5ELZA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 98
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA01
1RDWX 3QMLA 4IWVA 4K25A 2FLOA 4RTFD 1NGDA 2NRHA 4EFHA 3D2EA 3ZETA 3IDHA 3HSCA 3CETA 2P9LB 1QQOA 3R6MA 2GTDA 2E1ZA 3H3OB 4QS8A 3ID8A 3A0IX 2HMPA 3O80A 4BVOA 4CJ7A 5E84A 3TPQA 3VEVA 3DJCA 4FPBA 3DXKB 5EVZA 1MA9B 1P8ZA 2P9SB 4FWLA 1EQYA 2GELA 3A5MC 2QWRA 1HKBA 3MCPA 5F0XA 2YHYA 3AAQA 3QFPA 1GLLO 1BU6O 2FXUA 4YDUA 3QB0A 3VEZA 4CZMA 4BVPA 5ADXA 4XH5A 1BUPA 4DB3A 3EN9A 5KQDA 3EL2A 4CBUA 1BO5O 2V51B 4H0XB 2A42A 3AY9A 3M3ZA 5AQSA 5AFUH 4BR2A 5BPNA 3MMVA 2ZWHA 4DQ8A 3VOVA 3KZBA 3GOIA 3WEEB 3FZHA 4BRNA 3AARA 4RCHA 1SAZA 5EX5A 3SJHA 5LY3A 2YCHA 3H3NO 1IG8A 4CBXA 5AQWA 1MDUB 3M1FA 4BC3A 2E20A 3KVGA 5F2RA 4BGBA 3LL3A 2D0OA 3WXIA 1HJOA 3M6GA 3BUZB 1QHAA 3DAWA 5KPZA 5AQKA 1E4GT 2QWNA 3ZX3A 3DWLA 4FWQA 5AQHA 4BR7A 4JHDA 2E1YA 2E88A 2H3GX 5AQXA 4JD2A 3LDNA 3H1QA 1ZXOA 2Q0UA 4PKGA 4B1XB 4K42A 2P9KA 4K43A 4QS7A 5BRDA 3RSEA 1LOTB 2ZF5O 5ELZA 2QWPA 4WQ4A 4BREA 5AQLA 2E2PA 3JS6A 2P9PA 1NGEA 5AQZA 3UKUA 1JCFA 1G99A 1HKGA 1NM1A 1QQNA 2AP1A 1U6ZA 2GUPA 2P9NB 3O8MA 3WUHA 4FWRA 5FPMA 5I9EB 3ENOA 4CZJA 2NLXA 3IFRA 4CD3A 1QQMA 5BREA 2D4WA 5FPEA 3QBXA 4WYBA 1S22A 3GBTA 3O08A 3QDKA 3VEXA 4FO0A 2EWSA 3UB5A 3ATUA 4WQ5A 2A41A 4BR9A 4EHUA 3CJ7A 3MDQA 4JHDB 1XUPO 4JD2B 3O5BA 2HF4A 1SZ2A 2E2NA 3VEYA 3CJAA 2FSJA 1NGGA 3WEEA 2IVPA 4H5VA 4Z94A 5AQTA 5KPTA 4AM7A 1MWKA 3RSEB 4IO8A 4ISFA 3UE5A 1KAYA 3BF1A 3MK6A 5AQPA 4CZFA 5EY4A 4C23A 2I7PA 3FR0A 2A5XA 4MLEA 5EXWA 2P9PB 3UKUB 4CZIA 2IVNA 1H1VA 3W3DA 1GLEG 1IJJA 2ZGYA 3FZKA 3MN9A 4HWIA 3L0QA 5JLFA 4YDUC 3BEXA 3D7EO 5B8HA 4B1UB 2GWJA 1NGCA 2Q31A 5BN9A 5LJVA 2QWOA 4FWKA 3QICA 3EKSA 3OHRA 3H45C 4GY2B 2E2QA 4BG9A 4EAHD 3EKUA 2HF3A 3O1WA 4IZ9A 4BRGA 1BOTO 5AQQA 3VPZA 2E8AA 4DCHA 1OKJA 1NGIA 1DEJA 3C7NA 4H5TA 1X3NA 3A5NC 3L4IA 5AQVA 3B8AX 5AZJB 2ASOA 4BROA 2DPNA 1HLUA 3VF6A 3L6QA 3VETA 1X9JA 2P9IA 1SQKA 1V4TA 5CE3A 3A8YA 3AAPA 3VGLA 2P9NA 1T44A 4BRFA 4FSVA 4BQLA 4DHYA 4I6MA 4ISGA 3FZFA 4MO5A 4CI6A 3CJ9A 3WXLA 2D1KA 2A40A 3ZX0A 3P4IA 2OANA 4H5NA 4A61A 3VEOA 4B9QA 3I8BA 2A3ZA 4K41A 2CH6A 2W40A 3MN7A 4A62A 4O8KA 3SLCA 1XC3A 5KPRA 1MWMA 1GLJO 3FZLA 3I33A 4WQ4C 4L3QA 2VYPA 3O4WA 4CD1A 4IXCA 4M7YA 4H03B 3LM9A 3C7NB 4M63C 4XH4A 4NO7A 5ADXH 2PBDA 2FF3B 2ZGZA 1NWKA 3VEWA 1YAGA 4AM6A 1Z05A 5JMVA 2VCPA 4FWSA 3D2FA 4BGAA 2P9IB 1NGFA 3VGMA 1ZBSA 1YXQA 1Z6RA 4HTLA 4I6MB 4BRHA 4B1WB 3LDPA 3UKRB 3ENHA 2IVOA 4WQ5C 1GLCG 5AQNA 1C0FA 1J6ZA 2Q0RA 3SK3A 2Q97A 5BPLA 5AQYA 3LDLA 2YJEA 1LCUA 2A6AA 1BWFO 1NGBA 5AQJA 4BRKA 5AQRA 3U9DA 2YHWA 4JNEA 1E4FT 1GLBG 2F9TA 3GDQA 4CBWA 4CZHA 4H0PA 5AZIA 1K8KA 3S41A 4LC9B 2Q1NA 5BN8A 2E2OA 2VWBA 2CGLA 4IJAA 4H0OA 1JCEA 2D0PA 2YI1A 5AZJA 2QXLA 1RGIA 1JCGA 3FLCO 3MN5A 2V7YA 5E26A 1R59O 4JN4A 1NBWA 3WT0A 5FPDA 1X3MA 1NGHA 4NB4A 2F9WA 3BF3A 3D2FB 5AFUA 3ATVA 4BG8A 3QFUA 3HI0A 1NGAA 1Q18A 3J8AA 4CZLA 2I7NA 3KHYA 2QWMA 4BR0A 3FFKB 2YJFA 3CI5A 3VENA 3SMPA 5JLHA 4B1YB 4RWTA 3CERA 2UYTA 5AQMA 3EO3A 3GL1A 3CHWA 3LDOA 3F9MA 2QWQA 3CJBA 4EHTA 1HPMA 4MLHA 1ATSA 2W41A 2BUPA 3WQUA 3HZ6A 2QWLA 1RFQA 4O5FA 4CZGA 5AR0A 4H5WA 4M7XA 3FZMA 2BTFA 3QBWA 5AQOA 2IIRA 4JAXA 1DKGD 1KXPA 5AZIB 1K8KB 4QS9A 2ITMA 3ULEA 2Q36A 4PKIA 1TUUA 3CQXA 3ZEUB 3IMXA 1BDGA 3HTVA 3JXUA 3VERA 3CIPA 1KAZA 4EIAA 3DXMB 3EZWA 3H46O 3VF4A 4J8FA 4Y0WA 4MO4A 3SMSA 4BR4A 4BC2A 3A5OC 4E1JA 5BRHA 1D4XA 4KBOA 3UKRA 1GLDG 1BA0A 4F9OA 1Y64A 3CQYA 1U2VB 1T6DA 2CGJA 1HX1A 5F1XA 2NZTA 2P9UA 1HUXA 3FGUA 1TUYA 4FWNA 3H6EA 1TYQA 5KQ8A 4ISEA 4BRCA 4PKHA 4BR5A 1NGJA 3CJ1A 2AA4A 3VF2A 4PL8A 3G25A 4BRDA 1ATRA 3D2EB 3ZETB 2Q2RA 3HM8A 3O1BA 4BC5A 2QW9A 4FWPA 3ZX2A 3LDQA 4FOIA 4H5RA 4B1ZA 4FPAA 4PL7A 2J4RA 3C0BA 5BRFA 3ULEB 4BRQA 3U9ZA 1S3XA 1HKCA 3LM2A 4FWOA 1KAXA 4H0TB 3U8XA 4BRPA 5LJWA 1WOQA 5EOYA 3VGKA 4A2AA 1CZAN 1YVNA 4XH1A 5AQUA 4BRIA 3H1VX 1GLAG 2YHXA 5AQIA 2CGKA 2PAVA 4BRAA 1BG3A 2V52B 1ATNA 2HOEA 2KHOA 2GWKA 2GEMA 3GE1A 2P9UB 3U4LA 4BRMA 3W0LA 4IJNA 1TYQB 4BRLA 1T6CA 2WUSA 4XEIA 3HBTA 4H0VB 4CZKA 2P9LA 4H0YB 2CH5A 2FSKA 3WXKA 4FOEA 5FPNA 1BA1A 3A5LC 4B1VA 4CZEA 2FF6A 1ZC6A 1V4SA 3FE1A 1WUAA 3TU5A 1QZ5A 1XQSC 2V7ZA 3DXKA 5JICA 1NMDA 1QZ6A 3VESA 3ZEUA 2P9SA 1C0GA 3WQTA 5BR9A 2QM1A 3GG4A 1DGKN 4FWMA 3DXMA 5AQFA 3O6WA 5AQGA 3IUCA 1GLFO 1NLVA 1YUWA 4FL9A 4BC4A 3WXJA 4GNIA 3CJCA 3BP8A 5BPMA 1U2VA 4A2BA 3R9PA 3R8EA 1ESVA 5TKYA 2P9KB 4BQZA 2FSNA 2ASPA 2ASMA 3MN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QK9A 4FXDA 2O8EA 3MXJA 3TAPA 4CGIA 4FJIA 2KW4A 2UUBK 1QQOA 1VRTA 2GTDA 1RBRA 3AVAA 2O8BA 2E1ZA 4I9QA 2YHAA 2HMPA 2IS3A 3PO5A 3QNOA 2P5GA 4W5QA 3QIPA 1Z25A 3DJCA 5M1NA 4ELVA 3DXKB 5EVZA 3THYA 3TSQA 1HQUA 4UY8O 3QEVA 5C24A 3L3VA 4NXMK 3HVRA 3MEGA 4CGFA 2QWRA 1HKBA 3AAQA 1GLLO 3SUNA 3MX5A 3VEZA 4BVPA 4OVLA 4WE1A 3ZT0A 4CBUA 3AO5A 1QSLA 3AY9A 5AFUH 2HW3A 5BPNA 2ZWHA 4KH6A 4B3RK 5FROA 4O4GA 3G0ZA 3VOVA 4W5OA 1DLOA 3GOIA 3WEEB 4CEFA 4BRNA 3AARA 4I9LA 5EX5A 4CJSA 3H3NO 4DS4A 2G8WA 5AQWA 2NRRA 4I7FA 1GOAA 3KVGA 2OZMA 3KK1A 1ZBIA 3SAGA 2F96A 2F8TA 3PSFA 5SZTA 4KHWA 1NU0A 4K8XA 1NKCA 3SUQA 3DWLA 4FWQA 4WFAL 3EY1A 2E88A 5AQXA 3OYLA 3HP6A 1QE1A 3LDNA 2R7YA 1KVAA 5FRMA 4K42A 3QIOA 4WF9L 4G9ZA 1JLEA 5BRDA 2P51A 3AVGA 3RSEA 3QEWA 1S1XA 2QWPA 4WQ4A 3DRPA 3JS6A 4NLCA 2P9PA 2HHUA 1NGEA 3CCJN 1QQNA 1NM1A 2GUPA 4FWRA 4CZJA 4CHOA 3RR8A 2O8DB 2NLXA 3AVBA 4IO9L 2BDPA 3ZSYA 2KKZA 1WAJA 2D4WA 3V9ZA 4CEDA 4NCBA 5FPEA 3QBXA 3RWUA 1RBTA 3V9UA 3VEXA 1L3VA 3UB5A 3ATUA 1T3VA 3TAGA 1NOYA 3OYBA 1S6QA 2ITGA 3AO2A 1KCFA 4BR9A 3MDQA 4DV1K 4JHDB 3TARA 1BL3A 3KLIA 2P5OA 1SZ2A 4DTPA 2OA8A 2Z1IA 4CFCA 1RT5A 1TL3A 3R1XA 4H5VA 4Y1DA 5GIPA 4DR2K 3T19A 5AQTA 4LSLA 4WFBL 4Z4FA 2GV9A 4KTQA 2RN2A 3AVMA 3PY8A 2IVNA 1J5OA 1H1VA 4DFJA 4CEZA 2IDOA 2YNIA 1N33K 1NGCA 4C8NA 4X66K 5A2QO 3QICA 3TANA 4LF6K 3H45C 4GY2B 4BG9A 1SL1A 3EKUA 2HF3A 4CF9A 3SV3A 3G4SN 2HBLA 4ICLA 2XRIA 5AQQA 3BY5A 1NGIA 4H5TA 3KK7A 3A5NC 2WTUA 5AZJB 2ASOA 1LWEA 4BROA 1WSFA 2O8CB 1VQKN 4FK4A 4CFAA 4AF1A 2P9IA 1OVQA 3A8YA 4AHUA 2P9NA 4FSVA 4BQLA 3SQ2A 3FZFA 4MO5A 1LAWA 4AH9A 1HJRA 2VQEK 1NKEA 1YF5L 4ILJA 3OJSA 2CH6A 4E7IA 1DTTA 3E9OA 1VRUA 3ZLJA 5SWMA 3NF9A 4A62A 5J1EA 4RW6A 4JYAK 2WBNA 4KH4A 4EP5A 4J2EA 4TSXA 3NH0A 1GLJO 4WQ4C 1VSMA 2VYPA 4CD1A 4IXCA 1VSKA 5C12A 2HHVA 4H03B 4NO7A 2PBDA 2ZGZA 1NK7A 2A1RA 4JK8A 3SZ2A 3AV9A 3T69A 4OLBA 1L3TA 3MXMA 3P38A 3TR8A 1XWLA 1VSFA 4DTJA 3UKRB 5CHIA 2B5JA 4DR4K 1SL2A 1WBDA 1C0FA 2Q0RA 3JSMA 5BPLA 5AQYA 3OYCA 2HNZA 1BWFO 1NGBA 4CK1A 5AQRA 4C1NK 3SUPA 4ELTA 4I2QA 1I94K 4PHTX 1C0MA 3WNGA 3GDQA 4KB0A 4DTXA 4JI5K 1EKEA 3KKSA 1NOZA 2BH1A 2RPIA 1JLBA 3KLHA 3RRGA 1B92A 1NBWA 2OZSA 4ID5A 3BF3A 3KD5E 3ATVA 1WN7A 3LZJA 4E19A 3EE8A 2Y1JA 3QFUA 3HI0A 4CJUA 4CZLA 3FFKB 4YNQA 4BE1A 3CI5A 3O9UA 3SMPA 4B1YB 4CJQA 3DLKA 1WB9A 2WC9A 2UYTA 3NHGA 3PX6A 3LDOA 2QWQA 3F9MA 2WFBA 4CFBA 4X65K 1R0AA 2BUPA 4KI4A 4QOZB 3HPHA 3HZ6A 1RFQA 4RG8A 4LF5K 3F2KA 3QEIA 1NK0A 4DV3K 1YITN 3RRHA 4BDPA 1DKGD 1A5VA 4DR7K 4A57A 1LV5A 5H1SQ 4GKJK 5FRNA 3VTIA 2E6LA 3CQXA 3SQ4A 3JXUA 1BDGA 3ZSVA 3VERA 1KAZA 1WSGA 2VGNA 4EIAA 1RT6A 4J8FA 3SMSA 4FJKA 3LWLA 4BC2A 1RDUA 3A5OC 4Y1CA 4E1JA 5BRHA 3VQBA 3NF8A 2G8KA 4JI6K 3IG1A 3CQYA 1U2VB 3PV8A 2LSNA 4LY7A 1UA1A 4KB1A 1JL1A 4M3WA 1JLAA 4K8ZA 3S9HA 4FLTA 1U47A 1REVA 4BR5A 4DU4A 5LMNK 3IAYA 2O8EB 2AA4A 3H08A 3VQQA 1TKZA 4KHUA 3HM8A 1HQEA 1C1BA 4FWPA 3ZX2A 2OYQA 4LF4K 4JI0K 4CJEA 4FOIA 4DF4A 4H5RA 4O44A 4FPAA 4A59A 1KSPA 4N76A 5I42A 1CZ9A 3CCRN 3ULEB 5J2MA 4CECA 1B9FA 4BRQA 5C10A 5HRRA 1FK9A 3LM2A 1YJWN 2YNFA 3U8XA 3I8DA 2D0AA 4DUZK 3TSPA 1VQON 1YVNA 4DSIA 2O8FA 1S5JA 4U67L 2IC3A 3P5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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