3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
5E26A 2YHWA 4PL7A 3LDOA 3A5OC 1MA9B 3D2FB 1WOQA 4Y0WA 3SMSA 2YHXA 1QQMA 4EHUA 5BRDA 5E84A 4CZLA 3CJBA 1NGAA 5EY4A 3M1FA 5AQZA 1V4TA 5EXWA 4HWIA 2GEMA 1LCUA 3ZX3A 5BPNA 2V52B 2YJFA 3D2FA 1TUYA 3O6WA 3AAQA 1T6CA 4K25A 2KHOA 3IUCA 2F9WA 3IFRA 4GY2B 3HTVA 2P9IB 1TUUA 1YXQA 4BGAA 3CJCA 5BPMA 3FR0A 1XC3A 5AQUA 3VEYA 4JHDB 3HBTA 3UKRB 1BWFO 5AQWA 2PBDA 1ATRA 2ZWHA 2QWPA 2D0PA 4BC2A 4CZKA 4IJAA 4BRKA 3CI5A 5FPMA 4YDUA 2A40A 2P9IA 1XQSC 1OKJA 3KZBA 2HF3A 4JHDA 3TPQA 3UKRA 4FO0A 4F9OA 3A0IX 1BA0A 3FZLA 2P9KB 5AQJA 4PKHA 2V51B 1NGCA 3L4IA 4Z94A 4BREA 5LJWA 2I7PA 4XEIA 4O5FA 4XH5A 4CZFA 3I8BA 1SAZA 1GLLO 2P9KA 3TU5A 1E4FT 4B1UB 4MO5A 4RCHA 1V4SA 1BOTO 3S41A 2H3GX 2Q0UA 3U9DA 3H45C 1RDWX 5AQOA 1GLFO 4BR7A 2ZGYA 3GE1A 4QS8A 3VETA 4I6MB 3LDPA 1GLEG 3I33A 3R6MA 4FOEA 2NLXA 3FFKB 5ADXA 3GL1A 2VYPA 3AAPA 4CBXA 4IJNA 1XUPO 1BUPA 3GG4A 3O8MA 4CZGA 1KAZA 4B1VA 4I6MA 4CZIA 1BU6O 4HTLA 4WYBA 2CH5A 5KPZA 3MN7A 4L3QA 1YUWA 1GLAG 3H3OB 3CERA 4BRDA 1GLDG 4CZEA 3VEXA 2E1YA 4BRQA 1QZ6A 2D1KA 3FZKA 2P9LB 1U6ZA 1C0GA 2FLOA 3MCPA 3LDNA 1RFQA 3F9MA 2HF4A 1Z05A 1NMDA 1SZ2A 1X9JA 3VF6A 4H5RA 4QS9A 5AQHA 5FPEA 4BR2A 4H0XB 4O8KA 3MN9A 2P9LA 3VGLA 2I7NA 4BVPA 2D0OA 3C7NB 1Z6RA 4BQLA 1ESVA 4M7XA 1YVNA 3EN9A 3JXUA 3O1WA 3H6EA 2QWOA 3O4WA 4BRFA 3C0BA 4YDUC 5BRFA 1MWKA 4FWSA 1NLVA 4FWOA 3D7EO 2E2OA 1NGJA 1JCFA 3BF3A 3C7NA 4MO4A 1X3NA 5AQRA 5F1XA 1X3MA 2E2NA 3IDHA 4IZ9A 4C23A 3L0QA 3WQUA 2Q2RA 1DEJA 3QFUA 1QQNA 3ENOA 4B1ZA 5KQDA 2HOEA 4FWQA 4FWMA 1BG3A 1HJOA 1NGIA 2IIRA 3DXMB 1NGGA 4KBOA 1EQYA 4B1YB 2ASMA 3SJHA 4H0OA 4PKIA 3VF4A 5BN8A 3VEOA 5ELZA 4PKGA 5BR9A 2P9SB 3CETA 4JN4A 1NBWA 2VWBA 3DXMA 4FWNA 3A5LC 4WQ5A 3U9ZA 5AQKA 2QXLA 4B1WB 4LC9B 3VF2A 5AZJB 2P9SA 3WEEB 4H03B 2J4RA 5EOYA 4H5WA 2E88A 1KAYA 2Q97A 2PAVA 1HX1A 5B8HA 3O5BA 4CBWA 2YJEA 5AZJA 3WEEA 3DJCA 3VGMA 4BR9A 3LM2A 4AM7A 3G25A 4A62A 3BEXA 1QHAA 4EFHA 4QS7A 3ZETB 3EKSA 3LDLA 5AQIA 4FWKA 4ISFA 4ISEA 3VEWA 1HKCA 1NGFA 3DWLA 4JAXA 4IWVA 2BTFA 1RGIA 3FGUA 4EHTA 5KQ8A 3GDQA 4CBUA 3CQXA 3MDQA 2A42A 2GWKA 4ISGA 3ZETA 2ITMA 4BVOA 3H1QA 1H1VA 3LL3A 1CZAN 4E1JA 5AQMA 2OANA 3ZEUB 1NGHA 2WUSA 4H5NA 1ATSA 3O80A 2Q36A 3QFPA 4MLHA 4EIAA 2QWNA 3FZFA 2DPNA 4H0PA 2FXUA 3W3DA 3ZEUA 4H0VB 3QDKA 3R8EA 3LDQA 2E2PA 3GBTA 2GTDA 2QWRA 3EO3A 2W41A 3M6GA 5JLHA 3O1BA 1E4GT 2QWQA 2ZF5O 3H3NO 3FE1A 3MN6A 2GUPA 2NZTA 3QB0A 1HKGA 4BRLA 1DGKN 2QW9A 4JD2B 1J6ZA 1G99A 1Q18A 2FSKA 4BQZA 3SLCA 3UE5A 2GELA 3KHYA 3JS6A 4JD2A 2CGJA 3ID8A 2FSJA 2VCPA 4WQ5C 3M3ZA 3WXIA 5AQTA 3U4LA 1MWMA 2W40A 5BREA 5AZIB 4CZJA 3CJAA 3D2EB 5BN9A 4DHYA 4RWTA 5FPDA 3UKUB 4DCHA 2HMPA 3U8XA 2GWJA 5BPLA 3EZWA 1R59O 5AZIA 5AQVA 1NGEA 3ATVA 4IXCA 3D2EA 4BG8A 3WXJA 1HPMA 1T6DA 2YI1A 3UKUA 4BR0A 5AQLA 2AA4A 3FZHA 2ASPA 5CE3A 2IVPA 4FPBA 2EWSA 1S3XA 3DXKB 5AQYA 3VERA 4H5VA 3MN5A 3HSCA 1SQKA 4NB4A 4B1XB 5BRHA 5JICA 4FOIA 5AFUH 4CZMA 3DXKA 2D4WA 1ZXOA 3DAWA 1S22A 3VESA 1U2VB 2Q0RA 2V7ZA 4H5TA 4BGBA 1K8KB 4WQ4A 4K41A 2A3ZA 3QICA 1MDUB 4B9QA 4FL9A 4CD3A 5ADXH 4A61A 1GLBG 1U2VA 5F2RA 5AQPA 1NWKA 3LM9A 2QM1A 5AR0A 1ATNA 1K8KA 2P9NB 1BO5O 4BC4A 4K43A 3VPZA 3VENA 1IG8A 4BRIA 2A5XA 1JCEA 3B8AX 4BR5A 2FF6A 3HI0A 3SK3A 2QWMA 1ZBSA 2P9NA 1KXPA 3MK6A 1WUAA 2YCHA 1GLCG 1QZ5A 3L6QA 2NRHA 5AQSA 2F9TA 3A5MC 2CH6A 2Q31A 2YHYA 2QWLA 4A2AA 2E20A 1HKBA 3R9PA 3WUHA 3QBXA 4K42A 1NGDA 3H1VX 3CJ1A 4CD1A 2IVNA 4BROA 4DQ8A 2FF3B 3OHRA 5EX5A 4FSVA 4M63C 4BC5A 1YAGA 4XH4A 3CIPA 3ATUA 1T44A 1Y64A 4BC3A 5F0XA 3KVGA 4BRMA 2CGKA 2A41A 2CGLA 5LY3A 1D4XA 2E1ZA 3UB5A 5AFUA 3CQYA 3GOIA 3J8AA 5KPTA 1BA1A 3ZX0A 4BR4A 3WXKA 1IJJA 2E2QA 4BRGA 1ZC6A 4FWLA 3ENHA 5AQFA 4BRCA 4CI6A 1C0FA 5I9EB 3SMPA 4CJ7A 1GLJO 3HZ6A 2P9PB 3WXLA 5AQGA 2E8AA 1P8ZA 1HLUA 3CJ9A 2AP1A 5JMVA 5TKYA 3WT0A 3W0LA 3MMVA 3HM8A 2ZGZA 4BRNA 4MLEA 2P9PA 4PL8A 4EAHD 4FPAA 2P9UB 4BRPA 3AARA 4H0YB 2FSNA 4WQ4C 2Q1NA 3QMLA 3QBWA 3FLCO 3RSEB 3A5NC 5EVZA 3AY9A 1HUXA 5FPNA 3BP8A 3BF1A 3ULEB 4NO7A 4BRAA 2P9UA 4XH1A 4DB3A 4M7YA 4IO8A 3VGKA 3EL2A 4FWRA 5AQNA 3CHWA 1BDGA 3WQTA 3VEVA 3RSEA 4FWPA 4BG9A 1LOTB 5AQXA 2ASOA 5KPRA 4AM6A 3ULEA 3VOVA 3P4IA 5JLFA 5AQQA 2V7YA 3A8YA 1KAXA 2BUPA 4A2BA 3O08A 2UYTA 3FZMA 4H0TB 3BUZB 5LJVA 2A6AA 2IVOA 4CZHA 1QQOA 1TYQB 3H46O 3ZX2A 3IMXA 1NM1A 4J8FA 4GNIA 3CJ7A 1NGBA 3EKUA 4JNEA 1JCGA 3VEZA 4BRHA 4RTFD 1DKGD 1TYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KYQA 4PL7A 4IFVA 4AF1A 5C42A 3LDOA 4LF7K 1QSYA 2QA4N 4KREA 1MA9B 4M3XA 5SWMA 4N41A 1RBRA 4FVMA 1QQMA 3THXB 1WMTA 4FJXA 1UA0A 2W6LA 4IDHA 3U3YA 3RRGA 2KJAA 5EXWA 1V4TA 2GEMA 3C95A 2OPSA 5DM7L 1LCUA 2VWKA 2OPPA 1TUYA 3KIOA 1NJZA 1T6CA 4AHRA 3SF4D 3THXA 3HTVA 3HPGA 2KBJA 5BPMA 3FR0A 3MAQA 3SPZA 3ZSQA 4U7BA 4JHDB 2KW4A 3IAYA 3UKRB 3MEEA 4O55A 4MDAA 3CI5A 1CXQA 1XQSC 4JHDA 4F9OA 2HF3A 3UKRA 1ZFUA 1POIA 2M8BB 2MBKA 3MWTA 5JS2A 2V51B 4IBNA 3OJUA 1NGCA 4L8RB 2HB5A 2F8SA 4NXNK 3ZCMA 3KTQA 3OS2A 1V4SA 3SQ0A 3S41A 1B7DA 2Q0UA 1QHTA 2ZD1A 3U9DA 3SPYA 1N5YA 3I0RA 1LQQA 1RDWX 4LF4K 5AQOA 3K9JA 4Y1DA 4KH5A 3MECA 2PYLA 2E5LK 1GLEG 3I33A 3R6MA 1CZ9A 3TTDA 4C8KA 4NLBA 1T7EA 3GL1A 1SKSA 3AAPA 1NOZA 1XUPO 3O8MA 3LP3A 3CCSN 2X78A 5AJ3K 1NKCA 4FJ9A 4YOTA 3KD5E 4HTLA 3I56N 2FBVA 3SV4A 2E2FA 1VSEA 2OZSA 4AH9A 3CMEN 4JI3K 1GLAG 3CERA 1C6VA 1ZYWA 1BK8A 1GLDG 2E1YA 5I3UA 1QZ6A 4ID1A 5GAHP 2MN5A 3FZKA 4C8MA 1C0GA 2XY6A 3MCPA 2HF4A 1Z05A 1NMDA 1K8BA 3CF5L 5AQHA 4PUOA 1I39A 1TAQA 1XHXA 4O8KA 4CIFA 4JKEA 3BGRA 4CGFA 5H1SQ 4FJHA 3DOLA 3IS9A 1KFSA 2D0OA 2D56A 1ESVA 3JXUA 1YIJN 3H6EA 3O4WA 4BRFA 4YDUC 4FWSA 1NLVA 5CZ2A 3E1YA 3BF3A 3MX2A 2HHVA 3KOWA 5FRMA 3L0QA 3WQUA 1HR0K 2Q2RA 4LF9K 4B1ZA 3Q7BA 1RT3A 1HNIA 4M3RA 4FWMA 4O4GA 4CFBA 1HJOA 1QVFM 2ZQBA 2DY4A 3LP0A 4H0OA 1EO1A 3SQ4A 2QI2A 1FK9A 5ELZA 4DV3K 4JV5K 2NNWA 3CETA 4WFAL 3QIOA 4JN4A 2HHWA 1NBWA 4LY7A 1C0TA 4E1MA 4GVMA 3U9ZA 1Q81O 5AQKA 3FFIA 3KC6A 1AHOA 3SBTA 3VF2A 1WSIA 1BL3A 3S5TA 3V9XA 4GKKK 3UIQA 2J4RA 1IKXA 4H5WA 2E88A 2Q97A 3OYEA 2VQEK 1HX1A 1VSDA 3SAGA 3NE6A 4W5TA 3NGIA 2JGUA 4DWIA 4M3ZA 4DV1K 2YHAA 3E7RL 2YKMA 4WFBL 1VQLN 3SAFA 4QS7A 4CHYA 4ISFA 4ISEA 3AVAA 3VEWA 3ZSYA 2HHXA 1NGFA 3DWLA 5KTQA 1X1PA 1WSHA 4CBUA 1ZBHA 3JSMA 1VQNN 3MDQA 2A42A 3WXMB 3AA4A 3TI0A 1M1KO 1REVA 5DMRA 4ISGA 4F2SA 3H1QA 1H1VA 1U48A 1NNEA 2A1RA 1ATSA 3QFPA 4DR3K 4CJFA 3CD6N 1YT3A 2DPNA 3ZT0A 1J5EK 4E7LA 3G71N 2OTJN 5CYQA 1KLNA 4FJ5A 1SKRA 1T7AA 4DV2K 3DLLL 3MN6A 1HNXK 2HW3A 2OPRA 3NFAA 3CC2N 1WSEA 2E4LA 3LP2A 2FSKA 1FKPA 3V1OA 3O9SA 3VQ5A 3DRSA 4BQZA 4CK2A 1FXXA 3CCRN 4E1NA 4ID5A 3M3ZA 3DMJA 3ISNC 3KLFA 3CYGA 4FK0A 3ZSXA 3S9HA 1TKXA 2VG6A 4RG8A 5GIOA 4E7JA 3CYMA 1X9WA 1T1TA 1BRZA 1BQMA 1JZBA 1NKEA 5AZIB 4DHYA 2UU9K 4CFDA 5JVGL 3UKUB 4DSEA 4OLBA 4LSNA 5DM6L 3P38A 5AZIA 2QEXN 1NGEA 4EZ6A 1HYVA 1T6DA 3UKUA 1TVRA 4DF8A 1VQON 1SEGA 1O1WA 3CCQN 1Q86O 4FLWA 1QVGM 1S9GA 2P1JA 4JLHA 1M90O 3VERA 3WNHA 4AHSA 4DQSA 2B3CA 1SS6A 4DV5K 3CG7A 1UAXA 3J80O 3HSCA 3K5OA 2GBZA 3OBWA 1KVBA 4NB4A 4B1XB 3PO4A 1MU2A 5AFUH 3LPUA 1BGXT 4OGCA 1C56A 4I2QA 4BGBA 1U2VB 2Q0RA 4YOWA 3K58A 3CMAN 2MZ0A 3SUQA 3IG1A 1LV5A 4DTMA 1K8KB 4WQ4A 4K41A 4M45A 2A3ZA 4B9QA 4FL9A 2XO7A 4A61A 1HPZA 1U2VA 3QEPA 4MQ3A 5AQPA 3HL8A 1Q9YA 4Q0BA 1K8KA 1BO5O 3AVBA 1S1WA 1ICAA 3VENA 4Z4GA 4BRIA 2A5XA 3B8AX 1C55A 4BEBA 3IKMA 3KP0A 3SK3A 1SNBA 1GPSA 3QETA 2PY5A 1KXPA 3AVFA 3AO4A 3A5MC 2Q31A 1L3SA 2E20A 3ZLJA 2R7YA 3H08A 3QBXA 3H1VX 2A7TA 4IG0A 4FSVA 4M63C 4FJJA 4GV3A 4N47A 3QEXA 4A5AA 2CGKA 3KKSA 2UUBK 3HM9A 5AFUA 4K8ZA 1JXBA 3C6UA 1L3VA 1KVAA 1XNRK 4JKBA 4H4OA 3CQ8A 4E0DA 1RDBA 1IJJA 1LWCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KYQ A;  4PL7 A;  4IFV A;  4AF1 A;  5C42 A;  3LDO A;  4LF7 K;  1QSY A;  2QA4 N;  4KRE A;  1MA9 B;  4M3X A;  5SWM A;  4N41 A;  1RBR A;  4FVM A;  1QQM A;  3THX B;  1WMT A;  4FJX A;  1UA0 A;  2W6L A;  4IDH A;  3U3Y A;  3RRG A;  2KJA A;  5EXW A;  1V4T A;  2GEM A;  3C95 A;  2OPS A;  5DM7 L;  1LCU A;  2VWK A;  2OPP A;  1TUY A;  3KIO A;  1NJZ A;  1T6C A;  4AHR A;  3SF4 D;  3THX A;  3HTV A;  3HPG A;  2KBJ A;  5BPM A;  3FR0 A;  3MAQ A;  3SPZ A;  3ZSQ A;  4U7B A;  4JHD B;  2KW4 A;  3IAY A;  3UKR B;  3MEE A;  4O55 A;  4MDA A;  3CI5 A;  1CXQ A;  1XQS C;  4JHD A;  4F9O A;  2HF3 A;  3UKR A;  1ZFU A;  1POI A;  2M8B B;  2MBK A;  3MWT A;  5JS2 A;  2V51 B;  4IBN A;  3OJU A;  1NGC A;  4L8R B;  2HB5 A;  2F8S A;  4NXN K;  3ZCM A;  3KTQ A;  3OS2 A;  1V4S A;  3SQ0 A;  3S41 A;  1B7D A;  2Q0U A;  1QHT A;  2ZD1 A;  3U9D A;  3SPY A;  1N5Y A;  3I0R A;  1LQQ A;  1RDW X;  4LF4 K;  5AQO A;  3K9J A;  4Y1D A;  4KH5 A;  3MEC A;  2PYL A;  2E5L K;  1GLE G;  3I33 A;  3R6M A;  1CZ9 A;  3TTD A;  4C8K A;  4NLB A;  1T7E A;  3GL1 A; 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