3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule tags Transferase
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
1BA0A 3U9DA 4BROA 2FSNA 2OANA 3KVGA 4H0PA 1DGKN 3QBWA 3MDQA 2NLXA 2IVNA 3VERA 3KHYA 3FZLA 5AR0A 4L3QA 4BRPA 2V52B 5AQSA 3DAWA 3QBXA 3LM2A 2BTFA 4WYBA 4BREA 4CZKA 3MN6A 3CERA 3D2EB 5KPZA 1J6ZA 3FZFA 5EVZA 1CZAN 2ASPA 2P9IB 1S3XA 3L0QA 4H5RA 3C7NB 3H3OB 1RFQA 1V4SA 3R9PA 4PL8A 3IUCA 2Q31A 4BVPA 4PL7A 5EY4A 1MWMA 3MCPA 2HOEA 1X9JA 1Q18A 2CGJA 2CGLA 4FWOA 5AQGA 3IMXA 1NGGA 3CJ7A 4FWPA 4BRHA 2QXLA 3MK6A 4NB4A 5BPMA 5LJWA 4DQ8A 3FZKA 1K8KB 1NBWA 2QWLA 2ASMA 3SMSA 4Z94A 1R59O 4BRLA 4BQLA 5KQ8A 4HTLA 2QW9A 4BGBA 3WXIA 4BRCA 2FXUA 4JD2B 4IJNA 4K25A 2P9NA 4AM6A 4E1JA 2QWRA 2ZGZA 5AQMA 2HF3A 3L6QA 2P9PA 1ATNA 2QWPA 2D1KA 1EQYA 5AQXA 1C0GA 1YVNA 1YUWA 1ATRA 2P9SA 3FGUA 3HBTA 4B1XB 2ASOA 2GUPA 4A2AA 5JLFA 2A6AA 3CJBA 4EHTA 3H3NO 5BRFA 4H0YB 2E1ZA 2IVPA 4FL9A 3QFPA 1Z05A 1ZXOA 3BF1A 1TYQB 5AQVA 4CZIA 1GLBG 2A5XA 5AZJA 3DJCA 5FPMA 5FPDA 5AQWA 4GNIA 1T44A 4BR5A 4BRIA 3AARA 3VEOA 3QDKA 3FLCO 5AQFA 2YHXA 5AQUA 2YHWA 1XC3A 5BRHA 3D2FB 5KQDA 3JXUA 1NGJA 4CZEA 5ADXH 1U6ZA 5AQZA 3ATUA 4RCHA 2E88A 2CGKA 3CIPA 3EN9A 5JICA 4H5WA 5LY3A 4H5VA 3LDOA 3FR0A 1JCGA 2A40A 3AY9A 3VENA 4B1YB 1XQSC 1YXQA 5E26A 4FWNA 1HKBA 2V51B 1NWKA 3M3ZA 3ZX3A 1X3MA 4Y0WA 1IG8A 1D4XA 3UKUB 2WUSA 3VEZA 2P9KA 4I6MB 4WQ5A 3M1FA 1V4TA 4IO8A 3BF3A 3H45C 4JAXA 1T6CA 4DHYA 4XH1A 4YDUC 3U8XA 2FF3B 3TU5A 1X3NA 2Q36A 2E20A 3H1QA 3B8AX 3GOIA 4BG8A 1Z6RA 3A8YA 4QS8A 1SQKA 1NGHA 5AZIB 3ZEUA 5EX5A 2FSKA 4CD1A 3FE1A 4BR9A 2E2NA 2GWJA 3HTVA 1GLJO 3JS6A 3VGKA 1LOTB 2QWMA 2CH5A 2PAVA 3MN7A 2F9WA 3WXKA 3DXMA 3HZ6A 5EOYA 4MLEA 2AA4A 4MO5A 4CZGA 1QQMA 3DXKB 5KPRA 1Y64A 4BVOA 4WQ4A 3QFUA 3O5BA 5F0XA 5AFUA 2HMPA 1U2VB 2A41A 1NM1A 3SK3A 1TUUA 1WUAA 1BWFO 1GLLO 4B1UB 4CI6A 1TUYA 3LM9A 5JMVA 2E2OA 4QS9A 3CJ1A 4H5TA 4A61A 1KXPA 5JLHA 3O1BA 5AQPA 3FZMA 1HJOA 3MN5A 2F9TA 4BRAA 1QZ5A 1ESVA 3I8BA 4H0VB 1T6DA 1BUPA 4B1ZA 3CETA 3EZWA 3GL1A 1GLDG 4BR7A 2KHOA 3BP8A 3VESA 4BC5A 3VPZA 2GTDA 4BG9A 2IIRA 4DB3A 4B9QA 3J8AA 4A62A 2VYPA 3WQUA 1BOTO 4EAHD 2P9LA 2ZWHA 2VCPA 4H03B 1JCEA 1H1VA 4FOEA 3O6WA 1S22A 2UYTA 4BRFA 3G25A 2I7NA 4HWIA 2QM1A 4BRDA 4GY2B 2Q0UA 4K43A 2P9UA 4CD3A 3HM8A 2CH6A 2GEMA 4M7XA 3OHRA 5AQLA 1ATSA 3HSCA 4XEIA 2V7YA 2GELA 3U4LA 4NO7A 3UKRB 2D4WA 5AQHA 5F1XA 3WUHA 2Q2RA 4C23A 2P9NB 3RSEA 3ATVA 4JNEA 2P9PB 1NGBA 3EO3A 3I33A 1BA1A 2P9SB 1NGIA 4M7YA 5BRDA 5AQKA 3S41A 4IZ9A 1DEJA 3O80A 3L4IA 4JHDA 4MO4A 3H1VX 3VEWA 1SAZA 4CBWA 3D7EO 1DKGD 5FPNA 3WXJA 1NGCA 2E2PA 3W3DA 1QQNA 4F9OA 4BC4A 3GDQA 4XH5A 5BPNA 4AM7A 1GLEG 5EXWA 3WXLA 4PKGA 2YI1A 4BRKA 5CE3A 4CBXA 1HX1A 1C0FA 4PKHA 1HUXA 3F9MA 5BPLA 4FO0A 5B8HA 4PKIA 5BREA 2GWKA 2AP1A 3H46O 2A3ZA 3U9ZA 5AQYA 3AAPA 3EKUA 3WQTA 1LCUA 3VEVA 1IJJA 3ZETA 3P4IA 3VGMA 5LJVA 1BDGA 2NRHA 5AFUH 1GLAG 3A5NC 2FLOA 4IJAA 3UB5A 1P8ZA 1RDWX 2QWQA 2YJEA 4BR2A 3WEEB 5AZIA 4EFHA 5BN8A 2W41A 2V7ZA 3HI0A 3CJAA 1KAXA 3QICA 4O8KA 3CI5A 1E4GT 2YJFA 3CQXA 1SZ2A 3C0BA 4H0OA 1BO5O 2PBDA 1MA9B 4BC2A 3D2EA 1WOQA 2E8AA 3EKSA 1HKCA 1KAYA 2P9KB 4RWTA 2P9IA 3TPQA 3VEXA 4FWQA 4H0TB 3C7NA 1QHAA 2IVOA 5AQQA 4M63C 2H3GX 3VEYA 3O4WA 3DWLA 3MN9A 5AQOA 3CJCA 4CZFA 4FWMA 3GE1A 4MLHA 5BN9A 1NLVA 4FPBA 1OKJA 3WT0A 4KBOA 4B1WB 3CQYA 3MMVA 1NGAA 5AQTA 3A5MC 3VF6A 3ZEUB 3A5OC 3H6EA 1NGFA 4ISEA 4FWKA 3LDNA 1K8KA 3IDHA 4B1VA 1XUPO 2FSJA 3KZBA 2YHYA 4K42A 3DXMB 3QMLA 3VGLA 3ENHA 4FWSA 3ZX0A 2A42A 3O8MA 4JD2A 3SJHA 3CJ9A 1QZ6A 2ZGYA 4ISGA 3LDQA 4O5FA 3SLCA 1BG3A 2FF6A 3GG4A 4LC9B 3ULEA 4FWLA 4A2BA 4FPAA 3LL3A 3O1WA 3GBTA 5KPTA 3UE5A 4YDUA 4BRMA 3VF4A 4H5NA 4WQ5C 5AQIA 2NZTA 4ISFA 2W40A 1HPMA 4XH4A 1TYQA 1MDUB 3UKRA 1NGEA 2E2QA 4CJ7A 2D0PA 2EWSA 3A0IX 3BUZB 3EL2A 2VWBA 2P9LB 3BEXA 4BGAA 2DPNA 3LDPA 5ELZA 1G99A 1E4FT 2J4RA 5TKYA 3ZX2A 4CBUA 3A5LC 4CZJA 3ENOA 3D2FA 3O08A 2BUPA 1BU6O 2YCHA 4BRNA 2P9UB 5I9EB 4FWRA 4BRGA 3R8EA 5FPEA 5BR9A 4WQ4C 1RGIA 1HKGA 5AZJB 5AQNA 2E1YA 5AQJA 1MWKA 4BC3A 4K41A 3UKUA 3ID8A 5F2RA 2QWOA 5E84A 4I6MA 4DCHA 2QWNA 4CZHA 3RSEB 1JCFA 4RTFD 2D0OA 2ZF5O 4FOIA 4CZLA 3SMPA 2ITMA 4FSVA 3ULEB 4JHDB 3WEEA 4QS7A 3LDLA 1NMDA 3QB0A 3IFRA 1GLFO 4BRQA 4CZMA 4BR0A 3AAQA 4IWVA 1GLCG 1ZBSA 4IXCA 2Q0RA 4EIAA 1HLUA 3FZHA 4EHUA 4BR4A 1KAZA 5AQRA 1YAGA 3R6MA 3VOVA 4J8FA 3M6GA 3FFKB 3CHWA 2HF4A 2Q1NA 3VF2A 3W0LA 1ZC6A 2I7PA 1QQOA 3DXKA 4H0XB 3VETA 4BQZA 5ADXA 3ZETB 1U2VA 4JN4A 2Q97A 1NGDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRPA 4BROA 2FSNA 4QOZB 2OANA 3G0ZA 3CC4N 4FLXA 3QEVA 3F9KA 3QBWA 2IVNA 1S9EA 3KHYA 4KH5A 3J7ZO 1OH6A 4L3QA 5AQSA 3QBXA 3AVIA 4BREA 4BE2A 4IO9L 1VQON 3CERA 3D2EB 1C6VA 2QI2A 5KPZA 3NVKA 1J6ZA 1IKVA 3CFOA 4FVMA 2P9IB 3H3OB 4GV3A 3NDKA 2FBTA 4JK9A 1V4SA 4OVLA 4J2DA 1IO2A 4BVPA 5C2FA 3OY9A 4RW6A 3OS1A 4FJIA 4O44A 4CF2A 4AH9A 3LPUA 3THWB 5GAGP 2QXLA 5BPMA 4DSIA 4DQ8A 1K8KB 2VG5A 3EE8A 3IRXA 4YORA 1L5UA 2YNFA 4DG1A 4CJRA 4I9LA 2GUIA 1NOZA 4BRCA 2FXUA 3O9SA 1U45A 3L2VA 2IC3A 1S5JA 1JLEA 3KK1A 1QSYA 4FJ5A 2HHWA 2D1KA 3BDPA 1YVNA 2P9SA 2HHHK 5FDLA 5GINA 3L2WA 5JLFA 2G8FA 4IFVA 4KHYA 2E1ZA 2IVPA 5BR8K 3HP6A 1RTDA 5AQVA 1IBLK 4CZIA 5FPMA 2O8EA 5AQWA 3AARA 3AV9A 3VEOA 3PY8A 4HUFA 1TK0A 1SKWA 4C1NK 2OPRA 4KHPK 5BRHA 1NGJA 4CJVA 4F3OA 3BGRA 3CMAN 4JI5K 2HMIA 3IKMA 1RBSA 1U6ZA 3ISNC 2CGKA 4DQRA 4OGEA 4E89A 4H5WA 5LY3A 4H5VA 1HQEA 2A40A 2YKNA 3VQ6A 1Q86O 1XC9A 3AA5X 1VHXA 3HP9A 5FROA 3M3ZA 4MDAA 3ZX3A 2W42A 4KAZA 4IG3A 3HPOA 1TL3A 5J2QA 5IT9O 2P9KA 4CHPA 4FJLA 4DUYK 4JAXA 3V1OA 4I7FA 4YDUC 5C24A 2KW4A 3HT3A 4Z4IA 4CJQA 3B8AX 3GOIA 3ZEUA 5MLCQ 1NJXA 1VQLN 1GLJO 3JS6A 4DTOA 4CJSA 4DV5K 3NF8A 4FK4A 5EOYA 5KGXA 4MLEA 4CZGA 4LSLA 4WQ4A 4KHWA 3O5BA 5F0XA 5AFUA 2HMPA 3O9QA 1U2VB 2HB5A 2A41A 1BWFO 1GLLO 1I3AA 4FLWA 4QS9A 4A61A 1KXPA 1HJOA 1ESVA 2PZSA 4FLUA 4LY7A 3ZSRA 4M3YA 3EZWA 3CCVN 3TR8A 1HPZA 1S1UA 3OBYA 2JGUA 4U7BA 2UXCK 3CM6A 4R5PA 3ZSYA 4CF8A 4N41A 4BG9A 1W9HA 4FLZA 2D0BA 4DB3A 3CCSN 1WSJA 3NVMA 4A62A 2KQ2A 5M1FA 3WQUA 4IKFA 1BOTO 4EAHD 2ZWHA 3KIOA 4FJMA 2G8HA 5CYMA 1JXBA 3DLLL 2FC0A 3PSIA 4HUGA 4YY3K 1WSEA 1Z25A 1VQ7N 1D5AA 4K43A 1IG9A 2P9UA 2W6LA 4Z4CA 1NK9A 3HM8A 3MEEA 4W5NA 3D45A 4KTWA 4DTJA 3TABA 4E7KA 4JEPA 4XEIA 4YOWA 4AQYK 1YHQN 4Q5VA 3OVNA 4B3RK 5AQHA 2E6MA 2Q2RA 3K5OA 4CEAA 2P9NB 3M8RA 3OS0A 4PA1A 1OVQA 3U6FA 3ATVA 4JNEA 2PY5A 3I33A 1BA1A 5M1OA 1WLJA 5AQKA 3S41A 2XY5A 2NRXA 1DEJA 3O80A 3NGYA 1HYVA 1HYZA 1RNHA 1VQMN 2OTJN 1ZBHA 4F9OA 2O4GA 4V19S 5K14A 4J2BA 5CZ1A 3GDQA 1SL2A 2YI1A 4M3WA 3CFPA 1HNXK 1BQMA 1HJRA 5HRRA 3OYKA 3QO9A 4FO0A 2RKIA 2GWKA 2AP1A 2A3ZA 3AAPA 2YX6A 1QVGM 3VEVA 4DF8A 3DLEA 5I42A 1Q82O 3P4IA 1REVA 2O8DA 5KRTA 3M8PA 5AFUH 4CCHA 4JKGB 5FLXO 4CHZA 2QWQA 5DM6L 3WEEB 5AZIA 3EY1A 4HTUA 1QSLA 2UXBK 3TARA 3QICA 4O8KA 3CI5A 2OPQA 3SQ4A 1YTUA 4H0OA 4CGDA 2KZZA 1RT5A 5M1NA 4C8NA 4FK0A 3QEIA 3NF9A 4H0TB 4DMNA 5AQQA 1M90O 4LF6K 4M63C 3O4WA 3EEQA 3VTIA 3OA9A 1JL2A 1OKJA 5M1PA 3K57A 3AVHA 3KD1E 4FJXA 1WB9A 3H6EA 2QXFA 1NNEA 2HVIA 4X64K 4FWKA 3IDHA 4B1VA 4ID5A 4LFCK 3SI6A 3DXMB 4WFBL 5JVGL 3QMLA 3QNNA 3CC2N 1EX4A 3AA3A 3WNFA 2YHBA 4CEZA 4IG0A 3OYNA 1XMOK 4A5AA 2A42A 4E7HA 3O8MA 3QEPA 4JD2A 1RTJA 3PIOL 4B3OA 1VSDA 3U3YA 4B3MK 2P1JA 3LDQA 4ISGA 1B92A 3SLCA 3QETA 2UXDK 3GG4A 3ULEA 4FWLA 4A2BA 4E7LA 3THXA 3GBTA 4GVMA 5KPTA 4DR6K 4Z4EA 1RBVA 4W5RA 2A1RA 4YDUA 1RBTA 5CHIA 1TYQA 3PX6A 3KLEA 1NGEA 3C95A 3BUZB 2Z1JA 4JV5K 1TL1A 1SS6A 5HL7L 4M3RA 2DPNA 2OPSA 1QSSA 4B08A 4H4MA 1KLNA 2VG7A 1KD1O 3LP1A 2J4RA 1EWRA 1NJYA 3T1YK 3A5LC 1VSJA 4A5BA 3NGIA 4A57A 3G4SN 1HNWK 3OJSA 4GV6A 4CEOA 3BZKA 4X66K 1CZ9A 2IOCA 1YF5L 4OPHA 2KLAA 3F5TA 3NGZA 4I2QA 4RW9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5I9E B;  1TKT A;  1RDB A;  3CCQ N;  3TSU A;  3CCJ N;  4IFE A;  3R8E A;  5LMN K;  3AGK A;  4WQ4 C;  4KB1 A;  4ILJ A;  1S1V A;  4JS5 A;  1OH8 A;  1JLC A;  3HM9 A;  2NUB A;  3CCE N;  4KI4 A;  4CGJ A;  4E7I A;  2E1Y A;  5AQJ A;  4CGI A;  3CCM N;  1JLG A;  1W0H A;  3MWT A;  5CY4 A;  5E84 A;  4IOX A;  3K5M A;  2OCE A;  1G15 A;  4KPY A;  3SPY A;  3TTF A;  3V9Z A;  3ZYY X;  4FOI A;  1P90 A;  3SMP A;  2BGG A;  4CFC A;  4B8A B;  3LWM A;  3NMU A;  3E9P A;  4DSE A;  1W2B M;  3LDL A;  4TSX A;  3QB0 A;  4C8O A;  3SZ2 A;  1I94 K;  4FLV A;  4IWV A;  2OZM A;  3HJF A;  3PLA A;  4AHS A;  4IXC A;  1CZB A;  3CQ8 A;  2OPP A;  3AO3 A;  3AVC A;  4CEC A;  4DF4 A;  4DU4 A;  3M6G A;  4BWJ A;  2HNZ A;  5KI6 A;  4PWD A;  3FFK B;  3I0S A;  2HF4 A;  3VF2 A;  3VMF B;  2KTQ A;  3N4P A;  2HST A;  2B6A A;  1FKO A;  4F2R A;  3ZET B;  3ZT2 A;  1VSM A;  1YTA A;  3PUF A;  3RMA A;  3QLH A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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