5EY4A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
378
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDITKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 378
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ey4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ey4A04
1C0GA 3CETA 2F9WA 2E2PA 4H0PA 1SZ2A 4BRNA 1NGFA 3VF4A 3H3NO 5BRFA 1TUUA 5AQYA 2P9KA 3CHWA 1J6ZA 1ATRA 3LM2A 3VEYA 4CZLA 4FOIA 4BC4A 1Q18A 4GY2B 4DQ8A 3SK3A 3VGMA 2FSNA 4A2AA 2P9NB 3CJBA 4MLHA 3SMPA 3ZETB 2YCHA 2FXUA 3A0IX 4RTFD 4CZFA 4Z94A 4JD2B 5I9EB 1YXQA 4H5TA 4IO8A 3VERA 4RCHA 2GEMA 4BR9A 2QWPA 3A8YA 1HKBA 2ITMA 4EAHD 3TU5A 2OANA 5AQGA 3H3OB 1DGKN 5AFUA 1BU6O 1GLEG 4JHDA 3QDKA 1X3NA 3CJCA 4CZEA 2W40A 1NLVA 2QWOA 2P9KB 4FWRA 5JMVA 1Z6RA 3MK6A 2FSKA 3VEOA 4DB3A 5AQUA 1HLUA 2J4RA 3C0BA 1YUWA 4PL7A 4JAXA 2P9IA 3L0QA 4QS9A 5TKYA 4CD1A 3FZLA 2F9TA 3A5OC 2FF6A 4EIAA 2YI1A 5AZIB 4FWLA 3ENOA 3FLCO 3EO3A 1QQMA 4IXCA 3CERA 4Y0WA 1D4XA 3HTVA 3QBWA 2FSJA 3O80A 1RDWX 2FF3B 2YHXA 3AAQA 4WYBA 1GLLO 5E84A 3U9ZA 3D2FA 1Z05A 1ZC6A 3EKSA 2H3GX 1BA1A 3C7NB 5AQFA 3A5LC 4BGAA 4CD3A 3QBXA 3FR0A 4H0VB 2P9IB 2I7NA 4I6MA 3IDHA 1NBWA 1NMDA 3RSEB 2V7YA 1X9JA 4FOEA 4BG8A 4H0OA 3O8MA 4BGBA 4FWPA 5BPMA 5F1XA 1K8KB 3IFRA 5KQDA 4BQLA 2Q1NA 4CZMA 5AQIA 4KBOA 3U9DA 1E4FT 1RFQA 4H0TB 4CZGA 3ULEA 3D2FB 3BF1A 4K42A 4JNEA 3UE5A 3VEZA 2HMPA 5AQNA 1KAZA 3HBTA 4FWSA 5ELZA 3TPQA 2ASOA 1GLCG 3H46O 2HOEA 5AQOA 3O08A 4MO4A 4BVPA 3L6QA 1OKJA 3I8BA 3AAPA 2P9NA 3HI0A 3ZX2A 3ZETA 1TUYA 4K41A 1NGJA 3LL3A 1MWMA 1YVNA 3O1WA 1KXPA 3O5BA 3FZFA 4HWIA 2FLOA 3WXLA 3M1FA 4FWMA 3UKRA 3WXKA 3DXMA 5B8HA 3J8AA 2PAVA 1NGIA 1MA9B 3BF3A 4LC9B 3BEXA 3GG4A 5F0XA 3SJHA 3VEVA 1XC3A 5AQVA 3WXJA 4B1XB 4BRQA 2Q31A 5BRDA 1E4GT 4B1UB 3WEEA 3A5NC 3EKUA 2P9LB 2D0PA 4XH4A 3MN7A 5FPMA 2QWNA 3MN9A 2Q36A 4AM6A 2QXLA 4HTLA 3FFKB 5FPDA 3SLCA 4BRMA 1SAZA 4O5FA 3MDQA 3R6MA 3O1BA 3GBTA 4RWTA 4XEIA 1ESVA 2ZGYA 5AZIA 5AQQA 4PL8A 3UKRB 2QM1A 4M7XA 3DXMB 1LCUA 2ASPA 2Q0RA 1DEJA 1YAGA 2QWLA 1S3XA 1U2VB 3A5MC 4BC2A 2E88A 5AR0A 3WEEB 1MWKA 4WQ4C 1GLJO 1HUXA 3C7NA 5F2RA 1V4TA 3ZX0A 3LM9A 4BRFA 4BRPA 1TYQA 4FPBA 2ASMA 4MLEA 4A61A 3H45C 3RSEA 4BRCA 2P9PA 4MO5A 2NRHA 3IUCA 4BR7A 4CZJA 2BUPA 5BPNA 4ISEA 5AZJB 4L3QA 4BR5A 3KVGA 5KPRA 4YDUC 2V52B 1K8KA 2P9SB 4BVOA 5EX5A 4H5WA 3H6EA 1HJOA 1CZAN 4QS7A 1R59O 3VETA 4E1JA 1T44A 4BC5A 1HKCA 3LDLA 4BROA 4J8FA 2CH6A 3FZMA 5AFUH 5EY4A 1XQSC 1IG8A 4NB4A 1TYQB 4A2BA 1JCGA 4BRGA 1JCFA 2A3ZA 1BA0A 1NGAA 2KHOA 4BRHA 2P9PB 3AARA 3WT0A 3VOVA 1QQNA 4FWQA 2DPNA 3UKUB 3EN9A 1GLBG 1BWFO 4BRDA 2QWMA 3EL2A 1GLFO 1H1VA 2NZTA 2E20A 2E8AA 5BN8A 4O8KA 4CZIA 3L4IA 2CGLA 3HZ6A 3M6GA 2VYPA 3ATVA 5ADXH 2A6AA 4CBUA 2W41A 4CZKA 5AQMA 1NM1A 3GOIA 1ATNA 3S41A 1ZBSA 1MDUB 1NGGA 2GWJA 2D0OA 3DXKA 4IJAA 4QS8A 2P9LA 3WUHA 5LJWA 4M7YA 2E2NA 4FWOA 3W0LA 1KAYA 3GL1A 4H5VA 1WOQA 1BOTO 4IZ9A 2AA4A 4DHYA 5EOYA 5CE3A 2E1YA 4FPAA 3CJAA 5AQKA 1BDGA 3U8XA 4XH1A 3QB0A 3CIPA 3D7EO 2UYTA 2VCPA 3LDPA 1T6CA 4IWVA 2YJEA 4CBXA 4WQ5C 4FL9A 2IVOA 3KZBA 3WQUA 4H03B 4BREA 1BG3A 2ZGZA 3U4LA 3CJ9A 3D2EB 2IVPA 4B1ZA 3VGLA 1U2VA 2QWQA 5BPLA 2E2QA 3BP8A 3DWLA 4ISFA 3DXKB 3SMSA 2YHWA 2HF4A 3B8AX 3IMXA 4K25A 4BR2A 1QZ6A 1GLDG 1S22A 2NLXA 3FZKA 5FPNA 3ID8A 2PBDA 4EHTA 3LDOA 4F9OA 3CJ1A 2A42A 3FE1A 2GWKA 4BG9A 4WQ4A 4NO7A 3LDNA 1V4SA 5AQJA 3G25A 1GLAG 4H0YB 3ATUA 5AZJA 3VEWA 3VF6A 2GELA 5FPEA 5BRHA 3CI5A 1SQKA 2QWRA 4ISGA 4H5NA 1ZXOA 2P9SA 3ZEUA 3VF2A 3R8EA 4A62A 1JCEA 2A41A 3GE1A 3H1QA 1NGCA 3ENHA 1U6ZA 4YDUA 2V7ZA 4C23A 5KPZA 1BO5O 2Q0UA 5JICA 1RGIA 2CGJA 2IIRA 3MMVA 2CH5A 5BN9A 1C0FA 2V51B 5KPTA 5JLHA 2Q2RA 4JN4A 2WUSA 3H1VX 2E1ZA 3UKUA 3VESA 1KAXA 3GDQA 5BR9A 3P4IA 3ZEUB 3EZWA 1DKGD 1LOTB 4FWKA 1NGEA 4BQZA 1NGHA 5EVZA 1EQYA 3QFPA 5AQPA 2ZF5O 4PKIA 4PKGA 1QQOA 2P9UA 3QICA 2D1KA 1XUPO 3HSCA 3R9PA 2E2OA 1Y64A 2I7PA 4K43A 2GUPA 3QFUA 1BUPA 1HX1A 3CQYA 3W3DA 5ADXA 4CBWA 2D4WA 2A5XA 3VEXA 1QHAA 4BC3A 4JHDB 4XH5A 1HPMA 3I33A 2Q97A 3JS6A 2IVNA 3AY9A 3MN6A 3DJCA 4H0XB 4FO0A 4BRLA 2AP1A 3VGKA 4CZHA 3BUZB 5AQSA 2QW9A 4IJNA 1HKGA 4PKHA 3D2EA 2ZWHA 2BTFA 2P9UB 1T6DA 5LJVA 4BRAA 5BREA 1WUAA 5AQWA 4FWNA 3O6WA 1NGBA 2HF3A 2VWBA 3CJ7A 4BRIA 3JXUA 5EXWA 4AM7A 4B1YB 4H5RA 3KHYA 3FZHA 4CI6A 4WQ5A 3MN5A 4BR4A 1NGDA 1ATSA 1X3MA 4GNIA 2GTDA 4EHUA 4EFHA 5AQHA 3WXIA 5LY3A 3LDQA 3QMLA 3MCPA 2YHYA 4BR0A 3FGUA 4B1VA 3CQXA 3WQTA 1QZ5A 1NWKA 5JLFA 3UB5A 4I6MB 4DCHA 2EWSA 5AQZA 1IJJA 1P8ZA 5KQ8A 3M3ZA 2A40A 5AQTA 3F9MA 4B1WB 3HM8A 2YJFA 4JD2A 3ZX3A 3VPZA 3O4WA 4M63C 5AQXA 5AQLA 5AQRA 5E26A 4BRKA 3VENA 3DAWA 4FSVA 4B9QA 4CJ7A 3OHRA 2CGKA 1G99A 3ULEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KK1A 4BRNA 3P31A 4W5OA 1BQMA 3H3NO 4EP4A 4KHQA 3V1OA 3IAYA 1ATRA 4CEAA 2KBKA 4BC4A 4DS5A 4DTMA 1K73O 2RE2A 3SK3A 1RBRA 2P9NB 3SMPA 4J2BA 1YTUA 3BY5A 5I9EB 4H5TA 4IO8A 5GINA 1KFSA 1L5UA 3VERA 3AGKA 3O9QA 4BR9A 3A8YA 1HKBA 2ITMA 4KKOA 3AA5X 3VQ9A 5AQGA 2E6LA 3QEPA 4KPYA 4E7KA 1X3NA 4CZEA 4CJPA 1W2BM 4OO1J 1YJ9N 4FWRA 1Z6RA 3MK6A 4DV7K 3VEOA 1Z26A 2HHUA 3NH2A 4HHFA 3AVIA 4E7IA 4JAXA 3ZSQA 3HL8A 4W5RA 4FK2A 1R0AA 3DRSA 2IDOA 3A5OC 4UAEF 2N66A 4CVNE 3CYGA 4EIAA 4A59A 3SQ2A 4DFJA 1ZYVA 5AZIB 4HUGA 3ENOA 3EO3A 1LAWA 3OYKA 1QQMA 1T7BA 3QBWA 4UQGA 1VQON 1KTQA 3KLEA 1S1VA 4WYBA 5E84A 3NVMA 3D2FA 4GV3A 1NJZA 3CCLN 1Z05A 1NOYA 3SNNA 2H3GX 2HBKA 1WNSA 3A5LC 3R3LA 4OKEA 4CD3A 4BY9C 3AGRA 1T7EA 5CZ2A 3VQQA 3FR0A 2P9IB 3HOSA 4DTRA 1VK0A 4OPAA 3DRPA 3VQ7A 4FJ9A 1L3SA 2GBZA 3KLIA 2V7YA 4BG8A 1JJ2M 1K8KB 5KQDA 4BQLA 1JZAA 3K5MA 4ELTA 3QETA 1JLAA 1RCHA 2UUAK 1RFQA 1VHXA 3ULEA 3VQ8A 5KI6A 3J81O 4JNEA 3RMCA 5AQNA 1FKPA 4JRPA 3ASMA 3V9WA 4B9MA 4JK7A 2O8EA 5AQOA 4MO4A 5JVHL 1BK8A 1P00A 4DU4A 2D0AA 1OKJA 4CGFA 2FC0A 3I8BA 3DI6A 3CCVN 4CHZA 3HVRA 3LL3A 3I0SA 4AILC 1LW2A 2VQEK 1MWMA 1J53A 3G10A 2PY5A 3UKRA 3WXKA 3DXMA 1EO1A 5B8HA 2B5JA 3GG4A 5F0XA 3TSPA 3WXJA 2Q31A 3CCJN 4CJSA 4OLAA 4FLWA 3J7AP 2E0HA 3K5NA 5J2QA 1VQPN 4CJ3A 2YX6A 4HTUA 1L3TA 4X66K 3MN9A 2Q36A 3E1YA 2QXLA 4CIEA 1FJGK 3FFKB 5FPDA 2KZMA 4DR5K 3TWHA 1EKEA 3R6MA 4CGJA 4A57A 5CHIA 1ESVA 1I6FA 5HRNA 5AQQA 1K8BA 3DYAA 5JS2A 3PIOL 2X6NA 4U67L 1LCUA 2Q0RA 1TAUA 1UOCA 1U2VB 3SYZA 3A5MC 4BC2A 1YHQN 3WEEB 4UAFE 1DLOA 2BRZA 2HBJA 1J5EK 2G8HA 3LP3A 1V4TA 3J80O 1LW0A 3ZX0A 2RF2A 4CK2A 2VGNA 4KAZA 3ZT1A 4X62K 1TYQA 1NH5A 2QK9A 2D5RA 3H45C 4C8MA 2P9PA 2YC1C 4BR7A 2NRHA 2UUBK 2BUPA 4ISEA 3VMFB 3NGIA 1VQNN 5J2MA 1NK4A 1CXUA 2ZJPL 1JLEA 5EX5A 5HRRA 1TGOA 4ZHRA 3H6EA 3V6DA 4DV1K 3E01A 3KKSA 4QS7A 2SN3A 1RDDA 3CFPA 2NRVA 4BROA 1KVBA 2CH6A 2GUIA 5J2NA 3NF9A 4F2RA 3AA4A 2LJMA 1XQSC 3AO1A 4CJEA 4QAGA 4LF9K 3THXA 4JV5K 2A3ZA 1NGAA 4CK1A 3V9XA 1RT3A 2E2FA 3B6PA 3HJFA 2QKBA 4BRDA 2NRWA 2QWMA 4JS4A 2JWKA 4N76A 4F8RA 5BN8A 4CZIA 3OS0A 4O0IA 3ATVA 2KYQA 2A1RA 4CBUA 4F4KA 2OCEA 2WC9A 2O8CB 1NGGA 4O5BA 2D0OA 4IFVA 4LY7A 2P9LA 3WUHA 2YILA 2B6AA 3G4SN 3NDKA 4G9ZA 4B8AB 1BCOA 3B6OA 1J54A 2HHIA 4Q0BA 4FPAA 1SN4A 5AQKA 1BDGA 3M8SA 3AO3A 3CIPA 3LDPA 2FBTA 2P5OA 4IWVA 4PQUA 4WQ5C 3KLFA 2IVOA 1KVCA 1JLGA 3KIOA 4JK8A 2ZD1A 3MXMA 5IT9O 3KZBA 3CG7A 3U4LA 4Q5VA 1AHOA 3VGLA 2VWKA 3IRXA 1LAVA 4V19S 3BP8A 3DXKB 3G0ZA 3TAGA 4FLUA 4NCGA 4E3SA 4O0JA 3SUNA 1GLDG 1S22A 1NKCA 2PBDA 4DV0K 1U48A 2F8TA 4EHTA 4F9OA 1SKWA 1ICAA 3FE1A 5T7BA 4BG9A 3PX4A 4PA1A 4NO7A 5M1NA 3O4QA 4H0YB 5AZJA 2OTLN 2GELA 3NH0A 5SZTA 1T8EA 1GOAA 5AJ3K 3EEQA 4H5NA 2P9SA 3ZEUA 1KD1O 1A5XA 1NNEA 5CZ1A 4HCBA 3THWB 1U6ZA 3NHGA 4OLBA 3PSIA 4YDUA 4C23A 4CESA 1WBDA 3LDSA 4ILGB 1Q8IA 3OJUA 1VQ7N 4C8NA 5BN9A 1YIJN 1XHZA 5JLHA 1VQ5N 3VQBA 1BI4B 2WUSA 2IAJA 5GADP 1RT5A 3UKUA 2ATBA 4CHNA 5BR9A 4YOTA 3HSTB 1ZVEA 3OYLA 3NH1A 3F9KA 4B3MK 4DR3K 3C6UA 5AQPA 4RW7A 2ZF5O 1Q9YA 4WCEL 2P9UA 4YOUA 1RBTA 2NNWA 4ZTJA 2GMOA 1Y64A 4I2PA 4CBWA 4C8KA 2D4WA 4KHYA 5EU7A 4BC3A 1HNWK 4B3SK 1T3VA 3SZ2A 1BIUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KK1 A;  4BRN A;  3P31 A;  4W5O A;  1BQM A;  3H3N O;  4EP4 A;  4KHQ A;  3V1O A;  3IAY A;  1ATR A;  4CEA A;  2KBK A;  4BC4 A;  4DS5 A;  4DTM A;  1K73 O;  2RE2 A;  3SK3 A;  1RBR A;  2P9N B;  3SMP A;  4J2B A;  1YTU A;  3BY5 A;  5I9E B;  4H5T A;  4IO8 A;  5GIN A;  1KFS A;  1L5U A;  3VER A;  3AGK A;  3O9Q A;  4BR9 A;  3A8Y A;  1HKB A;  2ITM A;  4KKO A;  3AA5 X;  3VQ9 A;  5AQG A;  2E6L A;  3QEP A;  4KPY A;  4E7K A;  1X3N A;  4CZE A;  4CJP A;  1W2B M;  4OO1 J;  1YJ9 N;  4FWR A;  1Z6R A;  3MK6 A;  4DV7 K;  3VEO A;  1Z26 A;  2HHU A;  3NH2 A;  4HHF A;  3AVI A;  4E7I A;  4JAX A;  3ZSQ A;  3HL8 A;  4W5R A;  4FK2 A;  1R0A A;  3DRS A;  2IDO A;  3A5O C;  4UAE F;  2N66 A;  4CVN E;  3CYG A;  4EIA A;  4A59 A;  3SQ2 A;  4DFJ A;  1ZYV A;  5AZI B;  4HUG A;  3ENO A;  3EO3 A;  1LAW A;  3OYK A;  1QQM A;  1T7B A;  3QBW A;  4UQG A;  1VQO N;  1KTQ A;  3KLE A;  1S1V A;  4WYB A;  5E84 A;  3NVM A;  3D2F A;  4GV3 A;  1NJZ A;  3CCL N;  1Z05 A;  1NOY A;  3SNN A;  2H3G X;  2HBK A;  1WNS A;  3A5L C;  3R3L A;  4OKE A;  4CD3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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