5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
2D0OA 5AQHA 3O8MA 4B1XB 1R59O 5AQSA 4O5FA 3LDNA 3H1QA 4FPBA 4AM7A 3CJ7A 4PKHA 4BRLA 3QBWA 2FXUA 2QW9A 1GLBG 3FZLA 3C0BA 4H0YB 1U6ZA 1HKGA 4CZGA 3FFKB 4XH5A 2F9WA 3EN9A 4JD2B 2I7NA 1U2VA 5KQ8A 3MN9A 1HJOA 2QWRA 4BRNA 2V7ZA 5JLHA 5AQXA 4BRMA 3M1FA 4BRQA 1K8KB 2A3ZA 2ZWHA 5AZJA 4XH1A 3EL2A 4J8FA 5BRDA 5AQQA 3M3ZA 4M7YA 4EHUA 3ZEUB 3ENHA 4EHTA 3GOIA 4BGAA 2V51B 3SMSA 4O8KA 1YUWA 3A5MC 4YDUA 3VGMA 3AAQA 1QZ5A 5AQPA 1T6DA 3GG4A 4BRPA 3WUHA 3AARA 2GWJA 4CBXA 3C7NB 4BQZA 4H0OA 3G25A 3QB0A 4JNEA 5FPNA 4FWRA 2IVOA 2FSKA 3DXMA 4BREA 3UKUA 4IWVA 2YHXA 3BF3A 3VPZA 3DAWA 1TUYA 2J4RA 1G99A 5AQYA 3ZX0A 2P9LB 4K42A 4M63C 1BDGA 3A8YA 4JN4A 5EOYA 5AZIA 1GLFO 5AQIA 2NZTA 3BP8A 1RFQA 3M6GA 3VEOA 2P9NA 4IJNA 4B1YB 3AAPA 3VF2A 5AZIB 2HF4A 4MO5A 2FSJA 3CQYA 1QZ6A 3A5LC 3GE1A 3D2EA 4K25A 3H6EA 3MMVA 3GDQA 3GBTA 3MN7A 2F9TA 3HZ6A 3ATUA 1YAGA 5AQFA 4GY2B 3A5OC 3UKUB 2HOEA 4CZKA 3SJHA 1OKJA 3ULEA 1H1VA 2E1YA 4H0VB 4RTFD 2QWMA 3MK6A 4QS9A 4BR7A 3MCPA 2ASPA 2ZF5O 1KAXA 2CGKA 1DGKN 2E2PA 4CZFA 3EZWA 4H5RA 4BGBA 4RWTA 4CI6A 5AQNA 2E8AA 1SZ2A 1V4SA 1NWKA 1NGJA 3LM2A 3EKSA 4FWLA 4ISGA 3VERA 1YVNA 4BC2A 1JCEA 2NLXA 1RGIA 2E20A 3IUCA 2IVPA 2Q0UA 1NGCA 3MN6A 3CJCA 4BR0A 3LM9A 1QQOA 3O1WA 4HWIA 1HKCA 1LCUA 2QWPA 3H46O 5F1XA 4DB3A 2AA4A 2GWKA 3CERA 3I33A 3CJAA 4PL8A 3H3NO 3CI5A 4BQLA 5BPLA 3EO3A 3AY9A 4KBOA 1LOTB 1Y64A 3QDKA 3SK3A 3SLCA 4BC4A 4NO7A 3D2EB 3LDLA 3DJCA 4IJAA 3KHYA 3H45C 2VYPA 2VCPA 1XQSC 1GLCG 4DHYA 4QS8A 2AP1A 4CD3A 2HF3A 3VETA 5BPNA 3JXUA 1Z05A 3ZETA 3H3OB 4A2BA 1BA0A 3D2FA 2DPNA 3VEYA 4CZEA 1WOQA 2P9SA 4BRCA 1HLUA 1YXQA 4FPAA 3U9ZA 3VF6A 2QWOA 3A5NC 3MDQA 3DXKB 4I6MA 4CZHA 3CHWA 3VENA 2A5XA 2GTDA 3O08A 1NGBA 2E2NA 4B1VA 4K43A 5KPTA 5ADXA 3CQXA 4EFHA 4PKGA 1BUPA 3ENOA 2A41A 2Q1NA 3C7NA 3IMXA 4FWOA 1CZAN 4BRDA 3FZFA 1S3XA 3ZX3A 2Q97A 3WQUA 4FWPA 2P9UA 4BRHA 4E1JA 3I8BA 5KPZA 3S41A 2P9UB 5B8HA 5BRFA 1BG3A 4FWMA 3LDOA 3WEEB 3HBTA 3R6MA 5LJVA 3P4IA 2NRHA 3H1VX 3DWLA 4IO8A 5BPMA 3RSEA 4H0XB 3L0QA 3U8XA 5FPDA 1ZC6A 3FLCO 5JLFA 4BG9A 4I6MB 5KPRA 5JICA 4FOEA 4GNIA 2FF3B 1JCFA 4F9OA 4CBUA 2ZGYA 4DCHA 2QM1A 4JHDA 5ELZA 4DQ8A 1NGHA 3VEXA 3ZETB 4BC3A 1GLJO 2YJFA 4IZ9A 3QFUA 4BR9A 3O5BA 2ASOA 4K41A 4BR4A 3LDQA 4MLHA 4AM6A 2E2QA 3MN5A 4H0PA 5I9EB 5AQKA 5AFUA 4WYBA 4H0TB 1X9JA 2UYTA 3UKRB 4FWKA 4BRIA 1NGEA 2D1KA 3HM8A 5BN8A 1Q18A 3IFRA 4YDUC 4PKIA 4Y0WA 3WXIA 2E1ZA 1E4FT 2KHOA 1T44A 3RSEB 2QXLA 4B1WB 4NB4A 5AQRA 3ID8A 1V4TA 1QHAA 2GELA 2Q2RA 3QBXA 3QICA 3FZKA 5CE3A 5JMVA 1KAYA 5BN9A 3WEEA 1ATNA 5EXWA 3UB5A 4BVOA 4CZMA 2BUPA 5AQOA 2IIRA 1X3MA 3FZHA 1TUUA 4H5NA 2ITMA 3R8EA 1NGDA 1ATSA 5EVZA 2VWBA 3HSCA 4EAHD 2IVNA 4WQ5A 4FL9A 3QMLA 5E84A 2A6AA 1NMDA 1RDWX 3VEZA 1NGGA 2P9IA 1E4GT 1ESVA 3ULEB 5LJWA 3D7EO 5EX5A 4XEIA 4BG8A 1ZBSA 4B9QA 4JAXA 3WXLA 4Z94A 2YI1A 1KXPA 4H03B 1NLVA 5LY3A 1BOTO 4BRGA 1S22A 2P9PB 4B1UB 3VGKA 2HMPA 1ZXOA 1SQKA 3FR0A 4FWQA 4A61A 2D4WA 3R9PA 1NGAA 1BO5O 2CH6A 2E88A 4H5VA 3L6QA 1WUAA 4RCHA 3CJBA 3IDHA 4A2AA 3L4IA 4B1ZA 4BR5A 5ADXH 3CIPA 2P9LA 5F0XA 3U4LA 3WXKA 2BTFA 2QWQA 5FPMA 3TPQA 4BC5A 3CJ9A 3W3DA 1GLDG 1MDUB 3TU5A 3FZMA 4HTLA 3VF4A 1HPMA 5EY4A 1QQNA 3LL3A 1ATRA 2CH5A 2YCHA 1C0GA 2I7PA 5BRHA 1HUXA 4M7XA 2Q31A 3VESA 4FOIA 2ASMA 1NGFA 2A42A 1DEJA 1GLEG 5AQVA 3O80A 5AR0A 3WQTA 2CGLA 3HI0A 4L3QA 3ZEUA 3W0LA 4C23A 1J6ZA 1HKBA 3CJ1A 2FF6A 5BR9A 4IXCA 1DKGD 3F9MA 4JHDB 3KVGA 4CZIA 5AQMA 4MO4A 1GLLO 1NM1A 3O6WA 5AQUA 1JCGA 2Q0RA 2P9PA 4FSVA 2FSNA 5AQWA 3KZBA 5E26A 2GEMA 2WUSA 1EQYA 2D0PA 3LDPA 1QQMA 1Z6RA 4BRKA 4QS7A 2EWSA 3FE1A 4LC9B 1XC3A 2YHYA 3BUZB 2W40A 3JS6A 1BWFO 3QFPA 2P9IB 4FWNA 1HX1A 3J8AA 4CZLA 5AQGA 4PL7A 4EIAA 5KQDA 1GLAG 3A0IX 3WT0A 4CBWA 2H3GX 1P8ZA 1MWKA 2P9KB 3BEXA 5FPEA 2Q36A 3FGUA 3VEVA 5AQTA 2A40A 2PAVA 4ISEA 2P9NB 1IJJA 2W41A 3U9DA 4CJ7A 5BREA 3CETA 4CZJA 5AQZA 2V7YA 2E2OA 4A62A 3WXJA 4WQ5C 1XUPO 3VOVA 3ATVA 4ISFA 1MWMA 1NBWA 4JD2A 1D4XA 1TYQA 3GL1A 4BROA 4CD1A 3DXMB 4WQ4A 1SAZA 3BF1A 1X3NA 1TYQB 3O4WA 3DXKA 1NGIA 4FO0A 3UE5A 3UKRA 5F2RA 2ZGZA 1MA9B 2P9SB 2YJEA 2GUPA 4WQ4C 3VEWA 3ZX2A 3VGLA 3D2FB 5AQJA 3B8AX 2CGJA 4XH4A 5TKYA 1BA1A 5AQLA 1BU6O 2PBDA 4BRFA 4H5WA 2QWNA 5AZJB 3SMPA 1T6CA 1K8KA 2OANA 2V52B 3HTVA 4BR2A 4FWSA 2P9KA 2YHWA 4BVPA 4MLEA 5AFUH 2FLOA 2QWLA 1IG8A 1KAZA 3O1BA 3EKUA 1U2VB 3OHRA 4BRAA 4H5TA 1C0FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF7A 3ZT1A 1R59O 1C0UA 2YNGA 5J2QA 3AO1A 2UXDK 2LN8A 4FPBA 4AM7A 1S72N 3C6AA 3OYEA 4PKHA 2QW9A 1GLBG 4H0YB 1HKGA 4DF8A 3FFKB 3TWHA 3VA3A 3EN9A 2GUIA 4AHRA 3OYJA 4M42A 5KQ8A 3SQ0A 3DM2A 3O3GA 4BE0A 4BRMA 3M1FA 1K8KB 4BE7B 3LZIA 2A3ZA 5AZJA 4J8FA 1XNQK 3M3ZA 3O3HA 1U04A 3PO4A 3I8DA 4CFAA 1S1VA 4O8KA 3A5MC 4YDUA 4DU1A 2UUBK 3OYLA 5AQPA 3GG4A 1YITN 1A5WA 3MECA 3AARA 3AVFA 3QB0A 3QEPA 3KLHA 5FPNA 1VNAA 4FWRA 2Z1JA 1RNHA 1X1PA 4GVMA 3C95A 2YHXA 3Q7CA 3SV3A 3G4SN 1TUYA 2DFHA 4FLTA 5JVGL 3SBTA 3DOKA 2DFFA 4K42A 1BDGA 3A8YA 2GMOA 4JN4A 5KI6A 4JS4A 4B9UA 3HK2A 5AQIA 2NZTA 4CGGA 3BP8A 2P9NA 1W9HA 3HVRA 4Z4EA 1QSLA 1IH7A 3WNGA 5CR4A 2UUCK 4IOCL 3SUNA 2A1SA 3MMVA 2F9TA 4R79A 2W6KA 4NXNK 3VTIA 5AQFA 4OPJA 1S5JA 3ZT0A 5AJ3K 3LP0A 3O9TA 4RTFD 4E7HA 2QWMA 4NCBA 3ALYA 3TI0A 4QAGA 3MK6A 2AJQA 3ENBA 3AVNA 3KD5E 2ASPA 3T3FA 3TTDA 3HJFA 2KBKA 4CZFA 3KHWA 4CF9A 1VQ4N 2Q3SA 4E72A 2N2RA 4ISGA 3E66A 4CEAA 1RGIA 2E20A 1JLFA 1SUQA 4OGEA 4HTUA 3M5RA 1U47A 4PY5A 2VWKA 1QQOA 1NK7A 4HVJA 3OJUA 4E7JA 1TI5A 3SNNA 2D0AA 2GWKA 3CERA 2ZQBA 3CJAA 4PL8A 3H3NO 4HUGA 1T7EA 3KK3A 3EO3A 2HHSA 5KTQA 3QDKA 3RR8A 2P51A 3SPYA 4BECA 3D2EB 3LDLA 1VQ9N 4KAZA 1N36K 3ZCMA 3O4NA 2VCPA 2FC0A 1XQSC 3AVIA 4CJWA 3PIPL 1OVYA 4KH4A 3K0SA 2G8VA 2KLAA 1WSFA 4KV8A 1T03A 3NFAA 4B9SA 4DFJA 2E3GA 1D9DA 1KCFA 2G8KA 4B3SK 4ELVA 1NK9A 2IOCA 4CCHA 3THYB 2Y1IA 1SN4A 5HLFA 3I55N 1IG9A 3V9ZA 1NRBA 2E2NA 4B1VA 1BCGA 1XWLA 3WNEA 3CQXA 3Q7BA 4EFHA 3U6FA 3C7NA 1CZAN 5IWAK 1ZVEA 4BRDA 2JDQD 3ZX3A 3QEWA 2HSTA 2Q97A 1JKHA 3WQUA 4FWPA 3TSQA 4FJHA 4N56A 1SV5A 3LAMA 3VQ6A 4E7IA 3BZCA 1N32K 2OPQA 3PIOL 4JRPA 3WEEB 1NG9A 2HBLA 3R6MA 2BGGA 1Q81O 1VHXA 4BEBA 2NRHA 4HUFA 1UWBA 3H1VX 2LT8A 3NGYA 1WLJA 3DWLA 1PE4A 4CK1A 1MR4A 3RSEA 1JL2A 3HO1A 3FFIA 1TKXA 4RW9A 3EY1A 1IKWA 3TAMA 5JLFA 3FLCO 1IV0A 2VQFK 1OH6A 2HVHA 1JCFA 3THXB 3KOZA 1RBVA 4CBUA 1Y97A 3SQ1A 4Z4CA 3L8BA 4DCHA 4HCBA 3VEXA 2RN2A 4KTWA 3EZ5A 1GLJO 1KQSM 2FBTA 1BIUA 3HVTA 3RVCA 2YIPA 1B92A 2EHGA 3MEEA 4CJ5A 4AHVA 1XNRK 4Z4FA 4CK2A 4Q0BA 1YVUA 4UJ0A 4LH5A 5AFUA 3P38A 2UYTA 5CZ1A 4FWKA 4B9VA 3G71N 3ZSQA 3IFRA 4BDYA 4DR7K 4Y0WA 3DMJA 2B6AA 3IKMA 1E4FT 2KHOA 3WXIA 1T44A 4HUEA 4WFBL 5AQRA 3SF4D 1WBBA 3TARA 2PZSA 1V4TA 4Y1CA 4AHTA 5HOOA 1RBUA 3AGKA 5DMRA 2YKMA 5KRSA 2VQEK 1TV6A 3AVGA 4G1QA 3R8EA 3TAPA 3K2PA 1VQLN 1T0ZA 1BQNA 1KVCA 4RW7A 1ASVA 1RDWX 2ZE2A 3N4QA 5HRRA 4LSLA 3IAYA 1ESVA 3AO5A 3HP9A 2ASCA 3AVKA 3D7EO 1EXQA 3PY8A 1YJNN 2ZD1A 3WXLA 2YI1A 4BDPA 1KXPA 4E3SA 4H03B 1NLVA 3OW2M 3OS1A 3THYA 5M1KA 3VGKA 4I7FA 3SAHA 3FR0A 3DLBA 2D4WA 3R9PA 2E88A 4H5VA 3L6QA 4A2AA 2G8IA 5C2FA 2P9LA 4CHOA 5F0XA 3WXKA 2QWQA 2PFUA 4AF1A 3HT3A 4BC5A 4B9LA 3CYGA 2GV9A 3W3DA 3GKUA 4GKKK 4Q5VA 1GOCA 4FM2A 1U45A 4J2BA 4F3OA 2I61A 1ATRA 1RT1A 1VRUA 1D5AA 2YCHA 1TAQA 3VTHA 3T69A 4JK7A 5I42A 4HCCA 2A42A 2ETJA 5AQVA 3SI6A 1HYZA 1A5VA 4OLBA 2FF6A 3PSIA 1L3UA 1LQQA 4IXCA 1DKGD 1RBTA 4ELTA 2QEXN 3AA4A 1GLLO 5AQUA 4BWMA 4CVNE 4OPAA 2P9PA 1J9AA 5E26A 3KZBA 4RG8A 2WUSA 3KIOA 3EEQA 4CEZA 1YJ9N 1Z6RA 3NDKA 4JKCA 1B7DA 2OZSA 5KGWA 3E7RL 3AV9A 4GMJB 4KHYA 3U3GA 4PA1A 3ZT2A 2W40A 3QFPA 2HVIA 1CZ9A 3J8AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3FE1 A;  4LC9 B;  1XC3 A;  2YHY A;  3BUZ B;  2W40 A;  3JS6 A;  1BWF O;  3QFP A;  2P9I B;  4FWN A;  1HX1 A;  3J8A A;  4CZL A;  5AQG A;  4PL7 A;  4EIA A;  5KQD A;  1GLA G;  3A0I X;  3WT0 A;  4CBW A;  2H3G X;  1P8Z A;  1MWK A;  2P9K B;  3BEX A;  5FPE A;  2Q36 A;  3FGU A;  3VEV A;  5AQT A;  2A40 A;  2PAV A;  4ISE A;  2P9N B;  1IJJ A;  2W41 A;  3U9D A;  4CJ7 A;  5BRE A;  3CET A;  4CZJ A;  5AQZ A;  2V7Y A;  2E2O A;  4A62 A;  3WXJ A;  4WQ5 C;  1XUP O;  3VOV A;  3ATV A;  4ISF A;  1MWM A;  1NBW A;  4JD2 A;  1D4X A;  1TYQ A;  3GL1 A;  4BRO A;  4CD1 A;  3DXM B;  4WQ4 A;  1SAZ A;  3BF1 A;  1X3N A;  1TYQ B;  3O4W A;  3DXK A;  1NGI A;  4FO0 A;  3UE5 A;  3UKR A;  5F2R A;  2ZGZ A;  1MA9 B;  2P9S B;  2YJE A;  2GUP A;  4WQ4 C;  3VEW A;  3ZX2 A;  3VGL A;  3D2F B;  5AQJ A;  3B8A X;  2CGJ A;  4XH4 A;  5TKY A;  1BA1 A;  5AQL A;  1BU6 O;  2PBD A;  4BRF A;  4H5W A;  2QWN A;  5AZJ B;  3SMP A;  1T6C A;  1K8K A;  2OAN A;  2V52 B;  3HTV A;  4BR2 A;  4FWS A;  2P9K A;  2YHW A;  4BVP A;  4MLE A;  5AFU H;  2FLO A;  2QWL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NF7 A;  3ZT1 A;  1R59 O;  1C0U A;  2YNG A;  5J2Q A;  3AO1 A;  2UXD K;  2LN8 A;  4FPB A;  4AM7 A;  1S72 N;  3C6A A;  3OYE A;  4PKH A;  2QW9 A;  1GLB G;  4H0Y B;  1HKG A;  4DF8 A;  3FFK B;  3TWH A;  3VA3 A;  3EN9 A;  2GUI A;  4AHR A;  3OYJ A;  4M42 A;  5KQ8 A;  3SQ0 A;  3DM2 A;  3O3G A;  4BE0 A;  4BRM A;  3M1F A;  1K8K B;  4BE7 B;  3LZI A;  2A3Z A;  5AZJ A;  4J8F A;  1XNQ K;  3M3Z A;  3O3H A;  1U04 A;  3PO4 A;  3I8D A;  4CFA A;  1S1V A;  4O8K A;  3A5M C;  4YDU A;  4DU1 A;  2UUB K;  3OYL A;  5AQP A;  3GG4 A;  1YIT N;  1A5W A;  3MEC A;  3AAR A;  3AVF A;  3QB0 A;  3QEP A;  3KLH A;  5FPN A;  1VNA A;  4FWR A;  2Z1J A;  1RNH A;  1X1P A;  4GVM A;  3C95 A;  2YHX A;  3Q7C A;  3SV3 A;  3G4S N;  1TUY A;  2DFH A;  4FLT A;  5JVG L;  3SBT A;  3DOK A;  2DFF A;  4K42 A;  1BDG A;  3A8Y A;  2GMO A;  4JN4 A;  5KI6 A;  4JS4 A;  4B9U A;  3HK2 A;  5AQI A;  2NZT A;  4CGG A;  3BP8 A;  2P9N A;  1W9H A;  3HVR A;  4Z4E A;  1QSL A;  1IH7 A;  3WNG A;  5CR4 A;  2UUC K;  4IOC L;  3SUN A;  2A1S A;  3MMV A;  2F9T A;  4R79 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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