4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
1YUWA 5AQSA 4CZFA 1ATRA 4B1UB 2QW9A 4MO5A 1MA9B 3LDOA 3FGUA 5AQRA 3WT0A 2IVOA 2ASPA 1U6ZA 2Q31A 5AZIB 4BRKA 4H0PA 3CI5A 2A3ZA 4CZMA 4CD3A 2YI1A 5JMVA 2AP1A 2CGKA 1JCEA 1D4XA 3QICA 1SQKA 3LM2A 3BEXA 3HI0A 4NB4A 1P8ZA 5KPRA 1BUPA 1T44A 3D2EA 3VEWA 1GLJO 1Q18A 2A42A 5CE3A 2A6AA 3FE1A 1Z05A 2VYPA 1BWFO 4DB3A 2Q2RA 3I33A 1JCFA 3B8AX 5AQMA 3D7EO 1WOQA 4PL7A 2HOEA 4IO8A 1HLUA 2D0PA 4K41A 5AQYA 4CD1A 2PBDA 1QHAA 3C7NA 4CJ7A 1RGIA 2P9NB 3TU5A 1Z6RA 3WXLA 2NZTA 4FWSA 2W40A 3MDQA 4FWNA 3U9ZA 1QZ6A 3BF1A 3UKUB 5AQGA 3VPZA 4E1JA 1C0GA 4H03B 2E8AA 4BR0A 3R9PA 1NGAA 2YCHA 3QBXA 4PKIA 5AQZA 2BTFA 4H0TB 2KHOA 3A5MC 3CJ9A 5AQXA 4MLEA 3HTVA 4CZGA 3VEYA 2P9KA 4AM6A 3CJ7A 3VGMA 3IMXA 3A5NC 3FLCO 1GLBG 1X3MA 1XUPO 3CERA 4FWOA 3C0BA 1EQYA 3HZ6A 3O4WA 4WQ5A 4B1XB 3O6WA 2P9PB 5AQTA 2ASMA 2GTDA 2QWQA 2VWBA 4FWPA 4BC3A 2Q97A 2FF6A 4GNIA 5E26A 5BN9A 3A5LC 5AQWA 4QS7A 5AZJA 1K8KB 3CJCA 2QWNA 3H3NO 4K25A 1MWMA 5AFUH 3CJ1A 1QQMA 3R6MA 4PKHA 4XH5A 5BRHA 3G25A 3H6EA 3VERA 3DXMB 4BRCA 4YDUC 1NGFA 3DXKA 4BREA 1GLEG 3EKSA 1XQSC 1DKGD 1NWKA 5F2RA 4NO7A 1SAZA 4RWTA 2UYTA 2D1KA 4EHUA 4QS9A 4M63C 5KPTA 1YXQA 4C23A 1NM1A 3AARA 4I6MA 3BP8A 5BRFA 1BG3A 1ZXOA 3O80A 4JAXA 5LJVA 4BRHA 4RCHA 4XH4A 1SZ2A 4DCHA 3U8XA 1BA0A 2QWPA 4ISFA 3MMVA 5ADXH 1T6CA 3VF4A 2P9SA 4B9QA 1GLFO 4JD2B 4JHDA 1X9JA 3AAQA 3C7NB 3VOVA 2EWSA 5I9EB 5E84A 2GWKA 3MCPA 3WEEA 3MN6A 4BGAA 4BRMA 2E2QA 4BR7A 1NGEA 5KPZA 1GLDG 3LDNA 3UKRB 4BRFA 2CGLA 1BOTO 5TKYA 5EOYA 3BF3A 2V52B 1OKJA 4WYBA 2DPNA 1J6ZA 3SMSA 2AA4A 5FPMA 2NLXA 1ZBSA 1MDUB 2P9UA 3VENA 3WXKA 2YHXA 4IXCA 1TYQB 1NGGA 2GELA 2Q36A 3F9MA 4EIAA 5AQFA 3U9DA 4BVPA 1DGKN 2FF3B 4H0XB 4B1VA 3CHWA 3KZBA 3H45C 2ZWHA 4FWLA 5AQIA 2P9IB 2FSNA 2NRHA 4BRAA 3VEXA 4Y0WA 2VCPA 1GLLO 3CJBA 3ZEUA 3FZFA 2FXUA 3FZKA 5AQVA 3CQXA 1NGIA 1R59O 3FZHA 3RSEA 4BRDA 4BRGA 2E20A 3IUCA 5EVZA 4FOIA 3A5OC 3CIPA 2YHYA 2QWOA 3H1QA 4DQ8A 3GL1A 4M7XA 1HKBA 2IVPA 3M1FA 4CI6A 1TUYA 3ZETB 1S22A 2IVNA 2P9LB 3ULEB 3ATUA 2ZF5O 2QWRA 3DXKB 5JLFA 3QMLA 4BG9A 1U2VB 1YAGA 5BREA 2FSJA 1BDGA 4FWRA 2HF4A 4A2BA 4CBUA 1TUUA 1HKGA 2GEMA 4BR2A 4QS8A 1JCGA 5AR0A 4I6MB 3I8BA 4H0YB 1NGHA 2CH5A 4K42A 4H0VB 1GLCG 3FR0A 5AQKA 3R8EA 3DJCA 4J8FA 3J8AA 2E2NA 4GY2B 4JHDB 5AQQA 1BO5O 5KQ8A 3L6QA 3O5BA 4CZIA 5AZIA 3MK6A 4CZLA 4CZEA 4CBWA 4B1ZA 1C0FA 2FLOA 3L0QA 4BC2A 3GBTA 5JLHA 2E88A 3IDHA 1KAXA 2QWMA 3WUHA 5AQPA 2P9UB 1WUAA 1H1VA 4AM7A 3EO3A 3U4LA 4EHTA 1ESVA 4FL9A 5BPMA 3LDLA 4BVOA 2I7NA 2A41A 4WQ4C 3VEOA 3ZX3A 3ZX0A 4DHYA 5LJWA 3WQUA 4A2AA 3D2EB 3KHYA 5FPEA 3WQTA 4FWMA 4BRLA 3H3OB 3SJHA 4BRNA 4H0OA 4CZHA 4PL8A 4BG8A 3P4IA 2ZGYA 3O08A 4CBXA 3SMPA 2IIRA 2P9NA 5AQHA 4IJNA 3SK3A 4EAHD 4BRQA 3MN5A 3DWLA 1NLVA 4ISEA 1NGCA 2E2OA 3A8YA 3UKUA 2YJFA 5EX5A 1LCUA 3FZMA 4BC5A 1KAZA 4O5FA 1DEJA 1QQOA 1RFQA 3BUZB 3ZX2A 2YHWA 1T6DA 4WQ4A 3WXJA 4HTLA 3AY9A 5F0XA 3CJAA 4YDUA 4FSVA 4FWQA 5BR9A 5ADXA 4KBOA 5EXWA 1Y64A 1LOTB 3A0IX 4RTFD 3VEVA 5FPNA 4O8KA 3GG4A 3SLCA 4ISGA 3O1BA 1CZAN 4H5VA 1HUXA 3EZWA 4IWVA 4FPAA 4L3QA 3ID8A 1HX1A 5AQLA 3DAWA 1E4GT 2P9KB 3UB5A 2CGJA 3VESA 3EN9A 3WXIA 2D0OA 3VGKA 3M3ZA 2P9PA 2V7ZA 5AQJA 4F9OA 1HKCA 1ATNA 2E2PA 2A5XA 3QB0A 3JS6A 4Z94A 4EFHA 1K8KA 2Q0RA 3QFUA 3QBWA 1YVNA 4MLHA 5AQNA 2ITMA 3HBTA 4A62A 3ENHA 3CQYA 3VF6A 3OHRA 2QWLA 1XC3A 3LL3A 2ASOA 4BRPA 4JN4A 3FZLA 3D2FA 5AZJB 1E4FT 1NGJA 5F1XA 2A40A 3DXMA 4BC4A 3FFKB 5FPDA 3S41A 2V51B 3CETA 3O8MA 3VETA 3VEZA 3GDQA 3H1VX 3JXUA 2OANA 3UE5A 2FSKA 5AQUA 5B8HA 2QM1A 3VGLA 4JD2A 5BPNA 1GLAG 3EKUA 1ATSA 3IFRA 1KAYA 2H3GX 3LDQA 4XH1A 3HM8A 3MN7A 4WQ5C 2P9SB 3UKRA 4M7YA 5KQDA 4BGBA 2GWJA 2Q0UA 3WEEB 4BR9A 5BPLA 4IZ9A 4LC9B 1NMDA 4H5RA 4FPBA 4H5WA 2PAVA 1KXPA 1BU6O 4H5TA 2HMPA 1TYQA 1RDWX 2CH6A 4A61A 5ELZA 4BRIA 5AQOA 4PKGA 1NGBA 1G99A 1QQNA 4K43A 2BUPA 4B1WB 2I7PA 4XEIA 4B1YB 1V4TA 2GUPA 2P9IA 2J4RA 3GOIA 4CZKA 2ZGZA 4BROA 4BQZA 3QDKA 5BN8A 2Q1NA 4CZJA 2E1ZA 4BR4A 3TPQA 4IJAA 3LDPA 5AFUA 3ZEUB 1HJOA 1IG8A 1NBWA 3LM9A 3VF2A 2D4WA 3AAPA 1MWKA 4FOEA 3RSEB 5BRDA 2YJEA 3D2FB 3W3DA 3ZETA 4BQLA 3EL2A 2P9LA 2F9WA 2V7YA 4JNEA 3ULEA 1QZ5A 3ATVA 4FO0A 3QFPA 1X3NA 1U2VA 1IJJA 3KVGA 1HPMA 3W0LA 5EY4A 4FWKA 3ENOA 2F9TA 4HWIA 5LY3A 1S3XA 2QXLA 2WUSA 3L4IA 3MN9A 4BR5A 3H46O 4MO4A 1BA1A 2HF3A 2W41A 1V4SA 4H5NA 1ZC6A 3M6GA 5JICA 3O1WA 3GE1A 1NGDA 3HSCA 2E1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQSA 1WBBA 1ATRA 3IG1A 4CHQA 4B1UB 4UY8O 2XHBA 1NU0A 3CCJN 1EKEA 2Q31A 4EZ9A 1VQLN 2JWKA 1EO1A 2ETJA 3VQDA 1JXBA 5KGXA 3JSMA 3AVGA 3K5LA 4B8AB 1HR0K 3BEXA 1QVFM 4M3RA 4B08A 4NCBA 1Q18A 1SUQA 2FBVA 4U67L 1BWFO 3RRHA 4E7KA 4DB3A 3LPTA 3I33A 1JCFA 1RDCA 1OVYA 3EE9A 4CJFA 3K9KA 3MX2A 1L3VA 3NDKA 4A5AA 3T1HK 4IO8A 4B9UA 2D0PA 4K41A 5AQYA 1K8AO 2PBDA 2P9NB 3CFPA 1RT5A 4FZYA 3WXLA 2ATQA 4DSFA 1I3AA 3MDQA 4FWNA 3NH0A 1QZ6A 5DM6L 1BI4A 3PX6A 4CJWA 3AA3A 5C24A 4NYFA 5H1SQ 2HHXA 2E8AA 1I39A 3R9PA 3TSUA 3AA5X 3EYZA 4PKIA 4DTXA 1C6VA 1WLJA 3SUPA 2JLEA 4MLEA 1RBUA 3VEYA 4AHTA 1T8EA 3CJ7A 4I2PA 3HO1A 1UWBA 4OKKA 1B92A 4B3RK 4PQUA 3CERA 5M1KA 4CIGA 3C0BA 3O4WA 3HZ6A 4B1XB 4WQ5A 4FJMA 4DSLA 5I3UA 2IS3A 3AVIA 1NK4A 2KZMA 2QWQA 1VQ5N 3O9SA 2VWBA 4DU4A 3RTVA 2HBKA 2Q97A 1DTQA 5BN9A 3SAFA 4KTWA 3CJCA 1QVGM 2RPIA 1C0UA 4E7IA 3LPUA 3P5JA 4K25A 3LP2A 3P39A 3S3OA 1NKCA 4B3MK 4CEZA 1QQMA 3R6MA 1QTMA 4XH5A 3D0PA 4E7JA 3G25A 3H6EA 3PSIA 4CJPA 3DXMB 2W42A 4YDUC 3DXKA 4F2SA 3EKSA 1TKZA 3MCAB 4HUFA 2R7YA 2UYTA 3ZSXA 3NMUA 4DTJA 1TV6A 3K5OA 1YJNN 2VWKA 4C23A 1GOCA 1BG3A 4FZXC 2OPQA 4XH4A 3U8XA 1BA0A 2QWPA 1EWQA 3PX0A 3MMVA 1T6CA 4I9LA 1LAVA 1X9JA 4TSXA 3SUNA 4LF4K 5E84A 2GWKA 3WEEA 3MN6A 4JRQA 4BR7A 3KLFA 1NGEA 5KPZA 1LW2A 2YNHA 2UU9K 4BRFA 1RT6A 4IG3A 3AO5A 2NRTA 4WYBA 1J6ZA 2AA4A 3ZT2A 2YHXA 3V9ZA 2GELA 2O8EA 1C1CA 3F9MA 2FF3B 4H0XB 1WSGA 5CHIA 1S1TA 4DV1K 3IS9A 3H08A 1D9FA 1X9MA 4BRAA 3VEXA 1EETA 4KI6A 4JYAK 5I42A 3ZEUA 1N6QA 2KZZA 4G9ZA 3VQQA 3RSEA 4AILC 4BRDA 4DR4K 5BR8K 2E20A 5EU7A 3IUCA 4DQ8A 1JLAA 4CGFA 2D5RA 1KFSA 3GL1A 3MECA 1U4BA 2NUBA 4E89A 2IVPA 2O8BB 3M1FA 4FK2A 3RMDA 1TUYA 1EWRA 3ULEB 3MXIA 3TSQA 3QMLA 4BG9A 5BREA 2PFUA 5M1PA 4A2BA 5GINA 1HKGA 5FDLA 4QS8A 1B9DA 5AR0A 4KHSA 1NGHA 4KKOA 4CJUA 4CJRA 4H0VB 3RMBA 1GLCG 4CJ4A 2WTUA 5AQQA 5KQ8A 1BCMA 3ZSZA 3BGRA 1K9MO 1DLOA 4CBWA 3TAFA 4G1QA 5M1QA 3T1YK 4DV7K 3LDSA 3OYMA 2QA4N 3DOKA 2UUAK 2QWMA 4O4GA 3MEEA 2W6LA 2NRWA 4EHTA 3QEVA 4LH4A 3CCSN 3THVA 4CEBA 3CM6A 3CPEA 4CIFA 1M1KO 4FVUA 4CZHA 5SWMA 5HBMA 3O9QA 3P4IA 3SMPA 1TK0A 2P9NA 4CF8A 5AQHA 4CJKA 3SK3A 2RF2A 3CPWM 4CFCA 3AV9A 2E6LA 3T3FA 3C6HA 3DWLA 4NYNA 4AHRA 1NGCA 1NJIO 3O9TA 1HNIA 2DTUA 3QLHA 2W6KA 4O5FA 4DMNA 3AVFA 2HHWA 1QQOA 1RFQA 4EZ6A 3L2RA 3AY9A 2IC3A 1UAXA 4YDUA 1QSLA 5HROA 2HVHA 4DUZK 1BIZA 1LOTB 4RTFD 1RBRA 4JKEA 4O8KA 3GG4A 3SLCA 2BDPA 1CZAN 4H5VA 1S6QA 2OPPA 4IWVA 3TTDA 3ZSRA 4JKHA 2Y1JA 3ID8A 4DFJA 3MX5A 5AQLA 3NGIA 2P9KB 3UB5A 3KLHA 3WXMB 3DLKA 4F9OA 4DS4A 3E01A 2UXDK 4DV0K 3PLAA 4JS5A 2E2PA 2A5XA 1JLBA 3QB0A 3JS6A 4N5SA 1VQ9N 3MXJA 3QBWA 1YVNA 2ITMA 3KD5E 4A62A 2Z1GA 3OYBA 3OHRA 3ULDA 3LL3A 4BRPA 1SL2A 3CCLN 4B9SA 4N47A 5AZJB 3SNNA 3DXMA 3HPHA 4ILHA 4BC4A 4CW7B 1D8YA 3HVTA 1J5OA 4BY9C 5FPDA 2VWJA 4W5QA 3K0SA 2V51B 4F2RA 1KLNA 5LMUK 4I7FA 4DR7K 4B9LA 3H1VX 2KFZA 1S1WA 4DR1K 1U49A 4B9NA 2YHBA 4OPKA 2FSKA 3O3GA 1SL1A 3VGLA 3O9UA 4F4KA 4GW6A 3LAKA 1N33K 3P38A 3O9RA 5J2NA 4JI4K 1N34K 3HJFA 4JI2K 4YOVA 4FCYA 4CEDA 2P9SB 3NF7A 4K8ZA 4IZ9A 3RVCA 1GOBA 3OS1A 1NMDA 3SQ2A 4H5RA 4JKGB 3M5RA 5CZ1A 2CH6A 4BRIA 4IO9L 4DFKA 4ELTA 1NGBA 3HOTA 1QQNA 2BH1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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