3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
b'MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule tags Transferase
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
1D4XA 1BOTO 2QWMA 2V7YA 4BG8A 1T6CA 1S3XA 4BR4A 1G99A 5AZIA 1NGEA 4DQ8A 5BPNA 1MDUB 1GLLO 2E1ZA 4NB4A 4BRNA 2E1YA 1NGBA 3MN5A 3EKUA 3UKUA 2Q36A 4QS8A 1JCFA 1K8KA 2P9LB 4ISGA 3CJ1A 4BRMA 2A40A 2QWOA 2D0OA 3LDQA 5KQ8A 2QWLA 3ZEUB 3GDQA 3QFUA 2IVOA 3HZ6A 4BRGA 3H3OB 4CZIA 4CZGA 3D2FA 3ENOA 4JAXA 3SLCA 5AQSA 4CZEA 1JCGA 3A5OC 2I7NA 4K43A 3JS6A 2GTDA 1E4GT 1Q18A 2QM1A 5AQKA 2QWQA 1NGJA 2HF3A 3W0LA 1X3MA 1MWKA 3WT0A 4IZ9A 3CETA 2VCPA 5AR0A 4AM6A 3CJ9A 3BF1A 2BTFA 2P9PB 1P8ZA 5B8HA 1NGAA 1QQNA 3LDOA 5JICA 3R9PA 2A5XA 3IUCA 3VEWA 4MO5A 5AFUH 1T44A 3O6WA 3WUHA 2YHWA 4CZMA 3FZKA 5AQHA 5FPEA 2YJEA 2E2NA 1GLFO 4BGAA 5JLFA 2YCHA 1Z05A 4H0YB 4EFHA 5AQNA 4JHDB 3VEXA 3RSEA 1BA1A 5EY4A 1ZXOA 4BR7A 2IVNA 5AQYA 3FGUA 4CJ7A 2A42A 1NMDA 4KBOA 3U8XA 2I7PA 4GNIA 4BRAA 4RCHA 1NWKA 3ULEA 3DXMA 3KHYA 4BR9A 1TYQB 1GLEG 3QFPA 3L0QA 4BC2A 1KXPA 4FOIA 5ELZA 4BRDA 2F9TA 3UB5A 3ATUA 2GWKA 1U2VA 1NGDA 3O80A 5LJVA 3HSCA 2KHOA 4PL8A 3LM9A 3FZMA 5LJWA 2P9SA 4K41A 5EXWA 1BA0A 4FWQA 3LDLA 2YJFA 5AFUA 3O5BA 4BRCA 3LDNA 4FWLA 4CBXA 3AY9A 4BGBA 1MWMA 4O5FA 4H5VA 3DJCA 1SQKA 1GLDG 3C7NB 1KAYA 4ISFA 3IFRA 5AQPA 3LDPA 2UYTA 1YUWA 4AM7A 2A41A 4PL7A 4IJAA 2FF6A 4BR5A 2P9IB 1BWFO 3DXKA 5BRFA 4CD1A 3TU5A 1ESVA 3ZX0A 2Q0UA 2HMPA 4C23A 3WXLA 1J6ZA 5AQOA 2P9UA 4B9QA 2P9KB 3MCPA 4BVPA 3CHWA 1SAZA 2NLXA 3D2EA 3R8EA 3GL1A 2VWBA 5E84A 3HI0A 3GBTA 3HBTA 3ZX2A 3QMLA 3AAQA 5AQGA 1KAZA 4WYBA 3CI5A 5AQVA 3WXKA 3ZETA 4B1ZA 1XC3A 3FZFA 1BUPA 1NGGA 1NGCA 2Q0RA 2ZGZA 2HF4A 3HTVA 5KQDA 4M63C 3L4IA 1DEJA 2WUSA 3FR0A 3QDKA 4O8KA 1DGKN 2ZGYA 2Q2RA 5AQRA 3MN6A 1RGIA 3A8YA 5AQXA 3I33A 5JLHA 4H5NA 3SMSA 3EKSA 5BRDA 3VESA 3F9MA 2FSKA 1HKBA 2FLOA 2FSNA 5BREA 2HOEA 5AQWA 4RTFD 1TUUA 4BROA 4FPAA 4BRLA 3QBWA 4CZFA 4FL9A 4B1UB 1DKGD 3JXUA 3R6MA 4A61A 3KVGA 5BPMA 2QWPA 3LM2A 3DWLA 4BR2A 2GUPA 2W41A 4I6MB 3UKRB 4H0OA 4B1YB 4WQ5C 4Y0WA 1C0FA 4RWTA 1QZ5A 1HPMA 1NBWA 3EO3A 5F2RA 3O1BA 1RFQA 4FWRA 5EVZA 5KPZA 1RDWX 4FWNA 1TUYA 1QZ6A 5AZJB 4EHTA 1ZC6A 4FSVA 5BPLA 3VF6A 3CQXA 4M7YA 3WXJA 4BRFA 3P4IA 2P9LA 5FPMA 4EIAA 2A6AA 4CZKA 3GG4A 3VF2A 1HKCA 4XH1A 4BG9A 4BRQA 3VOVA 3G25A 2ZF5O 5JMVA 2YHXA 1MA9B 2QXLA 1YXQA 3QBXA 3WQTA 3HM8A 3EZWA 3J8AA 2H3GX 2Q1NA 5AQTA 5AQLA 4XH4A 3DAWA 3WEEA 3ENHA 3SK3A 5KPTA 5F0XA 4IXCA 2PAVA 4JD2B 2W40A 3KZBA 4XEIA 1NGIA 4IJNA 2D1KA 2DPNA 2GEMA 3BEXA 2P9PA 3CJAA 2E8AA 3LL3A 2IVPA 2V51B 1LCUA 3MN7A 4K42A 1JCEA 3MK6A 3MDQA 5AZIB 3IDHA 1BDGA 4BRHA 3UKUB 2D4WA 2GELA 1OKJA 1SZ2A 3FZHA 4BREA 1NLVA 2E20A 3FZLA 4HWIA 1K8KB 1XQSC 4BRKA 5ADXA 1GLCG 2YHYA 4MLEA 4JHDA 2P9NA 2ASMA 4A2BA 2CGKA 3H3NO 3VEVA 1V4TA 4B1VA 5EOYA 4WQ5A 4FO0A 3D2FB 3QICA 4JNEA 4DCHA 5KPRA 3ZX3A 3TPQA 4H03B 1GLAG 3M3ZA 4FOEA 5BR9A 1QHAA 2Q31A 1X9JA 3H1QA 1TYQA 3O1WA 3U4LA 5EX5A 3FLCO 3O4WA 1QQMA 1BO5O 2NRHA 4ISEA 4CZLA 1S22A 3VERA 2PBDA 1EQYA 1CZAN 4BR0A 1YAGA 4QS7A 1V4SA 2ZWHA 2E2QA 4YDUC 3AARA 3VGMA 2CH6A 4H5TA 4FWPA 4QS9A 3VEYA 3BP8A 3UE5A 3O8MA 3VETA 3O08A 1ZBSA 5BRHA 4CZJA 2ASOA 4BQLA 5AQZA 2NZTA 1IG8A 3H46O 2CGJA 4F9OA 3FFKB 3C7NA 1Y64A 4H5WA 5AQUA 4H5RA 4FWOA 4BRIA 3RSEB 2E2OA 1QQOA 1HKGA 5ADXH 2E2PA 1HUXA 4WQ4C 2P9IA 3IMXA 4M7XA 5CE3A 4CI6A 3CERA 4EAHD 3WQUA 4JN4A 3ULEB 3DXMB 3SMPA 2P9KA 2V7ZA 2GWJA 3CJCA 1XUPO 1NGFA 3WXIA 3S41A 4NO7A 1WUAA 3H1VX 1GLBG 1ATRA 4HTLA 2YI1A 3WEEB 4CBUA 3BUZB 3I8BA 3CIPA 5F1XA 3BF3A 1U2VB 3MMVA 4K25A 4J8FA 3A0IX 4FWSA 3ID8A 1BU6O 3ATVA 1IJJA 4LC9B 2P9SB 4B1WB 4BC3A 4CBWA 3U9ZA 3OHRA 5TKYA 3M1FA 2CGLA 5FPNA 3EN9A 4DHYA 3ZEUA 4E1JA 3VEZA 2J4RA 1NGHA 3B8AX 3GOIA 5BN9A 5AQQA 4BQZA 2FXUA 4EHUA 1LOTB 1HJOA 1R59O 1Z6RA 4FWMA 4BC5A 4DB3A 4BC4A 3CJ7A 3CJBA 3SJHA 2E88A 1T6DA 2AP1A 1GLJO 2BUPA 4PKIA 3A5LC 2P9NB 3DXKB 1HX1A 3M6GA 3VPZA 4YDUA 4A2AA 3L6QA 3A5MC 3VENA 2AA4A 2FF3B 2OANA 2P9UB 4I6MA 4H0TB 2A3ZA 4MO4A 3UKRA 5AQIA 2QWNA 5I9EB 4L3QA 4XH5A 4H0XB 3D2EB 5AQJA 3ZETB 3MN9A 3H6EA 1BG3A 4BRPA 1C0GA 5BN8A 4H0PA 5AZJA 4CD3A 3EL2A 2FSJA 5FPDA 5AQMA 1HLUA 1NM1A 3VGLA 3GE1A 2QWRA 4WQ4A 2QW9A 4CZHA 4PKHA 5LY3A 3D7EO 2IIRA 2V52B 1X3NA 2F9WA 1WOQA 3AAPA 3A5NC 4B1XB 3VF4A 3VEOA 4MLHA 1U6ZA 2ASPA 2VYPA 4FWKA 4BVOA 3W3DA 4Z94A 4H0VB 2ITMA 4IWVA 2CH5A 4JD2A 1YVNA 1E4FT 3FE1A 4IO8A 4PKGA 3CQYA 4A62A 3H45C 3QB0A 5AQFA 4FPBA 1ATSA 3C0BA 4GY2B 1H1VA 3VGKA 2EWSA 5E26A 1KAXA 3U9DA 2D0PA 2Q97A 1ATNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QEWA 2PYJA 2HNZA 4GVEA 4BG8A 1S3XA 3SV3A 1BCMA 1NGEA 1MDUB 3ID6A 2A1SA 1NGBA 3EKUA 2Q36A 4CCHA 1RBRA 3KD5E 5FROA 4QS8A 4A59A 4CEOA 1D9DA 1F21A 2P9LB 4O55A 2X6NA 5J2NA 4DTUA 2D0OA 3S3NA 4DKWA 5AJ3K 3QFUA 1XMOK 2IVOA 3KWGA 4U7BA 3VQQA 1A5XA 3D2FA 4JAXA 3SLCA 4CZEA 1VQKN 4I7FA 3MXJA 2VQEK 4YHHK 1M1KO 1J54A 2BDPA 3THXB 1UWBA 3OTOK 3WT0A 1RT5A 2VCPA 5AR0A 4AM6A 1UOCA 1SL2A 3BF1A 4DR6K 3DOLA 3F2KA 4DV1K 1NGAA 2D0CA 3CCLN 1KVBA 3IUCA 2VQFK 4DLGA 4BDPA 1RT7A 4MO5A 3VQPA 4DLEA 1XI1A 1LWEA 1Q8IA 2O4GA 1T44A 4CK3A 4FZZA 3WUHA 4DTOA 2YHWA 3PUFA 1KTQA 1JL2A 5JLFA 1YTAA 2YCHA 4H0YB 3RR7A 1IH7A 5AQNA 3VEXA 3E01A 4HCCA 5HRSA 2QKKA 4BR7A 3FGUA 4YNQA 3QINA 4MDBA 3HK2A 1NMDA 4KBOA 3U8XA 2HSTA 2I7PA 1X9MA 1VSHA 4DV2K 1HNWK 4JKGB 3DXMA 4BR9A 1KFSA 1OH8A 1VQ8N 4CJRA 4FOIA 3TWHA 3DRPA 2O8FB 1A5WA 2D0BA 3UB5A 4I2PA 3O80A 5LJVA 4JKDA 3L3UA 5CYQA 4OKEA 3FZMA 4JI5K 4K41A 3LDLA 2YJFA 4CFDA 3THVA 3RR8A 3EZ5A 1ZBFA 3LDNA 4DQIA 1HNXK 2ZJRL 4QAGA 3SPYA 4H5VA 4NLBA 2W6KA 3DJCA 1GLDG 3C7NB 1KAYA 4ISFA 3AA3A 4FLYA 1YUWA 4DR3K 2HVHA 4TSXA 4IJAA 1TKZA 1BWFO 3DXKA 4AHCA 5BRFA 3LP3A 3RMCA 4A5AA 3TU5A 5J1EA 4C23A 3WXLA 5AQOA 3LZJA 4B9QA 1Q7YO 1JLQA 3HP9A 3ZT2A 1DTTA 2NLXA 2F7TA 3GBTA 3HBTA 2NRXA 5AQGA 3ZT3A 4WYBA 3CI5A 4AHTA 4FXDA 5AQVA 4M3UA 3K5NA 3S3MA 3FZFA 1NNEA 3OYCA 3SQ0A 4FJ9A 1NGCA 2Q0RA 4HUGA 1TK8A 2PYLA 4GV3A 4Q0BA 4GKJK 2ZE2A 2WUSA 1B9FA 4X64K 5AQRA 1RGIA 3ZT0A 4KREA 4AF1A 4FJMA 2NRZA 3EKSA 5BRDA 3E9LA 3OBYA 3VESA 5HRRA 1LV5A 2FLOA 1VQPN 3CQ8A 3OVNA 4HTUA 1TUUA 5K14A 1SV5A 4JK8A 4FL9A 4A61A 4I9LA 5H1SQ 4H0OA 1KLMA 1WNSA 4B1YB 4Y0WA 2F8SA 1RNHA 3AVJA 5KPZA 1RDWX 1ZC6A 3T1AA 4NYNA 4LF6K 4I2QA 1RT4A 1TVRA 4M7YA 3WXJA 5C0YA 4BRFA 3KKSA 3P4IA 2NUBA 5FPMA 4EIAA 4KI4A 5KI6A 4BRQA 2ZF5O 3T1HK 3AO1A 4F2SA 3SUOA 1IO2A 1S5JA 3AGRA 4CJWA 2YKNA 2O8EA 4IG3A 5MLCQ 4YOXA 4PY5A 1KD1O 3DAWA 1RDAA 5F0XA 4GMJB 4DTNA 4CJ5A 2PAVA 4JD2B 1NK0A 1NGIA 4IJNA 3CC7N 2DPNA 2GEMA 5DM7L 2FBYA 4DS5A 4X65K 5CR4A 3KTQA 1UA0A 1ZBLA 1ASWA 4HUEA 3K58A 3K9KA 1OKJA 3IS9A 3G4SN 2OZSA 2E20A 3FZLA 2OA8A 5TKWA 3G6EN 4B9UA 5ADXA 5CZ1A 4YOUA 2FC0A 4FK0A 3QNNA 1ITGA 2P9NA 2ITGA 3CXCM 5KGXA 4A2BA 2FBVA 3J7ZO 4KHWA 4B1VA 1S1XA 4FJGA 4FO0A 2JWLA 3D2FB 4LF5K 3TAEA 3QEPA 3M3ZA 1KC8O 4OX9K 5DMRA 4LSNA 5EX5A 1EP4A 3FLCO 1QQMA 3O4WA 2KW4A 2HHUA 4DQRA 4DSEA 1I3AA 3LP1A 1EQYA 4LH4A 3SCXA 3VN5A 3MCAB 4OJRA 1YAGA 4QS7A 4UY8O 1V4SA 4YDUC 3VGMA 4LSLA 3NF6A 4H5TA 2HNYA 3LP2A 4WFBL 1VQMN 2JGUA 4PQUA 3HJFA 3BP8A 4B3MK 3UE5A 1NK9A 3V81A 1NK7A 5KRSA 1ZBSA 4LF7K 3DMJA 4CIEA 1RDBA 2GV9A 3J81O 4H5WA 4H4OA 4RW7A 3C95A 4CEDA 3WNEA 4FW1A 4M3RA 4DFJA 2P9IA 3CCVN 4ID5A 1DTQA 4EAHD 4CF9A 4FVUA 3TABA 3DXMB 3VQAA 5FRMA 2KTQA 1WUAA 4LF9K 5M1KA 4ELUA 1K73O 3PX6A 4PA1A 1UA1A 3I8BA 4K25A 1EWQA 2ZJQL 1BU6O 5C15A 1IJJA 4LC9B 1B9DA 4BC3A 3SZ2A 1S1UA 4B3SK 4B9NA 1C0UA 4CJKA 4DHYA 4E1JA 1XMQK 4JKEA 5E41A 3GOIA 4BQZA 3VQBA 3WNGA 1HYZA 5BN9A 3ZYYX 5BR8K 1LOTB 1Z6RA 2QA4N 4FWMA 1IBMK 4BC4A 3E1YA 4FM0A 3CJ7A 3CJBA 4F2RA 3SJHA 2HHHK 4PKIA 2XO7A 3DXKB 1HX1A 4KPYA 4CJPA 4YDUA 4FJNA 3A5MC 4J2BA 1XHXA 4OPAA 5FRNA 5A2QO 2QWNA 4CHPA 1ZYQA 1FKPA 4XH5A 4H0XB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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