3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
molecule keywords Propionate kinase
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
4PKGA 2P9PB 5B8HA 3M3ZA 4IWVA 4NO7A 5F2RA 4FPAA 4JD2B 2A5XA 3D2FB 5BN8A 1K8KB 1YXQA 5F1XA 4RTFD 1SZ2A 4FWNA 4CZIA 5ELZA 3CI5A 3ZX2A 1XQSC 4BG8A 4BC5A 4BRQA 5BRDA 2QWRA 4H0VB 1V4TA 5KPTA 4BR9A 2NZTA 2E2QA 4CD3A 3SLCA 2IVOA 4J8FA 5ADXA 2VYPA 3G25A 4CZFA 4I6MB 5FPDA 2CH6A 3DJCA 1ZC6A 1ATNA 3WT0A 5AQQA 5AZJA 1QZ6A 3FFKB 1HJOA 1T6DA 5AQSA 5AQHA 2QWQA 3UB5A 4BRMA 1TUUA 2P9UA 4H0YB 4BRPA 2Q31A 3VOVA 4BVOA 3ULEA 2H3GX 1NGEA 2Q36A 5KQ8A 5AQRA 4JN4A 2D0PA 4QS7A 2D0OA 3VF6A 3VESA 1GLCG 2ZF5O 4H0PA 4WYBA 1Y64A 3UKRB 3MMVA 3CERA 1X3MA 3R6MA 4O5FA 2J4RA 3U4LA 5AQKA 3SMPA 3A5LC 4BVPA 5BRHA 3IDHA 5BN9A 1U6ZA 4PKHA 3A0IX 1HPMA 3ZEUB 4Z94A 2GTDA 1KXPA 2V52B 4H0XB 5AQTA 4RWTA 3CQXA 3H3OB 3LDNA 1KAXA 4JHDA 5TKYA 2P9KB 3P4IA 1HKCA 1GLEG 3A8YA 3AAPA 3U9ZA 1GLAG 3QFUA 2F9WA 3RSEA 3VENA 2Q1NA 2D1KA 4BQLA 4BRNA 4HTLA 2FSJA 2CGKA 3FZKA 3I8BA 4FL9A 4H0TB 5JLHA 1E4FT 4BGAA 4A2AA 3LL3A 5JLFA 5AQJA 1JCEA 4CI6A 1RFQA 1IG8A 2NLXA 1BOTO 3CQYA 3MK6A 4XEIA 4MO5A 4FWKA 3VEXA 3ZETB 5AQUA 2DPNA 4H5RA 3H1QA 2P9NA 4MO4A 4CD1A 3S41A 1GLBG 1NMDA 3C7NA 4IO8A 3LDOA 2W41A 4FWSA 1U2VB 5EXWA 3O4WA 3GE1A 2P9IA 3WXLA 4FWLA 5AQYA 4CZKA 4XH4A 4M7XA 1MWKA 4ISEA 1TYQB 2AP1A 2ZGZA 1E4GT 1KAYA 1Z6RA 4BRHA 4K43A 3CJBA 3O6WA 1ESVA 4JAXA 3SK3A 1X9JA 2QWLA 2V7ZA 3L4IA 2P9PA 2A40A 4F9OA 4GY2B 4JD2A 4NB4A 2E2NA 3VEWA 5AQFA 3D2FA 2YI1A 1K8KA 4QS8A 3IFRA 1NM1A 2P9LA 3VPZA 2YHWA 3VEYA 5LJVA 2OANA 5AQWA 2FSKA 4BRDA 2ZGYA 1BWFO 5AQXA 1DEJA 1CZAN 4I6MA 3M1FA 2F9TA 3FLCO 4L3QA 2CH5A 3BF3A 3FZFA 5AQNA 3R8EA 3D2EB 1NGAA 5KPZA 2AA4A 4LC9B 1WOQA 5BR9A 3WEEB 2UYTA 3WXIA 3MN7A 1BA0A 1T44A 5E84A 3DAWA 3UKUA 1ATSA 3MN6A 3AY9A 4HWIA 2YJEA 2GUPA 3SMSA 3VERA 1NBWA 4H03B 2NRHA 3B8AX 4K25A 4BRKA 5I9EB 3EKUA 2FLOA 3HTVA 4GNIA 5AZIA 4AM7A 2Q0RA 4E1JA 3VEZA 5F0XA 1NGIA 4ISFA 4DQ8A 2GWKA 1X3NA 2FXUA 3LM2A 1BG3A 3ZX0A 2A6AA 2I7PA 4CZMA 2EWSA 2QWNA 1MA9B 3MN9A 5AQOA 3M6GA 4FWRA 1DGKN 1XC3A 5AQLA 1H1VA 4B1YB 5FPEA 2E2OA 1RDWX 3IMXA 4FSVA 1GLDG 2P9UB 2I7NA 3FR0A 4BRCA 1IJJA 3W0LA 1Z05A 5EX5A 3FE1A 4PL7A 3ZX3A 2BTFA 2IVNA 3ENOA 1BA1A 2ASPA 3QB0A 3KVGA 2QWOA 3IUCA 3QMLA 2BUPA 3WQUA 4BR5A 2ITMA 2QW9A 2ASOA 3DWLA 1GLFO 4IJAA 2HOEA 2W40A 3CJ7A 4FWQA 1NGCA 4CZHA 4K42A 4H5TA 3CHWA 4XH5A 4EIAA 3WUHA 4BQZA 3HZ6A 4BC2A 3J8AA 2P9SB 2E2PA 1ZBSA 4IZ9A 1EQYA 4CZJA 3CJCA 4H5VA 4CBUA 1GLJO 5FPNA 5AQIA 4BC4A 1HLUA 3F9MA 1V4SA 2WUSA 4JHDB 1MWMA 1NGHA 1JCGA 4CBWA 3EZWA 3GBTA 5EVZA 2PBDA 3AAQA 4FWMA 4RCHA 1LCUA 3FZHA 4IJNA 3O1BA 1WUAA 4B1ZA 3VGLA 4WQ4A 3MN5A 1S22A 1YAGA 3GL1A 4FPBA 4FOEA 4CBXA 1Q18A 5JMVA 1NGGA 4PKIA 1HKBA 3BF1A 4B1UB 4DHYA 3WQTA 3DXKB 5LY3A 5BPMA 3VETA 4EAHD 2A3ZA 3DXMB 4IXCA 4BRAA 3HSCA 1NGFA 3QFPA 3SJHA 3A5OC 2HF3A 4CJ7A 4CZLA 2QM1A 3GDQA 4O8KA 5BREA 4WQ5C 4A61A 1HUXA 2P9NB 3ENHA 4JNEA 3C7NB 4H5WA 1ATRA 2VCPA 4BRGA 1BDGA 4ISGA 2E88A 2YHXA 3QBXA 3W3DA 1TUYA 1HX1A 3VEVA 3L0QA 4PL8A 2HF4A 4EFHA 2IIRA 2GEMA 4H0OA 3CETA 4WQ5A 5AQZA 4BROA 5ADXH 5AQPA 3KZBA 4EHTA 4FO0A 4BG9A 3FZMA 3A5MC 3HM8A 3BEXA 4MLEA 3WXJA 1QQNA 5EY4A 2YHYA 2Q2RA 1NGJA 1GLLO 4B9QA 3VGMA 4C23A 5BRFA 2ZWHA 5JICA 3O80A 4BRLA 1JCFA 2A42A 2FSNA 3O1WA 2P9LB 3WXKA 5AFUH 3ATVA 5BPNA 3FGUA 3CJAA 2FF6A 5LJWA 3UKRA 3EN9A 2YCHA 2D4WA 3BP8A 3EL2A 4XH1A 4BR4A 3AARA 3TU5A 3VGKA 3GG4A 1RGIA 1NWKA 1S3XA 3O8MA 5AQMA 2A41A 3CIPA 4BR0A 3CJ1A 4BRFA 4KBOA 3O08A 1QQOA 3LM9A 3ZEUA 3VF4A 2Q0UA 1BUPA 4BR7A 3TPQA 1G99A 1YUWA 1QZ5A 2P9KA 2E1YA 4Y0WA 5AZJB 1LOTB 3L6QA 3KHYA 5AFUA 3BUZB 3VEOA 1NGBA 4BGBA 1BU6O 3UKUB 3EO3A 2CGJA 3U9DA 2VWBA 3GOIA 4MLHA 2QWPA 3ATUA 3QICA 4EHUA 3H45C 3LDLA 4H5NA 4AM6A 1KAZA 1QQMA 3ULEB 3VF2A 5FPMA 5AQGA 4A2BA 5AQVA 5AZIB 4FWPA 3QDKA 2P9SA 3H1VX 3C0BA 5AR0A 3H3NO 3HBTA 4FWOA 3I33A 4DCHA 3ZETA 3JS6A 3MCPA 4M7YA 2CGLA 2E20A 2IVPA 3H46O 4WQ4C 2PAVA 1XUPO 4CZEA 1U2VA 4A62A 4YDUC 2QWMA 3A5NC 4B1XB 3H6EA 2QXLA 2YJFA 5CE3A 3UE5A 1TYQA 2E8AA 3DXKA 3HI0A 3LDQA 5E26A 3RSEB 3D7EO 3DXMA 2FF3B 4BRIA 2ASMA 2HMPA 3R9PA 2E1ZA 1P8ZA 4YDUA 1NLVA 1OKJA 2GWJA 1T6CA 1J6ZA 4QS9A 3MDQA 4DB3A 4BR2A 2V51B 1C0FA 1SQKA 1SAZA 3QBWA 4K41A 4M63C 2KHOA 1HKGA 3OHRA 5KQDA 3U8XA 1R59O 1MDUB 4B1VA 1YVNA 1NGDA 3CJ9A 3LDPA 1BO5O 2P9IB 3D2EA 1C0GA 5EOYA 4BREA 2V7YA 3EKSA 2GELA 1D4XA 4FOIA 3ID8A 5BPLA 3O5BA 1QHAA 1DKGD 3WEEA 4B1WB 3JXUA 5KPRA 1ZXOA 3FZLA 2Q97A 4CZGA 4BC3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UY8O 4M3TA 4NO7A 5F2RA 5GINA 4JD2B 1YXQA 3EZ5A 4RTFD 4FWNA 1UOCA 5CZ1A 5ELZA 5BRDA 3ZX2A 1ZYQA 3AO5A 1V4TA 1CLQA 2E2QA 5I3UA 4CD3A 3Q7CA 2KW4A 1FK9A 1VQKN 2GBZA 3IRXA 2CH6A 1ZC6A 3WT0A 2EHGA 1QZ6A 3FFKB 5JVHL 2QWQA 3DM2A 4DTPA 1TUUA 4QCLA 2Q31A 4BVOA 2X6SA 3ULDA 3ULEA 3RMCA 5KQ8A 3KD1E 1TVRA 1JXBA 3VTIA 1JLBA 3VESA 4JI7K 4I2QA 5CR4A 3PO4A 1VRUA 3R6MA 1X3MA 4CFCA 2F8SA 5AQKA 4CIGA 3ENBA 4O55A 3IKMA 5AJ3K 1U6ZA 1K6YA 4Z94A 2GTDA 1B9FA 4DQRA 3LAKA 4CJFA 3QESA 3CQXA 1NK0A 4IFVA 5TKYA 5C0YA 3M8RA 1IBMK 4LFBK 3A8YA 2HNZA 2IDOA 2Y1IA 3B6OA 4O0IA 3ZT3A 2F9WA 3RSEA 4BRNA 4HTLA 3ZSRA 3FZKA 4ZTJA 4IOAL 5H1SQ 3HSTB 3I8BA 4FL9A 4ID1A 3NHGA 2PYJA 1WSFA 5JLHA 1E4FT 4BGAA 3P38A 2O8FA 4A2AA 4GV9A 3OYNA 1Y97A 1VAZA 2Z1JA 5J2MA 4FJ9A 4XEIA 4MO5A 2O8DB 3F2KA 4FWKA 1I3AA 4CF2A 4CEFA 1ZBIA 4DLGA 1ASVA 1K73O 4H5RA 3T1HK 3ZYYX 1GLBG 3C7NA 4FWSA 1A5XA 5EXWA 4NYFA 1S1UA 5AQYA 3NBPA 1NK5A 4ISEA 2OYQA 4HUFA 3NDKA 2AP1A 2ZE2A 3N4QA 3S3OA 4K43A 3O6WA 1ESVA 4C8LA 2UXBK 2Z1GA 4KB1A 4JV5K 3C6UA 1X9JA 2QWLA 4OKJA 5M1PA 5M1KA 4F9OA 1WSEA 3AVAA 1JJ2M 3ZSYA 3HPGA 3D0PA 3OYAA 3S3MA 3OBWA 3LANA 2IAJA 4OGEA 3TTCA 5MLCQ 5J2PA 3VEYA 3ZSZA 2PFUA 3AO1A 3PUFA 3MX2A 3CXCM 3THYA 3ASMA 4BRDA 2ZM6K 1DEJA 4I6MA 2ATQA 2F9TA 3HRGA 4IOXA 2HVHA 3BF3A 3FZFA 2QKKA 5HL7L 5C42A 1NGAA 3RTVA 2GUIA 4M45A 4UQGA 5KI6A 3MAQA 1EP4A 1BA0A 1D5AA 2Y1JA 5KGWA 3DAWA 2B6AA 3UKUA 1HNVA 5C10A 4FVUA 3H08A 4HWIA 1VQ5N 4YFUA 3DLRA 1NBWA 4H03B 4FJHA 3O9UA 1BQNA 2I5JA 4CJ3A 5I9EB 3NGZA 4LFCK 4CK3A 4AM7A 4E1JA 4DG1A 5J2QA 3E9PA 4ISFA 4HHTA 3LM2A 3HL8A 4CZMA 2KZZA 4JI4K 5JS1A 1DGKN 1XC3A 1HNZK 1QSSA 3SUNA 2P9UB 3AVGA 5FRNA 5CYMA 2GX9A 2HNYA 3HVTA 1M90O 2IVNA 3ENOA 2O8BB 2ASPA 4LFAK 2QWOA 3IUCA 3WXMB 1VQMN 4A59A 4ELVA 3DWLA 3OYKA 2HOEA 4CZHA 4K42A 4XH5A 2HSTA 4CGFA 1JL2A 4J2AA 1LW0A 1ZBSA 1FKPA 4CBUA 4H5VA 1TV6A 4FJ8A 4E0DA 2WUSA 5DM6L 4CBWA 3EZWA 3L2UA 4NCAA 2PBDA 3AAQA 1DTQA 4AHUA 4WE1A 5HRSA 5HOOA 1P90A 1WUAA 3CG7A 3MXIA 3VGLA 1KVCA 4JK8A 3MN5A 1S22A 1VQ9N 1RDDA 5JMVA 3M8PA 4FJIA 4DHYA 3BF1A 1SL0A 3F5TA 3WQTA 3P1GA 4EAHD 3EYZA 4JI1K 3SJHA 4N47A 3L3VA 5BREA 3CMEN 5C12A 3ENHA 2DTUA 4JNEA 4JKFA 3VTHA 1QHTA 4FK0A 1BDGA 4KV8A 5HBMA 3W3DA 4DTJA 1HX1A 2VWJA 1WBBA 1VQ7N 4EFHA 4JYAK 4H0OA 4CGDA 1RT7A 4CK1A 2VGNA 5ADXH 4GW6A 1NOZA 4EHTA 3OS1A 3FZMA 3HOSA 4CFDA 3A5MC 1VQ8N 1RT3A 4Z0UA 3BEXA 4MLEA 5LMUK 1SKSA 4JKGA 5EY4A 4OLBA 3KKRA 1EWQA 3Q7BA 3VGMA 1C6VA 3TI0A 4OX9K 4BWJA 2A42A 3G71N 1FW6A 2P9LB 1BGXT 4E19A 5AFUH 3BZCA 1WSHA 1NJYA 1VSDA 4CJVA 4JKAA 2UUAK 1VSFA 3LALA 3GG4A 4B3TK 1NWKA 3O8MA 4DLEA 3CIPA 4BR0A 4BRFA 4KBOA 3LM9A 2HBJA 5KRTA 2VG5A 2WOMA 3TPQA 1G99A 4KI6A 1YUWA 4IFEA 4ICLA 1EO1A 4J2BA 1Q9YA 1LWCA 4I9LA 4BE2A 4DR3K 3O4NA 1LOTB 3KHYA 5AFUA 3BUZB 4M3ZA 5D3GA 4B9VA 2CGJA 3U9DA 2QWPA 4KTZA 3H45C 4W5NA 4H5NA 3OTOK 3R1XA 3ULEB 3SQ0A 1S1TA 4FLZA 1BIUA 1J54A 2O4IA 1B9DA 3HBTA 4JI5K 3I33A 4DCHA 4I7FA 3TWHA 1T7PA 2UXDK 2O8DA 5IT9O 3AVHA 3HP6A 4M7YA 5KGXA 3V4IA 2CGLA 3KK1A 2E20A 4WQ4C 1T3VA 3AVFA 2O8EB 4CZEA 1GOCA 3E66A 2F96A 3S9HA 2LSNA 4CERA 4I9QA 2YKMA 3H6EA 1Q86O 2P1JA 1XI1A 1KD1O 2RF2A 3UE5A 3TTFA 2OCEA 4EP5A 3AVJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4H4M A;  4FM1 A;  3VF2 A;  5AQG A;  3I55 N;  1U49 A;  3UIQ A;  1BIS A;  3QDK A;  2YV0 X;  4E1N A;  3OS0 A;  3H1V X;  1NK7 A;  3C0B A;  3U3Y A;  3H3N O;  4FWO A;  4LH5 A;  3PLA A;  4R5P A;  1KTQ A;  2OTL N;  1N6Q A;  3JS6 A;  2IVP A;  3KWI A;  3EE9 A;  3VQ5 A;  4KRE A;  1LWE A;  2OZS A;  1EXQ A;  4CHP A;  2QK9 A;  3JSM A;  4A62 A;  4YDU C;  1C0T A;  2YNF A;  3MWT A;  3V81 A;  4DSJ A;  3I0R A;  1TK5 A;  2P5G A;  5CE3 A;  2Z1H A;  4W5T A;  3QNN A;  3HI0 A;  5E26 A;  3D7E O;  3DOK A;  2ASM A;  5CHI A;  4Z4I A;  4EZ9 A;  1NLV A;  1OKJ A;  4TSX A;  1FJG K;  4PWD A;  2RN2 A;  1C0F A;  1SQK A;  4LSN A;  1VHX A;  3VQQ A;  4DTR A;  4K41 A;  4KAZ A;  5LL6 Z;  1NOY A;  2KHO A;  2HB5 A;  1OH7 A;  4BDP A;  1RT5 A;  1YVN A;  5LMN K;  3NCI A;  3CCJ N;  4AHT A;  3D2E A;  1BIZ A;  4DKW A;  1U4B A;  4E7K A;  3CCU N;  4W5O A;  3G4S N;  1SUQ A;  3LPU A;  3D6R A;  4B8C A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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