5ELZA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
b'KVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 98
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA01
1NGFA 3QBWA 4BR9A 2FSKA 3QDKA 4WQ4C 3MK6A 2CH6A 3LDNA 5AZIB 1MWMA 2E2PA 3P4IA 5LJVA 4I6MB 4B1VA 2H3GX 4FWMA 2GELA 3UKRA 3HM8A 2FSJA 5AZIA 5JLFA 4BR0A 4BVOA 5EXWA 3AAPA 4ISFA 1NLVA 2P9UB 5AFUA 5AQUA 4H5WA 1YAGA 1TUUA 2ZGZA 5BN8A 1OKJA 4WQ5A 4FWKA 3ZETB 4H5RA 3VGLA 3MN9A 2D1KA 3WXLA 4CBXA 1E4FT 1ATRA 3ID8A 3ZETA 3IMXA 1HJOA 3CJCA 4BRMA 1RFQA 1S3XA 4IJNA 5ADXA 4BREA 4CZEA 1KAYA 4L3QA 3VPZA 3HSCA 4FSVA 3A5LC 2A6AA 1DKGD 3LDQA 4B1ZA 3O5BA 1XC3A 4PL7A 4CZKA 5AQWA 2QWMA 4NO7A 2E1ZA 3ZEUB 1JCFA 5AQKA 1HKCA 2CGLA 2FF3B 4H5TA 1NGJA 3A5MC 1C0FA 4GY2B 3VEVA 4F9OA 2EWSA 3GBTA 3KHYA 3ZEUA 4K42A 5BRFA 4AM6A 3ENOA 2E2OA 3CJ9A 1KAXA 3LDLA 2KHOA 3BUZB 3R9PA 2VCPA 3LDOA 1K8KB 5AQFA 5AQSA 2QWNA 2YJEA 5KQDA 2DPNA 2D0OA 1BA1A 1NGEA 4A2AA 3O08A 4EIAA 2FF6A 2ZGYA 3FGUA 1MDUB 4BRGA 1ESVA 1XQSC 3A5OC 2D4WA 4M63C 5E26A 5BREA 4YDUA 3DAWA 1E4GT 5AQTA 1C0GA 2P9IA 3SMSA 5BPLA 3O6WA 3O80A 3VOVA 3A8YA 4RWTA 2IVOA 2P9LB 3FLCO 3I33A 3VEYA 4H0TB 3H1QA 3DXKA 5JMVA 1D4XA 3ZX0A 3VERA 5AQZA 2P9LA 4BC2A 1ZXOA 3BF3A 1NGDA 3EKUA 5AQOA 4QS7A 3ATUA 4H0VB 1ATNA 1NM1A 1U2VB 4B9QA 4MO4A 4BRNA 2D0PA 3TU5A 2QWQA 1U2VA 4FPAA 4BC5A 4HWIA 3FZKA 4FL9A 3SJHA 3O4WA 3D2EB 5AQXA 3C7NB 1X9JA 4BQLA 3S41A 3U8XA 3DWLA 5BRDA 2P9SB 5TKYA 2E1YA 3WQUA 4K41A 2IVPA 2P9KA 5F2RA 1NGCA 4QS8A 4CBWA 1LOTB 2P9SA 4CZIA 4BR4A 1DEJA 4JNEA 4BRFA 1KXPA 5FPDA 4PKHA 5BRHA 3FZHA 3GOIA 3VEXA 4BRAA 1QQOA 2Q0UA 2GUPA 3UKUA 3DXMB 4BGBA 3QFUA 4QS9A 5AFUH 1KAZA 2ASPA 3UKRB 3UB5A 2PBDA 2E8AA 3GE1A 3U4LA 1H1VA 3W0LA 3DXMA 2QM1A 1QZ5A 3EL2A 4H0YB 2GEMA 4FWRA 4CZGA 3IFRA 2ZWHA 3QFPA 3ATVA 3EZWA 4K43A 1QQMA 1SQKA 3FFKB 1QHAA 3RSEB 1R59O 2FLOA 5ADXH 3ZX2A 2ITMA 1HX1A 5CE3A 1Q18A 3ZX3A 4EAHD 3CJBA 2YJFA 3O1BA 3JXUA 3RSEA 1YVNA 2NLXA 1ATSA 4BG9A 4DB3A 4M7YA 4EFHA 2UYTA 4A61A 2CH5A 4EHUA 4ISGA 1HPMA 4FWPA 2Q36A 1T44A 3G25A 1NGHA 3H3OB 5AQVA 3SK3A 3FZMA 2Q0RA 2Q97A 3IUCA 4IZ9A 3MN7A 4IXCA 3UE5A 2QWRA 2QWPA 2J4RA 1X3NA 4H03B 1GLEG 5BN9A 4DCHA 3VETA 3FE1A 1GLJO 3BP8A 1NGAA 4FOEA 2YI1A 3MCPA 4O8KA 3MN5A 4CD3A 5AR0A 1GLBG 5JLHA 4XEIA 3B8AX 5AQQA 2PAVA 4BQZA 3AAQA 3QB0A 4CZJA 2E20A 2P9IB 1SZ2A 2V7YA 2YHXA 3H6EA 4FOIA 4MLHA 4LC9B 1XUPO 1NGIA 3DXKB 3WQTA 1Z6RA 3JS6A 1IJJA 2E2QA 3A0IX 3BEXA 4FWLA 4XH1A 5FPMA 2HF3A 3OHRA 1MWKA 5EX5A 1NGGA 2Q2RA 3BF1A 4BRIA 1BO5O 4IWVA 3HZ6A 1GLAG 3VESA 4ISEA 3CHWA 4BRLA 5LJWA 1GLFO 3SLCA 3M3ZA 2IVNA 3MN6A 1P8ZA 4FPBA 4H0PA 5JICA 4DHYA 1QZ6A 4MO5A 2P9PA 5EVZA 3HBTA 3U9ZA 3O8MA 3VF6A 2ZF5O 5AQGA 2E88A 2VYPA 3LDPA 2P9KB 4CZFA 2HMPA 1Z05A 5EY4A 4RCHA 3R6MA 1TUYA 5AQIA 2V52B 4BRPA 1X3MA 2A42A 4XH5A 2E2NA 1RDWX 4PKGA 3VEOA 4C23A 2A40A 2AP1A 4BC4A 4IO8A 4GNIA 2A41A 4A62A 1MA9B 2A5XA 1G99A 3CQXA 3UKUB 3D2FB 1LCUA 2V51B 3CERA 1BUPA 2Q31A 1TYQA 4BR5A 2WUSA 3CI5A 1QQNA 4BROA 2CGJA 3D2FA 1NGBA 3WT0A 5AQLA 3R8EA 3WEEB 5LY3A 4M7XA 4E1JA 4H0XB 2GTDA 3KVGA 3WEEA 1BG3A 4RTFD 3WXKA 3F9MA 3ULEB 1SAZA 4CI6A 3FZFA 1HUXA 5AQHA 3O1WA 1BOTO 4FWQA 4JN4A 4BVPA 4JAXA 4BGAA 1U6ZA 3GDQA 3ULEA 3FZLA 5B8HA 4K25A 4FO0A 1V4TA 2P9NA 3VENA 1J6ZA 4EHTA 3QMLA 3H1VX 5BR9A 1ZC6A 2IIRA 2GWKA 4FWSA 4CZLA 2F9WA 1T6DA 2I7NA 3CQYA 4CBUA 3TPQA 4BC3A 4I6MA 1Y64A 3QICA 4O5FA 1BU6O 4FWNA 2ASMA 4J8FA 5AQYA 4JD2B 3U9DA 1T6CA 2P9UA 3D7EO 1JCGA 5AQMA 4JHDB 4JD2A 4B1UB 3CETA 5AQNA 2W41A 3SMPA 4BR2A 1HKGA 4BG8A 4JHDA 4XH4A 3W3DA 2I7PA 4Z94A 4MLEA 5AQPA 5AZJB 4BRKA 3H46O 2QWLA 4A2BA 1BA0A 1YXQA 3WXIA 5AZJA 4BRDA 3VEZA 3WUHA 4CD1A 3CJ1A 4IJAA 1CZAN 1DGKN 1ZBSA 2VWBA 2YHWA 3GL1A 2QXLA 5I9EB 5KPZA 4CJ7A 4H5VA 5KPTA 4KBOA 2HOEA 1GLLO 1YUWA 3AY9A 3J8AA 4DQ8A 3CIPA 5FPEA 1JCEA 3ENHA 5F0XA 1BDGA 4AM7A 3VEWA 4WQ5C 3CJAA 2QW9A 1WOQA 3DJCA 3C0BA 1K8KA 2Q1NA 1NBWA 3FR0A 3M1FA 5E84A 1GLCG 5BPNA 3VF2A 1NMDA 1HLUA 3LL3A 1IG8A 2YHYA 2P9PB 3AARA 1HKBA 1S22A 5FPNA 2BUPA 1NWKA 1BWFO 3VF4A 5KPRA 3A5NC 3HTVA 4B1YB 3M6GA 3H45C 5AQJA 1RGIA 2FXUA 3MMVA 4HTLA 3GG4A 3VGMA 3LM9A 2V7ZA 2W40A 4H5NA 3L4IA 3LM2A 4WQ4A 4WYBA 2NZTA 5BPMA 4PL8A 2ASOA 4Y0WA 3EO3A 3MDQA 4BRCA 2NRHA 2BTFA 4FWOA 1TYQB 3H3NO 4B1XB 3IDHA 1EQYA 1WUAA 3L0QA 5F1XA 4BRQA 1GLDG 2OANA 3VGKA 4BRHA 4NB4A 5ELZA 3I8BA 4H0OA 3D2EA 3QBXA 3C7NA 4B1WB 4CZMA 3KZBA 4YDUC 2CGKA 4PKIA 5EOYA 5AQRA 2AA4A 2GWJA 2HF4A 3HI0A 3CJ7A 2QWOA 3L6QA 5KQ8A 2YCHA 4BR7A 2F9TA 1V4SA 3EN9A 4CZHA 3EKSA 2FSNA 2A3ZA 2P9NB 3WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HJFA 4DTOA 2XY5A 1T05A 2FSKA 1Q81O 4OPJA 4OKJA 3U3GA 4KHYA 4CEAA 4MDAA 2VWKA 4RW6A 1NKEA 3KIOA 2KFNA 5GADP 4I6MB 2Z1GA 3NH2A 1VSLA 5JLFA 3KD5E 3F5TA 4IOXA 5AQUA 2KKZA 1OH7A 1TUUA 1OH8A 4DQPA 3VA3A 1TAUA 1OKJA 4AHUA 2OCEA 4H5RA 3CXCM 3ZSYA 3VGLA 3WXLA 4QCLA 4CBXA 3AV9A 1E4FT 1HNWK 3EZ5A 1ATRA 2EX3A 1S3XA 4IJNA 4CZEA 1U4BA 1KAYA 3VPZA 3HSCA 3L2RA 4KTZA 3K9JA 1XC3A 4CEZA 4BY9C 4NO7A 3ZSWA 1UA1A 2VG5A 4LH5A 3AA3A 1JCFA 2FF3B 4LH4A 4H5TA 1NGJA 3A5MC 3VEVA 4F9OA 2NRXA 2PYJA 3KHYA 4IO9L 5BRFA 1KFSA 4Z4CA 3LDLA 3BUZB 1X9MA 3R9PA 2VCPA 3J80O 3G6EN 4LFBK 2RHKA 4B9VA 4KB1A 3OY9A 2RPIA 4CCHA 4FJHA 4CEBA 1BA1A 1NGEA 4MDBA 4OO1J 4X64K 2FF6A 3P83D 1MDUB 1ESVA 1XQSC 3D45A 4EP4A 2D4WA 5SZTA 4IOCL 1U48A 5E26A 4YDUA 3DAWA 3SMSA 1C0GA 4CIGA 1NJZA 3O6WA 3A8YA 4RWTA 4I9LA 4MQ3A 3FLCO 1JLFA 3T19A 2HVHA 4KHNA 4IDHA 3DXKA 5JMVA 1D4XA 3OYHA 5AQZA 3QETA 4BC2A 1JL1A 2RN2A 3LDSA 1S1XA 3DRSA 5LMUK 5AQOA 3QEIA 2O8BA 2NUBA 2G8WA 1NM1A 4KI6A 2WONA 3OS2A 3LPTA 4AHRA 2WFBA 2ETJA 3ZLJA 4CGGA 4FVUA 3SAHA 3OYMA 4JKDA 4FPAA 4JKCA 3OYJA 4HWIA 4IEEA 4CERA 3RVCA 1LAVA 1VRUA 3Q7CA 4JS5A 1YJ9N 3S41A 3K0SA 4F2RA 1Q8IA 1TL1A 3DWLA 4ELVA 3HPOA 4OPAA 2P9KA 4K0KK 2NNWA 5C25A 1NGCA 1IBMK 3VTIA 1LOTB 2P9SA 1UOCA 1WLJA 5HL7L 5GINA 1QSLA 4J2EA 2VGNA 2HW3A 1RTHA 4ZTFA 5BRHA 4CJWA 3GOIA 2BANA 3AO1A 4UQGA 3VEXA 4E7KA 4BRAA 1RT5A 2KZMA 1JLEA 2FBVA 3DXMB 4DLEA 1SS6A 5AFUH 2ASPA 2PBDA 3GE1A 4KTQA 2YKMA 3TARA 4H0YB 2UXBK 2ZJRL 1S5JA 4B9TA 4N76A 1NK8A 4CZGA 3L2QA 3F9KA 2HBLA 1YT3A 5HROA 3NVMA 2X6NA 4KV8A 3PUFA 1QHAA 5ADXH 3OYFA 2ITMA 4DF4A 4C8NA 3OBYA 1Y97A 2A1SA 4V19S 2OYQA 4FW2A 2O4IA 4M42A 4EHUA 1CZ9A 1KVAA 1HQEA 4FJIA 2XY8A 3E66A 3G25A 1NGHA 1YF5L 3H3OB 3SK3A 4HVJA 3LPUA 2AJQA 3DM2A 4CF0A 1D5AA 1U45A 4YOVA 3TTCA 2QWRA 2QWPA 4BE1A 3FE1A 2HBMA 1GLJO 1RBSA 1NGAA 2YI1A 1RDAA 2Z1JA 3M8SA 2B4JA 1XMQK 3M8PA 3MN5A 4CD3A 1GLBG 3AVAA 4BQZA 2PAVA 3O9UA 4FZXC 1IV0A 3AVKA 1D9DA 4PWDA 3E9OA 1NGIA 1JLBA 4FLUA 3C95A 3DXKB 4FJLA 2P1JA 4IFVA 2QTDA 1RTDA 3A0IX 4B3MK 3IG1A 1TVRA 5FPMA 1KLNA 4HHTA 2O8BB 1MWKA 4DTRA 3BF1A 5J2MA 1GOBA 1BO5O 2D5RA 3K58A 3TAFA 2UUCK 2UU9K 1SV5A 3CCLN 1Z26A 3CHWA 5LJWA 4DR3K 4CJLA 3TAEA 3RMCA 3DLBA 5FDLA 4DHYA 2P9PA 3PSIA 3PY8A 3HBTA 2O8FA 1JLAA 3V9SA 3RWUA 2ZF5O 3HT3A 3LDPA 2P9KB 2HMPA 1BQNA 3QIOA 4F8RA 5C12A 3HYFA 5EY4A 2HBJA 2V52B 4BRPA 1X3MA 4N47A 1BQMA 1JLGA 4C23A 3CD6N 4BC4A 3KWIA 3CQXA 4DG1A 1HMVA 4KKOA 4JKEA 1BUPA 5C2FA 4W5OA 1NNEA 3CI5A 3AVLA 5C15A 2D0CA 3O9TA 3J7ZO 2OZSA 1S72N 1N5YA 3WT0A 3MAQA 3DOKA 3QERA 1OH6A 4NLBA 2FBYA 4E1JA 4M3WA 1JXEA 4YOWA 3WXKA 1REVA 3F9MA 4CI6A 3FZFA 2IC3A 3VTHA 5J2PA 4JYAK 2KTQA 3L8BA 3LZJA 1LW2A 5B8HA 4K25A 1IG9A 2ATQA 1V4TA 2LSNA 3SJJA 1J6ZA 4EHTA 5CZ1A 5BR9A 2NRWA 2F4VK 3TAQA 3K57A 3LANA 4FLWA 2ZJQL 4O5FA 1BU6O 1RT7A 4J8FA 5AQYA 3SQ1A 2FBTA 4M3UA 5K14A 4DFJA 2NRZA 3D7EO 2P5GA 4JRQA 4JHDB 4JD2A 1IH7A 3RRHA 4CEDA 5AQNA 3THXB 3JSMA 4XH4A 2KQ2A 3ZSXA 1SL0A 3AO4A 4MLEA 5AQPA 3AVMA 3H46O 2QWLA 4FLTA 1RDCA 2FC0A 3OJUA 3PIOL 2PYLA 1F21A 1WNSA 3PSFA 1CZAN 3SBGA 3LWMA 2QXLA 4BE2A 1C1BA 4KI4A 4YFUA 2HOEA 1RBRA 1B92A 1LAWA 2QKBA 3MXJA 3J8AA 4DQ8A 1Q86O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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