5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
3O5BA 3U8XA 4DQ8A 1NBWA 2ZF5O 4M63C 5E26A 5B8HA 2I7PA 4A61A 4B1YB 5AQUA 2Q1NA 2P9NA 2CGJA 1G99A 2FSJA 4BC5A 3KHYA 4CZJA 1MWMA 5AQNA 3H45C 3HI0A 1K8KB 2P9LA 3I33A 3EZWA 3W0LA 3ZX3A 3GOIA 4K43A 2CH6A 3WQTA 1NGIA 4JN4A 2IIRA 4FL9A 5AQVA 5FPNA 2DPNA 3ATVA 5AQGA 5AQRA 5EY4A 1TUYA 5BREA 5BPNA 1GLFO 4KBOA 2P9PB 2IVNA 3G25A 4F9OA 4BRNA 2E1ZA 3MN6A 4QS8A 4CZFA 3A5NC 4FWQA 3QFUA 3RSEB 3IMXA 4BR5A 3D2FA 5AR0A 4BVPA 2HF3A 3CJAA 4H0VB 3QFPA 1D4XA 4BRKA 4B1ZA 3GDQA 3O08A 1KAYA 1KXPA 1Z05A 4CZLA 1BDGA 1GLBG 3CJ7A 3BEXA 4A2AA 1BOTO 3EL2A 4BRPA 4BC3A 1NLVA 2AP1A 3LDPA 3FZMA 5JICA 3VF2A 3UB5A 4CJ7A 1ZBSA 4HTLA 3W3DA 4BR4A 4H0XB 3AY9A 2I7NA 4BG9A 3EKSA 3MN9A 5JLFA 1NGGA 4IO8A 3FGUA 4ISEA 2QWNA 1DEJA 3L6QA 3ENOA 4Y0WA 5BN8A 3ULEA 4BRFA 3LM9A 2P9LB 2GWJA 1E4GT 5KQ8A 5F0XA 2VCPA 1H1VA 3VEOA 4FSVA 4GNIA 1U2VB 1T6CA 3UKRA 5LJVA 3VEWA 1QHAA 1WOQA 2P9KA 3A0IX 4XH1A 3SJHA 3CHWA 1GLAG 2V7ZA 3IUCA 3KZBA 4FOEA 4CBUA 5BR9A 1BO5O 4DHYA 4FPAA 2ZGYA 3M6GA 3LDQA 3VF4A 4CZEA 2P9SB 3CQXA 5AQPA 3MK6A 3DXKA 3CQYA 4MO4A 4FWSA 5BPLA 3LDLA 3BF1A 4BRHA 1HLUA 4CD3A 4K25A 3C7NB 3EN9A 4L3QA 3R8EA 3VGKA 4B1VA 5TKYA 4BG8A 4H5NA 2QW9A 4JD2A 4BR0A 3VGMA 4B1WB 1Q18A 2GELA 4C23A 4I6MA 3ATUA 4MLEA 5AQYA 5AQQA 3F9MA 1OKJA 2E2NA 3SLCA 1V4TA 2WUSA 1TYQA 4AM6A 1JCGA 3CIPA 3AAPA 3FZHA 1BUPA 3EKUA 2GWKA 4H0TB 3SMSA 3VERA 1MA9B 4CZHA 3ENHA 5AZIA 2QWMA 4FO0A 3P4IA 2A5XA 3R9PA 4BRCA 2E1YA 3D7EO 3H1QA 3EO3A 4JAXA 4BC2A 2E20A 3A5MC 1RDWX 1GLCG 3UKUA 2GUPA 2HF4A 2Q36A 4O8KA 4K42A 3FZFA 5AQOA 2UYTA 4PKIA 2OANA 3UKRB 2YCHA 2A41A 3CJ9A 1YVNA 1E4FT 4MO5A 1TUUA 1NM1A 2P9UA 2P9IA 4IXCA 3MCPA 1SQKA 3ZEUB 1JCFA 4BROA 1LOTB 4B1UB 3LDOA 1T44A 3MMVA 2V51B 3MN5A 4H5TA 2YI1A 5AQIA 3BUZB 3DXMB 1ATNA 2H3GX 1U6ZA 2YJFA 4CBXA 2FSKA 1C0GA 2CH5A 4IJNA 2F9TA 4BREA 1ATSA 5FPMA 4YDUA 4PL8A 4I6MB 3QICA 4BRIA 3CJ1A 5AZJA 2CGLA 4EFHA 4M7YA 2ZWHA 1BA1A 3FFKB 3D2EB 2ZGZA 3SMPA 4EAHD 3WXKA 2A42A 4WQ4C 3ZETB 4WYBA 3JS6A 4IJAA 3WEEB 2FF3B 3ID8A 1BG3A 1RGIA 1HPMA 5AQZA 4NO7A 4CD1A 4CZKA 4H5VA 4DB3A 5AQTA 2YHWA 2P9NB 3HBTA 4FWLA 3H3NO 4BC4A 5AFUA 2BUPA 4GY2B 5AQKA 2E2PA 1NWKA 3ZX0A 1YAGA 5BRHA 5FPDA 5ELZA 5AQLA 1NMDA 3FR0A 2YHXA 2EWSA 1BWFO 3CETA 4JHDA 2PBDA 5AFUH 4BGAA 4ISFA 2E88A 4IZ9A 4H0PA 2QWRA 4B1XB 2FSNA 5BRDA 2QWLA 3VGLA 4FWMA 3A8YA 1DGKN 3WQUA 4IWVA 2W41A 3L0QA 3FZKA 1XC3A 3D2FB 1NGBA 5ADXA 3MDQA 4A62A 5AQXA 1NGEA 3WXJA 1HKBA 1K8KA 2VYPA 4EHUA 3IDHA 1GLLO 1IJJA 1QZ5A 2D1KA 1EQYA 5AQSA 2QWQA 2GTDA 2KHOA 3O6WA 1NGDA 3U4LA 5AQJA 4RTFD 5KPZA 1S22A 1QQOA 4BRAA 4CZGA 4LC9B 3DWLA 3SK3A 5ADXH 1KAZA 2P9PA 4H0OA 4FWKA 5LY3A 5KPRA 4PKGA 5AQWA 2ASOA 3QDKA 2ITMA 3M3ZA 1IG8A 1KAXA 4H5WA 4BRLA 5LJWA 1HJOA 3O80A 3QMLA 2HOEA 5F1XA 3O4WA 3R6MA 4RWTA 3ZX2A 1GLEG 4CI6A 3ULEB 1NGAA 3H6EA 2ASMA 3C0BA 3U9DA 4CZIA 1X3NA 2E8AA 3L4IA 3MN7A 3WXLA 5EX5A 2GEMA 2P9KB 3H46O 2YJEA 1HKGA 1WUAA 3H3OB 4BGBA 2NRHA 1BU6O 1GLJO 2PAVA 3VEYA 3VOVA 3DXKB 3GG4A 2FLOA 4FWRA 1BA0A 1ZC6A 3LM2A 1CZAN 4H0YB 4BRGA 4JD2B 3KVGA 4FWPA 3GL1A 4FOIA 4EHTA 5AQMA 1U2VA 3VPZA 3JXUA 4A2BA 4EIAA 3O1WA 1HX1A 2Q0UA 3QBWA 1Y64A 3FLCO 4E1JA 1R59O 1TYQB 1V4SA 3IFRA 2E2OA 3BP8A 2Q97A 4FPBA 3O8MA 5FPEA 4FWNA 2ASPA 2J4RA 5EVZA 1ATRA 2P9SA 3UE5A 4AM7A 4CZMA 1SAZA 2V52B 3TU5A 5AZIB 1NGFA 3WUHA 1NGHA 1C0FA 3C7NA 4K41A 4MLHA 4BVOA 5E84A 2Q2RA 3U9ZA 2V7YA 5KPTA 3UKUB 3VEVA 3I8BA 4PKHA 4B9QA 3O1BA 4XH4A 4CBWA 4DCHA 3CJBA 1P8ZA 2W40A 4WQ5A 3LDNA 1NGJA 3S41A 1ZXOA 3WT0A 1J6ZA 2Q0RA 1QZ6A 3GE1A 1MWKA 3CI5A 4M7XA 4ISGA 1RFQA 3HSCA 2IVOA 2P9UB 2P9IB 4H03B 2IVPA 3H1VX 2D0PA 3A5OC 1X3MA 1LCUA 3HZ6A 2CGKA 4BRDA 5JLHA 2YHYA 1XUPO 2FXUA 2A6AA 3VEZA 4RCHA 3J8AA 3GBTA 3CJCA 1QQNA 1DKGD 5EXWA 5BN9A 1NGCA 2Q31A 4XH5A 3WXIA 1JCEA 1GLDG 3CERA 1QQMA 5AQHA 3FE1A 3M1FA 4Z94A 1SZ2A 3VF6A 4BRQA 4QS9A 3TPQA 2D0OA 2A3ZA 3BF3A 2HMPA 1T6DA 3QB0A 5AZJB 3HTVA 4JNEA 5KQDA 3DJCA 4QS7A 5F2RA 3QBXA 3ZEUA 2VWBA 5JMVA 4NB4A 1MDUB 4BQZA 4FWOA 1S3XA 1HUXA 5CE3A 2QM1A 2A40A 3LL3A 1HKCA 4YDUC 3DXMA 4H5RA 3OHRA 4J8FA 3FZLA 2AA4A 1YXQA 1XQSC 1X9JA 5BPMA 3VEXA 3RSEA 2NLXA 4PL7A 2F9WA 3AAQA 3HM8A 4WQ4A 4BQLA 4HWIA 2D4WA 4BR9A 1ESVA 3VETA 3DAWA 3VESA 2QXLA 3A5LC 4XEIA 4BR7A 5I9EB 2QWOA 3D2EA 2QWPA 4BRMA 3VENA 2E2QA 3ZETA 4JHDB 5BRFA 3WEEA 2NZTA 5EOYA 4BR2A 1YUWA 3AARA 3B8AX 2BTFA 4O5FA 5AQFA 1Z6RA 2FF6A 4WQ5C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQ8A 1NBWA 4M63C 5KK4A 5E26A 2I7PA 4A61A 3N4PA 4E7HA 2LKBA 2DFFA 3CM6A 1U48A 3OS1A 1KFDA 1OH5A 3ZSXA 4ELUA 4KV8A 3M5RA 3EZWA 3W0LA 4LSNA 4CQKA 3ZX3A 1P00A 1WSHA 2OPRA 2X6SA 2KKZA 3ATVA 5EY4A 4LFBK 3CXCM 1BIUA 1WSIA 4F9OA 1RT2A 4BRNA 3KOZA 4X65K 4BE1A 3OYNA 3A5NC 3ISNC 5I3UA 2KJAA 4FWQA 4B3OA 3QFUA 2OA8A 4NLBA 4NCBA 1TI5A 3IMXA 3D2FA 1NJYA 4DUYK 1D8YA 4BVPA 4CESA 1WSGA 2GL1A 1VRUA 4M3WA 3QFPA 1D4XA 4I9QA 3MX5A 1NOYA 3DM2A 4FZZA 4GV6A 4HUGA 4CZLA 4OGEA 1KRPA 3CJ7A 4FJ7A 2LR3A 4FJNA 4F4KA 2ZJRL 4JK7A 3OYHA 4EZ6A 1VQ5N 3VF2A 1ZBSA 4HTLA 1UOCA 5HL7L 1VSJA 4H0XB 1JKZA 4FLVA 3AY9A 1VSKA 3NGYA 4FLWA 1TAUA 1HNVA 1HR0K 3CMAN 1RCHA 1S1UA 1DEJA 3WNEA 2O8FA 4DU3A 4GV3A 3UIQA 1EETA 3QEXA 3K9JA 1IG9A 4GNIA 1N4NA 1Q8IA 2IGIA 4CJEA 5C10A 3WNHA 2KLAA 3V9UA 4G9ZA 1C55A 1RDDA 2P9KA 3A0IX 4YOVA 2VG6A 4XH1A 5C15A 4CF1A 3RR8A 1JLEA 4CBUA 5BR9A 3HYFA 4DS4A 1I6FA 2ASCA 3F2KA 4FLZA 3KC6A 2ZGYA 3AGKA 3M6GA 5FRMA 4CFBA 3MK6A 4MO4A 4FWSA 5GAEP 3LDLA 4BRHA 1HLUA 3C7NB 3EN9A 3TR8A 2QW9A 3KOXA 4BY9C 1Q18A 2GELA 2UXDK 1BRZA 4RW7A 5KTQA 1ZBHA 4AHSA 3F9MA 2E2NA 3G0ZA 3LPTA 1V4TA 4B9VA 1I39A 1JCGA 5FROA 4DF8A 3VERA 1JXBA 2YBRC 4CZHA 4JKDA 5M1NA 3D7EO 1K8AO 3EO3A 2E20A 3NH2A 4CJ5A 4FW2A 4IDHA 4O8KA 5HRPA 3FZFA 2UYTA 4FVUA 3THVA 4JKFA 4MO5A 1TUUA 3SJJA 4C8LA 4J2DA 1YVUA 2PZSA 2P9UA 2XY8A 2YEOA 3LALA 3SV4A 3ITHA 3AA3A 3J7YP 1GPSA 3MEGA 3SZ2A 4FJXA 1Q86O 1KV0A 1YHQN 5KGWA 3ZLJA 4AHVA 3ASMA 2QEXN 4DS5A 1ASVA 4K0KK 1XHXA 1C0GA 1DQ7A 2CH5A 3OYEA 3SBTA 1S1XA 4DV2K 1OZZA 3AVNA 4CHNA 4FZYA 5FPMA 4DTRA 4YDUA 2YC1C 1VSFA 2B6AA 4BRIA 1SKSA 1ICAA 1B92A 4FM2A 1T0ZA 4EFHA 3O3HA 2ZWHA 3EEQA 3SMPA 1YTUA 3ZT2A 4DQQA 3E7UX 3JS6A 2FF3B 4DV6K 5EU7A 1ZYQA 2YKMA 4NO7A 3B6OA 4JV5K 1F21A 1TKTA 4FWLA 3HBTA 4KTQA 2FBXA 5AFUA 1SEGA 3QI7A 3AVCA 1SL1A 4ZHRA 5AQKA 2E2PA 2KBKA 4LY7A 3PO5A 3VQ8A 3ZX0A 3LANA 4JI6K 3K5OA 1NMDA 4HUEA 1AHOA 2HHIA 5CZ2A 4BGAA 2VWJA 1NK4A 5D3GA 4IZ9A 5HOOA 4X64K 4B1XB 3AA5X 5BRDA 3AO1A 3NVMA 4FWMA 5FLXO 1DGKN 4DSJA 4DR1K 1QSLA 3FZKA 1XC3A 5JVGL 1OH7A 1OH8A 3WNFA 3D2FB 4YOTA 5ADXA 4BDZA 3WXJA 1ZVGA 1OVQA 1LWFA 1K8KA 3LDSA 5CYQA 3TTFA 4WFNL 1QZ5A 3C6HA 4QOZB 1EQYA 4CF0A 2QWQA 2KHOA 3O6WA 5KPZA 1N8RO 3TTDA 1OVYA 4BRAA 4CZGA 4LC9B 3SK3A 1RT5A 2IC3A 2A1RA 4PKGA 4U67L 1T7BA 2C1GA 3VQBA 2ASOA 1HNXK 4MDBA 3SYZA 3QDKA 2ITMA 3KLIA 1IG8A 3MCAB 1KD1O 1KAXA 4H5WA 4GV9A 2O4IA 2G8FA 2W42A 3O80A 3VA0A 5F1XA 2A7TA 2O8FB 2DFHA 3ZSVA 3SUPA 3ZX2A 2QKBA 4Z4CA 4DFPA 4CJ4A 3L2WA 3VQPA 3U9DA 1S9EA 4KAZA 4CK1A 3PSIA 4CZIA 2E8AA 3L4IA 4DTOA 4B9SA 3CFPA 2P51A 2P9KB 2NY8X 4CVNE 4F3OA 4DG1A 1WWNA 3I8DA 2DY4A 4BGBA 2KZZA 1Q7YO 2XY6A 2E2FA 3U3GA 1ILYA 1W9HA 4JKHA 2GX9A 3VOVA 2FLOA 1KLMA 4FWRA 3HK2A 2UUBK 3NF9A 1VHXA 2B5JA 3CM5A 4H0YB 1WN7A 3KVGA 4FWPA 1XMOK 2PYJA 4DQIA 2MBKA 3P1GA 1RT3A 4A2BA 3MXIA 3PV8A 1FK9A 3P39A 4YNQA 4YOWA 1HX1A 3PO4A 1CZBA 2VGNA 3FLCO 3ZSWA 3SAHA 4DV5K 4FCYA 3DOLA 3IFRA 2ETJA 1HQUA 4KFBA 1C1CA 5FPEA 3U3YA 5GAGP 3ZSZA 2HHUA 3O3FA 1ATRA 1CXQA 1SAZA 4O4GA 4PA1A 3WUHA 3ZYYX 1VSLA 4MLHA 4JK9A 3U9ZA 4CIFA 3VEVA 1XRSB 3I8BA 1ZBFA 3NFAA 4KHUA 2F7TA 3E7RL 4DSKA 3WNGA 1C0UA 4WQ5A 2W40A 2E3GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DQ8 A;  1NBW A;  4M63 C;  5KK4 A;  5E26 A;  2I7P A;  4A61 A;  3N4P A;  4E7H A;  2LKB A;  2DFF A;  3CM6 A;  1U48 A;  3OS1 A;  1KFD A;  1OH5 A;  3ZSX A;  4ELU A;  4KV8 A;  3M5R A;  3EZW A;  3W0L A;  4LSN A;  4CQK A;  3ZX3 A;  1P00 A;  1WSH A;  2OPR A;  2X6S A;  2KKZ A;  3ATV A;  5EY4 A;  4LFB K;  3CXC M;  1BIU A;  1WSI A;  4F9O A;  1RT2 A;  4BRN A;  3KOZ A;  4X65 K;  4BE1 A;  3OYN A;  3A5N C;  3ISN C;  5I3U A;  2KJA A;  4FWQ A;  4B3O A;  3QFU A;  2OA8 A;  4NLB A;  4NCB A;  1TI5 A;  3IMX A;  3D2F A;  1NJY A;  4DUY K;  1D8Y A;  4BVP A;  4CES A;  1WSG A;  2GL1 A;  1VRU A;  4M3W A;  3QFP A;  1D4X A;  4I9Q A;  3MX5 A;  1NOY A;  3DM2 A;  4FZZ A;  4GV6 A;  4HUG A;  4CZL A;  4OGE A;  1KRP A;  3CJ7 A;  4FJ7 A;  2LR3 A;  4FJN A;  4F4K A;  2ZJR L;  4JK7 A;  3OYH A;  4EZ6 A;  1VQ5 N;  3VF2 A;  1ZBS A;  4HTL A;  1UOC A;  5HL7 L;  1VSJ A;  4H0X B;  1JKZ A;  4FLV A;  3AY9 A;  1VSK A;  3NGY A;  4FLW A;  1TAU A;  1HNV A;  1HR0 K;  3CMA N;  1RCH A;  1S1U A;  1DEJ A;  3WNE A;  2O8F A;  4DU3 A;  4GV3 A;  3UIQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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