The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
207
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structure length |
197
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Chain Sequence |
DIGSEFEGQELIVRAAVSELDPSNTIWLDIEGPPTDPVELALYQPAKKQYIHCFRKPHDEKGFKNGSRHSHGILMKDIEDAVPGVLSYVIGLLPPNMVITTQGSDDIRKLLDIHGRKDLKLIDVKFTSDQARQFEHQVWDKFGHLCKQHNGVIISKPSPDEPHCALLDCIMFHSAMSGELPKEEPIPLLPKEFLFFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Nucleoprotein
|
| publication title |
Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Tacaribe virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| total genus |
57
|
| structure length |
197
|
| sequence length |
207
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3Q7B A; 4GVE A; 3R3L A; 4GV3 A; 4GV6 A; 3MX5 A; 3MX2 A; 3MWP A; 3MWT A; 3Q7C A; 4FVU A; 4G9Z A; 4GV9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BHL A; 3D7E O; 2HBM A; 3HP6 A; 1W97 L; 3AY9 A; 3K59 A; 1JCG A; 4BR7 A; 1D9F A; 4IO8 A; 4KHW A; 1UOC A; 4LF6 K; 3QEP A; 3O5B A; 1T44 A; 2AA4 A; 2O8F A; 4DR2 K; 4DQP A; 4CD1 A; 3ULE A; 3FZK A; 3OS1 A; 4F2R A; 5LY3 A; 1U47 A; 4RW6 A; 2NRW A; 4DV5 K; 2FSJ A; 5AQW A; 3MX2 A; 3A5L C; 3FFK B; 4JKB A; 2A5X A; 1QSL A; 4M7Y A; 3LDL A; 3ZSZ A; 4CI6 A; 1TL1 A; 3K9K A; 5LMU K; 4CZF A; 1BI4 B; 3R3L A; 4B8A B; 4FWM A; 3KD5 E; 3MXM A; 3LDQ A; 2VGM A; 1JLF A; 4C8N A; 3CC7 N; 4CJS A; 3PX6 A; 1K8K B; 3F2K A; 3NVK A; 5D3G A; 4JK8 A; 1BDG A; 4F2S A; 4DTO A; 1RFQ A; 4BC4 A; 1KCF A; 3VA0 A; 3LAN A; 3V1O A; 2OA8 A; 4LF4 K; 4CVN E; 1L3S A; 1X3N A; 3I0S A; 1QSY A; 4PA1 A; 2OCE A; 4CJF A; 5BN9 A; 5GAH P; 1V4T A; 5AQG A; 4CHO A; 1YAG A; 1SV5 A; 3QML A; 4QS7 A; 1KAZ A; 4DV4 K; 5AQQ A; 3DXM B; 3L3V A; 1C0U A; 3AGK A; 1HNX K; 4RTF D; 1VAZ A; 4B1X B; 4CEF A; 1VSL A; 2O8D A; 1WSI A; 5KQ8 A; 1IKX A; 3HXM A; 1XMQ K; 4Z4E A; 3K0S A; 1VQ5 N; 3I8D A; 2P9P A; 1W9H A; 5FPN A; 3JAM O; 3F9K A; 1VHX A; 3CJA A; 4JI7 K; 2OTL N; 4W5R A; 1RBV A; 1S5J A; 3HI0 A; 4B1U B; 4B9S A; 3HM9 A; 4Y0W A; 4FLV A; 3DLK A; 4JKH A; 1A5V A; 3AVB A; 3AAP A; 1OVQ A; 3MEE A; 5C24 A; 3AVA A; 4A62 A; 3TAN A; 3NGZ A; 4EIA A; 2I7P A; 3W3D A; 1HYS A; 2Q1N A; 4L3Q A; 1HNV A; 4KO0 A; 2YNH A; 3VER A; 2Y1J A; 3EZ5 A; 2VWK A; 3RSE B; 2P9K A; 3TWH A; 5LJW A; 5ADX A; 3O3F A; 1YVU A; 1WLJ A; 2A41 A; 1BIS A; 3ZCM A; 1IV0 A; 3C6T A; 4BWM A; 4PY5 A; 4DQ8 A; 3IS9 A; 4FJ9 A; 4H03 B; 3SCX A; 5CHI A; 4B9N A; 1JLA A; 4JV5 K; 3ENO A; 4CBU A; 4CFD A; 1RDU A; 1G99 A; 4B9Q A; 2FSN A; 1S1W A; 4CJL A; 1NBW A; 5FPD A; 5FLX O; 1VRU A; 3R1X A; 4F4K A; 1QZ5 A; 3LDS A; 1HR0 K; 1HPM A; 4K8Z A; 4LF5 K; 1JCF A; 2F9T A; 3OBW A; 1NU0 A; 4DLE A; 4FJI A; 1JJ2 M; 3VPZ A; 2GEL A; 1MU2 A; 4MDB A; 3THW A; 3CME N; 4H0P A; 3OBY A; 3HOT A; 5BN8 A; 5KTQ A; 2ZJR L; 3CYM A; 2ZE2 A; 2EHG A; 4IOA L; 4BRH A; 3F5T A; 5LJV A; 3LAM A; 1JLC A; 4FM2 A; 4PQU A; 5AQI A; 2HBK A; 5C15 A; 3V9Z A; 1YT3 A; 1NK7 A; 4DR3 K; 3AAQ A; 3O08 A; 5T7B A; 2HND A; 4DLG A; 3PIP L; 2EX3 A; 3OJU A; 4CIE A; 3ZT4 A; 3CF5 L; 4FK4 A; 1NNE A; 2QM1 A; 2FLO A; 1JCE A; 1N5Y A; 3ZET A; 4K25 A; 5FRN A; 1OH6 A; 1XC3 A; 5I9E B; 2ZJQ L; 4BAC A; 3CD6 N; 1N8R O; 1KVC A; 3CC4 N; 1NK8 A; 2Q31 A; 3TSQ A; 4QS8 A; 2CH6 A; 5AQZ A; 4CGD A; 1XC9 A; 2JWL A; 1SL0 A; 1HQU A; 3CMA N; 3RMC A; 5AQN A; 3LP2 A; 3ZT1 A; 5GIN A; 3RR7 A; 1HYZ A; 4J2E A; 3SJH A; 4DV6 K; 3M8P A; 1ASU A; 4JKE A; 2B4J A; 3LM9 A; 2IS3 A; 4M3R A; 4CJ5 A; 3TTD A; 2Z1G A; 4DG1 A; 3SBG A; 1CLQ A; 4DCH A; 4CGF A; 4JRP A; 4IZ9 A; 3IRX A; 2BDP A; 3VEW A; 3GG4 A; 3GL1 A; 4LH5 A; 3OYK A; 5AQL A; 3E1Y A; 3V9S A; 1VQN N; 1GLA G; 4DV2 K; 2CGJ A; 1RDW X; 1FKO A; 1RTJ A; 2AJQ A; 4LF7 K; 4XH5 A; 4JLH A; 1E4G T; 1TKT A; 4DSF A; 1JLQ A; 4OPJ A; 1HYV A; 3UKR A; 4C8O A; 4CEB A; 2W6K A; 4CJQ A; 3RRH A; 4BG8 A; 3LPT A; 3MED A; 1UAX A; 4CJW A; 4DFP A; 4FJ7 A; 1RDD A; 1J54 A; 2QWP A; 2YV0 X; 3H08 A; 2P51 A; 3W0L A; 1R0A A; 3EEQ A; 4BY9 C; 5CY4 A; 3M3Z A; 3U4L A; 4YHH K; 4H0X B; 2BTF A; 4KFB A; 3WNG A; 2Z1H A; 5K14 A; 3T1Y K; 3MX5 A; 4CF0 A; 1RT5 A; 3OYC A; 2OTJ N; 3FZM A; 2DTU A; 4IKF A; 4I9L A; 3VQ5 A; 1B9D A; 1IKV A; 3IMX A; 4YOU A; 4W5N A; 4CGH A; 2WBN A; 1RT2 A; 1YI2 N; 1RDC A; 4G1Q A; 4BDP A; 5HL7 L; 4HUG A; 2E8A A; 3THY B; 4QS9 A; 4BGB A; 5LMN K; 2RE2 A; 4CHQ A; 5AZI B; 2FF6 A; 4GMJ B; 4PWD A; 3O9T A; 4CEA A; 1NGJ A; 4A2B A; 4DTX A; 4IOC L; 3G10 A; 1DEJ A; 1T03 A; 4BG9 A; 4DS5 A; 2H3G X; 3U3Y A; 3CFR A; 2CGL A; 4DUZ K; 4PKH A; 4DS4 A; 5GIP A; 3PY8 A; 4JI5 K; 2NNW A; 4DWI A; 1R59 O; 2HHU A; 4TSX A; 4CHZ A; 4M45 A; 2JLE A; 4FWQ A; 4CEO A; 4C8M A; 2ASM A; 3FLC O; 3L2V A; 3MXI A; 4NO7 A; 2KFN A; 3CHW A; 1IG8 A; 4DB3 A; 4Z4H A; 1GLL O; 4CIG A; 2WFB A; 1S9E A; 4AHU A; 4M3X A; 1U2V B; 3Q7C A; 4LSN A; 3VEV A; 3S3M A; 3CC2 N; 3KZB A; 2G8U A; 3C94 A; 2XO7 A; 3SUQ A; 1Q82 O; 1JLG A; 4DTJ A; 3L3U A; 1M90 O; 2P1J A; 4B1W B; 4J2D A; 4WFB L; 2IGI A; 4ELV A; 1KFS A; 4DF4 A; 3ZX2 A; 1TUU A; 2OPR A; 3LAK A; 3DM2 A; 2O8F B; 3CPW M; 2YI1 A; 1RBR A; 4BDY A; 4PUO A; 3B8A X; 4WFA L; 3NF9 A; 4ICL A; 4IFV A; 2BE2 A; 3A0I X; 4K41 A; 5AQP A; 4CE9 A; 1Q86 O; 3OW2 M; 4YY3 K; 4AM6 A; 3SUO A; 4CEE A; 1M1K O; 1N33 K; 2E6L A; 1RT1 A; 3G25 A; 1GLB G; 4CF9 A; 4H4O A; 1RDB A; 1X9S A; 1D4X A; 3EL2 A; 4GW6 A; 4YOW A; 3ZYY X; 1I94 K; 1S9G A; 2W6L A; 4NYF A; 5GAE P; 3SUP A; 1KLN A; 4IEI A; 3EN9 A; 3D0P A; 3M8Q A; 3QEW A; 3VQ8 A; 4CZH A; 4GVM A; 4FW2 A; 1YHQ N; 1XQS C; 4JK7 A; 4V19 S; 3F73 A; 1SUQ A; 1C0F A; 1XHX A; 2FXU A; 1WAF A; 2HB5 A; 3V6D A; 4K42 A; 1WB9 A; 3LPU A; 2A3Z A; 2ITG A; 2NLX A; 3NGY A; 3HOS A; 1REV A; 4LFA K; 1I39 A; 1RBU A; 4NCG A; 3T1A A; 4C1N I; 3THV A; 5H1S Q; 4KI6 A; 4YDU C; 2KTQ A; 4EP4 A; 2PAV A; 3P83 D; 3TR8 A; 4E7H A; 4ISF A; 5DK5 A; 2HHW A; 2OPS A; 3WQT A; 2ZGZ A; 4W5Q A; 1SL1 A; 1ATR A; 3VF4 A; 3NH1 A; 3RVC A; 4WFN L; 4OPK A; 1V4S A; 2Y1I A; 4AHV A; 5C0Y A; 4FK2 A; 3I56 N; 1WBD A; 3ZSQ A; 3VN5 A; 2ZQB A; 2YHY A; 5I42 A; 3ULD A; 4JI3 K; 4NXN K; 3T19 A; 3R9P A; 4CHN A; 4DQQ A; 4WQ4 C; 4FLU A; 4KRF A; 4KB0 A; 1RBT A; 4BRN A; 3EE9 A; 5AQM A; 1HJR A; 1BA1 A; 3LWL A; 4HCB A; 3CER A; 5C25 A; 4JS5 A; 4RWT A; 3V1Q A; 2QWQ A; 3KWI A; 4OGE A; 2FF3 B; 3AA5 X; 1VSF A; 3VA3 A; 5EY4 A; 4CHY A; 3QBW A; 4H8K A; 1VQM N; 1NGF A; 4CGI A; 1X9M A; 2OAN A; 3TAG A; 3KLF A; 4E1M A; 5IWA K; 4AH9 A; 2P9N A; 1WNS A; 4X64 K; 3AVM A; 3C6A A; 4FO0 A; 1TGO A; 5M1N A; 2P9K B; 4BR5 A; 3B6O A; 5C10 A; 3SZ2 A; 4LC9 B; 3ITH A; 3L4I A; 2UUA K; 3LL3 A; 4FYD A; 2KZZ A; 2E6M A; 2UU9 K; 3EKS A; 4CFA A; 1YJW N; 1TK5 A; 2NRH A; 4DKW A; 3NE6 A; 2QK9 A; 3QO9 A; 4I6M A; 2W42 A; 4GV9 A; 4CFC A; 1LV5 A; 4FJM A; 1HLU A; 1U48 A; 3VQA A; 3HBT A; 2IDO A; 1Q9Y A; 5AQY A; 5HBM A; 1TYQ A; 5CYQ A; 1HX1 A; 3MDQ A; 4JKG A; 1A5W A; 3VEO A; 3TAM A; 5BRE A; 1VSH A; 3D2E B; 4CFB A; 3THW B; 3T69 A; 3HSC A; 2O8B A; 4FJL A; 2O8E B; 2XY8 A; 5IT9 O; 2HF3 A; 3BGR A; 3D6R A; 1KRP A; 4AQY K; 3TSU A; 5HRP A; 4LFC K; 1ZBH A; 1YUW A; 3SBT A; 4DTR A; 2P5G A; 2OZS A; 4GKJ K; 4XH4 A; 1KXP A; 1EX4 A; 4H0V B; 1GLD G; 2QWL A; 3NDK A; 2XY5 A; 2QWR A; 4CD3 A; 2IVO A; 3OYB A; 1EKE A; 4DTP A; 1BUP A; 3AVJ A; 4CK2 A; 1S6Q A; 4AM7 A; 1QE1 A; 1IJJ A; 1W0H A; 3PO4 A; 2RPI A; 3CJ7 A; 5JMV A; 1NJZ A; 1IH7 A; 5GIO A; 5HRS A; 1P90 A; 2VQE K; 1D8Y A; 3KWG A; 2O8C A; 4LF9 K; 4OKK A; 5LL6 Z; 4GVE A; 3AO3 A; 4OO1 J; 3D2F B; 3LDP A; 4IDK A; 1GLJ O; 4JHD A; 3UKU A; 2V7Z A; 4FVU A; 1Q18 A; 2QWO A; 3L2R A; 2FBV A; 4JD2 B; 3LWM A; 1VSI A; 2GWJ A; 2P9I A; 4BQL A; 1LWC A; 3ZSY A; 4ZTJ A; 3WNH A; 3FFI A; 3BY5 A; 4B1V A; 4BQZ A; 4JKF A; 4BE0 A; 4KHY A; 2QI2 A; 3WUH A; 2E2Q A; 3DMJ A; 1S1T A; 3VEX A; 1NK4 A; 3O9S A; 4OGC A; 3SI6 A; 2G8V A; 4JKC A; 4CK1 A; 3P31 A; 3V4I A; 3QET A; 1VQ7 N; 1ZC6 A; 5MLC Q; 3DXK B; 1T3V A; 4FWS A; 1SKW A; 3O80 A; 5J1E A; 2RF2 A; 5HP1 A; 3MN6 A; 5F1X A; 3O3H A; 3K5M A; 2X6N A; 4DU3 A; 4MFB A; 3ZEU A; 3E9O A; 3NH0 A; 1QHA A; 3JXU A; 4DU4 A; 1OKJ A; 1C0M A; 3GOI A; 4H0Y B; 3OTO K; 4RW9 A; 2RHK A; 3MEC A; 1NG9 A; 2P9S B; 2FBX A; 3KKR A; 2FBY A; 1T6C A; 3MN5 A; 2GTD A; 3CQX A; 3KKS A; 4ELT A; 1F21 A; 3BZC A; 3C0B A; 2VGN A; 1U6Z A; 1O13 A; 2D5R A; 3Q7B A; 2KW4 A; 1NJI O; 1DT9 A; 3SQ1 A; 4DSL A; 4O4G A; 2IVN A; 2YNF A; 1ILY A; 3CCM N; 5CYM A; 3QB0 A; 2HHV A; 3VQQ A; 3QNO A; 2JWK A; 1W2B M; 3CFP A; 1NJY A; 1NGG A; 4BR2 A; 5TKW A; 2OPP A; 2E20 A; 3C7N A; 1X3M A; 4BRD A; 2PY5 A; 3KIO A; 2DFE A; 4KHQ A; 3U9Z A; 4LF8 K; 4FWL A; 5TKY A; 4DV7 K; 5AQX A; 4B9M A; 1NMN A; 2O4G A; 1NK0 A; 1ASV A; 4FWR A; 1OH5 A; 4DTS A; 2HBL A; 4ILH A; 3E9P A; 2E5L K; 3HK2 A; 3KTQ A; 4NLB A; 3DLH A; 2YKM A; 4A5B A; 3TPQ A; 1TKX A; 3CM6 A; 3JYT A; 2DFF A; 3TAF A; 1U49 A; 1BCO A; 1RTH A; 4CJE A; 1IG9 A; 1X9W A; 4A5A A; 1TKD A; 4GKK K; 4C1N K; 3QEV A; 1RT3 A; 3AVH A; 4M41 A; 3CCU N; 1EWQ A; 3THX B; 1YJ9 N; 3TAB A; 4YOY A; 3QFU A; 3J80 O; 5FDL A; 1LAV A; 4YDU A; 3WXI A; 1N34 K; 1LCU A; 3OY9 A; 4LD0 A; 3U6F A; 3C95 A; 1NGA A; 4IBN A; 3DOL A; 4IFY A; 5KI6 A; 2NRV A; 2ITM A; 2WC9 A; 5AZJ A; 3IFR A; 1DGK N; 4GY2 B; 3VTH A; 4E1N A; 4JNE A; 1UA1 A; 3NHG A; 3QEI A; 4BR4 A; 3SK3 A; 4DU1 A; 1VQL N; 2XY6 A; 3HZ6 A; 3VET A; 1VRT A; 1ZYQ A; 4RG8 A; 2YJF A; 4WQ4 A; 1NLV A; 1ZBS A; 1NGB A; 3TAE A; 1ZXO A; 1B92 A; 1ZBL A; 3VGL A; 1A5X A; 3ID8 A; 4W5O A; 3LZI A; 5AQV A; 3CCS N; 4KKO A; 3MMV A; 3NMU A; 1CZA N; 1LW2 A; 2QWM A; 3ASM A; 1RGI A; 2UXC K; 3OYH A; 3G4S N; 3IAY A; 3GE1 A; 3HST B; 1VQ8 N; 1BOT O; 3NBP A; 5BRD A; 4U7B A; 1QQO A; 1TVR A; 4DFM A; 3H45 C; 2UXD K; 4F3T A; 4H4M A; 2KKZ A; 3QBX A; 1ZBF A; 3CFO A; 1QZ6 A; 1OH7 A; 1HKB A; 5CZ2 A; 4BRL A; 3VQ9 A; 3P39 A; 1K8A O; 4BC2 A; 4G9Z A; 2P9U B; 3L8B A; 4Z4C A; 1TK0 A; 3DLR A; 3P38 A; 3EKU A; 3CCL N; 3SAH A; 1C1C A; 3BEX A; 3DAW A; 1TKZ A; 1VSJ A; 2YHA A; 1HQE A; 4RW4 A; 4NYN A; 4CEZ A; 4O0I A; 4CJV A; 3S9H A; 2KFZ A; 4BRE A; 4BVO A; 1TK8 A; 1YXQ A; 3M6G A; 3EO3 A; 4J2B A; 3BDP A; 3K5N A; 5KRT A; 3DXM A; 4FXD A; 2X6S A; 2YHB A; 5HRR A; 1QS4 A; 2DY4 A; 3C6U A; 3QES A; 2YCH A; 4CEC A; 2E2O A; 3M8R A; 2HHH K; 1TAU A; 1JLE A; 4JRQ A; 4XEI A; 3SV4 A; 3L2U A; 2IIR A; 1EO1 A; 2IOC A; 1RT6 A; 2UUC K; 4Q0B A; 3K9J A; 2VYP A; 4WQ5 C; 1N6Q A; 2ZF5 O; 5CE3 A; 2Q97 A; 1VK0 A; 3VOV A; 2ETJ A; 4HTU A; 3VEZ A; 4OPH A; 3CJB A; 4JKA A; 4CF1 A; 3PIO L; 5FRM A; 1CZB A; 4CJT A; 2XY7 A; 3ZLJ A; 5KPZ A; 4IJN A; 2I7N A; 3OYN A; 5J2N A; 4KTW A; 1J5E K; 3RMB A; 3WT0 A; 4DR4 K; 5FPM A; 3HTV A; 1BQM A; 4M3T A; 4IEE A; 3G6E N; 2P9N B; 2F9W A; 4K8X A; 4CIF A; 2GX9 A; 5KQD A; 2G8F A; 4Z94 A; 5BRH A; 4ZTF A; 3KLE A; 5DM7 L; 2WON A; 3O4Q A; 5KGW A; 4CHP A; 4E3S A; 2ASO A; 4XIU A; 1JL1 A; 1HNI A; 4FWN A; 4LSL A; 3BZK A; 4YFU A; 5KPR A; 4DSK A; 1JKH A; 1WSF A; 3K5O A; 1W7A A; 1WBB A; 4QAG A; 4I6M B; 5EU7 A; 4HVJ A; 5BRF A; 5CZ1 A; 4FJH A; 1K73 O; 3HPO A; 1NGD A; 4B3S K; 5EVZ A; 5M1F A; 4DQS A; 1LWF A; 4IG3 A; 4BE2 A; 1RTI A; 5M1P A; 2PFU A; 4PL7 A; 3QIP A; 5I3U A; 1TYQ B; 4JKG B; 2F96 A; 4LFB K; 2YHX A; 5JLF A; 1S1V A; 1NJX A; 3OVN A; 1KVB A; 1NGE A; 3CM5 A; 5AR0 A; 1NGC A; 4MDA A; 4CZI A; 2O8B B; 3TSP A; 3CIP A; 4CF8 A; 4EZ9 A; 1J5O A; 1KC8 O; 4FLT A; 2VG7 A; 2XHB A; 3A5O C; 1NK6 A; 4MLH A; 3ULE B; 3O4N A; 4YOV A; 4BRO A; 4CJR A; 3SMS A; 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