4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
5JMVA 2E8AA 3D2FB 3P4IA 2P9IA 3U4LA 3R8EA 3CI5A 2YJEA 3H3NO 3SJHA 2E2OA 1GLEG 3VGLA 3W3DA 4BRPA 4BR9A 3WQUA 5AQSA 5ADXA 2EWSA 2P9NA 4A2BA 3VESA 4BR7A 1GLJO 1E4FT 1X9JA 2F9WA 1NGGA 4PKHA 4JHDB 4CZLA 1HKCA 1C0GA 3CJCA 1EQYA 1SQKA 1ZC6A 3FGUA 2ITMA 4H0OA 3AY9A 4RWTA 4H0PA 5AQJA 5ADXH 1NGEA 3CJBA 1NMDA 3VEWA 1K8KA 3QB0A 2Q36A 1QHAA 3C7NA 1R59O 4MLEA 2A41A 3ID8A 1KXPA 2BUPA 4Z94A 4K25A 3DXKB 1ATSA 5AQWA 3FZMA 1RDWX 2E88A 4BC5A 3C0BA 4BRAA 4ISGA 3D2FA 3MK6A 4EAHD 5KPRA 3QFPA 4FWOA 3U9DA 2VCPA 4H0XB 4CBWA 3CJ1A 5TKYA 4CZMA 4BRGA 2ZGZA 4HTLA 1JCFA 2CH6A 3O5BA 1KAXA 5KQ8A 3UE5A 3S41A 1NGDA 4QS9A 4BQZA 3KZBA 4FWNA 2HF4A 4JHDA 1QQOA 1IJJA 2V52B 2UYTA 1XQSC 3R9PA 3FZHA 2A3ZA 3EZWA 2J4RA 3TU5A 4CD3A 3A5LC 3LM9A 3O08A 2D0PA 1ATNA 1X3NA 3D7EO 3I8BA 2Q97A 1MDUB 1BA1A 3VF4A 3ENOA 3ZEUA 3DXKA 2P9PB 2ASMA 1MWKA 4FWMA 2V7YA 3KVGA 2CGLA 4ISFA 1BOTO 1RFQA 2FSNA 3MMVA 4XH4A 2BTFA 3VEOA 3MDQA 4FWLA 5FPNA 4MO5A 3A5NC 3UKUB 2IVPA 3KHYA 4CZHA 5AQTA 3EN9A 4IWVA 3WXKA 4B1XB 2AA4A 3CQXA 4F9OA 2I7PA 5AQKA 2ASPA 3IMXA 3ZX0A 1Q18A 4FWKA 2GTDA 1HKBA 2YHWA 3ATVA 3H1QA 5E84A 3IDHA 3LDQA 4JNEA 5AQNA 4EHUA 3H3OB 4BR4A 4BRNA 3RSEB 3BUZB 3VEZA 5FPDA 4BRLA 2CGKA 2QM1A 2QWRA 4H5TA 3ATUA 5KPTA 2GWJA 3EKUA 3QBWA 1TUUA 3WEEB 3MN9A 3IUCA 5AQPA 2GEMA 1HKGA 4IO8A 4IZ9A 4IJAA 4JN4A 3GL1A 3ZETB 2VWBA 3F9MA 4WQ5A 3VENA 5BREA 3WXJA 4DHYA 2GWKA 3DWLA 2D4WA 4FWSA 1YXQA 3VOVA 3MN7A 3M6GA 5AQGA 1J6ZA 2WUSA 4B1VA 3BEXA 3OHRA 3UKUA 1S22A 4H0VB 3BP8A 3UKRB 1HUXA 1C0FA 5FPMA 2DPNA 2E1YA 2QWNA 5KQDA 3GOIA 5BRHA 1NGJA 5F2RA 2NLXA 5F0XA 5LJWA 3HM8A 3FZKA 3VF6A 4BRQA 3LDOA 4BGAA 4ISEA 4JAXA 3RSEA 1GLAG 3FE1A 4K41A 5E26A 3A5OC 2P9UB 1BA0A 4KBOA 4Y0WA 3WEEA 3EL2A 5AZJB 4E1JA 1ZBSA 2ZF5O 1WUAA 3MCPA 4I6MB 3QMLA 3I33A 3ZETA 2FSKA 2P9KB 2QXLA 2V51B 3ULEB 3VEYA 5AQYA 5EX5A 2HOEA 1YAGA 1BO5O 2P9LB 4WQ5C 3O8MA 1NGBA 1BG3A 2P9SB 4H5RA 2IVOA 3IFRA 3UKRA 4BG8A 3QFUA 2V7ZA 3TPQA 3WT0A 3HZ6A 5FPEA 4BVOA 4EIAA 2D1KA 1S3XA 3CHWA 3H46O 4B1YB 3CETA 2W41A 4BR2A 4JD2B 2W40A 2NZTA 4LC9B 4BRFA 3CERA 4BR5A 1NBWA 2E2QA 1V4SA 3VERA 3MN6A 5AQHA 2YCHA 2Q0RA 1BUPA 4HWIA 4CBUA 2P9UA 4H0TB 1BDGA 5BPLA 4B1ZA 5LY3A 5AZJA 2I7NA 3M1FA 3CJ9A 3ENHA 4DQ8A 4FWQA 4FPBA 3W0LA 3LDNA 4H5WA 4I6MA 3VEXA 4CZKA 4A61A 4YDUA 3SMPA 4CZEA 2QWOA 3GBTA 4FWRA 4CZJA 2P9KA 3ULEA 2HF3A 4DB3A 1NLVA 3JS6A 2QWPA 3VGMA 4CI6A 2NRHA 1RGIA 2FLOA 3EO3A 2P9LA 3O6WA 1SZ2A 1GLLO 1HJOA 3WQTA 2IIRA 3EKSA 4MO4A 5F1XA 2GELA 2P9SA 4BC4A 4BRCA 1LCUA 1P8ZA 3A0IX 4B1UB 2A42A 3LDPA 4QS8A 4BROA 4CZFA 5BRDA 2P9IB 3O1WA 1X3MA 4O5FA 4JD2A 1E4GT 5BR9A 1T6CA 5I9EB 3CJ7A 1MA9B 3R6MA 3L0QA 4M7YA 3H45C 1ESVA 1LOTB 1U6ZA 3HSCA 4IXCA 3DXMB 1G99A 5EXWA 5BPNA 2OANA 5AFUA 2YHYA 4EFHA 4XH5A 4GNIA 1NM1A 5AQLA 2P9PA 1BWFO 4L3QA 3SK3A 3VETA 4BRMA 1NGAA 1U2VB 2F9TA 4WYBA 2A40A 1GLCG 3GDQA 1KAYA 3QDKA 2CGJA 4H5VA 3BF3A 4YDUC 5EOYA 5AZIB 4NO7A 4FSVA 1HLUA 3C7NB 4PL7A 5AQRA 3VEVA 2GUPA 4BQLA 3A5MC 2Q2RA 2E20A 1D4XA 3VPZA 4PKGA 4CD1A 2QW9A 1GLDG 4BC3A 3J8AA 4B9QA 3LM2A 3ZX3A 4BC2A 4BG9A 2PAVA 4K42A 1WOQA 3L4IA 1YVNA 3DXMA 3GE1A 3JXUA 1NWKA 4BRIA 3LDLA 4FOEA 3HBTA 1ZXOA 1Y64A 5JLFA 1MWMA 3WXLA 4FWPA 2D0OA 4C23A 4RTFD 4DCHA 1U2VA 1DKGD 1JCGA 3HTVA 4MLHA 5JLHA 2Q1NA 2YI1A 4BGBA 1CZAN 3VGKA 4WQ4A 2Q31A 3AARA 5AZIA 3B8AX 4XEIA 5AQOA 5BN8A 1BU6O 2VYPA 3ZEUB 3H1VX 3DJCA 3FZLA 1NGIA 3O4WA 1QZ6A 2A5XA 2HMPA 1T44A 5BRFA 4BREA 3CJAA 3BF1A 1HPMA 4BRHA 3G25A 2A6AA 4FO0A 3FZFA 2FSJA 5EVZA 3O80A 4FL9A 1NGHA 4PL8A 2FF6A 4BRKA 1TUYA 4A62A 5JICA 2YJFA 2ZGYA 4H5NA 5AQZA 4BRDA 5AQMA 2ZWHA 2Q0UA 4H03B 1ATRA 1TYQB 4CBXA 3FFKB 4CZIA 2ASOA 4M7XA 3QBXA 5AQUA 1Z6RA 2E1ZA 4XH1A 4B1WB 2QWQA 3D2EB 5CE3A 3A8YA 2PBDA 3ZX2A 4QS7A 4H0YB 3L6QA 5BPMA 5BN9A 3QICA 4K43A 2YHXA 3FR0A 4EHTA 3CIPA 4WQ4C 3FLCO 1OKJA 2QWMA 3GG4A 5AQIA 1NGCA 4O8KA 1XC3A 3DAWA 2FF3B 5EY4A 2KHOA 1NGFA 3VF2A 3WXIA 1JCEA 1XUPO 4RCHA 2P9NB 3CQYA 4CJ7A 4PKIA 4NB4A 3U9ZA 1YUWA 4GY2B 4IJNA 3M3ZA 5AQXA 3H6EA 5AQQA 1QQMA 3SMSA 4AM7A 5LJVA 4BR0A 2E2NA 1HX1A 2H3GX 2QWLA 3MN5A 1SAZA 4FPAA 5AR0A 4AM6A 1GLFO 1IG8A 4FOIA 5AQVA 1TYQA 2CH5A 1H1VA 3WUHA 4CZGA 1QZ5A 5KPZA 5AQFA 3AAPA 1V4TA 2IVNA 5ELZA 1T6DA 1DGKN 1Z05A 3AAQA 1K8KB 3HI0A 5AFUH 3O1BA 1KAZA 4J8FA 1DEJA 3D2EA 3LL3A 2AP1A 3U8XA 4M63C 5B8HA 1QQNA 4A2AA 2FXUA 2E2PA 3SLCA 3UB5A 1GLBG 4BVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI0K 1J54A 4GVEA 4JV5K 4Z4CA 3AVBA 3CCUN 4LFAK 1ASUA 3D2FB 3R8EA 3CI5A 2YJEA 2NRZA 3SJHA 1BIUA 2E2OA 1D5AA 3W3DA 2XY7A 2HB5A 1WBBA 5AQSA 3O9RA 5C15A 2D0AA 5ADXA 5KTQA 2O4GA 3G6EN 5LMUK 1E4FT 1Q81O 4AHCA 1RT2A 1NGGA 4J2DA 4JHDB 1HKCA 5J2PA 1C0GA 3CFPA 1EQYA 4H0OA 2P5GA 4E7KA 5A2QO 4H0PA 1C0TA 1NGEA 3LPUA 1NMDA 1K8KA 3A2FA 3QB0A 4NYNA 4DQSA 2Q36A 1KXPA 2BUPA 4K0KK 3DXKB 1X1PA 3C0BA 1U49A 4GKJK 1VSKA 3MK6A 4JKAA 4EAHD 3QFPA 1I39A 2X78A 4RW7A 3PX4A 4FJJA 2FBYA 2ZGZA 4FZXC 3DLBA 3V1QA 1KAXA 1IKVA 4JRPA 2EHGA 4QS9A 3O3FA 3SV3A 1LW2A 4Y1CA 3NF7A 1XC9A 2V52B 4JKCA 1C1CA 3R9PA 2G8IA 2ZE2A 3EZWA 4I2PA 1EWQA 4CD3A 3RRHA 3KLEA 4BDZA 1JLEA 3KLGA 4JKGB 4A5AA 4M42A 3D45A 4JI3K 3JAMO 4FLZA 2Q97A 3AVFA 1MDUB 1BA1A 1HNXK 2HHSA 5AJ3K 4DR3K 4F3TA 2E5LK 3CCLN 3KVGA 4ISFA 2FSNA 3K0SA 2XY5A 4XH4A 1N8RO 2BANA 3LP1A 3SUQA 3THYA 2KKZA 1JJ2M 1HNIA 5AQTA 4DFMA 4DFJA 3EN9A 3WXKA 4DQIA 1WSHA 3CQXA 4JK8A 4O44A 3AGKA 4F9OA 4ZHRA 4CEDA 3L2WA 4N5SA 1HKBA 4YORA 4B9VA 4EHUA 5E84A 3IDHA 4BRNA 4DV7K 4PHTX 2YKMA 5FPDA 2CGKA 3LPTA 4DU1A 1JKHA 4H5TA 3QBWA 5K14A 2RPIA 1NJXA 4Q0BA 3VQ4A 3CCEN 3CCMN 4U7BA 4GMJB 4IZ9A 4FK2A 3ZETB 2VWBA 4YOTA 1BI4A 3WXJA 4AILC 2F7TA 2D4WA 1NOZA 1S9EA 5AQGA 3K9JA 3OHRA 3ISNC 2ZD1A 4KHPK 1HUXA 3U3GA 2DPNA 2E1YA 1EWRA 5KQDA 3GOIA 4IOCL 1BGXT 2HSTA 5F2RA 1NJIO 4CEZA 4DLEA 2NRVA 4E89A 1RCHA 1KFSA 4DSJA 4IDKA 3K5MA 3WEEA 1BA0A 3L3VA 3OW2M 1FJGK 2P51A 1ZBSA 4FCYA 1RT1A 3ITHA 1WUAA 3MCPA 1C1BA 1OVYA 3QMLA 4IEIA 3ZT3A 2FSKA 1KCFA 3VEYA 5EX5A 2EX3A 2IGIA 3L2RA 3EEQA 1J53A 2YHAA 3E01A 2P9LB 4WQ5C 3K57A 3KD1E 3AVJA 1LW0A 4CJSA 3KKRA 4HHTA 4FK0A 4FJKA 2VWJA 4EIAA 2D1KA 3AVGA 1UOCA 4CF8A 3PV8A 4N56A 1GOAA 1OVQA 2PFUA 4CGHA 1NK9A 4LC9B 4BRFA 2B4JA 1B9DA 1V4SA 1YI2N 2YCHA 3SI6A 1WSIA 4H0TB 3ZLJA 5LY3A 2I7NA 3QEWA 4O0JA 1U48A 4FWQA 1JLAA 1RT6A 3VEXA 3I55N 3SMPA 4CZEA 4CZJA 3AVIA 3AVMA 5C12A 2P9KA 2QK9A 3ULEA 4C8KA 2E6MA 4FYDA 3PUFA 2WBNA 3O6WA 1GLLO 1WAJA 4MQ3A 1N34K 4HUGA 5F1XA 2GELA 2P9SA 4KREA 4HCCA 1LCUA 3PIPL 4BROA 1BISA 2Y1JA 3OY9A 3HJFA 4LSNA 3CF5L 1KC8O 4W5OA 3K2PA 1E4GT 3QESA 5I9EB 3HK2A 2Z1IA 1YITN 4B9MA 2VG7A 3QLHA 4HUFA 4B3MK 1LOTB 2YNHA 3C6HA 4AF1A 2RE2A 3DXMB 3MXMA 5BPNA 5AFUA 3O9TA 1WN7A 4B3RK 4JKEA 4EZ6A 1NM1A 4G1QA 4L3QA 2UXCK 2F9TA 4NYFA 1OH5A 2CGJA 4H5VA 2ZM6K 4JKFA 4NO7A 1HLUA 3C7NB 3WNHA 3R1XA 4BQLA 2RHKA 3ZSOA 4LF6K 4Z4HA 1A5VA 4PKGA 3V1RA 4CD1A 2XRIA 4M3XA 3VMFB 5CHIA 1LWEA 1QE1A 3ZX3A 3SQ4A 4DQQA 3V81A 3CYMA 2PAVA 1BCOA 3Q7BA 3GE1A 3JXUA 5HBMA 1NWKA 3LDLA 4FOEA 4WF9L 4E19A 1M1KO 1K6YA 4FJLA 3WXLA 4ILHA 2Z1HA 3P83D 5GINA 3MEEA 3HTVA 4MLHA 4W5TA 3DLGA 1LV5A 3VGKA 5CYQA 3AARA 1U4BA 3NF6A 4NCAA 4FK4A 1XWLA 3O4NA 3I0RA 3O9SA 2X6NA 5BN8A 2B6AA 4F3OA 1Q9XA 3HO1A 2NRTA 3OYHA 5HRRA 1BQMA 1QZ6A 2A5XA 4W5RA 1T44A 4BREA 3LZJA 5JS1A 3VQDA 1RDBA 2A6AA 2KZMA 1TAQA 4HUEA 3LP3A 5EVZA 4BDYA 2FF6A 4DQPA 3SZ2A 4A62A 3C94A 2W42A 1S6QA 1VAZA 4H5NA 4CK1A 1TL1A 4OVLA 5AQMA 4BRDA 2ZWHA 4H03B 4CGGA 3HP6A 4E7IA 3E66A 1TYQB 4B3SK 3WNEA 3VQ6A 4GW6A 3QBXA 2E1ZA 4FJNA 1UWBA 2QWQA 3G71N 5CE3A 1QVGM 4W5QA 3C6UA 4LF8K 4CHPA 3SUOA 3CG7A 4DR5K 2YHXA 4I7FA 1YJNN 2QWMA 3GG4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3K58 A;  3MEC A;  1HNW K;  1NGH A;  3DYA A;  4BRK A;  5JIC A;  3V4I A;  2A1S A;  2Q0U A;  1QSL A;  4DV6 K;  3MED A;  4N47 A;  4KH4 A;  2IDO A;  2ASO A;  4M7X A;  4CEA A;  5AQU A;  4DU3 A;  1Q7Y O;  3VQ9 A;  1KQS M;  3A8Y A;  3P5J A;  5KRT A;  4QS7 A;  2IC3 A;  4H0Y B;  4FJG A;  4E1M A;  5BN9 A;  2HHW A;  2ZJR L;  3FR0 A;  4WQ4 C;  3FLC O;  4DUZ K;  1NGC A;  1XC3 A;  3TSP A;  5EY4 A;  1YJW N;  1WBD A;  2QEX N;  1NGF A;  1W0H A;  3MX5 A;  4PQU A;  3EZ5 A;  4RG8 A;  3VF2 A;  4CJQ A;  3QET A;  2GX9 A;  1XUP O;  4RCH A;  3ZSX A;  1JLG A;  3K5L A;  3CQY A;  4KB1 A;  2B5J A;  3H6E A;  1QQM A;  3VQ8 A;  1N6Q A;  2E2N A;  2WOM A;  4F2R A;  1GLF O;  1YVU A;  4YOV A;  5AQV A;  1TYQ A;  1EET A;  3AVL A;  4BE1 A;  1H1V A;  1L3S A;  1HNV A;  2RN2 A;  1Z05 A;  3TTD A;  4IG0 A;  4FM0 A;  4F2S A;  3S3O A;  3ULD A;  1DEJ A;  3KLH A;  5B8H A;  4A2A A;  2FXU A;  4DG1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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