5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
2P9SA 2Q2RA 2ZGYA 2IVPA 2BUPA 4BC3A 4CZEA 2GUPA 3ATUA 4XH5A 3VF2A 3A5OC 1NGHA 4B1UB 3H1VX 5BPMA 2YI1A 3AAQA 2YHWA 5KPTA 2D1KA 1TYQA 2D0PA 4C23A 3WT0A 2HOEA 2ITMA 5F1XA 4BVOA 2ZGZA 3FFKB 1X3MA 3CJ1A 1GLLO 3L6QA 2P9IB 3ZX0A 4B1XB 2P9PB 1GLFO 5BRDA 5AQZA 5AQWA 3D7EO 2HF4A 2QWQA 2IVNA 1JCFA 3QFPA 3A8YA 3TU5A 4FWMA 1QQOA 4B1VA 3HM8A 4IJAA 4JHDA 3ATVA 3CJ9A 2A40A 3RSEA 1V4SA 2UYTA 3C0BA 2QWLA 2FSKA 3SJHA 5BN9A 3W3DA 4BRFA 4QS8A 2QXLA 3QICA 4Y0WA 1JCGA 1NGDA 3A0IX 3VEZA 1DGKN 3EN9A 2Q0UA 4H0TB 4WQ5A 4MLHA 3LDNA 4BRCA 4EFHA 2E2NA 4FWPA 4H0OA 2I7NA 4WQ4C 3R9PA 3LM2A 1NLVA 1ZXOA 1SZ2A 4BRDA 3D2FA 4H5VA 5FPEA 3WEEA 5EXWA 3DJCA 1TUUA 1U2VA 4FO0A 2V7ZA 5F2RA 3TPQA 2E1YA 3GDQA 1NGAA 3FZFA 2FSJA 4BVPA 2QW9A 3HZ6A 4JHDB 3GE1A 4YDUA 3WXLA 4IO8A 4O5FA 1KXPA 3RSEB 4CZIA 2NRHA 2ASMA 4QS9A 4FWNA 3CJCA 5BREA 1SQKA 3VGKA 3AAPA 2YJEA 5AQSA 2P9NA 4BC4A 5AQMA 1GLEG 2NZTA 1GLCG 2AP1A 3U9ZA 3KZBA 2D0OA 1R59O 1U2VB 5AFUH 4BRNA 3ENOA 4JAXA 3VEXA 1HLUA 3FR0A 4CI6A 3M3ZA 4BR0A 1IG8A 2V7YA 4AM6A 3HBTA 3D2FB 3IFRA 1XC3A 2FF3B 3D2EA 2Q1NA 2HMPA 1KAYA 4BRPA 3AY9A 1CZAN 2YCHA 2E20A 2EWSA 4I6MB 4FWQA 5FPNA 3KVGA 5ADXA 3LM9A 1TUYA 1MA9B 1NM1A 4BC5A 2P9PA 1NGIA 4MLEA 1X3NA 1HKGA 1KAXA 3LL3A 2GTDA 5AQTA 2KHOA 5KPRA 4FSVA 5JICA 2P9NB 3D2EB 3EL2A 1BDGA 5AQKA 3L4IA 4GY2B 1ATRA 4B1WB 2E1ZA 3WUHA 2P9UA 4BGAA 4B1ZA 4B9QA 1NWKA 3M1FA 3VGLA 1J6ZA 2E2PA 5AQIA 4JD2A 3O4WA 3JS6A 4CZFA 5E84A 4F9OA 2VYPA 5BN8A 3UE5A 3FGUA 3SMSA 3WXIA 5AQPA 1OKJA 4BR4A 5AR0A 2E8AA 2DPNA 1BU6O 4JN4A 4PKHA 4BRHA 4IJNA 3VETA 1RGIA 4BG9A 4XH4A 2P9LA 3O1WA 1HKBA 3ZETA 3GOIA 1HUXA 3QBXA 1YUWA 1DEJA 3QBWA 1ESVA 3EKSA 2HF3A 1Q18A 2FLOA 3C7NA 4BG8A 3H3OB 3KHYA 5KPZA 3VEOA 1QQMA 1YXQA 2BTFA 3ENHA 4WQ5C 4CZKA 4EIAA 4DHYA 4CZGA 2QWMA 2FF6A 1K8KA 1C0FA 3UKUA 3BF3A 3H1QA 3FZHA 4H5TA 3GBTA 4ISEA 1HJOA 4CD3A 2QWNA 1DKGD 3CIPA 4BR7A 2AA4A 2YJFA 3CQYA 4H5WA 1TYQB 1HX1A 3LDQA 3VEVA 3MN7A 5AQQA 3M6GA 5AQOA 1JCEA 3QFUA 1MDUB 4BRAA 4Z94A 2QWRA 4CZLA 3G25A 3IUCA 5FPDA 4WQ4A 2CH5A 1IJJA 4BREA 3ZEUA 3CQXA 3HI0A 5AQJA 4BC2A 2GELA 2P9LB 3A5LC 5LY3A 2P9KB 3ZETB 4O8KA 2PBDA 3C7NB 4PL7A 3IMXA 1GLAG 2A42A 2V52B 4PKIA 3HSCA 4A2BA 4BR9A 4M7YA 3I33A 3MN5A 1Z05A 4H5NA 5I9EB 4FOIA 4K43A 4CZHA 2E2QA 4BQZA 4M7XA 2YHXA 4CZJA 1BWFO 4M63C 5TKYA 2A5XA 3VOVA 1E4GT 4H0VB 3ZX3A 3R6MA 2I7PA 1NGFA 4CZMA 3MK6A 4J8FA 3VESA 4CBUA 4ISFA 1T44A 3SK3A 3U8XA 3CI5A 2A3ZA 3O80A 3H3NO 5BRHA 5BRFA 3BEXA 2W40A 4IZ9A 2VCPA 4WYBA 3VERA 1HKCA 3U9DA 4LC9B 3CHWA 1NGBA 3A5NC 5ADXH 4XH1A 1GLBG 3LDLA 4H5RA 4QS7A 3ZEUB 1WUAA 2VWBA 3WQUA 3MCPA 5EY4A 1ZBSA 3VF6A 4H0PA 1T6DA 2E2OA 5AQUA 2YHYA 4A2AA 2IVOA 5E26A 2F9TA 4NO7A 1BA0A 3H46O 1QZ5A 1ATNA 2GEMA 4K41A 4XEIA 3WQTA 1P8ZA 3CJ7A 2J4RA 1GLJO 2Q31A 1BUPA 3DXMA 3QDKA 1Y64A 4GNIA 3L0QA 1NGCA 3MN6A 5AQGA 4CD1A 5CE3A 2P9SB 3UB5A 4RWTA 4BGBA 3VENA 5AQHA 1QQNA 3DXKA 1KAZA 3P4IA 5AZIB 3WXKA 1SAZA 4BRMA 3SMPA 3LDPA 1NBWA 1QZ6A 4BQLA 5AQFA 4BRKA 5EX5A 4PKGA 4FWSA 2E88A 5FPMA 1NGJA 4RCHA 3ZX2A 2F9WA 1QHAA 2OANA 1S3XA 4H03B 5KQ8A 5EOYA 3DXKB 4BRIA 2V51B 1BOTO 3O1BA 3FZLA 4E1JA 3SLCA 3DXMB 2IIRA 5AQNA 2Q36A 3ID8A 4CJ7A 3OHRA 3IDHA 4EHUA 3QMLA 3A5MC 3O8MA 1ZC6A 2PAVA 1ATSA 3O08A 1LOTB 3W0LA 1YVNA 5AZIA 1T6CA 2A6AA 4L3QA 2QWPA 1V4TA 3FE1A 3B8AX 2FXUA 1U6ZA 3O5BA 2Q97A 2D4WA 2GWKA 3DWLA 5AZJB 3ULEA 1E4FT 4K25A 3EO3A 3FZMA 5EVZA 2QM1A 3JXUA 5JLFA 5JMVA 2GWJA 3AARA 3BP8A 4CBWA 2FSNA 2ZWHA 3I8BA 4DQ8A 4BR2A 3GL1A 4PL8A 5AFUA 5BPLA 1NGGA 5LJVA 3FLCO 3BUZB 1BO5O 3EKUA 3VGMA 4BRLA 2P9IA 4BROA 2CGLA 4FPAA 3VF4A 2ZF5O 1XUPO 4H0YB 5AQVA 4MO4A 4NB4A 3S41A 4FWKA 1Z6RA 2W41A 3U4LA 3FZKA 4FL9A 3H45C 3BF1A 1NMDA 5AQXA 4ISGA 1LCUA 3QB0A 1YAGA 1K8KB 4I6MA 1D4XA 5JLHA 3LDOA 3GG4A 2CGJA 2CGKA 3CETA 4FWRA 4EHTA 3F9MA 5AZJA 3EZWA 1X9JA 3HTVA 4EAHD 5AQLA 2P9KA 1RFQA 2ASOA 2WUSA 4RTFD 4A62A 3VEWA 4HWIA 4KBOA 1WOQA 4JD2B 3VEYA 4BRGA 2H3GX 1EQYA 1S22A 1XQSC 4HTLA 3CERA 5BR9A 3UKRA 1G99A 3O6WA 5LJWA 4BRQA 3CJAA 4CBXA 5F0XA 4B1YB 1GLDG 3MMVA 4IWVA 2P9UB 1H1VA 5B8HA 1BG3A 4A61A 1MWKA 1C0GA 3MDQA 3VPZA 4BR5A 2ASPA 4FOEA 4H0XB 3WEEB 3MN9A 4FWOA 1NGEA 2QWOA 2Q0RA 5KQDA 2NLXA 4MO5A 3H6EA 3UKRB 3WXJA 2CH6A 3R8EA 4JNEA 3UKUB 1MWMA 3CJBA 4YDUC 4DB3A 1HPMA 5AQYA 4FWLA 4AM7A 4FPBA 1RDWX 3J8AA 5ELZA 3ULEB 3DAWA 2A41A 4K42A 4IXCA 5AQRA 5BPNA 1BA1A 4DCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC4N 1JLBA 2KJAA 3E9LA 1YITN 3F73A 4B9NA 3V1OA 1WSIA 4BC3A 3ATUA 1VHXA 3A5OC 2RF2A 1KV0A 4B1UB 5BPMA 3DRRA 2KSKA 3RMCA 4CF1A 2YHWA 5KPTA 3HVRA 1C1AA 5F1XA 2ZGZA 4ELUA 2OCEA 3DI6A 1TAQA 1ZUTA 2YIOA 3V9SA 2P9IB 2P9PB 4C8OA 1WB9A 4IG3A 2YIPA 1VQON 1T05A 5AQZA 3D7EO 2QWQA 1HNWK 2W00A 1JCFA 1XNRK 3A8YA 4IDKA 3TU5A 1SV5A 1QQOA 2ZJQL 3V9XA 2QKKA 1SN1A 5KTQA 2KFZA 1Q9YA 1YF5L 2FC0A 1OH7A 1P0AA 4GV6A 3C0BA 2FSKA 1W7AA 4Y0WA 3R2VA 3VEZA 4JKGA 2Q0UA 2Q3SA 4FJMA 2LJ7A 3LZIA 2W6LA 4YOUA 4FW2A 3G4SN 4BRCA 3QEIA 1VQ4N 1IKVA 1KC8O 4WQ4C 3R9PA 1SKRA 1ZXOA 1SZ2A 1X9WA 3SQ1A 2Z1HA 1LAVA 4FJNA 3WEEA 3DJCA 2JDQD 1TUUA 1OMYA 4CHYA 1VNAA 4FK2A 3G6EN 2ATBA 1L3UA 2QW9A 4V19S 4KTWA 4FWNA 4U67L 1NRBA 4Z4IA 3VGKA 4JI4K 2N66A 2YJEA 2YHBA 4FVMA 4BC4A 4W5TA 4GVMA 4LFAK 3AVKA 1E3MA 4DR3K 2AP1A 3U9ZA 3KZBA 3TI0A 2D0OA 1R59O 1GPSA 4BRNA 3ENOA 3TAEA 1CXQA 1HLUA 4DFJA 4FLXA 3SQ4A 1JKHA 2I5JA 3C6AA 4N5SA 2N69A 1F21A 2FBTA 2Q1NA 3O4QA 2QXFA 3AV9A 2YCHA 3ZT3A 1KVCA 3OYFA 3NVKA 2XY5A 2LJMA 4LH5A 1D9DA 4IOXA 3LM9A 4CERA 4DTNA 1L4VA 4NCAA 4MLEA 1HKGA 1RCHA 4JK7A 4XJXA 5AQTA 2QI2A 4JI5K 2HBLA 1WT7A 4FSVA 3EL2A 4CJPA 1BDGA 5LMUK 3KD5E 5AQKA 1IH7A 3O3FA 1UGLA 5M1OA 3PIPL 3SUPA 3E7RL 2P9UA 2XY6A 4BGAA 1ASWA 3HL8A 3MXMA 1TI5A 4DQPA 4DR7K 1NWKA 3R1XA 4HUEA 2NY8X 4YOVA 4F9OA 4CEAA 5HL7L 1KTQA 5K14A 4KV8A 4BR4A 5AR0A 2DPNA 1VSEA 3VTIA 4KB1A 1BU6O 1BCMA 4DV2K 1P00A 3LALA 2OPPA 3O1WA 3KWGA 1HUXA 3QBXA 4DG1A 2HF3A 1Q18A 2FLOA 2YBRC 5KPZA 4N47A 5LMNK 2O8FA 4CEBA 3ENHA 3NDKA 4ZTFA 4GV3A 3P1GA 4CGIA 3HPHA 2VGNA 3ZT0A 1W9HA 1ZBFA 1QQCA 2PFUA 4CD3A 3M8RA 3ZT1A 1RILA 2YJFA 4ID1A 4H5WA 4KTZA 3THVA 5AQOA 2NNWA 1K73O 2QKBA 3P38A 3CW4A 2W42A 2PZSA 4DF4A 3DLHA 4CZLA 2SN3A 4R79A 3KLHA 3BGRA 3DOLA 5CY0A 1T8EA 4M3XA 4CF9A 5I3UA 3RMAA 4C8NA 4DWIA 1RT6A 3PY8A 3THXA 5CZ2A 4JRQA 2DY4A 5AQJA 4B08A 4BC2A 2GELA 3A5LC 5J1EA 4FLZA 4IOCL 2PBDA 3JAMO 3LANA 4PL7A 1GLAG 4DFMA 1Q81O 2R7YA 4FLUA 5HP1A 4M7YA 1BIZA 3OYNA 3V9WA 1WSJA 1Z05A 2BE2A 1S1XA 4OGEA 5I9EB 4F2SA 4FOIA 4K43A 1C0UA 2E2QA 2RN2A 1U48A 2QK9A 2YHXA 3RWUA 1JKZA 5TKYA 3VOVA 3A2FA 5CHIA 1JLFA 1KFDA 1NMNA 1NJZA 3CI5A 3H3NO 5BRHA 3AA2A 5BRFA 1SL0A 3BEXA 2X74A 4IZ9A 2LY5A 1NGBA 3A5NC 1NNEA 3QERA 4H5RA 1LAWA 4QS7A 3ZEUB 1WUAA 3O9SA 1S1TA 2PY5A 3N4QA 5EY4A 4FJ8A 1L3TA 1XC9A 2D0CA 2Z1IA 1TKZA 3NAEA 4CJSA 1NK6A 5C24A 1J5OA 4DU3A 4HHFA 1BA0A 1XMQK 4FZZA 3SAGA 2GEMA 3BZCA 1MR4A 3QETA 1WSHA 3ENBA 4RW8A 3CJ7A 2P1JA 2HHHK 4IG0A 2IAJA 3UIQA 1IBLK 4AHSA 3V81A 4U7BA 4RWTA 4O4GA 1QQNA 3DXKA 4B9TA 5M1KA 5HROA 2LN8A 3E01A 3LDPA 4CGFA 1QZ6A 3TR8A 1NE5A 4JKFA 3KIOA 1VQLN 1RTIA 3GKUA 4GKJK 5JVHL 4BE1A 4DSIA 5FPMA 3WNGA 3CCQN 4G1QA 4RCHA 3RRGA 4DSLA 2HMIA 4LSLA 4E7HA 4H03B 2B68A 1D5AA 3DXKB 4BRIA 2WOMA 3L3UA 1T7AA 3V1RA 3VQDA 3J7YP 3SLCA 2NRRA 3DXMB 2IIRA 5AQNA 2Q36A 3ID8A 3VQ5A 4I2QA 2XO7A 4CF0A 2G2KA 3SAHA 4BDPA 4M3UA 3QMLA 3TAPA 3AVFA 2PAVA 2KBKA 3O08A 1LOTB 4CJ3A 3OYMA 1DLOA 2XY8A 3CFPA 1U47A 4EZ6A 3NH2A 4CGGA 3OS2A 1V4TA 3FE1A 3B8AX 4FJ9A 1YJNN 1OH5A 2ZJPL 1TKXA 3O5BA 5FROA 2GWKA 1EP4A 2HSTA 4CW7B 3ULEA 5EVZA 2QM1A 3AO1A 1SNBA 1REVA 2FBXA 5JMVA 3C94A 3AARA 4JV5K 2FSNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CC4 N;  1JLB A;  2KJA A;  3E9L A;  1YIT N;  3F73 A;  4B9N A;  3V1O A;  1WSI A;  4BC3 A;  3ATU A;  1VHX A;  3A5O C;  2RF2 A;  1KV0 A;  4B1U B;  5BPM A;  3DRR A;  2KSK A;  3RMC A;  4CF1 A;  2YHW A;  5KPT A;  3HVR A;  1C1A A;  5F1X A;  2ZGZ A;  4ELU A;  2OCE A;  3DI6 A;  1TAQ A;  1ZUT A;  2YIO A;  3V9S A;  2P9I B;  2P9P B;  4C8O A;  1WB9 A;  4IG3 A;  2YIP A;  1VQO N;  1T05 A;  5AQZ A;  3D7E O;  2QWQ A;  1HNW K;  2W00 A;  1JCF A;  1XNR K;  3A8Y A;  4IDK A;  3TU5 A;  1SV5 A;  1QQO A;  2ZJQ L;  3V9X A;  2QKK A;  1SN1 A;  5KTQ A;  2KFZ A;  1Q9Y A;  1YF5 L;  2FC0 A;  1OH7 A;  1P0A A;  4GV6 A;  3C0B A;  2FSK A;  1W7A A;  4Y0W A;  3R2V A;  3VEZ A;  4JKG A;  2Q0U A;  2Q3S A;  4FJM A;  2LJ7 A;  3LZI A;  2W6L A;  4YOU A;  4FW2 A;  3G4S N;  4BRC A;  3QEI A;  1VQ4 N;  1IKV A;  1KC8 O;  4WQ4 C;  3R9P A;  1SKR A;  1ZXO A;  1SZ2 A;  1X9W A;  3SQ1 A;  2Z1H A;  1LAV A;  4FJN A;  3WEE A;  3DJC A;  2JDQ D;  1TUU A;  1OMY A;  4CHY A;  1VNA A;  4FK2 A;  3G6E N;  2ATB A;  1L3U A;  2QW9 A;  4V19 S;  4KTW A;  4FWN A; 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