1J9AA

Oligoribonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
b'SHMSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERIKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords OLIGORIBONUCLEASE
publication title The Crystal Structure of Haemophilus Influenzae HI1715, an Oligoribonuclease
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2001-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1j9aA00
3ZSXA 3DRSA 2PYJA 1NKBA 3AA4A 3B6OA 4GMJB 1A5VA 1HYVA 1ZBHA 3VA3A 4TSXA 4FM2A 5KGXA 3LWLA 1C0UA 1JXEA 1TV6A 4I7FA 4NYNA 3WNGA 3D0PA 3SZ2A 4DTXA 4HCBA 3K57A 4B9NA 3LALA 5JS2A 5HROA 3P1GA 3LANA 4KTWA 4M3TA 1BQNA 1S5JA 1VSJA 1VRUA 4FXDA 4WE1A 4B9TA 3PX4A 1NK9A 1TKZA 4DQSA 3M8RA 4CK3A 1ASWA 3HXMA 2B4JA 4AILC 3TARA 1WAJA 4LH4A 4EP5A 1XI1A 2HVHA 1JLCA 1TGOA 1C6VA 1WSHA 3AVMA 3MEEA 4DG1A 1B9FA 3RMDA 1S1TA 2QKKA 1CZ9A 2F96A 3CFOA 1EETA 3TAQA 1U47A 4C8OA 5KRSA 4ELTA 1RT3A 4CF8A 3V9UA 1J54A 1NK6A 1D8YA 3DLRA 3VQCA 3NGIA 1D9DA 1LAVA 3OVNA 4F4KA 1DLOA 1RDCA 4M3YA 1NK8A 3AO3A 1F21A 3U3GA 4CHZA 1S1WA 4DFJA 3TR8A 4CK2A 3P83D 5CZ1A 3ZSQA 3KLEA 1NJWA 3L3UA 4FJHA 3SCXA 4ZTFA 1D5AA 3NBPA 2KTQA 4CEEA 3KLHA 4FJMA 3OYEA 1JLBA 3V9SA 1LAWA 3LWMA 4OVLA 4B9MA 1J9AA 3SNNA 4H8KA 4FM0A 4DFMA 4YFUA 1QSYA 3V1OA 1HNIA 3AVLA 3JYTA 1X9MA 4MQ3A 4NYFA 3EYZA 1LV5A 4BWMA 3ISNC 1TAQA 2KZZA 1LW2A 4CF0A 1EX4A 4IFVA 4Y1DA 4CJ4A 2RPIA 3OYMA 3LAKA 4W5RA 2ATQA 2D0AA 1SKWA 2Z1GA 4PWDA 4DU1A 1WSEA 3C94A 4IG0A 2VWJA 5SWMA 4IFYA 1NKEA 4OLAA 1RT7A 2Y1IA 3V9ZA 1K6YA 3K59A 2P5OA 5K14A 1A5XA 1NJZA 2NUBA 1T03A 2LSNA 3CFRA 1TKTA 3NH2A 4PA1A 1CZBA 1WNSA 5EU7A 2DFHA 4CF2A 3H08A 4YNQA 1WLJA 4JRPA 3RMBA 2HMIA 4EZ9A 2G8UA 4FK2A 1HYSA 3VQQA 1DTTA 3S9HA 3ZSRA 2QXFA 2OYQA 1D9FA 1I3AA 2KQ2A 1C1BA 4M45A 3TANA 3SUQA 3L2WA 2E6LA 4K8ZA 4N76A 4F3TA 4DSJA 4QOZB 3RRGA 4DWIA 2YKMA 4KAZA 4FW2A 1NK4A 4L8RB 3AVGA 4BWJA 1VSLA 4FLXA 3QESA 3AVIA 4PQUA 4DQPA 4OGEA 4DTRA 2Z1IA 1QSLA 1Y97A 2VWKA 4RW9A 2IOCA 4DTNA 3LP0A 4M42A 1KVBA 4BE1A 1ZYQA 3RRHA 2QKBA 3OYGA 5KRTA 2YV0X 4J2DA 1QS4A 2WOMA 3HVRA 1WSIA 3HVTA 5HRNA 3DM2A 2I5JA 1HQUA 1KVAA 1RILA 1IKVA 4E1MA 3SJJA 3SV3A 3V9WA 4E7IA 2XY5A 3NGZA 2PZSA 4N47A 2ZD1A 4C8MA 3QEXA 3AA5X 2A1RA 1KLMA 4DSEA 4DU3A 1IKXA 3ZSOA 3OYLA 4QAGA 5CYMA 1GOAA 4NCAA 2DTUA 2ZE2A 4KI4A 3SQ4A 2FBTA 2X6SA 2F8SA 1SL0A 4O4GA 1GOBA 1RT4A 3AVAA 3OYDA 4FLVA 4CJ5A 4FJLA 2OPRA 4KB1A 3VQDA 4DU4A 2BE2A 2IGIA 4CIGA 3SUPA 2AJQA 3AV9A 1UOCA 2OZSA 1SKRA 3IG1A 4IDKA 3RMCA 3UIQA 4FZXC 4BDZA 1HRHA 4CEZA 1YT3A 1B9DA 2YNFA 2XY8A 3CG7A 1L3VA 2W42A 3P5JA 1BISA 1U04A 3LAMA 1A5WA 5C24A 1UA0A 4M3ZA 3S3MA 1YTUA 1RT5A 4DTUA 2HHXA 1J53A 1TL3A 4KRFA 3AVJA 3DOLA 4CJFA 4I9QA 4IG3A 4FM1A 3SPZA 2G8WA 3ZSWA 4W5NA 3TAPA 1NK0A 4Z0UA 2FBVA 2HNZA 3AO2A 4RW6A 1HNVA 1RT1A 4OPJA 3OYKA 3O4NA 3KTQA 1VSEA 3C6TA 1KSPA 2YNHA 3AVHA 3AVBA 4OPKA 4RG8A 4R5PA 1ZBFA 5E41A 4CGFA 3OS0A 4JRQA 4HUFA 1L3TA 3V1QA 4Z4GA 3ZT2A 3QEPA 1CLQA 4JS5A 4LSNA 1Z25A 4ICLA 1WN7A 3NAEA 2FBXA 4ZTJA 1TKDA 2Z1HA 4Z4IA 4CHOA 3OY9A 4FW1A 4AHVA 3RR8A 3TAFA 4AHRA 1TK5A 1L3UA 4IKFA 4B8CA 4W5OA 5FRMA 1R0AA 2Z1JA 4IBNA 5D3GA 1RT6A 1VSIA 2FBYA 3OS2A 3TWHA 3AA2A 3VQEA 3TAEA 3PV8A 3SUOA 3BDPA 4DQIA 1X9SA 1JLEA 3FFIA 1Z26A 3I8DA 3C95A 1U45A 1ITGA 4O55A 4CJSA 2F8TA 4FLWA 1BIUA 3AVNA 3WNFA 2HNDA 3NHGA 4CJRA 4FZZA 1XHZA 4O0IA 4CEDA 1IG9A 4DTSA 4HCCA 1RBTA 3ITHA 4H4MA 4AHCA 3LZIA 3L2UA 4O0JA 1BHLA 1WAFA 1JL2A 5C42A 4E0DA 3S3NA 3DOKA 1Q9XA 2E6MA 4QCLA 3T19A 3KK2A 3O4QA 1SV5A 3L3VA 2HHTA 3HSTB 4B3OA 4OKJA 4CIEA 1BGXT 3IRXA 1O1WA 1JLAA 4M3RA 4CFAA 1YVUA 4E3SA 1BI4A 1KRPA 2BGGA 2HHSA 3HT3A 3PO5A 1KCFA 4W5QA 1XC9A 4KI6A 1BCOA 4OLBA 1S1XA 2FC0A 4OKKA 4HUEA 2GUIA 1HPZA 1QHTA 3TABA 1HJRA 1GOCA 3RWUA 3MECA 4O44A 3CYMA 4HTUA 2QK9A 4HHTA 4DQRA 3G0ZA 3K5MA 5CY4A 3HPOA 1RTIA 3ULDA 2X74A 2VG6A 1C1CA 3QO9A 1L3SA 4DQQA 3NCIA 2OA8A 4LH5A 3AVCA 4B08A 2OZMA 1JLQA 5HRSA 2P1JA 2XY7A 4CJWA 2YHAA 3F9KA 4I9LA 4W5TA 2WONA 4KTZA 4F2RA 3HJFA 1MU2A 1W0HA 4E7JA 2PYLA 4EP4A 1NOYA 5J2QA 1DTQA 1S6PA 3ASMA 1C1AA 2P5GA 2DFFA 1UAXA 1FK9A 3VQAA 3L2QA 2VG5A 3KK3A 5HP1A 4N5SA 1CXQA 4BE2A 4DTOA 1NJYA 3DRPA 1B92A 2P51A 3KIOA 4M3XA 4CEQA 1BCMA 1RCHA 4LD0A 1T05A 1TK8A 1CXUA 4CEBA 4F3OA 2YNGA 3VQ7A 4BDPA 3DI6A 1KFDA 3DRRA 1VRTA 1RBSA 3K58A 3NDKA 4CF9A 1Q8IA 3NFAA 5J1EA 1LWEA 3QNOA 3IAYA 4DS4A 3U3YA 2BANA 3NF9A 1WSFA 2E4LA 5KTQA 4Q5VA 5J2PA 1RDBA 3V1RA 4G1QA 4KHWA 5KGWA 3OJSA 4KKOA 1EP4A 3VA0A 4PY5A 3AVFA 2G8KA 3KLFA 3SQ1A 1C0MA 3KKSA 4E89A 2RKIA 1IO2A 4C8KA 4B9LA 3VQ9A 4KPYA 2HB5A 4XIUA 2VG7A 3QIOA 4DSLA 4FJJA 4CJ3A 4CIFA 1RDAA 3C6UA 5FDLA 2B5JA 2A1SA 2D5RA 2EHGA 4E19A 4JS4A 3VQ5A 1LW0A 3BGRA 1JL1A 3K5NA 4O5BA 4DSIA 4CK1A 2XRIA 1KLNA 2O4GA 3OYNA 4CJEA 3QIPA 2KW4A 5C25A 4FJGA 3KD1E 4CHPA 4M3WA 2YHBA 4B8AB 3DYAA 1VK0A 4J2EA 3NE6A 1TAUA 1T7PA 4FJ5A 1S6QA 3PX6A 2HHVA 3EZ5A 4F8RA 5HRRA 2RN2A 2HNYA 4KFBA 2DY4A 4LSLA 1X1PA 1SKSA 3U6FA 3AA3A 3M8QA 4CF1A 3KK1A 4F2SA 4K8XA 4AH9A 3HO1A 1QE1A 4CERA 3VQBA 3ZSVA 1RT2A 3ALYA 4EZ6A 1EXQA 3IS9A 3B6PA 2Y1JA 2YNIA 3A2FA 4CFCA 3ZSYA 2X78A 2HHUA 3MXMA 4DLEA 3LP2A 5DK5A 3LZJA 1RDDA 1JKHA 2IS3A 4BDYA 3OYHA 5HBMA 3VN5A 3HL8A 3K5OA 4KO0A 4AHTA 5T7BA 3L8BA 1N5YA 4KHSA 4DLGA 4DSFA 4DF8A 4LY7A 4BACA 5JS1A 4N41A 4JLHA 3T3FA 4CGGA 4MFBA 4GW6A 3ZT3A 4CFBA 3HP6A 4I2QA 4CGHA 4DF4A 3NF6A 1QQCA 4KHUA 1TK0A 3AO5A 3CFPA 1VSFA 3OYJA 4J2BA 4FYDA 4OGCA 3PUFA 4DFPA 4DSKA 1NJXA 4B9UA 1C0TA 1JLGA 4Y1CA 3HPHA 4OJRA 1JLFA 4NCGA 4ID5A 4OKEA 3SV4A 4FK4A 5FRNA 3LPUA 3DLGA 2IDOA 3TAMA 4CEFA 1HMVA 1YTAA 1IH7A 4CJUA 3HM9A 4DFKA 2KFZA 4HVJA 1FKOA 2HVIA 1XHXA 1SUQA 3KKRA 1KFSA 3K5LA 3PO4A 1HQEA 4AHUA 3NGYA 5CZ2A 5FROA 1U4BA 1L5UA 3I0SA 4KHQA 4FLZA 3CQ8A 2ETJA 4C8LA 4CJVA 3WNEA 1QTMA 3QNNA 1VSKA 3CM5A 1RBUA 1KVCA 4ELVA 2HHQA 1BI4B 3AO4A 1NKCA 3QLHA 3HP9A 3OJUA 1VSMA 3ZSZA 3ZT0A 3SI6A 3TAGA 4CJKA 1QSSA 3NF8A 1G15A 4CE9A 3SUNA 4FVMA 2Q3SA 3O3GA 3LP1A 1NK5A 1S9EA 3SPYA 4Z4EA 3V6DA 1S9GA 4FJIA 3CM6A 1Q9YA 5SZTA 3AO1A 4H4OA 1LWCA 4C8NA 3SQ0A 3THVA 3DMJA 5I3UA 1LWFA 3HYFA 3WNHA 4CHNA 5HRPA 2ZQBA 3DLEA 4CECA 1RBVA 1ASVA 3OYAA 4CEAA 3QEWA 4Z4CA 3V4IA 4FLUA 4M3UA 4UQGA 3QERA 1BIZA 3VQ4A 4CFDA 3E01A 4E7LA 3LP3A 1SL2A 2ITGA 1S1VA 3F73A 1WSJA 3JSMA 4RW8A 3PX0A 1VSDA 4E7KA 4Z4FA 2KFNA 1RBRA 1RTJA 3HPGA 2OPQA 1UA1A 4FJ9A 3K2PA 3OS1A 2YKNA 2D0BA 1ZBUA 4ID1A 4KV8A 3OYIA 3EY1A 4Q0BA 3DLBA 4FJXA 2KZMA 4FLYA 3DLHA 3QINA 4DS5A 2XHBA 1J5OA 4RW4A 3VQ8A 3ZT1A 3RTVA 1UWBA 4DTMA 3HK2A 2X6NA 4KREA 1RNHA 4CESA 4PUOA 2D0CA 5DMRA 4FCYA 3AVKA 4DTPA 4ELUA 4CGDA 4FK0A 3OYFA 4B9SA 2GV9A 3KLGA 1REVA 3T1AA 3S3OA 3SYZA 4KTQA 3VQPA 1VSHA 4Z4HA 4J2AA 2RF2A 3RMAA 5KI6A 4CJQA 2IC3A 5CYQA 4DMNA 1W9HA 3QETA 4ZHRA 3MAQA 1EKEA 2GBZA 3NF7A 1SL1A 5HLFA 2DFEA 3LPTA 3V9XA 3D45A 3OYCA 2JLEA 2G8FA 1WSGA 2HHWA 2IAJA 1TL1A 1BQMA 1U49A 2G8VA 2BDPA 1XWLA 3M8SA 3L2RA 4I2PA 4HUGA 4KHNA 3DLKA 4AHSA 1NK7A 4CJTA 4NCBA 2OPSA 2R7YA 1JXBA 4CHQA 4FJKA 1IKYA 3NH0A 1X9WA 3NH1A 5I42A 1NOZA 2G8IA 4CJLA 3TI0A 3MXIA 1S1UA 3V81A 1RTDA 1ZBLA 3G10A 1TKXA 2JGUA 1HYZA 2XY6A 4CCHA 1T8EA 3O3FA 4E7HA 3QEVA 5J2MA 2O4IA 3O3HA 3ZT4A 3MEDA 4BE0A 1ASUA 3L2VA 3VQ6A 1N6QA 4KB0A 4CHYA 3OYBA 4FZYA 2PY5A 1KTQA 4CGJA 4CGIA 4FJNA 5J2NA 4KHYA 4CEOA 1ZBIA 3LDSA 3MEGA 4N56A 1I39A 2HW3A 4RW7A 3PY8A 2EX3A 1FXXA 4FJ8A 3I0RA 4FJ7A 4B9VA 2B6AA 2OPPA 4DTJA 1TVRA 3MXJA 2XO7A 1U48A 3KD5E 3SQ2A 1RTHA 3ZCMA 3KJVA 4CJPA 1IKWA 3KLIA 3M8PA 4M41A 3RR7A 4E1NA 3QEIA 2G8HA 4GVMA 1BL3A 1FKPA 4FLTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSXA 3DRSA 1KQSM 3AA4A 5KGXA 2XY6A 1C0UA 3LM2A 3K57A 3LANA 3VETA 3J8AA 1JJ2M 4F9OA 3PX4A 4CK3A 1ASWA 4BROA 3GL1A 2HVHA 1JLCA 2UXBK 1TGOA 1B9FA 3RMDA 2O8EA 3G25A 4FPBA 2Q0RA 4CF8A 3VQCA 1D9DA 1RDCA 1NK8A 3AO3A 3U3GA 2NZTA 4CHZA 3C65A 4CW7B 4DFJA 3TR8A 4CK2A 2E5LK 4FJNA 3KLEA 4FJHA 2P9KB 3SCXA 4CEEA 3KLHA 4BQZA 4B9MA 3LWMA 3DXKA 1J9AA 3KVGA 3C0BA 2ZJQL 3TSQA 3UKUA 3EL2A 3UKRA 1QSYA 3AVLA 3JYTA 3ID6A 3ULEB 1C0GA 3HRGA 3J7YP 4Y1DA 3EE9A 3OYMA 3E1YA 2QEXN 2Z1GA 2HOEA 4PWDA 3J7AP 5AZIA 5TKYA 1VQPN 3WXIA 1RT7A 3BF3A 3V9ZA 4CZLA 3EE8A 4MO5A 2LSNA 3MCPA 3CFRA 5AQXA 3NH2A 4PA1A 1CZBA 1WNSA 4YNQA 3H08A 4EZ9A 4IJNA 2G8UA 3W3DA 3VQQA 3SAHA 2OYQA 3BUZB 3TANA 1C1BA 3I56N 3L2WA 2E6LA 3SUQA 3QFPA 4WFAL 4DWIA 4FW2A 3AVGA 4FLXA 4XH4A 4OGEA 4O8UA 3H3OB 1QSLA 2QTDA 3RRHA 3VEOA 3QB0A 3OYGA 2YV0X 4J2DA 1VQ9N 2WOMA 3DWLA 4DV2K 3HVTA 1HQUA 1KVAA 3SV3A 3LDOA 4CVNE 3V9WA 2XY5A 1NGIA 3AA5X 4DSEA 4DU3A 1IKXA 4QAGA 3QFUA 4KI4A 1SL0A 2NLXA 4UY8O 3SAFA 1GOBA 3AVAA 3J80O 4CJ5A 4FJLA 4KB1A 4CZMA 4DHYA 5BR9A 4IXCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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