4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
3CJBA 3TU5A 3GL1A 3FLCO 3IFRA 1NGAA 4CBWA 1G99A 3WQUA 2P9KB 1GLDG 4A2BA 5E26A 4IWVA 2YCHA 4BC2A 3O6WA 3OHRA 3U4LA 3LDQA 1NMDA 2QWRA 3VF4A 3BEXA 5AQTA 3VERA 4K25A 5BRDA 2FXUA 2QWNA 3WXIA 4CZIA 4C23A 4IO8A 1EQYA 1XUPO 4H5VA 1CZAN 3CJAA 4H5WA 4BRNA 3HSCA 3R8EA 2A40A 2HMPA 3FZKA 3DXMB 1J6ZA 2E2NA 2E8AA 4I6MA 3QB0A 1IG8A 5ADXH 1TUUA 5EOYA 3HTVA 2UYTA 3QDKA 1GLLO 4HTLA 1JCEA 1R59O 5ADXA 1DKGD 1Y64A 4CZEA 1GLFO 5AZJB 4DCHA 3DAWA 3EO3A 1QQNA 3FZMA 3AAPA 4A61A 4CZMA 2Q36A 2GUPA 3WXJA 4ISEA 2P9UA 4M7YA 2E88A 4BR5A 3H1QA 5AQPA 5BPLA 1TYQA 1NGFA 3ZETB 2EWSA 4BR9A 2YHXA 3D2EB 3CJ1A 4MLHA 2QWPA 1K8KB 4M7XA 5EX5A 1NGCA 1HKBA 1Z05A 5KQ8A 2YJEA 1RGIA 5AQSA 4BRQA 1KXPA 5FPEA 2QWQA 4AM7A 3MN9A 4KBOA 5FPNA 3VETA 2CH6A 2BUPA 2NLXA 2E2OA 4FWQA 4K41A 4FSVA 4H0OA 2A41A 3WEEB 3LM9A 5AZIB 1HPMA 4BC4A 1K8KA 3WT0A 3L4IA 1GLBG 1KAZA 3DXKA 3A8YA 2P9LA 3G25A 2ZGYA 2P9PA 4BRPA 2OANA 5BN9A 2PAVA 5I9EB 2VYPA 5BRFA 4QS8A 4Y0WA 1OKJA 4H5NA 3ENOA 1SQKA 3MN5A 3SMPA 4H03B 4H0VB 1HUXA 3O8MA 1GLAG 1X3NA 5AQNA 2ITMA 4HWIA 3VEZA 1DEJA 1HX1A 1U2VB 4PKGA 1E4FT 2YI1A 5AQRA 4RCHA 1NGHA 2ASOA 3EL2A 3GOIA 5BPMA 3FFKB 1MWKA 3AAQA 1T6CA 5AQKA 3F9MA 1QZ6A 4BQLA 3ULEB 3GBTA 5BR9A 1E4GT 4WQ4C 2E2PA 4JD2B 1C0FA 4EAHD 2Q1NA 3HBTA 3SLCA 4FWMA 4H5TA 2I7PA 3CETA 2IIRA 2NRHA 3UKUB 3R6MA 1ESVA 1BG3A 4ISGA 4BRGA 2A42A 3H6EA 1QQOA 5BPNA 1V4SA 1LCUA 4FWSA 3HM8A 4BRFA 3L0QA 1V4TA 3CI5A 3ID8A 1GLEG 3H45C 2GWJA 4XH1A 4CZGA 1HLUA 4ISFA 1NGEA 2FF6A 4CD1A 1Q18A 4BRKA 2IVPA 2FF3B 3HZ6A 4BGBA 4BRMA 5F1XA 5JICA 1C0GA 2GWKA 2HF4A 3ZX2A 2BTFA 3BF1A 3VF2A 3EKUA 4BGAA 5CE3A 1BUPA 1KAXA 2Q0UA 2YJFA 3VESA 1SAZA 3O80A 3VENA 4PL7A 1MWMA 5AQLA 3RSEA 1YVNA 1NGGA 4JHDA 3CIPA 3H1VX 4MO5A 5AQHA 4H0TB 3L6QA 3VEVA 2FSKA 2ASPA 3VOVA 4CZLA 2P9IB 3SMSA 2W40A 3UKUA 3LDNA 3WUHA 3D2FA 3QFUA 1QHAA 3DJCA 1BA0A 3WEEA 2DPNA 2W41A 1ATSA 1NM1A 3UKRB 4EFHA 2QXLA 3M6GA 4RTFD 1HKCA 3O4WA 5B8HA 2YHWA 4O5FA 4L3QA 4CI6A 1Z6RA 5EVZA 1DGKN 3BF3A 3D2EA 4IJNA 5FPMA 2A3ZA 3M1FA 3QBWA 3KVGA 4QS9A 1JCGA 2A5XA 1QQMA 2AA4A 2CGLA 4H0PA 4CZJA 3FZLA 3U8XA 1S22A 4FO0A 4B1YB 4F9OA 4DB3A 5KPRA 3VEYA 1ZC6A 3DXKB 3WQTA 5BREA 3LDOA 1KAYA 4H5RA 3UE5A 4B1ZA 3ZX0A 3VPZA 4BRAA 4J8FA 5AZIA 3GDQA 4FOEA 4BC3A 3U9ZA 4GNIA 5EY4A 3BUZB 3LDPA 3UKRA 1NGIA 1IJJA 1SZ2A 1XQSC 2Q0RA 3ATVA 2VCPA 4BREA 3DXMA 1NGDA 2V52B 2IVNA 5TKYA 2A6AA 2I7NA 4O8KA 4BRDA 3H46O 4CBXA 1TYQB 3I8BA 5KPZA 2KHOA 4K43A 5BRHA 4A2AA 3JS6A 2QWLA 3WXLA 2YHYA 3MN7A 4FL9A 4JAXA 4B1WB 1X9JA 3EKSA 4FPAA 2HOEA 3J8AA 5JLFA 1ATRA 2CGJA 3B8AX 4RWTA 2P9UB 4Z94A 3JXUA 2Q97A 4NB4A 3C0BA 3A0IX 3CJCA 5E84A 2E1ZA 1HKGA 2D0PA 3P4IA 5EXWA 2PBDA 1NGJA 3MCPA 3VEOA 4CZFA 2GELA 3ATUA 4H0XB 1BWFO 5AQFA 4WQ5A 4FWRA 4BRLA 4BG9A 4XH4A 1LOTB 3AARA 2GTDA 1P8ZA 3QMLA 3MMVA 4B1XB 3I33A 3QICA 3SJHA 5F2RA 3CHWA 4MLEA 4WQ5C 3IUCA 4CZHA 2GEMA 4MO4A 3CJ9A 3CERA 3CQXA 3MN6A 5AQGA 1JCFA 3FR0A 3RSEB 3VF6A 4BC5A 5KQDA 2QWMA 1MA9B 4FWPA 2CH5A 3O08A 3BP8A 1HJOA 3D7EO 4BRHA 1ATNA 2P9KA 1T44A 4FWLA 3O1WA 2QM1A 4PKIA 3ULEA 4BQZA 5BN8A 1GLCG 4WYBA 4IJAA 4B1UB 3GG4A 3IMXA 5KPTA 1BOTO 4IZ9A 3UB5A 3W3DA 4QS7A 4BVOA 2D1KA 4BR0A 2ASMA 2P9NA 2ZWHA 4CZKA 3C7NB 3W0LA 5AR0A 5AQYA 2AP1A 1U2VA 1H1VA 4XEIA 4EIAA 5AQWA 3LM2A 4M63C 1MDUB 3ZEUA 1S3XA 4B1VA 4LC9B 1NGBA 5LJVA 1U6ZA 2D0OA 2ZF5O 3FE1A 3QBXA 1ZXOA 5LY3A 3SK3A 4YDUA 2P9PB 1YXQA 2P9LB 3DWLA 1BU6O 5ELZA 1BO5O 3O1BA 2IVOA 3D2FB 3VGKA 4BG8A 5AQJA 2P9IA 3A5OC 1YUWA 3EZWA 2P9SB 2V7ZA 3H3NO 2V7YA 4XH5A 3LL3A 2V51B 4JN4A 4FPBA 4JNEA 4E1JA 4CJ7A 4WQ4A 3A5LC 4BRCA 3H3OB 1XC3A 4IXCA 3A5MC 2VWBA 2E2QA 4GY2B 4AM6A 2QW9A 2NZTA 3KHYA 2WUSA 3ZETA 2D4WA 4FOIA 2P9NB 4BR7A 2HF3A 3MDQA 2J4RA 2ZGZA 1NWKA 5JMVA 1RFQA 3AY9A 3FZFA 5FPDA 2P9SA 3KZBA 3ZX3A 1BA1A 4BR4A 1ZBSA 3O5BA 1WOQA 3M3ZA 4EHTA 2E20A 4FWNA 3ENHA 1D4XA 3U9DA 1YAGA 3CQYA 3LDLA 5AQVA 5AQQA 3FZHA 2Q31A 4PL8A 2H3GX 1X3MA 2FSJA 4BROA 4DHYA 4JHDB 2QWOA 4PKHA 1NBWA 3VGLA 3VEWA 4B9QA 2F9TA 1RDWX 1T6DA 1TUYA 4I6MB 4EHUA 2F9WA 1NLVA 4BVPA 2FLOA 4A62A 5AQIA 3ZEUB 3MK6A 4NO7A 4BR2A 3FGUA 5AFUA 4BRIA 3C7NA 4FWOA 5F0XA 4JD2A 3TPQA 2CGKA 3A5NC 3HI0A 5AQZA 2E1YA 5AQXA 3EN9A 4K42A 3S41A 4CD3A 5LJWA 1GLJO 3IDHA 1BDGA 2FSNA 3VGMA 5AQOA 3WXKA 5AQUA 4CBUA 4YDUC 3GE1A 5AFUH 4H0YB 1QZ5A 4FWKA 5JLHA 3R9PA 2Q2RA 3QFPA 4DQ8A 5AQMA 3CJ7A 3VEXA 1WUAA 5AZJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TTDA 3CJBA 3TU5A 3FLCO 3IFRA 2HHXA 1NGAA 3AVLA 1W0HA 2P9KB 3QEVA 4A2BA 4OKJA 3OYAA 3P31A 4IWVA 4PA1A 4CJKA 3U4LA 4L8RB 3HXMA 1VQPN 4CZIA 4C23A 2UUCK 3NMUA 3DOLA 3NF9A 4H5VA 3CJAA 1RDDA 2O8EA 1RILA 4BRNA 1JKHA 3R8EA 4KB0A 2Z1IA 2HMPA 3TAPA 4M3ZA 3FZKA 2RHKA 1UA1A 1SL2A 4I6MA 1I39A 4FCYA 5J2MA 3QESA 2NRVA 3I0RA 4J2DA 2ETJA 3QDKA 4FM2A 3VQCA 4MDAA 1NKBA 2BH1A 5ADXA 2HHWA 4CFBA 1CZ9A 3DAWA 3EO3A 1QQNA 3FZMA 2Q36A 1WN7A 3L2WA 2E88A 4KREA 2ZQBA 4C8MA 1NGFA 3U3YA 3QEWA 1K8KB 3KLEA 1NJZA 3M8PA 5EX5A 3HP9A 1JLQA 1HKBA 3AA3A 2WFBA 3OYFA 2QWQA 4KBOA 3VQAA 4DQQA 4FSVA 4M3YA 2A41A 3WEEB 3L8BA 3K57A 4Z4FA 1HPMA 4BC4A 3FFIA 3TTFA 1K6YA 4CK3A 5LL6Z 3L4IA 1KAZA 3AVCA 1JJ2M 3G25A 2ZGYA 3J7YP 5IT9O 1Q82O 3KK1A 1IKWA 2VYPA 4CJUA 1SQKA 3DRSA 3NAEA 4IFYA 1GLAG 4CHOA 3TSQA 2RKIA 3VEZA 1HX1A 2UXBK 4M3RA 3OJSA 4CJSA 4DG1A 3V81A 5BPMA 1CXQA 1T6CA 1HNWK 1TAQA 4BQLA 1VQ4N 4CGFA 3Q7CA 2D0CA 4W5TA 1E4GT 4WQ4C 3CC4N 3AVGA 3AVBA 1YIJN 3SLCA 4DR4K 4H5TA 2IIRA 4RG8A 1Z25A 4FVMA 4C8KA 4YHHK 1BG3A 4LFBK 3N4QA 3A2FA 1V4SA 3KKRA 4FWSA 3E01A 1ITGA 3AO1A 3HPGA 4EP5A 3B6PA 1B9DA 1U04A 2WONA 3ISNC 4LF5K 1NGEA 3CM6A 1BQNA 2FF6A 4CD1A 3AO5A 3MX5A 3EYZA 2FF3B 3HZ6A 4BGBA 4DTSA 5F1XA 3MWTA 2HF4A 2HW3A 1LV5A 3EKUA 1YJ9N 1HYSA 3CCRN 5E41A 4FJJA 1VSDA 4O5BA 4Z4GA 2Q0UA 1VRUA 3S9HA 1KRPA 4OPAA 3AV9A 4MO5A 3O9TA 3VEVA 5AQHA 3SZ2A 3L6QA 4HUGA 4CJTA 5TKWA 2ASPA 2QK9A 3CCSN 4DUYK 2W40A 3UKUA 3LDNA 4F8RA 3WUHA 3QFUA 4DV0K 4KHQA 4KB1A 4Q5VA 1WSFA 1Q81O 1ATSA 1RBSA 4UY8O 3D0PA 2QXLA 4FK2A 4AHUA 4O5FA 1Z6RA 2A3ZA 1RDBA 4AHCA 4IDHA 2AA4A 4H0PA 4CZJA 3G6EN 4FM1A 4DFPA 4DS5A 1KC8O 1S9EA 4B1YB 4DUZK 4KTZA 4LF6K 3DXKB 1VSHA 1XHZA 5AZIA 5T7BA 1XMOK 3NVKA 1WBDA 5GAEP 1WSJA 4QCLA 1VSEA 4CJ5A 2W42A 5EY4A 4PY5A 1IJJA 1U47A 3LPTA 2KFNA 1VSJA 3HVTA 3WNFA 5HOOA 1NGDA 3AA4A 4CESA 3VQ9A 1YI2N 2FBTA 2V52B 4DSEA 4G9ZA 3CD6N 1FKOA 1L3SA 1YTAA 1VQLN 4A5AA 3ZSOA 1RT3A 2NRZA 4O8KA 4YOXA 2Q3SA 3I8BA 2KHOA 4ELVA 5BRHA 2JWKA 4FPAA 3EKSA 5C2FA 1SKRA 4JKGB 1S1WA 4ID5A 5JLFA 1ATRA 4W5RA 1XWLA 1TK0A 3HP6A 1TL3A 3VQ8A 3OA9A 3PV8A 2OZSA 3OS1A 4I2QA 2E6MA 4FJHA 1SS6A 5EXWA 4CJRA 2X6SA 3NH1A 1X9WA 1OVQA 4H0XB 1BWFO 2G8HA 2HNYA 1LOTB 4JI7K 5H1SQ 1KCFA 4WFBL 3BZCA 3HM9A 3MMVA 2BANA 3ZT0A 3CG7A 3HL8A 1IBMK 3RMDA 4WQ5C 1XMQK 3HO1A 4CZHA 4GV6A 3CJ9A 1U49A 3RSEB 3M5RA 3VF6A 4BC5A 5KQDA 2RN2A 1ZBFA 3L2UA 2CH5A 3K59A 1QVGM 4B9NA 3BP8A 2ZE2A 5AJ3K 3JSMA 1ATNA 2P9KA 5HRSA 5FRNA 1I94K 4CGGA 4JS4A 3KLFA 1HYZA 3F9KA 4PKIA 3ULEA 2VG5A 5BN8A 4WYBA 3KLHA 4DSKA 5KPTA 4DF4A 2P9NA 3OBWA 3K58A 2ZWHA 1GOAA 3ZSVA 4IFVA 1TKXA 4LSNA 1W2BM 5AR0A 5SWMA 3OYLA 3M8QA 1TKDA 1VSKA 4ELUA 1H1VA 4JKBA 4JKCA 4B9UA 4OO1J 3SAGA 4B1VA 2HHUA 1NGBA 1WAFA 5LJVA 3FE1A 1ZXOA 1NK8A 2X78A 4GKKK 5LY3A 4RW7A 4KHUA 2P51A 2P9LB 4FJIA 2O8FB 5CYQA 4KO0A 3OYGA 3A5OC 3VA0A 2P9SB 3TANA 3H3NO 1ASUA 1C0UA 1F21A 3THYB 1M1KO 4JN4A 4FPBA 2O8BB 1JXEA 2A1RA 1SL1A 4BRCA 1VK0A 2B4JA 3A5MC 2VWBA 2NZTA 3PIOL 4ZTJA 4CW7B 4E89A 3NH2A 2D4WA 2G8IA 5JMVA 1SL0A 3AVHA 1YT3A 1OH6A 4CCHA 3AA2A 1RFQA 3AY9A 3FZFA 1VQ9N 2P9SA 3KZBA 4ID1A 1KLMA 4M42A 1ASVA 1WOQA 4DTMA 2YV0X 3ENHA 3DLRA 4DFJA 4FLWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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