3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
b'NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
3ATUA 1LOTB 5CE3A 5EY4A 2VYPA 5F1XA 3D7EO 5AQWA 3BEXA 3RSEA 3IFRA 4CBUA 1QQOA 4CZFA 3DXMB 2F9WA 2P9PA 3OHRA 4O5FA 5AQMA 3QFPA 4QS7A 4XH4A 3SJHA 4DCHA 5KPZA 1SQKA 3WXIA 2ASOA 3R9PA 3M1FA 5BREA 4FO0A 4K42A 1NM1A 3AY9A 4BROA 5AQRA 3QICA 3ZEUA 3LDPA 1JCGA 4QS8A 1V4SA 2E1ZA 1U6ZA 4BRGA 3UB5A 2I7NA 3M6GA 3ID8A 1GLJO 4FWKA 4BRPA 3H46O 2ZWHA 5FPNA 2F9TA 5FPDA 3D2FA 5AZJB 3A5NC 3GG4A 5EOYA 5BN8A 2Q1NA 4E1JA 3O8MA 1K8KA 4XEIA 3VERA 2FSNA 3L6QA 4IJNA 3A5MC 3H1QA 3CJ7A 3BP8A 2FF6A 3A0IX 1Z6RA 2IVOA 4FOEA 3A8YA 3HSCA 5F0XA 1P8ZA 2YHYA 4B1VA 2WUSA 3FZHA 3ZETB 1QZ5A 4H03B 4I6MA 1HKBA 2D1KA 3W0LA 2W41A 3JS6A 4KBOA 4BQZA 5BPLA 5AZIA 1HJOA 1MWMA 3UE5A 4M63C 3VF2A 5E84A 4BRNA 3WUHA 4BG9A 2KHOA 2QWOA 2VWBA 3QDKA 4CBXA 3CERA 3R6MA 4AM6A 3DXMA 1Q18A 3IUCA 5AQHA 3VEWA 2AP1A 4H0YB 4BRIA 3LDOA 1GLLO 3S41A 2GUPA 4H5RA 4ISEA 5AQNA 2V51B 2ITMA 3FR0A 3EL2A 4MLEA 3UKUB 3EO3A 3P4IA 4YDUC 1TUYA 1BG3A 4CJ7A 1YXQA 4YDUA 3DWLA 1MWKA 4CD3A 4FOIA 5KPRA 5LJWA 1DGKN 1R59O 2YCHA 1LCUA 2CGKA 4MLHA 4FWQA 3LM2A 4H5TA 4PKIA 5AZJA 2YI1A 4FSVA 5KQDA 5JMVA 4CBWA 1TYQB 5AR0A 3VGLA 3GE1A 3I33A 4BVOA 2P9LB 4BR0A 5FPMA 1NGIA 4IXCA 2E2NA 4CI6A 4BRDA 3LDLA 1V4TA 1Z05A 3LDQA 4K41A 3HM8A 3H3NO 3EZWA 4B1ZA 4H5NA 5ADXA 1C0FA 5BN9A 4ISGA 3ZETA 4A61A 4BC3A 3ULEB 3VOVA 4NO7A 1EQYA 5F2RA 2HF4A 3GL1A 5E26A 2Q97A 1T6DA 1IG8A 4FWRA 4NB4A 2V7YA 2GWJA 3JXUA 2E2OA 4JD2B 3H6EA 1ATSA 2YHWA 3CETA 3CHWA 3CJCA 3CJAA 5EVZA 4BC4A 4CZJA 4A62A 2IIRA 4J8FA 2P9NB 2QWRA 1RDWX 3GDQA 4BRLA 4FWNA 5BRDA 3VGMA 4ISFA 4BREA 3SK3A 2HMPA 4B1UB 4PKHA 3AARA 2GWKA 2NLXA 2QM1A 3SMSA 2OANA 5ELZA 1ZC6A 3UKUA 5BR9A 3CQYA 4IO8A 5BRFA 3HTVA 4GNIA 1IJJA 1YAGA 2P9KA 3EN9A 3EKUA 3QBWA 2D0PA 5BPNA 4PKGA 2PBDA 3SMPA 1H1VA 4CZGA 3ZX3A 1ATRA 4HTLA 4JHDB 4M7YA 1HX1A 3VEZA 4LC9B 2A5XA 1TYQA 1QQNA 2FXUA 2A3ZA 4MO5A 1S22A 1X3NA 1S3XA 1QZ6A 2ZGYA 2P9IB 1G99A 1HLUA 3SLCA 3MK6A 1CZAN 4BRFA 2Q2RA 3QFUA 3HI0A 4WQ5C 5AQVA 4BR7A 4Y0WA 4PL8A 3C7NB 4JNEA 1KAZA 3FZFA 5AQXA 3FZMA 2ASPA 3ULEA 1HKGA 5EXWA 1E4FT 3O08A 5AQZA 1BWFO 2E8AA 3ATVA 2PAVA 4FWOA 1NGJA 2V7ZA 3UKRB 4H0OA 1NGGA 5AQPA 2H3GX 1GLFO 4B1XB 5AQYA 3BF3A 2NRHA 5AQJA 4H0TB 5TKYA 1JCEA 1NGAA 2UYTA 3HBTA 2DPNA 4JD2A 3VEVA 4B1YB 3CJ1A 1NGFA 1HPMA 4IWVA 5AFUA 5AQTA 1T6CA 2P9NA 1NMDA 3O80A 3DJCA 3ZX2A 3WXLA 1NGEA 3MN7A 2FSJA 2HF3A 1U2VB 4BGAA 3VEOA 2ZGZA 4K43A 4CD1A 2VCPA 2BUPA 3C0BA 1ESVA 1BDGA 1TUUA 3KHYA 5AQQA 3A5LC 4A2BA 2CH5A 2W40A 3WEEB 4WQ4C 2AA4A 1YVNA 2Q31A 4AM7A 1JCFA 3ZEUB 3IMXA 2D0OA 5AQLA 3D2EB 3O4WA 2QWLA 4JHDA 2D4WA 3U4LA 1GLAG 2QXLA 4M7XA 2A40A 1ZXOA 1XUPO 3O1WA 1DKGD 3U9ZA 3FZLA 2P9IA 1KAXA 1ZBSA 2FLOA 3A5OC 3I8BA 2GTDA 2GEMA 3J8AA 4BRKA 5KPTA 5BRHA 2IVPA 3VPZA 1NWKA 4IJAA 3AAPA 1HUXA 4CZIA 4CZHA 3L4IA 2GELA 4BRQA 4WYBA 1BU6O 3BUZB 3MN5A 2P9SB 3FE1A 3VESA 3UKRA 2FF3B 5AQOA 4DHYA 4H5VA 2BTFA 5B8HA 3H1VX 4O8KA 1T44A 4BR4A 1NLVA 4GY2B 1KXPA 2E20A 1WOQA 2P9UB 4RCHA 2ZF5O 4BGBA 3U8XA 2FSKA 2Q36A 4FWLA 3O6WA 3VF6A 4H0XB 2E2QA 3AAQA 2QWQA 2I7PA 1U2VA 4XH5A 4BRAA 2J4RA 4JAXA 3CIPA 3MDQA 5BPMA 5JLHA 5KQ8A 1BUPA 3BF1A 2ASMA 5AQGA 4B1WB 3WEEA 4BQLA 1HKCA 2CH6A 1QHAA 3WXKA 4Z94A 5I9EB 1GLBG 4FPBA 3M3ZA 3D2EA 4H0VB 3TU5A 3O1BA 5EX5A 2P9LA 1ATNA 3WT0A 4BR5A 4CZEA 4BR9A 2QWNA 2E2PA 4BR2A 3DXKB 1D4XA 4BVPA 3HZ6A 4BC5A 1BOTO 3LM9A 2CGLA 3W3DA 3CJ9A 5AQFA 3WXJA 4B9QA 4BRHA 3WQTA 2HOEA 4WQ5A 2QWMA 3EKSA 2A41A 4FPAA 4L3QA 4BRCA 3FLCO 1NGDA 4H0PA 3F9MA 4HWIA 3VENA 2A42A 3VETA 4FWMA 5JLFA 3CI5A 2YJEA 2P9SA 3GOIA 3VEXA 1X9JA 1XQSC 3QB0A 4PL7A 4BRMA 4EFHA 3KZBA 4EHTA 4JN4A 2QW9A 3FGUA 3U9DA 4RWTA 2YJFA 4H5WA 3TPQA 1Y64A 4BG8A 4MO4A 3H3OB 4CZKA 5FPEA 1BA1A 1NGBA 2NZTA 3WQUA 4CZLA 3MCPA 3MN9A 4RTFD 5AQKA 1RFQA 4DB3A 2Q0UA 3RSEB 3VGKA 2P9UA 3QMLA 2EWSA 1C0GA 3IDHA 5AFUH 3MN6A 1XC3A 3B8AX 1SZ2A 2A6AA 2P9PB 1E4GT 1WUAA 3LL3A 3CQXA 4QS9A 5LJVA 3R8EA 4DQ8A 3H45C 1BA0A 1NGHA 2V52B 4CZMA 1KAYA 4FWSA 4WQ4A 4XH1A 1QQMA 1SAZA 2E1YA 3GBTA 1GLDG 3ZX0A 1GLCG 4F9OA 3ENOA 4A2AA 3KVGA 2YHXA 1J6ZA 5AQUA 3FFKB 3D2FB 3VF4A 2CGJA 1DEJA 3ENHA 2P9KB 3DXKA 1YUWA 4FL9A 5JICA 1K8KB 1MDUB 1MA9B 2Q0RA 5AQSA 3VEYA 5LY3A 1OKJA 3C7NA 3DAWA 3FZKA 5ADXH 3O5BA 3QBXA 3LDNA 1RGIA 4EIAA 4EAHD 4C23A 1X3MA 1GLEG 3MMVA 3CJBA 1BO5O 4I6MB 4BC2A 4K25A 5AQIA 2IVNA 3L0QA 4EHUA 1NGCA 4IZ9A 2QWPA 4FWPA 5AZIB 3G25A 2E88A 1NBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASVA 4RW8A 1LOTB 4IFEA 3LPUA 4O0IA 3KJVA 3CCUN 4PWDA 3D7EO 3BEXA 3IFRA 3I55N 3AVNA 4CEZA 3IRXA 1S6QA 1QQOA 4CZFA 2F9WA 4HCCA 1C1BA 3CCQN 4DR6K 3U3YA 4O5FA 4BE2A 3O9TA 4XH4A 4FJLA 3SJHA 5KPZA 4DR4K 4CJTA 2ASOA 3VA3A 1BCMA 4A5AA 2IGIA 2G8IA 3M1FA 3PY8A 3I0RA 1NM1A 3AY9A 3L3UA 3SBGA 3QICA 3ZEUA 3LDPA 4QS8A 3OYBA 4EZ9A 3SPZA 3M6GA 3SV3A 1GLJO 3CM5A 2ZWHA 2F9TA 2O8EA 4MDBA 5FPDA 2X78A 1UA0A 3VQ6A 2NRXA 3KWIA 3A5NC 5BN8A 3DOLA 2DY4A 3O8MA 3VTHA 4IEEA 1EWQA 2NRTA 4AH9A 3WNHA 4FM1A 3CFOA 5FDLA 3A5MC 4BWMA 3CJ7A 5KRSA 4Q0BA 1QTMA 1Z6RA 3THXB 4B1VA 5CY4A 3F73A 1VQ7N 1HKBA 5C15A 3AVCA 1VHXA 5GIOA 4OLAA 5BPLA 2HHUA 2XY5A 1HJOA 1MWMA 3UE5A 1S5JA 3PO4A 4JLHA 4CESA 3WUHA 4UQGA 4C1NK 2ZJQL 4AM6A 4DF8A 3ZSRA 3CCVN 1A5VA 1G15A 4BRIA 1KVAA 3V1RA 3S41A 1WSFA 2WFBA 4ISEA 4B8AB 3PLAA 5AQNA 2W6LA 4ELVA 3NF7A 1QQCA 4CHQA 1WBBA 4GV6A 3UKUB 1TKDA 3EZ5A 1BG3A 3PSFA 4YDUA 3ALYA 4CD3A 1MWKA 4Z4IA 1DGKN 1R59O 3NBPA 4FWQA 4FSVA 5KQDA 5I3UA 1X9SA 3Q7CA 3L3VA 1NK5A 1NK8A 3GE1A 4EP5A 4BR0A 3THWB 4B3OA 4Z4EA 4FK2A 4DR7K 1NGIA 2RPIA 3NDKA 1I94K 4DV1K 3OYAA 5FRMA 4W5OA 1V4TA 4RW4A 3H3NO 5GIPA 3EZWA 4FLYA 3THXA 2WOMA 4BDZA 3K5OA 3KTQA 4NO7A 1N32K 2VQEK 4NLBA 1VQ4N 3GL1A 3QETA 3O9SA 5E26A 2Q97A 4FLXA 4F3OA 4FJMA 1HNIA 4PHTX 4KFBA 4NB4A 3NHGA 2E6LA 5GAEP 4JD2B 3SUQA 4BE1A 4CZJA 3CHWA 3PIOL 4A62A 4E7JA 3AVHA 1VSKA 4J8FA 2VGMA 4OO1J 4BRLA 1NOZA 4FWNA 1J53A 3OBYA 1TAQA 4CJRA 3V1OA 4PKHA 3AARA 2XHBA 2VG5A 1ZC6A 1RTJA 3UKUA 1X9MA 2GV9A 1HYVA 1U49A 4K8ZA 1RBSA 4GNIA 3K59A 2RN2A 2P9KA 3EN9A 2G8UA 3EKUA 5BPNA 5J2PA 2PBDA 3SMPA 1C1AA 5M1NA 4V19S 4HTLA 4JHDB 3QNNA 5HOOA 4NCGA 3HK2A 4LY7A 1RCHA 4CK2A 1SL2A 4CHYA 3SZ2A 3G10A 1X3NA 3THWA 3HSTB 1C6VA 3VTIA 3DM2A 3HL8A 2O8DA 2Q2RA 1T8EA 3HI0A 5AQVA 2GUIA 3FZFA 5AQXA 1ILYA 2ASPA 1HKGA 1E4FT 3O08A 3UIQA 3K5LA 3HJFA 1XI1A 1NK9A 2F7TA 1YI2N 3KLFA 3UKRB 3EY1A 2JWLA 3DLBA 4X65K 1Q7YO 1RT7A 2H3GX 1UAXA 3BF3A 1BQMA 3EYZA 2YNHA 4JD2A 2O8FB 1YF5L 3VEVA 3VQ9A 4B1YB 4CEEA 3CJ1A 4ELTA 1HPMA 5AQTA 2PZSA 1T6CA 1T05A 4Q5VA 4DUZK 3DJCA 4W5RA 3NVKA 2ZJPL 1NGEA 1SKRA 3AVFA 2HF3A 1U2VB 3CCLN 4CW7B 3VEOA 3EE8A 1YT3A 4K43A 1ESVA 1BDGA 1X9WA 1RT2A 3KHYA 4KHPK 4A2BA 4E3SA 3V9UA 3WEEB 1YVNA 1T3VA 4AM7A 3O3FA 3THYB 4CVNE 3E66A 3O4WA 4OPJA 4JHDA 4CJPA 1GLAG 3HT3A 4DFKA 4M7XA 2A40A 1DKGD 3QEWA 1KAXA 3VQ8A 1ZBSA 2UXCK 2Q3SA 2GTDA 3JSMA 4DTSA 2RE2A 1NWKA 1SUQA 2QEXN 2WONA 3F5TA 2D0CA 3FE1A 1X1PA 3R1XA 1NJZA 5JVHL 3UKRA 2FF3B 5AQOA 4OKKA 2HNZA 4O4GA 1DLOA 4O8KA 4E0DA 1NKEA 1T44A 4JK9A 1GOCA 4BR4A 1NLVA 3VQCA 2KW4A 4BDPA 1BCOA 4RCHA 4JI8K 1CZ9A 4BGBA 4FWLA 4JKBA 4KH6A 3O6WA 3PX6A 3KLHA 2I7PA 1U2VA 1QVGM 2J4RA 1WB9A 2G8HA 4M3ZA 3E9OA 4CEFA 4JKEA 3HRGA 1JKHA 1VSMA 3CIPA 3BGRA 5JLHA 1HJRA 4AILC 1HYZA 4O55A 3WEEA 4BQLA 2VGNA 2YNFA 2CH6A 1RDUA 1RILA 3BZCA 4Z94A 3THYA 3HVTA 4FPBA 4IG3A 3M3ZA 4Y1CA 4BR5A 3PO5A 4BR9A 4GVEA 2E2PA 2ZM6K 4KV8A 1ITGA 1LAVA 1BOTO 2CGLA 4DLGA 3OY9A 1U04A 1LWEA 5AQFA 4BRHA 2OPQA 4DSEA 3NMUA 1NMNA 1KFSA 1RDCA 2PY5A 4LFCK 1YJNN 3FLCO 4JS4A 4YOTA 4B3RK 2A42A 4FWMA 3NAEA 3CI5A 3VQEA 3JYTA 1X9JA 4FJXA 4GV3A 4JN4A 4BG8A 1Q8IA 4MO4A 3ZCMA 3Q7BA 4U67L 4JS5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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