4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
5EY4A 4H5RA 4FWPA 4IJAA 2QM1A 2F9TA 4DB3A 3DJCA 4IO8A 2FXUA 1QZ5A 2QWNA 4ISEA 4A61A 4WQ5A 3D2EB 2P9IB 3D2FA 3LDQA 3WXJA 4CZFA 4BR2A 3DWLA 3JS6A 2UYTA 2V7ZA 3R8EA 2Q1NA 3IUCA 3CETA 5LJWA 3VEYA 4BRFA 3GE1A 3UE5A 2QXLA 4BC4A 2YI1A 3DXKA 3GBTA 3O8MA 3LDOA 2P9UA 1BDGA 4H0TB 4GNIA 3VEOA 2I7NA 2W41A 4WYBA 5JMVA 1NBWA 4A62A 3CI5A 3UKUA 3F9MA 1JCEA 3A5OC 3A5MC 3FZKA 3KVGA 3D7EO 3VGLA 1NGAA 3O1WA 5BREA 3HM8A 2DPNA 5AQMA 4FWNA 1XUPO 5BN9A 1NWKA 5BN8A 3VETA 1NGEA 2E2NA 2FF3B 2KHOA 3P4IA 2IVPA 4BG9A 4QS9A 3CJBA 3WUHA 5AQRA 2D4WA 1BUPA 4J8FA 3O5BA 4CZGA 5KQ8A 4MO5A 3BUZB 3SJHA 5AZIA 5EX5A 3H3OB 2QWOA 1QZ6A 4JHDB 3WT0A 4BGBA 4BR7A 1S3XA 3WQUA 2V7YA 1ATRA 1HX1A 2E88A 4O5FA 5EXWA 3SLCA 4WQ5C 1KAYA 2P9KB 3SMSA 1QQMA 3ZEUA 3VOVA 1V4TA 3H45C 4FPAA 2P9LB 1HJOA 4FWMA 3CJAA 3CJ9A 4PL8A 3ULEB 3MK6A 3D2EA 3QFPA 4IZ9A 2PBDA 3AARA 1GLCG 3TU5A 1RDWX 2HF4A 2QWLA 3MMVA 5BPNA 2ASPA 3W0LA 4JNEA 1NMDA 5EVZA 2OANA 3CJCA 2VWBA 5AQNA 1TUYA 1HKGA 1DKGD 3HBTA 4K43A 3H1QA 4M63C 3WEEA 2QW9A 4BRLA 4JD2B 3EKUA 4FWLA 5FPNA 1MWKA 3ZX2A 3EZWA 2VCPA 3VF6A 5JLFA 4ISFA 3VERA 3VF4A 3ENOA 1ATSA 2YHWA 1WUAA 3G25A 4A2BA 3BF3A 4BVPA 1BOTO 3GOIA 4AM7A 4PKGA 3IFRA 1TUUA 1TYQB 4BG8A 2Q2RA 5BRDA 1XC3A 3QMLA 4B1WB 3VF2A 3QB0A 4BRKA 1Z6RA 3A5NC 1U2VB 5LJVA 3WXLA 2F9WA 1YAGA 3C7NB 3CIPA 3CJ1A 4FWSA 4H0YB 1QQOA 4Z94A 1SAZA 5B8HA 2IIRA 4BC5A 5AZJA 4FWQA 3ID8A 1NGFA 2VYPA 5AQFA 5LY3A 2FSJA 3O4WA 4BREA 1NGJA 4BC2A 5AQOA 4ISGA 1DEJA 4BRIA 4BC3A 4JHDA 4BRQA 2CH6A 2FLOA 3UKRB 4DQ8A 3O80A 3VENA 4XH1A 3CERA 2P9KA 5KPTA 3KZBA 1HUXA 4F9OA 5FPEA 5BPLA 1ZBSA 1K8KB 5AQWA 3WQTA 5I9EB 2P9LA 3ULEA 4BGAA 1BA0A 3J8AA 2GELA 1WOQA 3BEXA 5F0XA 4KBOA 4CZHA 3FZMA 1NGCA 3A5LC 3RSEB 3I33A 5AFUA 1S22A 3BP8A 3S41A 4B1XB 1NGDA 3U9DA 5AQJA 4B1UB 4M7YA 2V51B 4H5NA 1BO5O 4PKIA 5KQDA 2GUPA 4GY2B 3U9ZA 4JD2A 3QBXA 3FLCO 3VGMA 3HTVA 1LOTB 5AQUA 2E1YA 4RWTA 5BPMA 3KHYA 1Z05A 2P9PB 3ATUA 1J6ZA 4L3QA 4NB4A 4M7XA 2ZWHA 4CD3A 4BVOA 1KAXA 1TYQA 5JLHA 1QQNA 3FGUA 4E1JA 5ADXA 4BR9A 1U2VA 4BR5A 4XH5A 2A6AA 3C7NA 1JCFA 3H3NO 4CBXA 1SQKA 4NO7A 4PKHA 1NGGA 2E2QA 3CJ7A 4CI6A 2IVNA 5E84A 4EIAA 4IJNA 1U6ZA 1T6CA 3O08A 5AQLA 3VEXA 4RCHA 4CZLA 1JCGA 1KXPA 2GTDA 3D2FB 2P9IA 4JAXA 4H0VB 5KPZA 3ZETB 3L0QA 5AQVA 2QWMA 2BUPA 4H5WA 4FL9A 2I7PA 2A42A 3UKRA 1BA1A 2ASMA 5E26A 3FZLA 4IXCA 3HI0A 4EAHD 4EHTA 2PAVA 5FPMA 3WXKA 1E4FT 4BRHA 2E2OA 1BU6O 1K8KA 4FOEA 2CGJA 3DXMB 1C0GA 2YCHA 4AM6A 3UKUB 4CBUA 4WQ4A 4YDUA 5FPDA 3M6GA 1ESVA 1X3MA 5EOYA 3RSEA 3A8YA 1GLBG 5CE3A 4K41A 4H0XB 3CHWA 2HOEA 2ZF5O 3L6QA 1HPMA 3M1FA 1Y64A 3GG4A 2YHYA 1YUWA 3LDNA 5AQPA 2FSNA 4A2AA 1ATNA 2ZGYA 1NGHA 4I6MB 2NRHA 2E2PA 4BR4A 1H1VA 1HKBA 5AQTA 3C0BA 2CGLA 1NLVA 4K25A 4CZJA 5AQHA 3TPQA 3EKSA 3QBWA 2A5XA 5BR9A 3EN9A 3VEVA 2P9PA 4PL7A 2Q36A 1BWFO 3U8XA 4BRCA 3GDQA 4BRDA 3LL3A 4B9QA 4MLEA 4CD1A 3LM9A 1RFQA 1KAZA 3EL2A 1Q18A 2E20A 4H0PA 2W40A 4BRAA 4H5VA 4RTFD 4BRNA 1G99A 3FR0A 3DAWA 2AA4A 3ATVA 3SK3A 2E1ZA 2Q0UA 4BRPA 3IDHA 3FFKB 3LDLA 3LM2A 1T6DA 2YJFA 3JXUA 2GEMA 3AAQA 4Y0WA 3MDQA 4MO4A 4HWIA 2HMPA 4FO0A 3ZETA 4B1YB 4H03B 2IVOA 4CZMA 5AFUH 1RGIA 2D0PA 5JICA 4WQ4C 2P9NB 3FZFA 5BRFA 4YDUC 1IG8A 4CZEA 3B8AX 3A0IX 1GLLO 4FOIA 1NM1A 2A41A 1GLEG 5AQXA 4FWOA 4O8KA 1MDUB 3DXMA 4QS7A 1XQSC 3WEEB 4BQZA 4JN4A 1ZXOA 4BRMA 4K42A 2QWPA 4MLHA 3ENHA 2Q97A 2QWRA 2Q0RA 4BR0A 2D1KA 4CZIA 2CH5A 2NZTA 3R9PA 2CGKA 3HZ6A 3FZHA 3M3ZA 3OHRA 2ASOA 4DHYA 3UB5A 1X3NA 4B1VA 2A40A 2P9SB 4I6MA 5AQIA 4FWKA 5ADXH 1MA9B 5F1XA 3U4LA 1QHAA 3CQYA 5AZJB 5AQQA 4LC9B 3H1VX 1EQYA 5ELZA 5AQGA 2YJEA 3VEZA 3SMPA 4XH4A 2GWJA 1P8ZA 5TKYA 1YXQA 1BG3A 3QDKA 3AY9A 3GL1A 1IJJA 4H0OA 3VGKA 3ZX0A 3O1BA 2A3ZA 3O6WA 3MN9A 1C0FA 1T44A 3AAPA 1NGBA 2ZGZA 1V4SA 2D0OA 3DXKB 2YHXA 2HF3A 3MCPA 2P9UB 4FPBA 1DGKN 3R6MA 4EFHA 3H6EA 1R59O 3HSCA 3CQXA 3QICA 3WXIA 1LCUA 2FSKA 1E4GT 1GLFO 5AQYA 4BROA 2FF6A 5AQZA 4H5TA 1CZAN 1MWMA 2Q31A 2EWSA 3VEWA 2P9NA 1GLJO 1SZ2A 4XEIA 3FE1A 4FSVA 3MN6A 1YVNA 3EO3A 3L4IA 1GLAG 2H3GX 2WUSA 1NGIA 1HKCA 3VPZA 1D4XA 1GLDG 4IWVA 3MN7A 1X9JA 3H46O 5AR0A 3LDPA 5AQSA 2GWKA 4EHUA 2BTFA 2NLXA 2ITMA 3BF1A 3QFUA 4DCHA 1OKJA 4B1ZA 4FWRA 5AZIB 2QWQA 5F2RA 1ZC6A 4BRGA 3ZX3A 4BQLA 5AQKA 2AP1A 2P9SA 4CBWA 3MN5A 3W3DA 5KPRA 2J4RA 4C23A 4CJ7A 2V52B 1HLUA 4QS8A 5BRHA 4HTLA 2E8AA 3VESA 3I8BA 4CZKA 3IMXA 3ZEUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLHA 4IJAA 2QM1A 1ITGA 3DJCA 2FXUA 4MDAA 2QWNA 4A61A 3DLBA 4CF1A 3D2FA 1S5JA 3WXJA 1EWRA 4CJLA 3OYGA 2IAJA 3DWLA 2OA8A 2UYTA 3HP9A 5LJWA 4ILGB 4BRFA 4J2AA 5HLFA 2YI1A 3DXKA 3GBTA 3O8MA 2W6KA 3HT3A 1NK6A 2W41A 2YNFA 3VTIA 4YOWA 4DSJA 3CI5A 3C94A 3V1OA 2UXDK 3VGLA 1XI1A 3O9TA 4HUFA 4M42A 2ZM6K 4CJ4A 3HM8A 3DLRA 1NWKA 3NBPA 4FJXA 3IG1A 4IDHA 2DFFA 3O9SA 1KTQA 3DOKA 1TGOA 1JL1A 3J7YP 4DV5K 4BG9A 4CGIA 3NGIA 1JLEA 4B9TA 5AQRA 4C8KA 4ELUA 3DMJA 1EETA 1FJGK 2P5GA 5KQ8A 3BUZB 4LF6K 3KK7A 3NMUA 5AZIA 4IFYA 5EX5A 4M41A 1QZ6A 4JHDB 1YTAA 2WTUA 4BR7A 4YOXA 1KAYA 5J2QA 2B5JA 3KLHA 5C2DA 3H45C 4FPAA 1HJOA 1WSGA 4PUOA 4FWMA 3CJAA 4PL8A 4U7BA 4FM0A 4IKFA 3L3VA 2O4GA 3E66A 2F96A 4FVMA 4ID5A 1KFSA 2PBDA 3AGRA 2ETJA 1GLCG 3TU5A 3DRSA 1Q8IA 3G4SN 4CEBA 5CZ1A 3ITHA 4JNEA 2OANA 1YITN 2VWBA 1JLFA 1T03A 1HYZA 4OPKA 2QA4N 3HVTA 4M63C 2QW9A 3U6FA 4JD2B 3ZX2A 3Q7BA 1MWKA 4FK0A 5AJ3K 1LWCA 3SAGA 3I8DA 4DTRA 2DY4A 1ATSA 4BDPA 1VRTA 4KHPK 4B3TK 2ZQBA 4O44A 3GOIA 1SL0A 1TUUA 3OVNA 3LAKA 1XC3A 4HUEA 3VA3A 3VF2A 1JXBA 3NGYA 4DF8A 4MQ3A 1YAGA 5B8HA 4LF9K 3CJ1A 4CHOA 3AA5X 1XC9A 4AHCA 4L8RB 1C1BA 3E9OA 2IIRA 1RILA 4BC5A 5D3GA 3NF9A 3CYMA 3ZSWA 4DR3K 3WNFA 1KLMA 5BR8K 3HK2A 2ATQA 4BREA 3CCRN 1NGJA 4BC2A 4E7IA 4NLBA 1DEJA 2E4LA 3UKRB 4XH1A 1N36K 2P9KA 3KZBA 5FPEA 4CGHA 4DR6K 3AVKA 3V1QA 5I9EB 3OS0A 1A5VA 4C1NK 3ULEA 1GOAA 4BGAA 1BA0A 3I0RA 1WOQA 4OPHA 4A5AA 1TVRA 4CFBA 4LF7K 5AFUA 3PSFA 4CHYA 1ZYQA 4B1XB 3QEIA 4FM1A 2PYLA 5AQJA 4IO9L 4J2BA 4M7YA 3DYAA 4CJTA 4X66K 2GUPA 2KTQA 3VGMA 4RWTA 4Z4GA 1D9FA 1Z05A 2P9PB 1VAZA 3ALYA 4M7XA 4CD3A 4LD0A 1EO1A 2EHGA 5JLHA 1TYQA 5C12A 3L2VA 3V9SA 3HM9A 4BR9A 4CK2A 1U04A 2E2QA 4C8LA 3B6PA 1U6ZA 1JLCA 3VEXA 1DTQA 4CZLA 1NK7A 2IC3A 3NFAA 1EKEA 3KLFA 1JCGA 3V1RA 3L8BA 1KXPA 4JK9A 1ZBFA 3HOSA 3D2FB 2O8DA 4B9LA 3ZETB 1RDBA 2I7PA 1SL1A 3J80O 4O55A 2PAVA 1QE1A 4YOTA 1BU6O 1K8KA 4DQQA 3DOLA 2UUAK 1C0GA 4WQ4A 4WE1A 2YHAA 4DFJA 1VQ9N 4K8XA 1X3MA 4CJUA 1GLBG 4K41A 4KHSA 2NRTA 5GIOA 4JYAK 1RBTA 3VTHA 3E01A 5KGXA 4FLZA 3LDNA 5C15A 2FSNA 2YKMA 3QETA 4DQSA 3U3GA 1ATNA 2ZGYA 3TAEA 2E2PA 4BR4A 4FLXA 1H1VA 3G6EN 2HBKA 3CPEA 1EWQA 4DTUA 1WLJA 3EKSA 5HROA 1RBVA 4DV4K 4DFPA 2FBVA 3M8SA 3K5MA 3V9UA 3VEVA 1ZBLA 1X1PA 2YHBA 4DS4A 1RBRA 2Q36A 4DSLA 1C1CA 2IDOA 4JK7A 4H0PA 3VQ6A 1S6QA 3OJSA 4H5VA 2JGUA 1BI4A 4CEZA 3DAWA 2Q3SA 3HYFA 3LPUA 3AVCA 2QTDA 3JXUA 4PY5A 4MO4A 5M1KA 1KVCA 5T7BA 4B1YB 4H03B 3BZKA 3DLLL 2FC0A 2NRXA 4ID1A 4B9SA 3G10A 1C0MA 4FJGA 2D0PA 3RMCA 4JI2K 3VQAA 4WQ4C 3FZFA 4N47A 1XHXA 3NF7A 2Z1JA 1QVGM 4FWOA 3KTQA 3NCIA 3DXMA 3OA9A 5IWAK 3CC7N 4BQZA 3L2UA 3SYZA 1NOZA 3CC2N 4BWMA 1JXEA 4F4KA 2QWPA 3O4NA 4FLVA 4BR0A 2Q0RA 2D1KA 2CH5A 3ZYYX 1K8AO 1RBUA 4DSKA 1A5WA 3M3ZA 3T3FA 5CHIA 3UB5A 4B1VA 5AQIA 2A40A 4ELVA 4LF5K 1S72N 3C6UA 1KCFA 2QI2A 1P90A 4HCCA 1XWLA 4EP4A 3C65A 2HMIA 3DRRA 3ISNC 3SMPA 4XH4A 4CEQA 4JS5A 1VQON 3AY9A 1IJJA 3CFRA 4H0OA 3O1BA 1MU2A 2WONA 3MN9A 2VQFK 1HRHA 1TKTA 1X9SA 3EY1A 3OYFA 3OYJA 2BH1A 2GX9A 3KIOA 5C2FA 4RW6A 3L2QA 2P9UB 5JS1A 4DU4A 1DT9A 1YF5L 2VGNA 4CJEA 4EFHA 2BANA 4Y1DA 3ZSQA 4AHRA 3QERA 4KH6A 2X6SA 3NH0A 1E4GT 2FF6A 4FLTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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