4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
1QZ5A 3IDHA 4QS8A 3QFPA 4BC3A 3VEYA 1K8KB 4JHDB 2V51B 3WQUA 3L4IA 5AQRA 1S3XA 3GBTA 3J8AA 3RSEB 4B1YB 4CD3A 4BR0A 1V4SA 3A8YA 5AQHA 3SJHA 3UKUB 2J4RA 4BC4A 5F0XA 3SMPA 3I33A 1BU6O 3VF2A 4JAXA 3FZHA 2F9TA 5AFUH 1EQYA 3CJBA 5AQNA 4BRHA 2P9UA 3ZX0A 5F2RA 1P8ZA 4I6MB 5AR0A 3CJ7A 4H0PA 4CBXA 1MA9B 1TYQA 1RGIA 4JNEA 3A5OC 3HTVA 1IG8A 2P9IB 2P9PA 5BR9A 4XEIA 2FXUA 3O6WA 2E2PA 2CGLA 4PKIA 5EXWA 2HF4A 2QWPA 1QQNA 4M63C 5FPEA 3O4WA 3LDQA 5AQZA 5BRFA 3OHRA 1Z05A 4BRGA 4Z94A 3CHWA 4BGBA 4C23A 3R6MA 1ATSA 4RWTA 5AQPA 2VWBA 3GE1A 2CGKA 1T44A 5E26A 4IJNA 4BR7A 1GLDG 3ID8A 3CJCA 4BR5A 4H0OA 1ZC6A 4NB4A 5AQYA 3F9MA 3GDQA 3FLCO 3HSCA 4EAHD 1X9JA 3WEEB 1HKBA 3G25A 3JXUA 3EKSA 1KAYA 3LDOA 3EKUA 3AARA 3HI0A 4BRPA 4BRAA 2YI1A 4XH4A 5EOYA 1NM1A 1G99A 3LM2A 2V7YA 2A40A 5AQLA 4YDUA 5AQWA 5JLHA 2HOEA 2P9SA 1QQMA 1YAGA 4H5VA 5ADXH 4EHTA 3QFUA 4WYBA 3FZMA 2E20A 4WQ4A 2AA4A 3FZKA 4DHYA 2W41A 3MN9A 5AQQA 3FFKB 4K43A 1QZ6A 4GNIA 5AQTA 3R8EA 3H1QA 4BRNA 1HX1A 3IMXA 4RCHA 1E4FT 1NMDA 4DCHA 2FSNA 4BC2A 3AAQA 5BN8A 3KVGA 3EN9A 1J6ZA 3VEWA 4MO4A 3MK6A 4H03B 3FZFA 2VYPA 1XUPO 5AQFA 4BG8A 1NGBA 4MO5A 1TUYA 1BWFO 1E4GT 1LOTB 3IUCA 3CJAA 1NLVA 1HLUA 3ZX2A 4RTFD 5LJWA 3QMLA 4GY2B 1S22A 1Q18A 2IVNA 4BQZA 3UKRA 1NBWA 4L3QA 2I7PA 5AQXA 5AZIA 1NGEA 1JCGA 5AQVA 2BUPA 1Y64A 4H0XB 1H1VA 2ZGYA 3ENOA 3D2FA 5F1XA 1HPMA 5AQIA 4KBOA 2FF6A 5BN9A 4B1UB 1NGGA 2FSKA 1DKGD 1X3NA 3FGUA 3JS6A 5AQJA 2AP1A 2NRHA 3TPQA 4BRKA 3CJ1A 3VETA 3B8AX 2GTDA 4IJAA 2D0OA 2GEMA 2QXLA 3CETA 4K25A 3KZBA 3VESA 2QWQA 3ULEA 3WQTA 3ZETB 4B1XB 1SAZA 3ZETA 2P9UB 4H0TB 4MLEA 5LJVA 4XH1A 5FPNA 3H3NO 4F9OA 4A61A 3LL3A 1TYQB 5BPLA 2YCHA 5BRHA 3MN7A 4FWRA 5EX5A 2P9PB 3MMVA 5KPZA 3EZWA 4BR2A 4CZGA 2WUSA 1RDWX 1OKJA 4A2BA 1NWKA 3H45C 3CQYA 4FWPA 2Q31A 2FLOA 3H1VX 4B1VA 2IVOA 1X3MA 4K42A 1U2VA 4H5TA 5BPMA 2P9KA 2D4WA 1T6CA 3BUZB 4CZMA 4CD1A 4CI6A 1ATRA 1YVNA 4HTLA 2A42A 5AQUA 4H0VB 1KAZA 4O8KA 3SK3A 2GWKA 5AQSA 4B1ZA 5AFUA 1GLBG 5FPMA 4FWQA 2QWOA 4LC9B 3H6EA 5ELZA 3A5MC 3MN5A 3AAPA 1BOTO 2ZWHA 1NGIA 1GLLO 3WXJA 1DEJA 3VGMA 1QHAA 4WQ5A 4IO8A 3U4LA 3DXMA 1D4XA 2E2OA 4B9QA 3UE5A 1MDUB 4BRMA 3A0IX 3C7NB 5CE3A 5AQGA 3C7NA 1YUWA 3QDKA 3QBXA 4BGAA 4CZEA 3MN6A 3W0LA 2P9SB 2ZGZA 3VGLA 2FF3B 2CH6A 2QWRA 3L0QA 1HJOA 2V52B 1GLJO 2A41A 2HF3A 3VOVA 1BUPA 3ZEUA 5JICA 1CZAN 1NGFA 2QWLA 3O08A 2FSJA 4BRCA 4ISFA 2D1KA 3BF3A 2ASPA 4CZKA 2QW9A 3VENA 5AZJA 4ISGA 3VGKA 2A5XA 2VCPA 4IZ9A 3MDQA 2H3GX 3ENHA 1IJJA 1NGHA 2E1ZA 3VERA 2P9LA 3QB0A 4JD2B 4BR4A 3LDPA 4JD2A 1LCUA 4WQ4C 1ATNA 2UYTA 5LY3A 3H3OB 1ZXOA 4FPAA 4IWVA 1Z6RA 4O5FA 4PKGA 2E2QA 2GUPA 2A6AA 5ADXA 3AY9A 2QWMA 5E84A 1KAXA 2PBDA 2Q36A 5BREA 1NGJA 1BO5O 4FWNA 1ESVA 2P9NA 2PAVA 3UKRB 4PL7A 4XH5A 1JCEA 5AQMA 1T6DA 3U8XA 3S41A 5AZIB 1HKCA 2YHWA 3KHYA 4ISEA 1NGDA 4M7XA 2E1YA 3MCPA 4FPBA 4BREA 3D2FB 3WUHA 3CIPA 2Q0UA 1XQSC 4IXCA 2Q1NA 4CZLA 2W40A 3GL1A 3LM9A 3TU5A 4BROA 5FPDA 3BF1A 2YJFA 3C0BA 5TKYA 4FSVA 4FWLA 2Q97A 4PL8A 5JMVA 3I8BA 4K41A 3GG4A 5KPTA 3HBTA 4BQLA 2F9WA 3ULEB 5KQ8A 3D2EA 1C0FA 3DXKA 3VEOA 3VPZA 2QWNA 4FO0A 4BRFA 3A5LC 1NGAA 1WOQA 1K8KA 2ASOA 3O1WA 4FWOA 4M7YA 4JHDA 1BDGA 3CJ9A 3P4IA 4QS7A 4CZFA 1KXPA 1V4TA 3BEXA 5KQDA 3M3ZA 3RSEA 1HKGA 2YJEA 4DQ8A 4EFHA 4H5NA 3M1FA 1U2VB 2ITMA 3UKUA 3VF4A 4DB3A 2P9KB 4PKHA 3L6QA 1TUUA 4NO7A 3D7EO 1BG3A 1SZ2A 4MLHA 1GLAG 4HWIA 3ATVA 5KPRA 3SMSA 4I6MA 1HUXA 2IIRA 3DJCA 4Y0WA 3FE1A 3LDLA 4FWSA 5AQKA 2P9IA 4JN4A 1QQOA 5BPNA 1RFQA 3O80A 4QS9A 2NZTA 2BTFA 2QM1A 3O5BA 5B8HA 4FWKA 4EIAA 4E1JA 3DXMB 4CZHA 4CBUA 3BP8A 1JCFA 3DAWA 2E88A 1WUAA 2EWSA 2Q0RA 1GLCG 5JLFA 2V7ZA 1C0GA 4FOIA 3ZX3A 3M6GA 4A62A 3QICA 3IFRA 4H0YB 4B1WB 1XC3A 3QBWA 4BC5A 3FR0A 3DWLA 3O1BA 3ZEUB 4WQ5C 1ZBSA 4J8FA 4H5WA 3WEEA 2ASMA 2GELA 3VEZA 3A5NC 4CBWA 4CJ7A 4FOEA 4A2AA 2Q2RA 5AZJB 3U9ZA 3LDNA 1NGCA 2YHXA 3O8MA 1BA1A 4BRDA 2E8AA 1R59O 3WXIA 2P9LB 2GWJA 3ATUA 3H46O 3HM8A 4YDUC 4AM6A 2OANA 4BRIA 3WT0A 2ZF5O 2E2NA 4BVOA 4BRLA 4CZIA 3WXKA 2KHOA 1BA0A 2A3ZA 2CGJA 3W3DA 2P9NB 4CZJA 4FWMA 3EO3A 1GLFO 2CH5A 4EHUA 4AM7A 2YHYA 4H5RA 5EVZA 3VEVA 3EL2A 3CI5A 3FZLA 2D0PA 2I7NA 3CQXA 3GOIA 3WXLA 5BRDA 1GLEG 1MWKA 3VF6A 4BVPA 4FL9A 3UB5A 5EY4A 3HZ6A 2IVPA 1SQKA 3SLCA 4BRQA 3CERA 4BG9A 5I9EB 1U6ZA 3D2EB 3DXKB 4BR9A 2NLXA 2DPNA 3U9DA 1DGKN 1MWMA 3R9PA 5AQOA 3VEXA 1YXQA 2HMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WTUA 1IKYA 4EP5A 4PHTX 5KGXA 3ISNC 4CGIA 3SAFA 2UUCK 1C6VA 2V51B 3LWMA 3Q7CA 5AQRA 1U47A 4B1YB 3GBTA 4AHRA 1V4SA 3LP1A 3A8YA 3UKUB 3E1YA 3KWGA 4JAXA 2P9UA 5EU7A 1RILA 1HNVA 1NJYA 4I6MB 5AR0A 2Y1IA 3CJ7A 5D3GA 2VG7A 2YKNA 3OTOK 3ZSQA 3HTVA 1IG8A 4IFYA 4CEOA 2P9PA 5C2FA 2O8EB 3AO3A 2FXUA 2NRVA 2XY7A 2QK9A 3PO4A 4OKKA 3HJFA 1YI2N 4M63C 1IBKK 3O4WA 4KHQA 5C42A 2VWJA 3VQ5A 4B3MK 3V1RA 1OH6A 2FC0A 4RW7A 4KH6A 5H1SQ 3EZ5A 4DV1K 3R6MA 3V6DA 2E5LK 4RWTA 2CGKA 4IBNA 2VQFK 3SQ0A 3G10A 1KFSA 4DFMA 1VSDA 1G15A 2YNIA 4MDAA 3FLCO 4EAHD 2F8SA 4MFBA 3G25A 4A59A 5IWAK 3EKSA 3QEPA 3K5LA 4FJIA 5CYQA 2HSTA 4HVJA 5J2PA 4KTQA 4BRPA 4BRAA 1XNQK 2YI1A 3KLIA 4OO1J 4O55A 2G8KA 3LM2A 1S9GA 2A40A 1K6YA 2P9SA 5M1PA 1YAGA 5ADXH 4EHTA 4CFBA 2QTDA 1IH7A 3QFUA 2E20A 3OS1A 3MN9A 1Z25A 3FFKB 1X9MA 2VWKA 4BRNA 3H1QA 3L3UA 4HTUA 4KV8A 1NK0A 3BDPA 1NMDA 2FSNA 4CF9A 1J6ZA 4MO4A 2FBTA 2VYPA 5GADP 1YJ9N 1W9HA 5AQFA 3T7ZA 4IEEA 4BG8A 1U45A 5GIOA 1K9MO 4MO5A 1TUYA 3OVNA 3V9UA 4O0JA 1NLVA 1NKCA 1JL2A 5LJWA 1BCMA 4PY5A 1S22A 4DFPA 3UKRA 1S1VA 3TTCA 1NGEA 4DQPA 1Y64A 2GV9A 4BWJA 1SKSA 3AVGA 1H1VA 2ZGYA 3DI6A 3D2FA 2HHHK 2FF6A 5J2NA 4JI1K 2UU9K 1X3NA 3K57A 3JS6A 1I3AA 3L2VA 2NRHA 3P5JA 3TPQA 4BRKA 4Z0UA 3VETA 4B9VA 1OH5A 3LP2A 3ZT1A 1NOYA 4FJ7A 3B8AX 2GTDA 4DV6K 3VQDA 1JLAA 1W2BM 3WQTA 3CCJN 3P83D 1RDUA 4KI6A 4FVUA 4OGCA 3C6AA 4XIUA 3JYTA 3CF5L 4DUZK 5LJVA 3V9SA 5FPNA 3LDSA 4YHHK 2G8UA 1UWBA 3LL3A 3TTFA 3ZSXA 4FJGA 3HPOA 4FWPA 3H1VX 4M3RA 4JK9A 1X3MA 3DRSA 2P9KA 3TAFA 3LAMA 1BI4A 4BE2A 2WOMA 4HTLA 2B5JA 5AQUA 4H0VB 3SK3A 5AQSA 1IKWA 1F21A 1XMQK 2HHUA 2QWOA 3B6OA 4W5RA 3MN5A 4JEPA 3TAEA 3TSUA 1ASWA 3WXJA 2KQ2A 3OYNA 3U4LA 1D4XA 4X62K 3SUQA 1OVYA 3QO9A 3C7NB 5AQGA 1YUWA 4F3OA 3QBXA 1HMVA 2ZE2A 4M3XA 1VK0A 1BQMA 3L4QA 4JYAK 4KHPK 2FF3B 2CH6A 2QWRA 4CF0A 3CCQN 2VGMA 4EZ6A 3VA3A 4ELUA 2HF3A 1BUPA 3ZEUA 1NGFA 1KLMA 3O08A 4DLGA 4KAZA 3I56N 2D1KA 3EEQA 2QW9A 3VENA 5AZJA 2VCPA 1IJJA 1YIJN 1NGHA 2E1ZA 1YVUA 1MU2A 2P9LA 4GKKK 5KTQA 2PFUA 3LDPA 2W6KA 4OKJA 2UYTA 4J2DA 3H3OB 1ZXOA 5LMUK 1Z6RA 1TAQA 3AO5A 3CCSN 2GUPA 5ADXA 1KAXA 1GOCA 4FWNA 3HVRA 3C6HA 3PX0A 1FK9A 2PAVA 1W97L 4DTUA 5AQMA 3U8XA 1JKHA 3S41A 4Y1DA 2NRXA 4YOWA 1HKCA 4DFJA 2E1YA 1QHTA 3O4NA 4BREA 3SUNA 1Q9XA 3AA2A 4W5QA 1UA0A 1A5WA 3CC2N 3CPWM 4FSVA 2Q97A 4ILHA 5JMVA 3I8BA 3KLHA 2WC9A 3GG4A 3D2EA 1TK0A 1HYVA 3MXMA 3VEOA 3NBPA 3VPZA 2QWNA 3AVJA 2OPQA 3DOLA 3AVCA 5TKWA 1WOQA 2ASOA 1Q82O 1KCFA 4M3ZA 1B9DA 1NNEA 4DQSA 4B9UA 3NF6A 3SNNA 1VSLA 4KB0A 4B8AB 2PZSA 4M3WA 5CR4A 1L3UA 3M1FA 3LANA 3UKUA 4NO7A 1N5YA 3VTHA 1BG3A 3OYMA 1NG9A 3SV3A 1RT7A 4DU1A 1GLAG 2QA4N 5HL7L 1TVRA 3TANA 1Z26A 4OKEA 5C10A 4CHQA 4R5PA 4I6MA 3CG7A 1JLQA 2IIRA 4Y0WA 3MXIA 3LDLA 4WF9L 4B9SA 4E19A 4JN4A 2O8EA 1QQOA 5BPNA 1D8YA 2QM1A 4E1JA 3BP8A 1JCFA 3K9KA 3KLEA 1NK7A 2Q0RA 4FJMA 4CFDA 2V7ZA 4IOAL 4PUOA 1VQ7N 4J2BA 1HPZA 1IO2A 5HRSA 4A62A 2NNWA 4CEAA 2BANA 3ITHA 4DSJA 4CJPA 4DV3K 4H0YB 4B1WB 4E7KA 3QBWA 3PX4A 1YJNN 1TK8A 3F9KA 3FR0A 4FK0A 1EKEA 4Z4HA 1S6QA 3DLKA 1VQ6N 2XHBA 3RMBA 3VEZA 3A5NC 5JVHL 4A5BA 3Q7BA 1CZBA 1NK6A 2E8AA 1VQNN 4B3TK 1ILYA 4L8RB 4BRIA 4CHYA 1K8AO 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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