The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
207
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structure length |
197
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Chain Sequence |
DIGSEFEGQELIVRAAVSELDPSNTIWLDIEGPPTDPVELALYQPAKKQYIHCFRKPHDEKGFKNGSRHSHGILMKDIEDAVPGVLSYVIGLLPPNMVITTQGSDDIRKLLDIHGRKDLKLIDVKFTSDQARQFEHQVWDKFGHLCKQHNGVIISKPSPDEPHCALLDCIMFHSAMSGELPKEEPIPLLPKEFLFFP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Tacaribe virus
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| molecule tags |
Viral protein
|
| molecule keywords |
Nucleoprotein
|
| total genus |
57
|
| structure length |
197
|
| sequence length |
207
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3Q7B A; 4G9Z A; 3Q7C A; 4GVE A; 3MX5 A; 3MX2 A; 3MWP A; 4GV9 A; 4GV6 A; 3R3L A; 3MWT A; 4FVU A; 4GV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CGJ A; 3WNF A; 1IG9 A; 2HOE A; 4DTS A; 4JKG B; 4CE9 A; 2KLA A; 4CHP A; 1RT5 A; 2IOC A; 3BGR A; 3EKS A; 5HRS A; 2BAN A; 3NH0 A; 3AO4 A; 4H4M A; 1BL3 A; 2JLE A; 3KLH A; 4F2R A; 2HVI A; 2YHX A; 2F96 A; 1GOC A; 3CG7 A; 3ZX0 A; 1KAX A; 1C0M A; 3O5B A; 3O9S A; 2KFZ A; 1EXQ A; 3VTH A; 2KKZ A; 3L8B A; 3CJ7 A; 2QM1 A; 4DTJ A; 5AQY A; 3VER A; 1IKW A; 4CHY A; 2QA4 N; 1K6Y A; 3B8A X; 3AVG A; 4OLA A; 3CYM A; 4BVO A; 1Q82 O; 2G8I A; 1LWF A; 2D5R A; 3ZLJ A; 5AQM A; 4CHO A; 3KLI A; 5I3U A; 5JLF A; 4IO9 L; 5E41 A; 3NH2 A; 4NB4 A; 4H5N A; 3T69 A; 4DLE A; 4RTF D; 4BG9 A; 4JI7 K; 1JLB A; 3A5N C; 3HOT A; 4OPA A; 5C42 A; 1NOZ A; 1IKV A; 1REV A; 4JKG A; 4LH5 A; 4FWN A; 3KD5 E; 4WQ5 A; 3G6E N; 4E19 A; 3NDK A; 1U49 A; 4PWD A; 3CQX A; 4CBX A; 1H1V A; 3OJU A; 3KK2 A; 3SQ4 A; 4WQ5 C; 2E2O A; 3ULD A; 3CCS N; 3SV4 A; 3OYM A; 4OX9 K; 4JKB A; 1NMD A; 4KTQ A; 3GG4 A; 2XO7 A; 4DQS A; 4N5S A; 3QEI A; 4KB0 A; 5C2F A; 3RSE A; 3BF1 A; 4F9O A; 2A6A A; 3OTO K; 2UU9 K; 1TAQ A; 2D1K A; 5JVH L; 4M3X A; 4BR5 A; 1RIL A; 1JCF A; 4FVM A; 1IKX A; 1QHA A; 1LAV A; 1Z05 A; 4B1Y B; 1BA1 A; 3BEX A; 3QFU A; 3P39 A; 4DR6 K; 3FLC O; 3O8M A; 1QQN A; 4RW4 A; 4AHT A; 4FM2 A; 4MLE A; 1U2V A; 4H0O A; 4DUZ K; 3DRR A; 5CYM A; 3RRG A; 2RE2 A; 1FW6 A; 3CER A; 5BPM A; 4B1U B; 1NGF A; 4YOW A; 3R9P A; 3EZW A; 3SQ0 A; 3HBT A; 4JI2 K; 1C1C A; 5AZI A; 5M1P A; 5AZJ A; 4WFA L; 1QQO A; 1HRH A; 1XC9 A; 5F2R A; 5AQV A; 1SL0 A; 3H3O B; 2NRX A; 3OYN A; 4GY2 B; 3PX6 A; 3J8A A; 1QZ5 A; 4FW2 A; 3AAP A; 3S9H A; 4DF4 A; 1TUY A; 5HRR A; 4FJ8 A; 2P9I A; 3O3H A; 2PY5 A; 4LF5 K; 1C0F A; 2NNW A; 3L2U A; 2Q0R A; 2Q1N A; 4QAG A; 3TAB A; 3A5L C; 3T19 A; 3ZSO A; 1XHZ A; 4NXM K; 2KZZ A; 1S6P A; 1NGD A; 3UE5 A; 1O13 A; 3ID8 A; 5AQL A; 3PV8 A; 3NMU A; 5JS1 A; 4PY5 A; 1OVY A; 2X6N A; 2ZJQ L; 3AGR A; 4MFB A; 3WT0 A; 1W0H A; 1LWC A; 4BDZ A; 3S3N A; 1WSG A; 4CZK A; 2DY4 A; 2V51 B; 3SAG A; 4R5P A; 4DFJ A; 3DI6 A; 4B3O A; 4CK3 A; 1VRU A; 4C8L A; 1E3M A; 2HHW A; 2OTL N; 4K25 A; 2P9P A; 3D2E A; 2A1S A; 3EEQ A; 3QML A; 1TK5 A; 3KK1 A; 2Q0U A; 3K58 A; 1NJW A; 4CEZ A; 1WUA A; 5FDL A; 1MU2 A; 3HOS A; 2ASP A; 3KLE A; 4DTN A; 4DU1 A; 3AVL A; 4CJQ A; 1QZ6 A; 3P4I A; 3V6D A; 2FSK A; 3NF6 A; 4IFY A; 3ASM A; 1BIS A; 1OVQ A; 4JK8 A; 1RBV A; 5CZ2 A; 1BDG A; 2QI2 A; 3E9P A; 4KRF A; 4CEE A; 4DCH A; 2AA4 A; 1J9A A; 3H1V X; 2F9W A; 1T6D A; 2QWO A; 3M6G A; 1KD1 O; 1U04 A; 2KFN A; 2NRZ A; 3MDQ A; 4I6M A; 4I7F A; 5K14 A; 5BPN A; 3OYA A; 3MEC A; 5AQP A; 3OYC A; 3SUP A; 5GAH P; 4PQU A; 1MA9 B; 4FOE A; 2IVN A; 2VWK A; 4AH9 A; 4B9Q A; 4M7Y A; 5AQX A; 4BQL A; 2O8F B; 4DV0 K; 3N4P A; 1SUQ A; 2PZS A; 1BCM A; 1VAZ A; 3ZSW A; 3CJC A; 4EZ6 A; 3ZX2 A; 1OH7 A; 3RMB A; 5IWA K; 5HBM A; 5FRM A; 4O44 A; 4HWI A; 1LCU A; 3U3Y A; 3UB5 A; 4ILJ A; 4B9N A; 2HNY A; 3WQT A; 4IEI A; 2P9I B; 4B1Z A; 4DMN A; 2PYJ A; 3CF5 L; 3S3O A; 4I9L A; 1T7P A; 2A5X A; 4CFB A; 1NGA A; 1SL2 A; 2GWK A; 4IEE A; 2O8F A; 5J2P A; 4L8R B; 3HYF A; 2UXD K; 3A5M C; 4FLZ A; 4JAX A; 3SPY A; 4WF9 L; 2FSJ A; 1YIJ N; 3GOI A; 4KHS A; 3JS6 A; 3OYK A; 5M1Q A; 3F73 A; 3HI0 A; 2AP1 A; 3KIO A; 4FPA A; 4PL8 A; 4W5R A; 3IUC A; 1VSE A; 1IH7 A; 3KJV A; 2P5G A; 3DLH A; 4LC9 B; 3ATV A; 1KC8 O; 1LW2 A; 1JJ2 M; 2FF6 A; 1VQP N; 1NG9 A; 2O8D B; 4O4G A; 3OYG A; 1CLQ A; 4DV5 K; 2RKI A; 1GOB A; 4CFC A; 3LZI A; 1YIT N; 3T3F A; 3MEE A; 4JI4 K; 1XNQ K; 2HMI A; 4Z0U A; 4FLX A; 2GBZ A; 4ZHR A; 5AFU H; 4DF8 A; 2P9L A; 3EZ5 A; 4DTP A; 4CFD A; 4E1N A; 4M3U A; 1CZ9 A; 5BRD A; 1VQ6 N; 1J6Z A; 3VMF B; 4DUY K; 3UKU B; 3VF6 A; 1XUP O; 4JKH A; 3ZT2 A; 3AVJ A; 1M90 O; 4DSL A; 1Z6R A; 5KGW A; 4DS4 A; 3O4N A; 3G25 A; 5D3G A; 3SK3 A; 1TKT A; 3WXM B; 1L3S A; 3AO2 A; 3HPG A; 3CC2 N; 1A5X A; 4HCB A; 3O08 A; 1TK8 A; 3CCM N; 4X62 K; 4Y1C A; 2G8H A; 1NJX A; 2DFE A; 2IC3 A; 3NE6 A; 3PLA A; 4NCB A; 4ELT A; 4IOX A; 4FWK A; 3L3U A; 5FPD A; 3CPE A; 4IXC A; 1IKY A; 4NYF A; 4DSF A; 1FXX A; 4KO0 A; 3VEZ A; 2ZJR L; 3J80 O; 3QEW A; 4DR5 K; 4DQI A; 4B8C A; 4WQ4 C; 3WQU A; 3VOV A; 4AF1 A; 3NHG A; 3ENB A; 3M8R A; 3BZK A; 1IBK K; 4WE1 A; 1I94 K; 4YNQ A; 3LP3 A; 4CI6 A; 1D4X A; 1NK5 A; 2ZF5 O; 4FCY A; 1YTA A; 4FWP A; 3QBX A; 4RW7 A; 4AIL C; 1WBD A; 3P31 A; 2ASO A; 1HKB A; 4CD3 A; 4CJE A; 3OYI A; 5E26 A; 5EXW A; 3THW A; 3IKM A; 2KTQ A; 3MX2 A; 1X9W A; 2DTU A; 4F3O A; 1SS6 A; 2YKM A; 4Z4E A; 2XY8 A; 1KQS M; 1ZBF A; 3C0B A; 4J8F A; 1A5W A; 3QB0 A; 4O55 A; 5KGX A; 3TPQ A; 4H0X B; 3F5T A; 3VEO A; 3P5J A; 4IO8 A; 2P9N A; 4X66 K; 1KRP A; 2WBN A; 5KPT A; 3QNO A; 2F9T A; 2D4W A; 5KRS A; 4X64 K; 1JXE A; 1S5J A; 1CZB A; 2LSN A; 5GAD P; 5AQU A; 2YHA A; 5CZ1 A; 4KTW A; 5DM6 L; 1NJY A; 2QXL A; 3FZM A; 2NRV A; 2OZM A; 3ZT1 A; 3HXM A; 3T7Z A; 2JGU A; 2IS3 A; 1NKB A; 3E1Y A; 2E8A A; 3TTD A; 3A8Y A; 1WSJ A; 2D0C A; 3EL2 A; 4FJI A; 4B8A B; 4FW1 A; 3ZSV A; 3NF7 A; 1BHL A; 4YY3 K; 2ZGZ A; 4QS8 A; 4KH6 A; 1ITG A; 1TYQ B; 3WXK A; 4CZF A; 3ZSX A; 1ZYQ A; 4E7I A; 1IG8 A; 5BRE A; 1Z25 A; 3G10 A; 1UWB A; 1NK8 A; 4I6M B; 4LD0 A; 2XY6 A; 4KHY A; 4CJ3 A; 2WC9 A; 4KKO A; 1N5Y A; 1NGH A; 3ID6 A; 1NU0 A; 2ITM A; 4HTL A; 1NGB A; 3E9O A; 4KB1 A; 3HP9 A; 1TK0 A; 3TSP A; 5BPL A; 3LAM A; 4KHW A; 4UY8 O; 3SLC A; 2WON A; 3EN9 A; 3ULE A; 4FLV A; 3B6O A; 3CM6 A; 4HUF A; 1SQK A; 2QWN A; 4JKC A; 4AHU A; 2DFF A; 3KKR A; 1CXU A; 3CJA A; 4TSX A; 3CD6 N; 3HO1 A; 3TSU A; 3L4I A; 1XC3 A; 3AVN A; 5CE3 A; 4LF8 K; 3LP0 A; 4CF0 A; 4CZM A; 1KSP A; 4F4K A; 4GKK K; 4CJR A; 3CFO A; 3HTV A; 2QWL A; 2B4J A; 4CGG A; 1RTH A; 3DJC A; 5F1X A; 1DT9 A; 4N76 A; 1VQN N; 1RT6 A; 4M3R A; 1B9D A; 2FLO A; 4Q5V A; 3UKR A; 2I7P A; 2FBT A; 3K9K A; 2E6M A; 1N32 K; 2KZM A; 3SV3 A; 4NLC A; 4E7L A; 4Z4C A; 1NGG A; 4OPK A; 3CQY A; 5SZT A; 3AVH A; 1JLG A; 4ELV A; 5EVZ A; 4JHD A; 5E84 A; 4FJK A; 1S1T A; 1RBS A; 1TVR A; 3ZEU B; 2WFB A; 2PFU A; 4IBN A; 5AR0 A; 4WQ4 A; 4FM1 A; 3WXJ A; 2YNI A; 4M3Z A; 3NF9 A; 1X9S A; 4DKW A; 2GUI A; 1NMN A; 5AQO A; 3CCJ N; 3QEV A; 1NJZ A; 1LV5 A; 2HBL A; 3K57 A; 3JAM O; 3NGZ A; 2Z1G A; 1FK9 A; 3EE9 A; 1TL3 A; 2NUB A; 2CH6 A; 4FXD A; 1DTQ A; 3QO9 A; 3P38 A; 4ZTF A; 5AQF A; 2ITG A; 1U47 A; 4FJM A; 2E6L A; 3I55 N; 1BI4 A; 1KCF A; 1J53 A; 3CC4 N; 5FRO A; 3ZT4 A; 4CHN A; 1ASW A; 1RDW X; 4PL7 A; 2ZM6 K; 2GEM A; 3H46 O; 3R1X A; 4BG8 A; 3FFK B; 3QES A; 1BG3 A; 5CR4 A; 2CH5 A; 4NYN A; 1Q8I A; 1YT3 A; 1R59 O; 2O8C A; 1BU6 O; 1T44 A; 1G15 A; 4FK4 A; 2P9P B; 3D2E B; 2CGL A; 4CIG A; 4M63 C; 3SUO A; 2HF3 A; 4JD2 A; 4ID5 A; 3NVM A; 3TSQ A; 4DV6 K; 5J2N A; 2O8E A; 1W2B M; 4BY9 C; 3VQ8 A; 4B3T K; 1TUU A; 2XY7 A; 3DLG A; 3CI5 A; 2JWL A; 3O6W A; 4CK1 A; 4CZH A; 1VRT A; 1P8Z A; 1IBL K; 4XH1 A; 2GX9 A; 3CJB A; 4DSI A; 4E3S A; 2A1R A; 1BGX T; 3VTI A; 4XEI A; 1RBR A; 2HF4 A; 4QCL A; 4CJU A; 4BRQ A; 4CEQ A; 1KAZ A; 3PY8 A; 4BRG A; 1YJW N; 4ILH A; 4F8R A; 2F8T A; 4A62 A; 3CCE N; 1K8A O; 3H1Q A; 3KHY A; 4HHT A; 3ZSZ A; 3F9K A; 3BP8 A; 4LY7 A; 3VQ9 A; 4JS4 A; 3ZEU A; 4LFB K; 1T6C A; 3C94 A; 2Q2R A; 1UAX A; 3IRX A; 3KK3 A; 4IKF A; 4JI8 K; 5B8H A; 2DPN A; 3OYE A; 3KLG A; 5FLX O; 1L3V A; 5JVG L; 3AVM A; 4BGB A; 3OS0 A; 2P9N B; 1WAJ A; 1VSJ A; 2I7N A; 1ATR A; 3SMP A; 1NK7 A; 1NLV A; 4M3W A; 1KFD A; 4HVJ A; 1JLA A; 4E7H A; 2GTD A; 4DQR A; 1N8R O; 4IFV A; 3LP1 A; 4RCH A; 4JI1 K; 2HHQ A; 4E1M A; 4Y0W A; 1NWK A; 4OKJ A; 3U4L A; 4KAZ A; 2WOM A; 3CCU N; 4NCA A; 5ELZ A; 4FJL A; 3MXM A; 4K41 A; 2QXF A; 4H5T A; 3ZSQ A; 4CGD A; 4YOR A; 4IDK A; 4OPJ A; 4MO5 A; 1W9H A; 4FSV A; 3TAE A; 3VQP A; 1D5A A; 2P9K A; 3NBP A; 3WEE B; 2W6L A; 4W5N A; 4B9V A; 1VSM A; 1BQM A; 4CEA A; 3L3V A; 1ZBI A; 1GLC G; 3HRG A; 4KV8 A; 3NVK A; 3O3G A; 3R6M A; 4PA1 A; 1Q18 A; 3MX5 A; 3NFA A; 4IJA A; 3SUN A; 3OS1 A; 3J7Z O; 4H0V B; 2PYL A; 1WSH A; 2HBK A; 3DLR A; 3I56 N; 3LM2 A; 4CJP A; 4HCC A; 4H4O A; 5HRO A; 3TWH A; 4BAC A; 4NLB A; 2HHH K; 3LPT A; 2QWP A; 3AAQ A; 5FPM A; 1SKR A; 3RR7 A; 4JLH A; 5LL6 Z; 3HPH A; 4GV6 A; 2E4L A; 3H45 C; 4HUE A; 1VQ5 N; 1U4B A; 3KK7 A; 3O4W A; 3MAQ A; 4YOX A; 4JV5 K; 1KVA A; 4KBO A; 4C23 A; 3S41 A; 3O1W A; 2UUC K; 4M45 A; 3MN6 A; 3CC7 N; 1KXP A; 1RGI A; 4LH4 A; 1MWK A; 5KTQ A; 3BDP A; 4XIU A; 1L3U A; 4BC3 A; 4YOT A; 4CJF A; 3B6P A; 3K2P A; 5FPE A; 5GIO A; 3U9Z A; 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1JLE A; 1NK6 A; 1YAG A; 5GAG P; 3WUH A; 2RF2 A; 4E0D A; 2ZE2 A; 4YHH K; 3THY B; 1NK4 A; 4JN4 A; 2O4I A; 1NK9 A; 1HUX A; 2ZWH A; 3D7E O; 3KD1 E; 4FZX C; 1QS4 A; 3VET A; 4BR0 A; 3CJ9 A; 2F8S A; 1C6V A; 3J81 O; 2OTJ N; 2E5L K; 4JEP A; 3C65 A; 1L3T A; 1RBU A; 1SV5 A; 3IS9 A; 4DU3 A; 4C8M A; 3RVC A; 1S6Q A; 2NRR A; 3SBT A; 1S9E A; 3SZ2 A; 4AHV A; 4CJ7 A; 3NGY A; 4B1W B; 4FJ7 A; 4B9U A; 2RPI A; 1X1P A; 4CES A; 1VSI A; 4FLY A; 1JL1 A; 2DFH A; 1N34 K; 3OW2 M; 3C95 A; 2VWJ A; 5C2D A; 3DRS A; 1UA1 A; 1YTU A; 2YKN A; 4N41 A; 5LMU K; 4FLT A; 3MK6 A; 1C0T A; 2HBM A; 4IG0 A; 5HRP A; 1BUP A; 1Q81 O; 4MDA A; 4A57 A; 3AY9 A; 3VEW A; 4KHN A; 4CJ4 A; 3CCL N; 1JXB A; 3HSC A; 3MXI A; 3DOL A; 2O8D A; 4ILG B; 1RBT A; 2V7Z A; 3HPO A; 3ZYY X; 1RFQ A; 4LSL A; 4C8N A; 3GDQ A; 4FYD A; 5DM7 L; 3MCA B; 4BRF A; 1JLQ A; 1BIU A; 4M3Y A; 3RSE B; 2D0B A; 2YCH A; 1ASV A; 4KTZ A; 4BRE A; 3TTC A; 1OH6 A; 1IV0 A; 5M1O A; 1B9F A; 3LDQ A; 1YJ9 N; 1NKC A; 3L6Q A; 1YVN A; 5AQS A; 1KLM A; 3OA9 A; 5SWM A; 4JRP A; 3MWP A; 4JI5 K; 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