3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
2NRHA 4CBWA 1V4TA 2P9UB 1SQKA 4CZIA 3B8AX 3IMXA 3GG4A 4K43A 5KPTA 2QWRA 3DXMA 4PKIA 4QS7A 2YHWA 4BREA 3R9PA 4E1JA 3ULEB 3MCPA 2VCPA 4PKGA 3VF4A 3I8BA 2P9UA 4GNIA 3VERA 4B9QA 2FSNA 3FZHA 5CE3A 3CJCA 5AQUA 4WQ4C 3EKUA 3VGMA 3JS6A 4BR2A 4BRDA 3ULEA 3SJHA 3FR0A 5AQGA 3FZLA 4NB4A 1QQMA 4FWNA 3VF2A 4O8KA 4JHDB 2Q36A 3AARA 5AZJB 1C0FA 4Y0WA 2AA4A 1TYQB 4ISEA 5BREA 4CZLA 3WXKA 4DQ8A 4YDUA 2IVOA 1CZAN 4RWTA 3HI0A 1DGKN 3L0QA 1HKGA 4EHUA 1XC3A 3BF3A 2QM1A 4JHDA 4BQZA 2V52B 2E20A 1NGGA 5AZJA 4B1VA 3UE5A 2Q31A 3CHWA 1TYQA 4H0VB 2E88A 1KXPA 2J4RA 1Y64A 3M6GA 1ATNA 4H5NA 4ISGA 3H6EA 5EOYA 5LY3A 1ATSA 4A2BA 4BC4A 4H0YB 1T6DA 4BRNA 5BRHA 3C7NB 3FGUA 4FPAA 3QB0A 4CZMA 3VGLA 1R59O 3HSCA 2GELA 4MLEA 2QW9A 1Z05A 2V7ZA 4CJ7A 3VESA 2UYTA 1BG3A 3C7NA 2A41A 3MN5A 3WXLA 1WUAA 1EQYA 4XH4A 2W41A 4H0XB 1V4SA 3DXKB 2E8AA 2HF4A 4MO5A 2FSJA 1HUXA 1QZ5A 3WEEB 3MMVA 5EXWA 1U2VB 3O1BA 4IWVA 2WUSA 4CZJA 3VOVA 4O5FA 3O08A 4AM6A 3O5BA 4EIAA 3GBTA 3DXKA 1QZ6A 4KBOA 4PL7A 3FLCO 4B1WB 4BQLA 3G25A 4FWSA 3EO3A 4BRCA 2Q0RA 4XH1A 3WEEA 2YHYA 1BOTO 3IUCA 1U2VA 3KZBA 5F1XA 3O8MA 1GLDG 5AR0A 1QHAA 4H5WA 3M1FA 2OANA 1GLBG 1IG8A 3LDLA 1NGBA 2E2NA 3L6QA 5E84A 5AFUA 5KQDA 4B1ZA 4BGAA 1BU6O 2FXUA 1HJOA 3QBXA 1HX1A 3LM9A 3M3ZA 3UKRB 4EAHD 3O6WA 1BWFO 2CGKA 1DKGD 3WXJA 3BF1A 5FPNA 2CH6A 4FO0A 1Q18A 2W40A 1NLVA 4IJAA 2VWBA 3CJBA 4H03B 4BC5A 3AAQA 4M63C 2CGLA 1YAGA 2QWOA 3CJ1A 4BRFA 4JNEA 4YDUC 1T6CA 1GLJO 2DPNA 4Z94A 3UKRA 5TKYA 3ATUA 1GLEG 2GWJA 2CH5A 3ZETB 5AQFA 2HF3A 5AQXA 2IVPA 3LM2A 3VEWA 3D2FB 2H3GX 2ZGYA 2ASMA 3GL1A 3S41A 4BR5A 2E2QA 2YHXA 3GE1A 5BRDA 4DCHA 1Z6RA 2A6AA 5AQHA 2QXLA 1NGEA 3ZETA 4JN4A 4A61A 1GLAG 4C23A 3D2FA 4B1YB 1X9JA 3QFUA 4EHTA 3H1VX 4FOEA 5AQTA 4BRHA 3WUHA 1RFQA 5E26A 3MN7A 3QDKA 1QQOA 2CGJA 1C0GA 5AQNA 1BA0A 1ESVA 1BUPA 4H0TB 1JCEA 3CI5A 4FWMA 2E2OA 1ZXOA 3EL2A 1SZ2A 2YI1A 3A5MC 3DWLA 3I33A 1KAZA 2PBDA 3HTVA 1S22A 4CZKA 1YVNA 2FLOA 4WQ5C 3SLCA 4GY2B 2QWQA 4BC3A 5AZIB 3VETA 3BUZB 5BPLA 4FWRA 2QWLA 4WQ4A 2ZGZA 4FSVA 3FZFA 5AQIA 2IIRA 2ASPA 1T44A 3MN6A 3FZKA 4M7XA 5BRFA 2D0PA 3VEYA 5KPRA 4FPBA 4NO7A 2QWNA 4H5TA 4RTFD 4BVPA 5AZIA 3A5NC 1GLFO 2ASOA 1X3MA 4FWKA 4JD2B 1HKCA 1NGDA 1DEJA 1OKJA 3H45C 3LDOA 3SMPA 3JXUA 3VEOA 3H46O 4BR0A 1E4FT 3LDQA 4K41A 4I6MB 4MO4A 5AQWA 4BGBA 4BVOA 3QICA 1P8ZA 5LJVA 4H0OA 5AQVA 3LDPA 2V7YA 4JD2A 1XQSC 5JICA 4K25A 1MWKA 3AAPA 3HM8A 4HTLA 2D1KA 3QBWA 4B1XB 3R6MA 4DHYA 4BRAA 5BN9A 3U9ZA 3D7EO 5KQ8A 4I6MA 3W0LA 2F9WA 3MDQA 2FSKA 4CBXA 3FZMA 3CETA 4PL8A 4BROA 3O1WA 1BA1A 4XEIA 1BDGA 5AQOA 1HLUA 4WYBA 4B1UB 4F9OA 5KPZA 5AQKA 2P9IB 5BPNA 1H1VA 5AQMA 1NGIA 2E2PA 1NGAA 2P9PB 1KAXA 1RGIA 2I7PA 4IZ9A 5AQYA 2IVNA 3H1QA 4FWOA 3QFPA 3VEXA 5EVZA 3FFKB 2F9TA 3CJ7A 2EWSA 3O4WA 3W3DA 4BRGA 4CD1A 2P9KB 1GLCG 2P9IA 2Q97A 1YUWA 3CQYA 2BTFA 2HMPA 5BPMA 1NGHA 4AM7A 2P9PA 3IDHA 4QS9A 2P9LA 3J8AA 4PKHA 5AQJA 3U9DA 3L4IA 4BRMA 1RDWX 1NGCA 3ZX2A 5B8HA 1ZC6A 4DB3A 5ADXH 2P9KA 2A5XA 3KHYA 1HKBA 4A62A 3DJCA 3GOIA 1XUPO 2FF3B 3UB5A 2Q0UA 3OHRA 5ELZA 5FPDA 3WQTA 3EN9A 2YJFA 5AQRA 4CD3A 4FOIA 4H5VA 3WQUA 3ZX0A 3H3NO 4BG8A 3MK6A 3A8YA 4BG9A 3TPQA 1GLLO 4CZEA 4BRKA 5AQQA 3AY9A 1S3XA 1NMDA 2YJEA 4ISFA 5AQLA 3CJAA 2NZTA 3R8EA 2GEMA 4IJNA 3QMLA 4IXCA 2A40A 1D4XA 3SK3A 3D2EB 1U6ZA 2ZWHA 4H5RA 2D4WA 3WXIA 4FL9A 1WOQA 5FPMA 1JCFA 3VF6A 4IO8A 3SMSA 4BRPA 3U4LA 3A5OC 1NGFA 3UKUB 4FWQA 2GTDA 3ZX3A 5LJWA 3HBTA 1JCGA 4CZFA 3TU5A 2FF6A 1MWMA 3D2EA 1LCUA 3IFRA 3KVGA 1NBWA 4FWPA 2HOEA 2AP1A 1ATRA 2YCHA 4MLHA 3RSEB 1E4GT 2E1YA 3ZEUB 2Q1NA 3UKUA 4XH5A 5AQSA 3F9MA 3P4IA 5FPEA 4BRQA 2ZF5O 3BEXA 3VGKA 4JAXA 3VEVA 3A0IX 2QWMA 4BRIA 5BR9A 2GUPA 2Q2RA 5AQPA 3RSEA 4CZHA 3CJ9A 3ZEUA 4HWIA 3ATVA 1J6ZA 4BR9A 1BO5O 5AQZA 3CIPA 2KHOA 5F2RA 1QQNA 3ENHA 3ID8A 3WT0A 5JLHA 1NM1A 1K8KB 5BN8A 2I7NA 2NLXA 4EFHA 1NGJA 1MA9B 3CERA 3MN9A 4L3QA 3U8XA 2PAVA 1X3NA 2E1ZA 4BRLA 1SAZA 1HPMA 3EZWA 3VPZA 4K42A 3DAWA 2VYPA 3EKSA 5F0XA 1ZBSA 1YXQA 1K8KA 4LC9B 1TUYA 3GDQA 5JLFA 3VEZA 4WQ5A 2P9NB 1KAYA 4CZGA 2A42A 4J8FA 5JMVA 1NWKA 2P9LB 4M7YA 5EX5A 1G99A 3A5LC 1TUUA 1MDUB 2P9SB 1IJJA 2P9NA 4RCHA 4BC2A 3ENOA 4BR7A 5EY4A 3BP8A 5I9EB 2BUPA 2QWPA 2D0OA 3O80A 3LL3A 2P9SA 3H3OB 4CBUA 4A2AA 3HZ6A 4CI6A 3CQXA 3LDNA 1LOTB 5ADXA 3DXMB 4H0PA 4QS8A 3FE1A 4FWLA 2A3ZA 2GWKA 5AFUH 2ITMA 2V51B 3C0BA 4BR4A 3VENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CBWA 1V4TA 4O55A 3B8AX 5KPTA 3V9WA 4IKFA 1XNRK 5M1PA 3VQCA 5BR8K 3BY5A 4E1JA 1C1CA 1KVBA 4B9QA 3AA5X 4GNIA 5CE3A 3QEIA 4DSLA 3WNHA 1Q9XA 2QKKA 3K57A 2G8FA 4YORA 4DLGA 3A2FA 3J7AP 1KD1O 3SJHA 3K2PA 3FR0A 1NK9A 3CPEA 1C0TA 1QQMA 1QSLA 2BANA 4GKKK 4JHDB 4AF1A 3CC2N 4M42A 3E66A 1F21A 4ISEA 4CZLA 3J81O 4DFPA 4EHUA 1VQNN 3S3OA 1C1BA 4GV9A 4CHOA 2QM1A 4JHDA 4BQZA 2V52B 5GINA 3LAKA 2E20A 4B1VA 4AILC 1N34K 2NRZA 3K5OA 4DV5K 3CHWA 4H0VB 1KXPA 4JK9A 2J4RA 3J80O 1Y64A 1WB9A 3M6GA 4JYAK 1J53A 5GIOA 3RMBA 5KGXA 3TAGA 4YFUA 1WBDA 5IT9O 1JL2A 3G71N 3I56N 1ATSA 3AVAA 3CG7A 5BRHA 2BE2A 3C7NB 4DSIA 1ZBIA 2ZJQL 4ZTJA 3ASMA 4ZHRA 2HB5A 4WFBL 4B3SK 1YIJN 1VSLA 1RBUA 2V7ZA 1EWQA 5GAEP 1JLFA 4RW4A 3C7NA 4FVMA 3PV8A 2FBXA 1WUAA 3T1YK 2OA8A 3M5RA 3AVIA 4ICLA 4H0XB 2EX3A 1RILA 2GUIA 2HF4A 4CVNE 3BZCA 3MMVA 5EXWA 1U2VB 1SL2A 2LSNA 3DLKA 1TAUA 2WUSA 2PYJA 4B9LA 3IAYA 3O3GA 4O5FA 3O08A 4F8RA 4NCAA 5HL7L 1WSFA 3SZ2A 2HHXA 3HOSA 1IKVA 4E7IA 4B1WB 4BQLA 4AHUA 1RTIA 4JEPA 3IUCA 1U2VA 4B8AB 3HVTA 3KKSA 1UOCA 4N5SA 2NRXA 1HNWK 2IC3A 3KLEA 1GLDG 5AR0A 1QHAA 3M1FA 3CMAN 1GLBG 3CF5L 3ZT2A 2E2NA 3L6QA 1VAZA 4B1ZA 4BGAA 3QO9A 1BU6O 3HM9A 4Z4EA 2FXUA 4CEQA 3UKRB 3K5LA 1BWFO 2FBTA 4CFAA 2W40A 3P5JA 3OYLA 1YAGA 2W42A 4AHRA 2DPNA 4KKOA 3CCUN 3UKRA 3O3HA 2G8KA 3ATUA 2GWJA 5HRRA 2CH5A 1VQ6N 3KIOA 3LDSA 3RMDA 4G1QA 2ASMA 3GL1A 5JS2A 4A5BA 4M3YA 2E2QA 1LWFA 4DCHA 4E19A 4DR2K 4ZTFA 3VQ5A 1NGEA 4DWIA 2YHAA 3K59A 1YT3A 3TSPA 4JK7A 4LFBK 3CYMA 3G0ZA 2G8HA 3H1VX 4FOEA 3E9PA 5HP1A 3MN7A 3KLGA 2CGJA 4DV4K 1TAQA 1C0GA 3TSQA 1BUPA 4ILGB 3TAFA 3MWTA 3UIQA 2HW3A 4JI7K 1KAZA 3LPUA 3O9QA 4YOUA 4F2SA 4KV8A 2YV0X 4BC3A 5AZIB 5BPLA 4FW1A 4BACA 4BE0A 4FWRA 1NK4A 3OY9A 4WQ4A 1HNZK 3FZFA 4FM2A 1T8EA 2Q3SA 3ZLJA 3V9UA 3VEYA 1JLQA 3KK3A 4NCGA 4OKEA 3HJFA 5AZIA 5M1FA 3TR8A 1T7PA 1NGDA 1K6YA 3NBPA 1IKXA 3H46O 4CJQA 3LDQA 4K41A 4A57A 4YNQA 2HNYA 2HBJA 5AQWA 5M1QA 4BVOA 4QAGA 1P8ZA 4H0OA 3V6DA 4HUGA 1Q86O 4K25A 4CF1A 1U49A 4ILHA 5K14A 4O0JA 3OYNA 4MFBA 4BRAA 5BN9A 4JI8K 2UXBK 4AQYK 3THYB 4RW9A 1HYSA 4CF8A 2YKNA 2VQFK 2FSKA 4M45A 3P1GA 4N56A 3CETA 4Y1CA 1BDGA 2HNZA 4F9OA 5T7BA 4IDKA 4CIGA 4E7JA 2DY4A 3THYA 1NGAA 1ASUA 4KPYA 2RE2A 1RGIA 3ID6A 2I7PA 2KZZA 3QFPA 3NGIA 2F8TA 4JI2K 1Q81O 1Z25A 2X6SA 1WSJA 2KW4A 2Z1IA 3AVNA 2P9KB 2KTQA 2HMPA 4CGFA 1C1AA 4AM7A 3KD1E 3OYFA 4PKHA 5AQJA 3U9DA 3M8SA 1RDWX 3LP1A 3C95A 1QTMA 1M1KO 5B8HA 1Q82O 4NXNK 1NK5A 2FBVA 3VQPA 2P9KA 5EU7A 5FROA 2A5XA 3KHYA 3H08A 1FW6A 3DJCA 1XUPO 1RDCA 1Y97A 2Q0UA 4KI6A 3NMUA 3SJJA 3HT3A 2VGMA 4OVLA 5AQRA 4CGGA 2B5JA 1QQCA 1S9EA 1S6QA 4DV3K 3PY8A 5CZ1A 4DTMA 1XWLA 3TSUA 1GLLO 2OZMA 4O5BA 4FCYA 3SBGA 3RR8A 4BRKA 4JI0K 1BI4B 4CEFA 1HNXK 5AQLA 4FK4A 2NZTA 2GX9A 3R8EA 4IJNA 2BDPA 1NK8A 4KRFA 4M3WA 3SUQA 3SQ1A 1U6ZA 4H5RA 1RDAA 1HYZA 3N4QA 3HPGA 1GOCA 1LAWA 4FL9A 4TSXA 1X9MA 5AJ3K 4M3TA 1JCFA 2AJQA 1U48A 4OGEA 1BI4A 3U4LA 3A5OC 3NGZA 3LWLA 1VQMN 4FXDA 4OX9K 1FKOA 2GTDA 4FWQA 4DV7K 4F2RA 4LF8K 4B3MK 4JV5K 5J2QA 2R7YA 4LSNA 1EWRA 1VQKN 1HNVA 4Q0BA 4Y1DA 1NBWA 1OH5A 1ITGA 4JS5A 2AP1A 1RT2A 1ATRA 4O8UA 3RSEB 1E4GT 4OLBA 2UUAK 3ZEUB 4FJIA 3F9MA 3B6OA 1YTAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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