5ELZA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Staphylococcus aureus
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 98
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA01
1GLFO 2QWMA 4O8KA 5AQOA 5BRDA 4XH1A 4H5WA 4B9QA 1MDUB 1NGGA 2ASPA 2E2OA 2Q0RA 5AQWA 5TKYA 4B1XB 1SAZA 1BOTO 3QMLA 3QICA 2FSKA 2P9KB 4IXCA 4EHTA 3CIPA 3U9DA 2P9NA 1RGIA 2KHOA 5FPDA 2P9IB 1Y64A 5BR9A 4BC5A 2IVPA 2E8AA 3H3OB 1ATSA 2CGJA 2HF4A 3F9MA 2QM1A 4FWQA 3ZX3A 1HPMA 1EQYA 3VEYA 1TYQA 3CI5A 3ZX0A 3WXJA 3H46O 3QB0A 3QDKA 4B1UB 1NM1A 3GOIA 3KVGA 3IFRA 4WQ4A 5B8HA 5F0XA 5JLFA 4F9OA 4NO7A 5ADXA 2F9WA 5AQSA 3EKUA 1HX1A 5E26A 3M6GA 2AP1A 3VEWA 4YDUC 3ATVA 3ZEUB 3DJCA 1QQMA 3UKUA 2ASOA 2NRHA 3J8AA 1HKBA 3P4IA 5AQZA 3UKRB 3LM9A 2D0PA 3A5NC 3HSCA 3KZBA 3L6QA 4BGAA 3A5OC 1G99A 1QQOA 4Y0WA 3H1QA 3WXKA 5AQXA 1SZ2A 1OKJA 4FWLA 4HTLA 3SMPA 5LJVA 4JN4A 2J4RA 2QWNA 1WUAA 1GLLO 2E2QA 3W0LA 3MN5A 5EX5A 3O6WA 5AQJA 1RFQA 5JLHA 3FGUA 2IVOA 3LDOA 1BUPA 1T6DA 4PL7A 4CD3A 2QXLA 2QWOA 2Q31A 4FL9A 2ZGYA 1LOTB 1K8KA 4O5FA 4CI6A 1KAYA 5F2RA 1U2VB 1NGFA 4FWNA 4H0OA 3CJ9A 4BR0A 4MLEA 1NGBA 2E20A 4PKIA 5E84A 4BR2A 4CD1A 3MMVA 4DHYA 1ZBSA 2GWKA 1QQNA 2I7NA 5FPEA 2P9NB 3A5MC 3VEVA 2YI1A 3U4LA 1X3MA 4MLHA 4MO4A 4FWOA 3EL2A 3L4IA 3U9ZA 3VF2A 2E1ZA 5F1XA 3LDLA 3MN6A 4H5NA 3VF4A 3VOVA 3GL1A 4H5VA 1DEJA 3B8AX 4M63C 3R8EA 1DKGD 4BC4A 3LDQA 3MN9A 3FLCO 4H0XB 1YUWA 1P8ZA 4QS8A 3FR0A 3ATUA 3O8MA 5EOYA 5FPNA 2P9PA 1Z6RA 2BUPA 4PL8A 4BVPA 1IG8A 1NGCA 1BG3A 5AQUA 4RWTA 3BUZB 4XEIA 1IJJA 4PKGA 4A61A 4JHDB 1BA0A 2H3GX 2FF3B 2V7YA 4K41A 3CQYA 5BN8A 1T44A 4BR9A 4BRCA 5AQVA 3FZLA 3WEEB 3WUHA 3HM8A 4WQ5C 4CZIA 3UKUB 4FWSA 5I9EB 3I33A 3VF6A 3VEZA 4IJNA 4IJAA 1LCUA 2DPNA 5BPNA 1YAGA 2QW9A 4KBOA 1BU6O 3U8XA 1CZAN 4BG8A 4CZJA 4XH5A 3AAQA 4A2AA 2QWLA 4CZMA 4Z94A 4ISGA 5AZJA 5AQNA 3A8YA 3DXKA 5FPMA 3OHRA 5AQTA 2AA4A 4BC2A 2VYPA 4H5RA 3SMSA 3C0BA 1V4TA 5JICA 3CJ1A 3DAWA 1E4FT 1TUUA 2Q1NA 3VERA 3SJHA 3WXIA 1XC3A 2Q2RA 4BR5A 1H1VA 4B1WB 3FZMA 3QBXA 1NMDA 4CZGA 1K8KB 5KQDA 2ASMA 1NGJA 2ITMA 5KPTA 4XH4A 3C7NA 2E88A 3H1VX 3CETA 5AQLA 5AQGA 2YHYA 4B1ZA 5AR0A 3ENHA 2P9UB 3SLCA 4AM6A 5BREA 4BRHA 2D0OA 2FLOA 3ULEA 1ZC6A 2E1YA 5LJWA 4FWPA 4AM7A 4PKHA 4EFHA 2E2PA 4FWMA 2YHXA 3HTVA 5BN9A 3CJCA 2CGLA 4WQ5A 3TU5A 4K25A 4RCHA 1JCEA 4CBWA 2P9SA 1NGIA 2ZWHA 4BRKA 2NLXA 2YJFA 3HI0A 1V4SA 2I7PA 4QS9A 2P9KA 3WQTA 2P9PB 1MWMA 4IZ9A 4I6MB 3AARA 4EHUA 1YXQA 2WUSA 3O4WA 3FZFA 5AQFA 4CZKA 3EO3A 3FZKA 3SK3A 2P9LA 3VEXA 2IVNA 3RSEA 1MWKA 3H3NO 4M7YA 2GTDA 3LDNA 3LM2A 1NLVA 3BF1A 1X3NA 1E4GT 2YCHA 4ISFA 1DGKN 3IDHA 1NWKA 4BR4A 3ENOA 4E1JA 1HLUA 5AQHA 2W40A 5AQQA 4CZFA 5EY4A 2E2NA 3D2EA 3EZWA 3CJ7A 3VGLA 1GLBG 1MA9B 5AZJB 4A2BA 5BRHA 5KPZA 3W3DA 5AQKA 4YDUA 3EN9A 1NGAA 2PBDA 3R9PA 1TYQB 3JS6A 1C0GA 1JCFA 5AFUH 3O1WA 3O5BA 2HF3A 4JAXA 5AQRA 4BQLA 1NBWA 2QWPA 1ESVA 3R6MA 1Z05A 3I8BA 3MK6A 2FF6A 1ATNA 2A5XA 3VESA 4NB4A 4GNIA 2FXUA 2Q0UA 3C7NB 3GG4A 1HUXA 4B1YB 3MDQA 4FOIA 4L3QA 1BO5O 5KPRA 5BPMA 1GLEG 3CJBA 2FSNA 4H5TA 2CH6A 3ID8A 5EXWA 2V7ZA 4FWRA 3CHWA 1QZ5A 4BRQA 4A62A 2VWBA 5ELZA 2FSJA 4CJ7A 3AAPA 3IMXA 2PAVA 5AZIA 3QFUA 2A40A 4M7XA 3TPQA 4BRLA 5AQYA 4BRPA 4GY2B 4WYBA 4BRDA 2GEMA 4H03B 1BDGA 2Q36A 4H0YB 1U2VA 2P9SB 2V52B 3QFPA 5LY3A 3DXMA 2EWSA 5AQMA 1C0FA 3G25A 3MN7A 2A6AA 4CBUA 2CGKA 3WQUA 2QWRA 4BRGA 3O08A 3CERA 5JMVA 4CZHA 1ATRA 1BWFO 1BA1A 2P9LB 4BR7A 4CZEA 3RSEB 1GLJO 3DWLA 4BVOA 3BF3A 4BREA 3O1BA 3VGMA 4FOEA 3VGKA 3BP8A 1YVNA 4B1VA 3ZETA 3BEXA 3VEOA 2YHWA 1GLAG 5AQIA 1S3XA 4DCHA 1NGDA 3D2EB 4IWVA 3GDQA 3UE5A 4FPAA 4BRAA 4FO0A 1ZXOA 1QHAA 3IUCA 4BRIA 4JHDA 3D2FA 3FFKB 4JD2A 2BTFA 3LL3A 4BQZA 5ADXH 3VPZA 3O80A 4DB3A 3HBTA 3WEEA 2IIRA 1WOQA 4BC3A 3S41A 4K42A 3H6EA 3QBWA 1J6ZA 4IO8A 1KXPA 2QWQA 2A42A 3JXUA 2UYTA 4FSVA 3A0IX 2GUPA 4H0TB 4JNEA 5KQ8A 3M1FA 2P9IA 4CBXA 1RDWX 4H0VB 1XQSC 1NGHA 1SQKA 3GBTA 4ISEA 4C23A 1TUYA 4BRFA 5BPLA 3CQXA 4EIAA 2GELA 2W41A 2HOEA 3AY9A 1HKGA 4J8FA 1D4XA 1HJOA 1Q18A 3WXLA 2VCPA 5AZIB 1T6CA 2ZGZA 3FZHA 4RTFD 3A5LC 4K43A 3D7EO 1GLDG 3DXKB 5AFUA 4MO5A 2A41A 3DXMB 3UB5A 2ZF5O 4QS7A 3ZX2A 2GWJA 3CJAA 3EKSA 5AQPA 5CE3A 2HMPA 1X9JA 3H45C 3VETA 1GLCG 4DQ8A 3VENA 3ZEUA 2P9UA 2NZTA 1QZ6A 4BG9A 3FE1A 3LDPA 3MCPA 4BRMA 4BRNA 3UKRA 1R59O 5EVZA 4HWIA 2D1KA 4BGBA 2CH5A 4FPBA 4WQ4C 4EAHD 4BROA 2D4WA 4LC9B 2V51B 2F9TA 3KHYA 1U6ZA 3ZETB 4FWKA 4CZLA 3WT0A 3M3ZA 1XUPO 3ULEB 1KAZA 5BRFA 2OANA 1KAXA 2YJEA 3L0QA 4I6MA 1HKCA 3D2FB 3HZ6A 3GE1A 1NGEA 4JD2B 1JCGA 1S22A 2Q97A 4H0PA 2A3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FK0A 2QWMA 5AQOA 4OVLA 3QETA 4FLZA 4H5WA 5AQWA 5DM7L 3EZ5A 3QICA 4IXCA 4EHTA 4Z4GA 3B6OA 4ZTJA 2O8EA 5H1SQ 1S72N 4J2DA 1RGIA 3NGYA 4CJTA 2KHOA 4WFAL 3CMEN 4KHSA 3WXMB 2VG5A 4KI4A 5BR9A 1HRHA 2OPSA 3BGRA 3K58A 4O5BA 3O9UA 3CCVN 3KK7A 1RBUA 2RF2A 4JI8K 5JS1A 3O3FA 3WXJA 2IS3A 3LAMA 1NM1A 5HRNA 3KVGA 2NRXA 4E89A 5B8HA 1XWLA 4LFCK 3CCLN 2F9WA 3IRXA 3C94A 2HHWA 2VGNA 1WBBA 1NKCA 1WSEA 3SI6A 1T3VA 3PIPL 1VQ7N 3DJCA 3UKUA 2Q3SA 4WE1A 1JKHA 3P4IA 3LM9A 4CEQA 4XIUA 3HSCA 3KZBA 4BGAA 2O8BA 1G99A 1QQOA 1WBDA 2IOCA 3O9QA 2OPQA 3PX6A 3NF9A 3D0PA 1WUAA 2WTUA 2HVHA 3C65A 5MLCQ 4E7KA 2O8FB 4CHNA 4ID1A 1ZBHA 1HNVA 3LDOA 3EEQA 4FLXA 2QXLA 3HOSA 4FL9A 2ZGYA 1IKYA 3KK1A 3TWHA 4UY8O 2HHVA 4CFBA 4CCHA 5F2RA 1U2VB 3CJ9A 3WNHA 4O0IA 5KGWA 1NU0A 3ENBA 1S1WA 2NNWA 4MLEA 2E20A 2W6KA 4BR2A 4DSIA 4DHYA 1QQCA 1ZBSA 4WFBL 1NK4A 2BGGA 3VEVA 1X3MA 1SKRA 3U9ZA 3CCEN 1XC9A 2E1ZA 4YFUA 4DV2K 4E7JA 3MN6A 3VF4A 4GV6A 3GL1A 4H5VA 4AHRA 4BACA 1OH8A 1CZBA 3B8AX 3C6TA 3R8EA 1J5OA 1UAXA 3OJSA 3G10A 3BDPA 3PLAA 1YUWA 1P8ZA 4GV3A 4QS8A 1C1BA 2FBXA 3OYAA 4C8NA 1IG8A 1SL2A 4FJLA 4CJKA 1IJJA 4A61A 4BE2A 4B9TA 5HRSA 4JHDB 3AGKA 4RW8A 4J2BA 2FF3B 4M3YA 2HW3A 2Y1IA 2D0BA 1T44A 2VWJA 3S3NA 3ITHA 3WUHA 3WEEB 4CJEA 1RDBA 4CZIA 1RCHA 1NJIO 3O9TA 5I9EB 3CMAN 1N8RO 4OPJA 4IJAA 1GOAA 5M1QA 4OGCA 3HT3A 1WN7A 1RTJA 2QW9A 3U8XA 4XH5A 3ULDA 4KI6A 2Z1IA 2I5JA 4RW6A 4A2AA 3J7YP 5AZJA 3PY8A 2B4JA 5AQNA 3MAQA 3PV8A 3HVRA 3HJFA 4DQRA 4Y1CA 5TKWA 2NRWA 1V4TA 3EYZA 3WNGA 3PX4A 4BY9C 3WXIA 1XC3A 2Q2RA 2YKMA 4BR5A 3L2RA 4CK3A 3MWPA 3AO5A 1NGJA 1JLCA 1LW2A 1TL1A 3H1VX 5AQLA 5AQGA 4GW6A 1EETA 3SNNA 4G1QA 1N34K 4DTOA 2P9UB 2WFBA 4AM6A 2P5GA 5C15A 3ULEA 4LSLA 3TAEA 4JI7K 1U49A 1JXEA 3OS2A 1QVFM 3PO4A 4EFHA 4PKHA 2F7TA 5A2QO 3DYAA 1DLOA 2ZE2A 2GV9A 3CJCA 2CGLA 4DTJA 4WQ5A 5CZ2A 1K8AO 4CIFA 3OYFA 3P39A 4CECA 2HHSA 3NVMA 3LP0A 2ZWHA 5IWAK 2NLXA 1JLGA 2YJFA 3HI0A 4BE0A 4Z4IA 4KH4A 3CCSN 4IZ9A 4EHUA 2WUSA 3O4WA 5AQFA 3I55N 3UIQA 1RDAA 3VEXA 2P9LA 3MEEA 4DTUA 4W5RA 1WSIA 4CEFA 3NGZA 5J1EA 3BF1A 1X3NA 1E4GT 2YCHA 3CM6A 3IKMA 2PYLA 3F2KA 1DGKN 1SL1A 1EWQA 4HVJA 4HHTA 3LWMA 3QO9A 2W40A 5M1NA 1RILA 3L3VA 1HYZA 4CJQA 4E0DA 4RW7A 4NCAA 1VAZA 5KPZA 3KJVA 1NK5A 3O4QA 1Q9YA 4A5BA 3MX5A 1VSIA 1TYQB 5AFUH 1JCFA 3VQ6A 1EX4A 3O1WA 4BQLA 2PZSA 3OJUA 1FJGK 2X74A 1MU2A 1TL3A 3AA3A 5CR4A 3TARA 1NKBA 1YJ9N 4FLWA 1QSYA 4H5TA 3SPZA 2O8FA 3L2VA 2V7ZA 2HBKA 3CHWA 1VQKN 1QZ5A 1Q86O 1RTHA 4DR4K 1ZYQA 4CJVA 5ELZA 1VSMA 4CJ7A 5JVGL 4AILC 2PAVA 3QFUA 4BRLA 1FKOA 3OBYA 4BRPA 4GY2B 4WYBA 4BRDA 4H03B 3VQPA 3OS1A 1U2VA 3AVMA 4F4KA 3TAGA 1HQEA 3QFPA 4BWJA 3KD5E 2O8DA 5AQMA 3G25A 3ZSQA 2A6AA 1REVA 2CGKA 3M8SA 1LV5A 4DTRA 2QWRA 5KTQA 1A5XA 1IKXA 1RT2A 1ATRA 3OW2M 4KV8A 1BWFO 3TAMA 1EKEA 2YNGA 4CZEA 3RSEB 3AVJA 4BVOA 2E6MA 3VQ4A 4BREA 4FOEA 4CEOA 4F3TA 4M3RA 1KQSM 1RT3A 3BEXA 2YHWA 4YOVA 4J2EA 4MQ3A 3E01A 3N4QA 3D2EB 4BRAA 3GDQA 2HVIA 4FPAA 1BCOA 1QHAA 2WBNA 3IUCA 5LMUK 4JHDA 4CK1A 5DK5A 4B3OA 4Q5VA 3ALYA 2ZJQL 5M1OA 2VQEK 3U6FA 3KD1E 4B8AB 3HBTA 3WEEA 3NH0A 4IO8A 2HMIA 1NMNA 1KXPA 3IAYA 2QWQA 1L3SA 4FSVA 3A0IX 4H0TB 2P9IA 4M3ZA 3ZCMA 2P1JA 4WF9L 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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