3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule tags Transferase
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
2AP1A 2Q0UA 3VEWA 3P4IA 3EO3A 3BUZB 1RFQA 4HTLA 4A2AA 1J6ZA 2P9IB 4WQ5C 1BA1A 3CQXA 2GWJA 2P9PB 3J8AA 3MMVA 3CJCA 2ASMA 2GTDA 1TYQB 3GE1A 3U9DA 3FFKB 4PL7A 5E84A 4GY2B 3CJBA 2D1KA 4BRMA 5LJVA 5JMVA 1NGAA 4H03B 3H1VX 1HUXA 4BRLA 3MN7A 1X3MA 4WYBA 2FSNA 4FOEA 5FPEA 4FSVA 3JS6A 4BGAA 2CGLA 1NGJA 5AQVA 1BWFO 4LC9B 3SMSA 1NGGA 3VEXA 3O5BA 2Q31A 3UKUA 3GBTA 1HKGA 4IJAA 2PBDA 4EIAA 2V7YA 1JCEA 4KBOA 3GOIA 5ADXA 3UKRA 5I9EB 4BROA 2W41A 2E20A 4CZEA 1NGHA 3QDKA 4MLHA 4IWVA 3W0LA 4CZJA 4BG8A 1YAGA 3VENA 4K42A 1HJOA 3ZEUB 2E2QA 3H3OB 3R6MA 4BG9A 3DJCA 2EWSA 2P9NB 1BUPA 4BRPA 3WQTA 4NB4A 2CGKA 2E1YA 3FZKA 4ISEA 3VGLA 2A40A 2I7PA 2IVNA 3CQYA 3VETA 5AQMA 5BPNA 3FZLA 1NGCA 4M7XA 1WUAA 2BTFA 3WT0A 1K8KA 3HBTA 3BEXA 2HMPA 1U2VA 3D2EB 2ASPA 3VF4A 1CZAN 2IVPA 1HKCA 4JD2B 2E88A 4FL9A 4H0PA 3QBXA 5BPLA 2F9WA 5AQKA 1DGKN 3CJAA 4BRGA 3MCPA 4BR2A 4BC4A 4BR4A 2ZGZA 2A41A 3H46O 4YDUA 1HLUA 3BP8A 4H0VB 5JLHA 1TUYA 4XH1A 4H5TA 3WUHA 1YXQA 3G25A 3GL1A 3C7NB 1JCFA 1ATNA 3DXMB 3FR0A 4B1ZA 3EL2A 3H3NO 4K43A 1T44A 4L3QA 3HSCA 5AR0A 5AQGA 3LM9A 5BRHA 1XC3A 4FO0A 4JAXA 4B1VA 4CI6A 3ENOA 3ZETA 4B1XB 2P9UA 3MK6A 3WQUA 4I6MA 3WXJA 1ESVA 2P9KA 4FOIA 1YUWA 1GLDG 3QMLA 5KQ8A 5LJWA 4FPBA 3H6EA 4J8FA 3A5MC 4BRNA 1T6CA 2GWKA 3D2FA 4H0OA 5AQUA 3VPZA 4PKHA 2HOEA 3AARA 5E26A 1Z6RA 4CBXA 4ISFA 3RSEB 4FWLA 1NM1A 1T6DA 4QS7A 3DWLA 2IIRA 3ULEB 2P9SA 3O4WA 1X3NA 1GLBG 2A6AA 3QFPA 3M1FA 3WXKA 2NLXA 3FZMA 2H3GX 2PAVA 2Q0RA 3WEEB 1NMDA 5F0XA 1QQOA 4JHDB 2P9LA 4M63C 3SK3A 1YVNA 2GEMA 2W40A 3BF3A 1E4FT 4XEIA 5F2RA 4FWMA 1IJJA 1QQNA 3AY9A 4YDUC 1MWMA 1NLVA 3HZ6A 4M7YA 4WQ4A 2F9TA 2P9IA 1BOTO 1NGDA 1XUPO 2P9PA 3IMXA 3A5OC 3QB0A 1TYQA 2ZGYA 3UB5A 2E2OA 5BRFA 3F9MA 3UE5A 4A2BA 4BRCA 5AZIB 2YCHA 3VERA 1HPMA 4K41A 1KAZA 1RDWX 4FWNA 2YHXA 3DXKB 3ATUA 5AQFA 3GG4A 4BC5A 2CH6A 1SAZA 3KHYA 4FWSA 3ZX2A 4CZMA 2E2NA 4BR0A 1LCUA 2QWNA 5AQJA 2BUPA 3O80A 2YJEA 1NGBA 4H5WA 4PL8A 3VGKA 4CZLA 3ID8A 1P8ZA 1NWKA 1NGEA 3FZHA 4H0XB 1D4XA 2E2PA 3CIPA 3L0QA 5ADXH 3M3ZA 2YHYA 1ZC6A 4BVOA 4EAHD 5F1XA 3MDQA 4Z94A 3L6QA 5AFUA 1BA0A 3CETA 3TPQA 3ZEUA 2QWLA 5BN8A 2P9NA 2CH5A 4C23A 1MWKA 3O1WA 3OHRA 3VF6A 4BC2A 5JICA 3CI5A 4CZFA 3VOVA 4BC3A 1IG8A 1C0GA 3IUCA 1DEJA 2QW9A 4CJ7A 1NGFA 3D2EA 3QICA 5LY3A 4Y0WA 3VGMA 4BRFA 4FWRA 3FZFA 4JD2A 3O08A 1K8KB 4BRAA 1BU6O 3EKUA 4MO5A 4XH4A 1U2VB 2HF3A 1MDUB 2OANA 5KPTA 3LDQA 4QS8A 1Y64A 5AQWA 1WOQA 5JLFA 1SZ2A 4CZHA 4H0TB 1GLLO 4K25A 3AAQA 1S3XA 4BR9A 3C7NA 5AQZA 4BRQA 2Q97A 3LDPA 2A42A 3CJ9A 5EX5A 2J4RA 3DXMA 4WQ5A 4BREA 5AQYA 3IFRA 2CGJA 1V4SA 3VESA 4BQZA 2NRHA 5AQPA 5EY4A 2D0OA 3QBWA 3M6GA 1OKJA 5AQOA 1MA9B 2VWBA 4FWQA 2HF4A 4H5NA 3ZX0A 2D0PA 5FPNA 4BRKA 3H1QA 4PKIA 1TUUA 2KHOA 1BDGA 4ISGA 3CJ1A 3LDNA 4GNIA 4IXCA 4NO7A 5AQHA 3C0BA 5B8HA 5AZJB 3RSEA 1R59O 4O5FA 3R8EA 1X9JA 3FE1A 3HI0A 3ULEA 5KPRA 5TKYA 3L4IA 4B1UB 1ZBSA 1Z05A 4CD1A 3WEEA 4EHTA 3FLCO 4JHDA 4DCHA 1GLFO 3VEVA 3LDOA 3MN5A 3VEZA 3AAPA 3O6WA 3A0IX 1QQMA 4DB3A 3HTVA 4FWPA 2IVOA 2FLOA 2WUSA 4H5VA 1KAYA 3BF1A 3VEYA 1DKGD 4H5RA 2ZF5O 4B9QA 2YI1A 4BRIA 2YHWA 3LL3A 3VF2A 3WXLA 2QWMA 3FGUA 2QM1A 1S22A 4CBUA 1H1VA 3ZX3A 1NBWA 1Q18A 3A8YA 3ATVA 5AZIA 3I33A 2A5XA 4XH5A 3U8XA 5BR9A 3VEOA 3HM8A 1KAXA 2A3ZA 3EKSA 2Q2RA 3DXKA 3O8MA 5KQDA 4O8KA 1ATSA 4HWIA 1V4TA 1BG3A 1ZXOA 3UKUB 2FF3B 5AQIA 4QS9A 2YJFA 2AA4A 4H0YB 1RGIA 5FPDA 4FWKA 4AM6A 4DHYA 3UKRB 5AQSA 3O1BA 4F9OA 3I8BA 1XQSC 3SLCA 3ENHA 4CBWA 3DAWA 5BREA 4BRHA 1G99A 3A5NC 2QWQA 3EN9A 3KVGA 5EVZA 5AFUH 1EQYA 3QFUA 1GLAG 3MN6A 3H45C 1C0FA 1E4GT 3CHWA 2FSKA 2V7ZA 2VCPA 4EFHA 4AM7A 2QWPA 2E8AA 4BRDA 2ASOA 1QZ6A 4JNEA 4WQ4C 5EXWA 4EHUA 2VYPA 5CE3A 2I7NA 4A62A 1QHAA 5AQXA 3LM2A 4RWTA 1SQKA 4BQLA 1GLJO 4IJNA 4FWOA 1QZ5A 2FF6A 3MN9A 3W3DA 1KXPA 2E1ZA 3D7EO 4IZ9A 4PKGA 2D4WA 4MO4A 4BR7A 4CZKA 3TU5A 1BO5O 5BPMA 5AQNA 5BN9A 5BRDA 3B8AX 3SMPA 4JN4A 2Q36A 4A61A 3U4LA 3CJ7A 3WXIA 4BVPA 2GUPA 5EOYA 4CD3A 2Q1NA 4BGBA 5KPZA 3KZBA 1NGIA 4B1WB 3ZETB 2P9UB 4CZIA 5AQQA 4I6MB 1HKBA 2P9KB 5FPMA 4RCHA 3SJHA 2ITMA 2DPNA 3S41A 1GLEG 2GELA 1ATRA 1U6ZA 1GLCG 2ZWHA 3D2FB 1HX1A 5AZJA 3LDLA 4IO8A 3JXUA 4MLEA 3U9ZA 4B1YB 2FXUA 2QXLA 2NZTA 1JCGA 4CZGA 5ELZA 2QWRA 4FPAA 3EZWA 5AQRA 5AQTA 2P9SB 3A5LC 2UYTA 4RTFD 3R9PA 3GDQA 1LOTB 2P9LB 2QWOA 3CERA 2V52B 4BR5A 2FSJA 4DQ8A 5AQLA 2V51B 4E1JA 3IDHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCQN 3VEWA 4YORA 1IKVA 1RFQA 3TSQA 2ZJPL 1HNIA 1BA1A 1CXUA 3MMVA 4KB1A 1I3AA 3CJCA 2GTDA 2D0CA 5M1KA 4KPYA 4PL7A 1VQ9N 3CJBA 3TI0A 4AHSA 5JMVA 3QIOA 1WSIA 1X3MA 2YNHA 1C0MA 4FOEA 3JS6A 1SL0A 1NGJA 5AQVA 2IDOA 4LC9B 3SYZA 3SMSA 1K8AO 2Z1IA 4CEOA 3TAMA 3RMAA 2V7YA 3AVKA 3MEGA 3DOKA 3N4QA 1SS6A 5ADXA 3EY1A 4BROA 1REVA 4FW1A 4IOXA 1YT3A 4DTRA 1J9AA 4OX9K 3I0RA 2NRWA 1YAGA 4RW9A 4CIGA 4CGGA 3OJSA 3DJCA 3P5JA 2EWSA 1KLMA 1BUPA 2XY6A 4LFCK 5BPNA 1IBKK 2I7PA 3VETA 5AQMA 2PZSA 4BWMA 1U4BA 3WT0A 1KSPA 4B9LA 3HBTA 4MDAA 3AVAA 3BEXA 3T1YK 3D2EB 2ASPA 2HMIA 3NVMA 1C1AA 2UUAK 4FL9A 4FLXA 1FKOA 5BPLA 5HRRA 3DLLL 3IRXA 2F9WA 2HHSA 5AQKA 3OYCA 3CJAA 4BRGA 3CD6N 4BR2A 3U6FA 4BR4A 2ZGZA 4E7KA 4A5BA 1HLUA 1EXQA 2ETJA 3V1RA 4H5TA 3G25A 2WTUA 3VN5A 4FJGA 1SL1A 1T44A 4BE0A 4DTJA 1S6QA 1BCOA 2X6NA 4B1VA 4CI6A 3KLHA 3ZETA 4CEDA 3VA0A 2X74A 2D5RA 1W0HA 1M1KO 3NCIA 4JLHA 1WAFA 4J8FA 4CEBA 4BRNA 2KTQA 3L2RA 2DFFA 4DV6K 4PKHA 2HOEA 2JWKA 3G0ZA 4ISFA 3SQ2A 4J2EA 4FWLA 1ZBHA 3O4QA 3AV9A 4CJUA 3O4WA 2A6AA 3QFPA 4O8UA 4KKOA 3AVMA 5FLXO 3QETA 2Q0RA 2VG5A 4ELUA 1QQOA 3OYGA 3J81O 4JI1K 3SV3A 1WSHA 2GEMA 4KH6A 3LWMA 4ELVA 4IO9L 5F2RA 4Z4IA 4Y1DA 4DF4A 3AY9A 1MWMA 2RHKA 2HW3A 1NLVA 3RRHA 4NCGA 2P9IA 1NGDA 5T7BA 3SQ0A 3E1YA 2P9PA 3IMXA 4UY8O 5H1SQ 3HO1A 5IT9O 2E2OA 5BRFA 4CVNE 3EE8A 3CFRA 3CYMA 3F9MA 3RMDA 3UE5A 4BRCA 4J2DA 4BE1A 1KAZA 1Q9XA 4FWNA 2CH6A 4HTUA 4GW6A 3LPTA 3HK2A 1RBUA 5C25A 2YJEA 4PL8A 4JKFA 3VGKA 4CZLA 2G8UA 4NYNA 3ID8A 1P8ZA 2QTDA 4M45A 2O4IA 3TWHA 4FM0A 1D4XA 5ADXH 3NDKA 4TSXA 3J7YP 1Q7YO 3KIOA 5KI6A 2YHYA 1HR0K 3SZ2A 4CJLA 2ZQBA 3TPQA 3ZEUA 3KJVA 2PY5A 1MWKA 3K5LA 1BISA 3O1WA 4BC2A 2F4VK 1C0TA 3ISNC 1WBDA 3NE6A 2P51A 3ZT1A 1DEJA 3O9TA 4CJ7A 3FZFA 4CJ4A 2X78A 3O08A 1P90A 4BRAA 5JVHL 4JK9A 4XH4A 3O3HA 4QCLA 2A1RA 4RW7A 4O55A 5AQWA 1X9WA 3AVCA 2R7YA 3HXMA 3G4SN 3QEPA 1HNWK 4BRQA 4C8OA 1G15A 3PX4A 1IKYA 1LWFA 1M90O 4WQ5A 3ZT0A 4CEEA 4LF5K 2QA4N 1V4SA 3BZKA 3VESA 4DTSA 4JRQA 4CEAA 5AQPA 4JKHA 2Z1JA 3QBWA 3M6GA 1U47A 3D45A 1VQLN 4FWQA 1XC9A 2D0PA 5J1EA 1NK9A 3VQCA 2AJQA 4PKIA 3NF9A 1TUUA 2E5LK 4OPJA 3QEWA 2KHOA 2DY4A 4ISGA 1EP4A 5B8HA 4AH9A 3CCUN 1X9JA 3KLFA 3FE1A 3TAFA 3KLIA 4W5NA 4LSLA 5TKYA 1VQ5N 3DLGA 5MLCQ 3PV8A 1QQCA 3OS0A 3AA3A 3FLCO 1NMNA 4DCHA 3NGIA 3O6WA 1VQKN 3CPEA 1VRTA 3J7AP 1QQMA 4WE1A 3HTVA 1D9DA 4CGJA 2IVOA 3T3FA 2WUSA 1VQ4N 2P5OA 3BF1A 1YTUA 3LAKA 3MECA 4CK3A 2BANA 1NK8A 4JKGB 2WONA 4DSEA 3C94A 3HVRA 3QLHA 3HT3A 3ULDA 3I33A 3U8XA 1XMOK 4M3UA 3KLGA 4CGHA 2A3ZA 3EKSA 4CFCA 3OJUA 3LALA 3N4PA 3P38A 2YNGA 4LFBK 4B3SK 4MQ3A 2O8FB 2F8SA 3NHGA 3ZT3A 1S72N 1T3VA 4QS9A 4H0YB 4AHTA 3CFPA 4F2SA 4AM6A 4DHYA 3CCRN 1ITGA 1VSIA 4B3RK 3T19A 4FJIA 1EETA 3DLHA 4F2RA 1G99A 3A5NC 1JL2A 2QWQA 3EN9A 3KVGA 5EVZA 4DFKA 2QI2A 1NJZA 2W6KA 4ILGB 1RILA 3THWA 3SUPA 2NUBA 4EFHA 1DLOA 2QWPA 4BRDA 4KHWA 5EXWA 4NCBA 1ZBLA 4A62A 4CJTA 3J80O 3LM2A 4CF0A 4BQLA 3OBWA 4OPKA 1XHZA 1VSLA 5KGXA 1Q8IA 1QZ5A 3JYTA 5M1FA 2FF6A 3ITHA 3MN9A 3NF6A 1KXPA 1O1WA 2RF2A 4CZKA 3L8BA 1BO5O 2QEXN 5AQNA 3EEQA 4OGCA 4X65K 3AO1A 3MX5A 5HBMA 1HNXK 4KH4A 5GIOA 1QSLA 4X64K 4HUEA 4W5RA 1TVRA 2DFHA 4KFBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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