3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
4FPBA 3DXKA 4BG8A 4H5WA 3S41A 4CZJA 2HF3A 1KAZA 2YJFA 3QFUA 2D4WA 3VEOA 3A5OC 3W3DA 4FWMA 5E84A 3G25A 1QQNA 1U2VB 4EHUA 4FOIA 5F1XA 4JD2A 3VF6A 1NGDA 2J4RA 4ISFA 3L4IA 3FFKB 5FPEA 1HUXA 3CJ9A 2YHYA 3M3ZA 3GE1A 1JCEA 2Q97A 4CZIA 2IVNA 2YJEA 3WUHA 1SZ2A 1EQYA 2FSNA 3O8MA 3LM9A 2FXUA 3FZLA 3FZHA 3VESA 2BUPA 3VF2A 4CD1A 5AQGA 3L0QA 3O5BA 1NBWA 3AY9A 1V4SA 4A2AA 1BDGA 3O1BA 5LJVA 4IO8A 1DGKN 4JHDB 4FL9A 4K42A 5AQTA 2QWMA 4BR5A 3DJCA 1DKGD 1ATNA 1MDUB 4JN4A 3BF1A 5BREA 2GWKA 4JD2B 1NGGA 1GLJO 3FZFA 2PAVA 3FR0A 4CZGA 2D1KA 4MLHA 3ZEUB 3FE1A 2QW9A 4K41A 1BU6O 1E4FT 4CZMA 1RGIA 5AQFA 5AQKA 3HI0A 3MK6A 4BVOA 1QHAA 4Z94A 1WOQA 2E8AA 4BRLA 2Q0RA 2GEMA 4JNEA 3A0IX 4CZKA 2VWBA 3ZETA 2H3GX 3D2EA 2QWQA 5BN8A 4CI6A 4BR9A 1KXPA 3VEWA 3DXKB 2GUPA 4PKGA 5AQNA 1RDWX 2P9LA 5KPZA 3UKRA 5AQHA 2V52B 3TU5A 2YHWA 2YI1A 1X9JA 4NB4A 4DQ8A 1ATRA 1KAYA 2E20A 5FPMA 3DXMA 4FWPA 4FWNA 1U6ZA 1LCUA 4YDUC 2KHOA 4BR7A 1QZ6A 4BG9A 3VENA 2VCPA 5EX5A 4BRFA 2Q2RA 4QS7A 1BA0A 4RCHA 4M7XA 3EKUA 4CZLA 1GLFO 2E2QA 1BG3A 2ZF5O 3U9DA 3VEZA 3CJBA 2CGKA 1HKBA 4LC9B 3QMLA 3DWLA 5F0XA 2E2PA 2EWSA 4I6MB 2OANA 5AQUA 3D2FA 4K25A 1Q18A 2NLXA 5KPTA 3IUCA 5AZIB 3F9MA 4FO0A 3HTVA 4BQZA 3O4WA 3ZX3A 4I6MA 4XEIA 3WQTA 1YUWA 3P4IA 2F9WA 1NGIA 3HBTA 4CD3A 4K43A 1U2VA 3ENOA 2YCHA 5AQRA 4H0OA 1GLBG 3J8AA 3WEEB 4CZHA 1GLLO 4YDUA 4FWRA 4BRHA 1X3MA 3SJHA 3VEYA 3VEVA 2CGLA 1BO5O 3VF4A 3MN6A 4IJAA 3MN9A 2WUSA 1C0GA 4A2BA 3QFPA 1ZXOA 2A42A 3CJ7A 2PBDA 4GY2B 1SAZA 4MO5A 4XH4A 3RSEB 5TKYA 1HKGA 3EKSA 3H46O 3MN5A 4H0YB 2QWLA 4DHYA 3EL2A 4MLEA 5AQIA 5KQDA 1T44A 4AM7A 2ASMA 1JCGA 1ESVA 3B8AX 3CETA 4BRMA 5AQJA 2VYPA 5BRHA 2IVOA 5FPNA 1HKCA 5BR9A 3BEXA 3WXJA 1DEJA 3H3NO 4C23A 4BRPA 2W41A 3AARA 3W0LA 3VGLA 3LM2A 4H0TB 3CQXA 5AQXA 4B1WB 2GELA 1S22A 4M63C 4RTFD 3M6GA 4HWIA 3O80A 1NGCA 2P9UA 3ZEUA 4BRCA 2A41A 1HX1A 3A5LC 2V7YA 3UE5A 5LY3A 4F9OA 5AQZA 3UKRB 4H0XB 3H1VX 2Q36A 1BA1A 2QWRA 1P8ZA 2CH5A 3CIPA 2A3ZA 4HTLA 4A61A 3CQYA 3U9ZA 3L6QA 4PL7A 3FZKA 3ENHA 3U8XA 3SLCA 1H1VA 1MA9B 5AQOA 2QWPA 4BRKA 5BRFA 3HZ6A 2P9IA 3D2EB 2HOEA 3HSCA 4A62A 1MWKA 2I7NA 1ZBSA 2ITMA 1V4TA 1ATSA 2GWJA 3EO3A 4CJ7A 5BPMA 3UB5A 1NGHA 4B1YB 4B9QA 3EN9A 5BRDA 4JHDA 3C0BA 1GLEG 1YAGA 1KAXA 3AAPA 5AQQA 4QS8A 1Z05A 1Z6RA 2Q31A 5E26A 1NGBA 4DCHA 3M1FA 2ZWHA 5JLFA 5AQPA 1T6CA 3VGKA 2ASOA 3JS6A 3JXUA 4BRQA 4BREA 3MN7A 5EVZA 3LDNA 1NLVA 5AFUH 1ZC6A 5B8HA 5ADXA 1QZ5A 5AQMA 3O6WA 4PKIA 3I33A 4BR2A 2E2OA 3GDQA 2P9NA 4FPAA 3ATVA 2IVPA 5AQLA 1WUAA 3MCPA 2ZGZA 4M7YA 3GG4A 4NO7A 3ZETB 5BN9A 2P9KB 3FLCO 1NGEA 3O08A 4EHTA 3VOVA 3EZWA 3OHRA 2QM1A 1RFQA 3FZMA 5LJWA 4B1UB 3KZBA 4FWSA 1Y64A 2FLOA 4H03B 2P9PB 3QB0A 5KPRA 3A5MC 3MDQA 4BQLA 3A8YA 4BGAA 1BUPA 2P9SB 3LDOA 3BP8A 4BR0A 4BRNA 2ASPA 3TPQA 1T6DA 2CH6A 1QQOA 3R6MA 5AR0A 1BOTO 4H5RA 2FSJA 4XH5A 3UKUB 2UYTA 4FWLA 4CBXA 4Y0WA 4CBWA 4O5FA 2NRHA 2P9IB 1QQMA 3WXKA 3GL1A 1X3NA 3LL3A 4RWTA 1NM1A 3WXIA 3C7NA 4BC2A 4BRGA 2NZTA 4AM6A 4ISEA 2ZGYA 3SMPA 1TYQA 3LDPA 4BRDA 3ULEB 4IZ9A 3H45C 3VETA 4QS9A 5JMVA 1HLUA 2P9SA 1C0FA 2BTFA 4E1JA 3GBTA 1NMDA 2E1YA 3BF3A 5BPNA 2Q0UA 2P9UB 4JAXA 5EXWA 2A40A 3IFRA 4FWKA 5AQVA 4H5NA 3CJ1A 2Q1NA 4H0PA 4DB3A 2GTDA 5AQWA 1R59O 3DXMB 3SK3A 5EOYA 1LOTB 2QWOA 4BVPA 1S3XA 4FSVA 1K8KA 1HPMA 2HF4A 2AP1A 4WQ4A 2A5XA 1J6ZA 2E88A 1D4XA 3CI5A 3ZX2A 4IWVA 3LDQA 5AZJA 2P9KA 3KHYA 3WEEA 4EAHD 4ISGA 3QICA 2FF3B 4PKHA 4WQ4C 3VEXA 3D7EO 5EY4A 4BC5A 3VGMA 1TUUA 4B1VA 2D0PA 5AZIA 4WYBA 2P9NB 3CJCA 3I8BA 2AA4A 3QDKA 2D0OA 4B1ZA 1GLAG 3SMSA 3LDLA 3VPZA 2QXLA 2V7ZA 1K8KB 4IJNA 2I7PA 4XH1A 5F2RA 1GLDG 3ATUA 4CZFA 4FWOA 3UKUA 4BRIA 3QBXA 2W40A 1NGAA 2IIRA 3IMXA 4J8FA 4BC4A 4WQ5C 5AQSA 1E4GT 1IG8A 2V51B 1SQKA 3C7NB 3HM8A 4H5TA 2P9LB 3VERA 1G99A 3H3OB 1GLCG 1HJOA 4KBOA 3WQUA 1CZAN 3ID8A 3ULEA 3IDHA 1XQSC 4O8KA 3O1WA 3R8EA 3WT0A 3KVGA 1JCFA 2E1ZA 5BPLA 1XC3A 3DAWA 4B1XB 4MO4A 2YHXA 5AQYA 4FOEA 4BC3A 5JICA 5FPDA 1IJJA 2FF6A 3A5NC 4EFHA 1OKJA 3FGUA 4BR4A 4IXCA 4H0VB 2CGJA 1TYQB 3RSEA 4BRAA 4CBUA 4L3QA 1YVNA 5I9EB 4CZEA 5KQ8A 2F9TA 3CERA 5ELZA 4WQ5A 3R9PA 3GOIA 2HMPA 4GNIA 4BGBA 1BWFO 2P9PA 3ZX0A 1NWKA 2DPNA 4PL8A 1XUPO 4FWQA 1NGFA 2E2NA 3QBWA 3H6EA 5JLHA 4H5VA 5CE3A 3WXLA 5ADXH 5AFUA 3CHWA 3U4LA 3BUZB 1YXQA 1TUYA 1NGJA 2FSKA 3AAQA 3H1QA 4EIAA 4BROA 3MMVA 2QWNA 3D2FB 1MWMA 3CJAA 5AZJB 2A6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FPBA 4KB0A 4ZTJA 3S41A 4LH4A 4CZJA 3HYFA 1KAZA 2YJFA 3QFUA 3W3DA 4FWMA 3WNEA 4FJ5A 2O8EA 4Q5VA 4IFYA 1QQNA 4EHUA 3LP1A 4KHYA 5C2FA 4JD2A 3VF6A 3PX4A 1TAUA 1GOBA 4E0DA 1NGDA 3CC2N 3O4QA 3CCSN 2BH1A 3L4IA 5FPEA 4OVLA 2YHYA 2Q97A 1TK8A 1HR0K 2YJEA 3WUHA 2P5GA 2FSNA 4YOYA 3VESA 3NBPA 4CD1A 1T03A 5AQGA 3L0QA 3O5BA 4A2AA 3O1BA 3NVKA 4FL9A 1NK5A 2F4VK 1DKGD 1MDUB 4HUEA 5KRTA 1VQNN 5BREA 5HROA 1NGGA 4CGJA 4LFBK 4E1NA 2HSTA 1BCMA 4UY8O 3VQBA 4DR4K 3U6FA 4CGFA 3QO9A 4CZMA 5AQKA 2UU9K 4CEQA 3QEVA 1IKWA 1RT7A 1QHAA 3OY9A 1HPZA 5M1OA 3RWUA 2GX9A 1CZ9A 2Z1GA 1WOQA 2KZMA 4M41A 4CZKA 2O8CB 3ZETA 4AHCA 3QETA 2QWQA 5BN8A 4W5TA 4CI6A 3KK3A 1E3MA 3VEWA 4DSFA 1VQKN 2X6SA 4GVEA 4FJIA 3V1QA 2E20A 3MCAB 4GV9A 1HYVA 2VG6A 4B3OA 2QKKA 4M42A 3CXCM 1U6ZA 1QS4A 3KK1A 1TK0A 1BI4A 2KHOA 1SS6A 1FJGK 3V4IA 4BG9A 3OVNA 4EP5A 2O8EB 3TAEA 4RCHA 3EKUA 4CZLA 1GLFO 3U9DA 3V1OA 4LC9B 2CGKA 1HKBA 4E1MA 3DWLA 4OPHA 4GKKK 3L2RA 1JJ2M 2EWSA 4I6MB 5AQUA 1Q18A 3IUCA 5E41A 3U3YA 1U04A 3HTVA 5LMNK 1ITGA 3DRRA 1OH6A 1KVCA 3ZX3A 4I6MA 3WQTA 1YUWA 3DOKA 4CD3A 1EETA 1SUQA 4FK2A 3MX2A 4H0OA 1GLBG 4YORA 2YX6A 3VEYA 4Y1CA 2YNFA 4B3RK 3CFRA 2WUSA 3VQDA 2A42A 3D45A 3CJ7A 4DQQA 1YTAA 3HPHA 1U4BA 2VG7A 3HOTA 3HRGA 4CJ3A 3MX5A 1SAZA 4WE1A 4XH4A 4BE2A 1QTMA 3ZSRA 3DLBA 3R3LA 4LF7K 1C1CA 1NK6A 3SBGA 2HBJA 3K2PA 2FBXA 3AVCA 1N32K 5I42A 3RMCA 3EEQA 2QWLA 1DT9A 4DHYA 3CC4N 3ULDA 3EL2A 1T44A 1U48A 1ESVA 3CETA 3TR8A 2Q3SA 1I94K 4M3UA 4DR6K 3BEXA 2ZJQL 1X9MA 2G8VA 1NKEA 2YV0X 4C23A 2W41A 3AARA 3QIPA 2UXDK 1RTDA 4RTFD 1RT1A 2ZJRL 1C0MA 3CPEA 1KQSM 1HNIA 4OGEA 1NK4A 3WNHA 3ZSXA 3RR7A 3O9UA 4HUGA 2GBZA 4NLBA 2V7YA 3UE5A 2ZD1A 4DSIA 5LY3A 5AQZA 1TKTA 3H1VX 1BA1A 4LF4K 1P8ZA 3LWLA 1GOCA 4A59A 4NCGA 1RDAA 4JK8A 3U8XA 4BRKA 3OYAA 5JS1A 1VQ9N 1ZBSA 4AHSA 1RTHA 1V4TA 1RBRA 4DU1A 4FJKA 3V6DA 1XNQK 2NRRA 3NFAA 3ZSVA 1OH8A 3UB5A 4B1YB 4KHNA 3C0BA 4Z4HA 4HCBA 2OCEA 4YNQA 3TAMA 2VQFK 4DFJA 1TKZA 4DCHA 1CXUA 3UIQA 1JLFA 2ZWHA 3EE9A 3ENBA 1T6CA 1TK5A 3KJVA 3JXUA 3DOLA 3JYTA 4BREA 4J2EA 1VSLA 4NXMK 1C0UA 5B8HA 5ADXA 3O3HA 3KD5E 4PKIA 3ZSQA 4FPAA 3AGRA 3KD1E 1IG9A 2HMIA 5M1QA 4LF8K 3GG4A 3FLCO 1U45A 3OBWA 4CF2A 4O4GA 3VOVA 5CZ2A 4CGIA 1XI1A 2QM1A 3FZMA 5LJWA 4BDPA 4B1UB 3I8DA 2XRIA 4CJKA 3NDKA 3SUQA 4BQLA 1MU2A 4FLVA 2BDPA 3BP8A 1L3UA 4BR0A 4H8KA 4OKJA 3R6MA 1BOTO 2HHWA 1YT3A 1Q81O 4OO1J 1A5XA 4AILC 1J9AA 3AVMA 4Y0WA 3MAQA 3SUNA 1QQMA 3WXKA 1ZBFA 1BIUA 1RBVA 1X3NA 3OTOK 3LL3A 3WXIA 4BC2A 3U3GA 3ZT3A 4AM6A 2YHAA 4CGDA 3TARA 3LDPA 3TTFA 4X62K 2Z1HA 4GV6A 1VSEA 3AGKA 4DLEA 1UOCA 2BTFA 1M1KO 2P9UB 4JKFA 1L3SA 1LWCA 1TAQA 5AQVA 1JXEA 1JKHA 2GTDA 3ZCMA 4CJUA 2OPPA 5GIPA 2QWOA 2KLAA 2O4GA 4IG0A 1HPMA 1ZBIA 3OS2A 1J6ZA 3S3MA 1D4XA 4FJJA 3ZX2A 3O9RA 4CF1A 5DM7L 4OLBA 3DLKA 1W0HA 2P9KA 3CFPA 3KHYA 3L8BA 5J2NA 1B92A 4HCCA 3D7EO 5SWMA 2HHQA 1TUUA 4B1VA 2D0PA 4CHPA 3MXMA 4WYBA 3I8BA 2AA4A 3I0SA 3LAKA 3HK2A 4DFKA 4FLYA 3IS9A 3ID6A 1SKSA 2IOCA 1R0AA 3O9SA 2ITGA 3UKUA 2P1JA 4ELUA 3RMDA 4DU4A 3MWTA 1XMQK 1FK9A 3LPUA 4J8FA 1UA1A 3P1GA 3K57A 1A5VA 4JI7K 4B9SA 3C7NB 5GAEP 4LD0A 1BQNA 3RVCA 4DR1K 3ISNC 2E5LK 5IWAK 3IDHA 4DFPA 3R8EA 3CCVN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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