3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
1EQYA 3ULEB 2D1KA 3TPQA 5AQTA 2W40A 2E8AA 3JXUA 3EKSA 1E4FT 1YVNA 3M1FA 4BROA 1NGHA 2D0OA 3LM2A 5AQOA 1XUPO 3OHRA 5AQNA 5B8HA 4FPAA 4BR9A 3FFKB 2I7NA 2IVOA 4EIAA 5ADXA 3VERA 4MLHA 3A0IX 2ZGYA 1TUYA 1NGCA 3SK3A 4RCHA 1RGIA 3BEXA 4QS7A 3S41A 3UE5A 2YI1A 3AARA 4AM7A 1MDUB 2E1ZA 3KHYA 2GUPA 5TKYA 3O80A 2VCPA 2FSJA 1BUPA 5AQHA 1BO5O 4IXCA 3U8XA 2QWNA 3GDQA 4H5TA 5BN9A 3GL1A 3VEVA 3J8AA 3MN9A 2QW9A 4BG9A 4CD1A 3LDQA 3ID8A 4O5FA 5LJWA 4FWKA 4CZIA 3ZX0A 4B1ZA 1GLJO 1TYQB 1GLEG 4Y0WA 2F9TA 5AZIA 5BRDA 4FSVA 2HF4A 4FWQA 3GE1A 4BR0A 2ZWHA 1IJJA 2P9SB 3EN9A 4JHDB 5JICA 4BRPA 3FE1A 3HM8A 4H5WA 4BRLA 2QXLA 3MK6A 5AQWA 1T6CA 1BWFO 3QB0A 4CD3A 3DAWA 3F9MA 1ESVA 3VENA 1CZAN 3ZX2A 4FWRA 4BRCA 2CH6A 4BRNA 2EWSA 2IVNA 1HPMA 3VF4A 3R6MA 2QWRA 4I6MA 2V7ZA 1BA0A 5F2RA 4M7XA 3RSEA 3DXKA 3LL3A 4BRHA 4M7YA 3VETA 4BRKA 4H5VA 4NB4A 4WQ5A 3HZ6A 4MLEA 4F9OA 3IUCA 5KQ8A 2BUPA 4BRGA 4CI6A 2Q1NA 4JAXA 1NGBA 2IVPA 3CJ7A 5AR0A 1V4SA 2GWJA 2QWLA 2E1YA 2F9WA 4HWIA 5AFUH 1X3NA 2V51B 5BN8A 1RFQA 2YHYA 2P9NB 3O5BA 4J8FA 4E1JA 1KAZA 3WXKA 1U2VA 2P9UA 5AQIA 2P9KB 1HKGA 3O6WA 2E2OA 4BRIA 3ATUA 4H0YB 2GWKA 3CQXA 2P9IB 4H0TB 1YUWA 3A5NC 3CJBA 5ELZA 3VESA 2CGLA 3D2FA 2YHWA 5ADXH 2FSKA 2PBDA 3CQYA 2P9PA 1TUUA 5JLFA 2E2QA 3R8EA 1NGJA 5BPLA 1XQSC 3VGLA 3ENHA 2FSNA 3QBXA 4A62A 3WEEB 3O8MA 3FR0A 3FZMA 3C7NB 2NRHA 2Q0RA 1QHAA 4CBWA 1KAYA 4FWMA 3WXIA 1DGKN 3DXMB 3M6GA 4QS9A 4BREA 3IDHA 3KZBA 3ZEUA 1LOTB 2D4WA 1ATRA 2E2PA 3BUZB 3MN7A 3MN6A 5JLHA 3VEYA 2CH5A 3H1VX 1H1VA 4JD2A 4PKIA 1OKJA 2QM1A 5AQGA 3DJCA 2UYTA 2V7YA 3VPZA 5KQDA 3CJ9A 4YDUA 2QWQA 1HUXA 3SLCA 2P9LA 4H5NA 3SJHA 3WXLA 4BVPA 4BG8A 2CGJA 5LY3A 5EX5A 1R59O 5EXWA 1GLCG 5AQXA 1C0GA 2NLXA 4JNEA 5AZJA 1T44A 4ISFA 5AQSA 4CZHA 1ATSA 4BVOA 3WUHA 1GLAG 3L0QA 4BQZA 1QQOA 5FPDA 1BG3A 2J4RA 3ZETA 5BR9A 3MN5A 3ULEA 5BREA 3JS6A 3KVGA 3P4IA 1K8KB 2AP1A 5EOYA 3VF6A 4B9QA 4XH1A 3WQTA 4CZJA 5EVZA 4H5RA 3DXKB 4KBOA 3SMPA 1HKBA 5AQUA 5F0XA 4PKGA 1Q18A 1V4TA 2WUSA 4HTLA 4B1UB 3IMXA 4FWNA 3WT0A 1S3XA 4JN4A 2D0PA 4BR7A 1KAXA 4FWOA 1WUAA 3HI0A 2A6AA 2FF6A 3ATVA 5JMVA 1TYQA 3HTVA 1GLFO 4EFHA 3M3ZA 3MDQA 4M63C 2V52B 3H45C 5EY4A 4EHTA 5CE3A 1MWMA 4H0VB 4DCHA 3LDPA 3CETA 3UKUB 2H3GX 2QWOA 3O4WA 4XH5A 2P9SA 4JHDA 4BC5A 4FOEA 3FZHA 5FPEA 2YJFA 4BRMA 1GLLO 2A3ZA 3LDOA 3D2EB 3QFUA 3QDKA 1ZBSA 1MWKA 4GNIA 2HMPA 3FLCO 4ISGA 1JCGA 1BDGA 4DHYA 5KPTA 5AQMA 2QWPA 4PKHA 2ZF5O 3U4LA 3VEZA 3LDLA 3QMLA 4A2BA 4H03B 4IWVA 3UKRB 1HJOA 1D4XA 3MMVA 4BC4A 2ASOA 5BRHA 3W3DA 4A61A 3VGKA 1BA1A 5AQPA 4H0OA 3A5OC 4XH4A 2KHOA 1C0FA 1QQNA 1XC3A 4CBUA 3QBWA 2NZTA 4WYBA 5AQKA 3L4IA 2E20A 1ZXOA 3W0LA 1SQKA 4BR5A 4QS8A 2ZGZA 3HBTA 3AAPA 4Z94A 1JCEA 4WQ4A 4BC2A 3EKUA 4LC9B 2P9NA 3O08A 4DQ8A 4PL7A 2OANA 3VEWA 4FWSA 1QQMA 1NWKA 2A42A 2P9KA 3O1BA 4BRQA 4BR2A 5BRFA 4EHUA 1HKCA 3DWLA 4RWTA 4BGBA 2GEMA 2P9IA 4MO4A 4YDUC 3SMSA 3BF1A 4B1XB 5LJVA 3CIPA 4ISEA 3QICA 3TU5A 5AQZA 5AQVA 3VF2A 3GOIA 1JCFA 2CGKA 2A40A 5KPZA 1NLVA 5AQJA 3VEOA 5AZIB 1NM1A 3VEXA 2HOEA 4CZFA 3WEEA 2HF3A 2IIRA 3C7NA 5AQQA 2GTDA 3AY9A 2E88A 3ENOA 4FWPA 3U9DA 3DXMA 1ZC6A 4GY2B 3C0BA 1Z05A 3H3OB 1BOTO 2BTFA 3FZKA 1DKGD 4EAHD 4B1VA 1WOQA 1MA9B 2E2NA 3G25A 3H3NO 4IO8A 4FWLA 1Y64A 4FPBA 2VYPA 2QWMA 4CZLA 2YCHA 5FPNA 4I6MB 4IZ9A 3RSEB 3GG4A 1NGFA 3L6QA 5BPMA 2VWBA 1YAGA 4NO7A 4FO0A 4O8KA 3UB5A 1NMDA 4K43A 5AQFA 1SAZA 1IG8A 3EO3A 4CZKA 1U6ZA 2FLOA 2FXUA 2ASPA 3I8BA 2PAVA 1YXQA 2W41A 4CZGA 5I9EB 1KXPA 2Q36A 1NGDA 3CHWA 2DPNA 3I33A 1J6ZA 1P8ZA 1DEJA 5F1XA 3H6EA 2I7PA 4BGAA 1HLUA 3EL2A 4WQ5C 4XEIA 1NGGA 2Q0UA 3CI5A 4K42A 1U2VB 2P9UB 1K8KA 2AA4A 4A2AA 4FL9A 3B8AX 2ITMA 4AM6A 4BRFA 2A41A 1NBWA 1Z6RA 5BPNA 2ASMA 3H1QA 4B1WB 1QZ6A 1LCUA 3GBTA 1X3MA 4C23A 2Q2RA 3WXJA 3D2FB 1NGAA 2Q97A 5AQLA 2P9PB 3AAQA 3O1WA 3R9PA 1E4GT 1S22A 4MO5A 3HSCA 4H0PA 3BP8A 3EZWA 4CZMA 4B1YB 3LDNA 3A5LC 5KPRA 5FPMA 1SZ2A 3CJCA 3MCPA 4RTFD 3IFRA 3ZEUB 3A5MC 4CBXA 4K41A 4DB3A 1NGEA 1T6DA 4BRAA 2GELA 4CJ7A 4H0XB 4K25A 3D7EO 5AQRA 1RDWX 3H46O 1BU6O 4JD2B 4FOIA 1GLBG 3UKUA 3CERA 4IJNA 5AQYA 1ATNA 3BF3A 4IJAA 3VOVA 3D2EA 1G99A 3FZLA 4BC3A 2P9LB 4WQ4C 3WQUA 3QFPA 3ZX3A 5E26A 3U9ZA 2YHXA 1QZ5A 4BRDA 3LM9A 3FZFA 3VGMA 3CJ1A 3CJAA 1HX1A 2YJEA 5AZJB 4BQLA 3FGUA 1X9JA 2FF3B 4BR4A 4CZEA 2Q31A 5AFUA 4PL8A 5E84A 1GLDG 2A5XA 3A8YA 3UKRA 1NGIA 4L3QA 3ZETB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HE7A 3ULEB 2D1KA 5GADP 3VQBA 3JXUA 1I6FA 4M41A 3AA3A 3PSIA 1LWCA 1QHTA 4ELTA 4V19S 2D0OA 2G8IA 1S6PA 5DM6L 5M1PA 4KB0A 1B7DA 1JLCA 4DF8A 3KLFA 2ITGA 3A0IX 1NGCA 3SK3A 1R0AA 3UE5A 3AARA 4CEFA 3NE6A 4BE2A 1EETA 2VCPA 1BI4B 1KVBA 2FSJA 5AQHA 3PO5A 1BCGA 4FLWA 2C1IA 3GL1A 5HRRA 3J8AA 3DLRA 4CERA 4BG9A 1SKSA 4CD1A 1VQPN 5LJWA 2B3CA 1YJWN 2YILA 3HPOA 5AZIA 4Z4HA 3AVJA 3HPGA 4FWQA 1RTJA 5FDLA 4NCGA 2P9SB 2ASCA 1RDAA 3EN9A 4JHDB 5JICA 3K5NA 5DM7L 3HM8A 2LKBA 2QXLA 3MK6A 3CMAN 3QB0A 5CY4A 1ZUTA 4KTQA 4FYDA 4CGIA 1GOBA 4CD3A 3NF6A 3KD1E 2M8BB 3VENA 1L3SA 2Z1HA 3TAFA 3I0SA 3SYZA 5HRPA 1JLEA 4FWRA 4JKAA 2CH6A 4BDPA 1UGLA 4BRNA 3VQPA 5M1NA 4ZHRA 3HOTA 3V9SA 1K73O 2HVHA 3HYFA 3T1AA 2G8KA 1ZVEA 4M7XA 4X66K 4BRHA 1I6GA 3LL3A 3SUNA 1BQMA 4N41A 2VY6A 4H5VA 2YIOA 4F9OA 2BUPA 4CI6A 3NCIA 4FJKA 3AVAA 2Q1NA 4CW7B 5HP1A 3DLBA 2QWLA 4BDZA 4Q5VA 2JGUA 1YTUA 5AFUH 1ASUA 2O8BA 1F21A 4KHPK 1U2VA 5AQIA 5JS2A 1N4NA 4DV2K 3OBYA 1RTDA 2HHIA 3S9HA 5H1SQ 3P1GA 3VQ6A 3AVBA 3OYMA 1YUWA 3A5NC 2YHWA 5ADXH 2XRIA 3IKMA 3D6RA 2PBDA 5JLFA 1HNXK 1TUUA 3V9ZA 1RT7A 2QI2A 2P1JA 4DSLA 1NGJA 2FBYA 1O13A 3U6FA 4A62A 1L3VA 1WWNA 3BY5A 3FR0A 3S3MA 5J2QA 1U48A 2KFZA 1QHAA 3OA9A 4Q0BA 1EO1A 1KAYA 4FVMA 2KBJA 3CFOA 3WXIA 2ZJPL 1QQCA 1BK8A 2O8CB 4OPHA 2P51A 3KLIA 3SAHA 4DFPA 1LOTB 3BUZB 3ITHA 1VSMA 3H1VX 3I55N 3MX2A 3M8SA 2QKBA 3P39A 3KKRA 4G1QA 3DJCA 2V7YA 3VPZA 4KHQA 3NBPA 3THWA 2G8WA 4DTJA 1HNIA 2QWQA 2BH1A 3SLCA 4GW6A 3RR7A 4I9QA 4M3TA 1N6QA 3F9KA 1KD1O 1U4BA 5HBMA 5LY3A 4JI8K 4YOVA 3CCQN 5EXWA 5TKWA 4JI3K 3V1OA 1ZYWA 4BQZA 1DT9A 1BG3A 4CJUA 3OY9A 3JS6A 1WBDA 3KK7A 1JZBA 3KP0A 2AP1A 4UAFE 4JI7K 2OPSA 3OYBA 3QETA 3VF6A 4B9QA 3WQTA 3KLEA 4KHUA 1S1XA 2D5RA 1JKZA 4FM1A 4WF9L 4DFMA 4H5RA 5CHIA 4KBOA 3O9UA 3SMPA 4LSLA 4OKKA 4UADE 4AHTA 4CEAA 5F0XA 1FW6A 2WUSA 2PY5A 4B1UB 4FWNA 3WT0A 1OH8A 4JN4A 2D0PA 4BR7A 4C8MA 1RILA 4FWOA 1NJIO 1RT5A 4AF1A 3AO1A 2GL1A 2LSNA 1GLFO 4EFHA 2XHBA 3EEQA 2O8DA 2OZSA 4EHTA 1JLAA 2E6LA 4MFBA 4DCHA 3CETA 3UKUB 1S5JA 2H3GX 4XH5A 4BC5A 4DR7K 5FPEA 3BK3C 1JLBA 3LDOA 3QFUA 3OYEA 1MWKA 3J7ZO 2G8UA 3TTFA 3S5TA 3FLCO 4AH9A 5AQMA 1NK4A 3TSQA 2O8FB 3THVA 2G8FA 3ISNC 2HHQA 2B6AA 1CXUA 4DU1A 4M3XA 3QMLA 1A5XA 4DV3K 3CCUN 1XMQK 3L2UA 4CF2A 4B3OA 4GVMA 1T0ZA 1BA1A 4H0OA 3A5OC 4FCYA 4YHHK 4K8ZA 4CBUA 4CF0A 3HP6A 1C56A 1FXXA 3VQ4A 2WBNA 3L2WA 4WYBA 3QINA 1NKCA 3G0ZA 1J5EK 1M90O 4BC2A 4LC9B 2P9NA 2HBKA 1SV5A 4DQ8A 2P9KA 4BRQA 4BR2A 3DRSA 1FK9A 3Q7CA 4RWTA 4BGBA 1G15A 2GEMA 2P9IA 4MO4A 4YDUC 2NY9X 1LQHA 2GV9A 1ZBFA 3BF1A 3CPWM 3CIPA 1UOCA 5AQZA 1HYZA 1JCFA 2O8EA 1NLVA 2RHKA 5AQJA 3BZKA 2LT8A 3IAYA 1QVGM 5AZIB 3AO2A 3IS9A 1IBLK 3WEEA 1C55A 2HF3A 4CJQA 4JS4A 5HLFA 3C7NA 2OPRA 3B6OA 3ENOA 4YFUA 3U9DA 3ZSWA 3DXMA 3RVCA 1Z05A 2F7TA 4O5BA 2BTFA 4C1NI 2W00A 3FZKA 1DKGD 1KTQA 1TKDA 3KOXA 4LSNA 1TAQA 3SJJA 1WOQA 3AVFA 2R7YA 1MA9B 3G25A 1AHOA 3CCSN 4IO8A 4WFAL 4FWLA 4U67L 5T7BA 4B3RK 4YORA 3OYFA 1XNQK 4AHCA 4IZ9A 4IG0A 3SQ2A 4NO7A 3K9JA 3I0RA 3ZSOA 1NJYA 3ZT2A 4ICLA 4CZKA 3RMCA 1SNBA 3AO4A 2FXUA 3I8BA 2W6LA 3L56A 2PAVA 3PV8A 1WMTA 1IKYA 1KXPA 4CJWA 3V6DA 4KAZA 2DPNA 1CXQA 5F1XA 3QIPA 1YJNN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HE7 A;  3ULE B;  2D1K A;  5GAD P;  3VQB A;  3JXU A;  1I6F A;  4M41 A;  3AA3 A;  3PSI A;  1LWC A;  1QHT A;  4ELT A;  4V19 S;  2D0O A;  2G8I A;  1S6P A;  5DM6 L;  5M1P A;  4KB0 A;  1B7D A;  1JLC A;  4DF8 A;  3KLF A;  2ITG A;  3A0I X;  1NGC A;  3SK3 A;  1R0A A;  3UE5 A;  3AAR A;  4CEF A;  3NE6 A;  4BE2 A;  1EET A;  2VCP A;  1BI4 B;  1KVB A;  2FSJ A;  5AQH A;  3PO5 A;  1BCG A;  4FLW A;  2C1I A;  3GL1 A;  5HRR A;  3J8A A;  3DLR A;  4CER A;  4BG9 A;  1SKS A;  4CD1 A;  1VQP N;  5LJW A;  2B3C A;  1YJW N;  2YIL A;  3HPO A;  5AZI A;  4Z4H A;  3AVJ A;  3HPG A;  4FWQ A;  1RTJ A;  5FDL A;  4NCG A;  2P9S B;  2ASC A;  1RDA A;  3EN9 A;  4JHD B;  5JIC A;  3K5N A;  5DM7 L;  3HM8 A;  2LKB A;  2QXL A;  3MK6 A;  3CMA N;  3QB0 A;  5CY4 A;  1ZUT A;  4KTQ A;  4FYD A;  4CGI A;  1GOB A;  4CD3 A;  3NF6 A;  3KD1 E;  2M8B B;  3VEN A;  1L3S A;  2Z1H A;  3TAF A;  3I0S A;  3SYZ A;  5HRP A;  1JLE A;  4FWR A;  4JKA A;  2CH6 A;  4BDP A;  1UGL A;  4BRN A;  3VQP A;  5M1N A;  4ZHR A;  3HOT A;  3V9S A;  1K73 O;  2HVH A;  3HYF A; 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