3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
2QW9A 1KXPA 2D0PA 2P9NA 4FL9A 1GLLO 1DEJA 2EWSA 3H6EA 4IO8A 1QHAA 3EKSA 3HTVA 4NB4A 4YDUA 1MWKA 4A2BA 1BOTO 4FWLA 5FPMA 1TUYA 3IFRA 4MLEA 3ID8A 4DHYA 4A2AA 4CBXA 4BRPA 4BGAA 1QQMA 1P8ZA 4RWTA 3LL3A 3OHRA 3VEWA 4ISEA 3VEZA 3SMSA 5FPDA 1HLUA 4PL8A 2GTDA 5AQMA 3ATUA 3O5BA 5AZIB 4B1VA 3FE1A 2E1YA 1DGKN 5F2RA 2ZF5O 3UKRB 4EHTA 2E8AA 5AQFA 1R59O 4BR9A 5BRHA 1TYQA 3ATVA 2P9SA 3DXMB 1QZ6A 3BP8A 4RTFD 2I7PA 4BC3A 3JS6A 5AZJB 1MDUB 3LDPA 3D2EA 3FZLA 1T6CA 4DQ8A 2HMPA 1Z05A 3L0QA 3O4WA 5ADXA 2P9NB 3MN5A 1TUUA 3WXLA 3ZX0A 3A0IX 4J8FA 1D4XA 1MA9B 2I7NA 2GELA 2E1ZA 4BR4A 1E4GT 4QS9A 4AM7A 2D4WA 4I6MA 4CD1A 4BR5A 3VENA 5AQPA 2E2NA 1LCUA 1QZ5A 4BROA 3FZKA 5BN8A 3QBXA 4JD2A 3LDNA 2CGJA 4IWVA 3BEXA 4FWMA 3ENOA 4Y0WA 3EL2A 3AY9A 4CZMA 2P9SB 4H0TB 4ISFA 4XH4A 5KPZA 1RFQA 3D2EB 3DAWA 2FSNA 2QWLA 3I33A 5BPMA 2NLXA 1OKJA 3EO3A 4M7YA 1Q18A 3F9MA 4YDUC 2E20A 2ITMA 1G99A 1GLBG 3BF3A 4H5RA 1JCFA 1BUPA 1NBWA 3CETA 5AQOA 3AAQA 2PBDA 4I6MB 3LDOA 1NGFA 5BR9A 4BRLA 2QM1A 1HKBA 3TPQA 3ULEB 3O1WA 5AQYA 2A41A 4E1JA 4JD2B 5AQHA 3QMLA 3GBTA 3VESA 4CBUA 5KQ8A 5BPNA 1JCGA 4BC2A 4PKHA 1GLCG 4B1ZA 4WQ4A 4HWIA 3WXKA 1BA1A 2D0OA 1X3NA 2P9LB 2CH6A 1T6DA 4MO5A 3ZX3A 3ZETB 2Q0RA 2HOEA 2Q36A 4H5NA 5EXWA 1ZXOA 3U8XA 3MK6A 5TKYA 2ASOA 3VETA 3UKRA 3VGLA 3UKUA 3WEEB 3VEXA 5JLFA 4CI6A 4BRQA 3RSEB 2WUSA 1BG3A 5LJWA 3QFPA 3O8MA 4XEIA 3BF1A 1C0FA 3VF2A 2QWQA 4WQ5A 2YHXA 4H0XB 4B1WB 2Q1NA 4K43A 4PKIA 1NGHA 3GG4A 3QB0A 3VGMA 2IIRA 4EIAA 3WQTA 1V4SA 1XQSC 4H0OA 4BRFA 3VEYA 1E4FT 3VEOA 5FPEA 3GE1A 4O5FA 3VF6A 4BRMA 1ATSA 5JLHA 2P9PA 2UYTA 2YHYA 1EQYA 3UKUB 5EY4A 4CD3A 4CZEA 4PL7A 5I9EB 1LOTB 5AQUA 2A3ZA 2CGKA 3CJ7A 4DB3A 4IZ9A 1ZBSA 5AQIA 1Y64A 1HX1A 3MN6A 3U9ZA 2VCPA 2YJEA 4NO7A 3ZEUA 3P4IA 4FWPA 2V7ZA 4FWSA 2V52B 1IG8A 2Q97A 3M3ZA 3C0BA 4FWNA 2D1KA 1BO5O 1HKGA 4H5TA 1YAGA 3TU5A 2NZTA 2VWBA 5AFUA 3CJAA 3HI0A 4WQ4C 5LJVA 3G25A 3AAPA 3HZ6A 4FO0A 3SMPA 2GWKA 3DWLA 3ULEA 4CZIA 4M7XA 2GEMA 2FLOA 5JMVA 3WXJA 5BPLA 2P9IA 4IXCA 3VF4A 2P9PB 1KAXA 3CI5A 5F0XA 4B1YB 1ATRA 3FFKB 5CE3A 5EX5A 1GLJO 5BRFA 4BQLA 4BREA 3CJCA 4FOIA 2P9LA 4WQ5C 1ZC6A 4KBOA 3ZETA 3ZEUB 2IVPA 1RDWX 4CZFA 4JHDB 4BRNA 2H3GX 5KQDA 2J4RA 4BR2A 4B1UB 4H0VB 3R6MA 2IVOA 3WEEA 5BREA 3SLCA 3QBWA 3QFUA 2HF3A 1ESVA 2QWRA 3RSEA 5AQTA 1S22A 4K25A 3H45C 3S41A 4JNEA 2QWMA 5AR0A 4ISGA 4BRIA 3CERA 5AQNA 3MN7A 3CHWA 3AARA 3WXIA 1CZAN 4FWRA 2P9IB 4B1XB 1T44A 3MMVA 3R9PA 1XUPO 2DPNA 4L3QA 1J6ZA 3L4IA 1WOQA 3I8BA 4FWQA 3GOIA 4CZKA 1U6ZA 4BR7A 5KPRA 5EOYA 1JCEA 3O6WA 4CZGA 3UE5A 1S3XA 3VERA 2QWNA 5E84A 3WQUA 4EFHA 3DJCA 3EKUA 2CH5A 1GLAG 2FF6A 3MDQA 3UB5A 2F9TA 1C0GA 3IMXA 5B8HA 2E88A 1YVNA 5LY3A 5ADXH 5AQZA 3HSCA 3W0LA 4CZJA 3FGUA 4BRAA 1IJJA 1Z6RA 3GL1A 5FPNA 3BUZB 3H1QA 1HKCA 1SQKA 3A8YA 1NGIA 4FPAA 1H1VA 4H5VA 3LDLA 3H1VX 4XH5A 2PAVA 3FZFA 4GY2B 3QICA 4BR0A 2YCHA 2ASPA 2V51B 4MLHA 1BWFO 3EN9A 2W40A 4QS8A 3B8AX 2P9UA 1BA0A 4H0PA 4F9OA 2GUPA 3WT0A 3VPZA 1K8KA 3KZBA 4Z94A 1YXQA 3A5OC 3CQXA 1NGAA 1NGDA 1U2VB 3O80A 3C7NA 1BDGA 4BRGA 1NGCA 4BVOA 1NMDA 3A5LC 3ENHA 3KVGA 2IVNA 5BN9A 2A40A 4M63C 4H0YB 1KAYA 4B9QA 2QWOA 4CZLA 3HBTA 4DCHA 4EAHD 4FWOA 4CBWA 1RGIA 4BRDA 3FZHA 2YI1A 2AA4A 3H3OB 1NGGA 4BGBA 3M1FA 5AQRA 2HF4A 4JHDA 4BRHA 3VEVA 4FWKA 2ZGYA 3LDQA 2QXLA 2A5XA 5EVZA 4MO4A 3QDKA 4BG8A 1NGEA 2FSKA 2P9UB 3EZWA 4RCHA 1X9JA 2KHOA 1SAZA 3IDHA 1K8KB 5AQLA 2E2QA 3A5NC 3C7NB 1MWMA 2P9KA 3L6QA 1XC3A 4XH1A 1HPMA 3D7EO 3VGKA 4BQZA 2QWPA 2NRHA 1X3MA 2V7YA 4O8KA 3DXKA 3U9DA 5E26A 3VOVA 4BVPA 3O08A 1NLVA 4QS7A 5AQSA 3IUCA 5AQKA 3J8AA 4IJAA 1YUWA 2AP1A 1NGJA 4K41A 1NWKA 5KPTA 1GLDG 4A61A 1QQNA 1ATNA 2GWJA 4BC5A 3LM9A 1NGBA 1TYQB 3A5MC 4A62A 2E2PA 5JICA 1DKGD 2BUPA 3MN9A 2E2OA 4PKGA 2A6AA 2VYPA 1BU6O 3SJHA 4C23A 2YHWA 4FSVA 4FOEA 5AQQA 3D2FA 2P9KB 3W3DA 2BTFA 5AQXA 2Q2RA 3CJBA 4JAXA 1GLEG 2ZGZA 3MCPA 3JXUA 5ELZA 4CJ7A 3SK3A 1KAZA 3FZMA 3DXKB 3CJ1A 4IJNA 4JN4A 3CQYA 1V4TA 3KHYA 2FXUA 3O1BA 3FR0A 3LM2A 1SZ2A 3ZX2A 2YJFA 4AM6A 4H5WA 1U2VA 5BRDA 2Q31A 4GNIA 3R8EA 1HUXA 2CGLA 5AFUH 4FPBA 1QQOA 2FSJA 4EHUA 4BC4A 4BG9A 1NM1A 3CJ9A 2W41A 5AQWA 2ASMA 3M6GA 4K42A 3HM8A 2FF3B 4H03B 3D2FB 3H3NO 5F1XA 5AQGA 3H46O 5AQVA 4LC9B 1HJOA 3CIPA 2ZWHA 5AZIA 2Q0UA 5AQJA 4BRKA 4BRCA 4WYBA 4CZHA 3DXMA 3FLCO 3GDQA 4HTLA 3WUHA 5AZJA 1WUAA 3U4LA 2F9WA 2A42A 1GLFO 2OANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D0PA 2P9NA 4FL9A 3DLHA 2EWSA 4CF9A 1LV5A 1OH7A 4JI0K 1BISA 5FPMA 1TKZA 3KLGA 1U47A 4A2AA 4BRPA 4BGAA 4LF8K 1L3VA 4Z0UA 4CJPA 3V4IA 1QQMA 3RWUA 1P8ZA 2DTUA 3VEZA 3T1AA 5AQMA 4ELUA 1IKYA 4CJSA 3ATUA 4GV6A 3O3HA 4J2EA 3FE1A 1T7BA 2ZF5O 3UKRB 1O13A 1JXCA 1PE4A 2E8AA 1LW2A 2I5JA 3ATVA 1ZBUA 4KI6A 1VSLA 3JS6A 1YVUA 3TTFA 1Q81O 1T6CA 3F2KA 4GW6A 2YKNA 1Z05A 3L0QA 3HL8A 2ETJA 2D0AA 4DS5A 3LPTA 3CC7N 3WXLA 1JZAA 5MLCQ 3DLGA 4E89A 1MA9B 2I7NA 2GELA 2LT8A 2E1ZA 3AVAA 2QKKA 4WFNL 4KREA 1EWQA 3CXCM 4I6MA 2A7TA 5HL7L 4JKCA 4CD1A 3KD5E 3CG7A 3VENA 3B6OA 2E2NA 4BROA 3FZKA 4ELTA 1OH5A 4HUFA 1VQ8N 2BRZA 3HK2A 4Y1DA 4UQGA 4G1QA 2VQFK 4FJKA 2P9SB 3RMAA 3E7UX 4H0TB 2JDQD 5CR4A 1UGLA 3D2EB 1NK7A 3QIOA 5GIPA 3THWB 4YDUC 1OKJA 3R2VA 2E20A 3O4QA 1G99A 3SUQA 1NJXA 1I3AA 3AAQA 3QEXA 2NY8X 4F2SA 2YNHA 2QEXN 3J81O 2W6KA 4JI8K 3G71N 2OA8A 1HKBA 3TPQA 3TAQA 5AQYA 3GBTA 3VESA 4CBUA 3ZT4A 4FK2A 1NKBA 3L3VA 3DM2A 3LZIA 4FJMA 1JLCA 2O8DA 3RR7A 4C8MA 3LP2A 3VQ9A 5GIOA 4HWIA 3WXKA 2P9LB 2PZSA 3ZT3A 1T6DA 1RCHA 3ZX3A 4FZYA 3ZETB 1W9HA 1LAWA 4DFJA 4LSLA 1EX4A 2Q36A 1ZXOA 2PYJA 2ASOA 4Z4CA 3UKRA 1K8AO 1C0MA 2KBJA 4AHUA 3NVKA 3O9TA 4CI6A 3DLBA 4M3ZA 2QTDA 3RSEB 1BG3A 3DRSA 3C95A 5GINA 4OKJA 3O8MA 4DLEA 2MN5A 2NY9X 4HHTA 4IFVA 2NUBA 3LZJA 4A57A 1C0FA 1S1XA 4B1WB 2Q1NA 2F8TA 4KTWA 3GG4A 1JZBA 1QE1A 4FK0A 1V4SA 3P83D 4TSXA 1C1BA 1QHTA 4BRFA 1T7EA 4FJ8A 1OZZA 3VEYA 3MEEA 1BCGA 4O0IA 1BI4A 5FPEA 5HRSA 1WT7A 3F9KA 1ZUTA 4FVMA 1ZBLA 3QEVA 4GV3A 2G2KA 4DUZK 1LOTB 5AQUA 2A3ZA 4AQYK 4OKKA 3SF4D 3EYZA 3L2RA 3CJ7A 4CEQA 2HHVA 1W97L 1Q8IA 4Z4IA 1EKEA 2ZE2A 2YJEA 4W5RA 2XY5A 5I3UA 3SAHA 3KTQA 3NF7A 2HBKA 5C24A 1IG8A 3LP1A 1YT3A 5AFUA 3MX5A 4DR7K 4BEBA 1TL1A 1NG9A 3HZ6A 2ZJPL 4BE0A 1LQQA 2KLAA 2W6LA 4CZIA 3Q7CA 3O4NA 5GAHP 4IXCA 2JWLA 1N6QA 3FFKB 5CE3A 4B9SA 4CERA 4CJFA 1BQMA 4BREA 3ZSWA 3K5MA 3EE9A 2P9LA 1WAJA 4EZ6A 3ZETA 5JVGL 1TAQA 1FW6A 3VQ4A 4CZFA 4JHDB 3M8PA 1K9MO 4BR2A 4B1UB 1WN7A 3R6MA 4O8UA 2IVOA 2UXCK 1NJZA 1VQ6N 5BREA 1BRZA 3SLCA 1ESVA 3RSEA 3VQ6A 1RDDA 4K25A 3S41A 2D5RA 2QWMA 4ISGA 4JNEA 4CJLA 2K35A 1QS4A 1M90O 3CCVN 3CD6N 4DSJA 4DWIA 4WF9L 1BK8A 2BDPA 2P9IB 4DSLA 1T44A 3I8DA 4X66K 1JLFA 3O9RA 3L4IA 2EHGA 2SN3A 1NPIA 2KYQA 4O55A 1QSLA 2E5LK 3O6WA 1J54A 3AVCA 1S3XA 3AO4A 2QWNA 1BHLA 5J2QA 2LKBA 2DFEA 2IC3A 3EKUA 4BDYA 3MDQA 5AJ3K 4DV4K 1MR4A 1J9AA 3N4QA 5KGWA 1C0GA 3IMXA 4BACA 4CFBA 2E88A 1YVNA 5LY3A 1FK9A 3HSCA 1L4VA 2O4IA 4W5QA 5C42A 3GL1A 1VQNN 3DLRA 3BUZB 4JKDA 1RBVA 1HKCA 4CEAA 1SQKA 4M42A 1SKRA 1VSKA 1NGIA 3JYTA 4J2BA 4DQRA 1D5AA 1H1VA 1X1PA 3PY8A 3LDLA 4ILHA 3FZFA 4DQIA 3I55N 4DLGA 2YCHA 1CLQA 2V51B 3R1XA 2VY6A 3AVKA 4MLHA 3TANA 1IG9A 2OPSA 2W40A 1S1VA 4H0PA 4B3SK 2G8UA 3OYNA 2O8EB 1K8KA 1EXQA 3KZBA 3SPYA 3MEGA 3O80A 1U2VB 2LY5A 4BRGA 4M3RA 4BVOA 4C8OA 1NMDA 4FLWA 5BN9A 4M63C 4H0YB 1KAYA 3VTIA 4CJQA 3KKSA 4EP4A 4EAHD 4CBWA 3ISNC 3OYCA 2I61A 4DSKA 1NGGA 4BGBA 1RBSA 4CIGA 4JHDA 4BRHA 3VEVA 1KD1O 2ZGYA 1PTXA 4K0KK 5J2PA 1T8EA 5CZ2A 1NKCA 1C0TA 4BG8A 4CHQA 2FSKA 3EZWA 1X9JA 3E7RL 4JKGA 3AA2A 5AQLA 1D8YA 4BDPA 3DRRA 4KV8A 2A1SA 4OGEA 1MWMA 2P9KA 2WBNA 2LJ7A 1I6FA 4XH1A 1HPMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2D0P A;  2P9N A;  4FL9 A;  3DLH A;  2EWS A;  4CF9 A;  1LV5 A;  1OH7 A;  4JI0 K;  1BIS A;  5FPM A;  1TKZ A;  3KLG A;  1U47 A;  4A2A A;  4BRP A;  4BGA A;  4LF8 K;  1L3V A;  4Z0U A;  4CJP A;  3V4I A;  1QQM A;  3RWU A;  1P8Z A;  2DTU A;  3VEZ A;  3T1A A;  5AQM A;  4ELU A;  1IKY A;  4CJS A;  3ATU A;  4GV6 A;  3O3H A;  4J2E A;  3FE1 A;  1T7B A;  2ZF5 O;  3UKR B;  1O13 A;  1JXC A;  1PE4 A;  2E8A A;  1LW2 A;  2I5J A;  3ATV A;  1ZBU A;  4KI6 A;  1VSL A;  3JS6 A;  1YVU A;  3TTF A;  1Q81 O;  1T6C A;  3F2K A;  4GW6 A;  2YKN A;  1Z05 A;  3L0Q A;  3HL8 A;  2ETJ A;  2D0A A;  4DS5 A;  3LPT A;  3CC7 N;  3WXL A;  1JZA A;  5MLC Q;  3DLG A;  4E89 A;  1MA9 B;  2I7N A;  2GEL A;  2LT8 A;  2E1Z A;  3AVA A;  2QKK A;  4WFN L;  4KRE A;  1EWQ A;  3CXC M;  4I6M A;  2A7T A;  5HL7 L;  4JKC A;  4CD1 A;  3KD5 E;  3CG7 A;  3VEN A;  3B6O A;  2E2N A;  4BRO A;  3FZK A;  4ELT A;  1OH5 A;  4HUF A;  1VQ8 N;  2BRZ A;  3HK2 A;  4Y1D A;  4UQG A;  4G1Q A;  2VQF K;  4FJK A;  2P9S B;  3RMA A;  3E7U X;  4H0T B;  2JDQ D;  5CR4 A;  1UGL A; 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