4K43 | Genus

Total Genus 114

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	114
sequence length	370
structure length	360
Chain Sequence	TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural and biochemical studies of actin in complex with synthetic macrolide tail analogues. pubmed doi rcsb
molecule tags	Contractile protein
molecule keywords	Actin, alpha skeletal muscle
total genus	114
structure length	360
sequence length	370
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-04-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00022	Actin	Actin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4k43A01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4k43A02
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	4k43A03

3ID8A 4JNEA 4CZMA 2ZGZA 3HBTA 1MWMA 4H5WA 2OANA 3ULEA 5LJVA 1ESVA 4NO7A 1XC3A 4BRQA 5AZJA 2J4RA 4HWIA 3RSEA 2E2PA 3CHWA 5AR0A 4BR7A 2FLOA 3VEOA 4A2BA 1NBWA 2D4WA 2AP1A 4CBUA 2YHWA 4BGAA 4FOEA 4BREA 3EKUA 4CBXA 4BR0A 2GTDA 3MN9A 4Y0WA 4F9OA 4IJNA 1EQYA 1NGDA 4BQLA 5KPRA 1P8ZA 3O8MA 4FOIA 3WXKA 2NZTA 2VYPA 3GOIA 4EHUA 4JAXA 2E20A 2A40A 2YI1A 4BR9A 2QXLA 1NWKA 3A5LC 4B1ZA 3O80A 5FPDA 3O5BA 5JLFA 2GWJA 3UKRB 3H1QA 3LDOA 2P9SA 2UYTA 4WQ4A 1CZAN 3MN7A 1TYQA 5BN9A 3DWLA 1KAYA 4H03B 3WEEA 4KBOA 3L4IA 2WUSA 4BR2A 4FPBA 2Q1NA 4MLHA 5AQFA 3DXMA 2QWMA 3J8AA 1YUWA 2E1YA 4L3QA 3IUCA 1LOTB 2BUPA 3ATUA 4A2AA 3L6QA 3KVGA 4GY2B 3CJ1A 1MDUB 3LM2A 3VF2A 1NLVA 3F9MA 2P9NB 4WQ4C 5AQSA 2ASOA 3GE1A 3VOVA 3D2EB 3ZEUB 2P9SB 4FPAA 3VEVA 4DQ8A 2FSKA 3CJAA 2EWSA 1SAZA 4FWOA 4IO8A 3CERA 5AQKA 4CZKA 4FWPA 1GLBG 1TYQB 4B1XB 3EKSA 1K8KB 1V4TA 1HKCA 3FZKA 4BRLA 4BRDA 3WUHA 2VWBA 3S41A 3BF1A 4H5NA 5KPZA 1HKGA 2A5XA 3O6WA 4BC3A 4JHDA 3CIPA 2E2OA 3GBTA 4M63C 2QWOA 4WQ5A 4JN4A 4BVPA 3IFRA 1ATRA 2Q2RA 2YHYA 3MK6A 3MN6A 3H3OB 4IXCA 4PL8A 5ELZA 5AQXA 3D2FA 3WXJA 3I8BA 3OHRA 3ENOA 3ZX2A 3TU5A 5AQYA 1BO5O 3R9PA 2ZGYA 1BDGA 3LDNA 4PL7A 5AQVA 5KQ8A 2Q0RA 3DAWA 3UKUA 4RWTA 2ZF5O 4FO0A 2QWPA 3QICA 1ATSA 5LJWA 2HF4A 3SJHA 2GEMA 3O4WA 4RTFD 4H0TB 2QM1A 2F9WA 1IJJA 4PKHA 1RDWX 4BC2A 4O8KA 4WQ5C 3WQTA 2CGKA 3WXIA 4BRKA 4H5RA 1OKJA 2I7NA 1NGCA 5BPLA 4NB4A 2HF3A 2IVNA 3TPQA 4B1UB 4ISFA 4H0VB 1QHAA 4BC5A 3QBWA 5AQRA 5BPNA 4BQZA 3CQYA 4IZ9A 4BR4A 1NGHA 2YHXA 4GNIA 3CJ7A 2P9PA 4BRHA 3GL1A 4O5FA 4CZIA 5BRDA 5JMVA 3GDQA 3QMLA 3G25A 1QZ6A 4FL9A 3C7NA 4EAHD 3HM8A 2YCHA 3KHYA 4I6MB 3M6GA 2P9IA 1QQNA 1KAXA 2GWKA 3DXKA 1JCEA 1ZC6A 3ZETA 2FXUA 1QZ5A 1BUPA 3H3NO 1Y64A 1T6CA 4FWNA 2FSNA 3VF4A 5AQHA 3A5MC 3L0QA 4BC4A 4XH1A 3ULEB 5F1XA 3M1FA 5AZJB 3RSEB 2YJFA 5AQTA 5AFUH 3ATVA 2NLXA 2QWLA 3R8EA 4K42A 5ADXA 5LY3A 3IDHA 3AAPA 4B9QA 1DKGD 1BA0A 3VETA 3VPZA 2H3GX 5EVZA 4ISGA 1YVNA 3FZLA 3WT0A 2A42A 3H6EA 4MO4A 4JD2A 2QWRA 2V52B 1WOQA 1ATNA 1GLJO 3MDQA 4XEIA 3VEZA 4Z94A 5F0XA 4QS9A 4FWSA 3EO3A 2E88A 3A5OC 5AZIA 3W3DA 4CD3A 3D7EO 4FSVA 3EZWA 3FR0A 4FWKA 1U6ZA 1DEJA 4YDUC 1XQSC 1IG8A 2V7YA 2AA4A 5AQUA 2ASMA 2FF6A 3ENHA 5AQLA 5AQGA 3UB5A 3WQUA 1JCFA 2CGLA 4BRPA 3VEWA 4CI6A 3WEEB 1U2VA 2NRHA 3JXUA 3MN5A 3U9DA 5BPMA 4B1VA 5AQOA 3DXMB 5AQNA 3SMSA 4FWMA 2PBDA 3VEXA 4A62A 3GG4A 1HJOA 3QFUA 1GLAG 3B8AX 4DB3A 5BRFA 4CZHA 5TKYA 4BRMA 2P9KA 5JICA 2Q97A 5AQPA 2D0PA 4CZLA 3BUZB 4H5TA 4BRIA 2P9UA 3A5NC 1E4GT 3HI0A 4A61A 4DCHA 1TUYA 3VGMA 3FE1A 3VEYA 2P9LA 4JHDB 5EXWA 1QQOA 2KHOA 1QQMA 3MMVA 1NM1A 1BA1A 1G99A 1HKBA 2E8AA 5E84A 4IWVA 4BG8A 3H1VX 4CZGA 3D2FB 2Q36A 3LM9A 4EFHA 1X9JA 3VESA 3AARA 4C23A 3QDKA 1YAGA 2DPNA 3QFPA 1DGKN 3HZ6A 2VCPA 3FGUA 3ZX0A 3UKUB 1Q18A 3H46O 3CJ9A 4K25A 3VGKA 3CI5A 3CQXA 5B8HA 1ZBSA 2F9TA 2GELA 1GLLO 2CH5A 2I7PA 1NMDA 1KXPA 2HMPA 1X3MA 3UKRA 2W40A 4BRGA 2FF3B 5KPTA 3WXLA 2A6AA 1GLDG 1HPMA 1RGIA 5EY4A 2E2QA 2YJEA 4K41A 4QS7A 2E2NA 4AM6A 3VENA 3R6MA 2P9PB 2A3ZA 3BP8A 3VF6A 4CJ7A 4BR5A 3H45C 4XH5A 4FWLA 3EN9A 4FWRA 5FPNA 3JS6A 4YDUA 3C7NB 4BRFA 5F2RA 5CE3A 2Q0UA 1XUPO 4LC9B 2P9IB 3P4IA 4BVOA 1GLEG 1HX1A 1BWFO 2IVPA 3BF3A 5E26A 2D1KA 4H0OA 5BREA 5AQJA 2P9NA 1MA9B 3DXKB 4H0PA 2IVOA 3AY9A 3C0BA 3ZETB 2ZWHA 3D2EA 4CZJA 1NGJA 3ZEUA 3CETA 5EX5A 1BG3A 3LDPA 1BU6O 3DJCA 3VERA 2E1ZA 5BN8A 3M3ZA 4XH4A 4BRNA 5AQQA 4CD1A 1K8KA 4H0YB 1YXQA 1HUXA 4J8FA 3FZMA 5AQMA 4BRAA 3ZX3A 3LDQA 4EHTA 4HTLA 4K43A 2HOEA 4AM7A 2W41A 3O1WA 3U9ZA 3SLCA 3AAQA 4B1YB 3W0LA 5FPEA 4BG9A 4RCHA 3MCPA 1C0GA 1C0FA 1NGGA 1Z05A 3BEXA 4CZEA 4JD2B 3O1BA 3SK3A 3LL3A 3VGLA 4DHYA 3A8YA 2D0OA 3I33A 5AFUA 3FZFA 5BR9A 5AZIB 1NGBA 2ITMA 1NGFA 3IMXA 1BOTO 2CGJA 4H5VA 1E4FT 5AQWA 1NGAA 1NGEA 1KAZA 1S22A 3UE5A 1R59O 2V51B 5AQZA 3EL2A 5FPMA 4BRCA 2FSJA 1JCGA 1X3NA 4M7XA 4IJAA 2CH6A 4B1WB 1U2VB 4M7YA 5EOYA 1MWKA 1T44A 2Q31A 4WYBA 3O08A 4EIAA 1GLCG 3U4LA 4ISEA 4BGBA 4CBWA 2QW9A 2PAVA 1HLUA 2A41A 3A0IX 4MLEA 4PKGA 1D4XA 1TUUA 4FWQA 3LDLA 3QBXA 2ASPA 3QB0A 4CZFA 3CJCA 3HTVA 1LCUA 1Z6RA 3U8XA 4E1JA 2P9KB 1NGIA 3FFKB 3SMPA 3HSCA 4QS8A 1SZ2A 5JLHA 2QWQA 4I6MA 3FLCO 1ZXOA 1SQKA 5ADXH 2GUPA 2IIRA 2V7ZA 3CJBA 5BRHA 1T6DA 5I9EB 2P9UB 1RFQA 1V4SA 3FZHA 5AQIA 1GLFO 1H1VA 5KQDA 3KZBA 1J6ZA 2BTFA 4PKIA 2P9LB 4MO5A 4BROA 1S3XA 4H0XB 2QWNA 1WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2O8BB 4J2BA 5SZTA 3HBTA 1MWMA 4H5WA 3SUPA 4MDBA 1RTHA 3DLLL 4BR7A 2FLOA 4DTUA 2AP1A 2D0AA 4CEAA 2W6LA 4FVUA 2YHWA 4ILGB 4DR7K 5M1FA 4W5OA 2GTDA 4BQLA 3ZT3A 4DLGA 4E1MA 3WXKA 2NZTA 4B3MK 4NXNK 4FK4A 3AVNA 2A40A 4CECA 4BE2A 1NWKA 1C1AA 3WNGA 4B1ZA 1TAQA 3O80A 5FROA 3TAFA 4AILC 2FBTA 3QNOA 1CZAN 3ZT4A 4YOTA 3VQ7A 4DS4A 2PYJA 1TYQA 2O8DA 4PWDA 3M8QA 4C8KA 3NE6A 3WEEA 2X74A 2ZJRL 4HVJA 2WUSA 3J80O 4MLHA 3DXMA 4V19S 2Z1IA 3OYGA 5IWAK 2DFHA 1SKRA 4YFUA 4YOUA 3LM2A 3VF2A 4DMNA 5AQSA 4RW4A 3GE1A 4M3UA 2P9SB 1TGOA 2EWSA 1WAJA 3NF6A 1SL2A 3D6RA 2G8HA 3A2FA 1BISA 2XY6A 3EKSA 1Q86O 3AGRA 1QE1A 1N5YA 4BRDA 4ZTFA 3WUHA 3S41A 1U47A 4C8NA 5KPZA 1HKGA 5TKWA 2XO7A 1FXXA 4M63C 4CJFA 2O8FA 1KVAA 2KQ2A 5KGXA 2HSTA 2Q2RA 4IXCA 4H4MA 3H3OB 3OYAA 4F2RA 1RNHA 3CCRN 3ZX2A 4OKEA 4CE9A 4CEOA 3CCVN 4CJ4A 3J7ZO 3PIOL 4W5QA 5AQYA 3MWPA 2ZJPL 3LDNA 4B3OA 3VQ8A 5KQ8A 4RWTA 4CGFA 3PY8A 5LJWA 2GEMA 4J2DA 1CZ9A 2IOCA 2OCEA 3J7YP 3HXMA 4AHSA 1VQ9N 4CHNA 1DLOA 4DSIA 3OYFA 2CGKA 1IH7A 2QK9A 3TAQA 4H5RA 2XRIA 3LZJA 3VQBA 4JKAA 2G8WA 1I39A 4NB4A 1UWBA 2IVNA 1VQLN 4H0VB 4BC5A 4E19A 1VAZA 3ZSZA 4BQZA 3IAYA 2WTUA 3V1QA 3DRRA 3AVJA 3CJ7A 2P9PA 4BRHA 1U45A 4CHQA 1HJRA 5HRPA 3RMAA 3JYTA 3WNFA 4GV6A 3DOLA 4FLUA 2P9IA 4NCAA 3RMCA 3KLHA 5CYQA 3VQCA 1ZC6A 3QETA 2FXUA 5M1OA 1Y64A 5DMRA 4FWNA 4JKHA 5J1EA 2FSNA 4PQUA 3A5MC 3V4IA 3ID6A 1NJXA 4HCBA 1RTJA 3ULEB 1KLNA 1XC9A 1HQUA 2P1JA 2NLXA 2XY7A 1X9MA 2H3GX 1VK0A 5EVZA 2UXCK 4YOXA 1Q7YO 1K9MO 4OLBA 4RW6A 5GIPA 2A42A 3H6EA 1HNWK 2V52B 1WOQA 4IEIA 3V9ZA 1GLJO 2RHKA 1X9SA 4Z94A 1S5JA 3MEDA 4FWSA 3NH0A 4FJ5A 5AZIA 4FSVA 3FR0A 2O4GA 1XQSC 4KHQA 4OLAA 5AQLA 3WQUA 3AVHA 4PHTX 2VGMA 2QKKA 4AF1A 3JXUA 5AQOA 4A62A 2ZM6K 4FJXA 1J9AA 3THVA 4DTJA 1HJOA 3L2UA 5C12A 3QFUA 4O8UA 1S6QA 2GBZA 3MCAB 1FK9A 2HBLA 1LWCA 1VSEA 4F3TA 4FLVA 2OYQA 5JICA 2HBMA 5FRMA 2YV0X 5AQPA 3O9RA 3Q7BA 2UUAK 4CZLA 3RR8A 4M42A 3OJSA 4H5TA 3CFPA 1NNEA 4CF0A 4DU1A 4FK0A 1TK8A 3I0SA 4DF4A 2ATQA 2KHOA 3NBPA 1BA1A 2O8BA 4OPHA 4M3ZA 3K2PA 4CZGA 2Y1IA 1SKSA 5FDLA 3O3GA 3QDKA 4FM1A 3LWLA 2G8VA 2VCPA 3FGUA 2E6MA 2HNDA 4EP5A 3V9SA 3Q7CA 3SCXA 1VSKA 1XHXA 2QTDA 2UXBK 1GLLO 4LH5A 2I7PA 4PY5A 5GIOA 1RT3A 3RRGA 1KVBA 3WXLA 4IOAL 1GLDG 4LSNA 1RGIA 5EY4A 3KLFA 3OYMA 4WFBL 4QS7A 1T03A 4AM6A 2VQEK 4WE1A 1S1WA 1YJ9N 3BP8A 2NRXA 4JRPA 3M8RA 4E7HA 4M45A 4AHCA 1QS4A 3C7NB 3CFOA 3ZT0A 4BRFA 3QLHA 4BVOA 1HX1A 4M3TA 4OO1J 4TSXA 3BF3A 4FXDA 5AQJA 4DKWA 3AY9A 3C0BA 2ZWHA 4CZJA 4DR1K 4LFCK 3T1AA 4DF8A 1NK6A 1N33K 4RW8A 5M1NA 2NRVA 5H1SQ 1YXQA 5DM6L 4CJUA 5AQMA 4AM7A 2W41A 4W5TA 2D0CA 3LAMA 4BG9A 1JLGA 1C0GA 2QKBA 3O3FA 3S3OA 4CZEA 4JD2B 5JVHL 1U49A 3SK3A 4DHYA 4BWJA 3HT3A 3CCJN 3FZFA 4HTUA 4Q5VA 4EP4A 4JI3K 2IS3A 2ITMA 4A59A 4CJVA 3IMXA 1XI1A 1BOTO 2CGJA 4WFAL 4YOVA 4CJKA 3AO5A 1NK8A 1D8YA 3KLEA 4FZYA 1RCHA 4M3RA 1NKBA 2HVHA 3SJJA 1XMOK 4CK3A 2YX6A 4KFBA 1TK5A 4IJAA 3THXB 4B1WB 3TAGA 3R1XA 1TV6A 2QA4N 1IG9A 4EIAA 4ISEA 1REVA 4DFPA 3A0IX 4MLEA 1KC8O 4NYFA 1VQON 3M8PA 4BDPA 2ZD1A 3CJCA 1KRPA 1LCUA 1Z6RA 4E1JA 3SQ2A 1GOAA 3HSCA 1M1KO 3TAEA 1C1CA 3QIOA 2QWQA 1ZXOA 5CHIA 1RT7A 1TL1A 1SQKA 2IIRA 2V7ZA 3CJBA 5I9EB 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1ZBLA 3OBYA 4I2PA 3QICA 1FJGK 3ZT2A 5J2MA 4U67L 2QM1A 1IKXA 3WQTA 4FJGA 2OZMA 3HPOA 5M1PA 4JKFA 3RTVA 1HPZA 4Q0BA 2RF2A 3KK3A 5BPLA 4JK7A 4KRFA 3THYB 1I94K 3CPWM 4ISFA 1QHAA 3VQEA 3HJFA 1ZBFA 5BPNA 2R7YA 3CQYA 1NGHA 2YHXA 3NFAA 1JLBA 2YNFA 4DTOA 3H08A 3GL1A 3OYKA 3GDQA 3SPYA 4BY9C 3C7NA 4EAHD 4DSJA 2F96A 3KHYA 1QQNA 4B9NA 5MLCQ 1Q9XA 2WBNA 3C6AA 2NNWA 2VWJA 3VF4A 5AQHA 4HHTA 3TAMA 2D0BA 3SPZA 2WOMA 2AJQA 3MX5A 3SUOA 1QVGM 4DQPA 5AZJB 1ASVA 4M3XA 3K57A 4DUZK 2YJFA 3R8EA 3ATVA 4KAZA 4K42A 3NF8A 5ADXA 5LY3A 2XY5A 4H4OA 1BA0A 3E01A 4A5BA 3VPZA 4JS5A 1J54A 2EX3A 4ISGA 4LF6K 4Z4CA 4Z4FA 3FZLA 3SQ0A 4DFMA 1NOYA 4JD2A 1IBMK 1ATNA 4LF8K 1BHLA 1CLQA 2E88A 2HHVA 1U4BA 3AV9A 1X1PA 4O0IA 4FWKA 3PX4A 3RRHA 4YDUC 1T05A 3IKMA 1UAXA 3AGKA 4CEBA 3HPGA 4NLCA 3U6FA 2ASMA 1JCFA 2CGLA 3VEWA 1SUQA 4YY3K 3THXA 5CYMA 3I8DA 3HPHA 1SS6A 1LAWA 1VQKN 4DV7K 2GV9A 1Y97A 2YNGA 4DSFA 3G6EN 1GLAG 3DLBA 3F9KA 3AA4A 4JKCA 5BRFA 3U3YA 4BE1A 3NDKA 3KKSA 3L2WA 1RBRA 3CCSN 2XHBA 2ZE2A 2Q97A 2D0PA 3T1HK 3OS0A 4AH9A 4BRIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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