3CIPA

Complex of dictyostelium discoideum actin with gelsolin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
371
structure length
362
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Major actin
publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 122
structure length 362
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cipA03
1V4SA 4A61A 4FWQA 3CJ1A 4B9QA 2D0OA 2YHWA 1BDGA 2AA4A 5AQOA 1HKGA 4BRDA 2YCHA 1QQMA 1EQYA 3VF2A 4EAHD 1P8ZA 1JCEA 3DXKA 3F9MA 5BRDA 3MCPA 4CZIA 4JHDB 3ZX2A 1SAZA 4BRAA 5BRFA 1NMDA 2NRHA 2FF3B 2GTDA 2E2PA 2KHOA 1BOTO 1GLFO 3ZETA 3A5MC 3U4LA 1DGKN 3FGUA 4BROA 2E2OA 3ZEUB 2I7PA 1TUYA 3MK6A 1BO5O 3ZETB 4BG9A 4PL7A 3U8XA 3IUCA 2QWPA 2V7ZA 2E2QA 4H0TB 4NB4A 3VEYA 1G99A 4CZMA 3UKRB 3WUHA 1QHAA 4JN4A 4K43A 2YI1A 5AQYA 4BC5A 1ATNA 2Q97A 3D2FB 1NGFA 4K42A 2YJEA 1KAZA 4B1WB 2QW9A 5ELZA 3BF1A 5LJWA 2IVNA 3GG4A 5JLFA 3FFKB 3EL2A 3P4IA 4BVPA 2F9TA 3AAQA 4QS7A 1GLAG 2Q2RA 4M7XA 3VOVA 3G25A 1NM1A 1E4GT 3RSEA 3UKUA 2FSNA 3QFPA 3J8AA 1NGHA 4I6MB 1IJJA 2ASMA 5BREA 3U9ZA 3L0QA 4H5NA 3MMVA 3A5OC 4BRIA 3EKSA 4GNIA 3UB5A 1ESVA 3C7NA 3WXIA 2GEMA 1U6ZA 2FF6A 3GDQA 5KPTA 4KBOA 4F9OA 2QWMA 4FPAA 5EXWA 5AQTA 2H3GX 2CGKA 4L3QA 4H0VB 4CBXA 2Q0RA 3GL1A 3R9PA 4HTLA 3FE1A 1QZ6A 1KAYA 2Q0UA 4FWOA 3UE5A 4NO7A 3H46O 4ISGA 5I9EB 4BRCA 2QM1A 1SQKA 3CJAA 1DKGD 1BA0A 4XEIA 2P9SB 1T6DA 3QBXA 2FLOA 4YDUA 4C23A 3H45C 3VPZA 3RSEB 3UKUB 4BQLA 4EFHA 2DPNA 3LM2A 1NGEA 1MWKA 3QBWA 3QFUA 3ID8A 2ASOA 2A3ZA 1Q18A 4BVOA 3ENOA 4DCHA 1LOTB 5EX5A 4H03B 4JHDA 1RGIA 1WOQA 3C7NB 2WUSA 5KQ8A 2GUPA 3VEOA 4BC2A 3VENA 2P9UA 3VETA 3WQTA 4FPBA 3I33A 4FL9A 3CHWA 4MO4A 3S41A 2HOEA 2AP1A 5E26A 1X9JA 3MN5A 4JD2B 5AZIB 3VEVA 4DHYA 2E88A 2NZTA 3DXMA 1TUUA 4FWSA 3FZKA 1XUPO 4FWPA 3UKRA 4BRQA 3FZLA 3SK3A 3ZX0A 3VESA 1HLUA 4K25A 3D2FA 3MDQA 3CJCA 5AQXA 2P9KB 4H5RA 3W0LA 3QB0A 2VWBA 2P9LA 3QMLA 3FR0A 2A6AA 2CH5A 3I8BA 4CBUA 4AM7A 1QZ5A 1Z05A 2QWOA 4BRKA 3BF3A 4EHTA 4H5WA 4FOIA 4FSVA 5AQFA 3HBTA 3AARA 2P9UB 2QWQA 2HF4A 4BR0A 2Q36A 5ADXA 4I6MA 3CQXA 4K41A 3WXLA 1X3NA 3O80A 3HTVA 3DWLA 4M7YA 5AFUH 5EY4A 3M6GA 3VF6A 4RCHA 5AQJA 3IFRA 5AQKA 3LDOA 1R59O 4Z94A 4B1VA 3DXMB 5BPLA 4ISFA 2A42A 1KXPA 2V51B 3QICA 3ULEB 5BRHA 4HWIA 2D0PA 4B1UB 1HJOA 1S3XA 4J8FA 3HI0A 3H1VX 5AQLA 4YDUC 2IVPA 2ITMA 2W40A 4WQ5A 5AQPA 2ASPA 3WQUA 3GOIA 2IVOA 2P9LB 4CZGA 2EWSA 3HSCA 3GE1A 5AQIA 5BN8A 2CGJA 2P9SA 3BP8A 4CZFA 1NGJA 3VGMA 1H1VA 3IDHA 3R6MA 5B8HA 3CQYA 3LM9A 2P9IA 3D7EO 1NGGA 3DJCA 2PBDA 4PKHA 4BRMA 4CZJA 3ATUA 1J6ZA 2W41A 3O4WA 3VERA 2PAVA 4B1ZA 3SMSA 5TKYA 3O8MA 3CJ7A 4BRHA 1BU6O 3MN6A 3DAWA 3KVGA 2UYTA 1YAGA 3BEXA 3CJ9A 2ZGZA 2V52B 1ZBSA 4M63C 3BUZB 2A40A 4CD3A 1GLDG 4BGAA 4JD2A 3IMXA 4GY2B 5AZIA 3SMPA 3CETA 5AQQA 4DB3A 2ZGYA 4FWLA 4CZEA 4FWKA 2BUPA 4WQ4A 4BGBA 4EHUA 3WXJA 1U2VA 1BUPA 1MA9B 1QQOA 1LCUA 1GLLO 3VF4A 5AQHA 1IG8A 3FZHA 3LDPA 4RTFD 2P9KA 1ATRA 2P9IB 4A62A 4H0OA 1BA1A 3VEWA 1TYQB 1Y64A 1JCFA 2J4RA 1NGDA 2P9PB 4DQ8A 5AR0A 5AQSA 5BPNA 3JS6A 4PL8A 3D2EB 3GBTA 1BG3A 1NWKA 5AQRA 1QQNA 4BR9A 1NLVA 3A0IX 5JLHA 2YHYA 4JAXA 4QS8A 1YUWA 3MN9A 4A2AA 3FLCO 5JICA 1XC3A 3L4IA 3EN9A 3ZX3A 3ENHA 5FPEA 4IWVA 3ULEA 5LY3A 3O1WA 4FO0A 1U2VB 3A5LC 1T44A 5AQWA 4BR4A 1GLBG 5F2RA 3ATVA 5AQNA 1YVNA 4BR2A 2Q31A 2A5XA 1SZ2A 4ISEA 2QXLA 1GLCG 1ATSA 3VEZA 2HMPA 2E20A 3SLCA 1KAXA 5EVZA 3HM8A 3O6WA 1HKBA 2E8AA 4FWRA 2E1YA 5AQVA 4AM6A 1RDWX 2FSKA 4BQZA 3WEEA 1WUAA 1C0FA 5JMVA 3LDLA 3L6QA 4RWTA 4MO5A 4BR7A 3C0BA 1C0GA 4IJNA 4CBWA 1ZXOA 2QWNA 4BREA 1XQSC 4B1YB 4CI6A 4CZLA 3A8YA 3M3ZA 1BWFO 3VGKA 4BR5A 4JNEA 2QWLA 1RFQA 4WQ4C 4CJ7A 3TPQA 3WT0A 4PKIA 1HKCA 3CERA 5FPMA 1NGIA 5AZJB 4IZ9A 4MLHA 4BRNA 2HF3A 4BC3A 4LC9B 5KPZA 5KQDA 1MWMA 2D1KA 4B1XB 3AY9A 4FWNA 5AQMA 1HX1A 2GWJA 4IO8A 5KPRA 2P9NA 1HPMA 2GELA 2ZWHA 3OHRA 3KHYA 3WEEB 5CE3A 4E1JA 5BR9A 1TYQA 4BG8A 2E1ZA 3CIPA 3W3DA 3LDNA 3WXKA 4FOEA 2P9PA 1CZAN 4Y0WA 3O1BA 2FSJA 1K8KA 4WYBA 2CH6A 3D2EA 3DXKB 5BPMA 5LJVA 4A2BA 5F0XA 2V7YA 3H3NO 5FPDA 1Z6RA 5AQUA 3EKUA 2E2NA 3O08A 3QDKA 4H5VA 1D4XA 3MN7A 1YXQA 2I7NA 3CI5A 3TU5A 3H3OB 4MLEA 1HUXA 5E84A 3H1QA 5AFUA 4H0YB 5AQZA 3AAPA 3A5NC 3VEXA 1S22A 4CZHA 2P9NB 3FZFA 2YJFA 2FXUA 1T6CA 3R8EA 2YHXA 3LL3A 3M1FA 4IJAA 4XH1A 4O5FA 1V4TA 5AQGA 1K8KB 1NBWA 4BRGA 4H5TA 3O5BA 5F1XA 3KZBA 1OKJA 2BTFA 2D4WA 1E4FT 3HZ6A 3CJBA 5ADXH 4BRFA 3H6EA 2OANA 1X3MA 4QS9A 5EOYA 2F9WA 3SJHA 3EO3A 4IXCA 1NGAA 4BRLA 1GLEG 4H0PA 3LDQA 2VCPA 2A41A 5FPNA 4WQ5C 3B8AX 4BRPA 3EZWA 2IIRA 3JXUA 4XH4A 4CZKA 2GWKA 1MDUB 2VYPA 1NGBA 4BC4A 4CD1A 1ZC6A 4EIAA 1NGCA 4PKGA 4H0XB 2QWRA 1DEJA 5AZJA 2Q1NA 4FWMA 2CGLA 4XH5A 1JCGA 5BN9A 1GLJO 3VGLA 3ZEUA 2NLXA 2ZF5O 3FZMA 3U9DA 4O8KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TGOA 3U3GA 2RKIA 1QVGM 4PQUA 3LAKA 4FWQA 3CJ1A 3ISNC 1VSEA 3CMEN 1J54A 1ASUA 1T8EA 1HKGA 4FW1A 2XO7A 2Z1HA 3AGKA 3C6TA 4EAHD 4IG0A 1RBVA 3AA5X 1ASWA 3E9OA 5GADP 1FW6A 4JHDB 2HHQA 1SAZA 1XNQK 1FXXA 4FZZA 1DLOA 4KV8A 1GLFO 4I7FA 4RW6A 1YVUA 1M90O 1DGKN 4LFBK 3FGUA 1GOCA 3ZEUB 2I7PA 1TUYA 1YI2N 3ZETB 4BG9A 4A5BA 1NMNA 1QE1A 3NH0A 4NB4A 1KFSA 1G99A 3P39A 5DMRA 1TK5A 2YI1A 4A57A 2Q97A 5CZ1A 1NGFA 4K42A 1U4BA 2QKKA 3VQ9A 2QW9A 4GVEA 3H08A 3BF1A 5CYQA 5LJWA 2IVNA 1EWRA 3GG4A 4DR4K 4BDYA 3AAQA 1GLAG 2Q2RA 2HW3A 2VQEK 1E4GT 3OYNA 3AVIA 3RSEA 1IBMK 4EP4A 1UAXA 4I6MB 4C1NI 3SJJA 2F4VK 4GKJK 4KB0A 3U9ZA 4NLBA 2YNGA 3RMAA 1HNXK 2G8VA 3G0ZA 5C2FA 2GEMA 3T3FA 4DR5K 1U48A 1X9MA 2CGKA 2EX3A 3GL1A 2W6LA 4HTLA 3QEWA 4ILGB 1QZ6A 1KAYA 1Q9XA 4YOVA 2B6AA 3KLFA 3UE5A 4R5PA 5GAEP 1ZBIA 2O8BA 4DU1A 3CJAA 1DKGD 4XEIA 4KAZA 3CXCM 4JRPA 3VQCA 2WTUA 3V9ZA 2NRWA 3IKMA 3UKUB 2OPRA 4N41A 4CEFA 1MWKA 2KZZA 3SCXA 4M3RA 4FJIA 4B9SA 5HROA 5M1KA 1LOTB 4YOTA 4DFJA 4JHDA 3S5TA 3C7NB 2P1JA 1KLMA 2HB5A 4BC2A 2GV9A 5IWAK 1D8YA 1HQUA 2AP1A 3MX2A 4DU3A 4DQPA 2QKBA 4DSEA 4DR1K 2HHUA 1RNHA 4BEBA 4DHYA 4M3XA 1RT3A 2VG5A 3VMFB 4OPJA 3HP9A 1XUPO 3MX5A 2OTLN 4DG1A 4CVNE 3SK3A 4YORA 4CHZA 4K25A 4PHTX 4A5AA 5HRRA 4JEPA 1CZBA 5AQXA 1U45A 5C25A 4H5RA 4E7HA 4XJXA 4JKHA 2VWBA 4WCEL 1SKWA 3QESA 3FR0A 3I8BA 5HRSA 1D5AA 4AM7A 4CF9A 2QWOA 4EHTA 5H1SQ 1JL1A 4FSVA 3AARA 4DSIA 1GOAA 4CJSA 4I6MA 1JLGA 3MXJA 3CQXA 3PIPL 4JI0K 1HNWK 1X3NA 4CHOA 4YFUA 3M8QA 3HTVA 1ITGA 1L3UA 2RPIA 3OVNA 3VF6A 3IFRA 5AQKA 4E7KA 4X66K 1VQON 3VQDA 3VQAA 2P5GA 1HQEA 2HVIA 1KXPA 3QICA 3ULEB 3AVAA 2HBJA 2FBTA 4V19S 3DLEA 5JVGL 1W7AA 1S3XA 2W6KA 4YDUC 2ITMA 3RTVA 4DTUA 4FJ5A 5AQPA 4CFCA 2ASPA 3PIOL 3ID6A 1Q81O 4NYNA 1N32K 4OX9K 3GE1A 4DSLA 5BN8A 1NGJA 1HYZA 5JS2A 5B8HA 3O4NA 2KLAA 3LM9A 3L4QA 3L2RA 5HBMA 2QXFA 1BQMA 1GOBA 5KI6A 2PYJA 2OPPA 4BRMA 4C8KA 4CZJA 2Z1JA 1J6ZA 2W41A 4B1ZA 4KI6A 5TKYA 4JK9A 3O8MA 1BIZA 3CJ7A 3MN6A 3LZJA 4DSJA 2UYTA 3BEXA 1KRPA 5I3UA 3QEIA 3E9LA 4M63C 2A40A 3HRGA 1GLDG 3IMXA 1WSGA 4DV6K 1SUQA 1EKEA 3PSFA 4GMJB 4QCLA 4CJ5A 4WQ4A 4B8CA 4EHUA 4DR3K 4DFMA 3ZT1A 1QQOA 1JJ2M 4F3TA 1LCUA 2JWLA 1GLLO 4OGCA 5AQHA 3TTFA 4RTFD 2O8EB 3RRGA 4DTNA 2P9IB 2G8UA 5KRTA 2E6MA 3VEWA 1TYQB 2WFBA 2A1RA 4Z0UA 1NGDA 1WAFA 3I0SA 4DQ8A 4C8NA 3JS6A 4PL8A 3TTCA 1BG3A 4DTRA 4DLGA 4BR9A 1KCFA 4IEIA 1K8AO 2F96A 2YHYA 3SV4A 4M45A 5C10A 4YY3K 1CXUA 4A2AA 4AILC 3NF6A 3FLCO 2YNHA 3AVCA 3EN9A 4C8OA 3HO1A 4IWVA 2QEXN 3B6OA 4F2RA 3ULEA 4BECA 3OA9A 5HLFA 1LWEA 3LWMA 1U2VB 3TAMA 1T44A 2XY8A 5AQNA 2Q31A 2A5XA 2FBYA 4ISEA 2ZE2A 3CCMN 1GLCG 1SL2A 2HMPA 4BACA 5EVZA 3TAFA 2X6SA 4FWRA 1RDAA 2E1YA 1RT2A 4B3SK 1RDWX 3SNNA 4OLBA 1WUAA 4O4GA 4MO5A 4IJNA 2IC3A 4OPKA 2NUBA 4JKCA 4FLUA 3N4PA 2QWNA 2IAJA 3NGYA 1HNIA 4IFYA 4CI6A 3OS1A 3A8YA 3M3ZA 4L8RB 4OGEA 3SQ0A 1BWFO 3VGKA 3MEGA 3AA2A 3R3LA 2YNIA 3TAPA 3TPQA 4BY9C 4PKIA 1HKCA 4BC3A 1N5YA 5KQDA 2D1KA 4B1XB 1G15A 1VSHA 4FWNA 1HNZK 1ZBLA 5AQMA 1HX1A 4W5NA 1TAUA 5MLCQ 2O8EA 3KHYA 3HPHA 2XY6A 3L3UA 5BR9A 2GBZA 4CF1A 1TYQA 3NHGA 4DSFA 3CIPA 5GAHP 4JS4A 1RILA 3LDNA 3WXKA 3KWGA 1CZAN 3WXMB 3O1BA 5JENA 1RDUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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