5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
3SK3A 2FF3B 4ISEA 3EZWA 3O6WA 4FSVA 2QWRA 3ULEB 3QDKA 3O5BA 3MN7A 3DXMB 4RWTA 3U9ZA 2HF4A 1X3MA 1C0FA 1IG8A 4BVPA 4FWSA 3QICA 1TUUA 3FR0A 5AQNA 2P9PB 3UE5A 2E20A 4PL7A 2AP1A 4PL8A 5BPNA 4H5WA 1K8KB 2GWKA 3GDQA 4H0OA 1BOTO 4DQ8A 4BR4A 4BRCA 3ATVA 2EWSA 2CGKA 2YJEA 5LJVA 1NMDA 1X9JA 2VWBA 5AQMA 5AQIA 4BG8A 2IIRA 4XH4A 3A5LC 4BRLA 1HKBA 1HPMA 2P9KA 4XEIA 4BQZA 4H0TB 2V51B 3C0BA 3SMPA 4BC3A 4I6MA 4O5FA 3SLCA 2E1YA 1Z6RA 4JHDA 5EVZA 4DB3A 3EN9A 2V52B 3AAQA 4H5NA 2IVNA 3L0QA 2ASMA 5ADXH 1GLCG 3UKRB 4BRPA 4EIAA 2FSNA 1U2VB 4B1WB 1GLJO 3FZMA 4NO7A 4BQLA 3GL1A 5EOYA 5AZIA 3ZETA 2FLOA 3ULEA 4H03B 4CBUA 4CZLA 3DXMA 1YVNA 4IWVA 3I33A 3FZLA 3D2FB 3A5NC 2FSKA 3A5MC 3SJHA 2Q2RA 4FL9A 2P9PA 4WQ5C 1HUXA 4BC4A 3FLCO 1K8KA 5AQPA 4BGAA 2J4RA 2Q0RA 3WQTA 4PKIA 5LJWA 1HKGA 5F2RA 1GLLO 4B1VA 2Q31A 1NGHA 4E1JA 2IVOA 2A42A 1NM1A 3ENOA 1NGJA 1YXQA 3M3ZA 2NLXA 3GE1A 2YHXA 4EHUA 4LC9B 1E4GT 2D0PA 3HBTA 2ZGZA 4YDUC 5BR9A 4IJAA 5AQRA 3O08A 3O1WA 3WEEB 1C0GA 5F1XA 4FOEA 2GWJA 4BROA 1WOQA 1NWKA 1RFQA 4JAXA 2I7PA 3WXIA 1LOTB 3UKRA 3H45C 4BGBA 1U2VA 2P9UB 5BN8A 2FF6A 3H1VX 2YJFA 1ZBSA 4BRKA 3O80A 1BWFO 5TKYA 2ITMA 5JLFA 5BRHA 3O4WA 4EHTA 4MO5A 2ZF5O 1J6ZA 5AQSA 4MLEA 1S3XA 2QWQA 3D2FA 3CJ7A 3BUZB 4PKGA 3CERA 1QQNA 1NBWA 3ZX2A 4CI6A 3WXJA 1NGIA 3ID8A 5EY4A 5KPRA 4Y0WA 1XC3A 3QMLA 1JCEA 1MWKA 1QZ5A 3G25A 3D2EB 3M6GA 3HTVA 2QWOA 1H1VA 4O8KA 1NGGA 2YHYA 4BR7A 3VETA 1QZ6A 2QM1A 2ASOA 3VGMA 3VF6A 2E2QA 2D1KA 2F9TA 3CQXA 3QFPA 2YI1A 4A2BA 3DXKB 5FPNA 3WEEA 3LDQA 4WQ4C 4A2AA 5BPMA 1NLVA 1E4FT 4WQ5A 4AM6A 1S22A 3MN9A 3LDNA 1MWMA 1GLBG 1ZXOA 3VEOA 4A61A 2VCPA 2FXUA 1R59O 1JCFA 1KAXA 3ZEUB 3FE1A 3VENA 3VERA 2P9UA 4HWIA 1GLAG 4FWNA 2E2PA 2ZGYA 3L6QA 3CETA 2GUPA 4EAHD 4JD2B 1DEJA 3IFRA 1RGIA 4YDUA 2QXLA 1BA0A 3A8YA 2GEMA 1GLDG 3VEYA 3EKSA 1QQOA 4CZFA 5ELZA 1P8ZA 2AA4A 3CJCA 4B1XB 5AQHA 4H5VA 3O8MA 5AFUH 3I8BA 1DGKN 3D2EA 5FPDA 3BP8A 2A41A 3CJBA 3VEXA 2DPNA 3MN5A 5BPLA 1WUAA 4H5TA 3KZBA 4K42A 1KXPA 3ATUA 3QFUA 3KVGA 5AQYA 1HX1A 5AQGA 1ATSA 3U8XA 3AARA 4ISFA 3DXKA 4MO4A 2E2NA 4AM7A 1ESVA 3VF4A 2Q36A 2A6AA 5AQVA 3CJ1A 4B9QA 1TYQB 5E84A 3AY9A 3GBTA 1KAYA 2P9NB 4L3QA 3W0LA 4IO8A 3WXKA 2VYPA 3ZEUA 1T6CA 4IJNA 5KPZA 4JNEA 1YAGA 2P9IB 3FFKB 1QHAA 4M63C 2GELA 4EFHA 2QW9A 2OANA 2BUPA 4JD2A 1ZC6A 1D4XA 2D4WA 3CHWA 3AAPA 1BDGA 2A5XA 2Q0UA 2E2OA 1T6DA 4CBXA 4KBOA 2HF3A 3FZKA 2V7YA 1U6ZA 5AQJA 2HMPA 3LDPA 2V7ZA 3H46O 5ADXA 1TUYA 3CJAA 3VESA 4BRNA 4IZ9A 4K43A 2F9WA 4JN4A 5BRFA 4BR9A 1NGCA 2E8AA 2Q1NA 3UB5A 4CBWA 1HJOA 5BREA 3VOVA 3WUHA 4BVOA 2QWMA 2HOEA 3QBXA 3U4LA 4C23A 3H3OB 3F9MA 4CD1A 2ZWHA 5JLHA 4BR2A 3MN6A 4MLHA 2I7NA 3LM2A 5AQOA 4H0VB 2H3GX 4QS8A 2CH6A 3LM9A 4ISGA 5AQZA 3MMVA 1NGBA 1TYQA 3VGLA 3ENHA 2YCHA 2P9NA 4Z94A 3R6MA 1Z05A 1BO5O 3JS6A 4BRIA 1HKCA 5F0XA 4BRMA 1SQKA 5AQLA 2P9IA 3TU5A 4CZEA 2W40A 3L4IA 3BF3A 4DHYA 5I9EB 1V4SA 4CD3A 1BUPA 4B1YB 1HLUA 4BRDA 1NGEA 3P4IA 4J8FA 3MDQA 2GTDA 4BRGA 3IUCA 4BC2A 1EQYA 3WT0A 5KQ8A 3WXLA 1KAZA 4FWKA 4BC5A 3GOIA 1GLFO 3KHYA 4FPAA 3C7NB 5AQWA 1SZ2A 4FWLA 4FWQA 3VEVA 1NGAA 3H1QA 3VEZA 4CZJA 2UYTA 4FWOA 4FPBA 4FWMA 5AQQA 5KQDA 4H5RA 1ATNA 4H0XB 3IMXA 4PKHA 5EX5A 4CJ7A 3WQUA 2QWPA 2QWNA 3CIPA 4K25A 3FGUA 2CGJA 3LDOA 3R8EA 3H6EA 3CI5A 5B8HA 3U9DA 3J8AA 5E26A 1MDUB 3VF2A 4BRAA 3MCPA 1Y64A 5JMVA 3O1BA 2WUSA 4BRQA 1OKJA 3BF1A 3S41A 3EO3A 4XH5A 3VPZA 1GLEG 3UKUB 5BRDA 2Q97A 3QBWA 5AQXA 5FPEA 1NGFA 1BU6O 4WYBA 4BRFA 3CJ9A 4CZKA 1MA9B 4A62A 3EKUA 3LL3A 3VGKA 4FWRA 5JICA 2P9SB 4RTFD 4BG9A 3HZ6A 1ATRA 1Q18A 3DJCA 3HSCA 5BN9A 1X3NA 3CQYA 4QS7A 4BR5A 3C7NA 1V4TA 4FWPA 3FZFA 1BA1A 2P9LB 5AZJB 3QB0A 1LCUA 3EL2A 4H0PA 4IXCA 4WQ4A 2IVPA 2KHOA 1DKGD 2QWLA 4QS9A 1BG3A 2E1ZA 2FSJA 3RSEB 5AFUA 1T44A 3ZX0A 4GNIA 3D7EO 4B1ZA 3R9PA 3DWLA 4BREA 3ZX3A 3M1FA 5AQKA 1NGDA 2CH5A 2BTFA 4NB4A 4BRHA 5AQUA 1JCGA 2ASPA 3GG4A 4H0YB 3BEXA 3LDLA 3W3DA 2NZTA 4CZMA 4XH1A 3FZHA 3DAWA 2A3ZA 2CGLA 3MK6A 3B8AX 3UKUA 5AR0A 2A40A 2W41A 4FOIA 4CZHA 5AQFA 4B1UB 4F9OA 2P9KB 4RCHA 4HTLA 3VEWA 4BR0A 2P9SA 3H3NO 3HI0A 1QQMA 1XQSC 4K41A 4M7XA 2D0OA 4I6MB 1IJJA 3JXUA 2PAVA 5AQTA 2PBDA 1YUWA 2YHWA 4GY2B 1SAZA 3A0IX 5CE3A 4JHDB 3IDHA 4DCHA 2P9LA 4CZIA 5AZJA 2NRHA 5FPMA 1XUPO 3HM8A 5LY3A 5EXWA 2E88A 1CZAN 4M7YA 5KPTA 4CZGA 4FO0A 3OHRA 3TPQA 3A5OC 3SMSA 1RDWX 1G99A 5AZIB 3RSEA 3ZETB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH6A 3EZWA 3O6WA 4FSVA 2QWRA 1P0AA 1YIJN 2KZMA 3O5BA 4MQ3A 1BQNA 1LQHA 3NGYA 1RT2A 1ZYVA 1X3MA 3VTIA 3ZSYA 1Q86O 1EO1A 1PTXA 1RTJA 1TUUA 1KVCA 1TV6A 3FR0A 3UE5A 4WCEL 1N36K 2E20A 4E1MA 1NRBA 3N4QA 4CEZA 4PL8A 4PWDA 3AO2A 2E2FA 4CHYA 4BE7B 1BOTO 4BR4A 4BRCA 2CGKA 3ZLJA 1X9JA 1I2UA 4EP5A 1IBLK 4XH4A 4CEFA 3QEWA 4M3XA 4I9QA 1HPMA 3AGKA 3SMPA 4BC3A 4M3RA 3SLCA 1XMOK 4AHUA 4M42A 1AHOA 1YJWN 5D3GA 4JKGA 4H5NA 5KRSA 2IVNA 1GLCG 4C8MA 4BRPA 4QAGA 3FZMA 3AO5A 2HHSA 5EOYA 5AZIA 2MN5A 4JRQA 1JLEA 1C1AA 4DR5K 1C1CA 2NY9X 2PZSA 3M8SA 3LP3A 4IWVA 4DS4A 3I33A 4CIGA 2FSKA 3CW4A 3SJHA 1X9WA 4DMNA 3CYGA 3EZ5A 1K8KA 2X74A 2J4RA 3S3OA 1U48A 3WQTA 4PKIA 4NXMK 1HKGA 5F2RA 1GLLO 3LP1A 3L8BA 3OYKA 1NM1A 3GE1A 4DSIA 2E6LA 4JI4K 3K5MA 3HBTA 3CPEA 3O3FA 1N8RO 1KSPA 4I7FA 5F1XA 4FOEA 4IEIA 4CJ4A 4JK9A 2NRZA 3RMDA 4FJGA 1CN2A 3KOYA 3CCMN 1RDBA 1SN4A 3L4QA 1KRPA 4JEPA 3CQ8A 3RRGA 5J1EA 1ZBIA 1U2VA 2VQFK 4OPJA 2O8DA 1I6FA 3WNEA 2B68A 4JS4A 1BWFO 1JKHA 1BCOA 4DTOA 1YJNN 2LR3A 3CJ7A 1CXUA 3BUZB 1S5JA 4DR2K 2KBKA 2IDOA 3ZX2A 2O8FA 2KBHA 5EY4A 4Y0WA 3QEPA 3C94A 3L2QA 3M6GA 1WBBA 1HNXK 1BIZA 4CGDA 3M8RA 1ZBUA 1KLNA 1NGGA 5HRPA 4B9UA 4E19A 2QKBA 1T1TA 2HBJA 4DTPA 4BECA 1ASWA 4CJPA 4CVNE 3OS1A 3QI7A 2E2QA 3I0SA 4A2BA 3WEEA 1T05A 3LDQA 5HL7L 5BPMA 1NLVA 4WQ5A 4IG0A 2HNZA 5DM6L 5J2QA 1GLBG 3K0SA 2VWJA 4CHNA 2Z1JA 3K59A 2VCPA 1SKWA 2FXUA 4CIFA 1KAXA 3FE1A 4FWNA 3NHGA 1X9SA 2E2PA 3CFPA 4B3TK 2KLAA 3CC7N 2HHHK 1NJZA 3SUQA 3E7RL 1RGIA 4X62K 3A8YA 3KIOA 1TKXA 3VEYA 1QQOA 2OPSA 3K58A 1O13A 3R3LA 4E89A 1T03A 4DFKA 4A5AA 3D2EA 3AVCA 3BP8A 1ZVGA 2A41A 3CJBA 3OY9A 3MN5A 1WUAA 3KZBA 1OH7A 2WFBA 3DRPA 4CJQA 3QFUA 1N4NA 5AQGA 3MWPA 3AARA 5JS1A 2C1IA 3Q7CA 2RF2A 3DXKA 4ILGB 4MO4A 3VQ9A 4KHQA 2I61A 1YTUA 4KI6A 1TYQB 5E84A 3CMAN 4B9MA 4OKEA 4DLGA 4DQPA 4Z4GA 1UWBA 2VYPA 3CC2N 2LY5A 3LWMA 3THYB 2JWLA 2BE2A 2GELA 3F2KA 3OYDA 3VN5A 1QSSA 1SUQA 1BDGA 4KV8A 4CGJA 4LF7K 1T6DA 1I39A 1REVA 3VQ6A 3OBYA 4GMJB 3FZKA 3AVGA 4LF6K 3CJAA 3VESA 5BRFA 1W9HA 4BR9A 3V1QA 2OCEA 1WAJA 3DLEA 1HJOA 3QBXA 3U4LA 3DLGA 4HCBA 3CM5A 3DLRA 1UA1A 1T3VA 4C1NI 4CJVA 1KTQA 1XC9A 3QO9A 3C65A 3E9PA 3JSMA 3AVJA 3NH1A 2YC1C 2A1RA 3RWUA 1RBVA 5AJ3K 4EZ9A 2PY5A 3AVNA 1A5VA 3VGLA 3P1GA 4CJWA 4Z94A 3B6PA 2ATQA 3L2VA 4OO1J 4JRPA 5IT9O 1BO5O 1C6VA 2HSTA 1DLOA 4GV9A 1RBSA 2P9IA 4JKCA 4H8KA 1N32K 1TAQA 3AVBA 3QETA 3HK2A 1SL1A 3QEVA 3KP1A 4CFAA 3QNOA 1K9MO 3OYFA 2BANA 4AH9A 3P4IA 1JKZA 4J8FA 4BEBA 2HBKA 3AO3A 4CJ5A 1C0MA 4BC2A 1EQYA 3P31A 4UAFE 2ASCA 5JENA 4WFBL 2AJQA 4FK2A 4OPKA 5KQ8A 1LWEA 4DF8A 4BC5A 3OYGA 1JL2A 3QIOA 1SZ2A 4FWLA 4CZJA 2UYTA 4FWMA 1WSEA 3ZSQA 3IMXA 4PKHA 3ZCMA 4CFBA 3FGUA 3K5NA 4M3ZA 3CI5A 3VTHA 3J8AA 2GV9A 4R79A 4DU4A 4KI4A 3MCPA 3O1BA 5M1KA 3I56N 2QKKA 2XY6A 1OKJA 5C15A 2G8HA 5BRDA 3UKUB 1S1VA 3VQDA 3PO5A 5FPEA 1BU6O 5KTQA 3TR8A 1JXEA 4CZKA 4KFBA 3EKUA 3LL3A 4G1QA 5HRRA 4E7LA 2JLEA 1SN1A 4BG9A 4Z4HA 3MEEA 5FLXO 4FK0A 4K8ZA 3HSCA 2VG7A 4NCBA 4BR5A 2UXCK 1SEGA 4DUYK 2KSKA 1V4TA 4KHNA 4FWPA 3C6HA 3QB0A 3SAGA 5CZ1A 1DKGD 1RT5A 4JI5K 4C8LA 4QS9A 1O1WA 2E1ZA 1NOYA 3RSEB 2LKBA 4GNIA 5DMRA 2IC3A 3QLHA 5I42A 3V9SA 4DSFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OH6 A;  3EZW A;  3O6W A;  4FSV A;  2QWR A;  1P0A A;  1YIJ N;  2KZM A;  3O5B A;  4MQ3 A;  1BQN A;  1LQH A;  3NGY A;  1RT2 A;  1ZYV A;  1X3M A;  3VTI A;  3ZSY A;  1Q86 O;  1EO1 A;  1PTX A;  1RTJ A;  1TUU A;  1KVC A;  1TV6 A;  3FR0 A;  3UE5 A;  4WCE L;  1N36 K;  2E20 A;  4E1M A;  1NRB A;  3N4Q A;  4CEZ A;  4PL8 A;  4PWD A;  3AO2 A;  2E2F A;  4CHY A;  4BE7 B;  1BOT O;  4BR4 A;  4BRC A;  2CGK A;  3ZLJ A;  1X9J A;  1I2U A;  4EP5 A;  1IBL K;  4XH4 A;  4CEF A;  3QEW A;  4M3X A;  4I9Q A;  1HPM A;  3AGK A;  3SMP A;  4BC3 A;  4M3R A;  3SLC A;  1XMO K;  4AHU A;  4M42 A;  1AHO A;  1YJW N;  5D3G A;  4JKG A;  4H5N A;  5KRS A;  2IVN A;  1GLC G;  4C8M A;  4BRP A;  4QAG A;  3FZM A;  3AO5 A;  2HHS A;  5EOY A;  5AZI A;  2MN5 A;  4JRQ A;  1JLE A;  1C1A A;  4DR5 K;  1C1C A;  2NY9 X;  2PZS A;  3M8S A;  3LP3 A;  4IWV A;  4DS4 A;  3I33 A;  4CIG A;  2FSK A;  3CW4 A;  3SJH A;  1X9W A;  4DMN A;  3CYG A;  3EZ5 A;  1K8K A;  2X74 A;  2J4R A;  3S3O A;  1U48 A;  3WQT A;  4PKI A;  4NXM K;  1HKG A;  5F2R A;  1GLL O;  3LP1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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