4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
3VF6A 3CI5A 2V52B 1TUUA 2Q0RA 2YCHA 5AQYA 3CERA 5KPRA 3HBTA 2QWOA 3DAWA 4BRMA 3KVGA 4CZJA 3MK6A 4BRKA 3A5NC 5AQVA 5EOYA 4BR5A 5JICA 1HKCA 3EO3A 4MLHA 5EVZA 4EHUA 5JLHA 1G99A 4FO0A 4BGAA 2BUPA 2ASMA 2IVPA 1ATRA 5BN9A 4BRIA 2D0PA 3O6WA 2GTDA 3GG4A 1QQNA 3ENHA 5AQZA 4AM7A 2GELA 4PKHA 3VEYA 1NGJA 4BQLA 1X3NA 4M63C 3VENA 3VPZA 4Y0WA 1QZ6A 4CZMA 3VGLA 4IXCA 1HLUA 2E2NA 4BRAA 5F2RA 4CI6A 4ISEA 2H3GX 3ATUA 1TYQB 5F0XA 4IJNA 4BC3A 4H0PA 5AZJA 3ATVA 4CZEA 1IG8A 3BF1A 3FE1A 4FOEA 2Q2RA 1GLDG 5FPNA 4BRNA 3BUZB 5JMVA 1Q18A 3H1QA 4RCHA 1NGBA 2HF4A 4RTFD 1QQMA 3GOIA 3D2EB 2I7NA 3MN5A 1YXQA 2GWKA 3MN6A 4B1WB 2W41A 3QB0A 4A62A 2V7YA 3EKSA 5AFUA 3SMSA 2P9UA 3RSEA 4A2AA 1GLJO 5EX5A 3W3DA 4BREA 1NGEA 1S22A 4JD2A 1P8ZA 4BRQA 5AQTA 3M3ZA 1Y64A 3VEOA 3LM9A 3LDNA 3AY9A 3L4IA 3LM2A 2A41A 3QBWA 3JS6A 2P9LA 2ITMA 1JCEA 3DXKB 3IMXA 4XH4A 4BC5A 1KAXA 3ID8A 3DWLA 1SZ2A 3DXKA 4HTLA 2CGJA 5AQIA 5AQNA 4CZKA 5BR9A 3ZX0A 4JAXA 2IVNA 4K41A 1C0GA 3FZLA 4BQZA 1XC3A 1GLEG 2FF3B 2EWSA 2Q97A 1LOTB 3BEXA 3O4WA 3CJ9A 3AARA 3U9ZA 3U9DA 4B1VA 4CZLA 3CJCA 2ZGYA 2VWBA 2FSNA 2E20A 4PKGA 4CZIA 5EY4A 3VEXA 1JCFA 5LY3A 3VGMA 4F9OA 4B1YB 1D4XA 4YDUC 3VEVA 4I6MB 4AM6A 5FPEA 1NGGA 2P9NA 1MWKA 1NGAA 3QFUA 3R9PA 3HZ6A 5FPMA 3VETA 5AQKA 1ATNA 1E4GT 3LL3A 4XH1A 2Q31A 1ZBSA 2P9IB 2Q0UA 4FWOA 4WQ5A 3GE1A 3UKRB 4CBXA 5ADXA 4KBOA 4EFHA 4Z94A 4H0TB 5BN8A 1HKGA 3UKUA 4BG9A 1T6CA 3WUHA 2V7ZA 4CBWA 3AAPA 3DXMB 4K42A 5AQUA 2P9SB 4H0XB 1X3MA 3C0BA 4H03B 3EKUA 2VCPA 2QWRA 4FWNA 2ZF5O 3VESA 2FLOA 1BA0A 1TYQA 1MA9B 2P9SA 2PBDA 4O5FA 1X9JA 3FZFA 4DQ8A 2P9KB 4FL9A 2CGKA 4BRCA 5I9EB 1KXPA 5AQHA 1KAZA 1V4SA 2QXLA 3O5BA 5AQXA 3FFKB 3VF4A 3H45C 4B1ZA 4NO7A 5BPNA 1ZXOA 2E8AA 3AAQA 5BPMA 3UB5A 3QDKA 4JHDB 4MLEA 4BR9A 3ENOA 1HPMA 2A40A 3BP8A 3C7NB 3W0LA 3CJ7A 1E4FT 1IJJA 2A3ZA 4BGBA 4QS7A 3VF2A 1U2VA 2AA4A 3CQXA 2GEMA 3H3OB 1NGFA 4MO5A 4PKIA 4WQ5C 5BREA 3A5LC 1NM1A 1WOQA 2CH6A 3VEZA 4XH5A 3FZKA 3SLCA 3FGUA 3WXLA 3A5MC 3ULEA 3CETA 5LJWA 4CZFA 5AQLA 3LDLA 4BVOA 4GNIA 3QMLA 2E1ZA 4MO4A 3FLCO 1GLBG 2A6AA 5AQOA 4A2BA 1NBWA 2DPNA 1RFQA 3WEEB 1HUXA 4I6MA 4EAHD 3CHWA 3TU5A 4B1XB 4A61A 3ZETA 3MCPA 1SAZA 4E1JA 3TPQA 5KPTA 1BO5O 5KQ8A 4QS8A 2UYTA 3KHYA 2ASOA 1J6ZA 3J8AA 3O1BA 4NB4A 4H5RA 4B1UB 3WEEA 2HMPA 4JHDA 3FZMA 1GLFO 3WQUA 1TUYA 2YJFA 2V51B 2CH5A 3EZWA 3IFRA 1QHAA 5JLFA 4HWIA 3MN9A 4BROA 2IIRA 1JCGA 1YAGA 1Z05A 2HF3A 4FWKA 2QWMA 2NRHA 2HOEA 3ULEB 2P9LB 3O08A 4K43A 1EQYA 5F1XA 2BTFA 5B8HA 2P9IA 4H5TA 1HJOA 3MDQA 4BRDA 2KHOA 2QW9A 1ATSA 3SK3A 1DEJA 3GL1A 4IO8A 3GDQA 5TKYA 5AQFA 5E26A 2QWNA 3ZEUA 4DCHA 5ADXH 3QBXA 2A42A 3M6GA 2QWLA 5EXWA 3ZETB 2YJEA 2PAVA 5E84A 1NLVA 3B8AX 4CJ7A 1NGDA 5AQPA 4B9QA 5CE3A 1C0FA 4BRPA 3CJAA 3VEWA 4FPBA 2YHXA 1NMDA 4O8KA 5KPZA 3R8EA 3F9MA 5AQQA 3LDPA 4JNEA 3VERA 4DB3A 5AFUH 2P9KA 4PL8A 3D2FA 5BRFA 1RGIA 2E88A 2AP1A 2W40A 2P9PA 1BG3A 2ASPA 1KAYA 5AZIA 1MWMA 3D2EA 4M7XA 4FWQA 3A5OC 3G25A 4CBUA 4CD1A 4EHTA 1GLAG 2VYPA 1S3XA 4PL7A 4EIAA 3A0IX 4BRFA 3H1VX 1CZAN 4WYBA 3UE5A 1H1VA 3DJCA 2IVOA 4FWPA 1BUPA 4CD3A 3CJ1A 2NZTA 1DKGD 3ZX3A 3CQYA 4ISGA 2YHYA 4IZ9A 4L3QA 3L0QA 3RSEB 2CGLA 2P9UB 3UKUB 3WXIA 2I7PA 5FPDA 2E2PA 3IDHA 3DXMA 3HSCA 1T6DA 1XQSC 4H5NA 3VOVA 3QFPA 1SQKA 3WXJA 4BG8A 3M1FA 3ZEUB 3SJHA 2NLXA 3KZBA 5AQGA 3H3NO 1V4TA 3I8BA 3WQTA 2F9WA 2F9TA 4H5VA 5BRHA 5AR0A 3H46O 3U8XA 3L6QA 1QZ5A 4DHYA 3VGKA 5AZJB 4H0YB 4WQ4C 1ESVA 3U4LA 4FWMA 4FWLA 4QS9A 2J4RA 5AQMA 4IJAA 2FXUA 4BVPA 3O8MA 4CZHA 1WUAA 3EL2A 5AQRA 4BRHA 2Q36A 3HM8A 3BF3A 4FWRA 5AZIB 5LJVA 2E2OA 1BU6O 2FF6A 4FSVA 4H5WA 4XEIA 1T44A 1NGIA 4K25A 3WXKA 4IWVA 1MDUB 3R6MA 2D4WA 3LDOA 2YI1A 3O1WA 3CJBA 3HI0A 4BR0A 3S41A 4BC2A 3D2FB 4J8FA 4BC4A 3O80A 3D7EO 2OANA 1OKJA 4CZGA 3SMPA 1R59O 2GWJA 1GLLO 1Z6RA 3H6EA 5BPLA 4JN4A 1BDGA 1BWFO 2D0OA 4BR2A 2Q1NA 1GLCG 1NWKA 4FWSA 4GY2B 3WT0A 5ELZA 3JXUA 3C7NA 4ISFA 1NGCA 3CIPA 2QM1A 5KQDA 4BR4A 1U2VB 4LC9B 2GUPA 2P9NB 4M7YA 3MMVA 4H0VB 3EN9A 4WQ4A 3MN7A 1XUPO 3FZHA 3QICA 3P4IA 2YHWA 1K8KA 2E1YA 2A5XA 1HX1A 4FPAA 2ZWHA 3HTVA 3ZX2A 2E2QA 1U6ZA 1QQOA 1YVNA 3UKRA 3GBTA 5AQWA 4YDUA 3FR0A 5AQSA 2WUSA 1LCUA 3LDQA 4C23A 4FOIA 1NGHA 2QWQA 3I33A 3OHRA 5AQJA 3IUCA 2ZGZA 1BA1A 1K8KB 2D1KA 4H0OA 1DGKN 4RWTA 5BRDA 4BR7A 2P9PB 1YUWA 3A8YA 1RDWX 1BOTO 2FSJA 4BRLA 2FSKA 1HKBA 4JD2B 2QWPA 4BRGA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QEPA 1TUUA 1RBVA 2Q0RA 3ZSRA 4RW6A 5KPRA 2QWOA 1RTDA 5CYQA 1KC8O 2KFNA 4JLHA 4HUFA 1XNQK 1FK9A 3I8DA 3A5NC 1NJYA 5AQVA 3K59A 4EHUA 3AO5A 4XIUA 3IKMA 2WTUA 3NH0A 5C42A 1Q86O 2GTDA 3GG4A 4DG1A 3ENHA 3T1HK 1N6QA 2GELA 4ELUA 4N47A 4E89A 2OPPA 4DSFA 4CEAA 4JRPA 2VG5A 1QZ6A 1SKWA 3QESA 1GOCA 4IXCA 2NNWA 2XY8A 4CI6A 2ZJQL 3JSMA 2H3GX 1BHLA 3ATUA 4IJNA 4C8LA 4H0PA 3HO1A 1S5JA 2RPIA 3KWGA 4JI0K 4BRNA 1EETA 3AV9A 4LSLA 4CHQA 3GOIA 1VQ9N 4B1WB 2WBNA 4A62A 4DR6K 2P9UA 3CFRA 1LW0A 3CFPA 3AVFA 5EX5A 1TKTA 3P31A 3VQQA 1S9EA 4DTUA 2XY7A 4LH4A 1HQEA 5BR8K 4N76A 3JS6A 5E41A 1NK7A 2ITMA 3O9TA 4BE0A 2KKZA 3TAMA 3QO9A 4CJWA 3DWLA 1SZ2A 4HTLA 4KAZA 3NH2A 4CJEA 4CZKA 3M5RA 2ZD1A 4JAXA 1NOZA 1C0GA 1ZBLA 1XC3A 3MX5A 1QQCA 1GLEG 1LOTB 3BEXA 4EP5A 3CJ9A 1WSGA 4KO0A 3U9DA 4B1VA 4CZIA 4CJPA 5LY3A 4B3OA 1WLJA 4CERA 4B1YB 4YOVA 3RMCA 4AM6A 1NGAA 5HL7L 4QAGA 1W2BM 3HZ6A 4MFBA 3HK2A 1KLMA 4NLCA 4DTPA 4PY5A 2Q0UA 4CBXA 4NXNK 5BN8A 1S9GA 4PA1A 1NG9A 4N56A 4O8UA 3OYIA 4MQ3A 4CBWA 1N32K 1NK0A 3THYA 4DR5K 3DXMB 3WXMB 2P9SB 4H0XB 3C0BA 3EKUA 4CIEA 2VCPA 4JKFA 2FLOA 1TYQA 3TSPA 5JS1A 2P9SA 5A2QO 1WSFA 2PBDA 4JKDA 3MEGA 4B8CA 3SNNA 1VSIA 4KTWA 4FZXC 5I9EB 3T1YK 1V4SA 1IV0A 4OKJA 1YTUA 3DLGA 3VF4A 4IO9L 2HHWA 5LL6Z 4W5NA 1YT3A 1BI4A 3AAQA 5BPMA 4JK9A 3QDKA 4JHDB 2HVHA 3THWB 4CJFA 3KTQA 4NLBA 1R0AA 5CYMA 4Z0UA 3CJ7A 3OJUA 3I55N 3VF2A 3OY9A 1RCHA 3CG7A 4CIGA 1JLQA 3H3OB 3HL8A 4MO5A 4PKIA 4DU3A 1L5UA 4DTNA 3HVRA 1WOQA 1K73O 3OBWA 2HHTA 2VWKA 3J7YP 1HR0K 3AVLA 4CESA 4BDYA 3FGUA 5C10A 4DF8A 4B3RK 5I3UA 3VQBA 4FK2A 4OGCA 5GAHP 3LDLA 2X78A 4DTOA 1TL3A 4GNIA 4DR4K 1NK5A 4PQUA 3DLKA 3FLCO 4C1NK 3ALYA 1W97L 4DR3K 4FLXA 5DM7L 4CIFA 1RBUA 1REVA 4I6MA 2D0CA 3SAFA 3AGKA 4B9SA 3CHWA 2B5JA 2HBLA 4O4GA 4O0JA 3MCPA 3OYKA 3IAYA 4E1JA 4CFBA 3RR7A 5H1SQ 5KPTA 1BO5O 5KQ8A 4QS8A 4B9MA 1SKRA 3V4IA 2ASOA 2OPSA 2EX3A 2HMPA 4M3TA 3TANA 4NCAA 4HCBA 3WQUA 1TVRA 2CH5A 3EZWA 4IG3A 3O9RA 3TWHA 2UUBK 2IAJA 2HF3A 4HUEA 1XMOK 4FWKA 4LFCK 2HBKA 4LF4K 3ULEB 1Q9XA 2GUIA 5B8HA 4LF7K 4DR7K 2KFZA 2P9IA 1RT7A 3MDQA 4BRDA 3R1XA 1DEJA 4W5TA 1RBTA 1K6YA 4YOTA 1C1AA 3DLEA 3E9LA 5HRRA 1XC9A 3PV8A 2I5JA 3ZEUA 3QERA 4FLWA 2Z1HA 3K9JA 2QWLA 1C1CA 3K57A 2PAVA 4F3TA 1KVAA 4B9QA 5CE3A 2ZJRL 4LD0A 3KJVA 3K5LA 4DSJA 2FBYA 3VQDA 3NGZA 3R8EA 3F9MA 4CEBA 5C2FA 1HNWK 3LDPA 3VERA 3SUPA 2P9KA 1RGIA 4I9QA 2W40A 3VQEA 3LP3A 1JXBA 3D2EA 4M7XA 3OYCA 1RTJA 1RT6A 3C65A 2VYPA 1S3XA 3CC7N 3SAHA 1KVBA 1IBKK 3VMFB 3CM6A 1BUPA 3CJ1A 5GAGP 3ZX3A 2D5RA 4E7LA 2YHYA 4DV3K 3RSEB 3TARA 4RG8A 4FJMA 2E2PA 4CJ5A 4JI3K 3VQ4A 3G6EN 1T6DA 1JJ2M 4EZ9A 4JI7K 1NU0A 2YHAA 3H3NO 3WQTA 2F9TA 4H5VA 3LWLA 1GOBA 4JK7A 5GADP 1QZ5A 2VGNA 5AZJB 5IT9O 4FK0A 1ZBUA 4ELVA 4FWLA 3L8BA 4QS9A 2J4RA 1KTQA 4DV5K 2VGMA 5CZ1A 2JGUA 3MCAB 1TGOA 2FF6A 5IWAK 4H5WA 3MX2A 1HQUA 1NGIA 1T44A 3TTCA 3WXKA 4FXDA 4IWVA 3NDKA 4N5SA 4FCYA 3S41A 2DFFA 4BC2A 4X65K 3CF5L 3V9WA 3D2FB 4BC4A 3O80A 2OANA 1BCMA 4CZGA 1R59O 1T05A 3AVNA 2ZM6K 4DTMA 4O55A 1Z6RA 1ASWA 3C6UA 1Z25A 4JN4A 2O8DA 3F2KA 2B4JA 4JYAK 3O4QA 3G0ZA 2Q1NA 4ILGB 4BR2A 4FM1A 1JKHA 5ELZA 1NJIO 2HNYA 4DSKA 2W6LA 5K14A 4CHOA 4O44A 4B9LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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