1J9AA

Oligoribonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SHMSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERIKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords OLIGORIBONUCLEASE
publication title The Crystal Structure of Haemophilus Influenzae HI1715, an Oligoribonuclease
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2001-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1j9aA00
3VQQA 5KGWA 3DRRA 4L8RB 3C94A 3SQ4A 4Q5VA 4CCHA 2BANA 1BCOA 1B9FA 3SV3A 4CEEA 1EXQA 3KK3A 4DLGA 5CZ2A 3ZSWA 4MFBA 5KRSA 3KLEA 1UA1A 1LAVA 3AVMA 1HYZA 3AVFA 4FVMA 1VSLA 3I8DA 4NCAA 3HXMA 2KQ2A 3D0PA 4M45A 1HNVA 4E1MA 1UOCA 3CQ8A 4B9LA 4OLAA 3HK2A 1D8YA 4FK2A 2F8SA 1CXUA 4DFKA 3SUPA 3HP6A 4DMNA 3M8PA 3HT3A 1NK5A 2R7YA 1NK4A 3HL8A 4OKJA 4KHNA 4CK2A 1Q9XA 1L3TA 2YV0X 4E7KA 1JXBA 4NYNA 3QLHA 1VSKA 3O3GA 3KK1A 3HJFA 1C1AA 3WNHA 4YNQA 5J2MA 1TK0A 3ALYA 2YNIA 1BHLA 4CJLA 3KKSA 3S3NA 4EZ9A 4CJFA 2E6MA 3AVBA 3RRHA 1N6QA 2F8TA 1S6PA 4CJRA 1NK0A 3MXIA 2EHGA 1JL1A 4PA1A 4CF1A 3S3MA 4IDKA 2Z1IA 5HROA 4KTQA 4FJHA 4CFAA 3L8BA 1GOCA 3AVHA 4G1QA 1JLBA 3O3FA 1KVAA 3SPYA 3CFOA 3ZT1A 4FLYA 4DS5A 1QSSA 4KB0A 5J2QA 3LZJA 3RWUA 4RG8A 4RW9A 3ZT2A 4E7LA 4J2BA 4J2AA 3MEGA 1ASVA 1WAFA 3V9UA 4E19A 3NF8A 3MEDA 4CJ5A 3TI0A 4RW8A 3NDKA 1TKXA 1LWEA 3K5OA 1C1CA 4ZTFA 2GV9A 1J54A 2IC3A 1F21A 4DTSA 2RPIA 5C24A 4XIUA 4BWJA 1HRHA 3T1AA 4DTUA 2RKIA 4HHTA 3S3OA 4M3XA 4DTPA 1QSLA 5FRNA 2G8HA 4EZ6A 1BQNA 4I7FA 1ZBIA 1TL3A 3D45A 3TWHA 5J2PA 3NH1A 4RW7A 1J53A 4EP5A 3KLGA 1X9WA 4E1NA 3OS0A 3I0RA 4CJ3A 4JRQA 1KFSA 4B9TA 4H4OA 4GMJB 3HVRA 4H8KA 4B9MA 1HYVA 1GOAA 1WLJA 4O55A 4FYDA 5I3UA 2Y1JA 3C95A 1HPZA 2Z1JA 4CESA 3G0ZA 4O5BA 1BISA 3OYDA 3EY1A 2G8VA 1IH7A 4KB1A 4M3RA 3OYAA 3L2QA 3QERA 4CECA 1WSEA 2HHTA 1JXEA 2O4IA 2DFHA 1RBSA 4ICLA 3S9HA 3TAEA 2FBXA 3VQEA 4Z4FA 4M3ZA 2D5RA 4DQQA 4CEOA 4I2PA 3KLFA 1BIUA 2FBYA 1KCFA 1XHZA 5I42A 1CLQA 2G8UA 3WNGA 1RT7A 4JS4A 3DMJA 4Z4EA 1XWLA 4PY5A 4CERA 4M3TA 5HRRA 2AJQA 3A2FA 4HVJA 1XHXA 1Y97A 3VA0A 4DU4A 1A5VA 1RT1A 2KW4A 3CFRA 4PQUA 1KTQA 4KTWA 4DQRA 1VSDA 2Z1GA 3VQ8A 3VQBA 1NKCA 2D0CA 3IRXA 1B92A 3TABA 3KD1E 4DSIA 4CFDA 4N41A 3LP2A 4FJLA 1X9SA 3TR8A 4FLUA 3SYZA 5KTQA 3HO1A 3AVIA 4O0JA 2XY6A 3U3GA 3TAPA 1SL1A 1RT3A 4FJJA 3SUQA 2YKMA 3B6OA 4CJWA 4FLXA 5D3GA 4KTZA 3T19A 3KLHA 1NKBA 2KFNA 1CZ9A 3ZSYA 3ULDA 2NUBA 4OJRA 4FJ8A 1X1PA 3QEVA 3IAYA 4E7JA 3O4QA 3NAEA 4CF0A 4CIFA 1NJXA 3DRSA 1IO2A 4M41A 1SUQA 2OPRA 1YTAA 4RW4A 5CY4A 4FM1A 1WN7A 2VWKA 1C1BA 4E0DA 4KREA 1MU2A 3VA3A 1IKWA 4IG0A 2HHWA 3NHGA 2FBTA 3HP9A 4CEFA 4CJKA 3K57A 2A1RA 4DSFA 1VSEA 1RBTA 1QHTA 4AHTA 4OPJA 3VQ9A 4CFCA 1YTUA 2KFZA 3DYAA 3P83D 4NYFA 4BDYA 1RT6A 4C8NA 1R0AA 1U45A 3CG7A 3OYHA 1J9AA 3QIPA 4OVLA 3DOKA 3SI6A 4C8KA 2HW3A 4IBNA 4Z4GA 4DQSA 2RF2A 4W5OA 1T7PA 4CK1A 1JKHA 2DFEA 1VSFA 4BDZA 4B9SA 3OJUA 3PV8A 3UIQA 4FK0A 2HHSA 1X9MA 3IG1A 5HRSA 1HNIA 4CJ4A 5KI6A 4CJUA 1RBRA 3EZ5A 2FC0A 4CF2A 1SV5A 4LY7A 4HUGA 4DU3A 2G8KA 2ATQA 4OKKA 4BE2A 4FJMA 4KRFA 4O4GA 2XO7A 4FLWA 3LAKA 4B8CA 4DF4A 4CJQA 1U4BA 1L5UA 1RDCA 4FLZA 4BACA 1K6YA 4CHNA 3ZSOA 2O4GA 4BWMA 5EU7A 1S1WA 1C0TA 1VRTA 4B8AB 2IGIA 1HYSA 3NGIA 4KFBA 2OA8A 4B9NA 1BI4B 4OGEA 3NGYA 1RDBA 1NJZA 2YHAA 1UWBA 4KHYA 2ZD1A 4CEZA 1RT4A 4BE1A 4KHUA 2Q3SA 4E89A 3SPZA 5DK5A 4FJ7A 3NFAA 3VQ5A 3OYIA 2OPSA 1KSPA 1A5XA 3SCXA 3KLIA 3ZSQA 4LSNA 3CM5A 4CF9A 1SL0A 3AVKA 3QETA 4IKFA 2E6LA 3OYNA 3OJSA 3HPOA 4N76A 1NK9A 3NF6A 2DFFA 3RMAA 4DWIA 2A1SA 1ZYQA 3V4IA 2G8FA 4Q0BA 1VRUA 1VSHA 4R5PA 2HB5A 3RRGA 3PO4A 1C0UA 2B5JA 1T05A 3KKRA 2OYQA 1JLAA 3QNOA 4DG1A 3E01A 1KLNA 4JLHA 4PWDA 1QTMA 1JLQA 3KJVA 1XI1A 1EKEA 3DLEA 1IG9A 3DLKA 4FJIA 3MAQA 4QAGA 3SUNA 3P5JA 1D5AA 4CJTA 3WNFA 4HUFA 1ZBLA 2P1JA 3AVLA 1TL1A 4LH5A 4AHUA 4C8MA 3O3HA 4F2RA 4J2DA 2GBZA 3RTVA 3QINA 3LWLA 4K8XA 1O1WA 1Q8IA 4FLTA 3OYCA 1QS4A 1T03A 3V1RA 5JS2A 3LWMA 4CJPA 1KRPA 4UQGA 3BDPA 4FJGA 1LWCA 2LSNA 4IFVA 3OYJA 1FKOA 1HQEA 4FZZA 4CJVA 3AVJA 1S1UA 1Z26A 1NOYA 2QKKA 4N5SA 3JSMA 3SNNA 4TSXA 4EP4A 2IOCA 2ZQBA 3ASMA 3M8SA 1RDAA 3TANA 3B6PA 3MECA 1NJYA 1RT5A 2ETJA 3CYMA 3OYLA 3TAQA 1I39A 4E7HA 3NH0A 4M3YA 1U49A 4F3OA 2HHVA 2X74A 5FROA 1W9HA 5C42A 3QESA 4FJ5A 3WNEA 1W0HA 2IDOA 5KGXA 4FJKA 3DLBA 4HUEA 5FDLA 1DTQA 1WAJA 4DSLA 4DQIA 3AO5A 3U3YA 3VQDA 3K5MA 4M3WA 3L2RA 4LD0A 3OYMA 5HLFA 2X78A 3RR7A 4DF8A 1FXXA 1WSHA 1TGOA 1JLCA 5J1EA 1SKWA 2P5GA 3KD5E 2HVHA 2JGUA 3HPGA 5HRPA 1RTJA 2HHUA 4AHSA 1RBUA 1EP4A 2X6NA 1FK9A 2KTQA 3V1QA 3NF9A 4FM0A 1ZBHA 2YKNA 3OYGA 1TK8A 3SQ2A 3RMDA 3AO1A 4H4MA 4KV8A 3C6UA 1D9DA 3JYTA 1JLGA 4I2QA 4NCBA 3LDSA 3V9WA 4CGFA 4DSJA 3NE6A 1T8EA 4I9LA 2BDPA 5E41A 3PY8A 2W42A 1G15A 5C25A 4MQ3A 2OZSA 3F73A 4HCCA 2G8IA 1C0MA 2FBVA 4CGJA 1ASUA 1RILA 1U04A 4DLEA 3ZSZA 2RN2A 2IS3A 4CHQA 1HJRA 1S1XA 4NCGA 5KRTA 4FZYA 3TAFA 1IKXA 4CEQA 2G8WA 3K58A 3LPTA 4KHQA 2XY8A 4KHWA 4DFPA 4FXDA 4FK4A 1Z25A 3K59A 1B9DA 1VSIA 1QSYA 3DLHA 2VG5A 4CHZA 4CGIA 4OKEA 4W5TA 3OY9A 2OPPA 3NCIA 4E7IA 1NK7A 3K2PA 3AVCA 1U47A 3QEPA 1WSFA 4CF8A 5SWMA 2XRIA 1KVBA 5HBMA 3O4NA 3TARA 4F4KA 1TKTA 3FFIA 4Y1DA 1UA0A 1D9FA 1NOZA 2HNDA 2DY4A 2D0AA 3V9SA 4DTMA 3AA4A 2YNGA 4C8OA 4FZXC 1BQMA 2YHBA 3LANA 1DLOA 4N47A 4CFBA 5SZTA 4CJEA 4CGDA 2QXFA 2X6SA 3L3UA 1VK0A 3NF7A 1RT2A 3T3FA 3THVA 3ZT3A 1N5YA 1JLEA 2KZMA 3G10A 4FCYA 1LAWA 3M8RA 3SJJA 3QO9A 3HM9A 4KPYA 1TAQA 3C6TA 4Z4CA 2P5OA 3AVNA 3LALA 3LZIA 1BIZA 1RTHA 4DTRA 1ASWA 4C8LA 4DSEA 2PZSA 4F8RA 4JS5A 4CEBA 1EETA 4HCBA 4ID1A 3VQCA 4DSKA 1HQUA 3PX4A 4KI4A 3KTQA 4QOZB 1RTIA 2PYLA 4ELVA 3NBPA 1S9GA 3L2UA 3V6DA 2QKBA 3OS1A 4DTNA 2DTUA 3ZT4A 3CM6A 3NGZA 3AV9A 1L3SA 2KZZA 1JLFA 1KVCA 1QQCA 3AA3A 4B9UA 4M3UA 1TKDA 2VWJA 2BE2A 3OYKA 4FJXA 5J2NA 4Z4IA 1DTTA 3AA5X 3ZCMA 4AH9A 3DLRA 4W5NA 4AILC 4FJNA 4IFYA 1TK5A 3ISNC 2E4LA 3PX0A 3U6FA 1BI4A 2OPQA 4HTUA 3LP3A 4GVMA 2QK9A 3ZT0A 2XY5A 1SKSA 4CEDA 3TAGA 1NK6A 4AHVA 4DFJA 1NKEA 4KI6A 4O44A 3ZSXA 2I5JA 4CHYA 1WSGA 3K5LA 1NJWA 4M42A 3L3VA 3DI6A 4Z0UA 3PO5A 1TVRA 2B6AA 2YNFA 3M8QA 3LPUA 1IKVA 4ZHRA 1S9EA 5CYQA 3MXMA 3RR8A 3I0SA 1ZBFA 4QCLA 1WSIA 4F3TA 1BGXT 1CXQA 3LAMA 1BL3A 4DS4A 2WONA 4ELUA 4ELTA 3VQPA 2ZE2A 2B4JA 5HP1A 3KIOA 4DTOA 3NH2A 2HHQA 1JL2A 3HSTB 1HMVA 3DLGA 1VSJA 2PYJA 1EX4A 4W5QA 3VQ6A 4K8ZA 4ID5A 4KO0A 4CGGA 3OS2A 3QNNA 4FW1A 3P1GA 2HNYA 3HYFA 1RCHA 3EYZA 2XHBA 3CFPA 1U48A 4PUOA 5FRMA 5T7BA 1TKZA 1YT3A 1ZBUA 2ITGA 3DOLA 1C6VA 3ZSRA 3ITHA 3HVTA 1KLMA 4B9VA 1NK8A 1YVUA 2IAJA 3LP1A 1VSMA 3V81A 4DTJA 2WOMA 1CZBA 3AVGA 1LW2A 1RDDA 4N56A 4FJ9A 4OLBA 4YFUA 2D0BA 5CZ1A 1SL2A 2HHXA 1FKPA 4WE1A 3VN5A 2HVIA 3IS9A 1RBVA 4OGCA 3VQ4A 3QEXA 2XY7A 4B08A 3L2WA 4FM2A 4IG3A 3V1OA 4Z4HA 2HNZA 4B3OA 3AO3A 3K5NA 4CGHA 4I9QA 5JS1A 4DFMA 3TAMA 4BE0A 1I3AA 2F96A 3KK2A 2VG7A 3DM2A 4CIGA 4DU1A 1J5OA 2BGGA 2VG6A 1TAUA 3OYEA 1S5JA 4GW6A 4CHPA 1RNHA 1Q9YA 3AO2A 3F9KA 1UAXA 4DQPA 3SQ0A 5HRNA 3VQAA 2PY5A 3DRPA 1XC9A 1L3VA 3AA2A 5K14A 4CK3A 5CYMA 1ITGA 4LH4A 3ZSVA 1S1VA 4Y1CA 4FW2A 3SZ2A 4ZTJA 1WSJA 3AO4A 2HMIA 3H08A 4AHRA 4AHCA 3QIOA 3AVAA 3HPHA 3LP0A 2Z1HA 4LSLA 1WNSA 2GUIA 3RMBA 3QEWA 1LWFA 4J2EA 4CEAA 3V9ZA 2OZMA 3SV4A 2P51A 4CIEA 4DTXA 4KAZA 1LW0A 1IKYA 4CHOA 2Y1IA 1QE1A 3OVNA 1TV6A 1L3UA 1SKRA 4KHSA 3VQ7A 2JLEA 3MXJA 4KKOA 1GOBA 1BCMA 1RTDA 1REVA 4OPKA 3MEEA 3PX6A 4RW6A 4W5RA 4JRPA 3V9XA 2EX3A 2YNHA 3SQ1A 4BDPA 3QEIA 1KFDA 3SUOA 4F2SA 3BGRA 1A5WA 1S6QA 4O0IA 3OYBA 4E3SA 3OYFA 4FLVA 1LV5A 5DMRA 3L2VA 3RMCA 4CJSA 3PUFA 1S1TA 4CE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KGWA 3QBWA 3CIPA 3CCQN 3KK3A 2GWKA 5GAEP 5AQYA 1UA1A 4GV9A 4FWRA 3NMUA 4QS9A 3E66A 1NMDA 3HXMA 4YOXA 4PKGA 3D0PA 1HNVA 1S22A 4MO4A 3HK2A 5LMUK 1NGJA 3HP6A 3HT3A 1NK4A 4OKJA 2YV0X 3O3GA 3QLHA 1YVNA 5J2MA 4CW7B 4DR5K 1D4XA 3KKSA 3RRHA 3VGLA 1S6PA 1NK0A 3MXIA 2EHGA 4CF1A 4K25A 3J81O 4CFAA 5AQPA 4KB0A 2E2QA 3MEGA 2KHOA 1WAFA 3MEDA 4CJ5A 4IJNA 3NDKA 1TKXA 1LWEA 1C1CA 4ZTFA 1J54A 1XQSC 2RPIA 4H0XB 3T1AA 2V51B 4M3XA 4DR1K 2RKIA 4DTUA 3S3OA 3HTVA 4DTPA 5FPEA 4JYAK 3F5TA 1GLFO 4RW7A 3P38A 3PSFA 4JRQA 3T69A 1KAZA 1HNWK 4H4OA 4GMJB 3HM8A 1TYQB 1WLJA 3C95A 3G0ZA 4O5BA 2G8VA 4FVUA 1YF5L 3CCLN 4YOTA 4KB1A 3DXKB 4U67L 1WSEA 2W41A 4Z4FA 2FBXA 3VQEA 4IZ9A 3AY9A 4CEOA 4DQQA 3KLFA 1NGFA 3VTIA 2FBYA 1KCFA 3WT0A 3D7EO 1Q81O 1GLEG 2G8UA 4Z4EA 1XWLA 4B3TK 4PY5A 3THYB 3GE1A 1XHXA 3VA0A 2KW4A 1RT1A 2JWKA 4PQUA 1KTQA 1W7AA 3HOSA 1NKCA 2D0CA 1YHQN 3LP2A 1QVFM 4GVEA 3TR8A 3SYZA 3HO1A 3BY5A 4O0JA 1SL1A 1RT3A 3BUZB 3T19A 3ZSYA 4OJRA 5FPDA 1X1PA 3A5MC 4E7JA 3O4QA 3NAEA 3ZETB 3VEOA 2QWPA 1SUQA 1W2BM 1WN7A 3Q7CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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