The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
207
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structure length |
197
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Chain Sequence |
DIGSEFEGQELIVRAAVSELDPSNTIWLDIEGPPTDPVELALYQPAKKQYIHCFRKPHDEKGFKNGSRHSHGILMKDIEDAVPGVLSYVIGLLPPNMVITTQGSDDIRKLLDIHGRKDLKLIDVKFTSDQARQFEHQVWDKFGHLCKQHNGVIISKPSPDEPHCALLDCIMFHSAMSGELPKEEPIPLLPKEFLFFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Nucleoprotein
|
| publication title |
Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Tacaribe virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| total genus |
57
|
| structure length |
197
|
| sequence length |
207
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MX2 A; 3R3L A; 3MX5 A; 4GV6 A; 4G9Z A; 4GV9 A; 3MWT A; 3Q7C A; 3Q7B A; 4FVU A; 3MWP A; 4GVE A; 4GV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5BN9 A; 3O6W A; 2G8I A; 1IBK K; 5FPM A; 2Z1G A; 4KV8 A; 1DTQ A; 4KB0 A; 4JI5 K; 5CE3 A; 3OYN A; 1TYQ A; 1RT4 A; 3M8S A; 3U4L A; 4EAH D; 3NF7 A; 3BDP A; 3LWM A; 5DK5 A; 3OS2 A; 4J2E A; 2ITM A; 3TI0 A; 1NJW A; 1MA9 B; 4DU3 A; 5CZ1 A; 5B8H A; 2NRW A; 2OZM A; 2JLE A; 4FM2 A; 2EHG A; 4BR4 A; 3CPW M; 5FPN A; 5BR9 A; 1K73 O; 4FJJ A; 1S72 N; 2ATQ A; 1VSK A; 1UAX A; 2F9W A; 2HBL A; 4RW4 A; 3VEV A; 4DV3 K; 3T19 A; 5MLC Q; 1REV A; 1NGC A; 3G71 N; 2YX6 A; 4FLU A; 1YIT N; 2O8F B; 1D5A A; 1S3X A; 4ISG A; 4JKE A; 2IAJ A; 2DFF A; 2FXU A; 2V7Z A; 3D0P A; 2O4G A; 2OYQ A; 4DR4 K; 5AQV A; 3M1F A; 5I42 A; 3QLH A; 4EIA A; 3QEI A; 1FJG K; 3G4S N; 3ULE A; 3S9H A; 1QQM A; 4MFB A; 4CFB A; 3RTV A; 1BQM A; 4DS4 A; 3VEW A; 3SCX A; 1IJJ A; 1CXU A; 3LAK A; 4JKF A; 1C0F A; 1TL1 A; 4R5P A; 3QEV A; 2Q36 A; 4CJ7 A; 4DR1 K; 3CM5 A; 2YKM A; 3M3Z A; 4MLE A; 1HPZ A; 4NXM K; 3M8P A; 2PYJ A; 2BGG A; 4CJV A; 3QBX A; 2Y1I A; 1NKB A; 4CZF A; 2P9S B; 1IG9 A; 1NKE A; 4H5N A; 3OYH A; 3IG1 A; 5ADX A; 3CYM A; 3ZCM A; 3O9U A; 3H1Q A; 4PQU A; 2DY4 A; 2YCH A; 1RFQ A; 1TK5 A; 3QFU A; 4JKA A; 4BWM A; 3K9K A; 4DSK A; 3NF8 A; 3MEG A; 2FBV A; 1ASV A; 4X66 K; 4CZH A; 1W7A A; 4KTW A; 4K42 A; 2YHX A; 2P9K B; 3H08 A; 4FK4 A; 3E9L A; 3OA9 A; 4CD1 A; 4F9O A; 1YTU A; 4CHY A; 1O13 A; 3P83 D; 4FJI A; 3ZT0 A; 3H1V X; 2E8A A; 5EY4 A; 4BRO A; 4DV1 K; 3RMD A; 5JLF A; 5ELZ A; 2A40 A; 4PL8 A; 2O8B A; 2A41 A; 1VRU A; 4CGH A; 1C0G A; 3HP6 A; 1RTI A; 2DPN A; 3JS6 A; 4CF2 A; 3TR8 A; 2YI1 A; 1GLF O; 3ZX0 A; 1VSJ A; 1J5O A; 3OY9 A; 1VQL N; 1TYQ B; 1KTQ A; 1NGH A; 3NAE A; 1Q8I A; 1SS6 A; 3D6R A; 2X74 A; 3P38 A; 3TSU A; 4A62 A; 3WNH A; 3AVL A; 3K5O A; 3QML A; 4FL9 A; 2IVP A; 1BIS A; 1YJ9 N; 1NK0 A; 1GLE G; 4DTR A; 3O4W A; 1S6Q A; 3VQ9 A; 4B1W B; 3K2P A; 4JKC A; 4FJH A; 4R79 A; 1NK4 A; 2GTD A; 2YHY A; 3MN6 A; 3IUC A; 4DSJ A; 3OVN A; 3M5R A; 3V4I A; 3QIO A; 5E84 A; 5AQI A; 1WSF A; 4AHT A; 4CJK A; 3VEZ A; 1Y64 A; 2P51 A; 1DGK N; 3AVJ A; 4JK9 A; 3NH1 A; 1YIJ N; 3ULE B; 5JVG L; 1JJ2 M; 1J6Z A; 4QS7 A; 5EU7 A; 3EL2 A; 1NGA A; 1BGX T; 3FR0 A; 1U04 A; 4OKJ A; 3MX5 A; 1BOT O; 3I8D A; 1ATR A; 4CK2 A; 3K5N A; 3U3G A; 3K9J A; 4DWI A; 4DF4 A; 1ZBS A; 1D9F A; 4Z4E A; 4YOW A; 4OKE A; 4OPJ A; 4I6M A; 3ZX3 A; 1BO5 O; 3AA4 A; 1NLV A; 3TAR A; 3ZSX A; 1QZ6 A; 1RIL A; 4PL7 A; 3F2K A; 1SL2 A; 4IEI A; 1TUY A; 4BRH A; 1CLQ A; 3O9Q A; 1L3U A; 1XWL A; 2CGK A; 1N34 K; 3EKU A; 3NBP A; 4JD2 A; 3J8A A; 2FSN A; 3AVK A; 3CC4 N; 3CJC A; 2UXD K; 3CCR N; 3DM2 A; 3QIP A; 3KK1 A; 4OPA A; 2XY6 A; 2QTD A; 3U3Y A; 5CZ2 A; 5GAH P; 3C6T A; 4NB4 A; 1K8K A; 2KKZ A; 4RW6 A; 3BZK A; 4C8L A; 4LSN A; 2O8B B; 4DU4 A; 3J7Z O; 4W5O A; 5AQU A; 1YXQ A; 1ZBH A; 5C25 A; 1XI1 A; 1A5W A; 1VHX A; 4KHW A; 3EY1 A; 1X3M A; 3CIP A; 1I39 A; 3ZSR A; 2IVO A; 2A1S A; 1VK0 A; 5ADX H; 2NUB A; 4K43 A; 4DR5 K; 3UKR B; 1KVC A; 5KQ8 A; 1VQK N; 4J2B A; 1YI2 N; 1EO1 A; 2AP1 A; 4IDH A; 2E20 A; 5HRS A; 1JLB A; 2HHS A; 2E88 A; 3QBW A; 2I5J A; 4A57 A; 4M7X A; 4HCC A; 2PY5 A; 1O1W A; 4IBN A; 1RTH A; 3HXM A; 4YOV A; 3QIN A; 5FRN A; 4X65 K; 1Q18 A; 4B8C A; 4FJK A; 1QQC A; 1NJX A; 5F2R A; 3GOI A; 5BRE A; 2Z1I A; 4M45 A; 3E1Y A; 4HTL A; 4F3T A; 4EZ9 A; 2F9T A; 4FJG A; 1KSP A; 4DTU A; 1IG8 A; 2EWS A; 2WFB A; 4I2Q A; 1W0H A; 1QVF M; 1C0M A; 4CEQ A; 4AHS A; 3AO3 A; 5D3G A; 4KHN A; 1W2B M; 4FWQ A; 1LV5 A; 1V4T A; 4CZL A; 3AO4 A; 2BTF A; 4O8U A; 2YHW A; 3V9X A; 3K5L A; 3FE1 A; 3H6E A; 3O4Q A; 5C12 A; 4MO4 A; 2QXF A; 3T7Z A; 3V9Z A; 4CER A; 4YOY A; 3VA3 A; 3I8B A; 4YOX A; 1UOC A; 4PHT X; 4BWJ A; 4DTJ A; 3VQB A; 3SUN A; 2G8F A; 5C10 A; 4JRQ A; 4LFA K; 4DLE A; 1LAW A; 1GLJ O; 2KQ2 A; 4I6M B; 1GLB G; 3IS9 A; 1OKJ A; 4C8M A; 3QIC A; 3THW A; 1S6P A; 3VF6 A; 4DTM A; 3T1A A; 3OTO K; 2ZM6 K; 1NGE A; 4CHQ A; 4M42 A; 4DKW A; 4IO9 L; 4ILH A; 4I9L A; 1WSJ A; 1A5X A; 2HF3 A; 4H5R A; 5FPE A; 2OZS A; 4CD3 A; 4CE9 A; 3FFK B; 2HMI A; 4H5W A; 4CW7 B; 5KTQ A; 3GG4 A; 5AQT A; 4DTX A; 1BDG A; 3R8E A; 1OVQ A; 1S1W A; 1EXQ A; 2CGL A; 2OAN A; 4B9U A; 3JSM A; 1XUP O; 4H8K A; 3QNN A; 4ZTJ A; 5BPL A; 2QI2 A; 3NGI A; 1KCF A; 5SZT A; 5AQR A; 2NRV A; 2WC9 A; 1KVB A; 1V4S A; 3ID6 A; 3SUQ A; 3RMC A; 3QO9 A; 3H3N O; 4QS9 A; 1HKC A; 4H4M A; 2BH1 A; 4JEP A; 1RCH A; 1TAQ A; 1WAF A; 1WN7 A; 5J2Q A; 4E1M A; 1NK8 A; 4Q5V A; 1VQM N; 3L2W A; 3FFI A; 3MWP A; 4KHS A; 4CBX A; 3MAQ A; 4RCH A; 1TKZ A; 2XHB A; 4DFK A; 1GOB A; 3CPE A; 1DKG D; 5T7B A; 1NGI A; 4RG8 A; 4DTO A; 1XQS C; 1HQE A; 4CHZ A; 2D0A A; 1F21 A; 3P1G A; 4FYD A; 4BGB A; 4C1N K; 2KHO A; 1KXP A; 3F73 A; 4DFM A; 3T1Y K; 4OGE A; 4CJW A; 4EHT A; 3QER A; 2HHQ A; 1M1K O; 3WXI A; 1T6D A; 4FWK A; 2HMP A; 1RBV A; 3OBY A; 5GAD P; 4E7L A; 5LJV A; 3VQE A; 3O4N A; 3VEY A; 3WQT A; 4DR3 K; 4DB3 A; 3LZI A; 3AV9 A; 4M3X A; 1HMV A; 2QKB A; 4BVP A; 4KO0 A; 3PSF A; 4G9Z A; 3BY5 A; 1IBM K; 4IFV A; 4W5R A; 5E26 A; 1TKT A; 2Q0R A; 2P5G A; 4MLH A; 3PSI A; 1NK6 A; 2UYT A; 3CJ7 A; 3G0Z A; 3MX2 A; 3DAW A; 4JI2 K; 4XH1 A; 4WQ5 C; 2Q3S A; 4CHP A; 4WE1 A; 1P90 A; 4WYB A; 4DHY A; 4EZ6 A; 5H1S Q; 4LC9 B; 4CIE A; 4B9N A; 3L0Q A; 2E2P A; 3NE6 A; 2WTU A; 5AQY A; 3CCJ N; 3PIO L; 2QWR A; 3ZET B; 3LDN A; 4C8O A; 5BRH A; 4BRG A; 3MN5 A; 3MXJ A; 4KI6 A; 1D8Y A; 1NK9 A; 2Y1J A; 4NLB A; 3QET A; 4KH4 A; 3V9S A; 1B9D A; 2ZJQ L; 3L8B A; 3ZSZ A; 2D4W A; 1N5Y A; 5LJW A; 3C95 A; 1NOZ A; 2QWL A; 4CHN A; 3LWL A; 3ATU A; 2QK9 A; 4B9L A; 2VQF K; 4OGC A; 1T03 A; 1FKP A; 1NMD A; 3EZ5 A; 1G99 A; 2IDO A; 2KLA A; 5GAG P; 2E4L A; 4CJL A; 2QM1 A; 2IGI A; 1Q86 O; 4UY8 O; 3TTC A; 1K8A O; 2HST A; 3DJC A; 3BZC A; 3SUP A; 1QSS A; 4V19 S; 4N5S A; 3AVI A; 1C1A A; 4M3T A; 4KBO A; 3H3O B; 2RPI A; 1BG3 A; 4ID5 A; 2HHU A; 1ZBU A; 4LF7 K; 4IZ9 A; 3TTD A; 3CQ8 A; 3LDS A; 3AVA A; 2BAN A; 4B3T K; 5FLX O; 3HSC A; 5M1Q A; 1UA0 A; 4CCH A; 3NH0 A; 4IOX A; 1ILY A; 2ITG A; 3A8Y A; 1TKD A; 4IJN A; 4CFC A; 3M6G A; 1RNH A; 4CES A; 5BRD A; 4YY3 K; 3MCP A; 5JMV A; 2F8S A; 3LP0 A; 2GUP A; 1VQO N; 4FWO A; 2HNY A; 1HUX A; 1UWB A; 4DCH A; 2A6A A; 4I9Q A; 3OYA A; 3L3V A; 1R59 O; 5BPM A; 3C7N A; 2GBZ A; 4ILJ A; 1HX1 A; 2OTL N; 3KJV A; 4CIG A; 2XY5 A; 4FZZ A; 1TVR A; 3VQ6 A; 3S41 A; 2PFU A; 4CGJ A; 2E6L A; 3IRX A; 1EKE A; 4ICL A; 1VAZ A; 4DV4 K; 2XRI A; 3LDO A; 3MCA B; 4CZG A; 4IG3 A; 2Z1H A; 2YHA A; 3HK2 A; 3C65 A; 5KPT A; 1BU6 O; 1NK7 A; 4JN4 A; 4B3O A; 1RDA A; 5F0X A; 5C2F A; 4DV5 K; 2Q31 A; 4JKD A; 1WOQ A; 4JI3 K; 1YVN A; 4QS8 A; 1KAZ A; 4DQR A; 1HQU A; 3S3M A; 1HNV A; 4M3R A; 4JHD A; 4CJT A; 4DV2 K; 4OLA A; 3SAF A; 2PYL A; 2W41 A; 3TU5 A; 3D45 A; 3KIO A; 5KRT A; 1SZ2 A; 3L3U A; 4WFB L; 1VSE A; 3KTQ A; 1NJI O; 4FWM A; 4FVM A; 2RN2 A; 4K8X A; 3SAH A; 3MXM A; 4GV3 A; 1Q82 O; 3CC7 N; 4F2R A; 5KQD A; 1TK0 A; 3KD5 E; 3DOL A; 3VF4 A; 4FK0 A; 4E1J A; 3J81 O; 4HUE A; 3BGR A; 3KKS A; 1VQ7 N; 4JKH A; 4JI7 K; 3NCI A; 4RTF D; 4FLT A; 2P9N A; 2QWN A; 3KLH A; 4MDA A; 4PUO A; 3LPU A; 4JK8 A; 4FJX A; 5HRO A; 2B5J A; 3BF3 A; 3BF1 A; 3DLH A; 5I9E B; 3ZX2 A; 4N76 A; 2UUA K; 4GMJ B; 5KGW A; 3AVM A; 3V9U A; 2YNF A; 1LWF A; 5C42 A; 4JI4 K; 2NRX A; 3OYD A; 2ZJP L; 2IS3 A; 3OYF A; 2OPP A; 3MEE A; 3IMX A; 4LF5 K; 3RWU A; 4DSE A; 2FSJ A; 1KC8 O; 2GEM A; 3DRP A; 3SPY A; 1JLE A; 3THY A; 4Z0U A; 3VQC A; 4N56 A; 3CER A; 3DYA A; 2A3Z A; 3NMU A; 4CVN E; 1KD1 O; 3HO1 A; 4UQG A; 4WF9 L; 1C6V A; 3QEW A; 1XMO K; 4B9M A; 3VEX A; 3VGL A; 2HHV A; 4FLW A; 2IVN A; 1EET A; 3KLE A; 4DQS A; 3HPO A; 3PO4 A; 2PBD A; 4Q0B A; 4N41 A; 2QWO A; 2XO7 A; 3TAF A; 1U2V A; 2HBJ A; 4CIF A; 1ZBI A; 1NBW A; 2DFH A; 1KAY A; 5J2P A; 3LDL A; 1ATN A; 1U49 A; 4IDK A; 4GVM A; 2J4R A; 3MXI A; 3HRG A; 4A2B A; 3EE8 A; 1X9M A; 3E66 A; 4DU1 A; 1D4X A; 1RT6 A; 4YOR A; 5HLF A; 2RF2 A; 1T44 A; 3VA0 A; 3E9O A; 1S5J A; 2W6L A; 4DUZ K; 3WT0 A; 5GIN A; 1RTD A; 4M41 A; 4LF8 K; 3UB5 A; 4CEZ A; 2ZGZ A; 5M1F A; 5BN8 A; 3MDQ A; 1XNQ K; 5AQH A; 1RBR A; 3C6H A; 4IOA L; 4CK3 A; 4FXD A; 4A2A A; 4DSI A; 4H5T A; 2HND A; 4ID1 A; 4BRD A; 3NVK A; 1RT3 A; 4K41 A; 4DQQ A; 4NCG A; 4YOU A; 5HL7 L; 5CHI A; 4JS5 A; 4FOI A; 4A61 A; 1KRP A; 4GKK K; 4B1V A; 2P9N B; 3LAL A; 4DSL A; 3Q7C A; 3O1B A; 3HVR A; 3PO5 A; 1GLD G; 3SI6 A; 3O5B A; 4BRF A; 4IO8 A; 3VMF B; 4ZHR A; 4DV7 K; 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5CR4 A; 4CZK A; 1U48 A; 1SKW A; 4H0X B; 3OYJ A; 3ULD A; 3IFR A; 2YV0 X; 2A5X A; 1HLU A; 3MN7 A; 3DOK A; 4H03 B; 5KI6 A; 4JV5 K; 4JKB A; 4YDU C; 1J5E K; 3ISN C; 2VG6 A; 1BCO A; 1HKG A; 2WOM A; 3D2E A; 3SBG A; 3F5T A; 3KK3 A; 4CHO A; 1VSD A; 4OX9 K; 3ZEU A; 4CJU A; 2B6A A; 3WXK A; 2F96 A; 1U45 A; 3HP9 A; 4BG9 A; 1WSI A; 4RWT A; 1M90 O; 2YHB A; 4O5F A; 5FRO A; 1NGG A; 3AVB A; 2ASM A; 4DFP A; 3HOS A; 2QKK A; 3GE1 A; 4JD2 B; 4YDU A; 4M3Y A; 3ENH A; 3IKM A; 1ASU A; 4ISE A; 5M1P A; 5AZI A; 4KRF A; 3OW2 M; 1OH6 A; 3TAB A; 1NWK A; 5AZJ B; 3P31 A; 5J1E A; 1WSH A; 3VES A; 3A0I X; 1K8K B; 5AQO A; 1W9H A; 3AY9 A; 2RKI A; 3ZSY A; 4CJ3 A; 3D7E O; 2UUB K; 4AH9 A; 1N33 K; 1LCU A; 2P5O A; 4IXC A; 2E2O A; 2B4J A; 2XY7 A; 1NOY A; 1T3V A; 3GBT A; 4H0Y B; 5C0Y A; 3VTI A; 3TAG A; 2YNI A; 3IAY A; 4QOZ B; 1IKW A; 1T7P A; 1NU0 A; 3V6D A; 2UXB K; 1BA1 A; 4BVO A; 1IH7 A; 4FLZ A; 5HRN A; 2ASO A; 4M63 C; 1FK9 A; 4FJ7 A; 4B9S A; 4KHY A; 2KZZ A; 4DLG A; 4B3S K; 4KH5 A; 4BGA A; 3WEE A; 3V1R A; 3OYG A; 4FJL A; 3RMA A; 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