3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
3A0IX 3LDQA 1TYQB 2HF4A 5BREA 1R59O 1K8KA 4BR2A 4FWSA 3FZHA 2D1KA 1TUYA 3CQXA 4L3QA 3H6EA 4WYBA 2P9PB 1TYQA 4A62A 2QWMA 1ZBSA 4K25A 1V4TA 3M6GA 5AR0A 4BC3A 3EKUA 2P9PA 2FLOA 4H5NA 3SMPA 2YJEA 4M63C 2A41A 3SLCA 4CBWA 3MCPA 2P9NB 1NGIA 3O4WA 3BUZB 2Q1NA 2P9NA 2HMPA 3DWLA 1X3MA 1KAZA 3U8XA 4BRHA 1E4FT 4JD2A 4CD3A 3QBWA 5CE3A 5AQYA 4BG8A 3ID8A 3MK6A 3EO3A 4BG9A 5BN8A 4BRGA 4BC5A 2QWLA 4ISFA 3VERA 2YHWA 5BRHA 4BRDA 4GY2B 2HOEA 2GTDA 2V51B 4C23A 2GUPA 3GG4A 3O5BA 3VESA 3QMLA 4H0VB 3CQYA 4H5RA 3VEXA 3TU5A 5AQIA 3KVGA 4CZIA 3QICA 1GLEG 2Q0UA 2NZTA 1NGGA 3H46O 1KXPA 3I33A 1SAZA 1QHAA 2NLXA 5E84A 2BUPA 2F9WA 4FWPA 3BEXA 3FZLA 2DPNA 5E26A 4EFHA 3HZ6A 3MN6A 2BTFA 3DXMB 3QB0A 1YXQA 4CZJA 1GLCG 2P9UA 3DXMA 1IG8A 3R9PA 4EAHD 1XC3A 3O1WA 2A3ZA 4RTFD 1BWFO 4I6MB 1GLLO 2QWQA 4AM6A 3O08A 3JXUA 4BRCA 3CI5A 4BVPA 1BU6O 1HUXA 2FSJA 3MN5A 5EOYA 3U9ZA 3GBTA 4XH4A 4H5TA 3MDQA 3FZMA 4DCHA 3D2EB 2NRHA 1IJJA 3D2FA 1BOTO 1T6DA 3JS6A 3KHYA 3UE5A 2E2PA 2FSNA 3TPQA 4FOEA 4YDUC 5BPNA 4BR5A 3W0LA 2QM1A 3UKRB 2P9KB 5AQPA 2E1YA 2HF3A 1NM1A 1MDUB 4K42A 1QZ6A 1NWKA 4FWOA 3BP8A 4H0OA 4CZLA 2E2OA 1HKCA 2QXLA 4KBOA 2W40A 4ISGA 4F9OA 4QS9A 1BA1A 4O5FA 3GDQA 1MA9B 2FXUA 1ATNA 3WT0A 4BRMA 1RDWX 3ATVA 3WXJA 4H0TB 5FPDA 2FSKA 5AZJA 4IZ9A 5AQGA 4B1UB 3FE1A 2ASPA 4FO0A 3A8YA 5BRFA 4BGAA 2Q36A 1GLDG 2AP1A 4FWRA 4B9QA 3ZETA 1NGEA 3FZFA 1X3NA 5KPZA 3CJ1A 4CD1A 1HLUA 2YCHA 4B1YB 4H03B 4H0XB 3MMVA 4FWLA 4BRIA 4MLEA 3HTVA 4PKHA 3CJ9A 4CI6A 1T44A 2E2NA 4EHUA 5JMVA 4CZMA 4DHYA 1ESVA 1ZXOA 5BRDA 3H3NO 1HPMA 3R6MA 1U2VB 3ATUA 1OKJA 1QZ5A 4BRPA 2VWBA 4CZFA 2Q2RA 3VF2A 3DXKB 1SZ2A 3ENOA 4B1ZA 1XUPO 1BO5O 4J8FA 5ADXA 1Z6RA 1LCUA 2ASOA 4IJAA 5TKYA 2P9IB 4M7XA 3VEOA 1C0FA 1D4XA 3VGMA 5ADXH 3CJBA 3FFKB 5FPNA 1SQKA 3CHWA 3LL3A 2VCPA 1QQOA 2D0OA 5LY3A 5BPLA 1EQYA 3SJHA 1QQMA 4BR4A 3A5MC 4MO5A 3M3ZA 2YHXA 2QWRA 4BRFA 1P8ZA 4PL8A 1GLAG 2IIRA 4QS8A 4DQ8A 1DGKN 1BDGA 2CH5A 2YJFA 3O8MA 4BC4A 2I7NA 5AZIB 5F2RA 4K41A 4CZGA 1JCGA 4BR7A 3CETA 4B1WB 3W3DA 5AZIA 3AY9A 4A2BA 4BROA 3VPZA 3VETA 3LDLA 2A42A 1YAGA 2V7YA 2F9TA 2UYTA 3OHRA 4BQZA 3AAQA 4PKGA 1G99A 1NGFA 3IDHA 3ZEUB 3FZKA 4I6MA 4IJNA 3A5OC 4FWQA 2E2QA 5AQOA 3WEEB 1DEJA 4XEIA 4BGBA 4CJ7A 3ZEUA 2ZGZA 5EX5A 3CJAA 5AQFA 3O1BA 5AQNA 3D2EA 4FL9A 4Z94A 1NGHA 5JICA 4RWTA 3UKUB 3WXLA 4FOIA 3UKRA 2A5XA 3O6WA 2P9KA 2WUSA 2D4WA 2A6AA 5B8HA 4E1JA 2CGJA 2CH6A 3H3OB 5AQUA 4WQ5C 5AQVA 1S22A 2CGKA 1DKGD 2Q97A 3HSCA 3ULEB 3LM9A 2YHYA 1HKBA 2P9LB 4EIAA 1RFQA 1BA0A 2ITMA 4GNIA 2ZWHA 2PBDA 3VOVA 3WXIA 4NB4A 3L6QA 2V7ZA 3G25A 3FGUA 3MN7A 3QBXA 3HI0A 2ZF5O 2V52B 2J4RA 4JHDB 2IVNA 3C0BA 1V4SA 3VENA 3F9MA 2KHOA 4QS7A 3WXKA 1NLVA 4YDUA 3RSEB 3LDNA 4H5VA 1U6ZA 1JCEA 1X9JA 1RGIA 3AARA 4FSVA 3CJ7A 3RSEA 4H5WA 3AAPA 3VEYA 2GELA 4WQ4C 5EXWA 4BRKA 3P4IA 4MO4A 3I8BA 5BR9A 3C7NB 2OANA 2I7PA 5AQLA 5AQJA 2EWSA 4PKIA 3CIPA 3WQTA 3EL2A 3ZX3A 5LJWA 2W41A 3C7NA 5BPMA 3VGKA 1MWMA 4FPBA 5F0XA 1ATRA 1YVNA 1K8KB 3SK3A 4XH1A 4B1XB 3KZBA 1CZAN 3HM8A 4K43A 2E20A 3VF4A 5F1XA 4A61A 1U2VA 2FF3B 1NGCA 4B1VA 5EY4A 3H45C 3BF1A 3DXKA 1T6CA 3QDKA 3QFUA 2A40A 3VEVA 1XQSC 4EHTA 3ENHA 3DAWA 3FLCO 4MLHA 3R8EA 1WUAA 2P9IA 2E88A 4BRNA 3IMXA 3DJCA 4M7YA 3U4LA 5EVZA 4CZHA 5I9EB 2H3GX 3VEWA 3EN9A 4WQ4A 4JD2B 1S3XA 2FF6A 1Q18A 4BVOA 2Q31A 3QFPA 1Z05A 4JN4A 5AQSA 1NBWA 4Y0WA 1H1VA 4BR0A 1NGBA 4FPAA 1ATSA 3UB5A 5FPEA 3J8AA 5AQZA 3S41A 3GE1A 3BF3A 1KAXA 2GWKA 2IVOA 3IFRA 5AQKA 5AQQA 1ZC6A 2QWPA 3LM2A 2ZGYA 5ELZA 4JAXA 3O80A 4CBXA 1GLJO 2P9SB 4CBUA 2GWJA 3VEZA 2D0PA 1NGAA 2E8AA 1MWKA 4BC2A 4HTLA 1E4GT 1LOTB 2P9SA 4BREA 5KPTA 5AFUA 5AQHA 1BUPA 2P9UB 3EZWA 3EKSA 4IWVA 4FWKA 5AQMA 3WEEA 1TUUA 3A5NC 3HBTA 5AFUH 3FR0A 4CZEA 2E1ZA 4BR9A 3LDOA 5AQRA 5KPRA 4FWMA 4RCHA 3WQUA 4AM7A 3UKUA 3ZX0A 3D2FB 1NMDA 1J6ZA 4HWIA 2QW9A 1NGJA 4LC9B 5FPMA 4H0YB 4BRQA 3ULEA 1HX1A 3CJCA 2QWOA 3VF6A 2P9LA 4IO8A 3GOIA 3U9DA 1C0GA 1GLFO 5KQ8A 1YUWA 5AQTA 2Q0RA 3A5LC 5KQDA 4BQLA 3MN9A 3SMSA 3CERA 4CZKA 5JLFA 2IVPA 4DB3A 3GL1A 1GLBG 2YI1A 3L0QA 3WUHA 5BN9A 3VGLA 3D7EO 4JHDA 4JNEA 1HKGA 1BG3A 1NGDA 4PL7A 1Y64A 2CGLA 4FWNA 2QWNA 4IXCA 1KAYA 1HJOA 2ASMA 5AQXA 4O8KA 5JLHA 5AZJB 4A2AA 5AQWA 2PAVA 2AA4A 4H0PA 3H1QA 4WQ5A 4NO7A 3M1FA 3L4IA 3H1VX 3IUCA 2GEMA 4BRAA 1WOQA 2VYPA 4ISEA 3ZX2A 3B8AX 3ZETB 5LJVA 1JCFA 3LDPA 4XH5A 4BRLA 1QQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KCFA 1OVQA 3VA3A 4CHOA 4CJTA 4BR2A 4FWSA 4I2PA 3CMEN 3OBYA 4WFBL 1WLJA 3AVBA 2QXFA 4A62A 3K57A 4QCLA 4JS5A 1RBRA 4OGCA 3RTVA 2NRRA 4H5NA 1NNEA 2YJEA 4M63C 3SLCA 2QA4N 4I7FA 3BY5A 2Q1NA 2P9NA 3D6RA 3WNGA 4DG1A 4CHQA 1I39A 4MFBA 1E4FT 3QIPA 3K58A 2Y1JA 5CE3A 5T7BA 3QINA 2UXBK 4DV3K 5IT9O 4PUOA 3HO1A 1BI4B 4ZTJA 4BRDA 4GY2B 3P1GA 3AVLA 2IC3A 2G8IA 3LZIA 2ETJA 4IOXA 1KQSM 3CQYA 4KB1A 4OO1J 3TU5A 1TGOA 5AQIA 3I56N 1ZBFA 1ZBLA 2NZTA 1KXPA 4Q0BA 2F9WA 3B6OA 4BE2A 3BEXA 1HRHA 3J81O 1NMNA 1C0TA 4LSNA 4WE1A 4CZJA 2P9UA 3DXMA 5DMRA 3ZT4A 3AGKA 1IG8A 2GBZA 4OPJA 1VRUA 4DR3K 2A3ZA 3O08A 4DR5K 2O8FB 5SZTA 1BU6O 3E9PA 1RNHA 3NGYA 4CERA 1YTUA 1IJJA 1RTDA 1BOTO 3KHYA 2RF2A 2E2PA 4DQIA 4FOEA 4L8RB 4W5QA 3UKRB 2P9KB 1NM1A 3N4QA 1EWQA 1C1CA 4IG0A 4YOWA 1QZ6A 4JKHA 3BP8A 3SAHA 3NGIA 3RMBA 4CJUA 4CZLA 2PY5A 1JKHA 1HKCA 3NH2A 1GOAA 3RR8A 3DRPA 3SCXA 1YT3A 3MEGA 1C0UA 2VG6A 4JV5K 4BDZA 1OVYA 3LPUA 1ATNA 3AO1A 4BRMA 3NF8A 3ATVA 2F8TA 2FSKA 4E1MA 3U3GA 4IZ9A 4B9NA 3BGRA 1VQ5N 4IFEA 3DLGA 4B1UB 3FE1A 3QIOA 2UU9K 3THWA 3K59A 2AP1A 5HL7L 1EKEA 3G6EN 3OYEA 5HLFA 1YJNN 3FZFA 1X3NA 5C24A 1VSHA 1TL3A 3DMJA 3MX2A 3E9OA 4G9ZA 4KTQA 4MLEA 3SV4A 4FJHA 4KHYA 4JKDA 3CJ9A 2P51A 4CEEA 3OJSA 2F7TA 1YHQN 5KRSA 1T44A 3BZKA 4CZMA 3HYFA 4RW9A 1FKOA 1ZXOA 2VQFK 3H3NO 4KHSA 5IWAK 1SZ2A 3ENOA 4V19S 1BO5O 1XWLA 4HCBA 4JK9A 3AVCA 2FBTA 1D4XA 3VGMA 5FDLA 1VK0A 2O8BB 2FBXA 3ZSZA 3AA5X 1QQOA 1VSFA 4CFCA 3JAMO 1TAQA 4CGIA 3SJHA 4B3MK 4MO5A 5DK5A 2KZZA 3EY1A 4BRFA 2OZSA 4PL8A 1GLAG 3CG7A 4DQ8A 2PYLA 4DTOA 1VQ4N 1VQ7N 2I7NA 3SYZA 3VN5A 3SZ2A 1JCGA 2YNFA 4JI4K 3PIOL 3CETA 3AVMA 4CW7B 3TARA 1HNZK 3CFRA 4KI4A 3NE6A 3VQQA 3VETA 3LDLA 2A42A 1C1AA 3P39A 4YOXA 4DV4K 1G99A 4BWMA 4IJNA 1IKXA 3T7ZA 1SKWA 3EYZA 2ZGZA 1JLAA 3CJAA 5AQFA 1JLGA 4FL9A 1NGHA 3LALA 3DLEA 4FLWA 3NVMA 1BCOA 4YOUA 4AHRA 3AA2A 3DLKA 1HYVA 1WSGA 2D4WA 5B8HA 5C12A 4DU3A 1QQCA 4O0JA 3HRGA 1N5YA 4DUYK 4DTRA 3OY9A 5AQVA 1T8EA 2CGKA 1DKGD 4DTSA 1UA0A 2HHUA 3ULEB 4H8KA 3LM9A 1VSEA 1VSMA 2ITMA 3AO5A 3V9ZA 1Q7YO 3VOVA 4N5SA 4NB4A 3L3UA 2VG7A 1B9FA 3S3OA 2YNGA 4E7LA 1WSJA 3ITHA 2J4RA 4OKEA 4ZTFA 1RT2A 4CHZA 3MX5A 3WXKA 4YDUA 4BDPA 3RSEB 5GADP 4C8NA 1JCEA 1X9JA 1EXQA 3SBTA 1VQ6N 1MU2A 3VEYA 5J1EA 2GELA 5EXWA 1IBMK 3IAYA 3P4IA 4MO4A 1I3AA 4O5BA 4Q5VA 2G8FA 2BGGA 3EL2A 2W41A 3C7NA 2LSNA 1YF5L 4AHVA 1U45A 1SL2A 4E3SA 1YVNA 2KFZA 1K8KB 3SK3A 2E4LA 4XH1A 1CZAN 2X6NA 2E20A 4AF1A 4YOVA 3CXCM 2D5RA 5MLCQ 1NGCA 3H45C 3BF1A 1WSHA 3DXKA 3QFUA 1XQSC 2ZD1A 4B3SK 3R8EA 4DQPA 3E66A 4OKJA 1TV6A 3DJCA 3U4LA 1RBVA 4CZHA 5I9EB 4FJ7A 1RDDA 2H3GX 3VEWA 3O9RA 4A5BA 4OKKA 4KV8A 4BVOA 3KKRA 4JN4A 3FFIA 3M8QA 4CJRA 1EETA 5A2QO 1HPZA 1DT9A 3QNNA 4DFPA 3VA0A 4GVMA 1NOYA 4CECA 3MXMA 3GE1A 3BF3A 1HNIA 4QOZB 2VGNA 4JI5K 3MEEA 5K14A 4FLTA 4E7IA 4CJFA 3HPHA 5AQKA 4ELUA 4DF8A 3MCAB 4JAXA 3O9UA 4CBXA 4Z4HA 2Z1HA 2P9SB 3OJUA 4EZ6A 4ID1A 4FJMA 1YVUA 3OYDA 3SPZA 5KPTA 5AFUA 3PV8A 4IWVA 4F4KA 4FWKA 4AQYK 3C65A 4JKEA 3A5NC 3OTOK 4JLHA 1D5AA 3ZT0A 1UA1A 2HHVA 4KKOA 4FJKA 3LDOA 4KTZA 5AQRA 3F5TA 3QESA 3D2FB 4HHTA 3PX4A 4HWIA 3VQPA 2QKBA 1XHZA 1S1XA 1TK0A 1TKZA 1A5XA 1UAXA 1JJ2M 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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