4B1VA

Structure of the phactr1 rpel-n domain bound to g-actin
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
370
structure length
352
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRSYVGDEAQSLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
total genus 133
structure length 352
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1vA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1vA03
2V52B 3HI0A 3F9MA 4BR0A 5KPZA 5BREA 4FWMA 3DXMA 4MO4A 3D2EA 2ZGYA 3WXKA 4CZGA 3HM8A 5AQFA 4BRPA 3WXJA 2GUPA 2Q36A 1HKGA 1QZ6A 3M3ZA 2ZF5O 5E26A 3MN9A 3AARA 5AFUH 3QFUA 4BG8A 3FFKB 5BPNA 3FZMA 3UKRB 2V7YA 4H0PA 5AQGA 3WXLA 4CI6A 3QICA 3ENHA 4WYBA 1ATNA 1BUPA 4K42A 4BR2A 1WUAA 3D2FB 2ASOA 5BRFA 1RFQA 3H45C 4BRNA 4K41A 1S22A 3SMPA 5E84A 2HOEA 5AQSA 3UB5A 3O6WA 1KAYA 4WQ4A 4H0VB 2V7ZA 2GWKA 5I9EB 2CGJA 3VF6A 5JMVA 2OANA 4BRCA 4B1XB 2ZWHA 1TYQB 4IXCA 2FXUA 4FL9A 4BRFA 2PAVA 1ZXOA 3ATUA 3VESA 2ITMA 1KAXA 2I7NA 2P9PB 3EKUA 4FO0A 4WQ4C 3ENOA 3FZLA 5EXWA 4XH5A 5AQQA 3LDOA 2CGKA 3H3OB 4BQLA 1TYQA 2FF3B 4XH1A 4CJ7A 2Q97A 3HTVA 5F1XA 3O4WA 1MWKA 5AR0A 3EKSA 2HMPA 2W40A 1KXPA 1QQMA 3HZ6A 4XH4A 3RSEB 1ZC6A 2CH6A 1GLJO 3ZETB 5AQHA 1ESVA 2Q31A 2E1ZA 5BRDA 3UE5A 2AP1A 2HF4A 3VEOA 4BC4A 2A3ZA 1JCGA 3U9DA 5FPMA 3VF2A 3O08A 5FPNA 2QWRA 4H5NA 2P9UB 3BP8A 3BF3A 3VEXA 2P9KB 1NGAA 4PKHA 2YJEA 3ZETA 2W41A 5AQOA 5AQKA 4CD1A 3CJAA 4PL8A 3WEEA 4K43A 5B8HA 3KZBA 4H5WA 4HTLA 4BR5A 3CQYA 4EFHA 2D0PA 2P9UA 4JD2B 2A6AA 2P9KA 3VGKA 3R6MA 5LJVA 2E8AA 1Z6RA 4BRIA 4A2AA 3GL1A 1GLAG 4O5FA 4K25A 5AQLA 2E2OA 3SK3A 2QWPA 3A8YA 3VF4A 3ULEB 4LC9B 2CH5A 2YCHA 3G25A 5F2RA 2VCPA 1LOTB 5EY4A 4JD2A 1BOTO 3C0BA 3C7NB 3A5MC 3CQXA 3EN9A 1E4GT 4BGBA 4CBWA 5BPMA 3IMXA 5AQIA 3ZEUA 4CBXA 5CE3A 3DXMB 3BUZB 3SLCA 3FR0A 4JAXA 5LY3A 3S41A 3ZX0A 5AQRA 3ULEA 4DB3A 3VGMA 1C0FA 1YUWA 1HKCA 3C7NA 1Y64A 1HLUA 4ISFA 5FPDA 1QQOA 3CETA 1HPMA 2QWNA 3FZKA 3H3NO 2IVNA 1BG3A 4RWTA 4BR7A 2NRHA 2BTFA 1YAGA 2QW9A 3QDKA 3HSCA 1NGJA 5AQTA 3JXUA 2EWSA 3MMVA 2QXLA 2P9IB 3CJBA 4FWKA 4BC2A 4BRHA 4BVOA 4B9QA 1T44A 2ASMA 4Y0WA 1NGCA 4BC3A 1GLDG 4FSVA 3LL3A 4BR9A 5ADXA 4FWQA 4CZMA 1QQNA 5AQZA 1NGBA 4RCHA 2ASPA 1YVNA 3VERA 1JCFA 5TKYA 2P9IA 2P9NB 4PKIA 4H0OA 3H46O 4IJNA 2AA4A 3MN7A 4H0YB 3O8MA 4H5RA 3U8XA 3WUHA 4BR4A 3P4IA 3FE1A 2A5XA 1MDUB 4EAHD 1D4XA 4H5TA 5LJWA 1P8ZA 4FOEA 4I6MA 2FLOA 2F9WA 3VEYA 1NGIA 2P9NA 5ELZA 3R9PA 4QS7A 1ZBSA 1Q18A 4RTFD 3IFRA 3LDQA 2E2QA 4M7XA 1NMDA 1X3MA 1X3NA 4FPBA 2I7PA 3CJ1A 3L4IA 3GDQA 4H5VA 4BG9A 2QWQA 3HBTA 5EVZA 3B8AX 2IVOA 1XQSC 2E2NA 4FWSA 1DKGD 2E20A 2YHYA 4CD3A 2J4RA 3WEEB 2QWLA 4BGAA 5AQJA 1U2VB 2P9LB 1U6ZA 3VENA 1WOQA 5BRHA 3CJCA 3KVGA 3LDNA 3CJ9A 3GE1A 1QHAA 3LM2A 3UKUB 1T6CA 1QZ5A 1NWKA 3QBWA 2WUSA 3LDLA 4H03B 5BR9A 4CZHA 2YI1A 1V4TA 5KQ8A 4IZ9A 1JCEA 3FZFA 4H0TB 1U2VA 2P9LA 5AQUA 1KAZA 2IIRA 2VWBA 3VETA 1GLCG 2D4WA 3UKUA 3JS6A 3DWLA 1RGIA 3EL2A 3W3DA 3ZEUB 1EQYA 4EHUA 2QWOA 1HUXA 1Z05A 5AFUA 4XEIA 3VEVA 4YDUA 3LM9A 1E4FT 3O1WA 2QM1A 3MN6A 4JHDB 2UYTA 4J8FA 4BRKA 3VEZA 4KBOA 1OKJA 4CZFA 3QMLA 4IO8A 4QS8A 3W0LA 4H0XB 3BF1A 2ZGZA 2D0OA 1SZ2A 3ZX3A 1J6ZA 4YDUC 3AAPA 5AQYA 2A42A 1LCUA 4JHDA 1CZAN 3L6QA 3I33A 4NB4A 3WT0A 1XUPO 3SMSA 3DXKB 1GLFO 1SQKA 3FZHA 3IDHA 3O5BA 3R8EA 4BRGA 1HX1A 4QS9A 2VYPA 5AQMA 2P9SB 5JLHA 2YHXA 5AQVA 3O80A 3DAWA 1V4SA 3VPZA 2GELA 4B1UB 2CGLA 5EOYA 4PL7A 5KPRA 5AQPA 5AQNA 4BROA 1IJJA 3DXKA 4CZEA 4FWLA 3CIPA 1BU6O 3MCPA 3FLCO 3TPQA 2P9SA 4FWNA 1R59O 4IJAA 4B1VA 2FF6A 2F9TA 5BN8A 1K8KA 2E2PA 3IUCA 4I6MB 4MO5A 5BN9A 5JICA 4M63C 1TUUA 1S3XA 3WQTA 5AQXA 4DCHA 4A62A 4BRLA 1NGEA 3ATVA 1T6DA 4B1WB 5BPLA 4PKGA 1MWMA 3GG4A 3OHRA 2E1YA 4AM6A 4BRQA 2IVPA 4MLHA 3A5OC 3CJ7A 4IWVA 3FGUA 3CHWA 4FWOA 3A0IX 1BWFO 2FSKA 4BVPA 1BA0A 3VEWA 1NGGA 3L0QA 4HWIA 4A61A 2D1KA 3UKRA 4WQ5A 2YJFA 3WXIA 4FOIA 1HKBA 3H1VX 2DPNA 3WQUA 4JNEA 3ZX2A 3AAQA 4BRDA 1BO5O 1GLBG 5KQDA 3MK6A 1XC3A 3D2FA 2GWJA 4E1JA 1NGFA 3M1FA 5AQWA 4FWPA 3A5LC 4FPAA 3CI5A 4WQ5C 4DHYA 4CZKA 2GEMA 3QB0A 3VOVA 4BRMA 3MDQA 2HF3A 1SAZA 3DJCA 2Q0RA 1H1VA 3M6GA 5AZJB 4CZLA 3BEXA 1DEJA 2PBDA 3CERA 4GY2B 1BA1A 1NLVA 3QFPA 3H6EA 5ADXH 4O8KA 4FWRA 2FSJA 3U9ZA 2Q1NA 2P9PA 3GOIA 4CZJA 4A2BA 3SJHA 5AZIB 4B1YB 4BREA 2Q0UA 5AZJA 1ATRA 2Q2RA 4ISEA 4NO7A 4MLEA 4CZIA 4CBUA 2A40A 5FPEA 3VGLA 4GNIA 5EX5A 1HJOA 5AZIA 3RSEA 1G99A 2NLXA 3EO3A 3J8AA 3O1BA 4JN4A 4BRAA 1ATSA 1TUYA 2YHWA 4BC5A 3MN5A 4DQ8A 3A5NC 3U4LA 1MA9B 3ID8A 1NGHA 4C23A 2NZTA 4EIAA 3QBXA 4EHTA 1IG8A 1BDGA 2A41A 3LDPA 4ISGA 1DGKN 1GLLO 1C0GA 3H1QA 4M7YA 1RDWX 3TU5A 5F0XA 3GBTA 4AM7A 5JLFA 2FSNA 3AY9A 1NM1A 1YXQA 4B1ZA 3I8BA 4F9OA 2QWMA 2BUPA 4L3QA 2E88A 1NBWA 3D2EB 1GLEG 2GTDA 2H3GX 1K8KB 1NGDA 1X9JA 2V51B 4Z94A 3EZWA 5KPTA 4BQZA 3D7EO 2KHOA 3KHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQEA 3F9MA 5KPZA 3DLLL 4AILC 4JKEA 5BREA 4MO4A 3BY5A 3WXKA 1I94K 2Z1GA 4XIUA 1W2BM 2UUCK 3G10A 4PA1A 1BIUA 3M3ZA 2ZF5O 2DTUA 3AARA 3AO4A 2HSTA 1WSHA 1CXQA 4DFMA 4AF1A 4H0PA 4CEFA 3HO1A 3WXLA 4FJ7A 3OYIA 4IOAL 4HHTA 5KI6A 4BR2A 1RT4A 4DV4K 3ZYYX 4JEPA 1RFQA 3H45C 5DK5A 4BRNA 4CEEA 4RW4A 3SMPA 3O6WA 1KAYA 4G9ZA 2V7ZA 4CF2A 2YHAA 4KHNA 4FYDA 1VAZA 4ILGB 1Q81O 3E9PA 4F2SA 3ATUA 2P5OA 1RT5A 3VESA 4CJWA 4FJLA 5AJ3K 4FO0A 4B9NA 3FZLA 5EXWA 2O8DA 3WNHA 4KO0A 4XH5A 4H4MA 4DR2K 1NU0A 3ZT3A 1TYQA 4E3SA 2FF3B 2PYJA 3K5NA 3J80O 1J5EK 2Y1JA 1SL2A 3OYGA 4Z4IA 5AR0A 2RHKA 3LPTA 2HMPA 4ELVA 2W40A 1QQMA 4XH4A 1VSLA 1ZC6A 4M45A 2Q31A 3K9JA 2HB5A 2FBYA 2A3ZA 1GOAA 3T7ZA 4H5NA 4NCGA 2P9UB 1FKOA 3BF3A 5M1OA 3VQ9A 1KQSM 1NGAA 3QNNA 3ZETA 2UXBK 4L8RB 3CG7A 5AQOA 4PL8A 2UUAK 4HTLA 4BR5A 2E5LK 5DM6L 3SQ2A 5CZ2A 4M41A 2P9KA 3ALYA 4RW6A 3GL1A 2F4VK 4LSLA 5CZ1A 1WNSA 4NLCA 2E2OA 3SK3A 2QWPA 1NNEA 4NCAA 4YOWA 3ULEB 4LC9B 2CH5A 2O8CB 5EY4A 4KB0A 4CJPA 1BOTO 3C0BA 3RR8A 3C7NB 3CQXA 3MEDA 3IMXA 4A59A 5AQIA 1K9MO 5CE3A 3DXMB 4O0IA 3OJUA 4JKGB 4DWIA 5LY3A 3OYJA 1TKTA 3S41A 4AH9A 5HLFA 5H1SQ 2UXDK 4Z0UA 4IDHA 3KLEA 4DFPA 1U4BA 3LALA 4CHYA 2WONA 1QQOA 2F8SA 2QWNA 3OYNA 3DLHA 5IWAK 3BDPA 3KD1E 3VMFB 3SUPA 1HJRA 4BR7A 2BTFA 3VQPA 3HSCA 1NGJA 2ZQBA 1S72N 1U49A 1T7PA 1MU2A 4B9QA 4Y0WA 3HPHA 5C10A 3F2KA 3AO1A 4FSVA 1J54A 4FWQA 2KTQA 4FK2A 2YNIA 4RCHA 1D9FA 1YF5L 3Q7CA 3C6HA 1HPZA 2P9IA 4PKIA 3OBWA 4J2BA 4H0YB 3HYFA 2JWKA 4GW6A 3CCEN 1SL1A 3FE1A 3G71N 3HOSA 2HBKA 4I6MA 3VEYA 3NE6A 3PY8A 3MX5A 1VQMN 3NF9A 5ELZA 4M7XA 4DQQA 1X3MA 1KLMA 1JLQA 1BIZA 1EX4A 3CJ1A 1N36K 5KRSA 3E1YA 4M3UA 3LP2A 3D6RA 1LWEA 5LMNK 5EVZA 3B8AX 2ITGA 3CYMA 4LH5A 3L2QA 3TSPA 4B9UA 1CLQA 3C95A 2E20A 3QLHA 3ENBA 3HVRA 3MX2A 1TKDA 1VHXA 4CIGA 2F8TA 2J4RA 4DSFA 3HJFA 5AQJA 1U2VB 2YV0X 4FM1A 2VWKA 2FC0A 3CJCA 3LDNA 3CJ9A 2UXCK 1ASVA 1G15A 1QHAA 1RILA 3LM2A 1T6CA 3LP1A 4H03B 4CZHA 3ITHA 4R79A 1V4TA 4CERA 2OA8A 4JYAK 3THVA 3P83D 4I2QA 1UA0A 2IIRA 2VWBA 2EHGA 2D4WA 1WSJA 3UKUA 3EL2A 1Z05A 3WNFA 4BWJA 3L8BA 4CJVA 4X65K 4YDUA 1NKEA 3O1WA 4K8ZA 3RVCA 2QM1A 4C8NA 5C2FA 2UYTA 1Z26A 4I2PA 4FLZA 3RRGA 4J2DA 2O8FB 3VEZA 4DR5K 4KBOA 1XMQK 2G8HA 5C25A 3K5OA 3QMLA 3ZX3A 4O4GA 3AAPA 4OPKA 5FROA 3PIPL 2A42A 4GVEA 4N47A 5J2QA 4JHDA 2DY4A 1L3SA 1WSIA 1KC8O 2XY5A 3WT0A 3NHGA 1XUPO 2DFEA 3DXKB 3FZHA 4IFYA 1SUQA 2VYPA 1S1XA 4OGCA 3EE8A 1IBKK 3C65A 3O9TA 3CFRA 3DAWA 2CGLA 4K8XA 3THXB 1I39A 1YTAA 5AQPA 1HNWK 3QEWA 3SUQA 4F2RA 4FJHA 1LAWA 3FLCO 4FWNA 3QEIA 1IKWA 1R59O 1BL3A 3KLFA 3TTCA 4CESA 5BN8A 2OPSA 2OCEA 3O4NA 4FLYA 1S3XA 4OGEA 3WQTA 1VQPN 4A62A 2R7YA 1NGEA 2VG7A 1NK8A 1T6DA 2AJQA 2QKBA 3I55N 2D5RA 5BPLA 2KZZA 4AHCA 4BRQA 1B9FA 3OA9A 5J2NA 1IKXA 4X66K 3NF7A 3CJ7A 4B9TA 4OLBA 1YT3A 4FWOA 4O44A 2FSKA 3ASMA 2F96A 3C6TA 3L0QA 4HWIA 2X6SA 1W97L 4BY9C 3EE9A 2DPNA 4ID1A 4KH4A 5CY4A 3AAQA 3SPZA 4FK4A 4JRQA 4C8LA 2NRRA 1BO5O 2D0CA 3NFAA 1XC3A 3D2FA 2GWJA 1NGFA 1TL3A 4DHYA 4YHHK 4BRMA 3OJSA 1Q9YA 2HF3A 1JKHA 3MXJA 4KH6A 1H1VA 4GY2B 3AVNA 4RW8A 4JKCA 3HL8A 2ATQA 2XHBA 3H6EA 5ADXH 4O8KA 1KVCA 4W5TA 4M3TA 4YOVA 2NRWA 4CJLA 4CZJA 4A2BA 3K59A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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