3UKRA

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
415
structure length
401
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 126
structure length 401
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ukrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrA04
1NGHA 2EWSA 4NO7A 3VETA 5BN8A 3CQXA 2P9PA 3BF3A 2IIRA 4B1YB 2Q2RA 4MO4A 3CJBA 5KQDA 3D2FB 4L3QA 4PKGA 4BRHA 3H45C 2PAVA 5AQUA 4HTLA 4FPBA 3WQTA 2WUSA 2BTFA 3GL1A 2P9SA 3FLCO 1NGCA 4K41A 2FXUA 5EVZA 2E2QA 2QWQA 3KZBA 2D4WA 4QS9A 3UKRA 4XEIA 1ZC6A 3GDQA 4DHYA 3W3DA 3LDPA 5E26A 5AZJA 1DGKN 1T6CA 2Q1NA 5AQZA 4B1XB 3LM9A 4BROA 1DKGD 1ATRA 5LY3A 3HZ6A 2E2PA 2BUPA 5BN9A 4H03B 3FZLA 2GUPA 3QBXA 4CZIA 2GELA 4BVOA 4BQLA 1YVNA 3LDOA 3UKUB 4A2AA 4CD3A 3LDNA 3HM8A 1JCGA 4EFHA 1SZ2A 3MDQA 5AQYA 5AQIA 5EOYA 1K8KB 2E2NA 4PKIA 2V51B 1X9JA 2CGKA 3MCPA 4EAHD 3AAPA 3L4IA 4WQ4C 1HPMA 4BRMA 3GG4A 1QQNA 2YI1A 5F1XA 3JS6A 3WUHA 1NLVA 3CQYA 2AP1A 4CBXA 3VGMA 5B8HA 1NGGA 1TYQB 3DXMA 3RSEB 4IXCA 4BRAA 3A5NC 4H5RA 3QDKA 2FF6A 5AQLA 3VEXA 2CGLA 5JMVA 5JLHA 3FZKA 1HJOA 5KPZA 5FPEA 3IUCA 3DXKA 4FWPA 4CZJA 2FSJA 2Q0UA 4CBWA 3VEVA 4JD2B 1GLCG 3O5BA 4DCHA 5ADXH 3I8BA 3ULEB 3SJHA 2YJFA 4BR0A 1QQOA 2Q0RA 1BA1A 4BC2A 2HF3A 2QM1A 1S22A 1V4TA 3MN6A 1H1VA 1U2VB 3ZEUA 4B1ZA 4I6MB 4BREA 2ZGZA 5FPMA 2OANA 4WYBA 1HX1A 2QWLA 5AZIA 3TPQA 3SLCA 1Z6RA 3A8YA 2ASMA 1GLFO 4PL8A 4CZLA 4K43A 3VGKA 4H0YB 2P9KB 3CJCA 3AY9A 2QXLA 4MLHA 5AQRA 3VEYA 3ENOA 1QQMA 2I7PA 4GY2B 2ZWHA 1YUWA 3WXJA 5BPNA 4WQ5C 2YHXA 1T6DA 1XQSC 4BR4A 3FFKB 1OKJA 3WEEB 5KPTA 3H1QA 1HKCA 2YHWA 2DPNA 4BGBA 1G99A 1MA9B 5AFUH 3HTVA 2NLXA 1EQYA 2P9IA 3VGLA 4H0VB 1BWFO 1GLAG 2ASOA 3AARA 3UE5A 4XH4A 1U6ZA 3F9MA 4C23A 3AAQA 2A3ZA 4H0PA 1NGBA 4FWQA 3HBTA 4H0TB 1KAZA 4O5FA 4RCHA 1HKGA 4CZMA 4ISEA 2P9NA 3UKRB 1CZAN 3EN9A 1NGFA 5F2RA 2V7ZA 3VEZA 4FWNA 3EZWA 5AZJB 4WQ4A 5KPRA 3DWLA 4RTFD 4CBUA 4FO0A 4FWLA 4B1UB 4BRFA 2YJEA 3FGUA 5BRDA 3GE1A 3C7NB 3QFPA 1XUPO 5JLFA 2KHOA 2E88A 3VF6A 1KAYA 4H5WA 4MO5A 5E84A 2QWMA 1IJJA 3LM2A 1KXPA 3LDLA 3IDHA 5I9EB 2ITMA 2AA4A 3CJ7A 3ZX2A 4RWTA 4ISFA 3ZETA 3FZFA 2W40A 3A5LC 3TU5A 3A5OC 4PL7A 3QBWA 1D4XA 3EL2A 1V4SA 3A0IX 3KHYA 4KBOA 2H3GX 5BR9A 3GBTA 3WXLA 1E4FT 2V52B 3D2EA 2P9UB 1MWKA 1HUXA 2FLOA 4BRGA 1R59O 3QICA 3LL3A 3VENA 5BRFA 3D2FA 4WQ5A 4Y0WA 4BRDA 1QZ6A 3U9DA 4H5TA 2F9TA 3ZEUB 2GTDA 3BP8A 4AM7A 4JHDB 3CERA 3VOVA 3FR0A 5AQWA 1BU6O 1DEJA 1NWKA 4A61A 4A2BA 2PBDA 1NM1A 4BRPA 3O8MA 4EHTA 1BG3A 1BO5O 5AQGA 5AQOA 2QW9A 4BG8A 4IJNA 2F9WA 2P9LB 3ENHA 3M3ZA 1BUPA 3KVGA 4FWKA 3G25A 2E2OA 4NB4A 1TUYA 3LDQA 2QWNA 2FF3B 1GLJO 5TKYA 1Z05A 4LC9B 4YDUC 3GOIA 1WUAA 1K8KA 4H0XB 3O6WA 4QS7A 5CE3A 1Q18A 2VWBA 1ESVA 4QS8A 5AR0A 5LJVA 1ATNA 3H1VX 3FE1A 5AQFA 5EY4A 4DB3A 1RGIA 1GLBG 3H46O 4BR5A 1TYQA 1JCEA 3RSEA 5AQHA 3ATVA 2P9PB 2ASPA 4BQZA 3QFUA 1ATSA 4FWMA 2E8AA 4GNIA 1X3NA 3CJAA 3S41A 4H5NA 4ISGA 4M7XA 2E1YA 1J6ZA 1RFQA 1NGDA 4CJ7A 1NGIA 5ADXA 3VPZA 4JD2A 4BRNA 1HLUA 2P9SB 4O8KA 2YHYA 4XH1A 4FWRA 3QMLA 4BRQA 3VF4A 4Z94A 3ID8A 4B1WB 5KQ8A 3IMXA 3SK3A 5EXWA 1U2VA 1X3MA 3EKSA 3H6EA 3WT0A 3BUZB 3FZMA 4I6MA 4BR7A 5F0XA 2FSNA 1T44A 1JCFA 3VEOA 2A41A 2QWOA 2HMPA 1NGAA 3JXUA 2QWPA 4B9QA 3O4WA 5LJWA 4CZGA 2D1KA 1S3XA 3CIPA 1P8ZA 3WXIA 3CHWA 2UYTA 2P9KA 1E4GT 3MN7A 2E20A 3M1FA 1LOTB 1TUUA 3BF1A 3WEEA 3HI0A 1MDUB 1WOQA 5AQJA 1HKBA 4JNEA 3U4LA 5BPMA 5AFUA 5AQVA 1XC3A 4BR9A 4CZHA 2QWRA 2W41A 4BRIA 4J8FA 3EKUA 5EX5A 2J4RA 3DXMB 3L0QA 4FL9A 3D7EO 2CH6A 1KAXA 5AQMA 2D0OA 4YDUA 3P4IA 4CI6A 5AQQA 4M7YA 3DXKB 4BRKA 5AQNA 2IVNA 4IO8A 4E1JA 2ZGYA 1QZ5A 3DJCA 2Q36A 3CJ1A 4CZFA 1NMDA 4FOEA 3I33A 4MLEA 2E1ZA 4BRCA 4K42A 3ZX0A 4CZKA 1IG8A 4IZ9A 3CETA 3FZHA 3OHRA 3C7NA 3O80A 3R8EA 3L6QA 3MMVA 4EIAA 2A6AA 5AQXA 2I7NA 4BC4A 5AZIB 4BR2A 2GWKA 2FSKA 1MWMA 5BPLA 4CZEA 3VF2A 4AM6A 3SMPA 3ZX3A 4BGAA 4CD1A 3WQUA 3U9ZA 3W0LA 2VYPA 4H0OA 2HF4A 3CI5A 2CGJA 4PKHA 1QHAA 1ZXOA 3QB0A 4BRLA 4FWOA 3UKUA 4K25A 2P9IB 1GLDG 2A40A 2IVPA 1GLLO 2P9UA 1Y64A 2A42A 1BA0A 2GEMA 5JICA 3J8AA 2YCHA 2HOEA 3B8AX 5AQPA 1GLEG 1C0GA 4FSVA 2P9NB 2Q97A 4JAXA 4BVPA 3O1BA 3DAWA 3CJ9A 1LCUA 3MN5A 1BDGA 1BOTO 4JHDA 3SMSA 3WXKA 3BEXA 3HSCA 3IFRA 4H5VA 4JN4A 3UB5A 4DQ8A 1YXQA 4FOIA 1SAZA 3C0BA 5FPDA 4IJAA 1SQKA 2A5XA 2D0PA 2GWJA 3U8XA 3VESA 2Q31A 4BC5A 2VCPA 3ATUA 3ULEA 3O08A 4FWSA 2P9LA 5AQKA 1NGJA 5AQSA 4FPAA 5FPNA 3VEWA 2IVOA 4EHUA 4F9OA 3O1WA 3R6MA 3VERA 1NGEA 1ZBSA 3A5MC 1NBWA 1RDWX 5AQTA 4IWVA 3H3OB 3MK6A 3ZETB 5BREA 1YAGA 1C0FA 2NZTA 2CH5A 4M63C 4A62A 3M6GA 4BC3A 3EO3A 4BG9A 2NRHA 3R9PA 3MN9A 5ELZA 4XH5A 4B1VA 2ZF5O 3D2EB 5BRHA 4HWIA 2V7YA 3H3NO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EWSA 1LWEA 1VSEA 3VETA 3HJFA 1TL1A 3KKRA 3EE9A 4B1YB 4Z4GA 3NMUA 5J1EA 3CJBA 2DY4A 3D2FB 1XNQK 3C6HA 3HP6A 4L3QA 3H45C 4HTLA 4FPBA 2HHXA 3T3FA 3KK1A 2P9SA 2EHGA 1NGCA 1LAVA 3FLCO 3TTDA 3HM9A 1LW0A 4JKGA 1IKYA 4XEIA 4O44A 4CJKA 3HXMA 1JXBA 3GDQA 1P90A 1RT3A 3LDPA 5IWAK 4B1XB 1XC9A 1IBMK 3RMDA 1WSFA 4TSXA 3V9UA 4CK2A 4DSIA 5BN9A 4M3UA 2D0CA 4BVOA 3LDOA 1KFSA 4XIUA 3HM8A 4Z4EA 1SZ2A 2DFFA 3OYCA 5HROA 4PKIA 1X9JA 3N4PA 4EAHD 4DV5K 5M1PA 4KRFA 1HR0K 3AAPA 3L4IA 4WQ4C 1HPMA 4CEBA 1VQLN 4JI3K 1QQNA 3DLHA 5F1XA 3WUHA 4CHOA 1FK9A 3VQPA 4BE0A 3DXMA 4K8XA 1A5WA 4IXCA 4H5RA 4WF9L 5JLHA 1EXQA 5KPZA 2ZJRL 3DXKA 4BE7B 1RT7A 4DS5A 3SJJA 4JD2B 2RN2A 2ZJPL 3E9PA 4N5SA 2Q0RA 2QM1A 1S22A 3J81O 3F73A 5IT9O 1V4TA 1H1VA 3E66A 4I6MB 1WB9A 4BREA 4E7HA 3ZSRA 5FPMA 3SUPA 3LAKA 1WNSA 3SPYA 1XHZA 4FLVA 2KZMA 4DV0K 4CESA 1U45A 3K2PA 1C1BA 2KFNA 3VGKA 5FRNA 5AQRA 2QXLA 2E6MA 3MXMA 2UUBK 4YOWA 2ZWHA 2FBTA 2FBYA 3OS0A 1VSLA 3FFKB 1VSJA 1OKJA 1RBUA 4Z4HA 4HCBA 3HP9A 2HBMA 1BI4A 3O9RA 3HPOA 4DS4A 2DPNA 1G99A 4HCCA 4WE1A 1C0MA 4LH4A 4RW8A 4GW6A 4EP4A 2IOCA 4ICLA 2ASOA 3P1GA 4ID1A 4FK4A 4JYAK 4DV2K 1ITGA 4RW9A 3AARA 4XH4A 4KHNA 3CYGA 2RHKA 2A3ZA 4CJQA 4O0JA 1WLJA 4H0TB 1KAZA 4CZMA 1HKGA 1ASUA 4ISEA 2P9NA 3AO5A 3EN9A 1S9EA 1NGFA 4PUOA 3OY9A 1NK5A 3EZWA 4FLXA 5KPRA 4LFCK 1WBBA 3LZJA 4RTFD 4CBUA 4DR3K 4KH5A 4FWLA 4B1UB 1YIJN 4KB0A 3C7NB 3PSIA 3QFPA 2F8SA 1XUPO 2ITGA 3KWIA 2KHOA 4C8MA 3M5RA 4AHCA 1NK8A 2KTQA 4DFMA 1U48A 3PV8A 5E84A 2QWMA 2HBJA 3LDLA 1L3SA 2AA4A 3TAQA 3CJ7A 1L3TA 4FJ9A 4RWTA 3V9XA 4ISFA 3TU5A 4DTJA 4FJ8A 3QBWA 3EL2A 3VQ6A 4O8UA 1V4SA 3A0IX 3D6RA 3VQQA 4JRQA 5K14A 5FDLA 4IG3A 5BR9A 3WNHA 3HSTB 3OYIA 1IH7A 3D2EA 4LD0A 1YTUA 4CHYA 3QEXA 3MEEA 4FZXC 3MXJA 2W42A 2G8KA 4HTUA 1NKEA 1QZ6A 4BWMA 3U9DA 3CCRN 1M90O 4B3MK 1WAJA 2GBZA 3B6PA 3PX4A 3FR0A 1DEJA 2YNFA 4A61A 3T69A 3OYEA 2VGNA 4WCEL 2JGUA 4CHPA 3DM2A 4IJNA 4HVJA 1BUPA 3KVGA 4E19A 2E2OA 2F8TA 3MWPA 4IFEA 3OJUA 2FF3B 1GLJO 4DSJA 3G71N 5HRRA 4LC9B 4N47A 5SZTA 3NF8A 3GOIA 5JENA 5M1KA 4OJRA 4QS7A 2O8FB 5HRNA 1EO1A 4LF4K 3FE1A 1DTTA 5FROA 2B6AA 5EY4A 3LPUA 1RGIA 3CPEA 5AQHA 3CPWM 4J2AA 2P9PB 4E7KA 1U49A 1ATSA 1X3NA 3CJAA 3S41A 4DTXA 3TARA 2E1YA 2WBNA 3THWA 2G8WA 4LF9K 4FK0A 4BRNA 1ILYA 4Z94A 3TSQA 4CJLA 4AHRA 1WAFA 3SK3A 3H6EA 3BUZB 4CERA 1TKDA 3VEOA 4W5QA 4GV3A 4CGDA 1NGAA 4M3ZA 3AGRA 5LJWA 3ITHA 4CJRA 4YOTA 5C24A 3CHWA 2W00A 1C1CA 4IOAL 4CEDA 4JRPA 1E4GT 2E20A 1LOTB 3OW2M 5DMRA 4CIGA 3WEEA 1IKWA 3U4LA 5AFUA 2QWRA 4BRIA 3DLBA 3SI6A 1T03A 5HRSA 3ZYYX 1KLMA 4PHTX 2WFBA 3L2QA 2OPSA 2O8EB 2CH6A 5AJ3K 1KAXA 2D0OA 4OVLA 2PZSA 4WFBL 5KTQA 3MXIA 4OPHA 4FJKA 3RWUA 4OX9K 4OKJA 1N8RO 3NF7A 2IVNA 4E1JA 1Q82O 2ZGYA 1QZ5A 4DTSA 3DJCA 4Z4IA 1IKXA 4MFBA 5J2MA 4BRCA 3QNOA 4GMJB 4CZKA 4IZ9A 4FJNA 3OTOK 3FZHA 4JKFA 3OS1A 4ELUA 4JI7K 4A57A 4EIAA 3AVKA 5AZIB 2X6NA 3TTFA 4AH9A 3SQ0A 5CYQA 4AM6A 5H1SQ 2UUCK 1NJXA 4FJMA 3VQ9A 3IKMA 1QHAA 2YNIA 1YF5L 1VAZA 4BRLA 3UKUA 2P9IB 1GLLO 4BY9C 1FW6A 4OPAA 3J80O 4AF1A 2YCHA 1GLEG 4FSVA 2Q97A 4CECA 3O1BA 3CJ9A 3MX2A 3SBGA 4YOUA 1S1XA 3OYBA 3I8DA 3RMCA 2G8IA 3CFPA 1IBLK 2A1SA 4FOIA 4IJAA 2XY6A 1HNZK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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