3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
3EKUA 1ATRA 4M7XA 3ZEUB 3ATVA 3BF1A 4RTFD 5AQLA 5AZJA 1RDWX 3CIPA 3H3OB 4BQLA 1X3NA 3O5BA 2ASOA 1Y64A 1QZ6A 3MMVA 1S22A 4L3QA 4BR0A 1HKGA 1D4XA 2QM1A 4KBOA 3LDPA 1NGHA 4FWNA 3C7NA 5AQJA 3MK6A 4IWVA 3CQYA 1YAGA 4CBUA 4FPBA 3WXKA 4JD2B 1QQNA 3FZHA 1BOTO 2YJEA 5F1XA 4K43A 1QHAA 3FGUA 3GL1A 1MDUB 4BQZA 3A5LC 1TUUA 3R9PA 4ISFA 3HM8A 4Y0WA 3SJHA 3GOIA 1DEJA 2QWLA 5EOYA 2D4WA 3GG4A 1NBWA 4MO5A 5JLHA 3D2FA 4CBXA 1MWKA 1BU6O 3EO3A 3WEEB 2E2QA 1NM1A 3RSEB 4A62A 1MWMA 2ZF5O 3FZKA 2FSKA 3VPZA 3ULEB 4BRFA 1ATNA 4EFHA 2PAVA 3LL3A 2D1KA 3MN7A 3A8YA 4BC4A 3A5NC 3BEXA 3H46O 3DXMB 3MCPA 5EX5A 3O08A 1KXPA 4CZFA 2EWSA 5AZIB 4B1UB 4O8KA 5JLFA 3R8EA 3VEYA 3EL2A 5AQWA 1CZAN 2DPNA 5KPRA 2ASPA 1U6ZA 4FWRA 3KVGA 5AQVA 5AFUH 3LM9A 4FOIA 1TUYA 1ZC6A 4CD3A 4ISEA 4M7YA 3CJ7A 3VESA 5KQDA 3W3DA 3ZX3A 2VCPA 1C0GA 3QB0A 4H0OA 3SMSA 4CZGA 3A5OC 2QXLA 5BN9A 1NLVA 2P9NB 3AY9A 3O4WA 3ZX0A 3F9MA 4CBWA 4JN4A 4H0YB 2I7PA 4FWMA 4MLHA 4IO8A 3FZFA 1NGJA 1S3XA 4PKGA 3A0IX 3RSEA 2P9IB 4WQ5A 2GWKA 4XH1A 5BRHA 3ULEA 1X3MA 2QWQA 3U4LA 3FZMA 4BRHA 4NO7A 1H1VA 2P9UB 3DWLA 3LDNA 4H5WA 4JAXA 3DXMA 3M6GA 3D2EB 5BREA 3QBXA 2A5XA 1NGGA 5AZIA 1NGBA 5AQMA 3VGMA 3HI0A 4IJNA 2V52B 4WQ5C 2VWBA 4ISGA 2D0OA 4EHTA 2YHXA 4F9OA 1R59O 4RCHA 4QS8A 3CI5A 3I8BA 5AQFA 2E1ZA 2YI1A 1BA0A 3L4IA 4H5RA 3CHWA 4H0XB 4XH4A 2CGKA 4BRIA 1T6CA 3ENHA 3UKRB 4H0TB 4QS7A 3LDLA 5AQYA 1JCGA 1HPMA 2BTFA 3LM2A 3M3ZA 2HF3A 3P4IA 4FPAA 4PKHA 4BRPA 3M1FA 1WOQA 2FSNA 1BUPA 4BR2A 2Q0RA 2FSJA 1HKBA 2CGJA 2Q97A 5E84A 2HMPA 1OKJA 2P9SA 1GLJO 3QBWA 2P9UA 4H5NA 5JICA 1WUAA 4B9QA 4PL8A 2YHYA 1TYQB 4BR7A 1Q18A 4BGBA 2ITMA 3FFKB 4IZ9A 4WYBA 4HTLA 1U2VB 4K41A 5AQIA 4CZMA 4HWIA 3DXKA 3LDQA 2E20A 4QS9A 4CZEA 3VEVA 5AR0A 1YUWA 3VEXA 1GLEG 1HKCA 4NB4A 2YJFA 4BVPA 3AARA 1HJOA 3R6MA 3IFRA 3FZLA 3QFUA 4WQ4A 3ZX2A 2V7ZA 4JNEA 1IJJA 5AQPA 3EN9A 4B1ZA 4CZIA 3ZEUA 4H5TA 4EAHD 4XEIA 5BPLA 4CZJA 4DB3A 5B8HA 1HX1A 1ESVA 1IG8A 3MN5A 4H5VA 5FPDA 5AQKA 2FF6A 4FWKA 3MDQA 3I33A 5AQRA 2OANA 4FWSA 4WQ4C 1GLAG 5BPMA 4A2AA 4DHYA 2KHOA 1KAXA 3VGKA 5ADXA 3CJ9A 4FWOA 4JD2A 4GY2B 1XUPO 4BVOA 4FOEA 3FE1A 3EKSA 3WQUA 3U9ZA 1JCFA 4IXCA 1EQYA 1HUXA 4FWLA 1U2VA 4BRQA 3H45C 3DJCA 3UB5A 1NWKA 4BROA 4DQ8A 5BRDA 2V51B 3CJ1A 4CD1A 1YVNA 1LCUA 2AA4A 4J8FA 3S41A 5FPNA 1V4TA 3SLCA 4BC5A 4RWTA 2NLXA 3WEEA 2QWPA 2J4RA 3TPQA 4CI6A 3VEWA 2BUPA 2CGLA 1BWFO 1YXQA 2Q36A 1T44A 2A6AA 4BRLA 1NGDA 2A3ZA 1BA1A 3L0QA 2P9PB 3B8AX 5BPNA 1HLUA 3WXLA 2GEMA 2IIRA 2CH5A 3H6EA 5AZJB 1NGCA 5AQZA 1NGIA 4H03B 2A40A 4FWQA 3VF4A 4BR4A 2GTDA 4B1XB 1P8ZA 4CJ7A 5BRFA 2ZGZA 5ELZA 3BUZB 2Q1NA 4C23A 2W40A 1GLCG 4MLEA 4BR5A 4K42A 3FLCO 3GE1A 3AAQA 4B1VA 1K8KB 4BRGA 2P9NA 3WXIA 4BRCA 1SQKA 2HF4A 3C0BA 5EY4A 1XC3A 4MO4A 5AQXA 5AQOA 2Q0UA 5KQ8A 2GELA 4B1YB 5AQNA 1NGFA 2Q31A 4K25A 4PL7A 5AQHA 2P9IA 3ID8A 4AM7A 3OHRA 4A2BA 3SK3A 1GLBG 3SMPA 4B1WB 3VENA 1BDGA 1NGAA 1NGEA 2CH6A 5TKYA 2P9PA 2Q2RA 1ATSA 1RFQA 2GUPA 2GWJA 2HOEA 3L6QA 3WT0A 3O1BA 5BR9A 3D2EA 3TU5A 1GLLO 1DGKN 5ADXH 1J6ZA 2VYPA 1X9JA 5BN8A 3KHYA 5F2RA 1MA9B 4A61A 2PBDA 2F9WA 5KPZA 1KAYA 1SZ2A 2ASMA 4BG9A 3BP8A 4BGAA 3BF3A 2QWNA 1JCEA 1BG3A 2FLOA 4Z94A 2A41A 2H3GX 3LDOA 3HTVA 3H1VX 3O6WA 3O8MA 5LJWA 1K8KA 1C0FA 2ZGYA 3H1QA 3ZETB 4JHDB 3UKRA 3WUHA 4BC3A 4YDUA 5AQUA 2A42A 3A5MC 3DAWA 1QQOA 4DCHA 1G99A 2P9KB 5FPEA 5AQGA 1T6DA 2P9LB 1E4FT 4BRAA 3JXUA 2I7NA 4GNIA 4BRMA 4M63C 3CJCA 2W41A 4BRDA 1BO5O 3UKUB 1E4GT 3MN9A 4EHUA 1KAZA 4YDUC 5LJVA 3O80A 3W0LA 2NZTA 1TYQA 3HSCA 3D7EO 3GBTA 2IVOA 1QZ5A 2ZWHA 2AP1A 1NMDA 4BRKA 2QW9A 4FWPA 4LC9B 3IUCA 3H3NO 3QICA 3VOVA 3VETA 2QWOA 2D0PA 1Z6RA 3FR0A 3J8AA 4BC2A 5AQSA 3U9DA 4IJAA 4BREA 1QQMA 5LY3A 4BG8A 3HBTA 2YHWA 3ENOA 3UE5A 1XQSC 3ZETA 4E1JA 3QMLA 4JHDA 3CERA 1Z05A 2E8AA 3CJBA 4EIAA 2E88A 4I6MB 3VEOA 4FL9A 3VF2A 1ZBSA 5F0XA 2IVNA 3IDHA 2P9KA 2P9LA 3CETA 4BRNA 4BR9A 2E2NA 2F9TA 4FO0A 3GDQA 3VF6A 5AQTA 2E2PA 2FF3B 5JMVA 3UKUA 3IMXA 4CZHA 4AM6A 2FXUA 4XH5A 1SAZA 2UYTA 2YCHA 5I9EB 4O5FA 4H0PA 2E2OA 4PKIA 5EVZA 2P9SB 3C7NB 3WQTA 2QWRA 1DKGD 3QFPA 4H0VB 5AQQA 3HZ6A 5CE3A 3VGLA 4CZLA 3VERA 3CQXA 3ATUA 5AFUA 4CZKA 3QDKA 3JS6A 1LOTB 3MN6A 3U8XA 3AAPA 1GLFO 3DXKB 3O1WA 2NRHA 3KZBA 5FPMA 2IVPA 5EXWA 2WUSA 5KPTA 3G25A 3EZWA 3WXJA 1RGIA 1GLDG 1ZXOA 2E1YA 2V7YA 4I6MA 3D2FB 1V4SA 3CJAA 3VEZA 5E26A 2QWMA 4FSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M7XA 3ZEUB 1DTTA 3BF1A 4RTFD 4R79A 3E9OA 4DQSA 1NJWA 3OYEA 4DSLA 3H3OB 4MQ3A 2JDQD 4CJ5A 3GKUA 4KFBA 3MEGA 5FDLA 4E7HA 4GKKK 2YKNA 3AVJA 4BR0A 2YIOA 1HKGA 3AVHA 3QEWA 2Z1IA 2VQFK 4LH4A 1GPSA 4DTSA 2O8CB 1PTXA 1VHXA 1BCOA 3E9PA 3O4QA 3ZSRA 2LT8A 2A7TA 3WXKA 1JLCA 4JD2B 4W5OA 1QQNA 3T1AA 2YJEA 4K43A 4JKCA 1QHAA 1SL1A 1P90A 3DRSA 4W5RA 3LPUA 2P51A 2LR3A 3HM8A 4FLTA 3GOIA 2QWLA 5C42A 3L2UA 5EOYA 3ALYA 1J9AA 4MO5A 3GG4A 1XNQK 4CBXA 3QEXA 2G2KA 3EO3A 4A62A 3VQCA 1RT6A 2FSKA 2E5LK 4B8CA 4KTZA 3ULEB 4CFBA 3EYZA 3AGRA 3M8QA 1W9HA 3RWUA 2PAVA 5DMRA 2W42A 1X9WA 2D1KA 2UUAK 2HVHA 1SKRA 3L2VA 3H46O 3MCPA 5EX5A 1BHLA 3KK3A 3AO5A 2EWSA 4CZFA 2HHQA 4WFAL 5AZIB 4B1UB 2D0AA 3CG7A 5JLFA 4KHWA 3VEYA 5AQWA 1NK5A 2Y1JA 4IOCL 2UXDK 5AQVA 1BCGA 3LM9A 4FOIA 1TUYA 4CW7B 4DUZK 4BECA 4CD3A 3CJ7A 4ID1A 5GIPA 5KQDA 2ZJPL 4H0OA 3KD1E 4UY8O 3A5OC 2QXLA 1HPZA 2EX3A 3AY9A 3O4WA 4OKKA 5C24A 1KVAA 1C55A 1J5OA 4JN4A 3OYCA 1W97L 3MX5A 5LMNK 4J2BA 5KK4A 2GWKA 3THWB 5BRHA 4RW6A 1T05A 1WB9A 3KK7A 4DFMA 3DOLA 4FYDA 3DWLA 4OLBA 4DTNA 3DXMA 1HYVA 4IFEA 3VMFB 3AVBA 5AQMA 3P83D 4IJNA 4JK9A 4PWDA 3LWLA 4WQ5C 3G71N 1NK6A 2KJAA 3NF9A 2VG5A 3NFAA 5C2FA 1T8EA 4LF9K 1BK8A 4QS8A 3CI5A 1VQPN 3I8BA 3K58A 3L4IA 4CF0A 4FLXA 1VQON 5E41A 4BRIA 4JKFA 1ZYVA 3UKRB 1IKVA 3RMCA 3LDLA 3ZYYX 4E7LA 3LM2A 3P4IA 1KVBA 4CJ4A 1RT4A 3DOKA 1WSJA 2N69A 2KZZA 1EXQA 1JLBA 1ZU3A 2Q97A 5LMUK 4X66K 1VQLN 4OX9K 2P9SA 1GLJO 4I9QA 1A5VA 3SQ1A 2YBRC 1A5WA 1N6QA 4H8KA 3VTIA 1SKWA 3CCRN 4BR7A 4B9LA 2ITMA 3NF6A 1VQ4N 3CCLN 2UXCK 1ZBHA 4A5BA 5SWMA 1Q86O 4AHUA 4JI7K 3KLEA 5HRNA 4HVJA 1UWBA 4AQYK 4N41A 2O8EA 5AR0A 1JZAA 4CGJA 1WT7A 3QFUA 4CESA 1JXEA 1WSIA 3HPOA 1M90O 4Q0BA 1EETA 2UUBK 3CFOA 4HUFA 1IO2A 2HHVA 1IJJA 3Q7BA 5AQPA 3EN9A 4DV4K 3V1OA 2G8FA 2KFNA 5JS2A 3VA0A 3OYFA 4NYNA 4XEIA 4CZJA 4JRQA 1NRBA 3MN5A 1KFSA 5FPDA 1NK7A 3R1XA 2FC0A 3ZSXA 3I33A 5AQRA 4FWSA 5BPMA 3THXA 3TANA 5ADXA 1WAFA 3CJ9A 1ZYQA 4N76A 3PIPL 3BDPA 4IBNA 1SKSA 3U9ZA 4JK7A 4GV6A 1HUXA 3M5RA 2KBHA 1HNVA 3UB5A 3DJCA 4B8AB 3G6EN 3C6HA 4FK0A 2WTUA 3V4IA 1G15A 1QTMA 3ULDA 3VTHA 2NLXA 2DFEA 3SV3A 4DR7K 2KLAA 4JKGB 5GAHP 1HNZK 1T44A 3AGKA 4FW1A 4MFBA 4AHVA 1UOCA 1BA1A 1EO1A 3VQ9A 4LF6K 1BRZA 2A40A 4IEIA 2GTDA 4DF4A 2G8UA 1ZBIA 4UQGA 5H1SQ 4BY9C 2Q1NA 2B4JA 3KTQA 4C23A 1GLCG 1QE1A 4B3SK 3FLCO 2X6SA 4O0IA 1C1CA 3E66A 4JKAA 1LWEA 1T3VA 1LQQA 3WXIA 2HW3A 5CZ2A 4M3UA 3VA3A 4CK2A 4U67L 1GOAA 4CF8A 4RG8A 3KLIA 1BI4A 1NU0A 1FJGK 4BWJA 4K25A 4B9UA 4PL7A 2P9IA 3OHRA 1C1AA 3SK3A 4BACA 3V9SA 1BDGA 2HHSA 5TKYA 4C8LA 4A57A 1ATSA 2GWJA 4O44A 3D6RA 4M3RA 3MWTA 3TAFA 1JLQA 4C8MA 3O1BA 3TTDA 2NY9X 1L3VA 3V9UA 3TU5A 1RTHA 1DGKN 2VYPA 2YNFA 3SAHA 1F21A 4A61A 2MBKA 1RDBA 2PBDA 3NGZA 1QVFM 2VWKA 3V6DA 4JLHA 3DLLL 1KLNA 2LY6A 4BGAA 3BF3A 2FLOA 4Z94A 3VQQA 3SPYA 3H1VX 3O8MA 5LJWA 5DM6L 4YNQA 2ZGYA 1L3SA 1Y97A 3HP9A 1R0AA 4YDUA 2A42A 1MR4A 3PUFA 5J2NA 3AVAA 1QQOA 3NGYA 4RW9A 4OJRA 2HHWA 2NUBA 1XNRK 4V19S 3CJCA 3S3NA 4BRDA 2VWJA 3UKUB 3O3FA 1N33K 3O3GA 4X62K 1KAZA 5LJVA 1BIUA 3O80A 1U49A 2BE2A 2OPPA 1NMDA 1VQ6N 4CGIA 3DLRA 4FWPA 3KK1A 4Y1DA 4CF2A 3K5MA 1O13A 1TI5A 1RBRA 1Q81O 3VETA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M7X A;  3ZEU B;  1DTT A;  3BF1 A;  4RTF D;  4R79 A;  3E9O A;  4DQS A;  1NJW A;  3OYE A;  4DSL A;  3H3O B;  4MQ3 A;  2JDQ D;  4CJ5 A;  3GKU A;  4KFB A;  3MEG A;  5FDL A;  4E7H A;  4GKK K;  2YKN A;  3AVJ A;  4BR0 A;  2YIO A;  1HKG A;  3AVH A;  3QEW A;  2Z1I A;  2VQF K;  4LH4 A;  1GPS A;  4DTS A;  2O8C B;  1PTX A;  1VHX A;  1BCO A;  3E9P A;  3O4Q A;  3ZSR A;  2LT8 A;  2A7T A;  3WXK A;  1JLC A;  4JD2 B;  4W5O A;  1QQN A;  3T1A A;  2YJE A;  4K43 A;  4JKC A;  1QHA A;  1SL1 A;  1P90 A;  3DRS A;  4W5R A;  3LPU A;  2P51 A;  2LR3 A;  3HM8 A;  4FLT A;  3GOI A;  2QWL A;  5C42 A;  3L2U A;  5EOY A;  3ALY A;  1J9A A;  4MO5 A;  3GG4 A;  1XNQ K;  4CBX A;  3QEX A;  2G2K A;  3EO3 A;  4A62 A;  3VQC A;  1RT6 A;  2FSK A;  2E5L K;  4B8C A;  4KTZ A;  3ULE B;  4CFB A;  3EYZ A;  3AGR A;  3M8Q A;  1W9H A;  3RWU A;  2PAV A;  5DMR A;  2W42 A;  1X9W A;  2D1K A;  2UUA K;  2HVH A;  1SKR A;  3L2V A;  3H46 O;  3MCP A;  5EX5 A;  1BHL A;  3KK3 A;  3AO5 A;  2EWS A;  4CZF A;  2HHQ A;  4WFA L;  5AZI B;  4B1U B;  2D0A A;  3CG7 A; 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