5ELZA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 98
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA01
3WXJA 1NGFA 5AZIA 3DXMB 3LDPA 2F9WA 3AAQA 5ADXH 5BN8A 4ISEA 4A61A 4MLHA 3TU5A 2QWPA 4BRKA 1OKJA 4BQZA 2P9PB 5BRFA 4M7XA 4QS7A 2OANA 4BRPA 5KQDA 1NWKA 1HPMA 4CZKA 4DB3A 4BRQA 1ZBSA 4FL9A 2P9NA 2ASPA 1T6DA 3H6EA 3R6MA 4FOIA 1XUPO 4BRGA 2GTDA 4BRMA 4ISFA 4DHYA 3IFRA 3ZEUB 1BA1A 2QWOA 1QQOA 3HM8A 3FZMA 4JD2B 2QWMA 2FF6A 2Q36A 4WQ4C 4PKGA 2Q97A 1NM1A 2E2QA 2EWSA 3FZFA 3P4IA 4WQ5A 4F9OA 4RTFD 2P9LB 2UYTA 3I33A 3OHRA 3RSEB 3H46O 1BU6O 5E84A 3SJHA 4H0XB 1QQNA 2VCPA 4QS8A 4BG9A 3LDOA 4BGBA 3S41A 2YCHA 2BTFA 3FGUA 4B1XB 5JMVA 4EIAA 5JLFA 3ID8A 4B1YB 3GE1A 4RCHA 4CBUA 5JICA 4H03B 5AZJB 2ASOA 1NGIA 2GWJA 2Q1NA 2D0OA 1NGDA 4H5TA 3M6GA 3ENHA 4BC2A 3WXKA 3MMVA 2P9KB 4WQ4A 3L6QA 4CZFA 3ZETA 4BRNA 3IMXA 5AQPA 1KAYA 1HKCA 4O8KA 4B1WB 5KPZA 1ATSA 2AP1A 5LJWA 1C0GA 4BRFA 4GNIA 4PKHA 1JCEA 5JLHA 3CJBA 1YXQA 3VF6A 4H5RA 5EOYA 4HTLA 1WUAA 1T6CA 4B1VA 1JCFA 1HKGA 3UE5A 3BP8A 1U2VA 1NMDA 2A5XA 4Y0WA 4CBWA 5KQ8A 1Z6RA 2V51B 1GLLO 3R9PA 3UKRB 4CZEA 2WUSA 3CI5A 4CJ7A 3UKUB 4YDUA 2IVPA 4ISGA 2A42A 5KPTA 3LDQA 4NO7A 1XC3A 4FWOA 3DXMA 2HF4A 3DXKB 1V4SA 1BA0A 3J8AA 3U4LA 1NGBA 1BDGA 3LM9A 3WXIA 4CZIA 4BRIA 3BF3A 3LDNA 4QS9A 4WQ5C 3QBXA 5FPDA 1Z05A 4H0VB 4CZJA 4NB4A 2P9SB 3CJCA 1GLEG 4XH4A 5F0XA 4E1JA 2ZWHA 4LC9B 2FXUA 3H1VX 3WEEB 2D4WA 5ADXA 1GLAG 2H3GX 3IUCA 3ZEUA 3QFUA 5AQUA 3HZ6A 4JHDA 4FWMA 3A8YA 4JD2A 5AQFA 4FO0A 4O5FA 1X9JA 2PAVA 3R8EA 3VEWA 3ULEA 4BVPA 1DEJA 1MA9B 4A2AA 3W0LA 5AQNA 2YHYA 2QXLA 3RSEA 3W3DA 4MO4A 5AQIA 3VENA 4BR5A 2DPNA 3A5OC 3VGLA 4JN4A 4PL7A 2VWBA 2HMPA 3GOIA 3GL1A 5EVZA 5CE3A 3M1FA 2ZGZA 2CGLA 2E1ZA 3QICA 4JNEA 3UB5A 4BRLA 3CHWA 1HJOA 1S22A 2YJFA 3MN9A 5BN9A 5AZJA 2VYPA 4XH5A 2W40A 4FWPA 5AQWA 2HOEA 1K8KA 1SQKA 3MN6A 1GLFO 3EO3A 1J6ZA 4BR2A 3EKSA 4XEIA 1KAZA 4FWLA 2F9TA 1NGAA 4FOEA 2P9KA 4BRCA 2V7YA 5BREA 2V52B 2E20A 1NGJA 3ATVA 1HX1A 4AM6A 2A41A 3A0IX 4BREA 3CQYA 1V4TA 3WXLA 3D2EA 2ZF5O 1HKBA 3VF4A 5AFUH 4EAHD 2GUPA 4YDUC 1Y64A 3KHYA 4CZLA 5AFUA 4DCHA 3ATUA 3MCPA 3LM2A 4FPAA 4IJNA 3VEOA 1E4FT 3U9ZA 4DQ8A 2P9UB 5AQRA 2FSKA 4FWQA 3HSCA 1KAXA 3A5MC 3GDQA 1X3NA 5FPMA 3GBTA 3UKRA 3AARA 2QWQA 5BRHA 2FF3B 3HI0A 3H45C 4FWNA 5KPRA 3VEXA 2GWKA 1JCGA 5EY4A 1QZ5A 3MN7A 4BVOA 5BRDA 3TPQA 4BRHA 2ITMA 3ZX2A 2PBDA 3D2FB 3DWLA 1YVNA 3AAPA 3DXKA 3WQUA 2Q0RA 5AQSA 4IJAA 3CJ7A 1GLJO 5B8HA 4EHTA 1C0FA 1HLUA 3ZETB 1TYQA 4CZHA 1IJJA 4XH1A 1RFQA 4A62A 3CJ9A 1Q18A 1NGCA 4H0TB 3VESA 2P9IB 3WQTA 2FSNA 1MDUB 3WT0A 3CETA 3D7EO 4BC5A 5AQHA 3ZX3A 5FPEA 3EL2A 2Q2RA 2V7ZA 2P9PA 2CH5A 4BROA 2D1KA 3A5NC 3MN5A 1RGIA 2A40A 5AQZA 4C23A 1MWMA 4I6MB 5AQLA 2CGJA 1WOQA 1NGEA 4H0OA 3ZX0A 3LL3A 4B9QA 3MDQA 4CD3A 1BG3A 3BUZB 3A5LC 4CZMA 4HWIA 1DKGD 3C7NB 2QWLA 3QDKA 3VPZA 1QQMA 4H0YB 2IVNA 1KXPA 3FR0A 2E2OA 1IG8A 2E2NA 1BWFO 1TUUA 5F2RA 2A6AA 1BUPA 2HF3A 1P8ZA 2KHOA 2NRHA 4WYBA 1BO5O 4K41A 2YI1A 3L0QA 2QWNA 5AQOA 1BOTO 2P9LA 2E8AA 4IXCA 4B1UB 4H5VA 4K43A 5F1XA 1R59O 5AQJA 3VOVA 3SLCA 1SAZA 3QB0A 2I7NA 3CQXA 1YUWA 3WUHA 5EXWA 3VGKA 4B1ZA 3M3ZA 4A2BA 1NLVA 3MK6A 1MWKA 4JAXA 3VEVA 5AZIB 3CJ1A 1GLCG 5AQYA 3BEXA 1RDWX 4IO8A 5I9EB 1GLDG 4BGAA 3C0BA 5LJVA 4CI6A 2A3ZA 2NZTA 4FWSA 3LDLA 4J8FA 4JHDB 4L3QA 1XQSC 2YHWA 1YAGA 5AQMA 2I7PA 3FZHA 5ELZA 5AQGA 2P9NB 3ULEB 2FSJA 1GLBG 3KZBA 1X3MA 4BR9A 5AQQA 4GY2B 2E88A 5FPNA 2J4RA 3I8BA 4BR7A 2CH6A 3O5BA 4BRAA 5BPMA 2P9UA 5BPLA 1ZC6A 2QWRA 1ATNA 4PKIA 2W41A 3SK3A 1SZ2A 2YHXA 1LOTB 4CBXA 5AQXA 3FLCO 4FWKA 3DJCA 1ZXOA 1HUXA 3H1QA 4FPBA 4Z94A 3O1WA 3VGMA 1LCUA 3H3OB 4BR0A 5LY3A 1U6ZA 2BUPA 3O6WA 4KBOA 1QZ6A 3QMLA 5AQKA 4AM7A 1K8KB 3D2FA 3VEZA 4K25A 1EQYA 5EX5A 3FZKA 4K42A 3FE1A 1T44A 1NGGA 1NGHA 3UKUA 3U8XA 3QBWA 2E2PA 2ASMA 4BG8A 3H3NO 2GELA 4MO5A 4CZGA 5E26A 4BC4A 3CIPA 2D0PA 4H0PA 5AQTA 1ATRA 2CGKA 2IIRA 5AR0A 2Q0UA 2FLOA 3O8MA 3CJAA 3IDHA 2P9IA 1ESVA 2Q31A 2IVOA 3D2EB 3B8AX 2AA4A 3HTVA 3U9DA 3CERA 3EZWA 1E4GT 3SMPA 1QHAA 3L4IA 5AQVA 1S3XA 3VETA 3VERA 3O08A 4H5NA 4I6MA 3BF1A 3AY9A 5BR9A 3JS6A 5TKYA 3ENOA 4MLEA 4BRDA 2P9SA 3O4WA 2NLXA 3VF2A 4BQLA 4EFHA 2QW9A 4EHUA 4FSVA 1TUYA 4H5WA 3WEEA 4FWRA 3C7NA 3EKUA 3O80A 4CD1A 3FZLA 4PL8A 4BR4A 1U2VB 4BC3A 4M63C 1DGKN 3QFPA 2YJEA 4M7YA 4IZ9A 1G99A 3F9MA 1D4XA 2E1YA 3GG4A 3HBTA 3KVGA 3SMSA 2GEMA 3O1BA 5BPNA 1H1VA 4RWTA 2QM1A 3DAWA 3FFKB 1NBWA 3EN9A 1CZAN 1TYQB 2ZGYA 3G25A 3JXUA 3VEYA 4IWVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCJN 2IGIA 1L3UA 3OYIA 2F9WA 3ZT1A 3AAQA 4FJMA 3BDPA 4CJEA 1W9HA 4NYFA 4F2RA 2BGGA 2OANA 3D6RA 3CF5L 1RT3A 2PFUA 4CZKA 1ZBSA 3OS2A 2XHBA 1WAFA 4DR7K 1IBKK 1VQ4N 3R6MA 4FOIA 4AHTA 1VQON 1RNHA 4BRMA 3IFRA 1BA1A 3FZMA 2QWMA 3HO1A 2Q36A 3ZT3A 4J2DA 1YJWN 4CHYA 5I3UA 2G8IA 5GAGP 1LWCA 1OVQA 3I33A 3OHRA 4B9NA 1VSHA 3H46O 3ZSVA 4JI4K 3CC7N 1WN7A 1BCMA 1JLCA 4BGBA 2YCHA 4B1XB 1C1AA 2YKNA 2KQ2A 4CJ3A 1XHXA 1J5OA 2GWJA 3BGRA 4CJ4A 4CJUA 4WFNL 3QO9A 1QQCA 4DV5K 5C24A 4IOCL 3PLAA 4A59A 3WXKA 1QVGM 1SKWA 3OS0A 3TAPA 4WQ4A 1JLAA 4JKCA 3L6QA 1XC9A 4BRNA 1FW6A 2GBZA 1C6VA 1KAYA 4C1NI 2HBLA 2O8FB 1ATSA 2AP1A 3RVCA 4AQYK 1C0GA 2YKMA 2RKIA 4BRFA 3WNFA 3QNNA 3SPYA 1U04A 1WUAA 3EE9A 3O9QA 1KSPA 3BP8A 3IRXA 1NMDA 4Y0WA 5KQ8A 2D0BA 1RT6A 1Z6RA 3N4QA 3MEEA 3PO5A 4N47A 2WUSA 3CI5A 4QAGA 2AJQA 3AVJA 2KLAA 2QXFA 2IVPA 5AJ3K 1WLJA 1ZBLA 3AGRA 1A5XA 4E1MA 2QA4N 1S9EA 3MEDA 3HVRA 3DXMA 1W7AA 1IO2A 2HF4A 4DR1K 1V4SA 1BA0A 1NGBA 5JVHL 4LF9K 4CZIA 1U48A 2ZD1A 4BRIA 1JL2A 3BF3A 1Z05A 2IS3A 1S1VA 3G10A 1GOCA 2P9SB 3CJCA 2QK9A 1IKYA 2FXUA 4LC9B 3WEEB 1X9WA 1T05A 4CFCA 3M8RA 4U7BA 3MEGA 4KI4A 4JHDA 2WONA 2QTDA 3MX2A 5D3GA 1J53A 4OLAA 2ZE2A 3R8EA 3VEWA 2KZZA 1CXUA 1DEJA 1MA9B 1TV6A 3V9WA 4A2AA 3CYMA 3K9KA 2YHYA 2QXLA 4DR3K 3WNHA 2YNGA 4IFVA 3A5OC 4JN4A 4W5RA 1RDAA 2LSNA 1IH7A 3DOKA 2HMPA 3BZKA 5CE3A 3KK3A 3CHWA 1HNXK 4JKGA 1HJOA 3PIOL 4B9VA 5AZJA 1B92A 5AQWA 1VSLA 3NH0A 2RF2A 3KWGA 1J54A 2FBTA 1GLFO 3ZSYA 1J6ZA 3EKSA 4XEIA 1U45A 3THYA 1NGAA 2P9KA 4BRCA 2GUIA 3QESA 3ZSZA 2V7YA 3OYDA 2E20A 2VG7A 4J2EA 1WSJA 3A0IX 4IDKA 4AHCA 1HKBA 3HM9A 4FW1A 1RTDA 4LF4K 4EAHD 4DCHA 5GAHP 1L3SA 4IEEA 2BH1A 4FJHA 4B8AB 4MDBA 3L2QA 4DSIA 4IJNA 4OVLA 1B9DA 4FWQA 1VSKA 4DTJA 2E6MA 3A5MC 3GDQA 4E0DA 4DV3K 3GBTA 3AARA 5IT9O 5GAEP 5KPRA 5EY4A 2G8WA 4CJKA 2OA8A 4YHHK 4BRHA 3MXIA 2X6SA 2ITMA 3DXKA 2YNIA 4I2PA 4OLBA 3NF7A 4WF9L 1ASWA 5AQSA 2IOCA 3F2KA 2NRXA 3NE6A 3HJFA 3TTFA 4I9QA 1BCOA 4LH5A 3ZETB 1TYQA 3V4IA 4DFJA 3L2RA 2DY4A 3AVKA 3AVAA 4G1QA 2HHHK 4RW4A 2P9IB 3WQTA 3WT0A 3D7EO 4PWDA 3ZX3A 4YOTA 3B6OA 2V7ZA 4HVJA 3A5NC 2G8UA 5FLXO 4KTQA 1WNSA 5J2NA 4H0OA 4FJKA 1W97L 4KREA 1NJWA 4CD3A 2HVHA 2D5RA 5J2PA 4CZMA 4HWIA 4EP4A 1QQMA 4GVEA 4H0YB 4F2SA 1BIUA 1IG8A 2HF3A 1P8ZA 4JI1K 5MLCQ 4DTPA 3L0QA 1NG9A 2QWNA 2E8AA 1RDDA 4B1UB 5A2QO 5F1XA 1R59O 3SLCA 4GW6A 3QB0A 3CQXA 4KPYA 5EXWA 1UOCA 3MECA 1NLVA 1VSFA 3DLEA 1MWKA 4JAXA 3I55N 4GKKK 3T69A 3T1YK 4K0KK 3BEXA 2WC9A 3AVCA 1Q82O 3C95A 2NZTA 1RDCA 4L3QA 2YHWA 1YAGA 3ZSXA 5ELZA 3LP1A 4ID1A 1GLBG 3LZJA 1X3MA 4GY2B 2E88A 3SUQA 4DKWA 3C6UA 5FPNA 2HNZA 5BPMA 2P9UA 4BE1A 2QWRA 3O4QA 2W41A 5M1KA 3V9ZA 1RT5A 5GINA 2GX9A 4NXNK 3QIOA 5AQXA 3AVIA 3V81A 4Z94A 4LF7K 3SV3A 3H3OB 4BR0A 5LY3A 1LW2A 2BUPA 3O6WA 4JKEA 1R0AA 4KBOA 5AQKA 1IBMK 4DU1A 1JLQA 3CFPA 4KH5A 1NGHA 4FJLA 3SAHA 3ENBA 3QBWA 2E2PA 3VQEA 4JI8K 4KAZA 4BWJA 4B3RK 4BC4A 3NMUA 4CJRA 2D0PA 3TSUA 2Q0UA 2FLOA 3IDHA 4YOUA 1ESVA 3ULDA 5J2QA 3R3LA 4OKEA 1GOBA 5M1PA 3SMPA 3SZ2A 1QHAA 4NYNA 3K58A 2OZMA 3D45A 2HMIA 2UUAK 3VETA 4CF2A 3AA4A 3O08A 1KQSM 5HRSA 3BF1A 3AO4A 5JS1A 5TKYA 3U6FA 3NVKA 2P9SA 3OYEA 2HHXA 2NLXA 3VF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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