5EY4A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
378
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDITKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 378
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ey4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ey4A04
2I7PA 4FSVA 3SMPA 5AQHA 1TYQB 2QWRA 5EXWA 3MN5A 2E20A 2P9KA 4A2AA 4H0VB 2YHYA 4YDUA 1X9JA 5LJWA 3VERA 1KAZA 3QMLA 2HF3A 1Z6RA 1WOQA 1T6DA 5BN8A 2HF4A 5AFUA 3A5NC 4BQZA 4H0XB 3GBTA 1QQOA 3U4LA 2F9TA 4HTLA 4CZMA 1SAZA 3ZEUA 3ZX0A 4CZJA 5BN9A 1BG3A 1HPMA 5CE3A 1DKGD 4FO0A 4GNIA 2P9IB 1X3MA 1S3XA 2NRHA 3HSCA 3FGUA 3DXKA 3R9PA 3WXKA 2UYTA 5KQDA 3D2FB 2A40A 1XQSC 2E2NA 2Q2RA 4BR9A 1HLUA 1YAGA 2V51B 1NWKA 3UKRB 1XC3A 2E2OA 4BC4A 3CJCA 4BC5A 4YDUC 3LDPA 1QQNA 2VWBA 3RSEB 3QB0A 4BRFA 1X3NA 4CBXA 4E1JA 4JHDB 4B1VA 1U6ZA 3QFPA 1SQKA 2A41A 3D7EO 4I6MA 2P9LB 4CI6A 1YXQA 3CQXA 3VGMA 5ADXA 3VEZA 2QWMA 2GUPA 3VEWA 3KVGA 1K8KA 5LJVA 1D4XA 2Q1NA 3TPQA 3VF2A 3LM9A 5JLHA 3VGLA 3WXIA 2P9KB 4B9QA 2FF3B 2CH5A 3LDLA 4DHYA 4PKIA 5AQQA 4H5RA 4WQ5C 4FL9A 5AZIA 3HI0A 3CIPA 3MN7A 5BRHA 4BRKA 2EWSA 1NGJA 3BF3A 4JNEA 4CD1A 5FPMA 2FLOA 4PKGA 3A5LC 3H45C 4A2BA 4CZGA 3FE1A 4BR2A 3GE1A 3IFRA 4H0OA 3ULEB 2OANA 4M7YA 4QS8A 3VETA 3HBTA 4FWLA 4FPBA 1H1VA 2VYPA 4WYBA 2V52B 3ZETA 3ZX2A 4MO5A 4CZHA 2E88A 2P9SB 1XUPO 3L0QA 3O1WA 1ATRA 3FZHA 3M6GA 5EX5A 4KBOA 3CJ1A 2P9NB 4PL8A 3GL1A 3WQUA 5AZJA 2ITMA 5AQYA 4FWPA 3FZKA 4IZ9A 5KPRA 4J8FA 3VEYA 3UB5A 1KXPA 3CI5A 3GOIA 2D4WA 1C0FA 2V7ZA 3QFUA 5AR0A 4BRDA 2DPNA 3F9MA 4JD2A 3O1BA 1OKJA 2GWKA 5AQIA 2D0OA 3WXLA 1JCFA 3D2EA 4EIAA 2PBDA 3LDNA 1CZAN 4BVOA 3QICA 2AP1A 4RWTA 4BR7A 2PAVA 3H1QA 4CZEA 4BQLA 1ATSA 3VPZA 1V4TA 1NM1A 2QWQA 2Q97A 5LY3A 5AQTA 3VGKA 4GY2B 5AZIB 4M63C 4F9OA 2ASPA 2NLXA 3BF1A 3M3ZA 5AQVA 2I7NA 3VEXA 1NGAA 2IIRA 2IVPA 3EZWA 3L4IA 4MO4A 3H3OB 3G25A 5AQPA 1NGCA 3U9DA 4A61A 4FOIA 4IJNA 5JICA 3H6EA 3CJBA 2ASOA 1JCGA 4BRGA 5AQFA 1LOTB 3IDHA 3KHYA 1YUWA 4K25A 4CZLA 4WQ5A 1ZXOA 2YI1A 4K43A 4FWOA 3HM8A 2YJEA 4BG9A 4BRIA 2E2PA 2FSKA 4PL7A 3MN6A 1ESVA 4Y0WA 4BVPA 5AQOA 2FXUA 4K42A 3L6QA 1NGBA 4H03B 4HWIA 4H5VA 5AQWA 3CHWA 4XH4A 2BTFA 1ATNA 5AZJB 4BRQA 5FPNA 5AQGA 1Q18A 5AQUA 4CZKA 5BPMA 1SZ2A 1GLEG 3FFKB 5BR9A 5JLFA 4H5WA 2D1KA 5FPDA 4B1XB 5E84A 1EQYA 4CD3A 1V4SA 1GLDG 5AQZA 4L3QA 3P4IA 5EY4A 4B1WB 3D2EB 1JCEA 4XH5A 3VEOA 5AQJA 1E4FT 3VOVA 1HKBA 4B1ZA 1BA1A 2IVNA 2CH6A 1TUYA 1BWFO 4M7XA 1BUPA 1Y64A 4FPAA 3UKUA 4FWQA 3KZBA 2QWPA 3W0LA 4JAXA 3WEEA 1GLLO 1HX1A 4H0TB 4NO7A 3VENA 1GLJO 4PKHA 1BDGA 5TKYA 4AM6A 4FWKA 3BUZB 2P9PA 3EN9A 4BGAA 4BR4A 2VCPA 3DJCA 3ENHA 2Q31A 4CJ7A 1ZC6A 3CJ9A 2J4RA 2E1YA 3VESA 1R59O 1TYQA 3CJAA 5BRDA 1WUAA 3BEXA 3WXJA 3LDOA 3ZEUB 3DWLA 2A5XA 4BGBA 4DB3A 3CQYA 4IXCA 3CERA 2QWOA 4B1YB 4BG8A 2E2QA 2QWNA 3LDQA 3W3DA 4AM7A 2GTDA 5E26A 2KHOA 3DXKB 4FOEA 1E4GT 1LCUA 2E1ZA 2P9UA 4CZIA 3QBWA 3IUCA 4BRHA 3MCPA 3MK6A 5B8HA 2A3ZA 2H3GX 3O4WA 4BR5A 3DXMA 2FSJA 2NZTA 3FZFA 1QZ6A 3AY9A 2YJFA 3CJ7A 2P9IA 1HKGA 2Q36A 5AQMA 4CZFA 5ELZA 3A5MC 4EHTA 4I6MB 4DCHA 3FZMA 5F0XA 4QS7A 5F1XA 1K8KB 3D2FA 3M1FA 1P8ZA 3J8AA 4FWMA 2D0PA 3MDQA 3UKRA 1NGEA 1C0GA 4QS9A 3O6WA 2QWLA 1MDUB 3LM2A 3VF4A 3WEEB 1NBWA 3A0IX 5EOYA 4DQ8A 3RSEA 5AQRA 4LC9B 3O8MA 1BOTO 3IMXA 2QW9A 2P9PB 4JHDA 5AQSA 5BPLA 2P9LA 4IWVA 1NGIA 1GLAG 5BREA 4H0YB 2CGJA 3UE5A 3OHRA 3H3NO 3EKSA 1BU6O 3AAQA 1U2VA 2YHWA 2CGLA 3U9ZA 4FWRA 3O08A 1Z05A 2Q0RA 3O5BA 3ZETB 2BUPA 5AQXA 3SK3A 2HMPA 2YCHA 4BR0A 4FWNA 5EVZA 2P9UB 3ZX3A 4EAHD 4A62A 4B1UB 4BRMA 3FLCO 1S22A 3I8BA 2ZWHA 3MMVA 3EO3A 3GDQA 3WQTA 4CBWA 3R6MA 1BA0A 4O5FA 3TU5A 3ULEA 4IJAA 3DXMB 2WUSA 3ENOA 1NGFA 1MWMA 4BRLA 3B8AX 5AFUH 2FF6A 4BC3A 4JD2B 2CGKA 3AARA 2P9SA 2QXLA 1GLBG 2HOEA 2ZGYA 4BC2A 1KAYA 3BP8A 3EKUA 4BRCA 3SMSA 3C7NA 2P9NA 2QM1A 3R8EA 5BPNA 1T6CA 4RCHA 3SLCA 4RTFD 1GLFO 3A8YA 1GLCG 1QQMA 5AQLA 4O8KA 1J6ZA 2IVOA 4ISGA 3O80A 2A42A 4XEIA 3EL2A 5KQ8A 3QBXA 3H46O 3AAPA 1G99A 2ZGZA 3VF6A 3JXUA 4IO8A 3ID8A 5KPZA 3C0BA 2GELA 3SJHA 4BRAA 3JS6A 2V7YA 1YVNA 4NB4A 1IG8A 4JN4A 4BRNA 5I9EB 1U2VB 1RGIA 4XH1A 4WQ4A 3HZ6A 1QHAA 2ZF5O 1HJOA 5ADXH 3U8XA 3DAWA 2YHXA 3VEVA 4EHUA 4K41A 1ZBSA 1NMDA 2GWJA 4C23A 2Q0UA 3H1VX 2FSNA 3LL3A 3MN9A 4ISFA 1RFQA 4H5NA 4MLHA 1NGGA 4H5TA 3FZLA 1MWKA 5KPTA 2F9WA 1RDWX 1NGDA 3ATVA 4BROA 1NLVA 2E8AA 5JMVA 4EFHA 1DEJA 1IJJA 4Z94A 4H0PA 3WT0A 4FWSA 3ATUA 3A5OC 2AA4A 1KAXA 4BREA 5FPEA 2W40A 3GG4A 2GEMA 1NGHA 3HTVA 1DGKN 3C7NB 1TUUA 3CETA 3UKUB 2A6AA 3WUHA 1HKCA 4WQ4C 1BO5O 1QZ5A 2W41A 5BRFA 2ASMA 3FR0A 3S41A 4BRPA 3I33A 4MLEA 1T44A 1HUXA 5AQNA 4CBUA 1MA9B 5F2RA 5AQKA 4ISEA 3QDKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B9UA 3AA5X 4FSVA 3RVCA 3SMPA 5AQHA 4EP4A 1RILA 3R2VA 1BCOA 1BIZA 1WSIA 3DMJA 3QMLA 2G8FA 2HF3A 4OPKA 1L5UA 1JXEA 3O3GA 3D0PA 4K0KK 2HF4A 4TSXA 3KOZA 2RN2A 4BQZA 4H0XB 2HSTA 4DV1K 1TL3A 4IFYA 3OYJA 3SUOA 2IC3A 2XY5A 3KD5E 5EU7A 3OYIA 4H4MA 3SJJA 3ZEUA 5BN9A 1YVUA 1VNBA 2BH1A 1GOCA 2P9IB 1W2BM 3HSCA 3NAEA 3R9PA 2UYTA 4KHWA 2V51B 4RW4A 1LWFA 3KLFA 3KP1A 1LV5A 4BC5A 4J2EA 4KHUA 3KIOA 2VWBA 4WE1A 3L56A 2VWKA 5JVGL 3RWUA 4JHDB 4CFBA 3CFRA 3D7EO 4ILHA 4KH5A 2P9LB 5ADXA 3CQXA 4C1NK 1FXXA 2QWMA 2GUPA 3KVGA 5LJVA 1D4XA 2Q1NA 4X64K 4ID5A 2XO7A 5JLHA 3AVHA 1XRSB 2X6NA 4HUGA 5I42A 1Y97A 2CH5A 3BY5A 4ELVA 5LMNK 3BZCA 4O55A 5C10A 5AQQA 2E2FA 3QINA 4M41A 4FL9A 5AZIA 2KTQA 4BRKA 1NGJA 3I8DA 4CEOA 5FPMA 4NCBA 4PKGA 4A2BA 4AAZA 2FBXA 3S9HA 3HOSA 3FE1A 3MWTA 4YOWA 2RF2A 3IFRA 3ULEB 2OANA 4M3WA 3SCXA 3B6OA 4DTUA 4DR7K 4JI7K 4M3RA 4FPBA 3QEVA 3NGZA 3JYTA 4DTPA 2OPSA 2IS3A 2Q3SA 4CJTA 1SKSA 2UU9K 3EE9A 3L0QA 4PQUA 2HHTA 3FZHA 4F3OA 3CJ1A 2UUBK 1VRTA 4AF1A 3FZKA 2IOCA 3K57A 3AA4A 3UB5A 1O13A 1UWBA 4CJ4A 2DPNA 4CJRA 4JD2A 3O1BA 1SL0A 3WXLA 3KWIA 1C6VA 1K8BA 4FVMA 4BVOA 3CMAN 4BR7A 4DU4A 2VG5A 4BACA 1GOAA 3VN5A 3V1RA 4BQLA 3OYBA 4DSJA 2QWQA 1R0AA 1QVFM 3VGKA 1RNHA 1NKEA 1BQNA 3ZCMA 1U49A 1N6QA 5AQVA 3VEXA 2XHBA 4XIUA 3VQDA 3EZWA 4MO4A 2NNWA 3AO3A 2DFEA 5AQPA 1RBVA 2ZE2A 2W6LA 2KKZA 5JICA 3H6EA 3CJBA 1JCGA 3IDHA 5GAHP 3KHYA 4B9SA 1YUWA 4JK8A 4K25A 3OYAA 2SN3A 1Q8IA 4WQ5A 4KKOA 4BG9A 3SAGA 2BANA 4PL7A 3MN6A 3DRPA 2KYQA 1T3VA 4FLYA 1XNQK 4K42A 1NGBA 4H03B 4HWIA 4H5VA 5AQWA 4JKCA 2BTFA 1ATNA 4OGEA 4KHQA 2LI7A 5GINA 4BRQA 3K5NA 3CYGA 4FK4A 1OH7A 3VQ4A 5DM7L 4AH9A 4M3ZA 2MN5A 3C65A 3K2PA 1BHLA 5E84A 3KOWA 2OCEA 3KWGA 2ZJQL 3P31A 5K14A 1P00A 5AQZA 4BECA 1TKZA 3D2EB 4XH5A 1KLNA 1DTTA 2CH6A 1FJGK 3LP2A 5J2PA 1EETA 3W0LA 3L8BA 1GLLO 4H0TB 4CGHA 4HUEA 4FWKA 4FJKA 2OZMA 5DK5A 4ILGB 3MCAB 1NOYA 1ZVGA 1J9AA 4W5OA 1ZC6A 2QXFA 3VESA 4CF1A 4F2RA 5BRDA 1WUAA 3WXJA 3ZEUB 3TAFA 3OW2M 3NF9A 3KKSA 3AVIA 4DB3A 5JENA 3CERA 3PX4A 1N5YA 1XNRK 2W42A 2F4VK 2DFHA 1BMRA 4FOEA 3V9ZA 4DFMA 3ISNC 3QIPA 2P9UA 4E7HA 1RTDA 1QVGM 3CW4A 4JLHA 3MCPA 2YHAA 4JS5A 1NK4A 1NNEA 4OLBA 3O4WA 1KV0A 4AHRA 3CC2N 1NU0A 4FLTA 2Q36A 4CZFA 3G6EN 3SV4A 2ZQBA 1OH5A 4CEBA 1FH3A 5F0XA 1U45A 2W6KA 3AA2A 3C6AA 4JI0K 1QSSA 1NJWA 3M1FA 5C2DA 1C0GA 3LM2A 3WEEB 1NBWA 3LWLA 3NGYA 3O9RA 1EO1A 4DQ8A 3RSEA 2VY6A 3O8MA 3IMXA 4FZYA 2E0HA 5BREA 4Y1CA 2UXBK 2GV9A 4CE9A 2OTJN 4CGFA 3OHRA 3CMEN 1LQIA 4CEQA 2LR3A 3KTQA 3CM5A 2NRTA 2CGLA 2RHKA 4YOVA 4FJ9A 4GKKK 5T7BA 1Z05A 1ZUTA 4JI1K 3ZT3A 3CC4N 1T8EA 2KPYA 3WNGA 4LFBK 2HMPA 4FJXA 1CN2A 4BE7B 1ZFUA 3ZX3A 1I3AA 5A2QO 3K5MA 5HL7L 3VQEA 3I8BA 3OYGA 2KZMA 2WBNA 5J1EA 1VQNN 5DM6L 4IJAA 4M42A 3TAEA 3DXMB 4LF6K 2LY5A 3ENOA 2E6MA 2F7TA 5HLFA 3B8AX 3KOXA 3O9SA 1C1BA 4JD2B 2CGKA 2QXLA 2IAJA 4DG1A 1ZVEA 4F2SA 5GAEP 4BRCA 1WSGA 3C7NA 2P9NA 2QM1A 1IKVA 1T6CA 1VSLA 1LWEA 3OA9A 4RTFD 1NRBA 4NXNK 3KOYA 1QQMA 3CFOA 3S3NA 4O8KA 4YOXA 2G2KA 3O80A 2LJ7A 3EL2A 4J2AA 4CJ5A 2BDPA 1T7AA 3RMDA 4DV0K 2YIOA 2HBLA 3JXUA 4IO8A 1UA0A 3SJHA 3WNFA 5HRRA 4C8KA 1IG8A 3T19A 1U2VB 4FW1A 1RGIA 4WQ4A 5GIPA 1L4VA 4OPJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4B9U A;  3AA5 X;  4FSV A;  3RVC A;  3SMP A;  5AQH A;  4EP4 A;  1RIL A;  3R2V A;  1BCO A;  1BIZ A;  1WSI A;  3DMJ A;  3QML A;  2G8F A;  2HF3 A;  4OPK A;  1L5U A;  1JXE A;  3O3G A;  3D0P A;  4K0K K;  2HF4 A;  4TSX A;  3KOZ A;  2RN2 A;  4BQZ A;  4H0X B;  2HST A;  4DV1 K;  1TL3 A;  4IFY A;  3OYJ A;  3SUO A;  2IC3 A;  2XY5 A;  3KD5 E;  5EU7 A;  3OYI A;  4H4M A;  3SJJ A;  3ZEU A;  5BN9 A;  1YVU A;  1VNB A;  2BH1 A;  1GOC A;  2P9I B;  1W2B M;  3HSC A;  3NAE A;  3R9P A;  2UYT A;  4KHW A;  2V51 B;  4RW4 A;  1LWF A;  3KLF A;  3KP1 A;  1LV5 A;  4BC5 A;  4J2E A;  4KHU A;  3KIO A;  2VWB A;  4WE1 A;  3L56 A;  2VWK A;  5JVG L;  3RWU A;  4JHD B;  4CFB A;  3CFR A;  3D7E O;  4ILH A;  4KH5 A;  2P9L B;  5ADX A;  3CQX A;  4C1N K;  1FXX A;  2QWM A;  2GUP A;  3KVG A;  5LJV A;  1D4X A;  2Q1N A;  4X64 K;  4ID5 A;  2XO7 A;  5JLH A;  3AVH A;  1XRS B;  2X6N A;  4HUG A;  5I42 A;  1Y97 A;  2CH5 A;  3BY5 A;  4ELV A;  5LMN K;  3BZC A;  4O55 A;  5C10 A;  5AQQ A;  2E2F A;  3QIN A;  4M41 A;  4FL9 A;  5AZI A;  2KTQ A;  4BRK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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