCHA 1IKWA 1HRHA 4NYFA 2IDOA 3AA3A 1C1CA 3WNGA 1JLBA 3VA3A 4CF8A 5SZTA 3K57A 5HP1A 1JLQA 4M3UA 1EX4A 4M3ZA 4Z4IA 4FJIA 1A5VA 1RBVA 1BIZA 4FJNA 3VQQA 4JRPA 3HL8A 4F4KA 1EP4A 1RT7A 2P5GA 3ZT0A 3QIOA 5J1EA 1RTHA 1VSHA 4B9NA 4W5QA 3DM2A 4CFCA 1VSEA 4KKOA 4R5PA 4HCCA 3MEDA 3NDKA 1VRUA 3L3UA 1RT1A 4OJRA 1NOYA 4Z0UA 3VQBA 3OS0A 1ZYQA 4CEFA 3MEEA 3TWHA 1J9AA 1NKEA 3DLHA 4KO0A 2Z1IA 3AVIA 1NKBA 3O4QA 3MAQA 1WAFA 3B6PA 2HHQA 4W5NA 4E7JA 4DFKA 1TKZA 2A1SA 3LP0A 1NK4A 3TAGA 4FJ7A 4DQIA 2O4IA 1LWCA 2KFZA 4E1NA 1S1TA 4DF4A 3CQ8A 4B9MA 4CEAA 1ZBFA 4UQGA 4DFMA 5FDLA 3ZSQA 3M8RA 1DLOA 1Q9YA 1EKEA 1GOAA 1YTUA 4CJFA 2FC0A 4FM1A 1QS4A 3ZT4A 4DSKA 3T1AA 2JGUA 2E4LA 4Q5VA 1WSHA 1QSLA 3AVAA 3TI0A 1C0TA 2B6AA 4IKFA 1ZBHA 1UWBA 3WNFA 3KLGA 1RT5A 1Y97A 3L2WA 4M3YA 1F21A 1BQMA 1A5WA 1RTJA 1RT2A 5K14A 3HP6A 2P1JA 4RW9A 2P51A 3AA2A 1U49A 1B92A 1KTQA 3NCIA 1JLGA 3NF8A 4DTPA 2XY7A 4KHQA 1CXUA 3SUPA 1C1AA 4QCLA 3AVBA 3TR8A 3NGYA 4KTZA 2HHVA 3HPGA 5KGWA 1J53A 3QEVA 3TABA 3I0SA 4M3TA 3SJJA 1BHLA 4FK4A 4DTNA 3HO1A 3DRSA 4LY7A 5I42A 1SL1A 5CY4A 5KRTA 4CHPA 3RMBA 4M41A 1QQCA 4C8LA 4AHCA 4KHSA 4CJ3A 3HT3A 4CECA 4FK2A 3V1OA 4FZYA 4BE2A 4BE0A 4FLZA 3T19A 2QK9A 3EZ5A 3MXIA 4OPJA 5SWMA 1WSGA 4OLAA 3K5LA 4J2EA 4BDZA 4HTUA 3LAKA 1QSYA 3TAQA 4Y1CA 2BANA 3SV3A 3ZSWA 2DFHA 1XHZA 3AV9A 1FXXA 3HK2A 3S3MA 4DMNA 5CZ1A 2G8IA 2ITGA 3ZSXA 4N56A 4DTRA 5CYMA 3ZT2A 4DTSA 3KD5E 3AVNA 2KQ2A 3LAMA 1QTMA 1D9DA 4N41A 1JKHA 1S9GA 4FZXC 1YT3A 2D0CA 3OYMA 1MU2A 1KRPA 3DLGA 1RBRA 4M3WA 3M8PA 3NF9A 4CJSA 3V9WA 3AO2A 4E7IA 2PZSA 3D45A 5C24A 4B8CA 3KLEA 2O4GA 2XY6A 3F9KA 3EY1A 1KFDA 4O44A 4CK1A 3DOLA 3KLFA 3OYEA 1GOBA 3AO5A 1ASUA 1L3TA 2GBZA 1VSIA 4FK0A 4I2PA 3PO5A 2Q3SA 1HNVA 3HSTB 1JXBA 3NGZA 4B9LA 4DU1A 5J2MA 2HHTA 4GVMA 2D5RA 2D0AA 2RPIA 3HM9A 4E7KA 1NJXA 2YNFA 4ID5A 1JLCA 4KB0A 1I39A 1X1PA 4FJ8A 1RBTA 4IG0A 4DG1A 2G8KA 2OZSA 1HMVA 4GMJB 1ITGA 4CJRA 3DOKA 4DU3A 1RTIA 2G8HA 1VSMA 3JYTA 4HVJA 3LP3A 2DY4A 3DRRA 4PA1A 3RRHA 1GOCA 1N6QA 1IKVA 4ZTFA 3I0RA 3ZSRA 4FLVA 3D0PA 3RMDA 4ZTJA 3LANA 1QSSA 4Q0BA 4E7HA 2VG7A 2G8WA 3NF7A 3HVTA 3KKRA 4CEDA 3C6UA 3SV4A 3SNNA 3RRGA 1B9FA 1RNHA 1C0UA 4FLYA 3OVNA 3M8QA 4C8NA 3SZ2A 1T8EA 4I2QA 2RKIA 1WSEA 4IG3A 4AHRA 1Q9XA 3TAEA 4ELUA 1D8YA 4Z4HA 2OPRA 3K58A 4CK2A 2QKKA 4KI6A 2HHWA 1CLQA 4OGEA 4CFDA 1TL1A 4CF9A 1S1XA 5EU7A 2GV9A 1KFSA 5J2NA 4HCBA 4CGDA 4JS4A 4DFPA 2DTUA 4DS5A 3HVRA 3MXJA 4FYDA 1BCOA 3I8DA 3G10A 3LDSA 4F3OA 1B9DA 1TKXA 1UOCA 4RW7A 5DK5A 3SPZA 1KSPA 4CJEA 4L8RB 2BE2A 4JLHA 3TAMA 4NCGA 3AVMA 4CJ4A 2YHBA 3T3FA 3LZJA 2OZMA 1NJWA 2QKBA 1LAVA 1XHXA 3C95A 4CGGA 4KB1A 3NAEA 1JL1A 3TAPA 3G0ZA 1IKYA 3AO1A 2Y1IA 1TVRA 3ISNC 1ASVA 4CJVA 1RTDA 4JRQA 1BI4A 4I9LA 1TK5A 4FJGA 1VSLA 3THVA 3OYCA 4M3RA 2ATQA 3NH0A 2YNIA 5HROA 1RT6A 4FZZA 1KCFA 3VQ7A 2YNHA 5D3GA 2YNGA 1X9SA 4NYNA 3SQ4A 4KRFA 1YTAA 3RMAA 4FLWA 2XY5A 2F8TA 1WN7A 1N5YA 3QEWA 3SQ2A 2YV0X 1TL3A 3OS2A 4BE1A 4HUGA 1J5OA 4KREA 3AVJA 4KFBA 1SUQA 1XC9A 2JLEA 4O0IA 1NK0A 3WNEA 4O5BA 4CJKA 3C6TA 2HB5A 3QLHA 1TAUA 1JLAA 3NH1A 4B9VA 1K6YA 3AVLA 4O0JA 4CGIA 4G1QA 4OGCA 5JS2A 2Z1GA 4FJ9A 1C6VA 3VQ5A 4AILC 1SL0A 2OPQA 1S1VA 3M8SA 4K8XA 1L3VA 1D9FA 4RG8A 4Z4EA 1SL2A 4W5RA 2YKMA 1HYVA 4CEBA 5E41A 2HNZA 3MXMA 3VQ4A 4CJWA 3OY9A 4AHUA 3FFIA 1A5XA 1NJZA 3NH2A 3L3VA 1HNIA 1LW2A 2XY8A 4TSXA 4CGHA 2X74A 3ZCMA 3OYBA 3LWMA 4DQSA 1TGOA 1TK8A 1BIUA 1CXQA 1DTQA 3LP2A 3RR7A 4OVLA 3OYDA 1VSDA 4IFVA 4CESA 3LPUA 4FVMA 4IBNA 2HNDA 4WE1A 3WNHA 1W9HA 3HPHA 1NJYA 1R0AA 1S9EA 3U6FA 3TANA 4B9TA 3IRXA 2FBTA 3AVGA 3ZSOA 1X9WA 2E6MA 3V9ZA 3V6DA 4B9UA 3DI6A 3P83D 4KTWA 2YKNA 4FJKA 3PV8A 3AVFA 4H4MA 4CK3A 1SKRA 4DQQA 3VQ6A 5C42A 1KVAA 2G8UA 4DSLA 2B5JA 3OS1A 1S6PA 3PX0A 2KZMA 4BWMA 3S3OA 4Z4CA 4F2SA 1NK8A 3VA0A 4DSFA 5FROA 1S5JA 3OYGA 2IS3A 1VK0A 3LPTA 3K2PA 3SQ1A 3KTQA 3ZSZA 1FK9A 4ELVA 3SCXA 4DLEA 3ZT3A 2X6NA 3QO9A 1X9MA 4CGJA 1WLJA 1YVUA 5CYQA 3S9HA 4J2BA 3PX6A 4RW6A 2OYQA 1NK6A 4MQ3A 4M42A 4OLBA 3U3GA 4CJTA 2PYJA 2F8SA 2DFEA 5HRSA 1U04A 2PY5A 3NHGA 1TKDA 1JLEA 5JS1A 5HRRA 4H8KA 4NCBA 4AH9A 3U3YA 2IOCA 3OYFA 3TAFA 1UA0A 2FBYA 4B8AB 1RT4A 2A1RA 4Z4GA 1Z25A 2HVIA 3CG7A 1RDDA 4C8OA 4DTOA 1RBSA 5HBMA 4DSEA 2KFNA 1NK7A 2ZE2A 1KLMA 4OKJA 3VQ8A 4RW8A 3LWLA 2EHGA 4C8MA 1S1WA 3AA5X 2HMIA 4HUFA 4CF0A 2FBVA 3QNOA 1EETA 3VQ9A 4Z4FA 3KK1A 4CE9A 1LWFA 4EP4A 4DTUA 4CGFA 4DQRA 1Z26A 4CHOA 3K59A 5FRMA 3KIOA 3F73A 4B3OA 4PQUA 1ASWA 2VG6A 4OPKA 3V1RA 2RF2A 4BACA 1QE1A 4FJLA 4HUEA 4LD0A 3LZIA 4DWIA 3NGIA 2D0BA 2QXFA 3L2UA 4O55A 1HJRA 4LH4A 4OKEA 4CJ5A 3B6OA 2OA8A 1BQNA 3AA4A 1RDBA 1T03A 2P5OA 4IDKA 4FJXA 3KLHA 3VQCA 3ZSYA 4CERA 1UAXA 5DMRA 1C1BA 3EYZA 3VQEA 4HHTA 4I9QA 4KPYA 2Z1HA 4CHZA 3RMCA 4ZHRA 5I3UA 1J54A 1TKTA 3OYHA 2XO7A 4N76A 3HXMA 5KRSA 3IAYA 1HYSA 3IS9A 1IO2A 3SPYA 2RN2A 4DS4A 1WSFA 1NKCA 4CEZA 1KVBA 3O3FA 1SV5A 1HQEA 1FKOA 2IAJA 2OPPA 2XHBA 3CFPA 3RTVA 3CM5A 1NK5A 3V81A 4KHUA 2VWKA 4AHTA 4AHSA 4DSJA 4KAZA 2X6SA 2HVHA 1NK9A 4DQPA 4ICLA 2B4JA 2NUBA 5C25A 1T7PA 4CHQA 4KHYA 2FBXA 4CJUA 1U47A 3SQ0A 2KZZA 2HW3A 3KK3A 1SKWA 4FJHA 4E89A 4CHNA 1HQUA 3O3HA 1TAQA 2IC3A 3ZSVA 2WONA 5CZ2A 4CIEA 3V4IA 1L5UA 2G8VA 4FJMA 4XIUA 4B08A 3K5MA 1LAWA 1O1WA 2OPSA 4C8KA 3OYJA 4M3XA 3QNNA 3PUFA 4FLUA 4FW2A 5J2QA 3QINA 3L8BA 2ETJA 3K5NA 5J2PA 1KVCA 3NE6A 3LP1A 4J2DA 1HYZA 4FJ5A 1JL2A 4M45A 2DFFA 4EZ9A 3QIPA 1ZBLA 3OYIA 1XI1A 3HP9A 3O4NA 4QAGA 4FM0A 3H08A 4GW6A 3SUQA 3QEIA 3RR8A 1BISA 3DLRA 4F8RA 4CHYA 2YHAA 1VSJA 3RWUA 4FXDA 3KJVA 1LW0A 4DTMA 4CFAA 3KLIA 5KI6A 4EP5A 1CZBA 3HYFA 2X78A 3VQDA 3QETA 1S1UA 3A2FA 3AVCA 1FKPA 3L2QA 2HNYA 3CM6A 3OJSA 3P1GA 3PY8A 2PYLA 3QEPA 4DLGA 3SI6A 3NBPA 5T7BA 4N5SA 3PX4A 4PUOA 1TV6A 4E7LA 1IKXA 4LSNA 1BI4B 1XWLA 3KK2A 4K8ZA 4KI4A 3ASMA 1RILA 3VQPA 4PY5A 4MFBA 3OYNA 2BDPA 3VN5A 4DU4A 1S6QA 2ZQBA 4CJLA 3TARA 2VG5A 1VRTA 3ZT1A 1I3AA 1T05A 3DLKA 3AVKA 3CYMA 4CF2A 4KTQA 3NFAA 1LWEA 1RT3A 1ZBIA 4FLTA 4B9SA 2XRIA 4F3TA 1BGXT 3NF6A 1VSFA 4FLXA 2I5JA 3V9SA 3S3NA 3BDPA 3ALYA 4NCAA 2KTQA 2Z1JA 4RW4A 5KGXA 5HRNA 3JSMA 3QEXA 1RDCA 2WOMA 4CJPA 3HJFA 1CZ9A 3KD1E 4W5OA 3P5JA 2Y1JA 1WSJA 5HRPA 3AVHA 1SKSA 3DYAA 3LALA 4Y1DA 1BCMA 4N47A 4CFBA 1IH7A 4E1MA 2W42A 2VWJA 3CFRA 3DRPA 3DLBA 1HPZA 1DTTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N36K 4MLEA 1RDAA 1REVA 2ZD1A 1VQ9N 4NB4A 4CEEA 3KKSA 4CIGA 2PAVA 2E2NA 3MWTA 2AJQA 3PSIA 3D2FB 4MDAA 1U4BA 4FWQA 2IGIA 3QESA 2BGGA 3KVGA 4JD2A 3L2RA 4JHDB 4E0DA 4ELTA 2GUIA 3THXA 2G8FA 1SAZA 2P9NB 3MEGA 3VEXA 1L3UA 4BC2A 3DLLL 1ILYA 1L3SA 3EN9A 4O4GA 1VSKA 3OYLA 1IG9A 3ZEUB 1WNSA 5AQWA 4F9OA 4CZEA 3TSQA 1LV5A 1U48A 2VYPA 1QHTA 1U45A 2CH6A 2ZWHA 4KHWA 3CC4N 4CZFA 1X3MA 2P9UA 1D5AA 4DTJA 4CEOA 2OANA 2E6LA 4ID1A 4FM2A 1Q8IA 2Q0RA 4E19A 4FW1A 3ULEA 3CFOA 2VWBA 4JI0K 3LDPA 2JWKA 1WSIA 1NOZA 1HRHA 1EWRA 1C1CA 1YHQN 4CF8A 5SZTA 1JLQA 4M3ZA 4FJIA 1A5VA 3U9ZA 5J1EA 1RTHA 4WQ4A 1VRUA 4BY9C 1NOYA 4DUZK 1VQLN 3TU5A 2KLAA 3VQBA 1BOTO 1XMQK 5C2DA 2Z1IA 3AVIA 3DXKA 3MAQA 3UE5A 2HHQA 4W5NA 1NK4A 1HNXK 3TAGA 4H0PA 3L4IA 4DQIA 2O4IA 2AP1A 3QB0A 1R59O 5LMUK 4DFMA 3T1YK 5GIOA 1Q9YA 1EKEA 1QS4A 3ZT4A 2JGUA 3AVAA 2B6AA 5AQIA 1ZBHA 4M3YA 3SLCA 3LM9A 5AQNA 3HP6A 3VF4A 1T6CA 3VERA 3NCIA 3B8AX 3NF8A 5EVZA 2CGJA 1CXUA 3HPGA 5KPTA 3CCQN 5GAGP 4LY7A 5M1NA 3KK7A 5KRTA 1M90O 2F9TA 4PKIA 1QQCA 4AHCA 4CJ3A 4FK2A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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