5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
3D2EA 1U2VA 2ZWHA 2P9UB 3M1FA 3BP8A 3JS6A 4RCHA 2YHYA 5AFUA 3D7EO 5CE3A 1KAZA 4BROA 3P4IA 4CBXA 3GL1A 5FPMA 4WQ5C 1V4TA 4QS9A 4BVOA 4MO4A 2P9PB 4CD3A 1DGKN 2IVOA 1NWKA 1HKCA 4BG9A 5AZJA 5JLFA 5AQJA 3QB0A 3ZETB 1NGDA 1HJOA 3BUZB 2YJFA 2P9NB 3BEXA 1YAGA 2A5XA 1GLCG 4RTFD 2FSKA 4CZIA 3I33A 3HBTA 5AZIA 3U4LA 2E2PA 2I7NA 3BF3A 3VENA 1QQOA 3QFPA 2NLXA 4PL7A 3CQYA 2CH5A 3H3OB 5AQRA 3DXKA 1NBWA 1DEJA 3QBXA 4FWPA 4Y0WA 4EHTA 2UYTA 2AP1A 5BRFA 2A42A 3WQTA 1MA9B 3A5LC 4M7YA 3MK6A 2P9IB 5ELZA 4BGBA 1P8ZA 4FWQA 4IZ9A 2CGKA 3VF6A 5FPDA 5F2RA 1GLLO 4BC2A 3O80A 4BR4A 1TUYA 2H3GX 5LJVA 3GBTA 4CI6A 3U9DA 2QXLA 5BPLA 5EVZA 1Y64A 3UKUA 4WQ5A 2FSJA 4ISFA 4BR0A 3U9ZA 2QWNA 3DXMA 3R9PA 1Z6RA 4F9OA 4JD2A 2QWPA 5B8HA 4H03B 1NGGA 4FL9A 1NGAA 1NGFA 1RGIA 4FSVA 3WT0A 3GE1A 2ZGYA 3FFKB 4BGAA 2ITMA 2QWMA 4EFHA 4BREA 1Z05A 4IO8A 4H0VB 5AQUA 2D1KA 1E4GT 2V52B 3LL3A 1HKBA 4M63C 2YCHA 3C7NB 3CJCA 4EAHD 5KQ8A 1BA1A 3ULEA 2A41A 3H1QA 3UKRB 4JHDA 2QWLA 3EKSA 4FWOA 2ASMA 1BUPA 5AQIA 4BRGA 4CZEA 2F9TA 4A2AA 3A5OC 3IFRA 3O4WA 3FZMA 4BR5A 5AQPA 3VETA 1QHAA 4MO5A 5KPTA 2P9KA 4CJ7A 3ID8A 3SLCA 3CHWA 3RSEA 5AQZA 3WXJA 1SAZA 3ATVA 1SQKA 5AQTA 2FLOA 4DQ8A 2W41A 5LY3A 2EWSA 5EY4A 3O1WA 2P9PA 1ZC6A 3CJ1A 1ATSA 1XUPO 5JMVA 2KHOA 3ZEUB 3CETA 3WUHA 3CIPA 5AQNA 5BN9A 3IUCA 3U8XA 3A5MC 3M3ZA 4BVPA 3O5BA 4CBWA 3EKUA 2HMPA 4ISGA 4H5TA 2BTFA 2ASOA 4PKIA 4M7XA 5EOYA 1X3MA 3HSCA 1GLEG 5KQDA 4BR2A 4DB3A 2HF3A 1S3XA 1HPMA 4H5NA 5BRDA 3W3DA 3WEEB 4IXCA 4XH4A 3DAWA 2CH6A 2E1YA 1HLUA 1KAXA 4WYBA 2IVNA 5E84A 4IWVA 1NGJA 1BOTO 1ATNA 2NRHA 2P9SA 3VGLA 1SZ2A 1QZ6A 5FPEA 2DPNA 4NO7A 3AAPA 3WXKA 1XQSC 4B1VA 4FOEA 4JNEA 3GG4A 1LOTB 4B9QA 4WQ4C 2V7ZA 4I6MB 1QQMA 1IG8A 5AQVA 1GLDG 4BC4A 2QWOA 4CZGA 4FWNA 3LDLA 2OANA 4AM6A 2A3ZA 3D2EB 4BQLA 4CBUA 1U2VB 4FWKA 3H45C 3VEWA 3GOIA 5FPNA 4HTLA 3QMLA 3FZFA 5AQMA 5JICA 1TUUA 1ATRA 2V51B 1ZXOA 2P9LB 2E1ZA 2FSNA 4GNIA 2YI1A 2CGLA 3VERA 4Z94A 5JLHA 3ZX3A 1JCEA 4E1JA 2HF4A 4BRAA 3O08A 4H5WA 1TYQA 2GWKA 3ENHA 3O6WA 4EHUA 4AM7A 4K41A 5BREA 4MLHA 4H0XB 4FWRA 4BRIA 3ZX0A 1BG3A 1S22A 1IJJA 3AY9A 3C7NA 3QBWA 4O8KA 2QW9A 2D0PA 3CQXA 3D2FA 1NMDA 3MMVA 4XEIA 3VEZA 3FR0A 3UKRA 4J8FA 4BRLA 4CZMA 2Q36A 1E4FT 1K8KA 2ZGZA 5BPNA 2E8AA 2BUPA 3ZX2A 1Q18A 5AZIB 3L4IA 1BO5O 4H0OA 4K43A 1T6DA 4BC5A 3KHYA 5ADXH 5LJWA 3MN5A 1BDGA 3AAQA 3HI0A 4H0YB 3M6GA 3A8YA 3J8AA 1OKJA 3DXKB 3WXIA 2FXUA 1X9JA 3EN9A 2VWBA 5BRHA 5BPMA 2QM1A 3VF4A 3EZWA 4DHYA 4NB4A 5F1XA 3F9MA 1GLAG 1BU6O 3ZEUA 3CJBA 4B1XB 3TPQA 4JAXA 3A0IX 2Q1NA 3WXLA 2P9UA 2YJEA 3VGMA 4K42A 1X3NA 2GWJA 3L6QA 2QWRA 3VESA 2A6AA 3SMPA 3MN7A 2Q0RA 2VCPA 5BN8A 1HKGA 2CGJA 2J4RA 4BRPA 3FZKA 3L0QA 3H1VX 2E2NA 3WEEA 1HX1A 3FGUA 1HUXA 1DKGD 1BWFO 3CJ9A 4CD1A 1YUWA 3CI5A 3UE5A 3QFUA 4BRFA 1J6ZA 3ZETA 4FWMA 4PKGA 4B1YB 4BRQA 3HTVA 1C0GA 4FPAA 1GLBG 2P9NA 2W40A 3O1BA 5AQLA 5I9EB 3H46O 1JCFA 3ULEB 3KZBA 4I6MA 5KPRA 4JHDB 3CJAA 1D4XA 5AQWA 2NZTA 3HZ6A 2PAVA 2YHXA 4CZFA 5AFUH 3FE1A 3JXUA 4FO0A 4BG8A 1MWMA 4CZJA 4B1UB 4BRMA 4XH1A 4IJAA 3LDOA 3I8BA 2P9KB 2E2OA 5AQSA 3B8AX 2PBDA 3RSEB 4FOIA 2P9IA 5AQOA 3VF2A 2P9LA 4B1ZA 2I7PA 1CZAN 1BA0A 3GDQA 5AQQA 2IVPA 3MN9A 1ZBSA 5AR0A 1NGCA 4BR9A 4FWSA 5E26A 1QZ5A 5AQGA 1MWKA 4FPBA 1EQYA 5AQHA 2YHWA 2A40A 3LM2A 4LC9B 3ENOA 1WUAA 4RWTA 4H5RA 3VGKA 2Q97A 2WUSA 3S41A 4BR7A 3ATUA 4O5FA 4BRKA 1H1VA 3A5NC 5EXWA 3BF1A 3H3NO 5AQXA 2Q0UA 1RFQA 3W0LA 1NGIA 3R6MA 4H5VA 3UB5A 2GELA 4YDUC 1R59O 4BQZA 3QICA 3LDPA 3SK3A 3VEXA 3VOVA 1LCUA 2V7YA 3FZLA 3CERA 3CJ7A 5AZJB 1RDWX 3WQUA 4BRDA 3DJCA 3OHRA 2P9SB 2AA4A 1NLVA 1C0FA 3KVGA 1V4SA 4A2BA 5EX5A 5TKYA 3IDHA 3DWLA 3SMSA 4PKHA 4JN4A 4L3QA 3VEYA 2HOEA 4C23A 2IIRA 1NGEA 3O8MA 2GTDA 2VYPA 4BRHA 1NGBA 2D4WA 3H6EA 4WQ4A 1YVNA 2Q2RA 3MDQA 3C0BA 5ADXA 3HM8A 4KBOA 3FLCO 3QDKA 4FWLA 3G25A 1U6ZA 3TU5A 5AQYA 2D0OA 1TYQB 4K25A 4QS8A 4MLEA 3VPZA 2QWQA 3UKUB 5AQFA 5BR9A 2FF3B 4QS7A 1GLJO 1YXQA 3DXMB 4A62A 4CZKA 2E20A 4JD2B 3D2FB 3EO3A 2FF6A 4YDUA 4DCHA 4H0PA 3VEOA 3SJHA 2Q31A 1K8KB 2E88A 3LDQA 4H0TB 4B1WB 1NM1A 3LM9A 3EL2A 1MDUB 3IMXA 3VEVA 1WOQA 2F9WA 4IJNA 1T6CA 5F0XA 1T44A 4CZLA 4BRCA 3AARA 1KXPA 1XC3A 3LDNA 4BC3A 1JCGA 1QQNA 2ASPA 3FZHA 5AQKA 2GUPA 2ZF5O 3MCPA 4A61A 4EIAA 5KPZA 2E2QA 1ESVA 4PL8A 2GEMA 4BRNA 1NGHA 1KAYA 3MN6A 1GLFO 4CZHA 4HWIA 4ISEA 1G99A 4XH5A 3R8EA 4GY2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ILHA 3AVKA 3M1FA 3BP8A 3JS6A 1RT1A 2OZSA 3VQAA 3TAEA 2ZM6K 4KHPK 3CQ8A 4QS9A 4LFAK 5I3UA 4MO4A 2P9PB 4NLBA 4LY7A 1NWKA 4JLHA 1IV0A 4HE7A 5AZJA 4W5QA 3OYHA 3DM2A 2KFZA 1OH6A 3QEXA 1WSHA 1N4NA 1YAGA 3NF9A 1UA0A 1GLCG 4LSNA 2JWKA 2RF2A 3CCLN 1XC9A 2FSKA 4CF9A 2EX3A 5C42A 1Q81O 1CZ9A 5FROA 5GAHP 3VENA 1HNIA 4HHFA 4PL7A 3H3OB 3DXKA 1NBWA 2O4IA 1OVQA 2IAJA 2AP1A 5J2QA 2A42A 3RTVA 3WQTA 4NYNA 3A5LC 2RE2A 3MK6A 1NPIA 2P9IB 5ELZA 1P8ZA 1OH8A 3J7YP 1DLOA 3ITHA 3PX4A 1KFDA 4IO9L 4BC2A 2Z1IA 2HHSA 3DLKA 4B9NA 3DRSA 3QINA 5HROA 4RW8A 3UKUA 4BR0A 1NKCA 4YFUA 4F9OA 1L3VA 4CJ4A 1NK5A 4B9SA 4H03B 4DKWA 1NGGA 2UXCK 1C0TA 1TK5A 3DI6A 1ZYVA 1DQ7A 4M45A 3WT0A 3FFKB 3J7ZO 3CF5L 2YC1C 4BREA 3CD6N 1Z05A 4IO8A 4H0VB 5AQUA 2D1KA 2MN5A 4RW9A 1E4GT 1EWRA 3MEDA 3CCMN 1NH5A 3M8PA 4EAHD 1BHLA 3VQ4A 4FCYA 5KQ8A 1BA1A 2KW4A 2HHTA 3UKRB 1VSDA 4FWOA 4DV6K 1BUPA 3PX6A 3CYGA 4CJ3A 2F9TA 4LFCK 4YOXA 3A5OC 3O4WA 1P0AA 4BDPA 5AQPA 1QHAA 4B9UA 3K57A 3SAGA 3TI0A 2E6MA 2P9KA 4FM1A 5AQZA 3DLBA 4ID1A 2O8EA 1QSYA 3ATVA 5BR8K 5AQTA 5LY3A 2W41A 2OPQA 1IKYA 3S3NA 1D9DA 5EY4A 3O1WA 2P9PA 3ZSRA 1RDCA 4O5BA 3E01A 3CETA 4Y1CA 3WUHA 3HOSA 3IUCA 3U8XA 4E7LA 3HYFA 3A5MC 4OGEA 3M3ZA 4DR7K 3C65A 4ISGA 3L2RA 2BTFA 2NY8X 3HSCA 1WB9A 4Z4CA 3OYGA 3AGRA 4CJQA 1JLCA 3ZSWA 3CCRN 4FJMA 2QKKA 4XH4A 2F8SA 4WYBA 5GINA 4ZTFA 4IWVA 3CXCM 1BOTO 1ATNA 2P9SA 3F9KA 1OH5A 3VGLA 3OYEA 2RKIA 5FPEA 2DPNA 2DTUA 2PFUA 3CM6A 1NK8A 1XQSC 4DSLA 4YOUA 3GG4A 4CF8A 4B9QA 1TK8A 4BC4A 1I94K 4JI5K 1UAXA 4ILGB 4CZGA 3LDLA 2OANA 1RBUA 3V1QA 1U2VB 4EZ9A 3LANA 1JXBA 5FPNA 4B3RK 5DM6L 3FZFA 4F3TA 5CY0A 2ASCA 1ATRA 2KPYA 3RR8A 4FLZA 2YNGA 2P9LB 3LAKA 3I0SA 4B3TK 3NFAA 1Z26A 4BRAA 2GWKA 3ENHA 3O6WA 1A5XA 4K41A 4MLHA 4H0XB 3NMUA 3ZX0A 1BG3A 3TAFA 4Q5VA 3TABA 1TVRA 3D2FA 1EX4A 3V1RA 3FR0A 3UKRA 3KD5E 3UIQA 4OLAA 3O9UA 2IC3A 1XRSB 3OJSA 3DRPA 1BO5O 4DTUA 4N76A 2YHBA 4KHQA 3AO1A 2ZD1A 1C56A 1KVBA 3HI0A 3RMCA 1OKJA 3NE6A 3WXIA 2FXUA 1X9JA 3V81A 2VWBA 3KC6A 2NRXA 4ELVA 1S1VA 3E66A 1NOYA 4CGJA 4YHHK 1RTIA 4JI3K 4HUFA 4DMNA 3LAMA 5DK5A 1BU6O 3CJBA 3L2QA 2LJMA 2GBZA 3TPQA 3A0IX 4AHCA 2IDOA 2E6LA 1A5WA 4K42A 1HYVA 4CJSA 4B3SK 1G15A 3VESA 3SMPA 4OVLA 2O4GA 3OS0A 2CGJA 1L3UA 3U6FA 4K0KK 2LKBA 1ZBFA 4KHUA 4KKOA 3FZKA 3K59A 1ASVA 3FGUA 1DKGD 2E3FA 5J2PA 1QQCA 2B5JA 2D56A 3VQBA 4BRFA 4U67L 1IO2A 3O9SA 3AV9A 2YNHA 4X66K 2P9NA 3S3MA 3H46O 3CCEN 4DU3A 4CHYA 3KZBA 2KFNA 1D4XA 2A1SA 2HBLA 3HJFA 1XWLA 4CZFA 5AFUH 1TKZA 3JXUA 1TL3A 3G6EN 4BRMA 4HVJA 4KI4A 1XHZA 3S9HA 4QAGA 1YT3A 4IKFA 5AQOA 2P9LA 4KREA 4ELTA 2LJ7A 3DRRA 4YOYA 4DV1K 1OMYA 4BDYA 5HRNA 3OBYA 3MAQA 4DS5A 1NGCA 3E7RL 5HBMA 4FK0A 3OS1A 1QZ5A 1MWKA 4I2QA 1S1WA 2YHWA 3NCIA 2ATBA 1WUAA 4RWTA 3SV3A 3O4QA 3THYA 2JDQD 4E7KA 1WBBA 3AA2A 4KAZA 3T1HK 3S41A 1K73O 1VSEA 4Z4EA 3QEVA 1VQLN 3ATUA 4BRKA 3ULDA 3H3NO 5EXWA 3BF1A 3ENBA 1RFQA 2QTDA 2O8FB 4H5VA 3CC7N 4IEIA 3TAMA 1HNXK 4B9VA 3QICA 1VHXA 1SN1A 2VGMA 1LCUA 3WQUA 3AA4A 3CCVN 3VQ5A 5LMUK 3LP0A 4CK2A 4KH6A 1PE4A 4O0JA 2XHBA 4ID5A 2VQEK 3OYMA 1P00A 5HRPA 4L3QA 4OKEA 4C23A 2IIRA 3CCUN 1NGEA 3RRHA 1T7PA 4BRHA 1EETA 4CHOA 3AVFA 4MDBA 2D4WA 4CGIA 1YJ9N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ILH A;  3AVK A;  3M1F A;  3BP8 A;  3JS6 A;  1RT1 A;  2OZS A;  3VQA A;  3TAE A;  2ZM6 K;  4KHP K;  3CQ8 A;  4QS9 A;  4LFA K;  5I3U A;  4MO4 A;  2P9P B;  4NLB A;  4LY7 A;  1NWK A;  4JLH A;  1IV0 A;  4HE7 A;  5AZJ A;  4W5Q A;  3OYH A;  3DM2 A;  2KFZ A;  1OH6 A;  3QEX A;  1WSH A;  1N4N A;  1YAG A;  3NF9 A;  1UA0 A;  1GLC G;  4LSN A;  2JWK A;  2RF2 A;  3CCL N;  1XC9 A;  2FSK A;  4CF9 A;  2EX3 A;  5C42 A;  1Q81 O;  1CZ9 A;  5FRO A;  5GAH P;  3VEN A;  1HNI A;  4HHF A;  4PL7 A;  3H3O B;  3DXK A;  1NBW A;  2O4I A;  1OVQ A;  2IAJ A;  2AP1 A;  5J2Q A;  2A42 A;  3RTV A;  3WQT A;  4NYN A;  3A5L C;  2RE2 A;  3MK6 A;  1NPI A;  2P9I B;  5ELZ A;  1P8Z A;  1OH8 A;  3J7Y P;  1DLO A;  3ITH A;  3PX4 A;  1KFD A;  4IO9 L;  4BC2 A;  2Z1I A;  2HHS A;  3DLK A;  4B9N A;  3DRS A;  3QIN A;  5HRO A;  4RW8 A;  3UKU A;  4BR0 A;  1NKC A;  4YFU A;  4F9O A;  1L3V A;  4CJ4 A;  1NK5 A;  4B9S A;  4H03 B;  4DKW A;  1NGG A;  2UXC K;  1C0T A;  1TK5 A;  3DI6 A;  1ZYV A;  1DQ7 A;  4M45 A;  3WT0 A;  3FFK B;  3J7Z O;  3CF5 L;  2YC1 C; 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